View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9068_low_1 (Length: 726)

Name: NF9068_low_1
Description: NF9068
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9068_low_1
NF9068_low_1
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (10-726)||(92975-93691)
scaffold0001 (24-726)||(124349-125053)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (17-726)||(6955-7675)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (12-726)||(24915597-24916322)
chr2 (24-726)||(23198419-23199132)
chr2 (24-726)||(22640220-22640932)
chr2 (24-719)||(23811565-23812273)
chr2 (302-726)||(23624102-23624537)
chr2 (24-80)||(23616962-23617018)
chr2 (126-208)||(25113814-25113896)
chr2 (43-85)||(25113752-25113794)
chr2 (658-719)||(25114356-25114417)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (17-726)||(21295864-21296584)
chr1 (21-726)||(22802354-22803070)
chr1 (10-726)||(22691785-22692501)
chr1 (12-726)||(41377952-41378677)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (21-726)||(136617-137333)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (10-726)||(6049-6775)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (21-726)||(16212153-16212871)
chr6 (24-726)||(19032745-19033458)
chr6 (33-177)||(13779671-13779815)
chr6 (493-600)||(13779244-13779351)
chr6 (33-177)||(20190538-20190682)
chr6 (33-177)||(22145309-22145453)
chr6 (544-614)||(20191060-20191130)
chr6 (544-614)||(22144861-22144931)
chr6 (655-726)||(16164100-16164171)
chr6 (12-85)||(16163464-16163537)
chr6 (658-719)||(17806909-17806970)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (24-726)||(22346331-22347044)
chr8 (24-726)||(22341148-22341861)
chr8 (296-726)||(22069665-22070107)
chr8 (55-300)||(22172837-22173081)
chr8 (24-94)||(22711360-22711430)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (24-726)||(13369-14082)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (24-726)||(21512905-21513618)
chr5 (12-257)||(22849785-22850029)
chr5 (35-256)||(26864113-26864333)
chr5 (544-621)||(26864595-26864672)
chr5 (419-622)||(22850199-22850402)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (21-631)||(14744540-14745161)
chr4 (24-726)||(15151472-15152185)
chr4 (24-726)||(13286942-13287646)
chr4 (17-716)||(18560121-18560830)
chr4 (627-726)||(14748104-14748203)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (12-726)||(39841-40546)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (12-726)||(13304466-13305191)
chr3 (12-726)||(10784072-10784797)
chr3 (12-726)||(14690996-14691721)
chr3 (12-726)||(7362999-7363723)
chr3 (24-726)||(10154898-10155611)
chr3 (96-205)||(14141009-14141118)
chr3 (536-600)||(14140603-14140667)
chr3 (547-600)||(268499-268552)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (12-726)||(71341-72066)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (24-726)||(20601-21314)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (24-726)||(18169198-18169911)
chr7 (23-726)||(14340221-14340935)
chr7 (17-109)||(13375549-13375641)
chr7 (120-256)||(14164780-14164916)
chr7 (568-726)||(13276022-13276180)
chr7 (33-173)||(18458833-18458973)
chr7 (662-720)||(16033523-16033581)
chr7 (543-597)||(18457830-18457884)
chr7 (356-415)||(18458024-18458083)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (24-719)||(32888-33594)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (24-726)||(12930-13643)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (194-676)||(55920-56405)
scaffold0046 (672-726)||(35407-35461)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (24-726)||(35222-35936)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (12-549)||(150940-151488)
scaffold0013 (12-292)||(111815-112095)
scaffold0013 (505-719)||(85096-85310)
scaffold0013 (569-719)||(77289-77439)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (12-719)||(902-1621)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (24-390)||(66422-66788)
scaffold0023 (24-390)||(75600-75966)
scaffold0023 (419-552)||(66293-66426)
scaffold0023 (419-552)||(75471-75604)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (21-412)||(67093-67485)
[»] scaffold0897 (1 HSPs)
scaffold0897 (24-142)||(1861-1979)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (24-142)||(130109-130227)
scaffold0016 (604-719)||(177471-177586)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (35-256)||(54110-54330)
[»] scaffold0401 (2 HSPs)
scaffold0401 (12-256)||(6162-6406)
scaffold0401 (536-597)||(5810-5871)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (43-257)||(57013-57228)
[»] scaffold0757 (2 HSPs)
scaffold0757 (12-185)||(3318-3491)
scaffold0757 (517-614)||(2879-2976)


Alignment Details
Target: scaffold0001 (Bit Score: 625; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 93691 - 92975
Alignment:
Q  10 tggacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaag 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93691 tggacaacatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaag 93592  T
Q  110 gcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  93591 gcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattaagtaccctacttagataatatatggctttttctgtgccatttttatcctcttgtgcc 93492  T
Q  210 aacatgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgact 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93491 aacattctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgact 93392  T
Q  310 tgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93391 tgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttag 93292  T
Q  410 atttgatatgaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  93291 atttgatatgaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctgtttgat 93192  T
Q  510 ttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  93191 ttcgattccctttttatgcaccacgaaacctaaaaaatcacctgcacaaaccccgaatgcacattttaatggattcattttcaatccatattgcttcatc 93092  T
Q  610 ctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaat 709  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  93091 ctttcaaaagatcggcgtaaatgttccaaatgtttttcctctaaagaagattttaccacaatatcatcaatataaatttgcataaaatcttatatgaaat 92992  T
Q  710 catgaaacattaaattc 726  Q
    |||||||||||||||||    
T  92991 catgaaacattaaattc 92975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 124349 - 125053
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||    
T  124349 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacaaaaacaaagtttatcac 124448  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  124449 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtaccatacttagatagtaaatggccctttctgtgccatattcattctcttgtgctaacatacttcctat 124548  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||| || || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  124549 ggtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcctatctttcaacaaaggggaaagaaccggaggatttaccagatatgacttgatttcatcgaaa 124648  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||         
T  124649 gctttttggtgctcaggttcccatttgaaaatatcgtctttcttcagtcgaagtaatggtgagaaagcttgtgtcttcccactcagatttgatatgaacc 124748  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124749 tccggagaaagttgatttttcccagtaatgactgcaactctttcttcatagaaggagctttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 124848  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124849 gattccttttttgtgcactacgaaacctaagaaatcaccggcacaaactccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 124948  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    ||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||    
T  124949 tcaaatgattgacgtgaatgttccaaatgtctttcttccgaagaagattttacc---------tcaatgtaaactttcataaaatcttctatgaagtcat 125039  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  125040 ggaacattaaattc 125053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 7675 - 6955
Alignment:
Q  17 catgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7675 catgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagt 7576  T
Q  117 ttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgc 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |    
T  7575 ttttcactatgatgatatcttgtttcagcatcattgagtaccctacttagataatatatggctttttctgtgccatttttatcctcttgtgccaacattc 7476  T
Q  217 tgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7475 tgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttc 7376  T
Q  317 atcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgat 416  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7375 atcgaaggctttttggtgttccggctcccatttgaaaacatcctctttctttagttggagtaatggcgagaaagcttgtgtcttgccacttagatttgat 7276  T
Q  417 at-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggt 505  Q
    ||           ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7275 ataaacctcctgagaaagttgatttttcctaatagtgactgcaactctttcttcgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttctggt 7176  T
Q  506 tgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcct 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7175 tgatttcgattccctttttatgcaccacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccgaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcct 7076  T
Q  606 catcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatg 705  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7075 catcctttcaaaagatcgacgtaaatgttccaaatgtctttcttctgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaatcctctatg 6976  T
Q  706 aaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6975 aaatcatgaaacattaaattc 6955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 24916322 - 24915597
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24916322 gacaacatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgtttaagttttgtacatgaaaagtataagcaaaggc 24916223  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24916222 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcaacatcattgagtaccctacttagataataaatggccttttttgtgccatattcatcctcttgtgccaa 24916123  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24916122 catactgcatatagtgccatctgacgctgctatgtacaatttcattcttctgtccttcaataaaggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 24916023  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||||||||| || |||||||| | || ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24916022 atttcatcgaaagctttttggtgtttcgactcccatttgaaaacatcatctttctttagtcgaagtaatggcgagaaagtttgtgtcttgacacttagat 24915923  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24915922 ttgatataaacctcctgagaaagttgatttttcctaatagtgactgcaactctttcttcgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgtt 24915823  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24915822 ctggttgatttcgattccctttttatgcactacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 24915723  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24915722 cgcctcatcctttcaaatgatcggcgtaaatgttccaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaatcct 24915623  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24915622 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 24915597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 23198419 - 23199132
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  23198419 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 23198518  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23198519 taggatgatatcttgtttccacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 23198618  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  | ||||  || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||     
T  23198619 ggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctacctttcagcaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 23198718  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||         
T  23198719 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgctacttaggtttgatataaacc 23198818  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| |||||||  |  || || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23198819 ttcggagaaagttgatctttcctagtagagactgtaactctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatctc 23198918  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23198919 gattccctttttatgcacgacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacactttaaaggattcattttcaatccatattgcctcatcctt 23199018  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23199019 tcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgcataaaattctctatgaagtcat 23199118  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  23199119 ggaacattaaattc 23199132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 22640932 - 22640220
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  22640932 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 22640833  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| |||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22640832 taggatgatatcttgtttccacatcattaagtactcgacttaaataataaatagccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 22640733  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||| ||| | ||||||  | || ||||||||| |  | ||||  || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||     
T  22640732 ggtgccatttgacgttgctata-ataacttcattcttctacctttcagcaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 22640634  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||         
T  22640633 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaggtttgatataaacc 22640534  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| |||||||  |  || || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22640533 ttcggagaaagttgatctttcctagtagagactgtaactctttctttgtagaaggagccttggtctcaatttttgccttggttttgttctggttgatctc 22640434  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22640433 gattccctttttatgcacgacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccctaaatgcacactttaaaggattcattttcaatccatattgcctcatcctt 22640334  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  22640333 tcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctctttcgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgcataaaattctctatgaagtcat 22640234  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  22640233 ggaacattaaattc 22640220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 719
Target Start/End: Original strand, 23811565 - 23812273
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||||    
T  23811565 ttaattatatcaaaatgagaataaacataaacatcaaaagactttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatacaaacaaagacataacttttcac 23811664  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  23811665 taggatgatatcttgtttcagcatcatttaataccctactaagataataaatggctctttctgcgccattttcatcctcttgtgctaacacgcttcctat 23811764  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |  || |||| |||||||||||| |||||| || |  |||| |  | ||||||||| || ||| |||| |||| |||||| |||||||| || ||     
T  23811765 agtacattcagatgttgctatgtacaacttcatttttgtaccctttagaagtggtgaaagtataggatgattaatcaaatatgatttgatttcttcaaaa 23811864  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    ||||||||||| || |  |||  ||| || | |||||||||||| |  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||         
T  23811865 gccttttggtgttctggttccagtttgaacacatcttctttcttcagacgaagtaatggcgataaagcttgtgttttgccacttaggttcgatataaaca 23811964  T
Q  419 --------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatt 510  Q
            |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||     
T  23811965 ccttctgagaaagttgatttttcctaacaaagactgcaactctttctttgtcgaaggggcttgagtctccattattgccttggttttgttttgattaatc 23812064  T
Q  511 tcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcc 610  Q
    || ||||| || || || || ||  |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23812065 tcaattcctttcttgtggacgacaaaacctaaaaaatcacctgcagaaacaccaattgcacattttaatggattcatttttaatccatattgcctcatcc 23812164  T
Q  611 tttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatc 710  Q
    |||| || ||||| ||||| || |  || ||| | || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||| ||    
T  23812165 tttcgaatgatcgtcgtaagtgatctaagtgtttatcttctgaagatgattttaccacgatatcatcgatgtagacttgcatgaaatcctctatgaagtc 23812264  T
Q  711 atgaaacat 719  Q
    |||||||||    
T  23812265 atgaaacat 23812273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 302 - 726
Target Start/End: Original strand, 23624102 - 23624537
Alignment:
Q  302 atatgacttgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttg 401  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23624102 atatgacttgatttcatcgaaagctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttg 23624201  T
Q  402 ccacttagatttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgcct 490  Q
    |||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||  |  || || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23624202 ccacttaggtttgatataaaccttcggagaaagttgatctttcctagtagagactgtaactctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgcct 23624301  T
Q  491 tggttttgttctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcatttt 590  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23624302 tggttttgttctgcttgatctcgattccctttttatgcacgacggaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacatttttaaggattcatttt 23624401  T
Q  591 caatccatatcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgc 690  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||    
T  23624402 caatccatattgtctcatcctttcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctcttctgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgc 23624501  T
Q  691 ataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23624502 ataaaattctctatgaattcatgtaacattaaattc 23624537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 80
Target Start/End: Original strand, 23616962 - 23617018
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgctta 80  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23616962 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgctta 23617018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 25113814 - 25113896
Alignment:
Q  126 ggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgc 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  25113814 ggatgatatcttgtttcagcatcatttaaaaccctactaagatagtaaatggctctttctatgccattttcatcttcttgtgc 25113896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 85
Target Start/End: Original strand, 25113752 - 25113794
Alignment:
Q  43 aataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttt 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25113752 aataaacataaacatcaataggctttatatattgcttaagttt 25113794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 658 - 719
Target Start/End: Original strand, 25114356 - 25114417
Alignment:
Q  658 gattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacat 719  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  25114356 gatttaacaacaatgtcatctatgtaaatttgcataaatttccctataaaatcatgaaacat 25114417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 21296584 - 21295864
Alignment:
Q  17 catgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  21296584 catgtgtttaataatatcaaaacgggaataaacataaacatcaaaaggctttgtataatgcttaagttttgtacatgataaatataagcaaaggcataat 21296485  T
Q  117 ttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21296484 ttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcatcttgtgccaacatgc 21296385  T
Q  217 tgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttc 316  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21296384 tgcctatagtgccatctgatgttgctatgtacaatttcatccttttgcccttcaacaatggtgaaagtattggcggatttatcaaatatgactagatttc 21296285  T
Q  317 atcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgat 416  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21296284 atcgaaggccttttggtgctctggctcccatttaaaaatatcttctttcttcaatcggagtaatggcgagaatgcttgtgtcttgccacttagattcgat 21296185  T
Q  417 at-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggt 505  Q
    ||           ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21296184 ataaacctcctgagaaagtttatttttcctaataatgactgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttattctggt 21296085  T
Q  506 tgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcct 605  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21296084 tgatttcgattccttttttatgaaccacgaaacctaaaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcagtccatattgcct 21295985  T
Q  606 catcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatg 705  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |    
T  21295984 catcctttcaaaagatcggcgtaaatgtcccaagtgtttttcctctgaagaagattttaccacaatatcatcaatataaatttgcataaaagcttctacg 21295885  T
Q  706 aaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21295884 aaatcatgaaacattgaattc 21295864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 726
Target Start/End: Original strand, 22802354 - 22803070
Alignment:
Q  21 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22802354 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcaaagacatagttttt 22802453  T
Q  121 cactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcc 220  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22802454 cactaggacgatatcttgtttcaacatcattaagtaccctacttagataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgataacatactgcc 22802553  T
Q  221 tatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcg 320  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22802554 tatagtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcatatctttcaataaaggagaaagaaccggaggattcaccagatatgacttgatttcatcg 22802653  T
Q  321 aaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat-- 418  Q
    || || ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||      
T  22802654 aaagctttttggtgctctggctcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccacttaaatttgatataa 22802753  T
Q  419 ---------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgat 509  Q
             |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22802754 acctccggagaaagttgatttttcccaataatgactgcaactctttctttgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttctagttgat 22802853  T
Q  510 ttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatc 609  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22802854 tttgattccctttttatgcaccacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacactttaatggattcattttcaacccatatcgcctcatc 22802953  T
Q  610 ctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaat 709  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22802954 ctttcaaatgatcggcgtaaatgatccaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaacttgcataaaatcctctatgaaat 22803053  T
Q  710 catgaaacattaaattc 726  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22803054 catggaacattaaattc 22803070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 726
Target Start/End: Original strand, 22691785 - 22692501
Alignment:
Q  10 tggacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaag 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22691785 tggacaacatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatacaagcaaag 22691884  T
Q  110 gcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgcc 209  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22691885 gcataatttttcactatgatgatatcttgtttcagcgtcattgagtatcctacttaggtaataaatggctctttctgcaccattttcatcctcttgtgcc 22691984  T
Q  210 aacatgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgact 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22691985 aacatgctgcctatagtgccatctgatgccgctatgtacaatttcattcttttgcccttcaataacggtgagagtattggaggatttatcaaatatgact 22692084  T
Q  310 tgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgcc---act 406  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22692085 tgacttcatcaaaggccttttggtgttctggctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtaatggcgagaaagcttgtgttctgccattact 22692184  T
Q  407 tagatttgatatgaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggtt 506  Q
      ||||    | |||||  ||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| |||    
T  22692185 ccgatt---aaagaaagaagatattccctaataacgactgcaactctttcttcgtagaaggagcctgagtcttgattatggctttggttttgttctagtt 22692281  T
Q  507 gatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctc 606  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22692282 gatttcgattccttttttatgaaccacgaaacctaaaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcagtccatattgcctc 22692381  T
Q  607 atcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatga 706  Q
    |||||||||||  || ||| |||||||  ||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||    
T  22692382 atcctttcaaaaaataggcataaatgtcccaaatgtttatactctgaagaagatttaaccacaatatcatcaatataaatttgcataaaaacttctaaga 22692481  T
Q  707 aatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22692482 aatcatgaaacattaaattc 22692501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Original strand, 41377952 - 41378677
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  41377952 gacaacatatgtttaatgatatcaaaatgagaatacacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaac 41378051  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  41378052 aaagcttttcactaggatggtatcttgtttcagcatcattaagtactcgacttaaataataaatggccttttatgtgccatattcatcctcttgtgctaa 41378151  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    |||||| || || || |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  | ||||| || || ||||| |  |||||||||| || ||| ||||||    
T  41378152 catgcttccgatggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctccctttcaacaaaggagaaaggaccggaggatttaccaaataagacttg 41378251  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41378252 atttcgtcgaaggctttttggtgctcaggttcccatttgaaaacatcatctttcttcaatcgaagtagtggtgagaaagcttgtgtcctgccacttagat 41378351  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  41378352 ttgatataaatcttcggagaaagttgatttttcctaatagagactgtaattctttctttgtagagggagctttagtctcgattattgctttggttttgtt 41378451  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41378452 ctggttgatcttgattccttttttgtgcacaacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 41378551  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41378552 tgcctcatcctttcgaatgattggcgtaaatgctccaagtgtctttcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacttgcataaaattct 41378651  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41378652 ctatgaagtcatgtaacattaaattc 41378677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 726
Target Start/End: Original strand, 136617 - 137333
Alignment:
Q  21 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136617 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 136716  T
Q  121 cactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  136717 cactaggatgatatcttgtttcaacatcattgagtaccctacttagataataaatggccctttctatgccatattcatcctcttgtgctaacatactgcc 136816  T
Q  221 tatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcg 320  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  136817 tatagtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcttgtctttcaataaaggagaaagaatcggaggatttaccagatatgacttgatttcatcg 136916  T
Q  321 aaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat-- 418  Q
    || ||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  136917 aaagctgtttggtgctctggctcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaaaggcgagaaagcttgtgtcttgccacttaaatttgatataa 137016  T
Q  419 ---------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgat 509  Q
             |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  137017 accttctgagaaagttgatctttcctaatagtgactgcaactctttcttcgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttattctggttgat 137116  T
Q  510 ttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  137117 ttcgattccctttttatgcaccacaaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcctc 137216  T
Q  610 ctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  137217 ctttcaaacgatcggcgtaaatgttccaaatgtctatcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaacctgcataaaatcttctatgaaat 137316  T
Q  710 catgaaacattaaattc 726  Q
    |||||||||||||||||    
T  137317 catgaaacattaaattc 137333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 6775 - 6049
Alignment:
Q  10 tggacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaag 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6775 tggacaacatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttgagttttgtacatgagaagtataagcaaag 6676  T
Q  110 gcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgcc 209  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  6675 gcacaatttt-cactaggatgatatctggtttcaacatcattgagtaccctacttagataataaatggccttttctgtgccatgttcatcctcttgcgcc 6577  T
Q  210 aacatgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgact 309  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576 aacatactgcctatagtgccatatgacgcttctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgagagaattggaggatttatcagatatgact 6477  T
Q  310 tgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttag 409  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6476 tgatttcctcgaatgccttttggtgttcctgctcccatttgaaaacatcctctttctttaatcggagtaatggcgagaaagcttgtgtcttgccacttag 6377  T
Q  410 atttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttg 498  Q
    |||||||||           ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  6376 atttgatataaacctcctgagaaagttgatttttcctaatagtgactgcaactctttcttcgtagaaggagctttggtcttggttattgccttggttttg 6277  T
Q  499 ttctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccat 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6276 ttctggttgatctcgattccctttttatgaactacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccat 6177  T
Q  599 atcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaatt 698  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6176 attgcctcatcctttcaaaagatcggcgtaaatgttccaaatgtctttcttctgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaagtc 6077  T
Q  699 ctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6076 ctctatgaaatcatgaaacattaaattc 6049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 16212871 - 16212153
Alignment:
Q  21 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16212871 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaaattttgtacatgagaagaataagcaaagacatagttttt 16212772  T
Q  121 cactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtacccta--cttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  16212771 cactaggatgatatcttgtttcaacatcattgagtaccctatacttagataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgataacatactg 16212672  T
Q  219 cctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcat 318  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16212671 cctatagtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaaggagaaaggaccggaggatttaccaaatatgacttgatttcat 16212572  T
Q  319 cgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat 418  Q
    |||  || ||||||||||| |  ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16212571 cgagagctttttggtgctctggttcccacttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggcgagaaagcttgtgtcttaccacttaggtttgatat 16212472  T
Q  419 -----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttg 507  Q
               |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16212471 aaatctccggagaaagttgatttttcccaataatgactgcaattctttcttcgtagaaggagctttggtctcaattattgctttggttttgttctggttg 16212372  T
Q  508 atttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212371 atttcgattccctttttatgcaccacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctca 16212272  T
Q  608 tcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaa 707  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16212271 tcctttcaaatgatcggcgtaaatgttccaaatgtctttcctccaaagaagattttaccacaatgtcatcaatgtaaatttgcataaaatcctctatgaa 16212172  T
Q  708 atcatgaaacattaaattc 726  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16212171 atcatggaacattaaattc 16212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 19032745 - 19033458
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  19032745 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttatgttttgtacatgagaagaataagcacagacaaagtttttcac 19032844  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | | || | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  19032845 taggatgatatcttgtttcaacatcatcgcgcacacgacttaaataataaatggctctttctgtgccatgttcgtcctcttgtgctaacatacttcctat 19032944  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||||| || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||     
T  19032945 ggtgccatctgacgttgctatatataacttcattctcctgtctttcaacaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcaaaa 19033044  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || |||||||| || |    |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||         
T  19033045 gctttttggtgatctgataaccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccacttaggtttgatataaacc 19033144  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||||||||| |  |  || ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19033145 tccggagaaagttgatttttcccagtagagactgcaactctctctttgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttctggttgatttc 19033244  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19033245 gattccctttttatgcacgacgaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccattttgcctcatcctt 19033344  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19033345 tcgaatgattggcgtaaatgttccaaatgtctttcttccgaagaagatttcactacaatgtcatcaatgtaaacctgcataaaattttctatgaagtcat 19033444  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  19033445 ggaacattaaattc 19033458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13779815 - 13779671
Alignment:
Q  33 tcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||      
T  13779815 tcaaaatgagaataaacataaacatcaataggctttatatattgcttaagtttgatacaagagaaatacaaacaaaggcacaatttctcacttggatggc 13779716  T
Q  133 atcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatgg 177  Q
    | ||||| ||  | ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  13779715 accttgtctcgacatcatttaaaaccctactaagataatagatgg 13779671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 13779351 - 13779244
Alignment:
Q  493 gttttgttctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttca 592  Q
    |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  13779351 gttttgttttgatttatttcaatgccttttttgtgcacaacgaaacctaagaaatcacctgcaccaacaccaaaggcacatttcaatggattcattttaa 13779252  T
Q  593 atccatat 600  Q
    ||||||||    
T  13779251 atccatat 13779244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Original strand, 20190538 - 20190682
Alignment:
Q  33 tcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| || ||  | |||||||  |||||||| | ||| |    
T  20190538 tcaaaatgagaataaacataaacatcaataggctttatatattgtttaagtttgatacaagagaaatacaaatacaggcataacttttcacttgaatggt 20190637  T
Q  133 atcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatgg 177  Q
    | || ||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||    
T  20190638 acctagttgcagcatcatttaaaaccctactaagataatatatgg 20190682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22145453 - 22145309
Alignment:
Q  33 tcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| || ||  | |||||||  |||||||| | ||| |    
T  22145453 tcaaaatgagaataaacataaacatcaataggctttatatattgtttaagtttgatacaagagaaatacaaatacaggcataacttttcacttgaatggt 22145354  T
Q  133 atcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatgg 177  Q
    | || ||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||    
T  22145353 acctagttgcagcatcatttaaaaccctactaagataatatatgg 22145309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 614
Target Start/End: Original strand, 20191060 - 20191130
Alignment:
Q  544 aaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttc 614  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  20191060 aaatcacctgcacgaacaccaaaggaacatttcaatggattcattttcaatccatattttctcatcctttc 20191130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 22144931 - 22144861
Alignment:
Q  544 aaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttc 614  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  22144931 aaatcacctgcacgaacaccaaaggaacatttcaatggattcattttcaatccatattttctcatcctttc 22144861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 655 - 726
Target Start/End: Original strand, 16164100 - 16164171
Alignment:
Q  655 gaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||    
T  16164100 gaagattttaccataatatcatccatctaaatttgcataaatttatcaataaaatcgtgaaacattgaattc 16164171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 16163464 - 16163537
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttt 85  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | | | |||||| | |||||||||||    
T  16163464 gacagcatatgtttaataacatcaaaatgcgaataaacataaacaactacaagatttatacattgcttaagttt 16163537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 658 - 719
Target Start/End: Original strand, 17806909 - 17806970
Alignment:
Q  658 gattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacat 719  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  17806909 gatttgacaacaatgtcatctatgtaaatttgcataactttccctataaaatcatgaaacat 17806970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 22346331 - 22347044
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  22346331 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcaaagacaaagtttttcac 22346430  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22346431 taggatgatatcttgtttcaacatcattgagtaccctacttagatagtaaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 22346530  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  22346531 agtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaatgggaaagaactggagggtttaccagatatgacttgatttcatcaaaa 22346630  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||         
T  22346631 gctttttggtgctctggttcccacttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccactcagatttgatataaacc 22346730  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22346731 tccggagaaagttgattttttccagtaatgactgtaactctttcttcgtagaaggagctttggtcttaattattgccttggttttgttctggttgatttc 22346830  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22346831 gattccctttttatgcactacgaaacctaaaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 22346930  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22346931 tcaaatgattggcgtaaatgttccaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatgtcatcaatgtaaatttgcataaaaacctctatgaagtcat 22347030  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | |||||| |||||    
T  22347031 ggaacattgaattc 22347044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 22341148 - 22341861
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22341148 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcaaagacatagtttttcac 22341247  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22341248 taggatgatatcttgtttcaacatcattgagtacccttcttatatattaaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 22341347  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  22341348 agtgccatctgacgctgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaatgggaaagaactggagggtttaccagatatgacttgatttcatcaaaa 22341447  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||         
T  22341448 gctttttggtgctctggttcccacttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccactcagatttgatataaacc 22341547  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341548 tccggagaaagttgattttttccagtaatgactgtaactctttcttcgtagaaggagctttggtcttaattattgccttggttttgttctggttgatttc 22341647  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341648 gattccctttttatgcactacgaaacctaaaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 22341747  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22341748 tcaaatgattggcgtaaatgttccaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatgtcatcaatgtaaatttgcataaaaacctctatgaagtcat 22341847  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | |||||| |||||    
T  22341848 ggaacattgaattc 22341861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 296 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 22070107 - 22069665
Alignment:
Q  296 tatcagatatgacttgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgt 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22070107 tatcaaatatgacttgatttcatcaaaggccttttggtgctctggctcccatttaaaagtatcttctttcttcaatcggagtactggcgagaaagcttgt 22070008  T
Q  396 gttttgccacttagatttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaatta 484  Q
    || |||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070007 gtcttgccacttagattcgatataaatctcctaagaaagttgatttttcctaataacgactgtaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaatta 22069908  T
Q  485 ttgccttggttttgttctggttgatttcgattcccttttt-atgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggat 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22069907 ttgccttggttttgttctggttgatttcgattcctttttttatgaaccacgaaacctaaaaaatcacctgtacaaaccccaaatgcacattttaatggat 22069808  T
Q  584 tcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgta 683  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22069807 tcattttcagtctatattgcctcatccttccaaaagatcggcgtaaatgtcccaagtgtttctcctctgaagaagattttaccacaatatcatcaatata 22069708  T
Q  684 aatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22069707 aatttgcataaaatcttctatgaaatcatgaaacattaaattc 22069665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 55 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22173081 - 22172837
Alignment:
Q  55 catcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgag 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22173081 catcaaaaggctttaaataatgcttaagttttgtacatgagaaatatgatcaaaggcataatttt-cacttggatgatatcttgttttagcgtcattgag 22172983  T
Q  155 taccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttc 254  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  22172982 taccttacttagataataaatggctctttctgcgccatactcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagtgccatctgatgtcgctatgtacaatttc 22172883  T
Q  255 attcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatca 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22172882 attcttttgcccttcaacaatggtgaaagtattggagggtttatca 22172837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22711430 - 22711360
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatga 94  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  22711430 ttaataacatcaaaatgcaaataaacataaacaactaaagactttatatattgcttaagtttagaacatga 22711360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 14082 - 13369
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  14082 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcaaagacaaagtttttcac 13983  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  13982 taggatgatatcttgtttcaacatcattgagtaccctacttaaatagtaaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 13883  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  13882 agtgccatctgacgctgctatatacaatctcattctcctatctttcaataaaggggaaagaactggagggtttaccagatatgacttgatttcatcaaaa 13783  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||         
T  13782 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttggtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtctttccactcaaatttgatataaacc 13683  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13682 tccgtagaaagttgatttttcccagtaatgactgcaattctttcttcgtagaaggaactttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 13583  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13582 gattccctttttatgcactacgaaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 13483  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13482 tcaaatgatcgacgtaaatgttccaaatgtttttcctccgaagaagattttaccacaatgtcatcgatataaacttgcataaaatcctctatgaagtcat 13383  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | |||||| |||||    
T  13382 ggaacattgaattc 13369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 21513618 - 21512905
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  21513618 ttaataatatcaaaatgggaataaatataaatgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcacagacaaagtttttcac 21513519  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  21513518 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtaccctacttagatagtaaatggccctttctatgccatattcatcttcttgtgctaacatacttcctat 21513419  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| |||||||| | ||||||||||||  | || ||||| || || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21513418 ggtgccatctgacgctgctatatgcaatttcattctcctatctttcaacaaaggggaaagaaccggaggatttaccagatatgacttgatttcatcgaaa 21513319  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||         
T  21513318 gctttttgttgttctgtttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccacttagatttgatataaacc 21513219  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21513218 tccggagaaagttaatttttcccagtaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagctttggtctcaattattgccttggttttgttctcgttgatttc 21513119  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21513118 gattccctttttatgcactacgaaacctaagaaatcacctacacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 21513019  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21513018 tcaaaggattggcgtaaatgttccaaatgtctttcttccgaagaagattttaccacaatgtcatcaatgtaaacttgcataaaattttctatgaagtcat 21512919  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  21512918 ggaacattaaattc 21512905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Original strand, 22849785 - 22850029
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  22849785 gacatcatatgcttgattatgtcaaagtgggaatgaacataaacatcgacaagctttatatattgctaaagcttagtacatgaaaagtacaaacaaaggc 22849884  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||     
T  22849885 acaatttttcactgggatgataccttgttttagcattattcagaaccctactaagataataaatggctctttctacgccattttcatcttcttgtg-cag 22849983  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcatt 257  Q
    |||  | ||||||||   |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22849984 catcgttcctatagtattatctgaagcagctatatacaatttcatt 22850029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 26864113 - 26864333
Alignment:
Q  35 aaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgatat 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||| ||     
T  26864113 aaaatgagaataaacataaatatcaataggatttatatagtgcttaagtttgatacaagagaaatataaacaaaggcacaacttttcacttg-atggtac 26864211  T
Q  135 cttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagttccatctg 234  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||    ||||    
T  26864212 cttgtttcagcatcatttaataccctactaagataataaatggctttttctacgccattttcatcctcttgagctagcatacttcctatagtattctctg 26864311  T
Q  235 atgctgctatgtacaatttcat 256  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  26864312 aagcagctatatacaatttcat 26864333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 621
Target Start/End: Original strand, 26864595 - 26864672
Alignment:
Q  544 aaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaacgat 621  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||    
T  26864595 aaatcacctgcacgtacaccaaatgcaaattttaatggattcattttcaatccatattttctaattctttcaaacgat 26864672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 22850199 - 22850402
Alignment:
Q  419 gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttcgattcc 518  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| || || ||||| | ||  ||||| |  ||| |||| |||||||| || || ||||| || ||    
T  22850199 gaaagttaatttttcccaacaaagattgaagctctttatttgtcgaaggcggttttgtctccaaaatttcctttgttttgttttgattaatttcaatgcc 22850298  T
Q  519 ctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaac 618  Q
     ||||| ||||| ||  ||||||  || || | |||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||    
T  22850299 ttttttgtgcacaacaaaacctaagaagtcgcatgcacgcacaccaaaagcacatttcaatggattcattttcaatccatattttctcattctttcgaac 22850398  T
Q  619 gatc 622  Q
    ||||    
T  22850399 gatc 22850402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 631
Target Start/End: Original strand, 14744540 - 14745161
Alignment:
Q  21 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14744540 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcaaagacatagttttt 14744639  T
Q  121 cactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14744640 cactaggatgatatcttgtttgaacatcattgagtaccctacttagataataaatggctctttctgtgccatattcatcctcttgtgataacatactgcc 14744739  T
Q  221 tatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcg 320  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14744740 tatagtgccatctgactctgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaaggagaaagaaccggaggattcaccagatatgatttgatttcatcg 14744839  T
Q  321 aaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat-- 418  Q
    || || ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||      
T  14744840 aaagctttttggtgctctggctcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccacttaaatttgatataa 14744939  T
Q  419 ---------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgat 509  Q
             |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14744940 acctctagagaaagttgatttttcccaataatgactgcaactctttctttgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttctggttgat 14745039  T
Q  510 ttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745040 ttcgattccctttttatgcaccacgaaacctagaaaatcacctgcacaaacctcaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatc 14745139  T
Q  610 ctttcaaacgatcggcgtaaat 631  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  14745140 cattcaaatgatcggcgtaaat 14745161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 15151472 - 15152185
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  15151472 ttaataatatcaaaatgagaataaacatagacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 15151571  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15151572 taggatgatatctcgtttcaacatcattaagtacacgacttaaatagtagatggccctttccgtgccatgttcatcctcttgtgctaacatacttcctat 15151671  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||  || | ||||| || || |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  15151672 ggtaccatctgacgttgctatatataacttcattctcctgacattcaacaaaggagaaagaaccggaggatttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 15151771  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
     | ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||         
T  15151772 actttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaggtttgatataaacc 15151871  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||  |||||||  |  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15151872 tccggagaaagttgacctttcctagtagagactgcaactctttcttcgtggaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttttggttaatctc 15151971  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15151972 gattccctttttatgcacgacgaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcagtccatattgcctcatcctt 15152071  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || ||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15152072 tcgaatgactggcgtaaatgttccaaatgtctttcttctgaagaagattttactacaatatcatcgatataaacctgcataaaattttctataaaatcat 15152171  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  15152172 ggaacattaaattc 15152185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 13286942 - 13287646
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||    
T  13286942 ttaatgatatcaaaatgggagtaaacataaacgtcaaaaggttttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaacaagcacaaacaaagtttttcac 13287041  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13287042 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtacccgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcttcttgtgctaacatacttcctat 13287141  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||  || | ||||| || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||     
T  13287142 ggtgccatctgacgttgctatatataacttcattctcctgcctttcaacaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 13287241  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||         
T  13287242 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtttcttgccacttaggtttgatataaacc 13287341  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggag-cttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgattt 511  Q
          |||||||||| |||||||  |  || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13287342 tccggagaaagttgatctttcctagtagagactgcaactctttctttgtagaaggagtcttga-tctcgattattgccttggttttgttctggttgatct 13287440  T
Q  512 cgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcct 611  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13287441 cgatcccctttttatgcacgacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatattgcctcatcct 13287540  T
Q  612 ttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatca 711  Q
    ||| || |||||||||         |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13287541 ttcgaatgatcggcgt---------aaatgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatcgatataaacctgcataaaattttctatgaaatca 13287631  T
Q  712 tgaaacattaaattc 726  Q
    || ||||||||||||    
T  13287632 tggaacattaaattc 13287646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 716
Target Start/End: Original strand, 18560121 - 18560830
Alignment:
Q  17 catgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||      
T  18560121 catgtgtttaattatatcaaaatgagaataaacataaacatcaaacgactttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatacaaacaaagacataac 18560220  T
Q  117 ttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  18560221 ttttcactaggatgatatcttgtttcagaatcatttaataccctactaagataatagaaggctccttctacgccattttcatcctcttgtgttaacatgc 18560320  T
Q  217 tgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttc 316  Q
    | |||||||| |  |  |||| |||||||||| | ||||||||| |  | || |  | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18560321 ttcctatagtacacttagatgttgctatgtaccacttcattcttctaccttttagaagtggtgaaagtataggaggattaatcaaatatgatttgatttc 18560420  T
Q  317 atcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgat 416  Q
     || || ||||||||||| || |  |||||||| || | |||||| |||||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| || |||    
T  18560421 ttcaaaagccttttggtgttctggttcccatttgaacacatcttc-ttctttagacgaagtaatggcgagaaagtttttgttttgccgcttaggttcgat 18560519  T
Q  417 at-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggt 505  Q
    ||           |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |    
T  18560520 atgaaccttttgagaaagttgatttttcctagcaaagactgcaactctttctttgtcgaaggggcttgagtctccattattgctttggttttgtttttat 18560619  T
Q  506 tgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcct 605  Q
    | || | |||||| ||||| || || ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  18560620 taatcttgattccttttttgtggacaacaaaacctaaaaaatcacctgcacaaacaccaaatgcacattttaatggattaatttttaatccatattgcct 18560719  T
Q  606 catcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatg 705  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |  || ||| | || || ||||| | || ||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  18560720 catcctttcgaatgatcggcgtaagtgatctaagtgtttatcttctgaagatggttatactacgatatcatcgatgtaaacttgcatgaaatcctctatg 18560819  T
Q  706 aaatcatgaaa 716  Q
    || ||||||||    
T  18560820 aagtcatgaaa 18560830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 627 - 726
Target Start/End: Original strand, 14748104 - 14748203
Alignment:
Q  627 taaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14748104 taaatgttccaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaacttgcataaaatcctctatgaaatcatggaacattaaattc 14748203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Original strand, 39841 - 40546
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39841 gacaacatgtgttcaataatatcgaaatgggaaaaaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatataagcaaaggc 39940  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  39941 ataatttttcactaggatgatatcttgtttcagcatcattgagtactctactaaaataataaatggctctttctgcgccgtattcattctcttgcgccaa 40040  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    |||||| |||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||               
T  40041 catgctacctatagtgcaatctgactttgctatgtacaatttcattcttttccccttcaacaatggtgaaagtattggagggttcatca----------- 40129  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
             |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40130 ---------aaggccttttggtgttctggctcccatttaaaaacatcttctttcttcaagcggactaatggcgagaaagcttgtgtcttgccacttagat 40220  T
Q  412 ttgatatgaa-----------agttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    | ||||||||           |||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221 tcgatatgaatctcctaagaaagttgatttttcctagtaacgactgcaactctttctttgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 40320  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40321 ctggttgatttcgattccctttttatggaccacgaaacctaaaaaatcatatgcacaaacaccaaatgcacattttaatggattcatcttcaatccatat 40420  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  40421 tgcctcatcctttcaaaagatcggcgtaaatgctctaaatttttctcctctgaagaggattttaccacaatatcatcaatataaatttgcataaaatctt 40520  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40521 ctatgaaatcatgaaacattagattc 40546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Original strand, 13304466 - 13305191
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  13304466 gacagcatatgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtgaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaac 13304565  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13304566 aaagtttttcactaggatgatatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttagataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaa 13304665  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    ||| || ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  ||||||| || || |||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  13304666 catacttcctatggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctacccttcaacaaaggggaaagaaccggaggatttaccaaatatgacttg 13304765  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13304766 atttcatcgaaagctttttggtgctcggattcccatttgaagacatcatctttctttaatcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaggt 13304865  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13304866 ttgatataaaccttcggagaaagttgatttttcctaatagagactgtaattctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgccttggttttgtt 13304965  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13304966 ctggttgatctcgattccttttttgtgcacaacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatat 13305065  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  13305066 tgcctcatcctttcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgcataaaattct 13305165  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13305166 ctatgaagtcatggaacattaaattc 13305191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 10784797 - 10784072
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |       
T  10784797 gacaacatatgtttaatgatatcaaaatgagaatacacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttcagttttgtacatgagaagaataaacacaaat 10784698  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10784697 aaagcttttcactaggatggtatcttgtttcagcatcattaagtactcgacttaaataataaatggccttttctgcgccatattcatcctcttgtgctaa 10784598  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    |||||| || || || |||||||| | |||||| || || ||||||| |||  | ||||| || || ||||| |  |||||||| | || ||| ||||||    
T  10784597 catgcttccaatggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcgtttccctttcaacaaaggagaaaggaccggaggattcaccaaataagacttg 10784498  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10784497 atttcatcgaaggctttttggtgctcaggttcccatttgaaaacatcatctttcttcaatcgaagtagtggtgagaaagcttgtgtcctgccacttagat 10784398  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           |||||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10784397 ttgatataaatcttcggagaaagttgatttttcccaatagagactgtaattctttcttcgtagagggagctttagtctcgattattgctttggttttgtt 10784298  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10784297 ctggttgatctcgattccttttttgtgcacaacgaaccctaaaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcgcattttaatggattcattttcaatccatat 10784198  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  10784197 tgcctcatcctttcgaatgattggcgtaaatgttccaagtgtctttcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtagacttgcataaaattct 10784098  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10784097 ctatgaaatcatggaacattaaattc 10784072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Original strand, 14690996 - 14691721
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  14690996 gacaacatatgtttaatgatatcaaaatgggaatacacataaacgtcaaaaggctttatataatgctttagttttgtacatgagaagaataaacacaaac 14691095  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14691096 aaagtttttcactaggatggtatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaa 14691195  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    ||| || || ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||| |   |||||| || || ||||| |  |||||||||| || ||| ||||||    
T  14691196 catacttccgatagtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctactcttcaacaaaggagaaaggaccggaggatttaccaaataagacttg 14691295  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14691296 atttcatcgaaagctttttggtgctcaggttcccatttgaaaatatcatctttcttcaaccgaagcagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttagat 14691395  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14691396 ttgatataaatcttcggagaaagttgatttttcctaatagagactgtaattctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgctttggttttgtt 14691495  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691496 ctggttgatctcgattccttttttgtgcacaacgaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 14691595  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||||||||| |  ||| | |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |    
T  14691596 tgcctcatcctttcgattgattgtcgtaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatataaacctgcataaaatttt 14691695  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14691696 ctatgaagtcatggaacattaaattc 14691721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Original strand, 7362999 - 7363723
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  7362999 gacaacatatgtttaatgatatcaaaatgggaatacacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttgagttttgtacatgagaagaataaacacaaac 7363098  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7363099 aaagtttttcactaggatggtatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaa 7363198  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    ||| || || ||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  ||||||| || || ||||| |  |||||||||| || ||| ||||||    
T  7363199 catacttccgatagtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctacccttcaacaaaggagaaaggaccggaggatttaccaaataagacttg 7363298  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7363299 atttcatcgaaagctttttggtgctcaggttcccatttgaaaatatcatctttcttcaaccgaagcagtggtgagaaagcctgtgtcttgccacttagat 7363398  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||| ||||| |  || || || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  7363399 ttgatataaatcttcggagaaagttgattttccctaatagagactgtaattctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgctttggttttgtt 7363498  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7363499 ctggttgatctcgattccttttttgtgcacaacgaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 7363598  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||    
T  7363599 tgcctcat-ctttcgaatgattggcgtaaatgttccaagtgtctttcttccgaagaagacttcactacaatgtcatctatataaacctgcataaaattct 7363697  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  7363698 ctatgaagtcatgtaacatcaaattc 7363723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 10155611 - 10154898
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||    
T  10155611 ttaatgatatcaaaataggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcacaaacaaagtttttcac 10155512  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  10155511 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtacacgacttaaatagtaaatggccctttccgtgccatgttcgtcctcttgtgctaacatacttcctat 10155412  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     ||  ||||||| | |||||| || || ||||||||  || | ||||| || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||     
T  10155411 ggtgtcatctgacgttgctatatataacttcattctcctgcctttcaacaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 10155312  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||         
T  10155311 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtaatggtgagaaagcttgtgtcttaccacttaggtttgatataaacc 10155212  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| || ||||  |  || |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10155211 tccggagaaagttgatcttccctagtagagactgcaactctttcttggtagaaggagccttggtctcgattaatgctttggttttgttctggttgatttc 10155112  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10155111 gattccctttttatgcaagacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatattgcctcattctt 10155012  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10155011 tcgaatgattggcgtaaatgttccaaatgtctttcttccgaagaagatttcactacaatgtcatcgatgtaaacctgcataaaattttctatgaaatcat 10154912  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  10154911 ggaacattaaattc 10154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14141118 - 14141009
Alignment:
Q  96 aagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatatt 195  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||    
T  14141118 aagtataaacaaaggcataagttttcacttggatgataccttgtttcagcatcatttaaaaccctactaagataataaatgactctttctacgccatttt 14141019  T
Q  196 catcctcttg 205  Q
    |||| |||||    
T  14141018 catcttcttg 14141009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 536 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 14140667 - 14140603
Alignment:
Q  536 aacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140667 aacctaaaaaatcacctgcacgaacaccaaaggcacattttaatggattcattttcaatccatat 14140603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 600
Target Start/End: Original strand, 268499 - 268552
Alignment:
Q  547 tcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268499 tcacttgcacatacgccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 268552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 72066 - 71341
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  72066 gacagcatatgtttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggttttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaac 71967  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  71966 aaagtttttcactaggatgatatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaa 71867  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
    ||| || ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  ||||||| || || |||||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  71866 catacttcctatggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctacccttcaacaaaggggaaagaaccggaggatttaccaaatatgacttg 71767  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  71766 atttcagcgaaagccttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttcattaatcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgctacttaggt 71667  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  71666 ttgatataaagcgtcggagaaagttgatttttcctaatagagactgtaattctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgccttggttttgtt 71567  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatat 600  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  71566 ctggttgatctcgattccttttttgtgcacaacgaaccctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcatttttaatccatat 71467  T
Q  601 cgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattct 700  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  71466 tgcctcatcctttcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatatcatctatgtaaacctgcataaaattct 71367  T
Q  701 ctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||| || || ||||||||||||    
T  71366 ctatgaagtcttggaacattaaattc 71341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 20601 - 21314
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  20601 ttaatgatatcaaaatgagaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 20700  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20701 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatgttcatcctcttgtgctaacatacttcctat 20800  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||  |  | ||||| || || |||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||     
T  20801 ggtgccatctgacgttgctatatataaattcattctactacctttcaacaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 20900  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||         
T  20901 gctttttggtgctctggctcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaggtttgatataaacc 21000  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| |||||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21001 tccggagaaagttgatctttcctagtagagactgcaactctttctttgtagaaggagctttggtttcgattattgctttagttttgttctggttgatttc 21100  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  21101 gatcccctttttatgcacgacgaaacctaagaaatcacctgcacaaacctcaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatattgcctcataatt 21200  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21201 tcgaatgattggcgtaaatgttccaaatgtctttcttccgaagaagatttcactacaatgtcatcgatataaacctgcataaaattttctatgaaatcat 21300  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  21301 ggaacattaaattc 21314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 18169198 - 18169911
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  18169198 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaatgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 18169297  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  18169298 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 18169397  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || |||||||| | |||||| || || ||||||||| |  | ||||  || || |||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||     
T  18169398 ggtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctacctttcagcaaaggagaaagaaccggagggtttaccaaatataacttgatttcatcgaaa 18169497  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||         
T  18169498 gctttttggtgctctgtttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcgaagtagtggtgagaaaacttgtgtcttgccacttaggtttgatatgaacc 18169597  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| |||||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  18169598 ttcggagaaagttgatctttcctagtagagactgcaactctttctttgtagaaggagctttggtctcgattattgcttttgttttgttctggttgatctc 18169697  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18169698 gattcccttttaatgcacgacgaaccccaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacactttaaaggattcattttcaatccatattgcctcatcctt 18169797  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  18169798 tcgaatgatcggcgtaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgcataaaattctctatgaagtcat 18169897  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | ||||||||||||    
T  18169898 ggaacattaaattc 18169911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 726
Target Start/End: Original strand, 14340221 - 14340935
Alignment:
Q  23 tttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  || |||||||||    
T  14340221 tttaatgatatcaaaatgggaatacacataaacgtcaaaaggctttttataatgcttgagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttca 14340320  T
Q  123 ctaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgccta 222  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  14340321 ctaggatggtatcttgtttcaacatcattaagtactcgacttaaataataaatggccctttctgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttccga 14340420  T
Q  223 tagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaa 322  Q
    |||| |||||||| | |||||| || || ||||||||| |   |||||| || || ||||| |  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14340421 tagtgccatctgacgttgctatatataacttcattcttctactcttcaacaaaggagaaaggaccggaggatttaccaaataagacttgatttcatcgaa 14340520  T
Q  323 ggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat---- 418  Q
     || ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  14340521 agctttttggtgctcaggttcccatttgaaaatatcatctttcttcaatcgaagcaatggtgagaaagcttgtgtcttgccacttagatttgatataaat 14340620  T
Q  419 -------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgattt 511  Q
           ||||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14340621 ctttggagaaagttgatttttcctaatagagactgtaattctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgctttggttttgttctggttgatct 14340720  T
Q  512 cgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcct 611  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14340721 cgattccttttttgtgcacaacgaaacctaagaaatcacctccacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatattgcctcatcct 14340820  T
Q  612 ttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatca 711  Q
    ||| || ||| | || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  14340821 ttcgaatgattgacgcaaatgttccaagtgtctctcttccgaagaagatttcactacaatgtcatctatgtaaacctgcataaaattctctatgaagtca 14340920  T
Q  712 tgaaacattaaattc 726  Q
    || ||||||||||||    
T  14340921 tggaacattaaattc 14340935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 13375549 - 13375641
Alignment:
Q  17 catgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaag 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13375549 catgtgcttaattatatcaaaatgagaatagatataaacatcaaaaggctttatgtaatgcttaagttttgtacatgagaaatacaagcaaag 13375641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 14164780 - 14164916
Alignment:
Q  120 tcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgc 219  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  14164780 tcactgggatgataccttgtttcggcatcgtttaataccctactaagataataaatggctctttctacgccattttcatcctcttgtgctaacatactcc 14164879  T
Q  220 ctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcat 256  Q
    || |||| |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  14164880 ctgtagtacattcagatgatgctatgtacaatttcat 14164916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 568 - 726
Target Start/End: Original strand, 13276022 - 13276180
Alignment:
Q  568 gcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttacca 667  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| |  || |||   || |  |||||||||||    || ||||| |||||||||||||    
T  13276022 gcacatttcaatggattcattttcaatccatactttctcatcctcttgaatgataatcgaaggtgtttcaaatgatcgtcttccgacgaagattttacca 13276121  T
Q  668 caatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||    
T  13276122 caatatcatcaatgtagatttgcataaatttgccaatgaaatcattaaacattgaattc 13276180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18458973 - 18458833
Alignment:
Q  33 tcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgat 132  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | || || || || | ||| | ||||||||| ||||| |    
T  18458973 tcaaaatgaaaataaacataaatatcaacaggctttatatattgcttaagttttgtacaacaaaaatacaaacacatgcacaatttttcacttggatggt 18458874  T
Q  133 atcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatag 173  Q
    | ||||||||| | ||||| |  | |||||| |||||||||    
T  18458873 accttgtttcatcatcatttaaaatcctactaagataatag 18458833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 720
Target Start/End: Original strand, 16033523 - 16033581
Alignment:
Q  662 ttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacatt 720  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  16033523 ttaccataatatcatcaatgtaaatttgcataaatttatcaataaaatcatgaaacatt 16033581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 543 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18457884 - 18457830
Alignment:
Q  543 aaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatcca 597  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18457884 aaaatcacctgcacgaacaccaaagacacattttaatggattcattttcaatcca 18457830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18458083 - 18458024
Alignment:
Q  356 atcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttga 415  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  18458083 atcttctttctttggtcgaagtagtggcgagaaagcttcagttttgctacttagatttga 18458024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 33594 - 32888
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||    
T  33594 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaagactttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcacaaacaaagtttttcac 33495  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  33494 taggatgatatcttgtttcaacatcattaagtacacgacttaaatagtaaatggccctttctgtgccatgttcatcttcttgtgctaacatacttcctat 33395  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || | |||||| | |||||| || || ||||||||  || ||||||| || || |||||||  ||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||     
T  33394 ggtgctatctgacgttgctatatataacttcattctcctgcccttcaacaaaggagaaagaaccggagggtttactaaatatgacttgatttcattgaaa 33295  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         
T  33294 gctttttggtgttctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgttttgccacttaggtttgatataaacc 33195  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          |||||||||| || ||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33194 tccggagaaagttgatcttgcctagtagagactgcaactctttctttgtagaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttctggttgatttc 33095  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33094 gattccttttttatgcacgacgaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatttcctcatcctt 32995  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || ||| |||||| || || ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32994 tcgaatgattggcgtagatattccaaatgtctctcttctgaagaagatttcactacaatatcatcaatataaacctgcataaaattttctataaaatcat 32895  T
Q  713 gaaacat 719  Q
    | |||||    
T  32894 ggaacat 32888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 13643 - 12930
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||    
T  13643 ttaatgatatcagaatgggagtacacataaacgtcaaaaggttttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataagcacaaacaaagtttttcac 13544  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13543 taggatgatatcttgtttcgacatcattaagtacccgacttgaataataaatggccctttctgtgccatattcatcttcttgtgctaacatacttcctat 13444  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||| | | || ||| || || ||||||||  ||   ||||  || || |||||||  ||||| || | || |||||||||||||||||||||     
T  13443 agtgccatctaacgttgttatatataacttcattctcctgcttttcagcaaaggagaaagaaccggagggttcaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 13344  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatatgaa-- 421  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||      
T  13343 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaagtttgatatgaacc 13244  T
Q  422 ---------agttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
             ||||||| |||||||  |  || |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13243 tccggagaaagttgatctttcctagtagggactgcaactctttctttgtagaaggagccttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatctc 13144  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13143 gatcccctttttatgcacgacgaaccctaagaaatctcctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatatagcctcattctt 13044  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcat 712  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  13043 tcgaatgatcggcgtaaatgttccaaatgtctctcttctgaagaagatttcactacaatgtcatcaatgtaaacctgcataaaattttctatgaagtcat 12944  T
Q  713 gaaacattaaattc 726  Q
    | |||||| |||||    
T  12943 ggaacattgaattc 12930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 194 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 56405 - 55920
Alignment:
Q  194 ttcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggagga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56405 ttcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagtgccatctgacgttgctatatacaatttcattcttctgcccttcaataatggtgaaagtattggagga 56306  T
Q  294 tttatcagatatgacttgatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagctt 393  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |         || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  56305 tttatcaaatataacttgatttcatcgaaggccttttggtgctccggcc--------aatatatcttctttctttaatcgtagtaatggcgagaaagctt 56214  T
Q  394 gtgttttgccacttagatttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaat 482  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56213 gtgtcatgccacttagattcgatataaacctcctgagaaagttgatttttcctaacaatgactgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtgtcaat 56114  T
Q  483 tattgccttggttttgttctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatgga 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56113 tattgccttggttttgttctggttgatttcgattccttttttatgcaccacgaaacctaaaatatcacctgcacaaaccccgaatgcacattttaatgga 56014  T
Q  583 ttcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcat 676  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56013 ttcattttcaatccatattgtctcatcctttcaaaagattggcgtaaatatcccaagtgtttttcctttgaagaagattttaccacaatatcat 55920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 35461 - 35407
Alignment:
Q  672 atcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacattaaattc 726  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35461 atcatcaatataaattttcataaaatcttctatgaaatcatgaaacattaaattc 35407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 35222 - 35936
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  35222 ttaatgatatcaaaatgagaataaatataaacgtcaaaaggctttatataatgcttcagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 35321  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||    
T  35322 taggatgatatctcgtttcaacatcattaagtacacgacttaaatagtaaatggccctttccgtgccatgttcattctcttgtgctagcatacttcctat 35421  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
     || ||||||||   |||||| || || ||||||||  |||  ||||| || || |||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  35422 ggtaccatctgaccttgctatatataacttcattctcctgtttttcaacaaaggagaaagaaccagaggatttaccaaatatgacttgatttcatcgaaa 35521  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatttgatat----- 418  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||         
T  35522 gctttttggtgctctggttcccatttgaaaacatcatctttctttaaacggagtagtggtgagaaagcttgtgtcttgccacttaggttcgatataaacc 35621  T
Q  419 ------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttc 512  Q
          ||||||||||||| ||||  |  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||    
T  35622 tccggagaaagttgattttccctagtagagactgcaactctttcttcgtggaaggagctttggtctcgattattgccttggttttgttttggttattctc 35721  T
Q  513 gattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctt 612  Q
    |||||| ||||||||||| |   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35722 gattccttttttatgcacgaaaaaacctaagaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaaaggattcattttcaatccatattgcctcatcctt 35821  T
Q  613 tcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaat-gtaaatttgcataaaattctctatgaaatca 711  Q
    || || ||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  35822 tcgaatgactggcgtaaatgttccaaatgtctttcttctgaagaagattttactacaatatcatcgataataaacctgcataaagttttctatgaaatca 35921  T
Q  712 tgaaacattaaattc 726  Q
    || ||||||||||||    
T  35922 tggaacattaaattc 35936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 151488 - 150940
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  151488 gacatcatatgtttaataatattgaaatgagaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttatacatgagaaatacaagcaaaggc 151389  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  151388 ataatttttcgctagtatgatatctcgtttcagcatcatttagtattctactaagataatagatggctctttttgcgccattttcatcctcctgtgccaa 151289  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttg 311  Q
     ||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||    
T  151288 tatgctccctatagtgcaatctgaggttgctatgtacaacttcattcttttaccttttaataatggtgaaagtatgggagggttaatcaaatatgatttg 151189  T
Q  312 atttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagat 411  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |  |  ||| |||| |||| |||||| ||||| || || |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  151188 attttgtcgaaggccttttggtgttttggttccaatttgaaaacatcttccttcttcaagcgaagtaatggcgagacagcttatgtcttgccacttaaat 151089  T
Q  412 ttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgtt 500  Q
    | |||||           ||||||| |||||| |||  || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  151088 tcgatatgaatcttctaagaaagtttattttttctagtaaagactgcaactctttctttgtagaaggggcctgagtctcaattattgccttggttttgtt 150989  T
Q  501 ctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatca 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  150988 ctggttgatttcaattccctttttatggaccacgaaacctaaaaaatca 150940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 112095 - 111815
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  112095 gacaacatatgtttaataatattgaaatgagaataaacataaacatcaaaagactttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatacaagcaaaggc 111996  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  111995 ataatttttcactaggatgatatctcgtttcagcatcatttagtactctactaagataatagatggctctttttgcgccattttcatcctcctgtgccaa 111896  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggagg 292  Q
     ||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||    
T  111895 tatgctccctatagtgcaatctgaggttgctatgtacaacttcattcttttaccctttaataatggtgaaagtatgggagg 111815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 505 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 85310 - 85096
Alignment:
Q  505 ttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcc 604  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  85310 ttgatttcaattccctttttatggaccacgaaacctaaaaagtcacctgcacaaacaccaaacgcacattttaatggattcattttcaatccatattgcc 85211  T
Q  605 tcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctat 704  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |  || ||| | |||||  |||| ||||| |||||||| ||||  || |||| |||||| ||||  |||||    
T  85210 tcatcctttagaatgatcggcgtaaatgatctaagtgtttctcctctaaagaggatttcaccacaatgtcatagatataaaattgcatgaaatcttctat 85111  T
Q  705 gaaatcatgaaacat 719  Q
    ||||||||| |||||    
T  85110 gaaatcatggaacat 85096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 569 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 77439 - 77289
Alignment:
Q  569 cacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccac 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |  || ||| | |||||  |||| ||||| |||||    
T  77439 cacattttaatggattcattttcaatccatattgcctcatcctttagaatgatcggcgtaaatgatctaagtgtttctcctctaaagaggatttcaccac 77340  T
Q  669 aatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctctatgaaatcatgaaacat 719  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  77339 aatgtcatagatataaatttgcatgaaatcttctatgaaatcatggaacat 77289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 1621 - 902
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  1621 gacaacatatgtttaattatatcaaaatgggaataaacatagacgtgaaacggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaaatataagcatatac 1522  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  1521 ataacttttcactaggatggtatcttgtttcggcatcatttaatactctactaagataatatatggccctttctgcgccattttcatcctcttgtgctag 1422  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaa-gaattggaggatttatcagatatgactt 310  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||| |  | || |  | |||||||| | || ||||| || |||| ||| || ||    
T  1421 catgcttcctatagtacattccgatgctgctatatacaacttcattcttctaccttttagcagtggtgaaaggtataggagggttaatcaaatacgattt 1322  T
Q  311 gatttcatcgaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttaga 410  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |  || |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1321 gatttcttcgaaagccctttggtgctctggttcccatttgaacatatcttctttcttcagacgaagtaatggcgagaaaacctgtgtcttgccacttaga 1222  T
Q  411 tttgatat-----------gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgt 499  Q
    || |||||           |||||||||||||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1221 ttcgatatgaatcttttgagaaagttgatttttcccaataaagactgcagatctttctttgtagaaggggcttgagtctctattattaccttggttttgt 1122  T
Q  500 tctggttgatttcgattccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccata 599  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1121 tttggtaaatttcaattccctttttgaggaccacaaaacctaaaaaatcacctgcacaaacaccaaacacgcattttaatggattcatttttaatccata 1022  T
Q  600 tcgcctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattc 699  Q
    | |||| |||||||| || || | |||||| ||    || ||| |||| || || || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  1021 ttgccttatcctttcgaatgaactgcgtaagtgaactaagtgtttttcttctgaggatgattttactacaacatcatcgatgtaaatttgcatgaaatcc 922  T
Q  700 tctatgaaatcatgaaacat 719  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  921 tctatgaagtcatgaaacat 902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 66788 - 66422
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  66788 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaattttcgtacatgagaagaataagcaaagacaaagtttttcac 66689  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  66688 taggatgatatctagtttcaacatcattgactaccctacttagatagtaaatggccctttttgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 66589  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  66588 agtgccatctgacgttgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaaggggaaagaaccggagggtttaccagatatgacttgatttcatcaaaa 66489  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaag 390  Q
    || |||||||| |  |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  66488 gctttttggtgttttggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtattggtgagaaag 66422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 75966 - 75600
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  75966 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaattttcgtacatgagaagaataagcaaagacaaagtttttcac 75867  T
Q  124 taggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctat 223  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  75866 taggatgatatctagtttcaacatcattgactaccctacttagatagtaaatggccctttttgtgccatattcatcctcttgtgctaacatacttcctat 75767  T
Q  224 agttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatcgaag 323  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  75766 agtgccatctgacgttgctatatacaatttcattctcctatctttcaataaaggggaaagaaccggagggtttaccagatatgacttgatttcatcaaaa 75667  T
Q  324 gccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaag 390  Q
    || |||||||| |  |  |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  75666 gctttttggtgttttggttcccatttgaaaacatcatctttctttagtcggagtattggtgagaaag 75600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 66426 - 66293
Alignment:
Q  419 gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttcgattcc 518  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66426 gaaagttgatttttcctagtaatgactgcaattctttcttcgtagaaggagctttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttcgattcc 66327  T
Q  519 ctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacct 552  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  66326 ctttttatgcactacgaaacctagaaagtcacct 66293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 75604 - 75471
Alignment:
Q  419 gaaagttgatttttcctaacaatgattgcaactctttcttcgtagaaggagcttgagtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttcgattcc 518  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75604 gaaagttgatttttcctagtaatgactgcaattctttcttcgtagaaggagctttggtctcaattattgccttggttttgttctggttgatttcgattcc 75505  T
Q  519 ctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacct 552  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  75504 ctttttatgcactacgaaacctagaaagtcacct 75471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 67485 - 67093
Alignment:
Q  21 tgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagttttt 120  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | || ||||  ||||    
T  67485 tgtttaattatatcgaaatgagagtaaacataaacatcaaaagactttatataatgcttaagtttagtacatgagaaataaaaaaacagacataactttt 67386  T
Q  121 cactaggatgatatcttgtttc-agcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgc 219  Q
    |||| | ||||||||||||||  ||| || || |  |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| || |    
T  67385 cactggaatgatatcttgttttgagcatcgtttaacaccctactaagatattaaatggctctttctacgccattttcatcctcttgttctaacatactcc 67286  T
Q  220 ctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcattcttttgtccttcaataatggtgaaagaattggaggatttatcagatatgacttgatttcatc 319  Q
    ||||||| |  || || |||||||||||||||||||| ||  | | ||| |  |  || ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  67285 ctatagtacagtcagacgctgctatgtacaatttcatactcctattcttaagaagaggcgaaaggataggaggattggtcaaatatgacttgatttcttc 67186  T
Q  320 gaaggccttttggtgctccgtctcccatttaaaaatatcttctttctttaatcggagtagtggcgagaaagcttgtgttttgccacttagatt 412  Q
     || ||| ||||||||||    |||||||| || |  |||||||| ||||  |  || | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  67185 aaaagccctttggtgctcttgttcccatttgaatacgtcttctttttttaggcaaagcaatggcgaaaaagcttgcgttttgtcacttagatt 67093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0897 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0897
Description:

Target: scaffold0897; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 1861 - 1979
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  || ||||||||||    
T  1861 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaataaacacaaacaaagtttttcac 1960  T
Q  124 taggatgatatcttgtttc 142  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1961 taggatgatatcttgtttc 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 130109 - 130227
Alignment:
Q  24 ttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcac 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  || ||||||||||    
T  130109 ttaatgatatcaaaatgggaataaacataaacgtcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagaacaaacacaaacaaagtttttcac 130208  T
Q  124 taggatgatatcttgtttc 142  Q
    |||||||||||||||||||    
T  130209 taggatgatatcttgtttc 130227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 719
Target Start/End: Original strand, 177471 - 177586
Alignment:
Q  604 ctcatcctttcaaacgatcggcgtaaatgtttcaaatgtctttcctccgaagaagattttaccacaatatcatcaatgtaaatttgcataaaattctcta 703  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  || |  || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||  ||||    
T  177471 ctcatcctttcgaatgatcggcgtaggtgatctaagtgtttttcctctgaagaggattttaccacaatgtcgttgatataaatttgcatgaaatcttcta 177570  T
Q  704 tgaaatcatgaaacat 719  Q
    ||||||||||||||||    
T  177571 tgaaatcatgaaacat 177586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 54110 - 54330
Alignment:
Q  35 aaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgatat 134  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||| ||     
T  54110 aaaatgagaataaacataaatatcaataggatatatataatgcttaagtttgatacaagagaaatataaacaaaggcacaacttttcacttg-atggtac 54208  T
Q  135 cttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagttccatctg 234  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||   |||||    
T  54209 cttgtttcagcatcatttaataccctactaagataataaatggctttttctacgccattttcatcctcttgagctagcatacttcctatagtattatctg 54308  T
Q  235 atgctgctatgtacaatttcat 256  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  54309 aagcagctatatacaatttcat 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6406 - 6162
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||  | || || || || || ||||| |    
T  6406 gacaacatgtgtttgattatgtcaaaatgagaataaacataaacatcaacagactttatatattgcttaagcttcatgcaagaaaaatacaaacaaagac 6307  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaa 211  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||| |||| ||||| || | |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |     
T  6306 ataatttttcacttggatgatatcttgtttcagcatcatttgaaaccatactaagatagtaaacggctctttctacgccattttcatcttcttgtgctag 6207  T
Q  212 catgctgcctatagttccatctgatgctgctatgtacaatttcat 256  Q
    ||| || |||||||| | || ||| || ||||| |||||||||||    
T  6206 catacttcctatagtacaatatgaagcagctatatacaatttcat 6162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5810
Alignment:
Q  536 aacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatcca 597  Q
    |||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871 aacctaaaaaatcacctacacgtacaccaaatgcacattttaatggattcattttcaatcca 5810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 257
Target Start/End: Original strand, 57013 - 57228
Alignment:
Q  43 aataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaa-gtataagcaaaggcatagtttttcactaggatgatatcttgttt 141  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||  ||||||| || ||| || |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  57013 aataaacatagacatcaacaatttttatatattgcttaagtttaatacatgaaaatgtacaaacaaaggcacaatttttcacttggatgataccttgttt 57112  T
Q  142 cagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttctgcgccatattcatcctcttgtgccaacatgctgcctatagttccatctgatgctgc 241  Q
     ||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||   |||||| || ||    
T  57113 tagcatcattaaaaaccctactaagataataaatggccctttcgacgccattttcatcctcttgtgccagcatacttcctatagtattatctgaagcagc 57212  T
Q  242 tatgtacaatttcatt 257  Q
    ||| ||||||||||||    
T  57213 tatatacaatttcatt 57228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3491 - 3318
Alignment:
Q  12 gacatcatgtgtttaataatatcaaaatgggaataaacataaacatcaaaaggctttatataatgcttaagttttgtacatgagaagtataagcaaaggc 111  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||| | || |||||||    
T  3491 gacaacatgtgtttaattatgttaaaatgtgagtaaacataaacatcaataggatttatatattgcttaagtttcatacaggaaaagaacaaacaaaggc 3392  T
Q  112 atagtttttcactaggatgatatcttgtttcagcgtcattgagtaccctacttagataatagatggctctttct 185  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||| | ||||| |  |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  3391 atagtttttcacttggatgatcgctagtttcaacatcatttaaaaccctactaagataataaatggatctttct 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 517 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 2976 - 2879
Alignment:
Q  517 ccctttttatgcaccacggaacctagaaaatcacctgcacaaaccccaaatgcacattttaatggattcattttcaatccatatcgcctcatcctttc 614  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2976 ccctttttgtgcacaacaaaacctaaaatatcacctgcacgaataccaaaggcacattttaatggattcattttcaatccatatttcctcatcctttc 2879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University