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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9077_high_20 (Length: 386)
Name: NF9077_high_20
Description: NF9077
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9077_high_20 |
 | |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0419 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0277 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0349 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27604539 - 27604191
Alignment:
| Q |
16 |
actacataaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttc |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27604539 |
actacataaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattacccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttt |
27604440 |
T |
|
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27604439 |
atttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattatgatgttg---- |
27604344 |
T |
|
| Q |
216 |
ttacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccctt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27604343 |
ttacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccctt |
27604244 |
T |
|
| Q |
316 |
acatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27604243 |
acatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27604191 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Original strand, 26802801 - 26803141
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttcatttac |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
26802801 |
taaatcctatttttcccttttatattttatttcttcaacttcaatttcccaataatctcatcttaaaggttaaatggga---aatacctttcttatatac |
26802897 |
T |
|
| Q |
122 |
gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacat |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
26802898 |
gtttttaaacaagtattagttatttatatgttgaaatagttagaaatgtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtgatgttgttagt-acat |
26802994 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26802995 |
actaacttatcttgttggacatgaatagatatgaatacaagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgt |
26803094 |
T |
|
| Q |
322 |
tgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26803095 |
tgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaat |
26803141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Original strand, 27679305 - 27679645
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttcatttac |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27679305 |
taaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaattttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggga---aataccttttttatatac |
27679401 |
T |
|
| Q |
122 |
gtttttaaacaagta---ttagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaatta |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27679402 |
agttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatgtataatacattcttagt--acatggatgtgattgtgatgttgttag--- |
27679496 |
T |
|
| Q |
219 |
catactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttaca |
318 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27679497 |
-acactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaca |
27679595 |
T |
|
| Q |
319 |
tgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27679596 |
tgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27679645 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27592848 - 27592508
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttcatttac |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27592848 |
taaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaattttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggga---aataccttttttatatac |
27592752 |
T |
|
| Q |
122 |
gtttttaaacaagta---ttagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaatta |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27592751 |
agttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatgtataatacattcttagt--acatggatgtgattgtgatgttgttag--- |
27592657 |
T |
|
| Q |
219 |
catactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttaca |
318 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
27592656 |
-acactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaa |
27592558 |
T |
|
| Q |
319 |
tgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27592557 |
tgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27592508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27427356 - 27427099
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtga |
206 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27427356 |
accttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtg- |
27427260 |
T |
|
| Q |
207 |
tgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcg |
306 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27427259 |
tgatgttg-ttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcg |
27427161 |
T |
|
| Q |
307 |
tcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27427160 |
acagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27427099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Original strand, 28786677 - 28786933
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtg |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786677 |
accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg |
28786774 |
T |
|
| Q |
206 |
atgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtc |
305 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786775 |
atgttgtta----catactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtc |
28786870 |
T |
|
| Q |
306 |
gtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786871 |
gtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
28786933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Original strand, 28792798 - 28793054
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtg |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28792798 |
accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg |
28792895 |
T |
|
| Q |
206 |
atgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtc |
305 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28792896 |
atgttgtta----catactaacttatcttatcggacattaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtc |
28792991 |
T |
|
| Q |
306 |
gtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28792992 |
gtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
28793054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27706230 - 27705891
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttcatttac |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27706230 |
taaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatttcacaataatctcatcttaaagtttaaaggg----aaataccttttttatatac |
27706135 |
T |
|
| Q |
122 |
gtttttaaacaagta---ttagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaatta |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27706134 |
agttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatgaataatacattcttagt--acatggatgtgattgggatgttgttag--- |
27706040 |
T |
|
| Q |
219 |
catactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttaca |
318 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
27706039 |
-acactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttaca |
27705941 |
T |
|
| Q |
319 |
tgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27705940 |
tgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27705891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27677442 - 27677107
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattaccctataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaatacctttttcatttac |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27677442 |
taaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatttcacaataatctcatcttaaaggttaaaaggga---aataccttttttatatac |
27677346 |
T |
|
| Q |
122 |
-gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattaca |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27677345 |
agttttaaaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatgtataatacatta-----gtacatggatgtgattgtgatgttgttag----a |
27677255 |
T |
|
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatg |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27677254 |
cactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatg |
27677155 |
T |
|
| Q |
321 |
ttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27677154 |
ttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaat |
27677107 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 116 - 368
Target Start/End: Original strand, 28781549 - 28781796
Alignment:
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgtta |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28781549 |
atttacgtttttaaacaattatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatgttgtta |
28781646 |
T |
|
| Q |
215 |
attacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccct |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28781647 |
----catactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcact |
28781742 |
T |
|
| Q |
315 |
tacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28781743 |
tacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaat |
28781796 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27698301 - 27698073
Alignment:
| Q |
134 |
gtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacatactaacttatct |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27698301 |
gtattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatttataatatattctgagt--acatagatgtgattgtgatgttgttt----catactaacttttct |
27698208 |
T |
|
| Q |
234 |
tattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcc |
333 |
Q |
| |
|
|| | |||| || ||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27698207 |
tactcgacacgagtagatatgaatacaagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccc |
27698108 |
T |
|
| Q |
334 |
cgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27698107 |
tgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaat |
27698073 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27718156 - 27717986
Alignment:
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194 |
gatgtgattgtgatgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctcca |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
27718156 |
gatgtgattgtgatgttgtca----catactaacttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctcca |
27718061 |
T |
|
| Q |
294 |
acaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27718060 |
acaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
27717986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27610782 - 27610607
Alignment:
| Q |
189 |
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288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| | || |
|
|
| T |
27610782 |
acatggatgtgattgtgatgttgtca----catactaacttatcttattgggcatgaatagatatgaatacgagtttactggagagatagtcaaatacat |
27610687 |
T |
|
| Q |
289 |
ctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27610686 |
ctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaat |
27610607 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27530936 - 27530789
Alignment:
| Q |
220 |
atactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacat |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
27530936 |
atactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagat |
27530837 |
T |
|
| Q |
320 |
gttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaa |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27530836 |
gttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaa |
27530789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 370
Target Start/End: Original strand, 26646932 - 26647176
Alignment:
| Q |
122 |
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221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| | | | |
|
|
| T |
26646932 |
gtttttaaacaagtataaattatttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattctcggt--acatcaatgtatttgtgatgttggtgcatg--t |
26647027 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
26647028 |
actaacttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgt |
26647127 |
T |
|
| Q |
322 |
tgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
||||| || || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
26647128 |
agccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattg |
26647176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 370
Target Start/End: Original strand, 26752900 - 26753144
Alignment:
| Q |
122 |
gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacat |
221 |
Q |
| |
|
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| T |
26752900 |
gtttttaaacaagtataaattatttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattctcggt--acatcaatgtatttgtgatgttggtgcatg--t |
26752995 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
26752996 |
actaacttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgt |
26753095 |
T |
|
| Q |
322 |
tgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
||||| || || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
26753096 |
agccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattg |
26753144 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 302
Target Start/End: Original strand, 25538997 - 25539172
Alignment:
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123 |
tttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacata |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || | ||| | |
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|
| T |
25538997 |
ttttaaaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaaattagaattgcataatatattctcaat--acatggatgtgattttgattttagt--ttatgtt |
25539092 |
T |
|
| Q |
223 |
ctaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25539093 |
ctaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatca |
25539172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 370
Target Start/End: Original strand, 31285108 - 31285256
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| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgt |
321 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
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|
| T |
31285108 |
actaacatatctagttgaacatgaacagatatgaatatgattttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgt |
31285207 |
T |
|
| Q |
322 |
tgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
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|
| T |
31285208 |
tgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattg |
31285256 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 302
Target Start/End: Original strand, 26143322 - 26143497
Alignment:
| Q |
123 |
tttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgtt-gttaattacat |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || || ||| | |
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|
| T |
26143322 |
ttttaaaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaagttagaattgcataatatattctcaat--acatggatgtgattttgattttagtgtatt---t |
26143416 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26143417 |
tctaatttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatca |
26143497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Original strand, 26623835 - 26623966
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| Q |
237 |
tggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || || || |
|
|
| T |
26623835 |
tggacatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgt |
26623934 |
T |
|
| Q |
337 |
tggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26623935 |
tggattacagtctcaactacaacaagtgaaat |
26623966 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Original strand, 26729812 - 26729943
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| Q |
237 |
tggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || || || |
|
|
| T |
26729812 |
tggacatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgt |
26729911 |
T |
|
| Q |
337 |
tggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26729912 |
tggattacagtctcaactacaacaagtgaaat |
26729943 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 370
Target Start/End: Original strand, 26656514 - 26656662
Alignment:
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatg |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
26656514 |
tactaacttatctc-ttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatg |
26656612 |
T |
|
| Q |
321 |
ttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26656613 |
ttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
26656662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 370
Target Start/End: Original strand, 26762485 - 26762633
Alignment:
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatg |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
26762485 |
tactaacttatctc-ttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatg |
26762583 |
T |
|
| Q |
321 |
ttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26762584 |
ttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
26762633 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 370
Target Start/End: Original strand, 26884621 - 26884767
Alignment:
| Q |
224 |
taacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttg |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||| |||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
26884621 |
taacttatcttattggacatgaatagatacgaatacgagtttatcgggaagatagtcgaagatatctccgacaaaatcaatcgtgttgttttacatgtag |
26884720 |
T |
|
| Q |
324 |
ccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
26884721 |
ccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattg |
26884767 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 302
Target Start/End: Original strand, 25483512 - 25483688
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| Q |
122 |
gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaat-taca |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| | || ||||||| ||||| || ||| ||| | || |
|
|
| T |
25483512 |
gttttaaaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaagttagaattgcatgatatattctcaatg--catggatatgattttg--gtt-ttagtgtatg |
25483606 |
T |
|
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| || | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25483607 |
ttctaacttatcttattggacatgaatagatatgaacacaagtttattgagaagatagtccaatacatctccaacaatatca |
25483688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Original strand, 25511488 - 25511567
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| Q |
223 |
ctaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25511488 |
ctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaagatca |
25511567 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 302
Target Start/End: Original strand, 25580272 - 25580351
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| Q |
223 |
ctaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25580272 |
ctaacttatcttattggacacgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
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Alignment:
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gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacat |
221 |
Q |
| |
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|
| T |
27214905 |
gtttttaaacaagtataagtgttttatatgtgaaaagggttagaattatataatacaatctcagt--acatggatctgatattgatgttggtgtatgca- |
27215001 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaaga |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
27215002 |
-ctaacttatcttattggacattaacagatatgaatacaagtttattgagaagatagttgaagacatctcaaacaaga |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 302
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gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacat |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | | | |||||||||||||| |||| | | || | |
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|
| T |
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T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26056471 |
tctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatca |
26056551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 302
Target Start/End: Original strand, 26076345 - 26076521
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122 |
gtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaattacat |
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Q |
| |
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|
| T |
26076345 |
gttttaaaactagtgtaagttatttatatgtcaaaaaagttagaattgcataatatattatcaat--acatggatgtgattttgattctagtg--tatgt |
26076440 |
T |
|
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatca |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26076441 |
tctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatca |
26076521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 352
Target Start/End: Original strand, 26937606 - 26937708
Alignment:
| Q |
250 |
atatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtct |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26937606 |
atatgaatatgagcttattggaaagatggttcaagaggtgtctaacaagatcaatcgtcctcctttacatgttgcggattaccccgttggactgcagtct |
26937705 |
T |
|
| Q |
350 |
cga |
352 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
26937706 |
cga |
26937708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 368
Target Start/End: Original strand, 26824370 - 26824514
Alignment:
| Q |
224 |
taacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttg |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| | | | | || ||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
26824370 |
taacttatcttattgggcaggaatggatatgaatacaagcgtattggtgagataatcagaaacgtcaccaaccagatcaatcgtgttagtttacatgttg |
26824469 |
T |
|
| Q |
324 |
ccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26824470 |
ccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaat |
26824514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27337728 - 27337681
Alignment:
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattg |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27337728 |
tactaacttatct-attggacatgaatagatatgagtacgagcttattg |
27337681 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27398468 - 27398421
Alignment:
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattg |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27398468 |
tactaacttatct-attggacatgaatagatatgagtacgagcttattg |
27398421 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 27531028 - 27530983
Alignment:
| Q |
22 |
taaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
67 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27531028 |
taaatcctatttttcccttttatattttctttctttaatttcaatt |
27530983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Original strand, 31284823 - 31284876
Alignment:
| Q |
225 |
aacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatag |
278 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
31284823 |
aacttatcttgttgggcatgaatagatatgaatacaagcttactgggaagatag |
31284876 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Original strand, 26862142 - 26862189
Alignment:
| Q |
232 |
cttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagt |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26862142 |
cttattggacgtgaatagatatgaatatgagtttattgggaagatagt |
26862189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492804
Alignment:
| Q |
314 |
ttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25492860 |
ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattg |
25492804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Original strand, 60007 - 60264
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtga |
206 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60007 |
accttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtg- |
60103 |
T |
|
| Q |
207 |
tgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcg |
306 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60104 |
tgatgttg-ttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcg |
60202 |
T |
|
| Q |
307 |
tcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60203 |
acagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
60264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Original strand, 18074199 - 18074456
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtga |
206 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18074199 |
accttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtg- |
18074295 |
T |
|
| Q |
207 |
tgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcg |
306 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18074296 |
tgatgttg-ttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcg |
18074394 |
T |
|
| Q |
307 |
tcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18074395 |
acagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
18074456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 117 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18731232 - 18730987
Alignment:
| Q |
117 |
tttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaat |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18731232 |
tttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagg--acatggatgtgactgtgatgttgtta-- |
18731137 |
T |
|
| Q |
217 |
tacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccctta |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18731136 |
--catactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagccctta |
18731039 |
T |
|
| Q |
317 |
catgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18731038 |
catgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
18730987 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18723819 - 18723568
Alignment:
| Q |
111 |
ttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgtt |
210 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18723819 |
tttttatttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagt--aaatggatgtgactgtgatgtt |
18723722 |
T |
|
| Q |
211 |
gttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcag |
310 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723721 |
gtta----catactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtcaacaacaagatcagtcgtcag |
18723626 |
T |
|
| Q |
311 |
cccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723625 |
cccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
18723568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18655211 - 18654960
Alignment:
| Q |
111 |
ttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgtt |
210 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18655211 |
tttttatttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagt--aaatggatgtgactgtgatgtt |
18655114 |
T |
|
| Q |
211 |
gttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcag |
310 |
Q |
| |
|
|||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18655113 |
gtta----cacactgatttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcag |
18655018 |
T |
|
| Q |
311 |
cccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18655017 |
cccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
18654960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 118 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18699127 - 18698884
Alignment:
| Q |
118 |
ttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgttaatt |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18699127 |
ttacgtttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatactatgagg--acatggatgtgactgtgatgttgtta--- |
18699033 |
T |
|
| Q |
218 |
acatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttac |
317 |
Q |
| |
|
|| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18699032 |
-cacactgatttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttac |
18698934 |
T |
|
| Q |
318 |
atgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaa |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18698933 |
atgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaa |
18698884 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18679301 - 18679043
Alignment:
| Q |
111 |
ttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagtt-------agaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattg |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || |
|
|
| T |
18679301 |
tttttatttacgtttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagtttgaatttagaaatgtatgatatattatgagt--acatgggtgtgactg |
18679204 |
T |
|
| Q |
204 |
tgatgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcag |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18679203 |
tgatgttgtta----catactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacgtctctaacaagatcag |
18679108 |
T |
|
| Q |
304 |
tcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18679107 |
tcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
18679043 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0419 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:
Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 368
Target Start/End: Original strand, 7935 - 8182
Alignment:
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgtta |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7935 |
atttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatgttgtta |
8032 |
T |
|
| Q |
215 |
attacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccct |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8033 |
----catactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagccct |
8128 |
T |
|
| Q |
315 |
tacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8129 |
tacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaat |
8182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:
Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13409 - 13162
Alignment:
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattgtgatgttgtta |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13409 |
atttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatgttgtta |
13312 |
T |
|
| Q |
215 |
attacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagccct |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13311 |
----catactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagccct |
13216 |
T |
|
| Q |
315 |
tacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13215 |
tacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaat |
13162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4457 - 4199
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtatt-agttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtata--atatattctgagtgtacatggatgtgattg |
203 |
Q |
| |
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| T |
4457 |
accttttatatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcacaatagttagaaatgtataccatatattatgagt--acatggatgtgattg |
4360 |
T |
|
| Q |
204 |
tgatgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcag |
303 |
Q |
| |
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| T |
4359 |
tgatgttgtta----catactaacttatcttatcggacattaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaagaacatctccaacaagatcag |
4264 |
T |
|
| Q |
304 |
tcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
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| T |
4263 |
tcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaat |
4199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 268094 - 267825
Alignment:
| Q |
107 |
acctttttcatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgta--catggatgtgattgt |
204 |
Q |
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| T |
268094 |
accttttttatttacgtttctaaataagtattagttgtttatatgacgaaatagttagaaacgtataatatattttgagtacatgcatggatgtgattgt |
267995 |
T |
|
| Q |
205 |
g--atgttgttaattaca--tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagat |
300 |
Q |
| |
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| T |
267994 |
gtgatgttgttacatactattactaacttgcattatttgacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagat |
267895 |
T |
|
| Q |
301 |
cagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
267894 |
cagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattg |
267825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28127308 - 28127164
Alignment:
| Q |
222 |
actaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgt |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||| ||| ||||| |||| ||||||||| |
|
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| T |
28127308 |
actaacttatcttattggagattaatagatatgaatacaagtttattcagaagataatcaaagacatatccgacaggatcaatcgtgttttcttacatgt |
28127209 |
T |
|
| Q |
322 |
tgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaa |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |
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| T |
28127208 |
tgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaa |
28127164 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28164097 - 28164048
Alignment:
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttaga |
165 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28164097 |
atttatgtttttaaacaagtataagatatttatatgtcaaaatagttaga |
28164048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28127397 - 28127333
Alignment:
| Q |
116 |
atttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatatt |
180 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |
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|
| T |
28127397 |
atttatgtttttaaacaagtataaggtatttatatgtcaaaatagtcagagttgtataatgtatt |
28127333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28163916 - 28163860
Alignment:
| Q |
314 |
ttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattg |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28163916 |
ttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattg |
28163860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:
Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3196 - 3026
Alignment:
| Q |
194 |
gatgtgattgtgatgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctcca |
293 |
Q |
| |
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| T |
3196 |
gatgtgattgtgatgttgtca----catactaacttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctcca |
3101 |
T |
|
| Q |
294 |
acaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
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| T |
3100 |
acaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaat |
3026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14135 - 14082
Alignment:
| Q |
189 |
acatggatgtgattgtgatgttgttaattacatactaacttatcttattggacatgaa |
246 |
Q |
| |
|
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| T |
14135 |
acatggatgtgattgtgatgttgtca----catactaacttatcttattggacatgaa |
14082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29273472 - 29273325
Alignment:
| Q |
221 |
tactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatg |
320 |
Q |
| |
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| T |
29273472 |
tactaacttgtattatttgacatgaatagatatgaatacaagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatg |
29273373 |
T |
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| Q |
321 |
ttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaat |
368 |
Q |
| |
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| T |
29273372 |
ttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaat |
29273325 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 16449533 - 16449573
Alignment:
| Q |
314 |
ttacatgttgccaattatcccgttggattgcagtctcgagt |
354 |
Q |
| |
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| T |
16449533 |
ttacatgttgcgaattatccagttggattggagtctcgagt |
16449573 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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