View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9073_low_2 (Length: 718)

Name: NF9073_low_2
Description: NF9073
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9073_low_2
NF9073_low_2
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (18-712)||(50009-50703)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (18-712)||(16825210-16825906)
chr3 (18-712)||(14290463-14291157)
chr3 (15-703)||(12180857-12181545)
chr3 (18-703)||(17494159-17494848)
chr3 (15-703)||(12357455-12358143)
chr3 (15-703)||(31692113-31692801)
chr3 (15-703)||(31941416-31942104)
chr3 (25-703)||(12857434-12858111)
chr3 (15-699)||(18131275-18131958)
chr3 (18-558)||(35982839-35983379)
chr3 (18-702)||(11958112-11958796)
chr3 (21-665)||(16326641-16327287)
chr3 (43-703)||(16831484-16832144)
chr3 (20-703)||(17188887-17189570)
chr3 (18-703)||(24189817-24190501)
chr3 (15-702)||(10408482-10409169)
chr3 (15-702)||(28756833-28757520)
chr3 (15-702)||(47126458-47127145)
chr3 (30-703)||(15230116-15230789)
chr3 (30-703)||(15235984-15236657)
chr3 (269-662)||(11949107-11949500)
chr3 (75-703)||(8744378-8745006)
chr3 (75-703)||(13944537-13945165)
chr3 (507-712)||(12272842-12273047)
chr3 (387-697)||(10417345-10417655)
chr3 (471-703)||(16378318-16378550)
chr3 (471-702)||(12509867-12510098)
chr3 (417-639)||(13317864-13318086)
chr3 (565-703)||(14575499-14575637)
chr3 (57-443)||(16384342-16384728)
chr3 (486-703)||(15262133-15262350)
chr3 (486-690)||(12843513-12843717)
chr3 (486-692)||(15345655-15345861)
chr3 (486-692)||(16638287-16638493)
chr3 (486-692)||(24185704-24185910)
chr3 (486-692)||(43165189-43165395)
chr3 (486-692)||(48427961-48428167)
chr3 (433-658)||(15013115-15013340)
chr3 (505-692)||(15065585-15065772)
chr3 (486-692)||(10008114-10008320)
chr3 (486-692)||(10908724-10908930)
chr3 (486-692)||(12889223-12889429)
chr3 (486-692)||(13255204-13255410)
chr3 (486-692)||(15358597-15358803)
chr3 (486-692)||(15713466-15713672)
chr3 (18-358)||(13317500-13317840)
chr3 (341-692)||(3688457-3688808)
chr3 (486-692)||(15586802-15587008)
chr3 (486-690)||(14578818-14579022)
chr3 (18-280)||(12508496-12508758)
chr3 (486-692)||(15399927-15400133)
chr3 (486-692)||(20059464-20059670)
chr3 (505-658)||(14873997-14874150)
chr3 (486-658)||(16754111-16754283)
chr3 (505-692)||(5422359-5422546)
chr3 (25-127)||(2245610-2245712)
chr3 (486-692)||(6603249-6603455)
chr3 (486-692)||(16694678-16694884)
chr3 (486-692)||(26790823-26791029)
chr3 (486-692)||(53382428-53382634)
chr3 (486-658)||(16804357-16804529)
chr3 (192-423)||(2037017-2037248)
chr3 (192-423)||(2040758-2040989)
chr3 (192-423)||(14039539-14039770)
chr3 (187-286)||(15008684-15008783)
chr3 (18-287)||(12843045-12843314)
chr3 (578-690)||(17492367-17492479)
chr3 (81-287)||(16803952-16804158)
chr3 (78-187)||(3688959-3689068)
chr3 (486-547)||(11861033-11861094)
chr3 (30-287)||(15262549-15262806)
chr3 (78-178)||(10008625-10008725)
chr3 (78-178)||(10909235-10909335)
chr3 (78-178)||(15713061-15713161)
chr3 (486-574)||(23079427-23079515)
chr3 (75-181)||(6603757-6603863)
chr3 (225-287)||(23079166-23079228)
chr3 (507-552)||(8271830-8271875)
chr3 (36-121)||(10416994-10417079)
chr3 (507-552)||(13964786-13964831)
chr3 (507-552)||(30150021-30150066)
chr3 (78-181)||(6597077-6597180)
chr3 (156-287)||(11861272-11861403)
chr3 (78-181)||(13255712-13255815)
chr3 (18-113)||(14578363-14578458)
chr3 (78-181)||(16638795-16638898)
chr3 (156-287)||(23414870-23415001)
chr3 (78-181)||(43165697-43165800)
chr3 (225-287)||(15065990-15066052)
chr3 (71-113)||(23079012-23079054)
chr3 (507-552)||(15944026-15944071)
chr3 (507-552)||(22150168-22150213)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (18-712)||(12798194-12798885)
chr7 (18-712)||(19149876-19150570)
chr7 (18-712)||(20749275-20749969)
chr7 (90-703)||(15099365-15099978)
chr7 (18-697)||(14260936-14261615)
chr7 (30-702)||(16947174-16947846)
chr7 (15-703)||(13676325-13677007)
chr7 (18-694)||(13024228-13024903)
chr7 (18-702)||(12459503-12460187)
chr7 (18-703)||(11385119-11385804)
chr7 (57-703)||(14283103-14283749)
chr7 (15-702)||(26091485-26092172)
chr7 (15-697)||(21755292-21755974)
chr7 (15-702)||(26115277-26115964)
chr7 (15-702)||(49155176-49155863)
chr7 (15-667)||(40924504-40925156)
chr7 (14-702)||(13965354-13966042)
chr7 (25-703)||(12203497-12204175)
chr7 (75-703)||(18050700-18051328)
chr7 (411-703)||(14140553-14140845)
chr7 (441-703)||(15343305-15343567)
chr7 (73-321)||(14144917-14145165)
chr7 (30-703)||(15627397-15628070)
chr7 (18-512)||(12712353-12712847)
chr7 (486-692)||(11550282-11550488)
chr7 (486-692)||(14957438-14957644)
chr7 (488-658)||(15146105-15146275)
chr7 (486-692)||(44788531-44788737)
chr7 (486-692)||(8710489-8710695)
chr7 (486-692)||(13688925-13689131)
chr7 (486-692)||(14335280-14335486)
chr7 (18-259)||(13004783-13005024)
chr7 (486-690)||(14042581-14042785)
chr7 (486-690)||(14352611-14352815)
chr7 (486-692)||(11234393-11234599)
chr7 (486-692)||(18180627-18180833)
chr7 (486-692)||(18587351-18587557)
chr7 (486-692)||(15158237-15158443)
chr7 (486-692)||(17703635-17703841)
chr7 (486-692)||(9591248-9591454)
chr7 (486-692)||(12690386-12690591)
chr7 (582-692)||(8200932-8201042)
chr7 (75-287)||(17703224-17703436)
chr7 (18-187)||(14043084-14043253)
chr7 (18-187)||(14353114-14353283)
chr7 (78-178)||(15157832-15157932)
chr7 (75-287)||(16726210-16726422)
chr7 (58-287)||(11984281-11984510)
chr7 (604-692)||(10873574-10873662)
chr7 (78-178)||(13689436-13689536)
chr7 (516-575)||(38356-38415)
chr7 (156-287)||(9591653-9591784)
chr7 (486-573)||(16726621-16726708)
chr7 (507-552)||(4442951-4442996)
chr7 (507-552)||(7826924-7826969)
chr7 (507-552)||(13459057-13459102)
chr7 (507-552)||(27104975-27105020)
chr7 (507-552)||(27173305-27173350)
chr7 (78-178)||(11233988-11234088)
chr7 (78-178)||(18181138-18181238)
chr7 (507-552)||(14207343-14207388)
chr7 (507-552)||(14216033-14216078)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (36-703)||(14993088-14993755)
chr4 (15-627)||(15266736-15267348)
chr4 (25-703)||(15073243-15073921)
chr4 (21-665)||(20892953-20893597)
chr4 (15-696)||(16150527-16151208)
chr4 (15-696)||(16154673-16155354)
chr4 (15-702)||(3261494-3262181)
chr4 (15-702)||(29450237-29450924)
chr4 (15-702)||(44658566-44659253)
chr4 (15-667)||(11203932-11204584)
chr4 (18-399)||(18259629-18260010)
chr4 (36-703)||(27903269-27903936)
chr4 (15-574)||(7357280-7357839)
chr4 (75-703)||(51603552-51604180)
chr4 (75-660)||(53750230-53750815)
chr4 (565-701)||(15354290-15354426)
chr4 (441-703)||(14696985-14697247)
chr4 (25-311)||(8708953-8709239)
chr4 (486-687)||(14162370-14162571)
chr4 (486-690)||(15946-16150)
chr4 (54-283)||(13879413-13879642)
chr4 (486-692)||(14683462-14683668)
chr4 (486-692)||(17092060-17092266)
chr4 (486-692)||(12479495-12479701)
chr4 (486-692)||(16233903-16234109)
chr4 (486-692)||(23958642-23958848)
chr4 (486-692)||(27714231-27714437)
chr4 (486-658)||(8050534-8050706)
chr4 (486-658)||(14300890-14301062)
chr4 (486-658)||(19635065-19635237)
chr4 (486-692)||(8389307-8389513)
chr4 (486-692)||(16350465-16350671)
chr4 (512-692)||(15144829-15145009)
chr4 (486-658)||(19775704-19775876)
chr4 (623-702)||(15258812-15258891)
chr4 (505-692)||(18224376-18224563)
chr4 (486-692)||(40475935-40476141)
chr4 (505-692)||(16250780-16250967)
chr4 (486-652)||(13513285-13513451)
chr4 (89-287)||(14697401-14697599)
chr4 (473-530)||(15354234-15354291)
chr4 (486-589)||(16219186-16219289)
chr4 (486-589)||(16222506-16222609)
chr4 (18-115)||(14162942-14163039)
chr4 (78-178)||(14300485-14300585)
chr4 (156-287)||(13513650-13513781)
chr4 (633-692)||(16219125-16219184)
chr4 (633-692)||(16222445-16222504)
chr4 (53-287)||(8336-8570)
chr4 (225-287)||(18224123-18224185)
chr4 (58-287)||(18604302-18604531)
chr4 (72-178)||(19635542-19635648)
chr4 (507-552)||(14999681-14999726)
chr4 (516-573)||(18546820-18546877)
chr4 (578-658)||(14188435-14188515)
chr4 (489-553)||(18604733-18604797)
chr4 (225-287)||(16248326-16248388)
chr4 (507-552)||(15290350-15290395)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (18-712)||(63245-63919)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (18-712)||(5085-5778)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (18-703)||(22015520-22016205)
chr1 (18-712)||(21738811-21739505)
chr1 (18-712)||(21742327-21743021)
chr1 (15-703)||(19857204-19857892)
chr1 (18-702)||(24096390-24097074)
chr1 (15-703)||(20832673-20833360)
chr1 (15-702)||(38909598-38910285)
chr1 (15-702)||(48425804-48426491)
chr1 (15-702)||(52988672-52989358)
chr1 (15-702)||(31536769-31537456)
chr1 (15-660)||(20074481-20075126)
chr1 (15-702)||(37679980-37680667)
chr1 (54-667)||(20297347-20297962)
chr1 (29-525)||(21961135-21961631)
chr1 (432-703)||(18710315-18710586)
chr1 (15-703)||(20853532-20854220)
chr1 (441-692)||(16379004-16379255)
chr1 (54-286)||(18273114-18273346)
chr1 (486-661)||(21751988-21752163)
chr1 (486-692)||(22496499-22496705)
chr1 (444-692)||(24785058-24785306)
chr1 (486-692)||(16347838-16348044)
chr1 (486-692)||(20081619-20081825)
chr1 (486-692)||(51330735-51330941)
chr1 (505-692)||(33388291-33388478)
chr1 (595-702)||(12200449-12200556)
chr1 (486-692)||(17042258-17042464)
chr1 (486-658)||(21833246-21833418)
chr1 (444-692)||(21842122-21842370)
chr1 (486-692)||(19109278-19109484)
chr1 (21-287)||(16379409-16379675)
chr1 (486-643)||(41350911-41351068)
chr1 (441-547)||(21045322-21045428)
chr1 (486-634)||(21228799-21228947)
chr1 (156-287)||(21228469-21228600)
chr1 (78-187)||(16347433-16347542)
chr1 (78-187)||(16354081-16354190)
chr1 (78-178)||(51330330-51330430)
chr1 (18-112)||(20921929-20922023)
chr1 (507-552)||(20828656-20828701)
chr1 (507-552)||(20928104-20928149)
chr1 (30-207)||(21044941-21045118)
chr1 (486-563)||(22401631-22401708)
chr1 (78-178)||(21833723-21833823)
chr1 (486-541)||(22435976-22436031)
chr1 (84-187)||(41350512-41350615)
chr1 (132-178)||(19109791-19109837)
chr1 (225-287)||(24784839-24784901)
chr1 (156-285)||(17041929-17042057)
chr1 (507-552)||(20528103-20528148)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (18-703)||(29537-30222)
scaffold0067 (15-703)||(64305-64993)
scaffold0067 (15-703)||(48883-49571)
scaffold0067 (15-703)||(57917-58605)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (18-712)||(1017-1711)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (18-712)||(7648-8342)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (18-703)||(42611-43296)
scaffold0102 (486-658)||(50519-50691)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (18-703)||(34250-34935)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (15-703)||(36852-37540)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (15-703)||(518-1206)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (15-703)||(586-1274)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (18-645)||(70079-70706)
scaffold0046 (498-712)||(60643-60857)
scaffold0046 (18-112)||(433-527)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-658)||(4010-4650)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (18-703)||(23274108-23274793)
chr2 (18-703)||(19716260-19716945)
chr2 (15-702)||(20848105-20848789)
chr2 (18-702)||(23097261-23097945)
chr2 (18-560)||(19720823-19721365)
chr2 (54-703)||(12576868-12577517)
chr2 (412-703)||(23113238-23113528)
chr2 (25-423)||(28350670-28351068)
chr2 (25-369)||(21901386-21901730)
chr2 (441-703)||(24817506-24817768)
chr2 (486-690)||(22733485-22733689)
chr2 (486-690)||(23074391-23074595)
chr2 (516-690)||(23105469-23105643)
chr2 (469-692)||(45673706-45673929)
chr2 (486-692)||(9338108-9338314)
chr2 (486-692)||(9486742-9486948)
chr2 (486-692)||(11351422-11351628)
chr2 (486-692)||(16983766-16983972)
chr2 (486-692)||(17001526-17001732)
chr2 (486-692)||(21322977-21323183)
chr2 (486-658)||(22742677-22742849)
chr2 (486-658)||(23064973-23065145)
chr2 (444-692)||(24705151-24705399)
chr2 (486-692)||(22323053-22323259)
chr2 (486-692)||(24712560-24712766)
chr2 (486-692)||(44383281-44383487)
chr2 (505-692)||(23029191-23029378)
chr2 (489-692)||(27220542-27220745)
chr2 (505-692)||(27373795-27373982)
chr2 (486-692)||(10871376-10871582)
chr2 (486-692)||(24678013-24678219)
chr2 (486-692)||(24657369-24657575)
chr2 (486-643)||(30208631-30208788)
chr2 (486-692)||(24874461-24874667)
chr2 (486-658)||(24264930-24265102)
chr2 (505-692)||(21142771-21142958)
chr2 (486-658)||(23204874-23205046)
chr2 (486-573)||(19817492-19817579)
chr2 (225-287)||(22462931-22462993)
chr2 (651-703)||(23279291-23279343)
chr2 (156-287)||(23116440-23116571)
chr2 (156-287)||(24817221-24817352)
chr2 (226-287)||(23205245-23205306)
chr2 (226-287)||(23676849-23676910)
chr2 (484-552)||(22739363-22739431)
chr2 (78-178)||(24265407-24265507)
chr2 (225-287)||(11351161-11351223)
chr2 (483-552)||(22280771-22280840)
chr2 (18-115)||(22742209-22742306)
chr2 (29-114)||(24817094-24817179)
chr2 (78-178)||(10871887-10871987)
chr2 (78-181)||(9338616-9338719)
chr2 (78-181)||(9487250-9487353)
chr2 (486-553)||(23676583-23676650)
chr2 (78-181)||(44382876-44382979)
chr2 (245-287)||(24657128-24657170)
chr2 (225-287)||(24704932-24704994)
chr2 (507-552)||(25131275-25131320)
chr2 (597-658)||(41606209-41606269)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (18-703)||(43125-43810)
scaffold0104 (616-703)||(25129-25216)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (15-703)||(5718-6405)
scaffold0035 (486-656)||(41282-41452)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (18-712)||(19985121-19985815)
chr8 (18-712)||(21928369-21929063)
chr8 (42-703)||(22373819-22374480)
chr8 (15-703)||(22027423-22028111)
chr8 (18-702)||(31413678-31414362)
chr8 (15-702)||(29300569-29301256)
chr8 (73-702)||(22053814-22054443)
chr8 (15-702)||(28983862-28984549)
chr8 (15-697)||(16268367-16269049)
chr8 (25-703)||(20391036-20391714)
chr8 (383-702)||(28989081-28989400)
chr8 (524-702)||(27357487-27357665)
chr8 (54-451)||(6606651-6607048)
chr8 (486-690)||(22421506-22421710)
chr8 (444-690)||(21253908-21254154)
chr8 (489-703)||(22375071-22375284)
chr8 (486-690)||(21391475-21391679)
chr8 (486-690)||(21780801-21781005)
chr8 (516-690)||(21785999-21786173)
chr8 (508-692)||(22523507-22523691)
chr8 (444-692)||(22990006-22990254)
chr8 (486-692)||(19980928-19981134)
chr8 (441-703)||(22245584-22245846)
chr8 (441-703)||(22246002-22246264)
chr8 (486-692)||(17671636-17671842)
chr8 (512-692)||(21164178-21164358)
chr8 (486-692)||(19115361-19115567)
chr8 (486-692)||(20015877-20016083)
chr8 (486-692)||(32603106-32603312)
chr8 (444-692)||(22126531-22126779)
chr8 (486-692)||(18859538-18859744)
chr8 (486-692)||(22031064-22031270)
chr8 (486-692)||(22117789-22117995)
chr8 (486-692)||(22042788-22042994)
chr8 (486-692)||(30310758-30310964)
chr8 (486-692)||(15536344-15536550)
chr8 (486-692)||(22129231-22129437)
chr8 (486-643)||(19481686-19481843)
chr8 (15-114)||(21970694-21970793)
chr8 (16-114)||(22004225-22004323)
chr8 (78-287)||(22043193-22043402)
chr8 (30-287)||(22523876-22524133)
chr8 (225-287)||(30310497-30310559)
chr8 (75-178)||(18860049-18860152)
chr8 (156-287)||(32603511-32603642)
chr8 (18-187)||(21671981-21672150)
chr8 (78-178)||(22126168-22126268)
chr8 (507-552)||(20649990-20650035)
chr8 (30-178)||(22990520-22990668)
chr8 (156-287)||(15536749-15536880)
chr8 (84-187)||(19481287-19481390)
chr8 (18-113)||(22421039-22421134)
chr8 (225-287)||(21391214-21391276)
chr8 (225-287)||(21780540-21780602)
chr8 (16-114)||(21982098-21982196)
chr8 (16-114)||(21998584-21998682)
chr8 (78-172)||(22117384-22117478)
chr8 (516-573)||(19870773-19870830)
chr8 (507-552)||(21847972-21848017)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (15-703)||(23563050-23563738)
chr5 (18-702)||(23077790-23078474)
chr5 (15-667)||(20345116-20345768)
chr5 (15-667)||(22505513-22506165)
chr5 (15-702)||(14883873-14884560)
chr5 (30-703)||(21983074-21983747)
chr5 (15-702)||(25850871-25851558)
chr5 (25-703)||(21560917-21561595)
chr5 (15-703)||(17266216-17266904)
chr5 (18-293)||(21870163-21870438)
chr5 (18-293)||(21874443-21874718)
chr5 (226-697)||(20824257-20824728)
chr5 (471-703)||(28892280-28892512)
chr5 (471-703)||(20778711-20778943)
chr5 (481-703)||(22464748-22464970)
chr5 (371-658)||(21631637-21631924)
chr5 (25-451)||(43122517-43122943)
chr5 (42-311)||(23669822-23670091)
chr5 (486-690)||(25429250-25429454)
chr5 (486-690)||(26736080-26736284)
chr5 (486-692)||(21882601-21882807)
chr5 (486-692)||(16359329-16359535)
chr5 (489-703)||(23474011-23474225)
chr5 (486-692)||(29473426-29473632)
chr5 (486-692)||(34569321-34569527)
chr5 (486-692)||(40711607-40711813)
chr5 (486-692)||(14997092-14997298)
chr5 (486-692)||(18781941-18782147)
chr5 (486-692)||(22330240-22330446)
chr5 (486-692)||(27521233-27521439)
chr5 (486-658)||(37288849-37289021)
chr5 (486-658)||(41773703-41773875)
chr5 (486-692)||(19772787-19772993)
chr5 (486-692)||(27613183-27613389)
chr5 (486-692)||(27682753-27682959)
chr5 (486-692)||(22350746-22350952)
chr5 (486-692)||(27665843-27666049)
chr5 (486-658)||(23460832-23461004)
chr5 (505-692)||(20803424-20803611)
chr5 (486-658)||(22137529-22137701)
chr5 (192-423)||(16258095-16258326)
chr5 (436-658)||(21409995-21410217)
chr5 (486-587)||(21332339-21332440)
chr5 (18-287)||(23474426-23474695)
chr5 (192-311)||(22591814-22591933)
chr5 (192-311)||(22595369-22595488)
chr5 (486-618)||(23525952-23526084)
chr5 (601-692)||(21336762-21336853)
chr5 (597-658)||(21342878-21342939)
chr5 (78-178)||(22329835-22329935)
chr5 (225-287)||(18782346-18782408)
chr5 (18-111)||(21331874-21331967)
chr5 (36-125)||(28891845-28891934)
chr5 (78-178)||(14996687-14996787)
chr5 (78-178)||(19773298-19773398)
chr5 (78-178)||(27682348-27682448)
chr5 (78-181)||(27521741-27521844)
chr5 (87-178)||(27613694-27613785)
chr5 (15-325)||(22465126-22465436)
chr5 (30-115)||(21631296-21631381)
chr5 (507-552)||(23508633-23508678)
chr5 (507-552)||(24584159-24584204)
chr5 (21-125)||(20824829-20824933)
chr5 (84-287)||(23461203-23461406)
chr5 (78-178)||(29473021-29473121)
chr5 (78-181)||(16359837-16359940)
chr5 (81-280)||(21410373-21410572)
chr5 (54-113)||(25429826-25429885)
chr5 (78-181)||(34569829-34569932)
chr5 (225-287)||(23526283-23526345)
chr5 (84-178)||(37288450-37288544)
chr5 (36-121)||(20770518-20770603)
chr5 (36-121)||(20779293-20779378)
chr5 (225-286)||(20803830-20803891)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (18-703)||(19455771-19456456)
chr6 (15-703)||(19437750-19438438)
chr6 (18-648)||(19465971-19466601)
chr6 (15-700)||(14376761-14377446)
chr6 (25-703)||(25770592-25771270)
chr6 (25-703)||(21474348-21475010)
chr6 (15-665)||(18797476-18798126)
chr6 (93-712)||(24515337-24515956)
chr6 (18-702)||(10465696-10466380)
chr6 (25-703)||(19486149-19486827)
chr6 (18-702)||(21566839-21567523)
chr6 (15-667)||(24367184-24367836)
chr6 (15-703)||(34642430-34643119)
chr6 (15-703)||(15462084-15462772)
chr6 (441-703)||(23085096-23085358)
chr6 (486-690)||(18405260-18405464)
chr6 (486-690)||(23081184-23081388)
chr6 (443-703)||(30678297-30678557)
chr6 (489-703)||(18182686-18182900)
chr6 (18-311)||(8720553-8720846)
chr6 (537-693)||(20010821-20010977)
chr6 (18-311)||(16813780-16814073)
chr6 (486-652)||(5836544-5836710)
chr6 (486-692)||(29589755-29589961)
chr6 (486-658)||(22436662-22436834)
chr6 (486-692)||(2872118-2872324)
chr6 (486-692)||(16574649-16574855)
chr6 (486-692)||(16620525-16620731)
chr6 (486-692)||(16924956-16925162)
chr6 (486-692)||(27559285-27559491)
chr6 (486-692)||(24293098-24293304)
chr6 (512-692)||(19867446-19867626)
chr6 (486-692)||(28260513-28260719)
chr6 (486-692)||(28285197-28285403)
chr6 (486-692)||(28339262-28339468)
chr6 (18-259)||(19881588-19881829)
chr6 (18-287)||(30677872-30678141)
chr6 (486-658)||(28312423-28312595)
chr6 (18-287)||(23081587-23081856)
chr6 (489-658)||(27190229-27190398)
chr6 (489-658)||(27258842-27259011)
chr6 (486-692)||(25115311-25115517)
chr6 (18-287)||(18660083-18660352)
chr6 (78-178)||(5836139-5836239)
chr6 (53-281)||(25958636-25958864)
chr6 (15-313)||(20010346-20010645)
chr6 (486-553)||(22829702-22829769)
chr6 (225-287)||(21764976-21765038)
chr6 (507-552)||(16379710-16379755)
chr6 (507-552)||(16647306-16647351)
chr6 (25-114)||(23084680-23084769)
chr6 (78-178)||(2871713-2871813)
chr6 (71-113)||(22437207-22437249)
chr6 (132-178)||(22829351-22829397)
chr6 (245-287)||(27559044-27559086)
chr6 (507-552)||(16100914-16100959)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (15-703)||(98286-98974)
scaffold0020 (25-712)||(175892-176578)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (18-712)||(1625-2317)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (15-703)||(1655-2343)
scaffold0034 (30-703)||(70285-70958)
scaffold0034 (15-401)||(11609-11995)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (57-703)||(29440-30086)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (15-703)||(8527-9215)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (264-703)||(12640-13079)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (30-703)||(20727-21400)
scaffold0222 (18-703)||(193-878)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (15-702)||(39038-39723)
scaffold0010 (541-703)||(44656-44818)
scaffold0010 (448-692)||(4839-5083)
scaffold0010 (486-658)||(14382-14554)
scaffold0010 (156-287)||(14753-14884)
scaffold0010 (18-287)||(5244-5513)
scaffold0010 (36-121)||(180563-180648)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (30-703)||(990-1663)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (15-703)||(9477-10163)
scaffold0243 (486-690)||(24119-24323)
scaffold0243 (53-109)||(23686-23742)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (30-703)||(28003-28676)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (15-701)||(4912-5598)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (15-712)||(8165-8862)
scaffold0235 (15-712)||(18379-19076)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (36-701)||(6953-7618)
scaffold0664 (15-70)||(3-58)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (18-712)||(5506-6200)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (18-490)||(62478-62950)
scaffold0053 (225-703)||(65211-65689)
scaffold0053 (18-204)||(65028-65214)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (63-702)||(30077-30716)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (18-701)||(164107-164790)
scaffold0023 (484-690)||(47155-47360)
scaffold0023 (512-658)||(30774-30920)
scaffold0023 (578-690)||(152007-152119)
scaffold0023 (225-287)||(30487-30549)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (15-701)||(53962-54648)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (29-702)||(10891-11564)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (15-560)||(575-1125)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (18-702)||(251536-252217)
scaffold0009 (225-287)||(229765-229827)
scaffold0009 (486-553)||(230026-230093)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (15-703)||(22035-22723)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (275-703)||(11873-12301)
scaffold0165 (139-238)||(12322-12421)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (27-702)||(514068-514743)
scaffold0001 (510-697)||(441572-441759)
scaffold0001 (444-697)||(495939-496192)
scaffold0001 (30-114)||(442154-442238)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (171-703)||(325620-326151)
scaffold0004 (173-703)||(200338-200859)
scaffold0004 (15-352)||(319507-319844)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (15-702)||(375-1062)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (18-494)||(5562-6035)
scaffold0523 (489-712)||(2775-2998)
scaffold0523 (53-537)||(11484-11968)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (165-702)||(4998-5535)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (57-703)||(263139-263785)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (18-551)||(51716-52249)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (57-703)||(203294-203940)
scaffold0003 (341-658)||(424266-424583)
scaffold0003 (84-178)||(424746-424840)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (18-492)||(16761-17235)
scaffold0266 (507-548)||(7057-7098)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (222-703)||(764-1245)
scaffold0203 (15-181)||(3754-3920)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (63-703)||(9538-10177)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (15-667)||(41684-42336)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (63-702)||(39972-40611)
scaffold0114 (486-690)||(17523-17726)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (15-624)||(8724-9333)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (43-702)||(17215-17874)
scaffold0348 (84-702)||(4621-5239)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (18-703)||(251-936)
scaffold0476 (486-692)||(10710-10916)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (57-661)||(6002-6606)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (15-703)||(53126-53814)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (21-702)||(66817-67498)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (15-409)||(153699-154093)
scaffold0011 (417-703)||(151480-151766)
scaffold0011 (486-703)||(23707-23924)
scaffold0011 (507-556)||(73792-73841)
scaffold0011 (507-556)||(78173-78222)
scaffold0011 (507-559)||(175708-175760)
scaffold0011 (507-552)||(182054-182099)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (240-702)||(29848-30310)
scaffold0088 (15-190)||(30336-30511)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (18-355)||(4160-4496)
scaffold0017 (486-692)||(17240-17446)
scaffold0017 (489-702)||(24220-24433)
scaffold0017 (512-691)||(195038-195217)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (18-532)||(1193-1707)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (99-469)||(71-441)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (19-596)||(1555-2132)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (18-298)||(5608-5888)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (471-703)||(14-246)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (403-703)||(496-796)
scaffold1530 (15-322)||(798-1105)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (240-702)||(11723-12173)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (466-703)||(20682-20919)
scaffold0261 (466-703)||(12502-12739)
scaffold0261 (18-406)||(12120-12506)
scaffold0261 (18-406)||(20300-20686)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (18-306)||(115934-116222)
scaffold0031 (499-703)||(110523-110727)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (15-537)||(1310-1832)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (156-665)||(115513-116022)
scaffold0029 (387-703)||(93969-94285)
scaffold0029 (36-121)||(93618-93703)
scaffold0029 (78-178)||(107543-107643)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (483-703)||(1033-1253)
scaffold0167 (15-464)||(5205-5654)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (230-703)||(11743-12214)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (222-703)||(3999-4480)
scaffold0585 (25-227)||(574-775)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (15-339)||(245-569)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (471-703)||(15036-15268)
scaffold0074 (15-400)||(15288-15673)
scaffold0074 (441-697)||(6032-6288)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (18-259)||(3222-3463)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (481-698)||(9396-9613)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (156-697)||(3736-4274)
scaffold0130 (505-658)||(7972-8125)
scaffold0130 (237-287)||(7704-7754)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (15-464)||(2783-3226)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (521-712)||(49086-49277)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (27-529)||(518-1020)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (481-665)||(3-187)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (366-605)||(19023-19262)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (18-277)||(33078-33337)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (15-396)||(23626-24007)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (18-703)||(6786-7471)
scaffold0270 (18-703)||(13916-14601)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (384-703)||(5001-5320)
scaffold0529 (18-115)||(5589-5686)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (15-313)||(1007-1305)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (489-703)||(17791-18005)
scaffold0040 (486-670)||(111081-111265)
scaffold0040 (18-287)||(18174-18443)
[»] scaffold0282 (3 HSPs)
scaffold0282 (441-697)||(13608-13864)
scaffold0282 (51-287)||(13213-13449)
scaffold0282 (18-112)||(9828-9922)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (521-665)||(21802-21946)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (570-703)||(26025-26158)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (444-703)||(23430-23689)
scaffold0018 (441-703)||(9480-9742)
scaffold0018 (156-287)||(9195-9326)
scaffold0018 (29-114)||(9068-9153)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (486-690)||(4360-4564)
scaffold0621 (486-632)||(1-147)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (444-703)||(14398-14657)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (441-703)||(26265-26527)
scaffold0042 (512-692)||(37020-37200)
scaffold0042 (18-115)||(26853-26950)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (441-690)||(8336-8585)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (570-703)||(1132-1257)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (444-695)||(15111-15362)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (444-703)||(57746-58005)
scaffold0077 (18-287)||(57320-57589)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (444-703)||(15335-15582)
scaffold0293 (30-287)||(15739-15996)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (486-692)||(36422-36628)
scaffold0079 (156-287)||(36827-36958)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (444-697)||(216552-216805)
scaffold0012 (18-287)||(216126-216395)
[»] scaffold1423 (2 HSPs)
scaffold1423 (486-690)||(552-756)
scaffold1423 (64-113)||(130-179)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (486-690)||(2437-2641)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (486-690)||(1915-2119)
scaffold0324 (30-178)||(2427-2575)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (486-690)||(55644-55848)
scaffold0075 (53-287)||(48059-48293)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (486-656)||(1959-2129)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (486-690)||(11054-11258)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (507-703)||(13997-14193)
scaffold0120 (486-589)||(11291-11394)
scaffold0120 (507-552)||(25242-25287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (486-690)||(8149-8353)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (486-661)||(40681-40856)
[»] scaffold0100 (3 HSPs)
scaffold0100 (54-287)||(16351-16584)
scaffold0100 (441-543)||(16738-16840)
scaffold0100 (540-703)||(21413-21576)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (489-690)||(104153-104354)
scaffold0006 (18-281)||(104561-104824)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (486-690)||(7913-8117)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (486-692)||(10332-10538)
scaffold0550 (225-287)||(10071-10133)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (486-692)||(29102-29308)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (486-692)||(22171-22377)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (54-262)||(7911-8119)
scaffold0609 (187-423)||(1132-1368)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (486-654)||(14873-15041)
scaffold0403 (64-178)||(15349-15463)
[»] scaffold0080 (7 HSPs)
scaffold0080 (486-690)||(54563-54767)
scaffold0080 (487-692)||(31807-32012)
scaffold0080 (487-658)||(37307-37478)
scaffold0080 (486-658)||(10412-10584)
scaffold0080 (486-658)||(13067-13239)
scaffold0080 (225-287)||(10152-10214)
scaffold0080 (225-287)||(12807-12869)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (486-658)||(7194-7366)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (486-690)||(41558-41762)
scaffold0022 (486-690)||(75278-75482)
scaffold0022 (512-692)||(34915-35095)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (505-656)||(942-1093)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (486-690)||(8876-9077)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (516-690)||(24916-25090)
scaffold0218 (507-552)||(1147-1192)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (84-249)||(2198-2363)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (486-643)||(3524-3681)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (486-690)||(18576-18780)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (488-692)||(17861-18065)
scaffold0028 (486-692)||(11393-11599)
scaffold0028 (486-562)||(55058-55134)
scaffold0028 (624-692)||(53651-53719)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (512-655)||(1-144)
scaffold0273 (225-287)||(369-431)
scaffold0273 (57-115)||(541-599)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (592-703)||(3450-3561)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (508-690)||(4509-4691)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (486-692)||(10292-10498)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (486-692)||(8182-8388)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (486-692)||(3348-3554)
scaffold0044 (486-658)||(17118-17290)
scaffold0044 (156-287)||(17489-17620)
scaffold0044 (84-178)||(3859-3953)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (25-127)||(748-850)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (15-181)||(1-167)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (25-127)||(25949-26051)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (486-658)||(13298-13470)
scaffold0109 (486-692)||(41079-41285)
scaffold0109 (225-287)||(13037-13099)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (441-572)||(11072-11203)
scaffold0507 (18-178)||(11466-11626)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (78-319)||(996-1237)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (486-692)||(1206-1412)
[»] scaffold2059 (2 HSPs)
scaffold2059 (486-658)||(943-1115)
scaffold2059 (156-287)||(613-744)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (486-654)||(21566-21734)
scaffold0081 (486-654)||(36990-37158)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (489-692)||(65-268)
[»] scaffold0177 (3 HSPs)
scaffold0177 (489-654)||(11533-11698)
scaffold0177 (225-287)||(11269-11331)
scaffold0177 (225-287)||(14954-15016)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (506-658)||(674-826)
scaffold1881 (72-287)||(240-455)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (25-127)||(30741-30843)
scaffold0180 (194-310)||(30895-31011)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (18-287)||(1128-1397)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (486-627)||(15753-15894)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (597-690)||(3527-3620)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (18-214)||(20-215)
[»] scaffold0605 (3 HSPs)
scaffold0605 (481-532)||(1364-1415)
scaffold0605 (192-313)||(1583-1704)
scaffold0605 (60-125)||(1771-1836)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-152)||(17703-17834)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (199-283)||(36161-36245)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (486-562)||(48719-48795)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (601-692)||(12587-12678)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (15-190)||(13757-13932)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (486-573)||(2907-2994)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (225-287)||(208-270)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (54-115)||(2252-2313)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (483-552)||(13502-13571)
scaffold0467 (507-552)||(816-861)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (18-214)||(468-664)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (156-287)||(117-248)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (507-552)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (507-552)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (507-552)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (507-552)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (507-552)||(8221-8266)
scaffold0021 (507-552)||(90566-90611)
scaffold0021 (507-552)||(21071-21116)
scaffold0021 (507-552)||(30647-30692)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (507-559)||(3556-3608)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (15-70)||(1252-1307)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (226-285)||(445-504)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (84-287)||(5327-5530)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (156-287)||(139454-139585)
scaffold0008 (249-287)||(179-217)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (225-287)||(13945-14007)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-95)||(16232-16306)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (245-287)||(171447-171489)
scaffold0019 (505-546)||(171188-171229)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (507-552)||(2635-2680)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (187-280)||(4874-4967)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (507-552)||(4097-4142)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (507-552)||(5000-5045)


Alignment Details
Target: scaffold0108 (Bit Score: 571; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 50703 - 50009
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50703 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtga 50604  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50603 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcatagatggaatgatgagaggaggcccaa 50504  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50503 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgt 50404  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50403 ggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacccagccta 50304  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50303 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcc 50204  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  50203 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaatt 50104  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50103 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 50009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 16825210 - 16825906
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16825210 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtga 16825309  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  16825310 tgagtgagcgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgcccctcctgacaagggtaagtagagattgaaagatgagaggaggcccaa 16825409  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16825410 gatgagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgt 16825509  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16825510 ggtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatcagtttgcagtgtacgcagccta 16825609  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttcttta--atagtact 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16825610 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtact 16825709  T
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16825710 cctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaa 16825809  T
Q  616 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16825810 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatct 16825906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 14290463 - 14291157
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  14290463 atcaagagggctattggttatcaaaagataagaaatttttctgaattggaaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtga 14290562  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  14290563 tgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaa 14290662  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14290663 gaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagatgagaagaagtgctttaggtgt 14290762  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| || |   | || || || ||||| || ||| |||| | | ||||||    
T  14290763 ggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagccta 14290862  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14290863 agaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 14290962  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14290963 tttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatg 14291062  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14291063 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 14291157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12181545 - 12180857
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12181545 gacatcaagagaaccattggctatcagaaaataaggaacttctctgaattggtaagcggctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 12181446  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||||| |||| |    
T  12181445 tgatgagtgaacgaagaggcaagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagtagaggttaaatgatgagaggaggac 12181346  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  12181345 caagaggagagatgctcctactgacattttttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagt 12181246  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12181245 tgtggtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcaac 12181146  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| || |    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12181145 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 12181046  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12181045 tcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaa 12180946  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12180945 atggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12180857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 17494848 - 17494159
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17494848 atcaagagagccattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattacaaggtga 17494749  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgac----aacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggc 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |    || |||||||| || || |||||||||| |||||    
T  17494748 tgagtgagcgcagagccaagggacaacaaagtcgttcgaagccatatagtgctcctgctggctgagaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggc 17494649  T
Q  214 ccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  17494648 ccaagaggagagatgctcatactgagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgct-cag 17494550  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||     
T  17494549 gtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaa 17494450  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |  | | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17494449 ccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 17494350  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17494349 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 17494250  T
Q  614 aatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17494249 aatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 17494159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 12357455 - 12358143
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  12357455 gacatcaagagagccattaggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaagg 12357554  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || ||| | ||  |||||||||||| ||||||    
T  12357555 tgatgagtgagcgcagaggtaagggacatcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagtagaggctgaatgatgagaggaggcc 12357654  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12357655 caagaggagagatactcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 12357754  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  12357755 tgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaac 12357854  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357855 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 12357954  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12357955 acctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaa 12358054  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12358055 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12358143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 31692113 - 31692801
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31692113 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataagg 31692212  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  31692213 tgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcc 31692312  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| |||||| ||||| || |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||    
T  31692313 caataggagaaatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcagg 31692412  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||  ||| ||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  31692413 tgtggttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtacgcagc 31692512  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31692513 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 31692612  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31692613 tcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 31692712  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31692713 atggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 31692801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 31942104 - 31941416
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31942104 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataagg 31942005  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  31942004 tgatgagtgatcgaaggagcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcc 31941905  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||    
T  31941904 caataggagaaatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcagg 31941805  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||  ||||||| || || | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  31941804 tgtggtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacgcagc 31941705  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941704 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 31941605  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941604 tcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 31941505  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31941504 atggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagagactttga 31941416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Original strand, 12857434 - 12858111
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||  |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12857434 gggccattggctaccaaaagataagaattttttttgatttggtgagtagctgtagaatctatgaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 12857533  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  12857534 gcgtagaggcaagggacagtagagtcgtccaaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacaaggactgaatgatgagaggaggcctaaaaggaga 12857633  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||   ||    
T  12857634 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaagggccacatgagtaatgtatgtgactgtgatgagaagaagtgtttccgatgtggaaaga 12857733  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||   ||| ||| || |||||| | || |||||||||||||| |   | || ||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||     
T  12857734 aaggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgtagtgcaggaagcctaagaaggc 12857833  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857834 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggacg-acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 12857932  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12857933 gctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttg 12858032  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12858033 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttga 12858111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 699
Target Start/End: Original strand, 18131275 - 18131958
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || |||||  |||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |    
T  18131275 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatatggtgagtagctgtaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaag 18131374  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||| ||||| |||||| ||||||    
T  18131375 tgatgagtgaacggagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagagactgaataatgagaggaggcc 18131474  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  18131475 caagaggagagatgctcctgttgagattgattgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 18131574  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| || |    
T  18131575 tgtggtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatattagttcgcagtgtactcaac 18131674  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
      ||||||||||| || ||||| || |||||| || ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131675 tgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 18131774  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18131775 tcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaa 18131873  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagact 699  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18131874 acggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagact 18131958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35983379 - 35982839
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  35983379 atcaagagggctattggttatcataagataagaaatttttctgaattggtaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtga 35983280  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  35983279 tgagtgagtgcagaggtaagggacagcagagttgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaa 35983180  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35983179 gaggagagatgctcctactgtgattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgt 35983080  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  35983079 ggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcattgtacgcagccta 35982980  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  35982979 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactct 35982880  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982879 tttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 11958112 - 11958796
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || || || |||| ||||||||||||||    
T  11958112 atcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcgggatttatgaggaagacacaaaagttcattacaaggtga 11958211  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||| | |||||  ||    
T  11958212 tgagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagaatgaatgatgataggaggcttaa 11958311  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| |||||| |||||||||    
T  11958312 gaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtttcaggtgt 11958411  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  11958412 ggtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatcagttcatagtgtactcagccga 11958511  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11958512 agaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcc 11958611  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11958612 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatg 11958711  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  11958712 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagactttg 11958796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 665
Target Start/End: Original strand, 16326641 - 16327287
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||    
T  16326641 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 16326740  T
Q  121 gtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagag 220  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||    
T  16326741 gtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaaaaggtgaatgatgataggagacccaagag 16326840  T
Q  221 gagaga-tgctcctactgata-ttgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 318  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  16326841 gagagactgctcctgctgagacttgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtg 16326940  T
Q  319 gtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaa 418  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  16326941 gtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaa 16327040  T
Q  419 gaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 518  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327041 gaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcct 16327140  T
Q  519 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16327141 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatgg 16327240  T
Q  619 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327241 ttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 43 - 703
Target Start/End: Original strand, 16831484 - 16832144
Alignment:
Q  43 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 142  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16831484 agataagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 16831583  T
Q  143 acagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 242  Q
     ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  16831584 gcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 16831683  T
Q  243 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 341  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   ||||      
T  16831684 gtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcg 16831782  T
Q  342 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 441  Q
    || || |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16831783 gactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaagg 16831882  T
Q  442 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 541  Q
    |||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16831883 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgg 16831982  T
Q  542 tgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 641  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16831983 tgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 16832082  T
Q  642 tcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  16832083 tcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 16832144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 17189570 - 17188887
Alignment:
Q  20 caagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatg 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17189570 caagagggctattggataccagaagatcagaaacttctttgagttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacaaaagctcattacaaggtgatg 17189471  T
Q  120 agtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaaga 219  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17189470 agtgaccgcagaggcaagggccagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctaacaagggaaagcagagatttaatgatgagaggaggtccaaga 17189371  T
Q  220 ggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 319  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17189370 ggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 17189271  T
Q  320 tcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaag 419  Q
    || |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  17189270 tcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaaag 17189171  T
Q  420 aaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctt 519  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17189170 aagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctt 17189071  T
Q  520 taattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggt 619  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  17189070 taattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggt 17188971  T
Q  620 tgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  17188970 tgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 17188887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 24190501 - 24189817
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24190501 atcaagagggctattggataccagaagatcagaaacttctctgatttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacgaaagctcattacaaggtga 24190402  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| ||| || ||||||||||  || |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||  |||    
T  24190401 tgactgaccgcagaggcaaggc-cagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggtacaa 24190303  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24190302 gaggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 24190203  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |    
T  24190202 ggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgtactcagccaa 24190103  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||| || ||||| || | |||||| |||||| |||||||  |    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24190102 agaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 24190003  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  24190002 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatg 24189903  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  24189902 gttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 24189817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 10409169 - 10408482
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||   |||||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  10409169 gacatcaaaagagctattggatatcagcagatcagagttttttctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 10409070  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |   ||  |||||| | ||||||    
T  10409069 taatgagtgagaggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcc 10408970  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  10408969 caagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 10408870  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  10408869 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 10408770  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10408769 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 10408670  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  10408669 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 10408570  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  10408569 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 10408482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28757520 - 28756833
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  28757520 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 28757421  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  28757420 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 28757321  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  28757320 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 28757221  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  28757220 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagc 28757121  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28757120 cgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 28757021  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  28757020 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 28756921  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  28756920 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28756833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 47127145 - 47126458
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  47127145 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 47127046  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||    
T  47127045 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 47126946  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  47126945 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 47126846  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  47126845 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 47126746  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47126745 cgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 47126646  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||    
T  47126645 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaa 47126546  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  47126545 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 47126458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15230789 - 15230116
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15230789 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15230690  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15230689 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15230590  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15230589 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15230490  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15230489 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15230390  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |   | || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230389 caggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15230290  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15230289 tatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaact 15230190  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15230189 ccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15230116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15236657 - 15235984
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15236657 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15236558  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15236557 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15236458  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15236457 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15236358  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15236357 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15236258  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |   | || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236257 caggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 15236158  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15236157 tatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaact 15236058  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15236057 ccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15235984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 269 - 662
Target Start/End: Original strand, 11949107 - 11949500
Alignment:
Q  269 ccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgc 368  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || ||  ||||||||    
T  11949107 ccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgc 11949206  T
Q  369 tacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcag 468  Q
    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |      
T  11949207 tataactgcaatgaggaaggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaacca 11949306  T
Q  469 tgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 568  Q
      | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11949307 ctagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattga 11949406  T
Q  569 ttgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 662  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949407 atgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 75 - 703
Target Start/End: Original strand, 8744378 - 8745006
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  8744378 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 8744477  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  8744478 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 8744577  T
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 373  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  8744578 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 8744676  T
Q  374 cttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 473  Q
     |  || || || || || |||||| |  |||| || || || |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  8744677 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 8744776  T
Q  474 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||    
T  8744777 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtg 8744876  T
Q  574 catataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttg 673  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  8744877 catataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtg 8744976  T
Q  674 tctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || | | ||||||||||||||||| |||||    
T  8744977 tccaatttctatgtttggtagagattttga 8745006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 75 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13945165 - 13944537
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  13945165 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 13945066  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  13945065 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 13944966  T
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 373  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  13944965 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 13944867  T
Q  374 cttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 473  Q
     |  || || || || || |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  13944866 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 13944767  T
Q  474 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  13944766 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtg 13944667  T
Q  574 catataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttg 673  Q
    | |||||  ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | || ||    
T  13944666 cttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtg 13944567  T
Q  674 tctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || | | ||||||||||||||||| |||||    
T  13944566 tccaatttctatgtttggtagagattttga 13944537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 507 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272842
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatga 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  607 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgt 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  707 ccatct 712  Q
    | ||||    
T  12272847 cgatct 12272842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 387 - 697
Target Start/End: Original strand, 10417345 - 10417655
Alignment:
Q  387 ggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggactta 486  Q
    ||||| || |||||| ||||  |||| ||||||||||| || || || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||    
T  10417345 ggtcacattagttcgcagtgcccgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgactta 10417444  T
Q  487 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  10417445 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttggg 10417544  T
Q  587 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatg 686  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  10417545 tctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatg 10417644  T
Q  687 tttggtagaga 697  Q
    |||||||||||    
T  10417645 tttggtagaga 10417655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 471 - 703
Target Start/End: Original strand, 16378318 - 16378550
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  16378318 aatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16378417  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  16378418 gtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgag 16378517  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  16378518 gtgtccaatatctatgtttggtagagattttga 16378550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 471 - 702
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510098
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| |  |    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggg 12510066  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
     |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  12510067 gtgtcttatatctatgtttggtagagattttg 12510098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 417 - 639
Target Start/End: Original strand, 13317864 - 13318086
Alignment:
Q  417 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 516  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317864 aagaaggtcagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 13317963  T
Q  517 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaat 616  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  13317964 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaat 13318063  T
Q  617 ggttgttgaaactccagctaagg 639  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13318064 ggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 565 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 14575637 - 14575499
Alignment:
Q  565 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575637 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 14575538  T
Q  665 tctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14575537 tctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 14575499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 443
Target Start/End: Original strand, 16384342 - 16384728
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  16384342 tctgatttggtaagttgctgtaggatctatgaggaggacagcaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 16384441  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  16384442 agccatacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 16384541  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | |||||| ||||||||    
T  16384542 tggcgagaaagtccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtgg 16384640  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtg 443  Q
     ||  |||| ||||| || |  || || || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16384641 tgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtg 16384728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 486 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262133
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  686 gtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttga 15262133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843717
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
     ||| | | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||| |||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttat 12843712  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  12843713 gtttg 12843717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 15345655 - 15345861
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15345655 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15345754  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15345755 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15345854  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15345855 gtttggt 15345861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16638493 - 16638287
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  | |   ||||    
T  16638493 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 16638394  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16638393 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16638294  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16638293 gtttggt 16638287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 24185910 - 24185704
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  24185910 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24185811  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  24185810 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 24185711  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24185710 gtttggt 24185704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 43165395 - 43165189
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  43165395 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 43165296  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  43165295 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 43165196  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  43165195 gtttggt 43165189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 48428167 - 48427961
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  48428167 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 48428068  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  48428067 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 48427968  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  48427967 gtttggt 48427961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 433 - 658
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013340
Alignment:
Q  433 gtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 532  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||| ||  ||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  533 agatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 632  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||   |||||||||||| ||| | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  633 gctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065585
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15065585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10008320 - 10008114
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10008320 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10008221  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10008220 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10008121  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10008120 gtttggt 10008114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10908930 - 10908724
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10908930 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10908831  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10908830 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10908731  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10908730 gtttggt 10908724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12889429 - 12889223
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12889429 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12889330  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  12889329 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12889230  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  12889229 gtttggt 12889223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13255410 - 13255204
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13255410 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 13255311  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  13255310 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13255211  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  13255210 gtttggt 13255204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15358803 - 15358597
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15358803 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15358704  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15358703 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15358604  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15358603 gtttggt 15358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 15713466 - 15713672
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15713466 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15713565  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15713566 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15713665  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15713666 gtttggt 15713672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 13317500 - 13317840
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||    
T  13317500 atcaagagagccattggatatcagaagatcataaatttctcggagttggtgagcagttgtaggatatatgaggaggatacaaaggctcactataaggcga 13317599  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||| |||   ||    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||||| |||||| |     
T  13317600 tgagcgagaagaggaataagggccagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaatattaaatgatgagaggaggcctag 13317699  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  13317700 ggggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcaaaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgt 13317799  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgggga 358  Q
    ||||  ||||| ||   |||||  ||||| |||||||||||    
T  13317800 ggtcaaaaaggtcatgttttagcggattgcaagcgtgggga 13317840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 341 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 3688808 - 3688457
Alignment:
Q  341 tgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaag 440  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||| ||| |  |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||| |||   |||   ||| | |    
T  3688808 tgattgtaatcgtgcagacattgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggtgccgactactggtagg 3688709  T
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    || |||||||||||| | || ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3688708 gtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 3688609  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3688608 gtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaaggg 3688509  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  3688508 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 3688457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 15586802 - 15587008
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15586802 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15586901  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15586902 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15587001  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15587002 gtttggt 15587008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 14578818 - 14579022
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14578818 atcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14578917  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||     | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  14578918 gtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctat 14579017  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  14579018 gtttg 14579022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 12508496 - 12508758
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  12508496 atcaagagggccattggatatcagaagatctgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgagaaggatacgaaagctcattacaaggcta 12508595  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | | ||| ||| | || || ||||||   ||||| || ||||| || ||||| || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||     
T  12508596 tgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctccggctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaagaggcccat 12508695  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 280  Q
     | ||  ||| ||||||||||  ||||||||| |   ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12508696 aaagaaggatactcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagaaaaaggtcataagagtaa 12508758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 15399927 - 15400133
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15399927 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15400026  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15400027 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15400126  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15400127 gtttggt 15400133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 20059464 - 20059670
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  20059464 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20059563  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20059564 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20059663  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  20059664 gtttggt 20059670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 505 - 658
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874150
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | ||  |||||||| | | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754283
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422546
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggt 5422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 2245610 - 2245712
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2245610 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctttaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 2245709  T
Q  125 gcg 127  Q
    |||    
T  2245710 gcg 2245712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603249
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 6603356  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  6603355 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 6603256  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  6603255 gtttggt 6603249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694678
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 16694685  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16694684 gtttggt 16694678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 26790823 - 26791029
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||  |     ||||    
T  26790823 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgg 26790922  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  26790923 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 26791022  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  26791023 gtttggt 26791029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 53382428 - 53382634
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  53382428 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 53382527  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  53382528 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 53382627  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  53382628 gtttggt 53382634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804529
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 16804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 423
Target Start/End: Original strand, 2037017 - 2037248
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  2037017 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 2037116  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtca 391  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | |||||||||||    
T  2037117 gtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtca 2037216  T
Q  392 tatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    | | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  2037217 tcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2037248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 423
Target Start/End: Original strand, 2040758 - 2040989
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  2040758 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 2040857  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtca 391  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | |||||||||||    
T  2040858 gtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtca 2040957  T
Q  392 tatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    | | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  2040958 tcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2040989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14039770 - 14039539
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  14039770 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 14039671  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtca 391  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | |||||||||||    
T  14039670 gtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtca 14039571  T
Q  392 tatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    | | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  14039570 tcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 14039539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 286
Target Start/End: Original strand, 15008684 - 15008783
Alignment:
Q  187 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 286  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15008684 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagagaggccacaagagtaatgtttg 15008783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 12843045 - 12843314
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |      
T  12843045 atcaagcgggcaattggttaccagaagattcgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattg 12843144  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | || ||| || || |||||||||   ||||  |||||||| |||||||| || || || || ||| ||| |||||||| | |||| |     
T  12843145 tgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagctttatagtgctcctgctgataagggcaaacagagaatgattgatgagaggcggcctag 12843244  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    || || ||||||||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12843245 gaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 12843314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 578 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492367
Alignment:
Q  578 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtcta 677  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||      
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtccc 17492380  T
Q  678 ttgtctatgtttg 690  Q
    |||| ||||||||    
T  17492379 ttgtttatgtttg 17492367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 287
Target Start/End: Original strand, 16803952 - 16804158
Alignment:
Q  81 atttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgaca 180  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  16803952 atttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgata 16804051  T
Q  181 acggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 280  Q
    | || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  16804052 agggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 16804151  T
Q  281 tgtttgt 287  Q
    |||||||    
T  16804152 tgtttgt 16804158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3689068 - 3688959
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  3689068 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 3688969  T
Q  178 acaacggtaa 187  Q
    |||| |||||    
T  3688968 acaagggtaa 3688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 547  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15262806 - 15262549
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||||||  |||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  15262806 attggttactagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 15262707  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
     |||||| |  ||||| ||||||   ||||| || |  || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| |||||  |  |||| ||||||    
T  15262706 aaggcaaagatcaacaaagtcgtccaaagccttacaacgctcctgctgataagggtaaacaaagaatgaatgatgagaggaggcgtagaaggaaagatgc 15262607  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  15262606 tcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggctataagagtaatgcttgt 15262549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10008725 - 10008625
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10008725 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10008626  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  10008625 a 10008625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10909335 - 10909235
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10909335 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10909236  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  10909235 a 10909235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 15713061 - 15713161
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  15713061 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 15713160  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  15713161 a 15713161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 574
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079515
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 574  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgc 23079515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6603863 - 6603757
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  6603863 tgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 6603764  T
Q  175 ctgacaa 181  Q
    |||||||    
T  6603763 ctgacaa 6603757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 23079166 - 23079228
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23079166 gatgctcctgctgtgattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 23079228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 10416994 - 10417079
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 121  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10416994 tatcagaagatcagaattttctcagaactggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 10417079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6597180 - 6597077
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  6597180 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 6597081  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  6597080 acaa 6597077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11861403 - 11861272
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |    
T  11861403 aagccctatagtgcccctgctgataaaggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctatttcaatt 11861304  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11861303 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11861272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13255815 - 13255712
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  13255815 aggatctacgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 13255716  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  13255715 acaa 13255712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 14578363 - 14578458
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||  |  |||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  14578363 atcaagagagcaattggttaccagaagatccgtgacttttctaagctggtgagcagttgcaggatttatgaggatgataccaaggctcattacaag 14578458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16638898 - 16638795
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16638898 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16638799  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  16638798 acaa 16638795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 23414870 - 23415001
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  23414870 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaact 23414969  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23414970 atggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23415001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43165800 - 43165697
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  43165800 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 43165701  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  43165700 acaa 43165697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15066052 - 15065990
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15066052 gatgctcctgctgcgattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15065990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Original strand, 23079012 - 23079054
Alignment:
Q  71 cagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23079012 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 23079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944071
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 15944071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150213
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 533; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 12798194 - 12798885
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12798194 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtga 12798293  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  12798294 tgagtgagcgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggctcaa 12798393  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798394 gaggagagatgctcatactgatattgtttgtttcaagtgtgg---aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 12798490  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12798491 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagccta 12798590  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798591 agaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 12798690  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12798691 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatg 12798790  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12798791 gttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 12798885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 19150570 - 19149876
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19150570 atcaaaagggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 19150471  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  19150470 tgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaa 19150371  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19150370 gaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgt 19150271  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  19150270 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaaccta 19150171  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| ||||| |||||| || || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150170 agaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 19150071  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19150070 tttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatg 19149971  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19149970 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatct 19149876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20749969 - 20749275
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20749969 atcaaaagggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 20749870  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  20749869 tgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaa 20749770  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20749769 gaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgt 20749670  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  20749669 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaaccta 20749570  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| ||||| |||||| || || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749569 agaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 20749470  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20749469 tttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatg 20749370  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20749369 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatct 20749275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 703
Target Start/End: Original strand, 15099365 - 15099978
Alignment:
Q  90 gaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagc 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15099365 gaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgacgccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagc 15099464  T
Q  190 atagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtga 289  Q
    | || || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15099465 agaggttaaatgatgggaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtga 15099564  T
Q  290 ccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggt 389  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||    
T  15099565 tagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggt 15099664  T
Q  390 catatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatca 489  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  15099665 catatcagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatca 15099764  T
Q  490 gaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtct 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099765 gatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtct 15099864  T
Q  590 ggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgttt 689  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15099865 agttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgttt 15099964  T
Q  690 ggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||    
T  15099965 ggtagagactttga 15099978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 697
Target Start/End: Original strand, 14260936 - 14261615
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14260936 atcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 14261035  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    | |||||||| | ||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  14261036 tcagtgagcgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagtagagactgaatgatgagaggaggcctaa 14261135  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14261136 ggggagatatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgcgtcatcgagatgagaagaagtactttaggtgt 14261235  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
     ||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  14261236 agtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtttatgcagccta 14261335  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14261336 agaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcc 14261435  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14261436 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatg 14261535  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14261536 gttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 14261615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 702
Target Start/End: Original strand, 16947174 - 16947846
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16947174 attgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaa 16947273  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    | || |||||||| |||||||||   || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16947274 ggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 16947373  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    |||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||    
T  16947374 tccagttgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaagga 16947473  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||| ||| |    
T  16947474 cacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaa 16947573  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    | ||||| || |||||||| |||| | |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16947574 ccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctat 16947673  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947674 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 16947773  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16947774 ccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 16947846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13677007 - 13676325
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13677007 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaagg 13676908  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||| ||      ||||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||    
T  13676907 tgatgtgt------agaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcc 13676814  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  13676813 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtacttcagg 13676714  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||| | || |    
T  13676713 tgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaac 13676614  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676613 cgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 13676514  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676513 tcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 13676414  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13676413 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 13676325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 13024903 - 13024228
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  13024903 atcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtga 13024804  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | || || ||||||||  ||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | |||||||||    
T  13024803 tgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaa 13024704  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||   || |||||| ||| || |||||||||    
T  13024703 gaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttatggtagatatgagaggaaatgtttcaggtgt 13024604  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  13024603 ggttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccga 13024504  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13024503 agaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-actcc 13024405  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13024404 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatg 13024305  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtag 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||  |||||||||||||||||    
T  13024304 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtag 13024228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 12460187 - 12459503
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  12460187 atcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtga 12460088  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  12460087 tgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaa 12459988  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || ||||||    
T  12459987 gaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgt 12459888  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |    
T  12459887 ggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccga 12459788  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||| ||||| || || || |||||||  ||||   |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459787 agaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 12459688  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12459687 tttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 12459588  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  12459587 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttg 12459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 11385119 - 11385804
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||    
T  11385119 atcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatga 11385218  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  ||||||||    
T  11385219 tgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaa 11385318  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  11385319 gaggagagatgctcctgctgagatagtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 11385418  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  |||| || || || |    
T  11385419 ggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcaaccaa 11385518  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385519 agaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 11385618  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  11385619 tttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatg 11385718  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  11385719 gttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 11385804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 57 - 703
Target Start/End: Original strand, 14283103 - 14283749
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||    |||||||| ||||||||   ||    
T  14283103 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccga 14283202  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  14283203 agccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagactcaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtg 14283302  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14283303 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtgg 14283401  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     ||  |||| || || |||| |||||| || |||||||||||  |  ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  14283402 tgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgact 14283501  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14283502 ggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtt 14283601  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14283602 tcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttc 14283701  T
Q  656 tcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  14283702 tcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 14283749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 26091485 - 26092172
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  26091485 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 26091584  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  26091585 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 26091684  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  26091685 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 26091784  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  26091785 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 26091884  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091885 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 26091984  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  26091985 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 26092084  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  26092085 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 26092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21755974 - 21755292
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||     
T  21755974 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacatcaaagctcattacaaga 21755875  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | ||||||    
T  21755874 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaatatgagtgatgacatgaggcc 21755775  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||    
T  21755774 taagaggagagatgctccctctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcagg 21755675  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| || ||  ||||| |  |||    
T  21755674 tgtggtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagctcacagtgtcctgagc 21755575  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755574 cgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 21755475  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  21755474 tcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaa 21755375  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||    
T  21755374 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21755292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 26115277 - 26115964
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  26115277 gacatcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 26115376  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | ||||||    
T  26115377 taatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcc 26115476  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  26115477 caagaggagagatgctccggctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 26115576  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| ||| |  ||||| |  | |    
T  26115577 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaac 26115676  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26115677 cgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtac 26115776  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  26115777 tcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 26115876  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  26115877 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 26115964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 49155863 - 49155176
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| || || |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  49155863 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttagttaatagatgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 49155764  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||  ||| || | ||||||    
T  49155763 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgaggataggaggcc 49155664  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  49155663 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 49155564  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  49155563 tgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 49155464  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49155463 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 49155364  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||    
T  49155363 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaa 49155264  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  49155263 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttg 49155176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Original strand, 40924504 - 40925156
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| | |  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  40924504 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcaaagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 40924603  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  40924604 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 40924703  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  40924704 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 40924803  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  40924804 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 40924903  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40924904 cgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 40925003  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||    
T  40925004 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaa 40925103  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40925104 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 40925156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 702
Target Start/End: Original strand, 13965354 - 13966042
Alignment:
Q  14 ggacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||    
T  13965354 ggacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgttggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccag 13965453  T
Q  114 gtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggc 213  Q
     | ||||||||| | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | |||||    
T  13965454 ataatgagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggc 13965553  T
Q  214 ccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| |  || ||||||||    
T  13965554 ccaagaggagagatgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgatagaaaatgcttcag 13965653  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||| || |||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  ||    
T  13965654 gtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgag 13965753  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965754 ccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 13965853  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  13965854 ctcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggga 13965953  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  13965954 aatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 13966042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Original strand, 12203497 - 12204175
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  12203497 gggccattggttatcagaagatcaaacaattttctgagttagtgagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagttcattataaggttatgagtga 12203596  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    |   ||   ||  || || ||  |||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  12203597 gaagaggaacagaggccagcaaggtcgtcctaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 12203696  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| |||| |||  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  12203697 gatgttcctgctgtgattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaaga 12203796  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||  || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | ||||||||||||     
T  12203797 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtgatgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggc 12203896  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||  |  | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12203897 tcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaatt 12203996  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  ||||||||||||||||    
T  12203997 gctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttg 12204096  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12204097 aaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 12204175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 75 - 703
Target Start/End: Original strand, 18050700 - 18051328
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||| ||      
T  18050700 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgctccga 18050799  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  18050800 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 18050899  T
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 373  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| || || ||    
T  18050900 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgttataa 18050998  T
Q  374 cttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 473  Q
     |  || || || ||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  18050999 ttgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 18051098  T
Q  474 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||    
T  18051099 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtg 18051198  T
Q  574 catataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttg 673  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | || ||    
T  18051199 catataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtg 18051298  T
Q  674 tctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || | | ||||||||||||||||| |||||    
T  18051299 tccaatttctatgtttggtagagattttga 18051328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 411 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 14140845 - 14140553
Alignment:
Q  411 cagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaata 510  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140845 cagccgaagaaggttagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaata 14140746  T
Q  511 gtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagg 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  14140745 gtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaaggg 14140646  T
Q  611 agaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  14140645 agaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 14140553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15343567 - 15343305
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15343567 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15343468  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343467 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15343368  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |  |||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  15343367 taaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 15343305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14145165 - 14144917
Alignment:
Q  73 gttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 172  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  14145165 gttgcaggatctatgaggagggcaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 14145066  T
Q  173 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 272  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  14145065 tgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccatataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtatggcgagaaaggccac 14144966  T
Q  273 aagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 321  Q
    |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  14144965 aagagtaacgtttgt-accaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtc 14144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15628070 - 15627397
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||| |||||||||||   |||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |    
T  15628070 attggatatcagaagatccaaaaaatttctgaattggtaagtagttgccggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagagga 15627971  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
     | | ||| | ||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||| |  | || |||| |    
T  15627970 aaagtaagagtcaacaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgagaagaggcctagaaagaaagatac 15627871  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    |||| ||||  ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||    | |||| |||  |||| |||   ||||||  ||||||     
T  15627870 tcctgctgaagttgtttgctacaactgtggtgagaaaggccacaagagtaacgcttgtacttgggatgtgaaacagtgtttccattgtggtaagaaaggg 15627771  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    || ||| |    || || |||| ||  ||  | || || | ||||| ||| || || ||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||| |   |    
T  15627770 catactattacagaatgcaagcatgatgatgtggtgtgtttcaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcagtgaaagtagcctaagaaggctcaaa 15627671  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    |  |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15627670 ctagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactat 15627571  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||| | | | ||   |||||| |  ||||||||| | ||||||    
T  15627570 tattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaact 15627471  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||| |||   ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15627470 ccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttga 15627397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 512
Target Start/End: Original strand, 12712353 - 12712847
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   ||| ||| ||| |||| || || || || ||||| || ||| | || ||||||| ||||||||    
T  12712353 atcaagagggccattggctatcagaagattagaactctttatgagttgataagtagctgcagaatctatgaggaagattcaaaggctcattccaaggtga 12712452  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||  || || |||||  || ||||||||||||  || |||||    
T  12712453 tgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaa 12712552  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    | | |||||  |||||  ||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12712553 gggaagagacactcctgttgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 12712652  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||| || |||   |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||||| |||  |||| || || |  |    
T  12712653 ggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatggggagggtcatatcaattctcagtgcactcaacgga 12712752  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 512  Q
    |||||||||||||  | || || |||||||| ||| |  |||||||| |    ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712753 agaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 11550282 - 11550488
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |   ||||    
T  11550282 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgg 11550381  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  11550382 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 11550481  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  11550482 gtttggt 11550488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957438
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14957445  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  14957444 gtttggt 14957438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 488 - 658
Target Start/End: Original strand, 15146105 - 15146275
Alignment:
Q  488 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggt 587  Q
    ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  15146105 cagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggt 15146204  T
Q  588 ctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    || | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15146205 cttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 44788531 - 44788737
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  44788531 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 44788630  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  44788631 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44788730  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  44788731 gtttggt 44788737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8710695 - 8710489
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8710695 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8710596  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  8710595 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8710496  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  8710495 gtttggt 8710489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13689131 - 13688925
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13689131 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgg 13689032  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  13689031 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13688932  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  13688931 gtttggt 13688925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14335486 - 14335280
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14335486 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14335387  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  14335386 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14335287  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  14335286 gtttggt 14335280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13005024 - 13004783
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |   ||||||| ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  13005024 atcaagagggccattggttatcagaagatcaggattctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtga 13004925  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||  || |||||    
T  13004924 tgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggcaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaa 13004825  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 259  Q
    | | |||||  ||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  13004824 gggaagagacactcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 13004783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042581
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14042586  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  14042585 gtttg 14042581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352611
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14352616  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  14352615 gtttg 14352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 11234393 - 11234599
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  11234393 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 11234492  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11234493 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11234592  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  11234593 gtttggt 11234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18180833 - 18180627
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18180833 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18180734  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18180733 gtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18180634  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  18180633 gtttggt 18180627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 18587351 - 18587557
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18587351 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18587450  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18587451 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18587550  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  18587551 gtttggt 18587557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 15158237 - 15158443
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15158237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15158336  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15158337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15158436  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  15158437 gtttggt 15158443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703841
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17703834  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17703835 gtttggt 17703841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591248
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 9591255  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  9591254 gtttggt 9591248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12690591 - 12690386
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12690591 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12690493  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  12690492 gtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 12690393  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  12690392 gtttggt 12690386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 582 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8201042 - 8200932
Alignment:
Q  582 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 681  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||    
T  8201042 ttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 8200943  T
Q  682 ctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||    
T  8200942 ctatgtttggt 8200932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Original strand, 17703224 - 17703436
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || ||||||||||||     
T  17703224 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgccccta 17703323  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  17703324 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 17703423  T
Q  275 gagtaatgtttgt 287  Q
    |||||||||||||    
T  17703424 gagtaatgtttgt 17703436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14043253 - 14043084
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |      
T  14043253 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattg 14043154  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 187  Q
    ||| |||||| | || ||| || ||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14043153 tgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggtaa 14043084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14353283 - 14353114
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |      
T  14353283 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattg 14353184  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 187  Q
    ||| |||||| | || ||| || ||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14353183 tgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggtaa 14353114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 15157832 - 15157932
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  15157832 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 15157931  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  15157932 a 15157932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Original strand, 16726210 - 16726422
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || || |||||||||     
T  16726210 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttaaagtgccccta 16726309  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16726310 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 16726409  T
Q  275 gagtaatgtttgt 287  Q
    |||||||||||||    
T  16726410 gagtaatgtttgt 16726422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11984510 - 11984281
Alignment:
Q  58 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaa 157  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||    
T  11984510 ctgatttggttaacagttgtaggatctacgaagaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 11984411  T
Q  158 gccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgt 257  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| |   |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||    
T  11984410 gccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgt 11984311  T
Q  258 ggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11984310 ggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11984281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873574
Alignment:
Q  604 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 10873574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13689536 - 13689436
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| |||    
T  13689536 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactg 13689437  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  13689436 a 13689436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 516 - 575
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38415
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgca 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtgca 38415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9591784 - 9591653
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  9591784 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 9591685  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  9591684 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 9591653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 573
Target Start/End: Original strand, 16726621 - 16726708
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||    
T  16726621 atcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtg 16726708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 11233988 - 11234088
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  11233988 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 11234087  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  11234088 a 11234088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18181238 - 18181138
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| ||||    
T  18181238 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcttcctaagccgtacagtgcccccgctg 18181139  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  18181138 a 18181138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 703
Target Start/End: Original strand, 14993088 - 14993755
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993088 tatcagaagataagaaacttttctgatttggtaagtagttgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 14993187  T
Q  136 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 235  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14993188 agggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctac 14993287  T
Q  236 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14993288 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 14993387  T
Q  336 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 435  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14993388 ttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtg 14993487  T
Q  436 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 535  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993488 gcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 14993587  T
Q  536 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 635  Q
    |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993588 tactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 14993687  T
Q  636 aagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14993688 aagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggaggctttga 14993755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 15267348 - 15266736
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15267348 gacatcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttgataagtagctgcaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 15267249  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  15267248 tgatgagtgaacgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 15267149  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15267148 caagaggagagatgctcctacgaatattgtttgcttcaagtgtgatgagaagggccataagagtaatgtttgtgacagagatgagaagaagtgcttcagg 15267049  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267048 tgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 15266949  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||   | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15266948 cgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagtac 15266849  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266848 tcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 15266749  T
Q  615 atggttgttgaaa 627  Q
    |||||||||||||    
T  15266748 atggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15073921 - 15073243
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    ||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15073921 gggctatcggctaccaaaagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 15073822  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  15073821 gcgtagaggtaagggacagctgagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 15073722  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  15073721 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaaga 15073622  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| | | ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||  |||| | | ||||||||||||     
T  15073621 aaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggc 15073522  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15073521 tctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaatt 15073422  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15073421 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttg 15073322  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15073321 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttga 15073243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20893597 - 20892953
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||| | ||||    
T  20893597 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggtaaacagttgcaggatttacaaagaagacaccaaagctcattacaagataatga 20893498  T
Q  121 gtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagag 220  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||    
T  20893497 gtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagag 20893398  T
Q  221 gagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggt 320  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20893397 gagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggt 20893298  T
Q  321 cggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaaga 420  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || || || |||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  20893297 cagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatcagttcgcagtgtactgagccgaaga 20893198  T
Q  421 aggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 520  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893197 aggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 20893098  T
Q  521 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893097 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 20892998  T
Q  621 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20892997 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20892953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 16151208 - 16150527
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16151208 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaagg 16151109  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  16151108 tgatgagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcc 16151009  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  16151008 caagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagg 16150909  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| || ||| | || | | | |    
T  16150908 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaac 16150809  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca-atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||| | | || | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16150808 cgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagta 16150710  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  16150709 ctcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaagggga 16150610  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16150609 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 16155354 - 16154673
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16155354 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaagg 16155255  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  16155254 tgatgagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcc 16155155  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  16155154 caagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagg 16155055  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| || ||| | || | | | |    
T  16155054 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaaac 16154955  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca-atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||| | | || | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16154954 cgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagta 16154856  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  16154855 ctcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaagggga 16154756  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16154755 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 3261494 - 3262181
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  3261494 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 3261593  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  3261594 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 3261693  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  3261694 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 3261793  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  3261794 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 3261893  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3261894 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 3261993  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  3261994 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 3262093  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  3262094 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 3262181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 29450237 - 29450924
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| |  || || |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||     
T  29450237 gacatcaaaagggctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataaga 29450336  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  29450337 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 29450436  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| ||||||    
T  29450437 taagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgataggaagtgtttcagg 29450536  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||  ||||| |  |||    
T  29450537 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttcacagtgtcctgagc 29450636  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450637 cgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 29450736  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  29450737 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 29450836  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  29450837 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 29450924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 44658566 - 44659253
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  44658566 gacatcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 44658665  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |   ||  | |||| | ||||||    
T  44658666 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagatgggtcatgataggaggcc 44658765  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  44658766 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 44658865  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  ||| ||||||| |||||  ||||| |  | |    
T  44658866 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttcacagtgtcctgaac 44658965  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658966 cgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 44659065  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  44659066 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 44659165  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  44659166 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 44659253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Original strand, 11203932 - 11204584
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  11203932 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 11204031  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |   |||||||||| | ||| ||    
T  11204032 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagatgaatgatgataggagacc 11204131  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||    
T  11204132 caagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcagg 11204231  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| | ||| | | || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  11204232 tgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 11204331  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | || |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204332 cgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 11204431  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  11204432 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaa 11204531  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11204532 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 11204584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18260010 - 18259629
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  18260010 atcaagagggctattggttactagaaaataagaaacttctctgatttagtaagtagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtga 18259911  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  18259910 tgagtgagcgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaa 18259811  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18259810 gaggacagatgctcctactaatattgtttgctttaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 18259711  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagtt 399  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18259710 ggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagtt 18259629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 27903936 - 27903269
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 135  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   ||    |    
T  27903936 tatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtaagatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaagaggaata 27903837  T
Q  136 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 235  Q
    |||| ||    |||||   |||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||      
T  27903836 agggccagagtagtcgcccgaagccctacaatgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgctcctgt 27903737  T
Q  236 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 335  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||        
T  27903736 tgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaaggtcatgtg 27903637  T
Q  336 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 435  Q
    || | ||| || |||||||| || |||||||| || ||||  || ||||| ||  | || |||||  |||| ||||| ||||||||||| || ||  | |    
T  27903636 ttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggcaacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgag 27903537  T
Q  436 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 535  Q
    | || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27903536 gaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 27903437  T
Q  536 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 635  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27903436 cactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagcc 27903337  T
Q  636 aagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  27903336 aagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 27903269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 7357839 - 7357280
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||     
T  7357839 gacatcaaaagagctattgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaaga 7357740  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  7357739 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 7357640  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||||| |||||||||||||    
T  7357639 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgagaggaagtgcttcagg 7357540  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  7357539 tgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagc 7357440  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7357439 cgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 7357340  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 574  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  7357339 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 75 - 703
Target Start/End: Original strand, 51603552 - 51604180
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  51603552 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 51603651  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  51603652 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 51603751  T
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 373  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  51603752 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtgtgctataa 51603850  T
Q  374 cttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 473  Q
     |  || || || || || |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  51603851 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 51603950  T
Q  474 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  51603951 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtg 51604050  T
Q  574 catataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttg 673  Q
    | |||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  51604051 cttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtg 51604150  T
Q  674 tctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || | | ||||||||||||||||| |||||    
T  51604151 tccaatttctatgtttggtagagattttga 51604180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 660
Target Start/End: Original strand, 53750230 - 53750815
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  53750230 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 53750329  T
Q  175 ctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 274  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  53750330 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 53750429  T
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaa 373  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  53750430 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataa 53750528  T
Q  374 cttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaat 473  Q
     |  || || || || || |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| |||| ||  | |  |||    
T  53750529 ttgtaatgaagagggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaat 53750628  T
Q  474 gaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  53750629 gaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtg 53750728  T
Q  574 catataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 660  Q
    | |||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53750729 cttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 565 - 701
Target Start/End: Original strand, 15354290 - 15354426
Alignment:
Q  565 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 664  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15354290 ttgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttg 15354389  T
Q  665 tctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 701  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15354390 tctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagacttt 15354426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 14697247 - 14696985
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14697247 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 14697148  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14697147 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 14697048  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14697047 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttga 14696985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8709239 - 8708953
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8709239 gggccattggttatcagaagattaggcaattttttgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggatatcaaagctcattacaaggttatgagtga 8709140  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||   ||| || || ||  |||||  |||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| | |    
T  8709139 gcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagctctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaata 8709040  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||||||||    
T  8709039 gatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgaaaagaagtgcttc 8708953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 486 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 14162571 - 14162370
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14162571 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttgg 14162472  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
     ||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  14162471 atcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctat 14162372  T
Q  686 gt 687  Q
    ||    
T  14162371 gt 14162370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16150
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 16145  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  16146 gtttg 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13879642 - 13879413
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  13879642 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 13879543  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  13879542 cgaagccctacagtgctcctgatgacaaagggtagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgtttctactgagattgtttgttacaa 13879443  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 283  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13879442 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgt 13879413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683462
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14683569  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  14683568 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14683469  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  14683468 gtttggt 14683462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 17092060 - 17092266
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17092060 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 17092159  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17092160 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17092259  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17092260 gtttggt 17092266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12479701 - 12479495
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12479701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12479602  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  12479601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12479502  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  12479501 gtttggt 12479495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234109
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16234102  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16234103 gtttggt 16234109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958642
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 23958649  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  23958648 gtttggt 23958642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27714437 - 27714231
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27714437 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27714338  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  27714337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctat 27714238  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27714237 gtttggt 27714231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 8050534 - 8050706
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8050534 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8050633  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8050634 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 14300890 - 14301062
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14300890 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14300989  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14300990 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635065
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19635138  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19635137 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8389513 - 8389307
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8389513 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8389414  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  8389413 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8389314  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  8389313 gtttggt 8389307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350671
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 16350664  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    || ||||    
T  16350665 gtctggt 16350671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 512 - 692
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15145009
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | |||||||| | ||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15145009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775876
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 623 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258812
Alignment:
Q  623 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 15258812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224563
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  |||||||||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggt 18224563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 40476141 - 40475935
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  40476141 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40476042  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  40476041 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40475942  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  40475941 gtttggt 40475935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 16250780 - 16250967
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  16250780 ttaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 16250879  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  |||||||||||||||    
T  16250880 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggt 16250967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 486 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513285
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 652  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14697599 - 14697401
Alignment:
Q  89 agaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaag 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||||||    
T  14697599 agaggataccaaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaag 14697500  T
Q  189 catagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14697499 caaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctactgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 14697401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 473 - 530
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  473 tgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 530  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219186
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  586 gtct 589  Q
    ||||    
T  16219189 gtct 16219186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222506
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  586 gtct 589  Q
    ||||    
T  16222509 gtct 16222506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14163039 - 14162942
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  14163039 atcaagagggcaattggttaccagaagatccgaaatttttcagagctggtgagcagttgcaggatttatgaaaaggatactaaggctcactacaaggt 14162942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 14300485 - 14300585
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  14300485 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 14300584  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  14300585 a 14300585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13513781 - 13513650
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  13513781 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 13513682  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  13513681 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 13513650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219125
Alignment:
Q  633 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16219125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 633 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222445
Alignment:
Q  633 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16222445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8570 - 8336
Alignment:
Q  53 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 152  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  8570 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 8471  T
Q  153 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 252  Q
       ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  8470 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctataaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 8371  T
Q  253 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8370 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 18224123 - 18224185
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18224123 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagtgtaatgtttgt 18224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Original strand, 18604302 - 18604531
Alignment:
Q  58 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  | | |||| | | || | ||||| || ||||||||    |    
T  18604302 ctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaaggttgttaatgagagga-agactaagggccagcagagtcgcccta 18604400  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    |||| |||| |||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || ||    
T  18604401 agccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaactg 18604500  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18604501 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18604531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19635648 - 19635542
Alignment:
Q  72 agttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgccc 171  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||| ||   |||||||| |||||||    
T  19635648 agttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagccgtacagtgccc 19635549  T
Q  172 ctgctga 178  Q
    | |||||    
T  19635548 ccgctga 19635542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 573
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546877
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtg 18546877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14188515 - 14188435
Alignment:
Q  578 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||||||||||| | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14188515 taagttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctct 14188435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 553
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 553  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 16248326 - 16248388
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||||||| ||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16248326 gatgctccaactgagattacatgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 16248388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290395
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 15290395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 63245 - 63919
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63245 atcaagagggctattggttatgagaagataagaaacttttctgaattggtaagtagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 63344  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||                    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  63345 tgagtgagcgtagaggcaaggtacagcagagtc--------------------cctgctgacaagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaa 63424  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63425 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgataaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgt 63524  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63525 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccta 63624  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  63625 agaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactct 63724  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63725 tttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 63824  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  63825 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 63919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 5778 - 5085
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5778 atcaagagggctattggttatcagaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctacaagatttatgaagaggataccaaagctcattacaaagtga 5679  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  5678 tgagtgagcatagagtcaagggacagcagagtcatcggaagccgtacagtgcccctactgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc-aa 5580  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5579 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 5480  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5479 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccta 5380  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5379 agaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 5280  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5279 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatg 5180  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5179 gttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaagtcgatct 5085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 22015520 - 22016205
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22015520 atcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtga 22015619  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||| |||||| ||    
T  22015620 tgagtgagcgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagaataaatgatgagaggaggccaaa 22015719  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22015720 gaagagagatgctcctacaaatattgtttgattcaagtgtggagaaaaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 22015819  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |    
T  22015820 ggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatattagtttgcagtgtacgcagccga 22015919  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22015920 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 22016019  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016020 tttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 22016119  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22016120 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 22016205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 21738811 - 21739505
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21738811 atcaagagggctattggctatcaaaaggtaaggaatttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 21738910  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  21738911 tgagtgaccgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagcgcccatgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaa 21739010  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21739011 gaggagaggtgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 21739110  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21739111 ggtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacggagccta 21739210  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739211 agaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 21739310  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21739311 tttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatg 21739410  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21739411 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 21739505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 21742327 - 21743021
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742327 atcaagagggctattggttatgagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 21742426  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  21742427 tgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctactgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaa 21742526  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21742527 gaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgt 21742626  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21742627 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagccta 21742726  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21742727 agaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 21742826  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21742827 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatg 21742926  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21742927 gttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 21743021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19857892 - 19857204
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19857892 gacatcaagagagccattggctatcagaagattagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaagatctatgaagaggatactaaggctcattacaagg 19857793  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  19857792 tgatgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcc 19857693  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  19857692 taagaggagagatgcttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaaatgcttcagg 19857593  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |    
T  19857592 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaac 19857493  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||| |||  |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857492 cgaagaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtac 19857393  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857392 tcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaa 19857293  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857292 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 19857204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 24096390 - 24097074
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  24096390 atcaaaagagctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtga 24096489  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  24096490 cgagtgagcgaagaagtaagggacaacagagtcgtcctaaaccttatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaa 24096589  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| || ||||||    
T  24096590 gaggagagatgctcctgttgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgt 24096689  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  24096690 ggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagccga 24096789  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24096790 agaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcc 24096889  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24096890 tttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatg 24096989  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24096990 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 24097074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 20832673 - 20833360
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20832673 gacatcaagagggctattggataccagaaaattagaaacttttcgaagttggtgagcagctgtagaatctatgaataagatacgaaagctcattacaagg 20832772  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   || |  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  20832773 tgatgagtgaccgtagaggcaagggacagcagagtcgtcctaaaca-tatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacc 20832871  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| || ||||||    
T  20832872 caagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaattgtttcagg 20832971  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20832972 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaac 20833071  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | | |||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20833072 cgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattat 20833171  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20833172 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaa 20833271  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20833272 atggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 38909598 - 38910285
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  38909598 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 38909697  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||| | | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||    
T  38909698 taatgagtgggaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 38909797  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  38909798 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 38909897  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  38909898 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 38909997  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38909998 cgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 38910097  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||    
T  38910098 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaa 38910197  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  38910198 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 38910285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 48426491 - 48425804
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  48426491 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 48426392  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  48426391 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 48426292  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  48426291 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 48426192  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  48426191 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 48426092  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426091 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 48425992  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  48425991 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 48425892  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  48425891 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 48425804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 52989358 - 52988672
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||      
T  52989358 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaa- 52989260  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| || | ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||||||    
T  52989259 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcc 52989160  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||    
T  52989159 taagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcagg 52989060  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  | ||| |  | |    
T  52989059 tgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacaatgtcctgaac 52988960  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988959 cgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 52988860  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  52988859 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 52988760  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  52988759 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 52988672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 31536769 - 31537456
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  31536769 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 31536868  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | ||| ||    
T  31536869 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgaatgatgataggagacc 31536968  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||    
T  31536969 caagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcagg 31537068  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| ||||| |||||  ||||| |  |||    
T  31537069 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagtgtcctgagc 31537168  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31537169 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 31537268  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  31537269 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaa 31537368  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  31537369 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 31537456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 660
Target Start/End: Original strand, 20074481 - 20075126
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| ||| || |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  20074481 gacatcaaaagagctattgggtattagcagatcagattcttctctgagttggttaacatgtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 20074580  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || |||||  |||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | |||||     
T  20074581 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggct 20074680  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     |||||||| |||||||||||||    
T  20074681 taagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtagtaaagatgagaggaagtgcttcagg 20074780  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || ||||  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||| |||| ||||| |  |||    
T  20074781 tgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcaattcgcagtgtcctgagc 20074880  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074881 cgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 20074980  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20074981 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 20075080  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075081 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 37680667 - 37679980
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| | ||| ||||| |  || || || || |||||||| || || |||||||||||||||     
T  37680667 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctttgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 37680568  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  37680567 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 37680468  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  37680467 caagaggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 37680368  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  37680367 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagc 37680268  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680267 cgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 37680168  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||    
T  37680167 tcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaa 37680068  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  37680067 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 37679980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 54 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20297962 - 20297347
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||     
T  20297962 ttttctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtc 20297863  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
      ||||| || ||||| ||| ||||||| || || || |   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  20297862 ctaagccttacagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaa 20297763  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 353  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||   ||| ||| || ||||||    
T  20297762 gtgtggtgagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgt 20297663  T
Q  354 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttga 453  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |||||| |  || | ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  20297662 ggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttga 20297563  T
Q  454 -ctcgtacgcaatcagtg--aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 550  Q
     || ||    |  || |   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297562 gctggttattac-cactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactca 20297464  T
Q  551 ttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 650  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297463 ttgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 20297364  T
Q  651 acttctcttgtttgtct 667  Q
    |||||||||||||||||    
T  20297363 acttctcttgtttgtct 20297347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21961631 - 21961135
Alignment:
Q  29 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 128  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21961631 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgaattggtaaacagatgcataatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 21961532  T
Q  129 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 228  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21961531 agaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatg 21961432  T
Q  229 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 328  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21961431 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 21961332  T
Q  329 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 428  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||     
T  21961331 acacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttaga 21961232  T
Q  429 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 525  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961231 actggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 432 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710315
Alignment:
Q  432 ggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 531  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  532 tagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 631  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactcc 18710387  T
Q  632 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18710386 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 18710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 20853532 - 20854220
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  20853532 gacatcaagagagccattggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataagg 20853631  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||| |||   ||    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||| || |||| || || || |||||||||||||||| |  |||    
T  20853632 tgatgagcgagaaaaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcc 20853731  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||     
T  20853732 taaggggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcaga 20853831  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    || |||| ||| || || |  || | ||| || |||||||| || || ||||| |  || |    ||| || || || || || ||| |||| ||||| |    
T  20853832 tgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacattagctcgcagtgcacgcaac 20853931  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    |||||||||| || ||  | || ||||| || ||||||||| |||| ||  |    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20853932 ctaagaaggtcagaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 20854031  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20854032 tcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaa 20854131  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20854132 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 20854220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 441 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16379255 - 16379004
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||  |  | ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16379255 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattg 16379156  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||  | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16379155 gtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 16379056  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16379055 ttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16379004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18273346 - 18273114
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  18273346 ttttctgaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 18273247  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  18273246 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgttacaa 18273147  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 286  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18273146 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 18273114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 486 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 661  Q
    |||| | | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496705
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgg 22496598  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22496599 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22496698  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22496699 gtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 444 - 692
Target Start/End: Original strand, 24785058 - 24785306
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  24785058 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtg 24785157  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24785158 ctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttc 24785257  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  24785258 ggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 24785306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 16347838 - 16348044
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16347838 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16347937  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16347938 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16348037  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16348038 gtttggt 16348044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081825
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20081818  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  20081819 gtttggt 20081825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 51330735 - 51330941
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  51330735 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 51330834  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  51330835 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 51330934  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  51330935 gtttggt 51330941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388478
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 33388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 595 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200449
Alignment:
Q  595 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtag 694  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  695 agactttg 702  Q
    ||| ||||    
T  12200456 agattttg 12200449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042464
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    | || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17042457  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17042458 gtttggt 17042464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 21833418 - 21833246
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  | |   ||||    
T  21833418 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgg 21833319  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21833318 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 444 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21842370 - 21842122
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21842370 tttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 21842271  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   || ||||| | | | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21842270 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttc 21842171  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  21842170 ggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggt 21842122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109278
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||   ||||||||| | |   |||     
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttga 19109385  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19109384 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19109285  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  19109284 gtttggt 19109278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16379675 - 16379409
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||  | || ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  16379675 aagagggcaattggttactagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagatgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtga 16379576  T
Q  121 gtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagag 220  Q
     |||||| | ||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||| || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  |     
T  16379575 atgagcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcctctgctgataagggcaaacagagagttaatgatgagaggaggccgagaaa 16379476  T
Q  221 gagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    || ||||| |  | |||| |||||||| |     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16379475 gaaagatgttgttgctgagattgtttgctatgcttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgtttgt 16379409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 643
Target Start/End: Original strand, 41350911 - 41351068
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  41350911 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41351010  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41351011 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 441 - 547
Target Start/End: Original strand, 21045322 - 21045428
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045322 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 21045421  T
Q  541 gtgctac 547  Q
    |||||||    
T  21045422 gtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 634
Target Start/End: Original strand, 21228799 - 21228947
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21228799 atcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 21228898  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 634  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228899 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 21228469 - 21228600
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  21228469 aagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaact 21228568  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21228569 gtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 21228600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Original strand, 16347433 - 16347542
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16347433 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16347532  T
Q  178 acaacggtaa 187  Q
    |||| |||||    
T  16347533 acaagggtaa 16347542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Original strand, 16354081 - 16354190
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16354081 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16354180  T
Q  178 acaacggtaa 187  Q
    |||| |||||    
T  16354181 acaagggtaa 16354190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 51330330 - 51330430
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  51330330 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 51330429  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  51330430 a 51330430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20922023 - 20921929
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaa 112  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20922023 atcaagcgggcaattggatatcagaagatccgtaactttactgaactagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 20921929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Original strand, 21044941 - 21045118
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| | || | |    
T  21044941 attggttaacagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaataagagga 21045040  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgaga 207  Q
     ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  21045041 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggcaagcaaagagttaatgatgaga 21045118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401631
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 563  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21833823 - 21833723
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  21833823 aggatctatggagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 21833724  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  21833723 a 21833723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 541
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 541  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 187
Target Start/End: Original strand, 41350512 - 41350615
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 183  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  41350512 tatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagg 41350611  T
Q  184 gtaa 187  Q
    ||||    
T  41350612 gtaa 41350615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19109837 - 19109791
Alignment:
Q  132 ggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  19109837 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 19109791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 24784839 - 24784901
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24784839 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Original strand, 17041929 - 17042057
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| |||||||||| |    
T  17041929 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttcaact 17042027  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 285  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17042028 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 17042057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528103
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcatt 20528103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 30222 - 29537
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30222 atcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtga 30123  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  30122 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaa 30023  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30022 gaggagagatgttcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 29923  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    ||||  || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  29922 ggtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccga 29823  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29822 agaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 29723  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29722 tttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatg 29623  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29622 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttga 29537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 64305 - 64993
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || || |||||  |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||    
T  64305 gacatcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 64404  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  64405 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggcc 64504  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
     || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||    
T  64505 gaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcag 64603  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |||||  |||| || ||     
T  64604 gtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaa 64703  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||| || |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64704 ccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 64803  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  64804 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggaga 64903  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  64904 aatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 64993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 48883 - 49571
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||    
T  48883 gacatcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 48982  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  48983 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggcc 49082  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
     || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||    
T  49083 gaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcag 49181  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |||||  |||| || ||     
T  49182 gtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaa 49281  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||| || |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49282 ccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 49381  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  49382 ctcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggaga 49481  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  49482 aatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 49571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 57917 - 58605
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||    
T  57917 gacatcaagagagccatagggtatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataagg 58016  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  58017 tgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggcc 58116  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
     || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||    
T  58117 gaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcag 58215  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |||||  |||| || ||     
T  58216 gtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatattagttcacagtgcacacaa 58315  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||| || |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58316 ccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagta 58415  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  58416 ctcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggaga 58515  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  58516 aatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 58605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Original strand, 1017 - 1711
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017 atcaagagggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 1116  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  1117 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaa 1216  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1217 gaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 1316  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1317 ggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccta 1416  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | | |||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417 agaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 1516  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1517 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatg 1616  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1617 gttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 1711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 8342 - 7648
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8342 atcaagagggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 8243  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  8242 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaa 8143  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8142 gaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 8043  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8042 ggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccta 7943  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | | |||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7942 agaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 7843  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7842 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatg 7743  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7742 gttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 43296 - 42611
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43296 atcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaagatctatgatgaggatacaaaagctcattacaaggtga 43197  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  43196 tgagtaagcgccgaggcaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaa 43097  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43096 gaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgttgtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgt 42997  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  || |  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  42996 agtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatattagttcgcagtgtacgcaaccta 42897  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42896 agaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 42797  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42796 tttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 42697  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42696 gttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 42611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 50519 - 50691
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  50519 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgg 50618  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50619 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 34935 - 34250
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  34935 atcaagagtgccattggttattagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtga 34836  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  34835 tgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagctgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcaaaggttaaatgatgagaggaggcccaa 34736  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34735 gaggagagatgctcctactgacattgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgt 34636  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34635 ggttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgtagtgtacgcagccga 34536  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34535 agaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcc 34436  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34435 tttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatg 34336  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34335 gttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaagactttga 34250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 37540 - 36852
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||  || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37540 gacatcaagagagctattggatatcagaaaattagaaacttttatgagctgttaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaagg 37441  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37440 tgatgagtgaacgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcttgccgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc 37341  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  37340 caagaggagagacactcctactgatattttttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 37241  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37240 tgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcacagtgtacgcagc 37141  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37140 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagtac 37041  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37040 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 36941  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36940 atggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 36852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 518 - 1206
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  518 gacatcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttctgaggaagataccaaagctcattacaagg 617  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||| ||||||    
T  618 tgatgagtgaacatagaggcaagggacagcaaagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaaggggaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 717  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  718 caagaggagagatgctcctacggacattgattgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcagg 817  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  818 tgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatcagttcgcagtgtacgcagc 917  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  918 caaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtac 1017  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1018 tcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaa 1117  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 586 - 1274
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  586 gacatcaagagagccattggttatcagaaaaaaagaaatttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacaacaaagctcattacaagg 685  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||||| ||||||    
T  686 tgatgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccgtataatgctcctgctgacaagggtaagaagaggttaaatgatgagaggaggcc 785  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  786 caagaggagagatgctcctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcagg 885  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  886 tgtggtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaac 985  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 1085  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1086 tcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaa 1185  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1186 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 70706 - 70079
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  70706 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtga 70607  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  70606 tgagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaa 70507  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  70506 gaggagagatgctcctactgagattatttgctttaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgt 70407  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  70406 ggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagccta 70307  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  70306 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcc 70207  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  70206 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatg 70107  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcag 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  70106 gttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 498 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60643
Alignment:
Q  498 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 597  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  598 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  698 ctttgatgtccatct 712  Q
    |||||| ||| ||||    
T  60657 ctttgaagtcgatct 60643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 527 - 433
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaa 112  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | || |||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  527 atcaagcgggcaattggatatcagaagatctgtaactttactgaactagtgagcagttgcagaatctatgaagtggataccaaagcacattacaa 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 658
Target Start/End: Original strand, 4010 - 4650
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  4010 atcaaaagggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagttgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtga 4109  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  4110 tgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaa 4209  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4210 gaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaagactacaaaagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 4309  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4310 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagccta 4409  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4410 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactca 4509  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4510 tttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatg 4609  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4610 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23274793 - 23274108
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23274793 atcaagagggctattggttatcagaaaataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtga 23274694  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  23274693 tgagtgaacgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaa 23274594  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  23274593 gaggagagatgctcctactgaaattgtttgcaacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 23274494  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  |||| || || || |    
T  23274493 ggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgcacacaaccga 23274394  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274393 agaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 23274294  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23274293 tttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatg 23274194  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23274193 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 23274108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 19716260 - 19716945
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  19716260 atcaagagagccattggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtga 19716359  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19716360 tgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaa 19716459  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
     ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  19716460 taggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgt 19716559  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||||||| |||| || ||||| |    
T  19716560 ggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccga 19716659  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19716660 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcc 19716759  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19716760 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatg 19716859  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19716860 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttga 19716945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 20848789 - 20848105
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||     
T  20848789 gacatcaagagagctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataaga 20848690  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||   |    
T  20848689 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggat--c 20848592  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  20848591 caagaggagagatgctcctgttgagattgtt-gctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 20848493  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  20848492 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 20848393  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848392 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 20848293  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20848292 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 20848193  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  20848192 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 20848105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 23097261 - 23097945
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || || || || || || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  23097261 atcaagagggcctttggctatcagaagatcagaactttttctgagtttgtaagtagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtga 23097360  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| || | ||| |||||||     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  23097361 tgagtgagcggagaggtaaagcacatcagagtctccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagaggaggcccaa 23097460  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  23097461 gaggagagatgctcctgctgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgt 23097560  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| |    
T  23097561 ggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaa 23097660  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23097661 agaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactcc 23097760  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  23097761 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatg 23097860  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  23097861 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 23097945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 560
Target Start/End: Original strand, 19720823 - 19721365
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  19720823 atcaagagagccattggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtga 19720922  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19720923 tgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaa 19721022  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
     ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  19721023 taggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgt 19721122  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||||||| |||| || ||||| |    
T  19721123 ggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccga 19721222  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19721223 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcc 19721322  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721323 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12577517 - 12576868
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||     
T  12577517 ttttctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtc 12577418  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
      || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || ||    
T  12577417 ctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaa 12577318  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 352  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||   |||  ||||| |||||    
T  12577317 gtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcg 12577219  T
Q  353 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttg 452  Q
     || ||  |||| ||||| || |  || || || ||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||    ||||| || || |||||||||    
T  12577218 cggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttg 12577119  T
Q  453 actcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    ||| |||| ||  | |  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12577118 actggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 12577019  T
Q  553 gtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 652  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12577018 gtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactac 12576919  T
Q  653 ttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||| |||||  | || |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  12576918 ttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 12576868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 412 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23113528 - 23113238
Alignment:
Q  412 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatag 511  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||  |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23113528 agcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggaacacaggcagttattgaggacg-acttatcaaaggtacttgtttctttaatag 23113430  T
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  23113429 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 23113330  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23113329 gaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 23113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28351068 - 28350670
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |  | |||    
T  28351068 gggccattggctatcagaagatcagacaattttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagtggatacgatagctcactataaggttagtaatga 28350969  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||   |||||| || ||  |||||  |||||| |||||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  28350968 gcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccgaagccctatagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 28350869  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  28350868 gatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 28350769  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  28350768 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctcagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 28350670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21901730 - 21901386
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  21901730 gggccattggttaccaaaagatcagacaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaatctcattataaggttatgagtga 21901631  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    |   ||   ||| || || ||  ||| |  |||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21901630 gaagaggaacaaaggccatcaaggtcatccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 21901531  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  21901530 gatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 21901431  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgct 369  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||    
T  21901430 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgct 21901386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Original strand, 24817506 - 24817768
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   || |||||||||  || | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24817506 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 24817605  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||     | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24817606 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 24817705  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  24817706 ttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 24817768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733689
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctat 22733684  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  22733685 gtttg 22733689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074391
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23074396  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  23074395 gtttg 23074391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 516 - 690
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105643
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 615  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  616 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 23105643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 469 - 692
Target Start/End: Original strand, 45673706 - 45673929
Alignment:
Q  469 tgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttga 568  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  45673706 tgaatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcga 45673805  T
Q  569 ttgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtcta 668  Q
    |||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |     
T  45673806 ttgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 45673905  T
Q  669 agttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  45673906 agatgtcttttgtctatgtttggt 45673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 9338314 - 9338108
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  9338314 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9338215  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  9338214 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9338115  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  9338114 gtttggt 9338108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 9486948 - 9486742
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  9486948 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9486849  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  9486848 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9486749  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  9486748 gtttggt 9486742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351628
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11351621  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  11351622 gtttggt 11351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16983972 - 16983766
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16983972 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16983873  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16983872 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16983773  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16983772 gtttggt 16983766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 17001732 - 17001526
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17001732 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17001633  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17001632 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17001533  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17001532 gtttggt 17001526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 21322977 - 21323183
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21322977 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21323076  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  21323077 gtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 21323176  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  21323177 gtttggt 21323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742849
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22742776  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22742777 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 444 - 692
Target Start/End: Original strand, 24705151 - 24705399
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  24705251 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggttt 24705350  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     |||||||||||||| || ||| | || || |  |||||||||||||||    
T  24705351 ggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggt 24705399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 22323053 - 22323259
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22323053 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22323152  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22323153 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22323252  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22323253 gtttggt 22323259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 24712766 - 24712560
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24712766 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24712667  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24712666 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24712567  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24712566 gtttggt 24712560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 44383281 - 44383487
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  44383281 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgg 44383380  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  44383381 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44383480  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  44383481 gtttggt 44383487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029378
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 23029378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 489 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220542
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 27220546  T
Q  689 tggt 692  Q
    ||||    
T  27220545 tggt 27220542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373795
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 27373795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10871582 - 10871376
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10871582 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10871483  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10871482 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctat 10871383  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10871382 gtttggt 10871376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24678013
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 24678120  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  24678119 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24678020  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24678019 gtttggt 24678013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657575
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
     ||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24657568  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24657569 gtttggt 24657575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 486 - 643
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208788
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |  || ||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 30208730  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| ||| | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  30208731 gtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttc 30208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874667
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24874560  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24874561 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctat 24874660  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24874661 gtttggt 24874667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24265102 - 24264930
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24265102 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24265003  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24265002 gtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142958
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 21142958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204874
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||| |  ||||||  | |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19817579 - 19817492
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||    
T  19817579 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgctgcggattgtg 19817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 22462931 - 22462993
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22462931 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 22462993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279291
Alignment:
Q  651 acttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 23279291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 23116440 - 23116571
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  23116440 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcagagattgtttgtttcaact 23116539  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23116540 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 23116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 24817221 - 24817352
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  24817221 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 24817320  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24817321 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 24817352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23205306 - 23205245
Alignment:
Q  226 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23205306 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23205245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23676910 - 23676849
Alignment:
Q  226 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23676910 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23676849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 552
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  484 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24265507 - 24265407
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  24265507 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 24265408  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  24265407 a 24265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 11351161 - 11351223
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11351161 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11351223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  483 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Original strand, 22742209 - 22742306
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||   || || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22742209 atcaagagggcaattggttaccagaagatccgagttttctccgagctggtgagcagttgcaggatttacgaagaggataccaaggctcattacaaggt 22742306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 24817094 - 24817179
Alignment:
Q  29 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24817094 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 24817179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10871987 - 10871887
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10871987 aggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 10871888  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  10871887 a 10871887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9338719 - 9338616
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  9338719 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 9338620  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  9338619 acaa 9338616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9487353 - 9487250
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  9487353 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 9487254  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  9487253 acaa 9487250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 553  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 44382876 - 44382979
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  44382876 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 44382975  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  44382976 acaa 44382979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 24657128 - 24657170
Alignment:
Q  245 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24657128 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 24657170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 24704932 - 24704994
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24704932 gatgttcctgctgagattatctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24704994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 658
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606269
Alignment:
Q  597 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 41606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 43125 - 43810
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  43125 atcaagagggctattggttatcaaaagataaggaatttctcagatttggtaagcagctgtaggatatattaagaggataccaaatgtcattacaaggtga 43224  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||| ||| || |||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  43225 tgagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccaaaactgtatagtgctccttctaacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaa 43324  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43325 gaggagagatgctcctaatgagattgtctgtttcaagtgtcgtgaaaagggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 43424  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |   | || || |||||||| || ||| |||| | | |||| |    
T  43425 ggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcatattagctcgcagtgcaagaagccca 43524  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525 agaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 43624  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  43625 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatg 43724  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43725 gttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttga 43810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25129
Alignment:
Q  616 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttga 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 6405 - 5718
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6405 gacatcaagagagccattggctatcagaaaataaggaacttctttgaattgggaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 6306  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  6305 tgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaagggtaagca-aggttaaatgatgagaggaggcc 6207  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  6206 caagaggagagatgctcttactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaga 6107  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |    
T  6106 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatattagttcacagtgtacacaac 6007  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||  ||||||| |    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6006 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 5907  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5906 tcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaa 5807  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5806 atggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 656
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41452
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |  || ||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 41381  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 656  Q
    |||| ||| | ||   |||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  41382 gtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 19985815 - 19985121
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19985815 atcaagcgggccattggttatcaaaagataataaatttttctgatttggtaagcagttgtaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 19985716  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||| |||||||| |||||| ||    
T  19985715 tgagtgagcgcagtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcggacaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaa 19985616  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||    
T  19985615 gaggagagatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtatttcagatgt 19985516  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | |||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||| || |   | || || || ||||| || ||  |||| | | ||||||    
T  19985515 ggacagaaatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacagtgcaagaagccta 19985416  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985415 agaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 19985316  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19985315 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatg 19985216  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19985215 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 19985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 21929063 - 21928369
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21929063 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 21928964  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||| |     
T  21928963 tgagtgagcgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctag 21928864  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21928863 gaggagagatgctcctactgagattctttgtttcaagtgtggcgaaaagggccacgagagtaatgtaagtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgt 21928764  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| || ||  | || | | |||| |    
T  21928763 ggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacaatgcaagaagccca 21928664  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928663 agaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 21928564  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21928563 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatg 21928464  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21928463 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 21928369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 22374480 - 22373819
Alignment:
Q  42 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 141  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22374480 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatcaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 22374381  T
Q  142 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 241  Q
    |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | ||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  22374380 agtagagtcgtccgaaaccgtatagtgcccctgctgtcaaaggtaaacaaagacttaatgaggagaggaggcctaggaggagagattctcctactgagat 22374281  T
Q  242 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |    
T  22374280 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 22374181  T
Q  342 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 441  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  22374180 gattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaagg 22374081  T
Q  442 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 541  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374080 tgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 22373981  T
Q  542 tgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 641  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22373980 tgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 22373881  T
Q  642 tcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22373880 tcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagactttga 22373819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 22027423 - 22028111
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || || |||||  |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||    
T  22027423 gacatcaagagagccatagggtatcaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagatcattataagg 22027522  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22027523 tgatgagtgagcgaagtggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 22027622  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  22027623 caataggagagatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgataaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcagg 22027722  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || ||||    
T  22027723 tgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttgtttgctataactacaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagc 22027822  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027823 cgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 22027922  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22027923 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaa 22028022  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22028023 atggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttga 22028111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 31413678 - 31414362
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | ||||||| ||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||  |||    
T  31413678 atcaaaagagctattgggtatcagaagattaaaattttctctaagttggtaaacagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaaatga 31413777  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||   || || || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31413778 tgagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagcgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagaggaggcccaa 31413877  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||| |||||| || ||||||    
T  31413878 gaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgt 31413977  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |    
T  31413978 ggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagtcga 31414077  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414078 agaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 31414177  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31414178 tttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatg 31414277  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31414278 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 31414362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 29300569 - 29301256
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  29300569 gacatcaaaagagctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttagtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaagg 29300668  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||||||    
T  29300669 taatgagtgagaggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcc 29300768  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||   ||||||| | |||||| || |||    
T  29300769 caagaggggagatgttcccgctgaaattgtttgttttaagtgtggtgaaagaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgaaaggaagtgttttagg 29300868  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| || |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  29300869 tgtggtcagagaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagc 29300968  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||| |||||  ||||| || |||||| | |||||  |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29300969 cgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 29301068  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29301069 tcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaa 29301168  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29301169 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 29301256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 73 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22054443 - 22053814
Alignment:
Q  73 gttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 172  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  22054443 gttgcaggatctgtgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22054344  T
Q  173 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 272  Q
    |||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22054343 tgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgcttctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccac 22054244  T
Q  273 aagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctac 371  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |||| || ||     
T  22054243 aagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttat 22054145  T
Q  372 aacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtga 471  Q
    |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    |    
T  22054144 aactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactacta 22054045  T
Q  472 atgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattg 571  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  22054044 atgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaag 22053945  T
Q  572 tgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagt 671  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22053944 tgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagg 22053845  T
Q  672 tgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||    
T  22053844 tgtcctacatctatgtttggtagagactttg 22053814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28984549 - 28983862
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || || ||||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  28984549 gacatcaaaagagccattggatatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 28984450  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||    
T  28984449 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 28984350  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  28984349 caagaggagagatgctccagttgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 28984250  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  28984249 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 28984150  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28984149 cgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 28984050  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  28984049 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaa 28983950  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  28983949 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28983862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 697
Target Start/End: Original strand, 16268367 - 16269049
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||      
T  16268367 gacatcaaaagggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaata 16268466  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | ||||||    
T  16268467 taatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcc 16268566  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  16268567 taagaagagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcagg 16268666  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || || |   ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  16268667 tgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 16268766  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268767 cgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 16268866  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  16268867 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 16268966  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | |||||||||||||||||    
T  16268967 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagaga 16269049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20391714 - 20391036
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20391714 gggccattgggtatcaaaagatcaggcaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaagaggataccaaagctcattataaggttatgagtga 20391615  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||   ||| || || ||  |||||  |||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  20391614 gcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagtaga 20391515  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  20391514 gatgttccttctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttccaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 20391415  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||| || ||| |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||     
T  20391414 aagggcatactatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 20391315  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391314 tcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 20391215  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||| |  ||||||||||||||||    
T  20391214 tctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttg 20391115  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20391114 aaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 20391036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 383 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28989400 - 28989081
Alignment:
Q  383 ggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgga 482  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||  |    ||||||||| ||    
T  28989400 ggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccga 28989301  T
Q  483 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  28989300 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagt 28989201  T
Q  583 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtc 682  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||    
T  28989200 tgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatc 28989101  T
Q  683 tatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28989100 tatgtttggtagagattttg 28989081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357487
Alignment:
Q  524 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 623  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  624 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 27357487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 451
Target Start/End: Original strand, 6606651 - 6607048
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  | |||     
T  6606651 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggacgtc 6606750  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
     |||||| || ||||  |||  |||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  6606751 cgaagccctacagtgttcctattgacagaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaa 6606850  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 353  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || || ||  ||| ||| || ||||||    
T  6606851 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgt 6606950  T
Q  354 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttt 451  Q
    ||||| |||||||||| ||| |   | || ||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6606951 ggggatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttt 6607048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421710
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  22421706 gtttg 22421710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 444 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 21254154 - 21253908
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21254154 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21254055  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||| ||| ||||||  |||||||||   |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21254054 ctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21253955  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
     || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  21253954 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 21253908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 489 - 703
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375284
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 22375269  T
Q  689 tggtagagactttga 703  Q
    ||||||||| |||||    
T  22375270 tggtagagattttga 22375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 21391475 - 21391679
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  21391475 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21391574  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  21391575 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21391674  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  21391675 gtttg 21391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 21780801 - 21781005
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  21780801 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21780900  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  21780901 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21781000  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  21781001 gtttg 21781005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 516 - 690
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786173
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 615  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  616 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 21786173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 508 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523507
Alignment:
Q  508 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 607  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  608 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   || ||||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggt 22523507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 444 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22990006
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||  |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttc 22990055  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  22990054 ggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggt 22990006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19981134 - 19980928
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  19981134 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 19981035  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19981034 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19980935  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  19980934 gtttggt 19980928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Original strand, 22245584 - 22245846
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22245584 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22245683  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22245684 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaaggg 22245783  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22245784 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 22245846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Original strand, 22246002 - 22246264
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22246002 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22246101  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22246102 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaaggg 22246201  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22246202 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 22246264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 17671636 - 17671842
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17671636 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17671735  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17671736 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17671835  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17671836 gtttggt 17671842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 512 - 692
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164358
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |  ||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 21164358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19115567 - 19115361
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19115567 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19115468  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19115467 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19115368  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  19115367 gtttggt 19115361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 20015877 - 20016083
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  20015877 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20015976  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20015977 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20016076  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  20016077 gtttggt 20016083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603106
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 32603113  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  32603112 gtttggt 32603106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 444 - 692
Target Start/End: Original strand, 22126531 - 22126779
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22126531 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22126630  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22126631 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22126730  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
     || | ||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  22126731 ggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22126779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859538
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18859545  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  18859544 gtttggt 18859538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031064
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22031071  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22031070 gtttggt 22031064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 22117789 - 22117995
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||  | |   ||||    
T  22117789 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgg 22117888  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22117889 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22117988  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22117989 gtttggt 22117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042788
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||  | |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22042795  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22042794 gtttggt 22042788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310964
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 30310957  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  30310958 gtttggt 30310964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536344
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| || ||||||  ||||||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctat 15536351  T
Q  686 gtttggt 692  Q
     ||||||    
T  15536350 atttggt 15536344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129437
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22129330  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22129331 gtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22129430  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22129431 gtttggt 22129437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 643
Target Start/End: Original strand, 19481686 - 19481843
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19481686 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19481785  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19481786 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19481843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Original strand, 21970694 - 21970793
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21970694 gacatcaagagagccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21970793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 22004225 - 22004323
Alignment:
Q  16 acatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22004225 acatcaagagagccattggttatcagaagattataaacttttctaagttggtgagtagctgtaggatttatgaagatgataccaaagctcattataagg 22004323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22043402 - 22043193
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || |||||||     ||||| |||||||||||| |||    
T  22043402 aggatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcaccctaagccttatagtgcccctactg 22043303  T
Q  178 acaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 277  Q
    |||| || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  |||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22043302 acaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccaactgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 22043203  T
Q  278 taatgtttgt 287  Q
    ||||||||||    
T  22043202 taatgtttgt 22043193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22524133 - 22523876
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22524133 attggttaccagaagatccgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaa 22524034  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
     |||||| || || |||||||||   ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| | |||||||||| | |||| | || || ||||||    
T  22524033 aaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctgctgataagggaaaacaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgc 22523934  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  ||||| || |||||||||| |||||||| ||||    
T  22523933 tcctgttgagattgtgtgctatacttgtggcgagaaaggccacaggagtaatgcttgt 22523876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 30310497 - 30310559
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30310497 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 30310559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18860152 - 18860049
Alignment:
Q  75 tgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctg 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  18860152 tgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 18860053  T
Q  175 ctga 178  Q
    ||||    
T  18860052 ctga 18860049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32603642 - 32603511
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||   ||||| | | | || |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  32603642 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcgacctaagaagaaggatgctccttcggaaattgtttgtttcaact 32603543  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32603542 gtggtgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 32603511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21672150 - 21671981
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| |      
T  21672150 atcaagagggcaattggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatgccaagactcattacaagattg 21672051  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaa 187  Q
    ||| |||||| |  | |||||| || |||||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  21672050 tgaatgagcgaaaggccaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaa 21671981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 22126168 - 22126268
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  22126168 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 22126267  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  22126268 a 22126268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22990668 - 22990520
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22990668 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaagatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgga 22990569  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
     |||||| || || || ||||||   ||||| || ||||| ||||||||    
T  22990568 aaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctga 22990520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15536880 - 15536749
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || |    
T  15536880 aagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaatt 15536781  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15536780 gtggcgaagaaggccacaagagtaatgtttgt 15536749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 187
Target Start/End: Original strand, 19481287 - 19481390
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 183  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  19481287 tatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagg 19481386  T
Q  184 gtaa 187  Q
    ||||    
T  19481387 gtaa 19481390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 22421039 - 22421134
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |   ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  22421039 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttccaaccaggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaag 22421134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 21391214 - 21391276
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21391214 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21391276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 21780540 - 21780602
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21780540 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21780602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 21982098 - 21982196
Alignment:
Q  16 acatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21982098 acatcaagaaagccattggttatcagaagattataaacttttttaatttggtgagtagctgaaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21982196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 21998584 - 21998682
Alignment:
Q  16 acatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21998584 acatcaagaaagccattggttatcagaagattataaacttttttgagttggtgagtagctgaagaatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21998682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 172
Target Start/End: Original strand, 22117384 - 22117478
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccc 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||    
T  22117384 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22117478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19870830 - 19870773
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  19870830 cctttaattgctattatagatattggagctacgcattcttttatttctcttgattgtg 19870773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848017
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 21848017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 23563050 - 23563738
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | | | |||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||     
T  23563050 gacatcaagagagccattggttatcagaagattagaaatttctttaatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacactaaagctcattacaaga 23563149  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || || ||| |||||| ||||||    
T  23563150 tgatgagtgaacgtagaggtaagggacagaagagttgtccgaagccgtatagtgctcctgctgaaaaggataagcagaggttaaataatgagaggaggcc 23563249  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23563250 caagaggagagatgctcctactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagg 23563349  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23563350 tgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtacgcagc 23563449  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563450 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 23563549  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23563550 tcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaa 23563649  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  23563650 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagagactttga 23563738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 23077790 - 23078474
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  23077790 atcaaaagagctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaa 23077889  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||||||    
T  23077890 tgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaa 23077989  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| ||| || |||||||||    
T  23077990 gaggagagatgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgt 23078089  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  23078090 ggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccga 23078189  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078190 agaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 23078289  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23078290 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatg 23078389  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23078390 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 23078474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20345768 - 20345116
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| |  || || || |||||||| || || || |||||||||||||||     
T  20345768 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaaga 20345669  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  20345668 taatgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 20345569  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||    
T  20345568 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcagg 20345469  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  20345468 tgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagc 20345369  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345368 cgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 20345269  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20345268 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 20345169  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20345168 atggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtct 20345116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22506165 - 22505513
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||     
T  22506165 gacatcaaaagagctattggatatcagcaaatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataaga 22506066  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||||||    
T  22506065 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcc 22505966  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||    
T  22505965 taagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcagg 22505866  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||  ||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||| ||||||||  ||||| |  | |    
T  22505865 tgtggtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgtcctgaac 22505766  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22505765 cgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtac 22505666  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  22505665 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaa 22505566  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22505565 atggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 22505513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 14883873 - 14884560
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  14883873 gacatcaaaagggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 14883972  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| ||  ||  |||||| | ||||||    
T  14883973 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcc 14884072  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  14884073 caagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgataggaagtgcttcagg 14884172  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  14884173 tgtggtcagaagggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagc 14884272  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884273 cgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 14884372  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||    
T  14884373 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaa 14884472  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  14884473 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 14884560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Original strand, 21983074 - 21983747
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  21983074 attggttatcaaaagatcagaaaattttctgaatttgtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagctcattataagtttatgagtgagcgga 21983173  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |   ||| || || ||  |||||  |||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  21983174 ggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgttcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 21983273  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    |||| |||| |||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  21983274 tcctgctgagattgtttgctataggtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttcgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 21983373  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  |     
T  21983374 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagg 21983473  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21983474 caggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactat 21983573  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  21983574 tattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaact 21983673  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21983674 ccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttga 21983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 25851558 - 25850871
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||   || ||||| ||||| |  || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  25851558 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagttttctctgagttggttaataggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 25851459  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  25851458 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 25851359  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||    
T  25851358 caagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcagg 25851259  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| | ||| ||| |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||  ||||| |  |||    
T  25851258 tgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagc 25851159  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25851158 cgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 25851059  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  25851058 tcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 25850959  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  25850958 atggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 25850871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Original strand, 21560917 - 21561595
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  21560917 gggccattggttatcaaaagatcaggtaattttctaaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagcccgttataaggttatgagtga 21561016  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    | | ||   ||| || || ||  |||||  |||||| || |||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21561017 gaggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctactgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 21561116  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |  |  | | |||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  21561117 gatgttcctgctgagattgtttgcttcaagtgtggtaagaagggccacaagagtaatgttagcaatggtgttgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 21561216  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg- 423  Q
    |||| || ||  |||   | || ||| |||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||| ||||||||     
T  21561217 aagggcatacgatagcgaaatgcaagtgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcataagaaggc 21561316  T
Q  424 ttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaat 523  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21561317 ttagg-caggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaat 21561415  T
Q  524 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 623  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||   |||||  |||||||||||||||    
T  21561416 tgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgtt 21561515  T
Q  624 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21561516 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 21561595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 17266216 - 17266904
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||  || ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  17266216 gacatcaagagggctataggataccaacagattagaattttctctgatttggtaagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataagg 17266315  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  17266316 tgatgagtgagcgaagaggtaaagggcatcagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggcc 17266415  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
     |  | ||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17266416 gagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgttttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accgaggatgagaagaagtgcttcag 17266514  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||| | ||| || ||||   |||  ||||| ||||| || ||  |||| ||||| || |  || || || ||||| |||||| |  |||| || |||    
T  17266515 gtgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggtcacatcagtactcagtgcacacag 17266614  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| ||||  |  | |  ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17266615 ccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagta 17266714  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| || |||| ||| | |||||||||||    
T  17266715 ctcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggaga 17266814  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  17266815 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 17266904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 21870163 - 21870438
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21870163 atcaagagggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 21870262  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| ||    
T  21870263 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaa 21870362  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21870363 gaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21870438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 21874443 - 21874718
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21874443 atcaagagggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 21874542  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||||| ||    
T  21874543 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaa 21874642  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21874643 gaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21874718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 226 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20824728 - 20824257
Alignment:
Q  226 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 325  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||    | |||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  20824728 atgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcactcaagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaa 20824629  T
Q  326 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 425  Q
    ||| ||    || || || || |||||||| || |||||||| |  ||||     || |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||     
T  20824628 aggtcatgtgttggtggactgcaagcgtggagatattgtttgttttaactgtggtgatgaaggtcacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtc 20824529  T
Q  426 aggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 525  Q
    ||||| || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824528 aggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 20824429  T
Q  526 ctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttga 625  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824428 ctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttga 20824329  T
Q  626 aactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20824328 aactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 20824257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 471 - 703
Target Start/End: Original strand, 28892280 - 28892512
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  28892280 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 28892379  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28892380 gtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaag 28892479  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28892480 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 28892512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 471 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20778943 - 20778711
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  20778943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 20778844  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  20778843 gtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaag 20778744  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20778743 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 20778711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 481 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 22464970 - 22464748
Alignment:
Q  481 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  22464970 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataa 22464871  T
Q  581 gttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattg 680  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||    
T  22464870 gttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttg 22464771  T
Q  681 tctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22464770 tctatgtttggtagagattttga 22464748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 371 - 658
Target Start/End: Original strand, 21631637 - 21631924
Alignment:
Q  371 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtg 470  Q
    ||||| ||| || |||||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||| |  |||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  21631637 caactgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcagactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtg 21631736  T
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||| |  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21631737 aatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgatt 21631836  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | |||||||||||| ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21631837 gtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 43122943 - 43122517
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | || |||    
T  43122943 gggccattgggtaccaaaagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggttaggaatga 43122844  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||   |||||| |||||   |||   |||||| || ||||| | || |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  43122843 gcggaggaacaagggtcaacaagatcggccgaagccctacagtgctcatgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 43122744  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| || | | || |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||    
T  43122743 gatgttcatgcagagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaaga 43122644  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    | || ||  |  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43122643 aggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggt 43122544  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgcttt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43122543 taggacaggtggcaaggtgtttgcttt 43122517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23670091 - 23669822
Alignment:
Q  42 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  | || |||||| ||   |||||| |    
T  23670091 aagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggctaggaatgagcggaggaacaagggtc 23669992  T
Q  142 aacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 241  Q
    ||||  ||||   |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  23669991 aacaaggtcgaccgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgctcctgctgagat 23669892  T
Q  242 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    |||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  23669891 tgtttcctaccagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 23669822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429250
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||   ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctat 25429255  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  25429254 gtttg 25429250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736284
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  26736280 gtttg 26736284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882601
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21882708  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  21882707 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 21882608  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  21882607 gtttggt 21882601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16359535 - 16359329
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16359535 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16359436  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16359435 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16359336  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16359335 gtttggt 16359329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 489 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23474225 - 23474011
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  23474225 agaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtc 23474126  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    ||| | |  |  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |  ||| ||||  |||||||||||    
T  23474125 tggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtt 23474026  T
Q  689 tggtagagactttga 703  Q
    |||| |||| |||||    
T  23474025 tggtcgagattttga 23474011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 29473426 - 29473632
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29473426 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29473525  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  29473526 gtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29473625  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  29473626 gtttggt 29473632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 34569527 - 34569321
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  34569527 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 34569428  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  34569427 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 34569328  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  34569327 gtttggt 34569321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 40711813 - 40711607
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  40711813 atcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40711714  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  40711713 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40711614  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  40711613 gtttggt 40711607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 14997092 - 14997298
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   ||||    
T  14997092 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 14997191  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  14997192 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14997291  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  14997292 gtttggt 14997298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781941
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 18781948  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  18781947 gtttggt 18781941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 22330240 - 22330446
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22330240 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22330339  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22330340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22330439  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22330440 gtttggt 22330446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27521439 - 27521233
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27521439 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27521340  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27521339 gtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27521240  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27521239 gtttggt 27521233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 37288849 - 37289021
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  37288849 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 37288948  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37288949 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 41773875 - 41773703
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  41773875 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41773776  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41773775 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772787
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19772794  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  19772793 gtttggt 19772787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27613389 - 27613183
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27613389 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27613290  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27613289 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27613190  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27613189 gtttggt 27613183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 27682753 - 27682959
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27682753 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27682852  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27682853 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27682952  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27682953 gtttggt 27682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350746
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22350753  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22350752 gtttggt 22350746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666049
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27666042  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27666043 gtttggt 27666049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 23461004 - 23460832
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  23461004 atcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 23460905  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23460904 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 505 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803424
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 20803424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 22137701 - 22137529
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22137701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22137602  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22137601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 423
Target Start/End: Original strand, 16258095 - 16258326
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  16258095 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 16258194  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtca 391  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | |||||||||||    
T  16258195 gtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtca 16258294  T
Q  392 tatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    | | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  16258295 tcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 16258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 436 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 21410217 - 21409995
Alignment:
Q  436 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 535  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |  ||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21410217 gcaaggtgtttgctttagctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcataga 21410118  T
Q  536 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 635  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |  || |||||||| ||| | ||   ||| || || ||||||||||| ||||| || |||    
T  21410117 tactggtgctacatattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggct 21410018  T
Q  636 aagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| ||| || |||| ||||||    
T  21410017 aaggcttcggtgactagttctct 21409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 587
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  586 gt 587  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23474695 - 23474426
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || || ||  |||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  23474695 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcagctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 23474596  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| || | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  23474595 tgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacattgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccag 23474496  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || ||| | |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23474495 aaagaaagaagttgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 23474426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Original strand, 22591814 - 22591933
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  22591814 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 22591913  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    | || |||||||||||||||    
T  22591914 gtgaggagaagaagtgcttc 22591933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Original strand, 22595369 - 22595488
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  22595369 agattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 22595468  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    | || |||||||||||||||    
T  22595469 gtgaggagaagaagtgcttc 22595488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525952
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 618  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 692
Target Start/End: Original strand, 21336762 - 21336853
Alignment:
Q  601 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  21336762 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggt 21336853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 658
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  597 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 22329835 - 22329935
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  22329835 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 22329934  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  22329935 a 22329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18782408 - 18782346
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18782408 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18782346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 21331874 - 21331967
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattaca 111  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21331874 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattaca 21331967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 125
Target Start/End: Original strand, 28891845 - 28891934
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 125  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| ||  | || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28891845 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagttgctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgag 28891934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 14996687 - 14996787
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  14996687 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 14996786  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  14996787 a 14996787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19773398 - 19773298
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  19773398 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 19773299  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  19773298 a 19773298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 27682348 - 27682448
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  27682348 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 27682447  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  27682448 a 27682448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27521844 - 27521741
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  27521844 aggatctatgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctg 27521745  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  27521744 acaa 27521741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27613785 - 27613694
Alignment:
Q  87 gaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | |  |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  27613785 gaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 27613694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22465436 - 22465126
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||  || ||  ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  22465436 gacatcaagagagccattggatatcagaagatcataattttctcataattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataagg 22465337  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||| |||   ||    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||| || |||| || ||  | |||||||||||||||| |  |||    
T  22465336 tgatgagcgagaaaaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaataaagattgaatgatgagaggcagcc 22465237  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||     
T  22465236 taaggggagaaatgctcctgttgatgttatttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcatccaagatgagaagaaatgtttcaga 22465137  T
Q  315 tgtggtcggaa 325  Q
    || |||| |||    
T  22465136 tgcggtcagaa 22465126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 21631296 - 21631381
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    ||||| |||||||||||  | || |||| |||| |||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21631296 attggatatcagaagatccgtaaattttatgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 21631381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20824933 - 20824829
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || || || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20824933 aagagagccattgggtatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttacgaggaggatacgaagactcattacaaggtgatga 20824834  T
Q  121 gtgag 125  Q
    | |||    
T  20824833 gcgag 20824829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23461406 - 23461203
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaac 182  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||| | || | ||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  23461406 tatgaagaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcgga-agactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataag 23461308  T
Q  183 ggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 282  Q
    || ||  | ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23461307 ggaaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggaaattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatg 23461208  T
Q  283 tttgt 287  Q
    |||||    
T  23461207 tttgt 23461203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 29473021 - 29473121
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| ||| ||||    
T  29473021 aggatctatgaagaggatacgaatgctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctg 29473120  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  29473121 a 29473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16359940 - 16359837
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  16359940 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16359841  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  16359840 acaa 16359837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21410572 - 21410373
Alignment:
Q  81 atttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgaca 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||| |||||| || || |||   ||||| ||||||   || || || ||||| || ||||| |    
T  21410572 atttatgaagatgacaccaaagctcattataagattatgaatgagcggaggggtaagcaccaacaaagtcgtggtaaaccttacagtgctccagctgata 21410473  T
Q  181 acggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 280  Q
    | |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||   ||||| || ||||| || ||||||||    
T  21410472 agggtaagcatagggtgaatgataagaggaggcccagaaagagagatactcctactgaagttgtgtgtttccgatgtggagagaaaggtcataagagtaa 21410373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25429885 - 25429826
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25429885 ttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaag 25429826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34569932 - 34569829
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  34569932 aggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 34569833  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  34569832 acaa 34569829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23526345 - 23526283
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  23526345 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 23526283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 37288450 - 37288544
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| || |||||    
T  37288450 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgctga 37288544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20770603 - 20770518
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 121  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20770603 tatcagaagatcagaattttctcggaattggtgaggagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20779378 - 20779293
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 121  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20779378 tatcagaagatcagaattttctcggaattgttgagcagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20779293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20803891 - 20803830
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 286  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20803891 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttg 20803830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19456456 - 19455771
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||     
T  19456456 atcaagagaggtattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctgg 19456357  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  19456356 tgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaa 19456257  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  19456256 gaggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgg 19456157  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
     ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  19456156 tgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaa 19456057  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456056 agaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 19455957  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19455956 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatg 19455857  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19455856 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagagactttga 19455771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19438438 - 19437750
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19438438 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaagg 19438339  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |  |||||||  | ||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  19438338 tagtgagtgaaaggagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 19438239  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||     ||||||||| ||||| ||||||    
T  19438238 caagaggagagatgctcctgctgagatcgttcgttacaagtgtggtgagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatgagaataagtgtttcagg 19438139  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| ||  | |||||||||||| |||| || ||||    
T  19438138 tgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcagttcgcagtgcacacagc 19438039  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19438038 cgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 19437939  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19437938 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaa 19437839  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  19437838 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagagactttga 19437750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19466601 - 19465971
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||     
T  19466601 atcaagagaggtattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctgg 19466502  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  19466501 tgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaa 19466402  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  19466401 gaggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgg 19466302  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
     ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  19466301 tgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaa 19466202  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466201 agaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 19466102  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466101 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 19466002  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466001 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 700
Target Start/End: Original strand, 14376761 - 14377446
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14376761 gacatcaagagagacattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 14376860  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||    
T  14376861 tgatgagtgatcgaaggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggagacc 14376960  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| |||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  14376961 caataggagagatgctcctgttgatgttgtttgctacaagtgcggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagg 14377060  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||    
T  14377061 tgtggtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatcagttcgcaatgtacacagc 14377160  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14377161 cgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaa 14377260  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14377261 tcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaa 14377360  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactt 700  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14377361 atggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactt 14377446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 25771270 - 25770592
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  25771270 gggctattggctaccaaaagataaggaatttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattatagagtgatgagtga 25771171  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25771170 gcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgtaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 25771071  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||   ||    
T  25771070 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagaataatttatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttcgatgtgggacga 25770971  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |   | || ||||||||||| || ||  |||| | | | ||||||||||     
T  25770970 aaggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggc 25770871  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25770870 tctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 25770771  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25770770 gctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttg 25770671  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25770670 aatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 25770592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21475010 - 21474348
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21475010 gggctattggctactaaaagataaggaatttttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 21474911  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    |||                |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  21474910 gcg----------------cagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 21474827  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||    
T  21474826 gatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaaga 21474727  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |||||  |||| | | | ||||||||||     
T  21474726 aaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcaggaaacctaagaaggc 21474627  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474626 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaatt 21474527  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  21474526 gctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttg 21474427  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21474426 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 21474348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 18798126 - 18797476
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  18798126 gacatcaagagggctattggataccagaagatcagaaacttctctgagttggtaagtagctgcagaatctatgaagaggacacagaagctcattacaagg 18798027  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18798026 tgatgagtgaccgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 18797927  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||| |||| || ||||||    
T  18797926 caagaggagggatgctcctgtggatattgtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgcactaaagatgagcagaaatgtttcagg 18797827  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||  |||| || || |    
T  18797826 tgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgcactcaac 18797727  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797726 caaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 18797627  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  18797626 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagag 18797527  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18797526 atggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 18797476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 93 - 712
Target Start/End: Original strand, 24515337 - 24515956
Alignment:
Q  93 gatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || || || |    
T  24515337 gatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaaacaga 24515436  T
Q  193 gattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccg 292  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  24515437 ggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaa 24515536  T
Q  293 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcat 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| |||||||||||     
T  24515537 agatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcac 24515636  T
Q  393 atcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagag 492  Q
    ||||||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||| || |||||| || ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||    
T  24515637 atcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagag 24515736  T
Q  493 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24515737 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggt 24515836  T
Q  593 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  24515837 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 24515936  T
Q  693 agagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  24515937 agagactttgaagtcgatct 24515956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 10465696 - 10466380
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  10465696 atcaagagggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtga 10465795  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  10465796 tgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaa 10465895  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || ||||||    
T  10465896 gaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgt 10465995  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |    
T  10465996 ggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccga 10466095  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||| ||||| || || || |||||||  ||||   |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466096 agaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 10466195  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10466196 tttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 10466295  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  10466296 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttg 10466380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 703
Target Start/End: Original strand, 19486149 - 19486827
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19486149 gggccattggttatcagaagattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgagtga 19486248  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||| ||   ||| || || ||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  19486249 gcggaggaacaaaggccagcaaggtcgttcgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 19486348  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| | |||||   ||    
T  19486349 gatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaaga 19486448  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||| || ||  |||  || || |||| ||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||     
T  19486449 aagggcatacgatagcggaatgcaagcatggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 19486548  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  | ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486549 tcaggcaggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 19486648  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||   |||||||||||||||    
T  19486649 gttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttg 19486748  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19486749 aaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 19486827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Original strand, 21566839 - 21567523
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  21566839 atcaagagggccattggctatcagaagatcaggactttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtga 21566938  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  ||||||||    
T  21566939 tgagtgagcggaggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaa 21567038  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  21567039 gaggagagatgctcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 21567138  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   |  |||| || || ||||||||  |||| || ||||| |    
T  21567139 ggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaa 21567238  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |    ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21567239 agaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactta 21567338  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  21567339 ttcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatg 21567438  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  21567439 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 21567523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24367836 - 24367184
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||     
T  24367836 gacatcaagagagccattggatatcagcagatcagagtcttctatgagttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaaga 24367737  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  24367736 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 24367637  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  24367636 caagaggagagatgctcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 24367537  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||  ||||  |  | |    
T  24367536 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgccctgaac 24367437  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||   ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367436 cgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 24367337  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |||    
T  24367336 tcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaa 24367237  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367236 atggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtct 24367184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 34642430 - 34643119
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||   ||||||| ||| |||| || || || || |||||||| ||| | |  |||||||||||||    
T  34642430 gacatcaagagggccattggctatcaaaagatcagaactctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaagggctcattacaagg 34642529  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||  || || |||||  || |||||||||| | ||| ||    
T  34642530 tgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgaaaggagacc 34642629  T
Q  215 c-aagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
    | ||| | |||||  ||||| | || || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  34642630 ccaagggaagagacactcctgcggagatagtttgctttaagtgtggcgagaagggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcag 34642729  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||| | ||| || |||   |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  |||| || ||     
T  34642730 gtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaa 34642829  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || |||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34642830 ccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 34642929  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  34642930 tccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggaga 34643029  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| || |||||    
T  34643030 aatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttga 34643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15462772 - 15462084
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15462772 gacatcaagagagccattggatatcagaagatcaggattttctcggagttggtgagtagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagctcattacaagg 15462673  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||||   ||    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||| |  |||    
T  15462672 tgatgagtgagaagaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctaacaaaggcaaacagagattgaatgatgagaggcagcc 15462573  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |   |||||||  |||||  |||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||| || |||||     
T  15462572 tagagggagagagactcctgttgatgttgtgtgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccagagatgagaagaaatgtttcaga 15462473  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    || |||| |||||| ||    || | ||| || ||||| || || || || || || ||||     ||||| || || || |||||| |||| ||||| |    
T  15462472 tgcggtcagaaaggtcatgtgttggctgagtgcaagcggggagatatcgtgtgttataactgtggtgaggagggccacattagttcgcagtgcacgcaac 15462373  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    |||||||||| || || || || || || ||||| |||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462372 ctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 15462273  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15462272 tcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaa 15462173  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  15462172 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagagattttga 15462084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Original strand, 23085096 - 23085358
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||| || | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  23085096 gtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactg 23085195  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||   | | ||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23085196 gtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 23085295  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  23085296 ttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 23085358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405464
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  18405460 gtttg 18405464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081184
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23081189  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  23081188 gtttg 23081184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 443 - 703
Target Start/End: Original strand, 30678297 - 30678557
Alignment:
Q  443 gtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggt 542  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  30678297 gtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgt 30678396  T
Q  543 gctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 642  Q
    ||||| | |||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30678397 gctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtt 30678496  T
Q  643 cagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
      || ||||||||||| || ||||| |  |||   ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30678497 tggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttga 30678557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 489 - 703
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182900
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | |||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgct 18182885  T
Q  689 tggtagagactttga 703  Q
    |||| |||| |||||    
T  18182886 tggtcgagattttga 18182900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 8720553 - 8720846
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | |    
T  8720553 atcaaaagggctattggttatcagaagataaggaacttttccgagttggtgagtagctgtaggatatatgaggaggataccaaagctcactacaagatta 8720652  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
     ||  ||||| ||   |||||| |||||  |||||  ||| || || ||||| ||||   |||| ||  | | ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8720653 ggaacgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacctagattgaatgatgagaggaggcctaa 8720752  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  8720753 gaggagagatgatcctgatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 8720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 537 - 693
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010977
Alignment:
Q  537 actggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 636  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  637 agggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggta 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggta 20010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16814073 - 16813780
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |    
T  16814073 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttccgagttggtgagtagctacatgatatatgaggaggataccaaagctcactataagatta 16813974  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
     || |||||| ||   |||||| |||||  |||||  ||| || || ||||| ||||   |||| ||  | || |||||||||||||||| ||| || ||    
T  16813973 ggaatgagcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacagagattgaatgatgagaggagacctaa 16813874  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 311  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  16813873 gaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 16813780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 652
Target Start/End: Original strand, 5836544 - 5836710
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||    
T  5836544 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgg 5836643  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 652  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5836644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 29589755 - 29589961
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29589755 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29589854  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  29589855 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29589954  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  29589955 gtttggt 29589961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 22436834 - 22436662
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22436834 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22436735  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22436734 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 2872118 - 2872324
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  2872118 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 2872217  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  2872218 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 2872317  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  2872318 gtttggt 2872324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574649
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16574656  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16574655 gtttggt 16574649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620731
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16620724  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16620725 gtttggt 16620731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925162
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctat 16925155  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  16925156 gtttggt 16925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559491
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 27559484  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  27559485 gtttggt 27559491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 24293098 - 24293304
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24293098 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24293197  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24293198 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24293297  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  24293298 gtttggt 24293304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 512 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867446
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||| || ||| | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 19867446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260719
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28260712  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  28260713 gtttggt 28260719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285197
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28285204  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  28285203 gtttggt 28285197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339468
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28339461  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  28339462 gtttggt 28339468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19881829 - 19881588
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  19881829 atcaagagggccattggttatcagaagatcagaactctttccgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtga 19881730  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||   |||||||| || ||||||||||  || || |||||  || ||||||||||||  || |||||    
T  19881729 tgagtgaacggaggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaa 19881630  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 259  Q
    | | |||||  ||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  19881629 gggaagagacactcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 19881588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 30677872 - 30678141
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  |  | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |    
T  30677872 atcaagcgggccattggatatcagaagatccgtcaattttctgaattagtgagcagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctaattacaaggtta 30677971  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || || ||| | || |||| ||||   ||||| || |  || |||||||| ||  ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |     
T  30677972 tgagtgagcggaggggtaagagtcagcagaatcgtccaaagccttacaacgctcctgctgataaatgtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctag 30678071  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30678072 aaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaagtgtggtgagaagagccacaagagtaatgtttgt 30678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 28312595 - 28312423
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   ||||    
T  28312595 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgg 28312496  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28312495 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23081856 - 23081587
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||  | || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |      
T  23081856 atcaagcgggcaattggttaccagaagattcgtaccttttctgagctagtgagcagttgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattg 23081757  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | || ||| || || |||||||||   ||||| || |||||  ||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| | |||| |     
T  23081756 tgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctgctgataaaggaaagcaaagagttaatgatgagaggcggcctag 23081657  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    || || ||||||||||  ||| ||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23081656 gaagaaagatgctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 23081587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 658
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115311
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 25115318  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  25115317 gtttggt 25115311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18660352 - 18660083
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  18660352 atcaagagggtcattggatattagaagatccgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggctg 18660253  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | | ||| ||| | || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| | | |||||    
T  18660252 tgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtgagcagagggttaatgatgagaggggacccaa 18660153  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||| |||   |||||||||  ||||||||| |   ||||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  18660152 gaggaaagagaatcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagagaaatgtcacaagagtaatgcttgt 18660083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 5836139 - 5836239
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5836139 aggatttacgaagaggataccaaagctcactacaagactgtgaatgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgcccctgctg 5836238  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  5836239 a 5836239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 281
Target Start/End: Original strand, 25958636 - 25958864
Alignment:
Q  53 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 152  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |  |||  |||   ||||| || || || || ||||||    
T  25958636 cttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactagagctcactacaagatagtgaaagagaagagaggaaaagggcagcaaagtcgt 25958735  T
Q  153 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 252  Q
       ||||| |||||||| | || |||| | ||  |||| ||| || ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25958736 ccaaagccttatagtgctcttgttgacgaaggggagcaaagactggatgatgagaggagacctaagagtagagatgctcctactgagattgtttgctaca 25958835  T
Q  253 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 281  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  25958836 ggtgtggtaagaaaggccacaggagtaat 25958864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 20010346 - 20010645
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  20010346 gacatcaagagagccattggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataagg 20010445  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||| |||   ||    ||||| ||    |||||   |||||| || ||||| ||| || |||| || || || |||||||||||||||| |  |||    
T  20010446 tgatgagcgagaaaaggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcc 20010545  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgt-ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||    
T  20010546 taaggggagaaatgctcctgttgatgttgtattgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcag 20010645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 553
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 553  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21765038 - 21764976
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21765038 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 21764976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 114
Target Start/End: Original strand, 23084680 - 23084769
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23084680 gggccattgggtattagaagatccgtaatttttctgaactggtgagcagttgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 23084769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 2871713 - 2871813
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||    
T  2871713 aggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctg 2871812  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  2871813 a 2871813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22437249 - 22437207
Alignment:
Q  71 cagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22437249 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 22437207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Original strand, 22829351 - 22829397
Alignment:
Q  132 ggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  22829351 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 22829397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 27559044 - 27559086
Alignment:
Q  245 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27559044 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 27559086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100914
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 16100914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 98286 - 98974
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  98286 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaagg 98385  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  98386 taatgagtgaaaggagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgctcatgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 98485  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||    
T  98486 caagtggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcagg 98585  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||||||| |||| || ||||    
T  98586 tgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagc 98685  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  98686 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtac 98785  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  98786 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaa 98885  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  98886 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttga 98974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 176578 - 175892
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  176578 gggccattggctaccaaaagataaggaacttttatgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 176479  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||| | ||| || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  176478 gcgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgccaacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 176379  T
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  176378 gatgctcctacagagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaaga 176279  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | ||| | ||||||     
T  176278 aaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggc 176179  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  176178 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaatt 176080  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  176079 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttg 175980  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  175979 aaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatct 175892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 1625
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  2317 atcaagcgggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattagtaagcagctgtagaatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtga 2218  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||  ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||    
T  2217 tgagtgagcgcagaggtaagggatagtagagtcgtccgaaaccgt-tagtgcttctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaa 2119  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2118 gaggtgagatgctcctactgaaattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgt 2019  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| || |   | || || || ||||| || ||| |||| | | |||| |    
T  2018 ggacagaaaggacatactttagctgattgtaagcgtggg-atgttgtatgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagccca 1920  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1919 agaagtttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcc 1820  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  1819 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatg 1720  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1719 gttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 1655 - 2343
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||  | | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1655 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagcagcatgatatatgaagaagatactaaagctcattacaagg 1754  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||||||    
T  1755 tgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcc 1854  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1855 caagaggatagatgctcctgctgaaattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 1954  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  1955 tgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaac 2054  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | |||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2055 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtat 2154  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2155 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggat 2254  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagagactttga 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 70958 - 70285
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   |    
T  70958 attgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtatgatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaaga 70859  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |    ||||| ||    |||||   |||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||    
T  70858 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacattgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgc 70759  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||     
T  70758 tcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgcggtcataaaggt 70659  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    ||    || | ||| || |||||||| || |||||||| || ||||  || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||||||||| || |    
T  70658 catgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggccacattagttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaa 70559  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    | || || || || |||| ||||||| |||||||  |    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70558 ctggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 70459  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  70458 tatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaact 70359  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  70358 ctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 70285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 401
Target Start/End: Original strand, 11609 - 11995
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| | ||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  11609 gacatcaagagagccatagggtatcaaaagattaaaattttctctgatttggtaagcagctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataagg 11708  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  11709 tgatgagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagagacttaatgatgagaggaggcc 11808  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  11809 caagaggagagatgctcctactgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagg 11908  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 401  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11909 tgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatcagttcg 11995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 30086 - 29440
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  30086 tctgatttggtgagtagttgtagaatctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccga 29987  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  29986 aaccgtctagtgctcctgctgacaaaggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagatagtctatttcaagtg 29887  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||  ||| ||| || ||||||||     
T  29886 tggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggt 29787  T
Q  357 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactc 456  Q
    ||  ||||||||||||| |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||     
T  29786 gatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactg 29687  T
Q  457 gtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 556  Q
    |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29686 gtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgttt 29587  T
Q  557 cattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 656  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29586 cattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttca 29487  T
Q  657 cttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29486 cttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8527
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||| || || |  || ||||| ||||| |||||| |||||||  |||    
T  9215 gacatcaagagagccattgggtaccagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagtagctgcataatctatgaggaggacacgaaatctcattattagg 9116  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |   ||||||||||||  || ||    
T  9115 tgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagctgaatgatgagagaagacc 9016  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||    
T  9015 caagaggagagatgctcctgatgagattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcagg 8916  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || || |    
T  8915 tgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatcagttcgcagtgcactcaac 8816  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815 cgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 8716  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8715 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaa 8616  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttga 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 264 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12640
Alignment:
Q  264 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattg 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  13079 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgacgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttg 12980  T
Q  364 tttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgca 463  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12979 tttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgca 12880  T
Q  464 atcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 563  Q
    | | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12879 aacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 12780  T
Q  564 gttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12779 gttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 12680  T
Q  664 gtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12679 gtttaagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 12640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 20727
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || || || || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21400 attggctatcagaagataagaaatttctccgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 21301  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
     ||||||||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21300 aaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 21201  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    | || |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  21200 ttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaaggga 21101  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||| ||||| || | |||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |    
T  21100 cacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggagggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaa 21001  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21000 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 20901  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20900 tatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaact 20801  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20800 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 193 - 878
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  193 atcaagagagccattggctatcagaagataagaatcttctctgatttggtgagtagttgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtga 292  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  293 tgagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcaccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcagatattgaatgatgagaggaggcccaa 392  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtg 316  Q
     ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  393 taggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaaatgtggcaggaaaggccacaagagtgatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcaggtg 491  T
Q  317 tggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcct 416  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || |||||     
T  492 tggtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacagccg 591  T
Q  417 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 516  Q
    ||||||||||| || | ||| || |||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  592 aagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 691  T
Q  517 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaat 616  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || |||||||||||| ||||| |     ||||||||||||||||||||||    
T  692 ctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaat 791  T
Q  617 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  792 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttga 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 39038 - 39723
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  39038 gacatcaagagagccattgggtaccagaagattagaa--ttttctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcattacaagg 39135  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  39136 tgatgagtgaacgaagaggtaagggacagcagagtcttcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc 39235  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39236 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 39335  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||      
T  39336 tgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatcagttcgcagtgtacacaat 39435  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39436 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 39535  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  39536 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 39635  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  39636 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 39723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 541 - 703
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44818
Alignment:
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 44818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4839
Alignment:
Q  448 ctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 547  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  548 tcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 647  Q
     |||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| | ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4983 acattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagta 4884  T
Q  648 actacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||    
T  4883 actacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggt 4839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14382
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |  | |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14753
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  14884 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatatgcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaagt 14785  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14784 gtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt 14753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5513 - 5244
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  5513 atcaagcgggcaattggttactagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcaattgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 5414  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| ||  |||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||| |||||| |     
T  5413 tgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacggtgctcctgctgataagggcaaacaaagagttaatgatgagatgaggcctag 5314  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || ||||| |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5313 aaagaaagatgttgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 5244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 180563 - 180648
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 121  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  180563 tatcagaagatcagaattttctcagaaatggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 180648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Original strand, 990 - 1663
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  990 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 1089  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1090 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 1189  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  1190 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 1289  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| || ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  1290 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 1389  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1390 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1489  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1490 tatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaact 1589  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 ccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 9477 - 10163
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||  |||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  9477 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaatcttctctgagttggtgagtagctgcaggat--atgaggaggatactaaggctctttacaagg 9574  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |   || || |||||||| | |||||| || || ||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  9575 tgatgagtgaacgaagaggtaaaggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcttgctgataagggaaagcaaaggatgaatgatgagaggaggcc 9674  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||    
T  9675 aaacaggagagatgctcctgctgatattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcagg 9774  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |    
T  9775 tgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataagttcacaatgtacgcaac 9874  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9875 cgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtac 9974  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9975 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaa 10074  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  10075 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttga 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24323
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || | || ||||  ||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  24319 gtttg 24323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Original strand, 23686 - 23742
Alignment:
Q  53 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcatta 109  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23686 cttttctgagctggtaagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcatta 23742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 703
Target Start/End: Original strand, 28003 - 28676
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28003 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 28102  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28103 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 28202  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  28203 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 28302  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| || ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  28303 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 28402  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28403 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 28502  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28503 tatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaact 28602  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28603 ccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 28676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 701
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5598
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || | ||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  4912 gacatcaagagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcatgatatatgaggaagacactaaagctcattacaagg 5011  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| || ||| |  ||||||||   || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||||| |||||| | ||||    
T  5012 tgatgagtgaacgaagaggtaaaggaaagtagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaaggctgaataatgagaggtggcc 5111  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     | |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||    
T  5112 taggaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcagg 5211  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  | |    
T  5212 tgtggtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacataac 5311  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5312 cgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 5411  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5412 tcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaa 5511  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5512 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagacttt 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 712
Target Start/End: Original strand, 8165 - 8862
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  8165 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaagg 8264  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  8265 tgatgagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacc 8364  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||    
T  8365 caagaggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcag 8463  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||||||| |||| |  ||     
T  8464 gtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaa 8563  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 8663  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8664 atcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 8763  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8764 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 8862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 712
Target Start/End: Original strand, 18379 - 19076
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  18379 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaagg 18478  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  18479 tgatgagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacc 18578  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||    
T  18579 caagaggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcag 18677  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||||||| |||| |  ||     
T  18678 gtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaa 18777  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 18877  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878 atcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 18977  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18978 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 19076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 7618 - 6953
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 135  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  7618 tatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagca 7519  T
Q  136 agggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 235  Q
    | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7518 aaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgc 7419  T
Q  236 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 335  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7418 tgagattgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 7319  T
Q  336 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 435  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||   | || || || ||||| || ||| | || | | |||| |||||| ||||||| ||||    
T  7318 ctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtg 7219  T
Q  436 gcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 535  Q
    | || ||||||||| | ||| | |||||| |    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7218 gtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 7119  T
Q  536 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 635  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7118 cactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagct 7019  T
Q  636 aagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7018 aagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacttt 6953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 58 - 3
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaag 70  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  58 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaag 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6200 - 5506
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6200 atcaagcgggccattggttatcaaaagataaggaatttctcggatttggtaagcagctttagaatatatgaagaggatacgaaagctcattataaagtga 6101  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |   |||||||||||| |||||| |     
T  6100 tgagtgagcgcagaggtaagggtcagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagatgctgaatgatgagaggaggcctag 6001  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||| |||| ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||    
T  6000 gaggagagatgcccctaatgagactgtctatttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagataagaagaagtgtttcagatgt 5901  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    || | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || || |   | || || || || || || |||||||| | | | ||||    
T  5900 ggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattagctcgtagtgcaagaaaccta 5801  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5800 agaaggttcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 5701  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  5700 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatg 5601  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5600 gttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatct 5506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 490
Target Start/End: Original strand, 62478 - 62950
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  62478 atcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtga 62577  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  62578 tgagtgagcgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaa 62677  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  62678 gaggagagatgctcctactgatattgtttaattcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgt 62777  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  62778 ggtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagccta 62877  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcag 490  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  62878 agaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 225 - 703
Target Start/End: Original strand, 65211 - 65689
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 324  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  65211 gatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcaga 65310  T
Q  325 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 424  Q
    |||||||||| || | | |||||||| | || ||  ||||||| || || |   | |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||||||||    
T  65311 aaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggt 65410  T
Q  425 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 524  Q
    |||||| ||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  65411 taggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaatt 65510  T
Q  525 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 624  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65511 gctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 65610  T
Q  625 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | || |||||||||||||| |||||    
T  65611 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagagattttga 65689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 65028 - 65214
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  65028 atcaagagagccattggttatcagaaaatcagaaatttctctgagttggtgagtagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtga 65127  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatg 204  Q
    |||||||| | ||    || ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||    
T  65128 tgagtgagagaaggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcccctgctgataagggcaagcagagactgaatgatg 65214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 63 - 702
Target Start/End: Original strand, 30077 - 30716
Alignment:
Q  63 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 162  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || | ||||||||| | || || |||||| |||||| ||||   || || |    
T  30077 ttggtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaacctt 30176  T
Q  163 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 262  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || |   |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30177 acagtgctcctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtga 30276  T
Q  263 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 362  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||   ||||| ||| ||| || || |||||||||  |||||||||||   ||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  30277 aaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagataagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacatt 30376  T
Q  363 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgc 462  Q
    || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  30377 gtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 30476  T
Q  463 aatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 562  Q
    |  ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  30477 agacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattga 30576  T
Q  563 tgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 662  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30577 tattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 30676  T
Q  663 tgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30677 tgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 30716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 701
Target Start/End: Original strand, 164107 - 164790
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  164107 atcaagagagccattgggtatcagaagatcagaattttctccgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtga 164206  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||   ||  | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  164207 tgagtgaacgaagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgcccctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaa 164306  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
     |||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||    
T  164307 taggagagacgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaaggatgagaagaagtgtttcaggtgt 164406  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||||||| | | ||| ||||| |    
T  164407 ggtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatcagttcgcattatactcagccga 164506  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  ||||| |  |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164507 agaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 164606  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  164607 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatg 164706  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 701  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  164707 gttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctatgtttggtagggacttt 164790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 690
Target Start/End: Original strand, 47155 - 47360
Alignment:
Q  484 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 583  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||    
T  47155 ttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagtt 47254  T
Q  584 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 683  Q
    ||||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  47255 gggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtct 47353  T
Q  684 atgtttg 690  Q
    |||||||    
T  47354 atgtttg 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 512 - 658
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30920
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 578 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 152119 - 152007
Alignment:
Q  578 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtcta 677  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||      
T  152119 taagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct 152020  T
Q  678 ttgtctatgtttg 690  Q
    |||||||||||||    
T  152019 ttgtctatgtttg 152007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 30487 - 30549
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  30487 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 30549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 54648 - 53962
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  54648 gacatcaaaagagccattgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattataagg 54549  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  54548 tgatgagtgatcgaaggagcaaaggacatcagagtcgtccaaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggttgaatgatgagaggaggcc 54449  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| ||  || |||||| | |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||    
T  54448 caatagatgaaatgctcttgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcagg 54349  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || ||||||||||| ||   ||| || || |    
T  54348 tgtggtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagctcacggtgcacacaac 54249  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | || |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54248 cgaaaaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 54149  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54148 tcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaa 54049  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54048 atggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacttt 53962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 10891
Alignment:
Q  29 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 128  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  11564 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 11465  T
Q  129 agaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 228  Q
    || || ||||| || |||| ||||   ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  11464 aggggtaagggtcagcagattcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagattttgaatgatgataggagtcctaagaggagagatg 11365  T
Q  229 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 328  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11364 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 11265  T
Q  329 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 428  Q
    |||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  11264 acacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctagg 11165  T
Q  429 acaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 528  Q
    || || || ||||||||||| |||||| |||||||  |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11164 accggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgcta 11065  T
Q  529 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaac 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11064 ttatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaac 10965  T
Q  629 tccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||   | |||||||||||||| |||||||    
T  10964 tccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagggactttg 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 560
Target Start/End: Original strand, 575 - 1125
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  575 gacatcaagagagccattggctatcagagaataaggaacttctctaaattggtaaccagctgtaggatttatgaggaggacacgaaatctcattacaagg 674  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  675 tgatgagtgaatgtagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtactcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcc 774  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  775 caagaggagagatgctcctatggatattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatg 874  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcata-----tcagttcgtagtgtac 409  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |     |||||||| |||||||    
T  875 tgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcacatcagttcagttcgcagtgtac 974  T
Q  410 gcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaat 509  Q
     || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  975 acaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaat 1074  T
Q  510 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 560  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1075 aatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 252217 - 251536
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  252217 atcaaaagagctattaggtatcagaagattagaattttctctgaattggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtga 252118  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| | ||||   || || || ||||| ||||||| ||  || || ||||   |||||||||| | |||||||||    
T  252117 tgagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgccacaggaaaacataagatgaatgatgataggaggcccaa 252018  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||   ||||||||| ||| || || ||||||    
T  252017 gaggagagatgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagctatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgt 251918  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||      
T  251917 ggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagcc-- 251820  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
     ||||| |||||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  251819 -gaaggctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttc 251721  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  251720 tttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatg 251621  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  251620 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 229765 - 229827
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  229765 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 553
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 553  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 22723 - 22035
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||    
T  22723 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattatatgg 22624  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||  |||||| |   || || || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||    
T  22623 tgatgagtgggcgaaggggtaagggacagtagagtcttcctaaaccatacagtgcccctgccgacaaaggaaatcaaagactgaatgatgagaggaggcc 22524  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| |||||||     
T  22523 caataggagagatgctcctgttgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttttt-actaaggatgagaagaaatgcttcaa 22425  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || |||    
T  22424 gtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacag 22325  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || | ||| |  |||||||| |||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324 ccgaagaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 22225  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22224 ctcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggaga 22125  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22124 aatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttga 22035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 275 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 11873
Alignment:
Q  275 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaac 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12301 gagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaac 12202  T
Q  375 ttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatg 474  Q
    |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  12201 tgtaatgaagaaggacatattagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatg 12102  T
Q  475 aggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 12002  T
Q  575 atataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgt 674  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12001 atataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgt 11902  T
Q  675 ctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11901 ccgttgtctatgtttggtagatactttga 11873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 12322
Alignment:
Q  139 gacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactga 238  Q
    |||| |||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12421 gacagcagagtcgtccgaaatcgtatagtgctcctgctgacaaagataaacagaggctgaatgatgagaggaggccttagaggagagatgctcctactga 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 702
Target Start/End: Original strand, 514068 - 514743
Alignment:
Q  27 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 126  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  514068 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 514167  T
Q  127 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 226  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  514168 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 514267  T
Q  227 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 326  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||     
T  514268 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 514367  T
Q  327 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 426  Q
    |||||||  |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  514368 ggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggtta 514467  T
Q  427 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 526  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514468 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 514567  T
Q  527 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 626  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  514568 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 514667  T
Q  627 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  514668 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 514743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 510 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441572
Alignment:
Q  510 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaag 609  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  610 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagaga 441572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 444 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495939
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
     || |||||||||||||| | | |||| |||   ||||||||||||||| ||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgaga 495939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 442238 - 442154
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  442238 attgggtatcataagattcgtaacttttctgaactggtgagcagctgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 442154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 171 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 326151 - 325620
Alignment:
Q  171 cctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcc 270  Q
    |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||    
T  326151 cctgctaacaagggtaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc-aataggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgagaaagacc 326053  T
Q  271 acaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgcta 370  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  ||||||| ||    
T  326052 acaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgtta 325953  T
Q  371 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtg 470  Q
     |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |        
T  325952 taactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccact 325853  T
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  325852 agtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 325753  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  325752 gtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 325653  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  325652 atgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 325620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 173 - 703
Target Start/End: Original strand, 200338 - 200859
Alignment:
Q  173 tgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 272  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  200338 tgctgacaaagggaagtaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagaagttcctaatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccac 200437  T
Q  273 aagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctaca 372  Q
    ||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||    
T  200438 aagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttca 200537  T
Q  373 acttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaa 472  Q
    | |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||         ||| |||||||  | || ||    
T  200538 attgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagagggttcaggcaggtggaaaggtg---------actggtacgcagacggttaa 200628  T
Q  473 tgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 572  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  200629 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgt 200728  T
Q  573 gcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagtt 672  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  200729 gcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgattt 200828  T
Q  673 gtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  200829 gtctgttgtctatgtttggtagagattttga 200859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 319844 - 319507
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  319844 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataaagaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatttatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 319745  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  319744 tgataagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaggataagcagaggctgaatgatgagaggaggcc 319645  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  319644 caataggagagatgctcctgctgggattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 319545  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 352  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  319544 tgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcg 319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 375
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || ||||||   |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  1062 gacatcaaaagagctattcagtatcagcagatcagaatcttctctgagttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 963  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | |  |||| |||||| | ||||||    
T  962 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcc 863  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  862 taagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcagg 763  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    || |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||  ||||| |  | |    
T  762 tgcggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataagttcacagtgtcctgaac 663  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  662 cgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 563  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  562 tcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaa 463  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  462 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6035 - 5562
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6035 atcaagagggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggtga 5936  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  5935 tgagtgagcgcagaggtaagggacaacatagtcgtccgaagccgtatag---ccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcttaa 5839  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5838 gaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 5739  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5738 ggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccta 5639  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggt 494  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5638 agaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 489 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2775
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  689 tggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2798 tggtagagactttgaagtcgatct 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 537
Target Start/End: Original strand, 11484 - 11968
Alignment:
Q  53 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 152  Q
    |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||    
T  11484 cttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgt 11583  T
Q  153 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 252  Q
       ||||| || | ||| | ||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | || |||||||||||||||||| ||   ||| ||||| || | ||    
T  11584 cctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaagcccaagaggagagatgcaccagatgagattgtatgataca 11683  T
Q  253 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 352  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||  | |||||    
T  11684 agtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcg 11783  T
Q  353 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttg 452  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |  ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11784 tggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttg 11883  T
Q  453 actcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 537  Q
    ||| |||||||| |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11884 actggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 165 - 702
Target Start/End: Original strand, 4998 - 5535
Alignment:
Q  165 agtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaa 264  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||    
T  4998 agtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttaaaagagtgatgaaa 5097  T
Q  265 aaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgt 364  Q
    |||||||||| |  |||| |||||   || |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5098 aaggccacaaaaacaatgcttgtggtagaaatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgt 5197  T
Q  365 ttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 464  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||     
T  5198 ctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcag 5297  T
Q  465 tcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctg 564  Q
     |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5298 actacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcta 5397  T
Q  565 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 664  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5398 ttgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 5497  T
Q  665 tctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
      | || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5498 cttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttg 5535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 263785 - 263139
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  263785 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagttcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtctta 263686  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  263685 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 263586  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  263585 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 263487  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||||| |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  263486 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 263387  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     |||||||  |    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  263386 ggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 263287  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263286 tcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 263187  T
Q  656 tcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  263186 tcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 263139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 52249 - 51716
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  52249 atcaagcgggctattggttatcaaaagataaggaatatttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaggctcattataaagtga 52150  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||| |     
T  52149 tgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagccgtccgaaactgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctag 52050  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52049 gaggagagatgctcctactgagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 51950  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| ||| ||||   | || |||||| |||| |||||  ||||||||||||| |    
T  51949 ggtaagaaaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatattagttcacagtgtacgcagccaa 51850  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51849 agaaggttcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcc 51750  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51749 tttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 57 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 203940 - 203294
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  203940 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 203841  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  203840 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctggtgagatagtttgttttaagtg 203741  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  203740 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 203642  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||||| |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  203641 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 203542  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     |||||||  |    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  203541 ggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 203442  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||| | ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203441 tcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 203342  T
Q  656 tcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  203341 tcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 341 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 424583 - 424266
Alignment:
Q  341 tgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaag 440  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||    |||   ||| | |    
T  424583 tgattgcaagcgtgaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacatcagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagg 424484  T
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    || |||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  424483 gtttttgctttgacttgtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactg 424384  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||    |||||||  | |   ||| |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  424383 gtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 424284  T
Q  641 ttcagtaactacttctct 658  Q
    ||| || |||||||||||    
T  424283 ttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 424840 - 424746
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| || ||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||    
T  424840 tatgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacaatgcccctgctga 424746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17235 - 16761
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17235 atcaagagggctattggctatcaatagataaggaatttttctgaattggtaagcagatgtagaatatatgaagagaataccaaagctcattacaaggtga 17136  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||| ||    
T  17135 tgagtgagcgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaagggtaagcagaaactgaatgatgagaggaggcctaa 17036  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17035 gaggagagatgctcctactgagattatttgtttcaagtgtggagagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgt 16936  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  16935 ggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagacta 16836  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagag 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16835 agaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 548
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7098
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctact 548  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctact 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 222 - 703
Target Start/End: Original strand, 764 - 1245
Alignment:
Q  222 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 321  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  764 agagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcaagaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 863  T
Q  322 ggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaa 421  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||  |||||||||| || | |||    
T  864 agaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaa 963  T
Q  422 ggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 521  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |    | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  964 ggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 1063  T
Q  522 attgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttg 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1064 attgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttg 1163  T
Q  622 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1164 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3920
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3754 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaagg 3853  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaa 181  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3854 tgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaa 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 63 - 703
Target Start/End: Original strand, 9538 - 10177
Alignment:
Q  63 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 162  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  9538 ttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgt 9637  T
Q  163 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 262  Q
    | |||||||||||||| || |||||||  ||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||    
T  9638 acagtgcccctgctgataagggtaagctgagacttaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcga 9737  T
Q  263 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacat 361  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |    
T  9738 gaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgt 9836  T
Q  362 tgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacg 461  Q
    ||| || || |||| |||||| ||  | ||||||||| |  |||| || | ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  9837 tgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacg 9936  T
Q  462 caatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattg 561  Q
    ||  |    |||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9937 cagactactaatgatatagg-cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattg 10035  T
Q  562 ctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 661  Q
    || | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10036 ctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgt 10135  T
Q  662 ttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  10136 ttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 10177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42336 - 41684
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| | |  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  42336 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcaaagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataaga 42237  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  42236 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 42137  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  42136 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 42037  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  42036 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagc 41937  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||  ||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41936 cgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 41837  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||    
T  41836 tcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaa 41737  T
Q  615 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41736 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 41684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 63 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 40611 - 39972
Alignment:
Q  63 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgt 162  Q
    ||||||||  |||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||    
T  40611 ttggtaagtcgttgcagaatctataaagaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtatgggacaacagagtcgtcctaaaccgt 40512  T
Q  163 atagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 262  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  |||||||| ||    
T  40511 acagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggcga 40412  T
Q  263 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||  ||||| |||||| | ||  ||    
T  40411 gaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgtt 40312  T
Q  363 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgc 462  Q
    || || || |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  40311 gtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgc 40212  T
Q  463 aatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 562  Q
    |  |    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  40211 agactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgc 40112  T
Q  563 tgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 662  Q
    | | ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  40111 tttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtc 40012  T
Q  663 tgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  40011 tgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttg 39972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17726
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||  |  |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtc-cttgtctat 17721  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  17722 gtttg 17726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 624
Target Start/End: Original strand, 8724 - 9333
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  8724 gacatcaagagagccattgggtatcagaaggttagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcatgacaagg 8823  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | |||||||| || ||||| || ||| | |||||| || | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  8824 ttatgagtgaacgaagaggtaaaggatagcagagttgtcataaaccatatagtgctcctgcagacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc 8923  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||    
T  8924 caagaggagagatgcttctgctaagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaagccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcagg 9023  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||      
T  9024 tgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaa 9123  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124 cgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 9223  T
Q  515 tcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  9224 tcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaa 9323  T
Q  615 atggttgttg 624  Q
    ||||||||||    
T  9324 atggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 702
Target Start/End: Original strand, 17215 - 17874
Alignment:
Q  43 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 142  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17215 agattagaatcttctctgatttggtaaatcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 17314  T
Q  143 acagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 242  Q
     |||||||||   || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  17315 gcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaaacaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 17414  T
Q  243 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 341  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||| ||||      
T  17415 gtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcg 17513  T
Q  342 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 441  Q
    ||||  | |||||| ||  |||| || ||||| | |||||| || || ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||      
T  17514 gattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaa 17613  T
Q  442 tgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 541  Q
    |||||||||||||| |||||||  |    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17614 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattgg 17713  T
Q  542 tgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 641  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17714 tgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggt 17813  T
Q  642 tcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17814 tcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagagattttg 17874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 84 - 702
Target Start/End: Original strand, 4621 - 5239
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 183  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| |||||||||  |||||| |    
T  4621 tatgaggaggacacaaaacctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgccccttttgacaagg 4720  T
Q  184 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 283  Q
    | ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4721 gaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccaaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggccagaaaggccacaagagtaatgt 4820  T
Q  284 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 383  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||||    
T  4821 ttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgag 4920  T
Q  384 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 483  Q
    || || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||   |||||  |    ||||||||| | |    
T  4921 gagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtc 5020  T
Q  484 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  5021 ttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagtt 5120  T
Q  584 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 683  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||    
T  5121 gggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtct 5220  T
Q  684 atgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5221 atgtttggtagagattttg 5239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Original strand, 251 - 936
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || || || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  251 atcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtga 350  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |  ||||||||||||  || |||||    
T  351 tgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtccccctgctgacaagggaaagcaacggctgaatgatgagagaagacccaa 450  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  451 gaggagagatgctcctactgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgt 550  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||| |||||||||||| || | | | || ||| |    ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| |    
T  551 ggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggaatgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaa 650  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  651 agaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 750  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  751 tttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatg 850  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| || |||||    
T  851 gttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttga 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10710
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||| |||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10716 gtttggt 10710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 57 - 661
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6606
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaga 156  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  6002 tctgatttggtaagtcattgcaggatttatgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 6101  T
Q  157 agccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||    
T  6102 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgtcgagatagtttgttttaagtg 6201  T
Q  257 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    ||| |||||||||||||||    
T  6202 tggcgagaaaggccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtgg 6300  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     || ||||| ||||| || |  |||||  | || || |||||| |  |||| || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6301 cgatattgtatgctataattgtaacgaatagggccacatcagtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgact 6400  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     |||| ||  |    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6401 ggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtt 6500  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||| | ||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6501 tcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttc 6600  T
Q  656 tcttgt 661  Q
    ||||||    
T  6601 tcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 703
Target Start/End: Original strand, 53126 - 53814
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||    
T  53126 gacatcaagagagccattgggtatcaaaagattagaatcttctcggatttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagacaccaaggctcattataagg 53225  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| ||   ||||   || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  53226 tgatgagtgagcgaagagataagggacatcaagttcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcc 53325  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgag-atgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||| ||||||||||||| | |||  || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| || |||||    
T  53326 caataggagagatgctcttgctgggatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgattcag 53424  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcag 413  Q
    ||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||| ||| | || || || ||||  || || || || |||||||||||  | || ||  ||    
T  53425 gtgtggtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagagggccatatcagttcacaatgcacatag 53524  T
Q  414 cctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 513  Q
    || ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53525 ccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagta 53624  T
Q  514 ctcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaga 613  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  53625 ctcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggaga 53724  T
Q  614 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53725 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttga 53814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 66817 - 67498
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||   || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||    
T  66817 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtgttctctgatttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatga 66916  T
Q  121 gtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagag 220  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||| |||||| || ||| | |   |||||||||| | ||| ||||||||    
T  66917 gtgagaggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgttgacaaaggaaagtagatgatgaatgatgataggagacccaagag 67016  T
Q  221 gagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggt 320  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| ||| || ||||||||||||    
T  67017 gagagatgctccttccgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagacatgagaggaaatgtttcaggtgtggt 67116  T
Q  321 cggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaaga 420  Q
    |  || |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| | ||||   |||| ||||    
T  67117 caaaagggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgtagtgagccgaaga 67216  T
Q  421 aggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 520  Q
     |||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||  |    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67217 gggttagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttt 67316  T
Q  521 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 620  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  67317 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggtt 67416  T
Q  621 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  67417 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 154093 - 153699
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  154093 gacatcaagagagccattggttatcagaagattagaaacttctctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggagacgaaagctcattacaagg 153994  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||| |||| |  ||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  153993 tgatgggtgaacaaagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcc 153894  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  153893 caagaggagagatgctcccactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaagccataagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagg 153794  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtac 409  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  153793 tgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcacattagttcgcagtgtac 153699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 417 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 151766 - 151480
Alignment:
Q  417 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 516  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  151766 aagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactc 151667  T
Q  517 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaat 616  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  151666 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaat 151567  T
Q  617 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  151566 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattga 151480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 486 - 703
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23924
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  686 gtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  23907 gtttggtcgagattttga 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 556
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 556  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 556
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 556  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 559
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 559  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 240 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 30310 - 29848
Alignment:
Q  240 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 339  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||   |||    
T  30310 attgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgtggtagagatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctag 30211  T
Q  340 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaa 439  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  30210 ctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaa 30111  T
Q  440 ggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 539  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30110 ggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatact 30011  T
Q  540 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30010 ggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 29911  T
Q  640 gttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  29910 gttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 29848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30511 - 30336
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  30511 gacatcaatagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaga 30412  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagca 190  Q
      ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  30411 caatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagca 30336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Original strand, 4160 - 4496
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4160 atcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaa-ctcattacaaggtga 4258  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  4259 tgagtgaacgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtacactgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaa 4358  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4359 gaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgt 4458  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4459 ggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtgg 4496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17446
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 17439  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  17440 gtttggt 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 489 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24220
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||  |  || |||| ||    
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || |  ||||  ||||| |||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtt 24234  T
Q  689 tggtagagactttg 702  Q
    ||||||||| ||||    
T  24233 tggtagagattttg 24220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 512 - 691
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195217
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  |||||||| ||| | ||||||||||  |||    
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttgg 691  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttgg 195217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 532
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1707
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  1193 atcaaaagagctatagggtatcagaagatcagagtcttctctgagttggtaagcagctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtga 1292  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || || || | | |||||||||| | |||||||||    
T  1293 tgagtgagaggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaa 1392  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| || ||| || || ||||||    
T  1393 gaggagagatgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgtgaggaaatgttttaggtgt 1492  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  ||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1493 ggttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccga 1592  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||| ||||| || || || |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593 agaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 1692  T
Q  518 tttaattgctattat 532  Q
    |||||||||||||||    
T  1693 tttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 99 - 469
Target Start/End: Original strand, 71 - 441
Alignment:
Q  99 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  71 aaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtaaaatgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaa 170  T
Q  199 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 298  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  171 atgatgagaggaggcccaagagcagagaggctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatga 270  T
Q  299 gaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagt 398  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  271 gaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagt 370  T
Q  399 tcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagt 469  Q
    ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  371 tcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 596
Target Start/End: Original strand, 1555 - 2132
Alignment:
Q  19 tcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgat 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  1555 tcaagagggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgat 1654  T
Q  119 gagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaag 218  Q
    ||||||||| || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||  |||||||||    
T  1655 gagtgagcggaggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaag 1754  T
Q  219 aggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 318  Q
    |||||||||||| || |||| ||  |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1755 aggagagatgctactgctgaaataatttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtg 1854  T
Q  319 gtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaa 418  Q
    ||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| ||    
T  1855 gtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcccagtgcactcagccaaa 1954  T
Q  419 gaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 518  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||  | |  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1955 gaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 2054  T
Q  519 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 596  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||    
T  2055 ttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtttgattgta 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 5608 - 5888
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5608 atcaagagggctattggttatcagaaaataataaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtga 5707  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5708 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccaa 5807  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5808 gaggagagatgctcctactgatattgtttattacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 5888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 471 - 703
Target Start/End: Original strand, 14 - 246
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 113  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  114 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataag 213  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  214 atgtacgttgtctatgtttggtagagactttga 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 403 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 496
Alignment:
Q  403 agtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgttt 502  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    | | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  796 agtgtacacaaccgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgttt 697  T
Q  503 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgat 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  696 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgat 597  T
Q  603 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  596 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 497  T
Q  703 a 703  Q
    |    
T  496 a 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 798
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  1105 gacatcaagagagccattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggataataaggctcattacaagg 1006  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1005 tgatgagtgagcgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc 906  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||    
T  905 taagaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggctagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtacttcagg 806  T
Q  315 tgtggtcg 322  Q
    ||||||||    
T  805 tgtggtcg 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 240 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 12173 - 11723
Alignment:
Q  240 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 339  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  12173 attgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttag 12074  T
Q  340 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaa 439  Q
     ||| || ||||||||||||||| | || ||||||| ||| | |            |||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| ||    
T  12073 ctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaactgcaatggg------------agttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaa 11986  T
Q  440 ggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 539  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11985 ggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 11886  T
Q  540 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11885 ggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 11786  T
Q  640 gttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 702  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  11785 gttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 466 - 703
Target Start/End: Original strand, 20682 - 20919
Alignment:
Q  466 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 565  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 20781  T
Q  566 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20782 tgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20881  T
Q  666 ctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20882 ctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 466 - 703
Target Start/End: Original strand, 12502 - 12739
Alignment:
Q  466 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 565  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12502 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 12601  T
Q  566 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12602 tgattgtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12701  T
Q  666 ctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12702 ctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 12120 - 12506
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12120 atcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtga 12219  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  12220 tgagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaa 12319  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||    ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||    
T  12320 gaggagagatgagggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgt 12417  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtg 406  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12418 gctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 20300 - 20686
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20300 atcaagagagccattggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtga 20399  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  20400 tgagtgatcgtagaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaa 20499  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
    |||||||||||    ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||    
T  20500 gaggagagatgagggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgt 20597  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtg 406  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20598 gctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 116222 - 115934
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  116222 atcaagagggctattggttatcagaaaataagaaatttctctgatttggtaagcagctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtga 116123  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  116122 tgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagactgaatgatgagaggaggcctaa 116023  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  116022 gaggagggatgctcctactgatattgtttgtttcatgtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagt 115934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 499 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110523
Alignment:
Q  499 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  599 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagac 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 110528  T
Q  699 tttga 703  Q
    |||||    
T  110527 tttga 110523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 537
Target Start/End: Original strand, 1310 - 1832
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||      
T  1310 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagataagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaca 1409  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||| |||||| | ||||||    
T  1410 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcataagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcc 1509  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  1510 taagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcagg 1609  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  | |    
T  1610 tgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcccgaac 1709  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 514  Q
    | ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1710 cgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtac 1809  T
Q  515 tcctttaattgctattatagata 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  1810 tcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 156 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 116022 - 115513
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    |||||||| || ||||||||||  || || |||||  || ||||||||||||  ||||||||| | |||||  ||||| |||| || ||||| || ||||    
T  116022 aagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagggaagagacactcctgctgaaatagtttgctttaagt 115923  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| ||||||||    
T  115922 gtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtgg 115823  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     || || || ||||| || | ||| | ||| ||||||||||||||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||    
T  115822 tgatatagtatgctataattgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggct 115723  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     ||| |||| |    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  115722 ggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtt 115623  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||| | || |||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  115622 tcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttc 115523  T
Q  656 tcttgtttgt 665  Q
    ||||||||||    
T  115522 tcttgtttgt 115513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 387 - 703
Target Start/End: Original strand, 93969 - 94285
Alignment:
Q  387 ggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggactta 486  Q
    ||||| || |||||| |||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||||||  |    ||||||||  ||||||    
T  93969 ggtcacattagttcgcagtgcactcaacctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgactta 94068  T
Q  487 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  94069 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg 94168  T
Q  587 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatg 686  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  94169 tctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatg 94268  T
Q  687 tttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||| |||||    
T  94269 tttggtagagattttga 94285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 93618 - 93703
Alignment:
Q  36 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgag 121  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  93618 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 93703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 107543 - 107643
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||    
T  107543 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 107642  T
Q  178 a 178  Q
    |    
T  107643 a 107643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 483 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1033
Alignment:
Q  483 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  583 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtc 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtc 1054  T
Q  683 tatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1053 tatgtttggtagagactttga 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5654 - 5205
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5654 gacatcaagagaaccattgggtatcagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaagg 5555  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||||| ||||||    
T  5554 tgatgagtgaacgaagaggtaaaggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgataagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcc 5455  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5454 cacgaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgcggcgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcagg 5355  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  5354 tgtggttagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcaac 5255  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 464  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5254 cgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 230 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12214 - 11743
Alignment:
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 329  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  | |||||||| ||||||||  | |||||   ||||||     
T  12214 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtgatgagaaaaagtgctttcgatgtgggaagaaaggg 12115  T
Q  330 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 429  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  12114 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaga 12015  T
Q  430 caggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 529  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12014 caggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 11915  T
Q  530 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 629  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11914 tatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaact 11817  T
Q  630 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11816 ccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttga 11743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 222 - 703
Target Start/End: Original strand, 3999 - 4480
Alignment:
Q  222 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||      
T  3999 agagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtttggtgaaaagggaaacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagatgtgtttcctgtgtggga 4098  T
Q  322 ggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaa 421  Q
     |||| |||||||  ||| ||| || || | ||| |||||||| || | ||| |   | || ||||||||| | || ||| | |  | | ||||||||||    
T  4099 agaaaagacacacaatagctgagtgcaaacatggagacattgtctgtttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatccaggaagcctaagaa 4198  T
Q  422 ggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 521  Q
    || |  |||| |||| ||||||||| | |||||  ||||     | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199 ggctcagacaagtggaaaggtgttttcattgaccggtacatggacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 4298  T
Q  522 attgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttg 621  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||   |||||  |||||||||||||    
T  4299 attgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttg 4398  T
Q  622 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4399 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttga 4480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 574 - 775
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  574 gggctattggctaccaaaagataaggaatttttcttaattagtgagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcac-ataaggtgatgagtga 672  T
Q  125 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 224  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  673 gtgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtacagtgctcctgctgacaaaggtaaatagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 772  T
Q  225 gat 227  Q
    |||    
T  773 gat 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 245 - 569
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  245 gacatcaagagagccattggttatcagaagattaaaaacttctctgatttggtaagcagttgcaggatttatgaggaggacaggaaagctcattacaagg 344  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||  |||||    
T  345 tgatgagtaaacgtagaggtaagggacagcacagtcgtccgaagccgtatagtgctccttctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagagaaggcc 444  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  445 caagaggagagatgctcctatagatattgtttgtttcaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatgagaagaagtgcttcagg 544  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttag 339  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  545 tgtggtcagaaaggacacacattag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 471 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 15036
Alignment:
Q  471 aatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 570  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 15169  T
Q  571 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15168 gtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaag 15069  T
Q  671 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15068 gtgtccattgtctatgtttcgtagagattttga 15036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15673 - 15288
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15673 gacatcaagagagccattgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggaaacgaaagctcattacaagg 15574  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||||| || |   |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || || |||||||||| ||||||    
T  15573 tgatgagtgatcgaatgagcaaaggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagcgaaagcagaggttaaatgatgagaggaggcc 15474  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||| | || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  15473 caataggagagatgctcctgctgagattttctgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggacgagaagaagtgcttcag 15375  T
Q  314 gtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttc 400  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || |||||||||||    
T  15374 gtgtggtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttc 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 441 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6288 - 6032
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6288 gtgtttggtttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 6189  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
     |||||| |||||||| | |||| || ||||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  6188 atgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaaggg 6089  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  6088 ttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgaga 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3463 - 3222
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3463 atcaagagggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtacctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtga 3364  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3363 tgagtgagcgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaa 3264  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3263 gaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtgg 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 481 - 698
Target Start/End: Original strand, 9396 - 9613
Alignment:
Q  481 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||    
T  9396 gacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataa 9495  T
Q  581 gttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  9496 gttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttg 9595  T
Q  681 tctatgtttggtagagac 698  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9596 tctatgtttggtagagac 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 156 - 697
Target Start/End: Original strand, 3736 - 4274
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||  ||| |||||||| | |||||    
T  3736 aagccctatagtgctcctgctgacaaggggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgtttctgttgagattgtttgctacaagt 3835  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 355  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || ||  |  ||| ||| || ||||||||    
T  3836 gtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtgg 3935  T
Q  356 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgact 455  Q
     || ||||||| || ||| |   |  | ||||||||| | |  ||| | || | | |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  3936 tgatattgtttacttcaattgtgataaagaaggtcatcttaactcgcaatgcatgaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgacc 4035  T
Q  456 cgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 555  Q
     |||| ||  | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  4036 ggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtt 4132  T
Q  556 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4133 tcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactta 4232  T
Q  656 tcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4233 tcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 505 - 658
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7754
Alignment:
Q  237 gatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7704 gatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 7754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 2783
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3226 gacatcaagagagccattgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaagg 3127  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||||| ||      ||||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||    
T  3126 tgatgtgt------agaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcc 3033  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  3032 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagttcttcagg 2933  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagc 414  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||| | || |    
T  2932 tgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaac 2833  T
Q  415 ctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaa 464  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2832 cgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49277
Alignment:
Q  521 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 620  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  621 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttgatgtccatct 712  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatct 49277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 529
Target Start/End: Original strand, 518 - 1020
Alignment:
Q  27 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 126  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||| | |||||| ||     
T  518 gctattgggtatcagcagattagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagtttattacaagataatgagttaga 617  T
Q  127 gtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 226  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||  |||||| || ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  618 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctattgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 717  T
Q  227 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 326  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  718 tgctccttctgagattgtttgttacaagtttggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaag 817  T
Q  327 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 426  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  || |||||||| |||||| ||||| |  | || ||||||||||    
T  818 ggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatattagttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggtta 917  T
Q  427 ggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 526  Q
    | ||  | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  918 gaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgc 1017  T
Q  527 tat 529  Q
    |||    
T  1018 tat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 481 - 665
Target Start/End: Original strand, 3 - 187
Alignment:
Q  481 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  3 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataa 102  T
Q  581 gttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  103 gttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 366 - 605
Target Start/End: Original strand, 19023 - 19262
Alignment:
Q  366 tgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaat 465  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||     
T  19023 tgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaa 19122  T
Q  466 cagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 565  Q
    |    | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19123 ccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctat 19222  T
Q  566 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 605  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19223 tgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 33078 - 33337
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  33078 atcaaaagagctattgggtatcaaaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtga 33177  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||    
T  33178 tgagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaa 33277  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 277  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278 gaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 33337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 396
Target Start/End: Original strand, 23626 - 24007
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||| ||||||| |||     
T  23626 gacatcaaaagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataaga 23725  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   ||  |||||| | ||||||    
T  23726 ttatgagtgagaggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcc 23825  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcagg 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  23826 caagaggagagatgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcagg 23925  T
Q  315 tgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 396  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  23926 tgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggggaaggtcatatca 24007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 6786
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  7471 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 7372  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | ||||||| | || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |     
T  7371 tgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctag 7272  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
     | || ||||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    | || | |||  |||||||  | |||    
T  7271 aaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgt 7172  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  |||||| || ||  | | ||| ||||||| ||  ||  |||| || | ||| | ||| ||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||    
T  7171 ggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaagcatgatgatgttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagccta 7072  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||    |||   ||| |  || |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||    
T  7071 agaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcc 6972  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||||||||    
T  6971 tttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatg 6872  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6871 gttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 6786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 14601 - 13916
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  14601 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 14502  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | ||||||| | || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |     
T  14501 tgaatgagcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctag 14402  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgt 317  Q
     | || ||||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    | || | |||  |||||||  | |||    
T  14401 aaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgt 14302  T
Q  318 ggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccta 417  Q
    |||  |||||| || ||  | | ||| ||||||| ||  ||  |||| || | ||| | ||| ||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||    
T  14301 ggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaagcatgatgatgttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagccta 14202  T
Q  418 agaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 517  Q
    ||||||    |||   ||| |  || |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||    
T  14201 agaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcc 14102  T
Q  518 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 617  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||||||||    
T  14101 tttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatg 14002  T
Q  618 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14001 gttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 13916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 384 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 5320 - 5001
Alignment:
Q  384 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggac 483  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||| |   ||  |||| || ||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||| |      
T  5320 gaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggt 5221  T
Q  484 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 583  Q
    | || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  5220 tgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagtt 5121  T
Q  584 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 683  Q
    |||||| ||| | |   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  |||||     
T  5120 gggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcg 5021  T
Q  684 atgtttggtagagactttga 703  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  5020 atgtttggtcgagactttga 5001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5589
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5686 atcaagtgggccattggatatcagaagatccgtgacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 5589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 1007 - 1305
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||     
T  1007 gacattaagagagctattgggtatcagcagatcagattcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaaga 1106  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    | ||||||||| | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||    
T  1107 taatgagtgagaggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacc 1206  T
Q  215 caagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  1207 caagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcag 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 489 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17791
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 17806  T
Q  689 tggtagagactttga 703  Q
    |||| ||||||||||    
T  17805 tggtcgagactttga 17791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 670
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111265
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 670  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| ||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaag 111265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18443 - 18174
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | ||||||| |||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       
T  18443 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttttgagctggtgagtagttgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctg 18344  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||| | | ||| || || ||  | ||||||   ||||| || | ||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |     
T  18343 tgaatgagaggaaaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagccttacaatgctcctgctgataagggtaagcaaagagttaatgatgagaggaggccaag 18244  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || ||||||| || |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18243 aaagaaagatgctactgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 18174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 441 - 697
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13864
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||  |  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13608 gtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattg 13707  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
     |||||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  13708 atgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagag 13807  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13808 ttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgaga 13864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 287
Target Start/End: Original strand, 13213 - 13449
Alignment:
Q  51 aacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtc 150  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||| |||| ||||  ||| |||| | | ||||||||| || || |||     
T  13213 aacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcgttacgaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtt 13312  T
Q  151 gttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgttt 250  Q
    ||   ||| | |  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||| |  |||||| |||||||| |     
T  13313 gtccaaagtcttgcagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgttgttactgagattgtttgcta 13412  T
Q  251 caagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  13413 cacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 13449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 9828 - 9922
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaa 112  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9828 atcaagcgggcaattggatatcagaagatccgtaactttactgaattagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 521 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21802
Alignment:
Q  521 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 620  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  621 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 21802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 570 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26158 - 26025
Alignment:
Q  570 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 669  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26158 tgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 26059  T
Q  670 gttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26058 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 444 - 703
Target Start/End: Original strand, 23430 - 23689
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||  || | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||    
T  23430 tttgctttgactggtacgaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtg 23529  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||| | | | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23530 ctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23629  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     |  |||||||||||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  23630 ggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttga 23689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9742
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   || |||||||||  || | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  9480 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 9579  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||     | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9580 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 9679  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  9680 ttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 9742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9326
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  9195 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 9294  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9295 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9153
Alignment:
Q  29 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  9068 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 9153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4360
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  4364 gtttg 4360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 632  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 444 - 703
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14657
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||||||   |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14597  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     || |||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14598 ggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 14657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 441 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26527 - 26265
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  26527 gtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattg 26428  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26427 gtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 26328  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  26327 ttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttga 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 512 - 692
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37200
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||| |||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggt 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26950 - 26853
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||  | || ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26950 atcaagagggccattggatataaaaagattcgtaaattttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaatatacgaaagctcattacaaggt 26853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 441 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8336
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8585 gtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 8486  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 640  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8485 gtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaaggg 8386  T
Q  641 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
    ||| || |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||    
T  8385 ttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 570 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1132
Alignment:
Q  570 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  1257 tgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggt--------tacttctcttgtttgtctaa 1166  T
Q  670 gttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1165 gatgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 695
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15362
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 695  Q
     || ||||||||| | || ||| |||| | ||  || |||||||||||||||    
T  15311 ggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtaga 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 703
Target Start/End: Original strand, 57746 - 58005
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||   |  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  57746 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 57845  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||| ||||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  57846 ctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 57945  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  57946 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 58005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 57320 - 57589
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  57320 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 57419  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | |||||| || || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |     
T  57420 tgaatgagcggaaaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctag 57519  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || ||||||||||  ||| |||||||  |  |  ||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  57520 aaagaaagatgctcctgttgagattgtttactatacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgt 57589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 444 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15335
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  || | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||            ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttc 15395  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
     || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| | ||||| |||| |||||    
T  15394 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttga 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15996 - 15739
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||| | |    
T  15996 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagttggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagga 15897  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 229  Q
     |||||||   |  || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||| | |||||||||| | ||||||  | || |||||     
T  15896 aaggcaagtttccgcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggcaaacaaagagttaatgatgagaggcggcccagcaagaaagatgt 15797  T
Q  230 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15796 tgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 15739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36422
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 36429  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  36428 gtttggt 36422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36827
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || || || |||||||| |    
T  36958 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagatcgtctgtttcaatt 36859  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36858 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 36827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 697
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216805
Alignment:
Q  444 tttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 543  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||   | | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  544 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||| | |  ||||| ||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  216652 ctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttc 216751  T
Q  644 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 697  Q
     || |||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  216752 ggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgaga 216805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 216126 - 216395
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  || | |||||||| |  || |||||  ||||||| || ||||||||||||||      
T  216126 atcaagtgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctgctgagcagttgcataatatatgagaaggatactaaggctcattacaaggttg 216225  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||| |     
T  216226 tgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgataaaaggaggcctag 216325  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
     | || ||||| |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  216326 aaagaaagatgatgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 216395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 552 - 756
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 751  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  752 gtttg 756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 130 - 179
Alignment:
Q  64 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaag 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  130 tggtgagcagttgcaggatttatgatgaggatactaaggctcattacaag 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2641
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||||   ||||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgg 2536  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  2537 gtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 2636  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  2637 gtttg 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1915
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 1920  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  1919 gtttg 1915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2575 - 2427
Alignment:
Q  30 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 129  Q
    |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  2575 attggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaa 2476  T
Q  130 gaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
      | |||||| ||||||||||||   ||||| || ||||||| ||||||    
T  2475 aggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccttgctga 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55848
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctat 55843  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  55844 gtttg 55848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48293 - 48059
Alignment:
Q  53 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 152  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  48293 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 48194  T
Q  153 tagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 252  Q
       ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  48193 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 48094  T
Q  253 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48093 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 48059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 486 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 1959
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||   ||||||||    
T  2129 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 2030  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 656  Q
    ||||  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2029 gtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11258
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 11253  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  11254 gtttg 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 507 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 13997
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatga 606  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||| | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  607 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   |||||||| |||| | | ||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttga 13997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11291
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  586 gtct 589  Q
    ||||    
T  11294 gtct 11291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8149
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    | || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8154  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  8153 gtttg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 486 - 661
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 661  Q
    |||| ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 287
Target Start/End: Original strand, 16351 - 16584
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||     
T  16351 ttttctgaattggtgagaagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtc 16450  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
      ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||    
T  16451 caaagccttatagtgctcctgctgataaaggtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaa 16550  T
Q  254 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16551 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 16584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 543
Target Start/End: Original strand, 16738 - 16840
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16738 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactg 16837  T
Q  541 gtg 543  Q
    |||    
T  16838 gtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 540 - 703
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21576
Alignment:
Q  540 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 639  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||| || ||| | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  640 gttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 703  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  || || ||||||||| ||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttga 21576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 489 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 104354 - 104153
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  104354 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtc 104255  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
      ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  104254 ctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 104155  T
Q  689 tg 690  Q
    ||    
T  104154 tg 104153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 104824 - 104561
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |      
T  104824 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattg 104725  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    ||| |||||| | || ||| || || |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||| |||||||| | |||| |     
T  104724 tgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctag 104625  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 281  Q
     | || ||||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  104624 aaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaat 104561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8117
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8112  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  8113 gtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10538
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||   | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10531  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10532 gtttggt 10538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 10071 - 10133
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10071 gatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29308
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 29301  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  29302 gtttggt 29308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22377 - 22171
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22377 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22278  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22277 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22178  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  22177 gtttggt 22171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8119 - 7911
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 153  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  8119 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 8020  T
Q  154 agaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 253  Q
     |||||| || ||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  8019 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaa 7920  T
Q  254 gtgtggtga 262  Q
    |||||||||    
T  7919 gtgtggtga 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1132
Alignment:
Q  187 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 286  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1368 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 1269  T
Q  287 tgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaa 386  Q
      |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   ||||  ||    
T  1268 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaataa 1169  T
Q  387 ggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 423  Q
    |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  1168 ggtcatctcagttcacagtgtaagaagcctaagaagg 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14873
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 14942  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 654  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14941 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15463 - 15349
Alignment:
Q  64 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgta 163  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||    ||||| ||    
T  15463 tggtgagcagttgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagcctta 15364  T
Q  164 tagtgcccctgctga 178  Q
    |||||||||||||||    
T  15363 tagtgcccctgctga 15349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54563
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    ||||  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctat 54568  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  54567 gtttg 54563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 487 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31807
Alignment:
Q  487 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 586  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| | |||||||| | |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  587 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatg 686  Q
    ||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatg 31813  T
Q  687 tttggt 692  Q
    ||||||    
T  31812 tttggt 31807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 487 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37307
Alignment:
Q  487 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 586  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| | |||||||| | |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  587 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    ||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10584
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || | |||||||  | |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13239
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||   | | |||||||  | |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 10152 - 10214
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10152 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 10214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 12807 - 12869
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12807 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 12869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7194
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  7366 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 7267  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7266 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41558
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  41562 gtttg 41558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75278
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  75282 gtttg 75278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 512 - 692
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35095
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | |||||||| | ||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 35095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 942
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 604  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  605 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 656  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 8876
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||   ||||||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgg 8981  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8980 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8881  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  8880 gtttg 8876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 516 - 690
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25090
Alignment:
Q  516 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 615  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   |||||  ||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  616 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttg 25090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2363 - 2198
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 183  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2363 tatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctactgacaaag 2264  T
Q  184 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtt 249  Q
    | ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2263 gaaagcaaaggttgaatgatgagaggaggcggaataggagagatgctcctgctgagatagtttgtt 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 486 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3524
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 3582  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 643  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3581 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18576
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18681  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  18680 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 18581  T
Q  686 gtttg 690  Q
    |||||    
T  18580 gtttg 18576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 488 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17861
Alignment:
Q  488 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggt 587  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||  | |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  588 ctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgt 687  Q
    || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 17866  T
Q  688 ttggt 692  Q
    |||||    
T  17865 ttggt 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11393
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||  | |   |||     
T  11599 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttga 11500  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11499 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11400  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  11399 gtttggt 11393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 55134 - 55058
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 562  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55134 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 624 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53651
Alignment:
Q  624 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 512 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 1
Alignment:
Q  512 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 611  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||| | ||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  612 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 655  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 369
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  431 gatgttcctgctgagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 541
Alignment:
Q  57 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  599 tctgagttggtgagcagttgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaaggt 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 592 - 703
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3561
Alignment:
Q  592 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttgg 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttgg 3549  T
Q  692 tagagactttga 703  Q
    ||| || |||||    
T  3550 tagggattttga 3561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 508 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4509
Alignment:
Q  508 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 607  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||   |||||||||||| | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  608 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||  |||  |||||||||||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttg 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10498 - 10292
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10498 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10399  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10398 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10299  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  10298 gtttggt 10292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8182
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| || |   || |    
T  8388 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttag 8289  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |   |||||  ||||||||    
T  8288 gtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctat 8189  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  8188 gtttggt 8182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 3554 - 3348
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  3554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 3455  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  3454 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 3355  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  3354 gtttggt 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17118
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17620 - 17489
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  17620 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacatagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaatt 17521  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17520 gtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3953 - 3859
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||    
T  3953 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 3859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 748 - 850
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  748 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 847  T
Q  125 gcg 127  Q
    |||    
T  848 gcg 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 167 - 1
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  167 gacatcaagagagccataggttatcagaagattagaaatttttctgaattggtaagcagcagtaggatttatgaagaggatacgagagctcactataagg 68  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaa 181  Q
    | | || |||||| ||   |||||| || ||  |||||  |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  67 ttaggaatgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccgaagccctatagtgctcctgttgacaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26051 - 25949
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26051 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 25952  T
Q  125 gcg 127  Q
    |||    
T  25951 gcg 25949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13470
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41079
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgg 41186  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  41185 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 41086  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  41085 gtttggt 41079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 13037 - 13099
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13037 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 441 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 11203 - 11072
Alignment:
Q  441 gtgtttgctttgactcgtacgcaatcagtgaatgaggacggacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  |  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11203 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactg 11104  T
Q  541 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 572  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11103 gtactactcattgttttattgctattgattgt 11072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11626 - 11466
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||      
T  11626 atcaagcgggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttg 11527  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctga 178  Q
    ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  11526 tgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctgctga 11466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 319
Target Start/End: Original strand, 996 - 1237
Alignment:
Q  78 aggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctg 177  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || |||||||||||||| ||||    
T  996 aggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgaagagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccggctg 1095  T
Q  178 acaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 277  Q
    | || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | ||  | |||| || |||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  1096 ataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagaagggtgcttctgctgagatagtatgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagag 1195  T
Q  278 taatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 319  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1196 taacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 692
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1412
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| | || | ||  | ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 685  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 1405  T
Q  686 gtttggt 692  Q
    |||||||    
T  1406 gtttggt 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 658
Target Start/End: Original strand, 943 - 1115
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    |||| | | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 613 - 744
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||||||||  |||| |||  ||||||||| |    
T  613 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaatt 712  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  713 gtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 21734 - 21566
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21734 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21635  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 654  Q
    |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21634 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 486 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 37158 - 36990
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  37158 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 37059  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 654  Q
    |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37058 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 65
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 688  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| || ||| | || ||||  || ||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtt 69  T
Q  689 tggt 692  Q
    ||||    
T  68 tggt 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 654
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11698
Alignment:
Q  489 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 588  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  589 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 654  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactactt 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 11269 - 11331
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11269 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 14954 - 15016
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14954 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 658
Target Start/End: Original strand, 674 - 826
Alignment:
Q  506 taatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 605  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  606 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 658  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 240 - 455
Alignment:
Q  72 agttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgccc 171  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||| |||||    
T  240 agttgtagaatctatgaagaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatattgccc 339  T
Q  172 ctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 271  Q
    ||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  340 ctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctacggagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggcca 439  T
Q  272 caagagtaatgtttgt 287  Q
    |||||| |||||||||    
T  440 caagagcaatgtttgt 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 30741 - 30843
Alignment:
Q  25 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30741 gggccattggttatcagaggattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgtgtga 30840  T
Q  125 gcg 127  Q
    |||    
T  30841 gcg 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Original strand, 30895 - 31011
Alignment:
Q  194 attgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 293  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  |     
T  30895 attgaatgatgagaggagaactaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggt 30994  T
Q  294 gatgagaagaagtgctt 310  Q
    |||||||||||||||||    
T  30995 gatgagaagaagtgctt 31011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 1128 - 1397
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||       
T  1128 atcaagagggccgttggatatcagaagatcggtaacttttctaaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcatcacaaggctg 1227  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaa 217  Q
    |||||||| | | ||| ||| | ||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||| || ||| |||| ||  |||||||||||| | | |||||    
T  1228 tgagtgagaggaaaggtaagagtcaacagaatcgtccaaagccttacagtactcctgctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaggggacccaa 1327  T
Q  218 gaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||| |||   |||||||||  ||||||||| |   || || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1328 gaggaaagagaatcctactgaagttgtttgttaccgatgaggagagaaaggtcacaagagtaatggttgt 1397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 627
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15894
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 585  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgg 15852  T
Q  586 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 627  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15853 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 597 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3527
Alignment:
Q  597 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 690  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 3527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 20
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  |||| |||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||      
T  215 atcaagcgggcaattggttaccagaaaatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcaaaatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttg 116  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    ||| |||| | | ||||||||  || || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  115 tgaatgagaggaaaggcaaggt-cagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1364
Alignment:
Q  481 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1415 gacttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1704 - 1583
Alignment:
Q  192 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 291  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   ||    
T  1704 agattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgttaagggccacaagagtaatgcttgcaccc 1605  T
Q  292 gagatgagaagaagtgcttcag 313  Q
     |||||||||||| || |||||    
T  1604 aagatgagaagaaatgtttcag 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1771
Alignment:
Q  60 gaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgag 125  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  1836 gaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgag 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17834 - 17703
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatga 120  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||    
T  17834 aagagagctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatga 17735  T
Q  121 gtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 152  Q
    ||||| | || || |||||||| |||||||||    
T  17734 gtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgt 17703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36161
Alignment:
Q  199 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 283  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36245 atgatgagaggagacctaagagaagagatgcccctactaagattgtttgctacaggtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 36161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 562  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12587
Alignment:
Q  601 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 692  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 13757 - 13932
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaagg 114  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||     
T  13757 gacatcaagagagctattagatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaaga 13856  T
Q  115 tgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagca 190  Q
    | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  13857 taatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagca 13932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 486 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2907
Alignment:
Q  486 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 573  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtg 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 208
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  270 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2252
Alignment:
Q  54 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 115  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2313 ttttctgaattggtgagtagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggt 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 552
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  483 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 664 - 468
Alignment:
Q  18 atcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtga 117  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||       
T  664 atcaagatggccattggatatcaaaagatccgtaacttttctgaactggtgtgcagttgcagagtctatgaggaggatactaaagctcattacaaggctg 565  T
Q  118 tgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcc 214  Q
    |||||||| | | ||| ||||| || || |||||    ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  564 tgagtgagaggaaaggtaagggtcagcaaagtcgcccaaagccttacagcgctcctgctgataagggtaaacaaagagtgaatgatgagaggaggcc 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 117
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  248 aagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaatt 149  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  148 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21116
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30692
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 30692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 559  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 1252 - 1307
Alignment:
Q  15 gacatcaagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaag 70  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  1252 gacatcaagagagccattggttatcagaagattagaaacttctctgggttggtaag 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 445
Alignment:
Q  226 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 285  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  504 atgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5327
Alignment:
Q  84 tatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttagaagccgtatagtgcccctgctgacaacg 183  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||||||||| |||||| || |    
T  5530 tatgatgaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttgctgataagg 5431  T
Q  184 gtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 283  Q
    | || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  5430 gcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaagggccataagagtaatgt 5331  T
Q  284 ttgt 287  Q
    ||||    
T  5330 ttgt 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 287
Target Start/End: Original strand, 139454 - 139585
Alignment:
Q  156 aagccgtatagtgcccctgctgacaacggtaagcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||| ||||  |||| |||  ||| ||||| |    
T  139454 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatactccagctgagattacttgcttcaatt 139553  T
Q  256 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139554 gtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 139585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 179
Alignment:
Q  249 ttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  217 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Original strand, 13945 - 14007
Alignment:
Q  225 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13945 gatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 16232 - 16306
Alignment:
Q  21 aagagggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggat 95  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  16232 aagagagcaattggttaccagaagattcgaaacttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggat 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 171489 - 171447
Alignment:
Q  245 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 287  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171489 ttgttacaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 171447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  505 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 546  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Original strand, 4874 - 4967
Alignment:
Q  187 agcatagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 280  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||  ||||| |||| || ||||||| || ||||||||| || || |||||||||||    
T  4874 agcataggttgaatgacgagaggaggcccaagaaggaagagactcctgctgaaatagtttgttacaggtgtggtgagaagggtcacaagagtaa 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4142
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 552
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  507 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 552  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University