View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9241_high_10 (Length: 371)

Name: NF9241_high_10
Description: NF9241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9241_high_10
NF9241_high_10
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (1-359)||(7827153-7827511)
chr7 (1-359)||(27104433-27104791)
chr7 (1-359)||(27173534-27173892)
chr7 (219-359)||(4443394-4443534)
chr7 (221-345)||(13459484-13459608)
chr7 (206-255)||(14218512-14218561)
chr7 (189-258)||(17132119-17132188)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-359)||(16379168-16379526)
chr6 (1-359)||(16646764-16647122)
chr6 (1-359)||(21412321-21412679)
chr6 (30-359)||(22365159-22365488)
chr6 (215-359)||(1660638-1660782)
chr6 (184-359)||(16103616-16103791)
chr6 (25-359)||(14149550-14149883)
chr6 (1-154)||(16101143-16101296)
chr6 (205-275)||(19982480-19982550)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (1-359)||(30150250-30150608)
chr3 (1-359)||(15943484-15943842)
chr3 (1-359)||(8271288-8271646)
chr3 (1-359)||(13964244-13964602)
chr3 (1-359)||(6149742-6150100)
chr3 (1-359)||(22149635-22149993)
chr3 (42-359)||(17201570-17201887)
chr3 (222-359)||(17321483-17321620)
chr3 (311-359)||(25768418-25768466)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-359)||(20828114-20828472)
chr1 (61-359)||(20928393-20928691)
chr1 (30-359)||(20528361-20528690)
chr1 (1-359)||(22129161-22129519)
chr1 (46-329)||(23312571-23312854)
chr1 (2-354)||(41214588-41214939)
chr1 (205-275)||(20172616-20172684)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-359)||(24256-24614)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-359)||(4459-4816)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (1-359)||(14999910-15000276)
chr4 (1-359)||(15289808-15290166)
chr4 (218-359)||(12339524-12339665)
chr4 (30-144)||(12339739-12339853)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (5-359)||(604-958)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (5-359)||(21847430-21847784)
chr8 (1-359)||(16415416-16415773)
chr8 (1-359)||(20649448-20649806)
chr8 (1-359)||(21193645-21194003)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-359)||(12278-12636)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-359)||(24584379-24584736)
chr5 (1-359)||(23508853-23509211)
chr5 (219-359)||(21828203-21828342)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (61-359)||(6513-6811)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (61-359)||(131142-131440)
scaffold0008 (1-357)||(27069-27425)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-359)||(26689-27047)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-359)||(22281000-22281358)
chr2 (62-359)||(25131415-25131712)
chr2 (1-134)||(22739069-22739202)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (8-359)||(5023-5374)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (1-359)||(274-632)
scaffold0467 (1-359)||(12984-13342)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-333)||(182283-182615)
scaffold0011 (193-356)||(73290-73453)
scaffold0011 (193-356)||(77671-77834)
scaffold0011 (5-152)||(73457-73604)
scaffold0011 (5-152)||(77838-77985)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-359)||(25472-25830)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-359)||(96820-97176)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-359)||(90795-91153)
scaffold0021 (1-359)||(8450-8808)
scaffold0021 (30-359)||(20529-20858)
scaffold0021 (30-359)||(30105-30434)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-267)||(1504-1770)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (118-359)||(1-242)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-359)||(25353-25711)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (75-359)||(3579-3863)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (1-359)||(2996-3362)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (30-359)||(16223-16552)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (30-354)||(5671-5995)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (30-323)||(35398-35691)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (30-359)||(9042-9363)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (32-359)||(35826-36152)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (166-359)||(32528-32720)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (219-359)||(4001-4141)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (244-359)||(8089-8204)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (205-359)||(77918-78072)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (312-359)||(2180-2227)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (213-275)||(49164-49226)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7827153 - 7827511
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7827153 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 7827252  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827253 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 7827352  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  7827353 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 7827452  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7827453 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 7827511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27104791 - 27104433
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27104791 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 27104692  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104691 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 27104592  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  27104591 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 27104492  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27104491 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 27104433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27173534 - 27173892
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27173534 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 27173633  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173634 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 27173733  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  27173734 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 27173833  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27173834 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 27173892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 359
Target Start/End: Original strand, 4443394 - 4443534
Alignment:
Q  219 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4443394 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctccttaacacacatatactgatagatatccggcctatgtccactttcaaa 4443493  T
Q  319 tttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  4443494 tttcacacacttggacaccattgcatcctcaacattaatgt 4443534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Original strand, 13459484 - 13459608
Alignment:
Q  221 tcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| |||||| |    
T  13459484 tcatcgaatatacgacacttgtgcaccaaagtatcgaagtctctaatatcctaaacacacacatactgatagatatccagcttaagcccacgttcaaact 13459583  T
Q  321 tcacacacttcgaaaccatcgcatc 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  13459584 tcacacacttcgaaaccattgcatc 13459608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 14218512 - 14218561
Alignment:
Q  206 ttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  14218512 ttagccttcccagcatcatcaaacatgcaacacttgtgcaccaaagtatc 14218561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 258
Target Start/End: Original strand, 17132119 - 17132188
Alignment:
Q  189 ccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaa 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||    
T  17132119 ccttgtagtaattatccttagccttccccgcatcatcaaacatcctacacttgttcaccaaagtgtcaaa 17132188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16379526 - 16379168
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16379526 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 16379427  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379426 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 16379327  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  16379326 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 16379227  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16379226 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 16379168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16647122 - 16646764
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16647122 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggctta 16647023  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||  ||  | ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  16647022 gagcccccaccagattctctcttctttcctttatctttgctgtaaggtttcccaactccatagcccttccctttcttctcattctgagccttgtagtaat 16646923  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16646922 tagacttaaccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctccttaacacacatgtactgatagatatccgg 16646823  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16646822 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 16646764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21412679 - 21412321
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  21412679 tttcccacacttatgacaactaatgtccttcttacaatcattggcataatgacctatagttccacacttgtagcacttgacatccgctaaatttggctta 21412580  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||   ||||| ||| || ||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  21412579 gagcccccaccagcttctctcttcttccccttgtccttgttgtacggtttcccaactccatggcctttttctctcttcttattctgagccttgtagtaat 21412480  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||  ||| |  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21412479 tagcattaactctcccagcatcaacaaacatgcaacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccgg 21412380  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21412379 cctaagcccactttcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcttcagcattgatgt 21412321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22365488 - 22365159
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||  | | | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22365488 tcttgcactcattagcataatgacccatcgtgccacacttaaagcacttgacatcacccttattagtcttagagcctccaccagcttctctcttcttccc 22365389  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||  ||   ||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||    
T  22365388 tttgtccttgttgtacggttttccaactccatggcctcctcctctcttctcattctttaccttgtagtaattagccttaactctcccggcatcatcaaac 22365289  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  22365288 atacgacacttatacaccaaagtatcaaaatctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagctcactttcaaacttcacacact 22365189  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22365188 tcgaaaccattgcatcttcaacattgatgt 22365159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1660782 - 1660638
Alignment:
Q  215 ccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccacttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||| |    
T  1660782 ccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgaccggcctaagcccactct 1660683  T
Q  315 caaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1660682 caaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 1660638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 359
Target Start/End: Original strand, 16103616 - 16103791
Alignment:
Q  184 ctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacata 283  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||     
T  16103616 ctgagccttgtagtaactagtcttagctcttccagcatcatcaaacatacgacacttttgcaccaaagtatgaaagtctcggatctcctagacgcacatg 16103715  T
Q  284 tactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16103716 tactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcttcagcattgatgt 16103791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Original strand, 14149550 - 14149883
Alignment:
Q  25 atccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttc 124  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| || |||||   | |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14149550 atccttcttgcaatcgttagcataatgacccaaagttccacacctaaagcatctgacatcagctaaactcaccttagaacctccaccagtttcactcttc 14149649  T
Q  125 tttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcat 224  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||| |||   ||||| |   ||||| || | ||    || |||||||| |||| ||||||| |  | || || ||||    
T  14149650 tttcccttatccttgttgtacggtttcccaaatccatgactctttcctttcctatccttttgtgccttgtaataatcagacttaactcttccggcgtcat 14149749  T
Q  225 caaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcac 324  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14149750 caaacatacgacactgatgcac-aaggtatcaaaatctcggatctcttgaacacacatatacagatagaaatccagcctaagcccactttcaaatttcac 14149848  T
Q  325 acacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14149849 acacttggacaccatcgcatcctcagcattgatgt 14149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 16101143 - 16101296
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||  |||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16101143 tttcccacacttatgacaactaatgtcattcttacaatcattggcataatgacccaaggttccacacctatagtacttgacatccgccaaactcggctta 16101242  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttcca 154  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16101243 tagcccccaccagcttctctcttctttcctttgtctttgttgtaaggttttcca 16101296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19982550 - 19982480
Alignment:
Q  205 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaa 275  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19982550 cttagccttctcggcgtcatcaaacatacgatacttgtgtaccaaagtataaaaatctcggatctcatgaa 19982480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 30150250 - 30150608
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30150250 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 30150349  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150350 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 30150449  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  30150450 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 30150549  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30150550 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 30150608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15943842 - 15943484
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || | |||   |||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943842 tttcccacacttgtgacaattcacatcatgcttgcaatcattggcataatgacccaaagttccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggccta 15943743  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15943742 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcttctcaccctgagccttatagtaat 15943643  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15943642 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccgg 15943543  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15943542 cctaagcccactctcaaacttcacgcacttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgt 15943484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8271646 - 8271288
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8271646 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcgttcttgcaatcactaacataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggctta 8271547  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||  ||  | ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  8271546 gagcccccaccagattctctcttctttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatagcccttccctttcttctcattctgagccttgtagtaat 8271447  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8271446 tagacttaaccttcccagcatcatcaaacatacgacacttattcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 8271347  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8271346 cctaagcccactttcaaacttcacacactttgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 8271288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13964602 - 13964244
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13964602 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagatccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggctta 13964503  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||  ||  | ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  13964502 gagcccccaccagattctctcttctttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatagcccttccctttcttctcattctgagccttgtagtaat 13964403  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  13964402 tagacttaaccctcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 13964303  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13964302 cctaagcccactctcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctcagcattgatgt 13964244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6150100 - 6149742
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | || |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||| ||    
T  6150100 tttcccacacttgtgacaactgatatcctttttacaataattggcataatgacccatatttccacacttgaaacacttgacatctgacaaattcggctta 6150001  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||     
T  6150000 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcttatcattctgagccttgtagtaac 6149901  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6149900 tagtcttagctttcccaacatcatcaaacatacaacactaatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatattcgg 6149801  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6149800 cctaagcccactctcaaacttcacatacttcaaaaccatagcatcctcagcattgatgt 6149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22149993 - 22149635
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  22149993 tttcccacacttgtgacaactgatatccatcttacaatcattggcataatgacccatggttacacacttgaaacacttgacagccgccaaattcggctta 22149894  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| || ||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  22149893 gaggccccaccaacttctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggccccttcctctcttctcacgttgcgccttgtagtaat 22149794  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||| ||||| |||  |    
T  22149793 tagtcttagctttcccagcatcatcaaacatatgacacttgtgcaccaaagtgtcaaaatcacggatctcttgcacacacatgtactgatagacatctag 22149694  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||    
T  22149693 ccaaagcccactctcaaacttcacacacttggacaccattgcattctcgacattgatgt 22149635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 359
Target Start/End: Original strand, 17201570 - 17201887
Alignment:
Q  42 tagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgct 141  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||| |  ||  | | | | ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |    
T  17201570 tagcataatgacccatcatgccacacttaaagaacttgacagcacccttattagtcttagagcctccaccagcttctctcttcttctctctgtccttgtt 17201669  T
Q  142 gtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacactta 241  Q
    ||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| |||  |||  |||| |||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17201670 gtacggttttccaactccatggcctcttcctctcttctcattctgtaccttttagtaattagccttaactctcccggcatcatcaaacatacgacactta 17201769  T
Q  242 tgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcg 341  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17201770 tgcaccaaagtatcaaaatctaggatctcctaaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatcg 17201869  T
Q  342 catcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17201870 catcctcagcattgatgt 17201887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17321620 - 17321483
Alignment:
Q  222 catcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaattt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17321620 catcaaacatacgacacttatgcaccaaggtatcaaactctcgaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagtccactttcaaattt 17321521  T
Q  322 cacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17321520 cacacacttggacaccatcgcatcctcaacattaatgt 17321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 359
Target Start/End: Original strand, 25768418 - 25768466
Alignment:
Q  311 ctttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25768418 ctttgaaacttcacacactttgaaaccatagcatcttcagcattgatgt 25768466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20828472 - 20828114
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20828472 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggccta 20828373  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828372 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 20828273  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  20828272 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 20828173  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20828172 cctaagcccactttcaaacttcacacacttggaaaccatagcatcctccgcattgatgt 20828114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Original strand, 20928393 - 20928691
Alignment:
Q  61 tccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggccca 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  20928393 tccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcccccaccagattctctcttcttacttttgtccttgctgaaaggttttccaactcca 20928492  T
Q  161 tgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagt 260  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20928493 tggcctcttcctcccttctcaccctgagccttacagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagt 20928592  T
Q  261 ctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  20928593 ctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctgagcattgatgt 20928691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Original strand, 20528361 - 20528690
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20528361 tcttacaatcattggcataatgacccaaggttccacacctatagcacctgacatccgccaaacttggcttagagcccccaccagattccctcttctttcc 20528460  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20528461 tttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcctatcactctaagccttgtagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaac 20528560  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  20528561 atacgatacttattcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacatatgtactggtagatctccggcctaagcccactctcaaacttcacacact 20528660  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  20528661 tcgaaatcatagcatcctcaacattgatgt 20528690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22129519 - 22129161
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||| ||  | || ||  |||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||| || ||| | ||| ||    
T  22129519 tttcccacacttgtggcaactaatgtctttcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacttgtagcacctgacatcagctaaattcggctta 22129420  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
     |||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||   |  |  ||||||||| |    
T  22129419 aagcctccaccattctctttcttctttcctttatccttgttgtacggtttcccaactccatgacctcttcctctcttctctttcacaaacttgtagtagt 22129320  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22129319 tcactttagccttcgcggcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctaggatctcctaaacacacatatactgatagatatccgg 22129220  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129219 cctaagcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 22129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23312854 - 23312571
Alignment:
Q  46 ataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||  || |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23312854 ataatgacccaaagttccacatctatagcatttgacatccgctaaactcggcttagagcctccaccatcttctctcttctttcctttgtccttgttgtac 23312755  T
Q  146 ggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgca 245  Q
    ||||| |||   ||||| |   |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23312754 ggtttcccaactccatgactctttcctctcttctcattctgagccttgtagtagttagccttaactcttccagcatcatcaaacatacgacacttatgca 23312655  T
Q  246 ccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23312654 ccaaagtatcaaaatctcggatctcatgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacact 23312571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41214939 - 41214588
Alignment:
Q  2 ttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctag 101  Q
    |||||||||||||| ||  | || ||| |||| |||||| | | ||||||||| |  | ||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  41214939 ttcccacacttgtggcaactaatgtccttcttacaatcattggaataatgaccgaaggttccacacctgtagcacctgacatcagctaaacttggcttag 41214840  T
Q  102 agcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaatt 201  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   ||||| |||||||||||||| |||  |   | |||||| ||  |    
T  41214839 agcccccaccagtctctttcttctttcctttgtccttgttgtatggttc-ccaaatccatgacctcttcctctcttctcattcaccgacttgtaatagct 41214741  T
Q  202 agacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggc 301  Q
       ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41214740 caccttggccttcccggcgtcatcaaacatgcgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccagc 41214641  T
Q  302 ctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcatt 354  Q
    ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41214640 ctgagcccactttcgaacttcacacacttcgaaaccatcccatcttcagcatt 41214588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 275
Target Start/End: Original strand, 20172616 - 20172684
Alignment:
Q  205 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  20172616 cttagccttcccagcatcatcaa--atgtgacacttgtgcatcaaagtatcaaaatctcagatctcatgaa 20172684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 24256 - 24614
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24256 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcatagtgacccatagatccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggctta 24355  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24356 gagccaccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 24455  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  24456 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 24555  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24556 cctaagcccactttcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgt 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4816 - 4459
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4816 tttcccacacttgtgacaagtaa-atcattcttgcaatcactagcatagtgacccatagatccacacttaaagcacttgacatccgccaaacgtggctta 4718  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 4618  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  4617 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 4518  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4517 cctaagcccactttcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgt 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 14999910 - 15000276
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999910 tttcccacacttgtgacaattcaaatcattcttgcaatcattagcatagtgacccaaagttccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 15000009  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000010 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagcaccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 15000109  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcac--------caaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatag 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15000110 tagacttagcctttccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatag 15000209  T
Q  293 atatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15000210 atgtccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 15000276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15290166 - 15289808
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15290166 tttcccacacttgtgacacttgatatcagtcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatcctccaaacttggctta 15290067  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||  ||  | ||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  15290066 gagcctccaccagcttctctcttctttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatagcccttccctttcctttcattctgagccttgtagtaat 15289967  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  15289966 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcagatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 15289867  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15289866 cctaagcccattctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 15289808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12339665 - 12339524
Alignment:
Q  218 gcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaa 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |  || || |||||    ||||| ||||    
T  12339665 gcatcatcaaacatacgaaacttaggcaccaaggtatcgaaatccctgatctcctgaacacacatatactagtgaatctctggcctcaaaccactctcaa 12339566  T
Q  318 atttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12339565 acttcacacatttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 12339524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12339853 - 12339739
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||    
T  12339853 tcttacaatcactagagtaatgacccaaagtcccacacttaaagcatctgacatcagctacactcggcttagagcctccaccaacctctttcttcttccc 12339754  T
Q  130 tttgtccttgctgta 144  Q
    ||| |||||| ||||    
T  12339753 tttatccttgttgta 12339739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 604
Alignment:
Q  5 ccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagc 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| || ||| | || || | |||| | ||| ||||||    
T  958 ccacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcattggcataatgacccatatttccacacttgaaacacctaacgtctgacaaattcggcttagagc 859  T
Q  105 ctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattaga 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  858 ccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccagccccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattaga 759  T
Q  205 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggccta 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  758 cttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccggccta 659  T
Q  305 tgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  658 agcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctccgcattgatgt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21847784 - 21847430
Alignment:
Q  5 ccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagc 104  Q
    ||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21847784 ccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctctaaacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcttagagc 21847685  T
Q  105 ctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||  ||  ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21847684 ccccaccagattctctcttctttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatagccctttcctttcttctcattctgagccttgtagtaattaga 21847585  T
Q  205 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  21847584 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcgaatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggccta 21847485  T
Q  305 tgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21847484 agcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 21847430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16415416 - 16415773
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  16415416 tttctcacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcattagcataatgacccatatttccacacttgaagcatttgacatccgccaaattcggctta 16415515  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  16415516 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtacggttttccaactccatggccccttcctctcttatcattctgagccttgtagtaat 16415615  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  16415616 tagtctcagctttcccagcatcatcaaacat-caacagttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatcccctggacacacatgtactgatagatatccgg 16415714  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16415715 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 16415773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20649806 - 20649448
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  20649806 tttcccacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcattggcataatgacccatggttccacacttgtaacacttgacatccgcaaaattcggctta 20649707  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||    
T  20649706 gagcccccaccagcttccctcttctttcctttgtctttgttgtaaggtttcccaactccatgacctcttcctcttttctcattctgagccttatagtaat 20649607  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  20649606 tagtcttagctctcccagcatcattaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgtacatacatttactgatagatatccgg 20649507  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20649506 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcttcaacattgatgt 20649448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21194003 - 21193645
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||| |||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  21194003 tttcccacacttgtgacaactaatgtccttcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacctatagcacttgatatccgctaaactcggctta 21193904  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||   ||||| ||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  21193903 gagcccccaccaacttctctcttctttcttttgtccttgttgtacggtttcccaactccatgaccctttcctctcttctcactttgagccttgtagtagt 21193804  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21193803 tagccttaactcttccagcatcatcaaacttacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatctcggatctcctgaacacacatatactgatagatatccgg 21193704  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21193703 cctaagcccactttcaaacttcacacacttcgaaaccatcgcatcttcagcaatgatgt 21193645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12636 - 12278
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || | |||   ||| |||||| | ||||||||||| |  | ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12636 tttcccacacttgtgacaattcaaatcatgcttacaatcattggcataatgacctaaggttccacacctatagcccttgacatccaccaaacttggccta 12537  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12536 gagcccccaccagattttctcttatttcctttgtccttgctgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcctatcaccctgagccttgtagtaat 12437  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12436 tagacttaaccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatctgg 12337  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12336 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgt 12278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 24584379 - 24584736
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24584379 tttcccacacttgtgacaagtaaaatcattcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacttccgccaaacttggctta 24584478  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||  ||  | ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  24584479 gagcccccaccagattctctctt-tttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatagcccttccctttcttctcattctgagccttgtagtaat 24584577  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  24584578 tagacttaaccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaactctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccga 24584677  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24584678 cctaagcccactctccaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcaacattgatgt 24584736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 23508853 - 23509211
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || |  | | | ||| ||    
T  23508853 tttcccacacttgtgaaaattgatatccttcttgcaatcattagcataatgacccatatttccacacttgaaacacctgacgtctgagagattcggctta 23508952  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  23508953 gagcccccaccagattctctcttctttcctttatccttgttgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcttatcattatgagccttgtagtaat 23509052  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23509053 tagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcatcaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatatccgg 23509152  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23509153 cctaagcccactctcaaacttcgcacacttcgaaatcatagcatccttagcattgatgt 23509211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 359
Target Start/End: Original strand, 21828203 - 21828342
Alignment:
Q  219 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21828203 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaag-atcgaaatctctaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcgaa 21828301  T
Q  319 tttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21828302 cttcacacacttcgaaaccatcgcatcttcagcattaatgt 21828342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6811 - 6513
Alignment:
Q  61 tccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggccca 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |    
T  6811 tccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggcttagagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaacctta 6712  T
Q  161 tgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6711 tgtcctcttcctctcttttcaccctgagctttgtagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcactaaagtatcaaagt 6612  T
Q  261 ctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  6611 ctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctcaacattaatgt 6513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 131440 - 131142
Alignment:
Q  61 tccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggccca 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |    
T  131440 tccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggcttagagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaacctta 131341  T
Q  161 tgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  131340 tgtcctcttcctctcttttcaccctgagctttgtagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcactaaagtatcaaagt 131241  T
Q  261 ctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  131240 ctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctcaacattaatgt 131142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 27069 - 27425
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||| || ||||||||||| | |||| | ||| ||    
T  27069 tttcccacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcactagcataatgacccatatttcaactcttgaaacacttgacatctgacaaattcggctta 27168  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  27169 gagcccccaccaaattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggccttttcctctcttatcattctgcgccttgtagtaat 27268  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27269 tagtcttagctttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtataaaagtctaggatctactgaacacacatgtattgatagatatccgg 27368  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgat 357  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27369 cctaagtccactctcaaacttcacacacttcgaaaccacagcatcctcagcattgat 27425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 26689 - 27047
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26689 tttcccacacttgtgacaattcacatcattcttgcaatcattagcatagtgacctaaggttccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggcctt 26788  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||| ||| ||| | |||| |||  || ||||||||||||||    
T  26789 gagcccccaccagattctctcttctttcctttatccttgctgtaaggtttcccaactccatggccttttcatttcttctcattctaagccttgtagtaat 26888  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  26889 tagacttagcttttccagcatcaacaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccgg 26988  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  26989 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctcaacattgatgt 27047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 22281000 - 22281358
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||  |||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  22281000 tttcccacacttgtgacaactcaaatcattcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacctaaagcacctaacatccgccaaacttggctta 22281099  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||| || |||| |||  |||||||||||||||||    
T  22281100 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttacaactccatggcctctttctttcttctcattctgagccttgtagtaat 22281199  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  22281200 tagtcttagcttttccaacatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtataaaagtctcggatctcctgaacaaacatgtactgataaatatccgg 22281299  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22281300 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagcatcctcagcattgatgt 22281358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 359
Target Start/End: Original strand, 25131415 - 25131712
Alignment:
Q  62 ccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccat 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  | | | | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| | || |||||  ||   ||||    
T  25131415 ccacacttaaagcacctgacatcagccgtattagacttagagcctccaccagcttctttcttccttcctttatccttgttatacggtttcacaaatccat 25131514  T
Q  162 gtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtc 261  Q
    | ||  ||||| |||| |||   ||  ||||||| |||||||  ||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25131515 gaccctttcctttcttatcatgttgcaccttgtaataattagctttaacccttccggcgtcatcaaacatacgacacttttgcaccaaggtatcaaaatc 25131614  T
Q  262 tcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25131615 tcgaatctcctgaacacacatatactgataaatatccggcctaagtccactttcaaatttcacacactgtgacaccatcgcatcctcaacattaatgt 25131712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22739202 - 22739069
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  22739202 tttcccacacttgtggcaattaatgtccttcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacttgtagcacttgacatccgctaaattcggctta 22739103  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgt 134  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22739102 gaggccccaccaacttctctcttctttcctttgt 22739069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5374 - 5023
Alignment:
Q  8 cacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctc 107  Q
    |||||||||||  |||||| | || | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  5374 cacttgtgacaactgatatacttcatactatcattagcataatgacccatagatccacacttgaagcatttgacatccgccaaatttggcttagagcccc 5275  T
Q  108 caccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagactt 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||    
T  5274 caccagattctctcttcttccctttgtctttgttgtatggttttccaaccccatggcctcttcctctcttctcattctgagccttgtagtaactagtctt 5175  T
Q  208 agccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgc 307  Q
     ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||    
T  5174 ggctcttctagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctggacacacatgtactgatagatatccggtctaagc 5075  T
Q  308 ccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5074 ccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 5023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 632 - 274
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||  |||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  632 tttcccacacttgtgacaactcatgtcattcttacaatcattagcataatgacccaaggttccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggctta 533  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  532 gagcccccaccagattatctcttctttcccttgtccttgctgtaaggtttaccaactccatggcctcttccactcttgtcattctgagccttgtagtaat 433  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  432 tggtcttagctctcccagcatcatcaaacatacgacacttatgaaccaaagtatcaaaatctcggatctcctaaacacacatgtactgattgatatccgg 333  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  332 cctaagcccactctcaaacttcacacatttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 12984
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||  |||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13342 tttcccacacttgtgacaactcatgtcattcttacaatcattagcataatgacccaaggttccacacctatagcacttgacatccgccaaacttggctta 13243  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13242 gagcccccaccagattatctcttctttcccttgtccttgctgtaaggtttaccaactccatggcctcttccactcttgtcattctgagccttgtagtaat 13143  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  13142 tggtcttagctctcccagcatcatcaaacatacgacacttatgaaccaaagtatcaaaatctcggatctcctaaacacacatgtactgattgatatccgg 13043  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13042 cctaagcccactctcaaacttcacacatttcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 12984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 182283 - 182615
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || | |||| | ||| ||    
T  182283 tttcccacacttgtgacaaccgatatccttcttacaatcattggcataatgacccatatttccacacttgaaacacctgacgtctgacaaattcggctta 182382  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||    
T  182383 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcctatcactctgagcgttgtagtaat 182482  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  182483 tagacttagctttcccaacatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactaatagatatccgg 182582  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcga 333  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  182583 cctaagcccactctcaaacttcaaacacttcga 182615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 73453 - 73290
Alignment:
Q  193 gtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatag 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  73453 gtagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacatttttgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatag 73354  T
Q  293 atatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattga 356  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  73353 atatccggcctaagcccactctcaaaattcacacacttcgagatcatagcgtcctcaacattga 73290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 77834 - 77671
Alignment:
Q  193 gtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatag 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  77834 gtagtaattagacttagctttcccagcatcatcaaacatacgacatttgtgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactgatag 77735  T
Q  293 atatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattga 356  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  77734 atatccggcctaagcccactctcaaaattcacacacttcgagatcatagcgtcctcaacattga 77671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 73604 - 73457
Alignment:
Q  5 ccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagc 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || | |||| | ||| ||||||    
T  73604 ccacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcattagcataatgacccatatttccacacttgaaacacctgacgtctgacaaattcggcttagagc 73505  T
Q  105 ctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttc 152  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73504 ccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttc 73457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 77985 - 77838
Alignment:
Q  5 ccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagc 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || | |||| | ||| ||||||    
T  77985 ccacacttgtgacaactgatatccttcttacaatcattagcataatgacccatatttccacacttgaaacacctgacgtctgacaaattcggcttagagc 77886  T
Q  105 ctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttc 152  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  77885 ccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttc 77838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 25472 - 25830
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||  |||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25472 tttcccacacttgtgacaactaatgtcattcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacctatagcacttgacatccgccaaactcggctta 25571  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||   |||| |||  |||||||||||||||||    
T  25572 gagcccccaccagcttctctcttctttcctttgtctttgttgtaaggttttccaactccatggccttttcgcttcttctcattctgagccttgtagtaat 25671  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25672 tagtcttagctcttccaacatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctcaacacacatatactgatagatatccgg 25771  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25772 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatagcatcttcagcattgatgt 25830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 96820 - 97176
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||| | |||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  96820 tttcccacacttgtgacaattaatgtccttcttacaatcattggcataatagcccatagttccacacttgtagcacttgacatccgccaaattcggctta 96919  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  96920 gagcccccaccggcttctctcttatttcctttgtccttgttgtacggttttccaactccatggcctcttcctctcttctcattttgagccttgtagtaat 97019  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  97020 tagtcttagctcttccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctga--acacatatactgatagatatccgg 97117  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  97118 cctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccataacatcttcaacattgatgt 97176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 90795 - 91153
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||| ||    
T  90795 tttcccacacttgtgacaactgatgtccttcttacaatcattagcataatgacccatatttccacacttgaaacacttgacatctgacaaattcggctta 90894  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  90895 gagccgccaccagactctctattctttcctttgtccttgttgtacggctttccaactccatgccctctacctcttttatcattctgagccttgtagtaat 90994  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| | ||     
T  90995 tagtcttagctctcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtttcaaagtctctgatctcctgaacacacatttattgatagattttcgt 91094  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  91095 cctaagcccactctcaaacttcacatacttcgaaatcttagcatcctcagcattgatgt 91153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 8450 - 8808
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||| | |||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  8450 tttcccacacttgtgacaactgatatcctttttacaatcattggcataaagacccaaagttccatacttgtagcacttgacatccgccaaattcggctta 8549  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |  || |||   ||| | |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  8550 gagcccccaccggcttctctcttctttcccttgtccttgttgtacgacttcccaactccaaggcctcttcctctcttctcattctgagccttatagtaat 8649  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  8650 tagtcttagctcttccaacatcatcaaacatacgacacttatgtaccaaagtatcaaagtctcggatctcctggacacacaaatactgataaatattcgg 8749  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8750 cctaagcccactttcaaactttacacacttcgaaaccatagcatctttagcattgatgt 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20529
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||  | | | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20858 tcttgcactcattagcaaaatgacccaacgtgccacactcaaagcacttgacatccgccttattagacttagagcctccaccagattctttcttccttcc 20759  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
    ||| |||||| | || |||||  ||   ||||| ||  ||||| || | |||   || ||||||||||||||||  ||| |  |  | || |||||||||    
T  20758 tttatccttgttatacggtttcacaaatccatgaccctttcctttcctatcatgttgcgccttgtagtaattagctttatctctttcggcgtcatcaaac 20659  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20658 atatgacacctatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactggtagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacact 20559  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20558 tggaaaccatcgcatccttagcattaatgt 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30434 - 30105
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||  | | | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30434 tcttgcactcattagcaaaatgacccaacgtgccacactcaaagcacttgacatccgccttattagacttagagcctccaccagattctttcttccttcc 30335  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
    ||| |||||| | || |||||  ||   ||||| ||  ||||| || | |||   || ||||||||||||||||  ||| |  |  | || |||||||||    
T  30334 tttatccttgttatacggtttcacaaatccatgaccctttcctttcctatcatgttgcgccttgtagtaattagctttatctctttcggcgtcatcaaac 30235  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30234 atatgacacctatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactggtagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacact 30135  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30134 tggaaaccatcgcatccttagcattaatgt 30105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 1504 - 1770
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||||||||||||||| || | |||  |||| |||||| | ||||| ||||| |  | ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1504 tttcccacacttgtgacaattcacatcattcttacaatcattggcatagtgacctaaggttccacacctatagcacttgacttccgccaaatttggccta 1603  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1604 gagcccccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaagttttccaaccccatgtcctcttcctctcttatcaccctgagccttgtagtaat 1703  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggat 267  Q
    |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1704 tagagttaacttttccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggat 1770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 359
Target Start/End: Original strand, 1 - 242
Alignment:
Q  118 tctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttccca 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 tctcttctttcctttgtccttgttgtaaggttttccaactccatggcctcttcctctcctatcactctgagcgttgtagtaattagacttagctttccca 100  T
Q  218 gcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaa 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  101 acatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatgtactaatagatatccggcctaagcccactctcaa 200  T
Q  318 atttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    | |||| ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    
T  201 acttcaaacacttcgagatcataccatcctcaacattgatgt 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25711 - 25353
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||  |||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  25711 tttcccacacttgtgacaactaatgtcattcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacctatagcacttgacatccgctaaactcggctta 25612  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |   ||||| ||  ||||| |||| |||   || |||||||||||||    
T  25611 gagccccaaccagcttctctcttcttccctttgtccttgttgtacggtttccaaactccatggccctttcctttcttctcatgttgcgccttgtagtaat 25512  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccgg 300  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25511 tagccttaaccttcccaacatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatcttgaatctcttgaacacacatatactgatagacatccgg 25412  T
Q  301 cctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25411 cctaatcccactttcaaacttcgcgcacttggaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3863 - 3579
Alignment:
Q  75 acttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctct 174  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||   ||||| ||| ||||| |    
T  3863 acttgacatccgctaaactcggcttagagcccccaccaacttctctcttctttcctttgtccttgttgtacgattttccatctccatggccttttccttt 3764  T
Q  175 cttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctga 274  Q
    ||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3763 cttctcattctgaaccttgtagtaattagtcttagctcttccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgg 3664  T
Q  275 acacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  3663 acacacatgtactgatagatatctggcctaagcccactatcaaacttcacacacttcgaaaccataacatcttcagcattgatgt 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 2996 - 3362
Alignment:
Q  1 tttcccacacttgtgacacttgatatccatcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggccta 100  Q
    |||||| |||||||||||  | || ||  |||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||| | | ||    
T  2996 tttcccgcacttgtgacaactaatgtcattcttacaatcattggcataatgacccaaagttccacacctatagcacttgacatccgccgaactcgactta 3095  T
Q  101 gagcctccaccagattctctcttctttcctttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaat 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||     
T  3096 gagcccccaccagcttctctcttcttccctttgtctttgttgcaaggttttccaactccatggccttttcccctcttctcattctgagccttgtagtaac 3195  T
Q  201 tagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagta--------tcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatag 292  Q
    ||| ||| ||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  3196 tagtcttggctcttccagtatcaacaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcaaagtctcggatctcttggatacacatatactgatag 3295  T
Q  293 atatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  3296 atatccggcctaagcccactctcaaacttcacacacttcgaaaccatatcatcttcagcattgatgt 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Original strand, 16223 - 16552
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16223 tcttgcaatcattagcataatgacccaaagtcccacacttgaagaatctgacatcctccaaactcgccttagagtctccaccagattctctcttctttcc 16322  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
     || |||||| | || || ||||||   ||||| |   |||||||||| ||    || ||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16323 cttatccttgttatacggctttccaaatccatgactctttcctctcttatccttatgtgccttataataatcagacttaactttcccagcatcatcaaac 16422  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||    
T  16423 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcttgaacacacatgtactgatagatatccggcccaagtccactctcaaacttcacacgct 16522  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16523 tcgaaaccatagcatcctcaagattgatgt 16552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5995 - 5671
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| || ||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5995 tcttgcaattactagagtaatgacccaaagttccacacttaaagcatctgacatcagctaaactcgccttagagcctccaccagcttctctcttcttccc 5896  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||   ||||| ||| ||||| |||| |||   || |||||| |||||||| |  || || | |||||||| ||||||    
T  5895 tttgtccttgttgtacggtttcccaaatccatgaccttttcctttcttatcattttgtgccttgcagtaattatatctaacccttccagcatcttcaaac 5796  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5795 atacgacgcttatgcaccaagatatcaaaatctcaaatctcctgaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaacttcacacact 5696  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcatt 354  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5695 tcgaaaccattgcatcttcaacatt 5671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 323
Target Start/End: Original strand, 35398 - 35691
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  35398 tcttgcaatcattagcataatgacccaaagttccacacttgaagcacctgacatcctctaaactcgctttagagcctccaccagataccctcttctttac 35497  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
     || |||||| |||| || ||||||  |||||| |   ||||| || | ||   ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35498 cttatccttgttgtacggctttccaaacccatgactctttcctttcctatccttctgtgccttgtaataatcagacttaaccttcccagcatcatcaaac 35597  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttca 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  35598 atacgacacttgtgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactgatagatgtccggcctaagcccactctcaaacttca 35691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9363 - 9042
Alignment:
Q  30 tcttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcc 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9363 tcttgcaatcattagcataatgacccaaagttccaaacttaaagcacctgacatcctctaaactcgccttagagcctccaccagattccctcttctttcc 9264  T
Q  130 tttgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaac 229  Q
     || |||||| |||| || ||||||  |||||| |   ||||| || | ||   ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9263 cttatccttgttgtacggatttccaaacccatgactctttcctttcctatccttctgtgccttgtaataatcagacttaaccttcccaacatcatcaaac 9164  T
Q  230 atacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacact 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  9163 atacgacacttatgcaccaaagtctca--------gatctccttaacacacatgtattgatagatatccggcctaagtccactctcaaacttcacacact 9072  T
Q  330 tcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9071 tcgaaaccatagcatcctcagcattgatgt 9042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36152 - 35826
Alignment:
Q  32 ttgcaatcactagcataatgacccatagctccacacttaaagcacttgacatccgccaaacttggcctagagcctccaccagattctctcttctttcctt 131  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||| || ||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  36152 ttgcaatcactagagtaatgacccaaagttccacacttaaaggatctgacatcagctaaactcgccttagagcctccaccagcgtctctcttcttccctt 36053  T
Q  132 tgtccttgctgtaaggttttccaggcccatgtcctcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacat 231  Q
    |||||||| | || ||||| |||   ||||  || ||||||||||| |||  |   | ||  || |  ||   ||| |||||||| || |||||||||||    
T  36052 tgtccttgttatacggtttcccaaatccataaccccttcctctcttctcattcaccgactattaatggttcaccttggccttcccggcgtcatcaaacat 35953  T
Q  232 acgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttc 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35952 acgacacttatgcaccaaag-atcgaaatctctaatctcctgaacacacatatactgatagatatccgggctaagcccactttcaaacttcacacacttc 35854  T
Q  332 gaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35853 gaaaccatcgcatcttcagcattaatgt 35826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32720 - 32528
Alignment:
Q  166 tcttcctctcttttcaccctgagccttgtagtaattagacttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcgg 265  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  ||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32720 tcttcctctcttttcattgtgtgccttgtagtaattagctttaacttttccggcgtcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtcttgg 32621  T
Q  266 atctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||| |||| ||||    
T  32620 atctcctaaacacacatatactgatagatatccggcctaagcccactttcaaaattcacacacttggaca-catcacatcctcaacattaatgt 32528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 359
Target Start/End: Original strand, 4001 - 4141
Alignment:
Q  219 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  4001 catcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaaatcttcgatctcctggacacaaatatactgatacatatccagcctaagcctactttcaaa 4100  T
Q  319 tttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  4101 cttcacacacttggaaaccataacatcctccgcattgatgt 4141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8204 - 8089
Alignment:
Q  244 caccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggcctatgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgca 343  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  8204 caccaaaatatcaaagtctgggatctcctgaacacacatgtactgatagatgtccggcctaagcgcactctcaaacttcacacacttcgaaatcatagca 8105  T
Q  344 tcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||||||||||||||    
T  8104 tcctcagcattgatgt 8089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 359
Target Start/End: Original strand, 77918 - 78072
Alignment:
Q  205 cttagccttcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaacacacatatactaatagatatccggccta 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||  || ||||||| ||| || || |||||     
T  77918 cttagccttcccagcgtcatcaaacaggcgacacttgtgcaccaaagtatcaaagtcacaaatctcatgaaagcagatatactgataaatctcgggcctc 78017  T
Q  305 tgcccactttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
       ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  78018 aatccactctcaaacttcacacatttcgacaccatagcatcctcaacattaatgt 78072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 359
Target Start/End: Original strand, 2180 - 2227
Alignment:
Q  312 tttcaaatttcacacacttcgaaaccatcgcatcctcagcattgatgt 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  2180 tttcaaacttcacacacttcgaaaccatcgcatcttcaacattaatgt 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 275
Target Start/End: Original strand, 49164 - 49226
Alignment:
Q  213 tcccagcatcatcaaacatacgacacttatgcaccaaagtatcaaagtctcggatctcctgaa 275  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  49164 tcccggcatcattaaacatgtgacacttgtgcaccaaagtatcaaaatctctgatctcatgaa 49226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University