View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9118_low_12 (Length: 465)

Name: NF9118_low_12
Description: NF9118
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9118_low_12
NF9118_low_12
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (4-447)||(6950-7392)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (96-447)||(2875-3227)
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (97-447)||(53909430-53909782)
chr4 (177-433)||(34393367-34393624)
chr4 (96-433)||(15274343-15274681)
chr4 (171-438)||(18166851-18167117)
chr4 (233-447)||(45460709-45460926)
chr4 (221-447)||(12837998-12838224)
chr4 (229-447)||(21961253-21961472)
chr4 (187-425)||(7134276-7134513)
chr4 (187-433)||(8372589-8372834)
chr4 (229-447)||(20813704-20813922)
chr4 (187-433)||(26678161-26678404)
chr4 (191-425)||(19699383-19699616)
chr4 (191-425)||(19709968-19710201)
chr4 (96-447)||(109716-110056)
chr4 (227-447)||(44054136-44054347)
chr4 (229-447)||(12901455-12901663)
chr4 (228-447)||(30236232-30236443)
chr4 (187-433)||(22356390-22356634)
chr4 (114-447)||(54119906-54120227)
chr4 (237-446)||(13811380-13811589)
chr4 (97-425)||(9293702-9294022)
chr4 (97-425)||(10642364-10642684)
chr4 (4-193)||(33738635-33738824)
chr4 (189-447)||(53706604-53706858)
chr4 (4-193)||(44054331-44054519)
chr4 (233-447)||(44345026-44345247)
chr4 (10-172)||(13811200-13811364)
chr4 (34-205)||(43282980-43283154)
chr4 (10-165)||(18495978-18496134)
chr4 (201-448)||(47355476-47355719)
chr4 (27-166)||(52267056-52267196)
chr4 (221-437)||(16366435-16366646)
chr4 (183-433)||(18246160-18246399)
chr4 (260-424)||(18294592-18294755)
chr4 (4-157)||(15043381-15043536)
chr4 (4-157)||(15110888-15111043)
chr4 (183-433)||(19998499-19998738)
chr4 (221-447)||(33738446-33738657)
chr4 (10-170)||(30236061-30236222)
chr4 (66-193)||(44345237-44345364)
chr4 (183-433)||(16520783-16521023)
chr4 (97-193)||(16366360-16366457)
chr4 (10-170)||(45460525-45460686)
chr4 (221-447)||(13244574-13244787)
chr4 (187-425)||(15211505-15211732)
chr4 (96-242)||(14899895-14900047)
chr4 (249-447)||(18496169-18496366)
chr4 (96-193)||(12837920-12838020)
chr4 (96-448)||(5684487-5684841)
chr4 (341-447)||(8874272-8874378)
chr4 (97-193)||(13244765-13244862)
chr4 (260-431)||(43283131-43283309)
chr4 (336-447)||(13752082-13752191)
chr4 (96-295)||(19998907-19999101)
chr4 (350-447)||(27959339-27959436)
chr4 (96-192)||(8874086-8874183)
chr4 (229-336)||(55378542-55378650)
chr4 (183-295)||(16521015-16521129)
chr4 (363-436)||(14867675-14867749)
chr4 (96-168)||(21961161-21961234)
chr4 (379-447)||(34197988-34198057)
chr4 (328-433)||(55378678-55378782)
chr4 (372-447)||(19824284-19824360)
chr4 (380-447)||(37958862-37958930)
chr4 (97-171)||(41257951-41258031)
chr4 (369-447)||(41167723-41167801)
chr4 (176-243)||(55378465-55378532)
chr4 (96-168)||(12901365-12901438)
chr4 (114-295)||(18167097-18167273)
chr4 (96-192)||(22356147-22356244)
chr4 (389-441)||(15853114-15853166)
chr4 (239-295)||(34393610-34393666)
chr4 (228-306)||(13751910-13751989)
chr4 (96-170)||(14994699-14994774)
chr4 (98-140)||(10239037-10239079)
chr4 (191-241)||(18294577-18294627)
chr4 (128-193)||(53706515-53706581)
chr4 (114-295)||(8372854-8373029)
chr4 (96-190)||(15138142-15138238)
chr4 (187-295)||(19998780-19998888)
chr4 (99-291)||(26678428-26678615)
chr4 (369-442)||(42706998-42707074)
chr4 (96-190)||(47355803-47355899)
chr4 (97-140)||(5372297-5372340)
chr4 (212-295)||(18246391-18246474)
chr4 (118-163)||(7848856-7848902)
chr4 (369-447)||(12246044-12246125)
chr4 (96-140)||(12245854-12245898)
chr4 (115-193)||(15211814-15211894)
chr4 (96-140)||(15852918-15852962)
chr4 (96-163)||(16521294-16521362)
chr4 (96-190)||(18246668-18246764)
chr4 (171-222)||(7134188-7134239)
chr4 (171-222)||(8372823-8372874)
chr4 (393-448)||(15288885-15288940)
chr4 (393-448)||(15296052-15296107)
chr4 (89-140)||(16395693-16395744)
chr4 (97-140)||(17377039-17377082)
chr4 (97-140)||(50223761-50223804)
chr4 (359-448)||(33240620-33240708)
chr4 (372-447)||(41258155-41258232)
chr4 (171-217)||(55378510-55378556)
chr4 (395-448)||(10486917-10486970)
chr4 (96-137)||(34197767-34197808)
chr4 (97-138)||(47469936-47469977)
chr4 (97-153)||(53706464-53706521)
chr4 (388-448)||(14994449-14994509)
chr4 (96-132)||(27959563-27959599)
chr4 (183-222)||(7134248-7134287)
chr4 (96-166)||(14950523-14950594)
chr4 (171-222)||(26678393-26678444)
chr4 (4-75)||(33738794-33738864)
chr4 (97-135)||(54365173-54365212)
chr4 (402-447)||(7966437-7966483)
chr4 (402-448)||(8043275-8043321)
chr4 (402-448)||(13050029-13050075)
chr4 (402-448)||(14503377-14503423)
chr4 (18-92)||(15043489-15043563)
chr4 (18-92)||(15110861-15110935)
chr4 (221-295)||(15211762-15211836)
chr4 (227-277)||(16521168-16521218)
chr4 (402-448)||(23272036-23272081)
chr4 (197-243)||(43283122-43283168)
chr4 (395-448)||(16329781-16329834)
chr4 (212-241)||(21961290-21961319)
chr4 (96-137)||(37958659-37958700)
chr4 (96-129)||(41167536-41167569)
chr4 (395-447)||(50223994-50224047)
chr4 (125-188)||(7134088-7134152)
chr4 (175-223)||(19699319-19699367)
chr4 (175-223)||(19709904-19709952)
chr4 (171-207)||(19998891-19998927)
chr4 (185-229)||(22356340-22356384)
chr4 (400-448)||(26337731-26337779)
chr4 (18-58)||(43282923-43282963)
[»] chr5 (141 HSPs)
chr5 (44-447)||(28257749-28258146)
chr5 (171-433)||(10780062-10780323)
chr5 (187-433)||(10289-10534)
chr5 (191-433)||(34937553-34937794)
chr5 (187-433)||(43445674-43445919)
chr5 (171-433)||(9732542-9732800)
chr5 (4-193)||(21392602-21392790)
chr5 (229-447)||(21661407-21661624)
chr5 (187-436)||(23986130-23986380)
chr5 (191-433)||(25211762-25212000)
chr5 (191-433)||(25275914-25276152)
chr5 (221-447)||(21392400-21392624)
chr5 (187-433)||(19497918-19498163)
chr5 (228-443)||(24184952-24185165)
chr5 (212-433)||(22885032-22885252)
chr5 (202-425)||(11579912-11580132)
chr5 (44-310)||(21652999-21653257)
chr5 (187-425)||(17473665-17473902)
chr5 (187-433)||(1221604-1221844)
chr5 (229-447)||(4863519-4863744)
chr5 (4-171)||(3672421-3672590)
chr5 (227-447)||(11338602-11338834)
chr5 (229-447)||(27185517-27185731)
chr5 (183-425)||(29192633-29192867)
chr5 (96-295)||(10779881-10780082)
chr5 (10-193)||(23453355-23453541)
chr5 (10-193)||(23460599-23460785)
chr5 (10-193)||(23464860-23465046)
chr5 (183-433)||(11340581-11340820)
chr5 (183-433)||(18780014-18780253)
chr5 (183-448)||(22368453-22368707)
chr5 (183-448)||(25424631-25424885)
chr5 (197-419)||(1171250-1171468)
chr5 (227-447)||(23453152-23453371)
chr5 (227-447)||(23460396-23460615)
chr5 (227-447)||(23464657-23464876)
chr5 (189-433)||(110958-111191)
chr5 (18-171)||(5452353-5452511)
chr5 (177-408)||(17907853-17908076)
chr5 (183-433)||(25944528-25944768)
chr5 (186-433)||(35793127-35793363)
chr5 (342-447)||(7726887-7726993)
chr5 (10-193)||(24184782-24184967)
chr5 (87-193)||(1170310-1170417)
chr5 (114-207)||(17473568-17473662)
chr5 (10-140)||(19404043-19404172)
chr5 (96-192)||(4863738-4863835)
chr5 (183-448)||(16534358-16534612)
chr5 (96-222)||(22368186-22368314)
chr5 (97-193)||(24470708-24470805)
chr5 (343-447)||(24470523-24470626)
chr5 (183-295)||(10554-10668)
chr5 (97-193)||(11582318-11582415)
chr5 (239-443)||(19403786-19403991)
chr5 (96-192)||(27185426-27185523)
chr5 (96-295)||(19498182-19498376)
chr5 (177-295)||(25944417-25944536)
chr5 (10-241)||(11338434-11338669)
chr5 (96-192)||(21661316-21661413)
chr5 (183-291)||(110850-110957)
chr5 (369-447)||(37189918-37189998)
chr5 (183-295)||(16534604-16534718)
chr5 (221-295)||(11582266-11582340)
chr5 (96-193)||(22884885-22884983)
chr5 (221-437)||(23510211-23510414)
chr5 (221-293)||(1170395-1170467)
chr5 (96-171)||(35792832-35792908)
chr5 (96-295)||(9732368-9732562)
chr5 (183-295)||(29192527-29192641)
chr5 (96-169)||(110686-110760)
chr5 (96-193)||(1221434-1221532)
chr5 (183-295)||(11340862-11340978)
chr5 (368-447)||(13793426-13793508)
chr5 (114-193)||(23510392-23510473)
chr5 (96-140)||(21615538-21615582)
chr5 (215-295)||(22368331-22368411)
chr5 (172-235)||(1171275-1171338)
chr5 (114-171)||(18779790-18779848)
chr5 (96-195)||(11213305-11213406)
chr5 (96-171)||(24227065-24227146)
chr5 (96-140)||(19860759-19860803)
chr5 (395-447)||(20710740-20710791)
chr5 (96-295)||(43445459-43445654)
chr5 (96-295)||(11341018-11341212)
chr5 (379-425)||(23492226-23492273)
chr5 (212-295)||(25424877-25424960)
chr5 (171-241)||(1171160-1171230)
chr5 (96-190)||(10831-10927)
chr5 (227-295)||(1221516-1221584)
chr5 (96-140)||(11964474-11964518)
chr5 (96-140)||(13793656-13793700)
chr5 (370-447)||(21615298-21615377)
chr5 (96-190)||(21933861-21933957)
chr5 (96-190)||(21940031-21940127)
chr5 (96-140)||(23492529-23492573)
chr5 (96-190)||(25425102-25425198)
chr5 (389-425)||(28888206-28888242)
chr5 (379-446)||(32967971-32968038)
chr5 (96-190)||(35580735-35580831)
chr5 (96-190)||(37010865-37010961)
chr5 (171-222)||(10523-10574)
chr5 (171-222)||(1221564-1221615)
chr5 (25-92)||(3672543-3672610)
chr5 (317-436)||(11213515-11213634)
chr5 (226-277)||(16534750-16534801)
chr5 (96-166)||(16534812-16534883)
chr5 (101-140)||(20455700-20455739)
chr5 (96-170)||(29192319-29192394)
chr5 (371-438)||(21228186-21228256)
chr5 (395-448)||(21934136-21934189)
chr5 (395-448)||(21940306-21940359)
chr5 (395-448)||(25902302-25902355)
chr5 (4-37)||(28258112-28258145)
chr5 (96-137)||(32967770-32967811)
chr5 (395-448)||(35580503-35580556)
chr5 (395-448)||(37011140-37011193)
chr5 (395-448)||(37051233-37051286)
chr5 (96-190)||(4201668-4201764)
chr5 (388-448)||(7423849-7423909)
chr5 (96-132)||(7727112-7727148)
chr5 (395-447)||(20614862-20614914)
chr5 (96-190)||(21075190-21075286)
chr5 (400-448)||(21235388-21235436)
chr5 (183-243)||(22368403-22368463)
chr5 (96-140)||(37189726-37189770)
chr5 (171-222)||(11340987-11341038)
chr5 (369-437)||(19860529-19860600)
chr5 (125-191)||(25211623-25211690)
chr5 (125-191)||(25275775-25275842)
chr5 (96-166)||(27008517-27008588)
chr5 (171-222)||(43445634-43445685)
chr5 (402-448)||(4201951-4201997)
chr5 (4-34)||(21653000-21653030)
chr5 (227-277)||(22884967-22885017)
chr5 (368-436)||(25003141-25003211)
chr5 (177-222)||(11582235-11582280)
chr5 (395-448)||(23327201-23327254)
chr5 (395-448)||(24594749-24594802)
chr5 (183-243)||(34937840-34937898)
chr5 (171-207)||(19498166-19498202)
chr5 (346-406)||(21647196-21647255)
[»] chr8 (130 HSPs)
chr8 (44-446)||(22323049-22323445)
chr8 (229-447)||(20655756-20655975)
chr8 (175-425)||(41508881-41509132)
chr8 (183-433)||(24108427-24108675)
chr8 (114-447)||(43375202-43375525)
chr8 (188-433)||(22909309-22909553)
chr8 (230-447)||(37605252-37605467)
chr8 (187-433)||(13664516-13664761)
chr8 (187-433)||(13723791-13724036)
chr8 (183-433)||(22008317-22008565)
chr8 (191-433)||(18610410-18610651)
chr8 (221-447)||(25120713-25120938)
chr8 (187-425)||(24719289-24719523)
chr8 (191-438)||(16043023-16043268)
chr8 (96-447)||(29758527-29758867)
chr8 (191-433)||(645751-645988)
chr8 (11-193)||(19994716-19994898)
chr8 (191-425)||(16041347-16041579)
chr8 (11-181)||(25120928-25121097)
chr8 (191-433)||(831486-831723)
chr8 (191-425)||(269940-270169)
chr8 (255-447)||(41243916-41244107)
chr8 (10-241)||(28543290-28543527)
chr8 (183-433)||(3433497-3433736)
chr8 (187-433)||(23509050-23509295)
chr8 (227-447)||(38531850-38532069)
chr8 (227-447)||(17731200-17731419)
chr8 (114-447)||(24387310-24387625)
chr8 (97-243)||(24719076-24719221)
chr8 (96-433)||(24930700-24931026)
chr8 (10-193)||(17731033-17731216)
chr8 (4-241)||(38532003-38532246)
chr8 (257-433)||(17343462-17343635)
chr8 (10-140)||(21679664-21679793)
chr8 (97-295)||(13664295-13664496)
chr8 (97-295)||(13723570-13723771)
chr8 (4-242)||(18768329-18768572)
chr8 (221-425)||(19994876-19995088)
chr8 (230-447)||(28543119-28543355)
chr8 (183-433)||(28835962-28836201)
chr8 (260-422)||(18768536-18768698)
chr8 (221-447)||(20479861-20480092)
chr8 (349-447)||(21695867-21695965)
chr8 (97-244)||(22008138-22008288)
chr8 (342-447)||(39448573-39448678)
chr8 (295-433)||(6776303-6776440)
chr8 (29-241)||(22737468-22737683)
chr8 (96-207)||(270202-270315)
chr8 (96-207)||(645605-645718)
chr8 (96-207)||(831340-831453)
chr8 (95-193)||(16416714-16416813)
chr8 (96-193)||(16203921-16204019)
chr8 (66-191)||(20480072-20480197)
chr8 (96-181)||(41244117-41244203)
chr8 (223-437)||(16416515-16416734)
chr8 (342-447)||(22737759-22737866)
chr8 (343-425)||(23631101-23631183)
chr8 (221-447)||(16203997-16204211)
chr8 (371-447)||(17283522-17283599)
chr8 (96-243)||(22909144-22909290)
chr8 (96-171)||(25294490-25294568)
chr8 (96-171)||(25756479-25756557)
chr8 (171-295)||(3433332-3433455)
chr8 (369-447)||(21192535-21192614)
chr8 (97-191)||(24108244-24108339)
chr8 (239-447)||(21679402-21679612)
chr8 (103-192)||(37605462-37605552)
chr8 (96-171)||(37655243-37655324)
chr8 (96-190)||(23509397-23509493)
chr8 (371-447)||(15931612-15931691)
chr8 (369-447)||(21199962-21200040)
chr8 (97-140)||(22498901-22498944)
chr8 (381-447)||(23229114-23229181)
chr8 (96-170)||(24547724-24547799)
chr8 (363-425)||(31196395-31196458)
chr8 (97-140)||(33170787-33170830)
chr8 (14-192)||(20655596-20655762)
chr8 (97-140)||(23116418-23116461)
chr8 (97-140)||(23153407-23153450)
chr8 (97-140)||(24238067-24238110)
chr8 (393-448)||(24547430-24547485)
chr8 (185-265)||(28836223-28836305)
chr8 (97-136)||(33612659-33612698)
chr8 (96-190)||(272784-272880)
chr8 (96-190)||(642969-643065)
chr8 (96-190)||(828775-828871)
chr8 (96-190)||(3433158-3433254)
chr8 (96-190)||(5236674-5236770)
chr8 (96-140)||(39448419-39448463)
chr8 (97-140)||(22312192-22312235)
chr8 (171-222)||(23509284-23509335)
chr8 (97-140)||(45560816-45560859)
chr8 (395-448)||(23118678-23118732)
chr8 (368-447)||(23835513-23835595)
chr8 (369-444)||(37655448-37655526)
chr8 (395-448)||(273059-273112)
chr8 (395-448)||(642737-642790)
chr8 (395-448)||(828543-828596)
chr8 (395-448)||(5236442-5236495)
chr8 (395-448)||(21846348-21846401)
chr8 (395-448)||(21853753-21853806)
chr8 (395-448)||(22090301-22090354)
chr8 (395-448)||(24663103-24663156)
chr8 (395-448)||(43683901-43683954)
chr8 (96-140)||(21192343-21192387)
chr8 (96-140)||(21199770-21199814)
chr8 (96-140)||(21696083-21696127)
chr8 (96-190)||(21846073-21846169)
chr8 (96-190)||(21853478-21853574)
chr8 (96-132)||(31195881-31195917)
chr8 (171-222)||(13664476-13664527)
chr8 (171-222)||(13723751-13723802)
chr8 (96-166)||(22090026-22090097)
chr8 (100-138)||(11542868-11542906)
chr8 (402-448)||(21496168-21496214)
chr8 (395-448)||(225020-225073)
chr8 (395-448)||(701433-701486)
chr8 (395-448)||(738643-738696)
chr8 (395-448)||(862538-862591)
chr8 (395-448)||(16676182-16676235)
chr8 (403-448)||(16874791-16874836)
chr8 (18-75)||(18768302-18768359)
chr8 (403-448)||(22884733-22884778)
chr8 (175-243)||(24108395-24108461)
chr8 (400-448)||(17148093-17148141)
chr8 (175-223)||(18610667-18610715)
chr8 (10-50)||(20649007-20649046)
chr8 (183-223)||(22909280-22909320)
chr8 (96-140)||(23835743-23835786)
chr8 (370-447)||(29296164-29296244)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (4-447)||(13341-13772)
[»] chr7 (139 HSPs)
chr7 (171-425)||(13867836-13868090)
chr7 (96-425)||(369133-369463)
chr7 (187-425)||(7286294-7286532)
chr7 (10-199)||(11285613-11285803)
chr7 (183-433)||(7290890-7291139)
chr7 (221-440)||(44863418-44863637)
chr7 (97-447)||(11582534-11582872)
chr7 (214-425)||(12545600-12545812)
chr7 (221-441)||(47287950-47288170)
chr7 (229-447)||(12753140-12753358)
chr7 (171-425)||(18305591-18305841)
chr7 (187-433)||(15952825-15953068)
chr7 (187-425)||(2192572-2192809)
chr7 (187-433)||(16480802-16481047)
chr7 (221-447)||(26071937-26072163)
chr7 (221-447)||(26095724-26095950)
chr7 (98-447)||(13038809-13039146)
chr7 (221-447)||(141838-142062)
chr7 (221-447)||(15824178-15824403)
chr7 (241-447)||(49049549-49049755)
chr7 (4-193)||(142040-142229)
chr7 (96-447)||(32496143-32496483)
chr7 (196-433)||(14253046-14253281)
chr7 (4-193)||(44863615-44863804)
chr7 (4-191)||(15824012-15824198)
chr7 (4-238)||(10862422-10862661)
chr7 (227-447)||(15628972-15629192)
chr7 (4-229)||(12545313-12545537)
chr7 (44-277)||(13867635-13867864)
chr7 (10-241)||(49049365-49049603)
chr7 (115-447)||(122738-123059)
chr7 (114-447)||(16209943-16210263)
chr7 (4-193)||(47288148-47288337)
chr7 (229-447)||(3893349-3893573)
chr7 (345-447)||(16571983-16572085)
chr7 (345-447)||(16593577-16593679)
chr7 (141-447)||(3054950-3055246)
chr7 (10-172)||(13273170-13273334)
chr7 (10-200)||(15629169-15629362)
chr7 (212-448)||(15762251-15762478)
chr7 (7-193)||(16571661-16571849)
chr7 (7-193)||(16593813-16594001)
chr7 (229-447)||(112986-113200)
chr7 (4-171)||(12249678-12249847)
chr7 (191-295)||(12545523-12545627)
chr7 (227-416)||(13272975-13273164)
chr7 (333-447)||(45455499-45455613)
chr7 (96-298)||(15761954-15762156)
chr7 (183-433)||(16416491-16416731)
chr7 (187-310)||(2024765-2024892)
chr7 (228-321)||(45453932-45454026)
chr7 (96-193)||(26071861-26071959)
chr7 (96-193)||(26095648-26095746)
chr7 (114-225)||(36051035-36051147)
chr7 (227-316)||(16571833-16571923)
chr7 (227-316)||(16593739-16593829)
chr7 (229-447)||(1938448-1938661)
chr7 (350-425)||(2024682-2024757)
chr7 (96-192)||(12753352-12753450)
chr7 (100-192)||(112899-112992)
chr7 (96-192)||(3893567-3893664)
chr7 (171-241)||(7286204-7286274)
chr7 (362-438)||(11285325-11285402)
chr7 (145-222)||(18305491-18305568)
chr7 (96-191)||(1938364-1938460)
chr7 (380-447)||(12249908-12249975)
chr7 (96-171)||(9058230-9058311)
chr7 (171-239)||(11285473-11285541)
chr7 (96-171)||(45453850-45453926)
chr7 (176-243)||(7286159-7286226)
chr7 (227-281)||(12249853-12249907)
chr7 (96-193)||(15952681-15952779)
chr7 (114-295)||(16480605-16480782)
chr7 (115-295)||(2192376-2192552)
chr7 (368-447)||(15914224-15914303)
chr7 (96-190)||(18255409-18255505)
chr7 (372-448)||(18255663-18255739)
chr7 (371-447)||(16915938-16916017)
chr7 (371-447)||(16917837-16917916)
chr7 (371-447)||(17229913-17229992)
chr7 (4-75)||(18305364-18305434)
chr7 (98-140)||(20587210-20587252)
chr7 (171-243)||(7286254-7286324)
chr7 (96-140)||(4483270-4483314)
chr7 (393-448)||(2435837-2435892)
chr7 (114-192)||(7291257-7291335)
chr7 (97-136)||(8565177-8565216)
chr7 (97-140)||(9322663-9322706)
chr7 (171-222)||(11285564-11285615)
chr7 (369-447)||(13375972-13376049)
chr7 (183-295)||(16416723-16416835)
chr7 (97-140)||(28718979-28719022)
chr7 (369-447)||(13388274-13388356)
chr7 (177-243)||(15762191-15762256)
chr7 (395-447)||(5617744-5617797)
chr7 (96-191)||(10988092-10988189)
chr7 (96-190)||(7821406-7821502)
chr7 (96-190)||(7828717-7828813)
chr7 (395-447)||(10862754-10862806)
chr7 (187-243)||(11285519-11285575)
chr7 (96-140)||(13388490-13388534)
chr7 (96-190)||(15518443-15518539)
chr7 (96-190)||(27103132-27103228)
chr7 (96-190)||(27110480-27110576)
chr7 (96-190)||(27175098-27175194)
chr7 (96-190)||(38785224-38785320)
chr7 (171-222)||(2192532-2192583)
chr7 (96-166)||(2436135-2436206)
chr7 (371-447)||(9609531-9609610)
chr7 (371-447)||(9837103-9837182)
chr7 (96-170)||(16416970-16417045)
chr7 (395-448)||(9322896-9322950)
chr7 (18-92)||(10862395-10862469)
chr7 (395-448)||(11514372-11514425)
chr7 (395-448)||(13756827-13756880)
chr7 (395-448)||(13912975-13913028)
chr7 (395-448)||(15443419-15443472)
chr7 (395-448)||(15518719-15518772)
chr7 (171-241)||(15762107-15762179)
chr7 (96-137)||(15914030-15914071)
chr7 (96-140)||(21676631-21676676)
chr7 (395-448)||(27103407-27103460)
chr7 (395-448)||(27110755-27110808)
chr7 (395-448)||(27174865-27174918)
chr7 (395-448)||(30263984-30264037)
chr7 (395-448)||(38785499-38785552)
chr7 (362-447)||(9058420-9058506)
chr7 (400-448)||(10987860-10987908)
chr7 (96-140)||(13376197-13376241)
chr7 (227-277)||(2024904-2024954)
chr7 (402-448)||(15687852-15687898)
chr7 (227-277)||(15952763-15952813)
chr7 (189-243)||(16416825-16416879)
chr7 (395-445)||(26011053-26011103)
chr7 (395-448)||(18981844-18981897)
chr7 (395-444)||(25294139-25294188)
chr7 (395-448)||(42060152-42060205)
chr7 (4-57)||(47288325-47288377)
chr7 (96-140)||(3058582-3058626)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (96-336)||(13788-14029)
scaffold0396 (336-447)||(14075-14186)
scaffold0396 (96-190)||(15922-16018)
scaffold0396 (388-448)||(15693-15753)
[»] chr2 (139 HSPs)
chr2 (96-310)||(25600312-25600527)
chr2 (221-447)||(36892434-36892660)
chr2 (114-447)||(9654507-9654824)
chr2 (227-447)||(28972240-28972461)
chr2 (114-448)||(20629034-20629357)
chr2 (191-433)||(42180179-42180420)
chr2 (227-447)||(7319686-7319906)
chr2 (221-447)||(25877692-25877914)
chr2 (212-433)||(21276333-21276553)
chr2 (215-433)||(12637988-12638205)
chr2 (175-425)||(24966415-24966660)
chr2 (4-241)||(22581496-22581739)
chr2 (96-433)||(21140121-21140451)
chr2 (11-241)||(7319838-7320075)
chr2 (4-193)||(36892269-36892456)
chr2 (187-433)||(12643778-12644018)
chr2 (183-433)||(3801085-3801324)
chr2 (10-241)||(31745-31983)
chr2 (227-447)||(31915-32133)
chr2 (186-433)||(34822297-34822533)
chr2 (4-193)||(25877527-25877714)
chr2 (4-199)||(720829-721026)
chr2 (183-448)||(8941679-8941933)
chr2 (183-448)||(25210860-25211114)
chr2 (328-447)||(4450084-4450203)
chr2 (183-433)||(19888699-19888938)
chr2 (114-241)||(461091-461219)
chr2 (10-241)||(24572962-24573201)
chr2 (96-448)||(22273131-22273459)
chr2 (227-447)||(22581671-22581890)
chr2 (96-448)||(22282364-22282692)
chr2 (183-425)||(38706772-38707003)
chr2 (336-447)||(25600142-25600252)
chr2 (10-241)||(28972393-28972630)
chr2 (228-416)||(269421-269608)
chr2 (4-140)||(4449792-4449927)
chr2 (342-447)||(22654308-22654412)
chr2 (99-243)||(24088972-24089122)
chr2 (114-223)||(24966660-24966770)
chr2 (10-140)||(22691520-22691649)
chr2 (10-140)||(22696167-22696296)
chr2 (96-193)||(43644559-43644657)
chr2 (334-447)||(22691829-22691941)
chr2 (334-447)||(22696476-22696588)
chr2 (227-416)||(24573133-24573321)
chr2 (96-208)||(15631849-15631963)
chr2 (197-425)||(24089050-24089285)
chr2 (4-140)||(269649-269784)
chr2 (189-447)||(43644681-43644926)
chr2 (227-447)||(6877689-6877927)
chr2 (96-193)||(8886609-8886707)
chr2 (221-437)||(8886428-8886631)
chr2 (183-293)||(25211108-25211220)
chr2 (200-436)||(15631610-15631833)
chr2 (96-171)||(19435066-19435144)
chr2 (228-447)||(22861764-22861971)
chr2 (379-447)||(24296382-24296451)
chr2 (369-443)||(5076-5151)
chr2 (212-295)||(3800960-3801043)
chr2 (96-193)||(6877911-6878009)
chr2 (96-193)||(12643608-12643706)
chr2 (96-193)||(22861956-22862054)
chr2 (380-440)||(23823315-23823376)
chr2 (380-440)||(23825259-23825320)
chr2 (171-275)||(461007-461111)
chr2 (4-75)||(720996-721067)
chr2 (96-295)||(12637747-12637940)
chr2 (228-305)||(22691690-22691768)
chr2 (228-305)||(22696337-22696415)
chr2 (357-436)||(720660-720740)
chr2 (96-140)||(19658472-19658516)
chr2 (344-446)||(460801-460901)
chr2 (96-170)||(21276109-21276184)
chr2 (97-140)||(22137424-22137467)
chr2 (377-447)||(22137633-22137703)
chr2 (372-443)||(23806441-23806512)
chr2 (187-265)||(8941955-8942033)
chr2 (19-75)||(721037-721093)
chr2 (96-190)||(22692768-22692864)
chr2 (96-190)||(22697415-22697511)
chr2 (96-140)||(43641349-43641393)
chr2 (97-140)||(18534352-18534395)
chr2 (381-447)||(19655230-19655297)
chr2 (379-437)||(19670970-19671029)
chr2 (212-295)||(19888624-19888707)
chr2 (97-140)||(24272581-24272624)
chr2 (96-170)||(24828143-24828218)
chr2 (96-170)||(24832595-24832670)
chr2 (96-295)||(34822578-34822772)
chr2 (371-447)||(40642140-40642219)
chr2 (388-446)||(19812896-19812953)
chr2 (369-443)||(25303866-25303943)
chr2 (96-140)||(4884-4928)
chr2 (96-190)||(3800695-3800791)
chr2 (96-190)||(5889878-5889974)
chr2 (96-190)||(11232833-11232929)
chr2 (227-295)||(12643690-12643758)
chr2 (96-190)||(14908020-14908116)
chr2 (96-190)||(19888360-19888456)
chr2 (96-190)||(22514680-22514776)
chr2 (96-140)||(23823116-23823160)
chr2 (96-140)||(23825060-23825104)
chr2 (96-140)||(23832195-23832239)
chr2 (96-140)||(24296180-24296224)
chr2 (96-140)||(25304091-25304135)
chr2 (96-190)||(28777281-28777377)
chr2 (395-445)||(9782734-9782785)
chr2 (171-222)||(12637920-12637971)
chr2 (171-222)||(12643738-12643789)
chr2 (393-448)||(24828457-24828512)
chr2 (393-448)||(24832909-24832964)
chr2 (171-242)||(24089074-24089147)
chr2 (395-448)||(5890154-5890207)
chr2 (395-448)||(11233108-11233161)
chr2 (395-448)||(14908295-14908348)
chr2 (395-448)||(17398453-17398506)
chr2 (395-448)||(20013369-20013422)
chr2 (395-448)||(22514955-22515008)
chr2 (395-448)||(22692539-22692592)
chr2 (395-448)||(22697186-22697239)
chr2 (4-73)||(22787600-22787669)
chr2 (395-448)||(23772783-23772836)
chr2 (395-448)||(23818426-23818479)
chr2 (395-448)||(24687526-24687579)
chr2 (395-448)||(28777557-28777610)
chr2 (221-274)||(43644635-43644688)
chr2 (171-222)||(3800869-3800920)
chr2 (96-166)||(12726556-12726627)
chr2 (19-62)||(22787574-22787617)
chr2 (395-433)||(19657767-19657805)
chr2 (402-448)||(23779788-23779834)
chr2 (121-170)||(25211379-25211429)
chr2 (402-448)||(28032932-28032978)
chr2 (395-448)||(12726298-12726351)
chr2 (107-140)||(24562483-24562516)
chr2 (175-223)||(7513768-7513816)
chr2 (96-190)||(8942124-8942220)
chr2 (96-140)||(19670737-19670781)
chr2 (178-243)||(25211210-25211277)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (171-425)||(17725-17979)
scaffold0292 (66-223)||(18025-18182)
scaffold0292 (187-243)||(17957-18013)
scaffold0292 (175-277)||(17951-18049)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (187-425)||(41217534-41217773)
chr1 (97-447)||(20895389-20895719)
chr1 (221-447)||(22407968-22408194)
chr1 (171-447)||(9786073-9786346)
chr1 (4-242)||(22836818-22837060)
chr1 (228-447)||(35524165-35524381)
chr1 (4-242)||(20956534-20956777)
chr1 (229-447)||(5676350-5676567)
chr1 (191-431)||(20252326-20252565)
chr1 (4-193)||(49966055-49966247)
chr1 (96-443)||(37846064-37846394)
chr1 (96-447)||(20443974-20444312)
chr1 (4-199)||(27673251-27673448)
chr1 (7-193)||(22407805-22407990)
chr1 (233-447)||(35053109-35053312)
chr1 (97-223)||(9785898-9786025)
chr1 (114-447)||(21857721-21858035)
chr1 (183-448)||(17146787-17147041)
chr1 (96-447)||(44036491-44036823)
chr1 (97-433)||(22364925-22365253)
chr1 (227-447)||(51658069-51658288)
chr1 (183-433)||(15863287-15863526)
chr1 (96-295)||(22352498-22352700)
chr1 (227-436)||(2422813-2423018)
chr1 (228-447)||(21716399-21716624)
chr1 (241-447)||(18505615-18505817)
chr1 (171-433)||(22352267-22352518)
chr1 (187-295)||(41217793-41217901)
chr1 (14-193)||(2422651-2422829)
chr1 (96-447)||(20929715-20930045)
chr1 (10-172)||(51657899-51658063)
chr1 (114-223)||(20529948-20530058)
chr1 (4-193)||(35523988-35524180)
chr1 (10-140)||(21716665-21716794)
chr1 (212-351)||(22250767-22250905)
chr1 (342-447)||(22837186-22837292)
chr1 (175-382)||(20589874-20590078)
chr1 (350-447)||(20956820-20956918)
chr1 (260-447)||(27673076-27673268)
chr1 (183-295)||(15863181-15863295)
chr1 (373-447)||(22837420-22837495)
chr1 (96-229)||(41217883-41218018)
chr1 (187-447)||(20529714-20529960)
chr1 (379-447)||(36358137-36358206)
chr1 (96-171)||(35053331-35053407)
chr1 (96-193)||(15863017-15863115)
chr1 (369-447)||(37235762-37235843)
chr1 (96-171)||(5676199-5676275)
chr1 (171-243)||(20589796-20589868)
chr1 (96-190)||(22226459-22226555)
chr1 (18-92)||(20956507-20956581)
chr1 (379-439)||(38035421-38035482)
chr1 (175-243)||(20589750-20589818)
chr1 (373-433)||(22080172-22080232)
chr1 (96-140)||(37235559-37235603)
chr1 (97-140)||(5471983-5472026)
chr1 (97-140)||(5769813-5769856)
chr1 (97-140)||(22144991-22145034)
chr1 (96-170)||(35935164-35935239)
chr1 (97-140)||(41213266-41213309)
chr1 (171-241)||(20589920-20589990)
chr1 (174-222)||(20589849-20589897)
chr1 (96-140)||(21193691-21193735)
chr1 (96-171)||(22250620-22250696)
chr1 (221-281)||(49966017-49966077)
chr1 (212-295)||(17147033-17147116)
chr1 (371-447)||(17607212-17607290)
chr1 (97-140)||(20821478-20821521)
chr1 (393-448)||(35935478-35935533)
chr1 (97-139)||(18505814-18505856)
chr1 (18-92)||(27673401-27673475)
chr1 (96-140)||(77630-77675)
chr1 (368-436)||(19601490-19601559)
chr1 (4-57)||(22407762-22407814)
chr1 (96-190)||(17003302-17003398)
chr1 (96-190)||(17147258-17147354)
chr1 (395-447)||(27331084-27331135)
chr1 (96-170)||(45050185-45050260)
chr1 (98-140)||(38035221-38035263)
chr1 (395-448)||(5074167-5074220)
chr1 (395-448)||(7642448-7642501)
chr1 (175-276)||(9786001-9786100)
chr1 (395-448)||(18602910-18602963)
chr1 (175-243)||(20252587-20252653)
chr1 (395-448)||(20827088-20827141)
chr1 (395-448)||(22034092-22034145)
chr1 (99-140)||(36357938-36357979)
chr1 (96-132)||(13378359-13378395)
chr1 (96-132)||(19601713-19601749)
chr1 (370-447)||(21193449-21193529)
chr1 (388-448)||(21651871-21651931)
chr1 (388-448)||(22226230-22226290)
chr1 (388-448)||(29137074-29137134)
chr1 (177-229)||(41217755-41217807)
chr1 (404-448)||(41392697-41392741)
chr1 (232-295)||(5676293-5676355)
chr1 (96-170)||(7642174-7642249)
chr1 (379-447)||(17021843-17021914)
chr1 (96-166)||(51451115-51451186)
chr1 (227-277)||(15863099-15863149)
chr1 (221-295)||(22836987-22837059)
chr1 (395-445)||(51450861-51450911)
chr1 (4-33)||(2422681-2422710)
chr1 (395-447)||(5472224-5472276)
chr1 (395-448)||(17003070-17003123)
chr1 (18-59)||(22836791-22836832)
chr1 (395-447)||(33395154-33395207)
chr1 (395-447)||(40555656-40555709)
chr1 (96-156)||(41392964-41393025)
chr1 (183-223)||(20252581-20252621)
[»] chr6 (134 HSPs)
chr6 (187-433)||(35017417-35017663)
chr6 (184-433)||(18843671-18843918)
chr6 (191-433)||(35011093-35011334)
chr6 (175-447)||(18128308-18128578)
chr6 (171-433)||(18004807-18005068)
chr6 (114-447)||(18740613-18740935)
chr6 (221-447)||(25646592-25646818)
chr6 (96-447)||(19984788-19985128)
chr6 (187-433)||(33316379-33316624)
chr6 (221-442)||(31626712-31626933)
chr6 (187-433)||(18578816-18579061)
chr6 (227-447)||(22428442-22428664)
chr6 (229-447)||(16104818-16105037)
chr6 (187-425)||(13622898-13623131)
chr6 (191-433)||(19627480-19627721)
chr6 (229-447)||(18775475-18775691)
chr6 (215-433)||(23975690-23975908)
chr6 (214-425)||(14628361-14628571)
chr6 (4-193)||(25646426-25646614)
chr6 (227-447)||(32896250-32896461)
chr6 (4-193)||(18422207-18422396)
chr6 (4-241)||(25368922-25369164)
chr6 (283-447)||(23151674-23151837)
chr6 (183-348)||(18825609-18825774)
chr6 (97-229)||(35017302-35017435)
chr6 (183-448)||(25173485-25173739)
chr6 (10-200)||(28196352-28196545)
chr6 (228-425)||(18397153-18397351)
chr6 (227-447)||(25369097-25369327)
chr6 (235-442)||(13016526-13016728)
chr6 (229-447)||(25745987-25746192)
chr6 (212-448)||(1553897-1554124)
chr6 (183-423)||(16827779-16828011)
chr6 (183-433)||(4988970-4989209)
chr6 (114-241)||(13622800-13622926)
chr6 (96-298)||(1554219-1554421)
chr6 (4-223)||(15738626-15738849)
chr6 (10-172)||(22866601-22866764)
chr6 (96-193)||(31626911-31627009)
chr6 (96-243)||(18128706-18128851)
chr6 (10-135)||(18397397-18397521)
chr6 (97-295)||(18004634-18004827)
chr6 (11-140)||(13016350-13016478)
chr6 (114-223)||(16238816-16238926)
chr6 (349-447)||(33323009-33323106)
chr6 (345-447)||(18422083-18422185)
chr6 (260-447)||(22866376-22866564)
chr6 (96-295)||(14628193-14628388)
chr6 (340-447)||(17787714-17787821)
chr6 (380-447)||(16889621-16889689)
chr6 (96-241)||(22428596-22428746)
chr6 (97-192)||(25745897-25745993)
chr6 (369-447)||(7829717-7829796)
chr6 (343-433)||(18835474-18835562)
chr6 (183-295)||(4989201-4989313)
chr6 (187-285)||(16238707-16238804)
chr6 (388-447)||(25917949-25918008)
chr6 (343-447)||(940904-941010)
chr6 (185-295)||(25173731-25173843)
chr6 (4-73)||(32897258-32897326)
chr6 (96-190)||(1659291-1659387)
chr6 (183-291)||(16827625-16827733)
chr6 (97-192)||(18825419-18825515)
chr6 (371-447)||(22364041-22364120)
chr6 (96-295)||(23975956-23976149)
chr6 (96-169)||(4989403-4989477)
chr6 (96-192)||(18775685-18775782)
chr6 (183-243)||(18128584-18128644)
chr6 (97-192)||(18843480-18843576)
chr6 (96-190)||(33316164-33316260)
chr6 (96-140)||(34965472-34965516)
chr6 (96-170)||(1651530-1651605)
chr6 (97-140)||(19852797-19852840)
chr6 (96-169)||(16827460-16827534)
chr6 (96-168)||(16105056-16105129)
chr6 (96-171)||(22846615-22846696)
chr6 (342-401)||(15738496-15738556)
chr6 (372-448)||(17344101-17344177)
chr6 (171-222)||(18128555-18128606)
chr6 (371-447)||(21621394-21621473)
chr6 (101-140)||(23220224-23220263)
chr6 (177-243)||(1554119-1554184)
chr6 (114-190)||(11214623-11214701)
chr6 (18-92)||(15738802-15738876)
chr6 (96-165)||(15861243-15861313)
chr6 (369-447)||(12310808-12310889)
chr6 (96-140)||(21930419-21930464)
chr6 (388-448)||(1659547-1659607)
chr6 (96-190)||(10487364-10487460)
chr6 (96-190)||(16377867-16377963)
chr6 (96-190)||(16385191-16385287)
chr6 (388-448)||(18088640-18088700)
chr6 (96-140)||(18383282-18383326)
chr6 (221-265)||(18422185-18422229)
chr6 (96-190)||(25174040-25174136)
chr6 (392-447)||(25649540-25649596)
chr6 (96-190)||(27655668-27655764)
chr6 (171-222)||(23975925-23975976)
chr6 (146-193)||(32896445-32896492)
chr6 (394-448)||(15861010-15861064)
chr6 (368-447)||(18383474-18383556)
chr6 (171-241)||(1554196-1554268)
chr6 (395-448)||(1651847-1651900)
chr6 (395-448)||(10487132-10487185)
chr6 (97-134)||(16134812-16134849)
chr6 (395-448)||(16229833-16229886)
chr6 (395-448)||(16378142-16378195)
chr6 (395-448)||(16385466-16385519)
chr6 (395-448)||(16645737-16645790)
chr6 (395-448)||(16651103-16651156)
chr6 (175-243)||(18128682-18128748)
chr6 (177-222)||(18579050-18579095)
chr6 (395-447)||(21929733-21929786)
chr6 (388-448)||(11214394-11214454)
chr6 (402-446)||(14150864-14150908)
chr6 (389-433)||(16235750-16235794)
chr6 (183-243)||(16827729-16827789)
chr6 (379-445)||(17790971-17791039)
chr6 (388-448)||(19608673-19608733)
chr6 (96-190)||(26088319-26088415)
chr6 (96-140)||(33323339-33323383)
chr6 (175-295)||(18128586-18128700)
chr6 (395-447)||(17858219-17858272)
chr6 (395-447)||(19852554-19852607)
chr6 (395-448)||(23987294-23987347)
chr6 (395-448)||(29871332-29871385)
chr6 (96-140)||(16889344-16889388)
chr6 (96-132)||(17790740-17790776)
chr6 (183-223)||(18128676-18128716)
chr6 (175-223)||(19627737-19627785)
chr6 (25-61)||(25368902-25368938)
chr6 (404-448)||(27655952-27655996)
chr6 (126-169)||(32896494-32896538)
chr6 (175-223)||(35011029-35011077)
[»] scaffold0049 (5 HSPs)
scaffold0049 (171-433)||(30632-30894)
scaffold0049 (97-243)||(30946-31091)
scaffold0049 (372-448)||(44391-44467)
scaffold0049 (175-234)||(30881-30940)
scaffold0049 (175-222)||(30917-30964)
[»] scaffold0269 (5 HSPs)
scaffold0269 (171-425)||(3045-3299)
scaffold0269 (183-433)||(263-517)
scaffold0269 (97-217)||(3398-3519)
scaffold0269 (96-221)||(527-653)
scaffold0269 (175-223)||(3345-3393)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (120-297)||(15833-16011)
scaffold0346 (101-132)||(14215-14246)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (214-433)||(27932-28152)
scaffold0116 (97-295)||(28125-28328)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (229-447)||(59833-60051)
scaffold0068 (96-192)||(60045-60142)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (97-295)||(20905-21104)
scaffold0039 (187-433)||(21124-21362)
scaffold0039 (177-229)||(21090-21142)
[»] chr3 (194 HSPs)
chr3 (214-433)||(7851665-7851884)
chr3 (227-447)||(11199226-11199447)
chr3 (212-425)||(38166203-38166416)
chr3 (202-425)||(11812791-11813013)
chr3 (227-447)||(47786548-47786767)
chr3 (227-447)||(14287291-14287514)
chr3 (94-448)||(17957992-17958336)
chr3 (225-447)||(6148533-6148755)
chr3 (221-447)||(17098881-17099107)
chr3 (96-447)||(19230286-19230625)
chr3 (212-433)||(30140966-30141186)
chr3 (221-440)||(50113797-50114016)
chr3 (187-433)||(16819025-16819268)
chr3 (183-425)||(19944795-19945038)
chr3 (178-433)||(17936437-17936692)
chr3 (227-447)||(30204664-30204883)
chr3 (221-425)||(51160142-51160345)
chr3 (4-242)||(15516051-15516290)
chr3 (4-193)||(17099085-17099273)
chr3 (229-447)||(35121889-35122105)
chr3 (4-193)||(6148366-6148551)
chr3 (97-448)||(25057002-25057345)
chr3 (217-448)||(18737941-18738171)
chr3 (99-447)||(19262602-19262939)
chr3 (229-447)||(319297-319517)
chr3 (227-447)||(12351520-12351740)
chr3 (228-447)||(14296698-14296917)
chr3 (228-447)||(14302325-14302544)
chr3 (96-448)||(2048290-2048634)
chr3 (221-447)||(22145956-22146177)
chr3 (230-433)||(12796705-12796908)
chr3 (11-193)||(16183579-16183761)
chr3 (96-447)||(23490737-23491079)
chr3 (96-446)||(10736793-10737132)
chr3 (122-447)||(45581069-45581382)
chr3 (336-442)||(11062941-11063047)
chr3 (221-437)||(19572504-19572715)
chr3 (97-241)||(11813259-11813404)
chr3 (10-241)||(11062605-11062841)
chr3 (10-140)||(14522919-14523048)
chr3 (4-235)||(17137827-17138062)
chr3 (10-191)||(14287500-14287683)
chr3 (183-433)||(18908661-18908900)
chr3 (183-433)||(22273016-22273255)
chr3 (227-447)||(14523088-14523310)
chr3 (183-448)||(2451221-2451475)
chr3 (97-276)||(15860807-15860987)
chr3 (11-193)||(30204867-30205046)
chr3 (96-252)||(33340258-33340416)
chr3 (342-447)||(39654131-39654237)
chr3 (4-140)||(11883830-11883965)
chr3 (10-199)||(12563049-12563241)
chr3 (10-137)||(14291916-14292042)
chr3 (4-171)||(12951476-12951648)
chr3 (328-447)||(17536836-17536956)
chr3 (187-447)||(8630025-8630270)
chr3 (227-321)||(11062773-11062868)
chr3 (4-199)||(39654307-39654512)
chr3 (10-172)||(40938158-40938321)
chr3 (97-193)||(19572429-19572526)
chr3 (215-310)||(13815981-13816076)
chr3 (342-447)||(17137667-17137773)
chr3 (344-447)||(14061039-14061142)
chr3 (10-168)||(35122116-35122276)
chr3 (356-447)||(12563338-12563429)
chr3 (221-425)||(16183739-16183955)
chr3 (96-243)||(19945052-19945202)
chr3 (336-447)||(53900385-53900494)
chr3 (187-277)||(7851875-7851965)
chr3 (183-410)||(49230251-49230467)
chr3 (349-447)||(55443682-55443780)
chr3 (324-425)||(54045612-54045713)
chr3 (96-199)||(8630309-8630413)
chr3 (10-137)||(53900090-53900216)
chr3 (197-408)||(9304638-9304841)
chr3 (328-447)||(13815824-13815943)
chr3 (10-140)||(14296958-14297087)
chr3 (10-140)||(14302585-14302714)
chr3 (374-447)||(15548796-15548870)
chr3 (96-193)||(51160066-51160164)
chr3 (187-288)||(7851968-7852069)
chr3 (44-192)||(22145829-22145977)
chr3 (199-295)||(11813179-11813275)
chr3 (96-235)||(14060835-14060980)
chr3 (183-295)||(18908892-18909006)
chr3 (96-242)||(7852222-7852374)
chr3 (357-447)||(11884026-11884115)
chr3 (227-447)||(15515894-15516118)
chr3 (96-241)||(50113720-50113871)
chr3 (96-192)||(319206-319303)
chr3 (212-408)||(54686529-54686718)
chr3 (183-295)||(49230509-49230623)
chr3 (64-241)||(11199112-11199294)
chr3 (361-447)||(40937911-40937997)
chr3 (379-447)||(11330803-11330872)
chr3 (24-140)||(17536533-17536648)
chr3 (342-447)||(25769502-25769606)
chr3 (96-193)||(47786463-47786564)
chr3 (284-448)||(15940220-15940375)
chr3 (18-75)||(15516301-15516358)
chr3 (96-195)||(17913834-17913935)
chr3 (96-192)||(30141361-30141458)
chr3 (201-433)||(33340020-33340237)
chr3 (227-295)||(7852223-7852291)
chr3 (371-447)||(12020211-12020290)
chr3 (371-447)||(17202926-17203005)
chr3 (229-295)||(7852089-7852155)
chr3 (96-172)||(38812589-38812671)
chr3 (96-193)||(49230689-49230787)
chr3 (96-140)||(5229675-5229719)
chr3 (389-433)||(11381064-11381108)
chr3 (96-241)||(12351438-12351588)
chr3 (96-190)||(14846243-14846339)
chr3 (96-171)||(16259543-16259619)
chr3 (96-190)||(16819386-16819482)
chr3 (97-171)||(33370962-33371042)
chr3 (212-295)||(2451146-2451229)
chr3 (97-140)||(9592349-9592392)
chr3 (10-53)||(14522877-14522920)
chr3 (4-75)||(15516260-15516331)
chr3 (96-170)||(15574545-15574620)
chr3 (96-170)||(15613564-15613639)
chr3 (212-295)||(22273247-22273330)
chr3 (96-170)||(23081746-23081821)
chr3 (389-447)||(18008944-18009001)
chr3 (114-190)||(18905356-18905434)
chr3 (388-433)||(12490645-12490690)
chr3 (7-56)||(17099262-17099310)
chr3 (191-252)||(54049644-54049705)
chr3 (371-444)||(34558158-34558234)
chr3 (96-140)||(47983420-47983464)
chr3 (96-140)||(47992707-47992751)
chr3 (96-140)||(48001994-48002038)
chr3 (96-140)||(48011280-48011324)
chr3 (96-170)||(12266071-12266146)
chr3 (379-425)||(15874496-15874543)
chr3 (97-140)||(41660137-41660180)
chr3 (18-92)||(11883803-11883877)
chr3 (96-191)||(44227903-44228000)
chr3 (96-190)||(1469234-1469330)
chr3 (96-190)||(2450908-2451004)
chr3 (223-295)||(11813048-11813120)
chr3 (388-448)||(12266346-12266406)
chr3 (388-448)||(14846495-14846555)
chr3 (99-170)||(15470048-15470120)
chr3 (96-140)||(15874687-15874731)
chr3 (96-190)||(18909169-18909265)
chr3 (96-190)||(22273524-22273620)
chr3 (96-140)||(48420194-48420238)
chr3 (400-447)||(2045562-2045609)
chr3 (179-222)||(7852058-7852101)
chr3 (96-170)||(15940044-15940119)
chr3 (96-138)||(15989507-15989550)
chr3 (388-446)||(15470309-15470367)
chr3 (395-448)||(1469509-1469562)
chr3 (395-448)||(8270260-8270313)
chr3 (395-448)||(8277371-8277424)
chr3 (395-448)||(8306180-8306233)
chr3 (171-208)||(8630274-8630311)
chr3 (395-448)||(16746028-16746081)
chr3 (395-448)||(30151581-30151634)
chr3 (395-448)||(41268486-41268539)
chr3 (395-447)||(41659895-41659948)
chr3 (395-448)||(53768905-53768958)
chr3 (395-448)||(55314626-55314679)
chr3 (96-140)||(12490331-12490375)
chr3 (96-190)||(16745752-16745848)
chr3 (400-448)||(44227671-44227719)
chr3 (389-425)||(48419955-48419991)
chr3 (171-243)||(54686713-54686784)
chr3 (100-140)||(55442367-55442407)
chr3 (171-222)||(16819257-16819308)
chr3 (393-448)||(23082060-23082115)
chr3 (96-166)||(27839209-27839280)
chr3 (402-447)||(14819683-14819729)
chr3 (197-243)||(15516076-15516122)
chr3 (402-448)||(15574250-15574296)
chr3 (402-448)||(15613269-15613315)
chr3 (18-92)||(17138015-17138089)
chr3 (402-448)||(23888047-23888093)
chr3 (96-137)||(38377413-38377455)
chr3 (239-316)||(40938063-40938140)
chr3 (227-277)||(49230655-49230705)
chr3 (177-234)||(11813136-11813193)
chr3 (395-447)||(15988820-15988873)
chr3 (96-137)||(18008731-18008772)
chr3 (393-446)||(18905608-18905661)
chr3 (26-75)||(39654482-39654531)
chr3 (114-208)||(5227177-5227273)
chr3 (96-140)||(11330602-11330646)
chr3 (388-448)||(16935822-16935882)
chr3 (183-243)||(19945002-19945062)
chr3 (183-223)||(30141227-30141267)
chr3 (194-242)||(38166467-38166515)
[»] scaffold0031 (6 HSPs)
scaffold0031 (233-447)||(68562-68777)
scaffold0031 (230-447)||(30282-30497)
scaffold0031 (10-172)||(30506-30669)
scaffold0031 (96-193)||(68795-68895)
scaffold0031 (395-447)||(99024-99077)
scaffold0031 (228-271)||(68767-68810)
[»] scaffold0483 (3 HSPs)
scaffold0483 (187-425)||(4604-4841)
scaffold0483 (96-276)||(4336-4518)
scaffold0483 (183-222)||(4576-4615)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (187-425)||(49444-49681)
scaffold0109 (96-276)||(49176-49358)
scaffold0109 (183-222)||(49416-49455)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (221-447)||(256634-256859)
scaffold0011 (97-447)||(124992-125330)
scaffold0011 (114-447)||(72028-72349)
scaffold0011 (114-447)||(76409-76730)
scaffold0011 (4-193)||(256468-256656)
scaffold0011 (97-447)||(192737-193074)
[»] scaffold0184 (5 HSPs)
scaffold0184 (188-448)||(33362-33613)
scaffold0184 (96-275)||(32778-32952)
scaffold0184 (96-189)||(33756-33850)
scaffold0184 (183-223)||(33602-33642)
scaffold0184 (183-223)||(33626-33666)
[»] scaffold0078 (5 HSPs)
scaffold0078 (188-448)||(39231-39482)
scaffold0078 (96-275)||(39892-40066)
scaffold0078 (96-189)||(38994-39088)
scaffold0078 (183-223)||(39178-39218)
scaffold0078 (183-223)||(39202-39242)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (183-433)||(77580-77833)
scaffold0034 (171-241)||(36020-36090)
scaffold0034 (114-221)||(77869-77977)
scaffold0034 (175-310)||(36004-36136)
scaffold0034 (171-243)||(36142-36214)
scaffold0034 (171-222)||(36113-36164)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (187-425)||(156149-156386)
scaffold0023 (178-433)||(85923-86167)
scaffold0023 (177-265)||(58294-58382)
scaffold0023 (367-447)||(92220-92300)
scaffold0023 (96-295)||(155935-156129)
scaffold0023 (96-191)||(34811-34908)
scaffold0023 (171-222)||(156109-156160)
scaffold0023 (395-448)||(11121-11174)
scaffold0023 (400-448)||(34579-34627)
[»] scaffold0022 (12 HSPs)
scaffold0022 (228-447)||(113965-114182)
scaffold0022 (27-199)||(108052-108226)
scaffold0022 (260-447)||(107877-108069)
scaffold0022 (369-447)||(106708-106787)
scaffold0022 (96-190)||(6734-6830)
scaffold0022 (97-140)||(130411-130454)
scaffold0022 (115-190)||(59040-59117)
scaffold0022 (96-140)||(106518-106562)
scaffold0022 (403-448)||(59301-59346)
scaffold0022 (18-92)||(108202-108276)
scaffold0022 (403-448)||(7014-7059)
scaffold0022 (118-193)||(113902-113980)
[»] scaffold0008 (7 HSPs)
scaffold0008 (221-447)||(20828-21054)
scaffold0008 (221-446)||(28419-28644)
scaffold0008 (4-193)||(21032-21220)
scaffold0008 (4-188)||(28627-28810)
scaffold0008 (114-448)||(129804-130119)
scaffold0008 (5-75)||(21190-21259)
scaffold0008 (4-75)||(28780-28849)
[»] scaffold0622 (5 HSPs)
scaffold0622 (187-399)||(7452-7665)
scaffold0622 (171-298)||(7682-7809)
scaffold0622 (96-277)||(7807-8000)
scaffold0622 (229-295)||(7842-7908)
scaffold0622 (177-229)||(7647-7699)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (221-447)||(5813-6038)
scaffold0240 (96-193)||(6016-6114)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (221-447)||(138480-138705)
scaffold0021 (221-425)||(76579-76779)
scaffold0021 (4-200)||(76750-76945)
scaffold0021 (96-193)||(138404-138502)
scaffold0021 (351-447)||(9844-9940)
scaffold0021 (10-140)||(10126-10255)
scaffold0021 (227-309)||(10003-10086)
scaffold0021 (4-75)||(76915-76985)
scaffold0021 (4-34)||(87013-87043)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (96-447)||(236380-236749)
scaffold0009 (183-433)||(270311-270553)
scaffold0009 (96-193)||(270596-270695)
scaffold0009 (221-295)||(270545-270618)
[»] scaffold0447 (8 HSPs)
scaffold0447 (96-295)||(2993-3193)
scaffold0447 (187-295)||(2737-2845)
scaffold0447 (187-295)||(2865-2973)
scaffold0447 (187-288)||(2616-2717)
scaffold0447 (328-425)||(2465-2561)
scaffold0447 (177-229)||(2699-2751)
scaffold0447 (177-229)||(2827-2879)
scaffold0447 (177-229)||(2955-3007)
[»] scaffold0383 (8 HSPs)
scaffold0383 (96-295)||(5601-5801)
scaffold0383 (183-425)||(318-549)
scaffold0383 (187-288)||(5480-5581)
scaffold0383 (183-295)||(641-755)
scaffold0383 (328-425)||(5329-5425)
scaffold0383 (96-171)||(869-945)
scaffold0383 (177-229)||(5563-5615)
scaffold0383 (183-241)||(591-649)
[»] scaffold0044 (7 HSPs)
scaffold0044 (187-383)||(94335-94531)
scaffold0044 (143-223)||(94665-94745)
scaffold0044 (4-75)||(94812-94882)
scaffold0044 (187-243)||(94525-94581)
scaffold0044 (175-222)||(94570-94617)
scaffold0044 (4-34)||(94772-94802)
scaffold0044 (175-223)||(94593-94641)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (114-447)||(6826-7146)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (194-424)||(26442-26670)
scaffold0138 (221-444)||(15080-15300)
scaffold0138 (97-191)||(15005-15100)
scaffold0138 (379-447)||(24243-24312)
scaffold0138 (175-229)||(26707-26761)
scaffold0138 (183-223)||(26689-26729)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (221-447)||(37728-37954)
scaffold0102 (96-193)||(37932-38030)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (230-433)||(14831-15032)
scaffold0253 (343-425)||(4057-4141)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (214-422)||(21626-21834)
scaffold0077 (158-222)||(21547-21610)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (187-433)||(2431-2676)
scaffold0342 (228-447)||(4047-4263)
scaffold0342 (10-193)||(4248-4433)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (175-433)||(448-701)
scaffold0191 (170-223)||(395-448)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (221-425)||(31028-31230)
scaffold0171 (97-193)||(31208-31305)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (229-447)||(13933-14153)
scaffold0395 (99-192)||(14147-14243)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (183-425)||(29628-29870)
[»] scaffold2147 (2 HSPs)
scaffold2147 (221-437)||(514-728)
scaffold2147 (97-187)||(712-803)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (97-448)||(1266-1604)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (229-447)||(4394-4605)
scaffold0462 (96-165)||(4627-4697)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (229-448)||(75550-75760)
scaffold0001 (4-168)||(72014-72177)
scaffold0001 (187-265)||(166154-166232)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (96-275)||(144926-145106)
scaffold0025 (96-275)||(147185-147365)
scaffold0025 (371-447)||(51600-51679)
[»] scaffold0037 (5 HSPs)
scaffold0037 (229-447)||(66405-66623)
scaffold0037 (4-193)||(26324-26512)
scaffold0037 (221-447)||(26490-26692)
scaffold0037 (4-75)||(26284-26354)
scaffold0037 (104-192)||(66322-66411)
[»] scaffold0195 (9 HSPs)
scaffold0195 (187-447)||(17495-17750)
scaffold0195 (202-425)||(19546-19765)
scaffold0195 (342-437)||(8466-8561)
scaffold0195 (342-437)||(13855-13950)
scaffold0195 (98-222)||(17739-17871)
scaffold0195 (98-192)||(19860-19955)
scaffold0195 (96-137)||(8248-8289)
scaffold0195 (96-137)||(13637-13678)
scaffold0195 (229-296)||(19799-19866)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (237-447)||(3217-3427)
scaffold0808 (10-172)||(3038-3201)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (221-447)||(1120-1339)
scaffold0692 (19-192)||(969-1141)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (183-433)||(16752-17001)
scaffold0315 (96-171)||(17070-17146)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (227-447)||(1621-1839)
scaffold0092 (10-241)||(1771-2009)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (187-425)||(9896-10132)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (221-447)||(7087-7319)
scaffold0480 (4-193)||(6921-7109)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (227-447)||(12457-12684)
scaffold0083 (96-193)||(12668-12766)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (241-425)||(56196-56370)
scaffold0051 (98-171)||(56431-56505)
scaffold0051 (237-276)||(56369-56408)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (201-448)||(25505-25749)
[»] scaffold0597 (3 HSPs)
scaffold0597 (183-425)||(2861-3093)
scaffold0597 (96-243)||(2717-2871)
scaffold0597 (221-295)||(2796-2869)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (328-447)||(26841-26960)
scaffold0120 (96-192)||(27043-27142)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (97-262)||(39933-40099)
scaffold0106 (343-447)||(37595-37697)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (228-447)||(4528-4757)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (212-447)||(6401-6615)
scaffold0407 (94-199)||(6306-6412)
scaffold0407 (324-447)||(28-151)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (268-425)||(23030-23186)
scaffold0158 (346-425)||(16366-16445)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (342-447)||(144956-145060)
scaffold0014 (10-171)||(145357-145520)
scaffold0014 (227-350)||(145231-145351)
[»] scaffold0032 (6 HSPs)
scaffold0032 (212-447)||(53899-54121)
scaffold0032 (185-295)||(109859-109971)
scaffold0032 (177-275)||(109957-110055)
scaffold0032 (98-199)||(54110-54213)
scaffold0032 (96-171)||(109667-109743)
scaffold0032 (395-447)||(106446-106498)
[»] scaffold0003 (6 HSPs)
scaffold0003 (96-446)||(217335-217666)
scaffold0003 (183-433)||(5203-5443)
scaffold0003 (183-295)||(5435-5547)
scaffold0003 (96-170)||(5682-5757)
scaffold0003 (104-171)||(99615-99689)
scaffold0003 (189-243)||(5537-5591)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (221-447)||(19306-19521)
scaffold0234 (114-193)||(19248-19328)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (183-425)||(31110-31341)
scaffold0130 (183-295)||(31333-31447)
scaffold0130 (291-387)||(12989-13085)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (328-433)||(90931-91036)
scaffold0028 (202-331)||(90783-90912)
scaffold0028 (97-193)||(90599-90696)
scaffold0028 (212-295)||(128730-128813)
scaffold0028 (221-295)||(90674-90748)
scaffold0028 (369-447)||(77985-78064)
scaffold0028 (96-170)||(128888-128963)
scaffold0028 (183-243)||(128678-128738)
scaffold0028 (177-222)||(90734-90779)
[»] scaffold0673 (4 HSPs)
scaffold0673 (328-447)||(3927-4046)
scaffold0673 (97-190)||(3706-3800)
scaffold0673 (4-89)||(2401-2485)
scaffold0673 (221-336)||(3781-3897)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (96-242)||(3893-4045)
scaffold0243 (227-295)||(3978-4044)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (96-448)||(11617-11959)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (96-181)||(163817-163903)
scaffold0016 (96-140)||(118203-118247)
scaffold0016 (379-419)||(118403-118444)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (212-433)||(786-996)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (342-447)||(7416-7521)
scaffold0095 (96-140)||(7262-7306)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (171-408)||(44266-44495)
scaffold0066 (171-387)||(52457-52665)
scaffold0066 (199-243)||(52643-52687)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (227-446)||(6071-6303)
scaffold0589 (10-241)||(6235-6473)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (368-447)||(7267-7346)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (212-425)||(255-458)
scaffold0384 (99-190)||(1-94)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (212-425)||(27159-27361)
scaffold0026 (372-448)||(106244-106320)
scaffold0026 (96-170)||(106500-106575)
scaffold0026 (395-448)||(66370-66423)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (177-265)||(1246-1334)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (96-448)||(4085-4416)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (343-433)||(15167-15257)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (231-447)||(8355-8558)
scaffold0190 (96-168)||(8571-8646)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (342-448)||(72093-72199)
scaffold0058 (98-137)||(71879-71918)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (342-447)||(2438-2543)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (96-275)||(197687-197861)
scaffold0004 (97-140)||(84944-84987)
scaffold0004 (97-140)||(26082-26125)
scaffold0004 (395-447)||(25845-25898)
scaffold0004 (411-448)||(197976-198013)
[»] scaffold0521 (2 HSPs)
scaffold0521 (369-447)||(6860-6937)
scaffold0521 (37-199)||(7039-7204)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (100-193)||(249140-249234)
scaffold0012 (227-447)||(249218-249426)
scaffold0012 (402-448)||(35663-35709)
[»] scaffold0103 (3 HSPs)
scaffold0103 (10-140)||(32051-32175)
scaffold0103 (336-447)||(31744-31853)
scaffold0103 (228-306)||(31931-32010)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (4-99)||(6211-6305)
scaffold0090 (18-92)||(6184-6258)
[»] scaffold0266 (5 HSPs)
scaffold0266 (96-181)||(12786-12872)
scaffold0266 (96-181)||(5184-5270)
scaffold0266 (343-448)||(5388-5490)
scaffold0266 (343-437)||(12990-13081)
scaffold0266 (227-275)||(5283-5331)
[»] scaffold0498 (3 HSPs)
scaffold0498 (230-448)||(12524-12728)
scaffold0498 (227-275)||(7408-7456)
scaffold0498 (96-171)||(7480-7556)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (32-130)||(20172-20269)
scaffold0150 (32-130)||(27001-27098)
scaffold0150 (18-62)||(20280-20324)
scaffold0150 (18-62)||(27109-27153)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (344-447)||(45-146)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (344-447)||(1433-1534)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (10-62)||(23269-23321)
scaffold0124 (64-140)||(26509-26583)
scaffold0124 (227-296)||(26623-26692)
scaffold0124 (395-448)||(3433-3486)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (369-447)||(5208-5287)
scaffold0507 (96-140)||(4950-4994)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (388-447)||(21335-21394)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (371-447)||(29392-29471)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (96-192)||(1371-1469)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (96-171)||(3244-3325)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (64-140)||(2806-2880)
scaffold0750 (227-296)||(2920-2989)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (96-447)||(40947-41281)
[»] scaffold0786 (4 HSPs)
scaffold0786 (97-140)||(213-256)
scaffold0786 (377-447)||(5032-5102)
scaffold0786 (97-140)||(5268-5311)
scaffold0786 (377-418)||(5-47)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (377-447)||(3565-3635)
scaffold0390 (97-140)||(3801-3844)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (96-157)||(25210-25274)
scaffold0080 (369-447)||(25415-25496)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (379-447)||(4295-4364)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (369-447)||(33765-33846)
scaffold0013 (96-140)||(33995-34039)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (96-190)||(9511-9607)
scaffold0413 (388-448)||(9776-9836)
[»] scaffold0225 (4 HSPs)
scaffold0225 (96-190)||(14779-14875)
scaffold0225 (388-448)||(28071-28131)
scaffold0225 (388-448)||(14550-14610)
scaffold0225 (96-190)||(28300-28396)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (96-190)||(51511-51607)
scaffold0104 (388-448)||(51283-51342)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (117-190)||(35-110)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (396-447)||(9652-9703)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (388-447)||(12478-12536)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (362-443)||(2881-2962)
scaffold0409 (362-443)||(11136-11217)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (388-448)||(15799-15859)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (388-448)||(17074-17134)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (96-190)||(37768-37864)
scaffold0076 (395-448)||(37536-37589)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (379-447)||(78643-78713)
scaffold0053 (96-140)||(78431-78475)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (96-140)||(2576-2621)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (395-448)||(25123-25176)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (395-448)||(20895-20948)
scaffold0141 (395-448)||(25150-25203)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (395-448)||(29598-29651)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (372-442)||(1926-1999)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (395-448)||(113537-113590)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (96-190)||(17675-17771)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (402-448)||(1435-1481)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (402-448)||(7956-8002)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (402-448)||(3702-3748)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (402-447)||(3545-3591)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (402-448)||(42048-42094)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (395-447)||(22968-23021)


Alignment Details
Target: scaffold0338 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7392 - 6950
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7392 atctagtttgtggatttcggtcttgtagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctggagataggtgacg 7293  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7292 accttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttg-tgattgttcatgaaat 7194  T
Q  203 atgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7193 atgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatg 7094  T
Q  303 tgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093 tgagatatcgggattatgagataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtgg 6994  T
Q  403 attatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6993 attatgatgacgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 6950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3227 - 2875
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3227 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 3128  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||     
T  3127 catgaaatatgattgatgattgttcatgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgac 3028  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    ||||| |||||||||| || |||  || ||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  3027 tattgctgtgagatattggaattgggatataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaacta 2928  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2927 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 2875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Original strand, 53909430 - 53909782
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  53909430 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgaatgttc 53909529  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  53909530 atgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 53909629  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggat-tatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||     
T  53909630 attgatgtgagatattggggtgtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacta 53909729  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53909730 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 53909782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 177 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34393624 - 34393367
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34393624 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatg 34393525  T
Q  277 acacacgtgattggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaatt 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34393524 acagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaatt 34393425  T
Q  376 gaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393424 gaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 34393367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 96 - 433
Target Start/End: Original strand, 15274343 - 15274681
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  15274343 aggtgacaaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  15274443 tcatgaaatatgattaatgattattcatgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtga 15274542  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15274543 ttattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaact 15274641  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15274642 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 15274681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 171 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18167117 - 18166851
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  18167117 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttg 18167018  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18167017 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 18166919  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18166918 aaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatttg 18166851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Original strand, 45460709 - 45460926
Alignment:
Q  233 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtata 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  45460709 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 45460808  T
Q  332 --catatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcca 429  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  45460809 tacatatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgtaatacttatcccca 45460908  T
Q  430 gtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45460909 gtggttttgaccgcctac 45460926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 12837998 - 12838224
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  12837998 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttg 12838097  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12838098 atataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 12838197  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12838198 ttacccccagtggttttaacggcctac 12838224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 21961253 - 21961472
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  ||||    
T  21961253 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaag 21961352  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |    
T  21961353 tattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaataattaaccc 21961452  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||    
T  21961453 tagtggttttgaccgcctac 21961472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 7134276 - 7134513
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7134276 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 7134375  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||  ||| |||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  7134376 ttggtgattattgatgtgggatattggggtt-tgatgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 7134474  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7134475 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 7134513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8372834 - 8372589
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8372834 tgattgttcatggcttatgattggtgactgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 8372735  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||| |    
T  8372734 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattctt 8372636  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8372635 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 8372589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 20813704 - 20813922
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  20813704 gtgaatggtgtttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataag 20813803  T
Q  328 tata--catatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20813804 tatatacatgtgtgaatatt---attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttacc 20813900  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  20813901 cctagtggttttgaccgcctac 20813922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26678404 - 26678161
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26678404 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 26678305  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||    
T  26678304 taggtgaatattgatgtgacatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcat 26678208  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26678207 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 26678161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 425
Target Start/End: Original strand, 19699383 - 19699616
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  19699383 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 19699482  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  19699483 tgattattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgtta 19699581  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19699582 actgttatttggattatgttgatgtaatacttacc 19699616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 425
Target Start/End: Original strand, 19709968 - 19710201
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  19709968 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 19710067  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  19710068 tgattattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgtta 19710166  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19710167 actgttatttggattatgttgatgtaatacttacc 19710201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 110056 - 109716
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  110056 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| |||    
T  109956 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatga 109864  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    |||||||||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  109863 ttattgatgtgagatat-gggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcagatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaact 109770  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  109769 gctatttgtattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 109716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 44054347 - 44054136
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  44054347 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgta 44054248  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||          ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44054247 agtata----------tatttatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 44054158  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  44054157 cccagtggttttgaccgcctac 44054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 12901455 - 12901663
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||    
T  12901455 gtgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaag 12901554  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    ||||          ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12901555 tata----------tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 12901643  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  12901644 cagtggttttgaccgtctac 12901663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Original strand, 30236232 - 30236443
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||    
T  30236232 tgtgattggtgactgtgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataa 30236331  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||| ||||         ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  30236332 gtatatatat---------attattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc 30236422  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  30236423 ctagtggttttgaccgcctac 30236443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 22356390 - 22356634
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  22356390 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatga 22356489  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||   ||||||   ||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||  |    
T  22356490 ttggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattatt 22356587  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22356588 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 22356634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54120227
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgatcggtgattattcatgaaatgtaattaatg 54120005  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  54120006 attgttcatgataaatatggttggtgattgtgattgaatatttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatgattattgatgtgagatattg 54120098  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
     |  | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||| |||    
T  54120099 ag-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaaatatccatgttaattgttaattggattatgttga 54120192  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  54120193 tgtaatacttacccctagtggttttaaccgtctac 54120227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 446
Target Start/End: Original strand, 13811380 - 13811589
Alignment:
Q  237 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattg-atgtgagatatcgggattatgagataagtatacata 335  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||  || | | ||  ||    
T  13811380 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatggtatgaattta--ta 13811477  T
Q  336 tgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggt 434  Q
    | || ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13811478 tttggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggt 13811577  T
Q  435 tttgaccgccta 446  Q
    ||||| ||||||    
T  13811578 tttgatcgccta 13811589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9294022 - 9293702
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  9294022 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgtt 9293923  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| |||| | |||||||       ||||||| |||    
T  9293922 cgtgaaatgtgattaatgattattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaaaatttgtgaaatgataactgttcat-------gtgattgatga 9293830  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||    
T  9293829 ttattgatgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaaatatccatgttatct 9293734  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9293733 gttatttggattatgataatgtaatacttacc 9293702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10642684 - 10642364
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10642684 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 10642585  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| | ||| | || | |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| | |||||||       ||||||| |||    
T  10642584 cgtgaaatgtaattaatgactattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaagtgataactgttcat-------gtgattgatga 10642492  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  10642491 ttattgatgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaaatattcatgttatct 10642396  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10642395 gttatttggattatgataatgtaatacttacc 10642364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33738824 - 33738635
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||    
T  33738824 atctagtttgtggacttcagtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgagtgac 33738727  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  33738726 gaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgt 33738635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 447
Target Start/End: Original strand, 53706604 - 53706858
Alignment:
Q  189 attgttcatgaaatatgattgaggattgttcat-gatatatgtgatt-ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  53706604 attgttcatgaaatgtgattaatgattgttcattgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtga 53706703  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||  | |||  ||||||   || | ||    ||| |||||||||| | ||||||||||  | |||| |||||||    
T  53706704 ttgatgattattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtactaatttatg---tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcat 53706799  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  53706800 gttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac--ccagtggttttaaccgcctac 53706858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44054519 - 44054331
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  44054519 atctagtttctggacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattatgggcttcggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacg 44054422  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  44054421 gccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgt 44054331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 44345247 - 44345026
Alignment:
Q  233 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatac 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||     
T  44345247 ttggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 44345148  T
Q  333 at--------atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    ||        ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  44345147 atgtatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgtaatacttac 44345048  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  44345047 c-ccagtggttttaaccgcctac 44345026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 13811200 - 13811364
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13811200 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggtattgcagaga-cctttggcggtctagatataggtgacgaccttg 13811298  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13811299 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattg 13811364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 43282980 - 43283154
Alignment:
Q  34 atccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcata 133  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43282980 atccattagtgatctagattatgagcttcggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcata 43283078  T
Q  134 tatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatg 205  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  43283079 tatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgaatgttcatgacatatg 43283154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 18495978 - 18496134
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  18495978 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtaatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 18496076  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt--aataggtgcatatcatgacatgagt 165  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  18496077 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagt 18496134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47355719 - 47355476
Alignment:
Q  201 atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattga 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |||||||| |    
T  47355719 atatgattggtgattgttcatgatgtatataattgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaa 47355620  T
Q  301 tgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgt 400  Q
    |||||||||| ||| || |||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||   ||||||| | ||| || |||||||||| |    
T  47355619 tgtgagatattggggttctgatgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttat-t 47355524  T
Q  401 ggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  47355523 ggattatgataatgtaatgcttacccccagtggtttaaaccgcctact 47355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Original strand, 52267056 - 52267196
Alignment:
Q  27 tgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52267056 tgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacc--ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaagtgatttggtaccac 52267153  T
Q  127 atgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  52267154 atgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 437
Target Start/End: Original strand, 16366435 - 16366646
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||  | ||    
T  16366435 tgatatatgtgattagtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagg-gtgtg 16366533  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || ||||   |||||||||||||||   ||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16366534 atgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgtaatac 16366629  T
Q  421 ttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16366630 ttacccccagtggtttt 16366646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18246399 - 18246160
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||           
T  18246399 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataatcgtaaattgataattgttcata------ 18246306  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18246305 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 18246211  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18246210 tcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 18246160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 260 - 424
Target Start/End: Original strand, 18294592 - 18294755
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagt 359  Q
    ||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18294592 attgaggattgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatt-taatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagt 18294690  T
Q  360 acatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18294691 agatgatatttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 18294755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15043536 - 15043381
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||  |||||||||||||   ||||||||    
T  15043536 atctagtttatgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctagattgtgggtttcggccttgtagagacct-ttggtggtctagatgaaggtgacg 15043438  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatg 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  15043437 accttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 15110888 - 15111043
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||  |||||||||||||   ||||||||    
T  15110888 atctagtttatgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctagattgtgggtttcggccttgtagagacct-ttggtggtctagatgaaggtgacg 15110986  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatg 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  15110987 accttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19998738 - 19998499
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  19998738 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcat------- 19998646  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| |||  | |||  | |||||  || |||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  19998645 atgattgatgaatattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtgagtattaatgtgt---aattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 19998550  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19998549 ctatgttgactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 19998499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33738657 - 33738446
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  33738657 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttg 33738558  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||      ||        |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33738557 atgtaagtata------tg--------tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 33738472  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||  |||||||||| || ||||||    
T  33738471 -tacccacagtggttttaactgcctac 33738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 30236061 - 30236222
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  30236061 tttgtggacttcggtcttgcagagatctat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgtagagacct-ttgacggtctggatataggtgacgaccttg 30236158  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30236159 aggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttat 30236222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44345364 - 44345237
Alignment:
Q  66 cttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgag 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44345364 cttgcagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgag 44345266  T
Q  165 tcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||    
T  44345265 tcttattgatgtatatgtttggtgattgt 44345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16521023 - 16520783
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||           
T  16521023 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcat------- 16520931  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatg-tttgaattgaatta 381  Q
     |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||  | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  16520930 atgattgatgaatatagatgtaagatatcggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaata 16520835  T
Q  382 ttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16520834 tccatgttaactattatttagattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 16520783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 16366360 - 16366457
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16366360 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgt 16366457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 45460525 - 45460686
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||   |||| || ||||||||||||||||    
T  45460525 tttgtggacttcagtcttgcagagatccat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacct-ttgacagtctggatataggtgacgaccttg 45460622  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45460623 aggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttat 45460686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13244787 - 13244574
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||| | | |  ||    
T  13244787 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtg-tg 13244696  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || |||||   |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13244695 atgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgtaatac 13244601  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  13244600 ttacccccaatggttttaaccacctac 13244574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15211732 - 15211505
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  || |||||||| |||||||||        |||    
T  15211732 tgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tga 15211640  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | | |  |||  |||||||  || | |||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||    
T  15211639 ttgatgaatattgatgtgagatattgaggtg-tgatgtaagtatgaatgtatga---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccat 15211544  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15211543 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 15211505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14900047 - 14899895
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  14900047 aggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T
Q  192 gttcatg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
     ||||||  |||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14899947 attcatgataaatgtgagtgatgattattcatgataaatgtgattgatgattg 14899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 447
Target Start/End: Original strand, 18496169 - 18496366
Alignment:
Q  249 aataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattat 347  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  || | ||||  | ||||| ||||||    
T  18496169 aataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatata--tttgtga-tattat 18496265  T
Q  348 tattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||| | || || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18496266 tatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgtgatacttacccctagtggttttgaccgccta 18496365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 12837920 - 12838020
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta---ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12837920 aggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattg 12838019  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  12838020 t 12838020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Original strand, 5684487 - 5684841
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||| |||||||    
T  5684487 aggtgacgaccttgttgagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 5684586  T
Q  194 tcatgaaa--tatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggt 291  Q
     | ||| |  | ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || ||||  |||||    ||| ||||| ||| |||||||| || | | |||||||    
T  5684587 ccttgatacttgtgattgatgattgtacatgatacatgtgaatgatgtttgttcatgaaa---tgt-aattggtgaatgttcatgtcatatgcgattggt 5684682  T
Q  292 gatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    ||||| ||| ||||    || |||  || || ||||||||  ||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  5684683 gattaattgttgtggagcattggggataggatataagtattaatatgggagtattagtgttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgtta 5684782  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt-tgaccgcctact 448  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  5684783 actgttatttggattatgataatataatgcttacccctagtggtttctaaccgcctact 5684841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 447
Target Start/End: Original strand, 8874272 - 8874378
Alignment:
Q  341 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||    
T  8874272 atatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatatttactcccattggttttaac 8874371  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  8874372 cgcctac 8874378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13244862 - 13244765
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13244862 ggtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 13244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 431
Target Start/End: Original strand, 43283131 - 43283309
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattga-tgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatg----tgaatattattatt-ga 353  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||  || ||| || |||||    | | |||||||||| ||    
T  43283131 attgatgaatgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattggaattatggtatgagtgtatatatggatattattattattatttga 43283230  T
Q  354 tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagt 431  Q
    | |  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43283231 ttatatacatgctatttgaattgaattattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagt 43283309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 447
Target Start/End: Original strand, 13752082 - 13752191
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13752082 tgtgaatcttattattgatcaaatgcatgaagttcgg-ttgaattattcatgttaa-tgttatgtgaattatgctgatgtaatacttacccccagtggtt 13752179  T
Q  436 ttgaccgcctac 447  Q
    || |||||||||    
T  13752180 ttaaccgcctac 13752191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19999101 - 19998907
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||         
T  19999101 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg----- 19999007  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19999006 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatattggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 19998909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27959436 - 27959339
Alignment:
Q  350 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||    
T  27959436 ttgattaagtacatgatatttgaattaaattattcatgcttaactgttatgtggattatggtgatgtaatacttacc-caaatggttttgactgcctac 27959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 8874086 - 8874183
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  8874086 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtggttagtgattg 8874183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 336
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378650
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  328 tatacatat 336  Q
    |||| ||||    
T  55378642 tatatatat 55378650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16521129 - 16521015
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16521129 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgcatatgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatac 16521030  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  16521029 atgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14867749 - 14867675
Alignment:
Q  363 tgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14867749 tgatatttgaattgaattatttatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttt 14867675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 21961161 - 21961234
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21961161 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 21961234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 34197988 - 34198057
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  34197988 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccgcagtagttttgaccgcctac 34198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 433
Target Start/End: Original strand, 55378678 - 55378782
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  55378678 tatatatatatggatattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttat-tggattatgtttatgtaatacttacccc 55378776  T
Q  428 cagtgg 433  Q
    ||||||    
T  55378777 cagtgg 55378782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Original strand, 19824284 - 19824360
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  19824284 aattgatttattcacgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatctccaatggttttgatcgcctac 19824360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 380 - 447
Target Start/End: Original strand, 37958862 - 37958930
Alignment:
Q  380 tattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37958862 tattcatgtctatctgctatgtggattatgatgatgtaatacttacctccggtggttttgaccgcctac 37958930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 41257951 - 41258031
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257951 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 41167723 - 41167801
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41167723 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattgtgatgatgtaatacttacc-ctagtggttttgaccgcctac 41167801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Original strand, 55378465 - 55378532
Alignment:
Q  176 aatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  55378465 aatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 55378532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 12901365 - 12901438
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12901365 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtctt 12901438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167097
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||       |||||  |||  |     
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat-------gaaatgagatgaat 18167181  T
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18167180 gattattgatgatgtttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 22356147 - 22356244
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  22356147 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Original strand, 15853114 - 15853166
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15853114 taactgttatgtggattatgatgatataatacttacccccagtggttttgacc 15853166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  239 attgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751989
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgag 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgattaattgatgtgag 13751989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14994774 - 14994699
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14994774 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 14994699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 10239037 - 10239079
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10239037 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 10239079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 18294577 - 18294627
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18294577 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatttatgtgatcggtgatt 18294627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706581
Alignment:
Q  128 tgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgt 53706581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372854
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||       |||||||  |||  |     
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaat 8372937  T
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8372936 gattattgatgatgt-tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 15138142 - 15138238
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  15138142 aggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19998888 - 19998780
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   |||||||   ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| || |    
T  19998888 tgattgttcatggcttatgatttgcgattgttcatgaagtatatgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaa 19998789  T
Q  287 ttggtgatt 295  Q
    |||||||||    
T  19998788 ttggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26678615 - 26678428
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgttca 196  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||       |    
T  26678615 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg-------a 26678523  T
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggt 291  Q
    ||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||    
T  26678522 tgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42707074 - 42706998
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42707074 ttgaattgaattattcatgcttaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccg 42706998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47355899 - 47355803
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  47355899 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 5372297 - 5372340
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372297 ggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 5372340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18246474 - 18246391
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246474 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848856
Alignment:
Q  118 tggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatga 7848856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 12246044 - 12246125
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12246044 ttgaagtgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctac 12246125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 12245854 - 12245898
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12245854 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 12245898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15211894 - 15211814
Alignment:
Q  115 atttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  15211894 atttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgt 15211814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 15852918 - 15852962
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15852918 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 15852962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16521362 - 16521294
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatga 163  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16521362 aggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18246764 - 18246668
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  18246764 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 7134188 - 7134239
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7134188 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 7134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8372874 - 8372823
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8372874 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 8372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 15288885 - 15288940
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15288885 tgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15288940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 15296052 - 15296107
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15296052 tgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15296107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Original strand, 16395693 - 16395744
Alignment:
Q  89 tagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16395693 tagatataggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 16395744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 17377039 - 17377082
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17377039 ggtgatgaccttgaggtgatttggtaccacattcatatatgtgt 17377082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 50223761 - 50223804
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50223761 ggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgt 50223804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33240708 - 33240620
Alignment:
Q  359 tacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33240708 tacatgatatttgaattga-ttattcatgcttatctgttatatg-attatgttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctact 33240620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Original strand, 41258155 - 41258232
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41258155 aattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacc-ccagtggttttgaccgcctac 41258232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 55378510 - 55378556
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  55378510 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaaggtgattgatgattgt 55378556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10486970 - 10486917
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10486970 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 10486917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 34197767 - 34197808
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34197767 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 34197808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 138
Target Start/End: Original strand, 47469936 - 47469977
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgt 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47469936 ggtgacgaccttggggttatttggtaccacatgcatatatgt 47469977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Original strand, 53706464 - 53706521
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatat 153  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  53706464 ggtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14994509 - 14994449
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  14994509 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacctctagtggttttaaccgtctact 14994449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27959599 - 27959563
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27959599 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 7134248 - 7134287
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7134248 ttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 7134287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14950594 - 14950523
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  14950594 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtc 14950523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26678444 - 26678393
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26678444 tgatacatgtgattggtaattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 26678393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 33738864 - 33738794
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  33738864 atctagtttttgggctccggccttgcagagatc-atttgtgatctagtttgtggacttcagtcttgcagaga 33738794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 135
Target Start/End: Original strand, 54365173 - 54365212
Alignment:
Q  97 ggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatata 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54365173 ggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatata 54365212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 447
Target Start/End: Original strand, 7966437 - 7966483
Alignment:
Q  402 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7966437 gattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctac 7966483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8043321 - 8043275
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8043321 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 8043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 13050029 - 13050075
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  13050029 gattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctact 13050075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 14503377 - 14503423
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14503377 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 14503423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15043563 - 15043489
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| ||||||    
T  15043563 cttcggccttgcagggatcatttagtgatctagtttatgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctaga 15043489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 15110861 - 15110935
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| ||||||    
T  15110861 cttcggccttgcagggatcatttagtgatctagtttatgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctaga 15110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15211836 - 15211762
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  15211836 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgagtatttttgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16521218 - 16521168
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16521218 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 23272036 - 23272081
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23272036 gattatgttgatgtaatactcacc-ccagtggttttgaccgcctact 23272081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 243
Target Start/End: Original strand, 43283122 - 43283168
Alignment:
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43283122 tgaaatgtgattgatgaatgttcatgacatatgtgattggtgattgt 43283168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16329781 - 16329834
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16329781 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccacagtggttttaaccgcctact 16329834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 241
Target Start/End: Original strand, 21961290 - 21961319
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961290 gattgttcatgatatatgtgattggtgatt 21961319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 37958659 - 37958700
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37958659 aggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 37958700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 129
Target Start/End: Original strand, 41167536 - 41167569
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41167536 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 50223994 - 50224047
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  50223994 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctac 50224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 188
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134152
Alignment:
Q  125 acatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtg 188  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg 7134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 19699319 - 19699367
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  19699319 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 19699367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 19709904 - 19709952
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  19709904 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 19709952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19998927 - 19998891
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgat 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19998927 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgat 19998891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Original strand, 22356340 - 22356384
Alignment:
Q  185 ggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  22356340 ggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 22356384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26337779 - 26337731
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  26337779 tggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 26337731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Original strand, 43282923 - 43282963
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtggg 58  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43282923 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtggg 43282963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 141)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 28258146 - 28257749
Alignment:
Q  44 gatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aa 142  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28258146 gatctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttggtggtctggatatgggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaa 28258049  T
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28258048 taggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatgtatgtgattggtgattg 28257949  T
Q  243 tgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaat 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  |||||||||     
T  28257948 tgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattgatatgtgaa- 28257851  T
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28257850 --tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 28257754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 171 - 433
Target Start/End: Original strand, 10780062 - 10780323
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  10780062 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttg 10780161  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10780162 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 10780260  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10780261 aaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 10780323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10289
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  10534 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 10435  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  10434 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 10336  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10335 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 10289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34937794 - 34937553
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  34937794 tgttcatggaatatgattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 34937695  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  34937694 tgattattaatgttagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgtta 34937596  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34937595 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 34937553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 43445674 - 43445919
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43445674 tgattgttcatggcttatgattggtgactgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 43445773  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  43445774 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 43445872  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43445873 gttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 43445919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 433
Target Start/End: Original strand, 9732542 - 9732800
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9732542 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgactgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttg 9732641  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9732642 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgttt 9732737  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
       ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9732738 atcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 9732800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21392790 - 21392602
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  21392790 atctagtttgtggacttcagtcttgcagagatcc-ttagtgatctagtttgtggacttcagccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatcggtgacg 21392693  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21392692 accttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgt 21392602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 21661407 - 21661624
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||  ||||     
T  21661407 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagc 21661506  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21661507 atatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ct 21661605  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21661606 agtggttttgaccgcctac 21661624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 436
Target Start/End: Original strand, 23986130 - 23986380
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||  |||    
T  23986130 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcacgatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatga 23986229  T
Q  287 ttggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||  |||||  |||||||  ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||    
T  23986230 ttggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatgatgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatcca 23986329  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23986330 tgttaactgttatttggattatgatgatgtaatgcttacccccagtggttt 23986380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 25211762 - 25212000
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25211762 tgttcatggaatatgattggtgatttttcatgaaat--gtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgg 25211859  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  25211860 tgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgtta 25211957  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25211958 actgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 25212000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 25275914 - 25276152
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25275914 tgttcatggaatatgattggtgatttttcatgaaat--gtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgg 25276011  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  25276012 tgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgtta 25276109  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25276110 actgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 25276152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21392624 - 21392400
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  21392624 tgatatatgtgtttggtgattgtgtatgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt--g 21392527  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21392526 atgtaagtatatgtatgagaatatttttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 21392427  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21392426 ttacccctagtggttttgaccgcctac 21392400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19498163 - 19497918
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   |||||||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19498163 tgattgttcatggcttatgatttgtgattgttcatgaagtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 19498064  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  19498063 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcat 19497965  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19497964 gttatctgttatttgcattatgataatgtaatacttacccccagtgg 19497918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 228 - 443
Target Start/End: Original strand, 24184952 - 24185165
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||      
T  24184952 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatattt 24185051  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||  |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24185052 gtatttatatgtgaatatt---attgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc 24185148  T
Q  427 ccagtggttttgaccgc 443  Q
    |||||||||||||||||    
T  24185149 ccagtggttttgaccgc 24185165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Original strand, 22885032 - 22885252
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||     
T  22885032 gattgttcatgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatatt 22885131  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||     
T  22885132 ggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgata 22885230  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22885231 atgtaatacttacccccagtgg 22885252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 202 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11580132 - 11579912
Alignment:
Q  202 tatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgat 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11580132 tatgattgatgattgttcatgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgat 11580033  T
Q  302 gtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtg 401  Q
    ||||||||| ||  || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11580032 gtgagatattggagttttgatgtaagtat--atatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttg 11579936  T
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  11579935 aattatgatgatgtaatacttacc 11579912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 21652999 - 21653257
Alignment:
Q  44 gatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-a 142  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  21652999 gatctagtttgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcga 21653097  T
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  21653098 taagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgaaata--tgattggtgattg 21653195  T
Q  243 tgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatat 310  Q
    |  |||   || |||| ||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21653196 ttcatg---aaatgtg-attaatgattgttcatg--aaatgtgattggtgattattgatgtgagatat 21653257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 17473665 - 17473902
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga--tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgt 284  Q
    ||||||||||||   |||||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  17473665 tgattgttcatggcttatgatttgtgattgttcatgaagtatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgt 17473764  T
Q  285 gattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattc 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||  |||||||    |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  17473765 gattggtgattattgatgtgagctattggggtt-tgatgtaagtat--tgatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattc 17473861  T
Q  385 atgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17473862 atgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 17473902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 1221604 - 1221844
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  1221604 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 1221703  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||  |||||||    |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||    
T  1221704 ttggtgattattgatgtgagctattggggtt-tgatgtaagtat--tgatgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcat 1221797  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1221798 gataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 1221844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4863744 - 4863519
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||    
T  4863744 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagt 4863645  T
Q  329 a------tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatact 421  Q
    |      || ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4863644 atatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgtaatact 4863545  T
Q  422 tacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4863544 tacccccagtggttttaaccgcctac 4863519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3672590 - 3672421
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3672590 atctagtttgtgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgatggtctagatataggtgacg 3672492  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672491 accttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 11338602 - 11338834
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  11338602 atgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtga-ttgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagttattgggatcatgatata 11338700  T
Q  326 agtatacatatgt------------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgat 413  Q
      |||| |||| |            |||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11338701 tatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgat 11338800  T
Q  414 gtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11338801 gtaatacttacccccagtggttttgatcgcctac 11338834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 27185517 - 27185731
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||    
T  27185517 gtgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagt 27185615  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    ||  |||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27185616 attgatatgtgaatatt---attgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtaatacttaccccc 27185712  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  27185713 agtgattttaaccgcctac 27185731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Original strand, 29192633 - 29192867
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  29192633 ttggtgattgttcatgaaatgtgatcaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata------ 29192726  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  29192727 -tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatat 29192824  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29192825 tcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacc 29192867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 10779881 - 10780082
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  10779881 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10779981 tcatgaaatatgattaatgattattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgat-attgttcctgatacatgtgattggtg 10780079  T
Q  293 att 295  Q
    |||    
T  10780080 att 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23453541 - 23453355
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23453541 tttgtggacttcggtcttgcaaagatccattagtgatctagattgcgggcttcggccttgcagggacca-ttaatggtctagatataggtgacgaccttg 23453443  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  23453442 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23460785 - 23460599
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23460785 tttgtggacttcggtcttgcaaagatccattagtgatctagattgcgggcttcggccttgcagggacca-ttaatggtctagatataggtgacgaccttg 23460687  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  23460686 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23465046 - 23464860
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23465046 tttgtggacttcggtcttgcaaagatccattagtgatctagattgcgggcttcggccttgcagggacca-ttaatggtctagatataggtgacgaccttg 23464948  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  23464947 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11340820 - 11340581
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||           
T  11340820 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata------ 11340727  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  11340726 -tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 11340632  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11340631 ccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 11340581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 18780014 - 18780253
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  18780014 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 18780107  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||||| | |  |||  |||||||  || ||| | ||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18780108 -tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaattattatta---atcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 18780202  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18780203 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 18780253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 22368453 - 22368707
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||           
T  22368453 ttggtgattgttcatgaaatgtcattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata------ 22368546  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||  ||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||  |  |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  22368547 -tgattgatggatatcgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaacgtgtga---ttattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatat 22368641  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22368642 taatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 22368707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25424885 - 25424631
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  25424885 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 25424792  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  25424791 -tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 25424697  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  25424696 tcatgttaactgttatttgaattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 25424631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 419
Target Start/End: Original strand, 1171250 - 1171468
Alignment:
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| || |||    
T  1171250 tgaaatgtgattgatgattattcaggataaatgtggttggtgattgtttatgaaa---tgtga-ttgatgattattcatgataaatgtgattgatgttta 1171345  T
Q  297 ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtt 396  Q
    || ||||||||||| |||  | |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  1171346 ttaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgtt 1171445  T
Q  397 atgtggattatgatgatgtaata 419  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1171446 atttggattatgatgatgtaata 1171468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23453371 - 23453152
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||     ||    
T  23453371 atgtgattgatgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgta 23453272  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453271 aatata--tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 23453175  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  23453174 ccctagtggttttgaccgcctac 23453152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23460615 - 23460396
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||     ||    
T  23460615 atgtgattgatgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgta 23460516  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460515 aatata--tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 23460419  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  23460418 ccctagtggttttgaccgcctac 23460396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23464876 - 23464657
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||     ||    
T  23464876 atgtgattgatgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgta 23464777  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23464776 aatata--tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 23464680  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  23464679 ccctagtggttttgaccgcctac 23464657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 433
Target Start/End: Original strand, 110958 - 111191
Alignment:
Q  189 attgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgatt 288  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||        |||||    
T  110958 attgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgatt 111050  T
Q  289 ggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgt 388  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  111051 gatgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgt 111146  T
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111147 taactgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtgg 111191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Original strand, 5452353 - 5452511
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatt 117  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  5452353 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttcggccttgtagagacct-ttggtggtctagataaatgtgacgaccttgaggtgatt 5452451  T
Q  118 tggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452452 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17908076 - 17907853
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  17908076 atgtggttggtgattgttcatggagtatgattaatgattgttcatgatat--gtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcat- 17907980  T
Q  277 acacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattg 376  Q
           |||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||   ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  17907979 ------atgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattg 17907886  T
Q  377 aattattcatg-ttaactgttatgtggattatg 408  Q
    || ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  17907885 aaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 25944528 - 25944768
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||           
T  25944528 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaattattattcatgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata------ 25944621  T
Q  283 gtgattggt-gattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatta 381  Q
     |||||| | ||||||| |||||||||||  || |  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  25944622 -tgattgattgattattaatgtgagatattagggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaata 25944716  T
Q  382 ttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25944717 tccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 25944768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 433
Target Start/End: Original strand, 35793127 - 35793363
Alignment:
Q  186 gtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtg 285  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||        ||    
T  35793127 gtgatttttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tg 35793219  T
Q  286 attggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||| | |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  35793220 attgatgaagattgatgtgagatatcgaggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattca 35793315  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35793316 tgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 35793363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726887
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 7726894  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  7726893 cgcctac 7726887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 24184782 - 24184967
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24184782 tttgtggatttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctctggccttgtcgagacct-ttggcggtctagatataggtgacgacctt 24184879  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||    
T  24184880 gaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgt 24184967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 1170310 - 1170417
Alignment:
Q  87 tctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttg 185  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1170310 tctagatatgggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 1170409  T
Q  186 gtgattgt 193  Q
    ||||||||    
T  1170410 gtgattgt 1170417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473662
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatatgat 17473662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19404172 - 19404043
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19404172 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattggtgatctagattgtgggcttcgaccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacaaccttg 19404074  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19404073 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 19404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4863835 - 4863738
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4863835 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattg 4863738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16534612 - 16534358
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  16534612 ttggtgattttccatgaaacgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 16534519  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||  ||||| |  |||  |||||||  || ||| |   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  16534518 -tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 16534424  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
     |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16534423 ccatgttaattattatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16534358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 222
Target Start/End: Original strand, 22368186 - 22368314
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  22368186 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22368286 tcatgaaatatgattaatgattgttcatg 22368314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24470805 - 24470708
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  24470805 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctgattgt 24470708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 343 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24470626 - 24470523
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24470626 attattattgatcaaatgcatgatgtta-aattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 24470528  T
Q  443 cctac 447  Q
    |||||    
T  24470527 cctac 24470523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10668 - 10554
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  10668 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatac 10569  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | |||||||||||||    
T  10568 atgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11582415 - 11582318
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  11582415 ggtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgt 11582318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19403991 - 19403786
Alignment:
Q  239 attgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatat- 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || | || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||   || | || | ||||     
T  19403991 attgtgtgtgaataaatgtga-ttaaagaatgttcatgacacatgtgactggtgattgattgatgtgagatatggggattatagtatgaataaatatata 19403893  T
Q  337 -gtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggt 434  Q
     |||| ||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19403892 agtga-tattattatcggattcaatgcatgatatttgaattgaactattcatgttaattattatatggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggt 19403795  T
Q  435 tttgaccgc 443  Q
    |||||||||    
T  19403794 tttgaccgc 19403786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 27185426 - 27185523
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  27185426 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 27185523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19498376 - 19498182
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||         
T  19498376 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg----- 19498282  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19498281 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatattggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 19498184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 25944417 - 25944536
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  25944417 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaatatttgcgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcat 25944516  T
Q  276 gacacacgtgattggtgatt 295  Q
    || ||| || ||||||||||    
T  25944517 gatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 11338434 - 11338669
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  11338434 tttgtggacttcggtcttgcatagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccgtccttgcagaga-cctttgacggtctagatataagtgacgacctt 11338531  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||| ||||     ||||| || |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||   ||||    
T  11338532 ggaatgatatggtacaacatgcatatacgtgtcgggttaggtacacatcatg-catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaat 11338630  T
Q  203 atgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  11338631 gtgattgataattgttcatgacacatgtgattgatgatt 11338669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 21661316 - 21661413
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  21661316 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattg 21661413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 110850 - 110957
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||     
T  110850 ttggtgaatgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgat-attgttcatgatacat 110948  T
Q  283 gtgattggt 291  Q
    || ||||||    
T  110949 gtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 37189918 - 37189998
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37189918 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 37189998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16534718 - 16534604
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  16534718 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgcgtatgaataactgtgaatagataattgttcatgatac 16534619  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    |  | ||||||||||    
T  16534618 atttaattggtgatt 16534604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11582340 - 11582266
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11582340 tgatgtatgtgattggagattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 22884885 - 22884983
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  22884885 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgt 22884983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23510414 - 23510211
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||       | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  23510414 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca-------catgattgatgactattgatgtgagatattggggt-atg 23510323  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |   ||||||  || ||||    || ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  23510322 atgcaagtattaatgtgtgg---ttgttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatatttatgttaactgtcatttggattatgataatgtaatac 23510228  T
Q  421 ttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||| | |||||||||    
T  23510227 ttaccccaagtggtttt 23510211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Original strand, 1170395 - 1170467
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1170395 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 35792832 - 35792908
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35792832 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 35792908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 9732368 - 9732562
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtg-taataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || || ||||||         
T  9732368 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattggtg----- 9732462  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9732463 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 9732560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Original strand, 29192527 - 29192641
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||    
T  29192527 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatac 29192626  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  29192627 aagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 110686 - 110760
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta 169  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110686 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 110760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 1221434 - 1221532
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||    
T  1221434 aggtgacgaacttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgt 1221532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11340978 - 11340862
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatat--atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgac 278  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||     
T  11340978 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattagtcatgat 11340879  T
Q  279 acacgtgattggtgatt 295  Q
    ||| || ||||||||||    
T  11340878 acatgtaattggtgatt 11340862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13793508 - 13793426
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13793508 tttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 13793426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510392
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgt 23510392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21615582 - 21615538
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21615582 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 21615538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Original strand, 22368331 - 22368411
Alignment:
Q  215 tgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||| || ||||||||||    
T  22368331 tgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 1171275 - 1171338
Alignment:
Q  172 gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  1171275 gataaatgtggttggtgattgtttatgaaatgtgattgatgattattcatgataaatgtgattg 1171338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779848
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 18779848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 11213305 - 11213406
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| |||||||    
T  11213305 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgt 11213404  T
Q  194 tc 195  Q
    ||    
T  11213405 tc 11213406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 24227065 - 24227146
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227065 aggtgacgaccttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19860803 - 19860759
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19860803 aggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 19860759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20710791 - 20710740
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20710791 ttatatggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 20710740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 43445459 - 43445654
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| | || || ||||||         
T  43445459 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtg----- 43445553  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
      |||||||  |||  | || | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||| |    
T  43445554 --atgaaatgagatgaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcg 43445651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11341212 - 11341018
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||         
T  11341212 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg----- 11341118  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  11341117 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtga 11341020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23492273 - 23492226
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492273 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 23492226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25424960 - 25424877
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  25424960 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaatgactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25424877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 1171160 - 1171230
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  1171160 tgataaatgtggttggtgattattggtgaaatgtgattgatgattattcatgataaatgtggttggtgatt 1171230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10927 - 10831
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  10927 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Original strand, 1221516 - 1221584
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1221516 atgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11964518 - 11964474
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11964518 aggtgacgaccttgaggtggtttggtaccacatgcatgtatgtgt 11964474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13793700 - 13793656
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13793700 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 13793656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21615377 - 21615298
Alignment:
Q  370 tgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21615377 tgaattgatttgttcatgtctaactgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 21615298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 21933861 - 21933957
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21933861 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 21940031 - 21940127
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21940031 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23492573 - 23492529
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23492573 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 23492529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25425198 - 25425102
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  25425198 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28888242 - 28888206
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888242 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 28888206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 446
Target Start/End: Original strand, 32967971 - 32968038
Alignment:
Q  379 ttattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  32967971 ttattcatgtttaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttacccactgtgg-tttgaccgccta 32968038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35580831 - 35580735
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  35580831 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 37010865 - 37010961
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  37010865 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10574 - 10523
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10574 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 1221564 - 1221615
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1221564 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 1221615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3672610 - 3672543
Alignment:
Q  25 cttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||| ||||||    
T  3672610 cttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttcggccttgcagagatccattagtgatctaga 3672543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 11213515 - 11213634
Alignment:
Q  317 tatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||  |||||| || |||||||  ||||||||| | ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  11213515 tatgatataagtattaatatgggatcattattgttaatcaagtgtatgatgtttaatttgtaatattcatgttgattgatatttggattatgataatgta 11213614  T
Q  417 atacttacctccagtggttt 436  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  11213615 atacttacccccaatggttt 11213634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16534801 - 16534750
Alignment:
Q  226 tatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16534801 tatgtgattggagattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16534883 - 16534812
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  16534883 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtc 16534812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Original strand, 20455700 - 20455739
Alignment:
Q  101 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455700 acgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 20455739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 29192319 - 29192394
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  29192319 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttat 29192394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 438
Target Start/End: Original strand, 21228186 - 21228256
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21228186 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttg 21228256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 21934136 - 21934189
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21934136 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 21934189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 21940306 - 21940359
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21940306 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 21940359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 25902302 - 25902355
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25902302 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 25902355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 28258145 - 28258112
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258145 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc 28258112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 32967770 - 32967811
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32967770 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 32967811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35580556 - 35580503
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35580556 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 35580503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 37011140 - 37011193
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37011140 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 37011193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37051286 - 37051233
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37051286 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 37051233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 4201668 - 4201764
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  4201668 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7423909 - 7423849
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  7423909 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctact 7423849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7727148 - 7727112
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7727148 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20614914 - 20614862
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20614914 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctac 20614862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 21075190 - 21075286
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21075190 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Original strand, 21235388 - 21235436
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21235388 tggattatgataatgtaatgcttaccaccagtggttttaaccgcctact 21235436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 22368403 - 22368463
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22368403 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcaggatacatgtaattggtgattgt 22368463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 37189726 - 37189770
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  37189726 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacttgcatttatgtgt 37189770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11341038 - 11340987
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11341038 tgatacatgtgaatggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 11340987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19860600 - 19860529
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19860600 ttgaattgatttgttcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccggtggtttt 19860529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211690
Alignment:
Q  125 acatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 25211690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275842
Alignment:
Q  125 acatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 25275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27008588 - 27008517
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  27008588 aggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtc 27008517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 43445634 - 43445685
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43445634 tgatacatgtgattggcgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 43445685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 4201951 - 4201997
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4201951 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 4201997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 34
Target Start/End: Original strand, 21653000 - 21653030
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21653000 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 21653030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Original strand, 22884967 - 22885017
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22884967 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25003211 - 25003141
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatg-ttaactg-ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  25003211 tttgatttgaattattcatgcttaattgattatgtggattatgttgatgtaatgctcacccccagtggttt 25003141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11582280 - 11582235
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  11582280 atgtgattggtgattgttcatgaaatattattaatgattgttcatg 11582235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23327254 - 23327201
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  23327254 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 23327201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24594802 - 24594749
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24594802 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 24594749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34937898 - 34937840
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  34937898 ttggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 34937840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19498202 - 19498166
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgat 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498202 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgat 19498166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21647255 - 21647196
Alignment:
Q  346 attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggatta 406  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21647255 attattgatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttggatta 21647196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 130)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 44 - 446
Target Start/End: Original strand, 22323049 - 22323445
Alignment:
Q  44 gatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aa 142  Q
    |||||||||||||  |||  | ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22323049 gatctagtttgtgaacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaa 22323146  T
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22323147 taggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgttcttgaaatatgattgaggattgttcatgatgtatgtgattggtgattg 22323246  T
Q  243 tgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaat 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||  | |||  |||| ||   ||||||||     
T  22323247 tgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagcattgttatgtgaa- 22323344  T
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22323345 --tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttattttgtttatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 22323441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 20655756 - 20655975
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20655756 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataag 20655855  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20655856 tatacatatgtggatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 20655955  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20655956 cagtggttttgaccgcctac 20655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 425
Target Start/End: Original strand, 41508881 - 41509132
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41508881 aaatgtgcttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttca 41508980  T
Q  275 tgacacacgtgattggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaa 373  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41508981 tgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaa 41509080  T
Q  374 ttgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41509081 ttgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 41509132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 24108427 - 24108675
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  24108427 ttggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacat 24108526  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||    
T  24108527 gtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 24108624  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24108625 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 24108675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375525
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatg 43375301  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  43375302 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------atgattgatgattattgatgtgggatattg 43375394  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||  | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43375395 gg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataa 43375490  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43375491 tgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 43375525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 188 - 433
Target Start/End: Original strand, 22909309 - 22909553
Alignment:
Q  188 gattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgat 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  22909309 gattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgat 22909408  T
Q  288 tggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg 387  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22909409 tgatgattattaatttgagatattgggatt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatg 22909507  T
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22909508 ttaactattatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 22909553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 37605467 - 37605252
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagta 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||  ||||||    
T  37605467 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtt-tgatgtaagta 37605369  T
Q  330 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcca 429  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37605368 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgtaataattacc-cca 37605270  T
Q  430 gtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37605269 gtggttttgaccgcctac 37605252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 13664516 - 13664761
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13664516 tgattgttcatggcttatgagtggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 13664615  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  13664616 ttgatgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcat 13664714  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13664715 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 13664761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 13723791 - 13724036
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13723791 tgattgttcatggcttatgagtggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 13723890  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  13723891 ttgatgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcat 13723989  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13723990 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 13724036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 22008317 - 22008565
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||     
T  22008317 ttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatataattgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacat 22008416  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  22008417 gtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 22008515  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22008516 ttatgttaactgttatttggattatgataatgtaata-ttacccccagtgg 22008565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18610651 - 18610410
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  18610651 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 18610552  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  18610551 tgattattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgtta 18610453  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18610452 actgttatttggattatgttgatgtaatacttacccccagtgg 18610410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25120938 - 25120713
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  25120938 tgatatatgtgtttgataattgtgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtt-tg 25120840  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25120839 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 25120740  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  25120739 ttaaccccagtggttttgaccgcctac 25120713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 24719289 - 24719523
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  24719289 tgattattcatgaaatatgattgatatttgttcacgatttatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtga 24719388  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||   ||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  24719389 atggtgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgcaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcat 24719484  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24719485 gttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 24719523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 438
Target Start/End: Original strand, 16043023 - 16043268
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |     
T  16043023 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgataga 16043122  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16043123 tgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgtta 16043220  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  16043221 actgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccgagtggatttg 16043268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 29758867 - 29758527
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  29758867 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| ||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||       ||||||| |||    
T  29758767 tcatgaaatgtgagtaatgattattcatgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaat-------gtgattgatga 29758675  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||  ||| |||  || ||||   | || |||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29758674 ttattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaattattaatgtgtg---actactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaact 29758581  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29758580 gctatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 29758527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 645751 - 645988
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  645751 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 645850  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||  |||||||  || ||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  645851 tgattattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgtta 645945  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  645946 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 645988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 19994716 - 19994898
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagcctt-gcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  19994716 ttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggctttgcagagaccc-ttggtggtcttgatatgggtgacgaccttg 19994813  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19994814 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgt 19994898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 425
Target Start/End: Original strand, 16041347 - 16041579
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |     
T  16041347 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgataga 16041446  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16041447 tgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgtta 16041544  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16041545 actgttatttggattatgataatgtaatacttacc 16041579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25121097 - 25120928
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25121097 ttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttcgtgatctagtttttgggcttcggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgacgaccttga 25121000  T
Q  111 ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25120999 ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 25120928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 831486 - 831723
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  831486 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 831585  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||  |||||||  || ||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  831586 tgattattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgtta 831680  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  831681 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccncagtgg 831723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 270169 - 269940
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  270169 tgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaa 270070  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||  |||||||  || ||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  270069 tgattattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgtta 269975  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  269974 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 269940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 255 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 41244107 - 41243916
Alignment:
Q  255 tgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgat 354  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  41244107 tgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgat 41244009  T
Q  355 caagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  41244008 caagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaacccaagtggttttaaccgcctac 41243916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28543527 - 28543290
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  28543527 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 28543429  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||| || |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||   ||||    
T  28543428 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgtgcatgaataaat 28543330  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28543329 gtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgatt 28543290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 3433497 - 3433736
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  3433497 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 3433590  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  3433591 -tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatat 3433685  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3433686 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 3433736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23509295 - 23509050
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  23509295 tgattgttcatggcttatgattggtgaatattcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtga 23509196  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||  |||||||  ||  | ||||||||||||||| ||| |  | |||||||  |||||| |||||||    
T  23509195 ttggtgatgattgatgtgcgatattggggtt-tgatgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcat 23509097  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23509096 gttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 23509050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 38532069 - 38531850
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||  ||     
T  38532069 atgtgattgatgattgtgcat-aataattgtga-ttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatg 38531972  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
    |||||| |||||   ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38531971 agtatatatatgg--atattcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgtaatactta 38531874  T
Q  424 cctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  38531873 cccctagtggttttgaccgcctac 38531850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 17731200 - 17731419
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| || |     
T  17731200 atgtgattgatgattgtgtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattgaaattat-ag-tg 17731297  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
     | |||||| ||||| | ||||||| | || || |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17731298 tgaatacatttgtgatt-ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 17731396  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  17731397 ccccagtggttttgaccgactac 17731419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 24387310 - 24387625
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||       |||||||||||||| ||||| |     
T  24387310 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatg-------attgttcatgaaatgtgattaat 24387402  T
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24387403 gattattcatgatacatgtgagtggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgaaatatc 24387495  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||| | ||||  |||||||  || |||||   |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  24387496 ggggt-atgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttatctgctatttggattatgata 24387589  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24387590 atgtaataattacccccagtggttttaaccgcctac 24387625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 24719076 - 24719221
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  24719076 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattggtgaatgttc 24719175  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24719176 atgaaatgtgattaatgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 24719221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 433
Target Start/End: Original strand, 24930700 - 24931026
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||    
T  24930700 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgatatgtgattgt 24930799  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||| |||||        |||||| |||    
T  24930800 tcatggaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattattcat-------atgattgatga 24930892  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
     ||||||||||| |||| |||  |||||  ||||| |  || ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  24930893 atattgatgtgaaatattggg-gtatgatgtaagttttaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttatct 24930986  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24930987 actatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 24931026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 17731033 - 17731216
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  |||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  17731033 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaggcct-ttgaaggtcta---ataggtgacgaccttg 17731128  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgt 193  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  17731129 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38532246 - 38532003
Alignment:
Q  4 atctagtttg-tggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  38532246 atctagtttggtggacttcgatcttgcagagatccattagtgatccagattttgggcttcggccttgcaaagacct-ttggtggtctagatataggtgac 38532148  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcat- 197  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||   | |||||| | | ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||| |||     
T  38532147 gaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgtgcata 38532048  T
Q  198 -gaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
      || | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38532047 ataattgtgattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 38532003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17343635 - 17343462
Alignment:
Q  257 tgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatca 356  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||    ||| |||||  || || ||||||||||||||||||    
T  17343635 tgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggttt---gatgagtattgatgtgggaatattattattgatca 17343539  T
Q  357 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17343538 agtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 17343462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21679793 - 21679664
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21679793 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-tccttgacggtctagagataggtgacgaccttg 21679695  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21679694 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 21679664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Original strand, 13664295 - 13664496
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  13664295 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 13664394  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| ||||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13664395 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 13664494  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  13664495 tt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Original strand, 13723570 - 13723771
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  13723570 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 13723669  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| ||||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13723670 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 13723769  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  13723770 tt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 18768329 - 18768572
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  18768329 atctagtttgtgggctttgaccctgcagagatccaatagtgatctagattgtgggcttcggccttgtagaga-cctttgttggtctagatataggtgacg 18768427  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg- 198  Q
    || |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||   | | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| | ||||     
T  18768428 actttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattatgcatga 18768527  T
Q  199 -aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
     |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18768528 taaatatgattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattg 18768572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Original strand, 19994876 - 19995088
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  19994876 tgatatatgtgtttggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttg 19994975  T
Q  321 ag--------ataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    |         |||  |||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  19994976 atgtatatatatatatatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatga 19995075  T
Q  413 tgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||    
T  19995076 tgtaatacttacc 19995088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 230 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 28543355 - 28543119
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatg-------- 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||            
T  28543355 tgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgggatcatggtgtgtgt 28543256  T
Q  321 ------------agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatg 408  Q
                | |||  |||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28543255 gtgtgtgtatatatatatatatatatatgggaatgttatt-tggatcaagtacatgatgttt-aattgaattattcatgttaattgttatttggattatg 28543158  T
Q  409 atgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28543157 atgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 28543119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28836201 - 28835962
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  28836201 ttggcgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 28836108  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||    
T  28836107 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatat 28836013  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28836012 tcaggttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 28835962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 260 - 422
Target Start/End: Original strand, 18768536 - 18768698
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaag 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||| || ||||||  || ||||||  ||| || |||||||||||||  |||    
T  18768536 attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggatattattattgagtaag 18768633  T
Q  359 tacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactt 422  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768634 tacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactt 18768698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20480092 - 20479861
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  20480092 tgatatatgtgctcggtgattatgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttg 20479993  T
Q  321 agataagtatacat------atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatg 414  Q
    |  |||||||| ||      ||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  20479992 atgtaagtatatatgtatatatgagaatatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatg 20479894  T
Q  415 taatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20479893 taatacttacccctagtggttttaaccgcctac 20479861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 349 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21695965 - 21695867
Alignment:
Q  349 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21695965 attgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 21695867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 244
Target Start/End: Original strand, 22008138 - 22008288
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22008138 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgtt 22008237  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtg 244  Q
    |||||||| ||||| | || | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22008238 catgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtg 22008288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448678
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctcaatggttttgatc 39448672  T
Q  442 gcctac 447  Q
    ||||||    
T  39448673 gcctac 39448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 433
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776440
Alignment:
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctg 6776401  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6776402 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 6776440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 22737468 - 22737683
Alignment:
Q  29 cagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||  ||| |||||||    
T  22737468 cagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga--ccttaatggtctagatataggtgacgaccttgaaaagaaatggcaccacat 22737565  T
Q  129 gcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg--aaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||   | ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| || | |||||||||    
T  22737566 gcatatatgtgtcgaactaggtacat-tcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatgataaatgtgatcgatggttgttcatg 22737664  T
Q  223 atatatgtgattggtgatt 241  Q
    | | |||||||| ||||||    
T  22737665 acacatgtgattagtgatt 22737683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 270315 - 270202
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg-gttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  270315 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatttggtgattgt 270216  T
Q  194 tcatgaaatatgat 207  Q
    ||||||||| ||||    
T  270215 tcatgaaatgtgat 270202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Original strand, 645605 - 645718
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg-gttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  645605 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatttggtgattgt 645704  T
Q  194 tcatgaaatatgat 207  Q
    ||||||||| ||||    
T  645705 tcatgaaatgtgat 645718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Original strand, 831340 - 831453
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg-gttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  831340 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatttggtgattgt 831439  T
Q  194 tcatgaaatatgat 207  Q
    ||||||||| ||||    
T  831440 tcatgaaatgtgat 831453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16416813 - 16416714
Alignment:
Q  95 taggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  16416813 taggtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgt 16416714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 16203921 - 16204019
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16203921 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 16204019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20480197 - 20480072
Alignment:
Q  66 cttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgag 164  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20480197 cttgcagagaccc-ttagtggtctggattcaggtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgag 20480099  T
Q  165 tcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20480098 tcttattgatatatgtgctcggtgatt 20480072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41244203 - 41244117
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41244203 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtg 41244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16416734 - 16416515
Alignment:
Q  223 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgag 322  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  16416734 atatatgtgttcggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgat 16416635  T
Q  323 ataagta------tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
     | ||||      || |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||    
T  16416634 gtgagtatatatgtatatatttgaatatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgta 16416536  T
Q  417 atacttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  16416535 atacttacccccagaggtttt 16416515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 22737759 - 22737866
Alignment:
Q  342 tattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttga 439  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  22737759 tattattatttgattaagtgcatgatatttgaattgaactattcatgtttaactgttatgtagattatgatgatgtaatacttacccctagtgattttga 22737858  T
Q  440 ccgcctac 447  Q
    ||||||||    
T  22737859 ccgcctac 22737866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 343 - 425
Target Start/End: Original strand, 23631101 - 23631183
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23631101 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 23631183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 16203997 - 16204211
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||       |||||  |||||||||||||||||||| || | | ||    
T  16203997 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattaatgattattgatgtgagatattgg-agtgtg 16204088  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |   ||||||  || ||||    |||||||||  ||| | |||||||||  | ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16204089 atgcaagtattaatgtgtgg---ttattattggccaaatgcatgatgtta-atttgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatac 16204184  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16204185 ttacccccagtggttttaaccgcctac 16204211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17283599 - 17283522
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17283599 gaattgaattattcatgattaactgttatgtggattatgattgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 17283522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Original strand, 22909144 - 22909290
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||   ||||||| ||| |||||||     
T  22909144 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgtc 22909243  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  22909244 catgaaatgtgattaatgaatgttcatggaata--tgattggtgattgt 22909290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25294568 - 25294490
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25294568 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25756557 - 25756479
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25756557 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Original strand, 3433332 - 3433455
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagga-ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgatt 269  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  3433332 tgatacatgtgaatggtgattgttcatgaaatatgattaatgatttgttcatggctta--tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattatt 3433429  T
Q  270 gttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
     ||||||| ||| || ||||||||||    
T  3433430 attcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 21192535 - 21192614
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21192535 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttgactgcctac 21192614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 24108244 - 24108339
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||    
T  24108244 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 24108339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21679612 - 21679402
Alignment:
Q  239 attgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagta--tacata 335  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || | || ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||   || | ||  || |||    
T  21679612 attgtgtgtgaataaatgtga-ttaaagaatgttcatgacacatgtgactggtaattgattgatgtgagatatggggattatagtatgaataaatatata 21679514  T
Q  336 tgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg-ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| ||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21679513 tgtga-tattattatcggattcaatgcatgatatttgaattgaactattcatgataaattattatatggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 21679415  T
Q  434 ttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||    
T  21679414 -tttgaccgcctac 21679402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37605552 - 37605462
Alignment:
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||    
T  37605552 gaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgatgattg 37605462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 37655243 - 37655324
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655243 aggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23509493 - 23509397
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  23509493 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15931691 - 15931612
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15931691 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctac 15931612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 21199962 - 21200040
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  21199962 ttgaattgttttatccatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatc-ctagtggttttgaccgcctac 21200040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 22498901 - 22498944
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498901 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 22498944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 447
Target Start/End: Original strand, 23229114 - 23229181
Alignment:
Q  381 attcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  23229114 attcatgttaaacttttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctac 23229181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24547799 - 24547724
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547799 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 425
Target Start/End: Original strand, 31196395 - 31196458
Alignment:
Q  363 tgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31196395 tgatatttgaattgaattattcatgtttaacgtttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 31196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33170830 - 33170787
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33170830 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 33170787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 20655596 - 20655762
Alignment:
Q  14 tggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgagg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||| ||              |||    
T  20655596 tggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccggccttgcagaga-cctttgatggtctagatat--------------agg 20655679  T
Q  113 tgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||    
T  20655680 tgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattg 20655762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 23116418 - 23116461
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116418 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 23116461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 23153407 - 23153450
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153407 ggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 23153450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24238110 - 24238067
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238110 ggtgacgaccttgagctgatttggtaccacatgcatatatgtgt 24238067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24547485 - 24547430
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24547485 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 24547430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28836305 - 28836223
Alignment:
Q  185 ggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28836305 ggtgattgttcatgatgtatatgataaatgattgttcatgacgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgat 28836223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 33612659 - 33612698
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612659 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33612698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 272784 - 272880
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  272784 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 643065 - 642969
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  643065 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 828871 - 828775
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  828871 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 3433158 - 3433254
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  3433158 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5236770 - 5236674
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  5236770 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 39448419 - 39448463
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39448419 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 39448463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22312235 - 22312192
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312235 ggtgatgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 22312192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23509335 - 23509284
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23509335 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 23509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 45560816 - 45560859
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45560816 ggtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatgtatgtgt 45560859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 23118678 - 23118732
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23118678 ttatgtggattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctact 23118732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23835595 - 23835513
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  23835595 tttgaattggtttattcatgtctaactatttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctac 23835513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 444
Target Start/End: Original strand, 37655448 - 37655526
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgt-tatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  37655448 ttgaattgatttattcatgtctaactgtctatgtgggttatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgaccgcc 37655526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 273059 - 273112
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  273059 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 273112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 642790 - 642737
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  642790 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 642737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 828596 - 828543
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  828596 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 828543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5236495 - 5236442
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5236495 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 5236442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 21846348 - 21846401
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21846348 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctact 21846401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 21853753 - 21853806
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21853753 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctact 21853806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 22090301 - 22090354
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22090301 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 22090354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 24663103 - 24663156
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24663103 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 24663156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43683954 - 43683901
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43683954 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 43683901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 21192343 - 21192387
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21192343 aggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 21192387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 21199770 - 21199814
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21199770 aggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 21199814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21696127 - 21696083
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  21696127 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgt 21696083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 21846073 - 21846169
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21846073 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 21853478 - 21853574
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21853478 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 31195881 - 31195917
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31195881 aggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 13664476 - 13664527
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  13664476 tgatacatgtgattggtgattgttcgtgaaatatgattaatgattgttcatg 13664527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 13723751 - 13723802
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  13723751 tgatacatgtgattggtgattgttcgtgaaatatgattaatgattgttcatg 13723802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 22090026 - 22090097
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090026 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11542906 - 11542868
Alignment:
Q  100 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgt 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11542906 gacgaccttgaggtgatttgataccacgtgcatatatgt 11542868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 21496168 - 21496214
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21496168 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 21496214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 225020 - 225073
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  225020 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctact 225073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 701433 - 701486
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  701433 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctact 701486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 738643 - 738696
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  738643 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctact 738696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 862538 - 862591
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  862538 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctact 862591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16676182 - 16676235
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16676182 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtagttttaaccgcctact 16676235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 16874791 - 16874836
Alignment:
Q  403 attatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16874791 attatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16874836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Original strand, 18768302 - 18768359
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18768302 cttcggccttgcagatatcatttagtgatctagtttgtgggctttgaccctgcagaga 18768359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22884778 - 22884733
Alignment:
Q  403 attatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22884778 attatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 22884733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 24108395 - 24108461
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24108395 aaatgtgattgatgaatgttcatggaatatgattggtgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 24108461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Original strand, 17148093 - 17148141
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17148093 tggattatgataatgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctact 17148141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18610715 - 18610667
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  18610715 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 18610667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 20649007 - 20649046
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20649007 tttggggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctag 20649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 22909280 - 22909320
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22909280 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaacgattgttcatga 22909320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23835786 - 23835743
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  23835786 aggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatgtgt 23835743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 29296244 - 29296164
Alignment:
Q  370 tgaattgaattattcatgt-taactg-ttatgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  29296244 tgaattgaattattcatgtccaactgtttatgtggagcattattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctac 29296164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 447
Target Start/End: Original strand, 13341 - 13772
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  13341 atctagtttgtggacttcgatcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgac 13438  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaa 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||  ||||      
T  13439 gaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgtatgag- 13536  T
Q  202 tatgattgaggattgttca-tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattga 300  Q
    ||         |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  13537 ta---------attgttaaatgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgat-attgttcatgacacatgtgattagtgaatattga 13626  T
Q  301 tgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgt 400  Q
    |||||||||| ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13627 tgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattt 13725  T
Q  401 ggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13726 ggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 13772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 139)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 171 - 425
Target Start/End: Original strand, 13867836 - 13868090
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  13867836 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttg 13867935  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13867936 ttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatgatataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 13868035  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13868036 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 13868090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 96 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 369463 - 369133
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  369463 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 369364  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  369363 tcatgaaatatgattaatgattattcatgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtga 369264  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    | ||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  369263 tgattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaact 369165  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  369164 gttatttggattatgataatgtaatacttacc 369133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 7286294 - 7286532
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7286294 tgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 7286393  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7286394 ttggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcat 7286493  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7286494 gttaactgttatgttgattatgatgatgtaatacttacc 7286532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11285803 - 11285613
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11285803 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctggggataggtgacgaccttg 11285704  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11285703 agttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgttcatga 11285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7291139 - 7290890
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  7291139 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacat 7291040  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  7291039 gtgattgatgattattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 7290941  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7290940 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 7290890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 221 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44863637 - 44863418
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  44863637 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 44863538  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44863537 atgtaagtataagtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgtaatac 44863438  T
Q  421 ttacctccagtggttttgac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  44863437 ttacccccagtggttttgac 44863418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Original strand, 11582534 - 11582872
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11582534 ggtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttc 11582633  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||       ||||||| |||||    
T  11582634 atgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccat-------gtgattgatgatt 11582726  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    ||||||||||||||| | |  | |||  |||||||  || ||||   ||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  11582727 attgatgtgagatattgag-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgt 11582820  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11582821 tatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 11582872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 214 - 425
Target Start/End: Original strand, 12545600 - 12545812
Alignment:
Q  214 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12545600 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattgg 12545699  T
Q  314 gattat-gagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    | || | ||  ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12545700 ggtttttgatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatga 12545799  T
Q  413 tgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||    
T  12545800 tgtaatacttacc 12545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 221 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47288170 - 47287950
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  47288170 tgatgtatgtaattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttg 47288071  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47288070 atgtaagtatatgtacgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 47287971  T
Q  421 ttacctccagtggttttgacc 441  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  47287970 ttacccccagtggttttgacc 47287950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12753358 - 12753140
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||| |||||    
T  12753358 gtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataag 12753259  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12753258 tatt-atttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 12753160  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12753159 cagtggttttgaccgcctac 12753140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 425
Target Start/End: Original strand, 18305591 - 18305841
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  18305591 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttg 18305690  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18305691 ttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtt-tggtgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgttt 18305786  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18305787 atattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 18305841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 15952825 - 15953068
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  15952825 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 15952924  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||    
T  15952925 ttggtgaatattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcat 15953021  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15953022 gttaactattatttggattatgataatgtaatacttacctccagtgg 15953068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 2192572 - 2192809
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2192572 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 2192671  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  2192672 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 2192770  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2192771 gttatatgttatttggattatgataatgtaatacttacc 2192809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 16480802 - 16481047
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16480802 tgattgtttatgacttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtga 16480901  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16480902 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 16481000  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16481001 gttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 16481047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 26071937 - 26072163
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  26071937 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 26072036  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26072037 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 26072136  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||  |||| ||||| | |||||||    
T  26072137 ttacccacagtcgttttaatcgcctac 26072163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 26095724 - 26095950
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  26095724 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 26095823  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26095824 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 26095923  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||  |||| ||||| | |||||||    
T  26095924 ttacccacagtcgttttaatcgcctac 26095950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 447
Target Start/End: Original strand, 13038809 - 13039146
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttca 196  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13038809 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgttca 13038908  T
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||        |||||| ||||||    
T  13038909 tgaaatgtgattaatgattgttcatgacaaatgtgatcggtgattgtgaatgaacatttgtgaattgataattgttcat-------atgattgatgatta 13039001  T
Q  297 ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtt 396  Q
    |||||||||||||| | |  | |||  |||||||  || ||||   |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  13039002 ttgatgtgagatattgag-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgtt 13039095  T
Q  397 atgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  13039096 atttggattatgttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctac 13039146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 142062 - 141838
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  142062 tgatgtatgtgattggttattgtgtatgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtt-tg 141964  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141963 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 141864  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  141863 ttacc-ccagtggttttgaccgcctac 141838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 15824178 - 15824403
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  15824178 tgatgtatgtgtttggtgattatgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tg 15824276  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15824277 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 15824376  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  15824377 ttacccctagtggttttaaccgcctac 15824403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 241 - 447
Target Start/End: Original strand, 49049549 - 49049755
Alignment:
Q  241 tgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtg 339  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  || | ||||  ||||||    
T  49049549 tgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatggtatgaatata--tatgtg 49049646  T
Q  340 aatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49049647 gatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttg 49049746  T
Q  439 accgcctac 447  Q
    |||||||||    
T  49049747 accgcctac 49049755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 142229 - 142040
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  142229 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggctttagaccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgac 142132  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtg-taataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  142131 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgt 142040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Original strand, 32496143 - 32496483
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  32496143 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattg-gtg 292  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||        ||||||  ||    
T  32496243 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgtttgtg-atgaataattatgaattgataattgttcat-------atgattgattg 32496334  T
Q  293 attattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaac 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32496335 attattgatgtgagatatc-ggagtgtgatgtaagtatttatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttaac 32496428  T
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || | | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  32496429 tgctgtttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 32496483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 196 - 433
Target Start/End: Original strand, 14253046 - 14253281
Alignment:
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  14253046 atgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttatt 14253144  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  14253145 attgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgt 14253243  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14253244 tatttggattatgttgatgtaatacttacccccagtgg 14253281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44863804 - 44863615
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  44863804 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgac 44863707  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44863706 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgt 44863615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 15824012 - 15824198
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||  || || | |||||    
T  15824012 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagaccc-ttggcggtcaggatatggatgacg 15824109  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  15824110 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgatt 15824198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 10862422 - 10862661
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  10862422 atctagtttgtgggcttcggccttacagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttggtggtctagatataggtgacg 10862520  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg- 198  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||     
T  10862521 accttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatga 10862620  T
Q  199 -aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtg 238  Q
     |||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  10862621 taaatgtggttgatgattgttcatgacacatgtgattggtg 10862661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15629192 - 15628972
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||    
T  15629192 atgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttgatgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattat--ggta 15629095  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattatta-ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
     | ||| |||| || ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15629094 tgaatatatatatggatattatgatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 15628995  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  15628994 ccctagtggttttgaccgcctac 15628972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 12545313 - 12545537
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  12545313 atctagtttttgggtttcggccttgcagagatcttttag--atctagtttgtggacttctgtcttgcagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacg 12545409  T
Q  104 accttgaggtgattt-ggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545410 accttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaa 12545509  T
Q  202 tatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    | ||||| | || ||||||||| |||||    
T  12545510 tgtgattaatgactgttcatgaaatatg 12545537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 277
Target Start/End: Original strand, 13867635 - 13867864
Alignment:
Q  44 gatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-a 142  Q
    |||||||||||||| |||  | |||| | |||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13867635 gatctagtttgtggacttcggtcttgtaaagaccc-ttggtgatctggatatgggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 13867733  T
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  13867734 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattgctgattgttcatgaaata--tgattgatgattg 13867831  T
Q  243 tgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |  ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13867832 ttcatg-ataaatgtg-attaatgattgttcatga 13867864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 49049365 - 49049603
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49049365 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttggcggtctagatataggtgacgaccttg 49049463  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | | ||| ||||   ||||    
T  49049464 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgtgcatgaataaat 49049563  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49049564 gtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 49049603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122738
Alignment:
Q  115 atttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | |    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggggattgttcatgaaatgtgagtaatg 122960  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  122959 attattcatgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatgattattgatgtgagatattg 122867  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
     |  | |||  ||| |||  || ||||   | ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  122866 ag-gtgtgatgtaattattaatgtgtg---actattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcgtgttaactgctatttggattatgataa 122773  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  122772 tgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctac 122738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16209943
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgttcatgaaatgtgattaatg 16210164  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||        || ||  |||||||| ||||||||||| |    
T  16210163 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaat-attgtgaattggtaattgttcat-------atgtttaatgattattaatgtgagatattg 16210072  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
     | | | ||  |||||||  || |||    ||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  16210071 tggtga-gatgtaagtattgatgtgt---aattattattgatcaaatgcatgatgtt--aatagaattattcatgataactgttatttggattatgataa 16209978  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  16209977 tgtaatacttatccccagtgattttaaccgcctac 16209943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47288337 - 47288148
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  47288337 atctagtttgtggacttcggtcttgcaaagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgac 47288240  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  47288239 aaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgt 47288148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3893573 - 3893349
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||  ||||    
T  3893573 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaag 3893474  T
Q  328 tatacatatgt------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatact 421  Q
    |||| |||| |      | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3893473 tatatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatact 3893375  T
Q  422 tacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||    
T  3893374 tacccctagtggttttgaccgtctac 3893349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 345 - 447
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572085
Alignment:
Q  345 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcc 16572082  T
Q  445 tac 447  Q
    |||    
T  16572083 tac 16572085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 345 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593577
Alignment:
Q  345 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcc 16593580  T
Q  445 tac 447  Q
    |||    
T  16593579 tac 16593577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3055246 - 3054950
Alignment:
Q  141 aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtg 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | | || | ||||||| ||| |||||||||||    
T  3055246 aataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgttcataaaatgtgactaatgactattcatgaatatttgtgattggtg 3055147  T
Q  239 attgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgt 338  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||| |||  | ||| |||| |||  || |||    
T  3055146 attgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatgattattgatgtgagatat-gggggtgtgatataattattaatgtgt 3055055  T
Q  339 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
    | |   | ||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  3055054 gga---ttttattgatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggtttta 3054959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13273334 - 13273170
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  13273334 tttgtggacttcagtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcctcggccttgcagaga-cctttggtagtctagatatagatgacgaccttg 13273236  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13273235 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattg 13273170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15629362 - 15629169
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  15629362 tttgtggacttcggtcttgcagagttccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgtagaga-cctttggcggtctagatataggtgacgaccatg 15629264  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatgaa 200  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||    
T  15629263 aattgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaa 15629169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 15762251 - 15762478
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||        |||| | ||||||||||||||||||||     
T  15762251 gattgttcatgatat--gtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatatt 15762341  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    | | || |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  15762342 gaggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttattttgattatgttg 15762441  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  15762442 atgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttact 15762478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 16571661 - 16571849
Alignment:
Q  7 tagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| || |||  |||||||| |||||||| ||||    
T  16571661 tagtttgtggacttcggtcttgtagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcaaaga-cctttgacggtctagatataggtgatgacc 16571759  T
Q  107 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  16571760 ttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgt 16571849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16594001 - 16593813
Alignment:
Q  7 tagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| || |||  |||||||| |||||||| ||||    
T  16594001 tagtttgtggacttcggtcttgtagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcaaaga-cctttgacggtctagatataggtgatgacc 16593903  T
Q  107 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  16593902 ttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgt 16593813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 112986 - 113200
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | || |||  |||||    
T  112986 gtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttt-tgatgtaagt 113084  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    ||  |||||||| || ||||   |||||||| ||| ||||||   ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  113085 attgatatgtgactactatt---gatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccc 113181  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  113182 agtggttttaaccgtctac 113200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 12249678 - 12249847
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||  || ||  ||||||||| || |||||||    
T  12249678 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggtttttcagag-tccttttttggtctagatattggtgacg 12249776  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12249777 actttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatt 12249847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Original strand, 12545523 - 12545627
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  12545523 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattgg 12545622  T
Q  291 tgatt 295  Q
    |||||    
T  12545623 tgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13273164 - 13272975
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  13273164 atgtgaatgatgattgtgcatggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatggtatg 13273065  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
    | | ||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13273064 aatgta--tatgtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgta 13272975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 333 - 447
Target Start/End: Original strand, 45455499 - 45455613
Alignment:
Q  333 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtg 432  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  45455499 atatatgaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttatccctagtg 45455598  T
Q  433 gttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||    
T  45455599 gttttgaccgcctac 45455613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 15761954 - 15762156
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15761954 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgattat 15762053  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| |||| ||||  ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  15762054 tcatggaatatgattggtgattattcatgataaatgtgattgatgattattcatg-ataaatgtg-gttggtgattattcatgataaacgtgattgatga 15762151  T
Q  294 ttatt 298  Q
    |||||    
T  15762152 ttatt 15762156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16416731 - 16416491
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacaca 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||          
T  16416731 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgaataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata----- 16416637  T
Q  282 cgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatta 381  Q
      ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||    
T  16416636 --tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaata 16416543  T
Q  382 ttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16416542 ttcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 16416491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2024892 - 2024765
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtg- 285  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  2024892 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtga 2024793  T
Q  286 ---attggtgattattgatgtgagatat 310  Q
       |||||||||||||||||||||||||    
T  2024792 ttgattggtgattattgatgtgagatat 2024765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 321
Target Start/End: Original strand, 45453932 - 45454026
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatatcgggattatga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  45453932 tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattaggattatga 45454026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 26071861 - 26071959
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26071861 aggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 26071959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 26095648 - 26095746
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26095648 aggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 26095746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051035
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatg 36051048  T
Q  213 attgttcatgata 225  Q
    ||| |||| ||||    
T  36051047 attattcacgata 36051035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 16571833 - 16571923
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16571833 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattgggat 16571923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16593829 - 16593739
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16593829 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattgggat 16593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 1938448 - 1938661
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||  |||||    
T  1938448 gtgattggtgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtggttattgatgtgagatattgg-agtgcgacgtaagt 1938546  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    ||  | |||||  | || |||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  1938547 attgaaatgtg--tttttttattgattaaatgcatgatctt--aattgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccct 1938642  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  1938643 agtggttttaaccgcctac 1938661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024682
Alignment:
Q  350 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 2024682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12753450 - 12753352
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  12753450 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattggtgattg 12753352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Original strand, 112899 - 112992
Alignment:
Q  100 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtg-taataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  112899 gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattggtgattg 112992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3893664 - 3893567
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  3893664 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 3893567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 7286204 - 7286274
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7286204 tgataaatgtggttggtgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatgtggttggtgatt 7286274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11285402 - 11285325
Alignment:
Q  362 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11285402 atgatttttgaattgaattattcatgtttaactgttatgtggattatcatgatgtaatacttacccccagtggatttg 11285325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 18305491 - 18305568
Alignment:
Q  145 ggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||    
T  18305491 ggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaaatgtgattaatgaatgttcatg 18305568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Original strand, 1938364 - 1938460
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  1938364 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattggtgatt 1938460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 447
Target Start/End: Original strand, 12249908 - 12249975
Alignment:
Q  380 tattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12249908 tattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctac 12249975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 9058230 - 9058311
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058230 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11285541 - 11285473
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtga 239  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11285541 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatacatgcgattggtga 11285473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 45453850 - 45453926
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45453850 aggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 45453926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Original strand, 7286159 - 7286226
Alignment:
Q  176 aatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7286159 aatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 7286226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 281
Target Start/End: Original strand, 12249853 - 12249907
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacaca 281  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249853 atgtgattagtgaatgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacaca 12249907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 15952681 - 15952779
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  15952681 aggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattggagattgt 15952779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480782
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||       |||||||  |||  |     
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtg-------atgaaatgagatgaat 16480697  T
Q  212 gattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    || | |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16480698 gactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 2192376 - 2192552
Alignment:
Q  115 atttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||       |||||  |||  | |    
T  2192376 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat-------gaaatgagatgaatg 2192468  T
Q  213 attgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    | | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  2192469 actattcatgaatatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Original strand, 15914224 - 15914303
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15914224 tttgaattgttttattgatgtctaactgttatgtggattataatgatgtaatacttacccccagtgg-tttgaccgcctac 15914303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 18255409 - 18255505
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18255409 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Original strand, 18255663 - 18255739
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18255663 aattgaattattcaagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 18255739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16916017 - 16915938
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16916017 gaattgaattattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 16915938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16917916 - 16917837
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16917916 gaattgaattattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 16917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Original strand, 17229913 - 17229992
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17229913 gaattgatttgttcatgcttaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 17229992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Original strand, 18305364 - 18305434
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  18305364 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagat-catttgtgatttagtttttgggcttcggccttgcagaga 18305434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 20587210 - 20587252
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587210 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 20587252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Original strand, 7286254 - 7286324
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  7286254 tgataaatgtggttggtgattattcatgaaatatgattaatgattgttcatgactta--tgattggtgattgt 7286324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4483314 - 4483270
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483314 aggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 4483270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2435892 - 2435837
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2435892 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 2435837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291257
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt-tgaaatgtgattggtgattg 7291257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 8565177 - 8565216
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565177 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 8565216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 9322663 - 9322706
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322663 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 9322706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11285615 - 11285564
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  11285615 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatg 11285564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13376049 - 13375972
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  13376049 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtattacttacc-ctagtgg-tttgaccgcctac 13375972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16416835 - 16416723
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || |||| ||    
T  16416835 ttggtgattgttcatgatgtatatgatc-aggattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaa-aactgtgaattgatatttatttatgatac 16416738  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  16416737 aagtaattggtgatt 16416723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28719022 - 28718979
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28719022 ggtgacgaccttgaggtgacttggtaccacatgcatatatgtgt 28718979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13388356 - 13388274
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtgg-ttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13388356 ttgaattggtttattcatgtctaactgttcatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctac 13388274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 15762191 - 15762256
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15762191 atgtggttggtgattgttcatgggatatgattaatgattgttcatgataaatgtg-ttggtgattgt 15762256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5617797 - 5617744
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5617797 ttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctac 5617744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10988189 - 10988092
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10988189 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7821502 - 7821406
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  7821502 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7828813 - 7828717
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  7828813 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 10862754 - 10862806
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  10862754 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggtttcgactgcctac 10862806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11285575 - 11285519
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  11285575 tgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatgtgattaatgattgt 11285519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13388534 - 13388490
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13388534 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 13388490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 15518443 - 15518539
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  15518443 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 27103132 - 27103228
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27103132 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 27110480 - 27110576
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27110480 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27175194 - 27175098
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27175194 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 38785224 - 38785320
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  38785224 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 2192532 - 2192583
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2192532 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 2192583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2436206 - 2436135
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  2436206 aggtgacgacctttttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtc 2436135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9609610 - 9609531
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9609610 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctac 9609531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9837182 - 9837103
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9837182 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctac 9837103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16417045 - 16416970
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  16417045 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttat 16416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 9322896 - 9322950
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9322896 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctact 9322950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 10862395 - 10862469
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || || ||| ||||||    
T  10862395 cttcggccttgcagagatcacttagtgatctagtttgtgggcttcggccttacagagatccattagtgatctaga 10862469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11514425 - 11514372
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11514425 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 11514372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13756880 - 13756827
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13756880 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 13756827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 13912975 - 13913028
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13912975 ttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 13913028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 15443419 - 15443472
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15443419 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15443472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 15518719 - 15518772
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15518719 ttatctggattatgataatgtaatacttacccccggtggttttaaccgcctact 15518772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 15762107 - 15762179
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  15762107 tgataaatgtggttggtgattattcatgataaacgtgattgatgattattcatgataaatgtgattgatgatt 15762179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 15914030 - 15914071
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15914030 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15914071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 21676631 - 21676676
Alignment:
Q  96 aggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21676631 aggtgacgacctttgaggcgatttggtaccacatgcatatatgtgt 21676676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 27103407 - 27103460
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27103407 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 27103460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 27110755 - 27110808
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27110755 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 27110808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27174918 - 27174865
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27174918 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 27174865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 30263984 - 30264037
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30263984 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 30264037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 38785499 - 38785552
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38785499 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 38785552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 447
Target Start/End: Original strand, 9058420 - 9058506
Alignment:
Q  362 atgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  9058420 atgatgcttgaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacc-ctagt-gttttgaccgcctac 9058506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10987908 - 10987860
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10987908 tggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 10987860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13376241 - 13376197
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13376241 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccatatgcatttatgtgt 13376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2024954 - 2024904
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  2024954 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15687898 - 15687852
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15687898 gattatgctgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 15687852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Original strand, 15952763 - 15952813
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15952763 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16416879 - 16416825
Alignment:
Q  189 attgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16416879 attgttcatgaattatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgt 16416825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 445
Target Start/End: Original strand, 26011053 - 26011103
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcct 445  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  26011053 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcct 26011103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 18981844 - 18981897
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18981844 ttatctggattatgataatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctact 18981897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 444
Target Start/End: Original strand, 25294139 - 25294188
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  25294139 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcc 25294188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 42060152 - 42060205
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42060152 ttatctggattatgataatgtaatgcttaccctcagtggttttaaccgcctact 42060205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 47288377 - 47288325
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgg 57  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47288377 atctagtttttgggcttcggccttgcagagat-catttgtgatctagtttgtgg 47288325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3058626 - 3058582
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3058626 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgt 3058582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 96 - 336
Target Start/End: Original strand, 13788 - 14029
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13788 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtgattttt 13887  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13888 catgaaatatgattgaagattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgat 13987  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatat 336  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  13988 tattgatgtgagatgttgggattgtggtataagtatatatat 14029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 447
Target Start/End: Original strand, 14075 - 14186
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14075 tgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggtt 14174  T
Q  436 ttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||    
T  14175 ttgaccgcctac 14186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16018 - 15922
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16018 aggtgacgaccttttggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15753 - 15693
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15753 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 15693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 139)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25600527 - 25600312
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25600527 aggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtgattatt 25600428  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25600427 catgaaatatgattgaagattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 25600328  T
Q  295 tattgatgtgagatat 310  Q
    ||||||||||||||||    
T  25600327 tattgatgtgagatat 25600312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 36892434 - 36892660
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||    
T  36892434 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttg 36892533  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36892534 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaatac 36892633  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  36892634 ttacccgcagtggttttgaccgcctac 36892660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654824
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgttcatgaaatgttattaatg 9654606  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9654607 attattcatgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------atgattgatgattattgatgtgagatattg 9654699  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||| | |||  |||||||  |||||||   ||||||||||||||| | ||||||      |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9654700 gga-tgtgatgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatgat------attgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataa 9654789  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  9654790 tgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctac 9654824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 28972461 - 28972240
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcggga-ttatgagat 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||  ||    
T  28972461 atgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtat 28972362  T
Q  325 aagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28972361 atgtatatatgtgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt-aattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 28972263  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  28972262 ccccagtgattttgaccgcctac 28972240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 448
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629357
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatg 20629133  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  20629134 attattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat-------gtgattgataattattgatgtgagataatg 20629226  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||  | |||  |||||||  || ||||    || ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  20629227 gg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttgttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttggattatgataa 20629320  T
Q  413 tgtaatacttacctcc-agtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20629321 tgtaatacttaccccctagtggttttaaccgcctact 20629357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 42180179 - 42180420
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  42180179 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 42180278  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  42180279 tgattattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgtta 42180377  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42180378 actgttatttggattatgttgatgtaatacttacccccagtgg 42180420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7319906 - 7319686
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||     
T  7319906 atgtgaatgatgattgtgtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatggtatg 7319807  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||  || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319806 aatata--tacgtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 7319709  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |  ||||| ||||||||||||||    
T  7319708 cctcagtgattttgaccgcctac 7319686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 25877692 - 25877914
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | ||    
T  25877692 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggat-tg 25877790  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||   ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25877791 atgtaagtattgttatgtgaatatt---attgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatat 25877887  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  25877888 ttacccccaatggtttttaccgcctac 25877914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Original strand, 21276333 - 21276553
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21276333 gattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatatt 21276432  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||| || |||  |||||||  || || |||||| |||||||||||| | ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21276433 ggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgata 21276531  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  21276532 atgtaatacttatccccagtgg 21276553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 433
Target Start/End: Original strand, 12637988 - 12638205
Alignment:
Q  215 tgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcggg 314  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  12637988 tgttcatgatgcatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggg 12638087  T
Q  315 attatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatg 414  Q
     || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  12638088 gtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggtttatgataatg 12638186  T
Q  415 taatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12638187 taatacttacccccagtgg 12638205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24966660 - 24966415
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggatt-gttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttc 273  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24966660 aaatgtgattgatgattattcatgaaatgtgattggtgatttgttcatgaaat--gtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttc 24966563  T
Q  274 atgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaa 373  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  24966562 atgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttata 24966467  T
Q  374 ttgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24966466 ttgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgtaatacttacc 24966415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 22581496 - 22581739
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||    
T  22581496 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagagatctagattgtgggcttcggccttgcagaga--ccttgacggtctagatataggtgacg 22581593  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  22581594 accttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcataa 22581693  T
Q  200 ---aatatga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
       ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22581694 atgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 22581739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21140451 - 21140121
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||       
T  21140451 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat--- 21140355  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
        |||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||  |||||| | | ||| |||||||||||    
T  21140354 ----gaaatgagatgaatgattattgatgatgt-tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtga 21140260  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  21140259 ttattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatct 21140161  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21140160 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 21140121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7320075 - 7319838
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7320075 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcagccttgcagaga-cctttggcggtctagatataggtgacgaccttga 7319977  T
Q  111 ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga---aata 203  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  ||||   |||     
T  7319976 agtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaatgaatg 7319877  T
Q  204 tga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7319876 tgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 7319838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 36892269 - 36892456
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  36892269 atctagttt-tgggcttcggccttgcagagatc-atttgtgatctagtttgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacg 36892365  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36892366 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 36892456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 12643778 - 12644018
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  12643778 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 12643877  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || |||  |||||||    |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||    
T  12643878 ttggtgattattgatgtgagacattggggtt-tgatgtaagtat--tgatgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcat 12643971  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12643972 gataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 12644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 3801085 - 3801324
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  3801085 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 3801178  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  3801179 -tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 3801273  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3801274 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 3801324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 31745 - 31983
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| |  |||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31745 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtaggcttcggccttgcataga-catttggcggtctagatatatgtgacgaccttg 31843  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||   ||||    
T  31844 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaataaat 31943  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31944 gtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgatt 31983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 31915 - 32133
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattatt-gatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||    
T  31915 atgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattat-ag-ta 32012  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattga-tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
     | ||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32013 tgaatatatatgtga-tattattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 32111  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||| ||||    
T  32112 c-ctagtggttttgaccgtctac 32133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34822533 - 34822297
Alignment:
Q  186 gtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtg 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||        ||    
T  34822533 gtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tg 34822441  T
Q  286 attggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  34822440 attgatgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcca 34822345  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34822344 tgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 34822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 25877527 - 25877714
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  25877527 atctagttt-tgggctccggtcttgcagagatctttt-gagatctagtttgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggattaaggtgacg 25877623  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25877624 accttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 25877714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 721026 - 720829
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  721026 atctagtttgtgggtttcggccttgcagagatc-attagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacg 720929  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
      ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  720928 ttcttgaagagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatga 720829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8941933 - 8941679
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  8941933 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 8941840  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || ||||||||||| | |||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  8941839 -tgattgacgaatattgatgtgaaacatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 8941745  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8941744 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 8941679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25211114 - 25210860
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  25211114 ttggtgactgttcatgaaatgtgattaataattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 25211021  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  25211020 -tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 25210926  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
     ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25210925 ccatgttaactgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 25210860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450203
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacctc 4450183  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4450184 tagtggttttgaccgcctac 4450203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 19888699 - 19888938
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  19888699 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattatgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 19888792  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  19888793 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 19888887  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19888888 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 19888938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461091
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttcatgagatgtgattaatg 461120  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  461119 attattcatgataaatgtgattggtgatt 461091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 24572962 - 24573201
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagatagg-tgacgacctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || || |||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24572962 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagtga-cctttgaaggtctagatataggttgacgacctt 24573060  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcat---gaaa 201  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||| |||    |||    
T  24573061 gaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtgcataaataaa 24573160  T
Q  202 tatga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    | ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24573161 tgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 24573201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22273459 - 22273131
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       |||||    
T  22273459 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtg-------attgt 22273367  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||       || | |||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| |||    
T  22273366 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattg-------tgaacgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatga 22273281  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
     ||||||||||| | ||||||||  |||  |||||||  || ||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  22273280 gtattgatgtgaaacatcgggatg-tgatgtaagtattaatgtgtgactattatt---gatcaaatacatgatgatt-aattgaaatattcatgttaact 22273186  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22273185 gctatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctact 22273131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 22581671 - 22581890
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| || |     
T  22581671 atgtgattgatgattgtgcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattat-ag-tg 22581768  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
     | ||| || ||||| ||||||||| | || || || ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22581769 tgaatatatttgtga-tattattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 22581867  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  22581868 ccccagtggttttgaccgcctac 22581890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22282692 - 22282364
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       |||||    
T  22282692 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtg-------attgt 22282600  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||       || | |||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| |||    
T  22282599 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattg-------tgaacgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatga 22282514  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
     ||||||||||| |||||||| |  |||  |||||||  || ||||| |||||||   |||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  22282513 gtattgatgtgaaatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtgactattatt---gatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaact 22282419  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22282418 gctatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctact 22282364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Original strand, 38706772 - 38707003
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  38706772 ttggtgattgttcctgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 38706865  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| ||  |  |||  ||||||  |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  38706866 -tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtg-tgatgtaagta--ctaatgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatat 38706960  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38706961 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 38707003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25600252 - 25600142
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600252 tgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggtt 25600154  T
Q  436 ttgaccgcctac 447  Q
    ||| ||||||||    
T  25600153 ttggccgcctac 25600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28972630 - 28972393
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || |||  ||||||||  || ||||||||||||    
T  28972630 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggctccggccttgcagaga-cctttgacggtctagatgtatgtgacgaccttg 28972532  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||     ||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||   ||||    
T  28972531 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaataaat 28972433  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  28972432 gtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgatt 28972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 269608 - 269421
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||  |||     
T  269608 tgtgattggtaattgtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatat 269509  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  269508 gtata--tatgtgaatattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgta 269421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 4449792 - 4449927
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||    
T  4449792 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagaaataggtgac 4449889  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4449890 gaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 4449927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654308
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttaatc 22654314  T
Q  442 gcctac 447  Q
    ||||||    
T  22654313 gcctac 22654308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Original strand, 24088972 - 24089122
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||     
T  24088972 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtg 24089071  T
Q  195 catg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24089072 catgataaatgtgattgatgattgttcatgataaatgtgattgatgattgt 24089122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966660
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatg 24966671  T
Q  213 attgttcatga 223  Q
    |||||||||||    
T  24966670 attgttcatga 24966660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 22691520 - 22691649
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||  |||  ||||| || |||||||| ||||||    
T  22691520 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggcttcggccttacagagacct-ttgacggtctggatataggtgaagacctt 22691617  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22691618 gaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgt 22691649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 22696167 - 22696296
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||  |||  ||||| || |||||||| ||||||    
T  22696167 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggcttcggccttacagagacct-ttgacggtctggatataggtgaagacctt 22696264  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22696265 gaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgt 22696296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 43644559 - 43644657
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43644559 aggtgacgatcttttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 43644657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 447
Target Start/End: Original strand, 22691829 - 22691941
Alignment:
Q  334 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22691829 tatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgtaatatttacc-ccaatgg 22691927  T
Q  434 ttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||    
T  22691928 ttttaaccgcctac 22691941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 447
Target Start/End: Original strand, 22696476 - 22696588
Alignment:
Q  334 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22696476 tatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgtaatatttacc-ccaatgg 22696574  T
Q  434 ttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||    
T  22696575 ttttaaccgcctac 22696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 416
Target Start/End: Original strand, 24573133 - 24573321
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |     
T  24573133 atgtgattgaagattgtgcataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattat-ag-tg 24573230  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
     | ||| || |||| || |||||||  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24573231 tgaatatatttgtg-attttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgta 24573321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15631963 - 15631849
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15631963 aggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggtgattgt 15631864  T
Q  194 tcatgaaatatgatt 208  Q
    |||| |||| |||||    
T  15631863 tcatcaaatgtgatt 15631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 425
Target Start/End: Original strand, 24089050 - 24089285
Alignment:
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  24089050 tgaaatgtgattgatgattgtgcatgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtga-ttgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattg 24089147  T
Q  297 -ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacat----atgtgaatattattat---tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg- 387  Q
     || |||| |||| | || ||||||  || |||||||||    || | | |||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  24089148 cttaatgtaagatgttggaattatggtatgagtatacatctagatattattattattatcattgattaagtacatgatatttgaattgatttattcatgt 24089247  T
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  24089248 ttaactgttatacggattatgatgatgtaatatttacc 24089285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 269784 - 269649
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||||    
T  269784 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatct-ttggtgatctagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataagtgac 269687  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  269686 gaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 269649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 447
Target Start/End: Original strand, 43644681 - 43644926
Alignment:
Q  189 attgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgatt 288  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||        |||||    
T  43644681 attgttcacgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcat-------atgatt 43644773  T
Q  289 ggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgt 388  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||   | ||||    ||| |||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||     
T  43644774 gatgattattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattattgtgtg---gttaatattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatga 43644867  T
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| | | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  43644868 taactgctttttggattgtgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgtctac 43644926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6877927 - 6877689
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||  || || |||  ||    
T  6877927 atgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgta 6877828  T
Q  326 agtatacatatgtgaatat-----------------tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatg 408  Q
    |||||| |||| |  ||||                 |||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6877827 agtatatatatatatatatatatatatatatatatatattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatg 6877728  T
Q  409 atgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  6877727 ataatgtaatacttacccccagaggtgttgaccgtctac 6877689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8886707 - 8886609
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  8886707 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggtgattgt 8886609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 8886631 - 8886428
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||       |||||  |||||||||||| ||||||| || | | ||    
T  8886631 tgatatgtgtgattggtgattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattaatgattattgatgcgagatattgg-agtgtg 8886540  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  || ||||  || |||||   |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8886539 atgtaggtattgatgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatac 8886445  T
Q  421 ttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8886444 ttacccccagtggtttt 8886428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25211220 - 25211108
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25211220 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatac 25211121  T
Q  281 acgtgattggtga 293  Q
    | || ||||||||    
T  25211120 aagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15631833 - 15631610
Alignment:
Q  200 aatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattg 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||| | |||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15631833 aatatgattggtgattgttcatgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattg 15631734  T
Q  300 atgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttat 398  Q
    |||||||||||  ||| | |||  |||||            ||||| ||||||||||| | ||||||| ||  |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  15631733 atgtgagatat-tggagtttgatgtaagt------------atattgttattgatcaaatgcatgatg-ttatattgaaatatccatgattaactgttat 15631648  T
Q  399 gtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15631647 ttgaattatgatgatgtaatacttacccccagtggttt 15631610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 19435066 - 19435144
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435066 aggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22861971 - 22861764
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||       |||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||    
T  22861971 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg-------tgattaatgattattgatgtgagatatcgggggtgtgatgtaag 22861879  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat-tattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    |||  || |||||   |||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  22861878 tattaatgtgtga---ttattattgatcaaatgcctgatgtt--aattgaaaatattcatgataattgttattttgattatgataatgtaatacttacc- 22861785  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  22861784 ccagtggttttaaccgcctac 22861764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 24296382 - 24296451
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24296382 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 24296451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 443
Target Start/End: Original strand, 5076 - 5151
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5076 ttgaattgttttattcatgtctaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc 5151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 3800960 - 3801043
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  3800960 gattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6878009 - 6877911
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  6878009 aggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgt 6877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 12643608 - 12643706
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||    
T  12643608 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgt 12643706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22862054 - 22861956
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   || |||| |||||||||||    
T  22862054 aggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgattgt 22861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 380 - 440
Target Start/End: Original strand, 23823315 - 23823376
Alignment:
Q  380 tattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23823315 tattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 23823376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 380 - 440
Target Start/End: Original strand, 23825259 - 23825320
Alignment:
Q  380 tattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23825259 tattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 23825320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 461111 - 461007
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| | |||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  461111 tgataaatgtgattggtgattcttcatgagatgtgattaatgattatttacgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattg 461012  T
Q  271 ttcat 275  Q
    |||||    
T  461011 ttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 721067 - 720996
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  721067 atctagtttgtgggcttcggccttgcagagatcaattagtgatctagtttgtgggtttcggccttgcagaga 720996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 12637747 - 12637940
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||         
T  12637747 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg----- 12637841  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12637842 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgt-tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 12637938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 305
Target Start/End: Original strand, 22691690 - 22691768
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22691690 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtga 22691768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 305
Target Start/End: Original strand, 22696337 - 22696415
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22696337 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtga 22696415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 720740 - 720660
Alignment:
Q  357 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  720740 agtacataatatttgaattgatttattcacgtttaactgttatatggattatgaggatgtaatacttacccccagtggttt 720660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19658516 - 19658472
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658516 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 19658472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 460901 - 460801
Alignment:
Q  344 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  460901 ttattactgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataattgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagttgttttaaccgc 460804  T
Q  444 cta 446  Q
    |||    
T  460803 cta 460801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 21276109 - 21276184
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21276109 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 21276184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 22137424 - 22137467
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137424 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 22137467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Original strand, 22137633 - 22137703
Alignment:
Q  377 aattattcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  22137633 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgctaacc-ccagtggttttgaccgcctac 22137703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 443
Target Start/End: Original strand, 23806441 - 23806512
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23806441 aattgaaatattcatgttaactgttatttgtattatgataatttaatacttacccccagtggttttaaccgc 23806512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8942033 - 8941955
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8942033 tgattgttcatgacttttgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaatgactgtgaattgat 8941955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 721093 - 721037
Alignment:
Q  19 ttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  721093 ttcggccttgcagagatcaattagtgatctagtttgtgggcttcggccttgcagaga 721037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22692864 - 22692768
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22692864 aggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22697511 - 22697415
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22697511 aggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43641393 - 43641349
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43641393 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgt 43641349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18534395 - 18534352
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534395 ggtgacgacgttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 18534352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19655297 - 19655230
Alignment:
Q  381 attcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  19655297 attcatgttaaactgttatgtagattatgatgatgtaatgcttacccccaatggttttgatcgcctac 19655230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Original strand, 19670970 - 19671029
Alignment:
Q  379 ttattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  19670970 ttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccccagtgatttt 19671029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 19888624 - 19888707
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  19888624 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactatgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 19888707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24272624 - 24272581
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24272624 ggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 24272581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 24828143 - 24828218
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828143 aggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 24832595 - 24832670
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832595 aggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34822772 - 34822578
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||         
T  34822772 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtg----- 34822678  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||| ||| || ||||||||    
T  34822677 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtga 34822580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Original strand, 40642140 - 40642219
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  40642140 gaattgatttattcatgattaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctac 40642219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 446
Target Start/End: Original strand, 19812896 - 19812953
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19812896 ttaactgttatatggattatgatgatgtaatatttacc-ccagtggttttgactgccta 19812953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25303943 - 25303866
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgatg-atgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25303943 ttgaagtgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgatttatgtaatacttacctctagtggttttgaccgc 25303866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 4884 - 4928
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4884 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 3800695 - 3800791
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  3800695 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 5889878 - 5889974
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  5889878 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 11232833 - 11232929
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  11232833 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Original strand, 12643690 - 12643758
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  12643690 atgtgattggtgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 14908020 - 14908116
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  14908020 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 19888360 - 19888456
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  19888360 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 22514680 - 22514776
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  22514680 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 23823116 - 23823160
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23823116 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 23823160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 23825060 - 23825104
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23825060 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 23825104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 23832195 - 23832239
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23832195 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 23832239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 24296180 - 24296224
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24296180 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 24296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25304135 - 25304091
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25304135 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 25304091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 28777281 - 28777377
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  28777281 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 445
Target Start/End: Original strand, 9782734 - 9782785
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcct 445  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9782734 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccactggttttgaccgcct 9782785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 12637920 - 12637971
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12637920 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 12637971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 12643738 - 12643789
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12643738 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 12643789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 24828457 - 24828512
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24828457 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctact 24828512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 24832909 - 24832964
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24832909 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctact 24832964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089147
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatga--aatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatgataaatgtgattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattg 24089147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 5890154 - 5890207
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5890154 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 5890207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 11233108 - 11233161
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11233108 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 11233161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 14908295 - 14908348
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14908295 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 14908348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 17398453 - 17398506
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17398453 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 17398506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20013422 - 20013369
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20013422 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 20013369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 22514955 - 22515008
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22514955 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 22515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22692592 - 22692539
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  22692592 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccattggttttaaccgcctact 22692539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22697239 - 22697186
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  22697239 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccattggttttaaccgcctact 22697186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 22787600 - 22787669
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcaga 73  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  22787600 atctagtttgtgggctttgagcctgcagagatccattagtgatctagattgtgggctccggccttgcaga 22787669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23772836 - 23772783
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23772836 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 23772783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23818479 - 23818426
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23818479 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 23818426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 24687526 - 24687579
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24687526 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 24687579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 28777557 - 28777610
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28777557 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 28777610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Original strand, 43644635 - 43644688
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  43644635 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800869 - 3800920
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3800869 tgatacatgtgaatggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 3800920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12726627 - 12726556
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  12726627 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 12726556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 22787574 - 22787617
Alignment:
Q  19 ttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggcttt 62  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22787574 ttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttt 22787617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19657805 - 19657767
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19657805 ttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccccagtgg 19657767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 23779788 - 23779834
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23779788 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 23779834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  121 taccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 28032932 - 28032978
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28032932 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 28032978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12726351 - 12726298
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12726351 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctact 12726298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 140
Target Start/End: Original strand, 24562483 - 24562516
Alignment:
Q  107 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24562483 ttgaggtgatttggtaccacatgcaaatatgtgt 24562516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 7513768 - 7513816
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  7513768 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 7513816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8942220 - 8942124
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  8942220 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 19670737 - 19670781
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  19670737 aggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatgtgt 19670781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25211277 - 25211210
Alignment:
Q  178 tgtggttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25211277 tgtgattggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgt 25211210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 171 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17979 - 17725
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  17979 tgataaatgtgattgatgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttg 17880  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17879 ttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatgatataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgttt 17780  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17779 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgtaatacttacc 17725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18182 - 18025
Alignment:
Q  66 cttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgag 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18182 cttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgag 18084  T
Q  165 tcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  18083 tcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatga 18025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18013 - 17957
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18013 tgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatgtgattgatgattgt 17957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18049 - 17951
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||  |||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  18049 aaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatggaata--tgattgatgattgttcatg-ataaatgtg-attgatgattgttca 17954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41217773 - 41217534
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  41217773 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 41217674  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  41217673 ttggtgattattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattca 41217574  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41217573 tgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 41217534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Original strand, 20895389 - 20895719
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20895389 ggtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttc 20895488  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20895489 atgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgatt 20895588  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    |||||||                     ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  20895589 attgatg---------------------taagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgtaaacagt 20895667  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20895668 taattgaattatgttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 20895719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 22407968 - 22408194
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  22407968 tgatatatgtgattggtgattgtgtgtgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 22408067  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22408068 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatac 22408167  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22408168 ttacccctagtggttttaaccgcctac 22408194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 447
Target Start/End: Original strand, 9786073 - 9786346
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  9786073 tgataaatgtgattgatgattgttcatggaatatgatttgggattgttcatgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttg 9786172  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||| |  |||  |||||| |  |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9786173 ttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattggggt--tgatgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgttt 9786270  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
        |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9786271 atgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 9786346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 22836818 - 22837060
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  22836818 atctagtttgtgggcatcgaccatgcagaaatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacct-ttggtgttctagatataggtgacg 22836916  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatg-- 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||      
T  22836917 accttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgttcatgat 22837016  T
Q  199 aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22837017 aaatgtgattgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattg 22837060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Original strand, 35524165 - 35524381
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  35524165 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaa 35524264  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  35524265 gtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgtaatacttacc- 35524360  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  35524361 ccagtggttttaaccgcctac 35524381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 20956534 - 20956777
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20956534 atctagtttgtgggcttcagccttgcagagatccattggtgatctagattatgggcttcggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacg 20956632  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20956633 accttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatga 20956732  T
Q  200 --aatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
      | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20956733 ttattgtgattgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattg 20956777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676567
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagt 5676448  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5676449 atatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttaccccc 5676548  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5676549 agtggttttgaccgcctac 5676567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20252565 - 20252326
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| ||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||     
T  20252565 tgttcatggaatataattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattga 20252466  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20252465 tgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgtta 20252367  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagt 431  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20252366 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagt 20252326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49966247 - 49966055
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagac---cccttggtggtctagagataggtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| || || ||||    
T  49966247 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattatgggcttcagccttgcagagagagacccttggtggtctggatatgggtg 49966149  T
Q  101 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49966148 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 49966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 443
Target Start/End: Original strand, 37846064 - 37846394
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37846064 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtt 37846163  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     ||||||| |||||||||        |||||| ||||    
T  37846164 catgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataa-----aattgataattgttcat-------atgattgatgat 37846251  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
     ||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    ||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  37846252 cattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaaatcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactg 37846345  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  37846346 ctatttggattatgataatgtaatacttacccccaatggttttaaccgc 37846394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20444312 - 20443974
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20444312 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtt 20444213  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||        | |||  ||||    
T  20444212 catgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgactatgaatgaataattgtgaattgataattgttcat-------ataattaatgat 20444120  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||     
T  20444119 tattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataacta 20444026  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20444025 ctatttggattgt-ataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 20443974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27673448 - 27673251
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27673448 atctagtttgtgggctttgtccttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttggtggtctagatataggtgacg 27673350  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27673349 cccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgttcatga 27673251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 22407805 - 22407990
Alignment:
Q  7 tagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||| || || ||||||||||    
T  22407805 tagtttgtggacttcggtcttgtagagatccat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgtagagacccat-ggtggtctggatatgggtgacgacc 22407902  T
Q  107 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22407903 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 22407990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35053312 - 35053109
Alignment:
Q  233 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatac 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    |||            
T  35053312 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggttt---gatg------- 35053223  T
Q  333 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtg 432  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35053222 -tatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacctacccccagtg 35053124  T
Q  433 gttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||    
T  35053123 gttttgaccgcctac 35053109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 9785898 - 9786025
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9785898 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 9785997  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  9785998 atgaaatatggttggcgattgttcatga 9786025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857721
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||       | ||||  |||||| ||||| | |    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtg-------actgtttttgaaatgtgattaatg 21857943  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||| ||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21857942 attattcatgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-------catgattgatgattattgatgtgagatattg 21857850  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    || |  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  21857849 gggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataa 21857756  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21857755 tgtaatacttacccccagtggttttaactgcctac 21857721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17147041 - 17146787
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  17147041 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 17146948  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  17146947 -tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 17146853  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17146852 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 17146787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Original strand, 44036491 - 44036823
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtaa-taggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       |||||    
T  44036491 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtg-------attgt 44036583  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| |||    
T  44036584 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgatgaatgtaattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------atgattgatga 44036676  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
     ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||  |||||||   ||||||||||||||| | || | ||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  44036677 atattgatgtgagatatcggg-gtgtgatgtaagtatttatatgtg---attattattgatcaaatgcaggttgtt--aattg-attattcatgataact 44036769  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  44036770 gttatttggattatgataatgtaatacttacccacagtggttttaaccgcctac 44036823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22365253 - 22364925
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  22365253 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 22365154  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| ||||| | || | |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||       ||||| | |||    
T  22365153 cgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtgaattgataactgttcat-------gtgatggatga 22365061  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  22365060 ttattgacgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaaatattcatgttatct 22364965  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22364964 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 22364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 51658069 - 51658288
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||  ||     
T  51658069 atgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatg 51658168  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    | | ||  |||||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51658169 aatgta--tatgtagatattattgt-gattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 51658265  T
Q  426 tccagt-ggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  51658266 cccagtgggttttgaccgcctac 51658288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Original strand, 15863287 - 15863526
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  15863287 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 15863380  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  15863381 -tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatat 15863475  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15863476 ccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 15863526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22352700 - 22352498
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22352700 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
    ||||||||| ||||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22352600 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtg 22352501  T
Q  293 att 295  Q
    |||    
T  22352500 att 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 436
Target Start/End: Original strand, 2422813 - 2423018
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||    
T  2422813 atgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaa 2422911  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    |||||  |||| |||   |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||     
T  2422912 gtatatgtatgagaa---tattattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgtaatgctcaccc 2423008  T
Q  427 ccagtggttt 436  Q
    ||| ||||||    
T  2423009 ccaatggttt 2423018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21716624 - 21716399
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||  ||      
T  21716624 tgtgattggtaattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgt 21716525  T
Q  327 gt------atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    ||      ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  21716524 gtgtgtgtatatatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaaaac 21716425  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21716424 ttacc-caagtggttttgaccgcctac 21716399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505615
Alignment:
Q  241 tgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtga 340  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |  |||  |||||||  |||||||     
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtg-tgatgtaagtattaatatgtgt 18505719  T
Q  341 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18505718 g-attattattgatcaaatgcatgatgtta-aattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgac 18505622  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    | |||||    
T  18505621 cacctac 18505615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22352518 - 22352267
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||    
T  22352518 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattgatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattg 22352419  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    |||||        |||||| ||| ||||||| |||||||| |||  | |||  |||||||  ||  |||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22352418 ttcat-------atgattgatgaatattgatatgagatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgcgtg---attattattgatcaagtgcatgatgttt 22352330  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  22352329 aaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttagccccagtgg 22352267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41217901 - 41217793
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  41217901 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 41217802  T
Q  287 ttggtgatt 295  Q
    |||||||||    
T  41217801 ttggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 2422651 - 2422829
Alignment:
Q  14 tggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggt 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||  | ||||||||| ||| || ||||| | || || ||||||||| |||||||    
T  2422651 tggacttcagtcttgcagagatctttt-gagatctagtttgtggacttcggtcttgcagaggccc-ttagtggtttggatatgggtgacgactttgaggt 2422748  T
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  2422749 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgt 2422829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20930045 - 20929715
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||     
T  20930045 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgattgtc 20929953  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||| |||||||||        |||||| |||     
T  20929952 catgaaatgtgattaatgattattcatgaaaaatgtgattggtgattttgaatgaatatttgttaattgataattgttcat-------atgattgatgaa 20929860  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    |||||||||||||||||  || | |||  |||||||  |  ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  20929859 tattgatgtgagatatc-agaatgtgatttaagtatttaagtgtg---attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattg-attattcaagtgaactg 20929767  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20929766 ctatttggattatgataatgtaatacttacc-caagtggttttaaccgcctac 20929715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 51657899 - 51658063
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51657899 tttgtagacttcgatcttgcagagatccgttagtgatctagattgtaggcttcggccttgcagaga-cctttggcggtctagatataggtgacgaccttg 51657997  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
      ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51657998 gagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattg 51658063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20530058 - 20529948
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  20530058 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatg 20529959  T
Q  213 attgttcatga 223  Q
    |||||||||||    
T  20529958 attgttcatga 20529948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 35523988 - 35524180
Alignment:
Q  4 atctagtttg-tggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtga 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||    
T  35523988 atctagtttggtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtga 35524085  T
Q  102 cgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||| ||   || |||| |||||||||||    
T  35524086 cgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgt 35524180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21716794 - 21716665
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  21716794 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctctggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 21716697  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  21716696 gagataatatggtaccacatgcatatatgtgt 21716665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 351
Target Start/End: Original strand, 22250767 - 22250905
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||     
T  22250767 gattgttcatgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatatt 22250866  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattatt 351  Q
    ||| || |||  |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  22250867 ggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 22837186 - 22837292
Alignment:
Q  342 tattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttga 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22837186 tattattatttgattaagtacatgatatt-gaattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttga 22837284  T
Q  440 ccgcctac 447  Q
    ||||||||    
T  22837285 ccgcctac 22837292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 382
Target Start/End: Original strand, 20589874 - 20590078
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||   ||| | ||  |||| |||||||||    
T  20589874 aaatgtgattgatgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatgtgattaatgattgttcat---taaatatgg-ttgaggattgttca 20589969  T
Q  275 tgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaa 373  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || ||||  ||| ||    
T  20589970 tgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgagatttaaa 20590069  T
Q  374 ttgaattat 382  Q
    |||||||||    
T  20590070 ttgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 350 - 447
Target Start/End: Original strand, 20956820 - 20956918
Alignment:
Q  350 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20956820 ttgattaagtacatgatatttggattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccacctac 20956918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27673268 - 27673076
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtat--acatatgtgaatattattatt---ga 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||  | ||||||  || |||||  | ||||||| |||||||||||   |     
T  27673268 attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattagtattatggtatgagtatgtatatatgtggatattattattattgg 27673169  T
Q  354 tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27673168 ttaagtacatgatatttggatt-atttattcatgtttaactgtcatgtggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 27673076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Original strand, 15863181 - 15863295
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15863181 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatac 15863280  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  15863281 atgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 373 - 447
Target Start/End: Original strand, 22837420 - 22837495
Alignment:
Q  373 attgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22837420 attgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 22837495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41218018 - 41217883
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  41218018 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtgattgt 41217919  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  41217918 tcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 41217883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20529960 - 20529714
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||        | |    
T  20529960 tgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgactatgaatgaataattgtgaattgataattgttcat-------ataa 20529868  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||    
T  20529867 ttaatgattattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcat 20529774  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||  ||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20529773 gataactactatttggattgt-ataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 20529714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 36358137 - 36358206
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36358137 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtcgttttgaccgcctac 36358206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35053407 - 35053331
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35053407 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 35053331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 15863017 - 15863115
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  15863017 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgt 15863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 37235762 - 37235843
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37235762 ttgaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 37235843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 5676199 - 5676275
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5676199 aggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 5676275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Original strand, 20589796 - 20589868
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20589796 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatggtaaatgtggttggtgattgt 20589868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22226555 - 22226459
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22226555 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 20956507 - 20956581
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  20956507 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttcagccttgcagagatccattggtgatctaga 20956581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 439
Target Start/End: Original strand, 38035421 - 38035482
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttga 439  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38035421 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttga 38035482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 20589750 - 20589818
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20589750 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgactaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgt 20589818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22080232 - 22080172
Alignment:
Q  373 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22080232 attgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacgcccagtgg 22080172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 37235559 - 37235603
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235559 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 37235603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 5471983 - 5472026
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5471983 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 5472026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 5769813 - 5769856
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769813 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 5769856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 22144991 - 22145034
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144991 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 22145034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 35935164 - 35935239
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935164 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 41213266 - 41213309
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213266 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 41213309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 20589920 - 20589990
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20589920 tgataaatgtgattaatgattgttcattaaatatggttgaggattgttcatgatacatgcgattggtgatt 20589990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Original strand, 20589849 - 20589897
Alignment:
Q  174 taaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20589849 taaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattgttcatg 20589897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21193735 - 21193691
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193735 aggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 21193691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 22250620 - 22250696
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22250620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatt 22250696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 49966077 - 49966017
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacaca 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||    
T  49966077 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacaca 49966017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17147116 - 17147033
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  17147116 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaatgactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 17147033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17607290 - 17607212
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  17607290 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacc-caagtggttttgaccgcctac 17607212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20821521 - 20821478
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20821521 ggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgt 20821478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 35935478 - 35935533
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35935478 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 35935533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18505856 - 18505814
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtg 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18505856 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtg 18505814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27673475 - 27673401
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||| ||||||    
T  27673475 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggctttgtccttgcagagatccattagtgatctaga 27673401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 77630 - 77675
Alignment:
Q  96 aggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77630 aggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 77675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19601559 - 19601490
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttt 436  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19601559 tttgaattgtttcattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatccccaatggttt 19601490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 22407762 - 22407814
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22407762 atctagtttgtggacttcggtcttgtagagatcc-ttagtgatatagtttgtgg 22407814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17003398 - 17003302
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  17003398 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17147354 - 17147258
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  17147354 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 27331084 - 27331135
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27331084 ttatttggattatgatgatgtaatactaacc-ccagtggttttgaccgcctac 27331135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45050260 - 45050185
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050260 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 38035221 - 38035263
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38035221 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 38035263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 5074167 - 5074220
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5074167 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 5074220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 7642448 - 7642501
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7642448 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 7642501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 276
Target Start/End: Original strand, 9786001 - 9786100
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |  ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  9786001 aaatatggttggcgattgttcatgaattgtgattaatgattgttcatgataaatgtgattaatgatttttcatg-ataaatgtg-attgatgattgttca 9786098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 18602910 - 18602963
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18602910 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 18602963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20252653 - 20252587
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  20252653 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 20252587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 20827088 - 20827141
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20827088 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 20827141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22034145 - 22034092
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22034145 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 22034092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 36357938 - 36357979
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36357938 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 36357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 13378359 - 13378395
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378359 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19601749 - 19601713
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19601749 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21193529 - 21193449
Alignment:
Q  370 tgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  21193529 tgaattgatttattcatctctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctac 21193449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 21651871 - 21651931
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21651871 ttaattgttatctggattatgataatataatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 21651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22226290 - 22226230
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22226290 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttactcccagtggttttaaccgcctact 22226230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29137134 - 29137074
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  29137134 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaatcgcctact 29137074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41217807 - 41217755
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  41217807 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 41217755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41392741 - 41392697
Alignment:
Q  404 ttatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41392741 ttatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 41392697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 295
Target Start/End: Original strand, 5676293 - 5676355
Alignment:
Q  232 attggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5676293 attggtgattgtgtatgaataattatgtattgat-atttgtcatgacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 7642174 - 7642249
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  7642174 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttat 7642249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17021914 - 17021843
Alignment:
Q  379 ttattcatg-ttaactg-ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  17021914 ttattcatgcttaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctac 17021843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 51451186 - 51451115
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  51451186 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 51451115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Original strand, 15863099 - 15863149
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15863099 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Original strand, 22836987 - 22837059
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22836987 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtga-ttgaagattgttcatgacacatgtgattggtgatt 22837059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 51450911 - 51450861
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcct 445  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  51450911 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcct 51450861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 33
Target Start/End: Original strand, 2422681 - 2422710
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagag 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422681 atctagtttgtggacttcggtcttgcagag 2422710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 5472224 - 5472276
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5472224 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacc-ccagtggttttgaccgcctac 5472276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17003123 - 17003070
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17003123 ttatctggattatgttaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 17003070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Original strand, 22836791 - 22836832
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggc 59  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22836791 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggc 22836832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33395207 - 33395154
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33395207 ttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctac 33395154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 40555709 - 40555656
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  40555709 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctac 40555656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41393025 - 41392964
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcat 156  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  41393025 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcat 41392964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20252621 - 20252581
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20252621 ttggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatga 20252581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 134)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 35017417 - 35017663
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  35017417 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 35017516  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  35017517 ttgatgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcat 35017616  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35017617 gttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 35017663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 433
Target Start/End: Original strand, 18843671 - 18843918
Alignment:
Q  184 tggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacg 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  18843671 tggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatg 18843770  T
Q  284 tgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattatt 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| || ||||    
T  18843771 tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatatt 18843868  T
Q  384 catgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18843869 catgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 18843918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Original strand, 35011093 - 35011334
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  35011093 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 35011192  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  35011193 tgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgtta 35011291  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35011292 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 35011334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18128578 - 18128308
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  18128578 aaatgtgattgatgattgttcatggaatatgattggggattgttcatgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttca 18128479  T
Q  275 tgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaat 374  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||  |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |      
T  18128478 tgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgttt-aga 18128381  T
Q  375 tgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  18128380 tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccaaagtggttttaaccgcctac 18128308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 171 - 433
Target Start/End: Original strand, 18004807 - 18005068
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18004807 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttg 18004906  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18004907 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgttt 18005005  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
      |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  18005006 atattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttacacccagtgg 18005068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740613
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||| | | |    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaactgttcatgaaatgtga-taatg 18740837  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||     
T  18740836 attattcatgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcat-------atgattgatgattattgatgtgagatatct 18740744  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18740743 gga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataa 18740648  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18740647 tgtaatacttatctccagtggttttaaccgcctac 18740613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 25646592 - 25646818
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||    
T  25646592 tgatatatttgattggtgattgtgtgtgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttg 25646691  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25646692 atgtaagtatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgtaatac 25646791  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25646792 ttacccctagtggttttaaccgcctac 25646818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Original strand, 19984788 - 19985128
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  19984788 aggtgacgaccttttggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    |||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||       ||| |||||| |||    
T  19984888 tcatgaaatgagattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgtt-------cacatgattgatga 19984980  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
      ||||||||||||||| | |  | ||| ||||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19984981 cgattgatgtgagatattgag-gtgtgatataagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataact 19985074  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19985075 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 19985128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 33316379 - 33316624
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33316379 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtaaatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtga 33316478  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||    
T  33316479 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccat 33316577  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33316578 gttaactgctatttggtttatgataatgtaatacttacccccagtgg 33316624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31626933 - 31626712
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  31626933 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 31626834  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31626833 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgtaatac 31626734  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    ||||| | ||||||||| ||||    
T  31626733 ttacccctagtggttttaaccg 31626712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18579061 - 18578816
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  18579061 tgattgttcatggcttatgattggtgattcttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtga 18578962  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||||    
T  18578961 ttggtgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcat 18578863  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18578862 gttaactgttatttggattatgatcatgtaatacttacccccagtgg 18578816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22428664 - 22428442
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattatt-gatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||  ||    
T  22428664 atgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgta 22428565  T
Q  326 agtat--acatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
    |||||  | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22428564 agtattgatatatttgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta 22428465  T
Q  424 cctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  22428464 cc-ccagtggttttaaccgcctac 22428442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16105037 - 16104818
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||    
T  16105037 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaag 16104938  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16104937 tattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 16104838  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||| | |||||||    
T  16104837 tagtggttttaatcgcctac 16104818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 13622898 - 13623131
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggatt-gttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtg 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  13622898 tgattgttcatgaaatgtgattggtgatttgttcatgaaat--gtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtg 13622995  T
Q  286 attggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  13622996 attggtgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattca 13623091  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13623092 tgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 13623131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19627721 - 19627480
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||     
T  19627721 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattga 19627622  T
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||||    
T  19627621 tgattattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgtta 19627523  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19627522 actgttatttggattatgttgatgtaatacttacccccagtgg 19627480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18775691 - 18775475
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||    
T  18775691 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagt 18775593  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    ||   | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |     
T  18775592 atttttttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgtaatacttacc-ct 18775494  T
Q  429 agtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  18775493 agtggttttaaccgcctac 18775475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23975908 - 23975690
Alignment:
Q  215 tgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcggg 314  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23975908 tgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggg 23975809  T
Q  315 attatgagataagtatacatatgtg-aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgat 413  Q
     || |||  |||||||  || || | ||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  23975808 gtt-tgatgtaagtattgatgtgggaaattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataat 23975710  T
Q  414 gtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23975709 gtaatacttacccccagtgg 23975690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 214 - 425
Target Start/End: Original strand, 14628361 - 14628571
Alignment:
Q  214 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgg 313  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14628361 ttgttcctgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 14628460  T
Q  314 gattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgat 413  Q
    | || |||  |||||||  || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  | ||    
T  14628461 ggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatcttaat 14628559  T
Q  414 gtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||    
T  14628560 gtaatacttacc 14628571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 25646426 - 25646614
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  25646426 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatctttt-gagatctagtttgtggacttcggtcttgtagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgacg 25646523  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  25646524 accttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgt 25646614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 32896461 - 32896250
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||  ||    
T  32896461 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagttattggggttatgatgta 32896362  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||          ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  32896361 agtata----------tatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactgttatttggattatgatgatgtaatacttatc 32896272  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  32896271 cctagtggttttgaccgcctac 32896250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18422396 - 18422207
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgac 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  18422396 atctagtttgcggacttcagtcttacagagatcc-ttagtgatatagattttgggcttcaggccttgcagagaccc-ttggtggtctggatatgggtgac 18422299  T
Q  103 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18422298 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgt 18422207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 25368922 - 25369164
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  25368922 atctagtttgtgggcttagaccctgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacc--ttggtggtctagatataggtgacg 25369019  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg- 198  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||     
T  25369020 accttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatga 25369119  T
Q  199 --aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
      |||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25369120 ataaatgtgattgatgattgttcatgacacttgtgattggtgatt 25369164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 283 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23151837 - 23151674
Alignment:
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23151837 gtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaatat 23151739  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  23151738 ccatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacatacccccagtggttttaaccgcctac 23151674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 18825609 - 18825774
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  18825609 ttggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacat 18825708  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattatt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18825709 gtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Original strand, 35017302 - 35017435
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35017302 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtggttgttc 35017401  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  35017402 ataaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 35017435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25173739 - 25173485
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||           
T  25173739 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaactgataattattcata------ 25173646  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||   | |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  25173645 -tgattgacaaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 25173551  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25173550 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 25173485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 28196352 - 28196545
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28196352 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtaggcgtcggccttgtagaga-cccttggcggtctagatataggtgacgaccttg 28196450  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatgaa 200  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  28196451 aagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattatgcatgaa 28196545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18397351 - 18397153
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||| |||     
T  18397351 tgtgattgatgattttgcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatat 18397252  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18397251 gtatatatatgtgaatattattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 18397153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 25369097 - 25369327
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||  ||     
T  25369097 atgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtga-ttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatg 25369195  T
Q  326 agtatacatatgt--------gaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgt 415  Q
    |||||| |||| |        | ||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25369196 agtatatatatatatatatatggatattcttatttgattaagtacatgataattgaattgaattattcatgtttaactgttatgtcgattatgatgatgt 25369295  T
Q  416 aatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25369296 aatacttacccctagtggttttgaccgcctac 25369327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 235 - 442
Target Start/End: Original strand, 13016526 - 13016728
Alignment:
Q  235 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacat 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||  ||||||||  |    
T  13016526 ggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggt--tgatgtaagtatattt 13016623  T
Q  335 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggt 434  Q
     |  ||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13016624 tttagaatattattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactg-tatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggt 13016720  T
Q  435 tttgaccg 442  Q
    ||| ||||    
T  13016721 tttaaccg 13016728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 25745987 - 25746192
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| || |||          
T  25745987 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttttga------ 25746080  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
            || | |||| |||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  25746081 --------tgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaatacttacccc 25746172  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  25746173 cagtggttttaaccgcctac 25746192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1554124 - 1553897
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||        |||| | ||||||||||||||||||||     
T  1554124 gattgttcatgatat--gtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatatt 1554034  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    | | || |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  1554033 gaggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttattttgattatgttg 1553934  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  1553933 atgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttact 1553897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 423
Target Start/End: Original strand, 16827779 - 16828011
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||||           
T  16827779 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgactggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataactgttcata------ 16827872  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||||  |  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  16827873 -tgattgatgattattgatgtgagataatggggtt-tgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 16827970  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16827971 ccatattaactgttatttggattatgataatgtaatactta 16828011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4989209 - 4988970
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||           
T  4989209 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcat------- 4989117  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||  || |||   |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||    
T  4989116 atgattgatgaatattgatgtgagatatcggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgt---tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatat 4989021  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | ||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4989020 ttatgttatttgttatttgtattatgataatgtaatacttacccccagtgg 4988970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622926
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatg 13622899  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  13622900 attgttcatg--aaatgtgattggtgatt 13622926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1554421 - 1554219
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1554421 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgattat 1554322  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| |||| ||||  ||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  1554321 tcatggaatatgattggtgattattcatgataaatgtgattgatgattattcatg-ataaatgtg-gttggtgattattcatgataaacgtgattgatga 1554224  T
Q  294 ttatt 298  Q
    |||||    
T  1554223 ttatt 1554219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15738849 - 15738626
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15738849 atctagtttgtgggctttagccctgcagagatccattagtgatctagattgtgg-cttcggccttgcagggacct-ttggtggtctagatataggtgacg 15738752  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg- 198  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||||| ||  ||||||||||||     
T  15738751 acgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgttcatga 15738652  T
Q  199 -aaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15738651 taaatgtgattgatgattgttcatga 15738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22866764 - 22866601
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22866764 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 22866666  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  | ||| |||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22866665 aagtgaaatagtatcacatgcatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattg 22866601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31627009 - 31626911
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31627009 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 31626911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18128851 - 18128706
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  18128851 aggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat--atgaaatgtgattggtgattgt 18128754  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  18128753 tcatgaaatgtgattgatgattgttcatggaata--tgattggtgattgt 18128706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18397521 - 18397397
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18397521 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtggccttcggccttgcagaggcct-ttgatggtctagatataggtgacgacctt 18397424  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatata 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18397423 gaggtgatatggtaccacatgcatata 18397397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Original strand, 18004634 - 18004827
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  18004634 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgtt 18004733  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    | |||||| ||||| | |||| ||||||| ||     ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18004734 cgtgaaatgtgattaacgattattcatga-at-----atttgtgattgtgaatgaatagttgtgaattgat-attgttcctgatacatgtgattggtgat 18004826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Original strand, 13016350 - 13016478
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  13016350 ttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggcttcggccttgcagagacct-ttgacggtctagatttaggtgacgaccttg 13016447  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13016448 agatgatatggtaccacatgcatatttgtgt 13016478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16238926 - 16238816
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| | | |    
T  16238926 gattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattcctgaaatatgactaatg 16238827  T
Q  213 attgttcatga 223  Q
    |||||||||||    
T  16238826 attgttcatga 16238816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33323106 - 33323009
Alignment:
Q  349 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33323106 attgattaagtatatgaaatttgaattaaattattcatgttaactgttgtgtggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 33323009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 345 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422083
Alignment:
Q  345 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgac 18422086  T
Q  445 tac 447  Q
    |||    
T  18422085 tac 18422083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22866564 - 22866376
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattg-atcaa 357  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||   || | |||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  22866564 attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgattgattgatgtgagacatcgagattatagtatgaatatatatgtgtga-tattattatcggattaa 22866466  T
Q  358 gtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  22866465 atgcatgatatttgaatggaattattcatgttaattattatttgaattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgacctcctac 22866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 14628193 - 14628388
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||         
T  14628193 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtg----- 14628287  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
      |||||||  |||  | || | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  14628288 --atgaaatgagatgaatgactattcatgaatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtg 14628385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17787821 - 17787714
Alignment:
Q  340 aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttga 439  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  17787821 aatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgtaatacttacccccaatggttttaa 17787722  T
Q  440 ccgcctac 447  Q
    ||||||||    
T  17787721 ccgcctac 17787714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 447
Target Start/End: Original strand, 16889621 - 16889689
Alignment:
Q  380 tattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16889621 tattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 16889689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22428746 - 22428596
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||     
T  22428746 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattgtg 22428647  T
Q  195 catg---aaatatg-attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     |||   || |||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  22428646 tatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgatt 22428596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 25745897 - 25745993
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  25745897 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 25745993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 7829717 - 7829796
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  7829717 ttgaattgatttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctac 7829796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835562
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 18835562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4989313 - 4989201
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||     
T  4989313 ttggtgaatgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacat 4989214  T
Q  283 gtgattggtgatt 295  Q
    || ||||||||||    
T  4989213 gtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16238804 - 16238707
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggatt-gttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtg 285  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16238804 tgattattcatgaaatgtgattggtgatttgttcatgaaat--gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtg 16238707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 388 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25918008 - 25917949
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25918008 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 25917949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 447
Target Start/End: Original strand, 940904 - 941010
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatga-tgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  940904 attactatggattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgcctaactgctatgtggattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgac 941003  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  941004 cgcctac 941010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25173843 - 25173731
Alignment:
Q  185 ggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||     
T  25173843 ggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaa 25173744  T
Q  283 gtgattggtgatt 295  Q
    || ||||||||||    
T  25173743 gtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32897326 - 32897258
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcaga 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32897326 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcca-tagtgatctagattgtgggcttcggccttgcaga 32897258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 1659291 - 1659387
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  1659291 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 16827625 - 16827733
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||     
T  16827625 ttggtgaatgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacat 16827724  T
Q  283 gtgattggt 291  Q
    || ||||||    
T  16827725 gtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 18825419 - 18825515
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  18825419 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Original strand, 22364041 - 22364120
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22364041 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccctgtggttttgaccgcctac 22364120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23976149 - 23975956
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||         
T  23976149 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtg----- 23976055  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23976054 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgt-tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 23975958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4989477 - 4989403
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta 169  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4989477 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 4989403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18775782 - 18775685
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||    
T  18775782 aggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgattg 18775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18128644 - 18128584
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18128644 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgattgt 18128584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 18843480 - 18843576
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  18843480 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 33316164 - 33316260
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  33316164 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34965516 - 34965472
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965516 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 34965472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 1651530 - 1651605
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651530 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19852840 - 19852797
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852840 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 19852797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 16827460 - 16827534
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta 169  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16827460 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtctta 16827534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16105129 - 16105056
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  16105129 aggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtctt 16105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22846696 - 22846615
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846696 aggtgacgaccttgcggtgatttggtactacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15738556 - 15738496
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtg 401  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15738556 tattataattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatgtg 15738496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Original strand, 17344101 - 17344177
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17344101 aattgaattattcaagataattgttatttgaattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 17344177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18128606 - 18128555
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18128606 tgataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattgttcatg 18128555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21621473 - 21621394
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21621473 gaattgatttattcatgcttaactacttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 21621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23220263 - 23220224
Alignment:
Q  101 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23220263 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 23220224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1554184 - 1554119
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1554184 atgtggttggtgattgttcatgggatatgattaatgattgttcatgataaatgtg-ttggtgattgt 1554119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11214701 - 11214623
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  11214701 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15738876 - 15738802
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||    
T  15738876 cttcggccttgcagatatcatttagtgatctagtttgtgggctttagccctgcagagatccattagtgatctaga 15738802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15861313 - 15861243
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagt 165  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861313 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 12310808 - 12310889
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12310808 ttgaattgacttattcatgtctaaatgtttatgtggattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctac 12310889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21930464 - 21930419
Alignment:
Q  96 aggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21930464 aggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 21930419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 1659547 - 1659607
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1659547 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 1659607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10487460 - 10487364
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  10487460 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 16377867 - 16377963
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16377867 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 16385191 - 16385287
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16385191 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 18088640 - 18088700
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18088640 ttaattgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 18088700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 18383282 - 18383326
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18383282 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 18383326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18422229 - 18422185
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18422229 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgat 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25174136 - 25174040
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  25174136 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25649596 - 25649540
Alignment:
Q  392 ctgttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  25649596 ctgttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctac 25649540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 27655668 - 27655764
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27655668 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23975976 - 23975925
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23975976 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 23975925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896445
Alignment:
Q  146 gtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgt 32896445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15861064 - 15861010
Alignment:
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15861064 gttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 15861010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Original strand, 18383474 - 18383556
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  18383474 tttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctac 18383556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1554268 - 1554196
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  1554268 tgataaatgtggttggtgattattcatgataaacgtgattgatgattattcatgataaatgtgattgatgatt 1554196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 1651847 - 1651900
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1651847 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 1651900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10487185 - 10487132
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10487185 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 10487132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16134849 - 16134812
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatat 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16134849 ggtgaagaccttgaggtgatttggtaccacatgcatat 16134812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16229886 - 16229833
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16229886 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16229833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16378142 - 16378195
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16378142 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16378195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16385466 - 16385519
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16385466 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16385519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16645737 - 16645790
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16645737 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16645790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16651103 - 16651156
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16651103 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16651156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18128748 - 18128682
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18128748 aaatgtgattgatgattgttcatggaatatgattggtgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 18128682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18579095 - 18579050
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18579095 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 18579050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21929786 - 21929733
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21929786 ttatgttgattatgattgatgtaaaccttacctccagtggttttgaccgcctac 21929733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11214454 - 11214394
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  11214454 ttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctact 11214394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14150908 - 14150864
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14150908 gattatgttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgccta 14150864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16235794 - 16235750
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16235794 taactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 16235750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Original strand, 16827729 - 16827789
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16827729 ttggtaattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 16827789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 445
Target Start/End: Original strand, 17790971 - 17791039
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg-ttttgaccgcct 445  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17790971 ttattcatgtataactgttatatggattatgatgatgtaacgcttaaccccagtggtttttgaccgcct 17791039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19608733 - 19608673
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  19608733 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttaccctcagtggttttaaccgcctact 19608673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26088415 - 26088319
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  26088415 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33323383 - 33323339
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  33323383 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatgtgt 33323339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18128700 - 18128586
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||  |||   || |||| ||| |||||||||||    
T  18128700 aaatgtgattggtgattgttcatgaattgtgattaatgattgttcatg--aaatgagattggtgattgttcatg---aaatgtg-attaatgattgttca 18128607  T
Q  275 tgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||| | | |||||||||||||    
T  18128606 tgataaatgtgattggtgatt 18128586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 17858219 - 17858272
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858219 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccagtggttttgaccgcctac 17858272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19852607 - 19852554
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  19852607 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctac 19852554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23987347 - 23987294
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  23987347 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 23987294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 29871332 - 29871385
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  29871332 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctact 29871385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 16889344 - 16889388
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16889344 aggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcacttatgtgt 16889388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 17790740 - 17790776
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17790740 aggtgacgacctagaggtgattcggtaccacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18128716 - 18128676
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  18128716 ttggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatga 18128676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19627785 - 19627737
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  19627785 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 19627737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 25368902 - 25368938
Alignment:
Q  25 cttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctt 61  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25368902 cttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggctt 25368938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 27655952 - 27655996
Alignment:
Q  404 ttatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27655952 ttatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 27655996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  126 catgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta 169  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 35011029 - 35011077
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  35011029 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatga 35011077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 171 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30894 - 30632
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  30894 tgataaatgtgattaatgattattcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttg 30795  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30794 ttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 30695  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30694 atattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 30632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31091 - 30946
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  31091 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgaatgttc 30992  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30991 atgaaatgtgattaatgattgttcatg--aaatgtgattggtgattgt 30946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44467 - 44391
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  44467 aattgaattattcaagataattgttatttggattatgatgatgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcctact 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30940 - 30881
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgatt 234  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  30940 aaatgtgattgatgaatgttcatggaatatgattgatggttgttcatgataaatgtgatt 30881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30964 - 30917
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  30964 aaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgaatgttcatg 30917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 171 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3299 - 3045
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  3299 tgataaatgtgattaatgattattcatgaaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttg 3200  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3199 ttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgattttt 3100  T
Q  371 gaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3099 atattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 263
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  517 ttggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacac 418  T
Q  281 acgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataag--tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaa 378  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||| || |||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  417 acgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttgatgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaa 318  T
Q  379 ttattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  317 atatccatgctaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3398
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  3519 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgaatgttc 3420  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgt 217  Q
    ||||||| ||||| | ||||||    
T  3419 atgaaatgtgattaatgattgt 3398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 527
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||    
T  653 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgatcatt 554  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcat 221  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||    
T  553 catgaaatatgattaatgattgttcat 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3393 - 3345
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3393 aaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattggtgattgttcatga 3345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 120 - 297
Target Start/End: Original strand, 15833 - 16011
Alignment:
Q  120 gtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgtt 15932  T
Q  219 catgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15933 catgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 132
Target Start/End: Original strand, 14215 - 14246
Alignment:
Q  101 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14215 acgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 214 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28152 - 27932
Alignment:
Q  214 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28152 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 28053  T
Q  314 gat-tatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    | | | |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28052 ggtgtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatga 27953  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  27952 tgtaatacttacccccagtgg 27932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28328 - 28125
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||       
T  28328 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagt 28229  T
Q  196 atgaa-atatg---attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggt 291  Q
    ||||| |  ||   |||||   ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||    
T  28228 atgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggt 28129  T
Q  292 gatt 295  Q
    ||||    
T  28128 gatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 60051 - 59833
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat-tattgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  60051 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataag 59952  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  59951 tatt-atttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 59853  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||    
T  59852 tagtggttttgaccgcctac 59833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 60142 - 60045
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  60142 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 60045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Original strand, 20905 - 21104
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20905 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgttc 21004  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21005 atgaaatgtgattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 21124 - 21362
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        |||    
T  21124 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat-------atga 21216  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21217 ttgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgtatgatgtt--aattgaaatattca 21314  T
Q  386 tgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    || |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21315 tgataactactatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 21362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 21090 - 21142
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  21090 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 21142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 194)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 214 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7851884 - 7851665
Alignment:
Q  214 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgg 313  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7851884 ttgttcatgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 7851785  T
Q  314 gattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgat 413  Q
    | || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  7851784 ggttgtcatataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgat 7851685  T
Q  414 gtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  7851684 gtaatacttacccccagtgg 7851665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 11199226 - 11199447
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||  |||    
T  11199226 atgtgattggtgattgtgcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtata 11199325  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11199326 tgtatatatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 11199425  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  11199426 cccagtggttttgaccgcctac 11199447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38166416 - 38166203
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  38166416 gattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatt 38166317  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||  || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38166316 ggagttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatg 38166217  T
Q  412 atgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||    
T  38166216 atgtaatacttacc 38166203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11813013 - 11812791
Alignment:
Q  202 tatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgat 301  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11813013 tatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat 11812914  T
Q  302 gtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtg 401  Q
    ||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  11812913 gtgagatattggggtt-tgatgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttg 11812815  T
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11812814 gattatgatgatgtaatacttacc 11812791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 47786548 - 47786767
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  47786548 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatata 47786647  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  47786648 agtatatatatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgtaatactaacc 47786745  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  47786746 cccagtggttttgaccgcctac 47786767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14287514 - 14287291
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| || || |||  |||    
T  14287514 atgtgattggtgattttgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtata 14287415  T
Q  326 agtatacatat--gtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
    |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287414 agtatatatatatgtgaacgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatactta 14287315  T
Q  424 cctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  14287314 cccctagtggttttgaccgcctac 14287291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 448
Target Start/End: Original strand, 17957992 - 17958336
Alignment:
Q  94 ataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  17957992 ataggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgatt 17958091  T
Q  192 gttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggt 291  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| | ||    |||||| ||||||||||||||||| ||||||       |||||||||    
T  17958092 gttcatgaaatatgattaatgattgtttaagatatatgtgattgataat----tatgaacaactgtgaattgatgatggttcat-------gtgattggt 17958180  T
Q  292 gattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtta 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  17958181 gattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaaatatccatgtta 17958280  T
Q  391 actgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17958281 actgtta--ttgattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 17958336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 225 - 447
Target Start/End: Original strand, 6148533 - 6148755
Alignment:
Q  225 atatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagat 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |    
T  6148533 atatgtgattggtgattgtgtgtgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgt 6148632  T
Q  325 aagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6148633 aagtatgtgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 6148732  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  6148733 ccccagtggttttgaccgcctac 6148755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17099107 - 17098881
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  17099107 tgatatatgtgattggtgattgtgtgtgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 17099008  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17099007 atgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 17098908  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||    
T  17098907 ttttccctagtggttttgaccgcctac 17098881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19230625 - 19230286
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  19230625 aggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattggtgaatatt 19230526  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||| ||||    
T  19230525 catgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat-------atgattgatgat 19230433  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  19230432 tattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactg 19230339  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  19230338 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccacctac 19230286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30141186 - 30140966
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  30141186 gattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatatt 30141087  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    |||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30141086 gggatt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgata 30140988  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  30140987 atgtaatacttacacccagtgg 30140966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 221 - 440
Target Start/End: Original strand, 50113797 - 50114016
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  50113797 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttct 50113896  T
Q  320 gagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaata 419  Q
     |  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50113897 aatgtaagtattga-atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaata 50113995  T
Q  420 cttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  50113996 cttacccccagtggttttgac 50114016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16819268 - 16819025
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16819268 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 16819169  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||    
T  16819168 ttggtgaatattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcat 16819072  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16819071 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 16819025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19945038 - 19944795
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  19945038 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacac 19944939  T
Q  281 acgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatt 380  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  19944938 atgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 19944840  T
Q  381 attcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19944839 atccatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 19944795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 178 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17936692 - 17936437
Alignment:
Q  178 tgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  17936692 tgtgattgatgattgttcatggaatatgatggggtattgttcatgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatga 17936593  T
Q  278 cacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt-gaattg 376  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||      
T  17936592 cacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtt-tgatataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatga 17936494  T
Q  377 aattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17936493 aaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 17936437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 30204883 - 30204664
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||    
T  30204883 atgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaa 30204785  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  30204784 gtatatgtatgagaacattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgtaatacttactc 30204685  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30204684 ccagtggttttgaccgcctac 30204664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Original strand, 51160142 - 51160345
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  51160142 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtt-tg 51160240  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51160241 atgtaagtattgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatac 51160340  T
Q  421 ttacc 425  Q
    |||||    
T  51160341 ttacc 51160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15516290 - 15516051
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15516290 atctagtttgtgggctttggccttgcagagatccattagtgatttagattgtgggctccggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacg 15516192  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg--aa 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  15516191 accttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat-cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgttcatgataa 15516093  T
Q  201 atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15516092 atgtgattgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattg 15516051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17099273 - 17099085
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  17099273 atctagtttgtgaacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagaccc-ttggtggtctagatatgggtgaca 17099176  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17099175 accttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17099085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35122105 - 35121889
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||    
T  35122105 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataag 35122006  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35122005 tatttatatgtaaatattatt---gatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtattacttacccc 35121909  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||||    
T  35121908 aagtggttttgaccgcctac 35121889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 6148366 - 6148551
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||    
T  6148366 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagaccc-ttggtggtctggat-tgggtgacg 6148462  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6148463 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat--atgtgattggtgattgt 6148551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25057345 - 25057002
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  25057345 ggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgtt 25057246  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    | |||||| ||| | | || | ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| | || |||||       |||||| |||    
T  25057245 cgtgaaatgtgactaatgactattcatgaatatttgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaactgataactgctcatg-------tgattgatga 25057153  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  25057152 ttattgatgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatct 25057057  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25057056 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 25057002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18738171 - 18737941
Alignment:
Q  217 ttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggat 316  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |    
T  18738171 ttcatgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggt 18738072  T
Q  317 tatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
    | |||  ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18738071 t-tgatgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 18737973  T
Q  417 atacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18737972 atggttacctccggtggttttaaccgcctact 18737941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 447
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262939
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttca 196  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgttca 19262701  T
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| ||||| | || | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||    
T  19262702 tgaaatgtgattaatgactattcatgataattgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatgatta 19262794  T
Q  297 ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtt 396  Q
    |||||||||||||| |||  | |||  |||||||  || ||||    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  19262795 ttgatgtgagatat-gggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgct 19262888  T
Q  397 atgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  19262889 aattggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 19262939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 319297 - 319517
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||| || |||  ||||    
T  319297 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaag 319396  T
Q  328 tatacatatgtga--atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  319397 tatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 319496  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  319497 -ctagtggttttaaccgcctac 319517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 12351520 - 12351740
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattatt-gatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| | |||  ||||| |||    
T  12351520 atgtgactggtgattgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacata 12351619  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12351620 agtattgatatgtgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 12351719  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  12351720 -ctagtggttttaaccgcctac 12351740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14296917 - 14296698
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||  ||||    
T  14296917 tgtgattggtgattgtgcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataa 14296818  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  14296817 gtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtta-aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaacacttaccc 14296719  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14296718 ccagtggttttgaccgcctac 14296698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14302544 - 14302325
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||  ||||    
T  14302544 tgtgattggtgattgtgcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataa 14302445  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  14302444 gtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtta-aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaacacttaccc 14302346  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14302345 ccagtggttttgaccgcctac 14302325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2048634 - 2048290
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  2048634 aggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
    ||||||||| ||||| | || | ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||       ||||||| ||    
T  2048534 tcatgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-------gtgattgatg 2048442  T
Q  293 attattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaac 392  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||| |||||| |  || |||| || |||||  |  |||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  2048441 attattgatgtgagatat-gggggtgtgatataagtgttaatgtgtggattttattgat--tcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaac 2048346  T
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  2048345 tgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaacctcctact 2048290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 22145956 - 22146177
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |   |    
T  22145956 tgatatatgtgattggtgattgcatatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattggggtg--g 22146053  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  || ||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22146054 atgtatgtattgatatgtgaatatt---attgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatac 22146150  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  22146151 ttatccccagtggttttgaccgcctac 22146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 230 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796705
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagta 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagta 12796810  T
Q  330 tacatatgtg-aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcc 428  Q
    |  || || | ||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  12796809 ttgatgtgggaaattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatataatacttaccccc 12796710  T
Q  429 agtgg 433  Q
    |||||    
T  12796709 agtgg 12796705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 16183579 - 16183761
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttag-ccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||| |||    
T  16183579 ttgtagacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagagatcc-ttggtggtctggatatgggtgacgactttg 16183676  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16183677 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgt 16183761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23491079 - 23490737
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  23491079 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatg-atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtg 292  Q
    || |||||| ||||| | || | |||||| |||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||| | | |||| ||       ||||||| ||    
T  23490979 tcgtgaaatgtgattaatgactattcatgaatatttgtgtttggagattgtgaatgaatatttgtgaattgttaactgtttat-------gtgattgatg 23490887  T
Q  293 attattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaac 392  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   |||| |||||||||| | ||||||||||  |||||| || |||||||| |    
T  23490886 attattgatgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatactcatgttatc 23490791  T
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23490790 tgttatttggattatgataatgtaatacttacc-ctagtggttttaaccgcctac 23490737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 10737132 - 10736793
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10737132 aggtggcgaccttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||       |||||||||||    
T  10737032 tcatgaaatgtgattattgattattcatgataaatgtgatttgtgatagtgaatggataattgtgaattgattgttgttcat-------gtgattggtga 10736940  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||  |||||||  | |||||    || |||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10736939 ttattaatgtgagatat-tggagtgtgacgtaagtattgacatgtg---gtttttattggtcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaact 10736846  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  10736845 gttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccaccta 10736793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581069
Alignment:
Q  122 accacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttca 220  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || | ||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactattca 45581283  T
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||  |||||||||  ||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||| |||  | ||    
T  45581282 tgataattgtgattggcaattatgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga-------gattgatgattattgatgtgagatat-gggggtgtg 45581191  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || ||||    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||     
T  45581190 atgtaagtattaatgtgtg---gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatat 45581096  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  45581095 ttacccccaatggttttaaccgcctac 45581069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 442
Target Start/End: Original strand, 11062941 - 11063047
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11062941 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggtt 11063040  T
Q  436 ttgaccg 442  Q
    |||||||    
T  11063041 ttgaccg 11063047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 221 - 437
Target Start/End: Original strand, 19572504 - 19572715
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  19572504 tgatatatgtgagtggtgattgtgaatgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg-tg 19572602  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || |||||   ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19572603 atgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaaacacatgatgtta-aattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatac 19572698  T
Q  421 ttacctccagtggtttt 437  Q
    |||||||||||||||||    
T  19572699 ttacctccagtggtttt 19572715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11813404 - 11813259
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11813404 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgttc 11813305  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  11813304 atgaaatttgattaataattattcatgataaatgtgattgatgatt 11813259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 11062605 - 11062841
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062605 tttgtggacttcggtcttgcagaaatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga--ccttgatggtctagatataggtgacgaccttg 11062702  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaa-atatg 205  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||||| |  ||    
T  11062703 aagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactg 11062802  T
Q  206 ---attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
       ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11062803 tgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 11062841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 14522919 - 14523048
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14522919 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 14523017  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523018 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 14523048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17138062 - 17137827
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||     
T  17138062 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccgttagtgatctagatggtgggctccggccttgcagaga-cctttgatggtctagatataggtgaca 17137964  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt--aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcat--g 198  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||| |||       
T  17137963 accttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtgcataat 17137864  T
Q  199 aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattg 235  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  17137863 aaatgtgattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14287683 - 14287500
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14287683 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcgtccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 14287585  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  14287584 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgatt 14287500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18908900 - 18908661
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  18908900 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 18908807  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18908806 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 18908712  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18908711 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 18908661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22273255 - 22273016
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  22273255 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata------ 22273162  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  22273161 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 22273067  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22273066 tcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 22273016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 14523088 - 14523310
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggatt-atgagat 324  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||    | | || | |||  ||    
T  14523088 atgtaattgatgattgtgcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctgaatctttgagaatgatggtat 14523187  T
Q  325 aagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523188 atgtatttatacgtgaatattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 14523287  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  14523288 ccctagtggttttgaccgcctac 14523310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 2451221 - 2451475
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  2451221 ttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataagtgtaaattgataattgttcata------ 2451314  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||    
T  2451315 -tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattaatgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatat 2451409  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2451410 ccatgttaactgttatctggattaagataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 2451475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Original strand, 15860807 - 15860987
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15860807 ggtgacgaccctttggagatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattc 15860906  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    ||||||| | ||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15860907 atgaaatgtaattaatgagtgttcatgataaatgtggttggtgattgtgattgaatatttgtgaattgataattgttcatg 15860987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30205046 - 30204867
Alignment:
Q  11 ttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  30205046 ttgtggacttcggtcttgcagagatctttt-gagatctagtttgtagactttggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggattcgggtgacgaccttga 30204949  T
Q  111 ggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  30204948 ggtgatttggtaccacatgcatttgtgtc-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgt 30204867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33340416 - 33340258
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  33340416 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaata 252  Q
    ||||||||| || || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33340316 tcatgaaatgtggttaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaata 33340258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654131
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 39654138  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  39654137 cgcctac 39654131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 11883830 - 11883965
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  11883830 atctagtttgtgggctttgtccttgcagagatccattagtgatctagattttgggcttcggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacg 11883928  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11883929 actttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 11883965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 12563049 - 12563241
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| || |||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  12563049 tttgtggacttcggtcttgtagagatccattagagatctagattgtaggcttcggccttgcagaga-cctttgacgatctagatataggtgacgaccttg 12563147  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  12563148 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatga 12563241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14292042 - 14291916
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14292042 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataggtgacgaccttg 14291944  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14291943 aagtgaaatggtaccacatgcatatatg 14291916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12951648 - 12951476
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  12951648 atctagtttgtgggctttggcctttgagagatccattagtgatatagattgtgggcttcggccttgcagagacct-ttggtggtctagatataggtgacg 12951550  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951549 accttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 17536836 - 17536956
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta-cct 426  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17536836 tatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccc 17536935  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  17536936 ccagtggttttgactgcctac 17536956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 8630270 - 8630025
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8630270 tgattattcatggaatatgattggtgagtgttcatgacatatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtga 8630171  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||| || |||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||               ||||||| ||| |||    
T  8630170 ttggagattatgaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgtggatattgttattgatca---------------aattgaaatatccat 8630087  T
Q  387 g-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8630086 gattaactgttatttggattatgatgatgtaatatttacccccagcggttttaaccgcctac 8630025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 321
Target Start/End: Original strand, 11062773 - 11062868
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatga 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11062773 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggatcatga 11062868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39654512 - 39654307
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  39654512 atctagtttgtgggcttcgaccttgcagagatccatcagtgatctagattgtgggcttcggtcttgcagaga-cctttggtggtctagatataggtgaca 39654414  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt----------aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||          | |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||||    
T  39654413 accttgaagtgatttggtaccatatgcatgtatgtgtcatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttggtgaaatgtgattgatgattg 39654314  T
Q  193 ttcatga 199  Q
    |||||||    
T  39654313 ttcatga 39654307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40938321 - 40938158
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  40938321 tttgtggacttcggtctttcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cctttgacggtctagatataagtgacgaccttg 40938223  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40938222 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattg 40938158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 19572429 - 19572526
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19572429 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgt 19572526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13816076 - 13815981
Alignment:
Q  215 tgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatat 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13816076 tgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatat 13815981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17137773 - 17137667
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||||| |||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17137773 tattatcattgactaagtatgtgatatttgaattgaattattcatggttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 17137674  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  17137673 cgcctac 17137667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 344 - 447
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061142
Alignment:
Q  344 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgtt-gaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccg 14061137  T
Q  443 cctac 447  Q
     ||||    
T  14061138 actac 14061142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35122276 - 35122116
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  35122276 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccgaccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 35122179  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| || ||||||||||||||    
T  35122178 gaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtctt 35122116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 447
Target Start/End: Original strand, 12563338 - 12563429
Alignment:
Q  356 aagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12563338 aagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgtaatacttaccccaagtggttttgaccgcctac 12563429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Original strand, 16183739 - 16183955
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  16183739 tgatatatgtgtttggtgattgtctgtgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttg 16183838  T
Q  321 agataagtatacatatgt------------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatg 408  Q
    | |||  |||| |||| |            |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16183839 atatatatatatatatatatatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatg 16183938  T
Q  409 atgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||||||    
T  16183939 atgatgtaatacttacc 16183955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19945202 - 19945052
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  19945202 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtt 19945103  T
Q  195 catga--aatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
     ||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19945102 tatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgt 19945052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 447
Target Start/End: Original strand, 53900385 - 53900494
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53900385 tgtgaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggtt 53900482  T
Q  436 ttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||    
T  53900483 ttgaccgcctac 53900494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7851965 - 7851875
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7851965 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatga 7851875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49230467 - 49230251
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  49230467 ttggtgattgttcatgaaatgtgattattgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcat------- 49230375  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||  | |||  ||||  |||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  49230374 atgattgatgaagattgatgtgagatattggg-gtgtgatgtaag--tactaatgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatat 49230279  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgat 410  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49230278 tcatgttaactgttatttggattgtgat 49230251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 447
Target Start/End: Original strand, 55443682 - 55443780
Alignment:
Q  349 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  55443682 attgattaagtatatgaaatttgaattgaatcattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 55443780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 54045612 - 54045713
Alignment:
Q  324 taagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54045612 taagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatactta 54045711  T
Q  424 cc 425  Q
    ||    
T  54045712 cc 54045713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8630413 - 8630309
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||    
T  8630413 aggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaatgattgtt 8630314  T
Q  195 catga 199  Q
    |||||    
T  8630313 catga 8630309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Original strand, 53900090 - 53900216
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  53900090 tttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 53900187  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  53900188 gaagtgaaatggtaccacatgcatatatg 53900216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 408
Target Start/End: Original strand, 9304638 - 9304841
Alignment:
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||        |||| | ||||||    
T  9304638 tgaaatatgattaatgattgttcatgatat--gtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcat-------atgatcgatgatta 9304728  T
Q  297 ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgt 395  Q
    |||||||||||||| | | || |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |    
T  9304729 ttgatgtgagatattgaggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactat 9304828  T
Q  396 tatgtggattatg 408  Q
    ||| |||||||||    
T  9304829 tatttggattatg 9304841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815824
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaatacttacccc 13815844  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||  ||||| |||||||||    
T  13815843 cagaagttttaaccgcctac 13815824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14297087 - 14296958
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  14297087 tttgtggacttcggccttgcagagatcc-ttagtgaactagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 14296990  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14296989 gaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgt 14296958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14302714 - 14302585
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  14302714 tttgtggacttcggccttgcagagatcc-ttagtgaactagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 14302617  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14302616 gaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgt 14302585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15548870 - 15548796
Alignment:
Q  374 ttgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15548870 ttgaattattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 15548796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 51160066 - 51160164
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  51160066 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgt 51160164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7852069 - 7851968
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7852069 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 7851970  T
Q  287 tt 288  Q
    ||    
T  7851969 tt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 22145829 - 22145977
Alignment:
Q  44 gatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aa 142  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||| ||| || || |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22145829 gatctagtttgtggacttcggtattgcagaggccc-ttagtagtctggatatgggtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa 22145927  T
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22145928 taggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 22145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11813275 - 11813179
Alignment:
Q  199 aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  11813275 aaatgtgattgatgattattcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 14060835 - 14060980
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||    
T  14060835 aggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaattgatgatt 14060934  T
Q  192 gttcatg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattg 235  Q
    || ||||  |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  14060935 gtgcatgataaatgtgattgatgattgttcatgacacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18909006 - 18908892
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  18909006 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatac 18908907  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  18908906 atgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7852374 - 7852222
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  7852374 aggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtgattgt 7852275  T
Q  194 tcatg---aaatatg-attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
      |||   || |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7852274 gtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgattg 7852222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 357 - 447
Target Start/End: Original strand, 11884026 - 11884115
Alignment:
Q  357 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  11884026 agtacatgatatttgaattgatttattcatgttaactgttatgtggattatgatcatataatacttacccctagtgg-tttgaccgcctac 11884115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15516118 - 15515894
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||| ||||||  | ||||||  ||     
T  15516118 atgtgattgatgattgttcatga-taaatgtga-ttgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattagaattatggtatg 15516021  T
Q  326 agtatacatatg----tgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaata 419  Q
    |||||| |||||    | | |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15516020 agtatatatatggatattattattattatttgattaagtaaatgatatttgaattgatttattcatgtttaactgctatgtggattatgatgatgtaata 15515921  T
Q  420 cttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||   |||||||||| ||||||||    
T  15515920 cttacc-gtagtggttttgcccgcctac 15515894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Original strand, 50113720 - 50113871
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  50113720 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 50113819  T
Q  194 tcatgaaata----tgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
      |||||  |     |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50113820 gtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgatt 50113871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 319206 - 319303
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||    
T  319206 aggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggtgattg 319303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 54686718 - 54686529
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||        |||| | ||||||||||||||||||||     
T  54686718 gattgttcatgatat--gtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatatt 54686628  T
Q  312 gggattat-gagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatg 408  Q
    ||| || | ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  54686627 ggggtttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgagtaactgttatttggattatg 54686529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49230623 - 49230509
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  49230623 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatac 49230524  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  49230523 atgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 11199112 - 11199294
Alignment:
Q  64 gccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgt---gtaataggtgcatatcatgaca 160  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   |   |||||||| |||||| ||    
T  11199112 gccttgcagagacc--ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-ca 11199208  T
Q  161 tgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga---aatatga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  11199209 tgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgtgcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgatt 11199294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 361 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 40937997 - 40937911
Alignment:
Q  361 catgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40937997 catgatatttgaattgagctattcatgttaattattatatggattattatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctac 40937911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 11330803 - 11330872
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11330803 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatagttacccccagtggttttgaccgcctac 11330872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Original strand, 17536533 - 17536648
Alignment:
Q  24 tcttgcagagatccattagtgatctagt-ttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggta 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17536533 tcttgtagagatcc-ttagtgatctagacttgtgggcttcggccttgcagagacct-ttgacagtctagatataggtgacgaccttgaggtgatatggta 17536630  T
Q  123 ccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17536631 ccacatgcatatatgtgt 17536648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25769606 - 25769502
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgac 440  Q
    |||||| || ||| |||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25769606 tattatcatcgattaagtatgtgatatttgaatttaatcattcatgcttaaccgttatgtggattatgatgatgtaatacttac--ccagtggttttgac 25769509  T
Q  441 cgcctac 447  Q
    |||||||    
T  25769508 cgcctac 25769502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 47786463 - 47786564
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  47786463 aggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattggtgatt 47786562  T
Q  192 gt 193  Q
    ||    
T  47786563 gt 47786564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 448
Target Start/End: Original strand, 15940220 - 15940375
Alignment:
Q  284 tgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattatt 383  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||  |||||||  ||||||||||||||||      ||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  15940220 tgattgatgattattggtgtgagatattggaat-atgatgtaagtatcaatatgtgaatattatt------caaatgcatgatgtt--aattgaattatt 15940310  T
Q  384 catgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    || | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15940311 caagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 15940375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15516358 - 15516301
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15516358 cttcggtcttggagagatccattagtgatctagtttgtgggcttcagccttgcagaga 15516301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 17913834 - 17913935
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  17913834 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgt 17913933  T
Q  194 tc 195  Q
    ||    
T  17913934 tc 17913935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30141458 - 30141361
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  30141458 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33340237 - 33340020
Alignment:
Q  201 atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattga 300  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||   |||||||||        |||||  ||||||||||    
T  33340237 atatgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatat-tgtgaattggaaattgttcata-------tgattaatgattattga 33340146  T
Q  301 tgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgt 400  Q
    ||| |||||| ||| |  |||  |||||||  || |||||   |||||| ||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33340145 tgttagatattggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgataactgttat-t 33340053  T
Q  401 ggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33340052 ggattatgataatgtaatacttacctccagtgg 33340020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7852291 - 7852223
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  7852291 atgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12020290 - 12020211
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12020290 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctac 12020211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17203005 - 17202926
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17203005 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctac 17202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7852155 - 7852089
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  7852155 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatacgtggttggtgatt 7852089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 38812589 - 38812671
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttattg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812589 aggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49230787 - 49230689
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  49230787 aggtgacgacgttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgt 49230689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 5229675 - 5229719
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229675 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 5229719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11381108 - 11381064
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11381108 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 11381064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Original strand, 12351438 - 12351588
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||  ||||||||||     
T  12351438 aggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtgattgtg 12351537  T
Q  195 catg---aaatatg-attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     |||   || |||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  12351538 tatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgatt 12351588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 14846243 - 14846339
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  14846243 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16259619 - 16259543
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16259619 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatt 16259543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16819482 - 16819386
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16819482 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 171
Target Start/End: Original strand, 33370962 - 33371042
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  33370962 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttggactaggtggatatcatgttgacatgagtcttatt 33371042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 2451146 - 2451229
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451146 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 9592349 - 9592392
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592349 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 9592392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 14522877 - 14522920
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagttt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14522877 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagttt 14522920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15516331 - 15516260
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15516331 atctagtttgtgggcttcagccttgcagagatcatttggtgatctagtttgtgggctttggccttgcagaga 15516260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15574620 - 15574545
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15613639 - 15613564
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613639 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22273330 - 22273247
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273330 gattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 23081746 - 23081821
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081746 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 447
Target Start/End: Original strand, 18008944 - 18009001
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18008944 taactgctatgtggattatgatgatgtaatacttacct-tagtggttttgaccgcctac 18009001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Original strand, 12490645 - 12490690
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12490645 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 12490690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17099310 - 17099262
Alignment:
Q  7 tagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtg 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17099310 tagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagtttgtg 17099262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Original strand, 54049644 - 54049705
Alignment:
Q  191 tgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaata 252  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54049644 tgttcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaata 54049705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34558234 - 34558158
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatgttaa-ctgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34558234 gaattgatttattcatgttaaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcc 34558158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47983464 - 47983420
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47983464 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgt 47983420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47992751 - 47992707
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47992751 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgt 47992707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48002038 - 48001994
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48002038 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgt 48001994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48011324 - 48011280
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48011324 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgt 48011280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 12266071 - 12266146
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  12266071 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttat 12266146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15874543 - 15874496
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15874543 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 15874496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41660180 - 41660137
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41660180 ggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 41660137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 11883803 - 11883877
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||| ||||||    
T  11883803 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggctttgtccttgcagagatccattagtgatctaga 11883877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44228000 - 44227903
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  44228000 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 1469234 - 1469330
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  1469234 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 2450908 - 2451004
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  2450908 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  223 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 12266346 - 12266406
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12266346 ttaattgttatctggattatgataatgtaatacttacacccagtggttttaaccgcctact 12266406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 14846495 - 14846555
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14846495 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 14846555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470120
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttat 15470120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15874731 - 15874687
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15874731 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 15874687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18909265 - 18909169
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  18909265 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22273620 - 22273524
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  22273620 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48420238 - 48420194
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48420238 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 48420194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 2045609 - 2045562
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2045609 tggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 2045562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7852101 - 7852058
Alignment:
Q  179 gtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7852101 gtggttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 7852058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 15940044 - 15940119
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15940044 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttat 15940119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15989550 - 15989507
Alignment:
Q  96 aggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatatatgt 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15989550 aggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgt 15989507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 446
Target Start/End: Original strand, 15470309 - 15470367
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15470309 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgccta 15470367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 1469509 - 1469562
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1469509 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 1469562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 8270260 - 8270313
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8270260 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 8270313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 8277371 - 8277424
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8277371 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 8277424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 8306180 - 8306233
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8306180 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 8306233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8630311 - 8630274
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8630311 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgatt 8630274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 16746028 - 16746081
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16746028 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 16746081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30151634 - 30151581
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30151634 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 30151581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41268539 - 41268486
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41268539 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 41268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 41659948 - 41659895
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41659948 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctac 41659895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 53768958 - 53768905
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53768958 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 53768905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 55314679 - 55314626
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55314679 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 55314626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 12490331 - 12490375
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12490331 aggtgacgaccttgagatgattcggtaccacatgcatttatgtgt 12490375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 16745752 - 16745848
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16745752 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44227719 - 44227671
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44227719 tggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 44227671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48419991 - 48419955
Alignment:
Q  389 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48419991 taactgttttgtggattatgatgatgtaatacttacc 48419955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 54686784 - 54686713
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  54686784 tgatatatgtggttggtgattgttcatggagtatgactcatgattgttcaagataaatgtg-ttggtgattgt 54686713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 55442367 - 55442407
Alignment:
Q  100 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  55442367 gacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgt 55442407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16819308 - 16819257
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16819308 tgatacatgtgattggtaattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 16819257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 448
Target Start/End: Original strand, 23082060 - 23082115
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  23082060 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcatact 23082115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27839280 - 27839209
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtc 166  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  27839280 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtc 27839209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 447
Target Start/End: Original strand, 14819683 - 14819729
Alignment:
Q  402 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14819683 gattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctac 14819729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15516122 - 15516076
Alignment:
Q  197 tgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15516122 tgaaatgtgattgatgattgttcatgataaatgtgattgatgattgt 15516076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15574296 - 15574250
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15574296 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15574250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15613315 - 15613269
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15613315 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15613269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17138089 - 17138015
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| || || ||| ||||||    
T  17138089 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccgttagtgatctaga 17138015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 23888047 - 23888093
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23888047 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 23888093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 38377413 - 38377455
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38377413 aggtgacgacctttaaggtgatttggtaccacatgcatatatg 38377455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40938140 - 40938063
Alignment:
Q  239 attgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggat 316  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  40938140 attgtgtgtgaataaatgtga-ttgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgattgattaatgtgagatatggggat 40938063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49230705 - 49230655
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  49230705 atgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11813193 - 11813136
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgatt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || | ||||||||| ||||||||    
T  11813193 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactattcatgataaatgtgatt 11813136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15988873 - 15988820
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15988873 ttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctac 15988820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 18008731 - 18008772
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18008731 aggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatttatg 18008772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 446
Target Start/End: Original strand, 18905608 - 18905661
Alignment:
Q  393 tgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18905608 tgttatttagattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgccta 18905661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 39654531 - 39654482
Alignment:
Q  26 ttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  39654531 ttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttcgaccttgcagaga 39654482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5227273 - 5227177
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgatt 208  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| || |||||  || ||||||| |||||    
T  5227273 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgattagtgatgattgatgaaatgtgatt 5227177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 11330602 - 11330646
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  11330602 aggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgcatttatgtgt 11330646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 16935822 - 16935882
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  16935822 ttaattgttatctggattatgagaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctact 16935882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19945062 - 19945002
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  19945062 ttggtgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgt 19945002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30141267 - 30141227
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30141267 ttggtgattgttcatggaatatgattggtgattgttcatga 30141227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38166515 - 38166467
Alignment:
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38166515 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattg 38166467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 6)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 68777 - 68562
Alignment:
Q  233 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattat-tgatgtgagatatcgggattatgagataagtata 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||     
T  68777 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatt 68678  T
Q  332 catatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagt 431  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  68677 tatatgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgacataatacttacccccagt 68578  T
Q  432 ggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| ||||||    
T  68577 ggttttgactgcctac 68562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 30497 - 30282
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagt 328  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |     
T  30497 tgattgataattgtgtgtgaataaatgtga-ttgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgattgattgatgtgagatatggggattat-ag-tatga 30401  T
Q  329 atacatatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    ||| |||||||| ||||||||| | || || | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  30400 atatatatgtga-tattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaattattatatagattatgatgatgtaatacttacccc 30302  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  30301 tagtggttttgatcgcctac 30282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30669 - 30506
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| || |||  | |||||| |||||||| |||||||    
T  30669 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcggcctttcagaga-cctttgacgttctagatataggtgatgaccttg 30571  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  | ||| |||||||||||||||||     |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30570 aagtgaaattgtatcacatgcatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattg 30506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 68895 - 68795
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||||    
T  68895 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattg 68796  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  68795 t 68795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 99024 - 99077
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  99024 ttatgtggattatgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctac 99077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 68810 - 68767
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  68810 tgtgattggtgattgtgtatgaataactatgatttggtgattgt 68767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 4604 - 4841
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |    
T  4604 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaa 4703  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  4704 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 4802  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4803 gttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 4336 - 4518
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  4336 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  4436 tcatgaaatgtgattaatgattattcataataaatgtgattggtgattgtgaatgcataattgtgaatttataattgttcatg 4518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 4576 - 4615
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4576 ttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 4615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 49444 - 49681
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |    
T  49444 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaa 49543  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  49544 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 49642  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49643 gttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 49681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 49176 - 49358
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  49176 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  49276 tcatgaaatgtgattaatgattattcataataaatgtgattggtgattgtgaatgcataattgtgaatttataattgttcatg 49358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 49416 - 49455
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  49416 ttggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 49455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 256634 - 256859
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  256634 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tg 256732  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  256733 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgtaatac 256832  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  256833 ttacccctagtggttttaaccacctac 256859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Original strand, 124992 - 125330
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  124992 ggtgacgacccttgggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgttc 125091  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||       ||| |||||| |||||    
T  125092 atgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttatgaattgataattgtt-------cacttgattgatgatt 125184  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  125185 attgatgtgagatattggga-tgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgt 125278  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  125279 tatttagattatgatgatgtattacttacacccaatggttttaaccgcctac 125330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72349
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgtaat-aggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatg 72127  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||       || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  72128 attgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgatttgataattgtt-------caagtgattgatgattattgatgtgagatattg 72220  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||  | | |  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  72221 gg-gtgtaatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgatga 72314  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  72315 tgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctac 72349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76730
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgtaat-aggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatg 76508  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||       || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  76509 attgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgatttgataattgtt-------caagtgattgatgattattgatgtgagatattg 76601  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||  | | |  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  76602 gg-gtgtaatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcttgataactgttatttggattatgatga 76695  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  76696 tgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctac 76730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 256468 - 256656
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  256468 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatc-atttgtgatctagtttgtggacttcggtcttgtagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacg 256565  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  256566 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 256656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192737
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtaat-aggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  193074 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggttattattc 192975  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||       || |||| |||||    
T  192974 atgaaatgtgattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattgtgaatgaacatttgtgaattgataattgttcat-------gtaattgatgatt 192882  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    ||||||||||||||| |||  | | |  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  192881 attgatgtgagatattggg-gtgtaatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgt 192788  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  192787 tatttggattatgttgatgtaatacttacc-ctagtggttttaactgcctac 192737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33613 - 33362
Alignment:
Q  188 gattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgat 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33613 gattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgat 33514  T
Q  288 tggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg 387  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33513 tgatgattattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagta--------tgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatg 33423  T
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33422 ttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 33362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Original strand, 32778 - 32952
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||    
T  32778 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatat-------gtgattgt 32870  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||  | |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  32871 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgatgaaagtgattggtgattgtgaataaatatttgtgaattgataattgttcat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33850 - 33756
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtga 189  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||    
T  33850 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 33756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33642 - 33602
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  33642 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaacgattgttcatga 33602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33666 - 33626
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  33666 ttggtgattgttcatggaatatgattggtgattgttcatga 33626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Original strand, 39231 - 39482
Alignment:
Q  188 gattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgat 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39231 gattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgat 39330  T
Q  288 tggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg 387  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39331 tgatgattattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagta--------tgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatg 39421  T
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39422 ttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 39482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40066 - 39892
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||    
T  40066 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatat-------gtgattgt 39974  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||  | |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39973 tcatgaaatgtgattaatgattattcatgatgaaagtgattggtgattgtgaataaatatttgtgaattgataattgttcat 39892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Original strand, 38994 - 39088
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtga 189  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||    
T  38994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 39088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 39178 - 39218
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  39178 ttggtgattgttcatggaatatgattggtgattgttcatga 39218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 39202 - 39242
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  39202 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaacgattgttcatga 39242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 77833 - 77580
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  77833 ttggtgattgttcatgatgtatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacac 77734  T
Q  281 acgtgattggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat 379  Q
    |  ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  77733 atttgattggtggttatggatgtgagatattagggtttttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaa 77634  T
Q  380 tattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  77633 tatccatgttaaatgttatttggattatgatgatataatacttacccccagtgg 77580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36090 - 36020
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36090 tgataaatgtgattaatgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatacatgtgattggtgatt 36020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77869
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgatctttcatgaaatatgattaatg 77878  T
Q  213 attgttcat 221  Q
    |||||||||    
T  77877 attgttcat 77869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36136 - 36004
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttca 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| |  ||   ||||| |||||||||    
T  36136 aaatgtgattgatgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatgtgattaatgattgttcatgaa-atatg---attgaggattgttca 36041  T
Q  275 tgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatat 310  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36040 tgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatat 36004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36214 - 36142
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36214 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgactgttcatgataaatgtggttggtgattgt 36142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36164 - 36113
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36164 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattgttcatg 36113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 156149 - 156386
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |    
T  156149 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaa 156248  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  156249 ttggtgattattgatgtgagatat-tggagtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 156347  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  156348 gttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 156386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 433
Target Start/End: Original strand, 85923 - 86167
Alignment:
Q  178 tgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||      
T  85923 tgtgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcat-- 86020  T
Q  278 cacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattga 377  Q
          |||||| |||||||||||||| ||||| |||  | |||  |||||||  || ||||   ||| ||||||||||| | ||||||||||  | |||    
T  86021 -----atgattgatgattattgatgtgggatattggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtga 86111  T
Q  378 attattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  86112 aatattcatgttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 86167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 265
Target Start/End: Original strand, 58294 - 58382
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  58294 atgtggttggtgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggtgattgtgtatgaatctttgtgaattgat 58382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 92300 - 92220
Alignment:
Q  367 gtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  92300 gtttaaatttaaatatttatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctac 92220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 155935 - 156129
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||         
T  155935 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtg----- 156029  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||  | |||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  156030 --atgaaatgagatgaatgattattgatgatgtttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtga 156127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34908 - 34811
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  34908 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 156109 - 156160
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  156109 tgatacatgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattgttcatg 156160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 11121 - 11174
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11121 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 11174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34627 - 34579
Alignment:
Q  400 tggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  34627 tggattatgataatgtaatgcttacccccagttgttttaaccgcctact 34579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 12)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Original strand, 113965 - 114182
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  113965 tgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttggtgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataa 114064  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  114065 gtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacataccc 114161  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  114162 ccagtggttttgaccgcctac 114182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 108226 - 108052
Alignment:
Q  27 tgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  108226 tgcagagatccattagtgatctagattgtgggctccagccttgcagagaccc-ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccac 108128  T
Q  127 atgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    ||||||||||||||   | | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  108127 atgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgttcatga 108052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 108069 - 107877
Alignment:
Q  260 attgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgt--gaatattattatt-gatc 355  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||  || |||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |  | ||||||||||| |||     
T  108069 attgatggttgttcatgatccatgtgattgatgattgcttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatatatatggatattattatttgatt 107970  T
Q  356 aagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  107969 aagtatatgatattcgaattgatctattcatgtttaactgatatgcggattatgatgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctac 107877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 106708 - 106787
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  106708 ttgaattgctttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccaatgattttgaccgcctac 106787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 6734 - 6830
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6734 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 130454 - 130411
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130454 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 130411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 59040 - 59117
Alignment:
Q  115 atttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  59040 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 106518 - 106562
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  106518 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 106562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 59301 - 59346
Alignment:
Q  403 attatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  59301 attatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 59346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 108276 - 108202
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| || || ||| ||||||    
T  108276 cttcggtcttgcagagatcatttagagatctagtttgtgggccttgaccctgcagagatccattagtgatctaga 108202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 448
Target Start/End: Original strand, 7014 - 7059
Alignment:
Q  403 attatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  7014 attatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccacctact 7059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 113902 - 113980
Alignment:
Q  118 tggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||| ||   || |||| |||||||||||    
T  113902 tggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgt 113980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 7)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21054 - 20828
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21054 tgatgtatgtgattggtgtttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatg 20955  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| |||||||||| || ||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20954 atgtaagtatatgtatgagaatattattgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 20855  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20854 ttacccccagtgcttttgaccgcctac 20828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 221 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28644 - 28419
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||    
T  28644 tgatgtatgtgattggtgtttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatg 28545  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||| ||  |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28544 atgtaagtctatgtatgagaatattattgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 28445  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||    
T  28444 ttacccctagtggttttgactgccta 28419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21220 - 21032
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||    
T  21220 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattgtggggttcggccttgcagagacct-ttggtggtctggatatgggtgacg 21123  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  21122 accttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgt 21032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28810 - 28627
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  | ||  ||||||    
T  28810 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcca-tagtgatctagattgtgggcttcggccttgcagaga-cccttggtggtctgcatatgagtgacg 28713  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtg 188  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28712 accttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtg 28627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 448
Target Start/End: Original strand, 129804 - 130119
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       |||||  ||||||| ||||| |     
T  129804 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtg-------attgtctatgaaatgtgattaat 129896  T
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    | || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| || |||||||||        ||| || ||| | ||||| ||||||||     
T  129897 ggttattcatgataaatgtgattggtggttgtgaatgaatatctatgaattaataattgttcata-------tgactgatgaatgttgatatgagatatt 129989  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    |||||  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||     
T  129990 gggatg-tgatgtaagtatttatgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgttaaatgctatttggattctgata 130082  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  130083 atgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctact 130119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21259 - 21190
Alignment:
Q  5 tctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  21259 tctagtttatggactttggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 21190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28849 - 28780
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  28849 atctagtttatggactttggtct-gcagagatcc-ttagtgatctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 28780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7665 - 7452
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  7665 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttga 7566  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagata-tcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattca 385  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| || |||  ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  7565 ttggtgattattgatgggagatattggggtttttgatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcca 7466  T
Q  386 tgttaactgttatg 399  Q
    ||||||||||||||    
T  7465 tgttaactgttatg 7452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7809 - 7682
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7809 tgatatatgtggttggtgaatgttcatgaaatgtgattaatgattgtttatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttg 7710  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattatt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7709 ttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7807
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt-attgataaat-------gtggttgg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||       ||| ||||    
T  8000 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtggtgattgg 7901  T
Q  187 tgattgttcatg---aaatatg-attgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatga 277  Q
    |||||||  |||   || |||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  7900 tgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactatg-attaatgattgttcatga 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7908 - 7842
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7908 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7647
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  7699 atgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 7647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6038 - 5813
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |     
T  6038 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-ta 5940  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5939 atgtaactatatgtatgagaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgtaatac 5840  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5839 ttatccccagtggttttgaccgcctac 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6114 - 6016
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  6114 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgatgattgt 6016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 138480 - 138705
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  138480 tgatatatgtgattggtgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tg 138578  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  138579 atgtaagtataagtatgaaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 138678  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  138679 ttacccccagtggttttaaccgcctac 138705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 76779 - 76579
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  76779 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtt-tg 76681  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  76680 atgtaagtattgatatatgaatattatta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 76584  T
Q  421 ttacc 425  Q
    |||||    
T  76583 ttacc 76579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 76945 - 76750
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  76945 atctagcttttgggcttcggccttgcagagatctttt-gagatctagtttgtggacttcgatcttgcagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacg 76848  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  76847 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgcatgaa 76750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Original strand, 138404 - 138502
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  138404 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 138502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 351 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9940 - 9844
Alignment:
Q  351 tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  9940 tgattaagtatatgagttttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctac 9844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10255 - 10126
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  10255 tttgcggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggctccgtccttgtagaga-cctttgatggtctagatataggtgacaacctta 10157  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    | ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  10156 aagtgaaatggtaccacatgcatgtatgtgt 10126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10086 - 10003
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagata 309  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10086 atgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttgatgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 76985 - 76915
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  76985 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagat-catttgtgatctagcttttgggcttcggccttgcagaga 76915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 87043 - 87013
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87043 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 87013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 236749 - 236380
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |    
T  236749 aggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggt 236650  T
Q  195 catgaaatatga-----------ttgaggattgttcatgatatatgtgat-------tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
     ||    |||||           |||| |||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||    
T  236649 gattgtctatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgataagtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatg 236550  T
Q  277 acacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattg 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  236549 acacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttc-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattg 236451  T
Q  377 aattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  236450 aaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctac 236380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 270553 - 270311
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||           
T  270553 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata------ 270460  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  270459 -tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 270362  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  270361 ccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 270311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 270695 - 270596
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  270695 aggtgacgatcttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgt 270596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 270618 - 270545
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  270618 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgat-attattcatgatacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 8)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 2993
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3193 aggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtt 3094  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3093 catgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 2994  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  2993 t 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2737
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2845 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtga 2746  T
Q  287 ttggtgatt 295  Q
    |||||||||    
T  2745 ttggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2973 - 2865
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2973 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtga 2874  T
Q  287 ttggtgatt 295  Q
    |||||||||    
T  2873 ttggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2717 - 2616
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2717 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtga 2618  T
Q  287 tt 288  Q
    ||    
T  2617 tt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2465
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 2465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2751 - 2699
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  2751 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 2699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2879 - 2827
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  2879 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 2827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3007 - 2955
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  3007 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 2955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 8)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5801 - 5601
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5801 aggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtt 5702  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5701 catgaaatgtgattaatgattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 5602  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  5601 t 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 549 - 318
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  549 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcat------- 457  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||  || |||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  456 atgattgatgaatattgatgtgagatatcggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgt---aattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 361  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  360 ccatggtaactgttatttggattatgataatgtaatacttacc 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5480
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5581 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtga 5482  T
Q  287 tt 288  Q
    ||    
T  5481 tt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 641
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  755 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatac 656  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  655 atgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5329
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 869
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  945 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5615 - 5563
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  5615 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatgaaatatg 5563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 591
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  649 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 7)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 94531 - 94335
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  94531 tgattgttcatgaaatatgattgatatttgttcacaatatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 94432  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattatt 383  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94431 ttggtgattattaatatgagatattgggattatgatataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 94745 - 94665
Alignment:
Q  143 taggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  94745 taggtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 94665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 94882 - 94812
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  94882 atctagtttgtggacttcagtcttgcagagat-catttgtgatctagtttttgggcttcggccttgcagaga 94812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 94581 - 94525
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  94581 tgattgttcatggaatatgattgatgattgttcatgataaatatgattaatgattgt 94525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 94617 - 94570
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  94617 aaatgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattgttcatg 94570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 94802 - 94772
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94802 atctagtttgtggacttcggtcttgcagaga 94772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 94641 - 94593
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  94641 aaatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattggtgattgttcatga 94593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 447
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7146
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgagg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattggtgactgttcatgaaatgtgattaatg 6925  T
Q  213 attgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcg 312  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  6926 attattcatgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggtcat-------atgattgatgactattgatgtgagatattg 7018  T
Q  313 ggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 412  Q
    ||| | |||  |||||||  || ||||   |||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  7019 gga-tgtgaagtaagtattaatgtgtg---attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataa 7112  T
Q  413 tgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7113 tgtaatacttacc-ccagtggttttaaccgcctac 7146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26670 - 26442
Alignment:
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  26670 tcatggaatatgattgatatttgttcacgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatga 26571  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26570 ttatgaatgtgagatattggggt--tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaact 26473  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26472 gttatttggattatgatgatgtaatacttac 26442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 221 - 444
Target Start/End: Original strand, 15080 - 15300
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgatt-gtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattat 319  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |  |    
T  15080 tgatacatgtgactggtgatttgtgaatgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtg-t 15178  T
Q  320 gagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaata 419  Q
    ||  |||||||  || | |||   |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15179 gatgtaagtattaatgtatga---ttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaata 15275  T
Q  420 cttacctccagtggttttgaccgcc 444  Q
    |||||||||| || |||| ||||||    
T  15276 cttacctccaatgattttaaccgcc 15300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 15005 - 15100
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  15005 ggtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatt 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 24243 - 24312
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||    
T  24243 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtagtgctcacccccagtggttttgaccgcctac 24312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26761 - 26707
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatg 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  26761 aaatgtgattggtgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatgaaatatg 26707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26729 - 26689
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  26729 ttggtgattgttcatgaaatatgattggtgatcgttcatga 26689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 37954 - 37728
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  37954 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 37855  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37854 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgtaatac 37755  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  37754 ttaccccaagtggttttaaccgcctac 37728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38030 - 37932
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  38030 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgt 37932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14831
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagta 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  330 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcca 429  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 14835  T
Q  430 gtgg 433  Q
    ||||    
T  14834 gtgg 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4141 - 4057
Alignment:
Q  343 attattat-tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141 attattatctgattaagtacatgatatttgaattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 4057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 214 - 422
Target Start/End: Original strand, 21626 - 21834
Alignment:
Q  214 ttgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgg 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21626 ttgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 21725  T
Q  314 gattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgat 413  Q
    | || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21726 ggttttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgat 21825  T
Q  414 gtaatactt 422  Q
    |||||||||    
T  21826 gtaatactt 21834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Original strand, 21547 - 21610
Alignment:
Q  158 acatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21547 acatgagtcttat-gatacatgtgattggcgattgttcatgaaatatgattaacgattgttcatg 21610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 433
Target Start/End: Original strand, 2431 - 2676
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   |||||||   ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2431 tgattgttcatggcttatgattagtgattgttcatggtgtatatgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtga 2530  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  2531 ttggtgaatattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcat 2629  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2630 gttaaatgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4263 - 4047
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  4263 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataa 4164  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacct 426  Q
    ||||  ||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||     
T  4163 gtatgtatatgtgaatactatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaataattacc- 4068  T
Q  427 ccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  4067 ccagtggttttgaccacctac 4047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4433 - 4248
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4433 tttgtggacttcagtcttgtagagatcc-ttagtaatctagatttgtgggctccggccttgcagagacat-ttgatggtctagatataggtgacgacctt 4336  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    || ||||  |||||||||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||    
T  4335 gaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgt 4248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 433
Target Start/End: Original strand, 448 - 701
Alignment:
Q  175 aaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggatt-gttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttc 273  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  448 aaatgtgattgatgattattcatgaaatatgattggtgatttgttcatgaaat--gtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttc 545  T
Q  274 atgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaa 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||  |    
T  546 atgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgtgaatatt---attgatcaagtgcatgatgtttata 641  T
Q  374 ttgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  642 ttgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Original strand, 395 - 448
Alignment:
Q  170 ttgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga 223  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  395 ttgatatatgtgattggtgattattcatgaaatgtgattaatgattgttcatga 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31230 - 31028
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  31230 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggt--tg 31133  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31132 atgtaagtatttttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatac 31033  T
Q  421 ttacc 425  Q
    |||||    
T  31032 ttacc 31028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31305 - 31208
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31305 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 31208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14153 - 13933
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga-ttattgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  14153 gtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataag 14054  T
Q  328 tata--catatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14053 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttacc 13954  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     | ||||||||| ||| |||||    
T  13953 -caagtggttttaaccacctac 13933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14243 - 14147
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta--ttgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||    
T  14243 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgattg 14147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29870 - 29628
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  29870 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacac 29771  T
Q  281 acgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatt 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  29770 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 29672  T
Q  381 attcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  29671 atccatgttaactgttattttgattatg-ttatgtaatacttacc 29628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 514
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  728 tgatatatgtgattggtaattacgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtt-tg 630  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  629 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgtaatac 530  T
Q  421 ttacctccagtggtttt 437  Q
     |||| |||||||||||    
T  529 atacc-ccagtggtttt 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 803 - 712
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggt 187  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  803 ggtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1266
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtaat-aggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  1604 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattattt 1505  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    | ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||       ||||||| |||||    
T  1504 acgaaatgtgattaatgattgttcataacaaatgtgataggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataactgttcat-------gtgattgatgatt 1412  T
Q  296 attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 395  Q
    ||||||||||||||| |||  | | |  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  1411 attgatgtgagatattggg-gtgtaatgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgt 1318  T
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1317 tatttggattatgttgatgtaatacttacc-ctagtggttttaaccgcctact 1266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4394
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatg-------tgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaag 4513  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  4512 tattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttaac-c 4414  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4413 cagtggttttgaccgcctac 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4697 - 4627
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagt 165  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4697 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 4627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 229 - 448
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75760
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| || | |||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  75650 tatatatttatgac----------gatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttacccc 75739  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  75740 cagtgattttgaccgcctact 75760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 72014 - 72177
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  72014 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccat-agtgatctagattgtgggcttcggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacg 72111  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  72112 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 166154 - 166232
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||   |||||||||||    
T  166154 tgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggcgattgtgtataaatctttgtgaattgat 166232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 145106 - 144926
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  145106 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgtt 145007  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  145006 catgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 147365 - 147185
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  147365 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgtt 147266  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  147265 catgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 51679 - 51600
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  51679 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtgaattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctac 51600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 229 - 447
Target Start/End: Original strand, 66405 - 66623
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataag 327  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||  ||||    
T  66405 gtgattgggaattgtgtatgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaag 66504  T
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  66505 tattgatatgtgaatattattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgtaatacttacc-c 66603  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  66604 tagtggttttaaccgcctac 66623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 26324 - 26512
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||    
T  26324 atctagtttttgggcttcggccttgcagagatctttt-gagatctagtttgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggattcaggtgacg 26421  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26422 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 26512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 26490 - 26692
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||                      
T  26490 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatg------------------ 26571  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
       |||||||  |||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26572 ---taagtattgatatatgaatat---tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgtaatac 26665  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||   ||||||||| |||||||||    
T  26666 ttaccctgagtggttttaaccgcctac 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Original strand, 26284 - 26354
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagaga 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  26284 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagat-catttgtgatctagtttttgggcttcggccttgcagaga 26354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66411
Alignment:
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattg 66411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 9)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17750 - 17495
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  17750 tgattgttcatggcttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtga 17651  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||||  |||| | ||| |||    
T  17650 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccat 17555  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17554 gttaactgttaattggattatgttgatgtagtacttacc-ctagtggttttaaccgcctac 17495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19765 - 19546
Alignment:
Q  202 tatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgat 301  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19765 tatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgat 19666  T
Q  302 gtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtg 401  Q
    ||||||||| ||| || |||  |||||||  |||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||||  |||| | ||| ||||||||||||||  ||    
T  19665 gtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattg 19570  T
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  19569 gattatgttgatgtagtacttacc 19546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8561
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtttt 437  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggtttt 8561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13950
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtttt 437  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggtttt 13950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17871 - 17739
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaat-------gtggttggtga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||       ||| |||||||    
T  17871 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtga 17772  T
Q  190 ttgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17771 ttgttcatgaaatatgattgatgattgttcatg 17739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19955 - 19860
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  19955 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 19860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 8248 - 8289
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8248 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Original strand, 13637 - 13678
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13637 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19866 - 19799
Alignment:
Q  229 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  19866 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 447
Target Start/End: Original strand, 3217 - 3427
Alignment:
Q  237 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacata 335  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  || | ||||  ||    
T  3217 tgattgcgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatggtatgaatata--ta 3314  T
Q  336 tgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggt 434  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  3315 tgtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtgatacttacccccagtgat 3414  T
Q  435 tttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||    
T  3415 tttgacggcctac 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 3038 - 3201
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  3038 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcgaccttgcagaga-cctttagcggtctagatataggtgacgaccttg 3136  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattg 172  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||||||   | ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  3137 aagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattg 3201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1339
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||    
T  1120 tgatatatgtgattggtgattgggtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggg-gtgtg 1218  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  ||| |||||      |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  1219 atgtaagtattgatacgtgaa------tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgtaatac 1312  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1313 ttacccccagtggttttaaccgcctac 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 969 - 1141
Alignment:
Q  19 ttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgattt 118  Q
    ||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  969 ttcggccttgcagagatctttt-gagatcaagtttgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtctggacatgggtgacgaccttgaggagattt 1066  T
Q  119 ggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1067 ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17001 - 16752
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17001 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacac 16902  T
Q  281 acgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatt 380  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| |    
T  16901 atgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgacgtt--aattgaaat 16805  T
Q  381 attcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
     |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16804 gttcatgataactgttatttagattatgataatgtactacttacccccagtgg 16752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17146 - 17070
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17146 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1839 - 1621
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  1839 atgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattat-ag-ta 1742  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattattga-tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 424  Q
     | ||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1741 tgaatatatatgtga-tattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttac 1643  T
Q  425 ctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  1642 c-ccagttgttttgaccgcctac 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2009 - 1771
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |  || || ||||   |    |||||||| | | | ||||||||||    
T  2009 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtaggcttcggaattacaaagacat-taaacggtctagataaaagagacgaccttg 1911  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||   ||||    
T  1910 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaataaat 1811  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1810 gtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgatt 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 425
Target Start/End: Original strand, 9896 - 10132
Alignment:
Q  187 tgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtga 286  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  9896 tgattgttcatgacttatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtga 9995  T
Q  287 ttggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| |  || || ||||| |||||| ||| |||| ||||||| || |||||||  || |||    
T  9996 ttggtgattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacat 10093  T
Q  387 gttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10094 gttaactgtcatttggattatgataatgtaatacttacc 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 7087 - 7319
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  7087 tgatatatgtgtttggtgattgtgtgtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 7186  T
Q  321 agataagta------tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatg 414  Q
    |  ||||||      || ||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  7187 atgtaagtatatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatg 7286  T
Q  415 taatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  7287 taatacttacccccggtggttttaactgcctac 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 6921 - 7109
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacg 103  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||| |||| |||  | ||||||||||||| |||||||| | || ||  ||||||    
T  6921 atctagttattggacttcggccttgcagagatctttt-gagatctagttcgtggacttcggtcttgcagagaccc-ttggtggtttggatatgagtgacg 7018  T
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7019 accttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgt 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12684 - 12457
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcggga--ttatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||   || |||      
T  12684 atgtgattggtgattgtgtatgaataattttgaattaatg-ttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatg 12586  T
Q  324 taagtatacatatgt------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaa 417  Q
    |||||||| |||| |      ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12585 taagtatatatatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaa 12486  T
Q  418 tacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12485 tacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 12457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12766 - 12668
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||    
T  12766 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattggtgattgt 12668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56196
Alignment:
Q  241 tgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||            
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtata-------- 56280  T
Q  340 aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56279 --tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 56196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 56505 - 56431
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56505 gtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 56431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 56408 - 56369
Alignment:
Q  237 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  56408 tgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25749 - 25505
Alignment:
Q  201 atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattga 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |||||||| |    
T  25749 atatgattggtgattgttcatgatgtatataattgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaa 25650  T
Q  301 tgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgt 400  Q
    |||||||||| ||| || |||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||  | || |||||   ||||||| | ||| || |||||||||| |    
T  25649 tgtgagatattggggttctgatgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcagatgcacgatgt---aattgaaatgttcttgataactgttattt 25553  T
Q  401 ggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25552 ggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 25505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Original strand, 2861 - 3093
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||           
T  2861 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat------- 2953  T
Q  283 gtgattg-gtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatta 381  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||  || ||||   ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  2954 atgattgattgattattgatgtgagatatcggg-gtgtgatgtaagtattaatgtgtg---attattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaata 3049  T
Q  382 ttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3050 tccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Original strand, 2717 - 2871
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtg--catatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  2717 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgatt 2816  T
Q  192 gttcatgaa---atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    ||  |||||    | ||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2817 gtgaatgaatatttgtgattaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 2871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Original strand, 2796 - 2869
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  2796 tgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtg-attaatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 26960 - 26841
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |    
T  26960 tatacatatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggactatgttgatgtaatacttacccc 26861  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  26860 tagtggttttaaccgcctac 26841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27142 - 27043
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta--ttgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||    
T  27142 aggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgattg 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40099 - 39933
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  40099 ggtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgactgttc 40000  T
Q  196 atgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaatt 262  Q
    ||||| | | ||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  39999 atgaactgttattaatgattattcatgataaatgtgattggtggttgtgaatgaatatttgtgaatt 39933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 343 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37595
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaacca 37600  T
Q  443 cctac 447  Q
    |||||    
T  37599 cctac 37595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 447
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4757
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| |||  |||     
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagtcattgagatcatggtatat 4627  T
Q  327 gtatacatat----------gtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgta 416  Q
    ||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4628 gtatatatatatatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaagtta-aattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgta 4726  T
Q  417 atacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  4727 atacttacccctagtggttttaaccgcctac 4757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 447
Target Start/End: Original strand, 6401 - 6615
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||             
T  6401 gattgttcatgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatg--------- 6491  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
                ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  6492 ------------taagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttg 6579  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  6580 atgtaatacttacccccagtggtcttaaccccctac 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 199
Target Start/End: Original strand, 6306 - 6412
Alignment:
Q  94 ataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  6306 ataggtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattg 6405  T
Q  193 ttcatga 199  Q
    |||||||    
T  6406 ttcatga 6412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 324 - 447
Target Start/End: Original strand, 28 - 151
Alignment:
Q  324 taagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactta 423  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  28 taagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtaatactta 127  T
Q  424 cctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    || |||||||| || ||| |||||    
T  128 cccccagtggtcttaaccccctac 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23186 - 23030
Alignment:
Q  268 ttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatg 367  Q
    |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23186 ttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg 23088  T
Q  368 tttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23087 tttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 23030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16366
Alignment:
Q  346 attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 16366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144956
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgtaatacttacc-ccagtggttttaacc 144962  T
Q  442 gcctac 447  Q
    ||||||    
T  144961 gcctac 144956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 145520 - 145357
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || |||  | |||||| |||||||| ||||| |    
T  145520 tttgtggacttcggtcttgcaaagatccattagtgatctagattgtgggctccggccttgcagaga-cctttgacgatctagatataggtgatgacctcg 145422  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    | || |  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  145421 aagtaaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatt 145357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 145351 - 145231
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| | ||| |||  ||||    
T  145351 atgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtg---attgatgtgaggtattgagatcatggtataa 145255  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattat 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  145254 gtatatatatgtgaatattattat 145231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 6)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 54121 - 53899
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||     
T  54121 gattcttcatgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatatt 54029  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    || | | |||  |||||||  | |||||    || ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  54028 gg-agtgtgacgtaagtattgacatgtgg---tttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgata 53935  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53934 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 53899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 109859 - 109971
Alignment:
Q  185 ggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  109859 ggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacat 109958  T
Q  283 gtgattggtgatt 295  Q
    |||||||||||||    
T  109959 gtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Original strand, 109957 - 110055
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  109957 atgtgattggtgattgttcatgaaatgtgattgatgattattcaagatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54213 - 54110
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgttc 195  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  54213 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattcttc 54114  T
Q  196 atga 199  Q
    ||||    
T  54113 atga 54110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 109667 - 109743
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109667 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 109743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 106446 - 106498
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  106446 ttatgtggattataatgatgtaatgcttacccccagtagttttgaccgcctac 106498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 446
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217666
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||    
T  217335 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatat-------gtgattgt 217427  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||| |||||        |||||| |||    
T  217428 tcatgaaatgtaattaatgattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattattcat-------atgattgatga 217520  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
     ||||||||||| |||| |||  |||||  ||||| |  || ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  217521 atattgatgtgaaatattggg-gtatgatgtaagttttaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattg-attattcatgataact 217613  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    | ||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  217614 gctatttggattttgataatgtaatacttaccccccgtggttttaaccgccta 217666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5203
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatga-tatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacaca 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||          
T  5443 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgaataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata----- 5349  T
Q  282 cgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatta 381  Q
      ||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||    
T  5348 --tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaata 5255  T
Q  382 ttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5254 ttcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 5203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5435
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || |||| ||    
T  5547 ttggtgattgttcatgatgtatatgatc-aggattgttcatgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaa-aactgtgaattgatatttatttatgatac 5450  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  5449 aagtaattggtgatt 5435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5757 - 5682
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  5757 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 99689 - 99615
Alignment:
Q  104 accttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt----aataggtgcatatca---tgacatgagtcttatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  99689 accttgaggtgatttggtaccacatacatatatgtgtcgggaataggcgcatatcatattgacatgagtcttatt 99615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5591 - 5537
Alignment:
Q  189 attgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5591 attgttcatgaattatgatcggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgt 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 447
Target Start/End: Original strand, 19306 - 19521
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||        |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  19306 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggga-tgtg 19397  T
Q  321 agataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatac 420  Q
    |  |||||||  || ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19398 atgtaagtattaatgtgtg---attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgtaatac 19494  T
Q  421 ttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19495 taacccccagtggttttaaccgcctac 19521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19328
Alignment:
Q  114 gatttggtaccacatgcatatatgtgta-ataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19248 gatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgt 19328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31341 - 31110
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacac 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||           
T  31341 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgataaacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgattattgttcata------ 31248  T
Q  283 gtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattat 382  Q
     || |||  || |||||||||||||||||||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  31247 -tgtttgacgaatattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatat 31153  T
Q  383 tcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31152 tcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacc 31110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31447 - 31333
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaa--atatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacac 280  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||    
T  31447 ttggtgattgttcatgatgtatatgatcggtgattgttcatgatgtatatgatcagtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatac 31348  T
Q  281 acgtgattggtgatt 295  Q
    | || ||||||||||    
T  31347 aagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  291 tgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg 387  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 328 - 433
Target Start/End: Original strand, 90931 - 91036
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  90931 tatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 91030  T
Q  428 cagtgg 433  Q
    ||||||    
T  91031 cagtgg 91036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 90783 - 90912
Alignment:
Q  202 tatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgat 301  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  90783 tatgattggtgattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaat 90882  T
Q  302 gtgagatatcgggattatgagataagtata 331  Q
    ||||||||| ||| || |||  ||||||||    
T  90883 gtgagatattggggttttgatgtaagtata 90912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 90599 - 90696
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  90599 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgt 90696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 128813 - 128730
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  128813 gattgttcatgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Original strand, 90674 - 90748
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  90674 tgatgtatgtgattggagattgtgtaagaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 78064 - 77985
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  78064 ttgaattgttttattcatgcctaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctac 77985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 128963 - 128888
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  128963 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 128888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 128738 - 128678
Alignment:
Q  183 ttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  128738 ttggtgattgttcatgaaatgtgattaatgattattcatgatacatgtaattggtgattgt 128678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 90734 - 90779
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatg 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  90734 atgtgattggtgattgttcatgaaatatgattaatgattattcatg 90779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4046
Alignment:
Q  328 tatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctc 427  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgtaatacttacccc 4026  T
Q  428 cagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  4027 tagtggttttaaccgcctac 4046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3800
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||    
T  3706 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgat 3800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 2401 - 2485
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggcttta-gccttgcagagaccccttggtggtct 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  2401 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatcc-ttagtgatctagattttgggcttcaggccttgcagaga-cccttggtggtct 2485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 336
Target Start/End: Original strand, 3781 - 3897
Alignment:
Q  221 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgatt-gttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattat 319  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  3781 tgatatatgtgattgatgatggtgtgtgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggtttt 3880  T
Q  320 gagataagtatacatat 336  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  3881 gatgtaagtatatatat 3897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 3893 - 4045
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgatt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||    
T  3893 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtgattgatgatt 3992  T
Q  192 gttcatg--aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattg 242  Q
    || ||||  |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3993 gtgcatgataaatgtgattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattg 4045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Original strand, 3978 - 4044
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt 295  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3978 atgtgattgatgattgtgcatga-taaatgtga-ttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Original strand, 11617 - 11959
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt-gataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  11617 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
    ||||||||  ||||| | | || ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||  |||| |||||| |||| ||||       ||||||| |||    
T  11717 tcatgaaaggtgattaatggttattcatgataaatgtaattggtgattgcgaatgaatagttgtgcattgataattgctcat-------gtgattgatga 11809  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||||| || |||| |||  | |||  |||||||   | ||||   | |||||| |||||| | ||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  11810 ttattgatgagaaatattggg-gtgtgatgtaagtattattgtgtg---actattatcgatcaaatgcatgatgatt-aattgtaatattcatgttaact 11904  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
      ||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11905 actattttgattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctact 11959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 163903 - 163817
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  163903 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 118203 - 118247
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  118203 aggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatatatgtgt 118247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 419
Target Start/End: Original strand, 118403 - 118444
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaata 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118403 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaata 118444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 996 - 786
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||        |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  996 gattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatc 904  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||| |  |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||     
T  903 ggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgata 808  T
Q  412 atgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  807 atgtaatacttacccccagtgg 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7521
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctcaatggttttgatc 7515  T
Q  442 gcctac 447  Q
    ||||||    
T  7516 gcctac 7521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 7262 - 7306
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7262 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 7306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44495 - 44266
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattg 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44495 tgatatatgtggttggtgattgttcatcgagtatgattaatgattgttcatgatat--gtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattg 44398  T
Q  271 ttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 370  Q
    |||||        |||| | || ||||||||||||||||| ||| || ||   ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44397 ttcat-------atgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgttt 44305  T
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgttatgtggattatg 408  Q
     ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  44304 aaattgaaatattcatgattgactgttattcggattatg 44266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 52665 - 52457
Alignment:
Q  171 tgataaatgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtga-ttgtgtatgaataactgtgaattgatgatt 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  52665 tgatatatgtggttggtgattgttcatggagtatgattaatgattgttcatg--atatgtgatcggtgatttgtgtatgaataattgtgagttgataatt 52568  T
Q  270 gttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtt 369  Q
    ||||||        |||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52567 gttcat-------atgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtt 52475  T
Q  370 tgaattgaattattcatg 387  Q
    | ||||||| ||| ||||    
T  52474 taaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52687 - 52643
Alignment:
Q  199 aaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgt 243  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  52687 aaatgtgattgatgattattcatgatatatgtggttggtgattgt 52643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 6071
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgagatatcgggattatgagata 325  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||    
T  6303 atgtgattgatgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattat-ag-ta 6206  T
Q  326 agtatacatatgtgaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaa--------------ctgttatgtggattatgat 410  Q
     | ||| || |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||               ||||||||||||||||||    
T  6205 tgaatatatgtgtg-atattattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatgttatgtggattatgat 6107  T
Q  411 gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgccta 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6106 gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgccta 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6473 - 6235
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |  || || ||||   ||   |||||||| ||| ||||||||||||    
T  6473 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgttggcttcggtttttcatagacttttttc-ggtctagatatatgtgacgaccttg 6375  T
Q  110 aggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatg---aaat 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||   ||||    
T  6374 aagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatgaataaat 6275  T
Q  203 atga-ttgaggattgttcatgatatatgtgattggtgatt 241  Q
     ||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  6274 gtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgatt 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7346 - 7267
Alignment:
Q  368 tttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7346 tttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctac 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 255 - 458
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||        |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  255 gattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatc 347  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    |||  | |||  |||||||  || ||| |   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||     
T  348 gggggtgtgatgtaagtattaatgtgtaa---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgata 444  T
Q  412 atgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||    
T  445 atgtaatacttacc 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  99 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27361 - 27159
Alignment:
Q  212 gattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatc 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||        |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27361 gattattcatgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatc 27269  T
Q  312 gggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatg 411  Q
    ||| |  |||  |||||||  || |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  27268 ggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtga---ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgata 27173  T
Q  412 atgtaatacttacc 425  Q
    ||||||||||||||    
T  27172 atgtaatacttacc 27159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 106320 - 106244
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  106320 aattgaaatattcaagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 106244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 106575 - 106500
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  106575 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 106500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 66370 - 66423
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  66370 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 66423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1334 - 1246
Alignment:
Q  177 atgtggttggtgattgttcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1334 atgtggttggtgattgttcatgaagtatgattgaggattgttcatgatatatgtgatcggtgattgtgtatgaatctttgtgaattgat 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4416 - 4085
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||         
T  4416 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtg----- 4322  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtga 293  Q
      |||||||  |||| | |||| || |||||   |||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| |||||       |||  |||||| |||    
T  4321 --atgaaatgagattaatgattattgatgatgattgtgattgatgattgtgaatgaatatttatgaattgataattgt-------acatatgattgatga 4231  T
Q  294 ttattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact 393  Q
    ||||||| ||||| ||| |||  |||||  |||||||  || ||||||||||||      |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |    
T  4230 ttattgaagtgaggtattggg-gtatgatgtaagtattaatgtgtgaatattat------tcaaatacatgatgtt--aattgatttattcaagttaatt 4140  T
Q  394 gttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4139 gttatttggattatgatattgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15257
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtgg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 15257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 8558 - 8355
Alignment:
Q  231 gattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta-ttgatgtgagatatcgggattatgagataagta 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| || |||| ||||  ||||||     
T  8558 gattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtgagtggtgattacttaatgtgagaaattgggactatgctataagtg 8459  T
Q  330 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcca 429  Q
    | |||||| ||||| ||              ||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8458 ttcatatgagaataata--------------catgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 8373  T
Q  430 gtggttttgaccgcctac 447  Q
     |||||||||||||||||    
T  8372 atggttttgaccgcctac 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8571
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtctt 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||    
T  8646 aggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtctt 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 448
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72199
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttactcacagcggttttgacc 72192  T
Q  442 gcctact 448  Q
    |||||||    
T  72193 gcctact 72199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 71879 - 71918
Alignment:
Q  98 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  71879 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatg 71918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 447
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2543
Alignment:
Q  342 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgacc 441  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaca 2537  T
Q  442 gcctac 447  Q
    ||||||    
T  2538 gcctac 2543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Original strand, 197687 - 197861
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtctta-ttgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||    
T  197687 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatat-------gtgattgt 197779  T
Q  194 tcatgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    ||||||||| ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  197780 tcatgaaatgtgattaatgattatccatgataaatgtgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaatcgataattgttcat 197861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 84987 - 84944
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84987 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 84944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26125 - 26082
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125 ggtgacgacctttaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 26082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25898 - 25845
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25898 ttatgtggattatgattgatataaatcttacccccagtggttttgaccgcctac 25845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 448
Target Start/End: Original strand, 197976 - 198013
Alignment:
Q  411 gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  197976 gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 198013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6860
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6937 ttgaattgacttattcatgttaactgttatatggattatgatgatgtaatacttacc-ctagtggttttgaccgcctac 6860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7204 - 7039
Alignment:
Q  37 cattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttg-aggtgatttggtaccacatgcatata 135  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  7204 cattggtgatctagtt-gtgggcttcggccttgcagagaccc-ttagtggtctagatataggtgacgaccttgaaagagaattggtaccacatgcatata 7107  T
Q  136 tgtgt---aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgat-aaatgtggttggtgattgttcatga 199  Q
    |||||   | |||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| |||||||||    
T  7106 tgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtctatttgatgtaatgtgattgatgaatgttcatga 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249234
Alignment:
Q  100 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  249140 gacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgt 249234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 447
Target Start/End: Original strand, 249218 - 249426
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataa 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||       |||||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||  |||    
T  249218 atgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattaatgattattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaa 249309  T
Q  327 gtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat-tattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 425  Q
    ||||  || |||||   |||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  249310 gtattaatgtgtga---ttattattgatcaaattcctgatgtt--aattgaaaatattcatgataattgttatttggattatgataatgtaatacttacc 249404  T
Q  426 tccagtggttttgaccgcctac 447  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  249405 cccagtggttttaaccgcctac 249426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 35663 - 35709
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35663 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 35709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32175 - 32051
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctag-tttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgacctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  32175 tttgtggacttcggtcttgcagagat------gtgatctagatttgtgggctccggccttgcagagacct-ttgacggtctagatataggtgacgacctt 32083  T
Q  109 gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32082 gaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgt 32051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 31853 - 31744
Alignment:
Q  336 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  31853 tgtgaatattattattgatcaagtgcatgaagtta-aattgaaatattcatgtaaa-tgttatgtgggttatgatgatgtaatgcttaccgcccgtggtt 31756  T
Q  436 ttgaccgcctac 447  Q
    || ||| |||||    
T  31755 ttaaccacctac 31744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32010 - 31931
Alignment:
Q  228 tgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatt-attgatgtgag 306  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32010 tgtgattgataattgtgtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgag 31931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 6211 - 6305
Alignment:
Q  4 atctagtttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggt 99  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  6211 atctagtttgtgggtttcggccttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttcagccctgcagaga-cctttggtggtctagatataggt 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 6184 - 6258
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctaga 92  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||||    
T  6184 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggtttcggccttgcagagatccattagtgatctaga 6258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 12786 - 12872
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 181  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12786 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 12872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5270
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 181  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5184 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtg 5270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 448
Target Start/End: Original strand, 5388 - 5490
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  5388 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgataaatgctatttggattatgataatgtaatacttacccctagcggttttaaccg 5484  T
Q  443 cctact 448  Q
    ||||||    
T  5485 cctact 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 437
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13081
Alignment:
Q  343 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggtttt 437  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  12990 attattatttatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgataaatgctatttggattatgataatgtaatatttacccctagtggtttt 13081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 275
Target Start/End: Original strand, 5283 - 5331
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  5283 atgtgattggtgattgtgaatgaaaatctgtgaattaataattgttcat 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12728 - 12524
Alignment:
Q  230 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatgagataagta 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||        |||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  12728 tgattggtgattgtgaatgaatatctgtgaattaataattgttcata-------tgattgatgaatgttgatgtgagatatcgggatg-tgatgtaagta 12637  T
Q  330 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctcca 429  Q
    |  || |||||   |||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  12636 tttatgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgttgtt--aattga-ttattcatgttaaatgctatttggattatgataatgtaatacttaccccta 12543  T
Q  430 gtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||||||| || |||||||    
T  12542 gtggttttaacagcctact 12524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7456 - 7408
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcat 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  7456 atgtgattggtgattgtgaatgaatatctgtgaattaataattgttcat 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7556 - 7480
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 171  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  7556 aggtgatgaccttttggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatt 7480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20269 - 20172
Alignment:
Q  32 agatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 130  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20269 agatccattagtaatctagattgtgggctttggccttgcagatacct-ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgc 20172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27098 - 27001
Alignment:
Q  32 agatccattagtgatctagtttgtgggctttagccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 130  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  27098 agatccattagtaatctagattgtgggctttggccttgcagatacct-ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgc 27001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20324 - 20280
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggcttt 62  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20324 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttt 20280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 27153 - 27109
Alignment:
Q  18 cttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggcttt 62  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27153 cttcggccttgcagagatcatttagtgatctagtttgtgggcttt 27109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 447
Target Start/End: Original strand, 45 - 146
Alignment:
Q  344 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  45 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 142  T
Q  444 ctac 447  Q
    ||||    
T  143 ctac 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 1433
Alignment:
Q  344 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1534 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 1437  T
Q  444 ctac 447  Q
    ||||    
T  1436 ctac 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 23269 - 23321
Alignment:
Q  10 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagtttgtgggcttt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23269 tttgtggacttcggtcttgcagagatccattagtgatctagattgtgggcttt 23321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 26509 - 26583
Alignment:
Q  64 gccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26509 gccttgcagagacct-ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaggtga-atggtaccacatgcatatatgtgt 26583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Original strand, 26623 - 26692
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26623 atgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 3433 - 3486
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3433 ttatctggattatggtaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 3486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 5208 - 5287
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5208 ttgaattgttttattcatgcctaactgttatgtggaatatgatgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctac 5287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 4950 - 4994
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4950 aggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 4994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 388 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21335
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21394 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 21335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 29471 - 29392
Alignment:
Q  371 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29471 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctac 29392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1469
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgattg 192  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  1371 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3325 - 3244
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatg---acatgagtcttatt 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3325 aggtgacgacctagaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 2806 - 2880
Alignment:
Q  64 gccttgcagagaccccttggtggtctagagataggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2806 gccttgcagagacct-ttgatggtctagatataggtgacgaccttgaggtga-atggtaccacatgcatatatgtgt 2880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Original strand, 2920 - 2989
Alignment:
Q  227 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgatta 296  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2920 atgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 41281 - 40947
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgtt 194  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  || || ||     ||||||||    
T  41281 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttt-tatatatg-----tgattgtt 41188  T
Q  195 catgaaatatgattgaggattgttcatgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacacgtgattggtgat 294  Q
    |||||||| | ||| | |||| |||||||||  | ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||        |||||| ||      
T  41187 catgaaatgtcattaatgattattcatgataattttgattggtgattgtgaacgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgga 41095  T
Q  295 tattgatgtgagatatcgggattatgagataagtatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactg 394  Q
    ||||||||||| |||| ||| |  |||  |||||||  || ||||| |||||||   |||||| | ||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  41094 tattgatgtgaaatattggggtg-tgatgtaagtattaatgtgtgactattatt---gatcaaatgcatgatcatt-aattgtaatattcatgttaactg 41000  T
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
      || | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40999 caattttgattatgataatgtaatacttatccccagtggttttaaccgcctac 40947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 213
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 5032
Alignment:
Q  377 aattattcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  5102 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgctaacc-ccagtggttttgaccgcctac 5032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5268
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5311 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47 - 5
Alignment:
Q  377 aattattcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaat 418  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaat 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3635 - 3565
Alignment:
Q  377 aattattcatgttaa-ctgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  3635 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgc-taactccagtggttttgaccgcctac 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3844 - 3801
Alignment:
Q  97 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3844 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 3801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Original strand, 25210 - 25274
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt---aataggtgcatatcatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  25210 aggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Original strand, 25415 - 25496
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25415 ttgaattgatttattcatgtctaactgtttaagtggattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctac 25496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4364 - 4295
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||    
T  4364 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaaagctcagccccagtggttttgaccgcctac 4295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33846 - 33765
Alignment:
Q  369 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33846 ttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctac 33765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34039 - 33995
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34039 aggtgacgactttgaggtgattcggtaccacatgtatttatgtgt 33995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 9511 - 9607
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9511 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 9776 - 9836
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9776 ttaattgttatttgaattatgataatgtagtacttacccccagtggttttaaccgcctact 9836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14875 - 14779
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14875 aggtgacgaccttttggagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28131 - 28071
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28131 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 28071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14610 - 14550
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  14610 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctact 14550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28396 - 28300
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28396 aggtgacgaccttttggagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51607 - 51511
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  51607 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51342 - 51283
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51342 ttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacc-ccagtggttttaaccgcctact 51283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 110 - 35
Alignment:
Q  117 ttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  110 ttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9703 - 9652
Alignment:
Q  396 tatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9703 tatgtggattatgttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctac 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 447
Target Start/End: Original strand, 12478 - 12536
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12478 ttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccccactggttttgaccgcctac 12536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 2881 - 2962
Alignment:
Q  362 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2881 atgatatttgaattgtttcattcatgtttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgc 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 11136 - 11217
Alignment:
Q  362 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgc 443  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  11136 atgatatttgaattgtttcattcatgtttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgc 11217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 15799 - 15859
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15799 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 15859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 448
Target Start/End: Original strand, 17074 - 17134
Alignment:
Q  388 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17074 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctact 17134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37864 - 37768
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  37864 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37589 - 37536
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37589 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 37536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 78643 - 78713
Alignment:
Q  379 ttattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  78643 ttattcatgtctaactgtttatatggattatgattgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctac 78713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 78431 - 78475
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  78431 aggtgacaaccttgaggtgattcagtaccacatgcatttatgtgt 78475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2621
Alignment:
Q  96 aggtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2576 aggtgacgacctttgaggtgatttggtaccacacgcatatatgtgt 2621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 25123 - 25176
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25123 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 25176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20948 - 20895
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20948 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 20895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25203 - 25150
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25203 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29651 - 29598
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29651 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 29598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 442
Target Start/End: Original strand, 1926 - 1999
Alignment:
Q  372 aattgaattattcatgt-taactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccg 442  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1926 aattgatttattcatgtctaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccg 1999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 113537 - 113590
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  113537 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctact 113590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Original strand, 17675 - 17771
Alignment:
Q  96 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgt-aataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  17675 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 1435 - 1481
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1435 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 1481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8002
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7956 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 8002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3748 - 3702
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3748 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 3702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 447
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3591
Alignment:
Q  402 gattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3545 gattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctac 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42094 - 42048
Alignment:
Q  402 gattatgatgatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctact 448  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42094 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctact 42048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 22968 - 23021
Alignment:
Q  395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctac 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22968 ttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctac 23021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University