View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9050_low_5 (Length: 619)

Name: NF9050_low_5
Description: NF9050
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9050_low_5
NF9050_low_5
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (12-600)||(27272441-27273029)
chr6 (12-495)||(22934741-22935218)
chr6 (12-495)||(23857186-23857663)
chr6 (12-369)||(24863695-24864052)
chr6 (12-608)||(15424178-15424771)
chr6 (12-608)||(24304479-24305072)
chr6 (12-608)||(26988743-26989336)
chr6 (12-608)||(26918122-26918715)
chr6 (18-608)||(26999815-27000402)
chr6 (12-608)||(13298812-13299405)
chr6 (15-369)||(16749832-16750186)
chr6 (12-608)||(29549220-29549810)
chr6 (12-369)||(29572991-29573348)
chr6 (12-608)||(4757503-4758099)
chr6 (42-600)||(27629591-27630155)
chr6 (12-342)||(3696086-3696416)
chr6 (12-369)||(30557877-30558234)
chr6 (12-344)||(4773009-4773341)
chr6 (11-369)||(27359852-27360210)
chr6 (11-369)||(27450195-27450553)
chr6 (12-342)||(34463207-34463537)
chr6 (12-608)||(4525031-4525621)
chr6 (12-369)||(16943888-16944245)
chr6 (12-344)||(27044390-27044723)
chr6 (12-344)||(26116271-26116603)
chr6 (12-489)||(29501267-29501750)
chr6 (12-342)||(16674144-16674474)
chr6 (12-336)||(4545636-4545960)
chr6 (12-336)||(4723995-4724319)
chr6 (12-336)||(28207465-28207789)
chr6 (11-345)||(26777475-26777809)
chr6 (17-546)||(22171800-22172323)
chr6 (12-344)||(27007730-27008062)
chr6 (17-546)||(20160508-20161031)
chr6 (12-369)||(27485107-27485464)
chr6 (12-347)||(27290231-27290566)
chr6 (12-369)||(22456795-22457152)
chr6 (12-348)||(14143146-14143482)
chr6 (12-344)||(17025280-17025612)
chr6 (12-348)||(26787943-26788279)
chr6 (12-348)||(27196316-27196652)
chr6 (12-348)||(27252588-27252924)
chr6 (26-525)||(28162485-28162978)
chr6 (17-525)||(13521939-13522441)
chr6 (26-525)||(8892186-8892678)
chr6 (26-525)||(33374131-33374624)
chr6 (26-525)||(8903421-8903913)
chr6 (118-555)||(22477240-22477674)
chr6 (12-138)||(17092301-17092427)
chr6 (436-608)||(27360292-27360464)
chr6 (436-608)||(27450635-27450807)
chr6 (436-489)||(4772858-4772911)
chr6 (449-489)||(16673988-16674028)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (13-546)||(16503185-16503715)
chr7 (13-546)||(16518221-16518751)
chr7 (12-366)||(10916672-10917026)
chr7 (12-489)||(11424580-11425054)
chr7 (12-369)||(2154555-2154912)
chr7 (10-608)||(5127738-5128333)
chr7 (12-608)||(4144927-4145520)
chr7 (12-369)||(5147144-5147501)
chr7 (12-608)||(45387089-45387682)
chr7 (12-369)||(26319673-26320030)
chr7 (12-489)||(26435122-26435596)
chr7 (12-369)||(9618633-9618990)
chr7 (12-369)||(26274898-26275255)
chr7 (12-369)||(26669718-26670075)
chr7 (12-369)||(16736264-16736621)
chr7 (12-369)||(16751318-16751675)
chr7 (12-369)||(17523514-17523871)
chr7 (12-369)||(17529344-17529701)
chr7 (12-608)||(31564194-31564796)
chr7 (14-603)||(16041077-16041660)
chr7 (12-342)||(26537674-26538004)
chr7 (12-369)||(24592345-24592702)
chr7 (12-290)||(11441633-11441911)
chr7 (12-342)||(3445315-3445645)
chr7 (12-369)||(31124902-31125259)
chr7 (20-543)||(16449810-16450327)
chr7 (12-348)||(26484697-26485033)
chr7 (26-348)||(2108823-2109145)
chr7 (12-348)||(39210827-39211163)
chr7 (12-345)||(2775365-2775698)
chr7 (26-525)||(31088282-31088775)
chr7 (26-525)||(45733292-45733785)
chr7 (12-221)||(26682804-26683013)
chr7 (35-608)||(5159268-5159835)
chr7 (12-219)||(4200679-4200886)
chr7 (35-348)||(18540802-18541115)
chr7 (402-489)||(5147531-5147618)
chr7 (437-608)||(9618397-9618568)
chr7 (241-342)||(26485756-26485857)
chr7 (449-489)||(3445159-3445199)
chr7 (449-489)||(26485982-26486022)
chr7 (449-489)||(26538111-26538151)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (12-546)||(27434351-27434882)
chr2 (12-606)||(23128473-23129064)
chr2 (12-369)||(28882191-28882548)
chr2 (12-369)||(20837895-20838252)
chr2 (12-369)||(12655519-12655876)
chr2 (12-489)||(11635093-11635570)
chr2 (12-489)||(11641282-11641759)
chr2 (12-608)||(21677089-21677682)
chr2 (12-369)||(32049775-32050132)
chr2 (12-369)||(34861657-34862014)
chr2 (12-369)||(37685816-37686173)
chr2 (12-369)||(37701081-37701438)
chr2 (47-369)||(34286331-34286653)
chr2 (47-369)||(34291391-34291713)
chr2 (12-608)||(37925234-37925827)
chr2 (14-603)||(21703073-21703656)
chr2 (12-369)||(22925935-22926292)
chr2 (12-608)||(13936451-13937044)
chr2 (12-369)||(16829245-16829602)
chr2 (12-369)||(16891879-16892236)
chr2 (12-369)||(31876258-31876615)
chr2 (97-369)||(34279426-34279698)
chr2 (12-344)||(37375163-37375495)
chr2 (12-342)||(40233515-40233845)
chr2 (12-369)||(19416406-19416763)
chr2 (12-345)||(39890075-39890408)
chr2 (12-336)||(260660-260984)
chr2 (26-525)||(31891249-31891742)
chr2 (17-603)||(19456333-19456913)
chr2 (12-342)||(27777226-27777556)
chr2 (12-342)||(27816984-27817314)
chr2 (12-608)||(12716509-12717105)
chr2 (12-342)||(39051729-39052059)
chr2 (21-525)||(27118515-27119013)
chr2 (15-342)||(27803711-27804038)
chr2 (12-342)||(12586814-12587144)
chr2 (12-525)||(34303210-34303717)
chr2 (26-525)||(3784481-3784974)
chr2 (26-342)||(9349903-9350219)
chr2 (26-525)||(34156838-34157330)
chr2 (26-525)||(16163426-16163919)
chr2 (65-342)||(27392973-27393250)
chr2 (419-489)||(37375021-37375091)
chr2 (449-489)||(39052169-39052209)
chr2 (449-489)||(40233359-40233399)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (12-608)||(24687972-24688565)
chr5 (12-608)||(23717803-23718396)
chr5 (12-366)||(30934626-30934980)
chr5 (12-369)||(11549344-11549701)
chr5 (12-608)||(33777241-33777834)
chr5 (12-608)||(23752265-23752858)
chr5 (12-363)||(24970014-24970365)
chr5 (12-369)||(22998929-22999286)
chr5 (12-369)||(15658575-15658932)
chr5 (12-369)||(9548358-9548715)
chr5 (12-369)||(30152008-30152365)
chr5 (12-369)||(9317441-9317798)
chr5 (12-369)||(12132145-12132502)
chr5 (12-606)||(23891962-23892553)
chr5 (12-608)||(8665290-8665883)
chr5 (12-369)||(15758672-15759029)
chr5 (12-369)||(26480382-26480739)
chr5 (12-369)||(2511041-2511398)
chr5 (12-489)||(6874175-6874652)
chr5 (12-369)||(30168459-30168816)
chr5 (12-369)||(5637900-5638257)
chr5 (12-369)||(18375227-18375584)
chr5 (14-546)||(22888289-22888815)
chr5 (12-344)||(28649250-28649582)
chr5 (20-344)||(18500553-18500877)
chr5 (12-369)||(33516346-33516703)
chr5 (12-608)||(31431182-31431787)
chr5 (35-482)||(41674589-41675033)
chr5 (12-344)||(37671298-37671630)
chr5 (14-606)||(25198788-25199374)
chr5 (12-369)||(29966881-29967238)
chr5 (12-369)||(30029405-30029762)
chr5 (12-345)||(34616532-34616865)
chr5 (12-344)||(37754995-37755327)
chr5 (12-344)||(37770802-37771134)
chr5 (12-342)||(31826222-31826552)
chr5 (12-342)||(43078269-43078599)
chr5 (11-345)||(28959600-28959934)
chr5 (12-369)||(37358458-37358815)
chr5 (11-489)||(32599286-32599758)
chr5 (12-344)||(3789556-3789888)
chr5 (12-348)||(29888897-29889233)
chr5 (12-342)||(24681457-24681787)
chr5 (12-342)||(24723984-24724314)
chr5 (12-342)||(40473364-40473694)
chr5 (12-344)||(13324644-13324976)
chr5 (26-525)||(11325634-11326127)
chr5 (17-525)||(33877087-33877589)
chr5 (26-525)||(13184477-13184970)
chr5 (26-525)||(13440323-13440816)
chr5 (35-608)||(33292282-33292849)
chr5 (402-495)||(24969891-24969984)
chr5 (436-608)||(24681191-24681363)
chr5 (436-608)||(24723718-24723890)
chr5 (402-489)||(3789399-3789486)
chr5 (402-489)||(9548745-9548832)
chr5 (437-608)||(15759094-15759265)
chr5 (436-489)||(13325080-13325133)
chr5 (436-489)||(28649099-28649152)
chr5 (436-608)||(37358891-37359063)
chr5 (449-489)||(40473801-40473841)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (12-608)||(17013760-17014353)
chr4 (12-608)||(14664778-14665371)
chr4 (12-366)||(24592232-24592586)
chr4 (12-489)||(14763222-14763696)
chr4 (12-489)||(5005749-5006226)
chr4 (12-608)||(27163235-27163828)
chr4 (12-489)||(6569732-6570206)
chr4 (12-369)||(40105556-40105913)
chr4 (12-608)||(18800531-18801133)
chr4 (12-369)||(14098537-14098894)
chr4 (12-369)||(31126436-31126793)
chr4 (12-489)||(36344433-36344904)
chr4 (14-603)||(1900025-1900608)
chr4 (12-344)||(54833408-54833740)
chr4 (14-603)||(15227638-15228221)
chr4 (17-603)||(15284851-15285431)
chr4 (12-342)||(30753777-30754107)
chr4 (12-342)||(33673716-33674046)
chr4 (12-369)||(21969697-21970054)
chr4 (12-342)||(39850661-39850991)
chr4 (26-525)||(24460537-24461030)
chr4 (44-486)||(14235475-14235914)
chr4 (35-608)||(24112425-24112992)
chr4 (35-608)||(34188901-34189468)
chr4 (47-342)||(15391291-15391586)
chr4 (436-608)||(19373021-19373193)
chr4 (449-489)||(33674162-33674202)
chr4 (449-608)||(39850383-39850542)
chr4 (407-608)||(24592621-24592822)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (12-495)||(39987-40467)
scaffold0089 (12-369)||(46903-47260)
scaffold0089 (12-546)||(29570-30101)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (12-366)||(8301226-8301580)
chr3 (12-608)||(18050968-18051561)
chr3 (12-495)||(15892665-15893145)
chr3 (12-608)||(4796612-4797205)
chr3 (12-369)||(15741053-15741410)
chr3 (12-369)||(18330611-18330968)
chr3 (12-366)||(8295917-8296271)
chr3 (12-369)||(6192258-6192615)
chr3 (12-369)||(29148714-29149071)
chr3 (12-608)||(35880472-35881065)
chr3 (12-608)||(4721337-4721930)
chr3 (12-608)||(22387537-22388127)
chr3 (12-489)||(28115913-28116390)
chr3 (12-489)||(18277011-18277485)
chr3 (12-489)||(18292312-18292786)
chr3 (12-489)||(18307613-18308087)
chr3 (12-375)||(4416855-4417218)
chr3 (12-608)||(7072918-7073511)
chr3 (12-369)||(10396075-10396432)
chr3 (12-369)||(31964432-31964789)
chr3 (12-369)||(50134030-50134387)
chr3 (12-369)||(5609281-5609638)
chr3 (12-369)||(47023395-47023752)
chr3 (12-369)||(28339244-28339601)
chr3 (12-608)||(7996268-7996861)
chr3 (12-608)||(10642776-10643369)
chr3 (12-369)||(21674635-21674992)
chr3 (26-369)||(5713169-5713512)
chr3 (26-369)||(5724079-5724422)
chr3 (26-369)||(5757055-5757398)
chr3 (26-369)||(5767946-5768289)
chr3 (12-369)||(17984915-17985272)
chr3 (12-608)||(8211447-8212037)
chr3 (12-345)||(28021241-28021574)
chr3 (12-369)||(18225133-18225490)
chr3 (12-343)||(5466953-5467284)
chr3 (12-489)||(5596316-5596799)
chr3 (12-342)||(36997036-36997366)
chr3 (12-342)||(48465896-48466226)
chr3 (12-345)||(4346646-4346979)
chr3 (12-369)||(5013654-5014011)
chr3 (12-345)||(22870815-22871148)
chr3 (12-345)||(22885874-22886207)
chr3 (12-369)||(24328101-24328458)
chr3 (12-344)||(6542421-6542753)
chr3 (12-300)||(51782034-51782322)
chr3 (12-342)||(11110308-11110638)
chr3 (12-369)||(18242681-18243038)
chr3 (17-603)||(16626470-16627049)
chr3 (12-300)||(51797123-51797412)
chr3 (14-603)||(18530108-18530685)
chr3 (12-342)||(20576806-20577136)
chr3 (12-342)||(29664929-29665259)
chr3 (12-348)||(32292715-32293051)
chr3 (12-345)||(31034076-31034409)
chr3 (26-525)||(17993757-17994250)
chr3 (21-525)||(5652179-5652677)
chr3 (34-525)||(4625736-4626221)
chr3 (35-608)||(32438863-32439430)
chr3 (35-344)||(20066010-20066319)
chr3 (134-544)||(4892983-4893387)
chr3 (402-608)||(22871220-22871426)
chr3 (402-608)||(22886279-22886485)
chr3 (419-608)||(5466691-5466880)
chr3 (402-489)||(29665331-29665418)
chr3 (407-608)||(15741433-15741634)
chr3 (436-608)||(6542854-6543026)
chr3 (449-489)||(21674518-21674558)
chr3 (449-489)||(48465740-48465780)
chr3 (449-489)||(51781836-51781876)
chr3 (449-489)||(51796925-51796965)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (12-369)||(19688079-19688436)
chr8 (12-546)||(16283256-16283787)
chr8 (12-608)||(2137136-2137729)
chr8 (12-608)||(16277299-16277892)
chr8 (12-369)||(27608782-27609139)
chr8 (12-366)||(14557608-14557962)
chr8 (12-608)||(19674183-19674779)
chr8 (12-608)||(31489627-31490220)
chr8 (12-369)||(19208237-19208594)
chr8 (12-369)||(28361832-28362189)
chr8 (12-369)||(31354505-31354862)
chr8 (12-369)||(33258704-33259061)
chr8 (12-344)||(19286468-19286800)
chr8 (12-608)||(18710331-18710924)
chr8 (12-369)||(12092601-12092958)
chr8 (12-344)||(29829328-29829660)
chr8 (12-344)||(3329384-3329716)
chr8 (12-525)||(9354453-9354961)
chr8 (12-186)||(189258-189432)
chr8 (21-525)||(19658926-19659423)
chr8 (26-525)||(44562932-44563423)
chr8 (27-345)||(33244670-33244988)
chr8 (47-280)||(22080790-22081023)
chr8 (278-489)||(19518280-19518494)
chr8 (407-608)||(14557372-14557573)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (13-608)||(27037-27629)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (12-608)||(47-641)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (12-369)||(7157-7514)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (12-369)||(8984-9341)
scaffold0159 (12-369)||(19996-20353)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (12-369)||(10962650-10963007)
chr1 (12-608)||(41793226-41793819)
chr1 (12-369)||(28584961-28585318)
chr1 (12-369)||(51638198-51638555)
chr1 (14-363)||(16207951-16208300)
chr1 (12-525)||(20340253-20340760)
chr1 (12-348)||(28151863-28152199)
chr1 (14-348)||(20461082-20461416)
chr1 (407-603)||(20460857-20461053)
chr1 (436-608)||(51637962-51638134)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (12-608)||(30198-30790)
scaffold0124 (14-348)||(20390-20723)
scaffold0124 (407-603)||(20162-20358)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (12-369)||(14848-15205)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (12-369)||(26119-26477)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (12-345)||(9571-9904)
scaffold0336 (419-608)||(7977-8166)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-336)||(7963-8287)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (20-344)||(6015-6344)
scaffold0415 (14-280)||(1838-2103)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (48-348)||(46756-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (12-525)||(2576-3083)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (71-348)||(5-282)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (42-432)||(1-397)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (47-270)||(21641-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (47-204)||(571-728)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 600
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27273029
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  27272641 aggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcat 27272740  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27272741 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgctgcacaatagcatt 27272840  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27272841 cacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggatactaatagtaaaatggcgggtagaatggatgttgagaatacggtacataggagtatggtggaggt 27272940  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272941 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 27273029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 495
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22935218
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22934941 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 22935040  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  22935041 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgt------tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 22935134  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 495  Q
     ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22935135 gacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcata 22935218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 495
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857663
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23857386 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23857485  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  23857486 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgt------tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 23857579  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 495  Q
     ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23857580 gacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcata 23857663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863695
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24863852 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24863753  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863752 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 24863695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424771
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15424378 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15424477  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  15424478 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 15424574  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  15424575 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 15424674  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15424675 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 15424771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24305072
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24304679 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24304778  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  24304779 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 24304875  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  24304876 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 24304975  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24304976 atttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24305072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26988743
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26989136 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26989037  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  26989036 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 26988940  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  26988939 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 26988840  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26988839 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 26988743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918122
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26918515 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 26918416  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  26918415 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcatt 26918319  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  26918318 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 26918219  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26918218 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 26918122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27000402 - 26999815
Alignment:
Q  18 caagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttag 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  27000402 caagtgtaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcag 27000303  T
Q  118 ctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27000302 ctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcg 27000203  T
Q  218 gacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaaca 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  27000202 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaaca 27000103  T
Q  318 tcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacggg 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| ||||| |||||    
T  27000102 tcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacggg 27000006  T
Q  418 tacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctga 517  Q
    ||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  ||||| |  ||     
T  27000005 tacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgg 26999906  T
Q  518 gcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26999905 gctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 26999815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299405
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  13299012 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 13299111  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  13299112 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 13299208  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  13299209 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 13299308  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13299309 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 13299405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749832
Alignment:
Q  15 catcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  115 tagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagg 214  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  215 tcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacataca 314  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |    
T  16749986 tcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatata 16749887  T
Q  315 acatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749886 acatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 16749832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549220
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||    
T  29549610 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 29549511  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||       | ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  29549510 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc------gtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 29549417  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||  |||||     
T  29549416 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggc 29549317  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  29549316 atttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtccat 29549220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29572991
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  29573148 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29573049  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573048 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 29572991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757503
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4757899 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4757800  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  || ||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  4757799 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 4757700  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  4757699 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 4757600  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757599 atttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4757503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 600
Target Start/End: Original strand, 27629591 - 27630155
Alignment:
Q  42 cttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttt 141  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || || |||||||| ||   | | |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |     
T  27629591 cttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctg 27629690  T
Q  142 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 241  Q
     || || ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |  |  ||||| ||  | || |||    
T  27629691 gacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatgga 27629790  T
Q  242 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 341  Q
    || || || ||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  27629791 tctggcggaggcctaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcc 27629890  T
Q  342 tagc------ttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctga 435  Q
    ||||       ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629891 tagcaaaatgctgctgttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctga 27629990  T
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27629991 tggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacattaacaggggcg 27630090  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 600  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630091 acagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 27630155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696086
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  3696216 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3696117  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3696116 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558234
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30558076  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  30558077 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30558176  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30558177 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 30558234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773009
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4773141 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4773042  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4773041 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 369
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360210
Alignment:
Q  11 tggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  111 aggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  ||    
T  27360052 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27360151  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  27360152 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27360210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 369
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450553
Alignment:
Q  11 tggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  111 aggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  ||    
T  27450395 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgca 27450494  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  27450495 tacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27450553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463537
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34463407 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34463506  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34463507 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525031
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
     | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4525421 ggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4525322  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||       ||  || || || || || |||||||| ||||| ||| |   ||| ||  | || |||||    
T  4525321 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag------tatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcatt 4525228  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     || || ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  4525227 gacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 4525128  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4525127 atttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4525031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944245
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  16944088 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 16944187  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16944188 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttg 16944245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044390
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc-acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  ||    
T  27044523 gagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgca 27044424  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27044423 tacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116603
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |  ||  |||    
T  26116471 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcat 26116570  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26116571 acaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501267
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  29501550 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 29501451  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag----ct--tgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaat 405  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||    ||  ||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |   ||||||  | ||    
T  29501450 acaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgat 29501351  T
Q  406 agcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29501350 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacgg 29501267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674144
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  16674274 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 16674175  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16674174 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545960
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  4545836 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4545935  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4545936 acaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724319
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  4724195 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 4724294  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4724295 acaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207465
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  28207589 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 28207490  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28207489 acaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777809
Alignment:
Q  11 tggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  111 aggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  ||    
T  26777675 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggca 26777774  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  26777775 tacaacatcggtataggagggaaggttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172323
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
    |||| | ||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || |||||| |||| |||    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 22172099  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||      ||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||  | || |||||  |||| ||||| ||||    
T  22172100 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttg------ttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgg 22172193  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    ||||||||||| | || | ||| | |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||  ||    
T  22172194 gtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattg 22172293  T
Q  517 agcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22172294 agtagcattaacaggggcaacagtagccat 22172323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007730
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  27007862 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27007763  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27007762 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160508
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
    |||| | ||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || |||||| |||| |||    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 20160732  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||| || | ||||||||||      ||| ||||||| || ||  | || |||||  |||| ||||| ||||    
T  20160731 atcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgt------tgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgg 20160638  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    ||||||||||| | || | ||| | |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||  ||    
T  20160637 gtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattg 20160538  T
Q  517 agcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20160537 agtagcattaacaggggcaacagtagccat 20160508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485107
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  27485264 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 27485165  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  27485164 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27485107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290566
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| || | |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  27290431 aggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27290530  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagctt 347  Q
    | ||||| |||||  |||| || |||||||||||||    
T  27290531 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagctt 27290566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457152
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||| ||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |  | |||| |||| | || |||||  |||    
T  22456995 aggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcat 22457094  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  22457095 acatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttg 22457152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143482
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  14143346 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 14143445  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14143446 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 14143482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025280
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 17025313  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17025312 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26787943
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  26788079 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26787980  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  26787979 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 26787943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196316
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  27196452 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27196353  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27196352 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 27196316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252924
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  27252788 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 27252887  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27252888 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 27252924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28162978 - 28162485
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  28162978 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 28162879  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| ||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  28162878 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 28162779  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  28162778 cttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 28162679  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  28162678 agaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 28162585  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  28162584 gttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522441
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
     ||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
     || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| |||    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 13522238  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    || |||||  |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| ||||    
T  13522239 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgg 13522332  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||||||||    
T  13522333 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 13522432  T
Q  517 agcagcatt 525  Q
    |||||||||    
T  13522433 agcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 8892186 - 8892678
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  8892186 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 8892285  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  8892286 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 8892384  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  8892385 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 8892484  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  8892485 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 8892578  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8892579 gttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 33374131 - 33374624
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||    
T  33374131 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttcctt 33374230  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  33374231 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 33374330  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  33374331 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 33374430  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  33374431 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 33374524  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33374525 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 8903421 - 8903913
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  8903421 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 8903520  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  8903521 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 8903619  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  8903620 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 8903719  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  8903720 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 8903813  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||  |||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8903814 gttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 555
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477674
Alignment:
Q  118 ctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcg 217  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||      
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  218 gacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaaca 317  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |  | |||| |||| | || |||||  |||||| ||    
T  22477340 gaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatca 22477439  T
Q  318 tcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacggg 417  Q
    | |||||  |||| || |||||||||||||| ||    |||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| || | || ||  |||| ||||| |||||    
T  22477440 ttggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacggg 22477536  T
Q  418 tacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctga 517  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| | ||| |   ||||||  ||     
T  22477537 tacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgg 22477636  T
Q  518 gcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgact 555  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||    
T  22477637 gcagcattaattggggcaacagtagccatggattgact 22477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagctt 138  Q
     || | |||||| || |||||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Original strand, 27360292 - 27360464
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  27360292 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagca 27360391  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27360392 acggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 27360464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Original strand, 27450635 - 27450807
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  27450635 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagca 27450734  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27450735 acggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 27450807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 4772911 - 4772858
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  4772911 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 4772858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16674028 - 16673988
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16674028 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 16673988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 546
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503715
Alignment:
Q  13 gacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  113 gttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  213 ggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacata 312  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16503385 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16503484  T
Q  313 caacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | || |||  | |||| ||  |||| |||||     
T  16503485 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcatta 16503581  T
Q  413 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggta 512  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||| |    
T  16503582 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggca 16503681  T
Q  513 gctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
      || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16503682 tttgggcagcattaataggagcaacagtagccat 16503715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 546
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518751
Alignment:
Q  13 gacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  113 gttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 212  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  213 ggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacata 312  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16518421 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 16518520  T
Q  313 caacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | || |||  | |||| ||  |||| |||||     
T  16518521 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcatta 16518617  T
Q  413 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggta 512  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||| |    
T  16518618 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggca 16518717  T
Q  513 gctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
      || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16518718 tttgggcagcattaataggagcaacagtagccat 16518751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10917026
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10916872 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 10916971  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916972 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 10917026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11425054
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11424780 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 11424879  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  11424880 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 11424976  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11424977 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 11425054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154555
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  2154712 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 2154613  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154612 acaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 2154555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5127738
Alignment:
Q  10 atggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  110 aaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatt 209  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  210 tgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaac 309  Q
    |||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  5128133 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagc 5128034  T
Q  310 atacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagca 409  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||    
T  5128033 atacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgca 5127937  T
Q  410 ttcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggag 509  Q
    || |||||||| |||||| | || | ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  ||||    
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  510 gtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    | |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 5127738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145520
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4145127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4145226  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||| |   ||| ||  | || |||||    
T  4145227 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcatt 4145323  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  4145324 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 4145423  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4145424 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 4145520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147501
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  5147344 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 5147443  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147444 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttg 5147501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387089
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  45387482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 45387383  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  45387382 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 45387286  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  45387285 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 45387186  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  45387185 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 45387089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26320030
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  26319873 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26319972  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319973 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 26320030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435122
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  26435396 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 26435297  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  26435296 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 26435200  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26435199 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26435122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618633
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9618790 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9618691  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618690 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 9618633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275255
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  26275098 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26275197  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275198 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 26275255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26670075
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  26669918 agatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26670017  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 26670075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736621
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16736464 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16736563  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736564 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 16736621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751675
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16751518 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 16751617  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751618 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 16751675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523514
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  17523671 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17523572  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523571 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 17523514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529701
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  17529544 agatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 17529643  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529644 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 17529701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564796
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  31564394 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31564493  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag----ct--tgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    ||  ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  ||||    
T  31564494 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaat 31564593  T
Q  406 agcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggt 505  Q
     ||||| ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||||      
T  31564594 tgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgac 31564693  T
Q  506 ggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtc 605  Q
    ||||| |  ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  31564694 ggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtc 31564793  T
Q  606 cat 608  Q
    |||    
T  31564794 cat 31564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041077
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||  |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||    
T  16041460 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 16041361  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||      ||||||||||| || ||| || | ||||| || |  | ||| |    
T  16041360 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgt------tgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaa 16041267  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |||||||     
T  16041266 cgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaa 16041167  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  16041166 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 16041077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26538004
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  26537874 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26537973  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26537974 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592702
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  24592545 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 24592644  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24592645 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 24592702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441633
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 290  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11441711 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 11441633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445315
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  3445445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 3445346  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3445345 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31124902
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  31125059 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 31124960  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  31124959 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 31124902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 543
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450327
Alignment:
Q  20 agtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagct 119  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  120 ttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcgga 219  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  220 cctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatc 319  Q
     |  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | |||     
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcatt 16450109  T
Q  320 ggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggta 419  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||      ||| || ||||| || ||| ||||||| || ||| ||   ||||| || |  ||||| | |||||    
T  16450110 ggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggta 16450203  T
Q  420 cctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagc 519  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || || | ||| |  ||||||| ||| ||    
T  16450204 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggc 16450303  T
Q  520 agcattaacaggggcgacagtagc 543  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  16450304 agcattaataggggcaacagtagc 16450327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484697
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  26484833 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 26484734  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  26484733 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 26484697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 348
Target Start/End: Original strand, 2108823 - 2109145
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||||    
T  2108823 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 2108922  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2108923 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaa 2109022  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||     
T  2109023 cctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatc 2109122  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
     |||| || ||||||||||||||    
T  2109123 agaggaaaggtaggtctagcttg 2109145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211163
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  39211027 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 39211126  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  39211127 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 39211163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775365
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||| ||||| |||    
T  2775498 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcat 2775399  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    | | ||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  2775398 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 31088282 - 31088775
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  31088282 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 31088381  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  31088382 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 31088481  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  31088482 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 31088581  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  31088582 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 31088675  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31088676 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45733785 - 45733292
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  45733785 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 45733686  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  45733685 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 45733586  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| ||| |  || || ||| |||| ||||| |||||     
T  45733585 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatc 45733486  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  45733485 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 45733392  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45733391 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683013
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
    ||| |  |||||||| || ||||| |||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  212 aggtcggacc 221  Q
    ||||||||||    
T  26683004 aggtcggacc 26683013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5159835 - 5159268
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||| ||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  5159835 tcacatatctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 5159736  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  5159735 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 5159636  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  5159635 taaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaa 5159536  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    || ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || |    
T  5159535 gttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccg 5159442  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggc 534  Q
     ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| ||    
T  5159441 gtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagc 5159342  T
Q  535 gacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
     ||||||||||| ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  5159341 aacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 5159268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200679
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  212 aggtcgga 219  Q
    ||||||||    
T  4200686 aggtcgga 4200679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18541115 - 18540802
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  18541115 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 18541016  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  18541015 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 18540916  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||    
T  18540915 taaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaa 18540816  T
Q  335 gtaggtctagcttg 348  Q
    ||||||||||||||    
T  18540815 gtaggtctagcttg 18540802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 489
Target Start/End: Original strand, 5147531 - 5147618
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5147531 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 5147618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9618568 - 9618397
Alignment:
Q  437 ggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcga 536  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || |    
T  9618568 ggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaa 9618469  T
Q  537 cagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9618468 cagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 9618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 342
Target Start/End: Original strand, 26485756 - 26485857
Alignment:
Q  241 atcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggt 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  26485756 atcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggt 26485855  T
Q  341 ct 342  Q
    ||    
T  26485856 ct 26485857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3445199 - 3445159
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3445199 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 3445159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Original strand, 26485982 - 26486022
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26485982 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26486022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Original strand, 26538111 - 26538151
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26538111 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434882
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  27434551 aggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcat 27434650  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  27434651 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 27434747  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |  |||||     
T  27434748 aacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggc 27434847  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    |  || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27434848 atttgggcagcattaataggagcaacagtagccat 27434882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 606
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23129064
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23128673 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23128772  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  23128773 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 23128869  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  23128870 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 23128969  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23128970 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 23129064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882191
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28882348 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 28882249  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882248 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 28882191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20837895
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20838052 aggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 20837953  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837952 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 20837895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655519
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  12655676 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 12655577  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655576 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 12655519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635570
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11635293 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11635392  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  11635393 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 11635492  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11635493 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 11635570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641759
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11641482 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 11641581  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  11641582 ataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 11641681  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11641682 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 11641759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677682
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  21677289 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 21677388  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  21677389 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcatt 21677485  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||| |||||     
T  21677486 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggc 21677585  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21677586 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 21677682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049775
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  32049932 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 32049833  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049832 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 32049775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861657
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34861814 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 34861715  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861714 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 34861657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686173
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37686016 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37686115  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686116 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 37686173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701438
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37701281 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37701380  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701381 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 37701438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286331
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 246  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  247 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 346  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34286354  T
Q  347 tgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34286353 tgctgattttgttgttgttgttg 34286331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291391
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 246  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  247 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 346  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagct 34291414  T
Q  347 tgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34291413 tgctgattttgttgttgttgttg 34291391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925234
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37925627 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37925528  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  37925527 ataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcatt 37925431  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  37925430 gacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 37925331  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37925330 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 37925234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 603
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703656
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||| |||||    
T  21703273 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 21703372  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||      ||| || |||||||| ||||||||||| || ||| || | || || || |  ||||| |    
T  21703373 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaa 21703466  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |||||||     
T  21703467 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaa 21703566  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  21703567 ctaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 21703656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926292
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  22926135 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 22926234  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926235 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 22926292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13937044
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 13936650  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  13936651 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 13936750  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   ||||| ||  | || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  13936751 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgt---tgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 13936847  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  13936848 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 13936947  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13936948 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 13937044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829602
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16829444  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  16829445 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16829544  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829545 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 16829602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16891879
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 16892037  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  16892036 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 16891937  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16891936 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 16891879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876258
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  | |    
T  31876415 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 31876316  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876315 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 31876258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 97 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279426
Alignment:
Q  97 gacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttga 196  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  197 tggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtca 296  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||      
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttg 34279499  T
Q  297 gaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279498 gaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 34279426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375163
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  37375295 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 37375196  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37375195 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233515
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||| |||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcat 40233546  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  40233545 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416763
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  19416606 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 19416705  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19416706 acaacatcggtataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 19416763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890075
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  39890208 agatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 39890109  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39890108 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260984
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  260860 agatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 260959  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  260960 acaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 31891249 - 31891742
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||||| |  |||||||    
T  31891249 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttcctt 31891348  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31891349 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 31891448  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  31891449 ccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 31891548  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  31891549 agaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 31891642  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31891643 gttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 603
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456913
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
      |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
     || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || |||||  |||| | |    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 19456632  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||| ||| ||||||| || ||| || | ||||  || || ||||| ||||    
T  19456633 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgg 19456726  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    | ||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||  | ||||| | ||| |  ||||||| |||    
T  19456727 gcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactg 19456826  T
Q  517 agcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  19456827 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 19456913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777226
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27777357  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  27777356 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27777257  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27777256 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27816984
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 27817115  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  27817114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27817015  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27817014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12717105
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12716708  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  12716709 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12716808  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |  || |  |||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| || ||    
T  12716809 ataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgtt 12716908  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  12716909 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 12717008  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12717009 atttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 12717105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39052059
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||     
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 39051928  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39051929 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39052028  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39052029 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118515
Alignment:
Q  21 gtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctt 120  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  121 tccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggac 220  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  221 ctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcg 320  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| ||||||||||||    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcg 27118714  T
Q  321 gtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtac 420  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| ||||||||    
T  27118713 gtatcggagggaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtac 27118620  T
Q  421 ctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagca 520  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||  | ||| |  |||||||||||||||    
T  27118619 ctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagca 27118520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803711
Alignment:
Q  15 catcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  115 tagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagg 214  Q
     |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaaga 27803839  T
Q  215 tcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacataca 314  Q
    || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |    
T  27803838 tcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatata 27803739  T
Q  315 acatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27803738 acatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586814
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 12586945  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  12586944 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcat 12586845  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12586844 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 525
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303717
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
    ||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| || | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||    
T  34303410 aggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcat 34303509  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |   ||||    
T  34303510 ataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacatt 34303603  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||    
T  34303604 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggt 34303703  T
Q  512 agctgagcagcatt 525  Q
    ||||||||||||||    
T  34303704 agctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3784974 - 3784481
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  3784974 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 3784875  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  3784874 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 3784775  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  3784774 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 3784675  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| |  ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  3784674 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 3784581  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3784580 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 9349903 - 9350219
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  9349903 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 9350002  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || || || | |||    
T  9350003 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaa 9350102  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| | || || || ||||| |||||||| || || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  9350103 ccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtata 9350202  T
Q  326 ggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  9350203 ggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34157330 - 34156838
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  34157330 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 34157231  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  34157230 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 34157132  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  34157131 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 34157032  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  34157031 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 34156938  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  34156937 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16163919 - 16163426
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  16163919 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 16163820  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  16163819 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 16163720  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  16163719 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 16163620  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  16163619 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 16163526  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16163525 gttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27393250 - 27392973
Alignment:
Q  65 tgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagc 164  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  27393250 tgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaac 27393151  T
Q  165 acccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 264  Q
    | || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||   |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  27393150 atccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcct 27393051  T
Q  265 ggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    |||||| || |||||| |  | || |||||| | |||| |||  |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27393050 ggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37375021
Alignment:
Q  419 acctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacgg 37375021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Original strand, 39052169 - 39052209
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  39052169 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 39052209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40233399 - 40233359
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  40233399 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 40233359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688565
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24688172 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24688271  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  |||| | |||    
T  24688272 acaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtatt 24688368  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  24688369 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 24688468  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24688469 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24688565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718396
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23718003 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23718102  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  23718103 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 23718199  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  23718200 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 23718299  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23718300 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 23718396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934626
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  30934780 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 30934681  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934680 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 30934626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549344
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11549501 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 11549402  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549401 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 11549344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777241
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  33777634 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 33777535  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  33777534 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 33777438  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  33777437 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 33777338  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  33777337 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 33777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752858
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23752465 aggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 23752564  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  23752565 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 23752661  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  23752662 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 23752761  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23752762 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 23752858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970014
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24970165 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 24970066  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24970065 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttg 24970014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999286
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  22999129 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 22999228  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999229 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 22999286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658932
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  15658775 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 15658874  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658875 ataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 15658932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548715
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  9548558 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcat 9548657  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548658 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 9548715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152008
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  30152165 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30152066  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152065 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 30152008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317441
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9317598 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9317499  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317498 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 9317441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132145
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  12132302 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 12132203  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132202 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 12132145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23891962
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| ||||||||||  |||    
T  23892353 aggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcat 23892254  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    |||  || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||||| || ||| || | ||||| || || |||||    
T  23892253 acatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgt---tgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcatt 23892157  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |  |||||     
T  23892156 gacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggc 23892057  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
    |  || |||||||||| ||| || ||||||||||| || |||   ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  23892056 atttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgtcc 23891962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665883
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  8665490 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 8665589  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  8665590 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcatt 8665686  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | || || ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||| |||||     
T  8665687 gacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggc 8665786  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8665787 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 8665883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15759029
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  15758872 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 15758971  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758972 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 15759029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480382
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  26480539 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 26480440  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480439 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 26480382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511041
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  2511198 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 2511099  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511098 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 2511041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874175
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||    
T  6874452 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcat 6874353  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  6874352 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 6874253  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  6874252 gacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 6874175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168459
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  30168616 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 30168517  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168516 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 30168459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5637900
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  5638057 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5637958  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637957 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 5637900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375584
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  18375427 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 18375526  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375527 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 18375584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888289
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | | || |||| | || |||||| |||||    
T  22888615 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatac 22888516  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||      ||| || |||||||| ||||||||||| || ||| || | ||||| || |  ||||| |    
T  22888515 aacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 22888422  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    ||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |||||||     
T  22888421 cggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaa 22888322  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22888321 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccat 22888289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649250
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28649382 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28649283  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28649282 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500877
Alignment:
Q  20 agtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagct 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  120 ttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcgga 219  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  220 cctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatc 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatc 18500852  T
Q  320 ggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18500853 ggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516346
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 33516504  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  33516503 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 33516404  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516403 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 33516346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431182
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  31431587 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 31431488  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag----ct-----tgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcac 402  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    ||     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |    
T  31431487 acaacattggtataggaggaaaagttggcctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggc 31431388  T
Q  403 aatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtat 502  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | ||||    
T  31431387 aattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtat 31431288  T
Q  503 ggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgat 602  Q
    |  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || |||||||||| ||| ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |    
T  31431287 gacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggt 31431188  T
Q  603 gtccat 608  Q
    ||||||    
T  31431187 gtccat 31431182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41675033 - 41674589
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  41675033 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataa 41674934  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |    
T  41674933 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggagg 41674834  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  41674833 caacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaa 41674734  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| || |    
T  41674733 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccg 41674637  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgag 482  Q
     ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  41674636 gtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671630
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37671498 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37671597  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37671598 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25198788
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||||||||| || |||  |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
     || || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||    
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 25199075  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||  |||||||||      ||||||||||| || ||| || | ||||| || |  || || |    
T  25199074 aacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgt------tgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaa 25198981  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    || ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||| |     
T  25198980 cgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaa 25198881  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
     || | |||||||| ||| || ||||||||||| || ||||  ||||  | ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25198880 ttgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgtcc 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967238
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  29967081 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 29967180  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29967181 acaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 29967238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029405
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  30029562 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 30029463  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30029462 acaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 30029405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616532
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  34616665 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 34616566  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34616565 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37754995
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37755127 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37755028  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37755027 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771134
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  37771002 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 37771101  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37771102 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826552
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  31826422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 31826521  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31826522 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078269
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  43078399 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 43078300  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  43078299 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 28959600 - 28959934
Alignment:
Q  11 tggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28959600 tggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaa 28959699  T
Q  111 aggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||    
T  28959700 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 28959799  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  ||    
T  28959800 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgca 28959899  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28959900 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358815
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  37358658 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 37358757  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  37358758 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 37358815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 489
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599758
Alignment:
Q  11 tggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  111 aggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||||||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  ||    
T  32599486 gagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgca 32599585  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcat 410  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| |   ||||||  | || ||||    
T  32599586 tacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcat 32599679  T
Q  411 tcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    | || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  32599680 tgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 32599758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789556
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  3789688 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 3789589  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3789588 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889233
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||| |||  | || | |||| |||    
T  29889097 aggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcat 29889196  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    ||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  29889197 acaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 29889233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681457
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24681588  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24681587 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24681488  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24681487 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24723984
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 24724115  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24724114 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 24724015  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24724014 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473694
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 40473663  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40473664 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324976
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 13324943  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  13324944 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11326127 - 11325634
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||||    
T  11326127 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttcctt 11326028  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  11326027 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaa 11325928  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  11325927 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 11325828  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  11325827 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 11325734  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11325733 gttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877087
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
     ||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
     || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| |||    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataac 33877290  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    || |||||  |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| ||||    
T  33877289 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgg 33877196  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||||||||    
T  33877195 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 33877096  T
Q  517 agcagcatt 525  Q
    |||||||||    
T  33877095 agcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 13184477 - 13184970
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  13184477 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 13184576  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  13184577 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 13184676  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  13184677 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 13184776  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  13184777 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 13184870  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13184871 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 13440323 - 13440816
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  13440323 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 13440422  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  13440423 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 13440522  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || | | |||| ||||| |||||     
T  13440523 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatc 13440622  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  13440623 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 13440716  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13440717 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33292849 - 33292282
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  33292849 tcacatatctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 33292750  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  33292749 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 33292650  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  33292649 taaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaa 33292550  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    || ||||||||      || |||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || |    
T  33292549 gttggtctagc------atattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccg 33292456  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggc 534  Q
     ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| ||    
T  33292455 gtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagc 33292356  T
Q  535 gacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
     ||||||||| | ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  33292355 aacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 33292282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 402 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24969984 - 24969891
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 495  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24969984 caattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 24969891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24681363 - 24681191
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  24681363 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgca 24681264  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24681263 acagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24681191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24723890 - 24723718
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  24723890 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgca 24723791  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24723790 acagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24723718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3789486 - 3789399
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3789486 caattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 3789399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 489
Target Start/End: Original strand, 9548745 - 9548832
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  9548745 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 9548832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 608
Target Start/End: Original strand, 15759094 - 15759265
Alignment:
Q  437 ggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcga 536  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || |    
T  15759094 ggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaa 15759193  T
Q  537 cagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |||||||||| || |||| ||||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15759194 cagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 15759265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 489
Target Start/End: Original strand, 13325080 - 13325133
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  13325080 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 13325133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28649152 - 28649099
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28649152 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 28649099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Original strand, 37358891 - 37359063
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  37358891 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagca 37358990  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37358991 acggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 37359063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Original strand, 40473801 - 40473841
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  40473801 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 40473841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17013760
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17014153 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcat 17014054  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  17014053 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 17013957  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  17013956 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggc 17013857  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17013856 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 17013760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14664778
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14665171 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14665072  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  14665071 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 14664975  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||  |||||     
T  14664974 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggc 14664875  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || |||||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14664874 atttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 14664778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592586
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24592432 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 24592531  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592532 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24592586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763696
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14763422 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 14763521  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  14763522 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 14763618  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14763619 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 14763696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5005749
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  5006026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5005927  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  5005926 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 5005827  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5005826 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 5005749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163828
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  27163435 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 27163534  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  27163535 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 27163631  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  27163632 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 27163731  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| |  || || ||||||||||| || ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27163732 atttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 27163828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569732
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  6570006 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 6569907  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  6569906 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgt---tgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 6569810  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6569809 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 6569732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105913
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||| |||    
T  40105756 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcat 40105855  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105856 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 40105913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18801133
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  18800731 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 18800830  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag----ct--tgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaat 405  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    ||  ||||| |  || ||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  ||||    
T  18800831 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaat 18800930  T
Q  406 agcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggt 505  Q
     ||||| ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||      
T  18800931 tgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgac 18801030  T
Q  506 ggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtc 605  Q
    ||||| |  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||  ||||  |||| ||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18801031 ggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtc 18801130  T
Q  606 cat 608  Q
    |||    
T  18801131 cat 18801133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098537
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  14098694 agatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 14098595  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098594 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 14098537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126793
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||    
T  31126636 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 31126735  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126736 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 31126793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344904
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  36344633 agatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 36344732  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||       || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  36344733 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag------tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 36344826  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     || || ||||||||| | || | |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36344827 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacgg 36344904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900025
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||||    
T  1900408 gtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatac 1900309  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||      ||| |||||||| || ||||||||||| || ||| || | ||||| || |  ||||| |    
T  1900308 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 1900215  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |||||||     
T  1900214 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaa 1900115  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  1900114 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 1900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833408
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  54833540 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 54833441  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  54833440 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15227638
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| | || |||||  ||||     
T  15228021 gtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 15227922  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||      ||| ||||||| || ||| || | ||||| || | |||||| |    
T  15227921 agcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgt------tgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaa 15227828  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||||     
T  15227827 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaa 15227728  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  15227727 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 15227638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 603
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285431
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
      |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || ||||| | ||| | |    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagc 15285150  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||| |||  |||||| || ||| || | ||||| || || ||||| ||||    
T  15285151 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgg 15285244  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    | ||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | |||   |||||||| |||    
T  15285245 gcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactg 15285344  T
Q  517 agcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||    
T  15285345 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttcttatgatg 15285431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753777
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  30753907 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 30753808  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30753807 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33674046
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  33673916 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 33674015  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  33674016 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969697
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 21969855  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  21969854 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 21969755  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969754 acaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 21969697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850661
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 39850692  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39850691 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 24460537 - 24461030
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  24460537 ggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 24460636  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  24460637 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 24460736  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  24460737 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 24460836  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  24460837 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 24460930  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  24460931 gttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 486
Target Start/End: Original strand, 14235475 - 14235914
Alignment:
Q  44 tcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagctttttta 143  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||    
T  14235475 tcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttcttta 14235574  T
Q  144 cgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatc 243  Q
    | ||| |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||| || |     
T  14235575 caatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggtt 14235674  T
Q  244 aggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | || | |||| | |||| |||  |||||||||| |||||  |||| || |||||||||    
T  14235675 aggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtcta 14235774  T
Q  344 gcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaag 443  Q
    ||||| ||   ||| || |||||||||||| | || || || ||| || | |||||  |||| ||||| ||||||||||  ||  | || ||||| | ||    
T  14235775 gcttgttg---ttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagag 14235871  T
Q  444 gatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagta 486  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14235872 ggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 14235914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24112992 - 24112425
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  24112992 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 24112893  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  24112892 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 24112793  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24112792 taaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaa 24112693  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    || ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || |    
T  24112692 gttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccg 24112599  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggc 534  Q
     ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| ||||| ||    
T  24112598 gtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagc 24112499  T
Q  535 gacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
     ||||||||| | ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  24112498 aacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 24112425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 608
Target Start/End: Original strand, 34188901 - 34189468
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  34188901 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 34189000  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  34189001 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 34189100  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  34189101 taaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaa 34189200  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    || ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || |    
T  34189201 gttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccg 34189294  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggc 534  Q
     ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| ||    
T  34189295 gtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagc 34189394  T
Q  535 gacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |||||||||| | ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  34189395 gacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 34189468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 342
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391586
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 246  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  247 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |  | || |||||| | ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19373193 - 19373021
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  19373193 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagca 19373094  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    || ||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19373093 acggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 19373021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Original strand, 33674162 - 33674202
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33674162 tgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 33674202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 39850542 - 39850383
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatag 548  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    || | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |    
T  39850542 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattg 39850443  T
Q  549 actgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    | ||||  |||| ||  || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  39850442 attgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 39850383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 608
Target Start/End: Original strand, 24592621 - 24592822
Alignment:
Q  407 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 506  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |    
T  24592621 gcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 24592720  T
Q  507 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
    |||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || |  || ||||| ||||||||||| |||||    
T  24592721 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 24592820  T
Q  607 at 608  Q
    ||    
T  24592821 at 24592822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 495
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40467
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40187 agatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 40286  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  40287 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg---aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 40383  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 495  Q
     ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  40384 tacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 40467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47260
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47103 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 47202  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47203 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 47260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29570
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29901 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 29802  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  29801 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcatt 29705  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||     
T  29704 aacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggc 29605  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    |  || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  29604 atttgggcagcattaataggagcaacagtagccat 29570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301580
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8301426 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8301525  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301526 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 8301580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18050968
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18051361 agatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 18051262  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  18051261 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 18051165  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  18051164 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 18051065  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18051064 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18050968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 495
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15893145
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15892865 agatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 15892964  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  15892965 acaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttg---aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 15893061  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 495  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15893062 aacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 15893145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4797205
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4796812 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4796911  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  4796912 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 4797008  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  4797009 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 4797108  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4797109 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741410
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  15741253 agatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 15741352  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741353 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 15741410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330611
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  18330768 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcat 18330669  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330668 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 18330611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8295917
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8296071 agatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcat 8295972  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295971 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 8295917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192258
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  6192415 aggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 6192316  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192315 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 6192258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29149071
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  29148914 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 29149013  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149014 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 29149071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880472
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  35880865 agatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 35880766  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  35880765 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 35880669  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  35880668 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 35880569  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  35880568 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 35880472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721337
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4721730 aggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 4721631  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||    |||| ||  |||| |||||    
T  4721630 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcatt 4721534  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||     
T  4721533 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggc 4721434  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4721433 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4721337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22388127
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  22387737 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcat 22387836  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||      || |||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  22387837 acaacattggtataggaggaaaagtcggtctagc------atattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 22387930  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |  || ||     
T  22387931 gacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacggggga 22388030  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    | |||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  22388031 aactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 22388127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116390
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  28116113 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcat 28116212  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  28116213 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 28116312  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28116313 gacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 28116390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277485
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  18277211 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18277310  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  18277311 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 18277407  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18277408 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18277485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292786
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  18292512 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18292611  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  18292612 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 18292708  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18292709 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18292786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18308087
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  18307813 agatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18307912  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||| ||  ||| ||  | || |||||    
T  18307913 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcatt 18308009  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18308010 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18308087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4416855
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4417018 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 4416919  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaac 375  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4416918 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaac 4416855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7072918
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  7073311 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 7073212  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  7073211 ataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 7073115  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  7073114 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 7073015  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  7073014 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 7072918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396075
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  10396232 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcat 10396133  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396132 acaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 10396075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964789
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  31964632 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31964731  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964732 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 31964789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134387
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  50134230 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 50134329  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134330 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 50134387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609638
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  5609481 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 5609580  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609581 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 5609638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023395
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  47023552 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 47023453  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023452 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 47023395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339244
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28339401 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28339302  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339301 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 28339244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996268
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  7996661 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7996562  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  7996561 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 7996465  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||| |||||     
T  7996464 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggc 7996365  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| |  || || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  7996364 atttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 7996268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10642776
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  10643169 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 10643070  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  10643069 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 10642973  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||| |||||     
T  10642972 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggc 10642873  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| |  || || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  10642872 atttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 10642776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674635
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  21674792 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcat 21674693  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674692 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 21674635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5713512 - 5713169
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5713512 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5713413  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  5713412 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5713313  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  5713312 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5713213  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5713212 ggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttg 5713169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5724422 - 5724079
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5724422 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5724323  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  5724322 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5724223  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  5724222 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5724123  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5724122 ggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttg 5724079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 5757055 - 5757398
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5757055 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5757154  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  5757155 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5757254  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  5757255 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5757354  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5757355 ggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttg 5757398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 5767946 - 5768289
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5767946 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccctt 5768045  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  5768046 gatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaa 5768145  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  5768146 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatc 5768245  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5768246 ggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttg 5768289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985272
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||    
T  17985115 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 17985214  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985215 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 17985272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211447
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  8211837 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 8211738  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||       || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| |   ||| ||  | || |||||    
T  8211737 acaacattggtataggaggaaaagttagtctag------tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcatt 8211644  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||     
T  8211643 gacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggc 8211544  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8211543 atttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 8211447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021241
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  28021374 agatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcat 28021275  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28021274 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225133
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  18225290 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 18225191  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18225190 acaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttg 18225133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5466953
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  5467084 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcat 5466985  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtcta 343  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  5466984 acaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596799
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  5596516 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 5596615  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag----ct--tgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaat 405  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||    ||  ||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |   ||||||  | ||    
T  5596616 acaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgat 5596715  T
Q  406 agcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
     ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5596716 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacgg 5596799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997366
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  |||    
T  36997236 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcat 36997335  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  36997336 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48465896
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  48466026 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcat 48465927  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  48465926 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346979
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  4346846 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 4346945  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4346946 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013654
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  | |    
T  5013811 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgt 5013712  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5013711 acaacattggtataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 5013654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871148
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  22871015 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22871114  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22871115 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886207
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  22886074 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 22886173  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22886174 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328101
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  24328258 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 24328159  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24328158 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 24328101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542753
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  6542621 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 6542720  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  6542721 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782034
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaag 300  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  51782122 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttagaag 51782034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110638
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  11110508 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 11110607  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11110608 acaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242681
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  18242838 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcat 18242739  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| |  ||||||||||||||    
T  18242738 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 18242681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 603
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16627049
Alignment:
Q  17 tcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggtta 116  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  117 gctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 216  Q
      |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  217 ggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaac 316  Q
     || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||  | || ||||| ||||| | |    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatc 16626769  T
Q  317 atcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgg 416  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||| ||| ||||||| || ||| || | ||||| || || ||||| ||||    
T  16626770 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgg 16626863  T
Q  417 gtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctg 516  Q
    ||||| ||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||| |  ||||||| |||    
T  16626864 gtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactg 16626963  T
Q  517 agcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  16626964 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgttt-cttcttcttatgatg 16627049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797123
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  212 aggtcggacctgaacc-tgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaag 300  Q
    || || |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  51797212 agatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttagaag 51797123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530108
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    | |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || |||||| |||||    
T  18530485 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatac 18530386  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattca 413  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||            |||||| || || ||| ||||||| || ||| || | ||||| || |  ||||| |    
T  18530385 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc------------ttgttgctgctgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 18530298  T
Q  414 cgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtag 513  Q
    |||| || |||||| | || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| | ||||||||     
T  18530297 cgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaa 18530198  T
Q  514 ctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| | ||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  18530197 ctgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 18530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577136
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 20577005  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20577006 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20577105  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20577106 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665259
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||     
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 29665128  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  29665129 agatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 29665228  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtct 342  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29665229 ataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292715
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  32292851 aggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 32292752  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  32292751 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 32292715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034409
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  31034276 aggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 31034375  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    | | ||| |||||  |||| || |||||||||||    
T  31034376 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Original strand, 17993757 - 17994250
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  17993757 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttcctt 17993856  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  17993857 ggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaa 17993956  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||     
T  17993957 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatc 17994056  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  17994057 agaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgag 17994150  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17994151 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652179
Alignment:
Q  21 gtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctt 120  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  121 tccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggac 220  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  221 ctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcg 320  Q
    | |||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||| |||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 5652378  T
Q  321 gtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtac 420  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||| ||||||||    
T  5652377 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtac 5652284  T
Q  421 ctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagca 520  Q
    ||||||| | || ||| ||||| |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  5652283 ctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagca 5652184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4626221 - 4625736
Alignment:
Q  34 ctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatg 133  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| || |||    
T  4626221 ctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatg 4626122  T
Q  134 agcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaa 233  Q
    || |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||     
T  4626121 agtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggag 4626022  T
Q  234 gcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 333  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| ||    
T  4626021 gcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaa 4625922  T
Q  334 agtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcct 433  Q
     ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |   |||| ||||||||||||||| | ||     
T  4625921 ggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgaccc 4625828  T
Q  434 gatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4625827 gatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 32439430 - 32438863
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  32439430 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 32439331  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  32439330 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 32439231  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  32439230 taaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaa 32439131  T
Q  335 gtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctg 434  Q
    || ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || |    
T  32439130 gttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccg 32439037  T
Q  435 atggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggc 534  Q
     ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| ||||| ||    
T  32439036 gtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagc 32438937  T
Q  535 gacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
     ||||||||| | ||  || | | || || || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32438936 aacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 32438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20066319 - 20066010
Alignment:
Q  35 tcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatga 134  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |    
T  20066319 tcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataa 20066220  T
Q  135 gcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaag 234  Q
    |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || || | |||||| ||| |    
T  20066219 gcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggagg 20066120  T
Q  235 caacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaa 334  Q
     || ||  | ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  20066119 taaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaa 20066020  T
Q  335 gtaggtctag 344  Q
    || |||||||    
T  20066019 gttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4893387 - 4892983
Alignment:
Q  134 agcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaa 233  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || || ||   |||||| |||     
T  4893387 agcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggag 4893288  T
Q  234 gcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaa 333  Q
    | || || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  4893287 gtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaa 4893188  T
Q  334 agtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcct 433  Q
    ||| ||||||||      || ||| || || || || |||||||| ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | ||     
T  4893187 agttggtctagc------atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggccc 4893094  T
Q  434 gatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacagggg 533  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| |    
T  4893093 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggag 4892994  T
Q  534 cgacagtagcc 544  Q
    | |||||||||    
T  4892993 caacagtagcc 4892983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 402 - 608
Target Start/End: Original strand, 22871220 - 22871426
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagta 501  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||    
T  22871220 caattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 22871319  T
Q  502 tggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtga 601  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||     
T  22871320 tgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 22871419  T
Q  602 tgtccat 608  Q
    |||||||    
T  22871420 tgtccat 22871426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 402 - 608
Target Start/End: Original strand, 22886279 - 22886485
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagta 501  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||    
T  22886279 caattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 22886378  T
Q  502 tggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtga 601  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||     
T  22886379 tgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 22886478  T
Q  602 tgtccat 608  Q
    |||||||    
T  22886479 tgtccat 22886485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5466880 - 5466691
Alignment:
Q  419 acctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgag 518  Q
    ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||    
T  5466880 acctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgag 5466781  T
Q  519 cagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    | ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||  ||||  |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  5466780 ctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 5466691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 489
Target Start/End: Original strand, 29665331 - 29665418
Alignment:
Q  402 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  29665331 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 29665418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 608
Target Start/End: Original strand, 15741433 - 15741634
Alignment:
Q  407 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 506  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |    
T  15741433 gcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 15741532  T
Q  507 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
    |||| |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15741533 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 15741632  T
Q  607 at 608  Q
    ||    
T  15741633 at 15741634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Original strand, 6542854 - 6543026
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  6542854 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgca 6542953  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542954 acagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 6543026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21674558 - 21674518
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21674558 tgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacgg 21674518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 48465780 - 48465740
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  48465780 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 48465740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 51781876 - 51781836
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  51781876 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 51781836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 51796965 - 51796925
Alignment:
Q  449 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 489  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  51796965 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 51796925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688079
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19688236 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 19688137  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688136 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 19688079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283256
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16283587 aggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcat 16283488  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  16283487 acaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatt 16283391  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     | ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |  |||||     
T  16283390 aatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggc 16283291  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccat 546  Q
    |  || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16283290 atttgggcagcattaataggagcaacagtagccat 16283256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137729
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2137336 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 2137435  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  2137436 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 2137532  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  2137533 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 2137632  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  2137633 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 2137729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277299
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16277692 agatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 16277593  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  16277592 ataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 16277496  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  16277495 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 16277396  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16277395 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 16277299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27609139
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27608982 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcat 27609081  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609082 acaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 27609139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557608
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14557762 agatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcat 14557663  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 366  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557662 ataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14557608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674183
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  19674579 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19674480  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| |||||    
T  19674479 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcatt 19674380  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  19674379 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 19674280  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || || |||||||| || ||||| |||| ||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  19674279 atttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccat 19674183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31490220
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  31489827 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 31489926  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    ||||||  | |||| ||  |||| |||||    
T  31489927 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcatt 31490023  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||   ||| | |||||  |||||     
T  31490024 gacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggc 31490123  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31490124 atttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 31490220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208594
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  19208437 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 19208536  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208537 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 19208594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362189
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28362032 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28362131  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362132 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 28362189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354505
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||    
T  31354662 agatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcat 31354563  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354562 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 31354505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258704
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  33258861 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 33258762  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33258761 acaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttg 33258704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286468
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||  |||    
T  19286600 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcat 19286501  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19286500 acaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710331
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  18710724 agatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcat 18710625  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||    || || || ||||| ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||  |||||    
T  18710624 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattg---ctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcatt 18710528  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||  |||||     
T  18710527 gacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggc 18710428  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  ||||| ||||| | ||| || || |||||||| || ||||  |||| ||  || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18710427 atttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18710331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092958
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  12092801 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcat 12092900  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  12092901 acaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgttgctgttgttgttg 12092958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829328
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  | |    
T  29829460 agatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgt 29829361  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29829360 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329716
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  3329584 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 3329683  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3329684 acaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354453
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgag-cttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattt 210  Q
    ||| |  |||||||| || |||||  |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  211 gaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    |||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||| |||| | || || ||| ||    
T  9354761 gaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagca 9354662  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcat 410  Q
    || ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| || |  ||||    
T  9354661 tataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcat 9354568  T
Q  411 tcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggagg 510  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||    
T  9354567 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggagg 9354468  T
Q  511 tagctgagcagcatt 525  Q
    |||||||||||||||    
T  9354467 tagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189258
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccag 186  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccag 189258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659423
Alignment:
Q  21 gtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctt 120  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  121 tccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggac 220  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  221 ctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcg 320  Q
    | |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  | |||| |||| | || || ||| |||| ||||| |    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattg 19659224  T
Q  321 gtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtac 420  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| ||      ||| || ||| |||| ||| |||| ||||| ||| || |  |||| || |  ||||| ||||||||    
T  19659225 gtatcagaggaaaggtaggtctagcctg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtac 19659318  T
Q  421 ctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagca 520  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  19659319 ctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagca 19659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 44563423 - 44562932
Alignment:
Q  26 ggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttcctt 125  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  44563423 ggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttcctt 44563325  T
Q  126 gatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaa 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  44563324 ggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaa 44563226  T
Q  226 cctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtatt 325  Q
    | ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||     
T  44563225 cttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 44563126  T
Q  326 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgag 425  Q
     |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||| ||| |||| || || ||| || |  |||| ||    ||||| |||||||||||||    
T  44563125 agaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgag 44563032  T
Q  426 gtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 525  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  44563031 gttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33244988 - 33244670
Alignment:
Q  27 gagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttg 126  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  33244988 gagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttg 33244889  T
Q  127 atcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaac 226  Q
     || ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  33244888 gtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaac 33244789  T
Q  227 ctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattg 326  Q
     | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  | |||| |||| | || || |||||||| ||||| |||||      
T  33244788 ttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatca 33244689  T
Q  327 gagggaaagtaggtctagc 345  Q
    |||| || |||||||||||    
T  33244688 gaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081023
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 246  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  247 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccct 280  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccct 22081023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 489
Target Start/End: Original strand, 19518280 - 19518494
Alignment:
Q  278 cctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc---tagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaa 374  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||   ||  |||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  19518280 cctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgttgaa 19518379  T
Q  375 ctggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacgg 474  Q
    | ||    || |||  | |||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19518380 ccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaagg 19518479  T
Q  475 atgttgagagtacgg 489  Q
    ||| ||||| |||||    
T  19518480 atgctgagaatacgg 19518494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14557573 - 14557372
Alignment:
Q  407 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 506  Q
    ||||| || ||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |    
T  14557573 gcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 14557474  T
Q  507 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtcc 606  Q
    |||| |  || || ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  14557473 gaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 14557374  T
Q  607 at 608  Q
    ||    
T  14557373 at 14557372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27037
Alignment:
Q  13 gacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  113 gttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 212  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  213 ggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacata 312  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27429 gatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcata 27330  T
Q  313 caacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattc 412  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||     
T  27329 taacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatta 27233  T
Q  413 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggta 512  Q
    |||||||| |||||| | || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  ||||| |    
T  27232 acgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 27133  T
Q  513 gctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
      || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27132 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 27037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 47 - 641
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaa-ca 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  247 agatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagca 346  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcat 410  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | |||| ||  |||| ||||    
T  347 tataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 443  T
Q  411 tcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggagg 510  Q
    | |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| | |||||  |||||    
T  444 taacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 543  T
Q  511 tagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
     |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  544 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7514
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  7357 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 7456  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7457 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 7514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9341
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9184 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 9283  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9284 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 9341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 19996
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20153 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 20054  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962650
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  10962807 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcat 10962708  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962707 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 10962650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793819
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  41793426 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 41793525  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    || |||  | ||||  |  |||| |||||    
T  41793526 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcatt 41793622  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||| | |||||  |||||     
T  41793623 gacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggc 41793722  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || || |||||||| || ||||  |||| ||  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  41793723 atttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 41793819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28584961
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28585118 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcat 28585019  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585018 ataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 28584961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638198
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  51638355 agatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 51638256  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638255 acaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 51638198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208300
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||   ||||    
T  16208151 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatac 16208250  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttg 363  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16208251 aacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttg 16208300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 525
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340760
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||  | || | |||  |||    
T  20340453 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 20340552  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||      || |||||||| ||| |||| || || ||| || | || || || |  |||||    
T  20340553 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctga------tgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcatt 20340646  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||| |  ||||||    
T  20340647 gacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggt 20340746  T
Q  512 agctgagcagcatt 525  Q
    ||||||||||||||    
T  20340747 agctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151863
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||  |||||| ||||| |||  |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || | ||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| |||| || ||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||    
T  28151999 aggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcat 28151900  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28151899 atagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 28151863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461082
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    |||||||||||  |||||  |||| |||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    | |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  ||||     
T  20461216 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatat 20461117  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    | |||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20461116 agcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 20461082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460857
Alignment:
Q  407 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 506  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| || |    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  507 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || ||| |||| |||||||| |||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctttcttcttatgatg 20460857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51638134 - 51637962
Alignment:
Q  436 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 535  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  51638134 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagca 51638035  T
Q  536 acagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  51638034 acagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 51637962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30198
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||     
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 30591  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |  ||  |||    
T  30590 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcat 30491  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    || |||  | |||| ||  | || |||||    
T  30490 acaacattggtatagga-ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgt---tgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcatt 30395  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||     
T  30394 aacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggc 30295  T
Q  512 agctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    |  || || ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||  |||| ||  || ||||| || |  || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30294 atttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 30198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20390
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatac 313  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||| | || |||||| |||||    
T  20524 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatac 20425  T
Q  314 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  20424 aacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttg 20390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20162
Alignment:
Q  407 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 506  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  507 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatg 603  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |  |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 20162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15205
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||    
T  15048 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcat 15147  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148 acaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 15205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26477
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  212 aggtcggacctgaacc-tgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaaca 310  Q
    || || |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| | |||  ||    
T  26319 agatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgca 26418  T
Q  311 tacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 369  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26419 tacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 26477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9571
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| |  ||  |||    
T  9704 agatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcat 9605  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9604 acaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 7977
Alignment:
Q  419 acctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgag 518  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||    
T  8166 acctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgag 8067  T
Q  519 cagcattaacaggggcgacagtagccatagactgacttgctctagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 608  Q
    | ||||| | ||| || |||||||||| ||| ||||  |||| ||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8066 ctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 7963
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||    
T  8087 agatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcat 7988  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7987 acaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6015
Alignment:
Q  20 agtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagct 119  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  120 ttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttc-aaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatg-gaaatcacatttgaggtcg 217  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| ||     
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  218 gacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagt-aaagtcagaagcaactcaacata-caa 315  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||  ||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaagcaactcagcatataaa 6045  T
Q  316 catcggtattggagggaaag-taggtctag 344  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  6044 catcggtataggaggaaaagttaggtctag 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2103
Alignment:
Q  14 acatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaagg 113  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  114 ttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  214 gtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccct 280  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2037 gtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 348
Target Start/End: Original strand, 46756 - 47072
Alignment:
Q  48 tcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaag-gttagcttt-ccttgatcaatgagcttttttacg 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  46756 tcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacg 46855  T
Q  146 atgtacttcaaagcata-gcacccctcgacatc-at--gacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacc-tgaacctgggaagcaacgg 240  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  46856 atatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacgg 46955  T
Q  241 atcaggtgggggc--ttgccctgtct-ggttgtacaatg-ccctctatggagtaaa---gtcagaagcaactcaacatacaacatc-ggtattggaggg- 331  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  46956 atcaggtgggggcgtttgccctgtctaggttgtacaatgtccctctatggagtaaatcggggggaagcaactcagcatacaacatcgggtatcggaggga 47055  T
Q  332 aaagtaggtctagcttg 348  Q
    |||||||||||||||||    
T  47056 aaagtaggtctagcttg 47072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 525
Target Start/End: Original strand, 2576 - 3083
Alignment:
Q  12 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 111  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  112 ggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 211  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  212 aggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacat 311  Q
    ||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||  | || | |||  |||    
T  2776 aggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcat 2875  T
Q  312 acaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcatt 411  Q
    | | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||      || |||||||| ||| |||| || || ||| || | || || || |  |||||    
T  2876 atagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctga------tgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcatt 2969  T
Q  412 cacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggt 511  Q
     ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||| |  ||||||    
T  2970 gacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggt 3069  T
Q  512 agctgagcagcatt 525  Q
    ||||||||||||||    
T  3070 agctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 348
Target Start/End: Original strand, 5 - 282
Alignment:
Q  71 ggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacgatgtacttcaaagcatagcacccct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  5 ggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 104  T
Q  171 cgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  105 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttga 204  T
Q  271 acaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 348  Q
     || ||||||||  | |||| |||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  205 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 397 - 1
Alignment:
Q  42 cttcaatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttt 141  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || || |||||||| ||   | | |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |     
T  397 cttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctg 298  T
Q  142 tacgatgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacgga 241  Q
     || || ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |  |  ||||| ||  | || |||    
T  297 gacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatgga 198  T
Q  242 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtc 341  Q
    || || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  197 tctggcggaggcttaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcc 98  T
Q  342 tagc------ttgctgattttgttgttgttgttgctgaactggtggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcc 432  Q
    ||||       ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97 tagcaaaatgctgctgttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21641
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcagg 246  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||| | | |||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  247 tgggggcttgccctgtctggttgt 270  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgt 21641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 571 - 728
Alignment:
Q  47 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaggttagctttccttgatcaatgagcttttttacga 146  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  571 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaa 670  T
Q  147 tgtacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatc 204  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  671 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University