View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9201_low_2 (Length: 695)

Name: NF9201_low_2
Description: NF9201
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9201_low_2
NF9201_low_2
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (11-679)||(13833625-13834298)
chr7 (11-677)||(27974006-27974691)
chr7 (11-677)||(566965-567646)
chr7 (37-677)||(29024325-29024951)
chr7 (11-511)||(4949641-4950146)
chr7 (37-380)||(27436160-27436510)
chr7 (11-401)||(5207177-5207579)
chr7 (431-677)||(27436511-27436757)
chr7 (414-677)||(5206887-5207150)
chr7 (11-350)||(8812594-8812937)
chr7 (11-153)||(1900166-1900309)
chr7 (530-665)||(38412256-38412391)
chr7 (11-152)||(13491232-13491371)
chr7 (37-155)||(15186452-15186571)
chr7 (37-155)||(29082879-29082998)
chr7 (19-377)||(12586519-12586885)
chr7 (37-155)||(16146569-16146688)
chr7 (11-153)||(13268539-13268681)
chr7 (11-398)||(840315-840693)
chr7 (11-398)||(847491-847869)
chr7 (11-398)||(1205495-1205873)
chr7 (11-109)||(34136937-34137035)
chr7 (21-153)||(23884753-23884885)
chr7 (128-400)||(4829916-4830193)
chr7 (523-655)||(3428700-3428832)
chr7 (542-635)||(12587035-12587128)
chr7 (230-474)||(1959468-1959706)
chr7 (11-153)||(804909-805054)
chr7 (11-79)||(16270644-16270710)
chr7 (221-278)||(16270442-16270498)
chr7 (11-90)||(3430724-3430803)
chr7 (212-350)||(13268344-13268479)
chr7 (212-332)||(23884567-23884692)
chr7 (30-83)||(16228645-16228699)
chr7 (11-59)||(9463104-9463151)
chr7 (11-59)||(16400050-16400097)
chr7 (11-59)||(30376543-30376590)
chr7 (414-451)||(803203-803240)
chr7 (414-451)||(16292070-16292107)
chr7 (415-460)||(34136598-34136643)
chr7 (37-104)||(2549856-2549923)
chr7 (11-90)||(16293858-16293937)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (11-677)||(15950317-15950986)
chr2 (11-677)||(24287742-24288385)
chr2 (11-681)||(35140749-35141426)
chr2 (11-677)||(42571801-42572479)
chr2 (11-677)||(21857383-21858050)
chr2 (11-677)||(16275554-16276245)
chr2 (11-401)||(25493980-25494375)
chr2 (18-367)||(21112150-21112506)
chr2 (11-401)||(3764018-3764418)
chr2 (414-677)||(3763728-3763991)
chr2 (11-153)||(26730967-26731110)
chr2 (11-153)||(34541156-34541299)
chr2 (199-401)||(30691456-30691664)
chr2 (35-146)||(24701129-24701241)
chr2 (11-134)||(40388514-40388637)
chr2 (35-146)||(24692290-24692402)
chr2 (11-111)||(21767056-21767154)
chr2 (200-278)||(24701289-24701366)
chr2 (89-155)||(42386963-42387029)
chr2 (416-488)||(25494393-25494466)
chr2 (200-278)||(24692449-24692526)
chr2 (414-460)||(24692661-24692707)
chr2 (121-152)||(12377267-12377298)
chr2 (75-138)||(20278855-20278918)
chr2 (414-460)||(24701501-24701547)
chr2 (416-460)||(19990255-19990297)
chr2 (37-66)||(42386926-42386955)
chr2 (286-350)||(20278671-20278734)
chr2 (11-59)||(22942907-22942954)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (11-677)||(39842868-39843531)
chr8 (11-677)||(17680211-17680876)
chr8 (11-676)||(6665875-6666544)
chr8 (11-256)||(6673537-6673777)
chr8 (11-153)||(16761728-16761871)
chr8 (11-153)||(19837545-19837686)
chr8 (11-350)||(20735863-20736209)
chr8 (11-153)||(20740901-20741043)
chr8 (11-350)||(20744421-20744767)
chr8 (30-190)||(22104942-22105104)
chr8 (11-147)||(32001904-32002040)
chr8 (11-150)||(22160921-22161060)
chr8 (11-134)||(23917521-23917644)
chr8 (18-397)||(24709061-24709436)
chr8 (11-109)||(25857102-25857200)
chr8 (212-350)||(22160721-22160856)
chr8 (253-350)||(20741148-20741251)
chr8 (414-455)||(32002307-32002348)
chr8 (414-460)||(25856759-25856805)
chr8 (286-348)||(25856869-25856930)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (11-681)||(41000421-41001098)
chr3 (11-681)||(41009203-41009880)
chr3 (11-681)||(8202817-8203499)
chr3 (11-677)||(25265673-25266342)
chr3 (82-665)||(17928027-17928609)
chr3 (37-677)||(10719996-10720658)
chr3 (11-401)||(9552601-9552993)
chr3 (9-312)||(15682786-15683093)
chr3 (11-350)||(14420436-14420777)
chr3 (19-667)||(3242630-3243272)
chr3 (431-677)||(15682448-15682694)
chr3 (21-342)||(8608327-8608652)
chr3 (11-153)||(15697794-15697936)
chr3 (11-153)||(12557195-12557336)
chr3 (11-343)||(30093459-30093798)
chr3 (11-331)||(11183583-11183903)
chr3 (11-349)||(14885413-14885754)
chr3 (30-153)||(14890876-14891000)
chr3 (11-153)||(18881266-18881408)
chr3 (21-350)||(12477128-12477456)
chr3 (11-155)||(7095802-7095946)
chr3 (11-460)||(15622593-15623041)
chr3 (11-350)||(23285736-23286071)
chr3 (415-642)||(27881584-27881810)
chr3 (30-460)||(70314-70729)
chr3 (21-278)||(8806485-8806741)
chr3 (21-185)||(15912056-15912220)
chr3 (21-153)||(21609933-21610065)
chr3 (11-153)||(18960552-18960683)
chr3 (612-681)||(9552489-9552558)
chr3 (11-134)||(13109591-13109714)
chr3 (11-153)||(15599553-15599688)
chr3 (11-350)||(6196558-6196889)
chr3 (11-104)||(8618616-8618708)
chr3 (11-104)||(15535066-15535158)
chr3 (11-104)||(46398513-46398605)
chr3 (523-655)||(3679627-3679759)
chr3 (523-655)||(30016197-30016329)
chr3 (30-84)||(17919962-17920016)
chr3 (11-111)||(6970197-6970295)
chr3 (212-350)||(33568206-33568341)
chr3 (200-332)||(21610113-21610250)
chr3 (93-401)||(27881251-27881564)
chr3 (11-90)||(30014230-30014309)
chr3 (11-153)||(41433823-41433968)
chr3 (414-460)||(12477020-12477066)
chr3 (414-460)||(14885303-14885349)
chr3 (11-90)||(3677659-3677738)
chr3 (30-66)||(4436511-4436547)
chr3 (11-90)||(20436660-20436739)
chr3 (492-608)||(26384076-26384192)
chr3 (11-59)||(46373802-46373849)
chr3 (200-255)||(14396298-14396353)
chr3 (37-83)||(24215391-24215438)
chr3 (414-460)||(8806886-8806932)
chr3 (282-343)||(8618870-8618929)
chr3 (415-460)||(14420843-14420888)
chr3 (414-451)||(20438484-20438521)
chr3 (415-460)||(23285626-23285671)
chr3 (414-451)||(41435649-41435686)
chr3 (30-66)||(5143701-5143737)
chr3 (11-59)||(5957518-5957565)
chr3 (37-104)||(11932154-11932221)
chr3 (121-153)||(26384530-26384562)
chr3 (286-342)||(46398287-46398341)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (11-681)||(31542081-31542758)
chr1 (11-677)||(2387295-2387963)
chr1 (30-677)||(13470882-13471530)
chr1 (11-312)||(31554281-31554592)
chr1 (432-677)||(31554693-31554938)
chr1 (11-153)||(13452956-13453098)
chr1 (21-350)||(22430075-22430404)
chr1 (30-401)||(1957985-1958356)
chr1 (9-278)||(14817945-14818202)
chr1 (18-104)||(2341525-2341610)
chr1 (30-126)||(19370984-19371081)
chr1 (11-323)||(6202787-6203100)
chr1 (212-331)||(19371138-19371260)
chr1 (111-460)||(35071822-35072165)
chr1 (11-158)||(27168225-27168373)
chr1 (414-460)||(6202651-6202697)
chr1 (212-278)||(2341361-2341427)
chr1 (414-460)||(14817763-14817809)
chr1 (30-83)||(22473489-22473543)
chr1 (11-59)||(5635719-5635766)
chr1 (414-460)||(22430466-22430512)
chr1 (414-451)||(19371337-19371374)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (11-681)||(24962560-24963236)
chr5 (11-677)||(21993638-21994291)
chr5 (11-401)||(20378632-20379025)
chr5 (444-677)||(28846480-28846712)
chr5 (11-401)||(28846073-28846460)
chr5 (252-677)||(23638462-23638889)
chr5 (252-677)||(23833998-23834427)
chr5 (11-272)||(21866131-21866389)
chr5 (414-677)||(12178351-12178616)
chr5 (414-677)||(27231425-27231688)
chr5 (11-401)||(12178647-12179047)
chr5 (11-401)||(33842911-33843311)
chr5 (11-401)||(26087416-26087816)
chr5 (11-401)||(11811500-11811901)
chr5 (414-677)||(33842621-33842884)
chr5 (414-677)||(26087120-26087383)
chr5 (414-677)||(11811197-11811460)
chr5 (11-460)||(22956632-22957078)
chr5 (18-257)||(23638203-23638439)
chr5 (18-257)||(23834451-23834687)
chr5 (11-268)||(27231843-27232101)
chr5 (11-348)||(29895244-29895576)
chr5 (11-460)||(25528337-25528780)
chr5 (57-350)||(20097251-20097550)
chr5 (11-153)||(36450393-36450535)
chr5 (11-398)||(26871190-26871568)
chr5 (11-278)||(7259793-7260060)
chr5 (11-104)||(1800288-1800380)
chr5 (11-104)||(12393443-12393535)
chr5 (11-104)||(21690733-21690825)
chr5 (11-115)||(29890230-29890334)
chr5 (523-655)||(37580755-37580887)
chr5 (30-153)||(358860-358983)
chr5 (11-86)||(20395672-20395746)
chr5 (414-460)||(7259625-7259671)
chr5 (415-472)||(21865921-21865978)
chr5 (200-350)||(36450583-36450730)
chr5 (19-62)||(37578782-37578825)
chr5 (414-460)||(29895640-29895686)
chr5 (11-59)||(15791307-15791354)
chr5 (11-59)||(36382575-36382622)
chr5 (11-59)||(37007247-37007294)
chr5 (286-343)||(7789240-7789295)
chr5 (286-343)||(12393225-12393280)
chr5 (282-323)||(21690984-21691024)
chr5 (414-451)||(34464032-34464069)
chr5 (37-104)||(3490920-3490987)
chr5 (11-59)||(5446797-5446844)
chr5 (11-59)||(7788983-7789030)
chr5 (11-59)||(11951010-11951057)
chr5 (417-453)||(21691131-21691167)
chr5 (11-59)||(31513825-31513872)
chr5 (11-90)||(34462205-34462284)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (32-681)||(25503768-25504426)
chr6 (11-677)||(16636282-16636956)
chr6 (11-401)||(28269987-28270386)
chr6 (11-401)||(28348737-28349136)
chr6 (11-401)||(28304954-28305355)
chr6 (11-401)||(27056372-27056773)
chr6 (535-681)||(5006783-5006929)
chr6 (414-677)||(27056064-27056327)
chr6 (11-342)||(22326025-22326361)
chr6 (11-350)||(620927-621270)
chr6 (11-153)||(27538305-27538448)
chr6 (11-350)||(27071864-27072204)
chr6 (11-153)||(25700474-25700616)
chr6 (30-350)||(19715822-19716143)
chr6 (11-155)||(18219274-18219418)
chr6 (21-153)||(20056100-20056231)
chr6 (37-155)||(18112836-18112955)
chr6 (30-350)||(20457035-20457358)
chr6 (11-155)||(23981842-23981986)
chr6 (11-153)||(3694321-3694465)
chr6 (11-104)||(27512121-27512213)
chr6 (37-109)||(22777010-22777082)
chr6 (212-315)||(27512302-27512407)
chr6 (11-104)||(16823023-16823115)
chr6 (32-84)||(18911256-18911308)
chr6 (216-278)||(20055967-20056028)
chr6 (37-153)||(28266931-28267047)
chr6 (37-153)||(28345680-28345796)
chr6 (243-343)||(22776802-22776905)
chr6 (11-59)||(9143000-9143047)
chr6 (414-460)||(18946917-18946963)
chr6 (414-460)||(27071751-27071797)
chr6 (286-343)||(20045665-20045720)
chr6 (11-95)||(20045908-20045988)
chr6 (417-453)||(27512506-27512542)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (11-665)||(73906-74566)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (11-677)||(1849-2516)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (11-400)||(12103-12491)
scaffold0056 (498-677)||(12567-12746)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (11-472)||(144300-144762)
scaffold0023 (11-239)||(131477-131706)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (11-461)||(6752-7217)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (418-677)||(21528930-21529189)
chr4 (444-677)||(8100380-8100612)
chr4 (11-401)||(21529217-21529586)
chr4 (11-401)||(8100633-8101020)
chr4 (37-312)||(26218314-26218595)
chr4 (431-677)||(26217977-26218224)
chr4 (11-147)||(3386336-3386471)
chr4 (11-155)||(14736116-14736260)
chr4 (11-153)||(1888796-1888938)
chr4 (11-350)||(20556056-20556393)
chr4 (11-278)||(16725868-16726133)
chr4 (18-350)||(14883695-14884022)
chr4 (492-676)||(12510293-12510477)
chr4 (11-350)||(15900530-15900867)
chr4 (11-153)||(3841888-3842030)
chr4 (36-99)||(9187022-9187085)
chr4 (577-667)||(12511465-12511555)
chr4 (11-104)||(18038434-18038526)
chr4 (11-104)||(22706146-22706238)
chr4 (220-342)||(15077321-15077447)
chr4 (577-667)||(12511038-12511128)
chr4 (212-315)||(18038616-18038721)
chr4 (11-350)||(15079619-15079961)
chr4 (216-401)||(3359573-3359761)
chr4 (34-134)||(17304043-17304144)
chr4 (212-278)||(3841764-3841828)
chr4 (414-460)||(14919898-14919944)
chr4 (417-460)||(16725687-16725730)
chr4 (414-460)||(3386030-3386076)
chr4 (542-655)||(15077014-15077127)
chr4 (37-104)||(10787570-10787637)
chr4 (414-460)||(9187384-9187430)
chr4 (11-57)||(23994001-23994047)
chr4 (415-460)||(20556457-20556502)
chr4 (282-323)||(22706397-22706437)
chr4 (417-453)||(3841582-3841618)
chr4 (286-350)||(9187258-9187321)
chr4 (417-453)||(22706531-22706567)
[»] scaffold2162 (2 HSPs)
scaffold2162 (414-677)||(452-715)
scaffold2162 (11-401)||(5-407)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (19-401)||(4881-5268)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (34-350)||(192297-192620)
scaffold0004 (542-652)||(192001-192111)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (11-343)||(19394-19728)
scaffold0019 (414-460)||(18481-18527)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (11-350)||(17178-17520)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (11-319)||(30575-30886)
[»] scaffold0551 (3 HSPs)
scaffold0551 (11-342)||(5047-5385)
scaffold0551 (414-460)||(4929-4975)
scaffold0551 (414-460)||(11043-11089)
[»] scaffold1818 (1 HSPs)
scaffold1818 (11-153)||(92-234)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (35-460)||(31033-31463)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-347)||(10309-10630)
scaffold0138 (593-668)||(10861-10936)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (11-153)||(8459-8601)
scaffold0357 (217-350)||(8665-8804)
scaffold0357 (414-460)||(8869-8915)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (21-278)||(31714-31970)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (11-153)||(2430-2574)
[»] scaffold0320 (2 HSPs)
scaffold0320 (21-153)||(4146-4278)
scaffold0320 (212-350)||(3947-4090)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (30-153)||(20756-20880)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (11-350)||(17784-18122)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (11-154)||(38679-38815)
[»] scaffold0478 (3 HSPs)
scaffold0478 (21-150)||(314-443)
scaffold0478 (414-455)||(2-43)
scaffold0478 (216-342)||(115-246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (11-343)||(98758-99089)
[»] scaffold0441 (2 HSPs)
scaffold0441 (11-153)||(9183-9326)
scaffold0441 (417-454)||(9585-9622)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (492-676)||(10000-10184)
scaffold0157 (577-667)||(9352-9442)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (34-158)||(301177-301297)
scaffold0005 (497-635)||(301586-301724)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (19-191)||(11374-11545)
scaffold0125 (542-612)||(11857-11926)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (11-153)||(8134-8270)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (19-153)||(16685-16811)
scaffold0243 (417-460)||(17062-17105)
[»] scaffold0362 (3 HSPs)
scaffold0362 (21-153)||(1872-1998)
scaffold0362 (521-667)||(1382-1528)
scaffold0362 (414-460)||(1580-1625)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (212-350)||(25380-25522)
[»] scaffold0435 (2 HSPs)
scaffold0435 (21-104)||(14601-14684)
scaffold0435 (414-454)||(14277-14317)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (220-350)||(3834-3968)
scaffold0393 (11-153)||(3626-3768)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (11-153)||(291-433)
scaffold0364 (286-350)||(96-159)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (11-104)||(23085-23177)
scaffold0068 (286-323)||(22886-22922)
scaffold0068 (417-453)||(22743-22779)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (220-460)||(37076-37319)
scaffold0104 (21-99)||(37438-37516)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (21-153)||(208-340)
[»] scaffold0866 (1 HSPs)
scaffold0866 (11-111)||(4586-4684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (11-99)||(299420-299507)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (212-351)||(33885-34029)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (11-158)||(185841-185989)
scaffold0014 (542-612)||(184024-184094)
scaffold0014 (414-451)||(184177-184214)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (589-648)||(29015-29074)
scaffold0031 (11-153)||(29511-29653)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (30-83)||(84320-84374)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (212-278)||(152039-152104)
[»] scaffold0782 (1 HSPs)
scaffold0782 (414-451)||(5901-5938)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-59)||(22701-22748)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 679
Target Start/End: Original strand, 13833625 - 13834298
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13833625 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtctttaccaagtggcgttgttatccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 13833724  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  13833725 atgtactttataataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatgg 13833823  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13833824 atatggactttgtaagaatgaacacaaagagatacaacttcaaaaatt-ttaactaagctttagcttttgtactctttccttgatttcgttcttaccttt 13833922  T
Q  311 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc-------nn 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  13833923 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcaaaaaaaaa 13834022  T
Q  404 nnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaat 503  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13834023 aaaaacaaaactatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtatgtgtttcatattttgtttctactagcaaaaggttaat 13834122  T
Q  504 ccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13834123 ccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaggtccat 13834222  T
Q  604 gagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggcca 679  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13834223 gagctgcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctaatatcttcattgatggcca 13834298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27974691 - 27974006
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  27974691 agaacccgtgatacaggtacgtttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 27974593  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-----ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaaca 204  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||||||||        |||||    
T  27974592 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaaca 27974495  T
Q  205 tcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggttt 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      ||| ||||||||||||    
T  27974494 tcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaactttttccttggttt 27974396  T
Q  298 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagt 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||    
T  27974395 cgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaacaatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagt 27974297  T
Q  397 ccttcnnnnnnnnnnnn----------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttc 485  Q
    |||||                      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||    
T  27974296 ccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttc 27974197  T
Q  486 taccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcga 585  Q
    | |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||  |||||| |    
T  27974196 t-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagttggatcaa 27974098  T
Q  586 cttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27974097 cttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27974006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 567646 - 566965
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  567646 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacgtcgtggaacttaccctcaccatgtattc 567548  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt----------gaaggacttagacaagnnnnnnnc 199  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||||||            
T  567547 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaattttttttttttgaaggacttagacaagtttttgt- 567450  T
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcg 299  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  | |   | |||  |||||||||||||    
T  567449 aaacatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcg 567351  T
Q  300 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  567350 ttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtcc 567252  T
Q  399 ttcnnnnnnnnnnnn--------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctacc 489  Q
    |||                    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| ||    
T  567251 ttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-cc 567153  T
Q  490 agcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttg 589  Q
    |  ||| ||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||    
T  567152 ataaaagggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttg 567053  T
Q  590 agcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  567052 agcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 566965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 677
Target Start/End: Original strand, 29024325 - 29024951
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||          
T  29024325 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgta---------ctttagcataaccat------ 29024408  T
Q  137 atgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacacc 236  Q
              |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29024409 ----------tcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggatttagacaagtttttgt-aaacatcatggatatggaccttgtaagaatgaacacc 29024496  T
Q  237 aagagatacaacttcaaaaaa------tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  29024497 aagagatacaacttcaaaaaaaaaatctcttaactaagttttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-cctt 29024595  T
Q  326 ttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnct---attttt 421  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||                  |||| |    
T  29024596 ttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctacaatgtttaaaaattaactttgataagtcctttaaaaaaaaaaatagtacatttct 29024694  T
Q  422 gcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgtt 520  Q
    ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||     
T  29024695 gcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccatgcctcatattttgtttttacctacaaaaggtcaatccaacattaaaggggtc 29024794  T
Q  521 caatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggt 620  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29024795 agatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggt 29024894  T
Q  621 aacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29024895 aacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 29024951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4950146 - 4949641
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  4950146 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaacatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatatattt 4950048  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaagga--cttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||        ||||||||    
T  4950047 tatgaattttagcataaccatgtatacatgcattcattcataaacaact-tttcca-ccaaaaattgaaggactcttagacaagtttttgt-aaacatca 4949951  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
     |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||     |||||||||||||||||||||    
T  4949950 cgaataatgaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaactt-taaaaatcttaactaagctttaacttttgtttagaactctttccttggtttcgttc 4949852  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc- 401  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4949851 ttaccttttgaaaaaggaatctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaatcatgttcgtctgccatgtttacaattcac-ttgataagtccttca 4949754  T
Q  402 ---nnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaagg 498  Q
                   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | || |  |||||||    
T  4949753 aaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcctcattttgcattcatagtttctagtatgtgtcttatcatgtgtctttatctacaaaagg 4949654  T
Q  499 tcaatccatcagt 511  Q
    |||||||||||||    
T  4949653 tcaatccatcagt 4949641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Original strand, 27436160 - 27436510
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgt-ggacttaacctcatcatgtattc------tatgtactttagcataacca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||    
T  27436160 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggctccaacattgtgggacttaacctcaccatgtattctatgtatatgtactttaacataacca 27436259  T
Q  130 tgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||         |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27436260 tgcatacatgcattcattcatgaataactttttccatc-aaaaattgaaggacttagataa-atttttgtaaacatcacggatatggaccttgtaagaat 27436357  T
Q  230 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27436358 gaacaccaagagatacagcttc--aaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacct 27436455  T
Q  325 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttaca 380  Q
     ||||||  |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  27436456 attgcaatatctttaaaattttc-aaatgaaaccatgttcctctactgtgtttaca 27436510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5207579 - 5207177
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  5207579 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 5207481  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa--------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaa 201  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||||||||||||||||        ||    
T  5207480 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aa 5207383  T
Q  202 acatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttgg 294  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||    
T  5207382 acatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttgg 5207284  T
Q  295 tttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgata 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  5207283 tttcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaaca 5207185  T
Q  394 agtccttc 401  Q
    ||||||||    
T  5207184 agtccttc 5207177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 431 - 677
Target Start/End: Original strand, 27436511 - 27436757
Alignment:
Q  431 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctcc 530  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||   |||||  |    
T  27436511 tatcatccatcactttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattttgtttttacctacaagaggtcaatccaacagtaaaggggtcagatgtcgtc 27436610  T
Q  531 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27436611 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaacatggatcagcttgagcaagaagtccaggagcttcgtggagaggtaacaacactt 27436710  T
Q  631 cgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  27436711 cgggctgaggtagagaagttagctagcctagtatcctcattgatggc 27436757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5207150 - 5206887
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  5207150 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 5207052  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5207051 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgg 5206952  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5206951 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 5206887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 8812594 - 8812937
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  8812594 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 8812692  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  8812693 atgttcttcagcataaacatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 8812790  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 301  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||  |||||||||||    
T  8812791 aaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttttggtttcgtt 8812889  T
Q  302 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  8812890 ctta-cttttgaaaagggaaccaattggaacatcttcacaattttcaaa 8812937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1900309 - 1900166
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1900309 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 1900210  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1900209 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 1900166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 530 - 665
Target Start/End: Original strand, 38412256 - 38412391
Alignment:
Q  530 catccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacact 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  38412256 catccaagtccggctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaagtacgggaacttcgtggagaggtaacaacact 38412355  T
Q  630 tcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 665  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  38412356 tcgggctgaggtagagaagttaactagtcttgtatc 38412391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13491371 - 13491232
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  13491371 agaacccgtgatacaggtata-tttaaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggacttaacctcattatgtattcc 13491274  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataa 152  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13491273 atgtattttagcataatcatgcatgcatgcatccattcataa 13491232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 15186452 - 15186571
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  15186452 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 15186551  T
Q  136 catgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15186552 catgcattcattcataaaca 15186571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 29082879 - 29082998
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  29082879 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 29082978  T
Q  136 catgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29082979 catgcattcattcataaaca 29082998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 12586519 - 12586885
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaa--cctcatcatgtattc----ta 111  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||| |||    |     
T  12586519 tgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtatttaccccttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttttcaccatt 12586617  T
Q  112 tgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatggg 211  Q
    ||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||| |||||||||       |||||||||  |     
T  12586618 tgtgc---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaaatttttccatcaaaca-tcgaaggatttagacaagttttta-caaacatcacaga 12586712  T
Q  212 t--atggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
    |  | |||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| |||| |||||||||||||    
T  12586713 tgaacggaccttgtaaggaagaacaccaagaaattcaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttctttggtttcgttct 12586811  T
Q  304 taccttttg-aaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt 377  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12586812 taccttttgaaaaaaggaacctattgcaatatctttacaat-ttttaaatgaaaccatgttcctctataatgttt 12586885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16146688 - 16146569
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  16146688 aaaccatagtccttaccagatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 16146589  T
Q  136 catgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16146588 catgcattcattcataaaca 16146569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13268681 - 13268539
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13268681 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 13268583  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13268582 catgttccttagcataatcatgcatacaagcattcattcataaa 13268539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 840315 - 840693
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  840315 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 840413  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  840414 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 840501  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  840502 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 840600  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  840601 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 840693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 847491 - 847869
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  847491 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 847589  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  847590 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 847677  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  847678 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 847776  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  847777 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 847869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 1205495 - 1205873
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1205495 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 1205593  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  1205594 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 1205681  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  1205682 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 1205780  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1205781 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 1205873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 34137035 - 34136937
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34137035 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggtgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 34136937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23884885 - 23884753
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  23884885 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 23884787  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23884786 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 23884753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4830193 - 4829916
Alignment:
Q  128 catgcatacatgcattcattcataaacaactatt-tccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca--tgggtatggaccttgta 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| | | |||||| |||||||||       |||||||||  |  | | |||||||| |    
T  4830193 catgcatacatgcattcattcataaacaacttttgtttatcaaata-tcgaaggatttagacaagttttttgcaaacatcacatatgaacggaccttgaa 4830095  T
Q  225 agaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaag 318  Q
    || | ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830094 aggaagaacaccaagaaattcaaacttcaaaaa-tcttaactaagccttagcttttattaagaactttttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaag 4829996  T
Q  319 gaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt 400  Q
    |||||  ||||||  |||||||||| ||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  4829995 gaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaatcacgttcctctataatgtttccaatt-actttgacaaatcctt 4829916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3428832 - 3428700
Alignment:
Q  523 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 621  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3428832 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccacgagcttcgtgaagaagta 3428734  T
Q  622 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 655  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3428733 actgtacttcgggccgaggtagagaagttaacta 3428700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 542 - 635
Target Start/End: Original strand, 12587035 - 12587128
Alignment:
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggc 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  12587035 gctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtccacgagcttcgtaaagaagtgacaacgcttcgggc 12587128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1959706 - 1959468
Alignment:
Q  230 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||     |||  |||||||||||||||||||| |||        |||| |    
T  1959706 gaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaattaaactttagcttttgttaagaacttcttccttggtttcgttcttactttt--------gaactg 1959616  T
Q  325 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnctatttttgca 424  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||            | |||||||||    
T  1959615 attgcaatatctttacaattttcaaa-taaagttatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataggcccttcggaaaaatcctac-atttttgca 1959518  T
Q  425 taagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctca 474  Q
    ||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1959517 taaacatacaatgcattattttgcattcatagtttctagttcgtgtctca 1959468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 805054 - 804909
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggactt--aacctcatcatgtat 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  805054 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttt 804956  T
Q  108 tc----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||    | |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  804955 tcaccatttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcatccataaa 804909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16270710 - 16270644
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactcca 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16270710 agaacctgtgatacaagtacaat--gaaaccatagtccttaccaaatggcgttataccccttgactcca 16270644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16270498 - 16270442
Alignment:
Q  221 tgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270498 tgtaaggaagaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttt 16270442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3430803 - 3430724
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430803 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 3430724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13268479 - 13268344
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | ||| ||||||||||||||||     
T  13268479 tatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaatttttttcttggtttcgttctta- 13268388  T
Q  307 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  13268387 cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 13268344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23884692 - 23884567
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac--tctttccttggtttcgttctt 304  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||     ||  | |||||||||||||||||||    
T  23884692 tatggatcttgtaagaaggaacaccaagaaatacaaactc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttccttggtttcgttctt 23884594  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaac 332  Q
    | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  23884593 a-cttttgaaaagggaaccaattgcaac 23884567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 16228645 - 16228699
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 83  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16228645 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 16228699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 9463104 - 9463151
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9463104 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 9463151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16400097 - 16400050
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16400097 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 16400050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 30376590 - 30376543
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30376590 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 30376543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 803240 - 803203
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  803240 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 803203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16292107 - 16292070
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16292107 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 16292070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34136643 - 34136598
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34136643 tatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 34136598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Original strand, 2549856 - 2549923
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  2549856 aaaccttagtccttaccaaatggcgttattaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcatcatg 2549923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16293937 - 16293858
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| || |||||||    
T  16293937 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcaatgtggac 16293858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15950986 - 15950317
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950986 agaacccgtgatacaggtacattttgaaaccatagtctttaccaagtggcgttgttatccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 15950887  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  15950886 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatca-aaaattgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatgg 15950788  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15950787 atatggactttgtaagaataaacacaaagagatacaacttcaaaaaat-ttaactaagctttagcttttgtactctttccttgatttcgttcttaccttt 15950689  T
Q  311 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 409  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||            
T  15950688 tgaaaaaggaaccgtttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaa 15950590  T
Q  410 nnnnct----atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatc 504  Q
         |    ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950589 aaaattgtacatttttgcataaatatataatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatc 15950490  T
Q  505 catcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950489 catcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcagcttgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 15950390  T
Q  605 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15950389 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 15950317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 24287742 - 24288385
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||    
T  24287742 agaacccgtgatacaggtacacttg--aaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaatattgtggaacttaacgccaccatgtattc 24287839  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||        ||||||||      
T  24287840 tatgttctt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggactaagacaagttttttgtaaacatcaca 24287937  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||                     |||||||||||||||||    
T  24287938 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagatatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctt---------------------ggtttcgttcttacctt 24288015  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            
T  24288016 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgttcctctataatgtttacaattcactttgataagtccttcaaaatttt 24288115  T
Q  410 nnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccat 507  Q
          ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24288116 ttttatctatttttgcataagcacatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcatattttgtttctaccagcaaagggtcaatccat 24288215  T
Q  508 cagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288216 cagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaagaaaaatcgatcgacttgagcaagaggtccacgagc 24288315  T
Q  608 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24288316 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcagtgatggc 24288385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Original strand, 35140749 - 35141426
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  35140749 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaccttaccatgtattc 35140848  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  35140849 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 35140946  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa--tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 301  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||     | | ||||||||||||||||    
T  35140947 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgtt 35141046  T
Q  302 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    |||| ||||| |||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141047 cttaacttttaaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 35141144  T
Q  402 nnnnnnnnnnnn-ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 499  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  35141145 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 35141244  T
Q  500 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 599  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141245 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 35141344  T
Q  600 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35141345 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 35141426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 42572479 - 42571801
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacc-tcatcatgtatt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  42572479 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgatgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaacatcctcatgtatt 42572380  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  42572379 caatgtactttattataaccatgcatacatgcatttattcataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattat 42572281  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||| | |    
T  42572280 ggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgattt 42572181  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcn 402  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||     
T  42572180 taccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttca 42572082  T
Q  403 nnnnnnnnnnnct------atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaa 495  Q
                       ||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42572081 aaaaaaaaaaaaattttacatttttgcataaatatatcattcatcatctttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaa 42571983  T
Q  496 aggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaag 595  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42571982 aggtcaatccatccgtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaag 42571883  T
Q  596 aggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42571882 aggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 42571801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 21858050 - 21857383
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21858050 agaacccgtgacaccggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggacttaacctcatcatgtattc 21857951  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  21857950 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcatccattcataaacaactttttccatca-aaaattgaaggacttagtcaagtttttgt-aaacatcatg 21857853  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21857852 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaatcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 21857754  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc------nn 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||            
T  21857753 ttgaaaaaggaaccgtttgcgacgtctttacaatattcaaaatgaaaccatattc--gtactgtgtttacatttcgctttgataagtccttcaaaaaaat 21857656  T
Q  404 nnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaa 502  Q
               | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||| |||  ||| |||  ||||||||||    
T  21857655 tattatcttttttttttttcataagcatatcatgcatcattttgtattcatagtttctagtccgtgtcttacattgtgtcctct-cca-taaaaggtcaa 21857558  T
Q  503 tccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtcca 602  Q
    ||| ||| |||||  |    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  21857557 tccgtcaataaaggggccagatgtcgtcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttca 21857458  T
Q  603 cgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21857457 tgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 21857383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 16275554 - 16276245
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16275554 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 16275652  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt-------------gaaggacttagacaagnnnnn 196  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||             ||||||||||||||||         
T  16275653 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaattttttttttttttttgaaggacttagacaagttttt 16275751  T
Q  197 nncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttc 289  Q
       |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  |||    
T  16275752 gt-aaacatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttc 16275849  T
Q  290 cttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16275850 cttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactt 16275948  T
Q  389 tgataagtccttcnnnnnnnnnnnn----------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatatt 478  Q
    | | |||||||||                      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | |    
T  16275949 taacaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacact 16276048  T
Q  479 ttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaat 578  Q
     | || || |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
T  16276049 gtctt-ct-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgagcaaacacaaaagat 16276146  T
Q  579 ggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16276147 ggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 16276245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 25493980 - 25494375
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  25493980 agaacccgtgatacaggtacactt-gaaaccatagtccttaccagatggtgttgttacccttagctccaacattgtggaacttgccctcaccatgtattc 25494078  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||       |||||||||||    
T  25494079 tatgtactttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacatcttttttcatcaaaaa-ttgaaggactaagacaagttttttgcaaacatcatg 25494177  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  25494178 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 25494277  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattc-actttgataagtccttc 401  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  25494278 taccttttgaaaaaaggaccttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaatcaactttgacaagtccttc 25494375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 21112150 - 21112506
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 117  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  21112150 gtgatacaggtaca-tatgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacttcaccatgttttctatgttct 21112248  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaa--aaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||        ||||||||||  ||||    
T  21112249 ttagcataatcatgcatacatgcattcatccataaatatttttttccatccattaaaatttaaggacttagacaagttttttgtaaacatcatgaatatg 21112348  T
Q  216 gaccttgtaagaatgaacacc--aagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc-----gtactctttccttggtttcgttcttacct 308  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21112349 gattttgtaagaatgaacaccaaaagagatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttcgctttcattaagaactttttccttggtttcgttcttacct 21112447  T
Q  309 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctc 367  Q
     |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21112448 gttgaaaaaggaatcgtttgcgacatctttacaattttcaaaataaaaccatgttcctc 21112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3764418 - 3764018
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  3764418 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 3764320  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  3764319 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 3764222  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  3764221 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 3764123  T
Q  297 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  3764122 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 3764024  T
Q  396 tccttc 401  Q
    ||||||    
T  3764023 tccttc 3764018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3763991 - 3763728
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  3763991 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 3763893  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3763892 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 3763793  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3763792 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 3763728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26731110 - 26730967
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26731110 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 26731011  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26731010 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 26730967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34541299 - 34541156
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34541299 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 34541200  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34541199 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 34541156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30691664 - 30691456
Alignment:
Q  199 caaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaa-aaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttcctt 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| ||    
T  30691664 caaacatcatgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttcttt 30691565  T
Q  293 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttga 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||    
T  30691564 ggtttcgatcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttga 30691466  T
Q  392 taagtccttc 401  Q
    ||||||||||    
T  30691465 taagtccttc 30691456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 24701129 - 24701241
Alignment:
Q  35 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  24701129 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataagcatgca 24701228  T
Q  134 tacatgcattcat 146  Q
    ||||| |||||||    
T  24701229 tacatacattcat 24701241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40388637 - 40388514
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40388637 agaacccgtgatataggtacatttggaaaccatagtccttaccaaatggtgttgttacccctaactccaacattgtggacctaacctcaccatgtattct 40388538  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcat 134  Q
     |||| |||||||||| |||||||    
T  40388537 ctgtattttagcataatcatgcat 40388514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 24692290 - 24692402
Alignment:
Q  35 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||  |||||    
T  24692290 tgaaaccatagtccttatcaaatggtgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataaagatgca 24692389  T
Q  134 tacatgcattcat 146  Q
    ||||| |||||||    
T  24692390 tacatacattcat 24692402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21767154 - 21767056
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||| | ||||| | ||||| ||||    
T  21767154 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaatagcattg-tacccttgactccaaccttatggattcaaccttaccatgttttct 21767057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 24701289 - 24701366
Alignment:
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  24701289 aaacatcaaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactagactttagcttt 24701366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 42386963 - 42387029
Alignment:
Q  89 acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386963 acttaccctcaccttgtattctatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 42387029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 488
Target Start/End: Original strand, 25494393 - 25494466
Alignment:
Q  416 atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctac 488  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  25494393 atttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctac 25494466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 24692449 - 24692526
Alignment:
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    ||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  24692449 aaacatcaaagatatggaccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactagactttagcttt 24692526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 24692661 - 24692707
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24692661 ctatttttgcataagcatatcgtgcatcattttgcattcataatttc 24692707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 152
Target Start/End: Original strand, 12377267 - 12377298
Alignment:
Q  121 gcataaccatgcatacatgcattcattcataa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12377267 gcataaccatgcatacatgcattcattcataa 12377298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20278918 - 20278855
Alignment:
Q  75 ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacat 138  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  20278918 ctccaacattatggacttaatctcaccatgcattccatgttctgtagcataatcatgcatacat 20278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 24701501 - 24701547
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24701501 ctatttttgcataaacatatcgtgcatcattttgcattcataatttc 24701547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 460
Target Start/End: Original strand, 19990255 - 19990297
Alignment:
Q  416 atttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19990255 atttttgcataagcgt--catgcatcattttgcattcatagtttc 19990297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 66
Target Start/End: Original strand, 42386926 - 42386955
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386926 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 42386955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20278734 - 20278671
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20278734 tttccttagtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20278671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 22942907 - 22942954
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22942907 agaacccgtgatacaggtacaaata-aaaccatagtccttaccaaatgg 22942954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 39843531 - 39842868
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39843531 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggtgttgttaccctcgactccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 39843433  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  39843432 aatgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 39843334  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843333 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttaccttttgtactctttccttggtttcgttcttacctt 39843235  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnn 408  Q
    ||||||||||  || |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||           
T  39843234 ttgaaaaaggg-ccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaa 39843137  T
Q  409 nnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccat 507  Q
         | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843136 ttgtac-atttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccat 39843038  T
Q  508 cagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843037 cagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgaaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagc 39842938  T
Q  608 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39842937 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 39842868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17680876 - 17680211
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17680876 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 17680778  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  17680777 agtgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 17680679  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680678 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgtactctttccttggtttcgttcttacctt 17680580  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnn 408  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||            
T  17680579 ttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttaaaaaaaa 17680482  T
Q  409 nnnnnct-atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatcca 506  Q
            ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680481 aattgtacatttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtttgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatcca 17680382  T
Q  507 tcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgag 606  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680381 tcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgag 17680282  T
Q  607 cttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17680281 cttcgtgcagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 17680211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 676
Target Start/End: Original strand, 6665875 - 6666544
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||    
T  6665875 agaacccgtgatacatgcaca-ttggaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggactctatctcaccatgtattct 6665972  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |         |||||||| ||    
T  6665973 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacga-atttttgtaaacatcacgg 6666069  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctta 305  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||     
T  6666070 atatggacattgtaagaaggaacaccaagagatgcaaattc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt- 6666167  T
Q  306 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc---- 401  Q
      |||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        
T  6666168 --tttgaaaaaaggaatcgtttgcaacatccttacaatgtttaaaatgaaaccattttcctctacaatgtttacatttcactttgataaatccttcaaaa 6666265  T
Q  402 --nnnnnnnnnnnncta-tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaag 497  Q
                  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |   ||| |||| | |   | ||    
T  6666266 aaaaaaagaattatctattttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcacaccgtgtcttctccaaaagagag 6666365  T
Q  498 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 597  Q
    |||||||| ||||| |||| || | |||||| | | ||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6666366 gtcaatccgtcagtgaagtggtccgatgtcttctttcaactttggctcgcatatgaagacactcgtgcagacaggaaaaacggatcggcttgagcaagag 6666465  T
Q  598 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 676  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6666466 gtccatgagctgcgtggagaggtaacaacactttgggctgaggtagaaaagttaactgacctagtatcttcattgatgg 6666544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 6673537 - 6673777
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||    
T  6673537 agaacccgtgatacatgcaca-ttggaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggactctatctcaccatgtattct 6673634  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |         |||||||| ||    
T  6673635 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacga-atttttgtaaacatcacgg 6673731  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa 256  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6673732 atatggacattgtaagaaggaacaccaagagatgcaaattcaaaaa 6673777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 16761728 - 16761871
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16761728 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 16761827  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16761828 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 16761871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 19837545 - 19837686
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19837545 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccgtagtcctcaccaaatggcattgttacctttgactccaacattgtggacttaacctcatcatttattct 19837643  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19837644 atgtactttaacataagcatgcatacatgcattcattcataaa 19837686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 20735863 - 20736209
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||     
T  20735863 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttggctccaactttgtggacttaacctccccatgcattcc 20735962  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaa---aaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  |   | || |||| ||||||| |||        ||||||||    
T  20735963 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaagtacttagataagtgtttgt-aaacatca 20736060  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgt 300  Q
      | ||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||    
T  20736061 aagatacagaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgt 20736159  T
Q  301 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20736160 tcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20736209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 20740901 - 20741043
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  20740901 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcatcgttacccttggctccaaatttgtggacttaacctcaccatgcattcc 20741000  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20741001 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 20741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 20744421 - 20744767
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  20744421 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcatcgttacccttggctccaaatttgtggacttaacctcaccatgcattcc 20744520  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaa---aaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  |   | || |||| ||||||| |||        ||||||||    
T  20744521 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaagtacttagataagtgtttgt-aaacatca 20744618  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgt 300  Q
      | ||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||    
T  20744619 aagatacagaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgt 20744717  T
Q  301 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20744718 tcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20744767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22105104 - 22104942
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaa-cctcatcatgtattctatgtactt-tagcataac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| || || ||||| |||   ||   | ||||||||     
T  22105104 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtttttacccttaactccaactttatggacttaaaccccaccatgttttcaccgtttgtgtagcataat 22105005  T
Q  128 catgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105004 catgcatacatgcattcattcataaacaactctttccatcaaaaaattgaaggacttagacaa 22104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 32001904 - 32002040
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||    
T  32001904 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaactttgtgggcttaacctcaccatgcgttc 32002002  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcatt 147  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32002003 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatt 32002040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22161060 - 22160921
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  22161060 agaacccgtgatacatgtaca-tttgaaaccgtagtacctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 22160962  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat 150  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22160961 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcat 22160921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 23917521 - 23917644
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||    
T  23917521 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacaattgactccaacattatggaacttaacttccccatgtattc 23917619  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcat 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||    
T  23917620 tatgtactttagcattatcatgcat 23917644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24709436 - 24709061
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 117  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||| | | |||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |     ||    
T  24709436 gtgattcaggtaca-tgtgaaaccgtagtccctaccatacgacgtgttttccctttactccaacattatggacttaacctca-cacctatttt-----ct 24709344  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnnc--aaacatcatgggtatg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| || | ||||||||||||| ||||          ||||||||    ||||    
T  24709343 ttagcataatcatgcatacatgcactcattcataaataatt-tttccatccaata-ttgaaggacttagtcaagtttttgttgtaaacatcacatatatg 24709246  T
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     | |  |||||||| |||||||||   |||    
T  24709245 ggccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactaagctttagcttttgttaagaatttcttccttggcttcgttcttgttttt 24709147  T
Q  311 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtc 397  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  24709146 tgaaaagggaaccgattgcaatatctttacaattttc-aattaaaaccatgttcctctgcaatgtctacaatttactttgaaaagtc 24709061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25857200 - 25857102
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  25857200 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 25857102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22160856 - 22160721
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||||     
T  22160856 tatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttatgaattttttccttggtttcgttctta- 22160765  T
Q  307 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22160764 cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 22160721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 350
Target Start/End: Original strand, 20741148 - 20741251
Alignment:
Q  253 aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||    
T  20741148 aaaaatcttaactaagctttagcttttgtttagaacttttatccttggtttcgttcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaatttt 20741247  T
Q  347 caaa 350  Q
    ||||    
T  20741248 caaa 20741251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 455
Target Start/End: Original strand, 32002307 - 32002348
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcata 455  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32002307 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcata 32002348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25856805 - 25856759
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25856805 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 25856759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25856930 - 25856869
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttca 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  25856930 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttca 25856869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Original strand, 41000421 - 41001098
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41000421 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 41000520  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  41000521 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 41000618  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttca-aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  41000619 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcataaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 41000718  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 402  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41000719 ttaacttttgaaaaag-aacctattccaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 41000816  T
Q  403 nnnnnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 499  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41000817 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 41000916  T
Q  500 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 599  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000917 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 41001016  T
Q  600 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41001017 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 41001098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Original strand, 41009203 - 41009880
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41009203 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 41009302  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  41009303 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 41009400  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttca-aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  41009401 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcataaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 41009500  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 402  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41009501 ttaacttttgaaaaag-aacctattccaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 41009598  T
Q  403 nnnnnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 499  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41009599 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 41009698  T
Q  500 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 599  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41009699 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 41009798  T
Q  600 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41009799 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 41009880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 8203499 - 8202817
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  8203499 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatgtactc 8203400  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnn-caaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||        ||||||| ||    
T  8203399 tatgtactttagcataatcatgcatacatgcattcattcacaaacaactttctccatcaaaaa-ttgaaggacttacacaagtttttttgcaaacattat 8203301  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttc 302  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||| ||||||||||||| |||    
T  8203300 ggatatggaccgtgtaagaatgaacatcaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgattaagaactttttccttggtttcattc 8203201  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttc 401  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||| || || | |||| ||| ||||||    
T  8203200 ttaccttttgaaaaaagaacctattgcaatatctttacaatttt-aaaatgaatccatgttcctttaaaatgtttataaattaagtttggtaaatccttc 8203102  T
Q  402 nnnnnnnnnnnnct-----atttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaa 496  Q
                 |     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8203101 gataaaaaaaaaattgtacatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtgtctcatattttgtttccatcagcaaaa 8203002  T
Q  497 ggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaaga 596  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  8203001 ggtcaatacgtcagtaaagtggttcgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagtcactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgatttgagcaaga 8202902  T
Q  597 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8202901 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactttgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 8202817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 25265673 - 25266342
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  25265673 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttaccattgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 25265771  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaa---aaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  25265772 tatccactt-agcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccataaataaaaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatc 25265869  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtttcg 299  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||  ||      |||  |||||||||||||    
T  25265870 acggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaatt-ttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcg 25265968  T
Q  300 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  25265969 ttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatattcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtcc 25266067  T
Q  399 ttcnnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaag 497  Q
    |||            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  |||||    
T  25266068 ttcaaaaaaat----ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaag 25266162  T
Q  498 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 597  Q
    |||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25266163 gtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagag 25266262  T
Q  598 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25266263 gtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 25266342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 82 - 665
Target Start/End: Original strand, 17928027 - 17928609
Alignment:
Q  82 attgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaagga 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17928027 attgtgaacttaacctcatcatgtattctatgtactttaacataactaggaatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaac-ttgaagga 17928125  T
Q  182 cttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt 281  Q
     ||||||||        ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  17928126 tttagacaaattttttgcaaacatcacggttatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatagaacttcaaaaa-tcttaattaagctttcgctttcgt 17928224  T
Q  282 -----actcttt--ccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatg 374  Q
         ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||    
T  17928225 taagtactttttttccttggtttcgttcttaccttgtgaaaaggaaacatattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatg 17928323  T
Q  375 tttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctc 473  Q
    |||||      ||||||||||||||||               ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  17928324 tttac------ctttgataagtccttcaaaaaaaaaaattcctttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctc 17928417  T
Q  474 atattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaatagga 573  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  17928418 atattttgtttctacctacaaaaggtcaatccgtcagtaaagtggttcgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgtaaacacaa 17928517  T
Q  574 aaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 665  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17928518 aagatggatcaacttgagcaagaagtccaggaacttcgtggagaggtaataacacttcgggttgaggtagagaagttaactagccttgtatc 17928609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 37 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10720658 - 10719996
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10720658 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattctatccactt-agcataaccatgcata 10720560  T
Q  136 catgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt-------gaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||    
T  10720559 catgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaatttttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcacggatatggaccttgtaagaa 10720461  T
Q  229 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaa 321  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10720460 tgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaa 10720362  T
Q  322 ccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnn------- 413  Q
    ||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||                       
T  10720361 cctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 10720263  T
Q  414 ---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatca 509  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| |    
T  10720262 aatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcatta 10720164  T
Q  510 gtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagctt 609  Q
    ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10720163 gtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagctt 10720064  T
Q  610 cgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10720063 cgtggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 10719996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9552993 - 9552601
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  9552993 agaacctttgttacaagtacatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatatattc 9552895  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||      
T  9552894 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcataaaaaactttttccatca-aaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcaaa 9552797  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-atcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||| |||||    
T  9552796 ggtatggaacttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaatatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttagttct 9552697  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    || ||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9552696 taacttttgaaaaa-gaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaactatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 9552601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15683093 - 15682786
Alignment:
Q  9 gcagaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15683093 gcagaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtatt 15682996  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-nnnnnnncaaacatca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||||||    
T  15682995 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaactactttttccatca-aaaattgaaggacttacacaagtttttttgcaaacatca 15682897  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| |||||||||||| | |    
T  15682896 tgggtatggaccttgtaaggatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttttgat 15682797  T
Q  302 cttaccttttg 312  Q
    |||||||||||    
T  15682796 cttaccttttg 15682786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 14420436 - 14420777
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14420436 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtcattaccaaatggcgttgttacctttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgtattct 14420534  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||        |||||||| ||    
T  14420535 atgtactttagcatcaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc-aaaaattgaaggatttgtacaagtttttgt-aaacatcacgg 14420632  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttctt 304  Q
     ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     || | |||||||||||||||||||    
T  14420633 atatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctt 14420731  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || ||||||||| ||||||  | ||||| |||| ||||| ||||||    
T  14420732 actttttgaaaagggaaccaatagcaacatcttcacaattttcaaa 14420777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3243272 - 3242630
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcat--catgtattctatgtac 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||| |||| | ||| |||| |||   ||||| |||||||| |    
T  3243272 tgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccatgtggcgtgtttacccttgactccatcattatagacctaacttcacaccatgttttctatgttc 3243174  T
Q  117 tttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||        | ||||| |||| |||| |||||| |  | ||||||||||||||||        ||||||||  ||||||    
T  3243173 tttagcataatcatgcatagat--------tgataaataactttttctcatcaata--tcgaaggacttagacaagttttttgtaaacatcaaaggtatg 3243084  T
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||     |||  |||||||| ||| ||||| | |||    
T  3243083 aaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaactaagcttttgcttttgttaagaacttcttccttggcttctttcttgc-ttt 3242986  T
Q  311 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnn 410  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| | || |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||| |||||             
T  3242985 tgaaaatggaaccgattgcaatatctttacaattttcaaa-taaaaccatgttcctatgcaatgtttacaattaactttaacaagcccttcaaaaaaaat 3242887  T
Q  411 nnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttg-cattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatca 509  Q
       | |||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||| | | ||| | | | |  ||||||| |||||||||    
T  3242886 tgtccatttttgcataaacatatcatgcatcgttttttcattcatagtttctagtccgtgtctcacactgtgtcttttcaat-aaaaggttaatccatca 3242788  T
Q  510 gtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagctt 609  Q
    ||||||| ||   |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  3242787 gtaaagtggtctgatgtcctcatccaaattcggctcgcacatgcaaactctcgtgcaaatacaaaaaatggatcagcttgaacaagaggtccacgagctt 3242688  T
Q  610 cgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 667  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3242687 cgcgaagaggtgacaacacttcgggccgagttagagaagttaactaaactagtatctt 3242630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 431 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15682694 - 15682448
Alignment:
Q  431 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  |||||||| |||||| |||||||| ||   ||||||     
T  15682694 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaaggtccatccattagtaaagtggtcagatgtctt 15682596  T
Q  530 catccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacact 629  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15682595 catccaagttcggctcacacatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacact 15682496  T
Q  630 tcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15682495 tagggctgaagtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 15682448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 342
Target Start/End: Original strand, 8608327 - 8608652
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||    
T  8608327 atacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaattggcgttgttacccttaagctccaacattatggacttaatctcaccatgcattccatgttcttt 8608425  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| ||         ||||||||  | ||| | |    
T  8608426 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttcctcactaatatcgaaggacttagataa-attcttgtaaacatcaaagatattgtc 8608523  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8608524 cttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcattctta-cttttg 8608622  T
Q  313 aaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  8608623 aaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 8608652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 15697794 - 15697936
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697794 agaacccgtgatacaggtatatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 15697892  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15697893 tatgtactttagcataatcatccatacatgcattcatgcataaa 15697936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 12557195 - 12557336
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  12557195 agaaccagtgataaaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcattgttacccttggctccaacattggggacttaacctcaccatgcattcc 12557293  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12557294 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 12557336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30093798 - 30093459
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30093798 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 30093700  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 205  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||| | |||  || ||||||||||||||| |||        ||||||    
T  30093699 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgataaaaacttttttc-tcactaatattgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 30093602  T
Q  206 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctt-tccttggtttc 298  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| || |||||||||||    
T  30093601 caaagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttcttaagaacttttatccttggtttc 30093503  T
Q  299 gttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  30093502 gttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 30093459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 331
Target Start/End: Original strand, 11183583 - 11183903
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  11183583 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcattgttatccttaagctccaacattatggacttaatctcaccatgcattc 11183681  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  11183682 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcat-aacacctttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 11183777  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  11183778 agatatggtccttgcaagaaggaacactaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 11183876  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaa 331  Q
    || |||||||| | | |||| |||||||    
T  11183877 ta-cttttgaagaggtaaccatttgcaa 11183903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14885754 - 14885413
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  14885754 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacattaccatgcattc 14885656  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  14885655 catgttctttagcataatcatgcatacattctttcattcataaaaacttttttctctcactaatatcgaaggacttagataaggttcttgtaaacatcaa 14885556  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  14885555 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatgcaatttc-aaaaatcttaactaag-tttatcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 14885458  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaa 349  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||    
T  14885457 tactttttg-aaaaggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaa 14885413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14891000 - 14890876
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  14891000 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgatgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatc 14890901  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14890900 atgcatacatgcattcattcataaa 14890876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18881408 - 18881266
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  18881408 agaacccgtgatgcaggtacattttgaa-ccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaccttaccatgtattc 18881310  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  18881309 tatgtactttagcataatcatacacacatgcatccatccataaa 18881266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12477456 - 12477128
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||    
T  12477456 atacaggtacaaat-gaagcgatagtccttaccaaatggcggtgttaccctttgcctccaacattttggacttaacctcaccatgcatttcatgttcttt 12477358  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  12477357 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtc 12477261  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc----gtactctttccttggtttcgttcttaccttttgaa 314  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12477260 cttgtaagaaggaacaccaaaaaataaaacttc--aaaatcttaactaagctttagctttcttaagaactttttccttggtctcgttctta-cttttgaa 12477164  T
Q  315 aaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || ||||||  ||||| | |||| ||||| ||||||    
T  12477163 aagggaaccaattgcagcatcttcacaattttcaaa 12477128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7095946 - 7095802
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  7095946 agaacccgtgatgcaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 7095848  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 155  Q
    |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7095847 tatgtaattgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 7095802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 460
Target Start/End: Original strand, 15622593 - 15623041
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| || || |||    
T  15622593 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccgacattgtggacctaacatcaccacgttttc 15622691  T
Q  110 tatg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
       | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||    
T  15622692 accgtttgtgtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatca 15622787  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
      | || || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||    
T  15622788 aagatagggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaact-tttccttggtttcgttc 15622885  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc- 401  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15622886 tta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttca 15622981  T
Q  402 -nnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15622982 aaaaaaaatgtgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 15623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23286071 - 23285736
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  23286071 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaaccttaccatgcattc 23285973  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  23285972 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcgtaaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 23285875  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||     | | ||||||||||||| ||||    
T  23285874 agatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagttttagcttttgtaaagaattttttccttggtttcattct 23285782  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  23285781 ta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 23285736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 642
Target Start/End: Original strand, 27881584 - 27881810
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaa 514  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||    
T  27881584 tatttttacataagcatttcatgcatcatgt-gcattcatagtttctagtccgtatctcatactctgtttctgtctacaaaagtccaatccgtcagtaaa 27881682  T
Q  515 gtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtgg 614  Q
    || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || ||||  ||||| |||||  |||  ||||||||| |    
T  27881683 gtggtctgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtacaaacacaaaagattgatcagcttgaacaagaattccttgagcttcgtag 27881782  T
Q  615 agaggtaacaacacttcgggctgaggta 642  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27881783 agaggcaacaacacttcgggctgaggta 27881810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 460
Target Start/End: Original strand, 70314 - 70729
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||            ||||| |    
T  70314 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgatgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------------cataaac 70401  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |||| |||||    
T  70402 atgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcacaaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttataaga 70498  T
Q  228 atgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaac 322  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  70499 aggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaaccaagctttagcttttgttaagaact-tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaac 70595  T
Q  323 cgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnctatttttg 422  Q
    |  ||||||| | || ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||| | ||||||| |||||||||            |||||||||    
T  70596 caattgcaacattttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaa-tgactttgacaagtccttc-aaaaaatgtgtctatttttg 70691  T
Q  423 cataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  70692 cataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 70729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 8806485 - 8806741
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  8806485 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 8806583  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  8806584 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaaaacttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaaagatatggtc 8806682  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
     ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8806683 tttgtaagaaggaacatcaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttttgcttt 8806741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 15912056 - 15912220
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacct--catcatgtattctatgtact 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |    
T  15912056 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttattacccttaagctccaacattgtggacttaacctcacaccatgttttctatgtttt 15912154  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggactta 185  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  15912155 ttagcataatcatgcatacat-cattcattcataa--aactttttctcatcaaaatatcgaaggactta 15912220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 21609933 - 21610065
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  21609933 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 21610031  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21610032 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 21610065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18960683 - 18960552
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||         |    
T  18960683 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaactccaaca-tgtggacttaacctcat---------t 18960595  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18960594 atgtattttagcataatcatgcatgcatgcatccattcataaa 18960552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 9552558 - 9552489
Alignment:
Q  612 tggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9552558 tggagaggtaacaacacttcggactgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 9552489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13109714 - 13109591
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13109714 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 13109616  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcat 134  Q
     |||| | ||||||||| |||||||    
T  13109615 catgttccttagcataatcatgcat 13109591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15599688 - 15599553
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |      | ||||||| |||| ||||     
T  15599688 agaacccgtgatacaggtaca-tctgaaaccgtagtccttaccaaatgacgtctttacccttgactccaacact------taaacctcaccatgcattcc 15599596  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15599595 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 15599553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 6196558 - 6196889
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||| |||           
T  6196558 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttactctaagctccaacattgtggacctaacctcaccat------- 6196649  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac--------tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 202  Q
              |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||        | ||| |||||||| || |||||||||||| |||        |||    
T  6196650 ----------gcatgatcatgcatacatgcattcatccataaaaaacttttttttttttttcatcaaaatatcgaaggacttagataagttttcgt-aaa 6196738  T
Q  203 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 297  Q
    |||||  | || || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||    
T  6196739 catcaaagatacggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggttt 6196837  T
Q  298 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6196838 cgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 6196889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 8618616 - 8618708
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8618616 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 8618708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15535158 - 15535066
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15535158 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 15535066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 46398605 - 46398513
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46398605 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 46398513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 655
Target Start/End: Original strand, 3679627 - 3679759
Alignment:
Q  523 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 621  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3679627 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccacgagcttcgtgaagaagta 3679725  T
Q  622 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 655  Q
    ||   ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  3679726 actgtacttcgggccggggtagagaagttaacta 3679759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 655
Target Start/End: Original strand, 30016197 - 30016329
Alignment:
Q  523 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 621  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  30016197 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccatgagcttcgtgaagaagta 30016295  T
Q  622 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 655  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30016296 actgtacttcgggccgaggtagagaagttaacta 30016329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 17919962 - 17920016
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacatt 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17919962 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggtgttgttacccttgactccaacatt 17920016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6970295 - 6970197
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||| ||||    
T  6970295 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaataacattg-tacccttgactccaaccttatggattcaacctcaccatgttttct 6970198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 33568206 - 33568341
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||||     
T  33568206 tatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctta- 33568297  T
Q  307 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  33568298 cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 33568341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Original strand, 21610113 - 21610250
Alignment:
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac--tctttcctt 292  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||     ||  | |||||||    
T  21610113 aaacatcaaagatatggatcttgtaagaaggaacaccaagaaatacaaactc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttcctt 21610211  T
Q  293 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaac 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  21610212 ggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaac 21610250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 401
Target Start/End: Original strand, 27881251 - 27881564
Alignment:
Q  93 aacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag- 191  Q
    ||||||||||| | ||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||     
T  27881251 aacctcatcatattttctat---ctttagcataatcatgcacacatgcattcaatcatgaatatttttttccatc-aaatattgaaggacttagccaagt 27881346  T
Q  192 nnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacacc--aagagatacaacttcaaaaa-atcttaactaagctttagctttcgt-----ac 283  Q
            ||||||||  || || |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||     ||    
T  27881347 ttttttgtaaacatcaaaggaatagaccttgtaagaatgaacaccaaaagacatataacttcaaaaacatcttgaccaagcttttgcttttgttgagaac 27881446  T
Q  284 tctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttaca-atgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaat 382  Q
    |  | | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||  || ||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  27881447 ttctccattggtttcattcttaccttttgaaaatagaaccgatcgcaatatccttacagattttc-aaatgaaaccatgttcatctacgatgcttactat 27881545  T
Q  383 tcactttgataagtccttc 401  Q
    || |||||| || ||||||    
T  27881546 tcgctttgacaaatccttc 27881564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 30014230 - 30014309
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  30014230 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 30014309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 41433823 - 41433968
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggactt--aacctcatcatgtat 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  41433823 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttt 41433921  T
Q  108 tc----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||    | |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41433922 tcaccatttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcatccataaa 41433968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12477066 - 12477020
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12477066 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 12477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 14885349 - 14885303
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14885349 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 14885303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 3677659 - 3677738
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3677659 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 3677738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 4436511 - 4436547
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 66  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4436511 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgtt 4436547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 20436660 - 20436739
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  20436660 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 20436739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26384192 - 26384076
Alignment:
Q  492 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 591  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  ||| |||  | |||| ||||  ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||     
T  26384192 caaagggtcaatccattagtaaagtggtccaatgtcttcactcaaattcaacccgcacatgcgaacactcgtgcaaacacaaagaatggatcaacttgaa 26384093  T
Q  592 caagaggtccacgagct 608  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26384092 caagaggtccacaagct 26384076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 46373802 - 46373849
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46373802 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 46373849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14396353 - 14396298
Alignment:
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaa 255  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14396353 aaacatcagaggtatggaccttgtaaaaaggaacaccgagaaatacaacttcaaaa 14396298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24215438 - 24215391
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24215438 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 24215391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 8806886 - 8806932
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8806886 ctatttttgcataagcatgacatgcatcattttgcattcataatttc 8806932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Original strand, 8618870 - 8618929
Alignment:
Q  282 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8618870 actttttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 8618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Original strand, 14420843 - 14420888
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14420843 tatttttgcataagcatagcatgcatcatttttcattcataatttc 14420888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Original strand, 20438484 - 20438521
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20438484 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 20438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23285671 - 23285626
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23285671 tatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 23285626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Original strand, 41435649 - 41435686
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41435649 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 41435686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 5143737 - 5143701
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 66  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5143737 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgtt 5143701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5957565 - 5957518
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5957565 agaacccgtaatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 5957518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11932221 - 11932154
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  11932221 aaaccttagtccttaccaaatggcgttattaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcatcatg 11932154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26384562 - 26384530
Alignment:
Q  121 gcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26384562 gcataaccatgcatacatgcatacattcataaa 26384530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46398341 - 46398287
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  46398341 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaa 46398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Original strand, 31542081 - 31542758
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  31542081 agaacctgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 31542180  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  31542181 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 31542278  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa-tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  31542279 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 31542378  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 402  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31542379 ttaacttttgaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 31542476  T
Q  403 nnnnnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 499  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  31542477 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 31542576  T
Q  500 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 599  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542577 caatccatcaataaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 31542676  T
Q  600 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31542677 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggatgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 31542758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 2387295 - 2387963
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  2387295 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttggctccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 2387393  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||        |||||||| |    
T  2387394 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaatttttccatcaaaaa-ttgaagagcttaaacaagttttttgtaaacatcacg 2387492  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2387493 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaa-atcttaactaagcttaagcttttgtactctttccttggtttcgttcttagctt 2387591  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttta-caattcactttgataagtccttc----nnn 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||           
T  2387592 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgttcctctacaatgtttagaaattaacttcgataagtccttcaaaaata 2387691  T
Q  405 nnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaat 503  Q
              ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  || ||| ||||  || |||||||| |||    
T  2387692 aaaatttatatatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtcttaccttgtgtcttct--catcaaaaggttaat 2387789  T
Q  504 ccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 603  Q
    || |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2387790 ccgtcagtaaagtggttcgatgtctttatccaagttcggctcgcatatacagacactcatgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 2387889  T
Q  604 gagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2387890 gcgcttcgtggagaggtaacaacgcttcgggccaaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 2387963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 677
Target Start/End: Original strand, 13470882 - 13471530
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  13470882 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttatccttgactccaacattgtggaacgtaccctcaccatatattctatgtactttggtctaacc 13470981  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||    
T  13470982 atgcatacatgcattcattcataaacaactttttccat-aaaaaattgaaggacttagacaagttttttgtaaacatcacggatatggaccttgtaagaa 13471080  T
Q  229 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaac 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       | |||||||||| |||  ||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13471081 tgaacaccaagagatacaactgcaaa-------atctaagctttaacttctgttaaagaacttcttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaac 13471173  T
Q  323 cgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt---cnnnnnnnnnnnnctatt 418  Q
    |  ||| |||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||                |||||    
T  13471174 ctattgtcaatatctttacaattttc-aaatgaaaccatgttccgctgccatgtttacatttcactttgacaagtccttaaaaaaaaaaaaatgtctatt 13471272  T
Q  419 tttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtc 517  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |   ||| ||||    | ||| ||||||| | ||||| ||||     
T  13471273 tttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtcagtgtctcacaccgtgtcttct--ttgtaaatggtcaattcgtcagtcaagtg 13471370  T
Q  518 gttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 617  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13471371 gtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgtagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgttgaga 13471470  T
Q  618 ggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13471471 tttaacaacactttgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 13471530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Original strand, 31554281 - 31554592
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  31554281 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 31554379  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  31554380 tatccac-ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaactaccttttccatcaaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 31554477  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 297  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| ||||||||||||    
T  31554478 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttt 31554577  T
Q  298 cgttcttaccttttg 312  Q
     | ||||||||||||    
T  31554578 tgatcttaccttttg 31554592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 432 - 677
Target Start/End: Original strand, 31554693 - 31554938
Alignment:
Q  432 atcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctcc 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |    
T  31554693 atcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttc 31554791  T
Q  531 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactt 630  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31554792 atccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacactt 31554891  T
Q  631 cgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31554892 agggctgaggtagagaatttaactagccttgtatcttcattgatggc 31554938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 13452956 - 13453098
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  13452956 agaacctgtgatgcaggtaca-tttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 13453054  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13453055 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 13453098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Original strand, 22430075 - 22430404
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||    
T  22430075 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaaggacgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccattttcttt 22430173  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  22430174 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttattgt-aaacatcaaagatatggtc 22430271  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc----gtactctttccttggtttcgttcttaccttttgaa 314  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22430272 cttgtaagaaggaacaccaaaatatacaacttc--aaaatcttaactaagctttagctttcttaagaactttttccttgatttcgttctt-gcttttgaa 22430368  T
Q  315 aaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22430369 aagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 22430404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 401
Target Start/End: Original strand, 1957985 - 1958356
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||| |    
T  1957985 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgctgttactcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatacattccatgttctttagcataatc 1958084  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | || |||||||||||||    
T  1958085 atgcatacatgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatacggaccttgtaaga 1958180  T
Q  228 atgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagga 320  Q
    | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1958181 aagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggga 1958278  T
Q  321 accgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    |||  ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1958279 accaattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttccttttcaa-gtttacaatt-actttgacaagtccttc 1958356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14818202 - 14817945
Alignment:
Q  9 gcagaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 108  Q
    ||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  14818202 gcagaacccttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttggctccaactttgtggacttaacctcaccatgcatt 14818103  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    | |||| |||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||| || |  || || |||||| ||||| |||        ||||||||     
T  14818102 ccatgttctttagcataa--------tcatgcattcattcataaa-aacttttttcacc--aatatcgaaggatttagataagttcttgt-aaacatcaa 14818015  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14818014 agatatggaccttgtaagaagaaacaccaagaaatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 14817945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2341610 - 2341525
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2341610 gtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatg 2341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 19370984 - 19371081
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  19370984 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataa 19371081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6203100 - 6202787
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| | ||| |||    
T  6203100 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtcccgaccaaatggcgttgttacccttaagctccgacattgtggacctaacatcaccgtgttttc 6203002  T
Q  110 tatg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
       | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || ||| |||||||| |||        ||||||||    
T  6203001 accgtttgtgtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaatgacttagataagttcttgt-aaacatca 6202906  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
      | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||    
T  6202905 aagatatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcataactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttc 6202807  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  6202806 tta-cttttgaaaagggaacc 6202787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 19371138 - 19371260
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 306  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||     ||| |||||||| |||||||||||     
T  19371138 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttgttaagaactttttccttgatttcgttcttat 19371236  T
Q  307 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaa 331  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  19371237 c-tttgaagaaggaaccgtttgcaa 19371260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 460
Target Start/End: Original strand, 35071822 - 35072165
Alignment:
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaa-attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||      
T  35071822 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaa 35071919  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 304  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||     | | |||||||||||||||||||    
T  35071920 gatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagttttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctt 35072012  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnn 404  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||| |||||| | || | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||        
T  35072013 ac-ttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttctcaattttcaaa-taaaacaatgttccttatcaa-gtttacaatt-actttgacaagtccttaaaa 35072108  T
Q  405 nnnnnnnnn-ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35072109 aaaaaagtgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 35072165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 27168225 - 27168373
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac--ttaacctcatcatgtatt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || ||| |  | ||||||| ||||| ||    
T  27168225 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtt-atacccttgactccatcgttatgggccttaaacctcaccatgtttt 27168322  T
Q  109 c----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaact 158  Q
    |    | |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27168323 caccgtttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaataact 27168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 6202697 - 6202651
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6202697 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 6202651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2341427 - 2341361
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2341427 tatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttt 2341361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 14817809 - 14817763
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14817809 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 14817763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 22473489 - 22473543
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 83  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22473489 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 22473543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5635766 - 5635719
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5635766 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 5635719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 22430466 - 22430512
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22430466 ctatttttgcataagcataccatgcatcattttgtattcataatttc 22430512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Original strand, 19371337 - 19371374
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19371337 ctatttttgcataagcatatcatgcaccattttgcatt 19371374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24963236 - 24962560
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||    
T  24963236 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacatcgtgaaacttaaccttaccatgtattc 24963137  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  24963136 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 24963039  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa-tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  24963038 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 24962939  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 402  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24962938 ttaacttttgaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 24962841  T
Q  403 nnnnnnnnnnn-ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtc 500  Q
                |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  24962840 aaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggtc 24962741  T
Q  501 aatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtc 600  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24962740 aatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtc 24962641  T
Q  601 cacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24962640 cacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 24962560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 21994291 - 21993638
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21994291 agaacccgtgacaccggtacaatttgaaaccatagtctttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggacttaacctcatcatgtattc 21994192  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  21994191 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcatcca-------acaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagtcaagtttttgt-aaacatcatg 21994101  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21994100 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 21994002  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||            
T  21994001 ttgaaaaaggaaccgtttgcgacgtctttacaatattcaaaatgaaaccatattc--gtactgtgtttacatttcgctttgataagtccttcaaaaaaat 21993904  T
Q  410 nnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatc 508  Q
         | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||    
T  21993903 tattatcttttt-cataagcatatcatgcatcattttgtattcatagtttctagtccgtgtcttacattgtgtcttct-cca-taaaaggtcaatccgtc 21993807  T
Q  509 agtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagct 608  Q
    ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  21993806 agtcaagtggttagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaagtccaggatct 21993707  T
Q  609 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21993706 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaaattaactagccttgtatcttcattgatggc 21993638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 20378632 - 20379025
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20378632 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccgaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 20378729  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac-tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  20378730 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttccatc-aaaaattgaaggacttagacaagttttttgcaaacatcatg 20378828  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| ||||||||| |||    
T  20378829 ggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcgatct 20378928  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 401  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  20378929 tacctttcgaaaaa-gaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 20379025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 444 - 677
Target Start/End: Original strand, 28846480 - 28846712
Alignment:
Q  444 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28846480 tttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggc 28846578  T
Q  544 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28846579 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 28846678  T
Q  644 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28846679 agaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 28846712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 28846073 - 28846460
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  28846073 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtagaacttaacctcctcatgtattc 28846171  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
     ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  28846172 aatgaactttagtataaacatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 28846270  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28846271 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaa-atcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 28846369  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 401  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  28846370 ttgaaaaagg-accttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 28846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 252 - 677
Target Start/End: Original strand, 23638462 - 23638889
Alignment:
Q  252 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||  |||| ||||| ||    
T  23638462 aaaaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaatttt 23638560  T
Q  347 caaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnctat-ttttgcataagcctatcatgcatcat- 443  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||             ||  ||||||||||    ||||||||||||     
T  23638561 caaa-tgaaaccatgtttatctacaatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaaaattgtacattttgcataa----atcatgcatcatc 23638655  T
Q  444 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 543  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  23638656 tttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattctgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggc 23638755  T
Q  544 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23638756 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtag 23638855  T
Q  644 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23638856 agaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 23638889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 252 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23834427 - 23833998
Alignment:
Q  252 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||  |||| ||||| ||    
T  23834427 aaaaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaatttt 23834329  T
Q  347 caaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnnctat---ttttgcataagcctatcatgcatca 442  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||             | |   ||||||||||    |||||||||||    
T  23834328 caaa-tgaaaccatgtttatctacaatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaaaaaattgtacattttgcataa----atcatgcatca 23834234  T
Q  443 t-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcg 541  Q
    | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  23834233 tctttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattctgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcg 23834134  T
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23834133 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggt 23834034  T
Q  642 agtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23834033 agagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 23833998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21866389 - 21866131
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  21866389 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggcttcaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 21866291  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||        ||| |||| |    
T  21866290 tatgttctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatcagg 21866194  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt 272  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21866193 gatatggatcttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttaaaaaaatcttaactaagcttt 21866131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12178616 - 12178351
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatatttt-gtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagt 511  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12178616 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccatgtctcatatttttgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagt 12178517  T
Q  512 aaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcg 611  Q
    ||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12178516 aaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcg 12178417  T
Q  612 tggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12178416 tggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 12178351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27231688 - 27231425
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27231688 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccatcaaaaggtcgatccattagta 27231590  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  27231589 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgt 27231490  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27231489 ggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27231425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12179047 - 12178647
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  12179047 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 12178949  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  12178948 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 12178851  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  12178850 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 12178752  T
Q  297 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  12178751 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 12178653  T
Q  396 tccttc 401  Q
    ||||||    
T  12178652 tccttc 12178647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33843311 - 33842911
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  33843311 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 33843213  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  33843212 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaactttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 33843115  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  33843114 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 33843016  T
Q  297 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  33843015 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 33842917  T
Q  396 tccttc 401  Q
    ||||||    
T  33842916 tccttc 33842911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26087816 - 26087416
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  26087816 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 26087718  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  26087717 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 26087620  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  26087619 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 26087521  T
Q  297 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 395  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  26087520 tcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 26087422  T
Q  396 tccttc 401  Q
    ||||||    
T  26087421 tccttc 26087416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11811901 - 11811500
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  11811901 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 11811803  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 202  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||||        |||    
T  11811802 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaa 11811705  T
Q  203 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggt 295  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  |||||||||    
T  11811704 catcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggt 11811606  T
Q  296 ttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||    
T  11811605 ttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaa 11811507  T
Q  395 gtccttc 401  Q
    |||||||    
T  11811506 gtccttc 11811500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33842884 - 33842621
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  33842884 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 33842786  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33842785 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 33842686  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33842685 ggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 33842621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26087383 - 26087120
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  26087383 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 26087285  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26087284 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 26087185  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26087184 ggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 26087120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11811460 - 11811197
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  11811460 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 11811362  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11811361 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcatatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 11811262  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11811261 ggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 11811197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 22957078 - 22956632
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  22957078 agaacctgtgatacaggtaca-tttgaaacaatagtccttaccaaatggcgtctttacccttgactccaactttgtggacttaacctcaccatgcattcc 22956980  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||  || || |||| ||||||| |||        ||||||||      
T  22956979 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcgttcagaaa-aacttttttc-tcactaatatcgaagcacttagataagttcttgt-aaacatcaaa 22956883  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 304  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  22956882 gatatggaccttctaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt 22956784  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnn 404  Q
    |||  ||| ||| ||||||  ||||||| | || ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||       
T  22956783 acc-cttggaaagggaaccaattgcaacattttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttcaag 22956688  T
Q  405 nnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
             |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22956687 aaaatgtgtctatttttgcataagcataacatgcatcattttgtattcataatttc 22956632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 23638203 - 23638439
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 117  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23638203 gtgatacagctaca-tttgagaccgtagtccttaccaaatgacgttgttacctttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgtattctatatact 23638300  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatgga 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||    
T  23638301 ttagactaaccatgcatacatgcattcattcataaacaacgttttctatc-aaaaatggaaggacttagacaag-tttttgcaaacatcgtggatatgga 23638398  T
Q  218 ccttgtaagaatgaacacc-aagagatacaacttcaaaaaa 257  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23638399 ccttacaagaatgaacaccaaagagatccaacttcaaaaaa 23638439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23834687 - 23834451
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 117  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23834687 gtgatacagctaca-tttgagaccgtagtccttaccaaatgacgttgttacctttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgtattctatatact 23834590  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatgga 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||    
T  23834589 ttagactaaccatgcatacatgcattcattcataaacaacgttttctatc-aaaaatggaaggacttagacaag-tttttgcaaacatcgtggatatgga 23834492  T
Q  218 ccttgtaagaatgaacacc-aagagatacaacttcaaaaaa 257  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23834491 ccttacaagaatgaacaccaaagagatccaacttcaaaaaa 23834451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27232101 - 27231843
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  27232101 agaacccgtgatacaggtacgtttttaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccatagactccaacattgtggaactcaccctcaccatgtattc 27232002  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaa---attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||        |||||||    
T  27232001 tatccac-ttagcatgaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatc 27231904  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaag 268  Q
    |  | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  27231903 acagatatggatcttgtaagaatgaacatcaagaaatacaacttc-caaaatcttaactaag 27231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 29895244 - 29895576
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga--ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29895244 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttactaaatggcgttgttacccttaaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcatt 29895342  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||    
T  29895343 ccatgttctttagcataatcatgcaaacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatca 29895438  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 302  Q
      | ||||| ||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  29895439 aagatatggtccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttc 29895531  T
Q  303 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttca 348  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29895532 tta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttca 29895576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 460
Target Start/End: Original strand, 25528337 - 25528780
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||     
T  25528337 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctaagctccaactttgtggacctaacctcaccatgcattcc 25528435  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   |  || || |||||||||||| |||        ||||||||  |    
T  25528436 atgttctttagcataaacatgcatacatgcattcattcacaaa-aact-tttctcgc-taatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaag 25528531  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttctta 305  Q
     ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  25528532 atatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgctaagaact-tttccttggtttcattctta 25528629  T
Q  306 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnn 405  Q
     |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | ||||| || ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||        
T  25528630 -cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgtt-ctttatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttcaaaa 25528725  T
Q  406 nnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
            |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25528726 aaatgtggctatttttgcataagcatagcatgcatcatattgcattcataatttc 25528780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20097550 - 20097251
Alignment:
Q  57 tggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aa 152  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |    
T  20097550 tggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgata 20097451  T
Q  153 acaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc 251  Q
    | |||| ||| | |||  || ||||||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20097450 aaaacttttttc-tcactaatattgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatacaacttc 20097353  T
Q  252 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||| ||    
T  20097352 -aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggaaaccaattgcaacatcttcacaatttt 20097255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 36450393 - 36450535
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  36450393 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 36450491  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36450492 catgttccttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 36450535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 398
Target Start/End: Original strand, 26871190 - 26871568
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  26871190 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttatccttcagctccaacattgtggacttaacatcaccatgcattc 26871288  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||  || ||  ||||||||||| |||        ||||||||     
T  26871289 ca--------cgcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-acctttttc--tcaccaatatcaaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 26871376  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||      | ||| ||||||||||||||||||    
T  26871377 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaataaaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttattaagaactttttccttggtttcgttct 26871475  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 398  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||   ||||| ||  ||| || | |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  26871476 tacc-tttgaagagggagccgtttgcaatacctttataaatttc-aactaagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 26871568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7260060 - 7259793
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  7260060 agaacccgtgatacaggtaca-tctgaaaccatagtccctaccaactggcatttttacccttgactccaacattgtggacttaacatcaccatgttttca 7259962  T
Q  111 atgtactt---tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac--tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaaca 204  Q
      ||  ||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||    
T  7259961 ccgt--ttgcgtagcgtaatcatgcatacacgcattcattcataaa-aactttttttctctcattaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaaca 7259866  T
Q  205 tcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7259865 tcaaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagttttaacttt 7259793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 1800288 - 1800380
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1800288 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 1800380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12393535 - 12393443
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12393535 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 12393443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21690733 - 21690825
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21690733 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 21690825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29890334 - 29890230
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  29890334 agaacccgtgatgcaggtacatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttatccttaactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 29890236  T
Q  110 tatgta 115  Q
    | ||||    
T  29890235 tctgta 29890230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 655
Target Start/End: Original strand, 37580755 - 37580887
Alignment:
Q  523 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaa 622  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  37580755 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttggagaagaggtccacgagcttcgtgaagaagtga 37580854  T
Q  623 caacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 655  Q
    | | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37580855 ctatacttcgggccgaggtagagaagttaacta 37580887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 358983 - 358860
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||| |||||| || | |    
T  358983 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaacttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatc 358885  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  358884 atgcatacatgcatccatccataaa 358860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20395746 - 20395672
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgt 86  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20395746 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccgtagtccttaccaaatggcattgttacctttgactccaacattgt 20395672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7259671 - 7259625
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7259671 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 7259625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21865978 - 21865921
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtct 472  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  21865978 tatttttgcgtaagcatatcatgcatcattttgcgttcatagtttctagttcgtgtct 21865921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 350
Target Start/End: Original strand, 36450583 - 36450730
Alignment:
Q  200 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttgg 294  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||    
T  36450583 aaacatcaatgatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttgg 36450675  T
Q  295 tttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36450676 tttcgttctta-cttttgaaatgggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 36450730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 37578782 - 37578825
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgt 62  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37578782 tgatacaggtacaaaatgaaaccatagtccttaccaaatggcgt 37578825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 29895640 - 29895686
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29895640 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 29895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 15791354 - 15791307
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15791354 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 15791307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 36382622 - 36382575
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36382622 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 36382575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 37007294 - 37007247
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37007294 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 37007247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 343
Target Start/End: Original strand, 7789240 - 7789295
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7789240 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 7789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12393280 - 12393225
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  12393280 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 12393225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 323
Target Start/End: Original strand, 21690984 - 21691024
Alignment:
Q  282 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21690984 actttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 21691024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Original strand, 34464032 - 34464069
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34464032 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 34464069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3490987 - 3490920
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  3490987 aaaccttagtccttaccaaatggcgttattaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcatcatg 3490920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5446844 - 5446797
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  5446844 agaacccgtgatacaggtacaaata-aaaccatagtccttaccaaatgg 5446797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 7788983 - 7789030
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  7788983 agaacccgtgatacaggtacaaata-aaaccatagtccttaccaaatgg 7789030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11951057 - 11951010
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  11951057 agaacccgtgatacaggtacaaata-aaaccatagtccttaccaaatgg 11951010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Original strand, 21691131 - 21691167
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattca 453  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21691131 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattca 21691167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 31513825 - 31513872
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31513825 agaacccgtgatacaggtacaaac-gaaaccatagtccttaccaaatgg 31513872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 34462205 - 34462284
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 90  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| || |||||||    
T  34462205 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcaatgtggac 34462284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 25504426 - 25503768
Alignment:
Q  32 atttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccat 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  25504426 attttaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatatattctatgtactttagcattatcat 25504327  T
Q  131 gcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  25504326 gcatacatgcattcattcataaaaaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcaaaggtatggaccttttaagaatg 25504229  T
Q  231 aacaccaagagatacaacttcaaaaa-atcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  25504228 atcaccaagagatacaacttcaaaaatatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttagttcttaacttttgaaaaag-aacct 25504130  T
Q  325 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnn-----ctattt 419  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||    
T  25504129 attgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcaaattttatttttttatctattt 25504031  T
Q  420 ttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  25504030 ttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgtttctacctacaaagggtcaatccatcagtaaagtgg 25503931  T
Q  519 ttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagag 618  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25503930 tccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccatgagcttcgtggagag 25503831  T
Q  619 gtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25503830 gtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaaccagcctagtatcttcattgatggccaca 25503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 16636282 - 16636956
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16636282 agaacccgtgatacaggtacgtttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 16636380  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt------gaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      ||||||||||||||||        ||||    
T  16636381 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 16636478  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtt 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  ||||||| ||    
T  16636479 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttctgttaaagaacttcttccttgatt 16636577  T
Q  297 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  16636578 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcata-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 16636676  T
Q  396 tccttcnnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaa 494  Q
    ||||||            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||    
T  16636677 tccttcaaaaaaaaat--ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaa 16636773  T
Q  495 aaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaa 594  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| |||||    
T  16636774 aaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttaagcaa 16636873  T
Q  595 gaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16636874 gaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 16636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 28269987 - 28270386
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28269987 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28270084  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-----nnnnnnncaaacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||    
T  28270085 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttgcaaacat 28270184  T
Q  206 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcg 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||||    
T  28270185 catgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcg 28270284  T
Q  300 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtcc 398  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28270285 atcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtcc 28270383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 28348737 - 28349136
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28348737 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28348834  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-----nnnnnnncaaacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||    
T  28348835 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttgcaaacat 28348934  T
Q  206 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcg 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||||    
T  28348935 catgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcg 28349034  T
Q  300 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtcc 398  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28349035 atcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtcc 28349133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 28304954 - 28305355
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28304954 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28305051  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-------nnnnnnncaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||    
T  28305052 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttttgcaaac 28305151  T
Q  204 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||    
T  28305152 atcatgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggttt 28305251  T
Q  298 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagt 396  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  28305252 cgatcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagt 28305350  T
Q  397 ccttc 401  Q
    |||||    
T  28305351 ccttc 28305355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27056773 - 27056372
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  27056773 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 27056675  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 202  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||||        |||    
T  27056674 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaa 27056577  T
Q  203 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggt 295  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  |||||||||    
T  27056576 catcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggt 27056478  T
Q  296 ttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataa 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||    
T  27056477 ttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaa 27056379  T
Q  395 gtccttc 401  Q
    |||||||    
T  27056378 gtccttc 27056372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 535 - 681
Target Start/End: Original strand, 5006783 - 5006929
Alignment:
Q  535 aagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcggg 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5006783 aagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagattcgtggagaggtaacaacacttcggg 5006882  T
Q  635 ctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5006883 ctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 5006929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27056327 - 27056064
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  27056327 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 27056229  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27056228 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 27056129  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27056128 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27056064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 22326025 - 22326361
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22326025 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 22326123  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 205  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||    
T  22326124 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgataaaaacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 22326221  T
Q  206 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgt 300  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||    
T  22326222 catagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgt 22326320  T
Q  301 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  22326321 tctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 22326361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 621270 - 620927
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  621270 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 621172  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  621171 atgttcttcagcataaacatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 621074  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 301  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     ||| |||  |||||||||||    
T  621073 aaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaa-cttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttttggtttcgtt 620975  T
Q  302 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  620974 ctta-cttttgaaaagggaaccaattggaacatcttcacaattttcaaa 620927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 27538305 - 27538448
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27538305 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 27538404  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27538405 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 27538448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27072204 - 27071864
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||    
T  27072204 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaactttgtaggcttaacctcaccatgcattc 27072106  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  27072105 catgttctttagcataatcatgcatacacgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 27072010  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||    
T  27072009 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagatttttttccttggtttcgttct 27071910  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27071909 ta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 27071864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 25700474 - 25700616
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  25700474 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccttagtccttaccaaatggtgttgtcacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 25700572  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25700573 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 25700616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Original strand, 19715822 - 19716143
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  19715822 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtgtttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccacattctttagcataatca 19715921  T
Q  130 tgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  |||  ||    || || |||||||||||| |||        ||||||||  | | ||||||| |||||||     
T  19715922 tgcatacatgcattcatacataagaaaaaattctca--ctaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaaagatgtggacctcgtaagaaa 19716018  T
Q  230 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     || | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19716019 gaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttaggttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaacc 19716116  T
Q  324 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
      || |||| |||| ||||| ||||||    
T  19716117 aattacaacatcttcacaattttcaaa 19716143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18219418 - 18219274
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18219418 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 18219320  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18219319 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 18219274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20056231 - 20056100
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttta 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |    
T  20056231 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttcttca 20056133  T
Q  121 gcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20056132 gcataaacatgcatacatgcattcattcataaa 20056100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 18112836 - 18112955
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||    
T  18112836 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtatttgagcattatcatacata 18112935  T
Q  136 catgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18112936 catgcattcattcataaaca 18112955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20457358 - 20457035
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||| |    
T  20457358 caatttgaaaccatagtgcttaccaaatggcgctgttactcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatacattccatgttctttagcataatc 20457259  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | || ||||||||||||     
T  20457258 atgcatacatgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatacggaccttgtaagg 20457163  T
Q  228 atgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagga 320  Q
    | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20457162 aagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggga 20457065  T
Q  321 accgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20457064 accaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20457035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23981986 - 23981842
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  23981986 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttactcttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 23981888  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23981887 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 23981842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 3694321 - 3694465
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3694321 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 3694419  T
Q  110 tatgtactt--tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    | |||| ||   |  | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3694420 tctgtaattgaaaaaacaatcatgcatacatgcattcatgcataaa 3694465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 27512121 - 27512213
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27512121 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatg 27512213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22777082 - 22777010
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22777082 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacactgtggacttaacctcaccatgcattc 22777010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 27512302 - 27512407
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt----actctttccttggtttcgttcttacc 307  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||||||| |    
T  27512302 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttccttggtttcgttctta-c 27512399  T
Q  308 ttttgaaa 315  Q
    ||||||||    
T  27512400 ttttgaaa 27512407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16823115 - 16823023
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16823115 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggactcaacctcaccatg 16823023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 18911256 - 18911308
Alignment:
Q  32 atttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18911256 atttgaaaccatagtccttacccaatggcgttgttacccttgactccatcatt 18911308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20056028 - 20055967
Alignment:
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20056028 gaccttgttagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagttttagcttt 20055967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28267047 - 28266931
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||| | || || |||||| |||||| || | ||||||||    
T  28267047 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatcatgcata 28266949  T
Q  136 catgcattcattcataaa 153  Q
    |||| || ||| ||||||    
T  28266948 catgtatccatccataaa 28266931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28345796 - 28345680
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||| | || || |||||| |||||| || | ||||||||    
T  28345796 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatcatgcata 28345698  T
Q  136 catgcattcattcataaa 153  Q
    |||| || ||| ||||||    
T  28345697 catgtatccatccataaa 28345680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22776905 - 22776802
Alignment:
Q  243 tacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctt 337  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22776905 tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatctt 22776808  T
Q  338 tacaat 343  Q
     |||||    
T  22776807 cacaat 22776802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 9143047 - 9143000
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9143047 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 9143000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 18946963 - 18946917
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18946963 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 18946917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27071797 - 27071751
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27071797 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 27071751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20045720 - 20045665
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20045720 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 20045665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20045988 - 20045908
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaac 95  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  20045988 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtc----cctaatggcgttgttacccttaagctccgacattgtggacctaac 20045908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Original strand, 27512506 - 27512542
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattca 453  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27512506 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattca 27512542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 74566 - 73906
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  74566 agaacctgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcattgttatatttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgtaatct 74468  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactattt-ccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||       |||||||||||    
T  74467 atattctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttccatcaaaaa-ttgaaggacttggacaagtttttg-caaacatcatg 74370  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 304  Q
    | ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||  |||  | ||||||||||||    
T  74369 gata--gaccttttaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttttttcggtttcgttctt 74273  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnn 404  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  74272 accttttgaaaaaggaacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctttgccatgtttacaattcactttgataagtccttcata 74174  T
Q  405 nnnnnnnnnct------atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaag 497  Q
              |      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  74173 aaaaaaaaaatttgtccatttttgcataagcatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccgtgtctcgtattttgtttctacctacaaaag 74074  T
Q  498 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 597  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  74073 gtcaatccgtcagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagag 73974  T
Q  598 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  73973 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatc 73906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 677
Target Start/End: Original strand, 1849 - 2516
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 1947  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||||| |    
T  1948 atgtactttaccataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttcatcaaaaaattgaaggacttatacatgttttttgcaaacatcatag 2047  T
Q  211 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctta 305  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || | ||     |||||||| ||||||| |||||||    
T  2048 atttggacattgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc--aaaatcttaactaagttttaactgttgttaagaactctttcgttggttttgttctta 2145  T
Q  306 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnn 405  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||         
T  2146 ccttttgaaaaaggaacctattgcaatatctttaaaattttc-aaatgaaaccatgttcctctactgtgtttacatttcactttgacaagtccttaaaaa 2244  T
Q  406 nnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatc 504  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| ||||| ||  ||| ||| ||||    
T  2245 aaaattgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttcta-cataaaagggttaatc 2343  T
Q  505 catcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 604  Q
      |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |    
T  2344 tgtcagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaacggcttgagcaagaagttcatg 2443  T
Q  605 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2444 agcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 12103 - 12491
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12103 agaacccgtaatacaggtacactt-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttattacccttggctccaacattgtggaacttaacctcaccatgtattc 12201  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| | |||    
T  12202 tatgtactttagtataaccatgcatacatgtattcattcataaacatctttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacgttatg 12300  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaa-gctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacct 308  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12301 gatatggaccatgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaaagctttagcttttgtactctttccttggtttcgttcttacct 12399  T
Q  309 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12400 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgactttacaatattcaaaatgaaaccatgttcctctactgtgtttacaattcactttgacaagtcctt 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 498 - 677
Target Start/End: Original strand, 12567 - 12746
Alignment:
Q  498 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 597  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567 gtcaatccatcagtaaagttgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcaaatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgaacaagag 12666  T
Q  598 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12667 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtggagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 12746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 144762 - 144300
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  144762 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatggaacttaccctcaccatgtattc 144664  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactattt---ccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
      | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||        ||| |||    
T  144663 cgttttctttagcataaccatgcatacatgcattcatttataaacaacttttttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatc 144566  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttac 306  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144565 atgcatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaactttaaaaa-tcttaactaagctttagctttagtactctttccttggtttcgttcttac 144467  T
Q  307 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt-cnnnn 405  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||          
T  144466 cttttgaaaaagaaaccgtttgcaacgtctttacaatgtccaaaatgaagccatgttccactacaatgtttacaattcactttgattagtccttgaaaaa 144367  T
Q  406 nnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtct 472  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  144366 atataattctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtct 144300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 131706 - 131477
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  131706 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 131608  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||| |||    
T  131607 tatgttctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttttccat-aaaaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatc 131510  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaag 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  131509 atggatatggaccttgtaagaatgaacaccaag 131477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 6752
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  7217 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggaattaacctcatcatgtattc 7118  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||        |||||||| |    
T  7117 tatgtactttcgcataaccatgcatacatgcattcattcataaacatctttttccatca-aaaattgaaggacttcgacaagttttttgtaaacatcacg 7019  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----------------actctttcctt 292  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||                 |||||||||||    
T  7018 aatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaatcgtaactaagctttagcttttgttaaaaaaaaaaaaaaaaactctttcctt 6920  T
Q  293 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgat 392  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6919 ggtttcgttcttacctttcaaaaagggaaccg-ttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgtccctctacaacgtttacaattcactttgat 6821  T
Q  393 aagtccttcnnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttct 461  Q
    |||||||||            |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6820 aagtccttcaaaaaaaattgtctatttttacataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttct 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 418 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 21529189 - 21528930
Alignment:
Q  418 ttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtc 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  21529189 ttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcatattttgtttccaccaacaaaaggtcaatccatcagtaatgta 21529090  T
Q  518 gttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529089 gttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 21528990  T
Q  618 ggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21528989 ggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 21528930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 444 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8100612 - 8100380
Alignment:
Q  444 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8100612 tttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggc 8100514  T
Q  544 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100513 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 8100414  T
Q  644 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8100413 agaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 8100380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21529586 - 21529217
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21529586 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctcggctccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 21529488  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattc--ataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||| |    
T  21529487 aatgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattcgtatatatatatttttccatc-aaaaattgaaggacttagataagttttttgcaaacatta 21529389  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacc 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||| |||||||||    
T  21529388 tggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagatatacaacttc-aaaaatcttaactaag---------------------attggttttgttcttacc 21529311  T
Q  308 ttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529310 ttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 21529217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8101020 - 8100633
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  8101020 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtagaacttaacctcctcatgtattc 8100922  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
     ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  8100921 aatgaactttagtataaacatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 8100823  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8100822 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 8100724  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 401  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  8100723 ttgaaaaagg-accttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 8100633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26218595 - 26218314
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218595 aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttaccttcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 26218497  T
Q  137 atgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag---nnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaac 233  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218496 atgcattcatccataaactactttttccatca-aaaattgaaggacttacacaagtttttttttgcaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaac 26218398  T
Q  234 accaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  26218397 accaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttttgatcttaccttttg 26218314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 431 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26218224 - 26217977
Alignment:
Q  431 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaagg-tcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtct 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  || ||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||    
T  26218224 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaagagggttaatccgtcagtaaagtggtcagatgtct 26218126  T
Q  529 ccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacac 628  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  26218125 tcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaagtccaggaacttcggggagaggtaacaacac 26218026  T
Q  629 ttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26218025 ttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 26217977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3386471 - 3386336
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||     
T  3386471 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttggctccaacattgtgaacttaacctcaccatgcattcc 3386373  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcatt 147  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3386372 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatt 3386336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14736260 - 14736116
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14736260 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 14736162  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 155  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14736161 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 14736116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1888938 - 1888796
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||     
T  1888938 agaacccgtgatgcaggtacatttt-aaaccataatccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtgaaacttaccctcatcatgtatta 1888840  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1888839 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 1888796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 20556056 - 20556393
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20556056 agaacccgtgatacaagtaca-tttgaaaccgtagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttgacctcaccatgcattc 20556154  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatc---aaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||     || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  20556155 gatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 20556252  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 301  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||    
T  20556253 aaagatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgtt 20556345  T
Q  302 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20556346 ctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20556393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16726133 - 16725868
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||     
T  16726133 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggctccaatatggtggacttaacctcaccatatattcc 16726035  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || ||||||||| || |||        ||||||||      
T  16726034 atatcctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttggataagttcttgt-aaacatcaaa 16725937  T
Q  210 ggtatggaccttgt-aagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    | ||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16725936 gatacagaccttgtaaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttt 16725868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 350
Target Start/End: Original strand, 14883695 - 14884022
Alignment:
Q  18 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtac 116  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||     ||| |||| |||| |    
T  14883695 gtgatacaggtacaact-gaaaccatagttcttactaaatggcgtcgttacccttaagctccaactttgtggacttaacc-----atgcattccatgttc 14883788  T
Q  117 tttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        |||| |||  | ||||    
T  14883789 tttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacctcaaagatatg 14883885  T
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14883886 gtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaatagctttttcc-tggtttcgttctta-cttt 14883982  T
Q  311 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  14883983 tgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 14884022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 492 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 12510477 - 12510293
Alignment:
Q  492 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||||    
T  12510477 caaaaggtcaatccatcagtaaagtggtctaatgtcttctttcaacttcagctagcatatgcaaacacttgtacaaacacaaaagatggattagcttgag 12510378  T
Q  592 caagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 676  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  12510377 caagaggtccacgaggttcgtgaagaggtaacaacacttcgggccgaggtagagaagttaactaatctggtatcttcactgatgg 12510293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15900867 - 15900530
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  15900867 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcgtttttacctttaagctccaacattgtggacttaacctctccatgcattc 15900769  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| |||||| |||| ||||    |||||||| ||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  15900768 catgttctttagtataatcatg----catgcatttattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 15900675  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| |||||| |||||||||||    
T  15900674 agatatggtccttgtaagaaggaacactaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttattaagaactttttcctcggtttcgttct 15900576  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || |||||||||| ||| ||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15900575 ta-cttttgaaaagggagccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 15900530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3842030 - 3841888
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccata-gtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||| ||||    
T  3842030 agaacccgtgatacaggtacaact-gaaaccataagtccctaccaattggcattgttacccttgactccatcattatggacctaacatcaccatgcattc 3841932  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3841931 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 3841888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 9187022 - 9187085
Alignment:
Q  36 gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9187022 gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctca 9187085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 577 - 667
Target Start/End: Original strand, 12511465 - 12511555
Alignment:
Q  577 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12511465 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagagaaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 12511555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 18038434 - 18038526
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18038434 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatg 18038526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 22706146 - 22706238
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22706146 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 22706238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15077447 - 15077321
Alignment:
Q  220 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15077447 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttctttccttggtttcgttctta-cttttga 15077350  T
Q  314 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  15077349 aaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 15077321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 577 - 667
Target Start/End: Original strand, 12511038 - 12511128
Alignment:
Q  577 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12511038 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagataaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 12511128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 18038616 - 18038721
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt----actctttccttggtttcgttcttacc 307  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||||||| |    
T  18038616 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttccttggtttcgttctta-c 18038713  T
Q  308 ttttgaaa 315  Q
    ||||||||    
T  18038714 ttttgaaa 18038721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15079961 - 15079619
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt-- 108  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||      
T  15079961 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcatgtttttccttgactccatcattatagacctaacatcaccatgttttca 15079863  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 207  Q
    | || |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        | ||||||    
T  15079862 ccat-ttgtgtggcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-agacatca 15079766  T
Q  208 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgtt 301  Q
      | |||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||        | ||||||||||||||||    
T  15079765 aagatatggtttttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaatttttttccttggtttcgtt 15079667  T
Q  302 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15079666 ctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 15079619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 401
Target Start/End: Original strand, 3359573 - 3359761
Alignment:
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 310  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  3359573 gaccttgcaagaaagaacgccaagaaatacaacttcaaaa-atcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttcccttgggttcgctcttaccttt 3359671  T
Q  311 t-gaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    | ||||||  ||||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  3359672 tggaaaaaaaaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaacaatgttcttctataatgtttccaa-tcactttgacaaatccttc 3359761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Original strand, 17304043 - 17304144
Alignment:
Q  34 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac-ttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgc 132  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||  ||  | | |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17304043 ttgaaaccatagtcattatcaaatgacgtatttatcttcgactccaacattttggaccttaacctcactatgtattctatgtcctttagcataaccatgc 17304142  T
Q  133 at 134  Q
    ||    
T  17304143 at 17304144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3841828 - 3841764
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3841828 tatggtccttgtaagaaggaacatcaagaaatacaacttc--aaaatcttaactaagctttagcttt 3841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 14919898 - 14919944
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14919898 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 14919944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16725730 - 16725687
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16725730 tttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 16725687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 3386076 - 3386030
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3386076 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 3386030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15077127 - 15077014
Alignment:
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 641  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| |   |||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||    
T  15077127 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacaaagtatggatcaactcggagaagaggtccatgagcttcgcgaggaggtcactacacttcgggccgaggt 15077028  T
Q  642 agtgaagttaacta 655  Q
    || |||||||||||    
T  15077027 agagaagttaacta 15077014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Original strand, 10787570 - 10787637
Alignment:
Q  37 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  10787570 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcatcatg 10787637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 9187384 - 9187430
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9187384 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 9187430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23994047 - 23994001
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaat 57  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994047 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaat 23994001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Original strand, 20556457 - 20556502
Alignment:
Q  415 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20556457 tatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 20556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 323
Target Start/End: Original strand, 22706397 - 22706437
Alignment:
Q  282 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22706397 actttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 22706437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3841618 - 3841582
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattca 453  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3841618 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattca 3841582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 9187258 - 9187321
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  9187258 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggaaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 9187321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Original strand, 22706531 - 22706567
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattca 453  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22706531 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattca 22706567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold2162
Description:

Target: scaffold2162; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 452 - 715
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  452 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 550  T
Q  513 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| ||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  551 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcaaatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 650  T
Q  613 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  651 ggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Original strand, 5 - 407
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  5 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 103  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa--------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaa 201  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||        ||||||||||||||||||        ||    
T  104 tatccac-ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacctttttcatcaaaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aa 201  T
Q  202 acatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttgg 294  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||    
T  202 acatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttgg 300  T
Q  295 tttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgata 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  301 tttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaaca 399  T
Q  394 agtccttc 401  Q
    ||||||||    
T  400 agtccttc 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5268 - 4881
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5268 tgatacaggtacaaaatgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtgaacttaacctcaccatgtattctatgtact 5169  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg--gtatg 215  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||||        |||||||||  |  | | |    
T  5168 atagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc-aaatatcgaaggatttagacaaattttttgcaaacatcacagatgaacg 5070  T
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5069 gactttgtaaagaagaacaccaagaaattcaaacttc-aaaaatcttaactaagctttaggttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttacttt 4971  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 401  Q
    |  |||||||||||  | ||||  | |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  4970 tgaaaaaaggaacctatcgcaatatatttacaactttc-aaatgaaaccatattcctctataatgtttccaatt-actttgacaaatccttc 4881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 192620 - 192297
Alignment:
Q  34 ttgaaaccatagtccttacc-aaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  192620 ttgaaaccatagtccttacccaaatggcgtctttacccttaaactccaacattgtggatttaacctcaccatgtattctaagttctttagcataatcatg 192521  T
Q  132 catacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-nnnnnnncaaacat--catgggtatggaccttgtaagaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||| |||||||||        |||||||  |||  | | ||||||||||||||    
T  192520 catacatgcattcattcataaacaactttttgcatc-aaagatcgaaggatttagacaagtttttttccaaacatcacatatgaacggaccttgtaagaa 192422  T
Q  229 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
     ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  192421 agaacaccaagaaatgcaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaca 192324  T
Q  324 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
      ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  192323 aattgcaacatcttcacaattttcaaa 192297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 192111 - 192001
Alignment:
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 641  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||| ||| |||||    
T  192111 gctcgcatatgcaaacactcatgcaaacacaaagtatggatcaacttggagaagaggtccacgagcttcccgaggaggtgactacacttcaggccgaggt 192012  T
Q  642 agtgaagttaa 652  Q
    || ||||||||    
T  192011 agagaagttaa 192001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19728 - 19394
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  19728 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtctttacccttgactccaactttgtggacttaacttcaccatacattcc 19629  T
Q  111 atgtactttagcat-aaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  19628 atgttctttagcataaatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 19532  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||| |||||    
T  19531 agatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaac-tccaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaaatttttccttggttttgttct 19433  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  19432 tacc-tttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 19394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 18527 - 18481
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18527 ctatttttgcataagcataacatgcatcattttgtattcataatttc 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 17178 - 17520
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17178 agaacctgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 17276  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||   |||  || || ||||| |||||| |||        ||||||||     
T  17277 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaaaacttttttttctcattaatatcgaagggcttagataagttcttgt-aaacatcaa 17375  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 303  Q
     | ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||    
T  17376 agatatgatctttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcataactaagctttagcttttgttaagaaatttttccttggtttcgttct 17474  T
Q  304 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || |||||| ||| ||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  17475 ta-cttttggaaagggaaccaattgcaacatcttcacatttttcaaa 17520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Original strand, 30575 - 30886
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30575 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaatcatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 30673  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 208  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  30674 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcatgaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 30770  T
Q  209 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgtt 301  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||    
T  30771 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgtt 30869  T
Q  302 cttaccttttgaaaaagg 319  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30870 ctta-cttttgaaaaagg 30886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5385 - 5047
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  5385 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 5286  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca---actatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 206  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  5285 atgttctttagcataattatgcatacatgcattcattcataaaaactttctttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcctgt-aaacatc 5187  T
Q  207 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgt 300  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||     || | |||||||||||||||    
T  5186 aatgatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaactt-taaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgt 5088  T
Q  301 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    ||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||| ||||    
T  5087 tctta-cttttgaaaagggaatcaattgcaacatcttcacaa 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4929
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4975 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 4929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11089 - 11043
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11089 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 11043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1818 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1818
Description:

Target: scaffold1818; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 92
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  234 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccattcattc 136  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  135 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 460
Target Start/End: Original strand, 31033 - 31463
Alignment:
Q  35 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31033 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccaacattgcggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatcatgca 31132  T
Q  134 tacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||   | |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |||||||||||     
T  31133 tacatgcattcattcataaa-aacttttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttgtaagaag 31230  T
Q  230 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||      ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  31231 gaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttgttaaagaactttttccttggtttcgttctca-cttttgaaaagggaacc 31328  T
Q  324 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc-nnnnnnnnnnnnctatttttg 422  Q
      ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||             |||||||||    
T  31329 aattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttcaaaaaaaatgtgtctatttttg 31425  T
Q  423 cataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31426 cataagcatatcatgcatcattttacattcataatttc 31463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 347
Target Start/End: Original strand, 10309 - 10630
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      | ||    
T  10309 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------catt 10401  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||  |||  || || ||||||||||||  ||        ||||||||  | |||||||    
T  10402 agcataaacatgcatacatgcattcattcataaaaaaaaaattc--tcactaatatcgaaggacttagatgagttcttgt-aaacatcaaagatatggac 10498  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttga 313  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10499 cttgtaaaaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttaccttttgttaagaact-tttccttggtttcgttcttactttttga 10596  T
Q  314 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttc 347  Q
    ||| ||||||  || |||| |||| |||||||||    
T  10597 aaagggaaccaattacaacatcttaacaatgttc 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 593 - 668
Target Start/End: Original strand, 10861 - 10936
Alignment:
Q  593 aagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttt 668  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  10861 aagaggtccacgagcttcgtgaggaggtgactacacttcgggccgaggtagagaagtgaaccaacctggtatcttt 10936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8601
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8459 agaacccgtgatacaggtaga-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtgaacttaacctcaccatgcattc 8557  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8558 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 8601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 350
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8804
Alignment:
Q  217 accttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttacctt 309  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  8665 accttgtaaggaagaacacccagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttcttacttt 8763  T
Q  310 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8764 ttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 8804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Original strand, 8869 - 8915
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8869 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31970 - 31714
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  31970 atacaggtacaaat-gaaatcatagtccttaccaaatgtcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcagcatgcattccatgttcttt 31872  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||  ||||| |||||||||||  ||        |||||||||  | |||||||    
T  31871 agcataatcatgcatacatgcattcattcgtaaa-aacttttttc-tcactaaaatcgaaggacttaggtaaagttcttgcaaacatcaaagatatggac 31774  T
Q  219 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaa-ctaagctttagcttt 278  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  31773 cttgtgagaaggaacaccaagaaatacaatttc-aaaaatcttaaccaaagctttagcttt 31714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2574 - 2430
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatg--tat 107  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||    
T  2574 agaacccgtaatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtatat 2476  T
Q  108 tctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2475 tctatgtactttagcattatcatgcatgcatgcattcatccataaa 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4278 - 4146
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  4278 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttcttt 4180  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4179 agcataatcatgcatacatacattcattcataaa 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4090 - 3947
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctt 304  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||  |      ||| |||||||||||||||||||    
T  4090 tatggaccctgtaagaaggaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaaactgtagcttttttttaagaactttttccttggtttcgttctt 3992  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    || ||||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3991 ac-ttttgaaaaggaaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 3947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20880 - 20756
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  20880 caatttgaaaccatagtccctacaaaatggcgttgttacgcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatc 20781  T
Q  129 atgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20780 atgcatacatgcattcattcataaa 20756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 17784 - 18122
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  17784 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccattgtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattt 17882  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccat---caaaaa-attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 205  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   ||  || || |||||||||||| |||        ||||||    
T  17883 gatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 17980  T
Q  206 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgt 300  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||    
T  17981 caaagatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgt 18073  T
Q  301 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18074 tctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38815
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38679 agaacccgtgatacaggtaaaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacactgtggaacttaacctcaccatgtattc 38778  T
Q  110 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaac 154  Q
    |||        ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38779 tat--------gcaaaatcatgcatacatgcattcattcataaac 38815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0478
Description:

Target: scaffold0478; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 443 - 314
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||| ||||    
T  443 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttgacctcaccatccattcgatgttcttt 345  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcat 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  344 agcataatcatgcatacatgcattcattcat 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43 - 2
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcata 455  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcata 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 115
Alignment:
Q  216 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttacct 308  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| ||    
T  246 gaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttatgaacttttatccttggtttcgttctta-ct 149  T
Q  309 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 342  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  148 tttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 343
Target Start/End: Original strand, 98758 - 99089
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||     
T  98758 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggtgtcgttatctttggctccaactttgtgggcttaacctcaccatgcgttcc 98856  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||      
T  98857 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatttattaa-acctttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttctggt-aaacatcaaa 98952  T
Q  210 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 304  Q
      ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  98953 catatggaccttgtaagaaggaataccaagaaatacaatttc-aaaaatcttaactaatctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt 99051  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 343  Q
    |  ||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  99052 a-gttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 99089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9326
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 109  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9183 agaacccgtgatacaagtacaaat-gaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttgcccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 9281  T
Q  110 tatgtactttagcataacca-tgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
     |||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9282 catgttctttggcataatcatttcatacatgcattcattcataaa 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 454
Target Start/End: Original strand, 9585 - 9622
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcat 454  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9585 tttttgcataagcataacatgcatcattttgcattcat 9622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 492 - 676
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10184
Alignment:
Q  492 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||||    
T  10000 caaaaggtcaatccatcagtaaagtggtctaatgtcttctttcaacttcagctagcatatgcaaacacttgtacaaacacaaaagatggattagcttgag 10099  T
Q  592 caagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 676  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  10100 caagaggtccacgaggttcgtgaagaggtaacaacacttcgggccgaggtagagaagttaactaatctggtatcttcactgatgg 10184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 577 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9442 - 9352
Alignment:
Q  577 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9442 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagagaaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Original strand, 301177 - 301297
Alignment:
Q  34 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |     ||    
T  301177 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaatattgtggatttaacctcaccatgtgttctatgttctttagcaata----tca 301272  T
Q  134 tacatgcattcattcataaacaact 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  301273 tacatgcattcattcataaacaact 301297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 635
Target Start/End: Original strand, 301586 - 301724
Alignment:
Q  497 ggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaaga 596  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||  ||| ||| ||||||| ||||  |||||  |||||| |  || |||||||| |||||| ||| |    
T  301586 ggtcaatccatcggtaaagtggtttgatctcttcactcaaattcagctcgcacatgcgaacactattgcaaacacaaagaatggatcaacttgaacaaaa 301685  T
Q  597 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggc 635  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  301686 ggtcgacgagcttcgtgaagaagtgacaagacttcgggc 301724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 11374 - 11545
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatg-tact 117  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||  || |  |    
T  11374 tgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaattgcgtttttacccttgactccaacattatgagcttaacctcaccatgttttcactgtttgt 11472  T
Q  118 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag 191  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  11473 gtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaacttttgccatc-aaacatcgaaggatttagacaag 11545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 612
Target Start/End: Original strand, 11857 - 11926
Alignment:
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11857 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtcca-gagcttcgt 11926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8270
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |     ||||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  8134 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggtgttgttatccttaa-----acattatggacttaacctcaccatgcattcc 8227  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8228 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 8270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 16685 - 16811
Alignment:
Q  19 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||       |||||||||| |||| |||| |||| |||    
T  16685 tgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgactttacccttgactccaaca-------cttaacctcaccatgcattccatgttctt 16776  T
Q  119 tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16777 tagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 16811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 460
Target Start/End: Original strand, 17062 - 17105
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17062 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattcataatttc 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1872
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      | ||    
T  1998 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgctcttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------catt 1906  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1905 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 1872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 521 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1382
Alignment:
Q  521 caatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggt 620  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  1528 caatgtcttcattcaacttcagctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaatttgaacaagaggtccatgagcttcgtgaggaggt 1429  T
Q  621 aacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 667  Q
     || |||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  1428 gactacactttgggccgaggtagagaagttaaccaacctggtatctt 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1625 - 1580
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgca-ttcatagtttc 460  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1625 ctatttttgcataagc--atcatgcatcattttgcatttcatagtttc 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25522 - 25380
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctta 305  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||||||||||||    
T  25522 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaaattttttccttggtttcgttctta 25424  T
Q  306 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
     |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25423 -cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 25380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14684 - 14601
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14684 atacaggtacaatt-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14317 - 14277
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcat 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14317 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcat 14277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 350
Target Start/End: Original strand, 3834 - 3968
Alignment:
Q  220 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3834 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttctttccttggtttcgttctta-cttttga 3931  T
Q  314 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3932 aaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 3968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 3626 - 3768
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt-- 108  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||      
T  3626 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcatgtttttccttgactccatcattatagacctaacatcaccatgttttca 3724  T
Q  109 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    | || |  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3725 ccat-ttgtgtggcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 433 - 291
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | |||     
T  433 agaacccgtaatacaggtaca-tatgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccgacattgtggacctaacatcaccattttttca 335  T
Q  111 atg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
      | |  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  334 ccgtttgtgcagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 96
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  159 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23177 - 23085
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23177 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 23085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22922 - 22886
Alignment:
Q  286 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22779 - 22743
Alignment:
Q  417 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattca 453  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22779 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattca 22743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 37319 - 37076
Alignment:
Q  220 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     || | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37319 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctta-cttttga 37222  T
Q  314 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc-nnnnnnnnnnn 412  Q
    ||| |||||   ||||||| |||| ||||  ||| |||| || | |||||||| ||  | || ||||||| ||||||| |||||||||                
T  37221 aaagggaactaattgcaacatcttcacaaatttc-aaataaaacaatgttcctttatcaagtctacaatt-actttgacaagtccttcaaataaaaaatg 37124  T
Q  413 nctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 460  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37123 tctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 37076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37516 - 37438
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctca 99  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37516 atacaggtacaaat-gaaatcgtagtccttaccaaatggcgtttttacccttaagctccaacattgtggacttaacctca 37438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 340 - 208
Alignment:
Q  21 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatg-tacttt 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||| |||   | |  | |    
T  340 atacaggtacaaat-gaaaccatagttcttaccaaatggcgttgttacccttgacttcgacattgtggacctaacatcagcatgttttcaccgtttgtgt 242  T
Q  120 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  241 agcataatcatgcatacatgctttcattcataaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0866 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0866
Description:

Target: scaffold0866; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4684 - 4586
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4684 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaatagcattgta-cccttgactccaactttatggactcaacctcaccatgttttct 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 299420 - 299507
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctca 99  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  299420 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtgaagttaacctca 299507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34029 - 33885
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||      ||| ||||||||||||| |||||    
T  34029 tatggaccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctatagcttttgttaaagaactttttccttggtttccttctt 33931  T
Q  305 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaa 351  Q
    | |||||||||| ||||||  ||||||||| || || || |||||||    
T  33930 a-cttttgaaaagggaaccaattgcaacgttttcacgattttcaaaa 33885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 185989 - 185841
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac--ttaacctcatcatgtatt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || ||| |  | ||||||| ||||| ||    
T  185989 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtt-atacccttgactccatcgttatgggccttaaacctcaccatgtttt 185892  T
Q  109 c----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaact 158  Q
    |    | |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  185891 caccgtttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaataact 185841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 184094 - 184024
Alignment:
Q  542 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 612  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  184094 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtccatgagcttcgt 184024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 184214 - 184177
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  184214 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 184177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 589 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29074 - 29015
Alignment:
Q  589 gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaag 648  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  29074 gagcaagcggtccacgagcttcgtgaagaggtgacaacacttcgggccgagatagagaag 29015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29653 - 29511
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 110  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |  || || ||| |  ||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||    
T  29653 agaacccgtgatacatgtacatttgaaaatcatagtccttaccaaatggcatgtttaccattggccacaacattatggacctcaccacaccatgttttct 29554  T
Q  111 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 153  Q
      || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29553 ccgttctttagcatattcattcatacatgcatacattcataaa 29511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 84320 - 84374
Alignment:
Q  30 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 83  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  84320 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 84374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 278
Target Start/End: Original strand, 152039 - 152104
Alignment:
Q  212 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 278  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  152039 tatggaccttgtaaaaaggagcaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactaaactttagcttt 152104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0782 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0782
Description:

Target: scaffold0782; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 451
Target Start/End: Original strand, 5901 - 5938
Alignment:
Q  414 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5901 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 5938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 22701 - 22748
Alignment:
Q  11 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 59  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22701 agaacccgtgatacaggtacaaata-aaaccatagtccttaccaaatgg 22748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University