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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9248_low_1 (Length: 875)

Name: NF9248_low_1
Description: NF9248
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9248_low_1
NF9248_low_1
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (1-860)||(36490127-36490984)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 817; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 817; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 36490984 - 36490127
Alignment:
Q  1 cactcctctcattcatatcaactttcccttcaattttgaagttaaggaaacgttgttagggaagagtagtatctcccaagtggcttccaattcaatttaa 100  Q
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T  36490984 cactcctctcattcatatcaactttcccttcaattttgaagttaaggaaacgttgttagggaagagtagtatctcccaagtggcttccaattcaatttaa 36490885  T
Q  101 cttttccaatgaaatgaactagtcacatacattttttctcaaatagttacactatgccaattgtattccctcatatgttatttgaatcataacaatcaac 200  Q
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T  36490884 cttttccaatgaaatgaactagtcacatacattttttctcaaatagttacactatgccaagtgtattccctcatatgttatttgaatcataacaatcaac 36490785  T
Q  201 atcttaagtaaatctaagttacctcgaatagtagtctatgcagttgcgcgcggataatacatttagtttaccaaaacaaaatcatatacttttaaatcaa 300  Q
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T  36490784 atcttaattaaatctaaattacctcaaatagtagtctatgcagttgcgcgcggataatacatttagtttaccaaaacaaaatcatatacttttaaatcaa 36490685  T
Q  301 gccaaatttcaatatgataatcaaaacatgcaaaacaaaattgctttaaaatcttagcaatacataacatcatttacattccaatctaatcaaaatatta 400  Q
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T  36490684 gccaaatttcaatatgataatcaaaacatgcaaaacaaaattgctttaaaatcttagcaatacataacatcatttacattccaatctaatcaaaatatta 36490585  T
Q  401 gcattgcaacaatgtttaggagaatcaatcctgcttgtatggctttatcagacgagttgtatctgcaatctccttatgaatacattcatgagattctcat 500  Q
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T  36490584 gcattgcaacaatgtttaggagaatcaatcctgcttgtatggctttatcagacgagttgtatctgcaatctccatatgaatacattcacgagattctcat 36490485  T
Q  501 ttattatttaaggaaaaactgactctaattatggaagcatgataaagcattataattaagttaaacattcggatattactgagttcaaagaaatagatcc 600  Q
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T  36490484 ttattatttaaggaaaaactgactctaattatggaagcatgataaagcattataattaagttaaacattcggatattactgagttcaaagaaatagatcc 36490385  T
Q  601 ttgtgattttgtattaatagttagtcatacaaattaattgaaaaatcatgtgtgagtataggttataaattgcatgaaggaaggaagaaagaaatgcaga 700  Q
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T  36490384 ttgtgattttgtattaatagttagtcatacaaattaattgaaaaatcatgtgtgag--taggttataaattgcatgaaggaaggaagaaagaaatgcaga 36490287  T
Q  701 cagaacagaacacacataaagaaactccattgtctgttggagaaaggttcgaaaaacttcgagcaaatcaatatatgcgcatccttctcttgtttagtaa 800  Q
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T  36490286 cagaacagaacacacataaagaaactccattgtctgttggagaaaggttcgaaaaacttcgagcaaatcaatatatgcgcatccttcttttgtttagtaa 36490187  T
Q  801 ttttattccactgtgacttggatctccacttatctgataatgtgttattaactttttctt 860  Q
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T  36490186 ttttattccactgtgacttggatctccacttatccgataatgtgttattaactttttctt 36490127  T

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