View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9144_low_1 (Length: 480)

Name: NF9144_low_1
Description: NF9144
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9144_low_1
NF9144_low_1
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-463)||(27830870-27831332)
chr7 (1-459)||(17259956-17260414)
chr7 (17-463)||(6789223-6789669)
chr7 (1-436)||(3147002-3147437)
chr7 (1-459)||(17267654-17268112)
chr7 (50-463)||(8654161-8654574)
chr7 (1-423)||(8646628-8647050)
chr7 (1-426)||(8659111-8659536)
chr7 (17-459)||(10494385-10494827)
chr7 (1-436)||(8585701-8586136)
chr7 (50-426)||(1301208-1301584)
chr7 (17-427)||(8667166-8667576)
chr7 (223-463)||(8616392-8616632)
chr7 (1-424)||(8545383-8545806)
chr7 (39-435)||(8570050-8570446)
chr7 (39-463)||(29581874-29582298)
chr7 (56-350)||(13333506-13333800)
chr7 (230-426)||(8601722-8601918)
chr7 (276-436)||(8383146-8383306)
chr7 (339-460)||(7878066-7878187)
chr7 (275-427)||(8537783-8537935)
chr7 (357-436)||(8590376-8590455)
chr7 (287-424)||(8576076-8576213)
chr7 (278-424)||(8581450-8581596)
chr7 (39-435)||(8636376-8636772)
chr7 (275-463)||(8609628-8609816)
chr7 (279-423)||(8673894-8674038)
chr7 (1-90)||(8628616-8628705)
chr7 (279-423)||(8664086-8664228)
chr7 (62-207)||(7877789-7877934)
chr7 (39-180)||(29577705-29577846)
chr7 (1-111)||(8602037-8602147)
chr7 (44-123)||(8609968-8610047)
chr7 (44-202)||(8538008-8538166)
chr7 (1-111)||(8559396-8559506)
chr7 (278-315)||(8664919-8664956)
chr7 (381-429)||(8102412-8102460)
chr7 (387-463)||(29578053-29578129)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (23-436)||(43744554-43744967)
chr8 (1-459)||(12528219-12528677)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (23-423)||(28219669-28220069)
chr5 (33-110)||(42555879-42555956)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (17-459)||(15594749-15595191)
chr1 (50-463)||(4678602-4679014)
chr1 (1-460)||(34466788-34467242)
chr1 (287-347)||(52549293-52549353)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (50-462)||(16657561-16657973)
chr2 (1-453)||(12258576-12259028)
chr2 (32-459)||(14703123-14703550)
chr2 (34-459)||(7541941-7542366)
chr2 (20-459)||(12245420-12245859)
chr2 (1-459)||(12234404-12234862)
chr2 (1-459)||(43625127-43625585)
chr2 (1-427)||(16661987-16662413)
chr2 (17-435)||(11999147-11999551)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (39-436)||(30774990-30775387)
chr4 (15-436)||(35132194-35132607)
chr4 (56-459)||(9335941-9336344)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-106)||(28910650-28910755)
chr6 (361-415)||(11160896-11160950)
chr6 (361-415)||(11199472-11199526)
chr6 (361-415)||(11156029-11156083)
chr6 (361-415)||(11196482-11196536)
chr6 (361-415)||(11241778-11241832)
chr6 (41-176)||(11209390-11209525)
chr6 (363-399)||(11132769-11132805)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 27830870 - 27831332
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27830870 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 27830969  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27830970 aactattttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacctaatgtgagaaggcaaaaa 27831069  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27831070 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcattgacttcttttcaatgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 27831169  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27831170 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 27831269  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27831270 ggctcttcaaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 27831332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17260414 - 17259956
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  17260414 tgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggtg 17260315  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaa-gaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaa 199  Q
     |||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||   ||| || || ||||||    
T  17260314 tactattttgtagaggagatcaa-aagaacgaaaaaattggacattattgggaacccaaaagccttaaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaa 17260216  T
Q  200 aggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaa 299  Q
    |||||||| |||||| |   ||  || | | ||||| |||| || |||||| ||||   | | || | |||  | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  17260215 aggacactttcttttgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttaatttttcttcgtcaatcactcgtgccaagtttgaagaaa 17260116  T
Q  300 tcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttgg 399  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||| | |||   |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  17260115 tcaatatggaccttttttatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgatggtaagattgacaagagcagaattgatgatgttgtccttgttgg 17260016  T
Q  400 tggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  17260015 tggatcttctaggattccgaaagtgcagcaactattgcaggatttcttcaagggtaagga 17259956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6789669 - 6789223
Alignment:
Q  17 acaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggagg 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||  ||||    
T  6789669 acaatcaaagataaggtcttccaagttaaggccaccggtggaaacactcacctcggaggagaggactttgataaccgattggtaaactactttgcagagg 6789570  T
Q  117 tgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttc 216  Q
     ||| |||| |||||| | |||||| |||| ||| ||| |||| ||||| || ||| |||||||    || || | ||| ||||||  ||||||||||      
T  6789569 agtttaagaggaagaacaaagtggatattactggaaactcaagggccttaagaaggttgagaactgcgtgtgaaagggccaaaagggtactctcttttgt 6789470  T
Q  217 tgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttc 316  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||  |||||| ||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||     
T  6789469 tgtcgtcactactattgaggtagactctttatttcagggcatcgacttcatttcatcacttactcgggccaagtttgaggaaatcaatatggatattttt 6789370  T
Q  317 aatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattc 416  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6789369 aatgagtgtatgaagaccgttgagagttgtcttgttgacgctaagatggacaagagtattgtaaatgatgttgtccttgttggtgggtcttctagaattc 6789270  T
Q  417 ccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
    |||||||||| || ||||||   ||  |||||| |||||||||||||    
T  6789269 ccaaagtgcaacaactattgcaagaagttttcatgggaaaggatttg 6789223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3147437 - 3147002
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3147437 tgatgtgtctcttcttacaattaaggataaggtctttcaagttaaggccatcgcaggaaacacccaccttgggggagaggactttgataataggatggtg 3147338  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||||||||||    || ||| ||||||||||| |  || |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||    || || |  ||||||     
T  3147337 aactactttgcacgggagtttaagaagaagaacaaggtagacattagtgagaactcaagagccttaaggaggttgaaaacggcgtgtgaaagagcaaaac 3147238  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    | | ||| |||||| ||||   ||| || |||||||||||| | |||||| ||||   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3147237 gaatactatcttttgctgtcatcaccaccattgagatagattctttatttcagggatttgacttattttcatcaatcactcgtgccaagtttgaggaaat 3147138  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactga-ctctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttgg 399  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||| || ||||  || || |||||||| |||  |||| ||||||| |||||||| ||    
T  3147137 caatatggatcttttcactgagtgtttggaaactgttaagagttgtttcgctgatgtcgaa-atggacaaaagtgctatacatgatgtcgtccttgtcgg 3147039  T
Q  400 tggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  3147038 tggctcgtctagaattccaaaagtgcaacaactattg 3147002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17268112 - 17267654
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||     
T  17268112 tgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggta 17268013  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
     |||| ||||| ||||   |||| | ||| |||| | || | |||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||   ||| || || |||||||    
T  17268012 tactattttgttgaggaaatcaaaaggaaaaaaaaattgaaaattgttgggaacccaaaagccatgaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaaa 17267913  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| |||||  |   ||  || | | ||||| |||| || |||||| ||||   ||| || | |||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17267912 ggacactttctttcgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttgatttttcttcgtcaatcactcgtgccaagtttgaggaaat 17267813  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||| | |||  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  17267812 caatatggacctttttgatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgatgctaagattgacaagagcagagttgatgatgttgtccttgttggt 17267713  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||| |||||||| |||||    
T  17267712 gggtcttctaggattccgaaagtgcagcaactattgcagaacttcttcaaggggaagga 17267654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8654574 - 8654161
Alignment:
Q  50 actgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| |    
T  8654574 actgctggaaacacgcacctagggggagaagactttgataacagaatggtgtactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggaaattagcg 8654475  T
Q  150 ggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatt 249  Q
    | ||||||| | |||| |||||| |||||||    || |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  8654474 gtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactctcttttacttttgtcaccactgttgaggtagatgctttatt 8654375  T
Q  250 tgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctc 349  Q
    |  ||| |  ||||| | |||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  | | |||||| |||||||||    
T  8654374 tatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgctaaatttgaggaaattaatatggactttttcaatgagtgtatcaatattgttgacagttgtctc 8654275  T
Q  350 actgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttca 449  Q
    |  || || |||||  |||||| |  ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||    
T  8654274 agagattcaaagatatacaagaatgatattgatgatgttgtactcgtgggtggctcgtctaggattcccaaagtgcaggatctattgctagagtttttca 8654175  T
Q  450 agggaaaggatttg 463  Q
    |||| |||| ||||    
T  8654174 aggggaaggctttg 8654161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8647050 - 8646628
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8647050 tgatgtgtctctccttacaattaaggataaggtctttcatgttaaagccaccgctggaaacactcacctcggaggagaggactttgatagtagaatggtg 8646951  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
     || ||||||   | |  || || |||||||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  8646950 gaccactttgcacaagaatttaacaagaagaacaaggtggacattactggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacggcatgcgagagagcaaaaa 8646851  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| |||||| ||  |  ||| || |||||  ||||| | |||||| | |||| ||||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| | |||    
T  8646850 ggacactatcttttgcttcttgcaccaccattgaattagattctttatttaatggcattgactttatttcatcaatcactcgtgccaaatttgacgcaat 8646751  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  | |||  | |||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||    
T  8646750 caatatggatctgttcatcgaatgtttggaaactgttgagagttgtcataatgatgccaagatggacaagagttctatccatgatgttgttcttgttggt 8646651  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagt 423  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8646650 ggctcctctagaattccaaaagt 8646628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8659536 - 8659111
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||| | | |||||  |||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  8659536 tgatgtgtctatccttacaatgaagggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatagcagaatggtg 8659437  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||    || |||| |||||| |    
T  8659436 aactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggacattagtggtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaga 8659337  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||| | ||| | |||||| |||| |  ||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8659336 ggacactctcttttgcttttgtcaccactgttgaggtcgattctttatttcagggaatagacttctgttcattaatcactcgtgccaggtttgaggaaat 8659237  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  || || || ||  | | ||||  ||| || ||| |||| ||||| |||    
T  8659236 gaatatggatctttttaatgagtgtatgaaaactgttgagagttgtcttagcgattcaaaaatacagatgagtgatattgacgatattgttcttgtgggt 8659137  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgca 426  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  8659136 ggttcgtctaggattcccaaagtgca 8659111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 10494385 - 10494827
Alignment:
Q  17 acaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggagg 116  Q
    |||||||||| | | |||||  |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  10494385 acaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagccactgcaggtaacactcaccttgggggagaggacttcgataacagaatggtgaattattttgttgagg 10494484  T
Q  117 tgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttc 216  Q
     |||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| |||||||    || |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10494485 agttcaaaaagaagaataacgtggacatcagtgggaatccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactctctttttc 10494584  T
Q  217 tgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttc 316  Q
    | ||| ||| ||  ||||| | ||||| ||||||  ||| |  ||||| | |||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  10494585 ttttgtcaccaccgttgaggtcgatgctttatttatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgaggaaattaatatagactttttc 10494684  T
Q  317 aatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattc 416  Q
    |  || |||||| | | |||||| ||||||||||  || || |||||  |||||| |  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  10494685 atcgagtgtatgaatattgttgacagttgtctcagggattcaaagatatacaagaatgatattgatgatattgttcttgtgggtggctcgtctaggattc 10494784  T
Q  417 ccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||||||||||| | ||||||   || ||||||||||| |||||    
T  10494785 ccaaagtgcaggatctattgctagaatttttcaaggggaagga 10494827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 8585701 - 8586136
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | | | |||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||    
T  8585701 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaatactcaccttgggggaggggactttgataacagaatgttg 8585800  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||  ||||| |  ||||| |||| |  |||||||||||| |||||| || | |||||   ||| || ||||||||||    
T  8585801 aactactttgttgaggaatttaagagaaagaacaatgtggatattactaagaacccaagagctttgaggcggttaagaacggcatgtgaaaaggcaaaaa 8585900  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| |||||     | | |||||||||||| || |||   |||| |||||||   || |||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  8585901 ggacactttctttcaaattggtcactactattgaaattgattatttatgtgagggcgtcgatttctcttcatcaatcacgcgtgtcaagtttgaggaaat 8586000  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||| | || |||| ||| |||||||||| |||    
T  8586001 caatatggacctttttaatgagtgtataaatactgttgagagttgtcttaccgattctaagatagagaagaatggtgtagacgatattgtccttgtcggt 8586100  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||    
T  8586101 ggctcgtccagaattcccaaagtacaggaactattg 8586136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1301584 - 1301208
Alignment:
Q  50 actgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtg 149  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  1301584 actggtggaaatactcaccttggaggagaggactttgataatagaatggtgagctactttgtagaggagttcagaaagaagaataaagtggacattagtg 1301485  T
Q  150 ggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatt 249  Q
    | ||||  | | |||| |||||| ||||||     || |||| |||||||||||||||||||||| || | | ||| ||  ||||| | ||| | |||||    
T  1301484 gtaaccagaaatccttaaggaggttgagaattgcgtgtgagagggcaaaaaggacactctcttttgctttagtcaccaccgttgaggtcgattctttatt 1301385  T
Q  250 tgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctc 349  Q
    | |||| |  ||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||   | || ||||||||||||||     
T  1301384 tcagggaatcgacttctgttcattaatcactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggatctttttaatgagtgtacaaaaaccgttgagagttgtctt 1301285  T
Q  350 actgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgca 426  Q
    |  || || || ||   || ||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1301284 agcgattcaaaaatatgcatgagtgatatcgatgatattgttcttgtgggtggctcgtctaggattcccaaagtgca 1301208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8667576 - 8667166
Alignment:
Q  17 acaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggagg 116  Q
    |||||||||| | | |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  8667576 acaattaagggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacactcaccttgggggcgaggacttcgataacagaatggtgaactattttgttgagg 8667477  T
Q  117 tgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttc 216  Q
     ||| || |||||||| | ||||||||| |||  |||||||| | |||| |||||| |||||||    || |||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  8667476 agttaaaaaagaagaataaagtggacatcagtcagaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactctcttttgc 8667377  T
Q  217 tgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttc 316  Q
    | |||  || ||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  ||||| | |||| | || |||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||    
T  8667376 ttttgttaccactgttgaggtagatgctttatttacgggaatcgacttttgttcatcaattactcgtgctaaatttgaggaacttaacatggactttttc 8667277  T
Q  317 aatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattc 416  Q
    ||||| |||||| | |  ||||| |  |||||||  || || |||||  |||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8667276 aatgagtgtatgaatatagttgacacctgtctcagggattcaaagatatacaagaatgatattgatgatgttgtacttgtcggtggctcgtctaggattc 8667177  T
Q  417 ccaaagtgcag 427  Q
    |||||||||||    
T  8667176 ccaaagtgcag 8667166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8616632 - 8616392
Alignment:
Q  223 cactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaa 322  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||  || |||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  8616632 cactactattgagattgattatttatgtgagggcatcgatttctcttcatcaatcactcgtgttaagtttgaggaaatcaatatggacctttttaacgag 8616533  T
Q  323 tgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaag 422  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | | ||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  8616532 tgtataaagactgttgagagttgttttaatgattctaagatagagaagagtagtgtagatgatattgttcttgtcggtggctcgtctaggattcctaaag 8616433  T
Q  423 tgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
    ||||| | ||||||   ||||||||| | || |||||||||    
T  8616432 tgcaggaactattgagtgactttttcgatgggaaggatttg 8616392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8545806 - 8545383
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||  | || ||||| ||||||||| ||||| |||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  8545806 tgatgtgtctattcttacaattaaaaataaggtctttgatgtcaaggccactgctggagacacttacctaggcggtgaagactttgataacagaatggtg 8545707  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| |||||| |  | ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    || |||||||||||||    
T  8545706 aattactttgtgaaggagttcaagaggaagaacaatgaggatattagtcggaacccagaagccttgaggaggttgagaactgcctgtgagaaggcaaaaa 8545607  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| || |       |||  | || |||||  ||||||| |||| | | || | |||||| | ||||   |||||||| || ||||||||| || |    
T  8545606 ggacactttcatacgacactgaggccacaattgacctagatgctttatatcaaggtattgacttttgttcatgcatcactcgggccaagtttgagcaatt 8545507  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     ||||||||||| ||  |  | |||||||| |||||| |  |||||||   |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8545506 gaatatggacctctttgaaaagtgtatggacactgttaattgttgtcttgttgatgctaagatggacaagggtagtgtagatgatgttgtccttgttggc 8545407  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtg 424  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  8545406 ggttcttctaggattcctaaagtg 8545383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8570446 - 8570050
Alignment:
Q  39 aagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagt 138  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || || || |||||||| || ||| |||   |||||||| ||  ||||||||||||||| |  |     
T  8570446 aagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggtgaagattttgataacagaatgttgactcactttgtgaagaagttcaagaagaagaacaacga 8570347  T
Q  139 ggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagata 238  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||    || |||| ||||||||||||||| || | |  |  |||  | || |||||| ||    
T  8570346 ggatattagtaggaacccaaaagccttgaggaggttaagaacagcttgtgagagggcaaaaaggacactttcatatgatactgaggccacaattgagcta 8570247  T
Q  239 gatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttg 338  Q
    |||||  ||| | |||| | |||||||  |||| | || || || || |||||||||||||| |||||| |||| ||  |  | |||||||| ||||||     
T  8570246 gatgctatatataagggaattgacttcagttcatcaataacccgggccaagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatggaaactgtta 8570147  T
Q  339 agagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctatt 435  Q
    | ||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  8570146 atagttgtcttgctgatgctaagatggaaaagaatagtgtagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgaggcagctatt 8570050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 463
Target Start/End: Original strand, 29581874 - 29582298
Alignment:
Q  39 aagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagt 138  Q
    |||| ||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | | | ||| |||| |||||| |   |    
T  29581874 aagtgaaggccactgctggcgatactcacctaggaggagaggactttgataaccgaatggtgaattactttgcgaatgagttgaagaggaagaacaattt 29581973  T
Q  139 ggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagata 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    || |||| |||||| |||||||| || |||    |||| || || |||||  ||    
T  29581974 ggacattagtgggaacccaaaagctttaaggaagctgagaacagcttgtgagagggcaaagaggacactttcatttgacattgagaccacaattgacgta 29582073  T
Q  239 gatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttg 338  Q
    |||||| | | | | || | ||| ||||  ||| |  | ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||  |  |||||||||||| |||||    
T  29582074 gatgccatttgtcaaggtattgatttctgctcaccagttactcgggccaagtttgagcaaatcaacatcgacctctttgaaaaatgtatggagattgttg 29582173  T
Q  339 agagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggc 438  Q
     |||||||||   |||  |||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  29582174 ggagttgtctacgtgatgctaacatggtcaagagtagtgtagatgatatcgtccttattggtggctcttctagaattcccaaagtgcatcagctattgca 29582273  T
Q  439 ggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
     || ||||||||||| |||||||||    
T  29582274 agaatttttcaaggggaaggatttg 29582298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 350
Target Start/End: Original strand, 13333506 - 13333800
Alignment:
Q  56 ggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |  || || || ||||||||||    
T  13333506 ggaaacactcaccttgggggagaagacttcgataacagaatggtgaactattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtcgatatcagtgggaacc 13333605  T
Q  156 caagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgaggg 255  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||    || |||| || |||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||| ||||  ||||||| ||||||  |||    
T  13333606 caaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggaaaaaaggatactctccttttcttttgtcaccactgttgaagtagatgctttatttatggg 13333705  T
Q  256 cactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctca 350  Q
     |  ||||| | |||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||  || |||||| | | |||||| ||||||||||    
T  13333706 aatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgaggaaattaatatagactttttcatcgagtgtatgaatattgttgacagttgtctca 13333800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8601918 - 8601722
Alignment:
Q  230 attgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatgg 329  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||  |||| | |||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||| || ||  | ||||| |    
T  8601918 attgacatagattccttatttgagggtattgatttccattcatcaatcactcgggccaagtttgagcaactcaatgtggacctctttaagaagtgtatag 8601819  T
Q  330 agactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgca 426  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  || |||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8601818 agactgttgaaagttgtcttagtgatgctcagatcgaaaagagtagtgtggatgatgctgtccttgttggcggttcttctaggattcccaaagtgca 8601722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 436
Target Start/End: Original strand, 8383146 - 8383306
Alignment:
Q  276 tcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtag 375  Q
    ||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||  |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  8383146 tcactcgggccaaatttgagcaactcaatatggacctatttgaaaagtgtatggagactgttgagagctgtcttactgatgctaagatgaacaagagtag 8383245  T
Q  376 tatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    | ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  8383246 tgtagatgatgttgttctcatcggtggttcttcgaggattcccaaagtgcaagagctattg 8383306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 460
Target Start/End: Original strand, 7878066 - 7878187
Alignment:
Q  339 agagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggc 438  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  7878066 agagttgtcttactgatgctatgatggacaagaacaatgtagatgatgttgtacttgttggtggatcatctaggattctcaaagtgcagcagctattgca 7878165  T
Q  439 ggactttttcaagggaaaggat 460  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  7878166 ggacttttttaaggggaaggat 7878187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8537935 - 8537783
Alignment:
Q  275 atcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagta 374  Q
    |||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||  |  | |||||| | |||||| |||||||| | | |||  ||||||||||||  ||||    
T  8537935 atcactcgggccaagtttgagcaactcaacatggacctctttgaaaagtgtatgaaaactgttaagagttgttttaatgatgctaagatggacagtagta 8537836  T
Q  375 gtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcag 427  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8537835 gtatggatgatgttgtactagttggtggctcttctaggattcccaaagtgcag 8537783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8590455 - 8590376
Alignment:
Q  357 ctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    |||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8590455 ctaagatggacaagaacattgtagatgatgttgtacttgttggtggttcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 8590376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8576213 - 8576076
Alignment:
Q  287 aagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatg 386  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||  |  | |||||| | |||||| | | ||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8576213 aagtttgaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatgaatactgttaatatttgtcttgctgatgctaagatggacaagaatagtgtagatgatg 8576114  T
Q  387 ttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtg 424  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8576113 ttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg 8576076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8581596 - 8581450
Alignment:
Q  278 actcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagta 377  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||| ||  |  | |||||||| |||||| | ||||||||  | ||  |||||||||||| | |||||     
T  8581596 actcgggccaagtttgagcaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatggacactgttaatagttgtcttgccgatgctaagatggacaggggtagtg 8581497  T
Q  378 tagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8581496 tagatgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtg 8581450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 435
Target Start/End: Original strand, 8636376 - 8636772
Alignment:
Q  39 aagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagt 138  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||   |||||| |||||| |  ||    
T  8636376 aagttaaagccactgccggagacacacaccttggaggagaggactttgataacagaatggtggaatattttgtagaggaaatcaagaggaagaacaaggt 8636475  T
Q  139 ggacattagtgggaaccc-aagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagat 237  Q
     |||||||| |||||| | ||||| ||| || ||| | ||||||   ||||| |  |||||||| |||||||| ||| | ||||| || || |||||| |    
T  8636476 agacattagcgggaacgctaagagtctt-agaaggttaagaacctcttgcgaaagagcaaaaagaacactctcatttgcagttgataccacaattgaggt 8636574  T
Q  238 agatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaa-tgtatggagactgt 336  Q
    |||||  ||||||||   |   || || | ||||  ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||| ||    
T  8636575 agatggtttatttgaaaacttcgatttttgttcattgataactcgtgcgaggtttgaggaactcaatatggacctcttta-tgaagtgtgtggagacggt 8636673  T
Q  337 tgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctatt 435  Q
      | |  ||||| |  || || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8636674 gaatacgtgtcttaaagattcaaatatggataagagcaatatagatgatgttgtccttgttggtggctcctctaggattccaaaggtgcagcaactatt 8636772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8609816 - 8609628
Alignment:
Q  275 atcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagta 374  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||  || | ||||| ||||  |    
T  8609816 atcactcgtgcgaagtttgagcaacttaacatggacctctttgaaaagtgtatggagacggttgaaagatgtcttactgatgctgaaatggataagaaaa 8609717  T
Q  375 gtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
       ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  8609716 ccgtagatgatgttgttcttgttggaggttcttctaggattccgaaagtgaagcagctactgcaagactttttcaatggaaaggatttg 8609628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 423
Target Start/End: Original strand, 8673894 - 8674038
Alignment:
Q  279 ctcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtat 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| | |||  | ||||||||||  |||  |||    
T  8673894 ctcgtgccaagtttgaggaaatcaatatcaatcttttcaacgagtgtttggaaactgttgagaattgtcttattgatgccaagatggacataagttttat 8673993  T
Q  379 agatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagt 423  Q
      || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8673994 ccattatgttgtccttgttggtggctcctctagaattccaaaagt 8674038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8628705 - 8628616
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataa 90  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | | | |||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8628705 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaatactcaccttggtggagaggactttgataa 8628616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8664228 - 8664086
Alignment:
Q  279 ctcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgact-ctaagatggacaagagtagta 377  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| | | ||| |  ||||||||| ||||  ||    
T  8664228 ctcgtgccaagtatgatgaaatcaatatggatcttttcaacg--tgtttggaaactgttgagagttgtctta-ttactgccgagatggacatgagtttta 8664132  T
Q  378 tagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagt 423  Q
    |  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8664131 tccattatgttgtccttgttggtggctcctctagaattccgaaagt 8664086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 7877789 - 7877934
Alignment:
Q  62 actcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagag 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| | || |||  || ||| |||| |||||| | |||||||||| |||| ||||| || |    
T  7877789 actcacctaggtggagaggactttgataacagaatgttgaaccatttagtgatggagtttaagaggaagaataaagtggacattggtggaaacccgaggg 7877888  T
Q  162 ccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacact 207  Q
    || | |||||| |||||||   ||| |||| ||| |||||||||||    
T  7877889 cccttaggaggttgagaactgcatgtgagagggctaaaaggacact 7877934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Original strand, 29577705 - 29577846
Alignment:
Q  39 aagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagt 138  Q
    |||| ||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||| | | ||| |||| |||||| |  ||    
T  29577705 aagtaaaggccactgctggtgatactcacctaggaggagaggacttcgataataaaatggtgagccactttgtgaatgagttgaagaggaagaacaatgt 29577804  T
Q  139 ggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaac 180  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  29577805 ggacattagtttgaacccaaaagctttaaggaagctgagaac 29577846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 8602147 - 8602037
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||||  |||| ||||| ||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  8602147 tgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacaccttggaggagaggactttgataaccgaatggtg 8602048  T
Q  101 aactactttgt 111  Q
    ||| |||||||    
T  8602047 aaccactttgt 8602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8610047 - 8609968
Alignment:
Q  44 aaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaa 123  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||  |||||||| ||| ||||||    
T  8610047 aaggctactgctggagatactcaccttggaggagaggactttgatcacagaatggttaatcactttgtgaaggagttcaa 8609968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8538166 - 8538008
Alignment:
Q  44 aaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggaca 143  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  | |||||| | |  || |||| ||| || | ||| ||||    
T  8538166 aaggccactgccggagatactcaccttggaggagaggactttgataatcggttggtgaatcattttgtgaatgaattgaagaggaaaaacaaagttgaca 8538067  T
Q  144 ttagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaagg 202  Q
    ||||||| ||  ||| |||  |||||| | |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  8538066 ttagtggaaattcaaaagctctgaggaagttgagaactgcatgcgagagggcaaaaagg 8538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 8559506 - 8559396
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||||  |||| ||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  8559506 tgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacacctcggaggagaggactttgataacagaatggtg 8559407  T
Q  101 aactactttgt 111  Q
    ||  |||||||    
T  8559406 aaacactttgt 8559396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8664956 - 8664919
Alignment:
Q  278 actcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggacctttt 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8664956 actcgtgcgaggtttgaggaaatcaatatggacctttt 8664919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8102460 - 8102412
Alignment:
Q  381 atgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagca 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  8102460 atgatgttgttcttgttggtggttcaactaggattcccaaagttcagca 8102412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 463
Target Start/End: Original strand, 29578053 - 29578129
Alignment:
Q  387 ttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttg 463  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| | | ||||||   |||||||||||||| | |||||||    
T  29578053 ttgtccttgttggaggttcatctagaattcccaaagtgcggaaactattgcaagactttttcaagggtagggatttg 29578129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 43744967 - 43744554
Alignment:
Q  23 aaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttca 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  43744967 aaggaaaaggtattccaagtgaaggccacctctggaaacactcacctcggaggagaggattttgataataggatggtgaactacttcgcagaggagttta 43744868  T
Q  123 agaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttga 222  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||   |||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||||     
T  43744867 agaagaagaacaaggtggacattactggaaacccaagagcattaaggaggttgagaacagcatgcgaaagagcaaaaaggacattatcttttgctgttgt 43744768  T
Q  223 cactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaa 322  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  43744767 caccactattgaggtagattctttatttgagggcattgatttctttacaacaatcactcgtactaagtttgaggaaatcaatatggatctcttcaacgag 43744668  T
Q  323 tgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaag 422  Q
    ||| || | | ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43744667 tgtttgaaaattgttgagagttgtcttactgatgccaagatggacaagagcgctatacatgatgttgttcttgttggtggctcctctaggattccaaaag 43744568  T
Q  423 tgcagcagctattg 436  Q
    | || || ||||||    
T  43744567 tacaacaactattg 43744554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12528677 - 12528219
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12528677 tgatgtgtctcttcttacagtaaagaataatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcaccttggaggagaggactttgataatcgaatggtg 12528578  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||  |||||||| | | ||| |||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||  |||||||  | ||||||||||| ||||    
T  12528577 aatcactttgtgaaagagtttaagaggaagaacaaagttgacattattgggaactcaaaagccctaaggagattgagaactaactgcgagaaggcgaaaa 12528478  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| || |    |   ||  |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||| || ||||| ||| || |    
T  12528477 ggacactttcatacgatacagaggctacaattgacatagatgctatatgtgagggcattgacttctgctcatcaatcactcgagccaagttcgagcaact 12528378  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     ||||||||||| ||  |  | ||||||||||| ||||| |||||| | || ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12528377 gaatatggacctctttgaaaagtgtatggagaccgttgaaagttgtttgaccgatgctaagatggacaagagtagtgtagatgatattgtacttgttggt 12528278  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  12528277 ggctcgtctaggattcccaaagtgaagcagctattgcaggagtttttcaagggcaagga 12528219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28220069 - 28219669
Alignment:
Q  23 aaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttca 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  28220069 aaggataaggtcttccaagtgaaggccaccgctggaaacactcacctcgggggagaggactttgatagtaggatggtgaactacttcgcagaggagttta 28219970  T
Q  123 agaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttga 222  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||    ||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  28219969 agaagaagaacaaggtggacattactggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacagcgtgcaagagagcaaaaaggacactatcttttgctgttgt 28219870  T
Q  223 cactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaa 322  Q
    | | || |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28219869 cgccaccattgaggtagattctttatttgaaggcattgatttcttttcatcaattactcgtgctaagtttgaggaaatcaatatggatcttttcaatgag 28219770  T
Q  323 tgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaag 422  Q
    ||| || | ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||   | || | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  28219769 tgtttgaaaactgttgagaggtgtctcactgatgccaatatggacaagagggctgtacacgatgttgttcttgttggaggctcctctagaattccaaaag 28219670  T
Q  423 t 423  Q
    |    
T  28219669 t 28219669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 110
Target Start/End: Original strand, 42555879 - 42555956
Alignment:
Q  33 tcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttg 110  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  42555879 tcttccaagtgaaggccacctctggtaacactcacctcgagggagacgacttggatagtaggatggtgaaatactttg 42555956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 15595191 - 15594749
Alignment:
Q  17 acaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggagg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||    
T  15595191 acaattaaggacaaggtcttccaagttaaggccacaggcggaaacactcaccttggaggagaggactttgataacagaatggtcaactactttgcgcagg 15595092  T
Q  117 tgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttc 216  Q
      ||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||| | ||||||||||  |||||||||| |    
T  15595091 aattcaagacgaagaacaaagtggatattactgggaacccaagggccttgaggagattgagaactgcgtgcgaaagggcaaaaagggtactctcttttac 15594992  T
Q  217 tgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttc 316  Q
    |  || |||||| |||||| |||||   |||||| | || | ||||||||||||| || | |||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  15594991 tactgtcactaccattgaggtagattgtttatttaacggtattgacttcttttcatcggttactcgttccaagtttgaagaaatcaacatggactttttt 15594892  T
Q  317 aatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattc 416  Q
    || || |||||| |||  ||||||||||||||   |||  |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15594891 aaggattgtatgaagatagttgagagttgtcttgatgatgctaagatgaataagagtagtgtaaatgatattgtcattgttggtgggtcttctaggattc 15594792  T
Q  417 ccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    |||||||||| || ||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  15594791 ccaaagtgcaacaactattgaaggattttttcgagggaaagga 15594749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 463
Target Start/End: Original strand, 4678602 - 4679014
Alignment:
Q  50 actgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtg 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||     
T  4678602 actgctggaaacactcacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagta 4678701  T
Q  150 ggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatt 249  Q
     |||| ||| | |||| |||||| |||||||    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |  ||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||    
T  4678702 agaacgcaaaacccttaaggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgag-tagattctttatt 4678800  T
Q  250 tgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctc 349  Q
    | |||| |  ||||| | |||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||     
T  4678801 tcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtctt 4678900  T
Q  350 actgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttca 449  Q
    | ||| || ||||||  |  ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| |    
T  4678901 agtgattcaaagatgcgcgggagtaatattgatgatgttgttcttgtgggtggttcatcgaggattcccaaagtgcaggatctattgcaagactttttta 4679000  T
Q  450 agggaaaggatttg 463  Q
    || | |||||||||    
T  4679001 agcggaaggatttg 4679014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 34466788 - 34467242
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |    
T  34466788 tgatgtgtctctccttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacactcacctcggacgagaggactttgataatagaatggcg 34466887  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||| ||||||   ||| |||||||| |||| | |    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    |||||||| ||||| |    
T  34466888 aaccactttgcaaaggagttcaagaggaagcataataaggatattagtggaaaccctagagctttgaggaggttgagaactgcgtgcgagaatgcaaaga 34466987  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||||| || |        | ||||| |||| |||||| | |||| |||||  | |||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34466988 ggacactcttttgt--------cgctactgttgaaatagattctttatatgaggtaattgacttccattcgtcaatcactcgtgccaagtttgaggaaat 34467079  T
Q  301 caatatggaccttttcaatga---atgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgtt 397  Q
    |||||||||| | || || ||   ||| |||  || ||||| |||||||||   |||  |||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||     
T  34467080 caatatggacttctttaaagattaatgcatgaggattgttgtgagttgtcttgttgatgctaagatggacacgagtagtgtgcatgatgctgtccttgtc 34467179  T
Q  398 ggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggat 460  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  34467180 gggggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcgggactttttcaatggtaaggat 34467242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 347
Target Start/End: Original strand, 52549293 - 52549353
Alignment:
Q  287 aagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtc 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||    
T  52549293 aagtttgaggaaatgaatatggacctttttaaggagtgtatgaagattgttgaaagttgtc 52549353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 462
Target Start/End: Original strand, 16657561 - 16657973
Alignment:
Q  50 actgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtg 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |  |||||||| ||||    
T  16657561 actgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtg 16657660  T
Q  150 ggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatt 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||    
T  16657661 ggaactcaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctcttttgcttttgtcaccactgttgaggtagattctttatt 16657760  T
Q  250 tgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctc 349  Q
    | |||| | |||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||     
T  16657761 tcagggaattgacttttcttcatcaatcacccgtgccaagtttgaggaaattaatatggatcttttcaatgagtgtatgaaaactgttgagaattgtctt 16657860  T
Q  350 actgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttca 449  Q
      ||| || |||||| |||   ||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||    
T  16657861 cgtgattcaaagatgcacattggtgatattgatgacgttgttcttgtgggtggctcatctaggattcccaaagtgcaggatctattgcaagactttttca 16657960  T
Q  450 agggaaaggattt 462  Q
    |||| ||||||||    
T  16657961 agggcaaggattt 16657973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 12258576 - 12259028
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12258576 tgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacacgcaccttggaggagaggactttgataatagaatggtg 12258675  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    |  |||||||| || | ||||||||  ||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||||||||  ||| |||    || ||||  |||||||    
T  12258676 agttactttgtagaagagttcaagagaaagaacaaagtagatataagtggaaatccaagagctttgaggagattgaaaacagcttgtgagagtgcaaaaa 12258775  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    |  |||| |||| |  |||||   | ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||| || | | || | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12258776 gatcactttcttatcttgttgttgcaactattgagatagattctttatgtgatggcattgatttttctgcatcaatcaatcgtgccaagtttgaggaaat 12258875  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  12258876 aaatttggaacttttcaatgaatgcatgaagactgttgagagttgtcttacggatgctaacacggacaagagtaatgtagatgatgttgtccttgtaggt 12258975  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaaggg 453  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  12258976 gggtcttctaggattctcaaagtgcagcagctattacaggattttttcaaggg 12259028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14703550 - 14703123
Alignment:
Q  32 gtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaaga 131  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | | ||||||||  || |    
T  14703550 gtcttccaaattaaggctactgctggaaacactcacctcgggggagaggacttcgataacagaatggtgaactactttgttcaagagttcaagagaaaaa 14703451  T
Q  132 aaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactat 231  Q
    | ||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||| |||||    |||| | | |||||    
T  14703450 acagattggacattagtggaaatccaaaagccttaaggagcttgagaaccgcttgcgagagggcaaaaagaacactttctttccaagttgtcgccactat 14703351  T
Q  232 tgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggag 331  Q
    |||| ||||||| |||||| |  ||| |||||| | |||| |||||| | | || |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||| || ||    
T  14703350 tgaggtagatgctttatttcaatgcattgacttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaagaaatgaatatggacttttttaatgagtgtgtgaag 14703251  T
Q  332 actgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagc 431  Q
    | ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||      
T  14703250 attgttgagagttgtcttattgatgctaagatggacaagagtagagtagatgatgttgttcttgtcggtgggtcttctcggattcccaaagtacagcaat 14703151  T
Q  432 tattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||||   |||||||||| |||| |||||    
T  14703150 tattacaggactttttccaggggaagga 14703123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7542366 - 7541941
Alignment:
Q  34 cttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaa 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||  |||||     
T  7542366 cttccaagttaaggccactgctggcaacactcaccttggtggagaagactttgataatagaatggcgaactactttgtacaagagttcaagagaaagaac 7542267  T
Q  134 agagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattg 233  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    || |||| |||||||||  |||| |||||   |||||   | |||||||    
T  7542266 aaagtggacattagtgggaatccaaaagccttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaaaagatcactttctttccttgttgttgccactattg 7542167  T
Q  234 agatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagac 333  Q
    || ||||| | |||||| | |||| |||||| | |||| |||||| | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||     
T  7542166 aggtagattctttatttcaaggcattgacttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaggagatgaatatggatctttttaacgagtgtatgacgat 7542067  T
Q  334 tgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagcta 433  Q
    |||||  || ||||| | |||  |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  7542066 tgttggaagctgtcttattgatgctaatatggacaagagcatgatagatgatgttgtccttgtcggcgggtcttcgaggattcccatagtacatcagcta 7541967  T
Q  434 ttggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||    
T  7541966 ttaaaggactttttcaatggaaagga 7541941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 459
Target Start/End: Original strand, 12245420 - 12245859
Alignment:
Q  20 attaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgt 119  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||    
T  12245420 attaaggataacatcttccaagttaaggccactgctggaaacactcaccttggaggagaggattttgataatagaatggtaaactactttgcacaggagt 12245519  T
Q  120 tcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgt 219  Q
    ||||||  ||||| | | |||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  |||||||    || |||| ||||||||| | ||| || |||  |||    
T  12245520 tcaagagaaagaacaaattggatattagtgcaagttcaaaagccttgaggagattgagaactgcttgtgagagggcaaaaagaatactttcgtttcttgt 12245619  T
Q  220 tgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaat 319  Q
    ||   | ||||||||| ||||| | |||||| | |||| ||| || | |||| | |||| ||| ||||||||||||||| | ||| | || ||| | |||    
T  12245620 tgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatccatcaatcgggcaaagtttgaggaattgaatttagatcttcttaat 12245719  T
Q  320 gaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattccca 419  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| | |  ||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12245720 gattgtataaagactgttgagagttgtattatggatgcaaagatggacaagagtactatagatgattttgtacttgttggtggatcttctaggattccca 12245819  T
Q  420 aagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    |||| || ||||||||   |||||||||||| || |||||    
T  12245820 aagtccaacagctattacaggactttttcaacgggaagga 12245859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12234862 - 12234404
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  | ||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||     
T  12234862 tgatgtgtctctcctaacaatcaaaggtaatgtcttccaagttaaagccacagccggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatggta 12234763  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    |||||| |||   | | |||||| |  ||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||    || |||| ||||||||    
T  12234762 aactaccttgctcaagagttcaatagaaagaaaaaagtggacatgagtggaaatccaaaagccttgaggaggttaagaactgcttgtgagagggcaaaaa 12234663  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    |  || | |||||   |||||   | || |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| || | |||| |||||| | | || ||||||||||||||    
T  12234662 gatcattgtctttccttgttgttgcaaccattgaggtagattctttatttgaaggcattgatttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaggaaat 12234563  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     |||||||| ||| | | ||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||| ||||     
T  12234562 gaatatggatcttcttattgagtgtatgaagattgttgagagttgtcttagtgatgctaagatggacaaaagtagggtggatgaagttgtccttattggc 12234463  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  12234462 gggtcctctaggattcccaaagtgcagcaactattgcaggattttttcaaggggaagga 12234404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43625585 - 43625127
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43625585 tgatgtgtctatacttacaattaaggacaaggtcttccgtgttaaagccactgctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatgatagaatggtg 43625486  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    ||||||||||  || |  ||  |||||||||| |  ||||| |||| ||| ||| |||||||| | || ||| |||||||   ||||||||  | |||||    
T  43625485 aactactttgcagaagaatttgagaagaagaacaatgtggatattattggaaactcaagagccataagaaggttgagaacggcatgcgagagaggaaaaa 43625386  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    ||||||| |||||| ||     ||  ||||||||| ||||| | |||||    || | ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  43625385 ggacactgtcttttgcttcgttcagcactattgaggtagattctttattccgtggtattgacttcttttcatcaatcactcgtgccaaatttgatgaaat 43625286  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
     |||||||| |||||||| || ||| || | |||||| |||||||||| | |||  | ||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||     
T  43625285 aaatatggatcttttcaacgagtgtttgaaaactgttaagagttgtcttattgatgccaagttggacaagagtgctatccacgatgttgtccttgttggc 43625186  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaagga 459  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||||||||| |||||    
T  43625185 ggctcctctagaattccaaaagtaaaacagctgttgcaggagtttttcaaggggaagga 43625127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 16661987 - 16662413
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | | | |||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  16661987 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatgttg 16662086  T
Q  101 aactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaa 200  Q
    |||||||||||| | |  || || | |||||| | |||||| || | | |||| |||||||||||||||||| |||||||    || || ||||| ||||    
T  16662087 aactactttgtgaaagaatttaataggaagaacaaagtggatatcactaggaatccaagagccttgaggaggttgagaacttcttgtgaaaaggcgaaaa 16662186  T
Q  201 ggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaat 300  Q
    |||||||||||||     | | |||  |||||||||| |||   ||||  |||| || |||||||| | || |  |||||||||  |||||||| |||||    
T  16662187 ggacactctctttcaaattggtcaccgctattgagattgattatttatacgaggacattgacttctctacatcactcactcgtgtcaagtttgaagaaat 16662286  T
Q  301 caatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggt 400  Q
    |||||||| |||||| || || |||||| ||| ||||||||||||| |    || || |||||||||||| |  || || ||||| |||| ||||| ||     
T  16662287 caatatgggcctttttaacgagtgtatgaagattgttgagagttgttttgtggattcaaagatggacaaggggggtgtacatgatattgttcttgtcggg 16662386  T
Q  401 ggctcttctaggattcccaaagtgcag 427  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16662387 ggctcgtctaggattccaaaagtgcag 16662413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11999551 - 11999147
Alignment:
Q  17 acaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggagg 116  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||             ||||||  | |    
T  11999551 acaattaaggacaatgtcttccaagttaaggccacagctggaaacactcacttcggaggagaggattttgataata-------------ctttgtacaag 11999465  T
Q  117 tgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttc 216  Q
     ||||||||  |||||   |||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||| |||||||    || |||| ||||||||| | ||| || |||      
T  11999464 agttcaagataaagaacgaagtggatattagtggaagttcaaaagccttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaaaaagaatactatcatttct 11999365  T
Q  217 tgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttc 316  Q
    |||||   | ||||||||| ||||| | |||||| | |||| ||| || | |||| | |||| ||| ||||||||||||||| | ||| | || ||| |     
T  11999364 tgttgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatccatcaatcgggcaaagtttgaggaattgaatttagatcttctt 11999265  T
Q  317 aatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattc 416  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| | |  ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  11999264 aatgattgtataaagactgttgagagttgtattatggatgcaaagatggacaagagtactatagatgatgttgtacttgttggtggatcttctagga-tc 11999166  T
Q  417 ccaaagtgcagcagctatt 435  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  11999165 ccaaagtccaacagctatt 11999147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30775387 - 30774990
Alignment:
Q  39 aagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagt 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||  || |||| |||||| |  ||    
T  30775387 aagttaaagcaactgctggaaacactcacatcgggggagaggactttgataacagaatgttgaattactttgtagaggaatttaagacgaagaacaacgt 30775288  T
Q  139 ggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagata 238  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||   | |||||||   ||| || |||||||||||||||||||| ||     ||  |||   | ||||||||    
T  30775287 ggacattaccgggaatccaagagctttgagacagttgagaactgcatgtgaaaaggcaaaaaggacactctccttcaagtttctcacatttgttgagata 30775188  T
Q  239 gatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttg 338  Q
    |||   |||||| | | || |||||| | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  30775187 gataatttatttcaagacattgacttttcttcatcaatcactcgtgtcaagtttgaggaaatcaatatggacctttttaatgagtgtatacagactgttg 30775088  T
Q  339 agagttgtctcactgactctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30775087 agagttgtcttactgattcaaaggtagacaagagtagtgtagatgatattgttcttgtcggtggttcttctaggattcccaaagtgcaggaactattg 30774990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35132607 - 35132194
Alignment:
Q  15 ttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtgga 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |    
T  35132607 ttactattaaggataatgtcttccaagttaaggccactgccggaaacactcatctcggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtaca 35132508  T
Q  115 ggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttt 214  Q
     | ||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |  |||    ||   ||| ||| |||||| ||  |||| |||||     
T  35132507 agagttcaagagaaagaacaaagtagacattagtgggaattcaaaagccttgagaa--ctg----cc---tgctagagggcaaagagatcactttctttc 35132417  T
Q  215 tctgttgacactactattgagatagatgccttatttgagggcactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttt 314  Q
      |||||   | | ||||||  ||||| | |||||| | |||| ||| || | |||| | |||| ||| || |||||||||||||| |||   |||||||    
T  35132416 cttgttgttgccaatattgaagtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatcaatcaatcgcgccaagtttgaggaaatgaatgcagaccttt 35132317  T
Q  315 tcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgactctaagatggacaagag-tagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctagga 413  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  35132316 ttaatgagtgtatgaataccgtagagagttgtctcattgatgctaagatggacaagagcaagggtagatgatgttgttcttgttggagggtcttctagga 35132217  T
Q  414 ttcccaaagtgcagcagctattg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35132216 ttcccaaagtgcagcagctattg 35132194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 459
Target Start/End: Original strand, 9335941 - 9336344
Alignment:
Q  56 ggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacc 155  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||| | ||||||||| |    |||||    
T  9335941 ggaaacacgcaccttggaggcgaggactttgataacagaatggttaactattttgtggaagagttaaaaaagaagaataaagtggacatcaagcagaacc 9336040  T
Q  156 caagagccttgaggaggctgagaacccaatgcgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacactactattgagatagatgccttatttgaggg 255  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||    || |||| ||||||||||| ||| |||||| || |||  || ||| ||||| ||||||| ||||||  |||    
T  9336041 caaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactgtcttttgcttttgttaccactgttgaggtagatgctttatttatggg 9336140  T
Q  256 cactgacttcttttcaacgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtatggagactgttgagagttgtctcactgac 355  Q
     |  ||||| | |||| | ||||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |  |||||||  ||     
T  9336141 aatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgaggaacttaacatggactttttcaatgagtgtatgaatattgttgacacctgtctcagggat 9336240  T
Q  356 tctaagatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaa 455  Q
    || |||||  ||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||||||||||| |    
T  9336241 tcaaagatatacaagagtaatattgatgatattgttcttgtgggtggctcgtctaggattccgaaagtgcaagaactattgctagaatttttcaagggga 9336340  T
Q  456 agga 459  Q
    ||||    
T  9336341 agga 9336344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28910755 - 28910650
Alignment:
Q  1 tgatgtgtctcttgttacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtg 100  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  28910755 tgatgtttctctccttacaattcaggataaggtcttccaagttaaggccaccgctggaaacactcacctcggggtcgaggacattgataataggatggtg 28910656  T
Q  101 aactac 106  Q
    ||||||    
T  28910655 aactac 28910650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11160950 - 11160896
Alignment:
Q  361 gatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggatt 415  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11160950 gatggacaagagtagcattcatgatgttgtccttgttggtggctctactaggatt 11160896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11199526 - 11199472
Alignment:
Q  361 gatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggatt 415  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11199526 gatggacaagagtagcattcatgatgttgtccttgttggtggctctactaggatt 11199472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11156083 - 11156029
Alignment:
Q  361 gatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggatt 415  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11156083 gatggacaagagtagcattcatgatgttgtccttgttggtggctctaccaggatt 11156029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11196536 - 11196482
Alignment:
Q  361 gatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggatt 415  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11196536 gatggacaagagtagcattcatgatgttgtccttgttggcggctctactaggatt 11196482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Original strand, 11241778 - 11241832
Alignment:
Q  361 gatggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttggtggctcttctaggatt 415  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11241778 gatggacaagagtagcattcatgatgttgtccttgttggtggctctattaggatt 11241832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11209525 - 11209390
Alignment:
Q  41 gttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactactttgtggaggtgttcaagaagaagaaaagagtgg 140  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||   ||||||||| | |||||| | | ||||  || |||| ||| | |||    
T  11209525 gttaaggctattgcaggagacactcacctcgggggacaagactttgataatgcaatggtgaaccattttgtgaaagagttcttgaggaaggaaaaaatgg 11209426  T
Q  141 acattagtgggaacccaagagccttgaggaggctga 176  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  11209425 acattagtggaaatccaagagcccttaggaggctga 11209390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11132805 - 11132769
Alignment:
Q  363 tggacaagagtagtatagatgatgttgtccttgttgg 399  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11132805 tggacaagagtagtattcatgatgttgtccttgttgg 11132769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University