View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9247_low_32 (Length: 307)

Name: NF9247_low_32
Description: NF9247
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9247_low_32
NF9247_low_32
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (11-300)||(13458708-13458995)
chr7 (11-289)||(4442600-4442878)
chr7 (11-289)||(27172954-27173232)
chr7 (11-289)||(7826573-7826851)
chr7 (11-289)||(27105093-27105371)
chr7 (11-220)||(17926292-17926501)
chr7 (154-254)||(11284626-11284726)
chr7 (11-160)||(22034738-22034887)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (13-300)||(23902914-23903201)
chr8 (11-289)||(21194305-21194583)
chr8 (11-289)||(20650108-20650386)
chr8 (11-300)||(22437053-22437329)
chr8 (11-247)||(23154838-23155073)
chr8 (11-289)||(16414841-16415114)
chr8 (11-289)||(21848090-21848368)
chr8 (11-251)||(24931619-24931855)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (11-299)||(6307-6596)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (11-300)||(25130924-25131213)
chr2 (11-289)||(22280420-22280698)
chr2 (11-289)||(24567518-24567796)
chr2 (35-289)||(22739504-22739758)
chr2 (121-251)||(25878531-25878661)
chr2 (11-223)||(24829105-24829316)
chr2 (11-223)||(12638818-12639030)
chr2 (121-223)||(12644485-12644587)
chr2 (121-222)||(34821575-34821675)
chr2 (115-263)||(27541905-27542058)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (11-300)||(22133123-22133412)
chr1 (11-266)||(41215261-41215516)
chr1 (11-289)||(20828774-20829052)
chr1 (11-289)||(20527752-20528030)
chr1 (11-289)||(20927753-20928031)
chr1 (96-263)||(20171946-20172113)
chr1 (37-180)||(21200445-21200588)
chr1 (153-206)||(12200390-12200443)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (70-300)||(2346-2575)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (11-289)||(7870-8148)
scaffold0021 (36-300)||(21177-21420)
scaffold0021 (36-300)||(30753-30996)
scaffold0021 (11-289)||(90215-90493)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (35-254)||(23025251-23025470)
chr6 (11-289)||(16379828-16380106)
chr6 (11-266)||(18401193-18401448)
chr6 (11-289)||(1646269-1646547)
chr6 (11-289)||(16100563-16100841)
chr6 (11-289)||(16647424-16647702)
chr6 (11-254)||(16234907-16235149)
chr6 (140-254)||(18578098-18578212)
chr6 (136-223)||(18836178-18836265)
chr6 (148-251)||(19985697-19985800)
chr6 (191-267)||(14133824-14133900)
chr6 (111-195)||(14131087-14131171)
chr6 (11-55)||(14131018-14131062)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (11-287)||(4217-4493)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-251)||(3196-3436)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (26-289)||(6150402-6150665)
chr3 (11-289)||(30149670-30149948)
chr3 (13-300)||(17200950-17201237)
chr3 (11-287)||(13964906-13965179)
chr3 (11-294)||(15948015-15948297)
chr3 (11-289)||(8271948-8272226)
chr3 (26-254)||(15612430-15612658)
chr3 (11-251)||(30140119-30140359)
chr3 (11-223)||(12795880-12796092)
chr3 (11-223)||(18915370-18915582)
chr3 (47-223)||(16258822-16258998)
chr3 (172-287)||(22150288-22150403)
chr3 (11-243)||(3295969-3296201)
chr3 (115-237)||(29680805-29680928)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (11-289)||(12938-13216)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (11-289)||(26109-26387)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (11-289)||(34798-35076)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (11-290)||(23508282-23508561)
chr5 (11-289)||(21934680-21934958)
chr5 (11-289)||(24583808-24584086)
chr5 (40-223)||(23505202-23505383)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-289)||(23676-23954)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (11-289)||(73910-74187)
scaffold0011 (11-289)||(78291-78568)
scaffold0011 (13-287)||(175828-176102)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-289)||(26490-26767)
scaffold0008 (11-289)||(131802-132080)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (11-289)||(5617-5895)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (42-289)||(934-1181)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-286)||(5122-5397)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (11-266)||(2435-2690)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (11-289)||(15290468-15290746)
chr4 (12-289)||(14999331-14999608)
chr4 (11-254)||(9292850-9293093)
chr4 (46-294)||(12340172-12340420)
chr4 (11-254)||(15139015-15139257)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (11-254)||(17696-17938)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (102-300)||(3303-3501)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (64-289)||(24944-25169)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-289)||(926-1202)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-289)||(15623-15901)
scaffold0162 (11-223)||(10553-10765)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (11-266)||(1288-1543)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (26-223)||(800-997)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (62-289)||(7175-7401)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (40-251)||(93791-94002)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (12-202)||(205-395)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (140-254)||(2320-2434)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (140-254)||(24913-25027)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (13-246)||(222-455)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (13-246)||(53967-54200)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (41-254)||(46431-46643)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-232)||(8196-8417)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (35-223)||(3331-3519)
scaffold0409 (35-223)||(11586-11774)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-223)||(51554-51766)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (62-223)||(38-198)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (11-223)||(10757-10970)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (197-289)||(2292-2384)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (103-266)||(77229-77398)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (160-251)||(21077-21168)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 13458708 - 13458995
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458708 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcagtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 13458807  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13458808 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatggttcaacggcatacacacaaaatccaac 13458907  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13458908 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag--cacactaaagaagtagtcacctaaccactagccggggtgttgatgaccatc 13458995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 4442600 - 4442878
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||    
T  4442600 acatcataaacacacaagcctcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcccacctaagtcatctaccagcttcgaaaatgttat 4442699  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4442700 actcttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaac 4442799  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4442800 tcaaaatcaatgttaccaaaattagcatgacacctagcacacactaaggaagtagttaccgaaccactagccggggtgt 4442878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 27172954 - 27173232
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  27172954 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 27173053  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27173054 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27173153  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27173154 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 27173232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 7826573 - 7826851
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  7826573 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 7826672  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7826673 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 7826772  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7826773 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 7826851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27105371 - 27105093
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  27105371 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 27105272  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27105271 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27105172  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27105171 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 27105093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 17926292 - 17926501
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  17926292 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaggacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttccctcctacctcagctaccggcttcgaaaatgttat 17926391  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17926392 actcttgattaaacaattaatgctaacaccaaaagacaacattcaatccataccagagatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaggatccaac 17926491  T
Q  211 ttaaaatcaa 220  Q
    | ||||||||    
T  17926492 tcaaaatcaa 17926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 11284626 - 11284726
Alignment:
Q  154 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11284626 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaaaatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 11284725  T
Q  254 c 254  Q
    |    
T  11284726 c 11284726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 22034738 - 22034887
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaa--atgtt 108  Q
    ||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||| |||||||  || | ||||  |||| |||  |||||    
T  22034738 acatcatgaacactctagattcaccatccaaagacttattcacttgtttcgcggtcaagaactttccacctacttcatctacc--cttctaaagaatgtt 22034835  T
Q  109 atactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatcca 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  22034836 atactcttggttaaacagttaatgttaacaccaaaagataacatccagtcca 22034887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 23902914 - 23903201
Alignment:
Q  13 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 112  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  23902914 atcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttatac 23903013  T
Q  113 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23903014 tcttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccatacaaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactc 23903113  T
Q  213 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23903114 aaaatcaacatttccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 23903201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21194583 - 21194305
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| |  | ||||| ||| ||||| ||||     
T  21194583 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaatttttctaccggctttgaaaaagttac 21194484  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21194483 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaaataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 21194384  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21194383 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagccggggtgt 21194305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20650386 - 20650108
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| || |     
T  20650386 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcgtctaccggcttcgaaaaagtcac 20650287  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20650286 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 20650187  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||    
T  20650186 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttatcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctggtcggggtgt 20650108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 22437053 - 22437329
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |             ||||| ||||||||||||||     
T  22437053 acatcatgaacacttaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttc-------------taccggcttcgaaaatgttac 22437139  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  22437140 acttttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacattcaatccatacaaaaaatcacatccatatgattcaatggaagacacacaagatctaac 22437239  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22437240 tcaaaatcaacattaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaagaagtagtcactgaaccactagtcggggtgtcgatgaccatc 22437329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23155073 - 23154838
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||| | ||||  ||||||||| ||||     
T  23155073 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccagcttcgaaaacgttac 23154974  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  23154973 actcttagtcaaacagttaatgctaaccccaaaagacaacaaccaatccat-cccaaaatcacatccatatgcttcaacggaagatacacaagatcaaac 23154875  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 247  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23154874 tcaaaatcaacattaccataattaacatgacacttag 23154838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 16414841 - 16415114
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  16414841 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 16414940  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |  ||||| |||||||    
T  16414941 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttc-----aaaaatcacaagatccaac 16415035  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16415036 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 16415114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21848368 - 21848090
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || || |||| ||||||| | ||||||  | |||||  || ||||| || |     
T  21848368 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcgttcaaaaacttcctatctaacttttctaccggtttagaaaaagtcac 21848269  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21848268 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21848169  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21848168 tcaaaatcaacatcaacaaaattaacaggacacttagcacacataaacgaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 21848090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24931855 - 24931619
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||| ||||  |||||||| | || | ||| ||||| ||||  ||| || |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  24931855 acatcatagacacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 24931756  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  24931755 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgga----aaacaagatccaac 24931660  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931659 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 24931619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6596 - 6307
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6596 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttattcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttat 6497  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6496 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaacacacacaagatccaac 6397  T
Q  211 ttaaaatcaacattacc-aaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccat 299  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6396 tcaaaatcaacattaccaaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcactgaaccactagccggggtgtcgatgaccat 6307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Original strand, 25130924 - 25131213
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  25130924 acatcataaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaacgttat 25131023  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25131024 actcttggttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 25131123  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25131124 tcaaaatcaatattaccaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 25131213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 22280420 - 22280698
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  22280420 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaagatctcttcacttgttccgcggtcaagaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 22280519  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22280520 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 22280619  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22280620 tcaaaatcaacattacctaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 22280698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24567796 - 24567518
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  24567796 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 24567697  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24567696 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttccatggaagacacacaagatccaac 24567597  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || | | |||| |||| ||||||||    
T  24567596 tcaaaatcaacagtaccaaaatcaacaggacacttagcacacataaaagaagttgtcatcgaaccgctagtcggggtgt 24567518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22739758 - 22739504
Alignment:
Q  35 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||| | ||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  22739758 cgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtctagaacttcctatctaactcttccaccggcttcgaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgct 22739659  T
Q  135 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaatta 234  Q
    ||| |||||    || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22739658 aaccccaaaaattaataaccattccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattacaaaaatta 22739559  T
Q  235 acaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  22739558 acaggacacttagcacacataaaagaagtagttaccgaaccgctagccgaggtgt 22739504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25878661 - 25878531
Alignment:
Q  121 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 220  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25878661 aaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaattcataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaa 25878562  T
Q  221 cattaccaaaattaacaggacacttagcaca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25878561 cattaccaaaattaacaggacacttaacaca 25878531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24829316 - 24829105
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  24829316 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaacgttac 24829217  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  24829216 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaacggaagaca-aaaagatccaac 24829118  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | |||||||||||    
T  24829117 tcaaaatcaacat 24829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12639030 - 12638818
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  ||  |||| || |     
T  12639030 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttacaaaaagtcac 12638931  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| |||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12638930 actcctagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagctaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaac 12638831  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | |||||||||||    
T  12638830 tcaaaatcaacat 12638818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12644587 - 12644485
Alignment:
Q  121 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 220  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12644587 aaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactcaaaatcaa 12644488  T
Q  221 cat 223  Q
    |||    
T  12644487 cat 12644485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 222
Target Start/End: Original strand, 34821575 - 34821675
Alignment:
Q  121 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 220  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  34821575 aaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaa-tcgcatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaa 34821673  T
Q  221 ca 222  Q
    ||    
T  34821674 ca 34821675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 263
Target Start/End: Original strand, 27541905 - 27542058
Alignment:
Q  115 ttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaa-----aaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaa 209  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| || |     |||||||||||||||||| ||| || |  || || ||||||||    
T  27541905 ttggttaaacaattaatgttaaccccaaaagacaacatccaattcattccgaaaattaaatcacatccatatgctccaaaggtatgcaaaccaaatccaa 27542004  T
Q  210 cttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 263  Q
       |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  27542005 tgcaaaatccacattaccaaaattaacatgacacttaacacacaccaaggaagt 27542058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22133412 - 22133123
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  22133412 acatcataaacacacaagctccaccgtccaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggcttcgaaaacgttac 22133313  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22133312 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 22133213  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22133212 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcgcacacaaaacaagtagtcaccgaaccattagccggggtgtcgatgaccatc 22133123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41215516 - 41215261
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  41215516 acatcataaacacacaagcctcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttat 41215417  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  41215416 actattcgttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcaataccaaaaatcacatccatatgctaaaacggaagacaaacaagatccaac 41215317  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 266  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41215316 tcaaaattaatgttaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaggaagtagt 41215261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20829052 - 20828774
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  20829052 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20828953  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20828952 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 20828853  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20828852 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 20828774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 20527752 - 20528030
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  20527752 acatcataaacacagaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgcttcgcggtcaagaacttcccatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20527851  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  20527852 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccatatcaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaac 20527951  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  20527952 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagtcggggtgt 20528030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 20927753 - 20928031
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||| | | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || |||||||| |     
T  20927753 acatcataaacacacaagctttaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaatgtcac 20927852  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  20927853 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaacaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 20927952  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20927953 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 20928031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 20171946 - 20172113
Alignment:
Q  96 cttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaaga 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||  ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |  |||||| |      
T  20171946 cttcgagaatgttatacttttggtcaaaaaattaatgtcaacactaaaagacgacatccagtccttaccgaaaatcacatccatattcaccaacggcaag 20172045  T
Q  196 cacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 263  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20172046 caaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacaaactaaggaagt 20172113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21200588 - 21200445
Alignment:
Q  37 tccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||| |||  || | ||| | ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  21200588 tccaaagacttcttcacttgttgtgcggttaaaaacttcccatctacttcatttactggcttagagattgttatactcttggttaaatagttaatattaa 21200489  T
Q  137 caccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccata 180  Q
    |||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21200488 caccaaaatatagcattcaatccataccaaaaatcacattcata 21200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Original strand, 12200390 - 12200443
Alignment:
Q  153 ccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatc 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||    
T  12200390 ccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtcaacggcagacacactaaatc 12200443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 2346 - 2575
Alignment:
Q  70 aacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaa 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2346 aacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccagaagacaacatccaatccataccaaaaa 2445  T
Q  170 tcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttac 269  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2446 tcacacccatatgctttaac-gaagacacacaagatccaactcaaaatcaaaattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaggaagtagtcac 2544  T
Q  270 ctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  2545 cgaacaactagtcggggtgtcgatgaccatc 2575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 7870 - 8148
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||     
T  7870 acatcatgaacacacaagcttcgccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaatgttac 7969  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7970 acttctggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagagaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaac 8069  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8070 ttaaaatcaacatcaccaaaattgacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 8148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21420 - 21177
Alignment:
Q  36 gtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgcta 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21420 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 21321  T
Q  136 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaa 235  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||    
T  21320 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacac---------------------acattaccaaaattaa 21242  T
Q  236 caggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21241 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 21177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30996 - 30753
Alignment:
Q  36 gtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgcta 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30996 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 30897  T
Q  136 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaa 235  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||    
T  30896 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacac---------------------acattaccaaaattaa 30818  T
Q  236 caggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30817 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 30753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 90215 - 90493
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || | ||| ||||| ||||  ||| || |||| ||||||| | ||||||| | || || ||| ||||| ||||     
T  90215 acatcatgaacacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctatcggcttagaaaaagttac 90314  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  90315 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatacgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 90414  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  90415 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgccagccggggtgt 90493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23025470 - 23025251
Alignment:
Q  35 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23025470 cgtccaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttacactcttggttaaacaattaatgct 23025371  T
Q  135 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaatta 234  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23025370 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacgcacaagatccaactcaaaatcaatgttaccaaaatta 23025271  T
Q  235 acaggacacttagcacacac 254  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  23025270 acaagacacttagcacacac 23025251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16380106 - 16379828
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  16380106 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 16380007  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16380006 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16379907  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16379906 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 16379828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 18401193 - 18401448
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||  ||||| ||||     
T  18401193 acatcatgaacacacaagcttcatcatccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagttac 18401292  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18401293 actcttagtcaaacaattaatgataacccaaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagacacaagatccaac 18401392  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 266  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18401393 tcaaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 18401448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1646547 - 1646269
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| || | ||||| ||| ||||| || |     
T  1646547 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaattcttctaccggcttagaaaaagtcac 1646448  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  1646447 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagaaaaacaagatccaac 1646348  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1646347 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 1646269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 16100563 - 16100841
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  16100563 acatcatgaacacccaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaggaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 16100662  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| | ||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16100663 actcttagtcaaacaattaatggtaaccctaaaagctaacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacgcaagatccaac 16100762  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  16100763 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgt 16100841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16647702 - 16647424
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||  | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  16647702 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcatatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 16647603  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16647602 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16647503  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  16647502 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgt 16647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 16234907 - 16235149
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||  | || |||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  16234907 acatcataaacacacaagcttcgccatctaaagatctcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 16235006  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  16235007 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccaaaacaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacaaacaagatccaac 16235106  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 254  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16235107 tcaaaatcaacattacc-aaattaacaggacacttagcacacac 16235149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 18578098 - 18578212
Alignment:
Q  140 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18578098 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 18578197  T
Q  240 acacttagcacacac 254  Q
    |||||||||||||||    
T  18578198 acacttagcacacac 18578212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18836265 - 18836178
Alignment:
Q  136 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  18836265 acaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacagacaagatccaactcaaaatcaacat 18836178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19985800 - 19985697
Alignment:
Q  148 aacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19985800 aacaaccaattcatacaaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaggatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaa 19985701  T
Q  248 caca 251  Q
    ||||    
T  19985700 caca 19985697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 267
Target Start/End: Original strand, 14133824 - 14133900
Alignment:
Q  191 gaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagtt 267  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14133824 gaagacacacaagatccagctcaaaatcaaccttaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagtt 14133900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 14131087 - 14131171
Alignment:
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaaga 195  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14131087 actcttggtcaaacaattaatacaaactccaaaagataacatccaatccataccaaagatcacatccatatgtttcaatggaaga 14131171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Original strand, 14131018 - 14131062
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactt 55  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14131018 acatcataaacacacaagcttcaccgtcgaaagacttcttcactt 14131062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4493 - 4217
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  4493 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgttcagcggtcatgaacttcctatctaactcctctaccggcttagaaaaagttac 4394  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4393 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 4294  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 287  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4293 tcaaagtcaacattaccaaaattaacagggcatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggt 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 3196 - 3436
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  3196 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggttaagaacttcctatctagctcttctaccggcttcgaaaacgttaa 3295  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3296 actcttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaatggaagacacacaagatccaac 3395  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3396 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaccaca 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6150665 - 6150402
Alignment:
Q  26 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 125  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |  || ||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| || | |||||| || |||||    
T  6150665 aagcttcaccatctaaagacttcttcacctgctctacgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaaca 6150566  T
Q  126 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacatta 225  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6150565 attaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatta 6150466  T
Q  226 ccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  6150465 ccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtaaccgaacctctagccggggtgt 6150402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 30149670 - 30149948
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  30149670 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30149769  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30149770 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30149869  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30149870 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 30149948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 17200950 - 17201237
Alignment:
Q  13 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 112  Q
    ||||| |||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||| || |||||||| |||||  || ||||||  || ||    
T  17200950 atcatgaacacacaagcctcaccgttcaaagacttcttcacttgctacgcggtcaagaacttcctacttaactcgtctaccggttttgaaaatactacac 17201049  T
Q  113 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 212  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17201050 tcttagttaaccaattaatgctaaccccaaaagatatcaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactc 17201149  T
Q  213 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||| |||||    
T  17201150 aaaatcaacattacctaaattaacaggacaattagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccgctagcacgggtgtcgatgaccatc 17201237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13965179 - 13964906
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  13965179 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccacggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13965080  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13965079 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13964980  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 287  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  13964979 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacaca-taa--aagtagtcaccgaaccgctagccggggt 13964906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15948297 - 15948015
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||  ||  | ||||||| | ||||| ||| |||||  |||     
T  15948297 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaatctcttatctaactcttctaccggcttagaaaactttac 15948198  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || || || ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  15948197 actcttagtcaa-caattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttaaacggaagacaaacaagatccaac 15948099  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatg 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15948098 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgttgatg 15948015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8272226 - 8271948
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  8272226 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 8272127  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8272126 actcctagtcaaacaattaatgcgaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8272027  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8272026 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 8271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Original strand, 15612430 - 15612658
Alignment:
Q  26 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 125  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||   ||  |||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || | |||| | || |||||    
T  15612430 aagcctcatcttctaaagacttcttcacttgccccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcctagtcaaaca 15612529  T
Q  126 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacatta 225  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  15612530 attaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatta 15612629  T
Q  226 ccaaaattaacaggacacttagcacacac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612630 ccaaaattaacaggacacttagcacacac 15612658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 30140119 - 30140359
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  30140119 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30140218  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30140219 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30140318  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 251  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30140319 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttaacaca 30140359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 12795880 - 12796092
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | || || ||| ||||| ||||     
T  12795880 acatcataaacactcaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaacggcttagaaaaagttac 12795979  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12795980 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 12796079  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | |||||||||||    
T  12796080 tcaaaatcaacat 12796092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 18915370 - 18915582
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||     
T  18915370 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaacgttac 18915469  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  18915470 actcttagtaaaacaattaatgataacaccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagccaaacaagatccaac 18915569  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | ||| |||||||    
T  18915570 tcaaagtcaacat 18915582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 16258822 - 16258998
Alignment:
Q  47 tcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaagga 146  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |     
T  16258822 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 16258921  T
Q  147 caacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16258922 taacaaccaatccataccaaaaataacatccatattcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 16258998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22150403 - 22150288
Alignment:
Q  172 acatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacct 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||     
T  22150403 acatccatatgcttcaacggaagacaaacaagacccaactcaaaattaacataaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccg 22150304  T
Q  272 aaccactagccggggt 287  Q
    |||| |||||||||||    
T  22150303 aaccgctagccggggt 22150288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3296201 - 3295969
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||   ||||||  | ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||   | | || ||||||||    
T  3296201 acatcataaacacactagcttcgccatccgaagacttcttcagtttctccgcggtcaagaacttcccacctaccacatctactagcgtagagaatgttat 3296102  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || | |||||| ||||| || || ||||||| |||||||  |||||| |  || || ||||||||     
T  3296101 acttttggttaaacagttaatgttaacccaaaaagatagcatccagtccattccgaatatcacattcatatgcaccaacggcaagcaaactaaatccaat 3296002  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacac 243  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  3296001 tcaaaatcaacgttgccaaaattaataggacac 3295969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29680928 - 29680805
Alignment:
Q  115 ttggttaaacagttaatgctaacacc-aaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactta 213  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |   | || |||||||| | |    
T  29680928 ttggttaaacaattaatattaacccccaaaagataacatctaatccattccaaaaatcacatccatatgctccaaagataagtaaactaaatccaattca 29680829  T
Q  214 aaatcaacattaccaaaattaaca 237  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  29680828 aaatccacaataccaaaattaaca 29680805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 12938
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  13216 acatcataaacacataagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13117  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13116 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaattcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13017  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  13016 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcactaaaccgctagccggggtgt 12938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 26109 - 26387
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  26109 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 26208  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26209 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 26308  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26309 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 26387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 34798 - 35076
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||| || ||||||||||  ||| ||||||| || |||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  34798 acatcataaacacacaagcttcaccatccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaatttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 34897  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34898 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 34997  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  34998 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 35076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Original strand, 23508282 - 23508561
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  23508282 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23508381  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  23508382 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 23508481  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgtt 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23508482 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacacacataaaagaagtagtcaccaaaccgctagccggggtgtt 23508561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21934958 - 21934680
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  21934958 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 21934859  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21934858 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21934759  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  21934758 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccagggtgt 21934680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 24583808 - 24584086
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || |||| || ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  24583808 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggttaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 24583907  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24583908 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 24584007  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  24584008 tcaaaatcaatatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 24584086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Original strand, 23505202 - 23505383
Alignment:
Q  40 aaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacac 139  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | ||||| | ||||||||||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  23505202 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccgacttcgaaaa-gtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 23505300  T
Q  140 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
    |||| |  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  23505301 caaaagctaacaatcaatccatac-aaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacat 23505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23676 - 23954
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  23676 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23775  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23776 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 23875  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23876 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 23954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 74187 - 73910
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  ||||| || | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| ||  |||||| ||||||||| ||||     
T  74187 acatcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 74089  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  74088 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 73989  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  73988 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 73910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 78568 - 78291
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  ||||| || | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| ||  |||||| ||||||||| ||||     
T  78568 acatcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 78470  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  78469 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 78370  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  78369 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 78291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 176102 - 175828
Alignment:
Q  13 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 112  Q
    |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||   ||| || || |||||||    
T  176102 atcataaacacactagcttcacagtccaaagacttcttcacttgctccaaggtcaacaacttcccacctacctcatctactagcttagagaaagttatac 176003  T
Q  113 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||     
T  176002 tcttggttaaacaattaatgctaacactaaaagacaacatccagtccataccaaaaatcacatccatgtgctttaacggaagaaacacaagaaccaactc 175903  T
Q  213 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   || |||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  175902 aaaatcaacattaccaaagttaacgggacacttagaacacctcaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggt 175828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 26490 - 26767
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  26490 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 26589  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26590 actcttagtcaaacaattactgctaaccccaaaagctaacaaccaatctataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 26689  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26690 -tcaaattaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 26767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 132080 - 131802
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  132080 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 131981  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| || || ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  131980 actcctagtcaaacaatttattctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 131881  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  131880 ttaaaattaacattaccaaaattaataggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 131802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5895 - 5617
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| | | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  5895 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaactttctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 5796  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||     
T  5795 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatcaaat 5696  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||    
T  5695 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaactgctagcaggggtgt 5617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1181 - 934
Alignment:
Q  42 agacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacacca 141  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  1181 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttttaccggcttagaaaacgttacactcttagtcaaacaattaatgctaacccca 1082  T
Q  142 aaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggac 241  Q
     | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1081 gaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcagtattaccaaaattaacaggac 982  T
Q  242 acttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  981 acttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5397 - 5122
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  5397 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 5298  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5297 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 5198  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccgggg 286  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5197 acaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccgggg 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 2435 - 2690
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| | | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  2435 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaactttctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 2534  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  2535 actcttagtgaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaaaacacacaagatctaac 2634  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 266  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2635 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcgcacataaaagaagtagt 2690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15290746 - 15290468
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||  ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  15290746 acatcataaacacacaagtctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 15290647  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| |||| |||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15290646 actcctagtcaaacaattaacgctaaccccaaaagcgaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 15290547  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15290546 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 15290468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 14999331 - 14999608
Alignment:
Q  12 catcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttata 111  Q
    |||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||  | ||||| | | ||||| |||  |||| |||| |    
T  14999331 catcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggccaagaacctcttatctaacccttctaccggcttacaaaacgttaca 14999430  T
Q  112 ctcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaact 211  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14999431 ctcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaataacaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaact 14999530  T
Q  212 taaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  14999531 caaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 14999608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 9292850 - 9293093
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||||| ||||||| | | |||||   ||||  ||||| ||| || |     
T  9292850 acatcatgaacacacaagtttcaccgtccaaaaacttcttcacttgctccgtggtcaagaacttcctatccaactctcctaccagcttcggaaaagtcac 9292949  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||  |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9292950 actcttagtcaaacaattaatgctaacctcaaaagctaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 9293049  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9293050 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 9293093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12340420 - 12340172
Alignment:
Q  46 ttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaagg 145  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  |  | ||| || |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |    
T  12340420 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctacctcctccaatggcttagataatgttatactcttggttaagcaattgatgttaacaccaaaag 12340321  T
Q  146 acaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacactt 245  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  12340320 acaacatctagtccataccaaaaatcacgtccatgtgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaagtcaacattaccagagttaacatgacactt 12340221  T
Q  246 agcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatg 294  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  12340220 agcgcacaccaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggtgtcgatg 12340172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15139257 - 15139015
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||  ||||| || |     
T  15139257 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttctttacttgctccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagtcac 15139158  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15139157 actcctagtcaaacaattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaattacatccataagcttcaacggaagaca-acaagatccaac 15139059  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15139058 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 15139015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17938 - 17696
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  17938 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctacggtcaaaaacttcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 17839  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  17838 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagattcaac 17739  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 254  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17738 -taaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacac 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3501
Alignment:
Q  102 aaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacaca 201  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3303 aaatattatactcttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatgtgcttcaacgaaagacacaca 3402  T
Q  202 aaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 300  Q
    | ||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  | ||||| | |||||||| |||| |||||    
T  3403 agatccaactctaaatcaacactaccaaaacgaacaagacacttagcacaccctaacgaagtagtcactgagccactggtcggggtgtcgatgaccatc 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 289
Target Start/End: Original strand, 24944 - 25169
Alignment:
Q  64 gtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccatac 163  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |  |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  24944 gtcaagaacttcctatctaactcttcaaccggctttgaaaaagttacactcttcgtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccatac 25043  T
Q  164 caaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  25044 caaaaatcacatccatatgctttaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaataggacatttagcacccataaaagaagt 25143  T
Q  264 agttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||    
T  25144 agtcaccgatccgctagccggggtgt 25169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 926 - 1202
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| || | || || ||| ||||  || |     
T  926 acatcataaacacacaagcttctccgtccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattcttctatcggcttagaaa--gtcac 1023  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  1024 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagaaacaagatccaac 1123  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1124 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 1202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 15623 - 15901
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  15623 acatcatgaacacaaaagcttcaccatctagagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 15722  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  15723 actcttagtcaaacaattaatgctagccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaactcacatccatatgcttcaacggaaggcaaacaagatccaac 15822  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||    
T  15823 tcaaaatcagcattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagacagggtgt 15901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10765 - 10553
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  10765 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaaaatttcttcacttgttccgcgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 10666  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10665 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaatcaatccataccaaaaattacatccatattcttcaacggaagacatacaagatccaac 10566  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | |||||||||||    
T  10565 tcaaaatcaacat 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1543 - 1288
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||||   | || || ||| | ||| || |     
T  1543 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaaccgttctatcggcttaggaaaagtcac 1444  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  1443 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaac 1344  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 266  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1343 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcacacataaaagaagtagt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Original strand, 800 - 997
Alignment:
Q  26 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 125  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||  ||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  800 aagcttcaacgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccagcttcgaaaaagttacactcttagtcaaaca 899  T
Q  126 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
     ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  900 attaatgctaaccccaaaagataacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7401 - 7175
Alignment:
Q  62 cggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccat 161  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||| | || | |||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  7401 cggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaataagtcacactcctagtcaaacaattaatactaaccccaaaagccaacaaccaatccat 7302  T
Q  162 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  7301 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaactggacatttagcacaca-taaagaa 7203  T
Q  262 gtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  7202 gtagtcactgaaccgctagccggggtgt 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 94002 - 93791
Alignment:
Q  40 aaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacac 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | | ||||| | ||||| ||| ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  94002 aaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggctttgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 93903  T
Q  140 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 239  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  93902 caaaagttaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactccaaatcaacattaccgaaattaacagg 93803  T
Q  240 acacttagcaca 251  Q
    ||||||| ||||    
T  93802 acacttaacaca 93791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 205
Alignment:
Q  12 catcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttata 111  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  395 catcataaacacacaagcttctccgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaatgttaca 296  T
Q  112 ctcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaa 202  Q
    |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295 ctcttaatcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaa 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 2320 - 2434
Alignment:
Q  140 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 239  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2320 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 2419  T
Q  240 acacttagcacacac 254  Q
    |||||||||||||||    
T  2420 acacttagcacacac 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25027 - 24913
Alignment:
Q  140 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 239  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25027 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgggagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 24928  T
Q  240 acacttagcacacac 254  Q
    |||||||||||||||    
T  24927 acacttagcacacac 24913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 222 - 455
Alignment:
Q  13 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 112  Q
    ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| |  |||||| | || || ||| ||||| || | ||    
T  222 atcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacac 321  T
Q  113 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 212  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  322 tcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaacctaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactt 421  T
Q  213 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  422 aaaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54200 - 53967
Alignment:
Q  13 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 112  Q
    ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| |  |||||| | || || ||| ||||| || | ||    
T  54200 atcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacac 54101  T
Q  113 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 212  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54100 tcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaactaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactt 54001  T
Q  213 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54000 aaaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 53967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46643 - 46431
Alignment:
Q  41 aagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacacc 140  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| |||| ||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  46643 aagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttattcaaaaaattaatgctaacccc 46544  T
Q  141 aaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagga 240  Q
    ||| |  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46543 aaaagctaacaactaatccataccaaaa-tcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccgaaatttacagga 46445  T
Q  241 cacttagcacacac 254  Q
    ||||||||| ||||    
T  46444 cacttagcaaacac 46431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8196
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  8417 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 8318  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8317 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataaaatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8218  T
Q  211 ttaaaatcaacattaccaaaat 232  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  8217 tcaaaatcaacatcaccaaaat 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3331
Alignment:
Q  35 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||| |    
T  3519 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgat 3420  T
Q  135 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3419 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11774 - 11586
Alignment:
Q  35 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||| |    
T  11774 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgat 11675  T
Q  135 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11674 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 51554 - 51766
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||  | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  51554 acatcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctacccaactcttctaccggcttagaaaaagttac 51653  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||  |||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  51654 actcttagtcaaacaattaatgctaaccacaaaagctaacaaccaatccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagataaacaagatccaat 51753  T
Q  211 ttaaaatcaacat 223  Q
    | |||||||||||    
T  51754 tcaaaatcaacat 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 38 - 198
Alignment:
Q  62 cggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccat 161  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| || | | |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||    
T  38 cggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtaacaatcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccat 137  T
Q  162 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  138 accaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaac-aaatccaactcaaaatcaacat 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10970 - 10757
Alignment:
Q  11 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 110  Q
    ||||||| |||||  |||||||  | || ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  10970 acatcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaacgttac 10871  T
Q  111 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 210  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10870 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaac 10771  T
Q  211 t-taaaatcaacat 223  Q
    |  |||||||||||    
T  10770 tccaaaatcaacat 10757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2384 - 2292
Alignment:
Q  197 acacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 289  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2384 acacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 77229 - 77398
Alignment:
Q  103 aatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgc------ttcaacggaagac 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||        |||||  |       
T  77229 aatgttatactcttggttaaatagttaatgttaactccaaaggataacatccaatccataccgaaaataacatccatttgcaccaatgacaacgttacca 77328  T
Q  197 acacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 266  Q
    | | || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  77329 aaataacattcaactcaaaatcaacgttaccaaaattaacaggaaacttagcacaaactaaggaagtagt 77398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 21077
Alignment:
Q  160 ataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21168 ataccgaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatacaactcaaaatcgacgctaccaaaactaacgggacacttagcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University