View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9173_low_1 (Length: 1086)

Name: NF9173_low_1
Description: NF9173
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9173_low_1
NF9173_low_1
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (18-1078)||(130223-131283)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (18-1078)||(34553513-34554573)
chr7 (18-1059)||(34565184-34566228)
chr7 (18-532)||(34290703-34291210)
chr7 (882-1057)||(34291556-34291731)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (19-1059)||(15894875-15895918)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 1029; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 1029; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1078
Target Start/End: Complemental strand, 131283 - 130223
Alignment:
Q  18 cttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131283 cttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgact 131184  T
Q  118 cgaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccatatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgactaaaacttcagtccc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  131183 cgaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccacatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgattaaaacttcagtccc 131084  T
Q  218 tctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcattgattgcaatctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131083 tctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcgttgattgcaacctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaa 130984  T
Q  318 taaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130983 taaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagt 130884  T
Q  418 ttcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130883 ttcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatc 130784  T
Q  518 acaatattctacttgtagtgtatgaagactaaccaaagcttgtgaaaaagatgaaagtttttgaatgtgtaaattgtgcatagacaaaactttgagtgct 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130783 acaatattctacttgtagtgtatgaagactaaccaaagcttgtgaaaaagatgaaagtttttgaatgtgtaaattgtgcatagacaaaactttgagtgct 130684  T
Q  618 ctcattcctctgaagaaatgttctggccattgatttggtccatctccttttgatcgcacttgtagaagttgaagtgtaggacaatctaagctgttttcta 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  130683 ctcattcctctgaagaaatgttctggccattgatttggtccatctccttttgatcgcacttgtagaagttgaagcgtaggacaatctaagctgttttcta 130584  T
Q  718 actctatagtgtgatccaagataagtgatattgcatcgatgtcattcaatttttcttctttcagccttttcatgtcatatttcaccataaacttgtgttc 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130583 actctatagtgtgatccaagataagtgatattgcattgatgtcattcaatttttcttctttcagcctcttcatgtcatatttcaccataaacttgtgttc 130484  T
Q  818 agttttaaatgaaactaagatgacaacatcacgtacaatgtcgtgcatcttcacacaccctggaacattgctgtccaacaacaagaaacatctctttaga 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130483 agttttaaatgaaactaagatgacaacatcacgtacaatgtcgtgcatcttcacacaccctggaacattgctgtccaacaacaagaaacatctctttaga 130384  T
Q  918 tcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatcccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaatag 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130383 tcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatcccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaatag 130284  T
Q  1018 gaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataaggagcttcttgtgttctctgct 1078  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130283 gaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataaggagcttcttgtgttctgtgct 130223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 1078
Target Start/End: Original strand, 34553513 - 34554573
Alignment:
Q  18 cttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgact 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  34553513 cttattgcaaggatttcacatttcttaatcaattgtgagaccatcaatatgctattaatagattgataatctatagcaccgacttgcaataaatttgact 34553612  T
Q  118 cgaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccatatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgactaaaacttcagtccc 217  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  34553613 ccaaatatgcagagcgctgaaaatcactataaagatccacataaatccaaaacttttgtaggttgtataagttcaagtccttgactgaaatttcagtccc 34553712  T
Q  218 tctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcattgattgcaatctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaa 317  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  34553713 tctgactttcatctcaacaacctttagctgatgagatatctttttcaactcattgatcgcaatttcatttttttcccaaggaaaattgtccatccttaaa 34553812  T
Q  318 taaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagt 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34553813 taaagttcttccaatcgagacaatcttatcaagacattagtagaaatgactttaagatcattgcaatttgtcaaatccaataatcttagaatgctcaagt 34553912  T
Q  418 ttcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatc 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34553913 ttcctatttcaactggaagttctttaattttagagtgtgcaaaacttaagacttctaggtgtataagttccttaccaattatagatatatctccaacatc 34554012  T
Q  518 acaatattctacttgtagtgtatgaagactaaccaaagcttgtgaaaaagatgaaagtttttgaatgtgtaaattgtgcatagacaaaactttgagtgct 617  Q
    ||||||||||| | | ||  |||| || |||||  |  |||| || | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  34554013 acaatattctaatagcagcatatggaggctaactgagacttgagatagagatggaagttttggaatgtacacattttgcatagacaaaactttgagtgat 34554112  T
Q  618 ctcattcctctgaagaaatgttctggccattgatttggtccatctccttttgatcgcacttgtagaagttgaagtgtaggacaatctaagctgttttcta 717  Q
     |||| | |  |||||||||||| ||||| || ||||||   | | |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  34554113 ttcatgcattggaagaaatgttccggccaatggtttggtttcttttcttttgatctaacttgtagaagctgaagggtaggacactctaagttgtcttcta 34554212  T
Q  718 actctatagtgtgatccaagataagtgatattgcatcgatgtcattcaatttttcttctttcagccttttcatgtcatatttcaccataaacttgtgttc 817  Q
    || |||  || | || |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  34554213 accctaccgtctcattcaagataagtgataatgcactgatgtcatttaatttctcttctttcaaactcttcatgtcatatctcaccataaacccatgttc 34554312  T
Q  818 agttttaaatgaaactaagatgacaacatcacgtacaatgtcgtgcatcttcacacaccctggaacattgctgtccaacaacaagaaacatctctttaga 917  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34554313 tattttaaatgcaactaatatgacaacatcacgtacaatatcatgtatcttcacacaccctgggacattgctatccaacaacaagaagcatctctttaga 34554412  T
Q  918 tcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatcccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaatag 1017  Q
    ||| |||| ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  34554413 tcgtccacaaaactattcactcggtttcttgctttccatggctcaccgatagctttgaacaatcccaagcccattgcgtgacataataaactttcaatag 34554512  T
Q  1018 gaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataaggagcttcttgtgttctctgct 1078  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  34554513 gtatgtcaaagtcttccggaaacaatccacaaagcataaggaatttcttgtgttctgtgct 34554573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 1059
Target Start/End: Original strand, 34565184 - 34566228
Alignment:
Q  18 cttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgact 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  34565184 cttattacgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcaatatgctaccaatagattgatagcctataccactaacttgcaataaagttgagt 34565283  T
Q  118 cgaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccatatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgactaaaacttcagtccc 217  Q
    | |||| |  ||| || ||||||||| | ||   ||||| ||| | |||||||||||| |  || |  |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  34565284 ccaaatataaagatcgttgaaaatcagtgtatggatccacataaacccaaaacttttgcaagtttttgaagtccaaatccttgactaaactttcagcccc 34565383  T
Q  218 tctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcattgattgcaatctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaa 317  Q
     |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |     
T  34565384 cctaaattttatctcaacaacctttagctgatgagatatttttttcaattcgttgagcgcaacttcatttcttttccaaggaaaattgtctattctatag 34565483  T
Q  318 taaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagt 417  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  |    
T  34565484 taaagttcttccaaccgagacaatcttatcaagatattatcagaaatgatgtcaagatcattgcaatttgacaaatctaataatcttacactgcccagat 34565583  T
Q  418 ttcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatc 517  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34565584 ttcctatttcaattgggagttctttaatattagaatgtgcaaaacttaggacttctaggtgtttaagttccttaccgattatagatatatctccaacatc 34565683  T
Q  518 acaatattctacttgtagtgtatgaagactaaccaaagcttgtgaaaaagatgaaagtttttgaatgtgtaaattgtgcatagacaaaactttgagtgct 617  Q
    ||| | ||||||||| | ||| || ||| | ||  ||||||| || ||| |||  |||||| |||||  |||||| | ||| || |||||||| ||||      
T  34565684 acagtgttctacttgcaatgtgtggagattgactgaagcttgggataaatatggcagttttggaatgcataaatttttcatggataaaactttaagtgtg 34565783  T
Q  618 ctcattcctctgaagaaatgttctggccattgatttggtccatctccttttgatcgcacttgtagaagttgaagtgtaggacaatctaagctgttttcta 717  Q
    ||||| | |  ||||||| |||| |||||     ||||| | |  | |||||| |  ||||||| || || |||||| ||||| | |||||  |||||||    
T  34565784 ctcatgctttggaagaaaagttcaggccaaaacattggttccttgctttttgaacttacttgtaaaattttaagtgtcggacagtgtaagccattttcta 34565883  T
Q  718 actctatagtgtgatccaagataagtgatattgcatcgatgtcattcaatttttcttctttcagccttttcatgtcatatttcaccataaacttgtgtt- 816  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| || || || | |   || || ||||| || || | ||     
T  34565884 actctttagtatcatccaaaataagtgatattgcattgatctcgttcaatttctcttcttttagactcttaaaggtgtactttaccatgaatttatcttc 34565983  T
Q  817 --cagttttaaatgaaactaagatgacaacatcacgtacaatgtcgtgcatcttcacacaccctggaacattgctgtccaacaacaagaaacatctcttt 914  Q
      || |||||||||  ||| | || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||   |||| ||    
T  34565984 tgcatttttaaatgctactgatataacaacattacgcacaatatcatgcatcttcacacaccctggcacactgctatccaacaataaaaactttctcctt 34566083  T
Q  915 agatcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatcccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaa 1014  Q
    |||||  |||||||  || |||||||||||||||||| | |||   |||  | | ||||||||   |||||||| |   |||||| ||||||| ||||||    
T  34566084 agatcttccaccaatgtatgcactcgatttcttgcttcccatgatgcactgatgtctttgaacggacccaagccaaaaccatgacacaataaactttcaa 34566183  T
Q  1015 taggaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataagga 1059  Q
    | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34566184 tgggaatgtcaaagtcttctggatacaatccacaaagcataagga 34566228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 532
Target Start/End: Original strand, 34290703 - 34291210
Alignment:
Q  18 cttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgact 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||    
T  34290703 cttattgcaaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcaatatgctattaatagattgataatcaatac-------ttgcaataaatttgact 34290795  T
Q  118 cgaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccatatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgactaaaacttcagtccc 217  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |  ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34290796 ccaaatatgcagagtgctgaaaatcactataaagatccacataaatccaaaacttttgcaagttgttgaaaaccaaatccttgactaaaatttcagcccc 34290895  T
Q  218 tctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcattgattgcaatctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaa 317  Q
    || |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | || |   ||||||   |||||||||||||||||||| || ||     
T  34290896 tccaactttcatctcaacaacctttagctgatgagatatctttttcaactcgttcagtgaagcttcatttttcttccaaggaaaattgtccattctaaag 34290995  T
Q  318 taaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagt 417  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  |    
T  34290996 taaatttcttccaaccgagacaatcttatcaagacattatcagaaatgatgacaagatcgttgcaatttgacaaatccaataatcttagactgcccagat 34291095  T
Q  418 ttcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatc 517  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34291096 ttcctatttcaaatgggagctctttaatattagaatctgcaaaacttaggacttctaggtgtttaagttccttaccaattatagatatatctccaacatc 34291195  T
Q  518 acaatattctacttg 532  Q
    ||||| ||| |||||    
T  34291196 acaatgttccacttg 34291210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 882 - 1057
Target Start/End: Original strand, 34291556 - 34291731
Alignment:
Q  882 acattgctgtccaacaacaagaaacatctctttagatcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatc 981  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||   |||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||   ||  || |  |||||||||||    
T  34291556 acattgctgtccaacaacaagaactttcgtcttagatcttccaccaatgtatgcactcggtttcttgctttcaatgatgcattaatgtatttgaacaatc 34291655  T
Q  982 ccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaataggaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataag 1057  Q
    ||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291656 ccaagccaaaagcatgatacaataaactttcaataggaatgtcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataag 34291731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 1059
Target Start/End: Original strand, 15894875 - 15895918
Alignment:
Q  19 ttattgcgaggatttcacatttcttaatcaattgtgagatcatcagtatgctattaatagattgatagtctatagcactaatttgcaataaatttgactc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15894875 ttattgcaaggatttcacatttcttaatcacttgtgagatcatcaatatgctatttatatattgataacctatagaactaacttgcaataaatttgactc 15894974  T
Q  119 gaaatgtgcagagcgctgaaaatcactataaatatccatatagatccaaaacttttgtagattgtataagtccaaatccttgactaaaacttcagtccct 218  Q
     |||| || ||| |  ||||||| |   ||   ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  15894975 caaatatgaagatctttgaaaattagagtatcgatccacataaacccaaaacttctgtaagttgttgaagaccaaatccttgagtaaaatttcagtacct 15895074  T
Q  219 ctaacttttatctcaaagacctttagctgataagatatcttttttaactcattgattgcaatctcatttcctttccaaggaaaattgtccatccttaaat 318  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||   |||||||||||||||| |||||| || |    
T  15895075 ctaaatttcatctcaacaacctttagctgatgagatatctttttcagctcgttgatcgcaacttcatttttattccaaggaaaattgtacatcctaaagt 15895174  T
Q  319 aaagttcttccaatcgagacagtcttatcaagacattactagaaatgacattaagatcattgcaatttgtcaaatctaataatcttagaatgctcaagtt 418  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |     
T  15895175 aaagttcttccaaccgaaacagtctaatcaagacattatcagaaatgaaattcagatcattgcaacctgtcaaatccaataatcttagactgcccaaatc 15895274  T
Q  419 tcctatttcaattggaagttctttaatattagagtgtgcaaaacttaggacttctatgtgtgtaagttccttaccaattatagatatatcaccaacatca 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15895275 tcctatttcaattgggagttctttaacattggaatgtgacaaacttaggacttctagaagtaaaagtttcttaccaattatagatatatctccaacatca 15895374  T
Q  519 caatattctacttgtagtgtatgaagactaaccaaagcttgtgaaaaagatgaaagtttttgaatgtgtaaattgtgcatagacaaaactttgagtgctc 618  Q
    |||| ||||||||  | ||| || ||| | |     ||||| || | ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| |||||||| || || |    
T  15895375 caatgttctactttcaatgtgtggagattgaatggggcttgggatagagacgagagtttaggaatgcacaaattttgcatagataaaactttaagagcac 15895474  T
Q  619 tcattcctctgaagaaatgttctggccattgatttggtccatctccttttgatcgcacttgtagaagttgaagtgtaggacaatctaagctgttttctaa 718  Q
     |||||||  ||||||| |||| |||||     ||||| | |  | |||||| |  ||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||   |||||||    
T  15895475 acattccttggaagaaaagttcgggccaagagattggttccttgctttttgaccttacttgaaaaagtttaagtgtcggacactctaagccactttctaa 15895574  T
Q  719 ctctatagtgtgatccaagataagtgatattgcatcgatgtcattcaatttttcttctttcagccttttcatgtcatatttcaccataaacttgtg---t 815  Q
    ||   | |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |  || || | ||  |||| ||||||||| || ||   |    
T  15895575 cttgtttgaatcatccaagataagtgatattgctttgatgtcattcaatttctcttcttttaaactcttaaagttgtattgcaccataaatttatgttct 15895674  T
Q  816 tcagttttaaatgaaactaagatgacaacatcacgtacaatgtcgtgcatcttcacacaccctggaacattgctgtccaacaacaagaaacatctcttta 915  Q
    ||| |||||||| ||| | | || |||||||  || ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| |||||| ||   ||||||||    
T  15895675 tcacttttaaataaaaatgatataacaacatttcgcacaatatcatgcatctttacacatcctcgcacattactttccagcaacaaaaactttctcttta 15895774  T
Q  916 gatcgcccaccaaactacgcactcgatttcttgctttcaatggctcaccaacggctttgaacaatcccaagcctattgcatgacgcaataaaatttcaat 1015  Q
    |||   | |||||  || ||||| | | |||||||| | |||   ||  || |  |||||||| |||||| || | ||||||| |||| |||  ||||||    
T  15895775 gattatctaccaatgtatgcacttggtctcttgcttcccatgatgcagtaatgtgtttgaacattcccaaacccactgcatgatgcaacaaacattcaat 15895874  T
Q  1016 aggaatatcaaagtcttctggaaataatccacaaagcataagga 1059  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15895875 aggaatatcaaagtcttcaggaaacaatccacaaagcataagga 15895918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University