View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9163_low_12 (Length: 383)

Name: NF9163_low_12
Description: NF9163
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9163_low_12
NF9163_low_12
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (94-285)||(13347128-13347319)
chr5 (92-285)||(39370925-39371118)
chr5 (93-285)||(2237275-2237467)
chr5 (94-285)||(40887942-40888133)
chr5 (94-270)||(9408054-9408230)
chr5 (109-285)||(14831559-14831735)
chr5 (94-285)||(1815620-1815807)
chr5 (94-272)||(27553387-27553564)
chr5 (131-285)||(31800595-31800748)
chr5 (94-192)||(33404529-33404627)
chr5 (93-285)||(19596068-19596259)
chr5 (94-228)||(17225319-17225451)
chr5 (94-285)||(4300544-4300734)
chr5 (165-285)||(42683670-42683790)
chr5 (103-285)||(41003851-41004031)
chr5 (91-273)||(12164248-12164433)
chr5 (98-284)||(19124474-19124657)
chr5 (95-180)||(37505869-37505956)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (91-285)||(6715-6909)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (94-285)||(3672274-3672465)
chr4 (94-285)||(28093096-28093287)
chr4 (94-285)||(6112630-6112820)
chr4 (94-285)||(7217765-7217956)
chr4 (94-285)||(21390956-21391146)
chr4 (94-285)||(44275706-44275896)
chr4 (93-285)||(49243814-49244005)
chr4 (94-284)||(35544912-35545102)
chr4 (94-285)||(46192359-46192550)
chr4 (92-285)||(45829258-45829450)
chr4 (110-285)||(51038779-51038955)
chr4 (94-180)||(52191305-52191391)
chr4 (99-201)||(54849793-54849895)
chr4 (94-158)||(25437012-25437076)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (94-285)||(34307138-34307329)
chr1 (94-284)||(39249864-39250054)
chr1 (98-285)||(2509028-2509215)
chr1 (93-285)||(46901735-46901927)
chr1 (94-284)||(19258674-19258863)
chr1 (92-285)||(28647351-28647543)
chr1 (98-220)||(29099821-29099942)
chr1 (99-177)||(10146971-10147049)
chr1 (112-285)||(9642867-9643039)
chr1 (93-130)||(8374694-8374731)
chr1 (102-158)||(39858355-39858412)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (94-285)||(26972203-26972394)
chr7 (94-285)||(36346565-36346755)
chr7 (92-285)||(28307495-28307688)
chr7 (94-285)||(7699883-7700074)
chr7 (94-285)||(7700081-7700272)
chr7 (94-285)||(7700279-7700470)
chr7 (94-285)||(7700477-7700668)
chr7 (93-285)||(45782660-45782852)
chr7 (93-285)||(34108425-34108617)
chr7 (92-272)||(30887698-30887877)
chr7 (92-285)||(42220964-42221156)
chr7 (94-285)||(5811164-5811354)
chr7 (100-285)||(31148296-31148480)
chr7 (93-285)||(13108147-13108337)
chr7 (97-285)||(34828069-34828255)
chr7 (100-285)||(23980137-23980321)
chr7 (92-284)||(21807324-21807515)
chr7 (115-285)||(36957450-36957618)
chr7 (94-237)||(15020282-15020422)
chr7 (136-285)||(46475066-46475215)
chr7 (188-285)||(29953572-29953669)
chr7 (99-180)||(38321014-38321095)
chr7 (129-223)||(20086690-20086784)
chr7 (128-159)||(29953661-29953692)
chr7 (102-158)||(28713685-28713742)
chr7 (136-189)||(42950109-42950162)
chr7 (102-158)||(42974495-42974552)
chr7 (102-135)||(43970967-43971000)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (94-285)||(22894680-22894870)
chr3 (94-285)||(21559561-21559752)
chr3 (94-285)||(34749898-34750089)
chr3 (94-285)||(51339784-51339972)
chr3 (94-285)||(43999989-44000180)
chr3 (94-284)||(36749406-36749596)
chr3 (94-285)||(36370338-36370529)
chr3 (98-285)||(46111944-46112131)
chr3 (94-285)||(30735496-30735686)
chr3 (91-285)||(48200682-48200876)
chr3 (92-285)||(38231291-38231483)
chr3 (94-190)||(29460660-29460756)
chr3 (94-190)||(29471512-29471608)
chr3 (94-285)||(39467102-39467292)
chr3 (102-285)||(20856154-20856334)
chr3 (94-201)||(39072357-39072464)
chr3 (94-223)||(50966131-50966256)
chr3 (94-223)||(51069266-51069391)
chr3 (116-228)||(53638157-53638269)
chr3 (186-285)||(29472901-29472999)
chr3 (101-187)||(29820397-29820483)
chr3 (102-158)||(12224120-12224177)
chr3 (102-158)||(23004764-23004821)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (97-285)||(44958116-44958304)
chr2 (93-285)||(33732568-33732759)
chr2 (94-285)||(16089822-16090011)
chr2 (94-264)||(14572995-14573165)
chr2 (94-283)||(3830900-3831086)
chr2 (94-285)||(37498863-37499056)
chr2 (94-285)||(36315561-36315752)
chr2 (91-285)||(6376239-6376427)
chr2 (94-285)||(37914237-37914427)
chr2 (93-228)||(24137149-24137288)
chr2 (287-352)||(33414922-33414987)
chr2 (17-81)||(33414838-33414902)
chr2 (102-285)||(41188777-41188960)
chr2 (20-82)||(33409307-33409369)
chr2 (292-341)||(33409465-33409513)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (95-278)||(44081781-44081964)
chr8 (94-285)||(42162598-42162789)
chr8 (94-285)||(31318805-31318996)
chr8 (97-285)||(12665347-12665536)
chr8 (93-285)||(36189215-36189405)
chr8 (93-285)||(30432338-30432529)
chr8 (98-285)||(10203668-10203855)
chr8 (97-285)||(18184556-18184743)
chr8 (98-285)||(43186031-43186217)
chr8 (100-285)||(33726017-33726202)
chr8 (114-247)||(42668820-42668952)
chr8 (110-185)||(31547-31622)
chr8 (142-287)||(38845021-38845165)
chr8 (102-158)||(8368488-8368545)
chr8 (102-158)||(11904861-11904918)
chr8 (102-158)||(28898003-28898060)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (94-285)||(3118047-3118238)
chr6 (93-285)||(14022933-14023124)
chr6 (94-285)||(3986906-3987096)
chr6 (94-285)||(15345660-15345848)
chr6 (93-285)||(24208443-24208634)
chr6 (92-285)||(13697567-13697758)
chr6 (102-147)||(16717998-16718044)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (98-285)||(87163-87350)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (121-159)||(5943-5981)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 13347128 - 13347319
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13347128 gagcttttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaaaga 13347227  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13347228 gtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 13347319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Original strand, 39370925 - 39371118
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39370925 ttgagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtgccaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 39371024  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39371025 gggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 39371118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 2237275 - 2237467
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2237275 tgagcttttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 2237374  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2237375 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacttgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 2237467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40888133 - 40887942
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40888133 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacactcttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 40888034  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40888033 gtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaatagatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 40887942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9408230 - 9408054
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9408230 gagctcttatacatgaaccacctcaggtgacatacgcccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 9408131  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgt 270  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9408130 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatatatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaatggtgt 9408054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Original strand, 14831559 - 14831735
Alignment:
Q  109 aaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14831559 aaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgatgatatgatgt 14831658  T
Q  209 ataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14831659 aaaattattcaaatacccctaatacgtaggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 14831735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1815807 - 1815620
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  1815807 gagctcttatacatgaaccatcttaggtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 1815708  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||      | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1815707 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-agggtgtacat---ttctttatgaaaaaaggtgtctacctatctttttc 1815620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27553564 - 27553387
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |    
T  27553564 gagctcttatacatgaaccattttaggtggcatataccattttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagaagaaaaatg 27553465  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtct 272  Q
    ||||| || | ||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27553464 gtgattatctgatgtaaaattactaaaatactcctaacacat-agggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtct 27553387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 285
Target Start/End: Original strand, 31800595 - 31800748
Alignment:
Q  131 ccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31800595 ccttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaatattgaaagaaaagatgaaaaggggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaa 31800694  T
Q  231 cacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    || |||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31800695 catatg-gggtgtacacaagaggtgtatgaaaaagggtgtctgcctatctttttc 31800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33404627 - 33404529
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33404627 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgccatacacacttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 33404529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19596259 - 19596068
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||     
T  19596259 tgagctgttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacatccacgcacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagaggtg-aaaat 19596161  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||| || ||||||  ||| ||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||| || | | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19596160 agtgataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatg-gggtgtacataagaggtatttcaaaaaaggatgtctacctatctttttc 19596068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Original strand, 17225319 - 17225451
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  17225319 gagctcttatacatgaaccactttaggtggcatactc--ttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaagag 17225416  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccct 228  Q
    |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  17225417 gtgatgatgtgatgtgaaattactaaaatacccct 17225451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4300734 - 4300544
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || |||| ||||| |    
T  4300734 gagctcttatacatgaaccattttaggtgacatatatccttttacacccacacatatttgtgacatatggcaaaaacattgaaataagagataaaaaatg 4300635  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| |||| | ||||  ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||| | |||||  | |||||||||    
T  4300634 gtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatatccctaacacatg-aggtgtacatgagagatgtataaaaaaggatgtctatcaatctttttc 4300544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 285
Target Start/End: Original strand, 42683670 - 42683790
Alignment:
Q  165 aaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaa 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42683670 aaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggatggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaa 42683769  T
Q  265 aggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     | |||||  |||||||||||    
T  42683770 ggatgtctatctatctttttc 42683790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41004031 - 41003851
Alignment:
Q  103 tacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgata 202  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  ||||||| || | || |||| || |||||||     
T  41004031 tacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacactcatacacatttatgacatgtggcaaaaatattgaaa-aagatataaaaagggatgatgatg 41003933  T
Q  203 taatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatga-aaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    | ||||| |||||| |||||| |||| ||| |||  ||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  41003932 tgatgtaaaattac-taaatatccctgacatatg-gggtgtacatgagaggtgtataacaaaaaggtttctgtctatctttttc 41003851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 12164248 - 12164433
Alignment:
Q  91 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaata---gatga 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||| | || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |   ||||     
T  12164248 attgaactcttatacatgaaccatcttaggtggcacacattctttaatactcacacacagttgtggcatgtggcaaaaacattgaaagaagaagagatgg 12164347  T
Q  188 aaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctg 273  Q
     | ||||||||| | | ||||  ||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  12164348 gagagggtgatggtgtgatgtgaaattactaaaatgcccctgctacatggaggtgtacataagaggtgcataaaaaagggtgtctg 12164433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19124657 - 19124474
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    ||||||||||  || | ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||| |  ||||    
T  19124657 tcttatacatggactatcttagatggcatacaca-tttgacacccacacacaattgtgacgtgtggcaaaaacatt-aaagaagagatgaaagaatgtga 19124560  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||  | |||| ||||  |||| || ||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  19124559 tgatatgatgtaaaattactaaaatacctttgacacgtgaa-ctgtatatgagaggtgtataaaaattggtgtctacctatcttttt 19124474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 37505869 - 37505956
Alignment:
Q  95 agctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacat--ttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaa 180  Q
    |||||||||||||  | || ||||  || |||||||||||| ||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37505869 agctcttatacatggatcatcttatatgacatacaccctttgacacatacatacataattgtgacatgtggcaaaatcattgaaagaa 37505956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Original strand, 6715 - 6909
Alignment:
Q  91 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa 190  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6715 attgagttcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 6814  T
Q  191 agggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6815 agggtgatgatatgatgtaaaattacttaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtatctacctatctttttc 6909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 3672274 - 3672465
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3672274 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 3672373  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3672374 gtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtatctacctatctttttc 3672465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28093287 - 28093096
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  28093287 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaaagg 28093188  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28093187 gtgatgatatgatgtaaaaatactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 28093096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 6112630 - 6112820
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6112630 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 6112729  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  6112730 atgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgga-gtgtacataagaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttc 6112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 7217765 - 7217956
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||    
T  7217765 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacaccctttaacacctacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaataagagataaaaaagg 7217864  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7217865 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctataacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 7217956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21391146 - 21390956
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |     
T  21391146 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaatga 21391047  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21391046 gtgaatatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtacataaaaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 21390956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 44275706 - 44275896
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  44275706 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatataccattttacactcacacacatttgtgacacgtgccaaaaatattgaaagaagagattaaaaagg 44275805  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44275806 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatctatctttttc 44275896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 49243814 - 49244005
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  49243814 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaa 49243913  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||    
T  49243914 agtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgga-gtgtacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacatatctttttc 49244005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 284
Target Start/End: Original strand, 35544912 - 35545102
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||    
T  35544912 gagctcttatacatgaaccatcttaggtggtatacaccattttacatccacatacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaaggg 35545011  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattact-taaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35545012 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaaatacccctaacacatgga-gtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatcttttt 35545102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 46192359 - 46192550
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||    
T  46192359 gagctcttatacatgaatcaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaggg 46192458  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| || | ||||  ||| | | ||||||||||   |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46192459 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggtacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttc 46192550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45829450 - 45829258
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||     
T  45829450 ttgagctcttatacatgaaccactttaggtgacatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaag 45829351  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||| || | ||||  ||| | | ||||||||||  || |||  ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45829350 gggtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggcatatg-gggtgtacataa-aggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttc 45829258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 285
Target Start/End: Original strand, 51038779 - 51038955
Alignment:
Q  110 accaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa-agggtgatgatataatgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| | | ||||    
T  51038779 accaccttaggtggcatacaaactttgacacccacacacaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaagggggtgatggtgtgatgt 51038878  T
Q  209 ataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
      ||||||| ||||| | ||  |||||   ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51038879 gaaattactaaaatatctctgccacataggggtgtacatgagatgtacatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 51038955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52191391 - 52191305
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaa 180  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  52191391 gagcccttatacatggaccaccttaggtggcatataccttttaacagccacacagaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaa 52191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Original strand, 54849793 - 54849895
Alignment:
Q  99 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgat 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||| | ||| ||||    
T  54849793 cttatacatgaaccaccttagatagcgtacacactttgatacccacacgcagttgtgacaagtgacaaaaatattgaaagaagagatgagagaggatgat 54849892  T
Q  199 gat 201  Q
    |||    
T  54849893 gat 54849895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25437076 - 25437012
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  25437076 gagcccttatacatggaccaccttaggtgacatacaccttttaacatccatacacaattgtgaca 25437012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34307329 - 34307138
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  34307329 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatatgaaaaagg 34307230  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34307229 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttc 34307138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39250054 - 39249864
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39250054 gagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 39249955  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
     || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39249954 atggtgatataatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatcttttt 39249864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Original strand, 2509028 - 2509215
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  2509028 tcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgg 2509127  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2509128 tgatatgatgtaaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaagtgtctacctatctttttc 2509215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46901927 - 46901735
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  46901927 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacaccattttacaccaacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagagatgaaaaag 46901828  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  46901827 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctgatacatggcggtgtacataagaaatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 46901735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19258863 - 19258674
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||    
T  19258863 gagctattatacataaaccatctaaggtggcatacacctttttacacccacatatatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaaaaagagatgaaaaggg 19258764  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
    ||| |||| | ||||  ||||| | |||||  |||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  19258763 gtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatg-gggtgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatcttttt 19258674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Original strand, 28647351 - 28647543
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28647351 ttgagctattatacatgaaccacctaaggttgcatacatctttttacacccacacatatttgtgatatttggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaag 28647450  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| |||| | ||||  ||||| | |||||  |||||||||||  | ||||||| |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28647451 gggtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatg-ggatgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 28647543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Original strand, 29099821 - 29099942
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || | || |||| ||||||    
T  29099821 tcttatacataaaccaccttagatggcatacactcttt-acgtccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaaaaagaaattaaaaggggtga 29099919  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaa 220  Q
    |||| | ||||  ||||||||||    
T  29099920 tgatgtgatgtgaaattacttaa 29099942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 177
Target Start/End: Original strand, 10146971 - 10147049
Alignment:
Q  99 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaa 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||    
T  10146971 cttatacatggaccaccttaggtggcatacaccctttgacccccacacacaattgtgacatgtggcaaaaacagtgaaa 10147049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9643039 - 9642867
Alignment:
Q  112 caccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatga-aaaagggtgatgatataatgtat 210  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||      
T  9643039 caccttagatggcatataccttttaacacccacacataattgtgacacatgacaaaaacaatgaaagaagagatgagaagggggtgatgatatgatgtga 9642940  T
Q  211 aattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9642939 aattactaaaacatccct-acacatgaa-gtgtgcataatagatgtataaaaaaaaatgtctacctatctttttc 9642867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 130
Target Start/End: Original strand, 8374694 - 8374731
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacac 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8374694 tgagcacttatacatagaccaccttaggtggcatacac 8374731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 39858355 - 39858412
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  39858355 atacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgaca 39858412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26972394 - 26972203
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  26972394 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaaagg 26972295  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26972294 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 26972203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36346755 - 36346565
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  36346755 gagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccagacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa-g 36346657  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36346656 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 36346565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28307688 - 28307495
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28307688 ttgagctcttatacataaactaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgcgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 28307589  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28307588 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccttaacatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaagatgtctacctatctttttc 28307495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7700074 - 7699883
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7700074 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7699975  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7699974 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 7699883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7700272 - 7700081
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7700272 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700173  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7700172 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 7700081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7700470 - 7700279
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7700470 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700371  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7700370 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 7700279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7700668 - 7700477
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7700668 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700569  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7700568 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 7700477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45782852 - 45782660
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  45782852 tgagctcttatacatcaaccactttaggtggcatacatcattttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 45782753  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45782752 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataaaaagtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 45782660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 34108425 - 34108617
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34108425 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatatgacaaaaacattgaatgaagagatgaaaaag 34108524  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34108525 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggagtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttc 34108617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 30887698 - 30887877
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  30887698 ttgagctcttatacatgaacaatcttaggtggcatacacacttttacacccacatacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaatgaagagatgaaaaa 30887797  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtct 272  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30887798 gggtgatgatatgatgtaaaattacttaaatacctctaatacatg-gggtgtatataagaagtgtatgaaaaagggtgtct 30887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42221156 - 42220964
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||     
T  42221156 ttgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacttttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaag 42221057  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattact-taaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42221056 gggtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatgga-gtgtacataagtggtgtatg-aaaaaggtgtctacctatctttttc 42220964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5811354 - 5811164
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  5811354 gagctattatacataaaccaccataggtggcatacatcctttttcacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 5811255  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||| ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5811254 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 5811164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 285
Target Start/End: Original strand, 31148296 - 31148480
Alignment:
Q  100 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatg 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31148296 ttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacatggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatg 31148395  T
Q  200 atataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31148396 atatgatgtaaaattactaaaataagcctaacatatg-gggtgtgtataagaggtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttc 31148480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 13108147 - 13108337
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |    
T  13108147 tgagctgttatacataaaccaccttaggcggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacgttgaaagaagagatg-aaagg 13108245  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13108246 ggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtacatgaaaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 13108337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 34828069 - 34828255
Alignment:
Q  97 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtg 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||    
T  34828069 ctcttatacatgaaccaccttgggtg-catacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtgatg 34828167  T
Q  197 atgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  34828168 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacatatg-gggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 34828255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 285
Target Start/End: Original strand, 23980137 - 23980321
Alignment:
Q  100 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatg 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  23980137 ttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgagg 23980236  T
Q  200 atataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    || | ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||   || ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  23980237 atgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacatatg-agatgtacatggaaaatgtataaaaaaggatgtctacctatctttttc 23980321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21807515 - 21807324
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  21807515 ttgagttcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacaaatttgtgatatgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaat 21807416  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
    || ||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||    
T  21807415 ggatgatgatgttatgtgaaattactaaaatacccctaacacgtg-gggtgtatatgagaagtgtataaaaaaggttgtcaacctatcttttt 21807324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 285
Target Start/End: Original strand, 36957450 - 36957618
Alignment:
Q  115 cttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||| || |||| || ||||||| ||||    
T  36957450 cttaggtggcatacacccttttacatccatacatatttgtgacacgtgacaaaaatattgtaagaagagatgaaaatggatgataatgtaatgtaaaatt 36957549  T
Q  215 acttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| ||||||||| ||||||||  |||||| || | | |||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  36957550 actaaaatacccccaacacatg--ggtgtatatgaaaggtgtataaaaaattgtgtctacctatctttttc 36957618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Original strand, 15020282 - 15020422
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||    
T  15020282 gagctgttatacataaaccaccataggtggcatacaaccttttacacc--cacacatttgtgacatatggcaaaaacattgaaagaagagacg-aaaggg 15020378  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatga 237  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15020379 gtgaagatatgatgtgaaattactaaaatatccctaacacatga 15020422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Original strand, 46475066 - 46475215
Alignment:
Q  136 tacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccc-taacaca 234  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  46475066 tacacccatacacatttgtgacatgtaacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgacgatgtgatgtgaaattactaaaataccccataacaca 46475165  T
Q  235 tgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    || || ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46475166 tg-agatgtacatgagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 46475215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29953669 - 29953572
Alignment:
Q  188 aaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29953669 aaaagggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatatccctaatacatggaagtctacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 29953572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 180
Target Start/End: Original strand, 38321014 - 38321095
Alignment:
Q  99 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaa 180  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38321014 cttatacattaaccatcttaggtggcatacacattttaacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaa 38321095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20086784 - 20086690
Alignment:
Q  129 acccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaata 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||||    
T  20086784 acccttttacacccacatacatttgagacatctggcaaaaacattaaaagaagagataaaaaggggtgatgatgtgatgtgaaattactaaaata 20086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 159
Target Start/End: Original strand, 29953661 - 29953692
Alignment:
Q  128 cacccttttacacccacacacatttgtgacac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29953661 cacccttttacacccacacacatttgtgacac 29953692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 28713685 - 28713742
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||    
T  28713685 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgaca 28713742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42950162 - 42950109
Alignment:
Q  136 tacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  42950162 tacacccacacacatttgtgatatgtggcaaatacattgaaaaaagagatgaaa 42950109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42974552 - 42974495
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  42974552 atacataaaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattgtgaca 42974495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 135
Target Start/End: Original strand, 43970967 - 43971000
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttt 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43970967 atacatagaccaccttaggtggcatacacccttt 43971000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 22894680 - 22894870
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22894680 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 22894779  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  22894780 atgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatg-aaaagggtgtctatctatctttttc 22894870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 21559561 - 21559752
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21559561 gagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagg 21559660  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21559661 gtaatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaatggtgtctatctatctttttc 21559752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34750089 - 34749898
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34750089 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 34749990  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  34749989 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacataggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctggctatctttttc 34749898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51339972 - 51339784
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51339972 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacatccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 51339875  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51339874 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaacacatg-atgtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 51339784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 43999989 - 44000180
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43999989 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 44000088  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  44000089 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggcgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttc 44000180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 284
Target Start/End: Original strand, 36749406 - 36749596
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36749406 gagctcttatacatgaaccaccttagatgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 36749505  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatcttttt 284  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  36749506 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatcttttt 36749596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36370529 - 36370338
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36370529 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 36370430  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  36370429 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgagggtgtatataaaaagtgtatgaaaaagagtatctacctatctttttc 36370338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46112131 - 46111944
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46112131 tcttatacatgaaccatcttaggtgacatacaccattttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtga 46112032  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||  | |||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46112031 tgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatggggatgtatataaaaggtgtatgaaaaatggtgtctacctatctttttc 46111944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30735686 - 30735496
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  30735686 gagctcttatatatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatctgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatat-aaaaagg 30735588  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattact-taaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30735587 gtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatgga-gtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 30735496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Original strand, 48200682 - 48200876
Alignment:
Q  91 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa 190  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  48200682 attgaactcttattcatgaatcatcttaggtggcatacacctttttacatccacatatatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaa 48200781  T
Q  191 agggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  48200782 aggatgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccataatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 48200876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Original strand, 38231291 - 38231483
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||    
T  38231291 ttgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagatatg-aaaa 38231389  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctgcctatctttttc 285  Q
     ||| || || ||||||  ||| ||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38231390 tggtaataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttttc 38231483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 190
Target Start/End: Original strand, 29460660 - 29460756
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29460660 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 29460756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 190
Target Start/End: Original strand, 29471512 - 29471608
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29471512 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 29471608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39467292 - 39467102
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||    
T  39467292 gagctgttatccataaaccaccatagatgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatgtgccaaaaatattgaaagaagagatgaaaaggg 39467193  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||| ||| | || |  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  39467192 gtgaggatgtgatatgaaattactaaaatatccataacacatg-aggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtgtacctatctttttc 39467102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20856334 - 20856154
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgat 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||| |||||||    
T  20856334 atacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaa-aagatat-aaaaaggatgatgat 20856237  T
Q  202 ataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatga-aaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     | || || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||| | |||||| ||| || |||||||||||    
T  20856236 gtgatataaaattac-taaatacccctgacacatg-gggtgtacatgagaggtgtataacaaaaagatgtttgtctatctttttc 20856154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39072464 - 39072357
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||    
T  39072464 gagctattatacatgaatcaccttagatgacatacacccttttacacccacatacatttgtgacatgtggcataaacattaaaagaagagatgaaaatgg 39072365  T
Q  194 gtgatgat 201  Q
    ||||||||    
T  39072364 gtgatgat 39072357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 50966131 - 50966256
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||     
T  50966131 gagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag- 50966228  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaata 223  Q
      |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50966229 --gatgatataatgtaaaattactaaaata 50966256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 51069266 - 51069391
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||     
T  51069266 gagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag- 51069363  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaata 223  Q
      |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51069364 --gatgatataatgtaaaattactaaaata 51069391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Original strand, 53638157 - 53638269
Alignment:
Q  116 ttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataatta 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||| |  |||||||||| | ||||| ||||     
T  53638157 ttaggtggcatacaccctttaacacccacacacaatcgtgacatgtggtaaaaacatggaaagaagagatgagagggggtgatgatgtgatgtaaaattg 53638256  T
Q  216 cttaaatacccct 228  Q
    || ||||||||||    
T  53638257 ctaaaatacccct 53638269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 285
Target Start/End: Original strand, 29472901 - 29472999
Alignment:
Q  186 gaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29472901 gaaaagggatgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 29472999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29820483 - 29820397
Alignment:
Q  101 tatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatga 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| | || |||||| |||| |||||| ||||||    
T  29820483 tatacatagaccaccttaggtggcatacacactttgacacccacatacaattgtgagatgtagcaaaaacattaaaagaagagatga 29820397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12224177 - 12224120
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttt-tacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  12224177 atacataaaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacacccacacacaattttgaca 12224120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 23004764 - 23004821
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23004764 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 23004821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 44958116 - 44958304
Alignment:
Q  97 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtg 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44958116 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagggtg 44958215  T
Q  197 atgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  44958216 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 44958304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 33732568 - 33732759
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33732568 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 33732667  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33732668 ggtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 33732759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 16089822 - 16090011
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  16089822 gagctcttatacatgaaccaccttaagtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagat-aaaaaag 16089920  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16089921 gtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttc 16090011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Original strand, 14572995 - 14573165
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14572995 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatccacccttttacatccacacacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaaagaagagatggaaaagg 14573094  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaa 264  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14573095 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggggtgtacataagaggtgtatgtaaaa 14573165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3831086 - 3830900
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  3831086 gagcacttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtg 3830989  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttt 283  Q
    ||||| || | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3830988 gtgattatctgatgtaaaattactaatatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 3830900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37499056 - 37498863
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa--a 191  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  37499056 gagctcttatatatcaaccatcttaactggcatacatccttttacactcacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaga 37498957  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37498956 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggatgtacataagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 37498863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 36315561 - 36315752
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |    
T  36315561 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaagag 36315660  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| || | ||||  ||| | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36315661 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctgacacatg-aggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttttc 36315752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6376427 - 6376239
Alignment:
Q  91 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||| |||||||||    
T  6376427 attgagctgttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggc-----cattgaaagaagagatgaaaa 6376333  T
Q  191 agggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     |||||| ||| | ||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||  || |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  6376332 tgggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacacatg-agatgtacatgggaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttttc 6376239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37914427 - 37914237
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||    
T  37914427 gagcttttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaggg 37914328  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| || | ||||  ||| | | ||||| ||||   |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37914327 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaata-ccctggtacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttc 37914237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24137288 - 24137149
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacc----cacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaa 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24137288 tgagctgttatacataaaccaccttaggtggtatacaccctttgacacctacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaa 24137189  T
Q  189 aaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccct 228  Q
    || || ||| ||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  24137188 aagggatgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccct 24137149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 352
Target Start/End: Original strand, 33414922 - 33414987
Alignment:
Q  287 taccacatttgggtctttaaaaccaacaatgttgaaagacaaaaaatcataaaaccctcctttaat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33414922 taccacatttgggtctttaaaaccaacaatgttgaaagacagaaaatcataaaaccctcctttaat 33414987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 33414838 - 33414902
Alignment:
Q  17 acatgcaagcaaaaccaaattaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaacta 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33414838 acatgcaagcaaaaccaatttaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaacta 33414902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 285
Target Start/End: Original strand, 41188777 - 41188960
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgat 201  Q
    |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| |  | ||||||| || |||||||    
T  41188777 atacatgaaccactttatgtgacatacacccttttatatctatacatatttatgacatgtggcaaaaacattgaaaaatgatatgaaaagggatgatgat 41188876  T
Q  202 ataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatga-aaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     | ||||| ||||||| ||||| | || |||||||  | ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  41188877 gtgatgtaaaattactaaaatatctctgacacatg-tgatgtacatgagaggtgtataacaaaagggtgtctgcctatctttttc 41188960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Original strand, 33409307 - 33409369
Alignment:
Q  20 tgcaagcaaaaccaaattaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaactat 82  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33409307 tgcacgcaaaaccaatttaaagtttaaatataggtttaaatgtattttttaccttttaactat 33409369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 341
Target Start/End: Original strand, 33409465 - 33409513
Alignment:
Q  292 catttgggtctttaaaaccaacaatgttgaaagacaaaaaatcataaaac 341  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33409465 catttgtgtctttaaaac-aacaatgttgaaagacagaaaaccataaaac 33409513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 278
Target Start/End: Original strand, 44081781 - 44081964
Alignment:
Q  95 agctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaaggg 194  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44081781 agctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtaacacgtggaaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggg 44081880  T
Q  195 tgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctat 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44081881 tgatgatataatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctat 44081964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 42162598 - 42162789
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42162598 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacccttttacacccaaacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 42162697  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  42162698 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttc 42162789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Original strand, 31318805 - 31318996
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31318805 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatataactttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 31318904  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  31318905 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctaatacatgggggtgtatataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttc 31318996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 12665347 - 12665536
Alignment:
Q  97 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagat-gaaaaagggt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12665347 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtaacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaagggt 12665446  T
Q  196 gatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12665447 gatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtacgaaaaaggatgtctacctatctttttc 12665536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 36189215 - 36189405
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  36189215 tgagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacatacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaagg 36189314  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     |||||||||| || || ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36189315 agtgatgatatgatataaaattattaaaatacccctaacatatg--ggtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 36189405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 30432338 - 30432529
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  30432338 tgagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttatacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagg 30432437  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| | |||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  30432438 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccataatatatg-ggatgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatcaatctttttc 30432529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Original strand, 10203668 - 10203855
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||     
T  10203668 tcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagggtgg 10203767  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||| || || ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10203768 tgatatgatataaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagagatgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttc 10203855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 18184556 - 18184743
Alignment:
Q  97 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtg 196  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  18184556 ctcttatatatgaaccaccttaagtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggtgaaaacattgaatgaagagatgaaaaggggtg 18184655  T
Q  197 atgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18184656 atgatatgatataaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 18184743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Original strand, 43186031 - 43186217
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43186031 tcttatacatcaaccactttaggtggcatatactcttttacacctgcacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaaaggtga 43186130  T
Q  198 tgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||| || || ||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  43186131 tgatatgatataaaattactcaaatgcccctaatacat-agggtgtacataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttc 43186217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 285
Target Start/End: Original strand, 33726017 - 33726202
Alignment:
Q  100 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaa-agggtgat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||     
T  33726017 ttatacataaaccactttaggtggcatacacctttttacacccacaaacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtggatgac 33726116  T
Q  199 gatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33726117 gatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaa-gtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 33726202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42668952 - 42668820
Alignment:
Q  114 ccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataat 213  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| | | ||||||| ||| ||||  |||    
T  42668952 ccttaggtggcatacacactttgacacccacacacaattgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagatatgagaga-ggtgatggtatgatgtgaaat 42668854  T
Q  214 tacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacat 247  Q
    ||||  ||||||||||  ||||| || |||||||    
T  42668853 tactacaatacccctacaacatggagatgtacat 42668820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31622 - 31547
Alignment:
Q  110 accaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagat 185  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31622 accatcttaggtagcatacacactttgacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagat 31547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38845165 - 38845021
Alignment:
Q  142 cacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggt 241  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||| |||| || | |||||||||| | |||   ||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  38845165 cacacacaattgtgacatgtggaaaaaatattgaaagaaaagat-aagaggggtgatgatgtgatgagaaattactaaaataaccctaacacataagggt 38845067  T
Q  242 gtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttcgt 287  Q
    |||||| |   |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  38845066 gtacatgaagggtgtataaaaaatggtgtttatctatctttttcgt 38845021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8368545 - 8368488
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8368545 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 8368488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 11904861 - 11904918
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||    
T  11904861 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgaca 11904918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 28898003 - 28898060
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  28898003 atacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgaca 28898060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3118238 - 3118047
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3118238 gagctcttatatatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagataaaaaagg 3118139  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||| ||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  3118138 gtggtgacatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggagtgtacataagagatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttc 3118047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 14022933 - 14023124
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  14022933 tgagctattatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgacaagg 14023032  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14023033 ggtgacgatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 14023124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3987096 - 3986906
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  3987096 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 3986997  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
     |||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  ||| ||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  3986996 atgataatatgatgtaaaattactcaaatacccttaatacatg-gggtatacataataaatgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttc 3986906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15345848 - 15345660
Alignment:
Q  94 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagg 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  15345848 gagctcttatacatcaaccaccttaggtggcatatactcttttacacccataca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaaag 15345751  T
Q  194 gtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15345750 gtgatgatatgatatcaaattactcaaatgcccctaatacat-agggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagatgtctacctatttttttc 15345660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 24208443 - 24208634
Alignment:
Q  93 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaag 192  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24208443 tgagctgttatacataaaccatcataggtggtatacactattttacacccacacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 24208542  T
Q  193 ggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    ||||| ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24208543 ggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatg-aggtgtaaatgagaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttttc 24208634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 285
Target Start/End: Original strand, 13697567 - 13697758
Alignment:
Q  92 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  13697567 ttgagctcttatacataaaccatcttagatgacatgcacccttttacacc-atacacatttgtgatacgtggtaaaaacattgaaagaagagatgaaaac 13697665  T
Q  192 gggtgatgatataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| | | ||| ||||||||||||    
T  13697666 gggtgatgatatgatataaaattactaaaatatctctaacacatg-gggtgtacataagtaatgtatgaaaaatgatctctacctatctttttc 13697758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 147
Target Start/End: Original strand, 16717998 - 16718044
Alignment:
Q  102 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacaca 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  16717998 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacaca 16718044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 87350 - 87163
Alignment:
Q  98 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaatcattgaaagaatagatgaaaaagggtga 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  87350 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttgtacacc-acacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaatagtga 87252  T
Q  198 tga--tataatgtataattacttaaatacccctaacacatgaaggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctgcctatctttttc 285  Q
    |||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  87251 tgatatataatataaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttc 87163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 159
Target Start/End: Original strand, 5943 - 5981
Alignment:
Q  121 tggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5943 tggcatacacccttttacacccacgcacatttgtgacac 5981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University