View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9224_high_2 (Length: 411)

Name: NF9224_high_2
Description: NF9224
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9224_high_2
NF9224_high_2
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (8-393)||(357520-357905)
chr6 (8-379)||(34304428-34304800)
chr6 (46-391)||(33220552-33220898)
chr6 (24-391)||(4206415-4206783)
chr6 (98-391)||(17249198-17249492)
chr6 (60-393)||(959499-959832)
chr6 (25-346)||(45489-45819)
chr6 (8-225)||(32115776-32115993)
chr6 (81-274)||(34415474-34415667)
chr6 (8-254)||(12401389-12401635)
chr6 (75-292)||(28543394-28543612)
chr6 (20-372)||(29337898-29338247)
chr6 (104-276)||(28008886-28009061)
chr6 (202-391)||(4165919-4166109)
chr6 (173-379)||(28625863-28626070)
chr6 (99-254)||(34554171-34554326)
chr6 (328-391)||(3137371-3137434)
chr6 (21-215)||(20693417-20693610)
chr6 (162-254)||(34168926-34169018)
chr6 (99-254)||(24016395-24016549)
chr6 (298-379)||(32115650-32115731)
chr6 (213-276)||(3714953-3715016)
chr6 (351-391)||(7749401-7749441)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (8-379)||(34644498-34644870)
chr1 (8-254)||(19035505-19035751)
chr1 (8-347)||(29169597-29169936)
chr1 (105-379)||(2764411-2764686)
chr1 (8-367)||(28040930-28041290)
chr1 (45-374)||(45659487-45659816)
chr1 (8-379)||(4861792-4862164)
chr1 (70-371)||(20259663-20259964)
chr1 (197-391)||(22346815-22347010)
chr1 (46-371)||(50161258-50161591)
chr1 (196-365)||(21472949-21473119)
chr1 (187-379)||(31737305-31737497)
chr1 (8-252)||(37932021-37932264)
chr1 (46-276)||(25375674-25375904)
chr1 (25-276)||(37200019-37200267)
chr1 (75-313)||(42919858-42920096)
chr1 (217-374)||(47459619-47459777)
chr1 (198-371)||(2898642-2898819)
chr1 (220-386)||(24177526-24177693)
chr1 (162-311)||(16500034-16500184)
chr1 (217-374)||(38731546-38731704)
chr1 (23-192)||(43831415-43831585)
chr1 (198-254)||(35387653-35387709)
chr1 (36-160)||(38731732-38731856)
chr1 (346-391)||(5454015-5454060)
chr1 (356-393)||(7483802-7483839)
chr1 (8-68)||(22347121-22347181)
chr1 (200-254)||(50314619-50314673)
chr1 (189-254)||(23043935-23044000)
chr1 (334-387)||(30688481-30688534)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (8-379)||(39434599-39434971)
chr8 (74-391)||(3187890-3188207)
chr8 (34-391)||(24124948-24125306)
chr8 (79-385)||(38815220-38815517)
chr8 (8-313)||(35739790-35740095)
chr8 (43-254)||(500285-500496)
chr8 (8-372)||(25021617-25021982)
chr8 (126-391)||(6592496-6592760)
chr8 (25-252)||(42921947-42922174)
chr8 (116-391)||(4699791-4700064)
chr8 (43-239)||(37517167-37517363)
chr8 (113-276)||(8619850-8620013)
chr8 (186-266)||(8882373-8882453)
chr8 (198-373)||(28196130-28196306)
chr8 (19-146)||(39671001-39671127)
chr8 (34-148)||(11611077-11611191)
chr8 (213-391)||(6618205-6618383)
chr8 (76-254)||(10189601-10189779)
chr8 (8-371)||(8115752-8116115)
chr8 (328-391)||(42659147-42659210)
chr8 (289-379)||(3821156-3821246)
chr8 (289-379)||(37514153-37514243)
chr8 (186-238)||(22589335-22589387)
chr8 (288-391)||(9259376-9259479)
chr8 (328-391)||(22589460-22589523)
chr8 (328-379)||(24451052-24451103)
chr8 (341-391)||(8882264-8882314)
chr8 (248-393)||(43823907-43824053)
chr8 (335-391)||(6792189-6792245)
chr8 (326-390)||(26732760-26732824)
chr8 (91-158)||(8390294-8390361)
chr8 (204-254)||(39671170-39671220)
chr8 (328-385)||(4066771-4066828)
chr8 (198-238)||(166233-166273)
chr8 (187-231)||(6792257-6792301)
chr8 (76-148)||(40839716-40839787)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (8-379)||(50000728-50001101)
chr4 (76-391)||(53619506-53619822)
chr4 (15-320)||(31847078-31847384)
chr4 (23-372)||(132324-132676)
chr4 (46-379)||(55933303-55933635)
chr4 (8-391)||(26521409-26521792)
chr4 (43-374)||(56461945-56462276)
chr4 (8-184)||(3330078-3330254)
chr4 (23-313)||(12918190-12918481)
chr4 (8-371)||(25504235-25504597)
chr4 (8-286)||(30940542-30940820)
chr4 (196-379)||(23255645-23255820)
chr4 (162-379)||(48656867-48657090)
chr4 (8-379)||(53170444-53170805)
chr4 (171-391)||(600658-600879)
chr4 (231-391)||(3329916-3330077)
chr4 (15-274)||(16957580-16957833)
chr4 (196-391)||(34107685-34107883)
chr4 (8-138)||(25706683-25706813)
chr4 (19-239)||(12053486-12053704)
chr4 (282-391)||(4419183-4419292)
chr4 (46-369)||(6865654-6865984)
chr4 (298-391)||(39001317-39001410)
chr4 (224-387)||(7536590-7536754)
chr4 (112-393)||(46440795-46441078)
chr4 (140-276)||(50462881-50463017)
chr4 (280-379)||(16955392-16955491)
chr4 (110-379)||(46391220-46391487)
chr4 (85-155)||(54927613-54927683)
chr4 (134-239)||(45385990-45386095)
chr4 (278-386)||(38535643-38535751)
chr4 (220-313)||(50483211-50483305)
chr4 (43-127)||(18534585-18534669)
chr4 (64-138)||(53098579-53098654)
chr4 (288-374)||(42455691-42455777)
chr4 (335-391)||(8738125-8738181)
chr4 (328-384)||(18981663-18981718)
chr4 (60-148)||(38535441-38535529)
chr4 (349-393)||(52022046-52022090)
chr4 (328-371)||(28739845-28739888)
chr4 (207-276)||(43849350-43849419)
chr4 (348-393)||(47585152-47585197)
chr4 (334-391)||(50442609-50442666)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (8-391)||(28517090-28517474)
chr7 (8-393)||(4501177-4501562)
chr7 (23-391)||(5825193-5825560)
chr7 (34-369)||(19277235-19277571)
chr7 (37-374)||(43856811-43857149)
chr7 (76-379)||(21326709-21327013)
chr7 (36-379)||(982881-983225)
chr7 (8-276)||(3676675-3676944)
chr7 (104-379)||(32584532-32584809)
chr7 (60-379)||(27521403-27521721)
chr7 (23-391)||(45613660-45614029)
chr7 (43-391)||(24527509-24527859)
chr7 (104-391)||(22197907-22198194)
chr7 (104-391)||(22239627-22239914)
chr7 (201-371)||(40726476-40726647)
chr7 (161-374)||(30216014-30216228)
chr7 (187-387)||(42295166-42295367)
chr7 (232-391)||(48539101-48539261)
chr7 (187-372)||(10905057-10905242)
chr7 (99-308)||(2904368-2904578)
chr7 (8-148)||(47679289-47679429)
chr7 (107-233)||(33202368-33202493)
chr7 (34-132)||(38596635-38596733)
chr7 (329-393)||(5714958-5715022)
chr7 (171-313)||(9281098-9281240)
chr7 (171-313)||(9292069-9292211)
chr7 (197-369)||(25186928-25187096)
chr7 (328-379)||(45003021-45003072)
chr7 (197-374)||(34772719-34772896)
chr7 (43-145)||(10905271-10905372)
chr7 (46-159)||(38839481-38839592)
chr7 (105-185)||(9266173-9266252)
chr7 (289-393)||(23037463-23037567)
chr7 (300-379)||(41117866-41117945)
chr7 (289-391)||(5972301-5972403)
chr7 (332-386)||(27027758-27027812)
chr7 (328-385)||(38839252-38839309)
chr7 (167-231)||(1249667-1249731)
chr7 (328-361)||(38766259-38766292)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (8-391)||(35310368-35310752)
chr5 (23-372)||(27336634-27336982)
chr5 (8-379)||(13166713-13167085)
chr5 (8-374)||(33691859-33692224)
chr5 (36-379)||(32269628-32269972)
chr5 (8-233)||(433371-433596)
chr5 (2-371)||(15291823-15292192)
chr5 (8-209)||(38446267-38446470)
chr5 (23-251)||(43129595-43129822)
chr5 (182-391)||(25663009-25663219)
chr5 (162-371)||(37873595-37873805)
chr5 (79-313)||(14423680-14423912)
chr5 (8-366)||(26212385-26212745)
chr5 (35-274)||(34335375-34335614)
chr5 (43-276)||(3114002-3114234)
chr5 (228-379)||(430534-430686)
chr5 (76-304)||(35455963-35456192)
chr5 (104-254)||(8858974-8859124)
chr5 (175-391)||(42921618-42921834)
chr5 (177-379)||(38875571-38875773)
chr5 (106-273)||(43115359-43115525)
chr5 (128-254)||(32230430-32230556)
chr5 (44-148)||(9841165-9841270)
chr5 (127-274)||(8100590-8100737)
chr5 (328-391)||(23023515-23023578)
chr5 (230-304)||(14723269-14723344)
chr5 (241-391)||(22188691-22188842)
chr5 (328-390)||(22819762-22819824)
chr5 (303-379)||(2566194-2566270)
chr5 (349-379)||(34475973-34476003)
chr5 (99-148)||(27355610-27355659)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (8-379)||(39583032-39583404)
chr3 (8-391)||(53785629-53786013)
chr3 (8-370)||(44198708-44199071)
chr3 (8-385)||(7900784-7901156)
chr3 (8-391)||(52741314-52741699)
chr3 (80-379)||(13582442-13582741)
chr3 (171-379)||(26772690-26772899)
chr3 (8-393)||(38145974-38146364)
chr3 (212-393)||(38670887-38671069)
chr3 (24-308)||(49017966-49018251)
chr3 (70-371)||(37132865-37133166)
chr3 (75-276)||(46940639-46940841)
chr3 (8-160)||(29861949-29862101)
chr3 (23-391)||(37992253-37992621)
chr3 (46-391)||(54508226-54508571)
chr3 (206-391)||(32546715-32546901)
chr3 (74-391)||(5338566-5338885)
chr3 (187-391)||(3443294-3443499)
chr3 (75-309)||(7501881-7502117)
chr3 (198-385)||(26856755-26856943)
chr3 (167-391)||(4472982-4473206)
chr3 (112-364)||(51234563-51234803)
chr3 (298-386)||(25094666-25094754)
chr3 (197-391)||(38978791-38978986)
chr3 (8-155)||(52411705-52411852)
chr3 (299-381)||(4763888-4763969)
chr3 (349-390)||(7257701-7257742)
chr3 (187-379)||(25324961-25325156)
chr3 (217-372)||(52411903-52412059)
chr3 (105-216)||(35236302-35236413)
chr3 (289-366)||(44781-44858)
chr3 (341-389)||(53502591-53502639)
chr3 (329-379)||(4669788-4669838)
chr3 (196-246)||(45676778-45676828)
chr3 (330-379)||(26393812-26393861)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (23-391)||(28224920-28225289)
chr2 (8-379)||(44686348-44686722)
chr2 (8-369)||(4412869-4413231)
chr2 (8-379)||(27502294-27502665)
chr2 (8-386)||(41867711-41868090)
chr2 (8-379)||(17344570-17344942)
chr2 (8-386)||(23484741-23485118)
chr2 (23-379)||(9685233-9685590)
chr2 (34-313)||(5532418-5532697)
chr2 (36-391)||(19161614-19161970)
chr2 (23-391)||(3825646-3826016)
chr2 (34-371)||(18744783-18745121)
chr2 (79-220)||(20142614-20142755)
chr2 (23-393)||(16351657-16352033)
chr2 (189-353)||(34814803-34814967)
chr2 (8-148)||(13146937-13147077)
chr2 (60-309)||(2888518-2888764)
chr2 (8-155)||(9675001-9675148)
chr2 (23-145)||(10579597-10579719)
chr2 (289-371)||(13413291-13413373)
chr2 (187-254)||(1296032-1296099)
chr2 (196-239)||(13147088-13147131)
chr2 (104-313)||(29808073-29808280)
chr2 (99-148)||(7760740-7760789)
chr2 (330-391)||(27494231-27494292)
chr2 (120-276)||(33612462-33612618)
chr2 (301-393)||(44684955-44685047)
chr2 (222-391)||(2886632-2886802)
chr2 (187-391)||(44720242-44720448)
chr2 (289-375)||(7760930-7761016)
chr2 (233-354)||(20142753-20142875)
chr2 (329-391)||(24765181-24765243)
chr2 (198-254)||(3968402-3968458)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (8-391)||(33170-33554)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (104-366)||(6279-6541)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (23-391)||(2-371)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (171-391)||(103026-103246)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (43-274)||(47377-47608)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (130-307)||(10364-10546)
scaffold0186 (25-117)||(19916-20008)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (75-313)||(18235-18473)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (105-296)||(8416-8608)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (104-274)||(49449-49622)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (213-391)||(7523-7701)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (187-254)||(16192-16259)
[»] scaffold0514 (2 HSPs)
scaffold0514 (335-391)||(4378-4434)
scaffold0514 (187-231)||(4322-4366)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (342-371)||(17415-17444)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (350-387)||(52663-52700)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 357520 - 357905
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  357520 gaagaaggaggcccttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgcagatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 357619  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  357620 catgcatgtgtggacttgactggagtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtcaagcaaag 357719  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  357720 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctaacattagaggttgatgaccttcta 357819  T
Q  308 catagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  357820 catagagtccaaatgattaagcatagcaatgttatctctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattaattttgccatcta 357905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34304800 - 34304428
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34304800 gaagaaggagacgcatgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggctggaggaaaa 34304701  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||     
T  34304700 catgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaaa 34304601  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||||| ||| | || |||||||||    
T  34304600 taaccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttct 34304501  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  34304500 acatagagtccaaagagttatgcatagcaatatcatgtctcataggtctatgaatgttgtatttacgaggatt 34304428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 33220552 - 33220898
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33220552 tagatagaagattgacactcaggcctgcagatgttatgatgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgt 33220651  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacat 245  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33220652 gggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacat 33220751  T
Q  246 gcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgt 344  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  33220752 gcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttgtgt 33220851  T
Q  345 ctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||    
T  33220852 cttctaggtccatgaatgttgcgtttacgataattggttttgccatc 33220898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 391
Target Start/End: Original strand, 4206415 - 4206783
Alignment:
Q  24 gtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggact 123  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||| | |  || |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4206415 gtgaacttcttgattgacccactagataaaagatcaacactcaagcctgcggatgttatggtgtacaaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtagact 4206514  T
Q  124 tgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4206515 tgactggggtttcaccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtcaagcaaagtggctaaacatgagaa 4206614  T
Q  224 agcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| |    
T  4206615 agcgtgttctgacaatgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaag 4206714  T
Q  323 attaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
     | | ||||  |||||| ||||| | |||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  4206715 gtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaatgaatatagtgtttacgaggattggttttgccatc 4206783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Original strand, 17249198 - 17249492
Alignment:
Q  98 tggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcg 197  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| ||||||||||||  || || |||||| | ||    
T  17249198 tggaggaaaatatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccatttgtgggtttcggagtgggcgcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcg 17249297  T
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttg 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||  |    
T  17249298 tcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcag 17249397  T
Q  297 atgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  17249398 ttgaccttctacatagagtccaaaggattatgtatagcaatgttatgtctcctaagttcatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 17249492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 959832 - 959499
Alignment:
Q  60 acacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcg 159  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  959832 acactcaggcatgcggatgttacagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtcg 959733  T
Q  160 gtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctt 259  Q
    |  ||| ||||||||||||  || || |||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||    
T  959732 ggccttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccatt 959633  T
Q  260 tgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatg 358  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||| || | | |||| | | | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  959632 tgtttttgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacgta-agttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggtccatg 959534  T
Q  359 aatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  959533 aatgttgtgtttacgaggattgattttgtcatcta 959499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Original strand, 45489 - 45819
Alignment:
Q  25 tgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggactt 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| |||||    
T  45489 tgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgtgatggtgtacggatgggtagatggaaaacatgcttgtgtagactt 45588  T
Q  125 gactg--------gggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaac 216  Q
    ||| |        | ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  45589 gacagcttgacaggtgtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaac 45688  T
Q  217 atgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagact 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||  ||||| |||||  ||||| || |||||||||||||||| |    
T  45689 atgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagt 45788  T
Q  316 ccaaatgattaagcatagcaatgttatgtct 346  Q
     |||| | | | |||||||||||||||||||    
T  45789 tcaaaaggtcatgcatagcaatgttatgtct 45819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32115993 - 32115776
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||  |||| || |||| ||||    
T  32115993 gaagaaagaggcgcatgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgagtaggaggaaaa 32115894  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||   || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32115893 catgcatgtgtagacttgaccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaag 32115794  T
Q  208 tggccaaacatgagaaag 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32115793 tggccaaacatgagaaag 32115776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34415667 - 34415474
Alignment:
Q  81 atggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacagg 180  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||  || || ||||||||| |  ||| |||||||||| |||    
T  34415667 atggtgtatggatgggtaggaggaaaacatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggatagg 34415568  T
Q  181 cagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  34415567 catccttacaagctgcgtcaagcaaaatggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacacttt 34415474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12401635 - 12401389
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| | ||||| || ||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12401635 gaagaaggaggcgcctgtgaacttcctgactgacctactagatagcagatcaagacttaagtctgcaaatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaa 12401536  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || || | |||| || ||||||||| |||||  |||||| | |||||| |||||    
T  12401535 catgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatggtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaag 12401436  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||    
T  12401435 tggccaaacataagatagcgtgttttgctaatcaacatgcttatata 12401389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28543612 - 28543394
Alignment:
Q  75 gatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtag 174  Q
    ||||||||| ||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||     
T  28543612 gatgttatgatgtacagatggataggaggaaaacatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtcaggacttttacggtaa 28543513  T
Q  175 gacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |  ||||| |||||   |||| |||| |||||||    
T  28543512 gacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttttgaaaatcactatgctcttatactatttgattttgacacttt 28543413  T
Q  275 -tgtttcctagcattagag 292  Q
      | |||||||||||||||    
T  28543412 cagcttcctagcattagag 28543394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 29337898 - 29338247
Alignment:
Q  20 gcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtg 119  Q
    |||| ||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29337898 gcttttgaacttctggattgacccactagatagaagttcgacacttaggcctgcagatgttatggtgtgcagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtg 29337997  T
Q  120 gacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatg 219  Q
    |||||||  | ||||| ||||||     | |||| |||||| |||| ||||||||||||  ||  | |||||| |  |||||||||||  ||||||||||    
T  29337998 gacttgatcgaggttttaccact----cgattagtggtcggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatg 29338093  T
Q  220 agaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactcca 318  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| |||| |||||| ||  |||||||||  |||| | | ||||||||||||||   | ||    
T  29338094 agaaaacgtgttctaacaatcaacatgctcttataccatttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttctacatatggttca 29338193  T
Q  319 aatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
    || | | | ||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29338194 aagggtcatgcacatcaatgtcatgactcctaggtccatgaatgttgtgtttac 29338247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 28008886 - 28009061
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  28008886 aaaacatgcacaggtgaacttgactggagtttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagc 28008985  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaat---gaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||| |||||   ||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  28008986 aaagcggtcaaacatgagaaagcttgttctaacaatcaagaatatggttttataccatttgcttttgacacttttg 28009061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 391
Target Start/End: Original strand, 4165919 - 4166109
Alignment:
Q  202 gcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatga 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||||  |||||||| |||    
T  4165919 gcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttga 4166018  T
Q  301 ccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||||||| |  ||| | | | ||||  |||||| ||||| | |||||| || ||| | |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  4166019 ccttctacatagagtttaaaaggtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaataaatatagtgtttacgaggattggttttgccatc 4166109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28626070 - 28625863
Alignment:
Q  173 aggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaaca-tgcttttataacctttgtttttaacac 271  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||| ||||    
T  28626070 aggataggcagcccttaaagctgcgtcaagtaaggtggctaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacac 28625971  T
Q  272 ttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttt 370  Q
    |||   ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | | |||| | | | ||||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28625970 tttcaatttcctagcaccagaggttgttgagcttctacataaagttcaaaaggtcatgcataac-atgtcatatctcataggtctatgaatgttgtgttt 28625872  T
Q  371 acgaagatt 379  Q
    ||| |||||    
T  28625871 acggagatt 28625863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 34554171 - 34554326
Alignment:
Q  99 ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgt 198  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||| ||  ||||| ||| || |  |||||| | |||    
T  34554171 ggaggaaaacaagcatatgtggatttgattggggtttcaccaattgtgggattagggatcagggcttttaaagtaggtcagacaacactaaaagttgcgt 34554270  T
Q  199 caagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  34554271 caagcaaaacgaccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttata 34554326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Original strand, 3137371 - 3137434
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  3137371 gcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 3137434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 20693417 - 20693610
Alignment:
Q  21 cttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtgg 120  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||  ||  ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | ||||     
T  20693417 cttgtgaactttttgattgaccaactagataaaagatccacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatgggtaggaggaaaacatgc-tatgtga 20693515  T
Q  121 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaa 215  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||| ||| |||| |||  | ||| |||| | | | |||| |||||||||||||    
T  20693516 acttgatcagggtttcaccactcgtgggattagaggtctgagcttttacagtagaacatacggccctaaaggttgcatcaaacaaagtggccaaa 20693610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34169018 - 34168926
Alignment:
Q  162 gcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||| ||| |||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||    
T  34169018 gcttttaccgtaggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatgtttggacaagcaacatgcttttata 34168926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24016549 - 24016395
Alignment:
Q  99 ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgt 198  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |  || | ||||| || || |||||| | | |    
T  24016549 ggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgaccggagtttccccacttgtgggattaggagtcggggctt-tttgggaagacagacaaccgtaaaagttgcat 24016451  T
Q  199 caagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24016450 caagtaaaatagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttata 24016395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32115731 - 32115650
Alignment:
Q  298 tgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||| ||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32115731 tgaccttctacaaagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgatt 32115650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3715016 - 3714953
Alignment:
Q  213 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  3715016 aaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatatcatctgtttttgacacttttg 3714953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7749441 - 7749401
Alignment:
Q  351 ggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  7749441 ggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 7749401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34644870 - 34644498
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34644870 gaagaaggaagcgcgtgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtatgcggatgttatggtgtatggatgggctggaggaaaa 34644771  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||| | |||||| |||||    
T  34644770 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaag 34644671  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34644670 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttct 34644571  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34644570 acatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgatt 34644498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19035751 - 19035505
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||| || |||||||||  |||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || | || |    
T  19035751 gaagaaggaggtgcctgtgaacttcctgaccgacccactagataaaagatcaacactcaggtatgtggacgttttggtgtacggatgggtaggtggaaca 19035652  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19035651 catgcttgtgtagacttgactgggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaag 19035552  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19035551 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttata 19035505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 29169597 - 29169936
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  29169597 gaagaaggaggcgcctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaa 29169696  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||| ||||| | |||| |  |||||| || |    
T  29169697 catgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtcaagtaagg 29169795  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  29169796 tggccaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttaaccttct 29169895  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctc 347  Q
    ||||||| | |||| | | | ||| |||||||| |||||||    
T  29169896 acatagagttcaaaaggtcatgcacagcaatgtcatgtctc 29169936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2764686 - 2764411
Alignment:
Q  105 aaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagca 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  ||||  ||    
T  2764686 aaacatgcatgtgtgaacttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagaca 2764587  T
Q  205 aagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacct 303  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  | |||  |||| |||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2764586 aagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgacct 2764487  T
Q  304 tctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||| | |||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2764486 tctacataaagtccaaagggttatgcaaatcaatgttatgtctcttaggtccataaatgttgtgtttacgatgatt 2764411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Original strand, 28040930 - 28041290
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||  ||||||| || | ||||    
T  28040930 gaagaaggaggcgtctgtgaacttcctgactaacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaa 28041029  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||| |||||||  ||||| |  |||||| |||||    
T  28041030 catgcttgtgtagacttgactggggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtcaaacaaag 28041129  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||  | |||||||||    
T  28041130 tggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggttgaccttct 28041229  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtg 367  Q
    ||||||| | |||| | | | |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||    
T  28041230 acatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtcctctaagtccatgaatgttgtg 28041290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 374
Target Start/End: Original strand, 45659487 - 45659816
Alignment:
Q  45 ctagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttg 144  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||   ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45659487 ctagaaagaagatcaacactcaggcatgcacatgttatagtgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttg 45659586  T
Q  145 tgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagcc-ttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaac 243  Q
    |||| |||||  ||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45659587 tgggattaggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaac 45659686  T
Q  244 atgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttat 342  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||| | ||||||| ||  ||||| || |||||||||  ||||| | |||| ||| | |||||||||||| ||    
T  45659687 atgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgaccttct--atagagttcaaaagatcatgcatagcaatgtcat 45659784  T
Q  343 gtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  45659785 gtctcctaggtcaataaatgtcgtgtttacga 45659816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 4861792 - 4862164
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||   | || |||||||||||||||||  |  |   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4861792 gaagaatgaggcgtttgtgaacttcttgattgatctattaaatagaagatcgacacttcagcctacagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaa 4861891  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    | | || |||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||     
T  4861892 catgcatgtgtggatttgactggtgtttcaccacttgttggattaggggtcttgacatttatggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaaa 4861991  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| | ||||||| ||  | | |||| |||||||||    
T  4861992 tggtcaaacatgagaaagcgtcttctgacaagcaacatacttttatacaatttgcttttgacactttcgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttct 4862091  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| | |||| | | | ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4862092 acatagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcacgtcccttagatccatgaatgttgtgattacgaggatt 4862164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 371
Target Start/End: Original strand, 20259663 - 20259964
Alignment:
Q  70 atgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatac 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||| |  ||| |||    
T  20259663 atgtggatgttatggtgtacagatgggtagg-gaaaaacatgcatgtgtagacatgactagggttttaccgcttgtgggattaggtgtcagaccttttac 20259761  T
Q  170 ggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaac 269  Q
     | |  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| || || ||    
T  20259762 cggaaaacaggtagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttattgttgac 20259861  T
Q  270 acttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgt 368  Q
    |||||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | |||||| ||||| ||||||| || ||  || ||||||||||    
T  20259862 actttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataagttaataaatgttgtgt 20259961  T
Q  369 tta 371  Q
    |||    
T  20259962 tta 20259964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22347010 - 22346815
Alignment:
Q  197 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggtt 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| |||||||  ||||||||| |  |||||||    
T  22347010 gtcaagcaaagtggccaaatatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgcttttgacactttcggtttcctagtagcagaggtt 22346911  T
Q  296 gatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | |||||||||||| ||| | |||| | | | |||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22346910 gttgaccttctacacagagttcaaaaggtcatgcatagaaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgttcacgaggattagttttgccatc 22346815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 371
Target Start/End: Original strand, 50161258 - 50161591
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| |||  ||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||| ||    
T  50161258 tagatagaagatcaacacatgggtctgtatatgttatggtgtacggttgggtaagagaaaaacatgcatgtgtggacttaaccgatatttcaccactcgt 50161357  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacat 245  Q
    ||  |||||||  |   ||| ||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50161358 ggaattaggggctgagacttttacggtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacat 50161457  T
Q  246 gcttttataacctttgttttt---aacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagca----at 337  Q
    ||||||||| | ||| |||||    | |||||| | | |||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||| ||||    ||    
T  50161458 gcttttatatcatttttttttttatatacttttggctccctagcaccaaaggttgatgacattctacatagagttcaaaggatcatgcagagcaatgcat 50161557  T
Q  338 gttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    |||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  50161558 gttacgacacataggtccatgaatgttgtgttta 50161591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21473119 - 21472949
Alignment:
Q  196 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactt-ttgtttcctagcattagaggt 294  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||| ||||||   |||||||||||  |||||     
T  21473119 cgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagaggc 21473020  T
Q  295 tgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttg 365  Q
    || |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21473019 tgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttg 21472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 379
Target Start/End: Original strand, 31737305 - 31737497
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagc 285  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  31737305 taaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgattttctagc 31737404  T
Q  286 attagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||| |  |||| ||||||||||| | |||| | | | ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  31737405 attagaggctattgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgttatgtttcctagatccatgaat-tagtgtttacgaggatt 31737497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 37932021 - 37932264
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||   ||||   |||| ||||    
T  37932021 gaagaaggagacgcttttgaactttctgaccgacccattagatagaaaatcgacacttaggcctgcggatgttatgatgtacatatggacaggaggaaaa 37932120  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |   |||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| |  ||||||||||     
T  37932121 catgcatgcgtggacttgattgaggtttcaccacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaaa 37932220  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgctttta 252  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  37932221 tggtcaaatacgagaaag-gtgttctgacaatcaacgtgttttta 37932264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 276
Target Start/End: Original strand, 25375674 - 25375904
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||| | || |||||||||| | ||||| |||||  ||||||||| ||| ||    
T  25375674 tagatagaagattgacacttaggtctgcagatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgt 25375773  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacat 245  Q
     || ||||||||| | |||| ||||||||||||| || |   ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| || || |||||    
T  25375774 cggattaggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacat 25375873  T
Q  246 gcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    | ||||||| | |||| | || |||||||||    
T  25375874 gtttttataccatttgctattgacacttttg 25375904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37200267 - 37200019
Alignment:
Q  25 tgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggactt 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||| |||   ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  37200267 tgaactttctgtctgacccactagatagaagattgacacttaagtttgaa-atgttatggggtaccaatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtg-actt 37200170  T
Q  125 gactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 224  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| ||| ||  ||| |||| |||  ||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  37200169 gactgatgtttcaccactcgtgggattaaggaccggagcttttacaataggacatgcagccataaaagttacgtcaagtaaagtggtcaaacataagaaa 37200070  T
Q  225 gcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    || ||| || ||||| || ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  37200069 gcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttgttttt-acacttttg 37200019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42920096 - 42919858
Alignment:
Q  75 gatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtag 174  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||   ||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||| || | |||    
T  42920096 gatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatag 42919997  T
Q  175 gacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||  || || |||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  | | || |||| |||||||    
T  42919996 gacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttt 42919898  T
Q  275 tg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    || ||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  42919897 tgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacataga 42919858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47459777 - 47459619
Alignment:
Q  217 atgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagact 315  Q
    |||| ||||||| || ||| | |||||||| ||||||| | |||| |||| | |||||||  ||||||| || |||||  | |||||||||||||||| |    
T  47459777 atgataaagcgtcttttgatagtgaacatgtttttataccatttgcttttgatacttttggcttcctagtatcagaggcagttgaccttctacatagagt 47459678  T
Q  316 ccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  47459677 ccaaaggaatatgcatagcaatgttatgtctcctaagtctataaatgttgtgtttacga 47459619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2898819 - 2898642
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaag----cgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| || | | ||||||| | |||| |||| | ||||| | ||||||||||  ||||    
T  2898819 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgatactttcggtttcctagcaccagag 2898721  T
Q  293 gttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  2898720 gttgttgaccttctacatagagttcaaaagatcatgcataacaatatcatgtctcatacgatcatgaatgttgtgttta 2898642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 386
Target Start/End: Original strand, 24177526 - 24177693
Alignment:
Q  220 agaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactcca 318  Q
    |||||| |||| | |||||| |||||  ||||||| | ||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| | ||    
T  24177526 agaaagtgtgtaccgacaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttctacatagagttca 24177625  T
Q  319 aatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttg 386  Q
    ||   | | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24177626 aaaagtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttg 24177693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16500184 - 16500034
Alignment:
Q  162 gcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttg 261  Q
    |||| ||||||||||||| ||  | |||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||    
T  16500184 gcttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatactatttg 16500085  T
Q  262 tttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacata 311  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16500084 cttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttctacata 16500034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731546
Alignment:
Q  217 atgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||| | |||||| | ||| |||||  |||||||| | |||||||||||||| |    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttctacatagagt 38731605  T
Q  316 ccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
     |||| | | | ||| |  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38731604 tcaaagggtcatgcacaataatgtcatgactcctaggtccatgaatattgtgtttacga 38731546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 43831415 - 43831585
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  |    ||||||||||||| ||| |||| | || || ||||| |||||||| |    
T  43831415 tgtgaactttttgattgtcacactaaatagaagatcgacatttaggcttacatatgttatggtgtacggacgggtagaaggaatacatggatgtgtggcc 43831514  T
Q  123 ttgactggggttt-caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaag 192  Q
    |||   ||||||| ||||||| ||||| |  | |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  43831515 ttggtcggggtttgcaccactcgtgggatgcgaggtcggggattttacggtgggacaggcagccctaaaag 43831585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 254
Target Start/End: Original strand, 35387653 - 35387709
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  35387653 tcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagtgtgttctgacgatcaacaagcttttata 35387709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38731856 - 38731732
Alignment:
Q  36 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||    ||  ||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||  |||||| |||||| ||||||    
T  38731856 actgacccactagatagaagatcgatagttaaacttgcagatattatggtgtgcggatgggtaggaggaaaatatgcaaatgtggatttgactagggttt 38731757  T
Q  136 caccacttgtgggtttaggggtcgg 160  Q
    ||||||| || | ||||||||||||    
T  38731756 caccactcgttgatttaggggtcgg 38731732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5454060 - 5454015
Alignment:
Q  346 tcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  5454060 tcttaggtccatgaatgttgtgtttacaaggattggttttgtcatc 5454015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7483839 - 7483802
Alignment:
Q  356 atgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7483839 atgaatgttgtgtttacgaagattagttttgccatcta 7483802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22347181 - 22347121
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttagg 68  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  22347181 gaagaaggaggcacctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcagg 22347121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 254
Target Start/End: Original strand, 50314619 - 50314673
Alignment:
Q  200 aagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50314619 aagcaaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaacatgcttttata 50314673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23044000 - 23043935
Alignment:
Q  189 aaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||    
T  23044000 aaagctgcatcaagcaaagtggccaaatatgagaaaacaagtactcacaatcaacatgcttttata 23043935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30688534 - 30688481
Alignment:
Q  334 caatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgt 387  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30688534 caatgtcatgactcctgggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgt 30688481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39434971 - 39434599
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39434971 gaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtctgtcgatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaa 39434872  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||    
T  39434871 catgcatgtgtgtacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtcaagcaaag 39434772  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||    ||| |||||    
T  39434771 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcatttgatcttct 39434672  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39434671 acatagagtccaaagggttatgcatatcaatgtaatgtctcttagatccatgaatgttgtgtttacgaggatt 39434599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3188207 - 3187890
Alignment:
Q  74 ggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggta 173  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  3188207 ggatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacatgcatgtgtggccttgtgtggggtttcaccacttgtgggttta-gggtcggggcttttacggta 3188109  T
Q  174 ggacaggcagcct-taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacact 272  Q
    ||||||| ||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| | |||    
T  3188108 ggacaggaagcctctaaaagttgcatcaagcaaagtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaact 3188009  T
Q  273 tt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    ||  | |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3188008 ttcggcttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagagt-caaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 3187910  T
Q  372 cgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||  ||| |||||| ||||    
T  3187909 cgagaattggttttgccatc 3187890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24125306 - 24124948
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggt 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||   |||||||||| ||  || |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24125306 tgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcatatgttatggtctactgacgggtaggaagaaaacatgcatgtgtagacttgactggggt 24125207  T
Q  134 ttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||   ||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24125206 ttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaaatggccaaacatgagaaagcgtgctct 24125107  T
Q  234 gacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcata 332  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| | | |||| | | | |||||    
T  24125106 gacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttctacataaagttcaaaaggtcatgcata 24125007  T
Q  333 gcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24125006 gcaatgtcatgtctcataggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatc 24124948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38815517 - 38815220
Alignment:
Q  79 ttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggaca 178  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||          ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  38815517 ttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgg----------ggtatcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggaca 38815428  T
Q  179 ggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgt 277  Q
    | ||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |     
T  38815427 gacagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgc 38815328  T
Q  278 ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaaga 377  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38815327 ttcctagcaccagagggtgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagga 38815228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Original strand, 35739790 - 35740095
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||||||| || | | ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  35739790 gaagaaggaggtgcctgtgaactttctgactgacccatttggtagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtatgaatgggtaggaggaaaa 35739889  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||| || || |||||| |  || ||||||||    
T  35739890 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccactagtgggatta-aggtcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaaag 35739988  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||   || | |||| |||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  35739989 tggccaaacatgagaaagcgggttctgacaatcaacatgtttttatacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgaccttct 35740088  T
Q  307 acataga 313  Q
    |||||||    
T  35740089 acataga 35740095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 500496 - 500285
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  500496 cactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgttgtatggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttgagtgaggtttcaccact 500397  T
Q  143 tgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaa 242  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  500396 tgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaa 500297  T
Q  243 catgcttttata 254  Q
    ||||||||||||    
T  500296 catgcttttata 500285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 372
Target Start/End: Original strand, 25021617 - 25021982
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25021617 gaagaaggaagcgcatgtgaacttcttgtctgacccactagatagaagatcgtcacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaa 25021716  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| ||| ||||  ||||| |||||| |  |||||||||||    
T  25021717 catgcatgtgtggacttgaccggagtttcaccacttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaag 25021816  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||  |||| ||| |||| | |||||||||  |||||||| ||||| ||     
T  25021817 tggtgaaatatgagaaagtgtgttctcacaatcaacatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccatcc 25021916  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
    ||| | | | |||| | | | ||| | |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25021917 acacaaagttcaaagggtcatgcacaacaatgtcatatctcctaggtccaggaatgttgtgtttac 25021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6592760 - 6592496
Alignment:
Q  126 actggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaag 225  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||  ||| |||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592760 actgggttttcaccgtttgtgggattaggtgtcggc-cttttacgataggatagacagtcgtaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaag 6592662  T
Q  226 cgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgat 324  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||| |||| |||||||  ||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||| | |||| | |    
T  6592661 cgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagaggttgttgaccttctgcatagagttcaaaaggt 6592562  T
Q  325 taagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
     | |||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  6592561 catgcata-taatgtcatgtctcataggttcatgaatgttgtgtttacgagtattggttttgtcatc 6592496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 42921947 - 42922174
Alignment:
Q  25 tgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggactt 124  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  42921947 tgaacttcttgacttactcactatatagaagattgacacttacgtatgtagatgttatggtgtacagatgggtaggaggaaaacaaacatgtgtggactt 42922046  T
Q  125 gactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 224  Q
    |||||| |||||| ||   ||| | |||  |||| | |||| || |||| |||| |||||| |||||| | |||||| |||| ||| ||||  |||||||    
T  42922047 gactggagtttcatcaaacgtgagattaatggtcagagcttttatggtaagacatgcagccataaaagttgcgtcaaacaaaatggtcaaatttgagaaa 42922146  T
Q  225 gcgtgttctgacaatgaacatgctttta 252  Q
     |||||| ||||||| || |||||||||    
T  42922147 acgtgttttgacaatcaaaatgctttta 42922174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4700064 - 4699791
Alignment:
Q  116 tgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaa 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||  | ||| || || || | |||| |  |||||||||||||||||||    
T  4700064 tgtggatttgactggggtttcaccacttgtgggtttaaggatcgcggcttttacaatcggatagacaaccctcaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaa 4699965  T
Q  216 catgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagac 314  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||||| || ||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||||||| ||| |     
T  4699964 catgataa-gcgtgttctcacaattaacatgtttttacaccatttgtgtt-aacacttttggcttcatagcaccagaggctgttgaccttctatataaag 4699867  T
Q  315 tccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | |||| | | | | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4699866 ttcaaagg-tcatgaatagcaatattatgtcacctaggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatc 4699791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37517363 - 37517167
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |  ||   |||| |||||||| |||||||| || | |||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37517363 cactagatagaagatcaacactcatgcctgcaaatgtgatggtgtacggatgggtaggtggaaaatatgtttgtgtagacttgactggggtttcgccact 37517264  T
Q  143 tgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaat 239  Q
    ||| || ||||| || ||  ||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37517263 tgttggattaggcgtaggaccttttaccgtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagggtgttccgacaat 37517167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8620013 - 8619850
Alignment:
Q  113 atgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggcc 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||   ||| |||| ||| |||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||| |    
T  8620013 atgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgtgggattagagatcgtgacttttacgatagaacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtc 8619914  T
Q  213 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  8619913 aaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgtttttaacatttttg 8619850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8882453 - 8882373
Alignment:
Q  186 ttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgttttt 266  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||    
T  8882453 ttaaaacctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttaaaccatttgttttt 8882373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28196306 - 28196130
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttg 296  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  28196306 tcaagtaaagcggctaaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttcctagcaccataggttg 28196207  T
Q  297 atgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacg 373  Q
     ||||| ||||| |||| | |||| ||| | ||| | |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  28196206 ttgaccatctacgtagagttcaaaggatcatgcacaacaatgtcatgtctcctagatccacggatgttgtgtttacg 28196130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 39671001 - 39671127
Alignment:
Q  19 cgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgt 118  Q
    |||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  39671001 cgcttgtgaaatttctaactgacccactagatattagatcgacatttaggtctgcggatgttacggtgtctagatgggtaggagaaaaatatgcatgtgt 39671100  T
Q  119 ggacttgactggggtttcaccacttgtg 146  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  39671101 ggacttgact-gagtttcaccatttgtg 39671127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 11611077 - 11611191
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacactta-ggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactgggg 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||   ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11611077 tgactgacccactagatagaagattgaaacttaaggtctgcaaatgttatggtgtatgaatgggtagggg-aaaacatgcatgtgtggacttcacagggg 11611175  T
Q  133 tttcaccacttgtggg 148  Q
    |||||||||| |||||    
T  11611176 tttcaccactcgtggg 11611191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6618383 - 6618205
Alignment:
Q  213 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||| |||| |||||||  ||||||||||   |||| ||| ||||||| | ||||    
T  6618383 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgaccttttgcata 6618284  T
Q  312 gactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |  | |||| | | | |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  6618283 gcgttcaaaaggtcatgcatat-aatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggttttgtcatc 6618205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10189779 - 10189601
Alignment:
Q  76 atgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtagg 175  Q
    |||||||| | || |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||    |||| || ||||||    
T  10189779 atgttatgttttacggattggtaggaggaaaacatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtagg 10189680  T
Q  176 acaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||  ||  | |||||| | || |||  ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  10189679 acatacattcctaaaagttgcgccaattaaagtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttata 10189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8116115 - 8115752
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |   | || ||||| |||||| | ||||||  ||| ||||    
T  8116115 gaagaaggaggcgcatgtgaacttcttgattgactcactaaacggaagatcgacacatatgccagcgggtgttacggtgtacgaatgggtaagagaaaaa 8116016  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||  ||||     || | |||||| ||| |||| | |||||| |  ||||| || ||    
T  8116015 catgcatttgtgaacttgactaaggtttcaccacttgtaggattaatggtcatgattttttcggtagaacaagcagtcctaaaagttatgtcaatcagag 8115916  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttcta 307  Q
    ||| ||||| | ||||| | |||||| | ||| || || |||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||  |   || |||||||| ||||||||||    
T  8115915 tggtcaaacgtaagaaatcttgttctaataatcaatatacttttataccatttgcatttgacacttttggttttttaaatgagaggttgttgaccttcta 8115816  T
Q  308 catagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    |||| | | |||| ||| | |||| ||||||| |||| | | | ||||||||||||| ||||||    
T  8115815 cataaagttcaaaggatcatgcattgcaatgtcatgtttataaagtccatgaatgttatgttta 8115752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 42659210 - 42659147
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42659210 gcatagcaatattatgtcttctaggttcatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgtcatc 42659147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3821246 - 3821156
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  3821246 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcataaatgttatgtttacgaggatt 3821156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37514243 - 37514153
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | |||| | | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  37514243 agaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgttacgtctcttaggtccatgaatgttgtattcacgaggatt 37514153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 22589335 - 22589387
Alignment:
Q  186 ttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaa 238  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22589335 ttaaaagctgcgtcaagcaaaatggctgaacatgagaaagcgtgttctgacaa 22589387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 9259376 - 9259479
Alignment:
Q  288 tagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgt 387  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | || |   | | |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  9259376 tagaggttgttgaccttctacatagagttcacagactcatgcatagcaatgtcatatatcctaagtccatgaatgttgtatttacgaagattgattttgt 9259475  T
Q  388 catc 391  Q
    ||||    
T  9259476 catc 9259479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Original strand, 22589460 - 22589523
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  22589460 gcatagcaatgtcatgtctcataggtctatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccatc 22589523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24451103 - 24451052
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24451103 gcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgatgatt 24451052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8882314 - 8882264
Alignment:
Q  341 atgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  8882314 atgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgccatc 8882264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43824053 - 43823907
Alignment:
Q  248 ttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtct 346  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||| | |||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  43824053 ttttataccatttgcttttgacacttttggcttccttgcattagaggctattgacctttcacatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatgtct 43823954  T
Q  347 cttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |  || ||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||    
T  43823953 ccgagatccattaatgttgtgtttacggcaattgggtttgtcatcta 43823907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6792245 - 6792189
Alignment:
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6792245 aatgtcatgtctcataagtccataaatgttgtgtttacgaatattggttttgtcatc 6792189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 390
Target Start/End: Original strand, 26732760 - 26732824
Alignment:
Q  326 aagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcat 390  Q
    |||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  26732760 aagcatagcaatttcatatcttttagatccatgaatgttgtgtttatgaaaattagtttcgtcat 26732824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8390361 - 8390294
Alignment:
Q  91 gatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtc 158  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||| |||||||||| ||||    
T  8390361 gatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtgaacttgactaggattttatcactcgtgggtttagcggtc 8390294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 39671170 - 39671220
Alignment:
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  39671170 aaagtggccaaaccagagaaagcgtgttttgacaattaacatgtttttata 39671220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4066828 - 4066771
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  4066828 gcatagcaatgtaatgtgtcctaggtccatgactgttgtgttcacgatgattggtttt 4066771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 166273 - 166233
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaa 238  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  166273 tcaaacaaagtgtccaatcatgagaaagcgtgttctgacaa 166233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6792301 - 6792257
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt 231  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6792301 taaaagctacgtcaaacagagtggccaaacatgagaaaacgtgtt 6792257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40839787 - 40839716
Alignment:
Q  76 atgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    ||||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  40839787 atgttctggtatacgggtgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggagtttc-ccacttgtggg 40839716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 50000728 - 50001101
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50000728 gaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaa 50000827  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  50000828 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtcaagcaaag 50000927  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgctttt-ataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttc 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||| |||||||| | || ||||||| |||||  | ||||||||    
T  50000928 tggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttttggctttctagcatcagaggcagttgaccttc 50001027  T
Q  306 tacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50001028 tacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatgttgtgtttacgaagatt 50001101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 76 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 53619822 - 53619506
Alignment:
Q  76 atgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtagg 175  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||    
T  53619822 atgttatggtgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagaggtgggggcttttacagtagg 53619723  T
Q  176 acaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt 275  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53619722 acaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttt 53619623  T
Q  276 g-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53619622 gacttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtctaaagggttatgcataacaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 53619523  T
Q  375 agattagttttgtcatc 391  Q
      ||| |||||| ||||    
T  53619522 gaattggttttgccatc 53619506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31847384 - 31847078
Alignment:
Q  15 gaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  31847384 gaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagataaaagattgacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatggattggaggaaaacatgcat 31847285  T
Q  115 gtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  31847284 gtgtggacttgactagggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaa 31847185  T
Q  215 acatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    |||||||||| | |||||||||| | |||||| |||| || | |||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||    
T  31847184 acatgagaaaccatgttctgacagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaagcggttgaccttctacataga 31847085  T
Q  314 ctccaaa 320  Q
     ||||||    
T  31847084 gtccaaa 31847078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 132676 - 132324
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||  |||  || |||| |||| ||||||||||| ||    
T  132676 tgtgaacttcttgactggtccactagatagaagatcgacacttcggcatgcagatgttatggtgtacagatacgtaggaggaaaatatgcatgtgtgaac 132577  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggt--aggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  132576 ttgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaaatggcaaaacatga 132477  T
Q  221 gaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaa 319  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||  || |||| ||| |||| ||||||| ||| |  ||    
T  132476 gaaatcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgacattctacacagagtttaa 132377  T
Q  320 atgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
    | | | ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  132376 agggtcaagcataacaatgtcatgtcttttaggttcatgattgttgtgtttac 132324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 55933303 - 55933635
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| || | || || ||||||||||| |||||    
T  55933303 tagatagaagatcgacacttaggtccgcagatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgaatgtctgaatttaaccggggtttcaccccttgt 55933402  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacat 245  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  55933403 gggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtttgttctaacaatcaacat 55933502  T
Q  246 gcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgt 344  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||| |  ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||  |||| |||| ||||||    
T  55933503 gcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagcat--caggttgttgaccttctacatagagtccaaagggttatacataacaatattatgt 55933600  T
Q  345 ctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  55933601 ctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgatgatt 55933635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26521792 - 26521409
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |  | | |||||||||||  || |||| |||| ||||    
T  26521792 gaagaatgaggcgcatgtgagctttctgactgacccactagatagaagatcgacatttaagcctacgaaggttatggtgtacagacgggtaggaggaaaa 26521693  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  ||| || |||||||||  || || |||||| | |||||| |||||    
T  26521692 catgcatgtatggacttgactggagtttcatcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaag 26521593  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | | || ||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  26521592 tggctaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttggtttcctagcaccagaggctgttgaccttct 26521493  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| | | |||| | | | || ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26521492 acatacagttcaaagggtcatgcgtagcaatgtcatgtatcctaggcccatg-atgttgtgtttacgaggattggttttgtcatc 26521409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 56461945 - 56462276
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  56461945 cactagatagaagatcgacacttaagcatgcgaatgttatggtgtacggatgagtaggtggaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccatt 56462044  T
Q  143 tgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaa 242  Q
    ||| || ||||||||||   ||| |||||| | | || |  || |||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  56462045 tgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggc-aaacatgataaagcgtgttctgacaatcaa 56462143  T
Q  243 catgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgtta 341  Q
    |||| ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| | ||||  |||||| |    
T  56462144 catgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcatgacaatgtca 56462243  T
Q  342 tgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  56462244 tgtctcctaagtccataaatgttgtgtttacga 56462276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3330254 - 3330078
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  3330254 gaagaaggaggcacctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatggattggaggaaaa 3330155  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagc 184  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3330154 cgtgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacggtaggacaggcagc 3330078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 12918190 - 12918481
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |     
T  12918190 tgtgaactttctaactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgtggatgtcatggtgtatggatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtgtag 12918289  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||| |||| ||||||||||||  || || |||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  12918290 ttgactggagtttcatcacttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggtcaaacataaga 12918389  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||   |||  |||| ||||||| |  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  12918390 aatcgtgttctgacaatcaacacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttctagataga 12918481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25504597 - 25504235
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |  ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25504597 gaagaacgaggcacatgtgaacttcttgatagacccactagatagaagtttaacactcagacatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaa 25504498  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||| || | |||| | | |||||||||     
T  25504497 catgcatgtatagacttgactgaggtttcaccacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccct-aaagttgcatcaagcaaa- 25504400  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||  || ||||||| |    
T  25504399 tggtcaaacatgagaaaacgtgttctaacaatcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgacctttt 25504300  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    | ||||| |  ||| | | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25504299 aaatagagtttaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataggtccatgaatattgtgttta 25504235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 30940542 - 30940820
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |  | ||||||||||||| | |||||| || | ||||    
T  30940542 gaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactaaggcctacgaatgttatggtgtacgaatgggtaggtggaaaa 30940641  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||    ||| |||  |||||||| || || |||||| | ||||||| ||||    
T  30940642 catgcttgtgtagacttgactgaggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaag 30940741  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagca 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  30940742 tggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttat-accattgcttttgacactttcgatttcctagca 30940820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23255820 - 23255645
Alignment:
Q  196 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggtt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||        ||| |||||| | |||      
T  23255820 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgtttttgac--------ttcttagcatcataggca 23255729  T
Q  296 gatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23255728 gttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatattgtgtttacgaggatt 23255645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 379
Target Start/End: Original strand, 48656867 - 48657090
Alignment:
Q  162 gcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttg 261  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||||||| | ||||    
T  48656867 gcttttacagtatgacagacagccctaaaagtttcatcaagtaaaatggacaaacatgagaaagtgtgttatgtcaatcaaaatgtttttataccatttg 48656966  T
Q  262 tttttaacacttttg-tttcctagc-attagaggttgatga----ccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtcc 355  Q
    ||||| ||||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  48656967 tttttgacactttcgacttcttagcgattagaggttgttgaccttccttctacatagagtccaaatgattatgcatagcaatgttatgtctcataggtct 48657066  T
Q  356 atgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  48657067 atgaatgttgtgtttacgatgatt 48657090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 53170805 - 53170444
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||      |||||| || | ||||    
T  53170805 gaagaaagaggcgtctgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacacttaggcatgcagacgttatggt------atgggtaggtggaaaa 53170712  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    || | | ||||    
T  53170711 catgcttgtgtagacttgactggggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgttaggtaaag 53170612  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        |||| |||| |||||||  |||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  53170611 tagccaaacatgagaaagcgtgttctgacagtcaacatgctt------gatttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgttgaccttct 53170518  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctc--ttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| | |||| | | | |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  53170517 acatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctataggt-catgaatgttgtgttcacgaggatt 53170444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 391
Target Start/End: Original strand, 600658 - 600879
Alignment:
Q  171 gtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca 270  Q
    ||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||  ||    
T  600658 gtaggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgcttttgtca 600757  T
Q  271 cttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    ||||  |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | | ||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  600758 ctttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgtataactatgtcatgtctcctaggtccattaatgctgtgtt 600857  T
Q  370 tacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  600858 tacgatgattagttttgccatc 600879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3330077 - 3329916
Alignment:
Q  231 tctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagc 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| |||||||||  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||    
T  3330077 tctgacaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgc 3329978  T
Q  330 atagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  3329977 atagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgctgtgtttacgatgattggttttgccatc 3329916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16957833 - 16957580
Alignment:
Q  15 gaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcat 114  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  16957833 gaggcgcctgtgaacttcctgactgacccgctagataaaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggtgtaaaacatgcat 16957734  T
Q  115 gtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaa 214  Q
    ||||||||||||| ||      ||||||||| || |||||||||||  ||  ||| |||||| |||||| | |||||| | |||  |||||| || ||||    
T  16957733 gtgtggacttgacggg------accacttgttggattaggggtcgggcctcttacagtaggataggcagtcctaaaagttgcgtagagcaaaatgaccaa 16957640  T
Q  215 acatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||| | |||| |||| |||||||    
T  16957639 acatgagaaagtgtgctctgataatcaacatgcttatataccatttgcttttgacacttt 16957580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 391
Target Start/End: Original strand, 34107685 - 34107883
Alignment:
Q  196 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgt--tctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagag 292  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||  || || ||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||    
T  34107685 cgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcgatttcctagcaccagag 34107784  T
Q  293 gttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | || |||||||||||||||| | ||||   | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34107785 gctgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgttatgtctcctagatccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgtcatc 34107883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25706813 - 25706683
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  25706813 gaagaaggaggcgcatgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcctacgtatgttatggtgtacagatgggtaggagaaaaa 25706714  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcac 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25706713 catgcatgtgtggacttgatttgggtttcac 25706683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12053704 - 12053486
Alignment:
Q  19 cgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgt 118  Q
    ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12053704 cgcttgtaaacttcctgactgatccactagatagaagatcgagactttggtctgcagatgttatgttgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt 12053605  T
Q  119 ggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacat 218  Q
    |||| | | ||||||||||||| | || || || |||||||   ||| ||| ||||||||  ||||  |||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  12053604 ggacattattggggtttcaccattagttggattgggggtcg--acttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaagttgtcaaacat 12053507  T
Q  219 gagaaagcgtgttctgacaat 239  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  12053506 gagaaatcgtgttctaacaat 12053486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4419292 - 4419183
Alignment:
Q  282 tagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattag 381  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4419292 tagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgg 4419193  T
Q  382 ttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||    
T  4419192 ttttgccatc 4419183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Original strand, 6865654 - 6865984
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||    
T  6865654 tagatagaagattgacacttaggtatgcggatgttatgatgtacgtatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgtatttatcgggagtttcaccatttgt 6865753  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacat-------gagaaagcgtgttctgacaa 238  Q
    | |  ||  |||||  |||| |||||||| |||  ||||| |||||||| ||   | ||||||| ||||||||       |||||| ||||||||||| |    
T  6865754 gagactaaaggtcgtggcttttacggtagaacaaacagccataaaagctacgattaacaaagtgtccaaacatgaaacacgagaaaacgtgttctgacta 6865853  T
Q  239 tgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaat 337  Q
    | |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | ||| ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| | |||| | | | ||||||||||    
T  6865854 tcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttgagcttcatagcactagatgttgttaaccttttacatagagttcaaagggtaatgcatagcaat 6865953  T
Q  338 gttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  6865954 gtcatgtctcctagat-catgaatgttctgtt 6865984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 298 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39001410 - 39001317
Alignment:
Q  298 tgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39001410 tgaccttctacatagagtccaaaggattatgcataacaatgttgtgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgtcatc 39001317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 387
Target Start/End: Original strand, 7536590 - 7536754
Alignment:
Q  224 agcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatg 322  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  7536590 agcgtgttttgacaatcaacatgtttttatacaatttgtttttgacaatttcagtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatg 7536689  T
Q  323 attaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgt 387  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  7536690 atcgtgcatagcaattttatgtctcgtagatccatgaatgttatgtttacaatgattggttttgt 7536754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 393
Target Start/End: Original strand, 46440795 - 46441078
Alignment:
Q  112 catgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttat-acggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtgg 210  Q
    |||||||||| |||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||| |   || | ||||||   |||||| ||||||||    
T  46440795 catgtgtggatttgattgagattttaccacttgtaggtttaggggtcggggctttttacagtaggataaatagtcctaaaagtaacgtcaaacaaagtgg 46440894  T
Q  211 ccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctaca 309  Q
     ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| | |||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  46440895 tcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagaagctgctgaccttctaca 46440994  T
Q  310 tagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  || | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  46440995 tagagtccaaagggttgtgcatagcaatgctatgtctcataggttcatgaaaattatatttacgatgattgattttgtcatcta 46441078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 276
Target Start/End: Original strand, 50462881 - 50463017
Alignment:
Q  140 acttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaat 239  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  50462881 acttgttggattaggtgtcggtacttctacggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaat 50462980  T
Q  240 gaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
     |||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||    
T  50462981 caacatgctttcataccatttgcttttgacacttttg 50463017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16955491 - 16955392
Alignment:
Q  280 cctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16955491 cctagcaccagaggttgctgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgttgtgtttacgaggatt 16955392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 379
Target Start/End: Original strand, 46391220 - 46391487
Alignment:
Q  110 tgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtg 209  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||| |||||||||| | |  | | |||||||| |||| | ||||| |    
T  46391220 tgcatgtgtgaatttgattggggtttcaccacttgtaggattagaggtcggatcttttacggtaggatatgttgacctaaaagctacgtcgaacaaagcg 46391319  T
Q  210 gccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctac 308  Q
    |  ||||| |||||| | |||||| |||   |||||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  46391320 gttaaacacgagaaaacatgttctcacagccaacatgtttttat-accattgcttgtaacattttcgatttcctatcagtagaggttgttgaccttctac 46391418  T
Q  309 atagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||| | | |||| ||| | ||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46391419 ataaagttcaaaagatcatgc--aacaatgtcatgtctcctaaatccatgaatgttgtatttacgaagatt 46391487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54927683 - 54927613
Alignment:
Q  85 tgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggg 155  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54927683 tgtatgggtgggtaggagggaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttccccacttgtgggtttaggg 54927613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 45385990 - 45386095
Alignment:
Q  134 ttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||   ||| | |||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45385990 ttcaccacttgtgggattagggcccgaaacttttgcggtaggacatgcaaccctaaaagctaagtcaaggaaagtggtcaaacataagaaagcgtgttct 45386089  T
Q  234 gacaat 239  Q
    ||||||    
T  45386090 gacaat 45386095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Original strand, 38535643 - 38535751
Alignment:
Q  278 ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaaga 377  Q
    |||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| | ||||   | | |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38535643 ttcctagcaccagaggttgttcaccctctacatagagttcaaagagtcatgcatagcaatgtcatgtcttataggtccatggatgttgtgtttacgagga 38535742  T
Q  378 ttagttttg 386  Q
    |||||||||    
T  38535743 ttagttttg 38535751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 50483211 - 50483305
Alignment:
Q  220 agaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||  ||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  50483211 agaaagcgtcttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacataga 50483305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18534669 - 18534585
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgac 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |    |||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  18534669 cactagattgaagatcgacacttaggcctacaaatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtggacttgac 18534585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53098654 - 53098579
Alignment:
Q  64 ttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttga-ctggggtttcac 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  53098654 ttaggtatatagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcaaatgtggacttgatcgggggtttcac 53098579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Original strand, 42455691 - 42455777
Alignment:
Q  288 tagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| | | ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  42455691 tagaggttgttaaccttctacatagagttcaaatgatcatggataacaatgtcatgttttctaggtccatgaatgttgtttttacga 42455777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8738181 - 8738125
Alignment:
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  8738181 aatgtcatgtctcttaggttcatgaatgttgtgtatacaaagattgattttgtcatc 8738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 384
Target Start/End: Original strand, 18981663 - 18981718
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttt 384  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18981663 gcatagtaatgtcatgtctct-aggtccatgaatgttgtgtttacgatgattggttt 18981718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 38535441 - 38535529
Alignment:
Q  60 acacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38535441 acacttaggtctgtggatgttattgtggacggatgggtaggaggaaaatatgtgtgagcagacttgactagggtttcactacttgtggg 38535529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 52022090 - 52022046
Alignment:
Q  349 taggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  52022090 taggtccatgaatgttgtgtttacgataattagttttttcatcta 52022046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28739888 - 28739845
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28739888 gcataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgttta 28739845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 276
Target Start/End: Original strand, 43849350 - 43849419
Alignment:
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||    
T  43849350 gtggccaaacacgagaaagcgtgttcagataaccaacatgcttttatactatttgtgtttgacacttttg 43849419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 393
Target Start/End: Original strand, 47585152 - 47585197
Alignment:
Q  348 ttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47585152 ttaggtctataaattttgtgtttacgaagattggttttgtcatcta 47585197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 391
Target Start/End: Original strand, 50442609 - 50442666
Alignment:
Q  334 caatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  50442609 caatgttatgtctcctaggttcatggatgttgtgtttaagaggattggttttgccatc 50442666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Original strand, 28517090 - 28517474
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28517090 gaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaa 28517189  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  28517190 catgtatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaag 28517289  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||   | |||||||||    
T  28517290 tggccaaacatgagaaagcgtgtttagacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttct 28517389  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  28517390 acatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 28517474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4501562 - 4501177
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||   | ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  4501562 gaagaaagaggtgcttgtgaacttcctgaatgacccactagatagaagataaacactcaggccagcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaa 4501463  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||  || || |||||||| |||||| |||||    
T  4501462 catgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaag 4501363  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4501362 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatataatttgcttttgacactttggttttctagcaccagaggttgttgaccttcta 4501263  T
Q  308 catagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4501262 catagagttcaaaagttcatgcatagcaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgaggattagctttgtcatcta 4501177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5825560 - 5825193
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5825560 tgtgaactttctgattgacccactagatagaagatcgacacataggcctgcggatgttatggtgtacgaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggac 5825461  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |    
T  5825460 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaagtg--caaacatgaca 5825363  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||  |||| |||||||  |  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  5825362 atgcgtgttatgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagtcgaaag 5825263  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  5825262 ggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtctatggatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 5825193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19277571 - 19277235
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggt 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19277571 tgactgacgcactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtctacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggt 19277472  T
Q  134 ttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    |||||||||||| || |||||  || |  ||| | | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19277471 ttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtcaagcaaagtagccaaacatgagaaagcgtgttct 19277372  T
Q  234 gacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcata 332  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | |||||    
T  19277371 gacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcata 19277272  T
Q  333 gcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19277271 gcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 19277235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43857149 - 43856811
Alignment:
Q  37 ctgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttc 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  43857149 ctgacccactagatagaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatacatgcgtggacttgacgggggtttc 43857050  T
Q  137 accacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgac 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43857049 accacttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaagtggctagacatgagaaagcgtgttttgac 43856950  T
Q  237 aatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagca 335  Q
    ||| ||||||| ||||||   |||| |||| ||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | ||| | ||    
T  43856949 aatcaacatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcacaaca 43856850  T
Q  336 atgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43856849 atgtcatgactcctaggtccatgaatgttatgtttacga 43856811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 379
Target Start/End: Original strand, 21326709 - 21327013
Alignment:
Q  76 atgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtagg 175  Q
    |||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||    
T  21326709 atgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatacttgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 21326808  T
Q  176 acaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt 275  Q
    |||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||     
T  21326809 acaaacagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc 21326908  T
Q  276 g-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    | ||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||| | |||| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21326909 gatttcctagcaccagaggctgttgaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacga 21327008  T
Q  375 agatt 379  Q
     ||||    
T  21327009 ggatt 21327013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 983225 - 982881
Alignment:
Q  36 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||| |||||| |||| | ||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  983225 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcatccggaagttatgatgtacgaatgagtaggtgaaaaacatgcttgtgtagacttgactagggttt 983126  T
Q  136 caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 235  Q
     |||||||||||| ||||| || ||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  983125 aaccacttgtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttctga 983026  T
Q  236 caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagc 334  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||| | |||||  |||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||| | |||| | | | ||||| |    
T  983025 caatcaacatgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatatc 982926  T
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  982925 aatgtcatgtcttctatgtccatgaatgttgtgttcacgaggatt 982881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3676944 - 3676675
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | |||||||||  |||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  3676944 gaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccaatagatagaaaatcaacactcaggcttgtagatgttatggtgtagggatgggtaggtggaaaa 3676845  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacagg-cagccttaaaagcttcgtcaagcaaa 206  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3676844 catgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgtcaagcaaa 3676745  T
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  3676744 gtggtcaaacatcagaaagcgtgttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttttg 3676675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32584809 - 32584532
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||| || |||||  | | |||| |    
T  32584809 aaaacatgcatgtgtggacttgactcgggtttcacctcttgtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatcaaac 32584710  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | |||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32584709 aaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaagatgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgttgacc 32584610  T
Q  303 ttctacataga-ctccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  32584609 ttctagatagagttccaaaagatcatgcatatcaatgttatgtctcatagatcgatgaatgttgtgtttacaaagatt 32584532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27521721 - 27521403
Alignment:
Q  60 acacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcg 159  Q
    ||||| |||| || ||||||||| || || |||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27521721 acactcaggtctgcggatgttattgtctacggatgggtaggagaaaaacat--atgtgtagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtcg 27521624  T
Q  160 gtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctt 259  Q
    |  ||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||   ||    
T  27521623 ggccttttacggtaggacatgcacccttaaaagttgcgttaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaatt 27521524  T
Q  260 tgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatg 358  Q
    |  |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| || ||| |||    
T  27521523 tacttttgacacttttggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtctatg 27521424  T
Q  359 aatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27521423 aatgttgtgtttacgaggatt 27521403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 45613660 - 45614029
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||  || |||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  45613660 tgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgatgtacgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagac 45613759  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||| | | ||||||||| || || |||||| | ||||||| || ||| ||||||| | ||    
T  45613760 ttgactggggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaggtgaccaaacacggga 45613859  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||| |||||||  |||||| ||||  ||||| || |  ||||||||||||| | ||||     
T  45613860 aagtgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagaggctgttagccttctacatagagttcaaaa 45613959  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | | | ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  45613960 gttcatgcataacaatgtcaaatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 45614029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24527859 - 24527509
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggtt-ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccac 141  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||| | || | ||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||     
T  24527859 cactaggtcgaagatcaacactcaggtctgcgaatgtcatggtgtacggatgggataggtggaaaacatgtttgtgtagacttgactagggtctcatcat 24527760  T
Q  142 ttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatga 241  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24527759 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaaaacatgagaaaacgtgttctgacaatca 24527660  T
Q  242 acatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgtt 340  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||  | |||||||||||||||| | |||| | | | ||||||||||||     
T  24527659 acatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtc 24527560  T
Q  341 atgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    || |||| | |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  24527559 atttctccttggtccatgaatgttgtattcacgaggattggttttgtcatc 24527509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22198194 - 22197907
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||  ||| || ||||||||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  22198194 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22198095  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22198094 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22197995  T
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||||| | |||| | ||| | ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  22197994 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatc 22197907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Original strand, 22239627 - 22239914
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||  ||| || ||||||||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  22239627 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22239726  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22239727 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22239826  T
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||||| | |||| | ||| | ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  22239827 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatc 22239914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 371
Target Start/End: Original strand, 40726476 - 40726647
Alignment:
Q  201 agcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||| ||    
T  40726476 agcaaagtggccaaacataataaaatgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttg 40726575  T
Q  300 accttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40726576 accttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgctatgtctcctagatccatgaatgttgtgttta 40726647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Original strand, 30216014 - 30216228
Alignment:
Q  161 tgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataaccttt 260  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||    
T  30216014 tgcttgtacagtagaacaagcatccttaaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccattt 30216113  T
Q  261 gtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatga 359  Q
    | |||| |||||||  |||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| | | |||||| | | |||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  30216114 gcttttgacactttcggtttcctagcatcagagtttgttgatcttccacataaagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtctatga 30216213  T
Q  360 atgttgtgtttacga 374  Q
    |||||||||| ||||    
T  30216214 atgttgtgttcacga 30216228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 387
Target Start/End: Original strand, 42295166 - 42295367
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagc 285  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||| |    
T  42295166 taaaagcggcgtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaac 42295265  T
Q  286 attagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
    |  || ||||| |||||||||||||||  | ||||  || | ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42295266 accaggggttgttgaccttctacatagcgttcaaaatatcatgcataacattgtcatgtctcctaggtccatgaatcttgtgtttacgatgattagtttt 42295365  T
Q  386 gt 387  Q
    ||    
T  42295366 gt 42295367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48539261 - 48539101
Alignment:
Q  232 ctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagca 330  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||||| | ||| ||||||  ||||| || ||| | |||||||||| |||||| | | | |||    
T  48539261 ctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggttttctagcaccagaggctgttgatcgtctacatagagtccaaaaggtcatgca 48539162  T
Q  331 tagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  48539161 tagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatc 48539101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10905242 - 10905057
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagc 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| |||| |||||||| ||| ||||||    
T  10905242 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaaaagtgttctgacactcaacatgc-tttataccatttgcttttgacacttttggttgcctagc 10905144  T
Q  286 attagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
    |  ||||  || |||||||||||||||| | ||||     | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10905143 accagagtatgttgaccttctacatagagttcaaagagccatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtcgtgtttac 10905057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2904578 - 2904368
Alignment:
Q  99 ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgt 198  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||  |  || | |||||||||| || ||| | |||||| | |||    
T  2904578 ggaggaaaatatgtatgtgtggatttcatcggggtttcaccacttgtgaggttaggggatgaggcatttacggtaggatagacagtcctaaaagttacgt 2904479  T
Q  199 caagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca-cttttgtttcctagcattagaggttga 297  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||| | |||  ||| | ||||||||| |||||||||     
T  2904478 caagcaaaatagtcaaacatgagaaagcatgttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttcctagcactagaggttgt 2904379  T
Q  298 tgaccttctac 308  Q
    |||||||||||    
T  2904378 tgaccttctac 2904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 47679429 - 47679289
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |  | |||| |||| ||  | |||||| |||| ||||    
T  47679429 gaagaaggagtcgcgtgtgaactttctgactgacgcactagatagaagatcgacactttgacttacgaatgtaatggcgtgcgaatgggtaggaggaaaa 47679330  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47679329 catacatgtctagacttgactagggtttcaccacttgtggg 47679289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 33202368 - 33202493
Alignment:
Q  107 acatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| ||  |||| |  ||| | |||| | | ||    
T  33202368 acatgcatgtgtggacttgact-gggtttcaccgcttgtgggattaggggttggggcttttacagtaggatagaaagccctggaagttgcgtccaactaa 33202466  T
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33202467 gtggccaaacatgagaacgcgtgttct 33202493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38596733 - 38596635
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactgggg 132  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38596733 tgaccgacccactaaataaaagatcgacacttaagcatgtggatgttatggtgtacggatgtgtagaagaaaaatatgcatgtatggacttgactgggg 38596635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5715022 - 5714958
Alignment:
Q  329 catagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5715022 cataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgtttatgaagattggttttgtcatcta 5714958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 313
Target Start/End: Original strand, 9281098 - 9281240
Alignment:
Q  171 gtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca 270  Q
    ||||||||| || || |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||  ||| |||    
T  9281098 gtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgaca 9281196  T
Q  271 -cttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
      ||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  9281197 ttttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacataga 9281240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 313
Target Start/End: Original strand, 9292069 - 9292211
Alignment:
Q  171 gtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca 270  Q
    ||||||||| || || |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||  ||| |||    
T  9292069 gtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgaca 9292167  T
Q  271 -cttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
      ||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  9292168 ttttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacataga 9292211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 369
Target Start/End: Original strand, 25186928 - 25187096
Alignment:
Q  197 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttg 296  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| || | |||| |||| |    |  |||||| | || |||||||||    
T  25186928 gtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatcaacatgtttttctaccatttgcttttga----tcggtttccgaacactagaggttg 25187023  T
Q  297 atgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
     |||||||||| ||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25187024 ttgaccttctatatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatgaatgttgtgtt 25187096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 379
Target Start/End: Original strand, 45003021 - 45003072
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45003021 gcatagcaatgttatgtctcataggaccatgaatgttgtgtttacgaagatt 45003072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34772896 - 34772719
Alignment:
Q  197 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggtt 295  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||| | |||| |||| | |||||   |||| ||| ||||||||||    
T  34772896 gtcaatcaaagtagccaaatatgagaaagtgtgttcggacaattaatatgtttttataccatttgcttttgaaactttcaatttcttag-attagaggtt 34772798  T
Q  296 gatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||   | | ||||| |||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34772797 gttgaccttctacataaacttcaaaaagtcatgcatatcaatgtcatgttttctaggtccatgaatattgtgtttacga 34772719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10905372 - 10905271
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactg-gggtttcaccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  10905372 cactagatataagatcgacacttaggcctgcagatgtt--ggtgtacggatggataggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactgaggttttcaccac 10905275  T
Q  142 ttgt 145  Q
    ||||    
T  10905274 ttgt 10905271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38839592 - 38839481
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||    
T  38839592 tagatagaagatcgacggttagacatatagatgttatggtgtacggatgtgtaagag-aaaacatgcatgtgtggacttgactgagatttcatca-ttgt 38839495  T
Q  146 gggtttaggggtcg 159  Q
    ||| || |||||||    
T  38839494 gggatttggggtcg 38839481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Original strand, 9266173 - 9266252
Alignment:
Q  105 aaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagcc 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  9266173 aaacatgcatgtgtggatttgaccggg-tttcaccacttgtgggattaggggttagggcttttactgtaggacaggaagcc 9266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23037567 - 23037463
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtc 388  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||  | |||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| |    
T  23037567 agaggttgttgaccatctacgtagggttcaaagggttatgcatagcaatgtcatttctcttaggtctatgaattttgtgtttacgaggattgattttgcc 23037468  T
Q  389 atcta 393  Q
    |||||    
T  23037467 atcta 23037463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 379
Target Start/End: Original strand, 41117866 - 41117945
Alignment:
Q  300 accttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41117866 accttctacatagagtttaaaagatcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgtgttcacgatgatt 41117945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 5972301 - 5972403
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtc 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||   | | |||||| ||||| || ||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5972301 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaaatgtcatgcatagtaatgtcatttctcccagatctatgaatgttgtgtttacgaggattagttttgcc 5972400  T
Q  389 atc 391  Q
    |||    
T  5972401 atc 5972403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 386
Target Start/End: Original strand, 27027758 - 27027812
Alignment:
Q  332 agcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttg 386  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  27027758 agcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttg 27027812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38839309 - 38839252
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
    ||||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38839309 gcataacaatgtcatgtttatcaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattggtttt 38839252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1249731 - 1249667
Alignment:
Q  167 tacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt 231  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1249731 tacggtaggatagacagccctaaaacctgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaagcgtgtt 1249667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38766292 - 38766259
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38766292 gcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaat 38766259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35310752 - 35310368
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35310752 gaagaaggaggcgcctgtgaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacacttaggcttgcggatgttatgatgtacggatgggttggaggaaaa 35310653  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||    
T  35310652 catgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtcaagcaaag 35310553  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |||| |||||||  | ||||| |||| ||||| || | |||||||    
T  35310552 tggccaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgttaaccttct 35310453  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  35310452 acatagagtccaaagggttttgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatc 35310368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27336982 - 27336634
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27336982 tgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggac 27336883  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27336882 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaga 27336783  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactt-ttgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| |||||| | | |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    ||||    
T  27336782 aatcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacataga--gaaaat 27336685  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  27336684 ggttatgtatagcaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtttttac 27336634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 13166713 - 13167085
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  13166713 gaagaaggaagcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcatgcggatgttatggtctacggatgggttggaggaaaa 13166812  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgg-gtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||  | |||| |||||| |||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  13166813 catgcatgtgtggacttgact-gggtttcaccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtcaagcaaa 13166911  T
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttc 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13166912 gtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgttgaccttc 13167011  T
Q  306 tacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13167012 tacatagagtccaaagggttatgcatagcaatggtatgtctcctaggtccatgaatgttgggtttacgatgatt 13167085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 374
Target Start/End: Original strand, 33691859 - 33692224
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33691859 gaagaaggaggcgcttgcgaactttctgactgaccc-ctagatagaagatcgacacttaagcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaa 33691957  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33691958 catgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaag 33692057  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |||||||  | ||| |||||| ||||  || |||||||||    
T  33692058 tggccaaacatgacaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttgtaccatttgcttttgacactttcggcttcttagcatcagagactgttgaccttct 33692157  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 374  Q
    ||||||  |||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  33692158 acatagtgtccaaa-gggtatgcataacaatgttatgtctcataggttcatgaatgttctgtttacga 33692224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 379
Target Start/End: Original strand, 32269628 - 32269972
Alignment:
Q  36 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |  | ||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32269628 actgacccactagatagaagatcaacactcaaatctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggttt 32269727  T
Q  136 caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 235  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||  ||| || ||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32269728 caccacttctggaattaggtgtcgggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 32269827  T
Q  236 caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagc 334  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||| |||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | | |||| | | | |||||||    
T  32269828 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttctgcatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 32269927  T
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32269928 aatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggatt 32269972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 433596 - 433371
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  433596 gaagaaagaggcgcccgtgaactttctgactggcccactaaatagaagatccacacttaggcatgcggatgttatggtgtacagatgggttggaggaaaa 433497  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||| || || |||||||||||  |||||||||||    
T  433496 tatgcatgtgtggacttgaccggggtttcaccacctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaag 433397  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  433396 tggccaaacatgagaaagcgtgttct 433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 15291823 - 15292192
Alignment:
Q  2 agcagagaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttgga 101  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||||||| || ||||| |||    
T  15291823 agcagtgaagaaggaagcgcctgtgaacttcccaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcgaatgttatggtgtacggctgggtagga 15291922  T
Q  102 gcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaa 201  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||| | |||||  ||| | ||||| ||||| || || ||||||   ||||||    
T  15291923 ggaaaacatgtttgtgtagacttgaatgaggtttcaccacttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaa 15292022  T
Q  202 gcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatga 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||  |||    
T  15292023 acaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttatacaatttgttttttacacttttagttttctagcactagaggttattga 15292122  T
Q  301 ccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
     |||||||| | | | |||| | | | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15292123 tcttctaca-aaagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcacatctcctaggtccatgaatgttgtgttta 15292192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38446470 - 38446267
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38446470 gaagaaggaggcgcatgtgaattttctgactgaccctctagatagaatatcgacacttaggcatgcaaatgttatggtgtacggatgggttggagtaaaa 38446371  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagcctt--aaaagcttcgtcaagcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||| ||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  38446370 catgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggagttggggcttttacggtatgacatgcatccctaaaaaagctgcgtcaagcaa 38446271  T
Q  206 agtg 209  Q
    ||||    
T  38446270 agtg 38446267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43129822 - 43129595
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||| | |||| |||| ||||||||||| |     
T  43129822 tgtgaactttcttactgatctactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatgatgtacggatggataggaggaaaa-atgcatgtgtgaaa 43129724  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||| |||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43129723 ttgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaga 43129624  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgctttt 251  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  43129623 aaacgtgttctgacaatcaacatgttttt 43129595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 391
Target Start/End: Original strand, 25663009 - 25663219
Alignment:
Q  182 agccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttc 280  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||| |||| |||||||  | |||    
T  25663009 agccctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttc 25663108  T
Q  281 ctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatta 380  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  25663109 ctagcatcagaagttgttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtcccctaggtccatgaatgttgagtttacgaggattg 25663208  T
Q  381 gttttgtcatc 391  Q
    | |||||||||    
T  25663209 gctttgtcatc 25663219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 371
Target Start/End: Original strand, 37873595 - 37873805
Alignment:
Q  162 gcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttg 261  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||    
T  37873595 gcttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttg 37873694  T
Q  262 tttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaa 360  Q
     |||| |||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | ||| | |||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  37873695 cttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcagaacaatgtcatgacttctaggtctatgaa 37873794  T
Q  361 tgttgtgttta 371  Q
    |||||||||||    
T  37873795 tgttgtgttta 37873805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14423912 - 14423680
Alignment:
Q  79 ttatggtgtatggatgggtt-ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggac 177  Q
    |||||||||| |||||| || || | |||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  || |||||||    
T  14423912 ttatggtgtacggatggtttaggtggaaaatatgcttgtgaagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggac 14423813  T
Q  178 aggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt 277  Q
    ||||| || |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||||   |    
T  14423812 aggcaaccctaaaaaatgcgtcaagcaaagtgaccgaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactt---t 14423716  T
Q  278 ttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
     ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14423715 ctcctagcatcagaggctgttgaccttctacataga 14423680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 366
Target Start/End: Original strand, 26212385 - 26212745
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||||| || ||| | || | ||||    
T  26212385 gaagaaggaggcgcctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatgcagatgtgatggtgtacgggtggctaggtggaaaa 26212484  T
Q  108 ca-tgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaa 206  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||  ||| ||  || |||  |||||   |||||| | |||||||||||    
T  26212485 aaatgcatgtgtagatttgactggggtttcatcacttgtgagattaggtgttggaccttttatcgttggaatggcagttctaaaagttgcgtcaagcaaa 26212584  T
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||  ||||| |||||  ||||| |  | ||||||    
T  26212585 gtggccaaacatgagaaagcgtattctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttttaccctttcagtttcttagcaccagaggctattaaccttc 26212684  T
Q  306 tacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgt 366  Q
    |||||||| | ||||   | | | || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26212685 tacatagagttcaaaatgtcatgtatggcaatattatgtctcctaagtccatgaatgttgt 26212745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34335614 - 34335375
Alignment:
Q  35 gactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtt 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||   ||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34335614 gactgacccactagatagaagatcgacacttaggcttgcatatgttatggtgtacaaatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtggaattcactggggtt 34335515  T
Q  135 tcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctg 234  Q
      | ||||||| || ||| |||||   |||| ||| |||||| || || || |||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  34335514 ctatcacttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaaagggccaaacatgagaaagcgtgtcctg 34335415  T
Q  235 acaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  34335414 acaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttt 34335375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 276
Target Start/End: Original strand, 3114002 - 3114234
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||  ||| ||| ||  ||| ||| ||||||||  |  ||||||||||    
T  3114002 cactagatagaagatcaacacttagtcatgcagatgttatggtgtacaaatgggtaagaggaaa-cactcatttgtagacttgaccagtatttcaccact 3114100  T
Q  143 tgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaa 242  Q
      |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  3114101 catgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcatgttctgacagtcaa 3114200  T
Q  243 catgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3114201 catgtttttataccatttgtttttgacacttttg 3114234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 430686 - 430534
Alignment:
Q  228 tgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgatta 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||    
T  430686 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgtcttcatagcatcagaggcagttgaccttctacatagattccaaagggtta 430587  T
Q  327 agcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  430586 tgcatagtaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggatt 430534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35456192 - 35455963
Alignment:
Q  76 atgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtagg 175  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||||||| |  ||| |||||||||    
T  35456192 atgttatggtgtacagatgggtaggaggtaaatatgcatgtgtggacttgaccggggttttgccactcgtaggattaggggtccggccttttacggtagg 35456093  T
Q  176 acaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt 275  Q
      ||| ||||  ||||| |  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||    
T  35456092 gtaggtagcccaaaaagttgtgttaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttataccttttgcttttgacaatttt 35455993  T
Q  276 -gtttcctagcattagaggttgatgacctt 304  Q
     | |||||||||  ||||| || |||||||    
T  35455992 ggcttcctagcaccagaggatgttgacctt 35455963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8859124 - 8858974
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || | ||||||  |   |||| |||||| ||||| ||| ||   ||| || ||||||||    
T  8859124 aaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcattacttctgagattagggaccatagcttttacggtgggacaagcaacccacaaaactgcgtcaagc 8859025  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8859024 aaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttata 8858974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 42921834 - 42921618
Alignment:
Q  175 gacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||| |  |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | |||||||    
T  42921834 gacaggcagccctaaaaactacgttaagtatggtggtcaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttatgacacttt 42921735  T
Q  275 -tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacg 373  Q
      |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | || | | | | ||||| |||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||     
T  42921734 cggtttcctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcagaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtccat-aatattgtgtttaca 42921636  T
Q  374 aagattagttttgtcatc 391  Q
    | |||| |||||| ||||    
T  42921635 aggattggttttgccatc 42921618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38875773 - 38875571
Alignment:
Q  177 caggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-t 275  Q
    |||||| || ||||| || | |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||||||      
T  38875773 caggcaaccctaaaaactgcatcaaacaaagcgaccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttca 38875674  T
Q  276 gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaa 375  Q
    | |||||||||  ||||| || ||||||||||| |||| | |||| | | | ||||| ||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  38875673 gcttcctagcaccagaggctgctgaccttctacgtagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcttgtctcctaggtcaatg-atgttgtgtttacgat 38875575  T
Q  376 gatt 379  Q
    ||||    
T  38875574 gatt 38875571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 43115359 - 43115525
Alignment:
Q  106 aacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaa 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||  ||    
T  43115359 aacatgcatgtatggatttgatcggggtttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgt-aaataa 43115457  T
Q  206 agtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactt 273  Q
    || || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| |||| ||||||    
T  43115458 agcggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacactt 43115525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Original strand, 32230430 - 32230556
Alignment:
Q  128 tggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcg 227  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||| |  ||| ||||||| |||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  32230430 tggggtttcatcagttgtgagattaggggtcagaacttttacggtaagacaagtagctttaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatg 32230529  T
Q  228 tgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  32230530 tgttctgacaatcaacaagcttttata 32230556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 9841165 - 9841270
Alignment:
Q  44 actagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgt-atggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||| |||||  |||||| | |||||||||||||    
T  9841165 actagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtgcgggatgggtagaagaaaaacatgcgtgtgtaaacttgagtagggtttcaccact 9841264  T
Q  143 tgtggg 148  Q
    ||||||    
T  9841265 tgtggg 9841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8100737 - 8100590
Alignment:
Q  127 ctggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  |  |||||||| ||| || |||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  8100737 ctggggtttcaccacttgtgggattaagagtcgggactttaatagtaggacatgcatccctaaacgctgcatcaagtaaaatggtcaaacatgagaaaac 8100638  T
Q  227 gtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  8100637 gtgttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacacttt 8100590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23023578 - 23023515
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23023578 gcatatcaatgtcatgtctcctaggtcgatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgtcatc 23023515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Original strand, 14723269 - 14723344
Alignment:
Q  230 ttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgacctt 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  14723269 ttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttttacacttttggttttttagcatcagaggttgttgacctt 14723344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 391
Target Start/End: Original strand, 22188691 - 22188842
Alignment:
Q  241 aacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgt 339  Q
    |||||| |||||||   ||||||||| ||||||| | |||  |||||  ||||| || |||||||||||||||| | |||| | | | ||||| |||| |    
T  22188691 aacatgattttatactatttgtttttgacactttcgattttttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatat 22188790  T
Q  340 tatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22188791 catgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgtcatc 22188842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Original strand, 22819762 - 22819824
Alignment:
Q  328 gcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcat 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  22819762 gcatagcaatgttatgtctgttaaatctatgaatgttgtgtttatgaagattgattttgtcat 22819824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Original strand, 2566194 - 2566270
Alignment:
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2566194 ttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatcaatgttgtgtttacgaggatt 2566270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34476003 - 34475973
Alignment:
Q  349 taggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34476003 taggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 34475973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 27355610 - 27355659
Alignment:
Q  99 ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  27355610 ggaggaaaacatggatgtgttgaattgaatggggtttcaccacttgtggg 27355659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 39583032 - 39583404
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  39583032 gaagaaggaggcgtatgtgaactttctgattgacccactagatagaagatcgacacttaggcatgcggatgttatagtgtacggatgggtaggaggaaaa 39583131  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||  | | || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39583132 catgcatgcgtggacttgacttaggttttaccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaag 39583231  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  39583232 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttgaccttct 39583331  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
     |||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  39583332 gcatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcatgaatgtcgtgtttacgaggatt 39583404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 53786013 - 53785629
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| || |||| |||||||||  | |||||| | ||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  53786013 gaagaaggaagcgcatgtgaacttcctaactgacccgctagaaataagatcaacactcaggcatgcggatgttttggtgtacggatgggtaggaggaaaa 53785914  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| || |    
T  53785913 catgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactagtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaagg 53785814  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  53785813 tggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttct 53785714  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  53785713 acatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttatgtttacgaggattggttttgccatc 53785629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44199071 - 44198708
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| || || | ||||    
T  44199071 gaagaaggaggtgcctgtgaacttcgtgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcttgtggacattatggtgtatggatgagtaggtggaaaa 44198972  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  44198971 catgttagtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtcaagcaaag 44198872  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  ||||| || ||   |||| || |||||||||    
T  44198871 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgagaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgttgaccttct 44198772  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttt 370  Q
    ||||||| | || | | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44198771 acatagagttcagaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 44198708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7901156 - 7900784
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    ||||    |||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  7901156 gaagaaggagacgcctgtgaactttctgactgactcactagatagaagatcaacaccc--gtat----atgttatggtgtatagatgtgtaggaggaaaa 7901063  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||     
T  7901062 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtaggacggatatccctaaaaactgcgtcaagcaaaa 7900963  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7900962 tagccgaacatgagaaagcgttttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttct 7900863  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
    ||||||| |   || |||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||    
T  7900862 acatagagtttgaaggattatacatagcaatgttatgtttcctaggtccatcaatattttgtttacaatgattagtttt 7900784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Original strand, 52741314 - 52741699
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||  |||||| |||| || |||||||| || | ||||    
T  52741314 gaagaaggaggcgtatgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcagacttgcagatgttgtggtatacggatgggtaggtggaaaa 52741413  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaa-gcttcgtcaagcaaa 206  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||    
T  52741414 catgcttgtgtagacttgactgaggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagtcaaacaaa 52741513  T
Q  207 gtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttc 305  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  52741514 ttgaccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttc 52741613  T
Q  306 tacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||| |||||  || |||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  52741614 tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatttatcttgtattcacgaagatttgttttgccatc 52741699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13582741 - 13582442
Alignment:
Q  80 tatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacag 179  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||| ||| ||||||||     
T  13582741 tatggtgtatggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgaccgaggtttcaacacttgtgggattaggtgtcaggccttttaccgtaggacaa 13582642  T
Q  180 gcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tt 278  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  13582641 gcagccctaaaagctgcgtcaatcaaagtgatcaaacataagaaagtgtgttctgacaatcaacgtgtttttataccatttgttttt-acacttttgatt 13582543  T
Q  279 tcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagat 378  Q
    ||||||||  |    ||| |||||||||||| ||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13582542 tcctagcaccaacaattgttgaccttctacagagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggaccatgaatgttgtgtttacgaagat 13582443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26772899 - 26772690
Alignment:
Q  171 gtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca 270  Q
    |||||||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  26772899 gtaggacatgcatccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaca 26772800  T
Q  271 cttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    ||||||  |||||||||| |||||  | |||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26772799 cttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctatatagagtacaaaggattatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 26772700  T
Q  370 tacgaagatt 379  Q
    ||||| ||||    
T  26772699 tacgaggatt 26772690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38146364 - 38145974
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatgg----tgtatggatgggttggagc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||  | | | |||     |||||  ||| || ||||     
T  38146364 gaagaatgaggtgcttgtgaactttctcactgaccaactagatagaagatcgacacttaggcctgatgttatgatgtacattgtatatatgagtcggagg 38146265  T
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||| |||||||  | |||| |    
T  38146264 aaaatatgcatgtgaggacttgcatggggtttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcatcaatc 38146165  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    ||||||| |||||  |||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||   ||| |||||||||  |||||||||  |||||||| | ||     
T  38146164 aaagtggtcaaacgcgagacaacgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtttaca 38146065  T
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    |||||| |||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38146064 ttctacttagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacgatgattgattttgtcatcta 38145974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 393
Target Start/End: Original strand, 38670887 - 38671069
Alignment:
Q  212 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgt-ttcctagcattagaggttgatgaccttctacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  38670887 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttttggctttctagcatcagaggcggatgaccttctacat 38670986  T
Q  311 agactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    ||| || |||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  38670987 agagtctaaagagttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtgtacgaggattggttttgccatcta 38671069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49018251 - 49017966
Alignment:
Q  24 gtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggact 123  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||  |||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  49018251 gtgaacttcctgactgacccactagatagaagattaacactcaggcatgcagatgttatggtgtacggattggtacgaggaaaacatgcatgtgtaaact 49018152  T
Q  124 tgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||   ||| |||||||||||| ||| || | |||| | ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  49018151 tgactggagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaagtgaccaaacatgagaa 49018052  T
Q  224 agcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctac 308  Q
    || ||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||  |||||||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  49018051 agtgtgttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttctac 49017966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 371
Target Start/End: Original strand, 37132865 - 37133166
Alignment:
Q  70 atgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatac 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || | |  ||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||| | ||| |  ||| ||     
T  37132865 atgtggatattatggtgtacggatgtgtagaaa-aaaacatgcatgtgtagacatgattgaggttttaccacctgtgggattaagtgtcagaccttttat 37132963  T
Q  170 ggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaac 269  Q
     | || |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  37132964 cggagaacagacagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttac 37133063  T
Q  270 acttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgt 368  Q
    |||||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | | || | | | |||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||    
T  37133064 actttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttctaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagttaatgaatgttgtgt 37133163  T
Q  369 tta 371  Q
    |||    
T  37133164 tta 37133166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 46940639 - 46940841
Alignment:
Q  75 gatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa-catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggta 173  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||  | || || ||||    
T  46940639 gatgttatggtgtatggatagataggagcaaaaacatgtatgtgtgaacttgactgaggtttcattactcgtgggattaggggtcgaggattttatggta 46940738  T
Q  174 ggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactt 273  Q
    |||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  46940739 ggacagacaactctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactt 46940838  T
Q  274 ttg 276  Q
    |||    
T  46940839 ttg 46940841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29862101 - 29861949
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  29862101 gaagaaagaggcacatgtgaacttcttgtctggcccactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaa 29862002  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgg 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||    
T  29862001 catgcatgtgtgaacttgactggggtttaaacacttgttagattaggggtcgg 29861949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37992621 - 37992253
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  37992621 tgtgaactttctcactgacccacttgatagaagatggacacttaggtctgtagatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgtgtgtgtggac 37992522  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    ||||  ||||||||| ||||  || | |||| |||||    || ||||||||||||   |||| |  ||| |  ||||| ||||||| |||||||||||     
T  37992521 ttgatcggggtttcatcactcatgagattagaggtcgagatttttacggtaggacatatagccctgcaagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgagg 37992422  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| | |||  |||| |   |||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | | ||     
T  37992421 aagcatgttctgacaatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcactagaggttgttgaccttctacaaagagttc-aag 37992323  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | | | ||| || ||||| ||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  37992322 ggtcatgcacagtaatgtcatgactcgtacgtgcatgaatgttgtgttttcgaagattggttttatcatc 37992253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 54508226 - 54508571
Alignment:
Q  46 tagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    |||||||||| | |||| || || ||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54508226 tagatagaaggttgacatttcggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtagaag-aaaacatgcatgtgtgtacttgattggggtttcaccacttgt 54508324  T
Q  146 gggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgag-aaagcgtgttctgacaatgaaca 244  Q
     || ||||| ||| |   || |||  || |||| |||||| | |||| | |||||| |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  54508325 tggattaggtgtcaggatttttacaataagacaagcagccat-aaagttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaaca 54508423  T
Q  245 tgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatg 343  Q
    || ||||||| | |||| |||| ||| ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||   | |||| ||| | || || |||| | ||     
T  54508424 tgtttttatatcatttgcttttgacatttttgattttctagcaccagaggttgttgaccttctgcataaggtacaaaggatcatgcgtaacaatatcata 54508523  T
Q  344 tctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  54508524 tctgctaggtccatgaatgttgtgtttaagataattggttttgtcatc 54508571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32546901 - 32546715
Alignment:
Q  206 agtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacctt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  | ||| || |||||||    
T  32546901 agtggccaaacatgagaaagcgtgttcggacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccaaaggctgttgacctt 32546802  T
Q  305 ctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||| | ||||   | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  32546801 ctacatagagttcaaaaagtcatgcatagtaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccatc 32546715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5338885 - 5338566
Alignment:
Q  74 ggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggg-gtcggtgcttatacggt 172  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||  |  | |||| ||||||    
T  5338885 ggatgttacggtgtatgaatgggtagaagaaaaacatgcatctgtggacttgatttgggttacaccacttgtgggattagggatttagagcttttacggt 5338786  T
Q  173 aggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt---ctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaac 269  Q
    |||||||  |||| ||| || | |||||| |||| | |||||||||||||||| | |||    ||||| | ||||||||||||||   |||| |||| ||    
T  5338785 aggacagaaagccctaagagttgcgtcaaacaaaattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttatacaatttgcttttgac 5338686  T
Q  270 acttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgt 368  Q
    |||||  | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | |||| | | | || |||||||||  |||||| ||||||   |||||||||||    
T  5338685 actttcggcttcctagcactagagattgttgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcgtagcaatgtcttgtctcataggtc---gaatgttgtgt 5338589  T
Q  369 ttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||| |||| |||||| ||||    
T  5338588 ttacgaggattggttttgccatc 5338566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 391
Target Start/End: Original strand, 3443294 - 3443499
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagc 285  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||| | |||  | || |||||||  ||||||||||    
T  3443294 taaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatgcttttataccattttctgttgacactttcagtttcctagc 3443393  T
Q  286 attagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| | |||| | | | || ||| |||||  |||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3443394 actagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcgtaggaatgtcttgtctcctaaatctatgaatgttgtgtttacgatgattggtttt 3443493  T
Q  386 gtcatc 391  Q
    | ||||    
T  3443494 gccatc 3443499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 309
Target Start/End: Original strand, 7501881 - 7502117
Alignment:
Q  75 gatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtag 174  Q
    ||||||||||| || |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||| |||    
T  7501881 gatgttatggtatacggattggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttaaccagggtttcaccactcgtgggtctaggggtcgg-gctgttacgatag 7501979  T
Q  175 gacaggcagccttaaaag-cttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatg-cttttataacctttgtttttaacact 272  Q
    |||| ||  || ||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| | |||  |||| ||| |    
T  7501980 gacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttcgaacaatcaacatgttttttataccattttcttttgacatt 7502079  T
Q  273 ttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctaca 309  Q
    ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  7502080 tttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctaca 7502117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 26856755 - 26856943
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttg 296  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | || |||| || |||| | |||||||||| |||||  ||    
T  26856755 tcaagtaaaatggtcaaatatgataaagcgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactg 26856854  T
Q  297 atgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagtttt 385  Q
     |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  26856855 ttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgcttgcgaggattggtttt 26856943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4473206 - 4472982
Alignment:
Q  167 tacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgttttt 266  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || || || ||| |||||||   |||||||||    
T  4473206 tacggtaggacagagagccttaaaaattgcgtcaagcaaagtgtcaaaacatgaaaaagcgtgttctaaccatcaatatgtttttatactatttgttttt 4473107  T
Q  267 aacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttg 365  Q
     |||||||  | |||||||||  |||  ||  | |||||||||||| | | ||||  || | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||    
T  4473106 gacactttcggcttcctagcaccaga-attcttaaccttctacataaagttcaaagaatcatgcatagcaatttcatgtctcctaggtctatgaatattg 4473008  T
Q  366 tgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||    
T  4473007 tgtttacgagaattggttttgtcatc 4472982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51234803 - 51234563
Alignment:
Q  112 catgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggc 211  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||  || || ||||| || |||                 
T  51234803 catgtgtggacttgattaaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgagacttttacgataggacaaacaaccctaaaaactgcgt------------- 51234717  T
Q  212 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacat 310  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51234716 caaacatgaaaaagcatgttatgacaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttctacat 51234617  T
Q  311 agactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgtt 364  Q
    ||| | |||| | ||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||    
T  51234616 agagttcaaaaggttatgcataacaatgttatgtctcctaagcccattaatgtt 51234563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 386
Target Start/End: Original strand, 25094666 - 25094754
Alignment:
Q  298 tgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttg 386  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25094666 tgaccttctacatatagttcaaatggtcatgcatagcaatgtaatatcttttaagtccatgaatgttgtgttcacgaagattagttttg 25094754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Original strand, 38978791 - 38978986
Alignment:
Q  197 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggtt 295  Q
    |||||||||| |||  | ||||| |||| ||| || ||||||| || ||| |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||      
T  38978791 gtcaagcaaattggttagacatgtgaaaacgtattttgacaatcaatatgtttttatactatttgtttttgacacttttggtttcctagcacctgaggcc 38978890  T
Q  296 gatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    | |||||||||||||| | | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38978891 gttgaccttctacatatagttcaaaaggtgatgcataacaatgtcatgtctcataggtttatcaatgttgtgtttacgaaaattagttttgccatc 38978986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 52411705 - 52411852
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||| |||  | ||||   |||| ||||    
T  52411705 gaagaaggagacgtttgtgaactttttaactgacccactagatagaagattgacgcttaggcctgcagatgttatgatgtccgaatggacaggaggaaaa 52411804  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggg 155  Q
    | | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52411805 cttacatatgtggactcgactgaggttttaccacttgtgggattaggg 52411852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 381
Target Start/End: Original strand, 4763888 - 4763969
Alignment:
Q  299 gaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattag 381  Q
    ||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4763888 gaccttctacatagagttcaaaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcct-ggtccatgaatgttgtgtttacgaggattag 4763969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 390
Target Start/End: Original strand, 7257701 - 7257742
Alignment:
Q  349 taggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcat 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7257701 taggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcat 7257742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25325156 - 25324961
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacat--gcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttccta 283  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||| | ||| ||| || || |||| |||||  | ||||||| | |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  25325156 taaaagttgcgtcaagcaaagtgacaaaacattataaaacgtattttggcaatcaacatatgtttttataccatttgctttcaacactttcgatttccta 25325057  T
Q  284 gcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||  | || ||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| | || || ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  25325056 gcaccatagattgttgaccttctacatagagttcaaatgatcatgcatagcaatgtcaagtttcctaaatccatgaatattgtgcttacgatgatt 25324961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Original strand, 52411903 - 52412059
Alignment:
Q  217 atgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagact 315  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||| |||||||  | || ||| || |||| || | |||||||||||||||| |    
T  52411903 atgagagagcgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttcagctttctaacactagatgtcgttgaccttctacatagagt 52412002  T
Q  316 ccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttac 372  Q
     |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||  |||| ||| ||||||||||    
T  52412003 tcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagacccataaatattgtgtttac 52412059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35236413 - 35236302
Alignment:
Q  105 aaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||   ||| || ||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |    
T  35236413 aaacatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccacctgtgggattagggatcgagccttttatggtaggataggtagctctaaaagttgcgtcaagta 35236314  T
Q  205 aagtggccaaac 216  Q
    || || ||||||    
T  35236313 aaatgaccaaac 35236302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44858 - 44781
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgt 366  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  44858 agaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Original strand, 53502591 - 53502639
Alignment:
Q  341 atgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtca 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  53502591 atgtctcttaggtgcatgaatgttgtgtttacgaaaattgattttgtca 53502639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Original strand, 4669788 - 4669838
Alignment:
Q  329 catagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4669788 cataacaatgtcatgtctccttggtccatgaatgttgtgtttacgatgatt 4669838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 45676778 - 45676828
Alignment:
Q  196 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatg 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45676778 cgtcaagcaaagtgaccaagcataagaaaacgtgttctgacaatcaacatg 45676828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Original strand, 26393812 - 26393861
Alignment:
Q  330 atagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26393812 atagcaatattatgtctccttggtctatgaatgttgtgtttacgaggatt 26393861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28225289 - 28224920
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28225289 tgtgaactttctgacttacccactagatagaatatcgacacttaggcctacggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggac 28225190  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28225189 ttgaatggggtttcactacttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaatatgaga 28225090  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  28225089 aagcgtattctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaag 28224990  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||  |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  28224989 gattatgcatgacaatattatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttatgaagatttgttttgccatc 28224920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44686722 - 44686348
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||   |||  |||||  ||||    
T  44686722 gaagaaggaggggcctgtgaactttgtgactgatctactagatagaagattgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacaaatgt-ttggacgaaaa 44686624  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||| |    
T  44686623 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacgataggacagacagtcctaaaagc-tggtcaagcaatg 44686525  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctga----caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||   || | |||| |||||||  | |||||||||| |||| ||| |||||    
T  44686524 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatcaacatgcttttatattgttcgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagtttgttgacc 44686425  T
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44686424 ttctacatagattccaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgaggatt 44686348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 369
Target Start/End: Original strand, 4412869 - 4413231
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  4412869 gaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaa 4412968  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  4412969 catgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtcaagcaaag 4413068  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  4413069 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgttgaccttct 4413168  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    ||||||  | |||| | | | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4413169 acatagggttcaaaaggtcatgcatagcaaagtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 4413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27502665 - 27502294
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27502665 gaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatgcaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaa 27502566  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||   | || |||||||| ||||||||||||    
T  27502565 catgcatgtgtggacctgaatggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggaca-ataaccctaaaagctgcgtcaagcaaag 27502467  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||   ||  ||||| ||||||| |  |||||||||| | |   || |||||||||    
T  27502466 tggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcctagcatcatatactgttgaccttct 27502367  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27502366 acatagaatccaaagggttatgcatagcaatatcatgtctcctagatctatgaatgttgtgtttacgaagatt 27502294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 41867711 - 41868090
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||  ||||||| || | ||||    
T  41867711 gaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaa 41867810  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41867811 catgcttgtgtagacttgactgagatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtcaagcaaag 41867910  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  | |||||||||  ||||| || |||||||||    
T  41867911 tggtcaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgttgaccttct 41868010  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttg 386  Q
    ||||||| | |||| | | | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41868011 acatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttg 41868090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17344942 - 17344570
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  17344942 gaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaa 17344843  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |  ||| ||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||| || |    
T  17344842 catgcatgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtcaagtaagg 17344743  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttct 306  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  | ||| || |||||||||    
T  17344742 tggccaaacacgagaaaacgtgttttcacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttgaccttct 17344643  T
Q  307 acatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    ||||||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17344642 acatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggatt 17344570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 23484741 - 23485118
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||| ||||| | | |||   |||||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  23484741 gaagaaggaggcgtctgtgaacttcctgattgacctactatatagaagatcaacactcaagcatgcatatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaa 23484840  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaag 207  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  ||||| |||||   |||| |||||||| |||||| |||||    
T  23484841 catgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaag 23484940  T
Q  208 tggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttcta 307  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |   ||||| |  ||    
T  23484941 tggccaaatatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttctgtttcctagcaccaga-gacaatgacttctta 23485039  T
Q  308 catagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttg 386  Q
    |||||| | |||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  23485040 catagagttcaaaagatcatgcataacaatgctatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacaaaaattggttttg 23485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Original strand, 9685233 - 9685590
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||  ||   |  |||||||||    |||||| || | ||||||||  ||||| |||    
T  9685233 tgtgaacttcctgactgacccactagatagaaggtcaacactcaggcctgcaaacattatggtgtgcatatgggtaggtggaaaacatgattgtgtagac 9685332  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9685333 ttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaaa 9685432  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||| | ||||     
T  9685433 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttctatatagagttcaaaa 9685532  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt 379  Q
    | | | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9685533 ggtcatggatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacaaagatt 9685590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5532697 - 5532418
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggt 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   | || ||  |||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| || || ||    
T  5532697 tgactgacccactagatagaagatcgacatcgaagtctgcagatgttatagtgtatggactggtaggagaaaaacatgcatgtgtgaacttaaccggagt 5532598  T
Q  134 ttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    |||||||||  | || ||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  5532597 ttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttgt 5532498  T
Q  234 gacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||  |||| ||||||| | |||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||    
T  5532497 gacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacactttagcttcctagcaccataggttgttgagcttctacataga 5532418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 19161614 - 19161970
Alignment:
Q  36 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 135  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  19161614 actgacccattagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatgatgtaaggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgaatagggttt 19161713  T
Q  136 caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 235  Q
    ||||||||||| | ||||  ||| |  ||| || |||||||||  || || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19161714 caccacttgtgagattagatgtcaggccttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaagtgggcaaacatgaaaaagcgtgttctga 19161813  T
Q  236 caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagc 334  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||| |||| |||||||  ||||  || || |||||| || | ||||| |||||||| | |||| | | | ||||| |    
T  19161814 caatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggttttgtaacactagaggctgcttaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatatc 19161913  T
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  19161914 aatgtcatgtctcctaggtcaatgaatagtgtgttttcgaggattgattttgtcatc 19161970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3826016 - 3825646
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||   ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  3826016 tgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacctttatgcttgtggatgttaaggtgtacaaatgagtaggagaaaaacatgcatgtgtggac 3825917  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||| ||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3825916 ttgattgaggtttcaccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaaa 3825817  T
Q  223 aagcgtgtt-ctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaa 320  Q
    |||  | || ||||||||  ||||| ||||||  | |||| ||   |||||||   ||||||||||| | |||||| |||||||| |||| || | ||||    
T  3825816 aagttttttcctgacaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgaccttcaacatcgagttcaaa 3825717  T
Q  321 tgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
      || | |||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3825716 gaatcatgcatagcaatgtcatgtcttctaggaccataaatgttgtgtttatgaagatcgattttgtcatc 3825646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 371
Target Start/End: Original strand, 18744783 - 18745121
Alignment:
Q  34 tgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggt 133  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||  || || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18744783 tgactgacccgctagaaagaatatcaacactcaggcctgcgggtgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggt 18744882  T
Q  134 ttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||| |||  ||||| |||| | |||||  |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18744883 ttcaccacttgtgggattaggtgtcaggccatttaccgtaacacaggaagcccttaaagcagcgtcaagttaggtggccaaacacgagaaagcgtgttct 18744982  T
Q  234 gacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcata 332  Q
    |||||| ||||| |||||||| | |||| |||| ||| ||| | ||| ||||||  | ||| || || ||||||||||||| | |||| ||| | |||||    
T  18744983 gacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacattttcgattttctagcaccataggctgttggccttctacatagagttcaaaagatcatgcata 18745082  T
Q  333 gcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    ||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  18745083 gcaatgtcatatttcctaggtctatgaatgttgtgttta 18745121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Original strand, 20142614 - 20142755
Alignment:
Q  79 ttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggaca 178  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||   ||| ||| ||||||||    
T  20142614 ttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgattggggcttcaccacttgtgggattaggtgtcgtaccttttaccgtaggaca 20142713  T
Q  179 ggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatga 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142714 ggcagctctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatga 20142755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 393
Target Start/End: Original strand, 16351657 - 16352033
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| | |||  |||||||||| || | ||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16351657 tgtgaactttttgactgacttactatatagaagatcaacacttagatctgtaaatgttatggtatacgaatgggttggaagacaacatgcatgtgtagac 16351756  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtag---gacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatg 219  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||  ||| | ||||| |  | |||| |||   ||||| ||  | |||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  16351757 ttgac-agagtttcaccatttgtggaattatgtgtcggagtatttacgataggtagacagacaatcctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatg 16351855  T
Q  220 agaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgttt-----cctagcattagaggttgatgaccttctacatagac 314  Q
    |||||  ||||||| ||||| |||||  |||||||   |||| |||| ||| ||||||||       || ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  16351856 agaaaatgtgttctcacaatcaacataattttatattgtttgcttttgaca-ttttgtttggctctttatcatcagaggttgttgaccttctacatagag 16351954  T
Q  315 tccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    | |||||| | | ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  16351955 ttcaaatggtcatgcacaacaatgtcatgtctcttaggtacatgaatattatgtttacgatgattgtttttgccatcta 16352033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 353
Target Start/End: Original strand, 34814803 - 34814967
Alignment:
Q  189 aaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttgtttcctagcatt 288  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||  ||||||| | |||||| ||      
T  34814803 aaagcttcgtcaaataaagtgatcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcggttcctaacacc 34814902  T
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggt 353  Q
    ||||  || |||||||||||||||| | |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34814903 agagactgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcataacaatgttatgtctcttaggt 34814967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 13146937 - 13147077
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||  ||||    
T  13146937 gaagaatgaggcgtctgtgaacttcctgattaacccactagatagaagatcgacatttaggcatgtagatgttatggtgtacgcatgggtaggaagaaaa 13147036  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13147037 cacggatgtgtgaacttgactgtggtttcaccacttatggg 13147077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2888764 - 2888518
Alignment:
Q  60 acacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcg 159  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||   ||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | || ||||||||||    
T  2888764 acacttaggtctgcagatgttatggtatacatatgggtaagaggtaaacatgcatgtgtggacttaactggaatttcgccacttataggattaggggtcg 2888665  T
Q  160 gtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctt 259  Q
    |   ||||  |||||  ||  || || |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||    
T  2888664 ga--ttat--ggtagtgcaaacaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatt 2888569  T
Q  260 tgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctaca 309  Q
     |||| | |||||||| | |||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  2888568 cgtttatgacacttttggcttcctaacacaagaggttgttgaccttctaca 2888518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9675148 - 9675001
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||  | || ||| |||||||||||||||  |||  ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||    
T  9675148 gaagaatgaggcgcctgtgaactttctgaccgaccgattaaataaaagatcgacacttagacatgcagatgttatgatgtacgaatgagtaggaggaaaa 9675049  T
Q  108 catgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggg 155  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9675048 catgcatgtatgaacttgattggggtttcaccactcatgggattaggg 9675001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 10579597 - 10579719
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    ||||||||| ||| |||||  || |||| |||||||||||||||||       ||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10579597 tgtgaacttcttgtctgacctaccagatggaagatcgacacttaggccaacaaatgttatggtgtacgagtgggtaggaggaaaacatgcatttgtggac 10579696  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10579697 ttgactggggtttcaccacttgt 10579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13413373 - 13413291
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | |||| | | | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13413373 agaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 13413291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Original strand, 1296032 - 1296099
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||    
T  1296032 taaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatgtttttata 1296099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 239
Target Start/End: Original strand, 13147088 - 13147131
Alignment:
Q  196 cgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaat 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147088 cgtcaagaaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaat 13147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29808280 - 29808073
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| | || |||||| |  | | || ||  |||||| || || | ||||||| | | |||||     
T  29808280 aaaacatgcatttgtgaatttgattggggtttcaccacttattggattagggtt--gagattttattgtaggatagtcaactttaaaagttgcctcaagt 29808183  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacact-tttgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||| | |||| |||| ||| | ||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  29808182 aaagtcaccaaacatgagacagcgtgttataacaatcaacatg-ttttataccatttgcttttcacattatttatttcctagcatcggaggttgttgacc 29808084  T
Q  303 ttctacataga 313  Q
    || ||||||||    
T  29808083 ttttacataga 29808073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 7760740 - 7760789
Alignment:
Q  99 ggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtggg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7760740 ggaggaaaacatacatgtgtgaacttgactagggtttcaccacttgtggg 7760789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27494292 - 27494231
Alignment:
Q  330 atagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  27494292 atagcaatgttatgtctcctaagtctatgaatattgtgtttacgaatattggttttgccatc 27494231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 276
Target Start/End: Original strand, 33612462 - 33612618
Alignment:
Q  120 gacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgt-caagcaaagtggccaaacat 218  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||   |||  || ||||||||| ||| || |||||||  ||| |||||||| |||  ||||||    
T  33612462 gacttgactgaggtttcaccgcttgtgggagtaagggtctaggctattatggtaggacatgcaaccctaaaagccacgtgcaagcaaaatggt-aaacat 33612560  T
Q  219 gagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg 276  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||| ||| |||||||||    
T  33612561 gagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacacttttg 33612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 393
Target Start/End: Original strand, 44684955 - 44685047
Alignment:
Q  301 ccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatcta 393  Q
    ||||||||||||| | |||| | | | ||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  44684955 ccttctacatagagttcaaagggtcatgcataacaatattatgtcttataagtccatgaatgttgtgtttatgagaattagttttttcatcta 44685047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 391
Target Start/End: Original strand, 2886632 - 2886802
Alignment:
Q  222 aaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaa 320  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| | | |||  |||||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||| | ||||    
T  2886632 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagaggctgttgatcttttacatagagttcaaa 2886731  T
Q  321 tgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagatt-agttttgtcatc 391  Q
     ||  | |||||||||| | || |||| | ||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  2886732 agagcatgcatagcaatatcatatctcgt-ggtccataaatgttgtgtttatgaggattgatttttgtcatc 2886802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44720448 - 44720242
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca--cttttgtttcctag 284  Q
    |||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||  |||||||   ||||| ||||||     
T  44720448 taaaagccgcgtcaagtaagatggccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgtttttataccgtttgaatttaacatttttttgcttcctaa 44720349  T
Q  285 cattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttt 384  Q
    ||  |||||||| | || || |||||| | | |||| ||| | ||||| |||| || | |||| ||||||||| |||  |||||||||||   || ||||    
T  44720348 caccagaggttgttcactttttacataaagttcaaaggatcatgcataacaatattttatctcataggtccataaataatgtgtttacgagatttggttt 44720249  T
Q  385 tgtcatc 391  Q
    |||||||    
T  44720248 tgtcatc 44720242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Original strand, 7760930 - 7761016
Alignment:
Q  289 agaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaa 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||| ||||||| || || || ||||| |||| |||||||    
T  7760930 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcgtagcaatgtgatgtctcataagttcaagaatgatgtgcttacgaa 7761016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 354
Target Start/End: Original strand, 20142753 - 20142875
Alignment:
Q  233 tgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcat 331  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||  |||| |||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||| | |||| | | |  |||    
T  20142753 tgacaatcaacatgcttttataccattttcttttgacacttttggttttctagcatcaaaggttgttgaccttatacatagagttcaaaaggtcatacat 20142852  T
Q  332 agcaatgttatgtctcttaggtc 354  Q
    | |||||| ||||||| ||||||    
T  20142853 aacaatgtcatgtctcctaggtc 20142875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24765243 - 24765181
Alignment:
Q  329 catagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| ||||    
T  24765243 cataacaatgtcatgtctcttaggtccatgaatgttctggttatgatgattaattttggcatc 24765181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 254
Target Start/End: Original strand, 3968402 - 3968458
Alignment:
Q  198 tcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||    
T  3968402 tcaagcaaagtggtcaaatatgagaaaacatgttttgacaatcaatatgcttttata 3968458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33554 - 33170
Alignment:
Q  8 gaagaatgaggcgcttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaa 107  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33554 gaagaaggaggcgcctgtgaacttcttgactgcct-actagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaa 33456  T
Q  108 cat--gcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaa 205  Q
    |||  |||||||   |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |   | ||||||||    
T  33455 catatgcatgtgcaaacttgattggggtttcaccacttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaaccttaaa-gtggcatcaagcaa 33357  T
Q  206 agtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctagcattagaggttgatgacctt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||  |||| ||| ||| | ||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  33356 agtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgacctt 33257  T
Q  305 ctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||||||| | |||| | | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  33256 ctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaattttatgtctcctaggtccatgaacgtcgtgtttacgaggattgattttgtcatc 33170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6541 - 6279
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagc 203  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| | |||||||     
T  6541 aaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggg-tcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaagt 6443  T
Q  204 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctagcattagaggttgatgacc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| |||||||  |||||||||||  ||||| || |||||    
T  6442 aaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgacc 6343  T
Q  303 ttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgt 366  Q
    ||||||||||| | |||| | | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6342 ttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 2 - 371
Alignment:
Q  23 tgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggac 122  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||   | |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||    
T  2 tgtgaacttcctgactgacccactagatagatgatcaacacgcaggcccgcggatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtatagac 101  T
Q  123 ttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  102 ttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggccttttactgtaggacaggcagccctaaaaactgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaga 201  T
Q  223 aagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaat 321  Q
     || | ||| |||| || |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||| |||| |  | |||||| ||||||||| |||| | | ||||     
T  202 cagtgggttatgaccatcaacatgcttttataccatttgtgtttgacacttttggttttctagtaccaaaggttgttgaccttctgcataaagttcaaaa 301  T
Q  322 gattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
      | |  ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  302 agtcatacatagcaatgtcatgtctcctagatcgatgaacgttgtgtttacgaggattagttttgccatc 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 103246 - 103026
Alignment:
Q  171 gtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaaca 270  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  103246 gtaggacaggcagccctcaaagctgcgtcaagtaagatggccaaacacgagaaagcgtgt-ctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaca 103148  T
Q  271 cttttg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacatagactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtt 369  Q
    |||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||   |||| | | | ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  103147 ctttcggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatcgagctcaaaaggtcatgcataacaatgtcgtgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 103048  T
Q  370 tacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| |||| |||||| ||||    
T  103047 tacgaggattggttttgccatc 103026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 274
Target Start/End: Original strand, 47377 - 47608
Alignment:
Q  43 cactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccact 142  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||   ||| ||  ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47377 cactaaatagaagatcaacacttagggatgcaaatgttatggtgtacaaatgagtatgagaaaaaaatgcaagtgtggacttgattggggtttcaccact 47476  T
Q  143 tgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaa 242  Q
    |||||| |||||| | |   ||| ||||||||||||   |  | |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  47477 tgtgggattagggattgagacttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagttaa 47576  T
Q  243 catgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    |||  ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  47577 catatttttataccatttgcttttaacacttt 47608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10364
Alignment:
Q  130 gggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 229  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||| || ||||| |||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  10546 gggtttcaccactcgtgggattaggggttggggcttttacagttggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgtg 10447  T
Q  230 ttctga----caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactt-ttgtttcctagcattagaggttgatgaccttcta 307  Q
    ||||||    |||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||| | | |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10446 ttctgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttcta 10364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19916
Alignment:
Q  25 tgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgtggatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtg 117  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  20008 tgaacttcttaactgacccactagatagaagatgaacacttagacctgtagatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtg 19916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 313
Target Start/End: Original strand, 18235 - 18473
Alignment:
Q  75 gatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtag 174  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||   ||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||| || | |||    
T  18235 gatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatag 18334  T
Q  175 gacaggcagccttaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    ||||  || || |||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  | | || |||| |||||||    
T  18335 gacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttt 18433  T
Q  275 tg-tttcctagcattagaggttgatgaccttctacataga 313  Q
    || ||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18434 tgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacataga 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 296
Target Start/End: Original strand, 8416 - 8608
Alignment:
Q  105 aaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtcaagca 204  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||  | | ||| ||||  || || ||||| ||| |||| |||||| | |||| ||    
T  8416 aaacatgcatgtttggactggactggggtttccccacttgtaggattgagagacggggctttcactgtgggacaagcaaccttcaaagctgcttcaaaca 8515  T
Q  205 aagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttg 296  Q
    |  |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8516 atttggttgaacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagcactagaggttg 8608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49622 - 49449
Alignment:
Q  104 aaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggt----gcttatacggtaggacaggcagccttaaaagcttcgtc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| | | |   |||| |||||| |||||| | | ||    
T  49622 aaaacatgcatgtgtggacttgattgag-tttcactacttgtgggattaggggtcggtcagagcttttgcagctagacaagcagccctaaaagttgcatc 49524  T
Q  200 aagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt 274  Q
    || |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||| |||||||    
T  49523 aaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacacttt 49449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7701 - 7523
Alignment:
Q  213 aaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacactttt-gtttcctagcattagaggttgatgaccttctacata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||| |||| |||||||  ||||||||||   |||| ||| ||||||| | ||||    
T  7701 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgaccttttgcata 7602  T
Q  312 gactccaaatgattaagcatagcaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    |  | |||| | | | |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  7601 gcgttcaaaaggtcatgcatat-aatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggttttgtcatc 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16259 - 16192
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttata 254  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||    
T  16259 taaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaataaacatgtttttata 16192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 391
Target Start/End: Original strand, 4378 - 4434
Alignment:
Q  335 aatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgtcatc 391  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4378 aatgtcatgtctcataagtccataaatgttgtgtttacgaatattggttttgtcatc 4434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Original strand, 4322 - 4366
Alignment:
Q  187 taaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtt 231  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4322 taaaagctacgtcaaacagagtggccaaacatgagaaaacgtgtt 4366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 371
Target Start/End: Original strand, 17415 - 17444
Alignment:
Q  342 tgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17415 tgtctcttaggtccatgaatgttgtgttta 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 52663 - 52700
Alignment:
Q  350 aggtccatgaatgttgtgtttacgaagattagttttgt 387  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  52663 aggtccatgaatattgtgtttatgaagattagttttgt 52700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University