View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9171_high_3 (Length: 278)

Name: NF9171_high_3
Description: NF9171
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9171_high_3
NF9171_high_3
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (13-143)||(11905836-11905966)
chr3 (22-143)||(19823025-19823146)
chr3 (14-143)||(29023938-29024066)
chr3 (13-143)||(37695636-37695767)
chr3 (24-143)||(54726499-54726618)
chr3 (13-143)||(37497506-37497636)
chr3 (20-137)||(43253841-43253958)
chr3 (20-135)||(37311972-37312087)
chr3 (13-143)||(45710864-45710994)
chr3 (30-138)||(24569088-24569196)
chr3 (15-143)||(30190633-30190761)
chr3 (13-138)||(52290912-52291037)
chr3 (20-143)||(36460394-36460517)
chr3 (13-135)||(12736543-12736665)
chr3 (13-138)||(53560236-53560361)
chr3 (20-115)||(10366620-10366715)
chr3 (13-143)||(38795358-38795488)
chr3 (13-143)||(17652766-17652892)
chr3 (20-122)||(8679032-8679134)
chr3 (41-143)||(30711087-30711189)
chr3 (13-135)||(43719289-43719410)
chr3 (11-143)||(19611923-19612054)
chr3 (23-135)||(34750518-34750630)
chr3 (20-143)||(1778657-1778779)
chr3 (23-134)||(51837940-51838051)
chr3 (20-143)||(3313268-3313387)
chr3 (40-138)||(23004380-23004478)
chr3 (13-139)||(34957521-34957647)
chr3 (22-143)||(36476598-36476719)
chr3 (44-143)||(3901151-3901250)
chr3 (44-127)||(30682068-30682151)
chr3 (20-143)||(44301576-44301699)
chr3 (20-122)||(49830164-49830267)
chr3 (20-138)||(27471354-27471472)
chr3 (34-127)||(11632111-11632203)
chr3 (17-122)||(28690757-28690862)
chr3 (21-138)||(37772943-37773060)
chr3 (50-138)||(54477467-54477555)
chr3 (23-122)||(50035198-50035297)
chr3 (20-100)||(14194612-14194692)
chr3 (20-88)||(51064796-51064864)
chr3 (22-115)||(5322919-5323010)
chr3 (41-131)||(47825085-47825175)
chr3 (20-100)||(31158500-31158579)
chr3 (20-71)||(33491061-33491112)
chr3 (63-134)||(54225857-54225928)
chr3 (84-138)||(39043799-39043853)
chr3 (49-131)||(47825627-47825709)
chr3 (13-138)||(48540971-48541096)
chr3 (29-93)||(7757591-7757655)
chr3 (40-99)||(10973594-10973653)
chr3 (36-115)||(25090048-25090127)
chr3 (15-143)||(26467123-26467252)
chr3 (74-137)||(43870841-43870904)
chr3 (41-143)||(36462945-36463047)
chr3 (39-83)||(20354434-20354478)
chr3 (34-66)||(21918366-21918398)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (13-143)||(33790708-33790838)
chr4 (13-143)||(11907576-11907706)
chr4 (13-138)||(52859776-52859901)
chr4 (20-143)||(6609775-6609898)
chr4 (13-143)||(2066803-2066933)
chr4 (13-135)||(17114462-17114584)
chr4 (13-143)||(47772996-47773126)
chr4 (13-143)||(3689576-3689706)
chr4 (22-143)||(44536182-44536303)
chr4 (20-143)||(32884815-32884938)
chr4 (20-138)||(34360674-34360792)
chr4 (29-143)||(35380326-35380440)
chr4 (20-143)||(38405086-38405209)
chr4 (20-143)||(53346773-53346896)
chr4 (20-138)||(40122838-40122956)
chr4 (20-138)||(52247412-52247530)
chr4 (13-138)||(49175911-49176036)
chr4 (23-143)||(17237283-17237403)
chr4 (39-138)||(2942648-2942746)
chr4 (40-143)||(21240708-21240811)
chr4 (20-143)||(47464349-47464472)
chr4 (20-143)||(49428326-49428449)
chr4 (20-100)||(51625140-51625220)
chr4 (20-143)||(43237257-43237380)
chr4 (20-138)||(16821315-16821433)
chr4 (13-143)||(25233195-25233325)
chr4 (21-143)||(35311208-35311330)
chr4 (21-123)||(46396868-46396970)
chr4 (20-129)||(5841411-5841520)
chr4 (22-143)||(6643646-6643767)
chr4 (21-122)||(28500876-28500977)
chr4 (13-138)||(38502459-38502584)
chr4 (20-127)||(7061648-7061755)
chr4 (56-143)||(26147635-26147722)
chr4 (20-135)||(30682180-30682295)
chr4 (20-138)||(11288614-11288731)
chr4 (36-122)||(42517638-42517724)
chr4 (13-138)||(32469925-32470050)
chr4 (13-122)||(36985821-36985930)
chr4 (20-123)||(29575142-29575245)
chr4 (16-138)||(19265827-19265949)
chr4 (20-143)||(22130057-22130184)
chr4 (36-115)||(39157873-39157953)
chr4 (20-143)||(49579162-49579285)
chr4 (13-135)||(2653442-2653562)
chr4 (41-143)||(54506802-54506904)
chr4 (34-143)||(49746975-49747083)
chr4 (22-122)||(30192240-30192340)
chr4 (20-122)||(4972595-4972697)
chr4 (22-143)||(35998825-35998946)
chr4 (13-122)||(39397379-39397488)
chr4 (20-137)||(42616887-42617004)
chr4 (20-123)||(52869106-52869209)
chr4 (44-138)||(461977-462071)
chr4 (39-137)||(20612174-20612272)
chr4 (20-117)||(5618582-5618679)
chr4 (78-143)||(18741516-18741581)
chr4 (13-138)||(47358926-47359051)
chr4 (20-72)||(50263916-50263968)
chr4 (50-129)||(16506248-16506326)
chr4 (40-83)||(34321715-34321758)
chr4 (37-100)||(53412165-53412228)
chr4 (49-100)||(56250309-56250360)
chr4 (13-71)||(3669965-3670023)
chr4 (13-71)||(25141891-25141949)
chr4 (46-100)||(35251946-35252000)
chr4 (43-96)||(21325171-21325224)
chr4 (45-137)||(2400798-2400890)
chr4 (49-121)||(17512352-17512424)
chr4 (22-94)||(41711442-41711514)
chr4 (58-122)||(50264102-50264166)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (13-143)||(40899932-40900062)
chr5 (14-143)||(6753629-6753757)
chr5 (20-143)||(40530200-40530323)
chr5 (13-138)||(21060649-21060774)
chr5 (13-143)||(7827895-7828025)
chr5 (20-143)||(4818565-4818688)
chr5 (38-143)||(6315771-6315876)
chr5 (22-143)||(8698323-8698444)
chr5 (22-135)||(8724987-8725100)
chr5 (30-143)||(19929960-19930073)
chr5 (45-122)||(41062161-41062238)
chr5 (20-119)||(9515784-9515883)
chr5 (20-138)||(27542814-27542932)
chr5 (22-143)||(42803598-42803719)
chr5 (23-138)||(27580619-27580735)
chr5 (20-143)||(29570406-29570529)
chr5 (20-129)||(31655081-31655190)
chr5 (13-118)||(32440180-32440285)
chr5 (15-138)||(1248575-1248698)
chr5 (20-135)||(29374364-29374479)
chr5 (29-143)||(6754043-6754156)
chr5 (20-135)||(15818456-15818573)
chr5 (34-143)||(6615870-6615979)
chr5 (13-122)||(38508156-38508265)
chr5 (20-120)||(2232049-2232149)
chr5 (13-122)||(2588037-2588139)
chr5 (13-143)||(41478841-41478971)
chr5 (40-122)||(5731811-5731893)
chr5 (46-143)||(11796169-11796266)
chr5 (20-99)||(30512661-30512740)
chr5 (20-99)||(30553001-30553080)
chr5 (13-143)||(41492316-41492446)
chr5 (36-135)||(41496102-41496201)
chr5 (13-85)||(843509-843581)
chr5 (34-118)||(15439309-15439393)
chr5 (39-134)||(22848379-22848474)
chr5 (20-138)||(29856066-29856182)
chr5 (49-135)||(4441043-4441129)
chr5 (14-135)||(11904227-11904349)
chr5 (44-100)||(5282399-5282455)
chr5 (44-138)||(26285478-26285572)
chr5 (34-124)||(37184069-37184159)
chr5 (35-121)||(3348116-3348207)
chr5 (20-71)||(42922843-42922894)
chr5 (44-122)||(18841514-18841592)
chr5 (44-89)||(3076658-3076703)
chr5 (78-143)||(38161446-38161511)
chr5 (44-100)||(18890555-18890611)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (13-143)||(15359056-15359186)
chr2 (13-143)||(16463703-16463833)
chr2 (13-143)||(39785599-39785732)
chr2 (13-143)||(25637495-25637624)
chr2 (13-143)||(45235595-45235725)
chr2 (22-138)||(16805900-16806016)
chr2 (22-138)||(16845181-16845297)
chr2 (20-143)||(37322442-37322566)
chr2 (13-143)||(36794298-36794428)
chr2 (20-138)||(39691509-39691627)
chr2 (15-143)||(14523343-14523471)
chr2 (20-143)||(8947028-8947151)
chr2 (20-143)||(31448669-31448792)
chr2 (21-143)||(34120416-34120536)
chr2 (23-138)||(43410445-43410560)
chr2 (33-143)||(35313901-35314011)
chr2 (13-143)||(36354412-36354542)
chr2 (13-117)||(32783404-32783508)
chr2 (22-138)||(34225609-34225725)
chr2 (20-143)||(11742505-11742627)
chr2 (15-138)||(43115773-43115896)
chr2 (23-143)||(5789627-5789747)
chr2 (20-100)||(19937734-19937814)
chr2 (20-135)||(16377632-16377747)
chr2 (30-143)||(41220932-41221045)
chr2 (20-143)||(17695344-17695467)
chr2 (41-143)||(9458268-9458365)
chr2 (34-135)||(39329652-39329754)
chr2 (20-95)||(3323262-3323337)
chr2 (22-84)||(26607946-26608008)
chr2 (25-123)||(27866526-27866623)
chr2 (30-143)||(35242283-35242396)
chr2 (50-137)||(43730635-43730720)
chr2 (49-123)||(1206708-1206782)
chr2 (22-115)||(11367121-11367214)
chr2 (50-138)||(19426474-19426563)
chr2 (78-135)||(32831209-32831266)
chr2 (13-122)||(18853169-18853279)
chr2 (40-100)||(43699595-43699655)
chr2 (20-71)||(39443799-39443850)
chr2 (22-56)||(3601465-3601499)
chr2 (13-63)||(5272162-5272212)
chr2 (20-117)||(10005101-10005197)
chr2 (90-122)||(3601419-3601451)
chr2 (22-85)||(12520827-12520891)
chr2 (20-92)||(27501514-27501586)
chr2 (36-100)||(34437993-34438057)
chr2 (78-122)||(38187917-38187961)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (20-143)||(21390316-21390439)
chr7 (20-143)||(21759969-21760092)
chr7 (24-143)||(41506054-41506173)
chr7 (13-128)||(42935697-42935812)
chr7 (13-143)||(83406-83536)
chr7 (20-127)||(38391785-38391892)
chr7 (13-143)||(759069-759199)
chr7 (13-143)||(16560548-16560678)
chr7 (13-143)||(16604984-16605114)
chr7 (13-118)||(40076361-40076466)
chr7 (20-143)||(11373413-11373536)
chr7 (13-143)||(28202287-28202417)
chr7 (22-143)||(3178191-3178312)
chr7 (13-138)||(9786014-9786139)
chr7 (20-143)||(24516274-24516397)
chr7 (20-143)||(28103754-28103877)
chr7 (20-143)||(43873944-43874067)
chr7 (20-143)||(46478278-46478401)
chr7 (13-143)||(34947521-34947651)
chr7 (20-143)||(5524401-5524524)
chr7 (13-143)||(13961980-13962110)
chr7 (13-120)||(46211472-46211582)
chr7 (20-143)||(7463234-7463357)
chr7 (20-137)||(2459498-2459613)
chr7 (13-143)||(27921009-27921139)
chr7 (21-143)||(30865988-30866110)
chr7 (20-143)||(22738722-22738845)
chr7 (20-138)||(26974052-26974173)
chr7 (13-100)||(44180269-44180356)
chr7 (21-143)||(8592426-8592548)
chr7 (20-143)||(19271718-19271841)
chr7 (20-134)||(29835399-29835513)
chr7 (37-143)||(34100549-34100655)
chr7 (20-143)||(21350613-21350733)
chr7 (22-138)||(33819240-33819356)
chr7 (23-122)||(7457409-7457508)
chr7 (68-135)||(21937820-21937887)
chr7 (20-143)||(23670507-23670629)
chr7 (15-143)||(48608887-48609011)
chr7 (37-138)||(49101689-49101793)
chr7 (20-129)||(31930482-31930591)
chr7 (13-143)||(44424165-44424286)
chr7 (20-122)||(2850866-2850968)
chr7 (20-143)||(17828337-17828459)
chr7 (22-143)||(37245711-37245834)
chr7 (13-143)||(37850707-37850835)
chr7 (68-143)||(6494967-6495042)
chr7 (23-122)||(12631347-12631446)
chr7 (37-143)||(32018917-32019024)
chr7 (78-129)||(42796043-42796094)
chr7 (48-134)||(762187-762273)
chr7 (50-120)||(47045469-47045538)
chr7 (13-122)||(16904421-16904530)
chr7 (52-124)||(15464718-15464790)
chr7 (36-115)||(25530991-25531070)
chr7 (63-118)||(39452390-39452445)
chr7 (36-122)||(7930095-7930181)
chr7 (85-143)||(25571440-25571498)
chr7 (13-122)||(32018690-32018799)
chr7 (13-58)||(36790852-36790897)
chr7 (93-137)||(30546413-30546457)
chr7 (47-115)||(31327482-31327550)
chr7 (107-143)||(35333064-35333100)
chr7 (78-122)||(39005463-39005507)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (20-143)||(11655923-11656046)
chr6 (13-124)||(21010210-21010321)
chr6 (13-143)||(29363320-29363450)
chr6 (13-143)||(6801945-6802075)
chr6 (13-143)||(32440615-32440745)
chr6 (18-138)||(1781822-1781941)
chr6 (24-143)||(5302365-5302484)
chr6 (13-118)||(27448126-27448231)
chr6 (23-143)||(13909438-13909558)
chr6 (23-143)||(23142681-23142801)
chr6 (23-122)||(6834349-6834448)
chr6 (20-139)||(1063580-1063699)
chr6 (20-143)||(15058131-15058254)
chr6 (13-138)||(3291738-3291863)
chr6 (13-138)||(30716919-30717044)
chr6 (54-143)||(11143597-11143687)
chr6 (38-138)||(24983444-24983544)
chr6 (39-143)||(31894206-31894310)
chr6 (20-143)||(13087544-13087667)
chr6 (20-138)||(3720218-3720336)
chr6 (13-122)||(1955949-1956058)
chr6 (35-143)||(181570-181677)
chr6 (37-127)||(21018789-21018879)
chr6 (44-97)||(7072220-7072273)
chr6 (74-127)||(8115069-8115122)
chr6 (74-143)||(34300009-34300078)
chr6 (68-134)||(10864886-10864951)
chr6 (34-109)||(27367427-27367502)
chr6 (34-109)||(27457774-27457849)
chr6 (13-100)||(28101329-28101416)
chr6 (39-113)||(2423662-2423736)
chr6 (13-71)||(8114982-8115040)
chr6 (36-122)||(12339995-12340080)
chr6 (25-127)||(21804511-21804612)
chr6 (45-130)||(1671714-1671799)
chr6 (49-121)||(17835420-17835492)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (13-143)||(49223960-49224090)
chr1 (15-143)||(16395023-16395150)
chr1 (41-143)||(40144849-40144951)
chr1 (13-143)||(15699136-15699267)
chr1 (13-143)||(20209814-20209944)
chr1 (13-122)||(42410029-42410138)
chr1 (20-143)||(39864125-39864248)
chr1 (13-128)||(45331370-45331485)
chr1 (13-138)||(37506143-37506271)
chr1 (30-127)||(37276491-37276588)
chr1 (20-143)||(12039096-12039219)
chr1 (13-135)||(38787363-38787485)
chr1 (8-128)||(32825961-32826080)
chr1 (20-143)||(9307641-9307764)
chr1 (20-122)||(23168974-23169076)
chr1 (20-138)||(31978633-31978751)
chr1 (37-138)||(6160457-6160558)
chr1 (14-143)||(13579596-13579725)
chr1 (34-143)||(28749005-28749114)
chr1 (20-143)||(26093408-26093531)
chr1 (22-143)||(10495853-10495973)
chr1 (20-143)||(21909987-21910109)
chr1 (20-122)||(917059-917161)
chr1 (13-129)||(41121796-41121915)
chr1 (30-138)||(7759234-7759342)
chr1 (20-100)||(43500765-43500845)
chr1 (29-88)||(35367635-35367694)
chr1 (20-138)||(2572488-2572605)
chr1 (20-138)||(44761512-44761630)
chr1 (23-119)||(31042835-31042931)
chr1 (20-143)||(6023630-6023753)
chr1 (20-143)||(24991634-24991757)
chr1 (20-143)||(30754922-30755045)
chr1 (44-143)||(36701935-36702034)
chr1 (44-143)||(36718039-36718138)
chr1 (20-143)||(44707741-44707864)
chr1 (31-125)||(22181368-22181462)
chr1 (20-122)||(33733244-33733345)
chr1 (20-138)||(52429363-52429481)
chr1 (37-122)||(32970565-32970650)
chr1 (55-143)||(14757610-14757698)
chr1 (22-122)||(34031510-34031610)
chr1 (13-100)||(6267830-6267917)
chr1 (44-143)||(8896337-8896436)
chr1 (90-143)||(35367816-35367869)
chr1 (41-143)||(4441605-4441707)
chr1 (20-138)||(12151195-12151313)
chr1 (20-129)||(5179380-5179489)
chr1 (44-121)||(31154164-31154241)
chr1 (44-129)||(45615559-45615644)
chr1 (50-98)||(3312170-3312218)
chr1 (44-123)||(35538677-35538756)
chr1 (40-134)||(24880899-24880993)
chr1 (20-66)||(26252512-26252558)
chr1 (58-127)||(7351666-7351735)
chr1 (31-143)||(9379245-9379358)
chr1 (13-129)||(11449913-11450027)
chr1 (44-125)||(17988563-17988646)
chr1 (50-122)||(34688858-34688930)
chr1 (50-122)||(34693386-34693458)
chr1 (44-100)||(43614454-43614510)
chr1 (20-71)||(4659843-4659894)
chr1 (77-136)||(22856275-22856334)
chr1 (29-100)||(35682795-35682866)
chr1 (13-128)||(41080627-41080742)
chr1 (44-128)||(978862-978946)
chr1 (29-129)||(27896983-27897083)
chr1 (78-122)||(29778435-29778479)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (13-143)||(10097963-10098093)
chr8 (13-143)||(13335230-13335360)
chr8 (13-123)||(34393926-34394036)
chr8 (22-138)||(9300094-9300210)
chr8 (20-122)||(1875571-1875673)
chr8 (13-143)||(40996337-40996467)
chr8 (13-105)||(36967413-36967505)
chr8 (20-143)||(21216080-21216203)
chr8 (20-143)||(32476301-32476424)
chr8 (13-138)||(31231749-31231875)
chr8 (20-129)||(26626091-26626200)
chr8 (15-138)||(10179921-10180044)
chr8 (13-127)||(51143-51256)
chr8 (20-122)||(22771814-22771916)
chr8 (29-143)||(31082633-31082747)
chr8 (20-138)||(31271040-31271158)
chr8 (20-98)||(39405821-39405899)
chr8 (20-138)||(45425645-45425763)
chr8 (20-137)||(39482635-39482752)
chr8 (50-143)||(44761503-44761596)
chr8 (33-128)||(2767283-2767378)
chr8 (13-143)||(4428324-4428453)
chr8 (13-143)||(17719230-17719360)
chr8 (23-128)||(42972490-42972595)
chr8 (44-135)||(5053156-5053247)
chr8 (20-143)||(11976915-11977038)
chr8 (13-88)||(32678787-32678862)
chr8 (40-138)||(7172933-7173031)
chr8 (13-115)||(7703128-7703230)
chr8 (13-143)||(34948659-34948789)
chr8 (23-134)||(14854916-14855027)
chr8 (44-111)||(39329065-39329132)
chr8 (44-138)||(4924070-4924164)
chr8 (30-88)||(29226220-29226278)
chr8 (20-118)||(39300920-39301018)
chr8 (41-134)||(396611-396704)
chr8 (50-127)||(5356630-5356706)
chr8 (36-127)||(11649638-11649729)
chr8 (85-143)||(32678417-32678475)
chr8 (53-138)||(42887019-42887104)
chr8 (20-95)||(6796024-6796099)
chr8 (38-97)||(10953405-10953464)
chr8 (38-97)||(10961410-10961469)
chr8 (56-143)||(17823935-17824022)
chr8 (24-143)||(27294042-27294161)
chr8 (14-100)||(12559650-12559735)
chr8 (23-121)||(33765696-33765794)
chr8 (50-134)||(3117029-3117111)
chr8 (36-105)||(8741079-8741148)
chr8 (30-83)||(9549999-9550052)
chr8 (37-122)||(41092029-41092114)
chr8 (91-143)||(29226578-29226630)
chr8 (44-143)||(31331422-31331521)
chr8 (44-128)||(34455688-34455771)
chr8 (20-88)||(1739709-1739777)
chr8 (13-133)||(9839798-9839918)
chr8 (89-133)||(30130311-30130355)
chr8 (55-143)||(36006901-36006989)
chr8 (49-129)||(44648540-44648620)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (13-138)||(1723-1848)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (20-127)||(2055-2162)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (13-118)||(39127-39232)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (23-122)||(1798-1897)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (36-125)||(16130-16219)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (13-143)||(7952-8082)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (20-126)||(17066-17172)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (20-98)||(50263-50341)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-138)||(105703-105820)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (34-143)||(20345-20454)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (20-143)||(5404-5527)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (20-143)||(136015-136138)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (23-143)||(34000-34120)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (20-98)||(6263-6341)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (22-100)||(6794-6872)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (55-129)||(697-771)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (40-100)||(126228-126288)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (68-127)||(435-494)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11905966 - 11905836
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11905966 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 11905867  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11905866 attgtagttaatggagttgttaagttggatg 11905836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19823146 - 19823025
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19823146 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtagaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtt 19823047  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||| | |||||||| ||||    
T  19823046 agtggaatagttaagttggatg 19823025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 29023938 - 29024066
Alignment:
Q  14 taatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaa 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  29023938 taatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaaca-tcttattaa 29024036  T
Q  114 ttgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  29024037 ttgtagttagtggagtaattaagttggatg 29024066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 37695636 - 37695767
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagttta-tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatt 111  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37695636 ataatagtcgtttaaggttttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 37695735  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37695736 aattgtagttagtggagtagttaagttagatg 37695767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 54726618 - 54726499
Alignment:
Q  24 ttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  54726618 ttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttaa 54726519  T
Q  124 tggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  54726518 tggagtagttaagttagatg 54726499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37497636 - 37497506
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  37497636 ataataatcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgatttattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacaccgttgtta 37497537  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37497536 actgtagttagtggagtagttaagttggatg 37497506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 43253841 - 43253958
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43253841 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtag 43253940  T
Q  120 ttaatggagttgttaagt 137  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  43253941 ttagtggagtagttaagt 43253958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37312087 - 37311972
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37312087 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaacccttattaattgtag 37311988  T
Q  120 ttaatggagttgttaa 135  Q
    ||| |||||| |||||    
T  37311987 ttagtggagtagttaa 37311972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45710994 - 45710864
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  45710994 ataatagtcgtttaaggttgatgcacggttgttaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacttttatta 45710895  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  45710894 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 45710864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 24569088 - 24569196
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24569088 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagt 24569187  T
Q  130 tgttaagtt 138  Q
     ||||||||    
T  24569188 agttaagtt 24569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 30190633 - 30190761
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30190633 aatagtcgtttaaggtttgtgcacggttatgaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaat 30190732  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  30190733 tgtagttagtggagtagttaagttggatg 30190761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52291037 - 52290912
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  52291037 ataataatcgtttaaggttgatgtacggttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtaccatttattaaaacagccttatta 52290938  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  52290937 attatagttagtggagtagttaagtt 52290912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 36460394 - 36460517
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| ||||  |  ||||||||||||||    
T  36460394 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaattattaattgtgttaatttcaatagtaaaattagtaacatttattaaaatattcttattaattgtag 36460493  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||    
T  36460494 ttaatggagtaattaagttggatg 36460517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Original strand, 12736543 - 12736665
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12736543 ataatagttgtttaaagtttgtgcacgatttttaaggaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatttactacaatacccttatta 12736642  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||| ||| || ||| |||||    
T  12736643 attgtacttagtgtagtagttaa 12736665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53560361 - 53560236
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53560361 ataatagttgtttaaggttgatgcacgatgattaaggaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaatttgtatcatttactaaaacacccttatta 53560262  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    | | |||||| | |||| ||||||||    
T  53560261 aatatagttagtagagtagttaagtt 53560236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Original strand, 10366620 - 10366715
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  10366620 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaatt 10366715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38795488 - 38795358
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  38795488 ataatagtcgtttaatgtttgtgcacgatatttaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttacccaaatgcccttatta 38795389  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  38795388 attgtagttggtggagttgttaagttggatg 38795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17652892 - 17652766
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    |||||||| || ||||||||    
T  17652892 ataatagtcgtttgaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta----ttactaaaacatccttatta 17652797  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| ||  || |||||||| ||||    
T  17652796 attgtagttagtgaggtagttaagttggatg 17652766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 8679032 - 8679134
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||    
T  8679032 tcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaagatccttattaattatag 8679131  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  8679132 tta 8679134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30711189 - 30711087
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    |||||||  |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  30711189 ttattaaagaaataattaattatgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaaaacaccattattaattgtagttaatggagcaattaagttag 30711090  T
Q  141 atg 143  Q
    |||    
T  30711089 atg 30711087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43719410 - 43719289
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||||    
T  43719410 ataatagtcggttaaagtttgtacacgatcattaataaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaatta-tatcattcactgaaacatccttatta 43719312  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  43719311 attgtagttagtggagtagttaa 43719289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19612054 - 19611923
Alignment:
Q  11 agataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttat 110  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||  | ||||||    
T  19612054 agataataattgtttaaagtttgtgtacgatttttaagaaagtgattaattgtgttgatttcaatgttaaaatta-tataatttactaaaatatccttat 19611956  T
Q  111 taattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  19611955 taattgttgttagtggagtagttaagtttgatg 19611923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34750630 - 34750518
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  34750630 tttaaggtttgtgcacgatttttgatgaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttg 34750531  T
Q  123 atggagttgttaa 135  Q
     |||||| |||||    
T  34750530 gtggagtagttaa 34750518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1778779 - 1778657
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1778779 tcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatgacatttactaaaacatccttatt-attgtag 1778681  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| | |||||| ||||    
T  1778680 ttagtggagtagataagttggatg 1778657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 51837940 - 51838051
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  51837940 tttaaggtttgtgcatgagtattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattagttgtagcta 51838039  T
Q  123 atggagttgtta 134  Q
     |||||| ||||    
T  51838040 gtggagtagtta 51838051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3313387 - 3313268
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    |||  ||||  ||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3313387 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgatta----tgtcgatttcaatggtaaaattagtagaattaactaaaacacccttattaattgtag 3313292  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||    
T  3313291 ttaatggagtatttaagttggatg 3313268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Original strand, 23004380 - 23004478
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23004380 attattaaggaaatgattaattgtgtcgatttcaatggtaaaattagtagtatatactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagtt 23004478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34957647 - 34957521
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||  | ||||||||    
T  34957647 ataatagtcgtttaaggtttatggacaattactaaggaaatgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttacttaaatatccttatta 34957548  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtta 139  Q
    ||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  34957547 attatagttagtggagtagttcagtta 34957521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36476719 - 36476598
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||   ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36476719 gtttaaggtttgttcacggttattaagaaaataattgattgtgttgattgcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagtt 36476620  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | | |||| |||||||| ||||    
T  36476619 agtagagtagttaagtttgatg 36476598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 3901151 - 3901250
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  3901151 ttaagaaaatgattaattgtattaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacattcttattagttgtagttagtggggtacttaagttggatg 3901250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 30682068 - 30682151
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  30682068 ttaaggaaatgattaattgttttaattttaatgttaaaatgagtatcatttactaaaataatcttattaattgtagttaatgga 30682151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44301699 - 44301576
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||| ||| | ||||| ||||  |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||     
T  44301699 tcgtttaaggtttgtgcccgacttttaaggaaatatttaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatacccttatcaattgtaa 44301600  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  44301599 ttagtggagtagttaagttggatg 44301576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49830267 - 49830164
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaa-tgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  49830267 tcgtttaacgtttgtgcacgattattaaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatatcatttactaaaataccattattaattgta 49830168  T
Q  119 gtta 122  Q
    ||||    
T  49830167 gtta 49830164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27471472 - 27471354
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  27471472 tcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatggtgaaattagttgcatttactaaaacactcttattaattataa 27471373  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
     || |||||| ||||||||    
T  27471372 gtagtggagtagttaagtt 27471354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11632203 - 11632111
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  11632203 tgcacgattattaa-aaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtagtatttactaaaacacctttattaattgtagttagtgga 11632111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 28690757 - 28690862
Alignment:
Q  17 tactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattg 116  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||    
T  28690757 tacttgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattg 28690856  T
Q  117 tagtta 122  Q
    ||||||    
T  28690857 tagtta 28690862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 37772943 - 37773060
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||   ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  37772943 cgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtattgattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattatagt 37773042  T
Q  121 taatggagttgttaagtt 138  Q
     | |||| | ||||||||    
T  37773043 cagtggaatagttaagtt 37773060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Original strand, 54477467 - 54477555
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54477467 aaatggttaattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagttaatggagtagttaagtt 54477555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 50035198 - 50035297
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  50035198 tttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgaataattatgttgatttcaataataaaattagtagcatttaccaaaacaccgttgttaattgtagtta 50035297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14194692 - 14194612
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14194692 tcgtttaaggtttgtgcacgatttttaaagaaatgatcaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaccatttactaaa 14194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 51064796 - 51064864
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagta 88  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  51064796 tcgtttaaagtttatgcacgaatattaaaaaaatgattaattgtgttgctttcaatggtaaaattagta 51064864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Original strand, 5322919 - 5323010
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5322919 gtttaaggtttgtgcacgattattaa--aaatgattaattatgttgatttcagtgataaaattaatatcatttactaaaatacacttattaatt 5323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47825175 - 47825085
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttg 131  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  47825175 ttattaaaaaaatgattggtagtgttaattttgatggtaaaatatgtttcatttactaaaatacccttatgaattataattaatggagttg 47825085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 31158500 - 31158579
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||| || |||||||||||    
T  31158500 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaa-aaaatgattaattgtgctgatttcgatagtaaaattaataacatttactaaa 31158579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Original strand, 33491061 - 33491112
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33491061 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattt 33491112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 54225857 - 54225928
Alignment:
Q  63 tgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  54225857 tgttaatttggatgataaaatgtgtttcatttactaaaacagccttattaattatagttagtggagtggtta 54225928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Original strand, 39043799 - 39043853
Alignment:
Q  84 tagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39043799 tagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggagtagttaagtt 39043853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47825709 - 47825627
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttg 131  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  47825709 aaaatgattggtagtgttaattttgatggtaaaatatgtttcatttactaaaatacccttatgaattataattaatggagttg 47825627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 48540971 - 48541096
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||| ||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||||||| ||||  |  |||||||    
T  48540971 ataatagttgtttaaagtttgtgcacaatgtttaaggaaatgactaattatgtcaatttctataataaaattaatatcatttattaaaatattcttatta 48541070  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||| ||| | |||| ||||||||    
T  48541071 attgtaattagttgagtagttaagtt 48541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7757655 - 7757591
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatt 93  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  7757655 gtttatgcacgtttgttaaggaaaagattaattgtgttgatttcaatgataaaattattatcatt 7757591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10973653 - 10973594
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  10973653 attattaagaaaatgattaataatgtttattttaatgacaaaatgtgtatcatttactaa 10973594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 25090048 - 25090127
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||  || ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  25090048 cacgattattaagaaaatgattagtagtgttaattttaattgtaaaatatgtttcaatttctaaaacactcttattaatt 25090127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26467252 - 26467123
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||||| ||||||  || |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||  |   ||||||||    
T  26467252 aatagtcgtttaaggtttatatacaattcgtaagaaaatgattgattgtgttgattttaatgat-aagttaatatcatttattaaaatatgtttattaat 26467154  T
Q  115 tgtagt--taatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  26467153 tgtagttataatgaagtagttaagttagatg 26467123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Original strand, 43870841 - 43870904
Alignment:
Q  74 atgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  43870841 atgataaaattagtttcatttactaaagtactctttttaatagtagttagtgaagtagttaagt 43870904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 36462945 - 36463047
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    ||||||| ||||||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| |    
T  36462945 ttattaaaaaaatgattgatagtattgattttaatgttaaaattggtagcatttactaaaataaccttattaattgttgtttgtggagtaattaagttgg 36463044  T
Q  141 atg 143  Q
    |||    
T  36463045 atg 36463047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 83
Target Start/End: Original strand, 20354434 - 20354478
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaat 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20354434 gattattaagaaaataattaatattgttaattttaatgataaaat 20354478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21918398 - 21918366
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21918398 tgcacgattattaagaaaatgattaattttgtt 21918366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 33790708 - 33790838
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  33790708 ataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtttcatttgctaaaacacccttatta 33790807  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  33790808 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 33790838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 11907576 - 11907706
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11907576 ataatagtcatttaaggttaatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 11907675  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  11907676 attgtagttattggagtagttaagttggatg 11907706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 52859776 - 52859901
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52859776 ataatagtcgcttaaggcttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttatta 52859875  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  52859876 attgtagttagtggagtagttaagtt 52859901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6609898 - 6609775
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||     
T  6609898 tcgtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacaaaaacatctttattaattgtaa 6609799  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  6609798 ttattggagtagttaagttggatg 6609775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2066933 - 2066803
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  2066933 ataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaagttagtattatttattaaaacacccttatta 2066834  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  2066833 attttagttagtggggtagttaagttagatg 2066803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17114584 - 17114462
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17114584 ataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 17114485  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  17114484 attgtagttagtggagtagttaa 17114462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 47772996 - 47773126
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47772996 ataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 47773095  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  47773096 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 47773126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3689706 - 3689576
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3689706 ataatagtcgtttaaggtttatgtacggttattaaagaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttatta 3689607  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3689606 attatagttagttgagttgttaagttagatg 3689576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 44536182 - 44536303
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44536182 gtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagcaggatttattaaaacacccttattaattgtagtt 44536281  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||| | |||||||||||    
T  44536282 agtggagtagctaagttagatg 44536303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32884938 - 32884815
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32884938 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtagaattagtagcatttagtaaaacactcttattaattgtag 32884839  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  32884838 ttagtggagtagttaagttggatg 32884815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34360792 - 34360674
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34360792 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtag 34360693  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  34360692 ttagtggagtagttaagtt 34360674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Original strand, 35380326 - 35380440
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||    
T  35380326 gtttatacacgattattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcattattaattgtagttagtggag 35380425  T
Q  129 ttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| ||||    
T  35380426 tggttaagttggatg 35380440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 38405086 - 38405209
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38405086 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattctgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtag 38405185  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| ||| || |||||||| ||||    
T  38405186 ttagtggtgtagttaagttggatg 38405209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 53346896 - 53346773
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  53346896 tcgtttaaaatttgtgcacgattattaagaaaataattgattgtgttagtttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttattaattttag 53346797  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  53346796 ttagtggagtagttaagtttgatg 53346773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 40122838 - 40122956
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40122838 tcgtttaagctttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgcgttgattttaatgttaaaattagtagcatttactaaaacacccttattgattgtag 40122937  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||  ||||||||    
T  40122938 ttagtggagcagttaagtt 40122956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 52247412 - 52247530
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  52247412 tcgtttaaggattgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattaatacaatttactaaaatatccttattaattgtag 52247511  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  52247512 ttagtggagtagttaagtt 52247530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 49175911 - 49176036
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  49175911 ataatagtcgtttaaggtttgtgcatgatttttaagaaaatgattaattgtggagatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaataaccttatta 49176010  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  49176011 attgtagttagcggagtagttaagtt 49176036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 17237283 - 17237403
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17237283 tttaaggtttgtgcatgattattaagaaaataattaattgtgttgattgcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacaaccttattaattgtagtta 17237382  T
Q  123 atggagttgttaagttagatg 143  Q
     |||||| |||||||| ||||    
T  17237383 gtggagtagttaagttggatg 17237403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 2942648 - 2942746
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2942648 gattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcgatgataaaattagtagcatttactaaaaca-ccttattaattgtagttagtggagtggttaagtt 2942746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 21240708 - 21240811
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtta 139  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||     
T  21240708 attattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaacacatccttattaattgtagttagttgagtagttaagttg 21240807  T
Q  140 gatg 143  Q
    ||||    
T  21240808 gatg 21240811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 47464349 - 47464472
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  47464349 tcgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaactcttattaattgtag 47464448  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||    
T  47464449 ttggtggagtagttaagttggatg 47464472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 49428326 - 49428449
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49428326 tcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattatttgtgttgatttcaatggtaaaattaatataatttactaaaatacccttattaattgtag 49428425  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| ||||||  ||||||| ||||    
T  49428426 ttagtggagtaattaagttggatg 49428449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 51625220 - 51625140
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51625220 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaa 51625140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43237380 - 43237257
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||  ||||||||||  | | ||||||||| |||    
T  43237380 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtaatatttactaaaaaatcattattaattatag 43237281  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || ||| |||||||| ||||    
T  43237280 ttagtgaagtagttaagttggatg 43237257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 16821315 - 16821433
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||    
T  16821315 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgcaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatccttattaattatag 16821414  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| ||||||  |||||||    
T  16821415 ttagtggagtatttaagtt 16821433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25233325 - 25233195
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  25233325 ataatattcgtttaaggttgatgtacagttattaaagaaataattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactagtatta 25233226  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||    
T  25233225 attatagttagtgaagtagttaagttggatg 25233195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 35311208 - 35311330
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  35311208 cgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattatgttaatttcaatggtaaaattaattgcatttactagaacactcttattaattgtagt 35311307  T
Q  121 taatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || ||||||  ||||||| ||||    
T  35311308 tagtggagtaattaagttggatg 35311330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 46396868 - 46396970
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  46396868 cgtttaaggtttgtgcacgatcattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtagt 46396967  T
Q  121 taa 123  Q
    |||    
T  46396968 taa 46396970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 5841411 - 5841520
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5841411 tcgtttaaggtttgtgcacaactattaaggaaatgattgattgcgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtag 5841510  T
Q  120 ttaatggagt 129  Q
    ||| ||||||    
T  5841511 ttagtggagt 5841520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 6643646 - 6643767
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  6643646 gtttaatgtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatctttattaattgtagtt 6643745  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||  | |||||||| ||||    
T  6643746 agtggtatagttaagttggatg 6643767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 28500876 - 28500977
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  28500876 cgtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgcagt 28500975  T
Q  121 ta 122  Q
    ||    
T  28500976 ta 28500977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 38502459 - 38502584
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||   |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||    
T  38502459 ataatagtcgtttaaggttgatgcatagttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaatacttttatta 38502558  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  38502559 attatagttaatgtagtagttaagtt 38502584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Original strand, 7061648 - 7061755
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||    
T  7061648 tcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactataatatctttattaattgtag 7061747  T
Q  120 ttaatgga 127  Q
    ||| ||||    
T  7061748 ttagtgga 7061755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Original strand, 26147635 - 26147722
Alignment:
Q  56 ttaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  26147635 ttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatg 26147722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 30682180 - 30682295
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |  | |||||||| ||||||    
T  30682180 tcgtttaaggtttttgcacgactattaaaaaaatgattaattgtgttaattttattggtaaaattaatatcatttactataatatccttattagttgtag 30682279  T
Q  120 ttaatggagttgttaa 135  Q
    ||| | |||| |||||    
T  30682280 ttagtagagtagttaa 30682295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 11288614 - 11288731
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  ||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  11288614 tcgtttaaggtttatgtacgattattaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggcaaaattaatatcatttactaaaata-tcttattaattgtag 11288712  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||  |||||| ||||||||    
T  11288713 ttggtggagtagttaagtt 11288731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 42517638 - 42517724
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  42517638 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaagatcatttactaaaatacccttattaattatagtta 42517724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 32469925 - 32470050
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | ||||||  ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  32469925 ataatatttgtttaagatttatgcataattttaaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacattcttatta 32470024  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    | ||||||||||  |||| |||||||    
T  32470025 actgtagttaataaagtttttaagtt 32470050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36985930 - 36985821
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |  |||||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  36985930 ataatactcgtttaagatttttatacgatttttcaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccgtatta 36985831  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  36985830 attgtagtta 36985821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29575245 - 29575142
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  29575245 tcgtttaaaatttgtacacgattactaagaaaatgattaattatgttaatttaaatgataaaattaataacatttattaaaatactcttgttaattgtag 29575146  T
Q  120 ttaa 123  Q
    ||||    
T  29575145 ttaa 29575142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19265949 - 19265827
Alignment:
Q  16 atactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  || ||||||||| | | ||||| ||||  | |||||||||||    
T  19265949 atactcgtttaaactttctgcacggttattaagaaaatgattaattatatttatttcaataataaaattaatgttatttattaaaataaccttattaatt 19265850  T
Q  116 gtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
     |||||| |||||| ||||||||    
T  19265849 atagttagtggagtagttaagtt 19265827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22130184 - 22130057
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgt----gttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    ||| ||||  ||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22130184 tcgtttaaggtttgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtatgtgttgatttcaatggtataattagtatcatttacaaaaacatccttattaatt 22130085  T
Q  116 gtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22130084 gtagttagtggagtaattaagttggatg 22130057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 39157873 - 39157953
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtg-ttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||    
T  39157873 cacgattattaagaaaatgattagttgtgtttaattttgatggtaaaatttgtttcatttactaaaatacacttattaatt 39157953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 49579162 - 49579285
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgtt-aattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  49579162 tcgtttaaagtttgtgcatgatttttaaataaatgattaattgtgttgatttttaatgataaaattattatta-ttactaaaacacttttattaattgta 49579260  T
Q  119 gttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||| || | |||||||||| ||||    
T  49579261 gttattgaaattgttaagttggatg 49579285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2653562 - 2653442
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | ||||||  ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  2653562 ataatagttgtttaagatttgtgcatgattattaa--aaatgattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtatcatttattaaaatactcttatta 2653465  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  2653464 attgtagttaaaggagtagttaa 2653442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 54506904 - 54506802
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||  | | |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  54506904 ttattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatcattatcaattgtagttagtggagtagttaagtttg 54506805  T
Q  141 atg 143  Q
    |||    
T  54506804 atg 54506802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 49747083 - 49746975
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||  ||| | ||||||| |||||| | |||| |||    
T  49747083 tgcacgattattaa-aaaataattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaataccttcattaattatagttagttgagtagtt 49746985  T
Q  134 aagttagatg 143  Q
    ||||| ||||    
T  49746984 aagttggatg 49746975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30192340 - 30192240
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | |||||| |||||  |  ||||||||||||||||    
T  30192340 gtttaatgtttgtacacgatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaattaatgtcatttgctaaaatattcttattaattgtagtt 30192241  T
Q  122 a 122  Q
    |    
T  30192240 a 30192240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4972697 - 4972595
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||   |||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4972697 tcgtttaagatttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattgaaaaattggtgacatttactaaaacactcttattaattgtag 4972598  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  4972597 tta 4972595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35998946 - 35998825
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||| |   ||||||||||| |||||| ||||  | | |||||||||||||||    
T  35998946 gtttaatgtttttgtacgattattaaaaaaattattatttatgttgattttaacagtaaaattagtaacatttattaaaatatcattattaattgtagtt 35998847  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
     ||||||| |||||||| ||||    
T  35998846 gatggagtagttaagttggatg 35998825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39397488 - 39397379
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||   || |||| ||| | ||||||||||||   ||| |||||    
T  39397488 ataataatcgtttaaagtttgtgcacgatgtttaaggaaatgattaattatgttgatttcattggtaaatttaatgtcatttactaaaatccccatatta 39397389  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  39397388 attgtagtta 39397379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 42616887 - 42617004
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||    
T  42616887 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtag 42616986  T
Q  120 ttaatggagttgttaagt 137  Q
    | | |||||| |||||||    
T  42616987 taagtggagtagttaagt 42617004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 52869209 - 52869106
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||  ||| |||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  52869209 tcgtttaaggtttgtgcacaattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatagtaagattaatatcgtttattaaaatacctttattaattgtag 52869110  T
Q  120 ttaa 123  Q
    ||||    
T  52869109 ttaa 52869106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 462071 - 461977
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  462071 ttaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaagtaatattatttactaaaatatccttattaattgtaattagcggagtagttaagtt 461977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 137
Target Start/End: Original strand, 20612174 - 20612272
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||   || |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  20612174 gattcttaaaaaaatgattagttgagttgatttcattgctaaagttagtataatttactaaaacaccattattaattgtagataatgaagtagttaagt 20612272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5618679 - 5618582
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgt 117  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||  || ||||| ||||  | |||||||||||||    
T  5618679 tcgtttaatgtttgtgctcgattattaaaaaaatgatgagttgtgttgattttaatggtaaaattaaaattatttattaaaatatccttattaattgt 5618582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Original strand, 18741516 - 18741581
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18741516 taaaattagtgtcatttattaaaatatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatg 18741581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 47358926 - 47359051
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||| || |||| |||||  ||  ||||||    
T  47358926 ataataatcgtttaatgtttgtgcatgatgtctaagaaaattattgattgtgttgatttcaatgataaaattagaataattttctaaaatacttttatta 47359025  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||    
T  47359026 attgtagtcagtggagtaattaagtt 47359051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 50263916 - 50263968
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaatttt 72  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  50263916 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattcactgtgttgatttt 50263968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 16506248 - 16506326
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16506248 aaattattaattatgttaatttcaatgatgcaat-agtaacatttactaaaacacatttattaattgtagttaatggagt 16506326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Original strand, 34321715 - 34321758
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaat 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  34321715 attattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaat 34321758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 53412228 - 53412165
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53412228 acgatttttaagaaaacgattaattttattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaa 53412165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 100
Target Start/End: Original strand, 56250309 - 56250360
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  56250309 aaaatgattgtttgtattaattttgatgataaaattaatattatttactaaa 56250360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3670023 - 3669965
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3670023 ataatagtcgtttaagatttatgcatgatttttaaaaaaatgattaattgtgttgattt 3669965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 25141891 - 25141949
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25141891 ataatagtcgtttaaggtttatatacgatttttaagaaaatgattaaatgtgttgattt 25141949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35252000 - 35251946
Alignment:
Q  46 aagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35252000 aagaaaataattaattgtggttatttcaatgataaaattaatatcatttactaaa 35251946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 96
Target Start/End: Original strand, 21325171 - 21325224
Alignment:
Q  43 attaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttac 96  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21325171 attaaggaaatgataaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttac 21325224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2400890 - 2400798
Alignment:
Q  45 taagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| | ||| || |||||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||    
T  2400890 taagaaaatgatcagttgtattaattataatggtacaattaacattatttactaaaacaccctcattgattgtagtttgtggagtagttaagt 2400798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 17512352 - 17512424
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| | | |||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17512352 aaaatgattagttgagttgattttaaaggtaaaattaatataatttactaaaataccattattaattgtagtt 17512424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Original strand, 41711442 - 41711514
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcattt 94  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||| | |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  41711442 gtttaaggtttgtgcacaatttttatggaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattaatatcattt 41711514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 50264102 - 50264166
Alignment:
Q  58 aattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  50264102 aattgtgttgatttcaatgttaaaattaacatcatttactaaaatactcttattaattgtagtta 50264166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40900062 - 40899932
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40900062 ataatagtcatttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggcaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 40899963  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40899962 attgtagttagtggagtagttaagttagatg 40899932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 6753629 - 6753757
Alignment:
Q  14 taatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaa 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6753629 taatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaatt-tattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaa 6753727  T
Q  114 ttgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  6753728 ttgtagttagtggagtagttaagttggatg 6753757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 40530200 - 40530323
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40530200 tcgtttaaggtctgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtag 40530299  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  40530300 ttagtggagtggttaagttggatg 40530323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21060774 - 21060649
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  21060774 ataatagtcgtttaaggtttatgcacggttattagggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaattagtattatttactaaaatactcttatta 21060675  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  21060674 attgtagttagtggagtagttaagtt 21060649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 7827895 - 7828025
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  7827895 ataataatcgtttaaggtttgtacacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaatacccttatta 7827994  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  7827995 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 7828025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4818688 - 4818565
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4818688 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtag 4818589  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||    
T  4818588 ttagtggagtgattaagttagatg 4818565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 6315771 - 6315876
Alignment:
Q  38 cgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  6315771 cgattattaaggaaatgattgattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtgaagtagttaagt 6315870  T
Q  138 tagatg 143  Q
    | ||||    
T  6315871 tggatg 6315876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8698444 - 8698323
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8698444 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttaccaaaacacccttattaattgtagtt 8698345  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  8698344 agtggagtggttaagttggatg 8698323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 8724987 - 8725100
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8724987 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacacttattaattgtagtt 8725086  T
Q  122 aatggagttgttaa 135  Q
    | |||||| |||||    
T  8725087 agtggagtagttaa 8725100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19930073 - 19929960
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |    
T  19930073 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgattttgatggtaaaactagcgtcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtgaaat 19929974  T
Q  130 tgttaagttagatg 143  Q
     |||||||| ||||    
T  19929973 agttaagttggatg 19929960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 122
Target Start/End: Original strand, 41062161 - 41062238
Alignment:
Q  45 taagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41062161 taagaaaataattaattatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 41062238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9515883 - 9515784
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  9515883 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagataatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaatagtag 9515784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27542932 - 27542814
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  27542932 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaataccatttactaaaatactcttattaattgtag 27542833  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  27542832 ttagtggagtagttaagtt 27542814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 42803598 - 42803719
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42803598 gtttaaggtttatgcacgattatcaaagaaataattaattgtgttcatttcaattgtaaaattagtagtatttactaaaacaccattattaattgtagtt 42803697  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  42803698 aatggagtggttaagttggatg 42803719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27580735 - 27580619
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgatta-ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    ||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27580735 tttaaggtttctgcacgattaatttaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagtt 27580636  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
    | |||||| ||||||||    
T  27580635 agtggagtagttaagtt 27580619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29570529 - 29570406
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  29570529 tcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgttaaaattattagtatttgctaaaacacctttattaattgtag 29570430  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||| | |||||||| ||||    
T  29570429 ttaatggaatagttaagttggatg 29570406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31655190 - 31655081
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  31655190 tcgtttaaagtttgtgtacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactataatatccttattaattgtag 31655091  T
Q  120 ttaatggagt 129  Q
    ||| ||||||    
T  31655090 ttagtggagt 31655081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32440285 - 32440180
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32440285 ataatagtcgttaaaggtttgtgcatgatttttaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttatta 32440186  T
Q  113 attgta 118  Q
    ||||||    
T  32440185 attgta 32440180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 1248575 - 1248698
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1248575 aatagtcgtttaagatttgtgcacggttattaaggaaattattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaat 1248674  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||| || ||| ||||||||    
T  1248675 tgtagttagtgaagtagttaagtt 1248698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29374479 - 29374364
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  29374479 tcgtttaaggtttatttaaggttattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaagacctttattaattgtag 29374380  T
Q  120 ttaatggagttgttaa 135  Q
    ||| |||||| |||||    
T  29374379 ttagtggagtagttaa 29374364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6754156 - 6754043
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||  |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6754156 gtttatgcactattaataagaaaatgattaatt-tgttgatttcaatagtaaaattaatgtcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggag 6754058  T
Q  129 ttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| ||||    
T  6754057 tagttaagttggatg 6754043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 15818456 - 15818573
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatc--atttactaaagcacccttattaattgt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15818456 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatatttactaaaacacctttattaattgt 15818555  T
Q  118 agttaatggagttgttaa 135  Q
    | | | |||||| |||||    
T  15818556 aatcagtggagtagttaa 15818573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 6615870 - 6615979
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  6615870 tgcacgattattaaataaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttaccaaaacatccttattaattttagttagtggagtggtt 6615969  T
Q  134 aagttagatg 143  Q
    ||||| ||||    
T  6615970 aagttggatg 6615979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 38508156 - 38508265
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | | ||||  || |||||||    
T  38508156 ataatagtcgtttaagatttgtgctcgatttttaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattagtatcactcattaaaatactcttatta 38508255  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  38508256 attgtagtta 38508265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 2232049 - 2232149
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||    
T  2232049 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgaataattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattaaaaaactcttattaattttag 2232148  T
Q  120 t 120  Q
    |    
T  2232149 t 2232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 2588037 - 2588139
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       ||||||| |||||||||||    
T  2588037 ataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattag-------tactaaaacacccttatta 2588129  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  2588130 attgtagtta 2588139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41478971 - 41478841
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagca-cccttatt 111  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||    
T  41478971 ataatagtcgtctaaggtttgtgcgcgatttttaagaaaatgattaattgtgcttatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaatatcccttgtt 41478872  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  41478871 aattgcagttaatgga-tagttaagttagatg 41478841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5731893 - 5731811
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  5731893 attattaagaaaatgattaattgtgttcattttaataacaaaatgtgtatcatttactaaaacatccttattaatcgtagtta 5731811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 11796169 - 11796266
Alignment:
Q  46 aagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  11796169 aagaaaatggttaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatattattattaattgtagttagtgtagtagttaagttagatg 11796266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Original strand, 30512661 - 30512740
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30512661 tcgtataaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaa 30512740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Original strand, 30553001 - 30553080
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30553001 tcgtataaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaa 30553080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41492446 - 41492316
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagca-cccttatt 111  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  | ||||| ||    
T  41492446 ataatagtcgtctaaggtttgtgcgcgatttttaagaaaatgattaattgtgcttatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatatcccttgtt 41492347  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41492346 aaatgtagttaatgga-tagttaagttagatg 41492316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41496201 - 41496102
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41496201 cacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttagtaaaacatcattattaattgtagttagtggagtagttaa 41496102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 843581 - 843509
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaatta 85  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  843581 ataataattgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgatttcaatgataaaatta 843509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 118
Target Start/End: Original strand, 15439309 - 15439393
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  15439309 tgcacgatatttaaggaaatgattaattgtattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacttttattaattgta 15439393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Original strand, 22848379 - 22848474
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22848379 gattattaaggaagcgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatagtatttattaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagtta 22848474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29856182 - 29856066
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||| || |||||  || ||||||||||||||    
T  29856182 tcgtttaagatttgtgcacgattattaaggaaataa--aattgcgttgatttcaatgataaaattaatatcacttgctaaaatactcttattaattgtag 29856085  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  29856084 ttagtggagtagttaagtt 29856066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4441129 - 4441043
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |   |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4441129 aaaataattaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaa 4441043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11904349 - 11904227
Alignment:
Q  14 taatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcaccctta-tta 112  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| || | ||  || ||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||    
T  11904349 taatagtcgtttaatgtttgtgcacgatctttaagaaagtgattaattgtattgagttcaataataaaattaatatcatttactaaaatactcttattta 11904250  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||||||  |||||| |||||    
T  11904249 attgtagttggtggagtagttaa 11904227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5282455 - 5282399
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  5282455 ttaagaaaatgattaattgtgctaattttaatgataaaataaatataatttactaaa 5282399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 138
Target Start/End: Original strand, 26285478 - 26285572
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||| |||||||||| |||  || ||||| | | ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26285478 ttaataaaatgattagttgacttgattttaacggtaaaattagtatcatttatgaaaacacacgtattaattgtagttaatgaagtagttaagtt 26285572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 37184069 - 37184159
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaat 124  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||    
T  37184069 tgcaagatttttaaaaaaatgattaattgagttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattcattgtagttaat 37184159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Original strand, 3348116 - 3348207
Alignment:
Q  35 gcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagt-----atcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     || ||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  3348116 gcacggttattaaggaaattattaattatgttgattttgatggtaaaattagtaccccattatttattaaaacacccttattaaatgtagtt 3348207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Original strand, 42922843 - 42922894
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42922843 tcgtttaagatttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattt 42922894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18841592 - 18841514
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  18841592 ttaaaaaaatgattaattatattgatttaaatggtaaaattaatatcatttaataaaataccgttattaattgtagtta 18841514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3076703 - 3076658
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtat 89  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  3076703 ttaacaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtat 3076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Original strand, 38161446 - 38161511
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  38161446 taaaattcatatcatttactaaaatatccttattaatcgtagttagtggagtagttaagttggatg 38161511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Original strand, 18890555 - 18890611
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18890555 ttaagaaaatgattagttgagttgtttttaatggtaaaattagtatcatttattaaa 18890611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 15359056 - 15359186
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15359056 ataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaagaagatgattaattgtgttgattttgatgataaaattaatatcatttactaaaacacccttatta 15359155  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  15359156 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 15359186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16463833 - 16463703
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16463833 ataatagtcgtttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 16463734  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  16463733 attgtagttagtggagtagtaaagtttgatg 16463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39785732 - 39785599
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattag---tatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||    
T  39785732 ataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtactatcatttactaaaacactctta 39785633  T
Q  110 ttaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39785632 ttaattgtagttaatggagtagttaagttggatg 39785599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25637624 - 25637495
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25637624 ataatagttgtttaaggtttatgcacgattat-aaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacctttatta 25637526  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  25637525 attgtagttataggagtagttaagttggatg 25637495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45235725 - 45235595
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45235725 ataatagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatta 45235626  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||    
T  45235625 attgtagttaatgaaatagttaagtttgatg 45235595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16806016 - 16805900
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16806016 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtt 16805917  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
    | |||||||||||||||    
T  16805916 agtggagttgttaagtt 16805900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16845297 - 16845181
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16845297 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtt 16845198  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
    | |||||||||||||||    
T  16845197 agtggagttgttaagtt 16845181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37322566 - 37322442
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaag-aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37322566 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgta 37322467  T
Q  119 gttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  37322466 gttagtggagtagttaagttagatg 37322442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36794428 - 36794298
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  36794428 ataatagtcgtttaagattgatgcatggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcttttactaaaacgcccttatta 36794329  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  36794328 actgtagttagtggagtagttaagttggatg 36794298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39691627 - 39691509
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  39691627 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgcag 39691528  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| || |||||    
T  39691527 ttagtggagtagtaaagtt 39691509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 14523343 - 14523471
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14523343 aatagtcgtttaaagtttatgcaaggttattaaggaaatgattttttgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaat 14523442  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14523443 tgtagttagtggagtagttaagttagatg 14523471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 8947028 - 8947151
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||    
T  8947028 tcgtttaaagtttgtgcataattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaatatttactaaaacatccttattaattatag 8947127  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  8947128 ttagtggagtagttaagttggatg 8947151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 31448669 - 31448792
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  31448669 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagagtcatttactaaaacacccttactaattgcag 31448768  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || | | |||||||| ||||    
T  31448769 ttagtgaaatagttaagttggatg 31448792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 34120416 - 34120536
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |   ||||||||||||||    
T  34120416 cgtttaaagtttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtattatttactaaa--atatttattaattgtagt 34120513  T
Q  121 taatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || |||| | |||||||| ||||    
T  34120514 tagtggaatagttaagttggatg 34120536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43410560 - 43410445
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  43410560 tttaatgtttgtgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgatatcaatgataaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagtta 43410461  T
Q  123 atggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||| ||||||||    
T  43410460 atggagtagttaagtt 43410445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35314011 - 35313901
Alignment:
Q  33 atgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgt 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35314011 atgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagtatttattaaagcaaccttattaattgtagttagtggagtagt 35313912  T
Q  133 taagttagatg 143  Q
    |||||| ||||    
T  35313911 taagtttgatg 35313901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 36354412 - 36354542
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||||||    
T  36354412 ataatagtcatttaaggtttatgtacgattattaaggaaatgactagttgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttattgaaacactcttatta 36354511  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  36354512 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 36354542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32783508 - 32783404
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  32783508 ataataatcatttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgtttattttgatagtaaaattaatatcatttactaaaacacctttatta 32783409  T
Q  113 attgt 117  Q
    |||||    
T  32783408 attgt 32783404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34225725 - 34225609
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34225725 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgaataattatattgattttaatggtaaacttagtattatttactaaaacacccttattaattgtagtt 34225626  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||  |||||||    
T  34225625 aatggagtatttaagtt 34225609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 11742505 - 11742627
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||| |||| | | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11742505 tcgtttaacgtttatgcacgattattaagaaattttttaattgtattgattttgatggtaaa-tcaatattatttattaaaacacccttattaattgtag 11742603  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  11742604 ttaatggagtagttaagtttgatg 11742627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 43115773 - 43115896
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||  || |||||| ||    
T  43115773 aatagtcgtttaaagtttgtgcgcgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaagttagtagcatttactaaaatactcttatttat 43115872  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  43115873 tgtagttagtggagtagttaagtt 43115896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 5789627 - 5789747
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5789627 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 5789726  T
Q  123 atggagttgttaagttagatg 143  Q
     || | | |||||||| ||||    
T  5789727 gtgaaatagttaagttggatg 5789747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19937814 - 19937734
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19937814 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaa 19937734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 16377632 - 16377747
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  16377632 tcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattacaatggtaaaattaatatcatttaccaaaataaccttattaattgtag 16377731  T
Q  120 ttaatggagttgttaa 135  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16377732 ttagtggagtagttaa 16377747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 41220932 - 41221045
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||| |||    
T  41220932 tttatgtacgatttttaaaaacatgattaattgtgttgatttcaattataaaattagtatcatttattaaaatatttttattaattgtagttaatgaagt 41221031  T
Q  130 tgttaagttagatg 143  Q
     ||||||| |||||    
T  41221032 agttaagtcagatg 41221045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17695467 - 17695344
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||| |||||||  |||||||||| |||  |  |||||||||| |||    
T  17695467 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattgatatcatttacaaaaatattcttattaattatag 17695368  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||    
T  17695367 ttagtagagtagttaagttggatg 17695344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 9458268 - 9458365
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||     | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  9458268 ttattaagaaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattag-----tgtattaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttgg 9458362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Original strand, 39329652 - 39329754
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgt--taattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttg 131  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  39329652 tgcacgatttctaagaaaatgatcaattgtgtattgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtagtt-atggagtag 39329750  T
Q  132 ttaa 135  Q
    ||||    
T  39329751 ttaa 39329754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 3323262 - 3323337
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcattta 95  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  3323262 tcgtttaaggtttgtgcacgattattataaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacattta 3323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 26607946 - 26608008
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaatt 84  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  26607946 gtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatt 26608008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27866623 - 27866526
Alignment:
Q  25 taaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  27866623 taaaggttctgcacgatttttaaggaaatgattaataatgttgattttaatgataaaattaatatc-tttagtaaaatatccttattaattgtagttaa 27866526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 35242283 - 35242396
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  |   |||||||||||||||| | ||||    
T  35242283 tttatgcacaatttttaaggagatgtttaattgtgttgattttaatgttaaaattagaatcatttactagaatatatttattaattgtagttagttgagt 35242382  T
Q  130 tgttaagttagatg 143  Q
     |||||||| ||||    
T  35242383 agttaagttggatg 35242396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 43730720 - 43730635
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43730720 aaatgattaggtgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaa--aaccttattaattgtagttactagagtagttaagt 43730635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Original strand, 1206708 - 1206782
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  1206708 aaaatgattaattatgttgatttcagtggtaaaattagtaacatttactaaaatatccttattaattgtagttaa 1206782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11367214 - 11367121
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  11367214 gtttaaagttcgtgcaagattagtaagaagatgattaattgtgttgattttaattgtaaaattaatgtcatttacttaaatacctttattaatt 11367121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19426563 - 19426474
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttga-tgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  19426563 aaatgattaattgtgttgattttcaatgataaaattagcaacatttactaaaatatcattattaattgtagtaagtcgagtagttaagtt 19426474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 32831209 - 32831266
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32831209 taaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttattggagtagttaa 32831266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 18853169 - 18853279
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataa--aattagtatcatttactaaagcacccttat 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||| |||  || |||||    
T  18853169 ataatagtcgtttaaaatttgtgcacgatctttaaggaaataattaattgtgttgatttcaatgataattaatt-gtatcatttaccaaaatactcttat 18853267  T
Q  111 taattgtagtta 122  Q
    || |||||||||    
T  18853268 tagttgtagtta 18853279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 43699595 - 43699655
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  43699595 attattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatagtaaaattagtatcatttattaaa 43699655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 39443850 - 39443799
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39443850 tcgtttaaggtttgtgcacaattattaagaaaatgattaattttgttgattt 39443799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3601499 - 3601465
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgat 56  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3601499 gtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgat 3601465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 5272162 - 5272212
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgt 63  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5272162 ataatagtcgtttaaggtttacgcacgattattaaggaaataattaattgt 5272212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 10005101 - 10005197
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgt 117  Q
    |||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  10005101 tcgtttaaggtttgtgcacatttat-aagaaaatgatcaattgtgttgatttcagcaataaaattagtatcatttactaaaatatctttattaattgt 10005197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3601451 - 3601419
Alignment:
Q  90 catttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3601451 catttactaaaacacccttattaattgtagtta 3601419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 12520827 - 12520891
Alignment:
Q  22 gtttaaag-tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaatta 85  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  12520827 gtttaaagatttgtgcacgattatcaataaaataattaattgtgttgattttaatggtaaaatta 12520891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Original strand, 27501514 - 27501586
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcat 92  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  27501514 tcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggaaatgataaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcat 27501586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Original strand, 34437993 - 34438057
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  34437993 cacggttattaaaaaaatgattaataatgttgattttaatgacaaaatatgtatcatttactaaa 34438057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Original strand, 38187917 - 38187961
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38187917 taaaattagtttaatttactaaaacacccctattaattgtagtta 38187961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21390439 - 21390316
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21390439 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaactaatatcatttactaaaacatccttattgattgtag 21390340  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  21390339 ttagtggagtagttaagttagatg 21390316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 21759969 - 21760092
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21759969 tcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttaataaaacacccttactaattgtag 21760068  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  21760069 ttaatggagtagttaagttggatg 21760092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 41506054 - 41506173
Alignment:
Q  24 ttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  41506054 ttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttag 41506153  T
Q  124 tggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  41506154 tggagtagttaagttggatg 41506173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42935812 - 42935697
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42935812 ataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatta 42935713  T
Q  113 attgtagttaatggag 128  Q
    |||||||||| |||||    
T  42935712 attgtagttagtggag 42935697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 83536 - 83406
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  83536 ataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttatta 83437  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  83436 attgtagttagcggagtagttaagtttgatg 83406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38391892 - 38391785
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38391892 tcgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttgttaattgtag 38391793  T
Q  120 ttaatgga 127  Q
    ||| ||||    
T  38391792 ttagtgga 38391785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 759069 - 759199
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  759069 ataatagtcatttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatta 759168  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  759169 attgtagttagcggagtagttaagttggatg 759199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 16560548 - 16560678
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16560548 ataatagtcatttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatta 16560647  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  16560648 attgtagttagtggggtagttaagttggatg 16560678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16605114 - 16604984
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16605114 ataatagtcatttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatta 16605015  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  16605014 attgtagttagtggggtagttaagttggatg 16604984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40076466 - 40076361
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  40076466 ataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactattatta 40076367  T
Q  113 attgta 118  Q
    ||||||    
T  40076366 attgta 40076361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 11373413 - 11373536
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11373413 tcgtttaaggattgtgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcgatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtag 11373512  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  11373513 ttagtggagtagttaagttggatg 11373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 28202287 - 28202417
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  28202287 ataatagttgtttaaggtttatgcacggttattaagaaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatgtcatttactaaaacatccttatta 28202386  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  28202387 attgtagttagtggagtagtaaagttggatg 28202417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 3178191 - 3178312
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3178191 gtttaaggtttgtgcatgattattaagtaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgtagtt 3178290  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  3178291 agtggagtagttaagttggatg 3178312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9786139 - 9786014
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  9786139 ataatagtcgtttaaggtctgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatttcatttactaaaacacgcttatta 9786040  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||    
T  9786039 attgtagttagtgaagtagttaagtt 9786014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 24516274 - 24516397
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24516274 tcgtttaaggtttatacacgattattaataaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaaaaaccttattaattgtag 24516373  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  24516374 ttagtggagtagttaagttggatg 24516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103754
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28103877 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagcagcatttaccaaaacacccttattaattgtag 28103778  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || ||| |||||||| ||||    
T  28103777 ttagtgaagtggttaagttggatg 28103754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43874067 - 43873944
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43874067 tcgtttaaggttgatgcatggttattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaaatgtag 43873968  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  43873967 ttagtggagtagttaagttggatg 43873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 46478278 - 46478401
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46478278 tcgtttaaagttcatacacgattattaattaaatgattaattgtgttaattttaatagtaaagttagtagcatttactaaaatacccttattaattgtag 46478377  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||    
T  46478378 ttaattgagtagttaagttggatg 46478401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34947651 - 34947521
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34947651 ataatagtcgtttaaggtttgtgcatgtttattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattattatcatttactaaaacacccttatta 34947552  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  34947551 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 34947521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5524524 - 5524401
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| |||    
T  5524524 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttaataaaacacttttattaattatag 5524425  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||    
T  5524424 ttagttgagtagttaagttggatg 5524401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13962110 - 13961980
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||  | ||||||||    
T  13962110 ataatagtcatttaaggtttatgcacgtttattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatatcacttaataaaatatccttatta 13962011  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  13962010 agtgtagttagtggagtagttaagttggatg 13961980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 46211582 - 46211472
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattag---tatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||||||||| || |||||    
T  46211582 ataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtactatcatttactaaaacatcctta 46211483  T
Q  110 ttaattgtagt 120  Q
    |||||||||||    
T  46211482 ttaattgtagt 46211472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7463357 - 7463234
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  7463357 tcgtttaaggattgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttacttaaataccctcattaattgtag 7463258  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  7463257 ttagtggagtagttaagttggatg 7463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2459613 - 2459498
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2459613 tcgtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattag--tcatttactacaacacccttattaattgtag 2459516  T
Q  120 ttaatggagttgttaagt 137  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  2459515 ttagtggagtagttaagt 2459498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27921139 - 27921009
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  27921139 ataatagttgtttaaggttgatgcacagttattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttatta 27921040  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| || | | |||||||| ||||    
T  27921039 attgtagttagtgcattagttaagttggatg 27921009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30866110 - 30865988
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| || |    
T  30866110 cgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatggtataattaatatcatttactaaaatactcttattaattataat 30866011  T
Q  121 taatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || |||||| |||||||||||||    
T  30866010 tagtggagtagttaagttagatg 30865988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22738845 - 22738722
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  22738845 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgtagatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcctcattaattgtag 22738746  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| | || | |||||||| ||||    
T  22738745 ttagtagattagttaagttggatg 22738722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26974173 - 26974052
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagt---atcatttactaaagcacccttattaattg 116  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||  || |||||||||||    
T  26974173 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatcatttactaaaatactcttattaattg 26974074  T
Q  117 tagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  26974073 tagttagtggagtagttaagtt 26974052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44180356 - 44180269
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44180356 ataatagtcgtttaaggtttatacacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaa 44180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 8592426 - 8592548
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8592426 cgtttaaggtttgtgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggttaaattagtagtatttaataaaacacccttattaattgtagt 8592525  T
Q  121 taatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || |||||| || ||||||||||    
T  8592526 tagtggagtagtaaagttagatg 8592548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 19271718 - 19271841
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||| ||||||  ||  |||||||||||||    
T  19271718 tcgtttaatgcttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatgatcaaattagtggcattgactaaaatacttttattaattgtag 19271817  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  19271818 ttagtggagtagttaagttggatg 19271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 29835399 - 29835513
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  29835399 tcgtttaaggtttgtgcgcgcttattaaggaaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgcag 29835498  T
Q  120 ttaatggagttgtta 134  Q
    |||| ||||| ||||    
T  29835499 ttaacggagtagtta 29835513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 34100549 - 34100655
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34100549 acgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattagtagcatttactaaaatatctttattaattgtagttactgaagtagttaag 34100648  T
Q  137 ttagatg 143  Q
    || ||||    
T  34100649 ttggatg 34100655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 21350613 - 21350733
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||| ||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21350613 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaat---taattgtgttgatttcaatggtaaaaatagttgtatttactaaaacacccttattaattgtag 21350709  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  21350710 ttagtggagtagttaagttggatg 21350733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33819356 - 33819240
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||    
T  33819356 gtttaaggttaatgtacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttacaaaatcactcttattaattgttgtt 33819257  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
      |||||| || |||||    
T  33819256 tgtggagtagtgaagtt 33819240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 7457409 - 7457508
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  7457409 tttaatgtttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagttacatttactaaaagacccttattaaatgtagtta 7457508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 21937820 - 21937887
Alignment:
Q  68 attttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21937820 attttaatgataaaattagtgtcatttactaaagcactcttattaattgtagttagtggagtagttaa 21937887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23670629 - 23670507
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  23670629 tcgtttaaggtttgtgcacaattattaagggaat-attaattgtgttgatttccatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaatggtag 23670531  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  23670530 ttagtggagtagttaagtttgatg 23670507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48609011 - 48608887
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    |||||||| || ||||||||||    
T  48609011 aatagtcgtttgaggtttatgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta----ttactaaaacatccttattaat 48608916  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
     ||||||| ||  || |||||||| ||||    
T  48608915 cgtagttagtgatgtagttaagttggatg 48608887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 49101793 - 49101689
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttac---taaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||   ||||  || | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  49101793 acgatttttaagaaaatgattaattgtgtttattttaaggataaaattaatatcatttactattaaaatactcatattaattgtagttagtggagtagtt 49101694  T
Q  134 aagtt 138  Q
    |||||    
T  49101693 aagtt 49101689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 31930482 - 31930591
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||| ||| ||||| || | | ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  31930482 tcgtttaaagtttatgcacgattattaaagaaatgattgactgtgttgattttaatggtaaaactaatctaattttttaaaatacccttattaattgtag 31930581  T
Q  120 ttaatggagt 129  Q
    ||| ||||||    
T  31930582 ttagtggagt 31930591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44424286 - 44424165
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||      |||||||||||    
T  44424286 ataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaat---tatcattta------cacccttatta 44424196  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  44424195 aatgtagttagtggagtaattaagttggatg 44424165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 2850866 - 2850968
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  2850866 tcgtttatggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaataccctcattaattatag 2850965  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  2850966 tta 2850968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 17828337 - 17828459
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| || |||| ||||  ||| |||||||| |||||||||| |||  || ||||| ||||||||    
T  17828337 tcgtttaaagtttgtgcacgat-attaaggaaacgattatttttgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttacaaaattactcttatcaattgtag 17828435  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| ||||||  ||||||| ||||    
T  17828436 ttagtggagtaattaagttggatg 17828459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37245834 - 37245711
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattatt---aagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||||||| |||| ||||  ||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37245834 gtttaaggtttgtgcacgattatttataagaaaaagattaattctgttgatttcaatggtaaa-ttagtagcatttactaaaacactcttattaattgta 37245736  T
Q  119 gttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
     | | |||||| |||||||| ||||    
T  37245735 ataagtggagtggttaagttggatg 37245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 37850707 - 37850835
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagc-acccttatt 111  Q
    |||||| | ||||||||||| | ||||||| || | ||||| |||||| || || ||||| ||   ||||||||||| ||||||||||   | ||||||     
T  37850707 ataataattgtttaaagtttgtacacgattttttaaaaaataattaatggtattgattttaat---aaaattagtatgatttactaaaaagatccttata 37850803  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850804 aactgtagttaatggagttgttaagttagatg 37850835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 6494967 - 6495042
Alignment:
Q  68 attttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  6494967 attttgatggtaaaattagtgttatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatg 6495042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12631446 - 12631347
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  ||  |||||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  12631446 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttatcaaaacatccttattaattgtagtta 12631347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 32018917 - 32019024
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatga-taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  32018917 acgatttttaatgaaatgattaattgtgttgattttgaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgttgttagtggagtaattaa 32019016  T
Q  136 gttagatg 143  Q
    ||| ||||    
T  32019017 gttggatg 32019024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42796094 - 42796043
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42796094 taaaattagtaacatttattaaaacacccttattaattgtagttagtggagt 42796043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 762273 - 762187
Alignment:
Q  48 gaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  762273 gaaaatgattagtagtgttaattttaatgataaaatgtgttacatttactaaaacacacttattaatcatagttcatggagtagtta 762187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 47045469 - 47045538
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47045469 aaatgattaattgagttgatttcaatg-taaaattagtatcatttcctaaaatacccttattaattgtagt 47045538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16904530 - 16904421
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||| || |||||  || | |||||    
T  16904530 ataatagtcgtttaaggtttgtgcaaaatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattattatcactttctaaaatactcgtatta 16904431  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||| ||||||    
T  16904430 attatagtta 16904421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15464790 - 15464718
Alignment:
Q  52 atgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaat 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  15464790 atgattaatagtgttgattttaatggtaaaatgtgtatcatttactaaagtactcttgttaattatagttaat 15464718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 25530991 - 25531070
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25530991 cacgattactaaaaaaatgattaatagtgttgattttaatggcaaaatgtgcatcatttactaaaacactcttattaatt 25531070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39452445 - 39452390
Alignment:
Q  63 tgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39452445 tgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 39452390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7930181 - 7930095
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||  |||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7930181 cacggttattaagaaaatgattagtagtgttgatttcaatggaaaaatatggttcatttactaaaacacccttattaattatagtta 7930095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25571498 - 25571440
Alignment:
Q  85 agtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  25571498 agtatcatttactaaaatacccttattagttgtagttagtggaatagttaagttggatg 25571440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 32018690 - 32018799
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| || |||||| ||| || |||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||  ||  |||||||  ||||||||||||||  || |||||||    
T  32018690 ataatagtcatttaaaatttttgtacgatttttaatgaaatgaataattgtgttgatttcaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttatta 32018789  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||| ||||    
T  32018790 attgtcgtta 32018799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 36790897 - 36790852
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgatta 58  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36790897 ataatagtcgtttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgatta 36790852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 30546413 - 30546457
Alignment:
Q  93 ttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30546413 ttactaaaacacctttattaattgtagttattggagtagttaagt 30546457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31327550 - 31327482
Alignment:
Q  47 agaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaatt 115  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  31327550 agaaaatgatgaataatgttgattttaatgataaaatatgtatcatttactgaaacactcttattaatt 31327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35333100 - 35333064
Alignment:
Q  107 ttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35333100 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatg 35333064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39005507 - 39005463
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  39005507 taaaattagtatcatttactaaaatacctttaataattgtagtta 39005463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 11655923 - 11656046
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11655923 tcgtttaaggtttatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtag 11656022  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||    
T  11656023 ttagtggagtagtaaagttggatg 11656046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21010321 - 21010210
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21010321 ataatagttgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatggaaaaattagtatcatttactaaaacacccttataa 21010222  T
Q  113 attgtagttaat 124  Q
    ||||||||||||    
T  21010221 attgtagttaat 21010210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29363450 - 29363320
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29363450 ataatagtcgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatta 29363351  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  29363350 attgtagttagcggattagttaagttggatg 29363320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6802075 - 6801945
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  6802075 ataatagtcgtttaagattgatgcatggttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacgcccttatta 6801976  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  6801975 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 6801945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 32440615 - 32440745
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32440615 ataatagtcgtttaagatttatgcacggttatttaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttactaaaacacccttatta 32440714  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||| ||||    
T  32440715 attgtaattagtagagtagttaagttggatg 32440745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1781941 - 1781822
Alignment:
Q  18 actcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1781941 actcgtttaaggtttatgcacgattgttaagaaaatgattaattatgttgatctcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgt 1781842  T
Q  118 agttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  1781841 agttagtggag-tgttaagtt 1781822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5302484 - 5302365
Alignment:
Q  24 ttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  5302484 ttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatataatttaccaaaacatccttattaattgtagttaa 5302385  T
Q  124 tggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  5302384 tggagtagttaagttggatg 5302365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 27448126 - 27448231
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  27448126 ataataatcgtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattatta 27448225  T
Q  113 attgta 118  Q
    ||||||    
T  27448226 attgta 27448231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13909558 - 13909438
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13909558 tttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaaatgtgttgatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatacccttattaattgtagtta 13909459  T
Q  123 atggagttgttaagttagatg 143  Q
     ||||||  ||||||||||||    
T  13909458 gtggagtaattaagttagatg 13909438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23142801 - 23142681
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23142801 tttaaggtttatccacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagtggcatttactaaaacacccttattaattgtaggta 23142702  T
Q  123 atggagttgttaagttagatg 143  Q
     |||||| |||||| ||||||    
T  23142701 gtggagtagttaagctagatg 23142681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 6834349 - 6834448
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  6834349 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattatagtta 6834448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 1063580 - 1063699
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || || | |||||||||    
T  1063580 tcgtttaaagtttatgtataatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactctgagtaattgtag 1063679  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtta 139  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  1063680 ttagtggagtagttaagtta 1063699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15058254 - 15058131
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15058254 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattaagttaatttcaatggtaaaattagtggcatttactaaaatacccttattaattgtag 15058155  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || |||  ||||||| ||||    
T  15058154 ttagtgaagtatttaagttggatg 15058131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3291738 - 3291863
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  3291738 ataatagtcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattaattgtatcgattttaatggtaatattagtattatttactaaaatacctttatta 3291837  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||    
T  3291838 attgtagttagtgaagtagttaagtt 3291863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30717044 - 30716919
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||  |||||||| |||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30717044 ataatagtcgtttaagattgatgcacagttattaaggaaatgattaattttattgactttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccttatta 30716945  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| |||||| || |||||    
T  30716944 attgtagttagtggagtagtaaagtt 30716919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Original strand, 11143597 - 11143687
Alignment:
Q  54 gattaattg-tgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||    
T  11143597 gattaattgatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaatcacccttattaattatagttagtgaagtagttaagttggatg 11143687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 24983444 - 24983544
Alignment:
Q  38 cgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagt 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24983444 cgattcttaaggaaatgattagttgagttgatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagt 24983543  T
Q  138 t 138  Q
    |    
T  24983544 t 24983544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Original strand, 31894206 - 31894310
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  31894206 gattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacgtcattattaattgtagttagtgaagtagttaagtt 31894305  T
Q  139 agatg 143  Q
     ||||    
T  31894306 ggatg 31894310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13087667 - 13087544
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13087667 tcgtttaaggttcataaacgattattaagaaagtgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattatag 13087568  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || |||  ||||||| ||||    
T  13087567 ttagtgaagtaattaagttggatg 13087544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 3720218 - 3720336
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  3720218 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaatttgtagtatttacaaaaacactcttattaattgtag 3720317  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||| | ||||||||    
T  3720318 ttagtggaatagttaagtt 3720336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 1955949 - 1956058
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  1955949 ataatagtcgtttaaggtttatacacagtaattaagaaaaagattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaatatactcttatta 1956048  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  1956049 attgtagtta 1956058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 181677 - 181570
Alignment:
Q  35 gcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||  |||||||||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  181677 gcacgattattaaaaaaat-attaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttactaaaacatcattattaattatagttagtggagtagtta 181579  T
Q  135 agttagatg 143  Q
    |||| ||||    
T  181578 agttggatg 181570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21018879 - 21018789
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  | || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  21018879 acgattattaaggaaatgattactactattgattttaatgataaaatatgtattatttactaaaacaccattattagttatagttaatgga 21018789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7072273 - 7072220
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttact 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  7072273 ttaagaaaataattaattgtgttgattttaatggtaaaattagtgtcatttact 7072220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 127
Target Start/End: Original strand, 8115069 - 8115122
Alignment:
Q  74 atgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||    
T  8115069 atgataaaattagtatcatttactaaaatactcttattaattttagttagtgga 8115122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34300078 - 34300009
Alignment:
Q  74 atgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||    
T  34300078 atgataaaattagtattatttactaaaatatccttattaattgtggttagtgaagtagttaagttggatg 34300009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10864951 - 10864886
Alignment:
Q  68 attttgatgataaaattagtat-catttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  10864951 attttgatgataaaat--gtattcatttactatagcacccttattaattatagttaatgaagtagtta 10864886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 27367427 - 27367502
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27367427 tgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Original strand, 27457774 - 27457849
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27457774 tgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27457849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 28101329 - 28101416
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||  ||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28101329 ataatagtcgtttaaaatttatacataatttttaagagaagtatttattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaa 28101416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2423736 - 2423662
Alignment:
Q  39 gattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2423736 gattattcagaaaatgattaatattgttgattttaatggtaaaatatgtatcatttattaaaacactcttattaa 2423662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 8114982 - 8115040
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8114982 ataatattcgtttaaagtttgtgtacaatttttaagaaaatgattaattatgtcaattt 8115040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12340080 - 12339995
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||  || | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  12340080 cacgattattaagaaaatgattagtagtgttgattttaatgat-aaatatgtttaatttactaaaacacttttattaattatagtta 12339995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 21804511 - 21804612
Alignment:
Q  25 taaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaat 124  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||  |||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |    
T  21804511 taaagtttgtgcataatttttaaagaaatgattaattgtattaatttcaattgtaaaattagtatcatttacttaaata-tcttattaattgtagttagt 21804609  T
Q  125 gga 127  Q
    |||    
T  21804610 gga 21804612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1671799 - 1671714
Alignment:
Q  45 taagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagtt 130  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | | ||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  1671799 taagaatatgattagttgcgttgattttaatgataaaatgaatttcaattattaaaacacacctattaattgtagttagtggagtt 1671714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17835492 - 17835420
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  17835492 aaaataattaattgtattgattttaataataaaattaatctcatttactaaaatacatttattaattgtagtt 17835420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 49223960 - 49224090
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49223960 ataatagtcgtttaagattgatgcacggttactaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttatta 49224059  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  49224060 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 49224090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 16395023 - 16395150
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||    
T  16395023 aatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaata-cctttttaat 16395121  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16395122 tgtagttagtggagtagttaagttagatg 16395150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 40144849 - 40144951
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40144849 ttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagttgg 40144948  T
Q  141 atg 143  Q
    |||    
T  40144949 atg 40144951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15699267 - 15699136
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaa-tgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatt 111  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15699267 ataatagtcgtttaaggttgatgcacagttattaagaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 15699168  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  15699167 aattgtagttagtggagtagttaagttggatg 15699136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 20209814 - 20209944
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20209814 ataatagtcgtttaaaggtgatgcaccgttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaacatccttatta 20209913  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20209914 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 20209944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42410138 - 42410029
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42410138 ataatagttgtttaaggttgatgcacggttattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaagcacccttatta 42410039  T
Q  113 attgtagtta 122  Q
    ||||||||||    
T  42410038 attgtagtta 42410029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39864248 - 39864125
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  39864248 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaatactcttattaattgtag 39864149  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  39864148 ttagtggagtagttaagttggatg 39864125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45331485 - 45331370
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45331485 ataatagtcgtttaaggttgacgcacggttattaagaaaataattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatta 45331386  T
Q  113 attgtagttaatggag 128  Q
    ||||||||||||||||    
T  45331385 attgtagttaatggag 45331370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37506271 - 37506143
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattag---tatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||  |||    
T  37506271 ataataatcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgataaaattagtactatcatttactaaaacactttta 37506172  T
Q  110 ttaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37506171 ttaattgtagttagtggagtagttaagtt 37506143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37276588 - 37276491
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37276588 tttatgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtgga 37276491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12039219 - 12039096
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  12039219 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaatacactcttattaattgtag 12039120  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||    
T  12039119 ttaatggagtatttaagttggatg 12039096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38787485 - 38787363
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  38787485 ataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttgccaaaacatccttatta 38787386  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    ||| |||||| |||||| |||||    
T  38787385 attatagttagtggagtagttaa 38787363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 32825961 - 32826080
Alignment:
Q  8 ggtagataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcaccct 107  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32825961 ggtaaataatagtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaat-gtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacctt 32826059  T
Q  108 tattaattgtagttaatggag 128  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  32826060 tattaattgtaattagtggag 32826080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9307764 - 9307641
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9307764 tcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaactgtgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacacccttgttaattgtag 9307665  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  9307664 ttagtggagtagttaagttggatg 9307641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 23168974 - 23169076
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  23168974 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatccttattaattatag 23169073  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  23169074 tta 23169076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 31978633 - 31978751
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||| |||    
T  31978633 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaaagattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcacttactaaactattcttattaattatag 31978732  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31978733 ttaatggagtagttaagtt 31978751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 6160457 - 6160558
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaag 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6160457 acgatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatggaatagttaag 6160556  T
Q  137 tt 138  Q
    ||    
T  6160557 tt 6160558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Original strand, 13579596 - 13579725
Alignment:
Q  14 taatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaa 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  13579596 taataatcatttaaggtttatgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatgacaatattaatatcatttacaaaaacacccatattaa 13579695  T
Q  114 ttgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  13579696 ttgtagttagtggagtatttaagtttgatg 13579725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28749114 - 28749005
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  28749114 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtaattagtagaattgtt 28749015  T
Q  134 aagttagatg 143  Q
    ||||| ||||    
T  28749014 aagttggatg 28749005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26093531 - 26093408
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  26093531 tcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatccttattaattgtag 26093432  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || |||  ||||||||||||    
T  26093431 ttagtgaagtaattaagttagatg 26093408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10495973 - 10495853
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  10495973 gtttaaggtttatgtaagattattaaaaaaattattaattttgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaaca-ctttattaattgtaatt 10495875  T
Q  122 aatggagttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  10495874 agtggagtagttaagttggatg 10495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 21909987 - 21910109
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| | |||    
T  21909987 tcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttgctaaaaca-ccttattaactatag 21910085  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||   ||||| |||||||| ||||    
T  21910086 tttgaggagtagttaagtttgatg 21910109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 917161 - 917059
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  917161 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaataaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtag 917062  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  917061 tta 917059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 41121796 - 41121915
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaa---gaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcaccctta 109  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  41121796 ataatagttgtttaaggtttatgcacatttattaattaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagcataatttactaaaataccctta 41121895  T
Q  110 ttaattgtagttaatggagt 129  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  41121896 ttaattgtagttagtggagt 41121915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7759342 - 7759234
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||| | |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |    
T  7759342 tttatgcacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtgaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggaat 7759243  T
Q  130 tgttaagtt 138  Q
     ||||||||    
T  7759242 agttaagtt 7759234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 43500765 - 43500845
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  43500765 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgattttgatggtataattagtttcatttactaaa 43500845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 35367635 - 35367694
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagta 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35367635 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagta 35367694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2572605 - 2572488
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  2572605 tcgtttaaagtttgtgtacgattattaaaataatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaa-tacaattattaattgtag 2572507  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  2572506 ttagtggagtagttaagtt 2572488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 44761512 - 44761630
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||||| |||    
T  44761512 tcgtttagagtttgtgtatgattaataaaaaaatgattaattatgttaattttaatgataaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattatag 44761611  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||| | ||||||||    
T  44761612 ttagtggaatggttaagtt 44761630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31042931 - 31042835
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  31042931 tttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactgtaatacccttattaattgtag 31042835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 6023630 - 6023753
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6023630 tcgtttaatgtttgtgcgcgattattacggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaatttagtagcttttactaaaatacctttattaattgtag 6023729  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  6023730 ttattggagtagttaagttggatg 6023753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 24991634 - 24991757
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||  |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  24991634 tcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatagtatttactacaacacctttattaattgtag 24991733  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||| | |||||||| ||||    
T  24991734 ttagtggaatagttaagttggatg 24991757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 30754922 - 30755045
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| ||||||||||  | | ||||||||| |||    
T  30754922 tcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaagggtaaaatttatattatttactaaaatatcattattaattatag 30755021  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || | | |||||||||||||    
T  30755022 ttagtgaaatagttaagttagatg 30755045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36702034 - 36701935
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  36702034 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36701935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36718138 - 36718039
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  36718138 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36718039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 44707741 - 44707864
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  44707741 tcgtttaaagtttttgcacgattattatagaaatgattaattatattgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaacacatttattaattgtag 44707840  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || ||  |||||||| ||||    
T  44707841 ttagtgaagcagttaagttggatg 44707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22181462 - 22181368
Alignment:
Q  31 ttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatg 125  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  22181462 ttatgcacggttattaaggaaatgattagttgagttcatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttagttattgtagttaatg 22181368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 33733244 - 33733345
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  33733244 tcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgatt-attgtgttgatttcaatggtaaaattattaacatttactaaaatacttttattaattgtag 33733342  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  33733343 tta 33733345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52429481 - 52429363
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  |||| |||| ||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  52429481 tcgtttaaggtttgtgcacgattatgaaggaaatgattaatttggttgattacgatggtaaatttaatgtcatttattaaaatacccttattaattgtag 52429382  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  52429381 ttagtggagtagttaagtt 52429363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Original strand, 32970565 - 32970650
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  || | |||||||||| ||||    
T  32970565 acgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaatactcgtattaattgttgtta 32970650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 14757610 - 14757698
Alignment:
Q  55 attaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  14757610 attaattgtgttgatttcaacgataaaattagtaacatttactaaaacactcttattaattgtagttagtgaagtagttaagttcgatg 14757698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 34031510 - 34031610
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  34031510 gtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattacttgtgttgattccaatggtaaaattaatatcatttactaaaataccgttattaattgtagtt 34031609  T
Q  122 a 122  Q
    |    
T  34031610 a 34031610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 6267830 - 6267917
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6267830 ataatagtcgtttaaggtttgtgcactatttttaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaactagtatcatgtactaaa 6267917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 8896337 - 8896436
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  8896337 ttaagaaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatatttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatg 8896436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35367869 - 35367816
Alignment:
Q  90 catttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35367869 catttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatg 35367816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 4441605 - 4441707
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttag 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||| |    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  4441605 ttattaagaaaataattaattgtggtgattttaatggtaaaattaatcgtctttactaaaacacccttgttaattgtagttagtggagtaattaaattag 4441704  T
Q  141 atg 143  Q
    |||    
T  4441705 atg 4441707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12151313 - 12151195
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||| | || ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||    
T  12151313 tcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggagattattaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatattgtaattaattgtag 12151214  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||  ||||||||    
T  12151213 ttagtggagcagttaagtt 12151195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 5179380 - 5179489
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||   ||||| |||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  5179380 tcgtttaaggtttgtacacgattcttaacaaaatgattaattgtgttgatttcaatagcaaaatgagtatcatttactaaagttttcatattaattgtag 5179479  T
Q  120 ttaatggagt 129  Q
    ||| ||||||    
T  5179480 ttagtggagt 5179489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31154241 - 31154164
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||   |  |||||||||||||||    
T  31154241 ttaataaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattagtattatctactaaattgcatttattaattgtagtt 31154164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 45615644 - 45615559
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45615644 ttaagaaaatgattagctgtgttaattttaattataaaaggagtttcatttactaaaattcccttattaatagtagttagtggagt 45615559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3312218 - 3312170
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttacta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3312218 aaatgattaattgtgttgattttaatgattaaattagtatcatttacta 3312170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35538756 - 35538677
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35538756 ttaagaaaattattaattgtgttgatttcaatgataaaatggatattatttactaaaatatccttattaattgtagttaa 35538677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24880993 - 24880899
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24880993 attattacggaaatgattgattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacttttattaattgtagttagtggagtagtta 24880899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Original strand, 26252512 - 26252558
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgtt 66  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26252512 tcgtttaaagtttttgcatgattattaaaaaaatgattaattgtgtt 26252558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7351735 - 7351666
Alignment:
Q  58 aattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||    
T  7351735 aattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaataaccttattaattctagttagtgga 7351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9379358 - 9379245
Alignment:
Q  31 ttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaat-ggagt 129  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |   |||||||||||||||| | |||||    
T  9379358 ttatgcacaatttttaaagaaatgattaattgtaatgattttaatgataaaattaatatcatttattaaaatatatttattaattgtagttagtgggagt 9379259  T
Q  130 tgttaagttagatg 143  Q
     |||||||| ||||    
T  9379258 agttaagtttgatg 9379245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11450027 - 11449913
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||  ||| ||||||||  || |||| ||| | |||  ||||||    
T  11450027 ataatagttgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatggttaattatgttgatttcaatggtaaaatta--ataattttctataacacatttatta 11449930  T
Q  113 attgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11449929 attgtagttaatagagt 11449913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 17988563 - 17988646
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatc--atttactaaagcacccttattaattgtagttaatg 125  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17988563 ttaagaatgtgattaattgtgttgatttcaatgttaaaattagtatattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatg 17988646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Original strand, 34688858 - 34688930
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  34688858 aaatgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagtta 34688930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Original strand, 34693386 - 34693458
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  34693386 aaatgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagtta 34693458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43614510 - 43614454
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43614510 ttaaggaaatgattaagtgtgttgattttaatggtaaaattagtatcattgactaaa 43614454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4659894 - 4659843
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattt 71  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4659894 tcgtttagggtttatgcatgaatattaagaaaatgattaattgtgttgattt 4659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Original strand, 22856275 - 22856334
Alignment:
Q  77 ataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaag 136  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22856275 ataaaattaataccatttactaaaataccctaattaattgtagttagtggagtagttaag 22856334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 35682795 - 35682866
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35682795 gtttgtgcacgatttttaacgaaaagattaattgtgttgatttcaatgataacattagtatcatttattaaa 35682866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41080742 - 41080627
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||| | ||  | | ||||||    
T  41080742 ataatagtcgattaaggtttatgcatgaattttaaaaaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaatttatatcatttattgaaatatctttatta 41080643  T
Q  113 attgtagttaatggag 128  Q
    |||||| ||| |||||    
T  41080642 attgtaattagtggag 41080627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 978862 - 978946
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||| | ||  | |||||||||| ||||||| |||||    
T  978862 ttaagaaaatgattagttgtgttgatttcaatgataaaatgtgtttcatttaatgaaatatccttattaatagtagttagtggag 978946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27897083 - 27896983
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||  |  |||||||||| |||||| |||||    
T  27897083 gtttgtgcatgatttttaaggaaataattaaacgtgttgattttaatgataaaattagtataatttatcaaaatattcttattaattatagttagtggag 27896984  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  27896983 t 27896983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Original strand, 29778435 - 29778479
Alignment:
Q  78 taaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  29778435 taaaattagtatcatttactaaaatatcattattaattgtagtta 29778479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 10097963 - 10098093
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10097963 ataatagtcgtttaaggttgatgcatggttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattaatatcatttactataacacccttatta 10098062  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  10098063 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 10098093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13335360 - 13335230
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||    
T  13335360 ataataatcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatggttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttagtaaaacacatttatta 13335261  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||| ||||    
T  13335260 attgcagttagtagagtagttaagtttgatg 13335230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 34393926 - 34394036
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  34393926 ataatagtcgtttaaagttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtataatttactaaaacacctttatta 34394025  T
Q  113 attgtagttaa 123  Q
    ||| |||||||    
T  34394026 attatagttaa 34394036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Original strand, 9300094 - 9300210
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9300094 gtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattgtttgtgttgattttaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttattaattttagtt 9300193  T
Q  122 aatggagttgttaagtt 138  Q
    | |||||| ||||||||    
T  9300194 agtggagtagttaagtt 9300210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 1875571 - 1875673
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1875571 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtag 1875670  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  1875671 tta 1875673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 40996337 - 40996467
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40996337 ataataatcgtttaaggtttatgcacaattgttaaggaaatgattaattgtgttgattttgaatgtaaaattagtttcatttactaaaacacccttatta 40996436  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| || | | |||||||| ||||    
T  40996437 attgtagttagtgaaatggttaagttggatg 40996467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36967505 - 36967413
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacc 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36967505 ataatagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacc 36967413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 21216080 - 21216203
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21216080 tcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttactaaaacatccttattaattgtag 21216179  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  21216180 ttagtggagtagttaagttggatg 21216203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32476424 - 32476301
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32476424 tcgtttaaggtttgtgcacggttattaagaaaatgattgattctgttgatttcaatgataaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtag 32476325  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||    
T  32476324 ttaatgaagtagttaagtttgatg 32476301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31231875 - 31231749
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagttt-atgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatt 111  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  31231875 ataatagtcttttaaaggttgatgcacggttattaaggaaatgatgaattgtgtcgattttgatggtaaaattaatatcatttactgaaacacccttatt 31231776  T
Q  112 aattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31231775 aattgtagttagtggagtagttaagtt 31231749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 26626091 - 26626200
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  26626091 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttattaaaatatccttattaattgtag 26626190  T
Q  120 ttaatggagt 129  Q
    ||| ||||||    
T  26626191 ttagtggagt 26626200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 10179921 - 10180044
Alignment:
Q  15 aatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaat 114  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  10179921 aatagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgagtagttgtattgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaatacacttattaat 10180020  T
Q  115 tgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  10180021 tgtagttagtggagtagttaagtt 10180044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51256 - 51143
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  51256 ataatagttgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatg-taaaataagtatcatttacaaaaacacatttatta 51158  T
Q  113 attgtagttaatgga 127  Q
    |||||||||| ||||    
T  51157 attgtagttagtgga 51143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 22771814 - 22771916
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22771814 tcgtttaaggtttatgcacagttattaaggaattgattaattgggttgattttgatggtaaaattagtgtcatttattaaaacacccttattaattgtag 22771913  T
Q  120 tta 122  Q
    |||    
T  22771914 tta 22771916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31082747 - 31082633
Alignment:
Q  29 gtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  31082747 gtttgtgcacgataattaaggaaatgattaattgtcttgattttaatgataaaattagtggtatttactaaaacacccttattaattatagttagtggag 31082648  T
Q  129 ttgttaagttagatg 143  Q
    | |||||||| ||||    
T  31082647 tagttaagttggatg 31082633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31271158 - 31271040
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||  || |||||||||| |||    
T  31271158 tcgtttaaggtttgtgtacgattattaagaaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatatactaaaatactcttattaattatag 31271059  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  31271058 ttagtggagtagttaagtt 31271040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39405899 - 39405821
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttacta 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39405899 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttacta 39405821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 45425645 - 45425763
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  45425645 tcgtttaagttttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattaataacatttattaaaacattcttattaattgtag 45425744  T
Q  120 ttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||| ||||||  |||||||    
T  45425745 ttagtggagtaattaagtt 45425763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39482752 - 39482635
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39482752 tcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaagggtaaaattagtagaatttactaaaacacccttattaattatag 39482653  T
Q  120 ttaatggagttgttaagt 137  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  39482652 ttagtggactagttaagt 39482635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 143
Target Start/End: Original strand, 44761503 - 44761596
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  44761503 aaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 44761596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Original strand, 2767283 - 2767378
Alignment:
Q  33 atgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  2767283 atgcacggttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaacatccttattatttgtagttagtggag 2767378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 4428324 - 4428453
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||    
T  4428324 ataatagtcgtttaaggtttatgtat-atttttaagaaaatgattatttgtgttgattttaatgataaaattattatcatttactaaaatacaattatta 4428422  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| || | | |||||||||||||    
T  4428423 attgtagttagtgaattagttaagttagatg 4428453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 17719230 - 17719360
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  17719230 ataatagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtaatgattttaatggtaaagttagtattatttactaaaatatccttatta 17719329  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  17719330 attatagttagtggagtagttaagttggatg 17719360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 42972490 - 42972595
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  42972490 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgttttgatttcaatggtaaaattaatatcgtttactaaaatacccttattaattatagtta 42972589  T
Q  123 atggag 128  Q
     |||||    
T  42972590 gtggag 42972595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Original strand, 5053156 - 5053247
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  5053156 ttaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacagtcttattaattgtagttagcggagtagttaa 5053247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 11976915 - 11977038
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||  ||| || ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11976915 tcgtttaaggtttgtgcatgattattatggaaatcattaattgtgttgatttcaatggtataatcagtagcatttactaaaatacccttattaattgtag 11977014  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| | |||| |||||||||||||    
T  11977015 ttagtagagtagttaagttagatg 11977038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 32678862 - 32678787
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagta 88  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  32678862 ataatagtcgtttaaagtttatacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta 32678787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7173031 - 7172933
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7173031 attattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttactaaaacatatttattaattgtagttaatgaagtagttaagtt 7172933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 7703128 - 7703230
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7703128 ataatagtcgtttaaagtttgtgtaagattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttatta 7703227  T
Q  113 att 115  Q
    |||    
T  7703228 att 7703230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 34948659 - 34948789
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||  || |||  ||||||    
T  34948659 ataataatcgtttaagatttgtacacaattattaaggaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattagtatcatttacagaaacacatttatta 34948758  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  34948759 attgtagttagtggagtagttaagttggatg 34948789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 14854916 - 14855027
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14854916 tttaaggtttgtacacgattatcaagaaaatgaatcattgtgttgattttaatggtaaaattaattgcatttgctaaaacacctttattaattgtagtta 14855015  T
Q  123 atggagttgtta 134  Q
     |||||| ||||    
T  14855016 gtggagtagtta 14855027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39329132 - 39329065
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||    
T  39329132 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttaatgataaaattagtatcgttttttaaaatacccttatt 39329065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 138
Target Start/End: Original strand, 4924070 - 4924164
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4924070 ttaagaaaattattagttgtgtatattttaatggtaaaattagtattatttactaaaatatctttattaattgtagttaatagagtagttaagtt 4924164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 29226220 - 29226278
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagta 88  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29226220 tttatgcataattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagta 29226278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 39300920 - 39301018
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgta 118  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39300920 tcgtttaagatttgtgtacgattattaaagaaatgattaattatgttgatttcgatggtaaaattaatatcatttactaaaaaaccctaattaattgta 39301018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Original strand, 396611 - 396704
Alignment:
Q  41 ttattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  396611 ttattaaggaaatgattaattatgttgatttcaacggtaaaattagtatcatttactacaatatccttattaattgtagttaatgaagtagtta 396704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5356706 - 5356630
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||    
T  5356706 aaatgattagttgtgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaatgta-ctttattaattgtagttaatgga 5356630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11649729 - 11649638
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| | ||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  11649729 cacggttattaaaaaaataattaatagggttgattttaataataaaatgtgtatcatttactaaaacacccttattaattatggttaatgga 11649638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32678475 - 32678417
Alignment:
Q  85 agtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  32678475 agtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 32678417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42887104 - 42887019
Alignment:
Q  53 tgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42887104 tgattaattgtgttgatttcaatagcaaaattagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggcgtagttaagtt 42887019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 6796024 - 6796099
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcattta 95  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  6796024 tcgtttaatgtttgtgcacgattattaataaaatgattaacagcgttgattttaatggtaaaattaatatcattta 6796099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 97
Target Start/End: Original strand, 10953405 - 10953464
Alignment:
Q  38 cgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttact 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  10953405 cgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10953464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 97
Target Start/End: Original strand, 10961410 - 10961469
Alignment:
Q  38 cgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttact 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  10961410 cgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10961469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17824022 - 17823935
Alignment:
Q  56 ttaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  17824022 ttaatcgtgttgatttcaatgataaaattagtatcttttactagaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatg 17823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 27294042 - 27294161
Alignment:
Q  24 ttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaa 123  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||  || | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |   |||||||||| |||||     
T  27294042 ttaaggtttgtgcacgatttttaaagaagttattaattgtgttcatttgaatgataaaattagtatcttttactaaaatatatttattaattgcagttag 27294141  T
Q  124 tggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||||  ||||||| ||||    
T  27294142 tggagtaattaagttggatg 27294161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12559735 - 12559650
Alignment:
Q  14 taatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||| |||||||||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  12559735 taatagtcgtttaaaaattatatacgatttttaagaaa-tgattaattgtgttgattttaataataaaattaataccatttactaaa 12559650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33765794 - 33765696
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtt 121  Q
    ||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  33765794 tttaaggtttgtgcacaatttttaaggaaatgattaattatgttgattttaatactaaaattactatcatttactaatatacttttattaattgtagtt 33765696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 3117029 - 3117111
Alignment:
Q  50 aaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtta 134  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3117029 aaatgattaatagtgttgatttcaatggtaaaat--gtgtcatttactaaaacacccttgttaattatagttaatggagtagtta 3117111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8741148 - 8741079
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||    
T  8741148 cacggttattaagaaaatgattagtggtgctaattttgatggtaaaatgtgtttcatttactaaaacacc 8741079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9550052 - 9549999
Alignment:
Q  30 tttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaat 83  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9550052 tttatgcacgataattaatgaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaat 9549999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41092114 - 41092029
Alignment:
Q  37 acgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  41092114 acgatttttaaagaaacgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattgtagtta 41092029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 143
Target Start/End: Original strand, 29226578 - 29226630
Alignment:
Q  91 atttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29226578 atttattaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatg 29226630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31331521 - 31331422
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||  || ||||||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||    
T  31331521 ttaaggaaatgattaattgtattgatttcaattataaaattattattatttactaaaatatcattattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatg 31331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 34455688 - 34455771
Alignment:
Q  44 ttaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaa-ttagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggag 128  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  34455688 ttaaggaaatgactaattgtgttgattttaatgataaaatttagtatcattta-taaaatacgttta-taattgtagttaatggag 34455771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1739777 - 1739709
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagta 88  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  1739777 tcgtctaaggtttgtgtacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagta 1739709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 9839798 - 9839918
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||  || ||| ||||| |||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||  | ||||    
T  9839798 ataatagtcgtttaatgtttatatacaatttttaaggaaatgattaaatgttttgatttcaacgataaaattagtattatttattaaaatacattcatta 9839897  T
Q  113 attgtagttaatggagttgtt 133  Q
    ||| |||||| | ||||||||    
T  9839898 attatagttagttgagttgtt 9839918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30130355 - 30130311
Alignment:
Q  89 tcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30130355 tcatttacgaaagtacctatattaattgtagttaatggagttgtt 30130311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 36006901 - 36006989
Alignment:
Q  55 attaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||  | || ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  36006901 attagttgtgttgattttaatgataaaattaatattattgactaaaatatccctattaattgtagttagtggggtaattaagtttgatg 36006989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Original strand, 44648540 - 44648620
Alignment:
Q  49 aaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||    
T  44648540 aaaatgattagtttagttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatacttactaattgtaattagtggagt 44648620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1848 - 1723
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1848 ataatagtcgtttaagatttatacacggttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccgtatta 1749  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagtt 138  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||    
T  1748 attgtagtcagtggagtagttaagtt 1723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2055
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2162 tcgtttaaggttcatgcacgattattaaggaagtgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattgtag 2063  T
Q  120 ttaatgga 127  Q
    ||| ||||    
T  2062 ttagtgga 2055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39232 - 39127
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  39232 ataataatcgtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattatta 39133  T
Q  113 attgta 118  Q
    ||||||    
T  39132 attgta 39127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 1798 - 1897
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  1798 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattatagtta 1897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16219 - 16130
Alignment:
Q  36 cacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatg 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16219 cacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatagcatttactaaaacacacttattaattgtagttaatg 16130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 7952 - 8082
Alignment:
Q  13 ataatactcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttatta 112  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  7952 ataatagtcgtttacggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattttgttgatttggatggtaaaattaatattatttaccaaaacacccttatta 8051  T
Q  113 attgtagttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  8052 attgtagttagtggagtaattaagttggatg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17172 - 17066
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| |||    
T  17172 tcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattagaacacccttattaattatag 17073  T
Q  120 ttaatgg 126  Q
    |||||||    
T  17072 ttaatgg 17066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 50341 - 50263
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttacta 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50341 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttacta 50263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 105820 - 105703
Alignment:
Q  21 cgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagt 120  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  105820 cgtttaagatttatgcatgattattaagtaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattaatagcgtttactaaaacacccttattaattgtagt 105721  T
Q  121 taatggagttgttaagtt 138  Q
    || || ||| ||||||||    
T  105720 tagtgaagtagttaagtt 105703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Original strand, 20345 - 20454
Alignment:
Q  34 tgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgtt 133  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  20345 tgcaagattattaattaaatgattaattgtgttgattttgattgtaaaattagtatcatttagtaaaatacccttattaattgcagttagtgaagtagtt 20444  T
Q  134 aagttagatg 143  Q
    ||||| ||||    
T  20445 aagttggatg 20454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5527 - 5404
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||    
T  5527 tcgtttaaggtttgtacatgattattaagaaaatgattaactgtgttgaattcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattttag 5428  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||    
T  5427 ttagtggagtagttaagttggatg 5404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 136015 - 136138
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  136015 tcgtttaagatttatgcacgattattaaataaatgattaataatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttattaattatag 136114  T
Q  120 ttaatggagttgttaagttagatg 143  Q
    ||| || ||| |||||||| ||||    
T  136115 ttagtgaagtagttaagtttgatg 136138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 34000 - 34120
Alignment:
Q  23 tttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagtta 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34000 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 34099  T
Q  123 atggagttgttaagttagatg 143  Q
     || | | |||||||| ||||    
T  34100 gtgaaatagttaagttggatg 34120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 6263 - 6341
Alignment:
Q  20 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttacta 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  6263 tcgtttaaagtttgtgcacgatttttaacgaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcattcacta 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6872 - 6794
Alignment:
Q  22 gtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    |||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6872 gtttaaggtttgtgcgtgatttttaaggaaatgattaattgttttaatttcaatgataaaattagtattatttactaaa 6794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 129
Target Start/End: Original strand, 697 - 771
Alignment:
Q  55 attaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagt 129  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  697 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacctttattgattgtagttagtggagt 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 126288 - 126228
Alignment:
Q  40 attattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  126288 attattaaggaaatgattaatagtgtttattttaatgacaaaatgtgtatcatttactaaa 126228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 494 - 435
Alignment:
Q  68 attttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatgga 127  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  494 attttaatgttaaaattagtatcattcaataaaacacccttattaatagtagttagtgga 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University