View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9195_low_2 (Length: 1377)

Name: NF9195_low_2
Description: NF9195
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9195_low_2
NF9195_low_2
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (13-1362)||(6140487-6141836)
chr3 (13-1362)||(6167098-6168441)
chr3 (13-1362)||(6257403-6258752)
chr3 (15-1358)||(6263887-6265233)
chr3 (13-1354)||(13271032-13272373)
chr3 (13-1358)||(6898293-6899638)
chr3 (13-1358)||(6591832-6593177)
chr3 (13-1358)||(6915306-6916651)
chr3 (13-1358)||(7748207-7749552)
chr3 (13-1358)||(6722558-6723903)
chr3 (13-1357)||(6880722-6882066)
chr3 (13-782)||(6244074-6244843)
chr3 (662-1220)||(6236068-6236626)
chr3 (580-1343)||(6850327-6851087)
chr3 (166-667)||(6237650-6238153)
chr3 (807-1358)||(6243522-6244073)
chr3 (835-1235)||(5297073-5297473)
chr3 (24-621)||(5279595-5280192)
chr3 (151-397)||(8453813-8454059)
chr3 (24-436)||(8569460-8569872)
chr3 (162-395)||(6520800-6521033)
chr3 (195-395)||(6735118-6735318)
chr3 (203-395)||(6946433-6946625)
chr3 (210-395)||(6480671-6480853)
chr3 (825-1204)||(7586227-7586606)
chr3 (162-395)||(6555106-6555339)
chr3 (201-398)||(5262942-5263135)
chr3 (991-1220)||(8469900-8470129)
chr3 (991-1218)||(8452977-8453204)
chr3 (987-1153)||(5266489-5266655)
chr3 (991-1218)||(8570415-8570642)
chr3 (203-313)||(8588978-8589088)
chr3 (687-946)||(5279276-5279535)
chr3 (232-291)||(6850245-6850304)
chr3 (218-565)||(5267047-5267391)
chr3 (1047-1218)||(6730242-6730413)
chr3 (953-1153)||(4390336-4390536)
chr3 (825-947)||(5262399-5262521)
chr3 (364-626)||(5297661-5297923)
chr3 (1047-1218)||(6450314-6450485)
chr3 (687-905)||(5248814-5249032)
chr3 (343-395)||(6527721-6527773)
chr3 (991-1115)||(6528477-6528601)
chr3 (687-1128)||(6734385-6734820)
chr3 (218-313)||(4389634-4389729)
chr3 (165-626)||(5249099-5249557)
chr3 (202-263)||(6449468-6449529)
chr3 (991-1204)||(6522946-6523159)
chr3 (690-959)||(6555610-6555879)
chr3 (590-627)||(6795692-6795729)
chr3 (590-627)||(7586792-7586829)
chr3 (590-627)||(8470487-8470524)
chr3 (825-905)||(4390229-4390309)
chr3 (991-1135)||(6481446-6481590)
chr3 (687-803)||(6528041-6528157)
chr3 (232-268)||(6850199-6850235)
chr3 (687-803)||(8453392-8453508)
chr3 (687-767)||(8570111-8570191)
chr3 (164-259)||(7587160-7587255)
chr3 (687-734)||(8588563-8588610)
chr3 (1103-1153)||(5248587-5248637)
chr3 (343-437)||(6839729-6839823)
chr3 (576-626)||(8588674-8588724)
chr3 (825-958)||(6795909-6796042)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (13-799)||(35140851-35141634)
[»] scaffold0425 (5 HSPs)
scaffold0425 (195-395)||(8178-8378)
scaffold0425 (232-291)||(13353-13412)
scaffold0425 (586-659)||(13441-13513)
scaffold0425 (687-906)||(8655-8874)
scaffold0425 (232-268)||(13307-13343)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (168-614)||(6573969-6574415)
chr7 (687-769)||(6574482-6574564)
[»] scaffold1643 (2 HSPs)
scaffold1643 (825-908)||(825-908)
scaffold1643 (590-626)||(1089-1125)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 1338; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 1338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1362
Target Start/End: Complemental strand, 6141836 - 6140487
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141836 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6141737  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141736 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 6141637  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141636 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 6141537  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6141536 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacgtcatcttaatttgaaaggcacaca 6141437  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141436 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcctgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 6141337  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141336 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 6141237  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141236 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 6141137  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141136 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 6141037  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141036 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 6140937  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140936 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 6140837  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140836 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 6140737  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140736 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 6140637  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140636 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 6140537  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgttatt 1362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140536 ctttggtcaaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgttatt 6140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 1087; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1362
Target Start/End: Complemental strand, 6168441 - 6167098
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168441 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcagattcgtgacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6168342  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168341 tgaccagcgctttcagataagcaccgatgttcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcgaaggttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 6168242  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6168241 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctacgatatctagacctttcttacaccgacattacaagcttacctaattccatttgtatgctgtataatt 6168142  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6168141 tgcatacgctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaattttggcaaactcatcaatttacgtcatcttaatttgaaaggcacaca 6168042  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6168041 tatcaagaagatgccaaaggagataagagtattaatcaatcttgagatgctgactgattttgttgtgggagagcaacatggatatgatattaagctgttg 6167942  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167941 gaagaacttaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaagaatgtgaccgatccagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 6167842  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6167841 atttacaagaattaatcatgtcatacgatgaatggagagaaatggaaggctcagaaactgaagcacgtctcttggtcttggaggctcttcaaccaaatag 6167742  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6167741 aaatctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttccaaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttt 6167642  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6167641 ggatgtaaacactgttcccagttgccaccacttgggcagttccattctctcaagaagctttccatttccggctgtcatggaatagagaacattggttcag 6167542  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||||| | |||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167541 agtttttcggctataatt------atgctgcatttagatcccttgaaactttgcgggtggagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 6167448  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6167447 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgctctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggaaattattgat 6167348  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6167347 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcatttcgataaatgaattgccatcatgct 6167248  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6167247 tgataagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttaaagagttggaagttgaagactt 6167148  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgttatt 1362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6167147 ctttggtcgaaatatggaatggttctctttgtatatgtgtagctgttatt 6167098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 1066; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1362
Target Start/End: Complemental strand, 6258752 - 6257403
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6258752 tttggtgccgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcagattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagaacaaggatatgg 6258653  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6258652 tgagaaacgctttaagatatccaccaatgtgcagcagagtttgttttcaagactaaaatatttgcggatattgtctttctctggttgcaatctcttagag 6258553  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  6258552 ctagctgatgagataagaaacttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacaccgagattacaagtttacctgattccatttgtatgttgtataatt 6258453  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  6258452 tgcatacactcttactggaagaatgttttaaactgactgagctcccatcaaattttcacaatctcatcaatttatgtcatcttaatttgaaaggcacgca 6258353  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6258352 tattaagaagatgccaaagaagataagagaattaatcaatcttgagatgctgactgattttgttgtggaagagcaacatggatatgatattaagcagttg 6258253  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6258252 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcgaatttcagggttgaaaaacgtggcggatccagcagttgctatggcagcaaatttgaaagagaagaaac 6258153  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6258152 atttagaagaattaagtttgtcgtatgatgaatggagagaaatggatggctcagaaactgaagcacgtgtatcggtcttggaggctcttcaacctaatag 6258053  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  6258052 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttccaaattggcttggggatcttaatctaccaaatttagtatctcttgaattagtg 6257953  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6257952 ggatgtaaacattgttcccagttgccaccacttgggaagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaataaagatcattggttcag 6257853  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257852 agttttgcggctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 6257753  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257752 tttccctctgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 6257653  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257652 tgcgaagagttggaggctttaattccaaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 6257553  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257552 tgaaaacggccatcctttgtggcactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 6257453  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgttatt 1362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6257452 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgcatgtgtgtagctgttatt 6257403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 985; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 1358
Target Start/End: Complemental strand, 6265233 - 6263887
Alignment:
Q  15 tggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatggtg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6265233 tggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactagagaatgttaaaaaaatcaagggactacacagtctgatggtagaagcacaaggctatggtg 6265134  T
Q  115 accaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagct 214  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6265133 accaacgctttaaggtacgcaccgatgtgcagcttaatttgtttttaagactaaaatatttgcgaatgttgtctttctcgggttgcaatctcttagagct 6265034  T
Q  215 agctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6265033 agctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacagagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtatagtttg 6264934  T
Q  315 cataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6264933 cataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacgtcatcttaatttgaaaggcacacata 6264834  T
Q  415 ttaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggc 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264833 ttaagaagatgccaaaggagatgagagggttaataaaccttgagatgctgaccgattttgttgtgggagagcaacatggatttgatattaagcagttggc 6264734  T
Q  515 agaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacat 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6264733 agaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtggctgatccagcagatgctatggcagcaaatttgaaacataagaaacat 6264634  T
Q  615 ttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatagaa 714  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6264633 ttagaagaattaagtttgtcgtatgatgaatggagagaaatggatggctcagtaactgaagcatgtttctcggtcttggaggctctgcgaccaaatagaa 6264534  T
Q  715 acctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcat---catctacccaatttagtatctcttgaattgtt 811  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6264533 atctcacgaggctcagcatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatcatctagccaatttattatctcttgaattgtt 6264434  T
Q  812 gggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttca 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6264433 gggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggagtagagatcattggttca 6264334  T
Q  912 gagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaag 1011  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6264333 gagttttgccgctataattcagcaaatgttccatttagatcccttgaaactttgtgtttcaagaacatgtctgaatggaaggaatggttatgtcttgatg 6264234  T
Q  1012 gtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattga 1111  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  6264233 gtttccctttagttaaagagctttctctaaatcattgtcccaaattgaaaagtaccctgccttatcacctcccttctttgctaaaattggagattattga 6264134  T
Q  1112 ttgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagc 1211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6264133 ttgccaagagttggaggcttcaattcctaatgctgctaatatcagtgatatagagctaaagagatgtgatggcatttttataaataaattgccatcaagc 6264034  T
Q  1212 ttgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagact 1311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6264033 ttggaaagggccatcctttgtggaactcatgtcattgaaaccaccctagagaaaattctagttagcagtgcctttcttgaagaactggaagttgaagact 6263934  T
Q  1312 tctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6263933 tctttggtccaaatctagaatggtcctctttgaatatgtgtagctgt 6263887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 982; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1354
Target Start/End: Original strand, 13271032 - 13272373
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271032 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcagattcataacattaaaggactacggagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 13271131  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13271132 tgataaacgctttaagatatccaccaatgtgcagtataatttgtattcaagactacaatatttacggatgttatctttcaaaggttgcaatctctcagag 13271231  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  13271232 ctagctgatgagataagaaacttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacaccgagattacaagcttacctgattccatttgtatgttgtataatt 13271331  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |   |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13271332 tgcatacgctcttgctgaaagaatgttttaaactacttgagctcccgccaaatttttgcaaactcatcaatttacgtcatcttaatttgaaaggcacgca 13271431  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13271432 tattaagaagatgccaaaggagataagtgaattaatcaatcttgagatgctgactgattttgttgtgggagagcaacatggatatgatattaagcagttg 13271531  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271532 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcaggattgaaaaatgtggctcatccagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 13271631  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13271632 atttagaagaattaagtttgtcgtatgatgaatggagagaaatggatggcttagtaactgaagcacgtgtctcggtcttggaagctcttcaaccaaatag 13271731  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271732 acacctcatgagactcaccatcaatgactacagaggtagtagctttccaaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 13271831  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271832 ggatgtaaactctgttcccagttgccaccacttgggcagttgccttctctcgagaagctttccatttctggctgtcatggaatagagatcattggttcag 13271931  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13271932 agttttgcggctataatccatcaaatgttccatttagatcccttgaaactttgcgggttgagcatatgtctgaatggaaggaatggttatgtcttgaagg 13272031  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13272032 tttcccattgcttcaagagctttgtataacgcattgtcccaagttgaagagtgctctgcctcagcacgttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 13272131  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13272132 tgccaagagttggaggcttcaattcctaatgctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcatttttataaatgaattgccatcaagct 13272231  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13272232 tgaaaagggccatcctttgtggaactcatgtcattgaaatcaccctagagaaaattctagttagtagtccctttcttgaagaactggaagttgaagactt 13272331  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtag 1354  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13272332 ctttggtccaaatctagaatggtcctctttggatatgtgtag 13272373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 786; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1358
Target Start/End: Complemental strand, 6899638 - 6898293
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899638 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactagagcatattcttaaaattaagggactacacagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6899539  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
      ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6899538 caaccaacgttttaggataagcaccaatgtgcagcataatttgttttcaagagtaaaatatttgcgggtgttgtctttctctggttgcaatctcatagag 6899439  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6899438 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacaccgagattgcaagcttacctgattccatttgtatgctgtataatt 6899339  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    |||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  6899338 tgcagacactcttactgcaaggttgttttaaactgactgagctcccttcagatttttgcaaactcgtcaatctacgtcatcttaatctgcaaggcactca 6899239  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  6899238 tataatgaagatgccaatgaagataggagggttaaacaatcttgagatgctgactgattttgttgtgggagagcagcgtgaatttgatattaagcagttg 6899139  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    |   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    ||||  ||| ||||| | |||||| |||||||||| ||  |||    
T  6899138 gggaaactcaaccaacttcaaggaaggcttcaaatttcagggttggaaaacgtcaaagatcctgcatatgctgtagcagcatatttgaaagacaaagaac 6899039  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6899038 agttagaagaattaagtctgtcatacgatgattggataaaaatggatggatcagtaactaaagcacgtgtctctgtcttagaggctcttcaaccaaatat 6898939  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6898938 aaacctcatgaggctaaccatcaaagactacagaggcagtagatttccaaattggcttggggttcatcatttacccaatttagtatctctagaattgttg 6898839  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  6898838 ggatgtaaacttcgttcccagttgcccccacttgggcagttaccctctctcaagaagctttccatttcaggctgtgatggaatagatatcattggtacag 6898739  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    || ||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6898738 agatttgtggctacaattcatcaaatgatccatttagatcccttgaaactttgcgatttgagcacatgtctgaatggaaggaatggttatgtcttgaatg 6898639  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  6898638 ttttcatttgcttcaagagctttgtatcaaacattgtccgaagttgaaaagttccctgcctcaacaccttccttctttgcaaaagttgaaaattattgat 6898539  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6898538 tgccaagagttgcaggcttcaattcccaaggctgataatatcagtgagctagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatccagct 6898439  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6898438 tgaaaaaggccatcctttgtggaactcaggtcattgaatccgccctagagaaaattctatttagcagtgcctttcttgaagtgttagaagttgaagactt 6898339  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6898338 ctttggtcaaaatctagaatggtcctctttggatatgtgtagctgt 6898293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 730; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1358
Target Start/End: Original strand, 6591832 - 6593177
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6591832 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactgaagcagattcataaaattaaaggactacacagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6591931  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||| || ||    
T  6591932 tgaaaaacgctttaagataagcaccagtgtgcagcataatttgttttcaagaataaaatatttgcggatgttgtccctttctggttgcaatctcgtaaag 6592031  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6592032 ctagatgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttctaaaactgagattgcaagcttacctaattccatttgtacgctgtataatt 6592131  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||    
T  6592132 tgcaaacattcttattggaagaatgttttaaattgaccgaactcccttcagattttcacaaactcatcaatttgcgccatcttaatctgaaaggcactca 6592231  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    |||||||||||||||||   || |   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  6592232 tattaagaagatgccaacaaagctcgaagggttaaacaatcttgaaatgctgactgattttgttgtgggagagcagcgtgggtttgatattaagcagttg 6592331  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    | | |||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6592332 ggaaaactaaaccaacttcaaggaagccttcgaatttcagggatggaaaatgtcattgatctagcagatgctattgcagcaaatttgaaagataagaaac 6592431  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || ||| | ||   | |||||||||||||| |||| || |||| || ||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6592432 atttaaaagaattaagtatgtcatatgattattgtcaaaaaatggatggctcaataactgaggcacatgcctctgtcatggagattcttcaaccaaatag 6592531  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6592532 aaacctcatgaggctcaccatcaaagactacagaggcagaagctttccaaattggcttggcgatctttatttacccaagttagtatcccttgaattgttg 6592631  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| |  |  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6592632 ggatgtaaattccattccgaattgccaccacttgggcagttcccctctctcaagaagctttccttttcaggctgtgatggaatagagatcattggtacag 6592731  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6592732 aattttacggctataattcatcaaatgttccatttagattccttgaaacattgcgatttgagaacatgtctgaatggaaggaatggttatgtcttgaagg 6592831  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6592832 tttccctttgcttcaagagctttgtataaaacattgtcccaagttgaaaagagccctgcctcaacaccttccttctttgcaaaaattggagattactgat 6592931  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  6592932 tgccaagagttggaggcttcaattcccaaggctgataatatcactgagctagaactgaagagatgtgatgacattttgataaatgaatatccatccagct 6593031  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6593032 tgaaaagggtcatcctttgtggaactcaggtcattaaatcctccctagagaaaattctatttaacagtgtctttcttgaagagttggaagttgaggactt 6593131  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    ||||| |  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6593132 ctttgattcaaatctagaatggtcctctttggacatgtgtagctgt 6593177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 714; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1358
Target Start/End: Complemental strand, 6916651 - 6915306
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6916651 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcagattcataaaattaaaggactacacagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6916552  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||    
T  6916551 tgacaaacgctataagataggcatcgatgtgcaacgtaatttgtattcaagactacaatatttgcggatgttatctttccatggttgcagtctctcggag 6916452  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| | | |||||||    
T  6916451 ctagcagatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagatctttcgtacactgagattacaagcttaccgatttccgtttgtatgatatataatt 6916352  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    | || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  6916351 tacagacactcttattggaagaatgttggaaattgactgagctccctttagattttggcaaactcgtcaacttacgccatcttaatctgaaaggcactca 6916252  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |   ||||| ||||||||||||||||    
T  6916251 tattaagaagatgccaacaaaaataggagggttaaacaatcttgagatgctgactgattttgttgtgggggagaagtgtggatctgatattaagcagttg 6916152  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    || ||||||||  |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6916151 gcggaactcaattatattcaaggaaggctccaaatttcagggttgaaaaatgtcattgatcctgcagatgctgtggcagcaaatttgaaagataagaaac 6916052  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6916051 atttagaagaactaagtttgtcatatgatgaatggagagatatgaatctgtcagtaactgaagcacaaatctctatcttggaggctcttcaaccaaatag 6915952  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6915951 aaatctcatgaggctcaccatcaaagactatggaggcagtagctttccatattggcttggagattatcatttaccaaatttagtatctcttgaattgttg 6915852  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  6915851 ggatgtaaactccgttcccagttgccgccacttgggcagttcccctctctcaagaagctttttatttcaggctgtgatggaatagaaatcattggtacag 6915752  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||| |   |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6915751 agttctatggctacaattcatcaaatgtttcatttaaatcccttgaaactttgcgatttgagcacatgtccgaatggaaggaatggttatgtcttgaatg 6915652  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6915651 tttccctttgcttcaagagctttgtataaaacattgtcccaagttgaaaagttccctgcctcaacaccttccttctttgcaaaaattggagattattgat 6915552  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | | ||    
T  6915551 tgccaagagttggcggcttcaattccgatggctgctaatatcagtgagctagaactaaagagatgtgatgacatattgataaatgagttgccagctacct 6915452  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| || || || ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6915451 tgaaaagagtcatcctttgtggaactcaggtcattcgatcctccctagagcaaattttatttaactgtgccattcttgaagaattggaagttgaagactt 6915352  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6915351 ctttggtccaaatctagaatggtcctctttggacatgtgtagctgt 6915306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1358
Target Start/End: Complemental strand, 7749552 - 7748207
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || | |||    
T  7749552 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactagatcatattcataaaattaagggactgcacagtctgatggtagaagcgcagggttgtgg 7749453  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||   | ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  7749452 tgaccaacgctttaagataagccccagtgtacagaaaattttgttttcaagactaaaatatttgcaggtgttgtccctctctggttgcaatctcgtagag 7749353  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7749352 ctagccgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttctcacactgagattgcaagcttacccaattccatttgtatgctgtataatt 7749253  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    |||| || |||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||| ||    
T  7749252 tgcagacactcttgttggaacaatgtttcagattggctgagctgccttcagatttttgcaaactcatcaatttacgtcatcttaatctaaacggcactca 7749153  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  7749152 tattaagaagatgccaccgaatataagtaggttaaaaaatattgagatgctgactgattttgttgtgggagagcagcgtggatttgacattaaacagttg 7749053  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  7749052 gcggaactcaaccatcttcaacgaaggcttcaaatttcagggttgaataatgtcatcgatcccgctgatgctgtggcagcaaatttggaagataaagaac 7748953  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7748952 atttagaagaattaagcgtatcatatgatgaatggagagaaatggatggatcagtaactgaagcacatgtctctgtcttagaggctctccaaccaaatag 7748853  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7748852 aaacctcatgaggctaaccatcaaagactacagaggcagtagctttccaaattggcttggcgattatcatttacccaatttagttactcttgaattgttg 7748753  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  7748752 ggatgtaaactttgttcccagttaccatcacttgggcagttccactctctcaagaagctttccatttcaggctgcgatggaatagagattattggtgcag 7748653  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7748652 agatttgtggctataattcatcaaatgtttcatttagatctcttgaaactttgcgatttgagcacatgtcagaatggaaggaatggttatgtcttgaatg 7748553  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7748552 tttccctttgcttcgagagctttgtataaaacattgtccgaagttgaaaagttccctgcctcaacaccttccttctttgcaaaaattggagattattgat 7748453  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7748452 tgccaagagttgcaggcttcaattcccaaggctgataatatcagtgacctagaactaaagagatgtgatggcattttaataaatgaattgccatctagct 7748353  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||| || || |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7748352 tgaaaagggtcatcctttgtgggtcttgggtcattgaatccaccctagagaaaattttatttaacagcgcttttcttgaaaagttggaagttgaagactt 7748253  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7748252 ctttggtccaaatttagaatggtcctcttcggatatgtgtagctgt 7748207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1358
Target Start/End: Original strand, 6722558 - 6723903
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6722558 tttggtgctgccttgatttgaaggatggtgacagaaaactagagcatattcacaaagttactggactacgcagtctgatggtagaagcacagggctacgg 6722657  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6722658 tgaccaacgctttaagataagcaccaatgtgcagcataatttgttttcaagactaaaatatttgcggatgctgtctttctctggttgcaacctcttagag 6722757  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6722758 ctatccgatgagataaggaatttaaagcttttgcgctatctagacctttcctacactgacattgtaagcttacctaattccatttgtatgctatataatt 6722857  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    |||| || |||||| ||||||| || |||||||||||| |||| || ||| || | | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||    
T  6722858 tgcagacactcttattggaagagtgctttaaattgactaagctaccttcagatatctacaaactcgtcaatttacgttatcttaatctgaaaggcactca 6722957  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6722958 tattaagaagatgccaacgaagataggagcattagacaagcttgagatgctgagtgatttttttgtcggaaagcagcgtggatttgatattaagcagttg 6723057  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    |   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||     |    ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  |||    
T  6723058 gggaaactcaaccaacttcaaggaaggcttcaaatttctgggttggaaaatgtcaaaaaaactgcacatgctgtggcagcgaatttggaagataaagaac 6723157  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6723158 atttagaagaattaagtatgtcatatgatggatggagaaaaatgaatggatcagtaactaaagcagatgtctctgtcttggaggctcttcaaccaaataa 6723257  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6723258 aaacctcatgaggctcaccatcaaagactatggaggcagtagctttccaaattgggttgggtatcgtcatttacccaatttagtatctcttgaattgttg 6723357  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  6723358 ggatgtaaattctgttcccagttaccaccacttgggcagttcccctttctcgagaagctttccatttcaggctgtgatggaatagagaccattggaacag 6723457  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6723458 agttttgcggctataatgcttcaagtgttccatttagatcccttgtaactttgcgatttgagcaaatgtctgaatggaaggaatggttatgtcttgaagg 6723557  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  6723558 tttccctttgctacaagagctttgtataaaacattgtcccaagttgaaaagttccctgcctcaacaccttccttcattgcaaaaattggagattattgat 6723657  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | ||    
T  6723658 tgccaagagctggaggcttcaattcccaaggctgataatatcagtaagctagaactaaagagatgtgatgatattttgataaatgaattgccctctacct 6723757  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6723758 tgaaaacggtcatccttggtggaactcgcatcattcgatcctccctagagaaaattctatttaacagtgcctttctagaagagttggaagttgaagactt 6723857  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    ||||| ||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6723858 ctttgatcataatctagaatggtcctctttggatatgtgtagctgt 6723903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 1357
Target Start/End: Complemental strand, 6882066 - 6880722
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||    ||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6882066 tttggtgctgccttgattttgaagatggtgatagaaaactagagtatcttcatagatgtaatggactacgcagtttgatagtagacgcacagggctatgg 6881967  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||  |    
T  6881966 tccccaccgctttaagataagcaccgttgtgcaacataatttgttttcaagagtaaaacttttgcggatgttgtccttctctggttgcaacctcttactg 6881867  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6881866 ctagatgatgggataagaaatttaaagcttctgcgctatctggacctttcgcacactgagattgcaagcttacctaattccatttgtatgttgtataatt 6881767  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    | || || |||||| ||||||||||||| ||||||  ||| || ||| || |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  6881766 tacagacactcttattggaagaatgtttcaaattgcttgaacttccaacagatttttgcaagctcatcagtttacgtcatcttaatctgacaggcactca 6881667  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    |||||||||||||||||   |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||    
T  6881666 tattaagaagatgccaacaaagatagaacggttaaacaatcttgagatgctgactgattttgttgtgggagagcagcgtggatttgatattaaaatgttg 6881567  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    |   |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  6881566 gggaaactcaaccaacttcatggaaagcttcaaatttcagggttggaaaatgtcaatgatcctgcacatgctgtggcagcaaatttggaagataaagaac 6881467  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6881466 atttagaagatttaagtatgtcatacaatgaatggagagaaatggatggatcagtaactgaagcacaagcctctgtcttggaggctcttcaaccaaatat 6881367  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttg 812  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6881366 aaacctcacgagtctaaccatcaaagactacagaggcggtagctttccaaactggcttggggatcgtcatttaccaaatttagtatctcttgaattgttg 6881267  T
Q  813 ggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcag 912  Q
    ||||||| |  |  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||    
T  6881266 ggatgtaaaatccattcccagttgccaccgcttgggcagtttccctctctcaagaagtgttccatttcaagctgtgatggaatagaaattattggtacag 6881167  T
Q  913 agttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaagg 1012  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6881166 agtttctcggctataattcatcagatgttccatttagatcccttgaaactttgcgatttgaaaacatggctgaatggaaggaatggttatgtcttgaagg 6881067  T
Q  1013 tttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgat 1112  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6881066 tttccctttgcttcaaaagctttgtataaaacattgtcccaagttgaaaagtgcccttcctcaacacctcccttctttgcaaaaattggagattattgat 6880967  T
Q  1113 tgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagct 1212  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |    
T  6880966 tgccaagagttggcggcttcaattcccaaggctgctaatatcactgagctagaactaaagagatgtgatgacattttgataaatgaattgccatctaaat 6880867  T
Q  1213 tgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 1312  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || || |  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880866 tgaaaagaatcatcctttgtggaactcaggtcattcaatcaaccctagagcaaattttgttgaactgtgcctttcttgaagagttggaagttgaagactt 6880767  T
Q  1313 ctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctg 1357  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6880766 ctttggtccaaatctagaatggtcctctttggacatgtgcagctg 6880722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 6244843 - 6244074
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244843 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcagattcataacattaaaggagtacggagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 6244744  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||| ||  ||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6244743 tgataaacgctttaagatatccaccaatgtgcagtataatttgtattcaagagtacaatatttacggaagttatctttcaatggttgcaatctctcagag 6244644  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6244643 ctagctgatgagataagaaacttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacaccgagattacaagcttacctaattccatttgtatgttgtataatt 6244544  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6244543 tgcatacgctcttactggaagaatgttttaaactacttgagctcccgccaaatttttgcaaactcatcaatttacgtcatcttaatttgaaaggcaccca 6244444  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6244443 tattaagaagatgccaaaggagatgagagggttaatcaaccttgagatgctgactgattttattgtgggagagcagcgtggatttgatattaagcagttg 6244344  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244343 gcagaactcaaccaccttagaggaagacttcgaatttcagggttgaaaaatgtggctgatccagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 6244244  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6244243 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatagatgactcagaaactgaagcacatgtctctatcttggaggctcttcaaccaaatag 6244144  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcat 782  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6244143 taacctcgtgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttccaaattggcttggggatcatcat 6244074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 662 - 1220
Target Start/End: Complemental strand, 6236626 - 6236068
Alignment:
Q  662 ctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcct 761  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236626 ctcagtaactaaagcacgtgtctcgatcttggaggctcttcgaccaaatagaaatctcatgaggctcggcatcaatgactacagaggtagtagctttcct 6236527  T
Q  762 aattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctc 861  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236526 aattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtaaatattgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctc 6236427  T
Q  862 tcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaac 961  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6236426 tcaagaagctttccatatcaggatgtcatggaataacgttcattggttcagagttttgcggctataattcatcaaatgttccatttagatcccttgaaac 6236327  T
Q  962 tttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaa 1061  Q
     ||| |  || || | |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6236326 attgtgttttaagaacatgtctgaatggaaggtatggttatgtcgtggaggtttcccttttcttaaagagctttgtataaaacattgtcccaagttgaaa 6236227  T
Q  1062 agtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgata 1161  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||      
T  6236226 agtgacctgcctcaataccttccttgtttgcaaaaattggagattattgattgccaagagttggaggcgtcaattcccaaggctggtaatatcagtgagc 6236127  T
Q  1162 tagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagcttgaaaagg 1220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6236126 tagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatccaccttgaaaagg 6236068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 580 - 1343
Target Start/End: Original strand, 6850327 - 6851087
Alignment:
Q  580 atgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacg 679  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||   |||||||  |||| |      
T  6850327 atgctgtggcagcaaatttggaagataaagaacatttagaagaattaagtatgtcatacgaggaatagag-gaaatggataaatcagtaatggaagtaaa 6850425  T
Q  680 tgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcat 779  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||| |||||| ||    
T  6850426 agtctctgtcttggaagctcttcaaccaaatggaaacctcatgaggctaaccatcaaagactaccgaggcagtagcttcccatattggctcggggattat 6850525  T
Q  780 catctacccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccattt 879  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6850526 catttacccaatttagtatctcttga-ttgttgggatgtaaacaccattcccagtttccatcacttgggctgttcccctctctcaagaatctttccattt 6850624  T
Q  880 caggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatat 979  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| | | ||    
T  6850625 caggctgtgatggaatagagatcattggtccagagttttacggctacaattcatcaaatgttccatttaaatcccttgaaactttgcgatttgggcacat 6850724  T
Q  980 gtctgaatggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcat 1079  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  6850725 gtctgagtggaaggaatgg-tatcccttgaaggtttccctttacttcaagagctttgtataaaacattgtccgaagttgaaaagtgccctgcctcaacac 6850823  T
Q  1080 cttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtg 1179  Q
    || |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6850824 ctcccttcttagcaaaaattggagattattgattgccaagagttggcggcttcaattcccaagatttacattatcagtgagctagaactaaagagatgtg 6850923  T
Q  1180 atggcattttgataaatgaattgccatcaagcttgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatag 1279  Q
    ||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||| || || || ||||  |    
T  6850924 atgacatattgataaatgagttaccatctaccttgaaaagagtcatcctttgcggaactcaggtcattccatcctccctagagcaaattttatttaactg 6851023  T
Q  1280 tgcctttcttgaagagttggaagttgaagacttctttggtcgaaatatggaatggtcctctttg 1343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  6851024 tgcctttcttgaagagttgaaagttgaagacttctttggtccaaatctagaatggtcctctttg 6851087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6238153 - 6237650
Alignment:
Q  166 taaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatga---gataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6238153 taaaatatttgcggatgttgtctatctctggttccaatcttttagagctagctgatgatctgataagaaatttaaagcttttgtgctatctagacctttc 6238054  T
Q  263 ttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatca 362  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6238053 ttacactgaaattacaagcttacctaattccatttgcatgttgtataatttgcatacgctcttaccggaagaatgttttaaattgactaagctcccatca 6237954  T
Q  363 aatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgc 462  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |    
T  6237953 aatttttgcaaacttatcaatttacgtcatcttaatttgaaaggaacgcatattaagaagatgccaaaggagatacgagaattattcaatcttgagattc 6237854  T
Q  463 tgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaa 562  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6237853 tgactgattttgttgtgggagagcaacatggatatgatattaagcagttggcagaagtcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttg-taaa 6237755  T
Q  563 tgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggc 662  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6237754 tgttgctgatccagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaattgagagaaatggatggc 6237655  T
Q  663 tcagt 667  Q
    |||||    
T  6237654 tcagt 6237650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 807 - 1358
Target Start/End: Complemental strand, 6244073 - 6243522
Alignment:
Q  807 ttgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattg 906  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6244073 ttgttgggatgtaaactctgttccaagttgccacaaattaagcagttcccatctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaataggtatcattg 6243974  T
Q  907 gttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgcct 1006  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  6243973 gttcagagttttgccgctataattcatcaaattttacatttagatcccttgaaactttgcggtttgagaatatgtctgaatggaaagattggttatgtat 6243874  T
Q  1007 tgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagatt 1106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  6243873 tgaaggtttccctttgctgaaagagctttcaataagatactgtcccaagttgaaaaggaaactgcctcaacatcttccttgcttgcaaaaattggagata 6243774  T
Q  1107 attgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccat 1206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6243773 attgattgccaagatttggaggcttcaattcccattgcttataatatcattcagctagaactaaagagatgtgatggcattttgataaataaattgtcat 6243674  T
Q  1207 caagcttgaaaagggccatcctttgtggaactcacgtcattgaatccaccctagagaaagttctaattaatagtgcctttcttgaagagttggaagttga 1306  Q
    | | |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6243673 ccaacttgaaaaaggtcatcctttgtggaactcagatcattgaatccgccctagagaaaattctatttaacagtacctttcttgaagaattggaagttga 6243574  T
Q  1307 agacttctttggtcgaaatatggaatggtcctctttgtatatgtgtagctgt 1358  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6243573 agacttctttggtcaaaatctagaatggtcctctttggatatgcgtagctgt 6243522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 835 - 1235
Target Start/End: Complemental strand, 5297473 - 5297073
Alignment:
Q  835 tgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatc 934  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||| | |  | || |||||    
T  5297473 tgccaccacttgggcagctctgctctctcaaagaactttcaatttcaggctgccatggaatagagagcattggcaaagagttttacggaaacaactcatc 5297374  T
Q  935 aaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctt 1034  Q
    ||||||||| || || ||||| | || ||||||  ||||| | |||||||||||||| || ||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||     
T  5297373 aaatgttgcgttcaggtccctcgcaattttgcgatttgagaaaatgtctgaatggaaagattggttatgtgttacaggtttccctttgctgaaagagctg 5297274  T
Q  1035 tgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaa 1134  Q
    |   ||| | | || || |||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  5297273 tcaataagatactgccctaagttgaaaaggaaactgcctcaacatcttccttctttgcaaaaattgaagattagtgattgccaagagttggaggcttcga 5297174  T
Q  1135 ttcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagcttgaaaagggccatcctttgtgg 1234  Q
    |||||||||||| ||||||   |||  |||| |||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||    
T  5297173 ttcccaaggctgataatattgttgagctagagctaaaaggatgtgaaaacattttggtaaatgaattgccatccaccttgaaaaatgtcatcctttgtgg 5297074  T
Q  1235 a 1235  Q
    |    
T  5297073 a 5297073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 5280192 - 5279595
Alignment:
Q  24 cttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatggtgaccaacgct 123  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||| || || |||||  ||| ||||| ||| |||  ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  5280192 cttgattggaaatatggttatagaaaattagagaatatttgtaagattaagggattacgcagtttgaaggtagaagaacaaggctatgatgagcaatgct 5280093  T
Q  124 ttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaat---ctcttagagctagctga 220  Q
    | |||||| |||   |||||||  || |  ||||||  || |||||||||||||| |||||  | ||| ||||||| |||   ||||  |||||||||||    
T  5280092 tcaagatatgcaagaatgtgcaaattgaactgttttcaagtctaaaatatttgcgtatgttaacattctatggttgtaataatctctccgagctagctga 5279993  T
Q  221 tgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcatacc 320  Q
     |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||     
T  5279992 cgagataagcaacttaaagcttctgtgttatctagacctttcttacactggaattacaagcctacctgattccatttgtgtgttgtataatttgcagaca 5279893  T
Q  321 ctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaaga 420  Q
    |||||| ||  || |||   || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |  || |||| | |||    |    
T  5279892 ctcttattgctaggatg---tagattgactgagctcccttcaaatttttacaaacttgtcaatttacgtcatcttaatctagaaagcactcttatctcaa 5279796  T
Q  421 agatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcagaact 520  Q
    |||||||| || | |||  | || ||| | ||||||||| | ||||  ||||| |||| ||||||||   ||| | | |||||||| |||||| | ||||    
T  5279795 agatgccagagcaaatacaaaggctaacccatcttgagacgttgacaaattttgttgtgggagagcatagtgggtctaatattaaggagttggaaaaact 5279696  T
Q  521 caaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaa 620  Q
    |||||| |||  |||||  |||   ||||||  |||| |||||||  ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  5279695 caaccatcttcgaggaacactttgtatttcacagttggaaaatgtcactgatcgtgcagatgctgtggaagcaaatttgaaaaataagagacatttggaa 5279596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8454059 - 8453813
Alignment:
Q  151 atttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgcta 250  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  8454059 atttgttttcaagactaaattttttgcggatgttatcatttagaggttgcggtctcttagaactagttgatgagataagcaatttaaaacttttgcgtta 8453960  T
Q  251 tctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgact 350  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||  ||  |||||| || ||||||||| | || |||||||||| || ||||| |||||||  |||| | |||||||     
T  8453959 tctagacctctcttacacatggattgaaatattacctgataccatttgtatgttgcataatttgcaaacactcttgctggaaggctgttgtgaattgaca 8453860  T
Q  351 gagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaa 397  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8453859 gagctcccttcaaatttttccaaactcgtcaatttacgtcatcttaa 8453813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 436
Target Start/End: Original strand, 8569460 - 8569872
Alignment:
Q  24 cttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatggtgaccaacgct 123  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| | ||| ||| ||| |||| ||||| ||| |||   ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || |||    
T  8569460 cttgatttgaaagatggtgcaagaatattaaggcacatttataagattaagggattacgcggtctactggtagaagcacaaggctattatgacgaatgct 8569559  T
Q  124 ttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatga 223  Q
    | |||||||||| | |||| || | | |  | ||||  | ||||||||| || |||||||| || ||   || |||  |||||  ||||||  | |||||    
T  8569560 tgaagataagcaacaatgttcaacatgaaattttttcaaaactaaaatacttacggatgttatcattttgtgattgtgatctcacagagctgtcagatga 8569659  T
Q  224 gataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctc 323  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||  ||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||     
T  8569660 gatatgcaatttaaagcttttgcgctatctagatctgactcgcacagagattaaaaggttgcctgattccatttgtaagttgtataatttacaaacacta 8569759  T
Q  324 ttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaaga 423  Q
     || |||||||||||| | |||||||  ||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||  ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  8569760 atattggaagaatgttctgaattgaccaagctcccttcatatttttacaaacttgccaatttacgccatcttaatctaaaaggcactgatattaagaaga 8569859  T
Q  424 tgccaaaggagat 436  Q
    |||||||| ||||    
T  8569860 tgccaaagcagat 8569872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Original strand, 6520800 - 6521033
Alignment:
Q  162 agactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagaccttt 261  Q
    |||||||||| |||||||||| |  | || | |||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  6520800 agactaaaatgtttgcggatgctaacatttagtggttgccttctctcagagcttgtggatgagataagcaatttaaaacttttgcgttatctagaccttt 6520899  T
Q  262 cttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatc 361  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| || || |||||  |  |||  ||   | |||||||||||||||| ||    
T  6520900 cttacaataagattgcaagcttacctgataccatttgtatgctgtataatttacaaacactcttgttaaaaggctgccatcaattgactgagctcccttc 6520999  T
Q  362 aaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatctt 395  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6521000 aaatttttccaaactcatcaatttacgtcatctt 6521033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6735318 - 6735118
Alignment:
Q  195 ggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattcca 294  Q
    |||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| || |||    
T  6735318 ggttgctatctctcagagcttgtggatgagataagcaatttaaaacttttgcgttatctagacctttcatacactaagattagaagcttacctgatacca 6735219  T
Q  295 tttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatct 394  Q
    |||||| | |||||||||| || || |||||  |  |||  |||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  6735218 tttgtatgttgtataatttacaaacactcttgttaaaaggttgtcgtcaattgactgagctcccttcaaatttttccaaactcgtcaatttatgtcatct 6735119  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  6735118 t 6735118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6946625 - 6946433
Alignment:
Q  203 tctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaag 302  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||  |||| ||||||| |    
T  6946625 tctctcagagctagttgatgagataagcaatttaaagcttttgcgttatctagacctttctcacactaatattacaaggttacccgattctatttgtatg 6946526  T
Q  303 ctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatctt 395  Q
     ||||||||||||| || |||||| || |||  |||   || ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  6946525 ttgtataatttgcaaacactcttattgcaaggctgtaggaagttgacagagctcccttcaaatttctcaaaactcgtcaatttacgtcatctt 6946433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 6480671 - 6480853
Alignment:
Q  210 gagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtata 309  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||    
T  6480671 gagctagttgatgagataagcaatataaaacttttgcgctatcttgacctttctttcactgagattacaagcttacctgatagcatttgtatgttgtata 6480770  T
Q  310 atttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatctt 395  Q
    ||||||| ||  ||||  || |||   | | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6480771 atttgcaaacaatcttgttgcaag---ggtgtgaattgactgagctcccttcaaatttttccaaactcatcaatttacgtcatctt 6480853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 825 - 1204
Target Start/End: Complemental strand, 7586606 - 7586227
Alignment:
Q  825 tgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagct 924  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||  || |||| |||||||||||| ||  ||||  |||||| ||   ||| ||||   ||     
T  7586606 tgttccgagttgccaccacttggacaactcccttgtctcaaagagatttcaatttcaggctgtgataaaataaggatcatagggaaagaattttatggca 7586507  T
Q  925 ataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgct 1024  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| | |||   |||| |  ||||| |||||| ||||||||| |   |||||||| || ||||||||    
T  7586506 ataattccacaaatgttccattcagatcccttgaaattctgcattttgattcgatgtcggaatgggaggaatggtcacatcttgaagggtttcctttgct 7586407  T
Q  1025 tcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttg 1124  Q
    | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| || ||  |||||||||  |||||| |  |||||    
T  7586406 taaagagctttctataaaaaaatgtcccaagttgaaaagggctctgcctcaacaccttccttctttacagaaactggagattaaagattgcaagaagttg 7586307  T
Q  1125 gaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgcc 1204  Q
    || || | |||||| |||  || |||||| |  ||  ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  7586306 gaagcattaattccgaagtgtgataatatgatagagttagatataaagagatgtgatagaattttggtaaatgaattgcc 7586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Original strand, 6555106 - 6555339
Alignment:
Q  162 agactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagaccttt 261  Q
    |||||||||| |||||||||| |  | || | ||||||  |||||| |||||| |  ||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||||||||     
T  6555106 agactaaaatttttgcggatgctaacatttagtggttggcatctctcagagcttgtggatgagataggaaagctaaaacttttgcgttatctagacctta 6555205  T
Q  262 cttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatc 361  Q
    | ||||| |  |||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| || |||||  |  |||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  6555206 catacactggtattaaaagcttacctgataccatttgtatgttgtataatttgcaaacactcttgttaaaagactgttatcaattgactgagctcccttc 6555305  T
Q  362 aaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatctt 395  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6555306 aaatttttccaaactcatcaatttacgtcatctt 6555339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5263135 - 5262942
Alignment:
Q  201 aatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgta 300  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |     
T  5263135 aatctctccgagctagctgacgagatcagcaacttaa-gcttctgcgttatctagacctttcttacactgggattacaagcctacctgattccatttatg 5263037  T
Q  301 agctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaat 398  Q
     | ||||||||||||| || |||||| ||  || |||   ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  5263036 tgttgtataatttgcagacactcttattgctaggatg---taaattgacggagctcccttcagatttttataaactcgtcaatttacgccatcttaat 5262942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 991 - 1220
Target Start/End: Complemental strand, 8470129 - 8469900
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||   |||||| | |||| ||| ||  ||||||| || ||||||| |||    
T  8470129 aggaatggttgtgtcttgaagggtttcctttgcttaaagagctttctataaaaagctgtcccgaattgagaagcgcattgcctcaacaccttccttcttt 8470030  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttg 1190  Q
     ||||| || ||||||||||| || |||  ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||  ||  |||| ||| |||||||||||  ||||||     
T  8470029 acaaaaattagagattattgactgtgaactgttagaggcatcgattcccaagggtgataatatcatagagttagatctacagagatgtgatcacatttta 8469930  T
Q  1191 ataaatgaattgccatcaagcttgaaaagg 1220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8469929 ataaatgaattgccaaccagcttgaaaagg 8469900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 991 - 1218
Target Start/End: Complemental strand, 8453204 - 8452977
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||   |||||||||| || ||||||| |||    
T  8453204 aggaatggttgtgtcttgaagggtttcctttgcttaaagagctttatataagagaatgtcccaaattgaaaatgtccctgcctcaacaccttccttcttt 8453105  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgcgaaga-gttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcatttt 1189  Q
     ||||| |||   |||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| | || ||||||||  ||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  8453104 acaaaaattgttcattaatgattgc-aagatgttggaagcatcaattcccaacggtgataatatcatagatttagatataaagagatgtgatagaatttt 8453006  T
Q  1190 gataaatgaattgccatcaagcttgaaaa 1218  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||    
T  8453005 ggtaaatgaattgccgaccagcttgaaaa 8452977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 987 - 1153
Target Start/End: Complemental strand, 5266655 - 5266489
Alignment:
Q  987 tggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttcctt 1086  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||   |||| ||| |||||||     || ||||| || |||||||    
T  5266655 tggaaggaatggttatgtgttgaaagtttccctttgcttgaagagctttttatagaaagttgtcacaaattgaaaaaatatctacctcaacaccttcctt 5266556  T
Q  1087 gtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatat 1153  Q
     ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5266555 ctttgcaaaaattggtgattaatgattgcgaagagttgaaggcttcaattcccgaggcttctaatat 5266489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 991 - 1218
Target Start/End: Original strand, 8570415 - 8570642
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    |||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| || |||||| | ||| | | |||| ||  |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||    
T  8570415 aggaatggttttgtattgaagggtttcctttgcttaaaaagctttctataagatattgtcacagattgaaaagggccctgcctcgacaccttccttcttt 8570514  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttg 1190  Q
     |||||  ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  || | ||| |   ||||||| ||||||||    
T  8570515 acaaaaactggagatcagtgattgcaagaagttggaggcttcaattcccaaggctgataatatcgaagagttatatctagatgaatgtgatagcattttg 8570614  T
Q  1191 ataaatgaattgccatcaagcttgaaaa 1218  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8570615 gtaaatgaattgccatccagcttgaaaa 8570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8589088 - 8588978
Alignment:
Q  203 tctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaag 302  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  8589088 tctctcagagctagttaatgagataagcaatttaaaacttttgcgttatctagacctttcttacactttgattacaagcttacctgataccatttgtatg 8588989  T
Q  303 ctgtataattt 313  Q
     ||||||||||    
T  8588988 ttgtataattt 8588978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 687 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 5279535 - 5279276
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctac 786  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||  || |||| |||| | ||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||   | || |||    
T  5279535 gtcttggaggttctcgaaccaaatagcaacctcaatagtctcatcatcgaggactacagaggcactggctttccacattggcttggggactgttatttac 5279436  T
Q  787 ccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctg 886  Q
     |||||||||||| |||||| ||    |||||  |   |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| |||||||  ||    
T  5279435 tcaatttagtatcccttgaactgaatagatgtggattttgtttccagtttccaccacttgggcagcttccctctcttaaggagctttctatttcagaatg 5279336  T
Q  887 tcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatt 946  Q
    | ||||||||||||| || |||  ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  5279335 tgatggaatagagattatcggtgaagagttttatggctataattcatcaactgttccatt 5279276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6850304 - 6850245
Alignment:
Q  232 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6850304 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacactgagattacaagcatacctaatt 6850245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5267391 - 5267047
Alignment:
Q  218 tgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcat 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||  |||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  5267391 tgatgagataagcaatttaaagcttttgcgttatctagacctgtctctcacaaagattaaaaggttgcctgattccatttgtaacctgtataatttacag 5267292  T
Q  318 accctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatatta 417  Q
    || ||  || ||| | | ||||    |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    || |||| ||||||| || || || |||| ||||| |    
T  5267291 acactactattggcatattgtt---cattgaccgagctcccttcagatttttacaaacttacaaacttacgtcatcttgatctggaatgcactcatataa 5267195  T
Q  418 agaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcaga 517  Q
    ||||||||||||| |||||| |  || ||| | ||||| ||| ||||||| | ||| |||| | | || | ||||| | || ||||||| ||||||| ||    
T  5267194 agaagatgccaaaagagatagggaggctaacccatcttcagacgctgactaaatttgttgtggtaaaggagcatgggtctggtattaaggagttggcgga 5267095  T
Q  518 actcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgt 565  Q
    ||| ||||| ||| |||| |  |||   |||||||||||| |||||||    
T  5267094 acttaaccagcttcaagggaaactttgtatttcagggttggaaaatgt 5267047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1047 - 1218
Target Start/End: Original strand, 6730242 - 6730413
Alignment:
Q  1047 tgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctg 1146  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||  |||| ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6730242 tgtcccaaactgaaaagggccctgcctcaacaccttccttctttagaaaaattgaagattgtttgttgcaaagagttggaggcatcaattcccaagggtg 6730341  T
Q  1147 ctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagcttgaaaa 1218  Q
     ||||||||  ||| || | |||  | |||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  6730342 ataatatcatagatttacatctagtgggatgtgaaagcattttggtaaatgaattgccgactagcttgaaaa 6730413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 953 - 1153
Target Start/End: Original strand, 4390336 - 4390536
Alignment:
Q  953 ccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaatggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtccc 1052  Q
    |||||||| ||||||  ||||| | |||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    | |||||     
T  4390336 ccttgaaattttgcgatttgaggacatgtccaattggaaggaatggttatgtgttgaaggtttccctttgcttaaagagctttctatacgtaattgtcca 4390435  T
Q  1053 aagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaata 1152  Q
    || |||| ||     || || || || ||||||| ||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4390436 aaattgacaaaatttctaccccaacaccttccttctttgcagggattggtgattattgattgccaagagttggaggtttcaattcccaaggcttctaata 4390535  T
Q  1153 t 1153  Q
    |    
T  4390536 t 4390536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 825 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 5262521 - 5262399
Alignment:
Q  825 tgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagct 924  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | || ||||| ||  ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||   |||    
T  5262521 tgttcccggttgccaccacttgggaagcttccctctcttaaagagctttctatttcagaatgttatggaatagagatcatcggtgaagagttttatggct 5262422  T
Q  925 ataattcatcaaatgttgcattt 947  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  5262421 ataattcatcaactgttccattt 5262399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 5297923 - 5297661
Alignment:
Q  364 atttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgct 463  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||||||   | |||||||| ||||| |||||||||||| || | ||| || | |||  | ||||| | | |||    
T  5297923 atttttacaaactcgtcagtttacgccatcttatcctaaaaggcactcatataaagaagatgccagagcatataggaagattacaccatcttcaaacgct 5297824  T
Q  464 gactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaat 563  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| | || | |||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||| |  ||||  |||||||||||| |||||    
T  5297823 gactgattttgttgtgggagaccaaaaagggtctgatattaatgagttggcaaaactcaaccatcttcaaggtacacttcgtatttcagggttggaaaat 5297724  T
Q  564 gtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaatta 626  Q
    ||   |||||  |  |||||  || ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||    
T  5297723 gtcattgatcgtgtggatgcagtgacagcaaatttgcaaaaaaagaaagatttagacgaatta 5297661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1047 - 1218
Target Start/End: Original strand, 6450314 - 6450485
Alignment:
Q  1047 tgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctg 1146  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||  |||| ||| ||||| ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6450314 tgtcccaaactgaaaagggccctgcctcaacaccttccttctttagaaaaattgaagattgtttgttgcaatgagttggaggcatcaattcccaagggtg 6450413  T
Q  1147 ctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttgataaatgaattgccatcaagcttgaaaa 1218  Q
     ||||||||  ||| || | |||  | ||| |||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  6450414 ataatatcatagatttacatctagtgggatatgaaagcattttggtaaatgaattgccgactagcttgaaaa 6450485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 5249032 - 5248814
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctac 786  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  | ||| ||||||||  ||||  |||| | ||||||||| || |||||||||| |  |||| |      
T  5249032 gtcttggaggcccttgaaccaaatagtaaccttaatatgctgaccatcaaacactatcgaggcactagctttccaaactggcttgggggtagtcatttgt 5248933  T
Q  787 ccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctg 886  Q
     |||||||| |||||| ||  || | ||||||  |   |||||||| ||||||||| ||| |  ||| || | ||||||||||||||  |||||||| ||    
T  5248932 tcaatttagaatctctggatctggtaggatgtgaattttgttcccatttgccaccatttgagttgtttccctatctcaagaagctttatatttcaggttg 5248833  T
Q  887 tcatggaatagagatcatt 905  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5248832 tcatggaatagagatcatt 5248814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 6527721 - 6527773
Alignment:
Q  343 aattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatctt 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6527721 aattgactgagctcccttcaaatttttccaaactcatcaatttacgtcatctt 6527773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 991 - 1115
Target Start/End: Original strand, 6528477 - 6528601
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| ||| | ||| |   |||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| |||    
T  6528477 aggaatggttatgccttggagagtttcctttgcttaaagagatttctataacaagttgtcccgaattgaaaagggctctgcctcaacaccttccttcttt 6528576  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgc 1115  Q
     |||||  |||||||||||||||||    
T  6528577 acaaaaactggagattattgattgc 6528601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 1128
Target Start/End: Complemental strand, 6734820 - 6734385
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctac 786  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| | | || ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||| |  |||| |||    
T  6734820 gtcttggaggctctaaaaccaaatagcaacttgaagaagctcaacatcacacactacaaaggtagtagatttccaaattggctaaggggtagtcatttac 6734721  T
Q  787 ccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctg 886  Q
     ||| ||||||||||||||| ||   || |||| |   ||||||   ||||||  |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  6734720 gcaacttagtatctcttgaactgaatggttgtaga---tgttcctgtttgccaatacttggacaactcccttctctcaagaaactttccatttatgactg 6734624  T
Q  887 tcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaaactttgcgggttgagtatatgtctgaa 986  Q
    | | |||||| ||||||||| |  ||||||||   || |||||||| ||| |||| |||| |  |||||||||  |||| |  ||||| |||||    |     
T  6734623 tgaaggaataaagatcattgatgaagagttttatggcaataattcaacaattgttccattcaagtcccttgaatatttgagatttgaggatatggtcaac 6734524  T
Q  987 tggaaggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttcctt 1086  Q
    ||| |||||||| ||||  |  ||||||| |||||||||  |||||||| | ||| | | ||||| ||  ||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  6734523 tgggaggaatggatatg--tgtaaggttt-cctttgcttatagagctttctataacaaattgtcctaaactgaaaggcaccctgcctcaacatcttcctt 6734427  T
Q  1087 gtttgcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggagg 1128  Q
     ||| ||||| ||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  6734426 ctttacaaaaattgaatattagtggttgcaaagagttggagg 6734385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Original strand, 4389634 - 4389729
Alignment:
Q  218 tgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataattt 313  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||  |||||| ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  4389634 tgataagataagcaatttaaagcttatgcgttatctagacctatctctcacaaagattaaaaggttgcctgattccatttgtaacctatataattt 4389729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 5249557 - 5249099
Alignment:
Q  165 ctaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttctt 264  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||| |  ||   | || ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5249557 ctaaaatgtttgcggatgttatcattgaatggttgtatccttccaaagttagatgatgaggtaagcaatttaaagcttttgcgttatctagacctatctt 5249458  T
Q  265 acacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaa 364  Q
    ||||    |||  ||| || ||| ||||||||||||| || |||||||| || || ||  || || || |   || |  ||||||||||||||| ||| |    
T  5249457 acacaagaattgaaagtttgcctgattccatttgtaacctatataatttacaaacactgctattgaaaaa---ttgtccattgactgagctcccttcaga 5249361  T
Q  365 tttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctg 464  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||||| || || || | || || || |||| ||||||||| || ||| |  || ||| | ||||| ||| | ||    
T  5249360 tttttacaaacttagcaatttacatcatcttgatctggaaagaactcacataaagatgatgccaaaagatatagggaggctaacccatcttcagacgttg 5249261  T
Q  465 actgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatg 564  Q
    ||| | ||| |||| | | || | ||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||| |  |||   |||||||||||  ||||||    
T  5249260 actaaatttgttgtggtaaaggagcatgggtatgatattaaggagttgacggaactcaaccagcttcaagggaaactttgtatttcagggttagaaaatg 5249161  T
Q  565 tttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaatta 626  Q
    |   |  ||  ||||||||| | | |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5249160 tcattattcctgcagatgctctagaagcaaaattaaaagataagaagcatttggaagaatta 5249099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 6449468 - 6449529
Alignment:
Q  202 atctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttct 263  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  6449468 atctctcagagctagtggatgagataagcaatttaaagcttttacgttatctagacctttct 6449529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 991 - 1204
Target Start/End: Original strand, 6522946 - 6523159
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| ||| | ||| | | |||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| |||    
T  6522946 aggaattgttatgccttggagagtttcctttgcttaaagagatttctataagaaattgtcccgaattgaaaagggctctgcctcaacaccttccttcttt 6523045  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatatcagtgatatagaactaaagagatgtgatggcattttg 1190  Q
     |||||  || |||||| | ||||| |  || ||||||| ||||||||||||  || |||||| |  ||  ||||  || |||| |||||| | ||||||    
T  6523046 acaaaaactgaagattagtaattgcaacaagatggaggcatcaattcccaagtgtgataatatgatagagttagatatacagagttgtgatagaattttg 6523145  T
Q  1191 ataaatgaattgcc 1204  Q
     |||||||||||||    
T  6523146 gtaaatgaattgcc 6523159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 959
Target Start/End: Original strand, 6555610 - 6555879
Alignment:
Q  690 ttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctaccca 789  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| | | || ||||| ||| |   |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||| |  |||| ||||||    
T  6555610 ttggaggctctaaaaccaaatagcaacttgaagaagctcaacattacacactacaaaggtagtagatttccaaattggctaaggggttgtcatttaccca 6555709  T
Q  790 atttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtca 889  Q
    | ||||||||||||||| |   ||| ||||     ||||||   |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |    
T  6555710 acttagtatctcttgaacttaagggttgtaagttatgttcctgtttgccaacacttggacaactcccttctctcaagaaactttccatttatgactgtga 6555809  T
Q  890 tggaatagagatcattggttcagagttttgcagctataattcatcaaatgttgcatttagatcccttgaa 959  Q
     |||||| ||||||||| |  ||||||||   || |||||||| ||| |||| |||| |  |||||||||    
T  6555810 aggaataaagatcattgatgaagagttttatggcaataattcaacaattgttccattcaagtcccttgaa 6555879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 627
Target Start/End: Original strand, 6795692 - 6795729
Alignment:
Q  590 agcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaa 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6795692 agcaaatttgaaagataagaaacatgtagaagaattaa 6795729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 7586829 - 7586792
Alignment:
Q  590 agcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaa 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7586829 agcaaatttgaaagataagaaacatgtagaagaattaa 7586792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8470524 - 8470487
Alignment:
Q  590 agcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaa 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8470524 agcaaatttgaaagataagaaacatgtagaagaattaa 8470487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 825 - 905
Target Start/End: Original strand, 4390229 - 4390309
Alignment:
Q  825 tgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcatt 905  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||| || ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4390229 tgttcccagttgccaccatttgagaagtttccctatctcaataatctttgtatttcaagctgtcctggaatagagatcatt 4390309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 991 - 1135
Target Start/End: Original strand, 6481446 - 6481590
Alignment:
Q  991 aggaatggttatgccttgaaggtttccctttgcttcaagagctttgtctaaaacaatgtcccaagttgaaaagtgccctgcctcatcatcttccttgttt 1090  Q
    ||||||||||||| | |||||| || |  | |||| ||||||||  | ||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||    
T  6481446 aggaatggttatgtcatgaagggtttctgtcgcttaaagagcttactataaaagattgtcccaaattgaaaagggcccttcctcaacaccttccttcttt 6481545  T
Q  1091 gcaaaagttggagattattgattgcgaagagttggaggcttcaat 1135  Q
     || || |||  ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  6481546 acagaaattgtcgattattaattgcaacaagttggaggcttcaat 6481590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 803
Target Start/End: Original strand, 6528041 - 6528157
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctac 786  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| | | || ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||| |  |||| |||    
T  6528041 gtcttggaggctatacaaccaaatagcaacttgaagaagctcaacatcacacactacaaaggtagtagatttccaaattggctaaggggtagtcatttac 6528140  T
Q  787 ccaatttagtatctctt 803  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6528141 ccaacttagtatctctt 6528157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Original strand, 6850199 - 6850235
Alignment:
Q  232 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacac 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6850199 atttaaagcttctgcggtatctagacctttcttacac 6850235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 8453508 - 8453392
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctac 786  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||    | |||| ||||| ||||||||| |||||| |  ||| | ||||| |||    
T  8453508 gtcttggaggctctccaaccaaatagaaacttgaagaggcttaccatctcaaaatacaaaggtaatagctttccaaattggataaggggttatcatttac 8453409  T
Q  787 ccaatttagtatctctt 803  Q
    | || ||||||||||||    
T  8453408 caaacttagtatctctt 8453392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 767
Target Start/End: Original strand, 8570111 - 8570191
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattgg 767  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||   ||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  8570111 gtcttggatgctcttcaaccaaatagcaacttgaagaggctcaccatcacatactacaatggcagtagctttccaaattgg 8570191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7587255 - 7587160
Alignment:
Q  164 actaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacct 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||  || |||  ||||||| | | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  7587255 actaaaatatttgcggatgttgtcattctgtggttataaactcaaagagctatcaggtgagataggaaatctaaagcttttgcgatatctaaacct 7587160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 8588610 - 8588563
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatc 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  8588610 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacttgaagaggcttaccatc 8588563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1103 - 1153
Target Start/End: Complemental strand, 5248637 - 5248587
Alignment:
Q  1103 gattattgattgcgaagagttggaggcttcaattcccaaggctgctaatat 1153  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5248637 gatttttgattgccaagagttagaggcttcaattcccgaggcttctaatat 5248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 437
Target Start/End: Original strand, 6839729 - 6839823
Alignment:
Q  343 aattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaagatgccaaaggagata 437  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||| |  |||||    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  6839729 aattgactgaactcccttcaaatttttacaaactagtcagtttacgccatcttaatcttgaaggctgtaatataaagaagatgccaaagaagata 6839823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 8588724 - 8588674
Alignment:
Q  576 gcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaatta 626  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8588724 gcagatgctgtgacagccaatttgaaagataagaagtatttagaagaatta 8588674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 825 - 958
Target Start/End: Original strand, 6795909 - 6796042
Alignment:
Q  825 tgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggttcagagttttgcagct 924  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| | ||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| || |     
T  6795909 tgttccgatttgccagcactagggcagctcccctctctcaaggacctttccatttcaagatgtgacggaataatgatcattggtgaagaattttacaaca 6796008  T
Q  925 ataattcatcaaatgttgcatttagatcccttga 958  Q
    ||| |||| |||||||| | || || ||||||||    
T  6796009 atagttcaacaaatgtttcgttcaggtcccttga 6796042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 515; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 799
Target Start/End: Original strand, 35140851 - 35141634
Alignment:
Q  13 tttggtgttgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcatattcataacattaaaggactacagagtctgatggtagaagcacaaggctatgg 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||  | |||    
T  35140851 tttggtgctgccttgatttggaagatggtgatagaaaactaaagcaaattcataacattaaaggactaaagaatttgatggtagaagaacaagtgt-tgg 35140949  T
Q  113 tgaccaacgctttaagataagcaccgatgtgcagcttaatttgttttttagactaaaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagag 212  Q
    |||  ||  ||||||||||  |||| | ||||| |  | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  35140950 tgagaaatactttaagatatccaccaacgtgcatcagagtttgttttcaagactaaa-tatttgcggatgttgtctttctcttgttgcaatctctcagag 35141048  T
Q  213 ctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatt 312  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35141049 ctagctgaagagataggaaacttaaagcttatgcgctatctagacctttcttacaccgagattacaagcttacctaattccatttgtatgttgtataatt 35141148  T
Q  313 tgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacaca 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35141149 tgcatacgctcttactggaagaatgttttaaaccgattgagctcccatcaaattttcgcaaactcatcaatttatgtcatcttaatttgaaaggcacaca 35141248  T
Q  413 tattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgactgattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141249 tattaagaa-atgccaaaggagatgagagggttaatcaatcttgagatgccgactgattttattgtgggagagcaacatggatttgatattaagcagttg 35141347  T
Q  513 gcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgtttctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaac 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141348 gcagaactcaaccaccttgaaggaaggcttcgaatttcagggttgaaaaatgcggctgatccagctgatgttatggcagcaaatttgaaagataagaaac 35141447  T
Q  613 atttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggatggctcagtaacagaagcacgtgtctcggtcttggaggctcttcaaccaaatag 712  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  35141448 atttagaagaattaagtgtgtcgtatgatgaatggagagaaatcgatggctcagtaacagaagcatgtgtctcagtgttggagtctcttcagccaaatag 35141547  T
Q  713 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatctacccaatttagtatc 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35141548 aaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttccaaattggcttggggatcatcatttacccaatttagtatc 35141634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 69; Significance: 3e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 8178 - 8378
Alignment:
Q  195 ggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaattcca 294  Q
    |||||| |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| || |||    
T  8178 ggttgctatctctcagagcttgtggatgagataagcaatttaaaacttttgcgttatctagacctttcatacactaagattagaagcttacctgatacca 8277  T
Q  295 tttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaatttttgcaaactcgtcaatttacatcatct 394  Q
    |||||| | |||||||||| || || |||||  |  |||  |||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  8278 tttgtatgttgtataatttacaaacactcttgttaaaaggttgtcgtcaattgactgagctcccttcaaatttttccaaactcatcaatttacgtcatct 8377  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  8378 t 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13412 - 13353
Alignment:
Q  232 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacacggagattacaagcttacctaatt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13412 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacactgagattacaagcatacctaatt 13353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 586 - 659
Target Start/End: Original strand, 13441 - 13513
Alignment:
Q  586 tggcagcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaattaagtttgtcgtacgatgaatggagagaaatggat 659  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  13441 tggcagcaaatttggaagataaagaacatttagaagaattaagtatgtcatacgacgaatagag-gaaatggat 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 906
Target Start/End: Original strand, 8655 - 8874
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatca-atgactacagaggtagtagctttcctaattggcttggggatcatcatcta 785  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| | | || ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |  |||| ||    
T  8655 gtcttggaggctttacaaccaaatagcaacttgaagaagctcaacatcacatg-ctacaaaggtagtagctttccaaattggctaaggggtagtcattta 8753  T
Q  786 cccaatttagtatctcttgaattgttgggatgtacacactgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggct 885  Q
    || || |||||||||||| || ||  ||| |||      ||||||   |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  8754 ccgaacttagtatctcttcaactgaagggttgtgggttatgttcctgtttgccagcacttggacaactcccttctctcaagaaactttccatttatgact 8853  T
Q  886 gtcatggaatagagatcattg 906  Q
    || | |||||| |||||||||    
T  8854 gtgaaggaataaagatcattg 8874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Original strand, 13307 - 13343
Alignment:
Q  232 atttaaagcttctgcgctatctagacctttcttacac 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13307 atttaaagcttctgcggtatctagacctttcttacac 13343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 67; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 614
Target Start/End: Original strand, 6573969 - 6574415
Alignment:
Q  168 aaatatttgcggatgttgtctttcaatggttgcaatctcttagagctagctgatgagataagaaatttaaagcttctgcgctatctagacctttcttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||  |||| |||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  6573969 aaatatttgcggatgttgtcattctatggttgtgaactcacagagttagcagatgagatagtcaatttaaagcttttgcgctatctagacctgagttaca 6574068  T
Q  268 cggagattacaagcttacctaattccatttgtaagctgtataatttgcataccctcttactggaagaatgttttaaattgactgagctcccatcaaattt 367  Q
       |||||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||||||  | || ||   ||||||||  |||  | ||||||| || ||||| ||| ||||    
T  6574069 ataagattaaaaggttgactaattccatatgtaagatgtgtaatttagagacactaacactggaaggctgtactgaattgaccgaactcccttcagattt 6574168  T
Q  368 ttgcaaactcgtcaatttacatcatcttaatttgaaaggcacacatattaagaagatgccaaaggagataagagggttaatcaatcttgagatgctgact 467  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |   | ||| | ||||| |||  ||||||    
T  6574169 ttacaaactcgacagtttacgtcatcttaatatgaatagcactgatattaagaagatgccaaagaagatagggaagctaaaccatcttcagacactgact 6574268  T
Q  468 gattttattgtaggagagcaacatggatttgatattaagcagttggcagaactcaaccaccttaaaggaaggcttcaaatttcagggttgaaaaatgttt 567  Q
     ||||| | || |||||| |  |||| | |||||||||| ||||||   | || || || ||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||      
T  6574269 aattttgtagtgggagagaagaatgggtctgatattaaggagttggataatcttaatcatcttcaaggaggacttcacatttcagggttggaacatgtca 6574368  T
Q  568 ctgatctagcagatgctatggcagcaaatttgaaagataagaaacat 614  Q
     | |||  |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  6574369 ttaatcccgcagatgctgcagaagcaaatttgaaagataagaaacat 6574415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 769
Target Start/End: Original strand, 6574482 - 6574564
Alignment:
Q  687 gtcttggaggctcttcaaccaaatagaaacctcatgaggctcaccatcaatgactacagaggtagtagctttcctaattggct 769  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  6574482 gtctttgaggctcttcgaccaaatagcaacctacagaggctcaccatcaaatactacaatggcagcagctttccaaattggct 6574564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1643 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1643
Description:

Target: scaffold1643; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 825 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 908 - 825
Alignment:
Q  825 tgttcccagttgccaccacttgggcagttcccttctctcaagaagctttccatttcaggctgtcatggaatagagatcattggt 908  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |||||||| |||||||||||    
T  908 tgttcccattttccaccacttgggcagcttccttctctcaagaatctttctatttcatattgtgatggaataaagatcattggt 825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1643; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 590 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 1089
Alignment:
Q  590 agcaaatttgaaagataagaaacatttagaagaatta 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1125 agcaaatttgaaagataagaaacatgtagaagaatta 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University