View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9060_low_21 (Length: 463)

Name: NF9060_low_21
Description: NF9060
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9060_low_21
NF9060_low_21
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-445)||(2678076-2678520)
chr6 (9-433)||(2573610-2574034)
chr6 (8-445)||(2618872-2619309)
chr6 (8-430)||(2585181-2585603)
chr6 (1-430)||(2601092-2601521)
chr6 (9-433)||(2645870-2646294)
chr6 (7-438)||(2431691-2432122)
chr6 (5-444)||(2447724-2448163)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (167-402)||(33801722-33801957)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (167-402)||(53664676-53664911)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (171-445)||(17874209-17874483)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 2678520 - 2678076
Alignment:
Q  1 aaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678520 aaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggtt 2678421  T
Q  101 cccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtaca 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2678420 cccttttgtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaaatgagagaagagtacaatcaagccggtaca 2678321  T
Q  201 atagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678320 atagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtga 2678221  T
Q  301 aattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaat 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678220 agttgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttggccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaat 2678121  T
Q  401 ggtcatgtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgcggttgg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2678120 ggtcatgtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgctgttgg 2678076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2574034 - 2573610
Alignment:
Q  9 taggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2574034 taggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttccttggaagctacatagcagcatttgcattgttatggagattggcaattgttgggttcccttttt 2573935  T
Q  109 tggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcaga 208  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2573934 tggtactactagtgattcctggtttcatgtatggaagaatttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcaca 2573835  T
Q  209 acaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggga 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2573834 acaagcaatatcttcaatcagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggga 2573735  T
Q  309 ttgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcatgt 408  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2573734 ttgaaacaaggcttggcgaaaggcataggcataggaagcaatggtcttgtttttgctgtatggtctttgatgtcatattatggtagcagaatggtcatgt 2573635  T
Q  409 atcatggtgctaaaggtggtactgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2573634 atcatggtgctaaaggtggtactgt 2573610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 445
Target Start/End: Original strand, 2618872 - 2619309
Alignment:
Q  8 ataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttccctttt 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2618872 ataggttccgaattttgtgatgaatacatctattttctttggaggatacatagtggcatttgcattgttatggagattggcaattgttgggttccctttt 2618971  T
Q  108 gtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2618972 gtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatggaagaactatgatgggattggctagaaaaatgagagaagagtacaataaagcaggtacaatagcag 2619071  T
Q  208 aacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2619072 aacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggg 2619171  T
Q  308 attgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcatg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2619172 attgaaacaaggcttagctaaaggcttaggcataggaagcaatggtcttctttttgctgtatggtctttgatggcctattatggtagcagaatggtcatg 2619271  T
Q  408 tatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgcggttgg 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2619272 tatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgctgttgg 2619309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Original strand, 2585181 - 2585603
Alignment:
Q  8 ataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttccctttt 107  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2585181 ataggttccggattttttgatgaatacatctaatttcattggaggatacatagtggcatttgctttgttatggagattagcaattgttgggttccctttt 2585280  T
Q  108 gtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcag 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2585281 gtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatggggttggctagaaaaattagagaagagtacaataaagctggtacaatagcag 2585380  T
Q  208 aacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  2585381 aacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagatgctttctctgaagctttggaaggatcagtgaagttggg 2585480  T
Q  308 attgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcatg 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||    
T  2585481 attgaaacaaggtttagctaagggcttggccataggaagcaatggtgttaattttgctatatggtcttttatggcatattatggtagcagaatggttatg 2585580  T
Q  408 tatcatggtgctaaaggtggtac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2585581 tatcatggtgctaaaggtggtac 2585603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 2601521 - 2601092
Alignment:
Q  1 aaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2601521 aaattatataggttccaaattttttgatgaatgtgtctatgttccttggaagctacatagcagcatttgcatcgttatggagattggcaattgttgggtt 2601422  T
Q  101 cccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtaca 200  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2601421 cccttttttggtattactagtgattcctggtttcatgtatggaaggacttcgatgggattggctagaaaaattagggaagagtacaataaagcaggtaca 2601322  T
Q  201 atagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2601321 atagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttacaggagaaaacaaaaccatagctgctttctctgatgctttggaaggaccactga 2601222  T
Q  301 aattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaat 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  2601221 agttgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttaggcataggaagcaatggtcttgtttttgccgtatggtcgttgatgtcctattatggtagcagaat 2601122  T
Q  401 ggtcatgtatcatggtgctaaaggtggtac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2601121 ggtcatgtatcatggtgctaaaggtggtac 2601092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2646294 - 2645870
Alignment:
Q  9 taggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttttg 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  2646294 taggttccaaatttgttgatgaatgcatctatgttcattggaagctatatagtagcatttacattattatggagattggcaattgtagggttccctttta 2646195  T
Q  109 tggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcaga 208  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  2646194 ttgttctacttgtgattcctggtttcatgtatcgaaggacatcgatgggattggctagaaaaattagtgaagagtataatcgagctggtacaatagcaga 2646095  T
Q  209 acaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattggga 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2646094 acaagcaatatcttcaatcagaactgtttattcctttacaggagaaaacaaaaccatagctgctttctcaaatgctttggaaggatcagtgaagttggga 2645995  T
Q  309 ttgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcatgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  2645994 ttgaaacaaggcttagctaaaggttttgccataggaagcaatggtgttgtttttgcaatagcttcttttatgacttattatggtagcagaatggtcatgt 2645895  T
Q  409 atcatggtgctaaaggtggtactgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2645894 atcatggtgctaaaggtggtactgt 2645870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 438
Target Start/End: Original strand, 2431691 - 2432122
Alignment:
Q  7 tataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2431691 tataggttccaaattttttggtgaatgcatctaggttcctttcaagcaacatagtagcatttgcattattatggagattggctattgttggattcccttt 2431790  T
Q  107 tgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagca 206  Q
    | |||  || |||||||| ||||||| |||||||  |||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  2431791 tatggttcttcttgtgatccctggttacatgtataagaggatttcgatgaggttggctagaaagattagagaagagtacaatcaagctggtacaatagcg 2431890  T
Q  207 gaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattgg 306  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2431891 gaacaagcaatatcttctataagaactgtttattcttttgtaggggaaagcaaaactctagcagctttctctaatgctttggaagggtcagtgaaattag 2431990  T
Q  307 gattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcat 406  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || | ||  |||||||||| |||||||||    
T  2431991 gtttgaaacaaggtttggctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtctatgctatatggtctttaatattctactatggtagcataatggtcat 2432090  T
Q  407 gtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttg 438  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2432091 gtatcatggtgctaaaggcggtacagtatttg 2432122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 444
Target Start/End: Original strand, 2447724 - 2448163
Alignment:
Q  5 tatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttccct 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2447724 tatacaggttccaaattttttgaagcatgtatctaagttcattgggaactacatagtggcatttgcattgttatggagattggccattgttgggttccct 2447823  T
Q  105 tttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatgggattggctagaaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatag 204  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||| ||||| |||  |||  ||  |||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2447824 tttgtggttctaattgtgactcctggcttcatatataagaggattatgattaggttggctagaaatatcagagaagagtacaatcaagctggtacaatag 2447923  T
Q  205 cagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaatt 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||||| || |  |  ||||||||||||| ||    
T  2447924 cagaacaagcgatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggggaaaataagactatatctgctttctctgattcacttcaaggatcagtgaagtt 2448023  T
Q  305 gggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtc 404  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |  |  |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2448024 gggattgaaacaaggcttggttaaaggcttagctataggaagcaatgctattgtgtatattcaatggtgttttatgtcatattatggtagtagaatggtc 2448123  T
Q  405 atgtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgcggttg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2448124 atgtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgcagttg 2448163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 167 - 402
Target Start/End: Original strand, 33801722 - 33801957
Alignment:
Q  167 aaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccata 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801722 aaaaatgagagaagagtaaaataaagccggtaaaatagcagaacaagcaatttcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccata 33801821  T
Q  267 gctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgcta 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||     
T  33801822 gctgctttctctaatgctttggaaggataagtgaaattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttaagcataggaagcaatggtcttctttttgctg 33801921  T
Q  367 tatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatgg 402  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  33801922 tatggtctttgatggcctattatggtagcagaatgg 33801957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 167 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53664911 - 53664676
Alignment:
Q  167 aaaaattagagaagagtacaataaagccggtacaatagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccata 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53664911 aaaaatgagagaagagtacaataaagccggtataatagcagaacaagcaatttcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccata 53664812  T
Q  267 gctgctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgcta 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  53664811 gctgctttctctaatgctttggaaggatgagtgaaattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttaagcataggaagtaatggtcttctttttgctg 53664712  T
Q  367 tatggtcctttatgtccttttatggtagcagaatgg 402  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  53664711 tatggtctttgatggcctattatggtagcagaatgg 53664676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 17874483 - 17874209
Alignment:
Q  171 attagagaagagtacaataaagccggtacaatagcagaacaagcaatatcttcaattagaactgtttattcctttgcaggagaaagcaaaaccatagctg 270  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||| ||||   ||    
T  17874483 attagagaagagtataatcaagctggtacaattgcagaacaaacaatatctaccattagaactgtctattcatttgtgggagaaaacaaatccatgtttg 17874384  T
Q  271 ctttctctaatgctttggaaggatcagtgaaattgggattgaaacaaggcttagctaaaggcttagccataggaagcaatggtgttgtttttgctatatg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||    || || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  17874383 ctttctctaatgctttgcaagggattgttaatttgggtttaaaacaaggattagctaaaggtttagcaattggaagcaatggtgttgtctttgcaatttg 17874284  T
Q  371 gtcctttatgtccttttatggtagcagaatggtcatgtatcatggtgctaaaggtggtactgtatttgcggttgg 445  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  17874283 gtccttcatgtgctattatggtagcaaattggttatgtatcatggtgctaaaggagggacagtttttgcagttgg 17874209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University