View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9132_low_1 (Length: 1290)

Name: NF9132_low_1
Description: NF9132
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9132_low_1
NF9132_low_1
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (1-839)||(74354-75192)
scaffold0007 (914-1270)||(73998-74354)
scaffold0007 (1149-1239)||(73888-73978)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (1-1266)||(29470735-29472008)
chr6 (159-1121)||(29767402-29768360)
chr6 (1-1270)||(29662801-29664100)
chr6 (166-1106)||(29689430-29690363)
chr6 (153-682)||(28487707-28488230)
chr6 (153-682)||(29800119-29800642)
chr6 (153-683)||(29718600-29719130)
chr6 (860-1162)||(29756577-29756884)
chr6 (860-1242)||(28488438-28488831)
chr6 (860-1242)||(29800850-29801243)
chr6 (860-1244)||(29719292-29719681)
chr6 (277-638)||(29756007-29756367)
chr6 (1014-1270)||(29801151-29801412)
chr6 (1014-1270)||(28488739-28489002)
chr6 (5-511)||(29671368-29671884)
chr6 (277-514)||(29712088-29712319)
chr6 (1031-1270)||(29672338-29672582)
chr6 (1014-1241)||(29719587-29719819)
chr6 (1031-1242)||(29720732-29720948)
chr6 (1031-1244)||(29720873-29721091)
chr6 (1043-1246)||(29671927-29672135)
chr6 (1031-1270)||(29721155-29721399)
chr6 (1031-1183)||(29719886-29720043)
chr6 (1031-1237)||(29720168-29720379)
chr6 (1034-1183)||(29712350-29712504)
chr6 (1018-1248)||(29757158-29757393)
chr6 (1023-1247)||(29757022-29757251)
chr6 (1031-1241)||(29720450-29720665)
chr6 (1166-1259)||(29470601-29470694)
chr6 (1150-1258)||(29664121-29664229)
chr6 (998-1106)||(29690462-29690570)
chr6 (998-1106)||(29768585-29768693)
chr6 (1014-1241)||(29672039-29672271)
chr6 (1122-1266)||(29704978-29705122)
chr6 (998-1106)||(29768378-29768486)
chr6 (1052-1162)||(29690582-29690697)
chr6 (1031-1106)||(29705023-29705098)
chr6 (1149-1219)||(28489022-28489092)
chr6 (1062-1231)||(29691006-29691180)
chr6 (1031-1244)||(29712629-29712851)
chr6 (1149-1219)||(29801432-29801502)
chr6 (998-1111)||(29470613-29470726)
chr6 (1062-1242)||(29768508-29768693)
chr6 (1031-1183)||(29720309-29720466)
chr6 (1031-1183)||(29721014-29721171)
chr6 (1062-1121)||(29768715-29768774)
chr6 (1014-1183)||(29712757-29712931)
chr6 (998-1111)||(29664105-29664218)
chr6 (1014-1095)||(29690685-29690766)
chr6 (1170-1239)||(29691320-29691389)
chr6 (1-62)||(29755728-29755789)
chr6 (1016-1108)||(29672464-29672556)
chr6 (1-65)||(29718439-29718503)
chr6 (1170-1237)||(29672623-29672690)
chr6 (1170-1219)||(28475623-28475672)
chr6 (1194-1239)||(29721464-29721509)
chr6 (99-136)||(29767333-29767370)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (153-1244)||(617671-618761)
chr3 (1031-1258)||(616811-617043)
chr3 (1014-1244)||(617530-617765)
chr3 (1052-1270)||(616658-616881)
chr3 (1049-1244)||(617248-617448)
chr3 (1031-1241)||(617110-617325)
chr3 (1014-1242)||(616968-617201)
chr3 (1031-1175)||(617458-617607)
chr3 (1031-1106)||(616686-616761)
chr3 (1170-1239)||(616548-616617)
[»] scaffold0012 (6 HSPs)
scaffold0012 (316-1270)||(209615-210557)
scaffold0012 (1-319)||(208733-209060)
scaffold0012 (915-1162)||(236499-236751)
scaffold0012 (1014-1244)||(236739-236974)
scaffold0012 (1031-1266)||(236897-237137)
scaffold0012 (1014-1106)||(237021-237113)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (153-683)||(12591757-12592288)
chr8 (814-1101)||(12591378-12591665)
chr8 (1-65)||(12592388-12592452)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (998-1241)||(5920666-5920914)
chr1 (976-1111)||(5919939-5920074)
chr1 (380-679)||(5918746-5919045)
chr1 (1128-1271)||(5921083-5921226)
chr1 (153-255)||(5918503-5918605)
chr1 (1133-1239)||(5920665-5920771)
chr1 (1014-1111)||(5921105-5921202)
chr1 (1148-1244)||(5919411-5919507)
chr1 (1000-1112)||(5920104-5920216)
chr1 (1168-1219)||(5920418-5920469)


Alignment Details
Target: scaffold0007 (Bit Score: 807; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 807; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 75192 - 74354
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtgacatacgtatcttctcatcatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75192 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtcacatacgtatcttctcatcatatg 75093  T
Q  101 tatagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagaggacattgaggatctgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75092 tatagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagaggacattgaggatctgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttct 74993  T
Q  201 aaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74992 aaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgt 74893  T
Q  301 gattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74892 gattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatt 74793  T
Q  401 tagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74792 tagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctca 74693  T
Q  501 caatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattag 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74692 caatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcaatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattag 74593  T
Q  601 caaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgctttgggctcacttttct 700  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  74592 caaacaacatgaaacttattgaaaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgcttcgggctcacttttct 74493  T
Q  701 ttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaacaactctatttggtaaataaacagttccacatttgcatggatatgatgttggaggcaga 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  74492 ttcacccttgatgataaattcagccagcagcgacaatgcaacaactctatttggtaaataaacagttccacatttgcatggatatgatgttggaagcaga 74393  T
Q  801 gtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaaggga 839  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  74392 gtatgattttcaaatggaaacggaaattcatttaaggga 74354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 914 - 1270
Target Start/End: Complemental strand, 74354 - 73998
Alignment:
Q  914 atatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaac 1013  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74354 atatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaacttgagccgagggatattcctatgcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaac 74255  T
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74254 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagcttttcaagcgaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 74155  T
Q  1114 tgtaacaaaacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttcta 1213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74154 tgtaacaaaacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccacgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttcta 74055  T
Q  1214 gagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  74054 gagaagctaacatgagaggtggaatactccttagcttgattcaacctttaacactca 73998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1239
Target Start/End: Complemental strand, 73978 - 73888
Alignment:
Q  1149 aaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaata 1239  Q
    |||| |||| |||||  ||| |||||||||||||  | |||||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  73978 aaactcatctaccataggtgaaaaactctcaagattactacaatatgaaagttcaagttcttctagagaaggtaacatgagatatggaata 73888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1266
Target Start/End: Complemental strand, 29472008 - 29470735
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtgacatacgtatcttctcatcatatg 100  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||    | |||| | |||| | || ||| |||       
T  29472008 agtgctttgtccatattattattcaatttttccatttgcatatgaaaaagatgtagatgatacacttc---tggtgataaacgtttattttcaccatgcc 29471912  T
Q  101 tatagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagaggacattgaggatc------tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaattt 194  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    || |||      |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  29471911 tatagaaaaatgtatcaccattgatgatcactcttacaggacgcctagaatcatcccatgtcgatggagaaacaacacagagagctatgacaggaaactt 29471812  T
Q  195 atttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgct 294  Q
     || || || ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  29471811 gttcctgaaccagaaagaaatagacaatcctgccaagcattgatggtcgaaccactctggaatccttgttcgtggcaaacggaaccaagtgtttcctgcc 29471712  T
Q  295 tcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaa-tatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaa 393  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||   ||||  | ||||||||| |||| ||    
T  29471711 tcatgtaattcctggtagtcataaattattaatgtaagtttaacctatatcaagaagaatatcaaata-cattaaaaattaaatacaaaatatatcataa 29471613  T
Q  394 cctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaat 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  29471612 cctgatttagtaatttgcttttgcacggtgaggtcaatgatttgcagtttaatgcagataatgtttttaagcatggtggaatcccttcaatttcctgaag 29471513  T
Q  494 ttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattctttt 593  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||     
T  29471512 ttcctcacagttatccaggacaagcctctgtaaaaaatgacatttttcgatagattttggaagaattttgaattggttatcacttaggtgtaattctttc 29471413  T
Q  594 acattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgctttgggctca 693  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29471412 acattagtaaacaacatgagacccgttgacaaatattcatctgaaaatttgcagttcctcagacaaatatattctacatgtgaagattgcattgggctca 29471313  T
Q  694 cttttctttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaacaactctatttggtaaataaacagttccacatttgcatggatatgatgttgg 793  Q
    |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||   || || ||||||| | ||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||| |    
T  29471312 ctttttcttcagcctggatggtaaattcagccagttttgacatcacagcagctctattcgataaataaacaactccacagttacattgatataatgtttg 29471213  T
Q  794 aggcagagtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaacttttggtatgtttctcatctctcccaatatttctgga 893  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |  | | |||| ||||| ||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  29471212 aggcggagtaagattttgaaatggaaacggcaattcttgtatgagagtattatccaagtgaatttctgttatattattcatctctcccaatatttttgga 29471113  T
Q  894 aaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattca 993  Q
    || ||||| || || | ||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||  ||||   |||||| || ||||| ||  ||||| ||| ||| |||    
T  29471112 aatctctctaggctcagacaatgtgaaagattgaaccgttccaatgaggtcaacctgagcgatgggatactcgtaagcttgacgcaatgttccatactca 29471013  T
Q  994 agaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgag 1093  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  29471012 agaatttaagtttatccaacaacccatccaccacagttggaaaactctcgagactataacaatgtgaaaggtcaagcttttctaatgaatccaacctgag 29470913  T
Q  1094 agctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaata 1188  Q
    || |||||||||| ||||| ||  ||||     |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |    
T  29470912 aggtggaatactcctgagattgcgacaatatttaacaagtaggattttaagttttccaagaaacccatccaccacaagtggaaaactctcgagactaaaa 29470813  T
Q  1189 caatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaaca 1266  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29470812 caatttgaaagatcgagttcttctaacgaagtcaacttaagagttggaatactccttaacttgacgcaacttctaaca 29470735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 159 - 1121
Target Start/End: Original strand, 29767402 - 29768360
Alignment:
Q  159 tggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtc 258  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    | ||| |||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29767402 tggagaaacaacacagagagctatggcaggaaacttgccacaaaaccagaaagaaattgactttcctgcctcgcattggtggtcgaaccactctggaatc 29767501  T
Q  259 tttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgt-aagtttaaatatatcaagaagaatatca 357  Q
    ||| | |||||||  || |||| ||| ||||| || |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  29767502 tttgcacgtggcaaacgaaaccgagtatttccagcctcatgtaatttctattagtcataaataattaatgttaagtttaactatatcaagaaaaatataa 29767601  T
Q  358 attatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagt 457  Q
    | || |||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||       
T  29767602 aata-cattacaaataaaa-acaaaataaatcataacctgatttagtaatttgcttttgcacgacgaagtcaata---tgcagtttagtgcagataactc 29767696  T
Q  458 ttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaaga 557  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |    
T  29767697 tcttaagcatggaggaatccctttcatttccataagttccttacaatcatccaagacgattttccataaaaattgacatttttcaatagatttaggaata 29767796  T
Q  558 actgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagac 657  Q
    ||||||||||||   | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29767797 actgtgaattgacagttagttatgtgtagttctttcacattagcaaacaacatgagacttattgacagatattcatctgaaagtttgcagttcctgacac 29767896  T
Q  658 aaatatattctacttgtgaagattgctttgggctcacttttctttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaacaactctatttggtaa 757  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| || || ||| ||||  |||| |||||||| ||| |||||||     |||||   ||||| |||||||||||||    
T  29767897 aaatatactttacatgtgaagattgcatttggttcattttttcttcagccttgatggtaagttcagccgattctgacatcacaacatctctatttggtaa 29767996  T
Q  758 ataaacagttccacatttgcatggatatgatgttggaggcagagtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaact 857  Q
         ||  |||||| |  |||| |    || || ||||| ||||| || ||| |||| |||| || ||||| || | |||||||| ||| ||||| | |    
T  29767997 gcggccatatccacagtcacatgaaacaaatctttgaggctgagtaagagtttgaaattgaaatggaaattcttttatgggagtttcatccaagtggagt 29768096  T
Q  858 tttggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgag 957  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| |    
T  29768097 cttggtatatttctcatctctcccaatatttctggaaaactctcaagcctataacaacatgaaagattgaaatgttccaacgaagtcaggctgagccgtg 29768196  T
Q  958 ggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaa 1057  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||  ||||||||      
T  29768197 ggatattcctaagcatgatgcagtttacaatattcaagaatttcaatttatccaacaacccatccaccacacttggaaagctctcgagcttataacaatc 29768296  T
Q  1058 tgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa 1121  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  29768297 tgaaaggtcaagtttttcaagtgaatccaacttgagagctggaatattcctgagattgtgacaa 29768360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 1270
Target Start/End: Original strand, 29662801 - 29664100
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtgacatacgtatcttctcatcatatg 100  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||| |||   ||||| || ||     
T  29662801 agtgctttgtccatatcatcattgaatttttcagtttgcatatgaaaaagatgtaaatgatacgtttcccgcagtgacataggtagaatctcaccacatt 29662900  T
Q  101 tatagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagaggacattgaggatc---------tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaa 191  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||    |||  |||         || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29662901 tatagacaaatgtatatccattgatgaccactcttgtaggttgatgattatcatctagccatgactatggagaaacaacacaaagaactatggcaggaaa 29663000  T
Q  192 tttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcct 291  Q
     || || |  || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  29663001 cttgttacggaaccagaatgaaattgacaatcctgccaagccttggtggtcgaatcactctggaatctttgctcatggcaaacggaaccgagtgtttcct 29663100  T
Q  292 gcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacatta----------caa 381  Q
    || |||||  |||||| ||| |||  || |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||          |||    
T  29663101 gcctcatgcaattcctattactca--aacaattaacgtttgtttaaccatatcaagaagaataacgattatcatatcaaatacattaacaataaaaacaa 29663198  T
Q  382 aataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttc 481  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||     
T  29663199 aataaatcattacctgacttagtaatttgcttttgcatgacgaagacagcgatttgcagttaaaagcagataatgattttaagcatggtggaatcccttt 29663298  T
Q  482 aatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttagg 581  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  29663299 aatttcctgaagttccttacaattatccaagacaggcctccataaaaaatgacatttttcgaaagatttaggaagaaacgtgaattgactttcatttagg 29663398  T
Q  582 tgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagatt 681  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| || ||| || || || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29663399 tgtaattctttcacattagcaaacaacatgagacctattgacaagtactcatctggaacttttcaatttctaagacaaatatattctacgtgtaaagatt 29663498  T
Q  682 gctttgggctcacttttctttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaacaactctatttggtaaataaacagttccacatttgcatgg 781  Q
    |  | ||| ||||||||  |||| ||| |||| || ||||  ||||   |||||  |||  |   ||| |||||||  |||||  |||||| || |||||    
T  29663499 ggatcgggatcactttttgttcagcctggatggtacattccaccagttttgacatcgcataattactagttggtaaggaaacaaatccacagttacatgg 29663598  T
Q  782 atatgatgttggaggcagagtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaacttttggtatgtttctcatctctccc 881  Q
    |||| || ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |  || |||| ||  |||| ||  |||||||||||||||    
T  29663599 atat-atttt--aggcagagtaagattttgaaatggaaacggcaattcttttatgggagtatattccaagttaaggtttgttacatttctcatctctccc 29663695  T
Q  882 aatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaac---tcgagccgagggatattcctaagcatggtgc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   || |||||||||||||     |||| | || ||| |||||| ||||   |    
T  29663696 aatatttctggaaaactctccagacttagacaatatgaaagatcaaacaatttcaacgaagtcaaccagctgagcggtggaatactcctaatcatgacac 29663795  T
Q  979 aatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaa 1078  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  29663796 aatgtttaatactcaagaattcaagtttatccaacaacccatccacaacatctggaaagccatcaagattataacaatatgaaaggtcaagttcttctag 29663895  T
Q  1079 agaatccaacttgagagctggaatactcttgaga--------atgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatga 1165  Q
     |||||||||||||||| |||||||||  |||||         ||| ||||     |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||  |    
T  29663896 cgaatccaacttgagaggtggaatacttatgagattgtgagtttgtgacaactttcaacaagcagggttttgagatttccaagaaacccatccaacacaa 29663995  T
Q  1166 gtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaac 1265  Q
    |||||||| |||| |||| || ||| |  |||||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| || | ||| | ||||||    
T  29663996 gtggaaaattctcgagactaaaacattgcgaaagatcgaatttttctaaagaagtcaacttaagaggtggaatactccttagatttaagcatcttctaac 29664095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 166 - 1106
Target Start/End: Original strand, 29689430 - 29690363
Alignment:
Q  166 acaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactc 265  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| || || | ||| |||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  29689430 acaacaccgagagctatggaaggaaacttgttacaaaaccagaaagaaactgacattcctgcctcgcattggtggtcaaaccactctggaatctttgccc 29689529  T
Q  266 gtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcat 365  Q
    ||||||  |  |||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||  || ||   |    
T  29689530 gtggcaaacaaaaccgagtgtttccagcctcatgtaatttctgttattcataaatta--aatgtaagtttaacgatatcaagaagaatagaaaatacagt 29689627  T
Q  366 atcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagc 465  Q
    | |||||  |  |  |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||   | ||||||    
T  29689628 a-caaatttaaaaataaataaat-ataacctgatttagtaaattgcttttgcatgacgaagtcaat---ttgcagtttactgcagataactctcttaagc 29689722  T
Q  466 atggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaa 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  29689723 atggaggaatccctttaatttcctcaagttccttacaatcatccaagaccagtttccatagaaaattacatttttcaatagatttaggaataactgtgaa 29689822  T
Q  566 ttgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatat 665  Q
    || | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||     
T  29689823 tttactgttagttaggtgtaattctttcacattagcaaacaacatgagagtttttgacagatattcatctgaaagtttgcatttcttcacacaaatatac 29689922  T
Q  666 tctacttgtgaagattgctttgggctcacttttctttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaacaa-ctctatttggtaaataaaca 764  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||| ||||   ||  |||  |||   | ||||||||    ||||| |  || || |||||||||| ||  ||  |    
T  29689923 tttacatgtgaagattgtattgggctcattttttcctcggcctgaatggagagttcagccatttttgaca-tcaaagaagctctatttggaaagcaagaa 29690021  T
Q  765 gttccacatttgcatggatatgatgttggaggcagagtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaacttttggta 864  Q
      |||||| || ||||||||  ||||| | ||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||| ||| ||||| | | ||||||    
T  29690022 tgtccacagttacatggataatatgtttggggctgtgtaagattttgaaatggaaacggtaattcttttatgggagtttcatccaagtggagtcttggta 29690121  T
Q  865 tgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatatt 964  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  29690122 tatttctcatctctcccaatatttctggaaaactctcaagcctataacaacatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaaactgagccgtgggatatt 29690221  T
Q  965 cctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaagg 1064  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  29690222 cctaagcatgatgcaattttcaatattcaagaatttcaatttatccaacaacccatccacaacacttggaaagctctcgagcttataacaatctgaaagg 29690321  T
Q  1065 tcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactc 1106  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29690322 ttaagtgtttctagtgaatccaacttgagagatggaatactc 29690363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 682
Target Start/End: Original strand, 28487707 - 28488230
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  28487707 tgtcaatggagaaactacacagagagctatggcaggaaacttgttaagaaaccagaaagaaattgacaatcctgcctcgctttggtggtcgaaccactct 28487806  T
Q  253 ggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaa 352  Q
    ||| |||||    ||||||  |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    |||||| |||||    
T  28487807 ggaatctttgtctgtggcaaacggaaccaagtgtttccatcctcatgtaattcctgttagtcataaataattaatttaagtcta----tatcaataagaa 28487902  T
Q  353 tatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagat 452  Q
    |||||| || |||  |||||| ||  |||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  28487903 tatcaaata-cattacaaata-atagcaaaataaatcataacctgctttactaatatgcttttgcatgaagaagtcaacgatatgcaatttagtgcagat 28488000  T
Q  453 aaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttag 552  Q
    ||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||  ||||||||||| || ||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  28488001 aacatttttaagcttggaggattccctttaatttcctgaagatccttgcaatcatccaaaacgagtttccacaaaaaatgacatttttcaatagatttag 28488100  T
Q  553 gaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcct 652  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28488101 gaagaactgtgaattgaatgttagttaggtgtaattctttcacattagcaaacaacatgagatttagtgacagatattcatctgaaagtttgcagtccct 28488200  T
Q  653 gagacaaatatattctacttgtgaagattg 682  Q
    ||  |||||||| | ||| |||| ||||||    
T  28488201 gatgcaaatatactttacatgtgcagattg 28488230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 682
Target Start/End: Original strand, 29800119 - 29800642
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  29800119 tgtcaatggagaaactacacagagagctatggcaggaaacttgttaagaaaccagaaagaaattgacaatcctgcctcgctttggtggtcgaaccactct 29800218  T
Q  253 ggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaa 352  Q
    ||| |||||    ||||||  |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    |||||| |||||    
T  29800219 ggaatctttgtctgtggcaaacggaaccaagtgtttccatcctcatgtaattcctgttagtcataaataattaatttaagtcta----tatcaataagaa 29800314  T
Q  353 tatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagat 452  Q
    |||||| || |||  |||||| ||  |||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  29800315 tatcaaata-cattacaaata-atagcaaaataaatcataacctgctttactaatatgcttttgcatgaagaagtcaacgatatgcaatttagtgcagat 29800412  T
Q  453 aaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttag 552  Q
    ||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||  ||||||||||| || ||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  29800413 aacatttttaagcttggaggattccctttaatttcctgaagatccttgcaatcatccaaaacgagtttccacaaaaaatgacatttttcaatagatttag 29800512  T
Q  553 gaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcct 652  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29800513 gaagaactgtgaattgaatgttagttaggtgtaattctttcacattagcaaacaacatgagatttagtgacagatattcatctgaaagtttgcagtccct 29800612  T
Q  653 gagacaaatatattctacttgtgaagattg 682  Q
    ||  |||||||| | ||| |||| ||||||    
T  29800613 gatgcaaatatactttacatgtgcagattg 29800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 683
Target Start/End: Original strand, 29718600 - 29719130
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |    
T  29718600 tgtcaatggagaaacaacacaaagagctatggcaggaaatttgttacgaaaccagaaagaaattgacaatcctgcctcgcatttgtggtcgaaccacttt 29718699  T
Q  253 ggagtcttt---actcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaa 349  Q
    ||| |||||   || |||||||  || || || |||||||  || |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29718700 ggaatctttggaacccgtggcaaacgaaagcaggtgtttctagcctcatgtaattcctgttagtaaaaaataattaatgtaagtttaactatatcaaaaa 29718799  T
Q  350 gaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgca 449  Q
    |||||| || || |||  |||| | |  | ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  29718800 gaatataaaata-cattacaaacaaa--aaaaaaagaatcataacctgatttagtaatttgcttttgcacgacgaagtcaacgatatgcagtgtactgca 29718896  T
Q  450 gataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatt 549  Q
    |||||   | |||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| || |||||||    
T  29718897 gataacactcttaagcgtggaggaatccctttaatttcgtgaagttccttacaatcatccaagacaagtttccataaaaattgacatttttcaatagatt 29718996  T
Q  550 taggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagttt-gcagt 648  Q
    |||||| || ||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | || |||||||  |||||||||||||||| ||| |    
T  29718997 taggaataattgtgagttgattgtttgttaggtgtaattctttcacattggcaaacaacataagagtttttgacaataattcatctgaaagtttagca-t 29719095  T
Q  649 tcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgc 683  Q
    |||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  29719096 tcctgacacaaatatactttacatttgaagattgc 29719130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 860 - 1162
Target Start/End: Original strand, 29756577 - 29756884
Alignment:
Q  860 tggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgaggg 959  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||| |||    
T  29756577 tggtatatttctcatttcccccaatatttctggaaaactctcgagactataacaacatgaaagattgaaatattccaatgaagtcaacctgagccgtggg 29756676  T
Q  960 atattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatg 1059  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  29756677 atattcctaagcatgatgcaacattcaatattcaaaaatttaagtttatccaacaacccatccaccacacatggaaaactctcaagactacagcaacatg 29756776  T
Q  1060 aaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaaca-----aaacaagcaaggttttaagttttccaagaaaccc 1154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29756777 aaaggtcaagtttctctaaagaatccagcttgagaggtgggatactcttgagattgtaacactttctaacaagcagggttttaagttttccaagaaaccc 29756876  T
Q  1155 atccacca 1162  Q
     |||||||    
T  29756877 gtccacca 29756884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 860 - 1242
Target Start/End: Original strand, 28488438 - 28488831
Alignment:
Q  860 tggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccaga------cttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagc 953  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      ||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  28488438 tggtatatttctcatctctcccaatatatctggaaaactctcaagatcaagactataacaacatgaaagattgaaatgttccaaagaagtcaacttgagc 28488537  T
Q  954 cgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataac 1053  Q
    |  ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28488538 catgggatattcctaagcatgacacaacattcaatattcaagaatttcagtttatccagcaacccatcctccacagatagaaaactctcgagactacaac 28488637  T
Q  1054 aaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaag 1148  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||     |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28488638 aatatgaaaggtcaagtttttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcctgagtttgtgacaacttccaacaagaagggttttaagttttccaag 28488737  T
Q  1149 aaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactc 1242  Q
    |||||| || ||||  |||||||||||||| |||  |  |||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28488738 aaacccgtctaccacaagtggaaaactctcgagattataacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtgaatccaacatgagaggtggaatactc 28488831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 860 - 1242
Target Start/End: Original strand, 29800850 - 29801243
Alignment:
Q  860 tggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccaga------cttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagc 953  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      ||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  29800850 tggtatatttctcatctctcccaatatatctggaaaactctcaagatcaagactataacaacatgaaagattgaaatgttccaaagaagtcaacttgagc 29800949  T
Q  954 cgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataac 1053  Q
    |  ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29800950 catgggatattcctaagcatgacacaacattcaatattcaagaatttcagtttatccagcaacccatcctccacagatagaaaactctcgagactacaac 29801049  T
Q  1054 aaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaag 1148  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||     |||||| | ||||||||||||||||||    
T  29801050 aatatgaaaggtcaagtttttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcctgagtttgtgacaacttccaacaagaagggttttaagttttccaag 29801149  T
Q  1149 aaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactc 1242  Q
    |||||| || ||||  |||||||||||||| |||  |  |||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29801150 aaacccgtctaccacaagtggaaaactctcgagattataacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtgaatccaacatgagaggtggaatactc 29801243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 860 - 1244
Target Start/End: Original strand, 29719292 - 29719681
Alignment:
Q  860 tggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgaggg 959  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||| |||  |||| | |||    
T  29719292 tggtatatttctcatctctcccaatatttctggaaaactctcaagactataacaacatgaaagattgaaatatttcaaagaagttaacctgagctgtggg 29719391  T
Q  960 atattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatg 1059  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||| || |||| |||| ||  || |||||  ||    
T  29719392 atactcctaagcatgatgcagaattcaatattcacgaatttaagtttatccaacaactcatcccgcacacttgaaaaactctcgagcataaaacaatttg 29719491  T
Q  1060 aaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaaccc 1154  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29719492 aaaggtcaagttcttgtagcaaatccaacttaagaggtggaatacttctgagattgtgacaatttttaacaagcatggttttaagttttccaagaaaccc 29719591  T
Q  1155 atccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactcct 1244  Q
     || ||||  ||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  29719592 gtcaaccacaagtggaaaattctcaagactaaaacaacatgaaagatcaagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcct 29719681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 277 - 638
Target Start/End: Original strand, 29756007 - 29756367
Alignment:
Q  277 aaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacat 376  Q
    ||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||  |||||| |     
T  29756007 aaccatgtttttccagcctcatgtaattcctgttagtcataaacaattaatataagtttaactatatcaagaagaatataaaata-cattacaaataaaa 29756105  T
Q  377 tacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatc 476  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  29756106 aagaaaataaatcataacctgatttagcaatttgctcttgcacgacgaagtcaacgacttgcagtttagtgcagataacattcttaagcatggaggaatc 29756205  T
Q  477 ccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcag 576  Q
    |||| ||||||   || | ||  ||||||||||||||  ||  |||| ||||| | ||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||    
T  29756206 cctttaatttctttaagtgccgtacaatcatccaagatgagtttccacaaaaattgacaattttcaatagatttaggaataactgtgaaatgattactag 29756305  T
Q  577 ttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaa 638  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||    
T  29756306 ttaagtgtaattctttcacattagcaaacaacataagactttttgacagatattcctctgaa 29756367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1270
Target Start/End: Original strand, 29801151 - 29801412
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  29801151 aacccgtctaccacaagtggaaaactctcgagattataacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtgaatccaacatgagaggtggaatactcttgagat 29801250  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttc 1208  Q
    | | ||||     || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  29801251 tatgacaatttttaagaagcaaggtttttagttttccgagaaacccatcctccactattggaaaactctcaagactaatacaatctgaaagatcaagttc 29801350  T
Q  1209 ttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29801351 ttctagagaagctaacatgagagttggaatactccttatattgatgcaacctctaacactca 29801412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1270
Target Start/End: Original strand, 28488739 - 28489002
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  28488739 aacccgtctaccacaagtggaaaactctcgagattataacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtgaatccaacatgagaggtggaatactcttgagat 28488838  T
Q  1114 tgtaacaa------aacaagcaaggtttta-agttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagt 1206  Q
    | | ||||      || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  28488839 tatgacaattttttaagaagcaaggttttttagttttccgagaaacccatcctccactattggaaaactctcaagactaatacaatctgaaagatcaagt 28488938  T
Q  1207 tcttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  28488939 tcttctagagaagctaacatgagagttggaatactccttatattgatgcaacctctaacactca 28489002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 29671368 - 29671884
Alignment:
Q  5 ctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtga---catacgtatcttctcatcatatgt 101  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||   | |||  ||||||  | ||| |||    
T  29671368 ctttttccatattatcattaaagttttccattttcatatgaaaaagatgcaaatgatacatattcagcggtgatttcgtacccatcttcaaaccatctgt 29671467  T
Q  102 atagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagag---gacattgaggatc------tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaat 192  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||| | ||| | |      ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  29671468 gtagataaatgtatttccattgatgatcactcttatagaatgacgtcgagaaccatcccatgttaatggagaaacaacacagagagctatggcaggaaac 29671567  T
Q  193 ttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtcttt---actcgtggcatccggaaccaagtgtttc 289  Q
    || || | ||| ||||||||||||||||||||  ||  | ||| |||||| |||||||||||| | |||   || |||||||  |  |||||||||||||    
T  29671568 ttgttacgaaaccagaaagaaattgacaatccggcctcgtatttgtggtcaaaccactctggaatttttggcacccgtggcaaacaaaaccaagtgtttc 29671667  T
Q  290 ctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatc 389  Q
    | || | |||| |||||||||| | |||||||||| |    ||||||| |||||||| |||||||| || ||   || |||||| |  ||||||||||||    
T  29671668 cagccttatgtaattcctgttagttataaataattca----agtttaactatatcaaaaagaatataaaataaatta-caaataaaa-acaaaataaatc 29671761  T
Q  390 acaa-cctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcc 488  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29671762 ataaacctgatttagtaatttgcttgtgcacgaagaagtcaacgacgtgcagtttacagcagataacattcttaagcatggaggaatcactttaatttcc 29671861  T
Q  489 cgaatttcctcacaatcatccaa 511  Q
     ||| ||||| ||||||||||||    
T  29671862 tgaagttccttacaatcatccaa 29671884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 514
Target Start/End: Original strand, 29712088 - 29712319
Alignment:
Q  277 aaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacat 376  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| || || |||  |||||| |     
T  29712088 aaccaagtgtttcctgccttatgtaattcctgtcaataataaataattaatttaagtttaactatatcaaaaggaatataaaata-cattacaaata-aa 29712185  T
Q  377 tacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatc 476  Q
     | |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||    
T  29712186 aataaaaaaaatcataacctgatttagtaatctgcttttgcacgacgaagtcaacgacatgcagtttactgcagataa----cataagcatggaggaatc 29712281  T
Q  477 ccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagac 514  Q
     ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  29712282 acttgaatttcctgaagttccttacaatcatccaagac 29712319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1270
Target Start/End: Original strand, 29672338 - 29672582
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||     ||||    
T  29672338 tggaaaactctcaagactaccacaatatgaaatgtcaagtttttctaacgaatccaacttgagtggtggaatactcctgagattgtgacaactttcaaca 29672437  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
      ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||  |||||| || | |  |||||| ||| |||||     
T  29672438 ttcagagttttaatttttccaagaatcccatccaccacaagtggaaaactctcgagacgaaaacaacatgaaaggtccattgtttctagtgaatccaact 29672537  T
Q  1226 tgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  29672538 taagaggtggaatactctttagcttgaagcatcctctaacactca 29672582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1241
Target Start/End: Original strand, 29719587 - 29719819
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29719587 aacccgtcaaccacaagtggaaaattctcaagactaaaacaacatgaaagatcaagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcctgagac 29719686  T
Q  1114 tgtaaca-----aaacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttc 1208  Q
    || ||||      |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| || |||      
T  29719687 tgaaacagtttgtaacaagcatggttttaagttttccaagatactcgtccaccacaagtggaaaactctcaagactatgacaatctgaaagttctagtgt 29719786  T
Q  1209 ttctagagaagccaacatgagagttggaatact 1241  Q
    ||| || ||| ||||| | |||| |||||||||    
T  29719787 ttccagtgaatccaacttaagaggtggaatact 29719819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1242
Target Start/End: Original strand, 29720732 - 29720948
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||     ||||    
T  29720732 tggaaaactctcaagagtatcacaacatgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcttgagattgtgacaatttttaaca 29720831  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||     
T  29720832 agcatggttttaagttttccaagatactcgtccgccacaagtggaaaactctcaagactatgacaatctgaaagttctagtgtttctagtgaatccaact 29720931  T
Q  1226 tgagagttggaatactc 1242  Q
    |||||| ||||||||||    
T  29720932 tgagaggtggaatactc 29720948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1244
Target Start/End: Original strand, 29720873 - 29721091
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||     ||||    
T  29720873 tggaaaactctcaagactatgacaatctgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcttgagattgtgacaatttttaaca 29720972  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||     
T  29720973 agcatggttttaagttttccaagatactcgtccgccacaagtggaaaactctcaagactatgacaatttgaaagttctagtgtttctagtgaatccaact 29721072  T
Q  1226 tgagagttggaatactcct 1244  Q
    ||||||  |||| ||||||    
T  29721073 tgagaggcggaaaactcct 29721091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1043 - 1246
Target Start/End: Original strand, 29671927 - 29672135
Alignment:
Q  1043 aagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggtttta 1137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||      |||||| | |||||||    
T  29671927 aagactataacaacatgaaaggtcaagtgtttctagtgcatcacacttcagaggtggaatactcttaagattgtgacagtttgtaacaagtagggtttta 29672026  T
Q  1138 agttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaa 1237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || |||  ||||||  || ||||| |||||| |||||    
T  29672027 agttttccaagaaacccgtccaccacaagtggaagactctcaagactaacacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtaaatccaacttgagagatggaa 29672126  T
Q  1238 tactcctta 1246  Q
    |||||||||    
T  29672127 tactcctta 29672135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1270
Target Start/End: Original strand, 29721155 - 29721399
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||  |||      ||||    
T  29721155 tggaaaactctcaagactatgacaaaatgaaagttttagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaaaacttctgagactgcgacagcttgtaaca 29721254  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    | || |||||||||||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| |  |||  |||||| ||| |||||     
T  29721255 atcatggttttaagttttcgaagatactcttccaccacaagtggaaaactctcaagactatgacaaaatgaaagttttagtgtttctagtgaatccaact 29721354  T
Q  1226 tgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29721355 tgagaggtggaatactccttagcttgatgcaatgtctaacactca 29721399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29719886 - 29720043
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||     ||||    
T  29719886 tggaaaactctcaagagtatcacaacatgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcttgagactgtgacaatttttaaca 29719985  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagac 1183  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29719986 agcatggttttaagttttccaagatactcgtccaccacaagtggaaaactctcaagac 29720043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1237
Target Start/End: Original strand, 29720168 - 29720379
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||     ||||    
T  29720168 tggaaaactctcaagagtatcacaacctgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatacttttgagattgtgacaatttttaaca 29720267  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||     
T  29720268 agcatggttttaagttttccaagatactcgtccaccacaagtggaaaactctcaagactatgacaatctgaaagttctagtgtttctagtgaatccaact 29720367  T
Q  1226 tgagagttggaa 1237  Q
    |||||| |||||    
T  29720368 tgagaggtggaa 29720379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1034 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29712350 - 29712504
Alignment:
Q  1034 aaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagc 1128  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||     |||||||    
T  29712350 aaaactcttaagattataacaacatgaaaggttaagtgtttctagcaaatccaacttgagaggtggaatacttctgagattgtgacaaccttcaacaagc 29712449  T
Q  1129 aaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagac 1183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  29712450 aaggttttaagttttccaagaaacccgtccaccacaattggaaaactctcaagac 29712504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1248
Target Start/End: Original strand, 29757158 - 29757393
Alignment:
Q  1018 catctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgta 1117  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  || |    
T  29757158 catccaccacaagtgggaaattctcaagactataacattgcgaaaggtcaagtgtttctagagaattcaacttgagaggtggaatactcgttagtttgca 29757257  T
Q  1118 acaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttct 1212  Q
     |||     ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| |  ||| |  ||||| || |||  ||||    
T  29757258 gcaacctttaacattcaaggttttaagttttccaagaaacgcatctaccacaagtggaaaattctcaagactataacactgcgaaaggtcaagtgtttct 29757357  T
Q  1213 agagaagccaacatgagagttggaatactccttagc 1248  Q
    ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29757358 agagaattcaacttgagaggtggaatactccttagc 29757393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1023 - 1247
Target Start/End: Original strand, 29757022 - 29757251
Alignment:
Q  1023 accacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa- 1121  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | |  ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||     
T  29757022 accacagatggaaaattctcaagattataacaatgtgaaaggttaagatatattagcgaatccaacttgagaggttgaatactcttgagattgtgacaac 29757121  T
Q  1122 ----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagaga 1217  Q
        ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||| |  ||| |  ||||| || |||  |||||||||    
T  29757122 tttcaacattcagggttttaagttttccaagaaacgcatccaccacaagtgggaaattctcaagactataacattgcgaaaggtcaagtgtttctagaga 29757221  T
Q  1218 agccaacatgagagttggaatactccttag 1247  Q
    |  |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  29757222 attcaacttgagaggtggaatactcgttag 29757251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1241
Target Start/End: Original strand, 29720450 - 29720665
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||  |||      ||||    
T  29720450 tggaaaactctcaagactatgacaaaatgaaagttttagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtgtaatactcatgagactgcgacagtttgtaaca 29720549  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |  |||  ||| || ||| |||||     
T  29720550 agcatggttttaagttttccaagatactcgtccaccacaagtggaaaactctcaagacaatgacaatctgaaagttttagtgtttccagggaatccaact 29720649  T
Q  1226 tgagagttggaatact 1241  Q
    |||||| |||||||||    
T  29720650 tgagaggtggaatact 29720665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1166 - 1259
Target Start/End: Complemental strand, 29470694 - 29470601
Alignment:
Q  1166 gtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacg 1259  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29470694 gtggaaaactctcaagacaagaacactgtgaaagatcgagttcttccagagaagccaacttgagaggcggaatactcctgagcttgatgcaacg 29470601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1150 - 1258
Target Start/End: Original strand, 29664121 - 29664229
Alignment:
Q  1150 aacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagct 1249  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  29664121 aacccatccaccactggtggaaaactctcaagacatgaacactctgaaagatcaagttcttctagagaagccaagttgagaggtggaatactcctgagct 29664220  T
Q  1250 tgatgcaac 1258  Q
    |||||||||    
T  29664221 tgatgcaac 29664229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 998 - 1106
Target Start/End: Original strand, 29690462 - 29690570
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29690462 tttaagtttatccaacaacccatccaccacgcctggaaagctctcaagcttataacaatttgaaatgacaagtttttctagtgaatccaacttgagaggt 29690561  T
Q  1098 ggaatactc 1106  Q
    | |||||||    
T  29690562 gaaatactc 29690570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 998 - 1106
Target Start/End: Original strand, 29768585 - 29768693
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29768585 tttaagtttatccaacaacccatccaccacgcttggaaagctctcgagcttataacaatttgaaaggacaagtttttctagtgaatccaacttgagaggt 29768684  T
Q  1098 ggaatactc 1106  Q
    | |||||||    
T  29768685 gaaatactc 29768693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1241
Target Start/End: Original strand, 29672039 - 29672271
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    ||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||| | | |     
T  29672039 aacccgtccaccacaagtggaagactctcaagactaacacaatttgaaaggtcaagtgtttctagtaaatccaacttgagagatggaatactccttaaat 29672138  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttc 1208  Q
    ||  ||||     | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||  || |||||  |||||||| || ||    
T  29672139 tgcgacaacttttagcactcagggttttaagttttccaagaaacccatccactacaagtggaaaattctcgagattaagacaatacgaaagatctagctc 29672238  T
Q  1209 ttctagagaagccaacatgagagttggaatact 1241  Q
    ||||||  ||   ||||||||||||||||||||    
T  29672239 ttctagcaaacttaacatgagagttggaatact 29672271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1122 - 1266
Target Start/End: Original strand, 29704978 - 29705122
Alignment:
Q  1122 aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagcc 1221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| || |||  |||||| ||| ||    
T  29704978 aacaggcaaggttttaagttttccaaaaaacctgtcaaccacaagtggaaaactctcaagactataacaacatgaaagttcaagtgtttctagtgaatcc 29705077  T
Q  1222 aacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaaca 1266  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  29705078 aacttgagagggggaatactccttagattggtacaacctctaaca 29705122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 998 - 1106
Target Start/End: Original strand, 29768378 - 29768486
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29768378 tttaagtttattcaacaacccatccaccacgcttggaaagctctcgagcttataacaatttgaaaggacaagtttttctagtgaatccaacttgagaggt 29768477  T
Q  1098 ggaatactc 1106  Q
    | |||||||    
T  29768478 gaaatactc 29768486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1052 - 1162
Target Start/End: Original strand, 29690582 - 29690697
Alignment:
Q  1052 acaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttcca 1146  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||      ||||  | ||||||||||||||||    
T  29690582 acaatatgataggtaaagtttttcaagtgaatccaacttgagagctggaatactcctgagattgtgacaacttttcacaaatagggttttaagttttcca 29690681  T
Q  1147 agaaacccatccacca 1162  Q
    ||||||||||||||||    
T  29690682 agaaacccatccacca 29690697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1106
Target Start/End: Original strand, 29705023 - 29705098
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactc 1106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  29705023 tggaaaactctcaagactataacaacatgaaagttcaagtgtttctagtgaatccaacttgagagggggaatactc 29705098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1219
Target Start/End: Original strand, 28489022 - 28489092
Alignment:
Q  1149 aaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaag 1219  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28489022 aaacccatctaccaaaggtggaaaactctcaagaccagtacaatctgaaagatcaagttcttctagagaag 28489092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1062 - 1231
Target Start/End: Original strand, 29691006 - 29691180
Alignment:
Q  1062 aggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccat 1156  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29691006 aggtcaagtttttcaagtgaatccaacttgagagttggaatactcctaagattgtgacaatttcgaacaaacagggttttaagttttccaagaaatccat 29691105  T
Q  1157 ccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagag 1231  Q
    |||||| |  |||||| ||||| ||   |  ||||||||||||  | |||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  29691106 ccaccacgcttggaaagctctcgagcttataacaatttgaaaggacaagtttttctagtgaatccaacttgagag 29691180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1244
Target Start/End: Original strand, 29712629 - 29712851
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa--------- 1121  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | || |   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |   ||||             
T  29712629 tggaaaattctcaagactatgacaatatgaaaggtcaaatgtctccagtaaatccaacttgagaggtggaatactcctgagattccgacaactatttatt 29712728  T
Q  1122 aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagcc 1221  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||||  || ||   |||||| ||| ||    
T  29712729 aacattcagggttttaagttttccaaaaaacccgtccaccacaattggaaaactctcaagaccgtgacaatgtgaaaagtcaagagtttctagtgaatcc 29712828  T
Q  1222 aacatgagagttggaatactcct 1244  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
T  29712829 aacttgagaggtggaatactcct 29712851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1149 - 1219
Target Start/End: Original strand, 29801432 - 29801502
Alignment:
Q  1149 aaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaag 1219  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29801432 aaacccatctaccaaaggtggaaaactctcaagaccagtacaatctgaaagatcaagttcttctagagaag 29801502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 998 - 1111
Target Start/End: Complemental strand, 29470726 - 29470613
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||   |||||| || |||| ||| | |||| ||||||||||||      
T  29470726 tttaagtttatccaccaacccatctaccacaggtggaaaactctcaagacaagaacactgtgaaagatcgagttcttccagagaagccaacttgagaggc 29470627  T
Q  1098 ggaatactcttgag 1111  Q
    ||||||||| ||||    
T  29470626 ggaatactcctgag 29470613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1062 - 1242
Target Start/End: Original strand, 29768508 - 29768693
Alignment:
Q  1062 aggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttt-tccaagaaaccca 1155  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||     ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||    
T  29768508 aggtcaagtttttcaagtgaatccaacttgagagctggaatactcctgagattgtgacaatttttaacaaacagggttttaagtttatccaa-caaccca 29768606  T
Q  1156 tccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactc 1242  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| ||   |  ||||||||||||  | |||| |||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  29768607 tccaccacgcttggaaagctctcgagcttataacaatttgaaaggacaagtttttctagtgaatccaacttgagaggtgaaatactc 29768693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29720309 - 29720466
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||  |||      ||||    
T  29720309 tggaaaactctcaagactatgacaatctgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggtggaaaacttctgagactgcgacagcttgtaaca 29720408  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagac 1183  Q
    | || |||||||||||||| |||| || | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29720409 atcatggttttaagttttcgaagatactcttccaccacaagtggaaaactctcaagac 29720466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29721014 - 29721171
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaaca-----aaaca 1125  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||  |||      ||||    
T  29721014 tggaaaactctcaagactatgacaatttgaaagttctagtgtttctagtgaatccaacttgagaggcggaaaactcctgagactgcgacagcttgtaaca 29721113  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagac 1183  Q
    | || |||||||||||||| |||| || | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29721114 atcatggttttaagttttcgaagatactcttccaccacaagtggaaaactctcaagac 29721171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1062 - 1121
Target Start/End: Original strand, 29768715 - 29768774
Alignment:
Q  1062 aggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa 1121  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  29768715 aggtcaagtttttcaagtgaatccaacttgagagctggaatactcctgagattgtgacaa 29768774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1183
Target Start/End: Original strand, 29712757 - 29712931
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    ||||| || ||||||  ||||||| |||||||||  | ||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29712757 aacccgtccaccacaattggaaaactctcaagaccgtgacaatgtgaaaagtcaagagtttctagtgaatccaacttgagaggtggaatactcctgagat 29712856  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagac 1183  Q
    ||  ||||     ||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||||| ||||||||||    
T  29712857 tgcgacaactactaacattcagggttttaagttttccaaaaaacccgtcctccacaattggaaatctctcaagac 29712931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 998 - 1111
Target Start/End: Original strand, 29664105 - 29664218
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||| |||||||||   ||||   |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |    
T  29664105 tttaagtttatccgccaacccatccaccactggtggaaaactctcaagacatgaacactctgaaagatcaagttcttctagagaagccaagttgagaggt 29664204  T
Q  1098 ggaatactcttgag 1111  Q
    ||||||||| ||||    
T  29664205 ggaatactcctgag 29664218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1095
Target Start/End: Original strand, 29690685 - 29690766
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagag 1095  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29690685 aacccatccaccacatttggaaaactctcgagcttataacaacttgaaaggtaaagtttttctagtgaatccaacttgagag 29690766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1170 - 1239
Target Start/End: Original strand, 29691320 - 29691389
Alignment:
Q  1170 aaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaata 1239  Q
    |||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  29691320 aaaactgtcaagactagtacaatctaaaagatcgagttcttctagagaaggtaacacgagagatggaata 29691389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 29755728 - 29755789
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgata 62  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29755728 agtgctttgtccatattatcattgaagttttccatttgcatatgaaaaagatgcaaatgata 29755789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1016 - 1108
Target Start/End: Original strand, 29672464 - 29672556
Alignment:
Q  1016 cccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactctt 1108  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29672464 cccatccaccacaagtggaaaactctcgagacgaaaacaacatgaaaggtccattgtttctagtgaatccaacttaagaggtggaatactctt 29672556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 29718439 - 29718503
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacat 65  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29718439 agtgctttgtccatattatcattgaagttctccgtttgcatatgaaaaagatgcaaatgatacat 29718503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1170 - 1237
Target Start/End: Original strand, 29672623 - 29672690
Alignment:
Q  1170 aaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaa 1237  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  29672623 aaaactctcaagattaatacaatatgaaagatcaagtttttctagagagggtaacatgagagatggaa 29672690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1170 - 1219
Target Start/End: Original strand, 28475623 - 28475672
Alignment:
Q  1170 aaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaag 1219  Q
    |||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28475623 aaaactgtcaagactagtacaatctaaaagatcgagttcttctagagaag 28475672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1194 - 1239
Target Start/End: Original strand, 29721464 - 29721509
Alignment:
Q  1194 tgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaata 1239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  29721464 tgaaagatagagttcttctagagaaggtaacatgagaggtggaata 29721509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Original strand, 29767333 - 29767370
Alignment:
Q  99 tgtatagaaaaatgtattgccattgatgatcactctta 136  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29767333 tgtatagaaaaatgtatttccgttgatgatcactctta 29767370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 1244
Target Start/End: Complemental strand, 618761 - 617671
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||    
T  618761 tgtcaatggagaaacaacacagagagtaatggcaggaaacttgttacgaaaccagaaagaaattgacaatcctgccaaacattggtgattgaaccactct 618662  T
Q  253 ggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaag---tttaaatatatcaagaa 349  Q
    ||| | ||  || ||||||   |||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||    
T  618661 ggaattttcgcttgtggcaaatggaaccaagtatttccagcctcatgtaattcctattagtcataaataattaatgtaaaatttttaactatatcaagaa 618562  T
Q  350 gaatatcaattatcatatcaaatacattaca-----aaata-aatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagttt 443  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  618561 taatatcaattatcatatcaaatgcataacacaaaaaaatataatcataacctgatttagtaatttgcttttgcacgacgaagtcaacgatttgcagttt 618462  T
Q  444 attgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcga 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  618461 attgcagataaagattttaagcatggaggaatcccttcaatttccaaaagttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaagatgacatttttcga 618362  T
Q  544 tagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagttt 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  618361 tagatttaggaagaactgtgaattgatttttagttaggtgtaattctttcacattagcaaacaacataagactttttgacagatattcatctgaaagttt 618262  T
Q  644 gcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgctttgggctcacttttctttcacccttgatgataaattcagccagcagtgacaatgcaaca 743  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||| ||| | |||||||   ||||  || |||  |||||||||||||   ||||             
T  618261 gcagttcctgacacaaatatgctttacatgtgaagattgcattgcgttcactttctcttcattctggatagtaaattcagccagtcttgac--------- 618171  T
Q  744 actctatttggtaaataaacagttccacatttgcatggatatgatgttggaggcagagtatgattttcaaatggaaacggcaattcattaaagggagttt 843  Q
    |  ||||||||||| || |||  |||||| ||      | || ||||| ||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  618170 atcctatttggtaagtagacatatccacagtt------acataatgtttgaggttgtgtaagattttgaaatggaaacggcaattcttttatgggagttt 618077  T
Q  844 tatcaaagtgaacttttggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaatatgaaagattgaattgttccaacgaagt 943  Q
     ||| ||| | |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  618076 catccaagaggactcctggtacatttctcatctctcccaatatttctggaaaactctcaagactataacaacatgaaagattgaaatgttccaacaaagt 617977  T
Q  944 caactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctca 1043  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  617976 caacctgagccgtgggatattcctaagcatgatgcaacattcgatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatccaccaccaatggaaaactctca 617877  T
Q  1044 agactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaa 1138  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||     |||||| | ||||||||    
T  617876 agactacaacaacatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaaattgagaggtgggatactcctgagattgtgacaacttgtaacaagtagggttttaa 617777  T
Q  1139 gttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaat 1238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |  |||||||||||| || |||| ||| || ||| |||||  ||||| ||||||    
T  617776 gttttccaagaaacccatccaccacaagtggaaaactctcgagcctataacaatttgaaaggtcaagtttttcaagtgaatccaactggagaggtggaat 617677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 617043 - 616811
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||     ||||    
T  617043 tggaaaactttcaagactataacaacatgaaagatcaagtgtttctagtgcatccaacttgagaggtggaatactcttgaggttgtgacaacttttaaca 616944  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||  ||  ||||| |||||| || |||| ||||||  || |||||     
T  616943 agcaaggttttaagttttccaagaaacccgtctaccacaagtggaaaacactcaagggcaccacaatatgaaaggtcaagtttttctagcaaatccaact 616844  T
Q  1226 tgagagttggaatactccttagcttgatgcaac 1258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  616843 tgagaggtggaatactccttagcttgatgcaac 616811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1244
Target Start/End: Complemental strand, 617765 - 617530
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  617765 aacccatccaccacaagtggaaaactctcgagcctataacaatttgaaaggtcaagtttttcaagtgaatccaactggagaggtggaatactcctgagat 617666  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttc 1208  Q
    ||| ||||     |||||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||| |||| || | |  |||||||||||| || |||||    
T  617665 tgtgacaacttgtaacaagaagggttttaagttttccaagaaacccgtgaaccacaagtggaaaattctcgagcctataacaatttgaaaggtcaagttc 617566  T
Q  1209 ttctagagaagccaacatgagagttggaatactcct 1244  Q
    ||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  617565 ttctagcaaatccaacttgagaggtggaatactcct 617530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1052 - 1270
Target Start/End: Complemental strand, 616881 - 616658
Alignment:
Q  1052 acaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgaga---atgtaacaa--aacaagcaaggttttaagttttcca 1146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| | ||    ||| ||| |  |||||| |  |||||||||||||||    
T  616881 acaatatgaaaggtcaagtttttctagcaaatccaacttgagaggtggaatactccttagcttgatgcaactattaacaagtagagttttaagttttcca 616782  T
Q  1147 agaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactcctta 1246  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| |  |||  ||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  616781 agaaacccgtccatcacaagtggaaaactctcaagactataacaacatgaaaggttaagtgtttctagcaaatccaacttgagaggtggaatactcctta 616682  T
Q  1247 gcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  616681 gcttgatgcaacgtctaacactca 616658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1049 - 1244
Target Start/End: Complemental strand, 617448 - 617248
Alignment:
Q  1049 ataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagtttt 1143  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||| ||||     |||||| |||||||||||||||    
T  617448 ataacaacatgaaaggtcaagtgtttctaaagaatccaacttgagcggtgggatactcttaagattgtgacaacttgtaacaagtaaggttttaagtttt 617349  T
Q  1144 ccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactcc 1243  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| || | |  |||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  617348 ccaagaaaaccgtccaccacaagtggaaaactctcaagactataacaacatgaaaggtcaaatgtttctagtgaatccaacttaagaggtggaatactcc 617249  T
Q  1244 t 1244  Q
    |    
T  617248 t 617248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1241
Target Start/End: Complemental strand, 617325 - 617110
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||| ||||     | ||    
T  617325 tggaaaactctcaagactataacaacatgaaaggtcaaatgtttctagtgaatccaacttaagaggtggaatactcctaagattgtgacaattttcagca 617226  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaaca 1225  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||  ||||| || | || |||||| ||| |||||     
T  617225 agaagggtttcaagttttccaagaaacccatccaccaccaatggaaaactctcaagactaccacaataagaaaggtcaaatttttctagcgaatccaact 617126  T
Q  1226 tgagagttggaatact 1241  Q
    |||||| |||||||||    
T  617125 tgagaggtggaatact 617110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1242
Target Start/End: Complemental strand, 617201 - 616968
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||     
T  617201 aacccatccaccaccaatggaaaactctcaagactaccacaataagaaaggtcaaatttttctagcgaatccaacttgagaggtggaatacttctgagat 617102  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttc 1208  Q
    ||  ||||     |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |||      
T  617101 tgccacaactagtaacaagtagggttttaagttttccaagaaacccgtctactataagtggaaaactttcaagactataacaacatgaaagatcaagtgt 617002  T
Q  1209 ttctagagaagccaacatgagagttggaatactc 1242  Q
    |||||| | | ||||| |||||| ||||||||||    
T  617001 ttctagtgcatccaacttgagaggtggaatactc 616968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1175
Target Start/End: Complemental strand, 617607 - 617458
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aaca 1125  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||     ||||    
T  617607 tggaaaattctcgagcctataacaatttgaaaggtcaagttcttctagcaaatccaacttgagaggtggaatactcctgagattgtgacaacttgtaaca 617508  T
Q  1126 agcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaact 1175  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  617507 cgcagggttttaagttttccaagaaacccgtccaccacaagtggaaaact 617458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1106
Target Start/End: Complemental strand, 616761 - 616686
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactc 1106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  616761 tggaaaactctcaagactataacaacatgaaaggttaagtgtttctagcaaatccaacttgagaggtggaatactc 616686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1170 - 1239
Target Start/End: Complemental strand, 616617 - 616548
Alignment:
Q  1170 aaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaata 1239  Q
    |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  616617 aaaattctcaagattagtacaatctgaaagatcgagttcttctagagaaggtaacatgagagatggaata 616548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 6)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 316 - 1270
Target Start/End: Original strand, 209615 - 210557
Alignment:
Q  316 taaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaagaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttctttt 415  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  || |||||| |    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  209615 taaacaatcaatgtaagtttaactatatcaagaagaatataaaatatagta-caaataaaagg-aaaataaatcataacctgatttagtaatttgctttt 209712  T
Q  416 gcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagaca 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| |||||||||||||||     
T  209713 gcacgacgaagtcaatgatatgcagtttagtgcagataacattcttaagcatggaggaatccctttaatttcttgaagtgccttacaatcatccaagacg 209812  T
Q  516 agcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaac 615  Q
    ||  |||| ||| | ||||| |  ||||||||||||||||  |||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  209813 agtttccacaaagatttacaatattcgatagatttaggaattactgtgaagtgattactagttaggtgtaattctttcacattagcaaataacataagac 209912  T
Q  616 ttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaagattgctttgggctcacttttctttcacccttgatgat 715  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||  ||||||| |    
T  209913 tttttgacagatattcatctgaaagattgcacctcctgacacaaatatactttacatgtaaagattgcattgtgttcactttttcttcattcttgatggt 210012  T
Q  716 aaattcagccagcagtgacaatgcaacaactctatttggtaaataaacagttccacatttgcatggatatgatgttggaggcagagtatgattttcaaat 815  Q
    ||||||||||||   |||||           ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||       |||||  |||  | ||| |||||| ||||    
T  210013 aaattcagccagtgttgacatc---------ctatttggtaagtaaacatatccacattcacata------atgttttaggttgggtaagatttttaaat 210097  T
Q  816 ggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaacttttggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaacaat 915  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||| | | | |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  210098 ggaaacggcaattcttttatgggagtttcatccatgaggactcctggcatatttctcatctctcccaatatttctggaaaactcttgagactataacaat 210197  T
Q  916 atgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaa 1015  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  210198 atgaaagattgaaatgttccaatgaagtcaacctaagccgcgggatattcctaagcatgatgcaacattcaatgttcaagaatttaagtttatccaacaa 210297  T
Q  1016 cccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatg 1115  Q
    | |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||    
T  210298 ctcatccaccacacatggaaaactttcaagactacaacaacatgaaaggtcaagtacttctaatgaatccaacttgagaggtgggatgctcttaagattg 210397  T
Q  1116 taacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttctt 1210  Q
    ||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| || | |  ||||  ||||| ||| ||   ||    
T  210398 taacaatttgtaacaagcagggttttaagttttccaagaaacccgttcaccacaagtggaaaactctcgagcctatgacaagatgaaaaatcaagggttt 210497  T
Q  1211 ctagagaagccaacatgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactca 1270  Q
    |||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  210498 ctagcgaattcaacttgagaggtggaatactccttagcttcctgcaacctctaaaactca 210557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 208733 - 209060
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacattttcagtcgtga---catacgtatcttctcatcat 97  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | | | |||||   | ||  |||||||  |||||    
T  208733 agtgctttgtccatattttcattgaagttttccatttgcatatgaaaaagatgcaaatgatacatgtccggccgtgatgacctatctatcttcgaatcat 208832  T
Q  98 atgtatagaaaaatgtattgccattgatgatcactcttagaggacattgaggatc------tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaa 191  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||      |||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  208833 gtgtatagaaaaatgtattgccattgatgaccactcttacaggacgttgagaatcgtgcaatgtcgatgaacaaacaacacagagagctatggcaggaaa 208932  T
Q  192 tttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactctggagtctttactcgtggcatccggaaccaagtgtttcct 291  Q
     || || | ||| |||||||||| |||||||| | || | || |||||||||||||||||||||    |  |||||||||  || ||||||||||||||     
T  208933 cttgttacgaaaccagaaagaaaatgacaatcttgccaaacagtggtggtcgaaccactctggaaatgtcgctcgtggcaaacgaaaccaagtgtttcca 209032  T
Q  292 gcttcatgtgattcctgttaatcataaa 319  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||    
T  209033 gcctcatgtaattcctgttagtcataaa 209060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 915 - 1162
Target Start/End: Original strand, 236499 - 236751
Alignment:
Q  915 tatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaaca 1014  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  236499 tatgaaatattgaattgttccaacgaagtcaaccggaatggtgggatgctccgaagcatcatgcaatgttcaatattcaagaatttaagtttttcaagaa 236598  T
Q  1015 acccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaat 1114  Q
    |||| || || |||  || |||| |||  || ||| ||||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||  ||||| |    
T  236599 acccgtccactacatgtgaaaaactcttgagcctacaacagtttgaaaggtcaagtctttctaaggattccaacttgagaggtgggatacttctgagatt 236698  T
Q  1115 gtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccacca 1162  Q
    || ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  236699 gtgacaatttctaacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccacca 236751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1244
Target Start/End: Original strand, 236739 - 236974
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaa 1113  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  || ||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||     
T  236739 aacccatccaccacacatggaaaactcttgagcctacaacaatttgaaaggttaagtttttctaaggaatccaacttgagagctggtatacttctgagat 236838  T
Q  1114 tgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaat-ttgaaagatcgagtt 1207  Q
    ||| ||||     || ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||| |||||||| |  ||||| |||||| | | ||||    
T  236839 tgtgacaaccttcaataagtagggttttaagttttccaagaaactcgtccaccacaattggaaaacgctcaagactataacaatattgaaa-agcaagtt 236937  T
Q  1208 cttctagagaagccaacatgagagttggaatactcct 1244  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  236938 cttctagagaatccaacttgagaggtggaatactcct 236974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1031 - 1266
Target Start/End: Original strand, 236897 - 237137
Alignment:
Q  1031 tggaaaattctcaagactataacaaaat-gaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgagaatgtaacaa-----aac 1124  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||     |||    
T  236897 tggaaaacgctcaagactataacaatattgaaaag-caagttcttctagagaatccaacttgagaggtggaatactcctgagatcgcgacaactattaac 236995  T
Q  1125 aagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaac 1224  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |  ||||  ||| || |  ||   |||||| ||| |||||    
T  236996 attcagggttttaagttttccaagaaacccatccaccacaggtggaaaactctcaagactatcacaacatgagaggttaagggtttctagcgaatccaac 237095  T
Q  1225 atgagagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaaca 1266  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  237096 ttgagaggtgggatactccttagcttgatacaatctctaaca 237137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1106
Target Start/End: Original strand, 237021 - 237113
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactc 1106  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  237021 aacccatccaccacaggtggaaaactctcaagactatcacaacatgagaggttaagggtttctagcgaatccaacttgagaggtgggatactc 237113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12592288 - 12591757
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12592288 tgtcaatggagaaacaacacaaagaactatggagggaaacttgttacgaaaccaaaaagaaattgacaatcctgccgagcatttgtggtcgaaccactct 12592189  T
Q  253 ggagtcttt---actcgtggcatccggaaccaagtgtttcctgcttcatgtgattcctgttaatcataaataattaatgtaagtttaaatatatcaagaa 349  Q
    ||| |||||   || |||||||  || |||||||||||||  || || ||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  12592188 ggaatctttggcacccgtggcaaacgaaaccaagtgtttctagcctcgtgcaattcctgttagtcaaaaataattaaagtaagtttaactatatcaaaaa 12592089  T
Q  350 gaatatcaattatcatatcaaatacattacaaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgca 449  Q
    |||||  || || |||  |||| | |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12592088 gaatacaaaata-cattacaaacaaaa-acaaaatgaatcataacctgatttagtaatttgcttttgcacgacgaagtcaatgacttgcagtttagtgca 12591991  T
Q  450 gataaagtttttaagcatggaggaatcccttcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatt 549  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||  |||||| | |    
T  12591990 gataacattcttaagcgtggaggaatccctttaatttcctgaagttccttacaatcatccaagacgagtttccataaaaaatgacattcttcgatacaat 12591891  T
Q  550 taggaagaactgtgaattgattttcagttaggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagtt 649  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12591890 taggaagaactttgaattgatagttagttaggtgtaattcttgcacattagaaaacaagatgagaatttttgacagattttcatatgaaagtttgcagtt 12591791  T
Q  650 cctgagacaaatatattctacttgtgaagattgc 683  Q
     |  | ||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  12591790 tcccacacaaatatactttacatttgaagattgc 12591757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 814 - 1101
Target Start/End: Complemental strand, 12591665 - 12591378
Alignment:
Q  814 atggaaacggcaattcattaaagggagttttatcaaagtgaacttttggtatgtttctcatctctcccaatatttctggaaaactctccagacttaaaca 913  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||| ||| |  |||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  12591665 atggagacggcaattcttttatggaagttttatccaagcgaagtcctggtatatttctcagatcttccaatatttctggtaaactctcaagactataaca 12591566  T
Q  914 atatgaaagattgaattgttccaacgaagtcaactcgagccgagggatattcctaagcatggtgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaac 1013  Q
    | |||||| |||||| ||||| || |||||||||  |||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591565 acatgaaatattgaaatgttctaaagaagtcaacgtgagccgtggaatactcctaagcatgatgcagtattcaatattcaagaatttaagtttatccaac 12591466  T
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaa 1101  Q
    ||||||||  |||||| || |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  12591465 aacccatccgccacacttgaaaaactctcgagcatataacaatttgaaaggtcaagtttttctagcgaatccaacttgagaggtggaa 12591378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12592452 - 12592388
Alignment:
Q  1 agtgctttgtccatagtatcgttgaatttttcccttttcatatgaaaaagatttaaatgatacat 65  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12592452 agtgctttgtccatattatcattgaagttctccatttgcatatgaaaaagatgcaaatgatacat 12592388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 45; Significance: 5e-16; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 998 - 1241
Target Start/End: Original strand, 5920666 - 5920914
Alignment:
Q  998 tttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagct 1097  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| || |||| ||| |||| | |||||||||||| |    
T  5920666 tttaagtttacccaacaacccatccaccacgggtggaaaactctcaaggctattgcaatatgaaagatcgagttgttccaaagcacccaacttgagaggt 5920765  T
Q  1098 ggaatactcttgagaatgtaacaa-----aacaagcaaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaat 1192  Q
    |||||| |||||||  || |||||     ||||   | |  |||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    |||| | ||||||    
T  5920766 ggaatattcttgagcttgcaacaatatctaacacttaggagtttaagtttatcaagaaacccatctacaatgactggaaaacttgtgagactattacaat 5920865  T
Q  1193 ttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatact 1241  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||| |||||    
T  5920866 atgatagatcgagttcttctagtgaagtcaacttgaaaggtgggatact 5920914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 976 - 1111
Target Start/End: Original strand, 5919939 - 5920074
Alignment:
Q  976 tgcaatattcaatattcaagaatttaagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttc 1075  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||  || ||||| |||| |   |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||  |||    
T  5919939 tgcaatatataatactcaagaattgaagtttatccataaatccatccaccaaaagaggaaaactctcgagattatcacaatatgaaagatcaagtacttc 5920038  T
Q  1076 taaagaatccaacttgagagctggaatactcttgag 1111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5920039 taaagaagccaacttgagaggtggaaaacttttgag 5920074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 679
Target Start/End: Original strand, 5918746 - 5919045
Alignment:
Q  380 aaaataaatcacaacctgatttagtaattttcttttgcacgacgaagtcaatgatttgcagtttattgcagataaagtttttaagcatggaggaatccct 479  Q
    |||||||||||  |||||||| |  || || ||| | |||||| ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  5918746 aaaataaatcaagacctgattcataaacttgcttgtacacgacaaagtcaaagatatgcagttaatggccgaaaaagtttttaagtttggcggaatccct 5918845  T
Q  480 tcaatttcccgaatttcctcacaatcatccaagacaagcctccataaaaaattacatttctcgatagatttaggaagaactgtgaattgattttcagtta 579  Q
    |  |||||| |||  | |||||| | |||||||| |||| || ||||||| |  ||||| || ||  | || || ||||  || |||| | |   | |||    
T  5918846 ttgatttcctgaagattctcacagttatccaagaaaagcttctataaaaagtggcatttttcaatgcagttggggagaatggtaaatttactccaactta 5918945  T
Q  580 ggtgtaattcttttacattagcaaacaacatgaaacttattgacaaatattcatctgaaagtttgcagttcctgagacaaatatattctacttgtgaaga 679  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||| |||  ||||||| ||||| |||||||||| || || || | ||||||||||||||||    
T  5918946 ggtataattctttaacattagcaaaccacataagaccgattgccaatgattcatcagaaaggttgcagttccagacacgaagaaattctacttgtgaaga 5919045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1128 - 1271
Target Start/End: Original strand, 5921083 - 5921226
Alignment:
Q  1128 caaggttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatg 1227  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |  |  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  5921083 caaggtttgaagtttattaagaaacccatctaccacatgtggaaaactctcgagactatcaatatatgaaagatcgagttcttctagcgaaaccaacttg 5921182  T
Q  1228 agagttggaatactccttagcttgatgcaacgtctaacactcaa 1271  Q
    |||| ||||| |||| | |||||  |||||| || ||| |||||    
T  5921183 agaggtggaagactcttgagcttcttgcaacttccaactctcaa 5921226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 255
Target Start/End: Original strand, 5918503 - 5918605
Alignment:
Q  153 tgtcaatggagatacaacacagagaactatggcaggaaatttatttctaaagcagaaagaaattgacaatcctcccgagcattggtggtcgaaccactct 252  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || | ||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||| | ||||| |    
T  5918503 tgtcaatggagaaacaacacaaagaactatggcagggaacttgttacgaaaccagaatgaaattgacagtccttgcatgcattggtggtcaatccacttt 5918602  T
Q  253 gga 255  Q
    |||    
T  5918603 gga 5918605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1133 - 1239
Target Start/End: Original strand, 5920665 - 5920771
Alignment:
Q  1133 ttttaagttttccaagaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagt 1232  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||| ||| | || | ||||| ||||||     
T  5920665 ttttaagtttacccaacaacccatccaccacgggtggaaaactctcaaggctattgcaatatgaaagatcgagttgttccaaagcacccaacttgagagg 5920764  T
Q  1233 tggaata 1239  Q
    |||||||    
T  5920765 tggaata 5920771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1111
Target Start/End: Original strand, 5921105 - 5921202
Alignment:
Q  1014 aacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctggaatactcttgag 1111  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |  | ||||||| || |||| |||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5921105 aacccatctaccacatgtggaaaactctcgagactatcaatatatgaaagatcgagttcttctagcgaaaccaacttgagaggtggaagactcttgag 5921202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1244
Target Start/End: Original strand, 5919411 - 5919507
Alignment:
Q  1148 gaaacccatccaccatgagtggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaagccaacatgagagttggaatactcct 1244  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  5919411 gaaaccgatccaccacaagtggaaaacactcaagattatgacaatatgaaagattgagttcttctagcgaagccaaattgagaggcgggatactcct 5919507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1000 - 1112
Target Start/End: Original strand, 5920104 - 5920216
Alignment:
Q  1000 taagtttatccaacaacccatctaccacacatggaaaattctcaagactataacaaaatgaaaggtcaagtttttctaaagaatccaacttgagagctgg 1099  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||   ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||| |||| |||    
T  5920104 taagtttacccaaaaatccatccaccactgttggaaaactctcgagactatcacaatatgaaagatcaagttcttccagtgaagccaactttagaggtgg 5920203  T
Q  1100 aatactcttgaga 1112  Q
     ||||||||||||    
T  5920204 gatactcttgaga 5920216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1168 - 1219
Target Start/End: Original strand, 5920418 - 5920469
Alignment:
Q  1168 ggaaaactctcaagaccaatacaatttgaaagatcgagttcttctagagaag 1219  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5920418 ggaaaactctcaagactctgacaatttgaaagatctagttcttctagagaag 5920469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University