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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9051_low_3 (Length: 560)
Name: NF9051_low_3
Description: NF9051
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9051_low_3 |
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| [»] scaffold0208 (2 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0363 (1 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 493; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11841813 - 11841270
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
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| T |
11841813 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaacc |
11841714 |
T |
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| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
11841713 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttgccacaaattctcataaagtgattgtcttgtttggttttgagataatattatggagaattgtgga |
11841614 |
T |
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| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
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| T |
11841613 |
tttagcaagttcagtgtgagtaagtttatattcctagttcaatatgtcaattttattttatttagtcaacgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
11841514 |
T |
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| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
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| T |
11841513 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagttcctggggacacctcttctgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
11841414 |
T |
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| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaataagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
500 |
Q |
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| T |
11841413 |
atcacaaaagagttatatcaataagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
11841314 |
T |
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| Q |
501 |
tattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
11841313 |
tattg-cccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
11841270 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10762726 - 10762192
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
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| T |
10762726 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgacacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatgatttgcaaagtcatgaaatc |
10762627 |
T |
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| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
10762626 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcatgaagtaattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtgga |
10762527 |
T |
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| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
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| T |
10762526 |
tttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaag |
10762427 |
T |
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| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
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| T |
10762426 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcctggggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggat |
10762327 |
T |
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| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
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| T |
10762326 |
atcacaaaagagttatatcaataaagttgtaaatgaaatgac----------ataatttttggatgacctcaatcaccgagagagactttgcagtctcaa |
10762237 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
10762236 |
atatag-cccattaggaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
10762192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 42193301 - 42192766
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
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| T |
42193301 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
42193202 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacc-acaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgg |
199 |
Q |
| |
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| T |
42193201 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtgg |
42193102 |
T |
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| Q |
200 |
atttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
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| T |
42193101 |
acttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaactaa |
42193002 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
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| T |
42193001 |
ggaaatctctaacaaaagttagtgatgtaagatcctagggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgga |
42192902 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
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| T |
42192901 |
tatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------gtaatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtctca |
42192812 |
T |
|
| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
42192811 |
aatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
42192766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 49155772 - 49156305
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
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| T |
49155772 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatttgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
49155871 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
49155872 |
cacttataagttaagaaatttgtctcttt-gtgttaccaaaaattctcattaagtaattattttatttggttttgagataatattatggagaattgtgga |
49155970 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
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| T |
49155971 |
tttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgttaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaag |
49156070 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
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| T |
49156071 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcctggggacacctcttttgtattagacatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggat |
49156170 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
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| T |
49156171 |
atcacaaaagagttatatcaataaagttgtaaatgaaatgac----------ataatttttggatgacctcaaccaccgagaaagactttccagtctcga |
49156260 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
49156261 |
atattg-cccattagaaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
49156305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 38451137 - 38450608
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
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| T |
38451137 |
tgtttcttaatgatgacatcaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaagtagatggtttaaaaagacatgaaatcc |
38451039 |
T |
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| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctcttt-agtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
38451038 |
acttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttggttttgagataatattatggagagttgtgga |
38450939 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
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| T |
38450938 |
tttaacaagttcagtgggagtaagtttatgttcctagtttaatatgtcaattttatttt---tagtcaacgttgatatatgttttttatgtgagaccaag |
38450842 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
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| T |
38450841 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatccttgggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgaat |
38450742 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38450741 |
atcacaaaagagttatttcaataaagttgaaaataaaatgac----------atattttttggatgaccccaatcacc-aaagagacttttcagtctcaa |
38450653 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38450652 |
atattg-cctattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
38450608 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10240283 - 10239751
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10240283 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaagtagatggtttaaaacggcatgaaatcc |
10240185 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctcttt--agtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgg |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10240184 |
acttataagttaagaaatttgtctttttttagtgttaccacaaattctcatgaaccaattgtctcatttggttttgagataatattatggagagttgtgg |
10240085 |
T |
|
| Q |
200 |
atttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
10240084 |
atttaacaagttcagtgggagtaagtttatgttcctagtttaatatgtcaattttatttt---tagtcaacattgatatatgttttttatgtgagaccaa |
10239988 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10239987 |
ggaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatccttgggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagatttttctcaaggtattatttgaa |
10239888 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10239887 |
tatcacaaaagagttatttcaataaagttgaaaataaaatgacat---attt------ttttggatgaccccaatcaccaagagagacttttcagtctca |
10239797 |
T |
|
| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10239796 |
aatattg-cctattagaaaatttatgaattcaaaaatataagtattt |
10239751 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 245 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24645286 - 24644996
Alignment:
| Q |
245 |
tgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacc |
344 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | || |||| |
|
|
| T |
24645286 |
tgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaaggaaatctctaacaaaagttagtgatggaagatcttcggaacact |
24645187 |
T |
|
| Q |
345 |
tcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacat |
443 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
24645186 |
tcttttgtattaagcatttcaatacttatagattattctcaaggtattattcggatatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac-- |
24645089 |
T |
|
| Q |
444 |
taaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtat |
543 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
24645088 |
--------ataatttttggatgatctcaatcatcgagagagacttttcagtctcaaatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtat |
24644998 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 29596630 - 29596439
Alignment:
| Q |
272 |
atgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaag-ttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatact |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||| || || || || |
|
|
| T |
29596630 |
atgatatatgttagttatgtgaaaccaagaaaatctctaacataagtttagcgatgaaagatcctagaaacacttcttttgtattagacaatttgatgct |
29596531 |
T |
|
| Q |
371 |
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464 |
Q |
| |
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| T |
29596530 |
tagagactcttcttaatg---tatttagatatcacaaaagagtcatattaataaaattgaaaagaaattgacattaaagttaataaattatgggt |
29596439 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29596877 - 29596672
Alignment:
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Q |
| |
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gtgtttcttaacgacaacattgatgatacaatatggtgcaaccaaagaaaactt--gtgtcaatagatacaaagtcgttggtttgcaaagtcatgaaatt |
29596780 |
T |
|
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196 |
Q |
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| T |
29596779 |
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29596680 |
T |
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197 |
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204 |
Q |
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| T |
29596679 |
tggattta |
29596672 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:
Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 10484 - 11018
Alignment:
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100 |
Q |
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gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
10583 |
T |
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101 |
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200 |
Q |
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| T |
10584 |
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10683 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
10684 |
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10783 |
T |
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| Q |
301 |
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400 |
Q |
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| T |
10784 |
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10883 |
T |
|
| Q |
401 |
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499 |
Q |
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| T |
10884 |
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10973 |
T |
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500 |
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545 |
Q |
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| T |
10974 |
atattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
11018 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 29218 - 29752
Alignment:
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Q |
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T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
29318 |
cacttgtaagttaagaaatttgtctctttagtgttacagcaaattctcataaagtaattgtctcgtttggttttgagataatattatggagaattatgaa |
29417 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctag-tttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
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| T |
29418 |
tttagtaagctcagtgggagtaaatttatattttgagttttaatgtgtcaattttattttatttagtcaactacgatatatgtctgttatgttaaaccaa |
29517 |
T |
|
| Q |
300 |
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398 |
Q |
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| T |
29518 |
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29614 |
T |
|
| Q |
399 |
atatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatg-ggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtct |
496 |
Q |
| |
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| T |
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gtatcacaaaagatttatatctatgaagttgaaaataaattgacattaaagttaataaattatgaggtgacttcaatcaccgagagagacttttcagtct |
29714 |
T |
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| Q |
497 |
caaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaat |
535 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
29715 |
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29752 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12688248 - 12687715
Alignment:
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T |
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cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
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T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
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gaaatctctaac-aaagttagtgatgaaagatcctggggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggat |
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T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12687849 |
atcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------ataatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
12687760 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
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atattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
12687715 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 545
Target Start/End: Original strand, 41295383 - 41295898
Alignment:
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142 |
Q |
| |
|
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|
|
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41295482 |
T |
|
| Q |
143 |
att-------------ctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaagtttat |
229 |
Q |
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| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
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| T |
41295483 |
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41295582 |
T |
|
| Q |
230 |
attcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaa |
329 |
Q |
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| T |
41295583 |
atttctagtttaatacgtcaattttattttattcaatcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaatcaaggaaatctctaacaaaagttagtgatgaaa |
41295682 |
T |
|
| Q |
330 |
gatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttg |
428 |
Q |
| |
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| T |
41295683 |
gatcctagggacacctcttttgtattaggcattttattacgtagagattcttctcaaggtattattcggatatcacaaaagagttatatcaataaagttg |
41295782 |
T |
|
| Q |
429 |
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528 |
Q |
| |
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| T |
41295783 |
aaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattg-cccattaggaaatttatgaatt |
41295881 |
T |
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| Q |
529 |
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545 |
Q |
| |
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| T |
41295882 |
cagaaatttaagtattt |
41295898 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32096282 - 32095748
Alignment:
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
32096182 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtgga |
32096083 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
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| T |
32096082 |
tttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgtcatgtggaaccaag |
32095983 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
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| T |
32095982 |
gaaatctctaacaaaagttagcgatgaaagatcctggggacacatcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggat |
32095883 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
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| T |
32095882 |
atcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaattac----------ataatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
32095793 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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| T |
32095792 |
atattg-cccgttagaaaatttataaattcataaatttaagtattt |
32095748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28527452 - 28526919
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
| |
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| T |
28527352 |
cacttataagttaagaaatttgtctcttt-gtgttaccaaaaattctcattaagtaattattttatttggttttgagataatattatggagaattgtgga |
28527254 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
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| T |
28527253 |
tttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgttaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaag |
28527154 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
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| T |
28527153 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcctggggacacctcttttgtattagacatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggat |
28527054 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
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| T |
28527053 |
atcacaaaagagttatattaataaagttgtaaatgaaatgac----------ataatttttggatgacctcaaccaccgagaaagactttccagtctcga |
28526964 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
28526963 |
atattg-cccattagaaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
28526919 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19061790 - 19061257
Alignment:
| Q |
1 |
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| |
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| T |
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T |
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cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
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Q |
| |
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19061690 |
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T |
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201 |
tttagcaagttcagtgggagtaa------gtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaa |
294 |
Q |
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| T |
19061590 |
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19061493 |
T |
|
| Q |
295 |
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394 |
Q |
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| T |
19061492 |
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19061397 |
T |
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| Q |
395 |
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493 |
Q |
| |
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| T |
19061396 |
tcggacatcgcaaaagacttatatcaataaagttgaaaatgaaatgaca-------taat--tttttggatgacctcaatcatcgagagagac--ttcag |
19061308 |
T |
|
| Q |
494 |
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545 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19061307 |
tctcaaatattg-tccattaggaaatttatgaattcagaaaattaagtattt |
19061257 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 424
Target Start/End: Original strand, 26508434 - 26508676
Alignment:
| Q |
181 |
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280 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |
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| T |
26508434 |
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26508532 |
T |
|
| Q |
281 |
gttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattct |
380 |
Q |
| |
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||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
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| T |
26508533 |
gtttgttatgttaaaccaataaaatctctaatgaaaattagcgatgaaagatcttaggaacacctcttttgtattaggcttttcgatacttagagattcc |
26508632 |
T |
|
| Q |
381 |
tctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaataa |
424 |
Q |
| |
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| T |
26508633 |
tctcaaggtatcattcaaatatcacaaaagagttatattaataa |
26508676 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 6101588 - 6102122
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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gtgtttcttaatggtgacattaatgatacaatatggtgcagctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
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T |
|
| Q |
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200 |
Q |
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| T |
6101688 |
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6101787 |
T |
|
| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
6101788 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatactcctagtttaatatgtcaattttattttatatactcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaag |
6101887 |
T |
|
| Q |
301 |
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400 |
Q |
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| T |
6101888 |
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6101987 |
T |
|
| Q |
401 |
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499 |
Q |
| |
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| T |
6101988 |
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6102077 |
T |
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| Q |
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545 |
Q |
| |
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| T |
6102078 |
atattg-tccataagaaaattcatgaattcagaaatttaagtattt |
6102122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21772660 - 21772120
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
21772660 |
gtgtttcttaatgatgacgttaatgatgcaatatggtgcaactgaatcagactttgga-tcaattgatacaaagtagatggtttaaaaaggcatgaaatc |
21772562 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
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| T |
21772561 |
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21772462 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
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| T |
21772461 |
tttagtaagctccgagggagaaaatttatatttcaagtttaatgtgtcaattatattttatttagtcaacgatgatatatgtttgtcatgtgaaaccaag |
21772362 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
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| T |
21772361 |
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21772264 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaataagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
500 |
Q |
| |
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| T |
21772263 |
atcacaaaagagttatatcaataagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagactttttagtctcaaa |
21772164 |
T |
|
| Q |
501 |
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545 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21772163 |
tattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatataagtattt |
21772120 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21192941 - 21192412
Alignment:
| Q |
16 |
gacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaag |
115 |
Q |
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| T |
21192941 |
gacattaacgatacaatatggtgcaatccaataattcttttatatcgatagatacaaagtagatggtttgcaaagtcatgaaatcgacttataagttaag |
21192842 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
21192841 |
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21192742 |
T |
|
| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
21192741 |
gggagtaattttatattcctattataatgtgtcgattttattttatttagtcaactgtgatatatgtcacttatgtgaaaccaagaaaatctctaacaaa |
21192642 |
T |
|
| Q |
316 |
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414 |
Q |
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| T |
21192641 |
agttagtgatgaaagattccagggacacctcttttgtattaaaacatttcaatacttagagattcttctcaagatattatttaaatatcacaaaagagtt |
21192542 |
T |
|
| Q |
415 |
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514 |
Q |
| |
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| T |
21192541 |
atatcaataagttgaaaataaattgacattaaggttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattg-tccattag |
21192443 |
T |
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| Q |
515 |
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545 |
Q |
| |
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| T |
21192442 |
aaaatttatgaattcaaaaatataagtattt |
21192412 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32031541 - 32031008
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
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||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
32031541 |
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32031442 |
T |
|
| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
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| T |
32031441 |
acttataagttaagaaatttgtctctttattggtaggacatattctcgtaaagcaattatctcatttggttttgagataatattatggagaattgtggat |
32031342 |
T |
|
| Q |
202 |
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301 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
32031341 |
ttagcaaattcagtgggagaaagtttatattcatagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaatcatgatatatgtttgttatgtgaaaccaagg |
32031242 |
T |
|
| Q |
302 |
aaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaata |
401 |
Q |
| |
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| T |
32031241 |
aaatctttaacaaaagttagtgatgaaagatcctggagacacctcttttgtattatgcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcagaca |
32031142 |
T |
|
| Q |
402 |
tcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
500 |
Q |
| |
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| T |
32031141 |
tcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgac----------ataatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtcttaaa |
32031052 |
T |
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| Q |
501 |
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545 |
Q |
| |
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|
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| T |
32031051 |
tatt-tcccattaggaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
32031008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 8652878 - 8652348
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
8652878 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaagtagatggtttaaaaaagcatgaaatcc |
8652780 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctcttt-agtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8652779 |
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8652680 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
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| T |
8652679 |
tttaacaagttcagtgggagtaagtttatgtacctagtttaatatgtcaattttatttt---tagtcaacattgatatatgttttttatgtgagaccaag |
8652583 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
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| T |
8652582 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatccttgggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagatttttctcaaggtattattcgaat |
8652483 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
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| T |
8652482 |
atcacaaaagagttatttcaataaagttgaaaataaaatgac----------atattttttggatgaccccaatcaccaagagagacttttcaatctcaa |
8652393 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8652392 |
atattg-cctattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
8652348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 17579760 - 17580150
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
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||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17579760 |
tgtttctcaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaacttaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtagatgttttgcaaaatcatgaaatcc |
17579859 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggat |
201 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |
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| T |
17579860 |
acttatgagttaagaaatttgtctctttatttttactacatattctcataaagcaattatctcatttgcttttgacataatattatggagaattgtggat |
17579959 |
T |
|
| Q |
202 |
ttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaagg |
301 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
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| T |
17579960 |
ttagcaaattcagtgggagtaagtttatatttatagtttaatatgtcaa-tttactttatttagtcaacgatgatatatgtttgttttgtgaaaacaaga |
17580058 |
T |
|
| Q |
302 |
aaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtatta |
393 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
17580059 |
aaatctctaacggaagttagtgatgaaagatcttgaggacacctcttttatattagacatttcaatatttagagattcttctcaaggtatta |
17580150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 12436753 - 12436830
Alignment:
| Q |
78 |
atggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagt |
155 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12436753 |
atggtttgaaaagtcataaaatgcacttatgtgttaagaaatttgtctctttattgctaccacaaattctcataaagt |
12436830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Original strand, 12436881 - 12436953
Alignment:
| Q |
247 |
tcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagtt |
319 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
12436881 |
tcaattatattttatttagtcaactatgatatatgttagttatgtgaaaccaagcaaatttctaacaaaagtt |
12436953 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 508
Target Start/End: Original strand, 12437053 - 12437158
Alignment:
| Q |
404 |
acaaaagagttatatcaataa-gttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaata |
502 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
12437053 |
acaaaagagttatattaataaagttgaaaataaattgacataaacaataagaaattatgggcgacctcaatcaccaagagagaatatttagtctctaata |
12437152 |
T |
|
| Q |
503 |
ttgccc |
508 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12437153 |
ttgccc |
12437158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 545
Target Start/End: Original strand, 17580178 - 17580251
Alignment:
| Q |
471 |
aatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
17580178 |
aatcactgagagagacttttcagtctcaaaaatt-tcccattagcaaatttaggaattgaaaaatctaaatattt |
17580251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 13460119 - 13460654
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13460119 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
13460218 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacc-acaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgg |
199 |
Q |
| |
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|
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| T |
13460219 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtgg |
13460318 |
T |
|
| Q |
200 |
atttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
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| T |
13460319 |
acttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaactaa |
13460418 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
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| T |
13460419 |
ggaaatctctaacaaaagttagtgatgtaagatcctagggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgga |
13460518 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
| |
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| T |
13460519 |
tatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------gtaatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtctca |
13460608 |
T |
|
| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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|
| T |
13460609 |
aatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
13460654 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 2 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 35086742 - 35086223
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35086742 |
tgtttctcaatggtgacattaatgatactatatggcgcaaccacataaaacttt-gtgtcattagatacaaagtagatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
35086644 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggat |
201 |
Q |
| |
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| T |
35086643 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttagttttgagataatattaagtagagttgtggat |
35086544 |
T |
|
| Q |
202 |
ttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaagg |
301 |
Q |
| |
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|
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| T |
35086543 |
ttagtaagcttagtgggagtaattttatattgctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaa-caaga |
35086445 |
T |
|
| Q |
302 |
aaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaata |
401 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
35086444 |
aaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcctggggagacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttggata |
35086345 |
T |
|
| Q |
402 |
tcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
500 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
35086344 |
tcac--aagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgac----------ataatttttggatgacctcaatcatcgagagagacttttcagtctcaaa |
35086257 |
T |
|
| Q |
501 |
tattgccccattagaaaatttatgaattcagaaat |
535 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |
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| T |
35086256 |
tattg-cccattaggaaatttatgtattcataaat |
35086223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 545
Target Start/End: Original strand, 23341691 - 23342209
Alignment:
| Q |
17 |
acattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaaga |
116 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23341691 |
acattaatgatacaatatggtgcaactaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaaggagaaggtttgcaaactgatgaaatccacttataagttaaga |
23341790 |
T |
|
| Q |
117 |
aatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtg |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||| || |||| || || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23341791 |
aatttgtctctttagtattaccacaaattctcatgaaggaattgtctcatttggttttgagataatataatagagagttttgaatttagtaagttcagtg |
23341890 |
T |
|
| Q |
217 |
ggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23341891 |
ggagtaaatttatgttttgagttttatgtgtcgattttattttatttagtcaacaatgatatatgtttgttatgtgaaaccaaggaaatctctaacaaaa |
23341990 |
T |
|
| Q |
317 |
gttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttat |
416 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || || ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23341991 |
gttagtgatgaaagatcctaggaacgcctttttggtattaggcatttcaatacttagagattcttctaaaggtattattcagatatcacaaaagagttat |
23342090 |
T |
|
| Q |
417 |
atcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattaga |
515 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||| |||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23342091 |
atcaataaagttgaaaatgaaatgac----------ataatttttggatgacctcaatcatcgagagagacttttcactcttaaatattg-cccattaga |
23342179 |
T |
|
| Q |
516 |
aaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
23342180 |
aaatttatgaattcggaaatttatgtattt |
23342209 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35440956 - 35440918
Alignment:
| Q |
507 |
cccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35440956 |
cccattagaaaatttatgaattcagaaacttaagtattt |
35440918 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 25383616 - 25383081
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25383616 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
25383517 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacc-acaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgg |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25383516 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtgg |
25383417 |
T |
|
| Q |
200 |
atttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
25383416 |
acttagcaagttcagtgggagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaactaa |
25383317 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25383316 |
ggaaatctctaacaaaagttagtgatgtaagatcctagggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgga |
25383217 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25383216 |
tatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------gtaatttttggatgacctcaatcaccgagagagacttttcagtctca |
25383127 |
T |
|
| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
25383126 |
aatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
25383081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 38145942 - 38145411
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38145942 |
gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaattaaacggtttgcatggtcatgaaatc |
38145843 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38145842 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttggcaaaaattctcataaagtaattgtcttatttgcttttgagataatattatggagaattgtgga |
38145743 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38145742 |
tttagcaagttcattggaagtaattttatatttctagtttaatatgtcaattttattttattcaatcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaacca-- |
38145645 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
38145644 |
-aaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcctggggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaagggattattcggat |
38145546 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38145545 |
atcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------ataatttttggacgatctgaatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
38145456 |
T |
|
| Q |
500 |
atattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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|
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| T |
38145455 |
atattg-cccattaagaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
38145411 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 31056138 - 31056672
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
31056138 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatacaaagtagatggtttaaaaaggcatgaaatc |
31056236 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctcttt-agtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgg |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31056237 |
cacttataagttaagaaatttgttttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttagttttgagataatattatggagaattgtgg |
31056336 |
T |
|
| Q |
200 |
atttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
| |
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|||||| ||| |||||||||| || |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |
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|
| T |
31056337 |
atttagtaagctcagtgggagaaaatttatatttcaagtttaatgtgtaaattatattttatttagtcaacgatgatatatgtttgtcatgtgaaaccaa |
31056436 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
| |
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|||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
31056437 |
-taaatctctaataaaagttagtgatgaaagatcttggggacgcctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgga |
31056535 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
31056536 |
tatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgaca-------taat--tttttggatgatctcaatcatcgagagagacttttcagtctca |
31056626 |
T |
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| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
31056627 |
aatattg-cccattaggaaatttatgtattcagaaatttaagtattt |
31056672 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15375937 - 15375724
Alignment:
| Q |
17 |
acattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaaga |
116 |
Q |
| |
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||||||| ||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
15375937 |
acattaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaattatatgat--gcaaaatcatgaaatccacttatgaggtaaga |
15375840 |
T |
|
| Q |
117 |
aatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtg |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
15375839 |
aatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaagcaattgtctcatttggtttagagatagtattatggagagttgtggatttagtaagttcagtg |
15375740 |
T |
|
| Q |
217 |
ggagtaagtttatatt |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15375739 |
ggagtaaatttatatt |
15375724 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35150068 - 35149525
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35150068 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatacaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaattagatggtttgcaacatcatgaaatc |
35149969 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
| |
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| T |
35149968 |
cacttataagttaaaaaatttgtctctttattgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttggttttaagataatattatggagaattgtgga |
35149869 |
T |
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| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctag-tttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaa |
299 |
Q |
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| T |
35149868 |
tttagtaagctcagtgggagtaaatttatattttgatattttatgtgtcaattatattttatttagtcaacgatgatatatgtttgtcatgtgaaaccaa |
35149769 |
T |
|
| Q |
300 |
ggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaa |
399 |
Q |
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| T |
35149768 |
g-aaatctctaataaatgttagtgatgaatgatcttggggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaga |
35149670 |
T |
|
| Q |
400 |
tatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctca |
498 |
Q |
| |
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|
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| T |
35149669 |
tatcac-aaagagttatatcaataaagttgaaaataaattgacattaaagtttataaattataggtgacctcaatcaccgagagagacttttcaatctca |
35149571 |
T |
|
| Q |
499 |
aatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
35149570 |
aatagtg-cccattagaaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
35149525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3813239 - 3812702
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3813239 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatacaaagtagatggtttaaaaaggcatgaaatc |
3813141 |
T |
|
| Q |
101 |
cacttataagttaagaaatttgtctcttta----gtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattg |
196 |
Q |
| |
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| T |
3813140 |
cacttataagttaagaaatttgttttttttttttgtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttagttttgagataatattatggagaattg |
3813041 |
T |
|
| Q |
197 |
tggatttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaac |
296 |
Q |
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| T |
3813040 |
tggatttagtaagctcagtgggagaaaatttatatttcaagtttaatgtgtaaattatattttatttagtcaacgatgatatatgtttgtcatgtgaaac |
3812941 |
T |
|
| Q |
297 |
caaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattattt |
396 |
Q |
| |
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| T |
3812940 |
caa-taaatctctaataaaagttagtgatgaaagatcttggggacgcctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattc |
3812842 |
T |
|
| Q |
397 |
aaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtc |
495 |
Q |
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| T |
3812841 |
ggatatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgaca-------taat--tttttggatgatctcaatcatcgagagagacttttcagtc |
3812751 |
T |
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| Q |
496 |
tcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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| T |
3812750 |
tcaaatattg-cccattaggaaatttatgtattcagaaatttaagtattt |
3812702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 232 - 543
Target Start/End: Original strand, 8499278 - 8499589
Alignment:
| Q |
232 |
tcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaaga |
331 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8499278 |
tcctattttaatgtgttgattttattttatttagtcaactatgatatattttagtaatgtaaaaccaagtaaatctctaacaaaagttaatgatgaaaga |
8499377 |
T |
|
| Q |
332 |
tcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaa |
430 |
Q |
| |
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| T |
8499378 |
tcctggggatacctcttttgtattaggcatttcattacctagagattcttctcaagttattattcggatatcacaaaagagttatatcagtaaagttgaa |
8499477 |
T |
|
| Q |
431 |
aataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattca |
530 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8499478 |
aataaattgacattaaagttaataaattatggatgacgtcaatcaccgagaaggacttttaagtctcaaatattg-cccattagaaaatttatgaattca |
8499576 |
T |
|
| Q |
531 |
gaaatataagtat |
543 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
| T |
8499577 |
gaaatttaagtat |
8499589 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Original strand, 349918 - 350198
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
349918 |
tgtttctcaatggtgacattaatgatactatacggcgcaaccacataaaacttt-gtgtcattagatacaaagtagatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
350016 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggat |
201 |
Q |
| |
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| T |
350017 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttcccacaaattgtcataaagtaattgtctcatttagttttgagataatattaagtagagttgtggat |
350116 |
T |
|
| Q |
202 |
ttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgtt |
283 |
Q |
| |
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|
|
| T |
350117 |
ttagtaagcttagtgggagtaattttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaacgatgatatatgtt |
350198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 232 - 543
Target Start/End: Original strand, 8486212 - 8486523
Alignment:
| Q |
232 |
tcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaaga |
331 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
8486212 |
tcctattttaatgtgttgattttattttatttagtcaactatgatatattttagtaatgtaaaaccaagtaaatctctaacaaaagttaatgatgaaaga |
8486311 |
T |
|
| Q |
332 |
tcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaa |
430 |
Q |
| |
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|
| T |
8486312 |
tcctagggatacctcttttgtattaggcatttcattacctagagattcttctcaagttattattcggatatcacaaaagagttatatcagtaaagttgaa |
8486411 |
T |
|
| Q |
431 |
aataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattca |
530 |
Q |
| |
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| T |
8486412 |
aataaattgacattaaagttaataaattatggatgacgtcaatcaccgagaaggacttttaagtctaaaatattg-cccattagaaaatttatgaattca |
8486510 |
T |
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| Q |
531 |
gaaatataagtat |
543 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8486511 |
gaaatttaagtat |
8486523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 399 - 543
Target Start/End: Original strand, 8521188 - 8521332
Alignment:
| Q |
399 |
atatcacaaaagagttatatcaataa-gttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctc |
497 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||| |
|
|
| T |
8521188 |
atatcacaaaagagttatatcagtaaagttgaaaataaattgacattaaagttaataaattatggatgacgtcaatcaccgagaaaaacttttaagtctc |
8521287 |
T |
|
| Q |
498 |
aaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtat |
543 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8521288 |
aaatattg-cccattaggaaatttatgaattcagaaatttaagtat |
8521332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 350251 - 350424
Alignment:
| Q |
363 |
tcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatg |
461 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || || |
|
|
| T |
350251 |
tcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggatatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgaca-------taat--tttttg |
350341 |
T |
|
| Q |
462 |
ggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
350342 |
gatgacctcaatcatcaagagagacttttcagtctcaaatattg-cccataaggaaatttatgtattcagaaatttaagtattt |
350424 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 4 - 545
Target Start/End: Original strand, 48165272 - 48165803
Alignment:
| Q |
4 |
tttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccac |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48165272 |
tttcttaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaactaaataaagcttttgtgttaattgatacaaagtagatagtttgcaaagtcatgaaatccac |
48165371 |
T |
|
| Q |
104 |
ttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggattt |
203 |
Q |
| |
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|
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| T |
48165372 |
ttgtaagttaaaaaatttgtctctttagtgttacaacaaattctcataaagtaattgtctcgtttggttttgagataatattaagtagagttgtggattt |
48165471 |
T |
|
| Q |
204 |
agcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaa |
303 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
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| T |
48165472 |
agtaagcttagtgggagtaattttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaa-caaggaa |
48165570 |
T |
|
| Q |
304 |
atctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatc |
403 |
Q |
| |
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| T |
48165571 |
atctctaacaaaagttaatgatgaaagatcctggagacacctcttttatattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggatatc |
48165670 |
T |
|
| Q |
404 |
acaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaata |
502 |
Q |
| |
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| T |
48165671 |
acaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgaca-------taat--tttttggatgacctcaatcatcgagagagacttttcagtctcaaata |
48165761 |
T |
|
| Q |
503 |
ttgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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| T |
48165762 |
ttg-cccattaagaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
48165803 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10735421 - 10734891
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10735421 |
tgtttcttcatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaagtagatggtttaaaaaggcatgaaatcc |
10735323 |
T |
|
| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctcttt-agtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtgga |
200 |
Q |
| |
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| T |
10735322 |
acttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttggttttgagataatagtatggagagttgtgaa |
10735223 |
T |
|
| Q |
201 |
tttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaag |
300 |
Q |
| |
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| T |
10735222 |
tttaacaagttcagtgggagtaagtttatgttcctagtttaatatgtcaattttatttt---tagtcaacgttgatatatgttttttatgtgagaccaag |
10735126 |
T |
|
| Q |
301 |
gaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaat |
400 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10735125 |
gaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatccttgggacacctcttttgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcgaat |
10735026 |
T |
|
| Q |
401 |
atcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaa |
499 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
10735025 |
atcacaaaagagttatttcaataaagttgaaaataaaatgac----------atattttttggatgaccccaatcaccaagagagacttttcactctcaa |
10734936 |
T |
|
| Q |
500 |
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545 |
Q |
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acattg-cctattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10949190 - 10948660
Alignment:
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
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10948895 |
T |
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400 |
Q |
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T |
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401 |
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499 |
Q |
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T |
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545 |
Q |
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acattg-cctattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26959204 - 26958808
Alignment:
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Q |
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gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatataaagtagatggtttaaaaaggcatgaaatc |
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T |
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200 |
Q |
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T |
|
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201 |
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300 |
Q |
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| T |
26959005 |
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T |
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399 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 5186912 - 5187452
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Q |
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T |
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Q |
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5187111 |
T |
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Q |
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| T |
5187112 |
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5187211 |
T |
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397 |
Q |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 390 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26958518 - 26958367
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T |
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Q |
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tcagtctcgaatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagta |
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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 545
Target Start/End: Original strand, 32283053 - 32283377
Alignment:
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Q |
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T |
|
| Q |
315 |
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412 |
Q |
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T |
|
| Q |
413 |
ttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaatattgccccat |
511 |
Q |
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| T |
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ttatatcaataaagttgaaaataaattaaca--gacgataataaattatgtgtgccctcaatcatcaagagagactatttagtctcaaatattg-tccat |
32283343 |
T |
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512 |
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545 |
Q |
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tagaacatttataaattcataaaattaagtattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 545
Target Start/End: Original strand, 3769091 - 3769228
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| Q |
409 |
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Q |
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3769091 |
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T |
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545 |
Q |
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ccctttagaaaatttataaatttagaaaattaagtattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 32282817 - 32283053
Alignment:
| Q |
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Q |
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T |
|
| Q |
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202 |
Q |
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| T |
32282915 |
ttatgagttaagaagttagtctatttaagttttaacacaaattttcataaggtaattgtctatttt--ttttaagataatattgtggagatttatgactt |
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T |
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| Q |
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243 |
Q |
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ttacaagatcaatgggaataagtttatattcttagtttaat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39729310 - 39728778
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4 |
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Q |
| |
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tttctcaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaacttaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtagatgttttgcaaagtcatgaaatccac |
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T |
|
| Q |
104 |
ttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggattt |
203 |
Q |
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39729210 |
ttatgagttaagaaattagtctctttattgttactacatattctcataaagcaattatctcattttgttttgagatgatattatggagaattgcggattt |
39729111 |
T |
|
| Q |
204 |
agcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaaggaa |
303 |
Q |
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| T |
39729110 |
agcaaattcagtgggagtaagtttatattcatagttgaatatgtcaattttattttatttagtcaacgatgatatatgtttgttatgtgaaaccaaggaa |
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T |
|
| Q |
304 |
atctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatc |
403 |
Q |
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| T |
39729010 |
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T |
|
| Q |
404 |
acaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaata |
502 |
Q |
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| T |
39728910 |
acaaaagagttataccaataaagttgaaaatgaaatgaca-------taat--tttttggatgacctcaatcatcgacagagactttgcagtctcaaata |
39728820 |
T |
|
| Q |
503 |
ttgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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| T |
39728819 |
ttg-cccattagaaaatttatgaattcagaaatttaagtattt |
39728778 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5544254 - 5543704
Alignment:
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Q |
| |
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|
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gtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatatgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagaaaatggtttgcaaagtcatgaaatc |
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T |
|
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cacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaat------------tctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatg |
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Q |
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| T |
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cacttataagttaataaatttgtctctttagtgttaccaaaaaaaaaaaaaaaaaatctcataaagtgattgtcttatttggttttgagataatattatg |
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T |
|
| Q |
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gagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagtta |
288 |
Q |
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| T |
5544054 |
gagaattgtggatttagcaagttcggtgggagtaattttatatttctagtttaatacgtcaattttattttattcaatcaacgatgatatatgtttgtta |
5543955 |
T |
|
| Q |
289 |
tgtgaaaccaaggaaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaagg |
388 |
Q |
| |
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| T |
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tgtgaaaccaaggaaatctctaacaaaagttagtgatgaaagatcccagggacacctcttttgtattaggcattttaatacttagagattcttctcaagg |
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T |
|
| Q |
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tattatttaaatatcacaaaagag----ttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagaga |
483 |
Q |
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| T |
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tattattcggatatcacaaaagagctatatatatcaataaagttgaaaatgaaatgac----------gtaatttttggatgacctcaatcaccaagaga |
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T |
|
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484 |
gacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
| |
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| T |
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gacttttcagtctcaaatattg-cccattagaaaatttatgaattcataaatttaagtattt |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 535
Target Start/End: Original strand, 32895108 - 32895628
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2 |
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Q |
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| T |
32895108 |
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32895207 |
T |
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102 |
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201 |
Q |
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| T |
32895208 |
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32895307 |
T |
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202 |
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301 |
Q |
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| T |
32895308 |
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32895406 |
T |
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| Q |
302 |
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401 |
Q |
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| T |
32895407 |
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32895506 |
T |
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| Q |
402 |
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500 |
Q |
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| T |
32895507 |
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32895594 |
T |
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| Q |
501 |
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535 |
Q |
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| T |
32895595 |
tattg-cccattaggaaatttatgtattcataaat |
32895628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Original strand, 14414059 - 14414571
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
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| T |
14414059 |
tgtttctcaatggtgacattaatgattcaatatggtgcaacttaagaaaactcttgtgtcaatagatacaaagtagatgttttgcaaaatcatgaaatcc |
14414158 |
T |
|
| Q |
102 |
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201 |
Q |
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| T |
14414159 |
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14414238 |
T |
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| Q |
202 |
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301 |
Q |
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| T |
14414239 |
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14414338 |
T |
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| Q |
302 |
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401 |
Q |
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| T |
14414339 |
aaatctctaacgaaagttagtgatgaaagatcttggggacacctcttttgtattatgca-tttaatacttagagattcttctcaaggtattattcagaca |
14414437 |
T |
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| Q |
402 |
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500 |
Q |
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| T |
14414438 |
tcacaaaagagttatatcaataaagttcaaaataaaatgac----------acaatttttggatgacctcaatcatcgagtgagactttctagtctcaaa |
14414527 |
T |
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| Q |
501 |
tattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
14414528 |
tattg-tccattagaaaattaatgaattcagatatttaagtattt |
14414571 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 350 - 545
Target Start/End: Original strand, 10704248 - 10704435
Alignment:
| Q |
350 |
tgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaatatcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaag |
448 |
Q |
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| T |
10704248 |
tgtattaggcatttcaatacttagagattcttctcaaggtattattcggatatcacaaaagagttatatcaataaagttgaaaataaaatgac------- |
10704340 |
T |
|
| Q |
449 |
ttaataagttatgggtgaccataatcacc--gagagagacttttcagtctcaaatattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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| T |
10704341 |
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10704435 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 266
Target Start/End: Original strand, 30413387 - 30413576
Alignment:
| Q |
78 |
atggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgtt-accacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttga |
176 |
Q |
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| T |
30413387 |
atggtttgtaaagtcatgaaatccacttatgagttaagaaatttttctagttaatgtttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttgattttga |
30413486 |
T |
|
| Q |
177 |
gatgatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagt |
266 |
Q |
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| T |
30413487 |
gataatattaagtagaattgtgaatttagtaagctaattggaagtaaatttaaatttaaattttaatgtgtcgattttattttatttagt |
30413576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 10704200 - 10704236
Alignment:
| Q |
1 |
gtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggt |
37 |
Q |
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| T |
10704200 |
gtgtttcttaatggtgacattaatgatacaatatggt |
10704236 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0363 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:
Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4652 - 4140
Alignment:
| Q |
2 |
tgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatcc |
101 |
Q |
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| T |
4652 |
tgtttctcaatggtgacattaatgattcaatatggtgcaacttaagaaaactcttgtgtcaatagatacaaagtagatgttttgcaaaatcatgaaatcc |
4553 |
T |
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| Q |
102 |
acttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtgattgtctcgtttgattttgagatgatattatggagaattgtggat |
201 |
Q |
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| T |
4552 |
acttatgagttaagaaatttgtctctttattgttactacatattctcataaagtaattatctcatttgattttgagaa--------------------at |
4473 |
T |
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| Q |
202 |
ttagcaagttcagtgggagtaagtttatattcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcattgatgatatatgttagttatgtgaaaccaagg |
301 |
Q |
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| T |
4472 |
ttagcaaattatgtgggagaaagtttatattcatagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaaccatgatatatgtttgttatgtgaaaccaagg |
4373 |
T |
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| Q |
302 |
aaatctttaacaaaagttactgatgaaagatcctggggacacctcttctgtattaggcacttcaatacttagagattcttctcaaggtattatttaaata |
401 |
Q |
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4372 |
aaatctctaacgaaagttagtgatgaaagatcttggggacacctcttttgtattatgca-tttaatacttagagattcttctcaaggtattattcagaca |
4274 |
T |
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| Q |
402 |
tcacaaaagagttatatcaat-aagttgaaaataaattgacattaaagttaataagttatgggtgaccataatcaccgagagagacttttcagtctcaaa |
500 |
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4273 |
tcacaaaagagttatatcaataaagttcaaaataaaatgac----------acaatttttggatgacctcaatcatcgagtgagactttctagtctcaaa |
4184 |
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501 |
tattgccccattagaaaatttatgaattcagaaatataagtattt |
545 |
Q |
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4183 |
tattg-tccattagaaaattaatgaattcagatatttaagtattt |
4140 |
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