View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9229_low_4 (Length: 696)

Name: NF9229_low_4
Description: NF9229
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9229_low_4
NF9229_low_4
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (9-682)||(15015837-15016510)
chr1 (25-682)||(15000831-15001486)
chr1 (196-682)||(15009437-15009920)
chr1 (144-682)||(15023554-15024089)
chr1 (196-682)||(15030535-15031018)
chr1 (427-677)||(14534528-14534778)
chr1 (439-682)||(15035310-15035553)
chr1 (439-674)||(14501995-14502227)
chr1 (25-365)||(15036059-15036399)
chr1 (9-407)||(15024114-15024512)
chr1 (9-407)||(15031455-15031853)
chr1 (527-679)||(14465883-14466035)
chr1 (180-423)||(15031007-15031250)
chr1 (144-407)||(14533597-14533860)
chr1 (180-407)||(14533777-14534004)
chr1 (25-273)||(15010131-15010379)
chr1 (144-407)||(15031167-15031430)
chr1 (442-679)||(14480778-14481027)
chr1 (196-423)||(15009909-15010136)
chr1 (472-677)||(14524596-14524798)
chr1 (197-407)||(15023970-15024180)
chr1 (197-407)||(15031311-15031521)
chr1 (152-273)||(15009915-15010036)
chr1 (152-273)||(15031013-15031134)
chr1 (311-407)||(15036161-15036257)
chr1 (286-419)||(14503111-14503244)
chr1 (311-423)||(15010125-15010237)
chr1 (180-269)||(15009703-15009792)
chr1 (180-269)||(15030801-15030890)
chr1 (322-389)||(14523510-14523577)
chr1 (144-269)||(14503117-14503242)
chr1 (167-264)||(14533908-14534005)
chr1 (167-215)||(14481606-14481654)
chr1 (180-272)||(14523512-14523604)
[»] scaffold0400 (7 HSPs)
scaffold0400 (442-682)||(5285-5525)
scaffold0400 (439-683)||(10783-11024)
scaffold0400 (167-355)||(11540-11728)
scaffold0400 (144-407)||(11776-12039)
scaffold0400 (167-353)||(11686-11872)
scaffold0400 (103-200)||(5695-5792)
scaffold0400 (144-218)||(11533-11607)
[»] scaffold0365 (7 HSPs)
scaffold0365 (442-682)||(5929-6169)
scaffold0365 (439-683)||(11426-11667)
scaffold0365 (167-355)||(12183-12371)
scaffold0365 (144-407)||(12419-12682)
scaffold0365 (167-353)||(12329-12515)
scaffold0365 (103-200)||(6339-6436)
scaffold0365 (144-218)||(12176-12250)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (527-599)||(16023082-16023154)
chr7 (527-599)||(16101174-16101246)
chr7 (527-599)||(16170852-16170924)
chr7 (532-596)||(17847267-17847331)
chr7 (527-599)||(14603611-14603683)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 630; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 630; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15016510 - 15015837
Alignment:
Q  9 agcagagaatttttccaacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15016510 agcagagaatttttccaacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattattatcatacaaatcgagtgctttcaaatcggtaagc 15016411  T
Q  109 ctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15016410 ctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagaatttgagaaaagagataatctaatgagttttgtcatgtttccaatagtgaaaggaattggttcag 15016311  T
Q  209 agagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016310 agagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccggtgagatcatttgagtaaagatatagtat 15016211  T
Q  309 attgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatggat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016210 attgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatggat 15016111  T
Q  409 agtggtattggtccaaaaagattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgt 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15016110 agtggtattgatccaaaaagattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaatgccgtacaggaagttgt 15016011  T
Q  509 ttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatgga 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016010 ttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatgga 15015911  T
Q  609 ttttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15015910 ttttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 15015837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15001486 - 15000831
Alignment:
Q  25 aacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagcctattaatttctgttg 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15001486 aacttcccaccgttacaaatattgtgaggtaaatgaccaacaaaattattatcagataaatggagtacttccaaatctgtaagcctattcatttctgttg 15001387  T
Q  125 gaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatga 224  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||   |      
T  15001386 gaatattctcacggaaagaatttgagaaaagatataatttacggagttttgtcatatttccaacagtggaaggaattggtccagagagacttttcatt-- 15001289  T
Q  225 aaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaa 324  Q
    |||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||| | |  | | ||||| || |||    
T  15001288 aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaa 15001189  T
Q  325 tttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatggatagtggtattggtccaa 424  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||     
T  15001188 tttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgggattgactcag 15001089  T
Q  425 aaagattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggt 524  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  15001088 cgagattgttaaccgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaactccgtgcaagaagttgtttgttaaaactaaggt 15000989  T
Q  525 acggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatca 624  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||    
T  15000988 gtggatttttgtaagtgatgagaaattgagagtttgaagcgtaccttttagtccaatattggtgagatttatcatgttgatggattttgattgataatca 15000889  T
Q  625 catgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15000888 cacgtgattccttcccaactactacaaggattattgccaatccatgaagagagcaatg 15000831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 196 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15009920 - 15009437
Alignment:
Q  196 ggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagt 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || | ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |    
T  15009920 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15009821  T
Q  296 aaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaa 395  Q
    ||| ||| | |  | | || || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15009820 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15009721  T
Q  396 attacctatggatagtggtattggtccaaaaagattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccg 495  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15009720 attacctatggatggtgggattgacccaaagagattgttaatcgacaaattaagagttttgagactagacatctctccaatttggtgtggaacaactccg 15009621  T
Q  496 tacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagattta 595  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15009620 tacaagaagttgtttgttaaaactaaagtgtggatttttggaagtgatgagaagttgagactctgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagattta 15009521  T
Q  596 ccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15009520 ccttgttgatggacttcgattcataatcacacgtgattccttccca---accacaaggattattaccaatccatgaagagagaaatg 15009437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 144 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15024089 - 15023554
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| || |  || ||||    
T  15024089 atttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaa 15023990  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaa 343  Q
    || || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||| | |  | | ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15023989 ttgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaa 15023890  T
Q  344 gtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatggatagtggtattggtccaaaaagattgttaatcgacaa 443  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15023889 ttggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatactatccaaattaatcaaattacctatggatggtgggattgacccaaagagattgttaatcgacaa 15023790  T
Q  444 atcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgat 543  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  15023789 attaagagttttcagactagacatctctccaatatggtgtggaataactccatacaaggagttgtttgttaaaactaaggtgtgtattttcggaagtgat 15023690  T
Q  544 gagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagc 643  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||      
T  15023689 gagaaattgagactttgaagagtaccgtttaatccaatattggtgagatttaccttgttgatggacttcgattcataatcacacgtgattccttccca-- 15023592  T
Q  644 tactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15023591 -accacaaggattattaccaatccatgaagagagaaatg 15023554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 196 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15031018 - 15030535
Alignment:
Q  196 ggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagt 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || | ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |    
T  15031018 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15030919  T
Q  296 aaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaa 395  Q
    ||| ||| | |  | | || || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15030918 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15030819  T
Q  396 attacctatggatagtggtattggtccaaaaagattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccg 495  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15030818 attacctatggatggtgggattgacccaaagagattgttaatcgacaaattaagagttttgagactagacatctctccaatttggtgtggaacaactccg 15030719  T
Q  496 tacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagattta 595  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15030718 tacaagaagttgtttgttaaaactaaagtgtggatttttggaagtgatgagaagttgagactctgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagattta 15030619  T
Q  596 ccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15030618 ccttgttgatggacttcgattcataatcacacgtgattccttccca---accacaaggattattaccaatccatgaagagagaaatg 15030535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 427 - 677
Target Start/End: Original strand, 14534528 - 14534778
Alignment:
Q  427 agattgttaatcgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtac 526  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||      
T  14534528 agattgttaactgacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaactccgtacaagaagttgtttgttaaaactaaagtgt 14534627  T
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcaca 626  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||    
T  14534628 ggatttttgtaagtgatgagaaattgagactttgaagcgtaccttttagtccaatatcagtgagatttaccttgttgatggactttgatttataatcaca 14534727  T
Q  627 tgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagag 677  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14534728 cgtgattccttcccaactactacaaggattattgccaatccatgaagagag 14534778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 439 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15035553 - 15035310
Alignment:
Q  439 gacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaa 538  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||| || ||||| | | ||||| | |||||||||||  |    | ||| ||||    
T  15035553 gacaaatcaagagtttctagattggacattacaccaatatggtgtggaactacaccgtagaaggagttgctgcttaaaactaaacttttcaatttcggaa 15035454  T
Q  539 gtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttc 638  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15035453 gtgatgagaaattgagagtttgaagcgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttc 15035354  T
Q  639 ccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15035353 ccaactactacaaggattattaccaatccatgaagagagcaatg 15035310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 14502227 - 14501995
Alignment:
Q  439 gacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaa 538  Q
    |||||||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||| | || || |   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14502227 gacaaatcaagagtgtctaggtttgacatcactccaatatggtgtggaacagctccatagaatgagttgttttttaaaactaaggtgcggatttttggaa 14502128  T
Q  539 gtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttc 638  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14502127 gtgatgataaattgagactttgaagcgtaccttttagtccaatatcagtgagatttaccttgttgatggattttgaatcattatcacatgtgattccttc 14502028  T
Q  639 ccagctactacaaggattattaccaatccatgaaga 674  Q
    |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14502027 cca---actacaaggattattaccattccatgaaga 14501995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15036399 - 15036059
Alignment:
Q  25 aacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagcctattaatttctgttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  15036399 aacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaaatgaccaataaatttattatcatataattcgagtacttccaaatccgtaagcctattcatttctgctg 15036300  T
Q  125 gaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatga 224  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| ||||| | ||||  | |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15036299 gaatattctcagtgagagaatttgataaaagagttaatgcactgagttttgtcaaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtga 15036200  T
Q  225 aaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaa 324  Q
    ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||| |  | | | ||| || |||    
T  15036199 aaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttccagtgagagcatttgagtaaattaataattcactcactttggttaaa 15036100  T
Q  325 tttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttc 365  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  15036099 tttccaatagtggaaggaattggtccagagagtttattttc 15036059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15024512 - 15024114
Alignment:
Q  9 agcagagaatttttccaacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagc 108  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15024512 agcagtgaatttttttatcttcccaccgacacaaatattgtgaggtaaatgaccaacaaaattattaacatctaaatggagtgcttccaaatcggtaagc 15024413  T
Q  109 ctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||   ||||    | |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15024412 ctattcatttctgttggaatattctcagtgagagaattaaatgaaagatgtaattcgctaagttttgtcaaatttccgatagtggatggaattggtccag 15024313  T
Q  209 agagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtat 308  Q
    |||||||||| | ||||||| |||    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||  || | |    
T  15024312 agagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacgccaagagttaattt 15024213  T
Q  309 attgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
    | | | |||||| |||||||| ||  || || ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15024212 actcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatgga 15024114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15031853 - 15031455
Alignment:
Q  9 agcagagaatttttccaacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagc 108  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15031853 agcagtgaatttttttatcttcccaccgacacaaatattgtgaggtaaatgaccaacaaaattattaacatctaaatggagtgcttccaaatcggtaagc 15031754  T
Q  109 ctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||   ||||    | |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15031753 ctattcatttctgttggaatattctcagtgagagaattaaatgaaagatgtaattcgctaagttttgtcaaatttccgatagtggatggaattggtccag 15031654  T
Q  209 agagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtat 308  Q
    |||||||||| | ||||||| |||    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||  || | |    
T  15031653 agagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacgccaagagttaattt 15031554  T
Q  309 attgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
    | | | |||||| |||||||| ||  || || ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15031553 actcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatgga 15031455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 527 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 14466035 - 14465883
Alignment:
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcaca 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  14466035 ggatttttggaagtgatgagaaattgagagtttgaagcgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgtagattgattttgattcatcatcaca 14465936  T
Q  627 tgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagta 679  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465935 tgtgattccttcccaactactacaaggattattaccaatccatgaagagagta 14465883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15031250 - 15031007
Alignment:
Q  180 atttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccg 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||     
T  15031250 atttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtcca 15031151  T
Q  280 gtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatag 379  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||    
T  15031150 gtgagagcatttaaataaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagg-gaaaag 15031052  T
Q  380 t-atccaaattaatcaaattacctatggatagtggtattggtcca 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15031051 taatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaattggtcca 15031007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 407
Target Start/End: Original strand, 14533597 - 14533860
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  14533597 atttgagaaaagtgataatgaattaagttttgtcaaatttccgatagtggaaggaattggtccagagagtttattttctgaaaggtaaatagtatccaaa 14533696  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaa 343  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| | |||| ||| |||| | | ||| || |||||||| | |||| ||||||    
T  14533697 ttaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgttaaatttccaacagtggaaggaa 14533796  T
Q  344 gtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
     ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14533797 ttggtctagagagtttattttctgaaaggtcaatagtatccaaattaaccaggttacctatgga 14533860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 407
Target Start/End: Original strand, 14533777 - 14534004
Alignment:
Q  180 atttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccg 279  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14533777 atttccaacagtggaaggaattggtctagagagtttattttctgaaaggtcaatagtatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgtccg 14533876  T
Q  280 gtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatag 379  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |   ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  14533877 gtgagagcatttgaggaaagatataacactgtgagttttgtcaaatttccgatagtagaaggaagtggtccagagattttattgtccgaaaggtcaatag 14533976  T
Q  380 tatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  14533977 tatctaaattgaccaatttacctatgga 14534004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15010379 - 15010131
Alignment:
Q  25 aacttcccaccgacacaaatattatgaggtaaatgaccaacaaaattaatatcatacaaatcaagtgctttcaaatcggtaagcctattaatttctgttg 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15010379 aacttcccaccaacacaaatattgtgaggtaaatgaccaacaaaaatattatcagataaatggagtacttccaaatcgataagcctattcatttctgttg 15010280  T
Q  125 gaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatga 224  Q
    ||||||||| ||||| || |||  |  ||||   || |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15010279 gaatattctcagtgagagaattaaatgaaagatgtatttcactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtga 15010180  T
Q  225 aaggtaaagagt-atgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatt 273  Q
    |||| ||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15010179 aagggaaa-agtaatccaaattagtcaaattacctatggaaggtggaatt 15010131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15031430 - 15031167
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| || |  || ||||    
T  15031430 atttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaa 15031331  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaa 343  Q
    || || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||| | |  | | ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15031330 ttgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaa 15031231  T
Q  344 gtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15031230 ttggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatgga 15031167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 14481027 - 14480778
Alignment:
Q  442 aaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtg 541  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||  | |||||||||| ||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  14481027 aaatcaagagtgttcagattggacattacaccaatatggtatggaataactccatagaagaagttgtttctcaaaactaatttttggatttttggaagtg 14480928  T
Q  542 atgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttccca 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||| || |||||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  14480927 atgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagttcaaaactggtgagatctatcttgttaatagattttgagttattatcacatatgattccttccca 14480828  T
Q  642 ------------gctactacaaggattattaccaatccatgaagagagta 679  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14480827 acttagtccaatactactacaaggattattaccaatccatgaagagagta 14480778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15010136 - 15009909
Alignment:
Q  196 ggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagt 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||| | ||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |    
T  15010136 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaat 15010037  T
Q  296 aaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagt-atccaaattaatca 394  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  15010036 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagg-gaaaagtaatccaaattaatca 15009938  T
Q  395 aattacctatggatagtggtattggtcca 423  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15009937 aattacctatggaaggtggaattggtcca 15009909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 677
Target Start/End: Original strand, 14524596 - 14524798
Alignment:
Q  472 ccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtacctt 571  Q
    |||||||||||||||||||| || || |   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14524596 ccaatatggtgtggaacaactccatagaatgagttgtttcttaaaactaagctatggatttttggaagtgatgagatattgagattttgaagtgtacctt 14524695  T
Q  572 ttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttcccagctactacaaggattattaccaatccatga 671  Q
    ||||||||||| | |  |||| || ||||| ||| |||||||| |   ||||||||||||||||  ||||   | | ||||| |||||||||||||||||    
T  14524696 ttagtccaatacttgcaagatgtatcttgtagatagattttgacttgccatcacatgtgattcccaccca---attgcaaggcttattaccaatccatga 14524792  T
Q  672 agagag 677  Q
    ||||||    
T  14524793 agagag 14524798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15024180 - 15023970
Alignment:
Q  197 gaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagta 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||| |    
T  15024180 gaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaa 15024081  T
Q  297 aagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaa 396  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||  ||||||||| |||||     
T  15024080 aagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaag 15023981  T
Q  397 ttacctatgga 407  Q
    |||||||||||    
T  15023980 ttacctatgga 15023970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15031521 - 15031311
Alignment:
Q  197 gaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagta 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||| |    
T  15031521 gaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaa 15031422  T
Q  297 aagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaa 396  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||  ||||||||| |||||     
T  15031421 aagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaag 15031322  T
Q  397 ttacctatgga 407  Q
    |||||||||||    
T  15031321 ttacctatgga 15031311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15010036 - 15009915
Alignment:
Q  152 aaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagt-atgcaaattaatta 250  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| || ||||||||| |    
T  15010036 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaa-agtaatccaaattaatca 15009938  T
Q  251 aattacctatggaaggtggaatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15009937 aattacctatggaaggtggaatt 15009915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15031134 - 15031013
Alignment:
Q  152 aaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagt-atgcaaattaatta 250  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| || ||||||||| |    
T  15031134 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaa-agtaatccaaattaatca 15031036  T
Q  251 aattacctatggaaggtggaatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15031035 aattacctatggaaggtggaatt 15031013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15036257 - 15036161
Alignment:
Q  311 tgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15036257 tgagttttgtcaaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatgga 15036161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14503244 - 14503111
Alignment:
Q  286 tcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatcca 385  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  |||||||   ||||| |||||| || ||    
T  14503244 tcatttgagaaaagatttaatatagtgagtttcgtcaaatttccgatagttgaaggaattggtccagagaggttattttgaaaaaggataatagaattca 14503145  T
Q  386 aattaatcaaattacctatggatagtggtattgg 419  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  14503144 aattaaccaaattacctatggatggtgggattgg 14503111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15010237 - 15010125
Alignment:
Q  311 tgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagt-atccaaattaatcaaattacctatggata 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  15010237 tgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagg-gaaaagtaatccaaattagtcaaattacctatggaag 15010139  T
Q  410 gtggtattggtcca 423  Q
    |||| |||||||||    
T  15010138 gtggaattggtcca 15010125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15009792 - 15009703
Alignment:
Q  180 atttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtgg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15009792 atttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15009703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15030890 - 15030801
Alignment:
Q  180 atttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtgg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15030890 atttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15030801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 389
Target Start/End: Original strand, 14523510 - 14523577
Alignment:
Q  322 aaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaatt 389  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14523510 aaatttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgtgaaaagtcaatagtatccaaatt 14523577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14503242 - 14503117
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    ||||||||||||   |||| || ||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |   |||||  || || || ||||    
T  14503242 atttgagaaaagatttaatatagtgagtttcgtcaaatttccgatagttgaaggaattggtccagagaggttattttgaaaaaggataatagaattcaaa 14503143  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtgg 269  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||    
T  14503142 ttaaccaaattacctatggatggtgg 14503117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 14533908 - 14534005
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaa 264  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||  |||||||  ||||||| || |||||  ||||| |  || ||||||||||||    
T  14533908 tgagttttgtcaaatttccgatagtagaaggaagtggtccagagattttattgtccgaaaggtcaatagtatctaaattgaccaatttacctatggaa 14534005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14481654 - 14481606
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagatt 215  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14481654 tgaggtttgtcaagtttccgatagtggaaggaattggtccagagagatt 14481606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 272
Target Start/End: Original strand, 14523512 - 14523604
Alignment:
Q  180 atttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaaggtggaat 272  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||| || || ||||| |||||| |  |  |||||||| |||||||||||    
T  14523512 atttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgtgaaaagtcaatagtatccaaattgacaaggttacctatagaaggtggaat 14523604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 7)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 5525 - 5285
Alignment:
Q  442 aaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtg 541  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5525 aaatcaagagtttccagatttgacatcaccccaatatggtgaggaacaactccgtaaaaggaattgttttttaaaactaagatgcggatttttggaagtg 5426  T
Q  542 atgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttccca 641  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  5425 atgagaaattgagactttgaagcataccttttaggccaatattggtgagatttaacttgcagatagattttgagtcatcacaacatgtgattccttccca 5326  T
Q  642 gctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5325 actactacaaggatcgttaccgatccatgaagagagcaatg 5285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 439 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11024 - 10783
Alignment:
Q  439 gacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaa 538  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  | |||||||| ||||||||||| ||  | |   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11024 gacaaatcaagagtttctagattggacattacaccaatatgatgtggaacaactccaaagaatgagttgtttcttaaaactaagctatggatttttggaa 10925  T
Q  539 gtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttc 638  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||| ||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |    
T  10924 gtgatgagatattgagattttgaagtgtaccttttagtccaatacttgcaagatgtatcttgtagatagattttgacttgccatcacatgtgattcccac 10825  T
Q  639 ccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatga 683  Q
    |||   | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10824 cca---attgcaaggcttattaccaatccatgaagagagcaatga 10783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11728 - 11540
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattatt-gtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaag 265  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||  || ||||| |||||| |  || |||  ||||||||    
T  11728 tgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaa-ggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaag 11630  T
Q  266 gtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagaga 355  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  11629 gtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtaggaattggtcccgaga 11540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12039 - 11776
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    |||||||||| | | ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||   ||||| |  || || || |||     
T  12039 atttgagaaaggaggtaagctactgagttttgtcaaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaag 11940  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaa 343  Q
    || |  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  |   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11939 ttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaa 11840  T
Q  344 gtggtccagagatattattt-tctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
     |||||| ||||  |||||| | || |||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  11839 ttggtcccgagagtttatttatatg-aaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatgga 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11872 - 11686
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattg-tatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaag 265  Q
    |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| | |||  || || |||||| |  || ||||||||||||     
T  11872 tgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataat-agaatccaaattgaccaagttacctatggaat 11774  T
Q  266 gtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccaga 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11773 gtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccaga 11686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5695
Alignment:
Q  103 gtaagcctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaat 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| || |||||| | ||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5792 gtaagcctattcatttcagttggaatatttccagtgagagcatttgaaataagagataacttagtgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11607 - 11533
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattatt 218  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  11607 atttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtaggaattggtcccgagagtttatt 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 7)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6169 - 5929
Alignment:
Q  442 aaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaagtg 541  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6169 aaatcaagagtttccagatttgacatcaccccaatatggtgaggaacaactccgtaaaaggaattgttttttaaaactaagatgcggatttttggaagtg 6070  T
Q  542 atgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttccca 641  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  6069 atgagaaattgagactttgaagcataccttttaggccaatattggtgagatttaacttgcagatagattttgagtcatcacaacatgtgattccttccca 5970  T
Q  642 gctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatg 682  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5969 actactacaaggatcgttaccgatccatgaagagagcaatg 5929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 439 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11667 - 11426
Alignment:
Q  439 gacaaatcaagagtttttagactagacatctctccaatatggtgtggaacaacgccgtacaggaagttgtttcttaaaactaaggtacggatttttggaa 538  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  | |||||||| ||||||||||| ||  | |   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11667 gacaaatcaagagtttctagattggacattacaccaatatgatgtggaacaactccaaagaatgagttgtttcttaaaactaagctatggatttttggaa 11568  T
Q  539 gtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttaccttgttgatggattttgaatcatcatcacatgtgattccttc 638  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| || ||||| ||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |    
T  11567 gtgatgagatattgagattttgaagtgtaccttttagtccaatacttgcaagatgtatcttgtagatagattttgacttgccatcacatgtgattcccac 11468  T
Q  639 ccagctactacaaggattattaccaatccatgaagagagtaatga 683  Q
    |||   | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11467 cca---attgcaaggcttattaccaatccatgaagagagcaatga 11426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12371 - 12183
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattatt-gtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaag 265  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| ||  || ||||| |||||| |  || |||  ||||||||    
T  12371 tgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaa-ggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaag 12273  T
Q  266 gtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagaga 355  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  12272 gtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtaggaattggtcccgaga 12183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12682 - 12419
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 243  Q
    |||||||||| | | ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||   ||||| |  || || || |||     
T  12682 atttgagaaaggaggtaagctactgagttttgtcaaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaag 12583  T
Q  244 ttaattaaattacctatggaaggtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaa 343  Q
    || |  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||  |   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  12582 ttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaa 12483  T
Q  344 gtggtccagagatattattt-tctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 407  Q
     |||||| ||||  |||||| | || |||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12482 ttggtcccgagagtttatttatatg-aaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatgga 12419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12515 - 12329
Alignment:
Q  167 tgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattattg-tatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattacctatggaag 265  Q
    |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| | |||  || || |||||| |  || ||||||||||||     
T  12515 tgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataat-agaatccaaattgaccaagttacctatggaat 12417  T
Q  266 gtggaatttttccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccaga 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12416 gtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccaga 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6339
Alignment:
Q  103 gtaagcctattaatttctgttggaatattcttagtgaaagtatttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaat 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| || |||||| | ||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6436 gtaagcctattcatttcagttggaatatttccagtgagagcatttgaaataagagataacttagtgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaat 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12176
Alignment:
Q  144 atttgagaaaagtgataatctaatgagttttgtcatatttccaatagtgaaaggaattggtccagagagattatt 218  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  12250 atttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtaggaattggtcccgagagtttatt 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16023154 - 16023082
Alignment:
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttacctt 599  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16023154 ggatatttggaagtgatgagaagttaagactttcaagcgtacctttcaatcccatatttgtgagatttacctt 16023082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16101246 - 16101174
Alignment:
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttacctt 599  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16101246 ggatatttggaagtgatgagaagttaagactttcaagcgtacctttcaatcccatatttgtgagatttacctt 16101174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16170924 - 16170852
Alignment:
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttacctt 599  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16170924 ggatatttggaagtgatgagaagttaagactttcaagcgtacctttcaatcccatatttgtgagatttacctt 16170852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 532 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 17847331 - 17847267
Alignment:
Q  532 tttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttac 596  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  17847331 tttggaaatgatgagaagttgagagtttcaagtgtaccttttaatcccatttttgtgagatttac 17847267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 527 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14603683 - 14603611
Alignment:
Q  527 ggatttttggaagtgatgagaaattgagactttgaagtgtaccttttagtccaatattggtgagatttacctt 599  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||    
T  14603683 ggatatttggaagtgatgagaagttaagactttcgagcgtacctttcaatcccatatttgtcagatttacctt 14603611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University