View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9053_low_26 (Length: 259)

Name: NF9053_low_26
Description: NF9053
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9053_low_26
NF9053_low_26
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (23-258)||(113752-113987)
scaffold0029 (29-178)||(108695-108844)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (15-258)||(19880324-19880567)
chr6 (15-258)||(34644598-34644841)
chr6 (23-258)||(18795716-18795951)
chr6 (44-258)||(21563173-21563387)
chr6 (44-258)||(21569032-21569246)
chr6 (23-258)||(15460362-15460597)
chr6 (23-258)||(8761953-8762188)
chr6 (23-254)||(19454450-19454681)
chr6 (29-258)||(5296232-5296461)
chr6 (23-258)||(21472627-21472862)
chr6 (23-258)||(10467869-10468104)
chr6 (23-258)||(14378937-14379172)
chr6 (23-258)||(14380487-14380722)
chr6 (44-258)||(15897120-15897334)
chr6 (44-214)||(22434939-22435109)
chr6 (44-214)||(22443337-22443507)
chr6 (29-231)||(27188489-27188691)
chr6 (29-231)||(27260549-27260751)
chr6 (23-258)||(24365438-24365673)
chr6 (47-178)||(16926684-16926815)
chr6 (45-180)||(20636343-20636478)
chr6 (44-258)||(19488313-19488527)
chr6 (44-202)||(22761496-22761654)
chr6 (23-177)||(28281833-28281987)
chr6 (29-178)||(25113658-25113807)
chr6 (44-180)||(23079573-23079709)
chr6 (44-144)||(29590961-29591061)
chr6 (47-178)||(16962489-16962620)
chr6 (44-178)||(16625758-16625892)
chr6 (47-178)||(5838263-5838394)
chr6 (24-258)||(19436028-19436262)
chr6 (41-195)||(19865776-19865930)
chr6 (29-178)||(28262223-28262372)
chr6 (29-178)||(28340972-28341121)
chr6 (47-214)||(1542128-1542295)
chr6 (50-197)||(25608908-25609055)
chr6 (45-214)||(27564863-27565032)
chr6 (44-144)||(2873844-2873944)
chr6 (50-180)||(18406991-18407121)
chr6 (44-131)||(18196774-18196861)
chr6 (125-249)||(25769226-25769350)
chr6 (47-144)||(18449650-18449747)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (15-258)||(6555-6798)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (23-258)||(19613827-19614062)
chr7 (41-258)||(11387308-11387525)
chr7 (23-258)||(19148363-19148598)
chr7 (23-258)||(20747762-20747997)
chr7 (23-258)||(14263106-14263341)
chr7 (23-258)||(15101465-15101700)
chr7 (23-258)||(16071157-16071392)
chr7 (23-258)||(13022509-13022744)
chr7 (23-258)||(11305125-11305360)
chr7 (23-258)||(26117467-26117702)
chr7 (44-258)||(12205683-12205897)
chr7 (26-258)||(12457792-12458024)
chr7 (23-258)||(16949334-16949569)
chr7 (23-234)||(49153477-49153688)
chr7 (23-258)||(268-504)
chr7 (23-250)||(14285238-14285465)
chr7 (23-178)||(14955785-14955940)
chr7 (23-255)||(13666692-13666924)
chr7 (55-214)||(15147801-15147960)
chr7 (44-178)||(8708836-8708970)
chr7 (44-214)||(11771146-11771316)
chr7 (44-178)||(18550663-18550797)
chr7 (44-178)||(44790256-44790390)
chr7 (29-144)||(18179007-18179122)
chr7 (50-180)||(320948-321078)
chr7 (44-214)||(10872190-10872360)
chr7 (23-177)||(23504732-23504886)
chr7 (29-210)||(16208-16389)
chr7 (29-178)||(23202503-23202652)
chr7 (29-178)||(23508630-23508779)
chr7 (44-144)||(8199893-8199993)
chr7 (44-144)||(14333661-14333761)
chr7 (44-144)||(15159962-15160062)
chr7 (23-258)||(13967530-13967765)
chr7 (44-258)||(11236118-11236332)
chr7 (29-178)||(12688731-12688881)
chr7 (23-177)||(18052815-18052969)
chr7 (44-144)||(13687329-13687429)
chr7 (45-177)||(15204851-15204983)
chr7 (23-258)||(15341583-15341818)
chr7 (29-197)||(14212886-14213054)
chr7 (45-144)||(11552008-11552107)
chr7 (168-258)||(12456854-12456944)
chr7 (45-214)||(9597252-9597421)
chr7 (20-135)||(40027-40142)
chr7 (44-183)||(14040921-14041060)
chr7 (44-183)||(14350951-14351090)
chr7 (65-219)||(15625744-15625898)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (23-258)||(13971223-13971458)
chr3 (23-258)||(14087464-14087699)
chr3 (23-258)||(10419148-10419383)
chr3 (23-258)||(17187165-17187400)
chr3 (23-258)||(12359630-12359865)
chr3 (23-258)||(14574714-14574949)
chr3 (23-258)||(31694289-31694524)
chr3 (23-258)||(47124735-47124970)
chr3 (23-258)||(17493421-17493656)
chr3 (23-258)||(28755109-28755344)
chr3 (23-258)||(31939694-31939929)
chr3 (23-258)||(13319605-13319840)
chr3 (23-230)||(16337615-16337822)
chr3 (23-258)||(16827306-16827541)
chr3 (20-258)||(14580053-14580291)
chr3 (23-222)||(11960272-11960471)
chr3 (47-214)||(15347383-15347550)
chr3 (23-258)||(16835613-16835848)
chr3 (44-258)||(15228440-15228654)
chr3 (44-258)||(15234308-15234522)
chr3 (29-144)||(6601631-6601746)
chr3 (45-180)||(16491317-16491452)
chr3 (23-153)||(12179234-12179364)
chr3 (29-214)||(53384138-53384323)
chr3 (44-144)||(15588527-15588627)
chr3 (26-222)||(16328766-16328962)
chr3 (44-144)||(16636668-16636768)
chr3 (44-144)||(20061189-20061289)
chr3 (44-144)||(43163992-43164092)
chr3 (44-144)||(48426342-48426442)
chr3 (44-231)||(5424065-5424252)
chr3 (50-196)||(17490693-17490839)
chr3 (27-221)||(18133453-18133647)
chr3 (23-177)||(44778119-44778273)
chr3 (44-144)||(10006495-10006595)
chr3 (44-144)||(10907105-10907205)
chr3 (44-144)||(13253585-13253685)
chr3 (44-180)||(15260489-15260625)
chr3 (23-177)||(41178394-41178548)
chr3 (44-144)||(15401652-15401752)
chr3 (45-214)||(14125730-14125899)
chr3 (138-258)||(11302991-11303111)
chr3 (38-178)||(12499109-12499249)
chr3 (44-144)||(15340164-15340264)
chr3 (44-144)||(15724069-15724169)
chr3 (20-177)||(16693026-16693183)
chr3 (23-177)||(13942896-13943050)
chr3 (45-258)||(14875635-14875848)
chr3 (23-144)||(16411396-16411517)
chr3 (81-144)||(16755757-16755820)
chr3 (23-177)||(16380031-16380185)
chr3 (45-214)||(16806083-16806252)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (23-258)||(32555-32790)
scaffold0076 (23-258)||(55778-56013)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (23-258)||(49392-49627)
scaffold0028 (47-214)||(44388-44555)
scaffold0028 (45-144)||(9781-9880)
scaffold0028 (45-112)||(16275-16342)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (23-258)||(21679835-21680070)
chr5 (23-258)||(22463027-22463262)
chr5 (23-258)||(24619352-24619587)
chr5 (23-258)||(24715583-24715818)
chr5 (23-258)||(24748611-24748846)
chr5 (23-258)||(20822529-20822764)
chr5 (23-256)||(28893999-28894232)
chr5 (23-256)||(28915470-28915703)
chr5 (23-256)||(28922825-28923058)
chr5 (23-258)||(14886048-14886283)
chr5 (23-231)||(28930738-28930946)
chr5 (23-258)||(23079146-23079381)
chr5 (23-234)||(24797454-24797665)
chr5 (23-222)||(22234977-22235176)
chr5 (57-250)||(20774843-20775036)
chr5 (23-234)||(37542438-37542649)
chr5 (44-258)||(21563051-21563265)
chr5 (44-180)||(23472400-23472536)
chr5 (23-222)||(25849187-25849386)
chr5 (44-144)||(16357710-16357810)
chr5 (44-144)||(27519614-27519714)
chr5 (44-144)||(34567702-34567802)
chr5 (44-144)||(40709988-40710088)
chr5 (44-231)||(27667568-27667755)
chr5 (29-144)||(41772050-41772165)
chr5 (29-178)||(19771134-19771283)
chr5 (26-258)||(20343358-20343590)
chr5 (38-142)||(21872122-21872226)
chr5 (38-142)||(21876402-21876506)
chr5 (44-144)||(27611562-27611662)
chr5 (44-214)||(23441348-23441518)
chr5 (50-180)||(25427605-25427735)
chr5 (29-126)||(21497150-21497247)
chr5 (38-231)||(26737799-26737992)
chr5 (29-178)||(37290559-37290708)
chr5 (44-144)||(14998817-14998917)
chr5 (44-144)||(22135876-22135976)
chr5 (44-144)||(22331965-22332065)
chr5 (44-144)||(27684478-27684578)
chr5 (44-144)||(29475151-29475251)
chr5 (29-231)||(22503782-22503984)
chr5 (45-214)||(23574867-23575036)
chr5 (29-197)||(18776951-18777119)
chr5 (44-105)||(20467176-20467237)
chr5 (83-252)||(21830878-21831047)
chr5 (45-214)||(21882087-21882256)
chr5 (53-144)||(21338384-21338475)
chr5 (51-177)||(17268419-17268545)
chr5 (23-100)||(846-923)
chr5 (47-258)||(21408232-21408443)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (23-258)||(24204-24439)
scaffold0090 (23-258)||(20042-20277)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (23-258)||(20060899-20061134)
chr1 (23-258)||(19662084-19662319)
chr1 (23-258)||(19855482-19855717)
chr1 (23-258)||(23197193-23197428)
chr1 (23-258)||(20855707-20855942)
chr1 (23-258)||(20834847-20835082)
chr1 (23-258)||(20939010-20939245)
chr1 (23-258)||(24098550-24098785)
chr1 (23-258)||(31538944-31539179)
chr1 (23-258)||(37678257-37678492)
chr1 (23-231)||(21952113-21952321)
chr1 (44-258)||(16373707-16373921)
chr1 (23-151)||(21744499-21744627)
chr1 (45-180)||(431085-431220)
chr1 (29-214)||(41352615-41352800)
chr1 (53-180)||(21750195-21750322)
chr1 (44-258)||(51332461-51332675)
chr1 (44-144)||(16349564-16349664)
chr1 (47-214)||(33390000-33390167)
chr1 (23-231)||(20295616-20295824)
chr1 (44-144)||(21838241-21838341)
chr1 (44-180)||(22110277-22110413)
chr1 (44-180)||(22114126-22114262)
chr1 (23-178)||(19107625-19107780)
chr1 (20-197)||(21234675-21234852)
chr1 (50-214)||(16077630-16077794)
chr1 (44-144)||(21831594-21831694)
chr1 (44-214)||(21025394-21025564)
chr1 (44-259)||(19759841-19760056)
chr1 (29-120)||(17043968-17044059)
chr1 (45-120)||(22361213-22361288)
chr1 (44-123)||(24793585-24793664)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (45-258)||(23099455-23099668)
chr2 (23-231)||(24949410-24949618)
chr2 (26-258)||(27209590-27209822)
chr2 (23-258)||(23277569-23277804)
chr2 (23-258)||(1064544-1064779)
chr2 (23-258)||(31831451-31831686)
chr2 (23-258)||(20829052-20829287)
chr2 (44-258)||(23111529-23111743)
chr2 (23-258)||(23294728-23294963)
chr2 (23-258)||(19651465-19651700)
chr2 (44-214)||(24710871-24711041)
chr2 (44-144)||(16923796-16923896)
chr2 (44-144)||(16926267-16926367)
chr2 (44-144)||(16983059-16983159)
chr2 (44-144)||(16999907-17000007)
chr2 (44-144)||(17064624-17064724)
chr2 (44-144)||(22324292-22324392)
chr2 (44-144)||(27218923-27219023)
chr2 (51-214)||(24676326-24676489)
chr2 (50-180)||(23067262-23067391)
chr2 (44-178)||(27372142-27372276)
chr2 (44-144)||(44385005-44385105)
chr2 (45-180)||(23107167-23107302)
chr2 (23-177)||(12575227-12575381)
chr2 (20-178)||(21144453-21144611)
chr2 (44-144)||(10869757-10869857)
chr2 (44-144)||(41607821-41607921)
chr2 (23-177)||(27788615-27788768)
chr2 (45-144)||(24876186-24876285)
chr2 (44-142)||(24263279-24263377)
chr2 (47-246)||(45533150-45533349)
chr2 (53-178)||(21324711-21324836)
chr2 (41-214)||(24706915-24707088)
chr2 (23-131)||(17967179-17967287)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-258)||(1076-1311)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (23-258)||(2208-2443)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (23-258)||(68563-68798)
scaffold0034 (23-258)||(3831-4066)
scaffold0034 (23-259)||(12786-13015)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (23-258)||(20984865-20985100)
chr8 (44-258)||(21841645-21841859)
chr8 (23-258)||(19852639-19852874)
chr8 (23-258)||(19858675-19858910)
chr8 (23-258)||(14566370-14566605)
chr8 (23-258)||(22372159-22372394)
chr8 (24-258)||(23656155-23656389)
chr8 (44-258)||(20395471-20395685)
chr8 (23-259)||(20974974-20975205)
chr8 (23-231)||(21324587-21324794)
chr8 (23-258)||(6604886-6605121)
chr8 (23-252)||(20009239-20009467)
chr8 (41-214)||(22376790-22376963)
chr8 (41-214)||(22382965-22383138)
chr8 (23-211)||(29302744-29302932)
chr8 (23-258)||(31415789-31416027)
chr8 (51-150)||(21921082-21921181)
chr8 (29-214)||(19483388-19483573)
chr8 (45-258)||(19979195-19979408)
chr8 (23-231)||(16270542-16270750)
chr8 (44-252)||(20389333-20389541)
chr8 (50-214)||(23651313-23651477)
chr8 (45-180)||(21252250-21252385)
chr8 (50-258)||(6680339-6680547)
chr8 (44-178)||(17673362-17673496)
chr8 (44-258)||(23886252-23886466)
chr8 (23-177)||(31570160-31570314)
chr8 (29-214)||(22041131-22041316)
chr8 (23-231)||(12306013-12306221)
chr8 (44-144)||(19114032-19114132)
chr8 (44-144)||(20017602-20017702)
chr8 (44-132)||(22247772-22247860)
chr8 (45-180)||(21393205-21393340)
chr8 (45-180)||(21787699-21787834)
chr8 (15-177)||(22052172-22052334)
chr8 (45-178)||(21043753-21043886)
chr8 (45-178)||(21165878-21166011)
chr8 (44-144)||(18857919-18858019)
chr8 (29-197)||(30312468-30312636)
chr8 (96-258)||(803064-803226)
chr8 (20-180)||(15534689-15534849)
chr8 (50-180)||(1267544-1267674)
chr8 (29-197)||(32601433-32601601)
chr8 (20-135)||(19869044-19869159)
chr8 (23-98)||(27355924-27355999)
chr8 (29-132)||(23452722-23452825)
chr8 (31-92)||(22132367-22132428)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (23-259)||(27901547-27901783)
chr4 (23-258)||(15002239-15002474)
chr4 (23-258)||(29452412-29452647)
chr4 (38-258)||(15413916-15414136)
chr4 (23-258)||(3263669-3263904)
chr4 (23-258)||(15357995-15358230)
chr4 (24-259)||(16148872-16149107)
chr4 (24-259)||(16153018-16153253)
chr4 (23-257)||(33224086-33224320)
chr4 (44-239)||(15320317-15320512)
chr4 (23-258)||(15247086-15247321)
chr4 (24-258)||(11206107-11206341)
chr4 (44-252)||(8707088-8707296)
chr4 (23-177)||(15071602-15071756)
chr4 (41-214)||(16354078-16354251)
chr4 (44-195)||(15146521-15146672)
chr4 (23-180)||(14160710-14160867)
chr4 (137-258)||(15078797-15078918)
chr4 (29-214)||(23956953-23957138)
chr4 (44-144)||(8387688-8387788)
chr4 (44-144)||(12477876-12477976)
chr4 (44-144)||(18298481-18298581)
chr4 (44-144)||(19777429-19777529)
chr4 (23-231)||(20892171-20892379)
chr4 (44-144)||(29038040-29038140)
chr4 (44-258)||(14695275-14695489)
chr4 (29-178)||(27712578-27712727)
chr4 (44-144)||(8052259-8052359)
chr4 (15-234)||(44660733-44660952)
chr4 (23-177)||(51605667-51605821)
chr4 (45-178)||(12524918-12525051)
chr4 (53-178)||(14850011-14850136)
chr4 (29-178)||(40474282-40474431)
chr4 (44-120)||(14681867-14681943)
chr4 (29-231)||(18226067-18226269)
chr4 (24-200)||(1648153-1648329)
chr4 (44-258)||(14302614-14302828)
chr4 (44-180)||(18614460-18614596)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (23-258)||(430-665)
scaffold0120 (45-180)||(13329-13464)
scaffold0120 (45-180)||(7291-7426)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (38-258)||(10986-11206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (23-258)||(5623-5858)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (24-258)||(24755-24989)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (23-258)||(111-346)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (23-254)||(29254-29485)
scaffold0026 (50-180)||(30216-30346)
scaffold0026 (23-93)||(50168-50238)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (23-258)||(323897-324132)
scaffold0004 (44-252)||(202367-202575)
scaffold0004 (44-200)||(118477-118633)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (23-258)||(89323-89558)
scaffold0001 (23-258)||(90001-90236)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (44-258)||(27717-27931)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (20-258)||(40891-41129)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (23-252)||(1732-1961)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (23-252)||(47912-48141)
scaffold0053 (23-258)||(56725-56960)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (23-258)||(46277-46512)
scaffold0010 (23-258)||(41211-41446)
scaffold0010 (51-258)||(3107-3314)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (44-258)||(5988-6204)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (23-258)||(10935-11170)
scaffold0298 (23-258)||(14705-14940)
scaffold0298 (23-258)||(21176-21411)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (23-258)||(15305-15540)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (23-258)||(28410-28645)
scaffold0139 (23-258)||(34663-34898)
scaffold0139 (82-159)||(95-172)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (23-258)||(13393-13628)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-258)||(43976-44211)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-255)||(249809-250041)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-258)||(194-429)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (23-258)||(4969-5204)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (23-258)||(6116-6351)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (23-258)||(42110-42345)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (23-258)||(149763-149997)
scaffold0011 (23-258)||(194582-194817)
scaffold0011 (51-180)||(25439-25568)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (44-258)||(50774-50988)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (23-258)||(171-406)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (23-258)||(2781-3016)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (47-258)||(5943-6154)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (23-258)||(2363-2598)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (15-258)||(2225-2468)
scaffold0222 (23-258)||(8253-8488)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (47-258)||(48297-48508)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (23-258)||(32604-32839)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (23-258)||(851-1086)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (23-258)||(20587-20822)
scaffold0104 (23-258)||(23407-23642)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (23-254)||(4330-4561)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (23-258)||(100440-100675)
scaffold0020 (95-214)||(181436-181555)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (20-258)||(517-755)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (38-258)||(1062-1282)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (44-252)||(16876-17084)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (23-258)||(3944-4177)
scaffold0035 (50-237)||(43012-43199)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (23-258)||(3369-3604)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (23-258)||(27818-28052)
scaffold0067 (23-254)||(51058-51289)
scaffold0067 (23-254)||(60092-60323)
scaffold0067 (23-254)||(66480-66711)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (23-258)||(20313-20548)
scaffold0058 (47-100)||(58093-58146)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (44-258)||(18114-18328)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (65-258)||(11926-12119)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (41-214)||(79390-79563)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (23-258)||(3150-3385)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (23-258)||(10335-10570)
scaffold0235 (23-258)||(20549-20784)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (23-258)||(566-799)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (23-258)||(30163-30398)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-258)||(9707-9921)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (84-252)||(1-169)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (23-231)||(7023-7231)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (23-231)||(12405-12613)
scaffold0180 (44-180)||(31652-31788)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (38-258)||(177155-177375)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (44-252)||(218316-218524)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (23-258)||(13177-13412)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (79-258)||(6264-6443)
scaffold0149 (79-258)||(10695-10874)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (23-258)||(45710-45945)
scaffold0114 (45-144)||(19241-19340)
scaffold0114 (23-200)||(21138-21315)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (23-222)||(108859-109058)
scaffold0031 (44-195)||(62930-63081)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (99-256)||(16475-16632)
scaffold0348 (27-105)||(10771-10849)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (41-222)||(15378-15559)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (44-180)||(16925-17061)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (44-180)||(16148-16284)
scaffold0040 (53-180)||(112396-112523)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (23-258)||(15591-15826)
scaffold0089 (44-258)||(10630-10844)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (24-258)||(32198-32432)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (24-142)||(35422-35540)
scaffold0156 (149-258)||(28418-28527)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (20-178)||(8670-8828)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (44-180)||(10240-10376)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (53-180)||(7561-7688)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (44-195)||(29470-29621)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (44-258)||(13661-13875)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (41-231)||(5091-5281)
scaffold0270 (41-231)||(12221-12411)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (44-258)||(23084-23298)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-214)||(102470-102640)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-195)||(7270-7442)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (41-177)||(277726-277862)
scaffold0005 (24-174)||(261585-261735)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (51-214)||(3431-3594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (45-180)||(7643-7778)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (45-144)||(7356-7455)
scaffold0358 (70-156)||(3534-3620)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (45-180)||(14111-14246)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (45-180)||(37-172)
scaffold0319 (45-180)||(2540-2675)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (23-258)||(18542-18777)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (45-180)||(25845-25979)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (23-258)||(5214-5449)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (71-258)||(39685-39872)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (45-195)||(50688-50838)
scaffold0081 (45-214)||(19839-20008)
scaffold0081 (45-214)||(35263-35432)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (23-177)||(80710-80864)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (62-214)||(5268-5420)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (23-231)||(178-390)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (45-180)||(7231-7366)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-234)||(28150-28361)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (44-195)||(26230-26381)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (44-252)||(23978-24179)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (45-178)||(8639-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (53-214)||(7995-8156)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (50-179)||(38853-38982)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (44-180)||(966-1102)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (44-144)||(8246-8346)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (44-180)||(4383-4519)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (45-144)||(2200-2299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (44-195)||(24723-24874)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (29-132)||(32457-32560)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (45-120)||(4253-4328)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (44-258)||(2101-2315)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (23-177)||(14178-14331)
scaffold0261 (23-177)||(22357-22510)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (44-258)||(9915-10129)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (45-214)||(1655-1824)
scaffold0044 (45-214)||(15395-15564)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (23-111)||(1712-1800)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (47-246)||(85421-85620)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (44-142)||(6790-6888)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (23-177)||(96438-96592)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (45-178)||(38720-38853)
scaffold0042 (20-111)||(66745-66836)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (23-250)||(6414-6641)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (53-120)||(12900-12967)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (45-144)||(28268-28367)
scaffold0023 (44-180)||(3355-3491)
scaffold0023 (80-180)||(131377-131477)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (23-177)||(11664-11818)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (50-180)||(39828-39958)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (70-180)||(6492-6602)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (45-111)||(18967-19033)
scaffold0017 (44-120)||(196377-196453)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (44-120)||(23972-24048)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (44-219)||(115804-115979)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (44-114)||(13980-14050)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-105)||(343-401)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (47-172)||(16466-16591)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 113987 - 113752
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  113987 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 113888  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113887 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 113788  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113787 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 113752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 108695 - 108844
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  108695 agatgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 108794  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  108795 tgtctgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19880567 - 19880324
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19880567 acatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtag 19880468  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19880467 aaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtg 19880368  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19880367 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtat 19880324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 34644598 - 34644841
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34644598 acatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtag 34644697  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  34644698 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtg 34644797  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34644798 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtat 34644841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18795951 - 18795716
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18795951 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 18795852  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18795851 tacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttggg 18795752  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18795751 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 18795716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563387
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtat 21563387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569246
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtat 21569246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15460597 - 15460362
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  15460597 cagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 15460498  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||| | | || |||||||| |||||    
T  15460497 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttggg 15460398  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  15460397 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtat 15460362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 8761953 - 8762188
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  8761953 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 8762052  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8762053 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8762152  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  8762153 gatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtat 8762188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19454681 - 19454450
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19454681 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19454582  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19454581 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 19454482  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||    
T  19454481 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaata 19454450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296461
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  229 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtat 5296461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21472862 - 21472627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21472862 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 21472763  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  21472762 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttggg 21472663  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21472662 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtat 21472627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 10467869 - 10468104
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  10467869 cagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacat 10467968  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  10467969 tgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggg 10468068  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  10468069 gatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtat 10468104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 14378937 - 14379172
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14378937 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14379036  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14379037 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14379136  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| | || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  14379137 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtat 14379172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 14380487 - 14380722
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14380487 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14380586  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14380587 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14380686  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| | || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  14380687 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtat 14380722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897120
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  15897134 attcttgaacagtat 15897120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434939
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 22434939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443337
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 22443337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27188691 - 27188489
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  27188691 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 27188592  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |    
T  27188591 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27188492  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  27188491 gaa 27188489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 27260549 - 27260751
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  27260549 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 27260648  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |    
T  27260649 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27260748  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  27260749 gaa 27260751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24365673 - 24365438
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  24365673 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacct 24365574  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  24365573 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 24365474  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  24365473 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 24365438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926815
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636478
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 20636478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488527
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| |||| || |||||||| ||||  |  ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtat 19488527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761654
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgtta 202  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  | ||||||||| |||||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtta 22761654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 28281833 - 28281987
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  28281833 cagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 28281932  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  28281933 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 28281987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113658
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 25113658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079573
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagattt 23079573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591061
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29591061 t 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962620
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16962620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625892
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 16625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838394
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| |||||||||||||||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagat 5838394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19436262 - 19436028
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||||| ||    
T  19436262 agaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacatt 19436163  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||  |||||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||  |     
T  19436162 gcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcagg 19436063  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  19436062 atgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtat 19436028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19865930 - 19865776
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  19865930 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatga 19865831  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    |||| || || || ||| | || || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  19865830 tggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtga 19865776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 28262223 - 28262372
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  28262223 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 28262322  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28262323 tgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 28340972 - 28341121
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  28340972 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 28341071  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28341072 tgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542295
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || |||||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1542295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609055
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaat 25609055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |   | || || ||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2873944
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  2873944 t 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407121
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 18407121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196861
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769226
Alignment:
Q  125 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggca 224  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  225 tgttgaaaatcaataatgaattctt 249  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttctt 25769226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449650
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 6555 - 6798
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6555 acatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtag 6654  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6655 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtg 6754  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6755 cagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19614062 - 19613827
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19614062 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 19613963  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19613962 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19613863  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19613862 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 19613827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 258
Target Start/End: Original strand, 11387308 - 11387525
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11387308 ttattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatga 11387407  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataa 240  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  11387408 tggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatag 11387507  T
Q  241 tgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  11387508 tgatttcttgaatagtat 11387525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19148598 - 19148363
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19148598 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19148499  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  19148498 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 19148399  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19148398 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtat 19148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20747997 - 20747762
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20747997 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20747898  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  20747897 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 20747798  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  20747797 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtat 20747762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 14263106 - 14263341
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14263106 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14263205  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  14263206 tacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttggg 14263305  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  14263306 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtat 14263341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 15101465 - 15101700
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  15101465 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgt 15101564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15101565 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15101664  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  15101665 tatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 15101700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 16071157 - 16071392
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  16071157 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacat 16071256  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16071257 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 16071356  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||    
T  16071357 tatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtat 16071392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13022744 - 13022509
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  13022744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 13022645  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  13022644 tacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggg 13022545  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||    
T  13022544 gatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtat 13022509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 11305125 - 11305360
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  11305125 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 11305224  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  11305225 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 11305324  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  11305325 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 11305360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 26117467 - 26117702
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || |    
T  26117467 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactt 26117566  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || || |||||  | || ||||| |||||||||| |  ||||||| | || |||||    
T  26117567 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttggg 26117666  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  26117667 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 26117702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205897
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     || |||||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtat 12205897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12458024 - 12457792
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12458024 aggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgc 12457925  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    | ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||| ||    
T  12457924 atatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggat 12457825  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  12457824 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtat 12457792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 16949334 - 16949569
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16949334 cagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 16949433  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  16949434 tgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 16949533  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||  || |||| ||| |||| |||||||||    
T  16949534 gatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtat 16949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49153688 - 49153477
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || |    
T  49153688 cagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactt 49153589  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  49153588 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttggg 49153489  T
Q  223 catgttgaaaat 234  Q
     |||||||||||    
T  49153488 aatgttgaaaat 49153477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 268 - 504
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgccttgagtagaaagacg 121  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | || |||||     
T  268 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagaca 367  T
Q  122 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgg 221  Q
    || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||| |||||| | |||||||    
T  368 ttgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttgg 467  T
Q  222 gcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    | ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  468 ggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 14285238 - 14285465
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  14285238 cagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacac 14285337  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  || |||||| | ||||||||    
T  14285338 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttggg 14285437  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttg 250  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||    
T  14285438 catgctgaagattaatagtgatttcttg 14285465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14955940 - 14955785
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14955940 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 14955841  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || ||||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14955840 tgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 14955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13666924 - 13666692
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  13666924 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgt 13666825  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  13666824 tgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggg 13666725  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatag 255  Q
     ||| |||| || || | | | |||||||||||    
T  13666724 gatgctgaagattaacagttatttcttgaatag 13666692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  55 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 154  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  155 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708836
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 8708836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771316
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || ||| |||| || || || || ||||||||||| ||| | || || || |||| ||| |||||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtg 11771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550797
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 18550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790390
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || || || || || || ||||||||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 44790390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18179122 - 18179007
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  18179122 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 18179023  T
Q  129 tgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||    
T  18179022 tgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321078
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || ||| |||| ||||||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagattt 321078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872190
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 10872190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 23504732 - 23504886
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||     
T  23504732 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgc 23504831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23504832 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 23504886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 16208 - 16389
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  16208 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 16307  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagag 210  Q
    |||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||    
T  16308 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 23202503 - 23202652
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  23202503 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23202602  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23202603 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23202652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 23508630 - 23508779
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  23508630 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23508729  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23508730 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23508779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199893
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8199893 t 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333661
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  14333661 t 14333661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160062
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15160062 t 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 13967530 - 13967765
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | || || |    
T  13967530 cagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactt 13967629  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  13967630 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggg 13967729  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  13967730 gatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtat 13967765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236332
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||| |||| |||||    
T  11236318 attcctgaaaagtat 11236332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12688881 - 12688731
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacac 127  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  12688881 agatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 12688782  T
Q  128 atgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12688781 atgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 18052815 - 18052969
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  18052815 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacac 18052914  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  18052915 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 18052969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687329
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  13687329 t 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204851
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
     || || || ||| | |||||  ||||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagaga 15204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15341818 - 15341583
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||     
T  15341818 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgc 15341719  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | ||||||||    
T  15341718 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttggg 15341619  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  15341618 catgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtat 15341583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14213054 - 14212886
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  14213054 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcata 14212955  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  14212954 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaat 14212886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552107
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456854
Alignment:
Q  168 agtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtat 12456854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9597421 - 9597252
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  9597421 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggt 9597322  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  9597321 tagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40142
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  40027 agacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 40126  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  40127 ccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14040921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350951
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625744
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  165 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | |||||||||||| | || || || |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagtt 15625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 13971223 - 13971458
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13971223 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgt 13971322  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13971323 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 13971422  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13971423 tatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 13971458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14087699 - 14087464
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  14087699 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacat 14087600  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14087599 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttggg 14087500  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14087499 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 14087464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 10419148 - 10419383
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  10419148 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 10419247  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||||||||||||    
T  10419248 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttggg 10419347  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10419348 tatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtat 10419383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17187400 - 17187165
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  17187400 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 17187301  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  17187300 tgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttggg 17187201  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  17187200 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtat 17187165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 12359630 - 12359865
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12359630 cagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgt 12359729  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  12359730 tgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 12359829  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  12359830 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 12359865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14574949 - 14574714
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14574949 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14574850  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14574849 tgcatatgtctgctatgatggtaaatgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 14574750  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  14574749 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtat 14574714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 31694289 - 31694524
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31694289 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31694388  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31694389 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31694488  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  31694489 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 31694524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47124970 - 47124735
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  47124970 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 47124871  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  47124870 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 47124771  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  47124770 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 47124735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17493656 - 17493421
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17493656 cagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgt 17493557  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  17493556 tgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggg 17493457  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  17493456 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 17493421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28755344 - 28755109
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28755344 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaacgt 28755245  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  28755244 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 28755145  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  28755144 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtat 28755109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31939929 - 31939694
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31939929 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31939830  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31939829 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31939730  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  31939729 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 31939694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 13319605 - 13319840
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |    
T  13319605 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagacct 13319704  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||    
T  13319705 tacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggg 13319804  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  13319805 gatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 13319840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Original strand, 16337615 - 16337822
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16337615 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16337714  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16337715 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 16337814  T
Q  223 catgttga 230  Q
     |||||||    
T  16337815 aatgttga 16337822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 16827306 - 16827541
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||    
T  16827306 cagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgt 16827405  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  16827406 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttggg 16827505  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16827506 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16827541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 14580053 - 14580291
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14580053 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14580152  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | | ||||||||  || |    
T  14580153 atttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagct 14580252  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     || |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||    
T  14580253 aggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtat 14580291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 11960272 - 11960471
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  11960272 cagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacat 11960371  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  11960372 tgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 11960471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347550
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 16835613 - 16835848
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  16835613 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactt 16835712  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |  |||||||| || || || |||||||||||  | || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  16835713 tgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttggg 16835812  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  16835813 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtat 16835848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228440
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtat 15228440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234308
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtat 15234308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6601746 - 6601631
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  6601746 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 6601647  T
Q  129 tgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||    
T  6601646 tgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491452
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 16491452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12179364 - 12179234
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12179364 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgt 12179265  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatt 153  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12179264 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 53384138 - 53384323
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  53384138 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 53384237  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  53384238 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 53384323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588627
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15588627 t 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 16328766 - 16328962
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  16328766 aggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattac 16328865  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| ||  | ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||| | ||||||||    
T  16328866 atatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 16328962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636668
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16636668 t 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061289
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  20061289 t 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163992
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  43163992 t 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426342
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  48426342 t 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424252
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaa 5424252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490693
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaa 196  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaa 17490693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133647
Alignment:
Q  27 ggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 126  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  127 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgg 221  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttgg 18133647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44778273 - 44778119
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  44778273 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 44778174  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44778173 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 44778119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006495
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10006495 t 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10907105
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10907105 t 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253585
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  13253585 t 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260489
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagattt 15260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41178548 - 41178394
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  41178548 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 41178449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  41178448 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 41178394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401752
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15401752 t 15401752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || ||||| || | |||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303111
Alignment:
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtat 258  Q
     | ||| ||||||||||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtat 11303111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12499249 - 12499109
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  12499249 gagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgcta 12499150  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  12499149 tgatggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagat 12499109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340164
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15340164 t 15340164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724169
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15724169 t 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16693183 - 16693026
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  16693183 agacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaaga 16693084  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || || ||||| ||| ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||    
T  16693083 cattgcatatgtctgccttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagaga 16693026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13943050 - 13942896
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  13943050 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 13942951  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  13942950 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 13942896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875848
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  245 ttcttgaatagtat 258  Q
    || ||||| |||||    
T  14875835 tttttgaaaagtat 14875848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 16411396 - 16411517
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| |||| ||  |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16411396 cagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacat 16411495  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    | || ||||| || ||||||||    
T  16411496 tgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755820
Alignment:
Q  81 gtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 16380031 - 16380185
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  16380031 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 16380130  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16380131 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 16380185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 32555 - 32790
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32555 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 32654  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32655 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 32754  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32755 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 32790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 55778 - 56013
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  55778 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 55877  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  55878 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 55977  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  55978 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtat 56013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49392 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 49491  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49492 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 49591  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49592 tatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 49627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44388
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 44388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9781
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16275
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagt 112  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 21679835 - 21680070
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21679835 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21679934  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21679935 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 21680034  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21680035 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 21680070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22463262 - 22463027
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22463262 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 22463163  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  22463162 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 22463063  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22463062 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtat 22463027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 24619352 - 24619587
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24619352 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24619451  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24619452 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24619551  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24619552 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 24619587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 24715583 - 24715818
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24715583 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24715682  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24715683 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24715782  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24715783 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 24715818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748846
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24748611 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24748710  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24748711 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24748810  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24748811 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 24748846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20822764 - 20822529
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  20822764 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 20822665  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || | | | || ||||||||||||||    
T  20822664 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttggg 20822565  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  20822564 tatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtat 20822529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 28893999 - 28894232
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28893999 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28894098  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28894099 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28894198  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 256  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| |||||    
T  28894199 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagt 28894232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 28915470 - 28915703
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28915470 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28915569  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28915570 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28915669  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 256  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| |||||    
T  28915670 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagt 28915703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 28922825 - 28923058
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28922825 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28922924  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28922925 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28923024  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 256  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| |||||    
T  28923025 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagt 28923058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 14886048 - 14886283
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14886048 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 14886147  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14886148 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14886247  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  14886248 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 14886283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 28930738 - 28930946
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28930738 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28930837  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28930838 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28930937  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||||||||    
T  28930938 tatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 23079146 - 23079381
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || || |    
T  23079146 cagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacat 23079245  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||    
T  23079246 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggg 23079345  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || || | | | ||||||||||||||    
T  23079346 gatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtat 23079381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 24797454 - 24797665
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |    
T  24797454 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactt 24797553  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  24797554 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 24797653  T
Q  223 catgttgaaaat 234  Q
     |||||||||||    
T  24797654 aatgttgaaaat 24797665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 22234977 - 22235176
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22234977 cagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 22235076  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  22235077 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 22235176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774843
Alignment:
Q  57 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 156  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  157 gttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 250  Q
    ||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttg 20774843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 37542438 - 37542649
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || |    
T  37542438 cagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactt 37542537  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  37542538 tgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T
Q  223 catgttgaaaat 234  Q
     |||||||||||    
T  37542638 aatgttgaaaat 37542649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563265
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||  | || || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  21563251 gttcttgaacagtat 21563265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472400
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 23472400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25849386 - 25849187
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  25849386 cagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactt 25849287  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  25849286 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 25849187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357710
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16357710 t 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519614
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27519614 t 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567702
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  34567702 t 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709988
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  40709988 t 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667755
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaa 27667755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41772165 - 41772050
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  41772165 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 41772066  T
Q  129 tgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||    
T  41772065 tgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19771283 - 19771134
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
T  19771283 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcata 19771184  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19771183 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20343590 - 20343358
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  20343590 aggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgc 20343491  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| | |||||||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  20343490 acatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggat 20343391  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  20343390 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtat 20343358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 21872122 - 21872226
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || |    
T  21872122 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgcta 21872221  T
Q  138 tgatg 142  Q
    |||||    
T  21872222 tgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 21876402 - 21876506
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || |    
T  21876402 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgcta 21876501  T
Q  138 tgatg 142  Q
    |||||    
T  21876502 tgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611562
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27611562 t 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441348
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtg 23441348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427605
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaattt 25427605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21497247 - 21497150
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 126  Q
    |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21497247 agatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 26737799 - 26737992
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |    
T  26737799 gagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgcta 26737898  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    ||||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  26737899 tgatggtaaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 37290559 - 37290708
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  37290559 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 37290658  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| || |||||||| |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  37290659 tgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagat 37290708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14998917
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  14998917 t 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135876
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  22135876 t 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332065
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  22332065 t 22332065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684578
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27684578 t 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475251
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29475251 t 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503782
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  22503784 gaa 22503782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574867
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 23574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18777119 - 18776951
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  18777119 agatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcata 18777020  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  18777019 tgtctgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 18776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 105
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467237
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 20467237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 252
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  83 aaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaa 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | |    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  183 gccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
    | || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882087
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || |||||||| || || ||||||| |||| | ||||| |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21882087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338475
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||| | | || ||||| || ||||||||    
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 17268419 - 17268545
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || |||||| | || ||    
T  17268419 attatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaaga 17268518  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    ||| || || || || |||||||||||    
T  17268519 attcgatttgctggaacagtttagaga 17268545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 846 - 923
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 100  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  846 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408232
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | || || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  247 cttgaatagtat 258  Q
     || ||||||||    
T  21408243 ttttaatagtat 21408232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24439 - 24204
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24439 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 24340  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24339 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 24240  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24239 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 24204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20277 - 20042
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  20277 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 20178  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20177 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 20078  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20077 tatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 20042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20060899 - 20061134
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20060899 cagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20060998  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060999 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttggg 20061098  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20061099 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 20061134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 19662084 - 19662319
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19662084 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 19662183  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  19662184 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggg 19662283  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  19662284 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtat 19662319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19855717 - 19855482
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19855717 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19855618  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  19855617 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 19855518  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19855517 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 19855482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 23197193 - 23197428
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  23197193 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgt 23197292  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23197293 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 23197392  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  23197393 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 23197428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20855707 - 20855942
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20855707 cagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20855806  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  20855807 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 20855906  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  20855907 tatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtat 20855942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20834847 - 20835082
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20834847 cagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20834946  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||    
T  20834947 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggg 20835046  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20835047 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtat 20835082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20939010 - 20939245
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  20939010 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 20939109  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  20939110 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggg 20939209  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  20939210 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtat 20939245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 24098550 - 24098785
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24098550 cagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 24098649  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24098650 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 24098749  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24098750 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 24098785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 31538944 - 31539179
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  31538944 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 31539043  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  31539044 tgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 31539143  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  31539144 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 31539179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37678492 - 37678257
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||    
T  37678492 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaacgt 37678393  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  37678392 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 37678293  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  37678292 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtat 37678257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21952321 - 21952113
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21952321 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 21952222  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||||||||    
T  21952221 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 21952122  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21952121 gatgctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 21744499 - 21744627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21744499 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21744598  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaa 151  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  21744599 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431220
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagattt 431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 41352615 - 41352800
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  41352615 agatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 41352714  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  41352715 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 41352800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750195
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 21750195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332675
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || || || || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||| |||| |||||    
T  51332661 attcctgaaaagtat 51332675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349664
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16349664 t 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390167
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20295824 - 20295616
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20295824 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactt 20295725  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || ||  | || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20295724 tgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggg 20295625  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  20295624 gatgctgaa 20295616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838241
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  21838241 t 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110277
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22110277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114126
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19107780 - 19107625
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19107780 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 19107681  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |  | ||||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19107680 tgtatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19107625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 21234675 - 21234852
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  21234675 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 21234774  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| || ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  21234775 cgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 21234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831594
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  21831594 t 21831594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025394
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21025394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760056
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    |  | ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  ||| |||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  244 attcttgaatagtata 259  Q
    |||  |||||||||||    
T  19760041 atttatgaatagtata 19760056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 120
Target Start/End: Original strand, 17043968 - 17044059
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043968 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361288
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 22361288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099668
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  245 ttcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| |||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtat 23099668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24949618 - 24949410
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  24949618 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 24949519  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  24949518 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggg 24949419  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  24949418 gatgctgaa 24949410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 27209590 - 27209822
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27209590 aggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgc 27209689  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| ||    
T  27209690 acatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtat 27209789  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27209790 gctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtat 27209822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23277804 - 23277569
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23277804 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 23277705  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23277704 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23277605  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||  |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  23277604 gattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtat 23277569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1064779 - 1064544
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  1064779 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 1064680  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  1064679 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 1064580  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  1064579 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 1064544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31831686 - 31831451
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  31831686 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 31831587  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  31831586 tacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 31831487  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  31831486 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 31831451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20829287 - 20829052
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20829287 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 20829188  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20829187 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 20829088  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  20829087 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 20829052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111529
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || ||| |||| || ||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  23111543 attcttgaacagtat 23111529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23294963 - 23294728
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  23294963 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgt 23294864  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| |  |||||||    
T  23294863 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggg 23294764  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  23294763 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 23294728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 19651465 - 19651700
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  19651465 cagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 19651564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  19651565 tgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 19651664  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19651665 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 19651700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710871
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 24710871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923796
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16923796 t 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926267
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16926267 t 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16983059
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16983059 t 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999907
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16999907 t 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064624
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  17064624 t 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324392
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  22324392 t 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218923
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27218923 t 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067262
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 23067262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372142
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 27372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385105
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  44385105 t 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107302
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagattt 23107302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12575381 - 12575227
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  12575381 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 12575282  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  12575281 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 12575227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Original strand, 21144453 - 21144611
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21144453 agacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 21144552  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || ||||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  21144553 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 21144611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869757
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10869757 t 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41607921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  41607921 t 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27788768 - 27788615
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  27788768 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 27788669  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  27788668 t-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 27788615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876285
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263279
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533150
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || || ||||| || ||  |||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 45533150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324836
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagat 21324836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 24706915 - 24707088
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||    
T  24706915 ttattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattga 24707014  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24707015 tggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Original strand, 17967179 - 17967287
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||| | || | ||  |||||||||| | |||||| |||||||| ||| | |    
T  17967179 cagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttgagttgagttatcttacgtgaaagaccaatgtagtagtagatgcattgagtaggaagtcct 17967278  T
Q  123 tacacatgt 131  Q
    | |||||||    
T  17967279 tgcacatgt 17967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1076
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1311 cagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacat 1212  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1211 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttggg 1112  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1111 tatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtat 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2443
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  2208 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 2307  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2308 tgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 2407  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  2408 tatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtat 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 68798 - 68563
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  68798 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 68699  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  68698 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 68599  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  68598 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtat 68563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 3831 - 4066
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3831 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgt 3930  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  3931 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggg 4030  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  4031 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 4066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 12786 - 13015
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  12786 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 12885  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  ||||||||||| ||||||| || || || | ||||||       || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12886 tgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 12978  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtata 259  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  12979 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtata 13015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20984865 - 20985100
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20984865 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgt 20984964  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20984965 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 20985064  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  20985065 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtat 20985100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841645
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  21841659 tttcttgaacagtat 21841645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19852874 - 19852639
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19852874 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19852775  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || |||||    
T  19852774 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattggg 19852675  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19852674 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 19852639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19858910 - 19858675
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19858910 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19858811  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || |||||    
T  19858810 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattggg 19858711  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19858710 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 19858675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14566605 - 14566370
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  14566605 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 14566506  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14566505 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14566406  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  14566405 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 14566370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22372394 - 22372159
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22372394 cagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22372295  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | || |||||||||   |||| | | |||||||||||||||||    
T  22372294 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttggg 22372195  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  22372194 tatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacagtat 22372159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23656389 - 23656155
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  23656389 agagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgtt 23656290  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||     
T  23656289 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggt 23656190  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  23656189 atgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtat 23656155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 20974974 - 20975205
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20974974 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20975073  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||     || ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20975074 tgcatatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 20975168  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtata 259  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||||||||    
T  20975169 gatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtata 20975205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21324587 - 21324794
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  21324587 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 21324686  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  21324687 tgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggg 21324785  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21324786 gatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6605121 - 6604886
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6605121 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 6605022  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  6605021 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 6604922  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  6604921 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtat 6604886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Original strand, 20009239 - 20009467
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20009239 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20009337  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20009338 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 20009437  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  20009438 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaa 20009467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 22376790 - 22376963
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||    
T  22376790 ttattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatga 22376889  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22376890 tggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtg 22376963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 22382965 - 22383138
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||    
T  22382965 ttattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatga 22383064  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22383065 tggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtg 22383138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 211
Target Start/End: Original strand, 29302744 - 29302932
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  29302744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacat 29302843  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagt 211  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  29302844 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagt 29302932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 31415789 - 31416027
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  31415789 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacat 31415888  T
Q  123 tacacatgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||||| ||     ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  31415889 tgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagtt 31415988  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  31415989 ggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtat 31416027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 150
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921181
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 19483388 - 19483573
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  19483388 agatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 19483487  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  19483488 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 19483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979195
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || |||||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  245 ttcttgaatagtat 258  Q
    || ||||| |||||    
T  19979208 tttttgaagagtat 19979195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 16270542 - 16270750
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16270542 cagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16270641  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16270642 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 16270741  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  16270742 gatgctgaa 16270750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389333
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || ||| | || || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  20389341 gttcttgaa 20389333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252250
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21252250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680339
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 249  Q
    | || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  250 gaatagtat 258  Q
    ||| |||||    
T  6680347 gaacagtat 6680339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673496
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 17673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 31570160 - 31570314
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  31570160 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 31570259  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31570260 ttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 31570314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22041316 - 22041131
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || |    
T  22041316 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcata 22041217  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  22041216 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12306221 - 12306013
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || |    
T  12306221 cagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacat 12306122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12306121 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 12306022  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||||||||    
T  12306021 gatgttgaa 12306013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19114032
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  19114032 t 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017702
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  20017702 t 20017702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247860
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393340
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21393340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787834
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21787834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22052334 - 22052172
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22052334 acatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 22052235  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
     |||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||    
T  22052234 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 22052172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043753
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagat 21043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166011
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 21166011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857919
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  18857919 t 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Original strand, 30312468 - 30312636
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  30312468 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcata 30312567  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  30312568 tgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 30312636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 258
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803226
Alignment:
Q  96 ttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  196 attgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 803226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15534849 - 15534689
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  15534849 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 15534750  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15534749 cattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagattt 15534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267544
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagattt 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32601601 - 32601433
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  32601601 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 32601502  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  32601501 tgtccgctttgatggttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaat 32601433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19869159 - 19869044
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  19869159 agacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 19869060  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  19869059 ccttgcacatgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27355999 - 27355924
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttg 98  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27355999 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23452825 - 23452722
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| || || | |||||| ||  || ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  23452825 agatggttggaattattgaaggattatgattttgagttgagttatcttccaggaaaggtcaatgtcgtaacatatgccatgagtaggaagtccttacaca 23452726  T
Q  129 tgtc 132  Q
    ||||    
T  23452725 tgtc 23452722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 22132367 - 22132428
Alignment:
Q  31 atggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatg 92  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22132367 atggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 22132428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27901783 - 27901547
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27901783 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 27901684  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||    
T  27901683 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttggg 27901584  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtata 259  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27901583 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtata 27901547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 15002239 - 15002474
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15002239 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15002338  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15002339 tgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15002438  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  15002439 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 15002474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 29452412 - 29452647
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  29452412 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 29452511  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  29452512 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 29452611  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  29452612 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 29452647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 15413916 - 15414136
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || |    
T  15413916 gagttgttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagcta 15414015  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15414016 tgatggttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaa 15414115  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  15414116 tagtgagttcttgaatagtat 15414136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 3263669 - 3263904
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  3263669 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 3263768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  3263769 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 3263868  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  3263869 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtat 3263904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 15357995 - 15358230
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15357995 cagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgt 15358094  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| ||    
T  15358095 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagg 15358194  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15358195 gatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtat 15358230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16149107 - 16148872
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16149107 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16149008  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16149007 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16148908  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtata 259  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  16148907 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtata 16148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16153253 - 16153018
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16153253 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16153154  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16153153 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16153054  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtata 259  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  16153053 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtata 16153018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33224320 - 33224086
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  33224320 cagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 33224221  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  33224220 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 33224121  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagta 257  Q
     ||| |||  || |||| ||| |||||||||||||    
T  33224120 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagta 33224086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320317
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 239  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaata 15320317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15247321 - 15247086
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||    
T  15247321 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgt 15247222  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||  |||||||| ||||||||    
T  15247221 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggg 15247122  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15247121 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 15247086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Original strand, 11206107 - 11206341
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  11206107 agaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacttt 11206206  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||     
T  11206207 gcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggg 11206306  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  11206307 atgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtat 11206341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707088
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  8707096 gttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15071756 - 15071602
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15071756 cagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15071657  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15071656 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 16354078 - 16354251
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  16354078 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 16354177  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  16354178 tggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146672
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 15146672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14160867 - 14160710
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  14160867 cagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagacct 14160768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||  | |||||||||||    
T  14160767 tgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagattt 14160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078797
Alignment:
Q  137 atgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatca 236  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  237 ataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtat 15078797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23957138 - 23956953
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  23957138 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23957039  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| || |||||||| |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23957038 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387688
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8387688 t 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477876
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  12477876 t 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298481
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  18298481 t 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777529
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  19777529 t 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20892379 - 20892171
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20892379 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 20892280  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20892279 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 20892180  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  20892179 gatgctgaa 20892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038140
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29038140 t 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695275
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  14695289 attcttgaacagtat 14695275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27712727 - 27712578
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
T  27712727 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcata 27712628  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  27712627 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 27712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052359
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8052359 t 8052359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 44660733 - 44660952
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |     
T  44660733 acatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaa 44660832  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || || || || ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |     
T  44660833 gaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 44660932  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaat 234  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  44660933 cagttgggaatgttgaaaat 44660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 51605667 - 51605821
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  51605667 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 51605766  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  51605767 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 51605821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524918
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12524918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850136
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagat 14850136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40474431 - 40474282
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  40474431 agatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcata 40474332  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| || |||||||| || || || || || || || ||||||||||||    
T  40474331 tgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 40474282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681867
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 18226067 - 18226269
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  18226067 agatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 18226166  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| ||  ||||||| |   | ||||||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |    
T  18226167 tgtcagctttgatggttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgct 18226266  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  18226267 gaa 18226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 1648153 - 1648329
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  1648153 agaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacatt 1648252  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  | |||||||| ||||    
T  1648253 gcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgt 1648329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302828
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||| |||| |||||    
T  14302814 attcctgaaaagtat 14302828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 18614460 - 18614596
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18614460 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatgg 18614559  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | |  || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  18614560 ttagagagtttgagttacttgaacaattcagagattt 18614596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 430 - 665
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  430 cagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  530 tgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 629  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  630 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13329
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagattt 13329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7291
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11206 - 10986
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  11206 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgcta 11107  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  11106 tgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaa 11007  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  11006 tagtgatttcttgaatagtat 10986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5623
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5858 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgt 5759  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5758 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 5659  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  5658 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 5623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Original strand, 24755 - 24989
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755 agagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgtt 24854  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||  ||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||     
T  24855 gcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttgggg 24954  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  24955 atgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 24989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 111 - 346
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  111 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 210  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  211 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttggg 310  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  311 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtat 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29485 - 29254
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  29485 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 29386  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  29385 tgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 29286  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  29285 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaata 29254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30216
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagattt 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50238 - 50168
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 93  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50238 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 324132 - 323897
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  324132 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 324033  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  324032 tgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 323933  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  323932 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtat 323897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118477
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 200  Q
    | || || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgt 118477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89558
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  89323 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 89422  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  89423 tgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 89522  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  89523 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 89558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 90001 - 90236
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  90001 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 90100  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  90101 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 90200  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  90201 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 90236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27717
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  27731 tttcttgaacagtat 27717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41129 - 40891
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  41129 agacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 41030  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  41029 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 40930  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  40929 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 40891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1961
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1732 cagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 1831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||  |||||||    
T  1832 tgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggg 1931  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||    
T  1932 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaa 1961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Original strand, 47912 - 48141
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  47912 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgt 48011  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  48012 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttggg 48111  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48112 tatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaa 48141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 56725 - 56960
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||     
T  56725 cagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgc 56824  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||  |||||  ||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  56825 tgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 56924  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  56925 aatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtat 56960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 46277 - 46512
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  46277 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgt 46376  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  46377 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 46476  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  46477 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 46512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 41211 - 41446
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  41211 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 41310  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41311 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 41410  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  41411 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtat 41446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3107
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 250  Q
     |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  251 aatagtat 258  Q
    ||||||||    
T  3114 aatagtat 3107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6204
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  242 gaattcttgaatagtat 258  Q
    || |||||||| |||||    
T  6188 gatttcttgaacagtat 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 10935 - 11170
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10935 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 11034  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  11035 tgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 11134  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  11135 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtat 11170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 14705 - 14940
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14705 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 14804  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  14805 tgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 14904  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  14905 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtat 14940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21411 - 21176
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| |  | |||||    
T  21411 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgt 21312  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  21311 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 21212  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  21211 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtat 21176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15305
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  15540 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggt 15441  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15440 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15341  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15340 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 15305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28645 - 28410
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  28645 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 28546  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  28545 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 28446  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  28445 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtat 28410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34898 - 34663
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  34898 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 34799  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  34798 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 34699  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  34698 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtat 34663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 95 - 172
Alignment:
Q  82 taaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagtt 159  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagtt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13393
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13628 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 13529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13528 tgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggg 13429  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  13428 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 43976
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |    
T  44211 cagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacat 44112  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44111 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 44012  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  44011 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 43976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 250041 - 249809
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  250041 cagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 249942  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |    
T  249941 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcg 249842  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatag 255  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  249841 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatag 249809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 194
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  429 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgt 330  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||    
T  329 tgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgg 230  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  229 gatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtat 194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4969
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  5204 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgt 5105  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |    
T  5104 tgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgag 5005  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  5004 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6351
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  6116 cagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 6215  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  6216 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggg 6315  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  6316 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 6351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42345 - 42110
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  42345 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 42246  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  42245 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 42146  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  42145 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 42110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 149997 - 149763
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  149997 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 149899  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  149898 tgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 149799  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  149798 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 149763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 194582 - 194817
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||    
T  194582 cagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgt 194681  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | || || |||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  194682 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggg 194781  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  194782 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtat 194817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 180
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25568
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagattt 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 50774 - 50988
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||    
T  50774 ttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatgg 50873  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||| |||| || |||| |||    
T  50874 taaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtga 50973  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     ||||||||||||||    
T  50974 tttcttgaatagtat 50988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 171
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  406 cagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 307  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  306 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 207  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  206 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2781
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||| ||    
T  3016 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgt 2917  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  2916 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 2817  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  2816 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 2781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5943
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  247 cttgaatagtat 258  Q
    ||||||||||||    
T  5954 cttgaatagtat 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 2363 - 2598
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  2363 cagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 2462  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |||  ||||||| ||||||||    
T  2463 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttggg 2562  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || |||  | | ||||||||||||||    
T  2563 tatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtat 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2468
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2225 acatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtag 2324  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||| || |||||  | |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||     
T  2325 gaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgtt 2424  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    |||||||| ||| |||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  2425 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtat 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8253
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8488 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgt 8389  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8388 tgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8289  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  8288 gatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtat 8253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48297
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  247 cttgaatagtat 258  Q
    ||||| ||||||    
T  48308 cttgagtagtat 48297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32839 - 32604
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| || || ||||    
T  32839 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgt 32740  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  32739 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 32640  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32639 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 32604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 851 - 1086
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  851 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgt 950  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||| ||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  951 tgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttggg 1050  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  1051 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20822 - 20587
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  20822 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacat 20723  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20722 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 20623  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||    
T  20622 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtat 20587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23642 - 23407
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  23642 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacat 23543  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23542 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23443  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||    
T  23442 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtat 23407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4561
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  4330 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 4429  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  4430 tacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 4529  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  4530 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaata 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 100440 - 100675
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  100440 cagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacat 100539  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||  ||||| | || |||||    
T  100540 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggg 100639  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  100640 gatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtat 100675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  95 gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  195 aattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||| || | | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 517
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  755 agacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 656  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||    
T  655 ccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 556  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  555 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtat 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1282 - 1062
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |    
T  1282 gagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctacta 1183  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||  |||  ||||| || || ||||||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  1182 tgatggtaaaggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaa 1083  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  1082 tagtgatttcttgaatagtat 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17084
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
    |||||||||    
T  17076 attcttgaa 17084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 3944
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||    
T  4177 cagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgt 4078  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  4077 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttggg 3980  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  3979 aatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtat 3944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3604 - 3369
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  3604 cagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 3505  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||| |||  |||||||  |||||||    
T  3504 tgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttggg 3405  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  3404 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 3369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28052 - 27818
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||    
T  28052 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcagaa-gacgt 27954  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || |||||||| || |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  27953 tggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttggg 27854  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27853 tatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtat 27818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 51058 - 51289
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  51058 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 51157  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  51158 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 51257  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||    
T  51258 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaata 51289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 60092 - 60323
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  60092 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 60191  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  60192 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 60291  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||    
T  60292 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaata 60323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66711
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  66480 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 66579  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  66580 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 66679  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||    
T  66680 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaata 66711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20313
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20548 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacat 20449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  20448 tgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 20349  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  20348 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 20313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18328
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||||||||||||||    
T  18314 attcttgaatagtat 18328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11926
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 164  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || || |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  165 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtat 11926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 79390 - 79563
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  79390 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatga 79489  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| |  || || |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  79490 tggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 79563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 3150 - 3385
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  3150 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 3249  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3250 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 3349  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  3350 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtat 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10570
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  10335 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 10434  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  10435 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 10534  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  10535 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtat 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20784
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  20549 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 20648  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  20649 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 20748  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  20749 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtat 20784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 566 - 799
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  566 cagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgt 664  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  665 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggg 764  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||    
T  765 gatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtat 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30398
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  30163 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 30262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  30263 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 30362  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  30363 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtat 30398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||| |||||||    
T  9907 gttcttggatagtat 9921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 252
Target Start/End: Original strand, 1 - 169
Alignment:
Q  84 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  184 ccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaa 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7231
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  7023 cagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 7122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  7123 tgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 7222  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||||||||    
T  7223 gatgttgaa 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12613
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12405 cagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgc 12504  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  12505 tgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 12604  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  12605 gatgctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31788
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 31788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 177155 - 177375
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |    
T  177155 gagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgcta 177254  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  177255 tgatggttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaa 177354  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  177355 tagtgaattcttgaacagtat 177375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218524
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
    |||||||||    
T  218516 attcttgaa 218524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 13177 - 13412
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  13177 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 13276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13277 tgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggg 13376  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||||| || | | | ||||||||||||||    
T  13377 gatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtat 13412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6443
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  179 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtat 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10874
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  179 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtat 10874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45945 - 45710
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||      
T  45945 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccc 45846  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  45845 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 45746  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||||||    
T  45745 aatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtat 45710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19340
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21315 - 21138
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21315 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 21216  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 200  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  21215 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgt 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 109058 - 108859
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||    
T  109058 cagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgt 108959  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  108958 tgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63081
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || |  || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 63081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16475
Alignment:
Q  99 cagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  199 gttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 256  Q
    || | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagt 16475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10849
Alignment:
Q  27 ggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 105  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10771 ggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgc 10849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 15378 - 15559
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | ||||    
T  15378 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 15477  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| ||  | ||||| || ||||  || ||||||||| |||||||    
T  15478 tggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttggg 15559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16925
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagattt 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16148
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagattt 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112523
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagattt 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15826
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15591 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactt 15690  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |  |||||||    
T  15691 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttggg 15790  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15791 aaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtat 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10630
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||  | ||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  10644 attcttgaacagtat 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32432
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  32198 agagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacatt 32297  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | ||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||     
T  32298 acatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggg 32397  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||    
T  32398 atgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtat 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35540 - 35422
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  35540 agagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgtt 35441  T
Q  124 acacatgtcggccatgatg 142  Q
     |||||||| || ||||||    
T  35440 gcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28418
Alignment:
Q  149 gaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattct 248  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  249 tgaatagtat 258  Q
    ||||||||||    
T  28427 tgaatagtat 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8828 - 8670
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8828 agacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 8729  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || ||||| || ||||||||||  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  8728 cattgcatatgtccgctatgatggtgagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10240
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagattt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7688
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29621
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13661
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || | || ||| | || ||| ||| |||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  13675 attcttgaacagtat 13661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5281 - 5091
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | ||||    
T  5281 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 5182  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    |||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  5181 tggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12411 - 12221
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | ||||    
T  12411 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 12312  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    |||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12311 tggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23298
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | |||||  |||||||| | || ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||| || ||||||||    
T  23284 attttttaatagtat 23298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || || || ||||| || || ||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7442 - 7270
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7442 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacat 7343  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || |||||  | |||||||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  7342 tgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtga 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Original strand, 277726 - 277862
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  277726 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 277825  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    |||| |  || || |||||||| || |||||||||||    
T  277826 tggttagagagttcgagttacttgaacagtttagaga 277862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 261735 - 261585
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  |    
T  261735 agaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacact 261636  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttag 174  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||    
T  261635 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttag 261585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7643
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7356
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3620
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 156  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14246
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 37
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2540
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 2540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18777 - 18542
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  18777 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacat 18678  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||| ||||||||    
T  18677 ttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttggg 18578  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| ||||  | |||| ||| ||||||||||||||    
T  18577 tatgctgaaggttaatagtgatttcttgaatagtat 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25979
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || |||||  | || ||||||||||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagattt 25979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 5214 - 5449
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  5214 cagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagacct 5313  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||   ||||||    |||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  5314 tacatatgtctgcgtagatggtatgagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 5413  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||||||    
T  5414 gatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtat 5449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39872
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagt 170  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  171 ttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||  || |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtat 39872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50688
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtga 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19839
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtg 19839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35263
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtg 35263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 80710 - 80864
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||      
T  80710 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacac 80809  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||    
T  80810 tacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 80864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5268
Alignment:
Q  62 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttac 161  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  162 tcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||| |||||||||    
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtg 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 178
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  390 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 291  T
Q  123 ----tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagt 218  Q
        || | ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||    
T  290 tgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagt 191  T
Q  219 tgggcatgttgaa 231  Q
    |||| ||| ||||    
T  190 tggggatgctgaa 178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7366
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28361 - 28150
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || || || |    
T  28361 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacat 28262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  28261 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 28162  T
Q  223 catgttgaaaat 234  Q
     ||| |||||||    
T  28161 gatgctgaaaat 28150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26230
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | |  || || ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtga 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24179
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  24171 gttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8639
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |||||  | || |||||||||||||| ||  | || |||||||||| | | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38982
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagagatt 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 966 - 1102
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagattt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8246
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8246 t 8246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4383
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggattt 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2200
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24723
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 32457 - 32560
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  32457 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcata 32556  T
Q  129 tgtc 132  Q
    ||||    
T  32557 tgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4328
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 4328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2101
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||  | || ||| | | ||| |||||||  ||  | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||| ||||| |||||    
T  2115 atttttgaacagtat 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14331
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14178 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  14277 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 22357 - 22510
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22357 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22455  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22456 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10129
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||| ||| | || || |||||| ||||||| ||  | || |||||| ||| |||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||  ||||||||||    
T  10115 atttctgaatagtat 10129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1800
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1712 cagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85620
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || |||||||| || || ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | || || |||||||| |||||  |||||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaatt 85620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 6790 - 6888
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||    
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatg 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 96592 - 96438
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  96592 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 96493  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  96492 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagaga 96438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38853
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 66836 - 66745
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  66836 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 66745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6641 - 6414
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  6641 cagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 6542  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || |||||  | ||||||||    
T  6541 ttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 6442  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttg 250  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||    
T  6441 catgctgaagattaatagtgatttcttg 6414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28367
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3491
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagattt 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131377
Alignment:
Q  80 ggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatt 179  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  180 t 180  Q
    |    
T  131377 t 131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11818
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  11664 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 11763  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||  | || || |||||||||||    
T  11764 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagaga 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39828
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 39828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6492
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcag 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  170 tttagagattt 180  Q
    || ||||||||    
T  6502 ttcagagattt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19033
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 19033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196453
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||  | ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14050
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtag 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 343
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16591
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagttt 172  Q
    | || ||||||||  | |||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University