View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9213_low_7 (Length: 248)

Name: NF9213_low_7
Description: NF9213
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9213_low_7
NF9213_low_7
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-234)||(2154852-2155085)
chr7 (1-234)||(10916499-10916732)
chr7 (1-234)||(16503011-16503244)
chr7 (1-234)||(16518047-16518280)
chr7 (1-230)||(11424412-11424640)
chr7 (1-230)||(5128271-5128500)
chr7 (1-233)||(26435536-26435768)
chr7 (1-233)||(26537502-26537734)
chr7 (1-233)||(5146972-5147204)
chr7 (1-233)||(24592173-24592405)
chr7 (1-233)||(3445585-3445817)
chr7 (4-233)||(16736092-16736321)
chr7 (4-233)||(16751146-16751375)
chr7 (4-233)||(17523814-17524043)
chr7 (4-233)||(17529172-17529401)
chr7 (1-233)||(4144755-4144987)
chr7 (1-233)||(31564022-31564254)
chr7 (1-233)||(31125199-31125431)
chr7 (1-191)||(11441851-11442041)
chr7 (1-233)||(9618930-9619162)
chr7 (1-233)||(45387622-45387854)
chr7 (1-233)||(26319501-26319733)
chr7 (1-233)||(26669546-26669778)
chr7 (1-233)||(26274726-26274958)
chr7 (71-233)||(26513130-26513292)
chr7 (36-234)||(16449629-16449827)
chr7 (37-234)||(16041638-16041835)
chr7 (36-206)||(39210682-39210852)
chr7 (36-206)||(26485008-26485178)
chr7 (36-206)||(26682659-26682829)
chr7 (36-206)||(2775673-2775843)
chr7 (36-173)||(4200861-4200998)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-234)||(2136963-2137196)
chr8 (1-234)||(14557902-14558135)
chr8 (1-234)||(27608609-27608842)
chr8 (1-234)||(16277832-16278065)
chr8 (1-234)||(19688376-19688609)
chr8 (1-233)||(19674719-19674951)
chr8 (1-234)||(16283727-16283960)
chr8 (1-233)||(29829600-29829832)
chr8 (1-233)||(9354901-9355133)
chr8 (1-233)||(19286740-19286972)
chr8 (1-233)||(3329212-3329444)
chr8 (1-233)||(31354802-31355034)
chr8 (1-233)||(19208065-19208297)
chr8 (1-233)||(28361660-28361892)
chr8 (1-233)||(31489455-31489687)
chr8 (1-233)||(12092429-12092661)
chr8 (1-233)||(33259001-33259233)
chr8 (1-152)||(189372-189523)
chr8 (115-234)||(18791099-18791218)
chr8 (36-206)||(18710899-18711069)
chr8 (36-224)||(19658754-19658942)
chr8 (62-206)||(44563438-44563582)
chr8 (52-173)||(22080643-22080764)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-234)||(15424005-15424238)
chr6 (1-234)||(26989276-26989510)
chr6 (1-234)||(24304306-24304539)
chr6 (1-234)||(24863992-24864225)
chr6 (4-234)||(27290058-27290288)
chr6 (1-234)||(22934568-22934801)
chr6 (1-234)||(23857013-23857246)
chr6 (1-230)||(26918655-26918884)
chr6 (1-233)||(16750129-16750361)
chr6 (1-234)||(13298639-13298872)
chr6 (1-233)||(29549750-29549982)
chr6 (1-233)||(27485404-27485636)
chr6 (1-233)||(34463035-34463267)
chr6 (1-234)||(27272268-27272501)
chr6 (1-233)||(3696356-3696588)
chr6 (1-233)||(4545464-4545696)
chr6 (1-233)||(16674414-16674646)
chr6 (1-233)||(29501690-29501922)
chr6 (1-233)||(27044663-27044895)
chr6 (51-233)||(27019461-27019643)
chr6 (1-233)||(4723823-4724055)
chr6 (1-233)||(4758039-4758271)
chr6 (1-233)||(4773281-4773513)
chr6 (1-233)||(27008002-27008234)
chr6 (1-233)||(4525561-4525793)
chr6 (1-233)||(28207729-28207961)
chr6 (1-233)||(29573288-29573520)
chr6 (1-234)||(27359680-27359913)
chr6 (1-234)||(27450023-27450256)
chr6 (1-233)||(26116099-26116331)
chr6 (1-233)||(30557705-30557937)
chr6 (1-233)||(16943716-16943948)
chr6 (1-233)||(26777299-26777536)
chr6 (1-107)||(17025552-17025658)
chr6 (36-224)||(22456641-22456820)
chr6 (36-224)||(14142983-14143171)
chr6 (36-224)||(26788254-26788442)
chr6 (36-224)||(27196627-27196815)
chr6 (36-224)||(27252425-27252613)
chr6 (1-55)||(27000348-27000402)
chr6 (33-233)||(17092129-17092329)
chr6 (36-206)||(13521789-13521959)
chr6 (181-233)||(27629389-27629441)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-234)||(23717630-23717863)
chr5 (1-234)||(22998756-22998989)
chr5 (1-231)||(23752095-23752325)
chr5 (1-234)||(24687799-24688032)
chr5 (1-230)||(11549641-11549870)
chr5 (1-231)||(33777774-33778004)
chr5 (1-234)||(30934920-30935153)
chr5 (1-234)||(15658402-15658635)
chr5 (1-234)||(24970305-24970538)
chr5 (1-233)||(18500373-18500605)
chr5 (1-233)||(28649522-28649754)
chr5 (1-233)||(3789828-3790060)
chr5 (1-233)||(6874592-6874824)
chr5 (1-233)||(13324472-13324704)
chr5 (1-233)||(43078539-43078771)
chr5 (1-233)||(24681727-24681959)
chr5 (1-233)||(24724254-24724486)
chr5 (1-233)||(2511338-2511570)
chr5 (1-233)||(15758500-15758732)
chr5 (1-233)||(31826050-31826282)
chr5 (1-233)||(34616805-34617037)
chr5 (1-234)||(18375054-18375287)
chr5 (1-233)||(8665118-8665350)
chr5 (1-233)||(37755267-37755499)
chr5 (1-233)||(37358286-37358518)
chr5 (1-233)||(31431727-31431959)
chr5 (1-233)||(40473192-40473424)
chr5 (1-233)||(12132442-12132674)
chr5 (1-233)||(5638197-5638429)
chr5 (1-233)||(9317738-9317970)
chr5 (1-233)||(28959429-28959661)
chr5 (1-233)||(30152305-30152537)
chr5 (1-233)||(37671126-37671358)
chr5 (1-233)||(37770630-37770862)
chr5 (4-233)||(32599115-32599344)
chr5 (1-233)||(33516643-33516875)
chr5 (55-233)||(41675050-41675228)
chr5 (1-233)||(30029702-30029934)
chr5 (1-233)||(30168756-30168988)
chr5 (1-233)||(26480679-26480910)
chr5 (36-233)||(23892528-23892725)
chr5 (36-224)||(29888734-29888922)
chr5 (1-149)||(29966793-29966941)
chr5 (1-173)||(9548246-9548418)
chr5 (36-234)||(22888792-22888990)
chr5 (49-234)||(25199364-25199549)
chr5 (62-172)||(13184352-13184462)
chr5 (36-206)||(33877569-33877739)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-234)||(14665311-14665544)
chr4 (1-234)||(17014293-17014526)
chr4 (4-234)||(24592059-24592289)
chr4 (1-233)||(36344261-36344493)
chr4 (1-233)||(14763050-14763282)
chr4 (1-233)||(6570146-6570378)
chr4 (1-233)||(18800359-18800591)
chr4 (1-233)||(33673544-33673776)
chr4 (1-233)||(39850931-39851163)
chr4 (1-233)||(30754047-30754279)
chr4 (1-233)||(54833680-54833912)
chr4 (4-233)||(5006169-5006398)
chr4 (1-233)||(21969994-21970226)
chr4 (1-233)||(14098834-14099066)
chr4 (1-233)||(31126264-31126496)
chr4 (1-233)||(40105384-40105616)
chr4 (1-233)||(27163063-27163295)
chr4 (42-234)||(15228204-15228396)
chr4 (33-234)||(15284673-15284874)
chr4 (36-233)||(1900585-1900782)
chr4 (59-173)||(15391144-15391258)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-234)||(8296211-8296444)
chr3 (1-234)||(4796439-4796672)
chr3 (1-234)||(6192555-6192788)
chr3 (1-234)||(15892492-15892725)
chr3 (1-231)||(15740883-15741113)
chr3 (1-230)||(35881005-35881234)
chr3 (1-234)||(4721870-4722103)
chr3 (1-230)||(18330908-18331137)
chr3 (1-234)||(8301053-8301286)
chr3 (1-234)||(29148541-29148774)
chr3 (1-233)||(28021514-28021746)
chr3 (1-233)||(7073451-7073683)
chr3 (1-230)||(22387368-22387597)
chr3 (1-233)||(18276839-18277071)
chr3 (1-233)||(18307441-18307673)
chr3 (1-233)||(48466166-48466398)
chr3 (1-233)||(18292140-18292372)
chr3 (1-233)||(20576634-20576866)
chr3 (1-233)||(21674932-21675164)
chr3 (1-233)||(51782262-51782494)
chr3 (1-233)||(4346474-4346706)
chr3 (1-233)||(5609109-5609341)
chr3 (1-233)||(8211977-8212209)
chr3 (1-233)||(11110136-11110368)
chr3 (1-233)||(18242978-18243210)
chr3 (1-233)||(28115741-28115973)
chr3 (1-233)||(36996864-36997096)
chr3 (1-234)||(18051501-18051734)
chr3 (1-233)||(31964260-31964492)
chr3 (1-233)||(5467224-5467456)
chr3 (1-233)||(5596144-5596376)
chr3 (1-233)||(10396372-10396604)
chr3 (1-233)||(28339541-28339773)
chr3 (1-233)||(29664757-29664989)
chr3 (1-233)||(4417158-4417390)
chr3 (1-233)||(22870643-22870875)
chr3 (1-233)||(22885702-22885934)
chr3 (1-233)||(18225430-18225662)
chr3 (1-233)||(6542249-6542481)
chr3 (1-233)||(17984743-17984975)
chr3 (1-233)||(7996801-7997033)
chr3 (1-233)||(10643309-10643541)
chr3 (1-233)||(5013951-5014183)
chr3 (1-233)||(24328398-24328630)
chr3 (1-233)||(47023692-47023924)
chr3 (62-173)||(17993631-17993742)
chr3 (1-111)||(51797352-51797462)
chr3 (1-101)||(50133990-50134090)
chr3 (36-234)||(18530662-18530860)
chr3 (36-234)||(16626292-16626490)
chr3 (36-206)||(31033931-31034101)
chr3 (36-206)||(32293026-32293196)
chr3 (4-224)||(5652629-5652849)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-234)||(28882488-28882721)
chr2 (1-234)||(27434178-27434411)
chr2 (1-234)||(12655816-12656049)
chr2 (1-234)||(20838192-20838425)
chr2 (1-234)||(23128300-23128533)
chr2 (1-233)||(27777496-27777728)
chr2 (1-233)||(27817254-27817486)
chr2 (1-233)||(37375435-37375667)
chr2 (1-233)||(12587084-12587316)
chr2 (1-233)||(12716337-12716569)
chr2 (1-233)||(27803981-27804213)
chr2 (1-233)||(13936279-13936511)
chr2 (1-233)||(39890348-39890580)
chr2 (1-233)||(11634921-11635153)
chr2 (1-233)||(11641110-11641342)
chr2 (1-233)||(39051557-39051789)
chr2 (1-233)||(260488-260720)
chr2 (1-233)||(21676917-21677149)
chr2 (1-233)||(40233785-40234017)
chr2 (1-233)||(32050072-32050304)
chr2 (1-233)||(37685644-37685876)
chr2 (1-233)||(37700909-37701141)
chr2 (1-233)||(37925767-37925999)
chr2 (1-233)||(16829073-16829305)
chr2 (1-233)||(16892176-16892408)
chr2 (1-233)||(19416234-19416466)
chr2 (1-233)||(34861954-34862186)
chr2 (55-233)||(34286682-34286860)
chr2 (55-233)||(34291742-34291920)
chr2 (1-234)||(31876555-31876788)
chr2 (52-233)||(9349717-9349898)
chr2 (36-234)||(21702898-21703096)
chr2 (33-234)||(19456155-19456356)
chr2 (36-173)||(34303098-34303235)
chr2 (36-206)||(22925790-22925960)
chr2 (70-224)||(27119031-27119185)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-234)||(39814-40047)
scaffold0089 (1-234)||(46730-46963)
scaffold0089 (1-234)||(30041-30274)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-234)||(30730-30964)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-234)||(27570-27804)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-233)||(6292-6524)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-233)||(8812-9044)
scaffold0159 (1-233)||(20293-20526)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-233)||(41793054-41793286)
chr1 (1-234)||(51638495-51638728)
chr1 (1-233)||(10962947-10963179)
chr1 (1-233)||(28585258-28585490)
chr1 (42-234)||(16207776-16207968)
chr1 (49-234)||(20461406-20461591)
chr1 (36-234)||(20340080-20340278)
chr1 (36-206)||(28152174-28152344)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-234)||(14675-14908)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-233)||(9844-10076)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-233)||(25947-26179)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-233)||(8227-8459)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-233)||(6985-7217)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-228)||(46545-46780)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-107)||(1-107)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (36-234)||(2403-2601)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (52-206)||(21890-22044)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (52-214)||(383-545)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (156-233)||(518-595)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 2154852 - 2155085
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2154852 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 2154951  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154952 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 2155051  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155052 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10916732 - 10916499
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10916732 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 10916633  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10916632 tgtgtaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 10916533  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916532 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16503244 - 16503011
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16503244 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 16503145  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16503144 tgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagctt 16503045  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503044 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16518280 - 16518047
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16518280 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 16518181  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16518180 tgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagctt 16518081  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518080 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11424640 - 11424412
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11424640 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 11424541  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11424540 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 11424441  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424440 gatgaatgataat-ttttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5128271 - 5128500
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  5128271 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagt 5128370  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5128371 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 5128470  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128471 gatgaatgataattttttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 26435536 - 26435768
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26435536 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 26435635  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435636 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 26435735  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26435736 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26537734 - 26537502
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26537734 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 26537635  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26537634 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 26537535  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26537534 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5147204 - 5146972
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5147204 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagc 5147105  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147104 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 5147005  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5147004 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24592405 - 24592173
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24592405 ccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagc 24592306  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24592305 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 24592206  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24592205 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 3445585 - 3445817
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3445585 ccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 3445684  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3445685 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 3445784  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3445785 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16736321 - 16736092
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16736321 aatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgt 16736222  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736221 gcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgat 16736122  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16736121 ggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16751375 - 16751146
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751375 aatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgt 16751276  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751275 gcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgat 16751176  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16751175 ggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 17523814 - 17524043
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17523814 aatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgt 17523913  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523914 gcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgat 17524013  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17524014 ggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17529401 - 17529172
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17529401 aatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgt 17529302  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529301 gcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgat 17529202  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17529201 ggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4144987 - 4144755
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4144987 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 4144888  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4144887 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 4144788  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
     |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4144787 aatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31564254 - 31564022
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31564254 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagc 31564155  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  31564154 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttt 31564055  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31564054 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 31125199 - 31125431
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31125199 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 31125298  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  31125299 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttt 31125398  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  31125399 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 11441851 - 11442041
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11441851 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 11441950  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacat 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11441951 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9618930 - 9619162
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  9618930 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagc 9619029  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9619030 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 9619129  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9619130 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 45387622 - 45387854
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45387622 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 45387721  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45387722 tgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 45387821  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  45387822 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26319733 - 26319501
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26319733 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 26319634  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26319633 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 26319534  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26319533 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26669778 - 26669546
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26669778 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 26669679  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26669678 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 26669579  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  26669578 gatgaatgataatctcctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26274958 - 26274726
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26274958 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 26274859  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26274858 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 26274759  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
     |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26274758 aatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  71 caactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  171 ctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16449827 - 16449629
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  16449827 tgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 16449728  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16449727 aattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 16041638 - 16041835
Alignment:
Q  37 gaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 136  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |  || |||||| |||    
T  16041638 gaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcatacca 16041737  T
Q  137 agtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    | |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16041738 attgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39210852 - 39210682
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  39210852 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 39210753  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  |||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39210752 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 39210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 26485008 - 26485178
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  26485008 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 26485107  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26485108 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26485178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26682829 - 26682659
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  26682829 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 26682730  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26682729 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 2775673 - 2775843
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  2775673 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 2775772  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |   |||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2775773 aattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 4200861 - 4200998
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  4200861 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 4200960  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 173  Q
    || |||| || |||  |  |||||||||||||||||||    
T  4200961 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgcta 4200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2137196 - 2136963
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2137196 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 2137097  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137096 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 2136997  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2136996 gatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14557902 - 14558135
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14557902 ccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 14558001  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558002 tgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 14558101  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558102 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27608842 - 27608609
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27608842 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27608743  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27608742 tgtgcaaagcttccctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagctt 27608643  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608642 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16277832 - 16278065
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16277832 ccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 16277931  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277932 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 16278031  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278032 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 19688376 - 19688609
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19688376 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 19688475  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19688476 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagctt 19688575  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  19688576 gatgaatgataattttttgaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19674719 - 19674951
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19674719 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 19674818  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19674819 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 19674918  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19674919 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16283727 - 16283960
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16283727 ccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagc 16283826  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16283827 tatgcaaagcttctctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 16283926  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16283927 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 29829600 - 29829832
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29829600 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagc 29829699  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829700 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 29829799  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29829800 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9354901 - 9355133
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9354901 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagc 9355000  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9355001 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcct 9355100  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9355101 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19286740 - 19286972
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19286740 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 19286839  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286840 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 19286939  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  19286940 gatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3329444 - 3329212
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3329444 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 3329345  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329344 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 3329245  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  3329244 gatgaatgataacttcctgactgtcagtgatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 31354802 - 31355034
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31354802 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 31354901  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |    
T  31354902 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcct 31355001  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31355002 gatggatgataatctcctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19208297 - 19208065
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  19208297 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 19208198  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19208197 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 19208098  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19208097 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28361892 - 28361660
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28361892 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 28361793  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28361792 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 28361693  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28361692 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31489687 - 31489455
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31489687 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 31489588  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489587 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 31489488  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31489487 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12092661 - 12092429
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  12092661 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagc 12092562  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12092561 tatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 12092462  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12092461 gatgaatgataattttctgaccgtcagtgatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 33259001 - 33259233
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  33259001 ccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 33259100  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  33259101 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagctt 33259200  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33259201 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 189372 - 189523
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  189372 ccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 189471  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189472 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 18791099 - 18791218
Alignment:
Q  115 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18791099 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 18791198  T
Q  215 ttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18791199 ttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 18710899 - 18711069
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  18710899 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 18710998  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18710999 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 18711069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19658942 - 19658754
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  19658942 tgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 19658843  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    |  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  19658842 agttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 19658754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Original strand, 44563438 - 44563582
Alignment:
Q  62 gtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||    
T  44563438 gtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcc 44563537  T
Q  162 tttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44563538 tttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 44563582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22080764 - 22080643
Alignment:
Q  52 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 151  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||||    
T  22080764 cttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcc 22080665  T
Q  152 ttcgtaatcctttgggttgcta 173  Q
      | |||||||| |||||||||    
T  22080664 gccataatccttggggttgcta 22080643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15424238 - 15424005
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15424238 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 15424139  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424138 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 15424039  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424038 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 26989276 - 26989510
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26989276 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagc 26989375  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989376 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 26989475  T
Q  201 gatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26989476 gatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24304539 - 24304306
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24304539 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagc 24304440  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304439 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 24304340  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304339 gatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 24863992 - 24864225
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24863992 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 24864091  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24864092 tgtgcaaatcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagctt 24864191  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24864192 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27290288 - 27290058
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||  ||||||||||| | || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27290288 aatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgt 27290189  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290188 gcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 27290089  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290088 gaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22934801 - 22934568
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  22934801 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagc 22934702  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22934701 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagctt 22934602  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22934601 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23857246 - 23857013
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23857246 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagc 23857147  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23857146 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagctt 23857047  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23857046 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26918655 - 26918884
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26918655 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 26918754  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26918755 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagctt 26918854  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26918855 gatgaatgataattttttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16750129 - 16750361
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16750129 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 16750228  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16750229 ggtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagctt 16750328  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750329 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13298872 - 13298639
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13298872 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 13298773  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  13298772 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagctt 13298673  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  13298672 gatgaatgacaattatttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 29549750 - 29549982
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29549750 ccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 29549849  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29549850 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 29549949  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29549950 gatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27485404 - 27485636
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27485404 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27485503  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27485504 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 27485603  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27485604 gatgaatgataatcttctgactgttagtgatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34463267 - 34463035
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34463267 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 34463168  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34463167 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 34463068  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34463067 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27272501 - 27272268
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||     
T  27272501 ccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagt 27272402  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  27272401 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagctt 27272302  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272301 gatgaatgataagtttttgactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 3696356 - 3696588
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3696356 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 3696455  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3696456 tgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 3696555  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3696556 gatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4545696 - 4545464
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4545696 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagc 4545597  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545596 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 4545497  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4545496 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16674414 - 16674646
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16674414 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagc 16674513  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674514 tgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 16674613  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16674614 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 29501690 - 29501922
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29501690 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagc 29501789  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29501790 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcct 29501889  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29501890 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27044663 - 27044895
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  27044663 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagc 27044762  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044763 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 27044862  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
     |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27044863 aatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  51 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  151 cttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4724055 - 4723823
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4724055 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagc 4723956  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4723955 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 4723856  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4723855 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 4758039 - 4758271
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4758039 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagc 4758138  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4758139 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 4758238  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  4758239 gatgaatgataatcttcggactgtcagtgatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 4773281 - 4773513
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4773281 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagc 4773380  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773381 tgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 4773480  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4773481 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27008002 - 27008234
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27008002 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagc 27008101  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27008102 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcct 27008201  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27008202 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 4525561 - 4525793
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4525561 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagc 4525660  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4525661 tatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcct 4525760  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4525761 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 28207729 - 28207961
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  28207729 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagc 28207828  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28207829 tatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 28207928  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28207929 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 29573288 - 29573520
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29573288 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 29573387  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29573388 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 29573487  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29573488 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27359913 - 27359680
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27359913 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagc 27359814  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27359813 tatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcct 27359714  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27359713 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27450256 - 27450023
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27450256 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagc 27450157  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27450156 tatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcct 27450057  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27450056 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26116331 - 26116099
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  26116331 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagc 26116232  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  26116231 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttc 26116132  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  26116131 gatgaacgataatcttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30557937 - 30557705
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30557937 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 30557838  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30557837 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 30557738  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30557737 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16943948 - 16943716
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16943948 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 16943849  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  16943848 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagctt 16943749  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16943748 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26777536 - 26777299
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgc-----acat 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||     || |    
T  26777536 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgctctgcacgt 26777437  T
Q  96 taagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaa 195  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26777436 caagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaa 26777337  T
Q  196 agcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26777336 agcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 17025552 - 17025658
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17025552 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 17025651  T
Q  101 tgtgcaa 107  Q
    |||||||    
T  17025652 tgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22456820 - 22456641
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||         ||||| ||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||    
T  22456820 tgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctg---------cacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcatgcc 22456730  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || || | || |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  22456729 aattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgt 22456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14143171 - 14142983
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  14143171 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 14143072  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  14143071 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 14142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 26788254 - 26788442
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  26788254 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 26788353  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  26788354 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 26788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 27196627 - 27196815
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  27196627 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 27196726  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27196727 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27196815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27252613 - 27252425
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  27252613 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 27252514  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27252513 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27252425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27000348 - 27000402
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000348 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17092329 - 17092129
Alignment:
Q  33 atgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcat 132  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||    
T  17092329 atgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcat 17092230  T
Q  133 gccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatg 232  Q
      ||  |||| |  || | | ||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || | | |||||||||||||||    
T  17092229 agcagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgatg 17092130  T
Q  233 t 233  Q
    |    
T  17092129 t 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13521959 - 13521789
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| ||||||    
T  13521959 tgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgcc 13521860  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13521859 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 13521789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27629441 - 27629389
Alignment:
Q  181 caagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27629441 caagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 27629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23717863 - 23717630
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23717863 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 23717764  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23717763 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 23717664  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23717663 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22998989 - 22998756
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22998989 ccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 22998890  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22998889 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 22998790  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22998789 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23752325 - 23752095
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23752325 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 23752226  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752225 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 23752126  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752125 gatgaatgataattttttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24688032 - 24687799
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24688032 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 24687933  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24687932 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 24687833  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24687832 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11549641 - 11549870
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11549641 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 11549740  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549741 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 11549840  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11549841 gatgaatgataattttttgactgctagtga 11549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33777774 - 33778004
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33777774 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 33777873  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33777874 tgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 33777973  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777974 gatgaatgataattttttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30934920 - 30935153
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  30934920 ccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagt 30935019  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  30935020 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagctt 30935119  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935120 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15658635 - 15658402
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15658635 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 15658536  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658535 tgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 15658436  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15658435 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 24970305 - 24970538
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  24970305 ccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagt 24970404  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24970405 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagctt 24970504  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970505 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18500605 - 18500373
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18500605 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 18500506  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18500505 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 18500406  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18500405 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 28649522 - 28649754
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28649522 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 28649621  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28649622 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagctt 28649721  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28649722 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 3789828 - 3790060
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3789828 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagc 3789927  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3789928 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 3790027  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3790028 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 6874592 - 6874824
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874592 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 6874691  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6874692 tgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 6874791  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6874792 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13324704 - 13324472
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13324704 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagc 13324605  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13324604 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 13324505  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13324504 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 43078539 - 43078771
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43078539 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 43078638  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43078639 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 43078738  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43078739 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 24681727 - 24681959
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24681727 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 24681826  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24681827 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 24681926  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24681927 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 24724254 - 24724486
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24724254 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 24724353  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24724354 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 24724453  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24724454 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 2511338 - 2511570
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2511338 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 2511437  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2511438 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 2511537  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2511538 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15758732 - 15758500
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15758732 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 15758633  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  15758632 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 15758533  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  15758532 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31826282 - 31826050
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31826282 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagc 31826183  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31826182 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagctt 31826083  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31826082 gatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 34616805 - 34617037
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  34616805 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagc 34616904  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34616905 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagctt 34617004  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34617005 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18375287 - 18375054
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18375287 ccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 18375188  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18375187 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagctt 18375088  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18375087 gatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8665350 - 8665118
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8665350 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 8665251  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8665250 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagctt 8665151  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  8665150 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 37755267 - 37755499
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  37755267 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagc 37755366  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37755367 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaactt 37755466  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37755467 gatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37358518 - 37358286
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37358518 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagc 37358419  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  37358418 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagatt 37358319  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37358318 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 31431727 - 31431959
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  31431727 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagc 31431826  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431827 tatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 31431926  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31431927 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40473424 - 40473192
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40473424 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 40473325  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  40473324 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 40473225  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    || |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40473224 gacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 12132442 - 12132674
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12132442 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 12132541  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12132542 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 12132641  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12132642 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 5638197 - 5638429
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5638197 ccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 5638296  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5638297 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 5638396  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5638397 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9317738 - 9317970
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  9317738 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 9317837  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9317838 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 9317937  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9317938 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28959661 - 28959429
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28959661 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagc 28959562  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959561 tgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 28959462  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28959461 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 30152305 - 30152537
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  30152305 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagc 30152404  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152405 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 30152504  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30152505 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37671358 - 37671126
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   | |||||||||||||||||||| ||||    
T  37671358 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagc 37671259  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  37671258 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttt 37671159  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37671158 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37770862 - 37770630
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  37770862 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagc 37770763  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37770762 tgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaactt 37770663  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37770662 gatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32599344 - 32599115
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32599344 aatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgt 32599245  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599244 gcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 32599145  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32599144 ggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 33516643 - 33516875
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  33516643 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 33516742  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33516743 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 33516842  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33516843 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 41675050 - 41675228
Alignment:
Q  55 gatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttc 154  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41675050 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 41675149  T
Q  155 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  41675150 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 30029702 - 30029934
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30029702 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 30029801  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  30029802 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagctt 30029901  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30029902 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 30168756 - 30168988
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  30168756 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 30168855  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30168856 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagctt 30168955  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
     |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30168956 aatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 26480679 - 26480910
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  26480679 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactc-tctggtacctctacacatcaagc 26480777  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26480778 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 26480877  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26480878 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 23892528 - 23892725
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  23892528 tgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcatgcc 23892627  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23892628 aactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattatttaactgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29888922 - 29888734
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  29888922 tgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatgcc 29888823  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    || |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  29888822 aattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 29888734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29966941 - 29966793
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29966941 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 29966842  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  29966841 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9548418 - 9548246
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  9548418 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagt 9548319  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 173  Q
    | ||| |||| || |||||   ||||||| ||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  9548318 tatgccaagcctctctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 9548246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Original strand, 22888792 - 22888990
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||  ||||   ||||||||||||     
T  22888792 tgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcatgct 22888891  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |  |||| || |||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  22888892 agttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 25199364 - 25199549
Alignment:
Q  49 agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggat 148  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||||  |||| || ||    
T  25199364 agacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaat 25199463  T
Q  149 gccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || |  ||||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  25199464 gcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13184462 - 13184352
Alignment:
Q  62 gtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||    
T  13184462 gtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcc 13184363  T
Q  162 tttgggttgct 172  Q
    |||||||||||    
T  13184362 tttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 33877569 - 33877739
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| ||||||    
T  33877569 tgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgcc 33877668  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33877669 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 33877739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14665311 - 14665544
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14665311 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 14665410  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14665411 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 14665510  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665511 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17014293 - 17014526
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17014293 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 17014392  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17014393 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 17014492  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014493 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24592289 - 24592059
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24592289 aatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgt 24592190  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24592189 gcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgat 24592090  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24592089 gaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36344493 - 36344261
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  36344493 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagt 36344394  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36344393 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 36344294  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36344293 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14763282 - 14763050
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14763282 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 14763183  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14763182 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 14763083  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14763082 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 6570146 - 6570378
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6570146 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 6570245  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570246 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 6570345  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6570346 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18800591 - 18800359
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18800591 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 18800492  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18800491 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 18800392  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18800391 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33673776 - 33673544
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33673776 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 33673677  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33673676 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 33673577  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33673576 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 39850931 - 39851163
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39850931 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 39851030  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39851031 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagctt 39851130  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39851131 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 30754047 - 30754279
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30754047 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 30754146  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30754147 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 30754246  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30754247 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 54833680 - 54833912
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54833680 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 54833779  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833780 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 54833879  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  54833880 gatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 5006169 - 5006398
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5006169 aatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgt 5006268  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5006269 gcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgat 5006368  T
Q  204 gaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5006369 gaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21969994 - 21970226
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21969994 ccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 21970093  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21970094 tgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 21970193  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21970194 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 14098834 - 14099066
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14098834 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 14098933  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14098934 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 14099033  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  14099034 gatgaatgataaccttctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31126496 - 31126264
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31126496 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 31126397  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31126396 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 31126297  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31126296 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40105616 - 40105384
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40105616 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 40105517  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40105516 tgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 40105417  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40105416 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27163295 - 27163063
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||     
T  27163295 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagt 27163196  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163195 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 27163096  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27163095 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 15228204 - 15228396
Alignment:
Q  42 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgc 141  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||| ||     
T  15228204 agctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccaattgt 15228303  T
Q  142 ctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    | || |||| | ||||||||||| |||||| |   ||||| | | |||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| || ||||||    
T  15228304 ccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15284874 - 15284673
Alignment:
Q  33 atgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcat 132  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||    
T  15284874 atgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 15284775  T
Q  133 gccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatg 232  Q
    ||||  ||||    |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||    
T  15284774 gccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 15284675  T
Q  233 tc 234  Q
    ||    
T  15284674 tc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 1900585 - 1900782
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| ||||||    
T  1900585 tgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgcc 1900684  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |  |||| || |||  | | |||| |||||||||||||   ||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  1900685 agttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15391258 - 15391144
Alignment:
Q  59 tccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaa 158  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||| |||||||||| |||| || |||||  | |||    
T  15391258 tccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataa 15391159  T
Q  159 tcctttgggttgcta 173  Q
    ||||| |||||||||    
T  15391158 tccttggggttgcta 15391144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 8296211 - 8296444
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8296211 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 8296310  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296311 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 8296410  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8296411 gatgaatgatgattttttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4796672 - 4796439
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4796672 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 4796573  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4796572 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagctt 4796473  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796472 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6192555 - 6192788
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6192555 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 6192654  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6192655 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 6192754  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6192755 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15892725 - 15892492
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15892725 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagc 15892626  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892625 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagctt 15892526  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892525 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15741113 - 15740883
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15741113 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagc 15741014  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741013 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 15740914  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15740913 gatggatgataattttttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35881005 - 35881234
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35881005 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 35881104  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881105 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 35881204  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35881205 gatgaatgaaatttttttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 4721870 - 4722103
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4721870 ccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 4721969  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721970 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 4722069  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4722070 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18330908 - 18331137
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  18330908 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagt 18331007  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18331008 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 18331107  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18331108 gatgaatgaaaattttttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8301286 - 8301053
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8301286 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 8301187  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  8301186 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagctt 8301087  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8301086 gatgaatgataattttttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29148774 - 29148541
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29148774 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagc 29148675  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148674 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagctt 29148575  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  29148574 gatgaatgacaattctttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 28021514 - 28021746
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28021514 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 28021613  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021614 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 28021713  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28021714 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 7073451 - 7073683
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7073451 ccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 7073550  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073551 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 7073650  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7073651 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22387597 - 22387368
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||    
T  22387597 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagc 22387498  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22387497 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 22387398  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387397 gatgaatgataattttttgactgttagtga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18277071 - 18276839
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18277071 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 18276972  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18276971 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 18276872  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18276871 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18307673 - 18307441
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18307673 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 18307574  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18307573 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 18307474  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18307473 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 48466166 - 48466398
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  48466166 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 48466265  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466266 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 48466365  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48466366 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18292372 - 18292140
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  18292372 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagt 18292273  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18292272 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 18292173  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18292172 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20576866 - 20576634
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20576866 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 20576767  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20576766 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 20576667  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20576666 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21674932 - 21675164
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21674932 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 21675031  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675032 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 21675131  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21675132 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 51782262 - 51782494
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51782262 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 51782361  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  51782362 tgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 51782461  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  51782462 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4346706 - 4346474
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4346706 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 4346607  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4346606 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagttt 4346507  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  4346506 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5609341 - 5609109
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5609341 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 5609242  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609241 tgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 5609142  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5609141 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 8211977 - 8212209
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  8211977 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaac 8212076  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8212077 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagctt 8212176  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212177 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11110368 - 11110136
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11110368 ccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 11110269  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  11110268 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaactt 11110169  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11110168 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 18242978 - 18243210
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18242978 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 18243077  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18243078 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagttt 18243177  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  18243178 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28115973 - 28115741
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28115973 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 28115874  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28115873 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 28115774  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28115773 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36997096 - 36996864
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36997096 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 36996997  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36996996 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 36996897  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36996896 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18051501 - 18051734
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18051501 ccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 18051600  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  18051601 tatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagctt 18051700  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051701 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31964492 - 31964260
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31964492 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 31964393  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  31964392 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 31964293  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| || |||||    
T  31964292 gatggatgataatcttctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 5467224 - 5467456
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5467224 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 5467323  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  5467324 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagttt 5467423  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  5467424 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5596376 - 5596144
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5596376 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagc 5596277  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596276 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 5596177  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5596176 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 10396372 - 10396604
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  10396372 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagc 10396471  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  10396472 tgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagctt 10396571  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10396572 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 28339541 - 28339773
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28339541 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 28339640  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  28339641 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 28339740  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28339741 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29664989 - 29664757
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29664989 ccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 29664890  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  29664889 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 29664790  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
     |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29664789 aatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 4417158 - 4417390
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  4417158 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 4417257  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4417258 tgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaaactt 4417357  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4417358 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22870875 - 22870643
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22870875 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagc 22870776  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22870775 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagttt 22870676  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22870675 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22885934 - 22885702
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22885934 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagc 22885835  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22885834 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagttt 22885735  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22885734 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 18225430 - 18225662
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18225430 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagc 18225529  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  18225530 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttataccgttcaagaagacatccaaagcct 18225629  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18225630 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6542481 - 6542249
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6542481 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagc 6542382  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  6542381 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttt 6542282  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  6542281 gatgaatgataatttcctgaccgtcagtgatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17984975 - 17984743
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  17984975 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagc 17984876  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17984875 tgtgtaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagctt 17984776  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| ||||| || || |||| || ||||||||    
T  17984775 gatggatgatgatcttctgaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 7996801 - 7997033
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7996801 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 7996900  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7996901 tgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 7997000  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7997001 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 10643309 - 10643541
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10643309 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 10643408  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10643409 tgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcct 10643508  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10643509 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 5013951 - 5014183
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5013951 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 5014050  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  5014051 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagctt 5014150  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5014151 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 24328398 - 24328630
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24328398 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 24328497  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24328498 tgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 24328597  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24328598 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 47023692 - 47023924
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47023692 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 47023791  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    || |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47023792 tgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 47023891  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  47023892 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17993742 - 17993631
Alignment:
Q  62 gtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17993742 gtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcc 17993643  T
Q  162 tttgggttgcta 173  Q
    || |||||||||    
T  17993642 ttggggttgcta 17993631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 51797352 - 51797462
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51797352 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 51797451  T
Q  101 tgtgcaaagct 111  Q
    |||||||||||    
T  51797452 tgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 50134090 - 50133990
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50134090 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 50133991  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  50133990 t 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Original strand, 18530662 - 18530860
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   |||||||||||||    
T  18530662 tgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgcc 18530761  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || || | || |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  18530762 aattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16626490 - 16626292
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||||||||||    
T  16626490 tgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgcc 16626391  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |  ||||  | |||| | | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||    
T  16626390 agttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31034101 - 31033931
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  31034101 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 31034002  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31034001 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 31033931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 32293026 - 32293196
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  32293026 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 32293125  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32293126 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 32293196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 5652629 - 5652849
Alignment:
Q  4 aatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgt 103  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  5652629 aatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttat 5652728  T
Q  104 gcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgat 203  Q
    || |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||    
T  5652729 gccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgat 5652828  T
Q  204 gaatgataattttttgactgt 224  Q
    ||| || |||| | |||||||    
T  5652829 gaacgacaattatctgactgt 5652849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28882488 - 28882721
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28882488 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 28882587  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28882588 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 28882687  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28882688 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27434411 - 27434178
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27434411 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27434312  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434311 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagctt 27434212  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27434211 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 12655816 - 12656049
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12655816 ccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 12655915  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655916 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 12656015  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12656016 gatgaatgataattttttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20838192 - 20838425
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20838192 ccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 20838291  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20838292 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagctt 20838391  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20838392 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23128533 - 23128300
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  23128533 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagc 23128434  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  23128433 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagctt 23128334  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23128333 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27777496 - 27777728
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27777496 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27777595  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27777596 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 27777695  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27777696 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27817254 - 27817486
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27817254 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27817353  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27817354 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 27817453  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27817454 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 37375435 - 37375667
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  37375435 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaac 37375534  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37375535 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 37375634  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37375635 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 12587084 - 12587316
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12587084 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 12587183  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  12587184 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 12587283  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12587284 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12716569 - 12716337
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12716569 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 12716470  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12716469 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 12716370  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12716369 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27803981 - 27804213
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27803981 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 27804080  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27804081 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 27804180  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27804181 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13936511 - 13936279
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13936511 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 13936412  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13936411 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 13936312  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13936311 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 39890348 - 39890580
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39890348 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 39890447  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  39890448 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggctt 39890547  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39890548 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11635153 - 11634921
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  11635153 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 11635054  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635053 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 11634954  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11634953 gatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11641342 - 11641110
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  11641342 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 11641243  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641242 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagctt 11641143  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11641142 gatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39051789 - 39051557
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39051789 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 39051690  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  39051689 tgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagctt 39051590  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39051589 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 260720 - 260488
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  260720 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagc 260621  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  260620 tgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagctt 260521  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  260520 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21677149 - 21676917
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21677149 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagc 21677050  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21677049 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagctt 21676950  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  21676949 gatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 40233785 - 40234017
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  40233785 ccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaac 40233884  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40233885 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagctt 40233984  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40233985 gatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 32050072 - 32050304
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  32050072 ccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 32050171  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32050172 tgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 32050271  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32050272 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37685876 - 37685644
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37685876 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 37685777  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37685776 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 37685677  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37685676 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37701141 - 37700909
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37701141 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 37701042  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37701041 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 37700942  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37700941 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 37925767 - 37925999
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37925767 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 37925866  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37925867 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 37925966  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37925967 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16829305 - 16829073
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16829305 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 16829206  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16829205 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 16829106  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16829105 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16892176 - 16892408
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16892176 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 16892275  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16892276 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 16892375  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16892376 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19416466 - 19416234
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  19416466 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 19416367  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19416366 tgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcct 19416267  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19416266 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 34861954 - 34862186
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34861954 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 34862053  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34862054 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 34862153  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34862154 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 34286682 - 34286860
Alignment:
Q  55 gatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttc 154  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34286682 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34286781  T
Q  155 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34286782 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 34291742 - 34291920
Alignment:
Q  55 gatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttc 154  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34291742 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34291841  T
Q  155 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34291842 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 31876555 - 31876788
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31876555 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 31876654  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  31876655 tgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagctt 31876754  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  31876755 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9349898 - 9349717
Alignment:
Q  52 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 151  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9349898 cttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcc 9349799  T
Q  152 ttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9349798 tccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21703096 - 21702898
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||| | ||| |||||| ||    
T  21703096 tgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcatacc 21702997  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| || ||||||    
T  21702996 aattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttgactgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19456356 - 19456155
Alignment:
Q  33 atgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcat 132  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||    
T  19456356 atgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcat 19456257  T
Q  133 gccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatg 232  Q
    ||||  ||||  | |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||    
T  19456256 gccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatg 19456157  T
Q  233 tc 234  Q
    ||    
T  19456156 tc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34303235 - 34303098
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   | |||||||||||    
T  34303235 tgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcatgcc 34303136  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 173  Q
    || |||| |  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  34303135 aattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgcta 34303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22925960 - 22925790
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  22925960 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 22925861  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||| ||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22925860 aattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 22925790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 27119031 - 27119185
Alignment:
Q  70 gcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggtt 169  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||    
T  27119031 gcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggtt 27119130  T
Q  170 gctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 224  Q
    ||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  27119131 gctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 27119185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40047 - 39814
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40047 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 39948  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39947 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 39848  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39847 gacgaatgataattttttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46963 - 46730
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46963 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 46864  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46863 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggctt 46764  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46763 gatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30041 - 30274
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  30041 ccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagc 30140  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30141 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagctt 30240  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30241 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30730 - 30964
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30730 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagc 30829  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30830 tgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagctt 30929  T
Q  201 gatgaatgataa-ttttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30930 gatgaatgataatttttttgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 27570 - 27804
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  27570 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagt 27669  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27670 tgtgcaaagcttctctatttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagctt 27769  T
Q  201 gatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27770 gatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 6292 - 6524
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6292 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 6391  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6392 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagctt 6491  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6492 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9044 - 8812
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9044 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 8945  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  8944 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 8845  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8844 gatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20293 - 20526
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20293 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 20392  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20393 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagctt 20492  T
Q  201 gatgaatgataat-tttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20493 gatggatgataatctttctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41793286 - 41793054
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41793286 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagc 41793187  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41793186 tgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 41793087  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  41793086 gatggatgataatcttctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 51638495 - 51638728
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  51638495 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagt 51638594  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51638595 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagctt 51638694  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51638695 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 10962947 - 10963179
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  10962947 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 10963046  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10963047 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagctt 10963146  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10963147 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 28585258 - 28585490
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28585258 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 28585357  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  28585358 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagctt 28585457  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28585458 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16207968 - 16207776
Alignment:
Q  42 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgc 141  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  |||    
T  16207968 agctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgc 16207869  T
Q  142 ctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    | || |||| | |||||||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16207868 ccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 20461406 - 20461591
Alignment:
Q  49 agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggat 148  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||||||  || | || ||    
T  20461406 agacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaat 20461505  T
Q  149 gccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20461506 gctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20340278 - 20340080
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  20340278 tgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 20340179  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20340178 agttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 28152174 - 28152344
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  28152174 tgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 28152273  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
    || |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28152274 aattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 28152344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14908 - 14675
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14908 ccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 14809  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14808 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagctt 14709  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14708 gatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9844 - 10076
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9844 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagc 9943  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9944 tgtgcaaagcctttctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 10043  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10044 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25947
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  26179 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagt 26080  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26079 tgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagctt 25980  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25979 gatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 8227 - 8459
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8227 ccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagc 8326  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8327 tatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagctt 8426  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8427 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 6985
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  7217 ccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagc 7118  T
Q  101 tgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7117 tgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagctt 7018  T
Q  201 gatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7017 gatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46780 - 46545
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatgg-tcgaagaatgtgaggca-gctccta-gacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatta 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  46780 ccaaatcatgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatca 46681  T
Q  98 agctgtgcaaagcttccctgttcagccatg-atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tttgggttgctatactgttcaaga-cgacatcc- 193  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
T  46680 agttgtgcaaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttttgggttgctttactgttcaagattgacatcca 46581  T
Q  194 aaagcttgatgaatgataa-ttttttgactgttagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46580 aaagcttgatgaatgataatttttttgactgttagt 46545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 1
Alignment:
Q  1 ccaaatcatgccgctgtaaatatggtcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  107 ccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagc 8  T
Q  101 tgtgcaa 107  Q
    |||||||    
T  7 tgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2601 - 2403
Alignment:
Q  36 tgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 135  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||    
T  2601 tgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcc 2502  T
Q  136 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 234  Q
    |  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  2501 agttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 21890 - 22044
Alignment:
Q  52 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21890 cttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgcc 21989  T
Q  152 ttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 206  Q
      | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  21990 gccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 545 - 383
Alignment:
Q  52 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 151  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  545 cttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgcc 446  T
Q  152 ttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 214  Q
      | |||||||| |||||| ||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  445 gccataatccttggggttgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaatt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 518 - 595
Alignment:
Q  156 taatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 233  Q
    |||||| |||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  518 taatcccttgggttgccgcattgtgcaagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University