View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9164_low_28 (Length: 381)

Name: NF9164_low_28
Description: NF9164
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9164_low_28
NF9164_low_28
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (1-150)||(17249297-17249447)
chr6 (1-149)||(33220704-33220853)
chr6 (1-155)||(34304461-34304616)
chr6 (1-149)||(45670-45819)
chr6 (2-150)||(4206588-4206737)
chr6 (2-145)||(4165919-4166063)
chr6 (8-155)||(34415408-34415556)
chr6 (5-150)||(357709-357854)
chr6 (1-153)||(959546-959698)
chr6 (8-153)||(29338068-29338214)
chr6 (1-150)||(34554269-34554419)
chr6 (80-150)||(34168913-34168983)
chr6 (63-135)||(24016365-24016437)
chr6 (67-150)||(28008979-28009065)
chr6 (54-150)||(28543394-28543490)
chr6 (8-125)||(13398199-13398317)
chr6 (5-149)||(22985890-22986035)
chr6 (5-149)||(23802359-23802504)
chr6 (67-119)||(26225602-26225654)
chr6 (88-150)||(12401384-12401446)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-155)||(53619551-53619706)
chr4 (1-155)||(50000912-50001068)
chr4 (1-116)||(3329961-3330077)
chr4 (1-150)||(23255678-23255819)
chr4 (1-150)||(55933454-55933602)
chr4 (21-155)||(31847072-31847207)
chr4 (1-150)||(46440881-46441031)
chr4 (1-151)||(600683-600834)
chr4 (1-150)||(56462099-56462248)
chr4 (3-150)||(26521455-26521603)
chr4 (1-155)||(132350-132505)
chr4 (1-86)||(39001362-39001448)
chr4 (77-150)||(30940731-30940803)
chr4 (1-142)||(34107694-34107838)
chr4 (1-143)||(53170478-53170615)
chr4 (1-149)||(25504260-25504408)
chr4 (27-127)||(50483211-50483312)
chr4 (1-128)||(6865834-6865962)
chr4 (1-150)||(45386053-45386203)
chr4 (9-150)||(50462938-50463080)
chr4 (30-150)||(12918364-12918485)
chr4 (1-123)||(7536590-7536713)
chr4 (1-82)||(4419228-4419310)
chr4 (77-146)||(16957584-16957653)
chr4 (63-140)||(43849350-43849427)
chr4 (1-149)||(48656903-48657057)
chr4 (1-104)||(38535607-38535711)
chr4 (18-117)||(53098403-53098503)
chr4 (63-129)||(45760847-45760913)
chr4 (53-118)||(24719952-24720017)
chr4 (1-49)||(16955425-16955473)
chr4 (73-120)||(11562936-11562983)
chr4 (14-99)||(747812-747898)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-150)||(39434632-39434782)
chr8 (1-149)||(3187935-3188083)
chr8 (1-144)||(38815259-38815403)
chr8 (8-150)||(500200-500342)
chr8 (1-149)||(24124993-24125142)
chr8 (15-155)||(6592554-6592695)
chr8 (53-153)||(25021803-25021903)
chr8 (2-153)||(35739975-35740127)
chr8 (79-150)||(8882371-8882442)
chr8 (1-99)||(43823954-43824053)
chr8 (63-128)||(10189571-10189636)
chr8 (8-105)||(3863289-3863387)
chr8 (53-150)||(8619832-8619929)
chr8 (2-153)||(4699837-4699986)
chr8 (77-134)||(6618326-6618383)
chr8 (1-149)||(28196157-28196306)
chr8 (1-112)||(37514186-37514298)
chr8 (63-150)||(42922119-42922206)
chr8 (53-143)||(36004140-36004230)
chr8 (1-50)||(3821189-3821238)
chr8 (57-108)||(27713949-27714000)
chr8 (53-143)||(39671170-39671261)
chr8 (63-149)||(166187-166273)
chr8 (70-151)||(8115846-8115927)
chr8 (104-149)||(37517163-37517208)
chr8 (54-130)||(12320200-12320276)
chr8 (71-149)||(4073571-4073649)
chr8 (1-39)||(42659192-42659230)
chr8 (102-155)||(22589341-22589394)
chr8 (63-108)||(27715376-27715421)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (1-150)||(13166902-13167052)
chr5 (217-365)||(7936533-7936674)
chr5 (1-150)||(35310413-35310563)
chr5 (1-150)||(27336660-27336808)
chr5 (8-150)||(37873630-37873773)
chr5 (2-149)||(25663025-25663173)
chr5 (1-119)||(430567-430686)
chr5 (1-155)||(33692042-33692196)
chr5 (32-150)||(14423678-14423793)
chr5 (26-150)||(43129524-43129649)
chr5 (32-151)||(34335333-34335453)
chr5 (53-153)||(35455974-35456074)
chr5 (1-150)||(26212575-26212725)
chr5 (1-128)||(42921662-42921790)
chr5 (8-149)||(38875610-38875752)
chr5 (64-149)||(3114156-3114241)
chr5 (1-149)||(32269790-32269939)
chr5 (8-150)||(15292018-15292160)
chr5 (70-150)||(32230499-32230579)
chr5 (88-150)||(8858969-8859031)
chr5 (77-129)||(43115470-43115522)
chr5 (114-155)||(433371-433412)
chr5 (1-149)||(8100517-8100666)
chr5 (53-117)||(14723269-14723333)
chr5 (63-142)||(16017202-16017281)
chr5 (63-143)||(14436528-14436605)
chr5 (87-120)||(9829374-9829407)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-153)||(26772723-26772876)
chr3 (1-135)||(38670887-38671022)
chr3 (1-155)||(52741499-52741654)
chr3 (1-150)||(44198732-44198882)
chr3 (1-155)||(39583216-39583371)
chr3 (1-150)||(53785674-53785824)
chr3 (3-150)||(7900825-7900973)
chr3 (1-150)||(37132991-37133141)
chr3 (1-141)||(32546760-32546901)
chr3 (1-129)||(52411904-52412033)
chr3 (1-135)||(51234581-51234716)
chr3 (1-125)||(26856779-26856904)
chr3 (1-149)||(38146021-38146170)
chr3 (8-150)||(3443304-3443447)
chr3 (53-151)||(7502002-7502101)
chr3 (71-150)||(46940762-46940841)
chr3 (1-150)||(4473027-4473176)
chr3 (1-153)||(38978788-38978941)
chr3 (66-153)||(37992363-37992450)
chr3 (14-114)||(21552646-21552746)
chr3 (8-114)||(5338615-5338722)
chr3 (87-144)||(49018015-49018072)
chr3 (71-119)||(54508407-54508455)
chr3 (1-48)||(4763888-4763935)
chr3 (1-155)||(13582475-13582629)
chr3 (3-50)||(44803-44850)
chr3 (101-150)||(45676779-45676828)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-155)||(28517274-28517429)
chr7 (1-150)||(21326830-21326980)
chr7 (1-155)||(19277258-19277413)
chr7 (1-146)||(40726476-40726622)
chr7 (1-155)||(982914-983069)
chr7 (1-149)||(5825238-5825385)
chr7 (8-152)||(24527561-24527706)
chr7 (1-144)||(27521436-27521580)
chr7 (1-155)||(4501224-4501378)
chr7 (8-150)||(43856846-43856989)
chr7 (1-150)||(22197952-22198101)
chr7 (1-150)||(22239720-22239869)
chr7 (8-155)||(30216045-30216193)
chr7 (1-155)||(10905083-10905237)
chr7 (1-115)||(48539146-48539261)
chr7 (1-149)||(32584565-32584715)
chr7 (23-135)||(9281138-9281251)
chr7 (23-135)||(9292109-9292222)
chr7 (71-155)||(3676675-3676759)
chr7 (63-150)||(2904393-2904480)
chr7 (8-126)||(45613858-45613977)
chr7 (79-153)||(25186925-25186999)
chr7 (81-150)||(42295176-42295245)
chr7 (33-146)||(47679122-47679236)
chr7 (79-151)||(34772825-34772897)
chr7 (15-120)||(10032193-10032299)
chr7 (77-149)||(7637505-7637576)
chr7 (63-149)||(34067855-34067940)
chr7 (7-40)||(1249623-1249656)
chr7 (1-50)||(25187024-25187073)
chr7 (63-108)||(30659351-30659396)
chr7 (1-29)||(38766274-38766302)
chr7 (87-143)||(43383221-43383277)
chr7 (1-33)||(45003007-45003039)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (1-150)||(34644531-34644681)
chr1 (2-150)||(28041119-28041268)
chr1 (1-150)||(21472968-21473118)
chr1 (1-153)||(2764444-2764597)
chr1 (1-153)||(29169782-29169935)
chr1 (3-150)||(31737315-31737463)
chr1 (1-151)||(22346860-22347011)
chr1 (1-106)||(47459647-47459753)
chr1 (1-155)||(45659635-45659788)
chr1 (52-155)||(19035464-19035567)
chr1 (1-150)||(20259789-20259939)
chr1 (17-129)||(38731590-38731703)
chr1 (8-150)||(4861981-4862124)
chr1 (1-149)||(2898667-2898819)
chr1 (8-127)||(24177526-24177646)
chr1 (20-147)||(50314619-50314747)
chr1 (63-150)||(25375825-25375912)
chr1 (87-150)||(50161409-50161472)
chr1 (36-143)||(16500034-16500142)
chr1 (71-149)||(15584910-15584988)
chr1 (92-149)||(35387653-35387710)
chr1 (70-149)||(36486921-36487000)
chr1 (8-149)||(42919832-42919973)
chr1 (87-149)||(23043929-23043991)
chr1 (64-150)||(37200012-37200097)
chr1 (1-50)||(48841175-48841224)
chr1 (72-129)||(23993473-23993530)
chr1 (3-129)||(18616166-18616293)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (1-155)||(4413053-4413208)
chr2 (1-155)||(28224965-28225120)
chr2 (1-155)||(41867895-41868050)
chr2 (1-150)||(44686381-44686535)
chr2 (1-150)||(9685407-9685557)
chr2 (1-135)||(34814826-34814960)
chr2 (1-155)||(17344603-17344758)
chr2 (1-155)||(27502327-27502482)
chr2 (8-140)||(18744956-18745089)
chr2 (1-150)||(23484930-23485078)
chr2 (17-155)||(5532401-5532539)
chr2 (1-150)||(19161775-19161925)
chr2 (63-146)||(2888544-2888627)
chr2 (1-153)||(16351830-16351986)
chr2 (1-114)||(20142753-20142867)
chr2 (1-129)||(32029099-32029228)
chr2 (66-149)||(3968402-3968485)
chr2 (10-125)||(2886632-2886748)
chr2 (15-118)||(10579803-10579907)
chr2 (63-134)||(33612555-33612626)
chr2 (70-150)||(13147089-13147172)
chr2 (15-94)||(8036530-8036610)
chr2 (75-149)||(29808115-29808188)
chr2 (87-155)||(5679330-5679398)
chr2 (72-139)||(44720360-44720427)
chr2 (1-150)||(7760838-7760987)
chr2 (1-50)||(13413316-13413365)
chr2 (1-46)||(44684955-44685000)
chr2 (91-155)||(1296037-1296101)
chr2 (289-365)||(9107576-9107652)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-150)||(6299-6449)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-149)||(33215-33364)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-139)||(103078-103209)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (77-149)||(49453-49525)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (8-150)||(10333-10479)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (70-150)||(176-256)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (77-134)||(7644-7701)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (63-129)||(8529-8595)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (8-149)||(18358-18499)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (81-150)||(47531-47600)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (92-155)||(16191-16254)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17249447 - 17249297
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17249447 agacataacattgctatacataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 17249348  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17249347 gcatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccactttgtttgac 17249297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33220853 - 33220704
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33220853 agacacaacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaacaacctcggatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 33220754  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33220753 gcatgttgattgtcaacacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 33220704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34304461 - 34304616
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34304461 agacatgatattgctatgcataactctttggactctatgtagaaggtcaacatcatctgatgctaggaagcccaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 34304560  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||    
T  34304561 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggttattttgcttgacgcagc 34304616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45819 - 45670
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || || ||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  45819 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaa 45720  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  45719 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgatcactttgcttga 45670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4206737 - 4206588
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4206737 gacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaag 4206638  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4206637 catgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgac 4206588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4166063 - 4165919
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4166063 gacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaag 4165964  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4165963 catgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgc 4165919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 34415408 - 34415556
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| | || || |||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34415408 acattgctatgcatgaccatttgaactctatatagaaggtcaactgcatttggtgttaggaaacctaaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagcatgtt 34415507  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  34415508 gattgtcagaacacactttctcatgtttcgccattttgcttgacgcagc 34415556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 357854 - 357709
Alignment:
Q  5 ataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||| |||||| | |||| ||| |||| |||| | |||||||||||    
T  357854 ataacattgctatgcttaatcatttggactctatgtagaaggtcatcaacctctaatgttaggaaac-aaaagtgttaaaaacaaaggttataaaagcat 357756  T
Q  104 gttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  357755 gttcattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 357709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 959546 - 959698
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||   |||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||     
T  959546 agacacaacattgctatgcatgaccttttgaact-tacgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaaatgtcaaaaacaaatggtataaag 959644  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  959645 acatgttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccactttgcttgacaca 959698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29338214 - 29338068
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  ||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29338214 acattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaacgatctctggtgctaggaagtcagaagtgtcaaaagcaaatggtataagagcatgtt 29338115  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29338114 gattgttagaacacgttttctcatgtttggcagctttgcttgacaca 29338068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34554419 - 34554269
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| | |||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  34554419 agacatgatattgctatacatgaccttttaaactctatgtagaaagtcaatagcatctggtgctaggaagccgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaaa 34554320  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  34554319 acatcttgattatcagaacacgctttctcatgtttggtcgttttgcttgac 34554269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 34168913 - 34168983
Alignment:
Q  80 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34168913 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgcttgtccaaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgac 34168983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Original strand, 24016365 - 24016437
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttg 135  Q
    |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  24016365 taggaaaccaaaactatcaatagcaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacaagctttctcatgtttg 24016437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28009065 - 28008979
Alignment:
Q  67 aagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagca---tgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  28009065 aagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaccatattcttgattgttagaacaagctttctcatgtttgaccgctttgcttgac 28008979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 28543394 - 28543490
Alignment:
Q  54 ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28543394 ctctaatgctaggaagctgaaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcatagtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccactttgcttgac 28543490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13398317 - 13398199
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcct-ctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||   || |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  13398317 acattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtcaacaacttctgatgttaggaagtcaaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatgtt 13398218  T
Q  107 gattgtcagaacacgcttt 125  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  13398217 gattgtcggaacatgcttt 13398199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 22985890 - 22986035
Alignment:
Q  5 ataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcat 103  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |     
T  22985890 ataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacacaagtagtataaaagtac 22985989  T
Q  104 gttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||| || |||| | |||||||| |||| ||| | |||||||    
T  22985990 gttgattgccataacatgttttctcacatttgaccaatctgcttga 22986035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23802504 - 23802359
Alignment:
Q  5 ataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcat 103  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |     
T  23802504 ataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacacaagtagtataaaagtac 23802405  T
Q  104 gttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||| || |||| | |||||||| |||| ||| | |||||||    
T  23802404 gttgattgccataacatgttttctcacatttgaccaatctgcttga 23802359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26225654 - 26225602
Alignment:
Q  67 aagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 119  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26225654 aagccaaaaatgtcaaacataactggtaaaaaagcatgttgattgtcagaaca 26225602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 12401384 - 12401446
Alignment:
Q  88 aatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  12401384 aatggtatataagcatgttgattagcaaaacacgctatcttatgtttggccactttgtttgac 12401446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 53619551 - 53619706
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53619551 agacataacattgttatgcataaccctttagactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 53619650  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  53619651 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc 53619706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50001068 - 50000912
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtat-aaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  50001068 agacataacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaagcaaattgtattaaa 50000969  T
Q  99 agcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50000968 agcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 50000912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 3329961 - 3330077
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3329961 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaa 3330060  T
Q  100 gcatgttgattgtcaga 116  Q
    |||||||||||||||||    
T  3330061 gcatgttgattgtcaga 3330077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 23255678 - 23255819
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||         ||||||||||||||    
T  23255678 agacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctatgatgctaagaagtcaaaaa---------caaatggtataaaa 23255768  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23255769 gcatgttaattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 23255819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 55933602 - 55933454
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55933602 agacataatattgttatgtataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaac-ctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaag 55933504  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  55933503 catgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgac 55933454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 31847072 - 31847207
Alignment:
Q  21 taaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  31847072 taaccgtttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactgtcagaaca 31847171  T
Q  120 cgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
     | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31847172 tggtttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 31847207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46441031 - 46440881
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtca-atgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46441031 agacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtcagcagcttctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaa 46440932  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     | |||| ||||| ||||||| |||| | | ||||| |||||||| |||||    
T  46440931 acgtgttaattgttagaacacacttttttatgtttgaccactttgtttgac 46440881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 600834 - 600683
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||| | ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  600834 agacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaa 600735  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  600734 gcatgttaattgttagaacacgttttctcatgtttggtcactttgcttgaca 600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 56462248 - 56462099
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  56462248 agacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtctaaaacaaatggtataaaa 56462149  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  56462148 acatgttgattgtcagaacacgctttatcatgttt-gccactttgtttgac 56462099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 26521455 - 26521603
Alignment:
Q  3 acataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagc 101  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||||| |||  |||||| ||| |||||||||    
T  26521455 acatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccaaaagtgttgaaagcatatgatataaaagc 26521554  T
Q  102 atgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  26521555 atgttgattgtcataacacgttttttcatgtttagccactttgtttgac 26521603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 132350 - 132505
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||||| |||||    |||||||  |||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  132350 agacatgacattgttatgcttgaccctttaaactctgtgtagaatgtcaacaatctctgatattaggaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaa 132449  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  132450 gcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgttttgccattttgcttgacgcagc 132505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 39001362 - 39001448
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagc 86  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  39001362 agacacaacattgttatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatcctaggaagccaaaagtgtcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30940803 - 30940731
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  30940803 tgtcaaaagcaa-tggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccactttacttgac 30940731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34107838 - 34107694
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34107838 agacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 34107739  T
Q  100 gcatgttgattgtcaga--acacgctttctcacgtttggccactt 142  Q
     |||||||||| || ||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34107738 acatgttgattatctgaacacacgttttctcatgtttggccactt 34107694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 53170478 - 53170615
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||| || || ||| ||||||||||||||       ||    
T  53170478 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctagcaaaccgaaagtgtcaaaagcaaat------caa 53170571  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccacttt 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53170572 gcatgttgactgtcagaacacgctttctcatgtttggctacttt 53170615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 25504260 - 25504408
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||  ||||||| || ||||||||  | ||||  || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25504260 agacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtcaacagtctctagtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaacggtataaaa 25504359  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25504360 acatgtcgattgttagaacacgttttctcatgtttgacca-tttgcttga 25504408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 50483312 - 50483211
Alignment:
Q  27 tttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgcttt 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50483312 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattgtcagaagacgcttt 50483213  T
Q  126 ct 127  Q
    ||    
T  50483212 ct 50483211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6865962 - 6865834
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||   | |||  || || |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6865962 agacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaa 6865863  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctc 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6865862 gcatgttgatagtcagaacacgttttctc 6865834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45386203 - 45386053
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| | | || ||||||||| |||| |||||  || ||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  45386203 agacacaacattgttatgcatgaccctttgaattttaggtagaaggttaatgacctcttgtgctagaaagccaaaagtttcaaatgtaaatggtataaaa 45386104  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
      |  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  45386103 agaaattgattgtcagaacacgctttcttatgtttgaccactttccttgac 45386053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50463080 - 50462938
Alignment:
Q  9 cattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttg 107  Q
    ||||| |||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||  | ||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50463080 cattgttatgcatggccctttaaactctacgtagaaggtcaacagtctctggtgtaaggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaaagcatgttg 50462981  T
Q  108 attgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  50462980 attgtcggaagacactttctcatgtttggtcatcttgcttgac 50462938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12918485 - 12918364
Alignment:
Q  30 ggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctc 128  Q
    ||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  12918485 ggactctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtgttgattgtcagaacacgatttctt 12918386  T
Q  129 acgtttggccactttgcttgac 150  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  12918385 atgtttgaccactttgtttgac 12918364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7536713 - 7536590
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| |  ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  7536713 agacataaaattgctatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaactgaaattgtcaaaaacaaattgtataaaa 7536614  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgct 123  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  7536613 acatgttgattgtcaaaacacgct 7536590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 4419228 - 4419310
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaa 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  4419228 agacataacattgttatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctacgaagccgaaagtgtcaa 4419310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 16957584 - 16957653
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgct 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  16957584 tgtcaaaagcaaatggtatataagcatgttgattatcagagcacactttctcatgtttggtcattttgct 16957653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43849427 - 43849350
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccac 140  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43849427 taggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgttggttatctgaacacgctttctcgtgtttggccac 43849350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 48657057 - 48656903
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtag----aaggtcaa-tgcctctgat-ggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggta 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||   ||||| || | || |||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  48657057 agacataacattgctatgcataatcatttggactctatgtagaaggaaggtcaacaacctctaatcgctaagaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggta 48656958  T
Q  95 taaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  48656957 taaaaacattttgattgacataacacactttctcatgtttgtccattttacttga 48656903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38535711 - 38535607
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||   |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  38535711 agacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaacaacctctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaatgcaaatggtataaga 38535612  T
Q  100 gcatg 104  Q
    |||||    
T  38535611 gcatg 38535607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Original strand, 53098403 - 53098503
Alignment:
Q  18 gcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcaga 116  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  53098403 gcatgaccatttgaactctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaaggaaacggttcaaaaacatgttgattgtcaga 53098502  T
Q  117 a 117  Q
    |    
T  53098503 a 53098503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 45760913 - 45760847
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45760913 taggaagtcaaaaatgtcaaatgcaaaagatataaaaatatgttgattgtcaaaacacgctttctca 45760847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 24719952 - 24720017
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaac 118  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24719952 cctctgttgttaggaagacaaaagtgtcaaacacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaac 24720017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16955425 - 16955473
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtca 49  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16955425 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtca 16955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Original strand, 11562936 - 11562983
Alignment:
Q  73 aaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacac 120  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11562936 aaaatgtctaaagtaaatgatataaaagcatgttgattgtccgaacac 11562983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 747898 - 747812
Alignment:
Q  14 ctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||   ||||||||  || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  747898 ctatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatattaagaaaccagaaatatcaaaagcaaatggtataaaa 747812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 39434632 - 39434782
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39434632 agacattacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaaatgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 39434731  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39434732 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 39434782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 3187935 - 3188083
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3187935 agacataacattgctatgcataaccctttg-actctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaa 3188033  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  3188034 gcatgttgattgtcagaacacgcttcctcatgttttgccactttgcttga 3188083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 38815259 - 38815403
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38815259 agacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaccctctggtgctaggaagcggaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 38815358  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38815359 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttg 38815403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 500200 - 500342
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttg 107  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  500200 acattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaacacctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttg 500299  T
Q  108 attgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  500300 attgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgcttgac 500342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 24124993 - 24125142
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||   |||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24124993 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaatcaaaattgtcaaaagcaaatggtataaaa 24125092  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24125093 gcatgttgattgtcagagcacgctttctcatgtttggccattttgcttga 24125142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 6592554 - 6592695
Alignment:
Q  15 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 113  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||   ||||||  | |||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  6592554 tatgcatgaccttttgaactctatgcagaaggtcaacaacctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtg 6592653  T
Q  114 agaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6592654 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc 6592695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25021903 - 25021803
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacac 152  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  25021903 cctctggtgctaggaagccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacacactttctcatatttcaccactttgcttgacac 25021804  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  25021803 a 25021803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35740127 - 35739975
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    ||||| || |||||| |  ||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  35740127 gacatgacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagctaattgtataaaaa 35740028  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35740027 catgttgattgtcagaacccgctttctcatgtttggccactttgcttaacaca 35739975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Original strand, 8882371 - 8882442
Alignment:
Q  79 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8882371 tcaaaaacaaatggtttaaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 8882442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 43823954 - 43824053
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43823954 agacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 43824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 10189571 - 10189636
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10189571 taggaagccaaaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacatgctttctc 10189636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 3863289 - 3863387
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgt 105  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  3863289 acattgctatgcactaccctttgaactctatgtagaaggtcaataacctctggtcctaggaagccaaaagtgtcacatgcaaatggaataaaagcatgt 3863387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Original strand, 8619832 - 8619929
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  8619832 cctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacgttgattgtcaaaatacgctttttcatgtttgaccattttacttgac 8619929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 4699837 - 4699986
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||| || || |||||||||| ||| || | |||||||| |||||     
T  4699837 gacataatattgctattcatgacc-tttgaactttatatagaaggtcaacagcctctggtgctatgaagccaaaagtgttaaca-caaatggtgtaaaaa 4699934  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4699935 catgttaattgtgagaacacgc-ttatcatgtttggccactttgcttgacaca 4699986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Original strand, 6618326 - 6618383
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgttt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6618326 tgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 6618383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 28196157 - 28196306
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||   ||| || || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28196157 agacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtcaacaacctatggtgctaggaagacaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 28196256  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     |||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  28196257 acatgtttattatcataacacactttctcatgtttagccgctttacttga 28196306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 37514186 - 37514298
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||    ||| |||||||||||||| |||||||     
T  37514186 agacgtaacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggcgctaggaaattgaaagtgtcaaaagcaaatagtataaac 37514285  T
Q  100 gcatgttgattgt 112  Q
    |||||||||||||    
T  37514286 gcatgttgattgt 37514298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42922206 - 42922119
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||| |||| |||||    
T  42922206 taggaagccaaaagtgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattgtcaaaacacgttttctcaaatttgaccattttgtttgac 42922119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 36004140 - 36004230
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccacttt 143  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||  ||| ||||||||    
T  36004140 cctctggtgataggaagtcaaaaatgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacgcactttgtcatatttagccacttt 36004230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 3821189 - 3821238
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa 50  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3821189 agacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaa 3821238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27714000 - 27713949
Alignment:
Q  57 tgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27714000 tgatgctaggaagccaaaaatatcaaacgtaaatggtataaaagcatgttga 27713949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39671261 - 39671170
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagc-aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccacttt 143  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  39671261 cctctggtgctaggaagccgaaaatgtaaaaaaataaattgtataaaaacatgttaattgtcaaaacacgctttctctggtttggccacttt 39671170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 149
Target Start/End: Original strand, 166187 - 166273
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  166187 taggaagccaaaaatttcaaacgtaaatagtatgaaaatatgtttgttgtcagaacacgctttctcatgattggacactttgtttga 166273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Original strand, 8115846 - 8115927
Alignment:
Q  70 ccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||| | ||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  8115846 ccaaaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagtatattgattattagaacaagatttcttacgtttgaccactctgattgaca 8115927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 37517163 - 37517208
Alignment:
Q  104 gttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37517163 gttgattgtcggaacaccctttctcatgtttggccactttgcttga 37517208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 130
Target Start/End: Original strand, 12320200 - 12320276
Alignment:
Q  54 ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcac 130  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12320200 ctctaatgctaggaagctgaaaatatcaaaaataaatggtacaaaagtatgttgattgtcggaacacgatttctcac 12320276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 149
Target Start/End: Original strand, 4073571 - 4073649
Alignment:
Q  71 caaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  4073571 caaaagtgtcaaatgcaaattgtataaaatcatgttgattggtaaaacacgttttctcttgtttgaccactttgtttga 4073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 42659192 - 42659230
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatg 39  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42659192 agacataatattgctatgcataaccctttagactctatg 42659230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22589394 - 22589341
Alignment:
Q  102 atgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||    
T  22589394 atgttggttgtcagaacacgctttctcatgttcagccattttgcttgacgcagc 22589341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Original strand, 27715376 - 27715421
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga 108  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27715376 taggaagctaaaaatatcaaacgtaaatggtataaaagcatgttga 27715421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13167052 - 13166902
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13167052 agacataccattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 13166953  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13166952 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgac 13166902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7936674 - 7936533
Alignment:
Q  217 agatgctatattgtatttgtaccaagataatggtggtaacaaaaacccaataccctttacatataaaaaattccaatatccttgaccttgaatgtggcat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||       |||| ||||||||||||||    
T  7936674 agatgctatattgtatttgtaccaagataatggtggtaacaaaaacccaatacccttcatatataaaacattcc-------ttgatcttgaatgtggcat 7936582  T
Q  317 tacggctgtagctaaattatttcaaagaagcttactagccggttattgt 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7936581 tacggctgtacctaaattatttcaaagaagcttactagccggttattgt 7936533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 35310413 - 35310563
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35310413 agacataacattgatatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaacagcctctgatgccaggaagccgaaagtgtcaaaagcagatggtataaaa 35310512  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35310513 gcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgac 35310563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 27336660 - 27336808
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27336660 agacataacattgctatacataaccatttt--ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 27336757  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27336758 gtatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttgaccactttgcttgac 27336808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37873773 - 37873630
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37873773 acattgttctgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgtt 37873674  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37873673 gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 37873630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25663173 - 25663025
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcct-ctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     
T  25663173 gacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaacaacttctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaa 25663074  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25663073 catgttgattatcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttga 25663025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 430567 - 430686
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  430567 agacataacattactatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctatgaagacaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 430666  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  430667 gcatgttgattgtcagaaca 430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33692196 - 33692042
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33692196 agacataacattgttatgcata-ccctttggacactatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaagaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtacaaaa 33692098  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33692097 gcatgttgattgtcataacacgttttgtcatgtttggccactttgcttgacgcagc 33692042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 14423678 - 14423793
Alignment:
Q  32 actctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcac 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14423678 actctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctaggag----aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcat 14423773  T
Q  131 gtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  14423774 gttcggtcactttgcttgac 14423793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 43129524 - 43129649
Alignment:
Q  26 ctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctt 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||   | |||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43129524 ctttgaactctctgtagaaggtcaaaaacatctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattgtcagaacacgttt 43129623  T
Q  125 tctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43129624 tctcatgtttgaccactttgcttgac 43129649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 34335333 - 34335453
Alignment:
Q  32 actctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcac 130  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||  || ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  34335333 actctatgtagaaggtcaacagcctctggtgtcagaaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcaggacacgctttctcat 34335432  T
Q  131 gtttggccactttgcttgaca 151  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  34335433 gtttggcccttttgcttgaca 34335453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 153
Target Start/End: Original strand, 35455974 - 35456074
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacac 152  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||    
T  35455974 cctctggtgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttgaccattttacttaacac 35456073  T
Q  153 a 153  Q
    |    
T  35456074 a 35456074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26212725 - 26212575
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||| |  |||  || |||| ||||||||||||||    
T  26212725 agacataatattgccatacatgacattttgaactctatgtagaaggttaatagcctctggtgctaagaaactgaaagggtaaaaaacaaatggtataaaa 26212626  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26212625 gcatgttgatcgtcagaatacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 26212575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 42921662 - 42921790
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||   |||||| || |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42921662 agacatgacattgttatgcatgaccttctgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcataagcaaatggtataaaa 42921761  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctc 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42921762 gcatgttgattgtcagaacacgttttctc 42921790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 38875610 - 38875752
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||| || ||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  38875610 acattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgctaggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatggtacaaaaacatgtt 38875709  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  38875710 gattgtcagaacacactttctcatgtttggtcgctttgtttga 38875752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3114241 - 3114156
Alignment:
Q  64 aggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3114241 aggaaaccaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgtttga 3114156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32269939 - 32269790
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||||||||   |||||  || ||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  32269939 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaatcgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaa 32269840  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  32269839 gcgtgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgaccactttggttga 32269790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15292160 - 15292018
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||| |||||  |||||  || ||| || | |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15292160 acattgctatgcatgaccttttgaacttt-tgtagaagatcaataacctctagtgctagaaaactaaaagtgtaaaaaacaaattgtataaaaacatgtt 15292062  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15292061 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgtttgac 15292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32230579 - 32230499
Alignment:
Q  70 ccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32230579 ccaaaagtgtcgaacgcagatggtataaaagcttgttgattgtcagaacacattttctcatgtttggtcactttgcttgac 32230499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 8858969 - 8859031
Alignment:
Q  88 aatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8858969 aatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgactactttgcttgac 8859031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43115522 - 43115470
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43115522 tgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattgtcaaaacacgctttctca 43115470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 155
Target Start/End: Original strand, 433371 - 433412
Alignment:
Q  114 agaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  433371 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagc 433412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 8100517 - 8100666
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| |  ||||  |||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||||||   ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8100517 agacatgacattgatatgcatgaatctttaaactctacgtagaaggtcaacaacctctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaa 8100616  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  8100617 gcatgtaaattgtcacaacacgttttctcatgtttgaccattttacttga 8100666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14723333 - 14723269
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaa 117  Q
    ||||||||| ||  || |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14723333 cctctgatgctaaaaaaccaaaagtgtaaaaaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaa 14723269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Original strand, 16017202 - 16017281
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactt 142  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  16017202 taggaagccaaaagtatcaaacgcaaatagtattaaatcatgttgattattagaacacactttctcatatttggcaactt 16017281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 143
Target Start/End: Original strand, 14436528 - 14436605
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccacttt 143  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14436528 taggaagtcaaaggtgtcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgatt---agaacacgttttttcatgtttggccacttt 14436605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9829407 - 9829374
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9829407 aaatggtataaaagcatgttgattgtcaaaacac 9829374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 26772723 - 26772876
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26772723 agacataacattgttatgcataatcctttgtactctatatagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 26772822  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26772823 gcatgttgattgtcagaacacgttttctgatgtttggccactttgcttgacaca 26772876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38671022 - 38670887
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  38671022 agacataacattgctatgcataactctttagactctatgtagaaggtcatccgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaaacaaattgtataaaa 38670923  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38670922 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52741654 - 52741499
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52741654 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 52741555  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||    
T  52741554 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggtcaatttgtttgactcagc 52741499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44198732 - 44198882
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| | || || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44198732 agacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtcaacagcctcgggtgttaagaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 44198831  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44198832 gcatgttgattctcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 44198882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39583371 - 39583216
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||| || ||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  39583371 agacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgcagaaggtcaacaacctatgatgctaggaaaccgaaagtgtcgaaaacaaatgatataaaa 39583272  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  39583271 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc 39583216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 53785674 - 53785824
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53785674 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 53785773  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  53785774 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgac 53785824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 7900825 - 7900973
Alignment:
Q  3 acataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagc 101  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7900825 acataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagc 7900924  T
Q  102 atgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  7900925 atgttgattgtcagaaaacgctttctcatgttcggctattttgcttgac 7900973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37133141 - 37132991
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||   |||||| || || ||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  37133141 agacatgacattgctatgcatgacctttagaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaa 37133042  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37133041 acatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttaaccactttgcttgac 37132991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 32546760 - 32546901
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||| || || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32546760 agacatgacattactatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctttggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 32546859  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccact 141  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32546860 gtatgttgattgtccgaacacgctttctcatgtttggccact 32546901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 52412033 - 52411904
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||  || ||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52412033 agacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacgacatctagtgttagaaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaa 52411934  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52411933 gcatgttgattgtcagaacacgctctctca 52411904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 51234581 - 51234716
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  51234581 agacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtataaaa 51234680  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttg 135  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  51234681 gcatgttggttgtcataacatgctttttcatgtttg 51234716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26856904 - 26856779
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||  | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  26856904 agacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctagtgctaggaaatcgaaagcgtcaaaagcagatggtataaaa 26856805  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgcttt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26856804 gcatgttgattgtcacaacacgcttt 26856779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 38146021 - 38146170
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||   |||||| || ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  38146021 agacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaaacaacctctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaa 38146120  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     |||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||| ||||    
T  38146121 acatgttgattgtcaaaacacgttgtctcgcgtttgaccactttgattga 38146170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3443447 - 3443304
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||  || |||||| |  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3443447 acattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaactgaaagtgtcaacagaaaatggtataaaagcatgtt 3443348  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3443347 gattgttagaatacactttttcatgtttggccattttgcttgac 3443304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7502101 - 7502002
Alignment:
Q  53 cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag-catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  7502101 cctctggtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctcatgtttgaccactttacttgaca 7502002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46940841 - 46940762
Alignment:
Q  71 caaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46940841 caaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcggaacatgttttctaatgtttggccactttgcttgac 46940762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 4473027 - 4473176
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    |||||| | |||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||    |||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  4473027 agacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtagaaggttaagaattctggtgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaa 4473126  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  4473127 catattgatggttagaacacgctttttcatgttttgacactttgcttgac 4473176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38978941 - 38978788
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||| | || |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  38978941 agacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtcaacggcctcaggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaa 38978842  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
     ||| |||||||||| || ||| |||| || || |  ||| |||||||||||||    
T  38978841 acatattgattgtcaaaatacgttttcacatgtctaaccaatttgcttgacaca 38978788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 37992363 - 37992450
Alignment:
Q  66 gaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  37992363 gaagccaaaaccatcaaaagtaaatgatataaaatcatgttgattgtcagaacatgcttcctcatgtttggtcactttgtttgacaca 37992450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 21552646 - 21552746
Alignment:
Q  14 ctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgt 112  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21552646 ctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaaactgaaaatgtcaaaaataaatggtat-aaagcatgttgattgt 21552744  T
Q  113 ca 114  Q
    ||    
T  21552745 ca 21552746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 5338615 - 5338722
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    ||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5338615 acattgctacgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaacaatctctagtgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagcatgtt 5338714  T
Q  107 gattgtca 114  Q
    || |||||    
T  5338715 gactgtca 5338722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 49018015 - 49018072
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttg 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  49018015 aaatggtataaaaacatgttgattgttagaacacactttctcatgtttggtcactttg 49018072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 54508455 - 54508407
Alignment:
Q  71 caaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54508455 caaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattgtcagaaca 54508407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 4763935 - 4763888
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtc 48  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4763935 agacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 13582475 - 13582629
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctct-gatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    | | | || ||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  13582475 agacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctgtagaaggtcaacaattgttggtgctaggaaatcaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaa 13582573  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
     || ||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||| ||||    
T  13582574 acacgttgattgtcagaacacactttcttatgtttgatcactttgattgacgcagc 13582629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Original strand, 44803 - 44850
Alignment:
Q  3 acataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa 50  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44803 acatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaa 44850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45676828 - 45676779
Alignment:
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||    
T  45676828 catgttgattgtcagaacacgttttcttatgcttggtcactttgcttgac 45676779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28517429 - 28517274
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28517429 agacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgtctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 28517330  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28517329 acatgttgattgtctaaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc 28517274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21326980 - 21326830
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21326980 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 21326881  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21326880 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 21326830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 19277258 - 19277413
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19277258 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 19277357  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19277358 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggctactttgcttgacgcagc 19277413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40726622 - 40726476
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40726622 agacatagcattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctatgaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 40726523  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgct 146  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||    
T  40726522 acatgttgattgtcagaacacattttattatgtttggccactttgct 40726476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 982914 - 983069
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||   |||||| || ||| || || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  982914 agacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaa 983013  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  983014 gcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc 983069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 5825238 - 5825385
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5825238 agacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggatgccgaaagtgtcaaaagtaaatggtataaaa 5825337  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||    
T  5825338 acatgttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg--cactttgcttga 5825385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 24527561 - 24527706
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||  || |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24527561 acattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctcgtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 24527660  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacac 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  24527661 gattgtcagaacacgttttctcatgttttcccactttacttgacac 24527706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 27521436 - 27521580
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||     
T  27521436 agacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagtaaattgtataaat 27521535  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27521536 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttg 27521580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 4501224 - 4501378
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||| || |||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  4501224 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaaccaaag-tgtcaaaagcaaattatataaaa 4501322  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4501323 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgacgcagc 4501378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 43856846 - 43856989
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43856846 acattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaattgtataaacgcatgtt 43856945  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  43856946 gattgtcaaaacacgctttctcatgtctagccactttgattgac 43856989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22197952 - 22198101
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  22197952 agacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaa 22198050  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22198051 acatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgac 22198101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22239869 - 22239720
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  22239869 agacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaa 22239771  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22239770 acatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgac 22239720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30216193 - 30216045
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||    |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30216193 acattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatcaacaaactctgatgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgtt 30216094  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||    
T  30216093 gattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccattttgcttgacgcagc 30216045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10905083 - 10905237
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    ||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10905083 agacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtcaacatactctggtgctaggcaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa- 10905181  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10905182 gcatgttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccactttgcttgacgcagc 10905237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 48539146 - 48539261
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||| || ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48539146 agacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatcaacagcctctggtgctagaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 48539245  T
Q  100 gcatgttgattgtcag 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  48539246 gcatgttgattgtcag 48539261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 32584565 - 32584715
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttgga-ctctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaa 98  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||   |||||| || |||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32584565 agacataacattgatatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacataaagtgtcaaaagcaaatggtgtaaa 32584664  T
Q  99 agcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  32584665 agcatcttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgtttga 32584715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9281251 - 9281138
Alignment:
Q  23 accctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacg 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   | |||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9281251 accctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacg 9281152  T
Q  122 ctttctcacgtttg 135  Q
    |||||||| |||||    
T  9281151 ctttctcatgtttg 9281138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9292222 - 9292109
Alignment:
Q  23 accctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacg 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   | |||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9292222 accctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacg 9292123  T
Q  122 ctttctcacgtttg 135  Q
    |||||||| |||||    
T  9292122 ctttctcatgtttg 9292109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Original strand, 3676675 - 3676759
Alignment:
Q  71 caaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  3676675 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatattgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccactttgcttgacgcagc 3676759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 2904393 - 2904480
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  2904393 taggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatgttgattgtcggaacatgctttctcatgtttgactattttgcttgac 2904480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45613977 - 45613858
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| || | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45613977 acattgttatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggctaacagcctctggtgcttggaaaccgaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaacatgtt 45613878  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttc 126  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  45613877 gattgtcagaacacactttc 45613858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25186999 - 25186925
Alignment:
Q  79 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  25186999 tcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattatcggaacacgctttctcatgttagaccactttacttgacaca 25186925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42295245 - 42295176
Alignment:
Q  81 aaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42295245 aaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggccattttgcttgac 42295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 47679122 - 47679236
Alignment:
Q  33 ctctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacg 131  Q
    |||||| |||||||||||   ||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||      
T  47679122 ctctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtatattgattgtgagaacacactttctcata 47679221  T
Q  132 tttggccactttgct 146  Q
    ||| | |||||||||    
T  47679222 ttttgtcactttgct 47679236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 151
Target Start/End: Original strand, 34772825 - 34772897
Alignment:
Q  79 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  34772825 tcaaaagcaaatggtataaaaacatattaattgtccgaacacactttctcatatttggctactttgattgaca 34772897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10032299 - 10032193
Alignment:
Q  15 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 113  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||   | ||| ||| || |||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  10032299 tatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggttaacaacatctaatgctaagaagctgaaaatatcaaaagcaaatagtataaaaacatattgattgtc 10032200  T
Q  114 agaacac 120  Q
    |||||||    
T  10032199 agaacac 10032193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7637576 - 7637505
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  7637576 tgtcaaacgcaaatggtataaaagcttattgatcgtcagagcacactttctcatg-ttgaccactttgcttga 7637505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34067940 - 34067855
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  34067940 taggaaaccaaaagtgtcaaatacaaatggcatagaaa-atgttgattgtcaaaacacactttctcatgtttggtcacttggcttga 34067855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 1249623 - 1249656
Alignment:
Q  7 aacattgctatgcataaccctttggactctatgt 40  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1249623 aacattgttatgcataaccctttggactctatgt 1249656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25187073 - 25187024
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa 50  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  25187073 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatatagaaggtcaa 25187024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30659396 - 30659351
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  30659396 taggaagtcaaaaatgtcaaaaacaaatgatataaaagcatattga 30659351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 38766274 - 38766302
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataacccttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38766274 agacataacattgctatgcataacccttt 38766302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 143
Target Start/End: Original strand, 43383221 - 43383277
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccacttt 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  43383221 aaatggcataaaagcatgttgattgctggaacatgctttctcatggttggccacttt 43383277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 45003039 - 45003007
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggac 33  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45003039 agacataacattgctatgcataactctttggac 45003007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 34644531 - 34644681
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34644531 agacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaa 34644630  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34644631 gcatgtaggttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgac 34644681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28041268 - 28041119
Alignment:
Q  2 gacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  28041268 gacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaa 28041169  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28041168 cctgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccactttgtttgac 28041119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21472968 - 21473118
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |   || |||||||||||||||||||||||    
T  21472968 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 21473067  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  21473068 acatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccattttacttgac 21473118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 2764444 - 2764597
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2764444 agacataacattgatttgcataaccctttggactttatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagaaaatggcataaaa 2764543  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  2764544 gcatgttgattgtcggaacacgttttctcatgtttgaccactttgtctgacaca 2764597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29169935 - 29169782
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||   |||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29169935 agacatgacattgctgtgcatgaccttttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 29169836  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  29169835 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacaca 29169782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31737463 - 31737315
Alignment:
Q  3 acataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagc 101  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31737463 acataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaatagcctctaatgctagaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagc 31737364  T
Q  102 atgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31737363 atgttgattgtcagaatatgttttctcatgtttggccactttgcttgac 31737315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22346860 - 22347011
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||   |||||| |  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  22346860 agacatgacatttctatgcatgaccttttgaactctgtgtagaaggtcaacaacctctgctactaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaaaggtataaac 22346959  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22346960 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatatttggccactttgcttgaca 22347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 47459647 - 47459753
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47459647 agacataacattgctatgcatattcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatactaggaagccaaaagtatcaaaagcaaatggtataaaa 47459746  T
Q  100 gcatgtt 106  Q
     ||||||    
T  47459747 acatgtt 47459753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45659788 - 45659635
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||||||  ||||||| || ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45659788 agacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--agaaggtcaacagcctctggtgataggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 45659691  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||    
T  45659690 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagc 45659635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 19035464 - 19035567
Alignment:
Q  52 gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgaca 151  Q
    ||||||| || |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19035464 gcctctggtgctaggaaaccgtaagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacg 19035563  T
Q  152 cagc 155  Q
    ||||    
T  19035564 cagc 19035567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20259939 - 20259789
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || || ||| || ||| |||||| |  |||||||||||||    
T  20259939 agacatgacattactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaacaataaatggtataaaa 20259840  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  20259839 acatgttgattgtcagaacacgctttctcatttttaaccactttgcttgac 20259789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 38731590 - 38731703
Alignment:
Q  17 tgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| || || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38731590 tgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaagaagccaaaagtttcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgattgtcag 38731689  T
Q  116 aacacgctttctca 129  Q
    ||||||||||||||    
T  38731690 aacacgctttctca 38731703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4862124 - 4861981
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctct-gatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || | | || ||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4862124 acattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggtgttaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagtatgtt 4862025  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  4862024 gcttgtcagaagacgctttctcatgtttgaccattttacttgac 4861981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 2898667 - 2898819
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| | |||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  2898667 agacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaa 2898766  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgct----ttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     | | |||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
T  2898767 ac-tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccactttgcttga 2898819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24177646 - 24177526
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24177646 acattgctatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtaaacagcctctgatgctaggaaaccgaaactgtcaaaaacaaatggtataaaaatatgtt 24177547  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttct 127  Q
    ||||||| | |||| ||||||    
T  24177546 gattgtcggtacacactttct 24177526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 50314747 - 50314619
Alignment:
Q  20 ataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcc-tctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaac 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||   | |||  || ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50314747 ataaccctttgaactctatgtagaaagtcaacaacatcttgtgttaggaaataaaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtgagaac 50314648  T
Q  119 acgctttctcacgtttggccactttgctt 147  Q
    | | ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  50314647 aagttttgtcatgtttgaccactttgctt 50314619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25375912 - 25375825
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  25375912 taggaagccaaaagtgtcaatagcaaatggtataaaaacatgttgatggtaagaacatgttttgtcatgtttggtcactttgcttgac 25375825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50161472 - 50161409
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50161472 aaatgatataaaagcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttgtccactttgcttgac 50161409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500142
Alignment:
Q  36 tatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgttt 134  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| |  |||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatgttaattgttagaacatgttttcttatattt 16500133  T
Q  135 ggccacttt 143  Q
    |||||||||    
T  16500134 ggccacttt 16500142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 149
Target Start/End: Original strand, 15584910 - 15584988
Alignment:
Q  71 caaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||  ||||||||||||    
T  15584910 caaaaatgtcaaacgcaaatggtatagaaacatgttgattgtcagaatacgttttccaatgtttgatcactttgcttga 15584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35387710 - 35387653
Alignment:
Q  92 gtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35387710 gtataaaagcttgttgatcgtcagaacacactttttcatgtttggccactttgcttga 35387653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 36486921 - 36487000
Alignment:
Q  70 ccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||    
T  36486921 ccaaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaagatattgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccactttacttga 36487000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 42919832 - 42919973
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggt---caatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||  ||||  || | ||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  42919832 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaat--ctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatg 42919929  T
Q  105 ttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  42919930 ttgattgtgagaacacg-tttctcatgtttggccgctttgtttga 42919973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 149
Target Start/End: Original strand, 23043929 - 23043991
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  23043929 aaatggtataaaagcatgttgattgtgagtacttgttttctcatatttggccactttgcttga 23043991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 37200012 - 37200097
Alignment:
Q  64 aggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  37200012 aggaagccaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacatattgattgttagcacatgctttcttatgtttgaccactttacttgac 37200097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 48841224 - 48841175
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa 50  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48841224 agacataacattattatgcataactctttagactctatgtagaaggtcaa 48841175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 23993473 - 23993530
Alignment:
Q  72 aaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  23993473 aaaaatgtcaaaaataaatcgtataaaaacatgttgattgtcggaatacactttctca 23993530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18616293 - 18616166
Alignment:
Q  3 acataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa-g 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||| |||||  ||||| | || ||| ||| | ||| ||| |||| ||||||||||||||      
T  18616293 acataatattgctatgcatgaccctttgaattatatgtagaatgtcaacagcctcgggtgctagaaagtcgaaagtgttaaaaacaaatggtataaaaca 18616194  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18616193 catgttgattatc-gaacacgttttctca 18616166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4413208 - 4413053
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4413208 agacatgactttgctatgcatgaccttttgaaccctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 4413109  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4413108 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagc 4413053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 28224965 - 28225120
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28224965 agacataatattgtcatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgaagctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 28225064  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  28225065 gcatgttgattgtcagaatacgctttctcatatttggtcactttgcttgacgcagc 28225120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41868050 - 41867895
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41868050 agacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 41867951  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  41867950 gcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 41867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44686381 - 44686535
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||   |||||||    
T  44686381 agacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaa 44686480  T
Q  100 gcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44686481 gcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 44686535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9685557 - 9685407
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |  ||||||  || ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9685557 agacatgacattgctatccatgaccttttgaactctatatagaaggtccacagcctctagtgctagaaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 9685458  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9685457 gcatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttggccactttgcttgac 9685407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34814960 - 34814826
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34814960 agacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaa-ccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaa 34814862  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttg 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34814861 gcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 34814826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 17344603 - 17344758
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||| || || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17344603 agacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctatggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 17344702  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||| || |||||| ||||    
T  17344703 gcatgttgattgtgaaaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagc 17344758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 27502327 - 27502482
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||| | ||| ||||||||   ||| ||||||||    
T  27502327 agacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtagaaggtcaacagtatatgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaaagcaattgtataaaa 27502426  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27502427 gcatgttgtttgtcggaacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 27502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18745089 - 18744956
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||  |||| || || ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18745089 acattgctatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgtt 18744990  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggccac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18744989 gattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 18744956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23485078 - 23484930
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaag 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||||  | |||| || ||||| || |||||| | | || |||||||| |||||||||||||||    
T  23485078 agacatagcattgttatgcatgatcttttgaactctatgtaagaagtcattgtctctggtgctaggaaac-agaagtgtcaaaaacaaatggtataaaag 23484980  T
Q  101 catgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  23484979 catgttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccactttgtttgac 23484930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 5532401 - 5532539
Alignment:
Q  17 tgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   ||| || || |||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  5532401 tgcatgaccctttgaactctatgtagaagctcaacaacctatggtgctaggaagctaaag-tgtcaaaagtaaatagtataaaagcatgttgattgtcac 5532499  T
Q  116 aacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5532500 aacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 5532539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19161925 - 19161775
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |   ||||||  || ||  || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19161925 agacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaagcagcctctagtgttacaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 19161826  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19161825 acatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttgcccacttttcttgac 19161775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 2888544 - 2888627
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgct 146  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2888544 taggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgtccactttgct 2888627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16351986 - 16351830
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaa---aatgtcaaaagcaaatggtata 96  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||   |||||||   |||||||||||||||   ||||    
T  16351986 agacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgataaagagccaaacaaaatgtcaaaagcaaacaatata 16351887  T
Q  97 aaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacaca 153  Q
    |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16351886 aaattatgttgattgtgagaacacattttctcatgtttgaccactttgcttgacaca 16351830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20142867 - 20142753
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20142867 agacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatggtataaaa 20142768  T
Q  100 gcatgttgattgtca 114  Q
    |||||||||||||||    
T  20142767 gcatgttgattgtca 20142753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32029228 - 32029099
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||  ||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  32029228 agacatgacattgttatggatgactctttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgaagttgggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatgatatgaaa 32029129  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32029128 gcatgttgattgtctgaacacacattctca 32029099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3968485 - 3968402
Alignment:
Q  66 gaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  3968485 gaagtcaaaaatgtcaaacgcaaattgtataaaagcatattgattgtcaaaacatgttttctcatatttgaccactttgcttga 3968402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2886748 - 2886632
Alignment:
Q  10 attgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga 108  Q
    ||||||||||||   | |||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| | |||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  2886748 attgctatgcatgctcttttgaactctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttggaaaccgaaaatatcaaaaacaaatgatataaaaacatgttga 2886649  T
Q  109 ttgtcagaacacgcttt 125  Q
    |||||||||||| ||||    
T  2886648 ttgtcagaacacacttt 2886632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10579907 - 10579803
Alignment:
Q  15 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatgc-ctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 113  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |  ||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  10579907 tatgcataaccctttgagttctatgtagaaggtcaacggtctctagtgacaggaagccaaaagtgtcaaacgcaaatggtataaaggcatgttgatggtt 10579808  T
Q  114 agaac 118  Q
    |||||    
T  10579807 agaac 10579803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33612626 - 33612555
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgttt 134  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  33612626 taggaagccaaaagtgtcaaatacaaattgtataaaatcatgttgattgtcaaaacacgttttctcatgttt 33612555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13147172 - 13147089
Alignment:
Q  70 ccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagc---atgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13147172 ccaaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaagtatatgctgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccacttttcttgac 13147089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8036610 - 8036530
Alignment:
Q  15 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggta 94  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8036610 tatgcataaacctttgaactctatgtaaaaggtcaacaacctctgatgttacgaagccaaaaatatcaaaaacaaatggta 8036530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 149
Target Start/End: Original strand, 29808115 - 29808188
Alignment:
Q  75 aatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||    
T  29808115 aatgtgaaaagcaaatggtataaaa-catgttgattgttataacacgctgtctcatgtttggtgactttacttga 29808188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 5679330 - 5679398
Alignment:
Q  87 aaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5679330 aaatggtatgaaaggatgttgattatcttaacatgttttctcatgtttggccactttgcttgaaacagc 5679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 139
Target Start/End: Original strand, 44720360 - 44720427
Alignment:
Q  72 aaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggcca 139  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  44720360 aaaaatgttaaattcaaacggtataaaaacatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttggcca 44720427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7760987 - 7760838
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa-tgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||| || |||||  |||| || |||||| |||  |||    
T  7760987 agacatcacattgctacgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgatagaaaaccaaaggtgtctaatgcaaatcgtaagaaa 7760888  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
      ||| ||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  7760887 atatg-tgattgttagatcacgttttctcatgattggccactttacttgac 7760838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13413316 - 13413365
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaa 50  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13413316 agacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaa 13413365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 44685000 - 44684955
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaagg 46  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44685000 agacataatattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaagg 44684955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1296101 - 1296037
Alignment:
Q  91 ggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  1296101 ggtataaaaacatgtttattgtcagaacatattttctcatgtttggccattttgtttgacgcagc 1296037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 365
Target Start/End: Original strand, 9107576 - 9107652
Alignment:
Q  289 ccaatatccttgaccttgaatgtggcattacggctgtagctaaattatttcaaagaagcttactagccggttattgt 365  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  9107576 ccaatacccttaatcttgaatgtgccattgtggctgtagctatattaaatcgaagaatcttactggccggttattgt 9107652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 6299 - 6449
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6299 agacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtatagaa 6398  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6399 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttacttgac 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 33215 - 33364
Alignment:
Q  1 agacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33215 agacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaa 33314  T
Q  100 gcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33315 acatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttga 33364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 103078 - 103209
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaat-gcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 106  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103078 acattgttatgcatgaccttttgagctcgatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 103177  T
Q  107 gattgtcagaacacgctttctcacgtttggcca 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  103178 gattgtcag-acacgctttctcgtgtttggcca 103209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Original strand, 49453 - 49525
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49453 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcacgttgattgtcagaacacgatttctcacatttgaccactttgtttga 49525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 10333 - 10479
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaatg-cctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg-- 104  Q
    |||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||   |||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  10333 acattgttatgcatggccctttcaactctat-tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgtt 10431  T
Q  105 --ttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
      |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  10432 gattgattgtcagaacacgcattatcatgtttggccattttacttgac 10479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 176
Alignment:
Q  70 ccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  256 ccaaaagtgtcaaacacaaatggtataaaagcatgttgatggtcataacccactgtctcatgtttggccactttgcttgac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Original strand, 7644 - 7701
Alignment:
Q  77 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgttt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7644 tgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8595 - 8529
Alignment:
Q  63 taggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctca 129  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8595 taggaaaccaaaagtgttaaacgcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacatgttttctca 8529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18358
Alignment:
Q  8 acattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggt---caatgcctctgatggtaggaagccaaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||  ||||  || | ||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  18499 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaat--ctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatg 18402  T
Q  105 ttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttga 149  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18401 ttgattgtgagaacacg-tttctcatgtttggccgctttgtttga 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47600 - 47531
Alignment:
Q  81 aaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgac 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  47600 aaaagcaaatggtataaaaatatgttaactgtcagaacacattttctcatgtttggccattttacttgac 47531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Original strand, 16191 - 16254
Alignment:
Q  92 gtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcacgtttggccactttgcttgacacagc 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  16191 gtataaaaacatgtttattgtcagaacatgttttctcatgtttggccattttgtttgacgcagc 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University