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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9248_low_2 (Length: 625)

Name: NF9248_low_2
Description: NF9248
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9248_low_2
NF9248_low_2
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (6-609)||(46532774-46533386)
chr7 (18-329)||(37338684-37338993)
chr7 (1-355)||(27616240-27616582)
chr7 (33-296)||(32716466-32716728)
chr7 (488-594)||(46525003-46525109)
chr7 (16-100)||(44572565-44572649)
chr7 (3-213)||(22290779-22290989)
chr7 (90-212)||(45215999-45216121)
chr7 (155-227)||(44572487-44572559)
chr7 (10-65)||(9730090-9730145)
chr7 (3-64)||(11812685-11812746)
chr7 (1-65)||(10678255-10678319)
chr7 (85-252)||(11820525-11820691)
chr7 (11-64)||(5741605-5741658)
chr7 (228-329)||(10678435-10678534)
chr7 (1-50)||(28026811-28026860)
chr7 (1-50)||(45216113-45216162)
chr7 (3-63)||(11815688-11815748)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (16-353)||(1255557-1255897)
chr6 (1-353)||(14494335-14494686)
chr6 (1-301)||(12843818-12844118)
chr6 (1-329)||(17539932-17540260)
chr6 (1-353)||(56923-57263)
chr6 (1-194)||(19294300-19294490)
chr6 (16-301)||(19542067-19542354)
chr6 (1-192)||(34708843-34709034)
chr6 (1-165)||(34013452-34013616)
chr6 (1-165)||(34011234-34011398)
chr6 (196-301)||(34709062-34709167)
chr6 (22-101)||(12790564-12790643)
chr6 (83-243)||(33234861-33235016)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (3-351)||(21408750-21409105)
chr3 (3-353)||(11410600-11410949)
chr3 (1-329)||(43921863-43922190)
chr3 (91-276)||(10516137-10516323)
chr3 (1-353)||(26565226-26565566)
chr3 (1-276)||(27063655-27063931)
chr3 (91-353)||(10657334-10657595)
chr3 (3-97)||(27111147-27111242)
chr3 (198-301)||(14218511-14218615)
chr3 (1-63)||(17716029-17716091)
chr3 (1-63)||(19017258-19017320)
chr3 (86-191)||(2227278-2227383)
chr3 (31-108)||(27109420-27109497)
chr3 (131-213)||(49860462-49860544)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (1-411)||(32676474-32676881)
chr5 (6-166)||(40837726-40837886)
chr5 (1-247)||(38989253-38989491)
chr5 (158-329)||(40837975-40838144)
chr5 (3-65)||(41815795-41815856)
chr5 (17-63)||(10613155-10613201)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (11-329)||(32740775-32741090)
chr1 (17-211)||(23431798-23431992)
chr1 (1-247)||(9148999-9149243)
chr1 (16-353)||(48632480-48632810)
chr1 (86-213)||(18476506-18476634)
chr1 (9-276)||(7021540-7021811)
chr1 (82-252)||(3387651-3387821)
chr1 (82-253)||(3954946-3955117)
chr1 (157-263)||(126323-126430)
chr1 (1-58)||(10171639-10171696)
chr1 (234-349)||(18488357-18488471)
chr1 (4-141)||(16426350-16426487)
chr1 (81-165)||(125172-125256)
chr1 (4-64)||(30883217-30883277)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (85-349)||(17732772-17733038)
chr4 (80-353)||(40289050-40289320)
chr4 (1-353)||(45612333-45612681)
chr4 (1-193)||(54305571-54305763)
chr4 (119-296)||(31734528-31734703)
chr4 (1-165)||(55680652-55680816)
chr4 (18-63)||(40289806-40289851)
chr4 (205-276)||(3419971-3420042)
chr4 (1-50)||(35529482-35529532)
chr4 (81-253)||(2641132-2641308)
chr4 (159-298)||(44507760-44507900)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (3-301)||(28420958-28421256)
chr8 (3-301)||(15131915-15132212)
chr8 (16-444)||(15850259-15850688)
chr8 (9-263)||(44502214-44502468)
chr8 (1-329)||(18602989-18603304)
chr8 (29-353)||(1225999-1226323)
chr8 (11-202)||(37855085-37855276)
chr8 (82-247)||(18393552-18393717)
chr8 (1-61)||(44508418-44508478)
chr8 (18-65)||(8690012-8690059)
chr8 (350-431)||(18602879-18602961)
chr8 (19-64)||(7619612-7619657)
chr8 (4-64)||(3159758-3159818)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (1-233)||(9929546-9929778)
chr2 (1-353)||(26575982-26576329)
chr2 (1-194)||(32200877-32201070)
chr2 (11-301)||(27003960-27004253)
chr2 (1-278)||(34409551-34409830)
chr2 (3-193)||(13037225-13037415)
chr2 (90-247)||(44649967-44650126)
chr2 (218-323)||(13039011-13039116)
chr2 (1-65)||(41848934-41848998)
chr2 (1-247)||(17651174-17651420)
chr2 (104-353)||(4747977-4748224)
chr2 (1-50)||(4748257-4748306)
chr2 (236-301)||(9929799-9929864)
chr2 (1-65)||(18724894-18724959)
chr2 (4-65)||(44650141-44650202)
chr2 (43-114)||(40279805-40279874)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (2-253)||(12794-13046)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-276)||(70042-70320)
[»] scaffold1723 (1 HSPs)
scaffold1723 (29-192)||(393-555)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 609
Target Start/End: Original strand, 46532774 - 46533386
Alignment:
Q  6 accgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  46532774 accgctaatttaaaaaatatagaacactgacactgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaattaaaatacatatataagcatc 46532873  T
Q  106 taacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  46532874 taacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctgctgtcaaaaaagctaaaaatgtt 46532973  T
Q  206 ataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46532974 ataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagctcttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaaaaac 46533073  T
Q  306 tgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgtcagacaccggttttaggagtctcgaattaaaggaaaaacaactttatttagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46533074 tgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgtcggacaccggttctaggagtctcgaattaaaggaaaaacaactttatttagg 46533173  T
Q  406 atatcgattttaattatccggcacgtatcgtac-----------gagtgttggacaccgcgacgcggttagtcctagaggtgtcgcttcataggtgataa 494  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46533174 atatcgattgtagttgtctggcacgtatcgtacaagtattagaggagtgtcggacaccgcgacgcggttagtcctagaggtgt--cttcataggtgataa 46533271  T
Q  495 ttattaatcaccaatatattcccacttggaaacatttatttttgttggcaccgattttcatttgtttcctcttgtttgtctaattctccggctaagtaac 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46533272 ttattaatcaccaatatattcccacttggaaacatttatttttgttggcaccgattttcatttgtttcctcttgtttgtctatttctccggctaagtaac 46533371  T
Q  595 tctttattttgtctt 609  Q
    |||||||||||||||    
T  46533372 tctttattttgtctt 46533386  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37338993 - 37338684
Alignment:
Q  18 aaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaa 117  Q
    ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  37338993 aaaaatacaggacaccggcaccgttacatatatgttaatttatttatagacagtctaaattgaaaatcaaaatacatatataagcatctaacttgagcaa 37338894  T
Q  118 gttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgt 217  Q
     |||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  37338893 attatttcattagaaaatgttatcaaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaagttaaaaatgttattatcaacttt 37338794  T
Q  218 aatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatat 317  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||| | | |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  37338793 aatgtttaaaatccctaattgatcaacatttctcaaagcatatgtaactcttgtatctacggtatgtggaagcaagagagaaa--aaatgtttcagatat 37338696  T
Q  318 ttgtctaagttg 329  Q
    |||||| |||||    
T  37338695 ttgtctgagttg 37338684  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 27616240 - 27616582
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| || ||||    
T  27616240 tcgacaccgttaatgtaaaaaatacaggacaccgacaccgctacatgtatgttaatttatttataggtggtctaaaatgaaaatcaaagtacgtacataa 27616339  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||| ||||||| |  |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||| ||||| | |||    
T  27616340 gcatcttacttgagcagtttatttaattagaacaagttctaaaacaagatatcatagtatttgacttttatttatacatctactatcagaaaagctaaaa 27616439  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataa-cccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaa 299  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||           | |||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  27616440 atgttataatcaactttaatgtctataaccccctaattgaccatcatttctcaa-----------ctcttgtatctacgacgtgtggaagcaagagagaa 27616528  T
Q  300 aacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgtca 355  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  27616529 aa-aaatgtttcagatatttgtctgagttg-tccgacacggcttgtatgagtgtca 27616582  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32716728 - 32716466
Alignment:
Q  33 cgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaa 132  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||  || || ||| |||  ||    
T  32716728 cgacactgctacatatatattaattaatttatagattgtctaaaatgaaaatcaaaatacatatatgtatatctaacttgaataatttgttttattaaaa 32716629  T
Q  133 aaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccc 232  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||| | || |||||||| | |||||| |||||||| |||||| |  |||||||| |||||| ||||| |||    
T  32716628 aaagttctaaaacaagatacaatagtatttgatctttatttattcatccactatcgaaaaagttaaaaatggtgcaatcaattttaatgtctataatccc 32716529  T
Q  233 taattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagaga 296  Q
    | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  32716528 tcatt-atcaaaatttctcaatatatatgtaactcttgtatttatgatgtgtggaagtaagaga 32716466  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 488 - 594
Target Start/End: Original strand, 46525003 - 46525109
Alignment:
Q  488 gtgataattattaatcaccaatatattcccacttggaaacatttatttttgttggcaccgattttcatttgtttcctcttgtttgtctaattctccggct 587  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  46525003 gtgataattattaaacaccactatattcccacttagaaatatttatttttgttggcaccgattttcatttgtttccgcttgtttgtcaatttctccgcct 46525102  T
Q  588 aagtaac 594  Q
    || ||||    
T  46525103 aactaac 46525109  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44572649 - 44572565
Alignment:
Q  16 taaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  44572649 taaaaaatataggaaaccgacaccgctacatatatgttaatttatttaaagttggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatataa 44572565  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 22290779 - 22290989
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||   || ||| |  ||||  ||| |||||||||||      
T  22290779 gacaccactaatttaaaaaatataggacaccgataccactacatttatgttaatttgtttaaagacagtctaaaaggaaaaataaattacatatataaac 22290878  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    |  |||||| |  || ||||||||||  ||||||||||| || |||||| | | |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  22290879 aattaacttaaacaatttatttcattaaaaaaagttctacaacaagatatcattgtatttgacctttatttattaatctactatcaaaaaagctaaaaat 22290978  T
Q  203 gttataatcaa 213  Q
      |||||||||    
T  22290979 tatataatcaa 22290989  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45216121 - 45215999
Alignment:
Q  90 tacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaa 189  Q
    |||||||||||  | |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  45216121 tacatatataaacaactaacttgagcaatttatgtcattagaaaaagttctacaataagatgtcatattatttgacctttatttattcatctactgtcaa 45216022  T
Q  190 aaaagtttaaaatgttataatca 212  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    
T  45216021 aaaagctaaaaatgatataatca 45215999  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44572559 - 44572487
Alignment:
Q  155 tagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttata 227  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44572559 tagtatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaaatgatataatcaattgtaatgtatata 44572487  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 9730145 - 9730090
Alignment:
Q  10 ctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9730145 ctaatgtaaaaaatatagaacactgacaccgctacctatatattaatttatttata 9730090  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11812746 - 11812685
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttat 64  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11812746 gacaccgctaatgtaaaaaacataggacaccgacacagctacctatatattaatttatttat 11812685  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 10678255 - 10678319
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  10678255 tcgacaccactagtttaaaaaatataggacaccgacatcgttagatatatattaatttatttata 10678319  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11820691 - 11820525
Alignment:
Q  85 caaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctact 184  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||  | || |||   ||| |||||| | || |||||| | |||||    
T  11820691 caaaatacatacatatgcatctaacttgagcaatttatttca-ttcaaaaagttctatgacaacatacaatagcatttgagctttatttatttatctact 11820593  T
Q  185 atcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctca 252  Q
    || |||||  || |||||||| ||||||  | |||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  11820592 attaaaaattttaaaaatgttgtaatcatctttaatgtctataacccttcgttgatcaacatttctca 11820525  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 5741605 - 5741658
Alignment:
Q  11 taatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttat 64  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  5741605 taatgtaaaaaacttagaacaccgacaccgctacacatatattaattaatttat 5741658  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 10678435 - 10678534
Alignment:
Q  228 acccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagt 327  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| | | |||| |||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| |||    
T  10678435 acccctaattgatcaatatttctcaaaacatacgtaactcttgtatctacggtatgtggaagcaagaga-aaaagaaatgttt-aaatatttgtctgagt 10678532  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28026860 - 28026811
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatat 50  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28026860 tcgacactgctaattttaagaatataggacaccgacaccgatacatatat 28026811  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45216162 - 45216113
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatat 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  45216162 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataagacacggacaccgttacatatat 45216113  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11815748 - 11815688
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 63  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||||    
T  11815748 gacaccgctaatgtaaaaaatataggacactgacactgctatctatttattaatttattta 11815688  T

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Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1255897 - 1255557
Alignment:
Q  16 taaaaaatatagaacaccgacaccgctac---atatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttg 112  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1255897 taaaaaatatgggacaccgacaccgctactacatatatgttaatttatttgtagacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatataagcatttaacttg 1255798  T
Q  113 aggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatca 212  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||  | || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1255797 agcaagttattttattagaaaaagttctaaaacaagatatcgtagtatttgacatttatttatgtatctgctatcaaaaaagctaaaaatgttataatca 1255698  T
Q  213 attgtaatgtttataa-cccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttc 311  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||     
T  1255697 actgtaatgtctataaccccctaattgatcaacattcctcaaaacctatgtagctcttgtatctattatttgtggaagcaagagagaaaaataatgttt- 1255599  T
Q  312 agatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  1255598 tgatatttgtctgagttgcccctacacagctcgtatgcgtgt 1255557  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14494686 - 14494335
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  14494686 tcgacaccgctaatgtaaaatatacaggacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 14494587  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      ||||| ||| || || |||||||||| |||||||||||| || || ||| | |||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  14494586 acatctatctttagcaatttatttcattagaaaaagttctacaacaaaatatcatagtatttgacctttatttattcgtctattatcaaaaaagttaaaa 14494487  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaa 300  Q
    ||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| | |||| || ||| |||||||    
T  14494486 atgatataatcaactatgatgtctataacccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaattcttgtatctatggtgtgtggaaacaatagagaaa 14494387  T
Q  301 acaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  14494386 acaattgtttaagatatttgtgtgagttg-tccgacacggctcgtattagtgt 14494335  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 12843818 - 12844118
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12843818 tcgacactgctaatataacaaatataggacactaacactgctacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaatgaaaatacatatataa 12843917  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  12843918 acatctaacttgagcaatatatttcattagaacaagttctacaataagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaa 12844017  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaa 300  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  12844018 atgatataatcaactataatgtgtataacccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgcgtggaagcaagagagaaa 12844117  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  12844118 a 12844118  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 17539932 - 17540260
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17539932 tcgacaccgttaatgtaaaaaatataagacaccgacaccattacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 17540031  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||||||| | || ||||  |||| |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||    
T  17540032 acatctaacttgggcaatttatgacattagaaaaagttctgcaataagatatcatagtatttgacctttatttatttatctactatcaaaaaagctaaaa 17540131  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaa 300  Q
    ||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  17540132 atgatataatcaactataacttttataacccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgtgcggaagcaagagagaaa 17540231  T
Q  301 acaactgtttcagatatttgtctaagttg 329  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||||    
T  17540232 aaaattgttttagatatttgtctgagttg 17540260  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 56923 - 57263
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    ||||| |||||| ||  ||||    
T  56923 tcgacaccgctaatataaaaaatataggacacgaacaccgctacatatatgttaatttatctatagacggtctaaatcgaaaattaaaatatattcataa 57022  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   |||||            ||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  57023 gcatctaacttgagcaacttatttcattagaaaatgttctaatataagatataatagta------------ttattcatctactatcaaaaaaggtaaaa 57110  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataaccc-ctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaa 299  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  57111 atgttataatcaactttaatgtctataaccctctagttgatcaacatttctccaaacatatgtaactcttgtatctacggtatgtggaagcaagagagaa 57210  T
Q  300 aacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    ||  | |  || |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  57211 aaataataatttagatatttatcttagttg-tccgacacggctcgtatgagtgt 57263  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 19294300 - 19294490
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  19294300 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgataccgctacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatggaaattaaaatacatatataa 19294399  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaag 194  Q
      ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||   || |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||    
T  19294400 acatctaacttaagcaatttatttcattagaaaaagttc---aacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatgaaaaaag 19294490  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 19542067 - 19542354
Alignment:
Q  16 taaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg-atctaacttgag 114  Q
    ||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  19542067 taaaaaacataggacatcgatactgctacatatatgttaatttatttatagacggtataaaattaaaatcaaaatacatacataaggcatctaacttgaa 19542166  T
Q  115 gaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaat 214  Q
     || | |||||||| |||||| |||||||| || ||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||||     
T  19542167 aaattgatttcattggaaaaaattctaaaacaaaatatcttagtatttgtcctttatttattcatctactatcaagaatgctaaaattgttataatcaac 19542266  T
Q  215 tgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatt-tgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    | |||| | | |||||| |||||| |||| ||| ||||||| | ||||| | ||||||| || | || |||| |||||||||||||||    
T  19542267 tttaatatctctaacccttaattgttcaatatttctcaaaacaaatgtaactcttgtatgtacggttatgtggaagcaagagagaaaa 19542354  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34708843 - 34709034
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | || ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  34708843 tcgataccgttaatgtaagaaatataggacaccgacacatctacgtatatgttaatttatttaaagatagtctaaaattaaaattaaaatacatatataa 34708942  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaa 192  Q
      |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  34708943 acatctaacttgagaaatttatttcattagaaaaagttctccaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactataaaaaa 34709034  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34013452 - 34013616
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   || |||  | ||||| |||||||||||||||    
T  34013452 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacaccgttacttatatgttaatttatttaaagaccgtctaaagtgaaaattaaaatacatatataa 34013551  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgac 165  Q
      |||||||| ||| || |||| ||||   ||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  34013552 acatctaactcgagcaatttatgtcatcataaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgac 34013616  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34011398 - 34011234
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   || |||  | ||||| |||||||||||||||    
T  34011398 tcgacgccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacaccgttacttatatgttaatttatttaaagaccgtctaaagtgaaaattaaaatacatatataa 34011299  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgac 165  Q
      |||||||| ||| || |||| ||||   ||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  34011298 acatctaactcgagcaatttatgtcatcataaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgac 34011234  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 301
Target Start/End: Original strand, 34709062 - 34709167
Alignment:
Q  196 ttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagag 295  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||| ||||||||   |||| |||||||||    
T  34709062 ttaaaatgatataatcaactataatgtatataacccctaattgatcaacatttttcaaaatatatataactcttatatctatggcgtgtgaaagcaagag 34709161  T
Q  296 agaaaa 301  Q
    ||||||    
T  34709162 agaaaa 34709167  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12790643 - 12790564
Alignment:
Q  22 atatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataag 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  12790643 atataggacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttatatacgatctaaaatgaaaatcaaattacatatataag 12790564  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33235016 - 33234861
Alignment:
Q  83 atcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcaccta 182  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||||   |||||||||||| || ||||| || |||    
T  33235016 atcaaaatacatacat--gcatctaacttgagcaatttatttca-ttaaaaaagttttataacaagatacaatagtatttgacc-ttatttatccatcta 33234921  T
Q  183 ctatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaa 243  Q
    |||||  |||| || |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  33234920 ctatc-gaaaatttcaaaatgttgtaatcaactttaatgtctataaccccttcttgatcaa 33234861  T

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Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21409105 - 21408750
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||||| |||||||     
T  21409105 gacaccgttaatgtaaaaaatataggatactgacaccgctacatatatgttaatttatttatatacggtctaaaatgaaaatcaaaatacaaatataaga 21409006  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||    
T  21409005 atctaatttgagcaagttatttcattagaaaaaattctaaaataagatatcgtagtatttgacctttatttattcatctactataaaaaaggttaaaaat 21408906  T
Q  203 gttataatcaattgtaatgttt-ataacccctaattgatcaacattcctcaaa--------atatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaag 293  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||| | |||||||||| | | |||| |||||||    
T  21408905 gttataatcaattgtaatgtttgttaccccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtacatatgtaactcttgtatctaagttatgtggaagcaag 21408806  T
Q  294 agagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagt 351  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||    
T  21408805 agagaaaa-aaatgttttagatatttgtttgagttg-tccgacacggctcgtatgagt 21408750  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 11410600 - 11410949
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||     
T  11410600 gacaccgctagtgtaaaatatataggacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttatatacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatttaagc 11410699  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| | | ||| |    
T  11410700 atctaacttgagcaagttatttcattagaaaaagttctaaaagaagatatcgtagtatttaacctttatttattcatctactatcaaaaaggctaaaact 11410799  T
Q  203 gttataatcaattgtaatgttta-taacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    |||||||||||   |||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| | | |||| ||| |||||||||||    
T  11410800 gttataatcaacaataatatctattaccccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctacggtatgtggaagtaagagagaaaa 11410899  T
Q  302 caactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
     || |||||  ||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  11410900 -aaatgttttcgatatttgcataagttg-tctgacatggctcgtatgagtgt 11410949  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43922190 - 43921863
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| |||||||||||  ||    
T  43922190 tcgacaccgctagtgtaaaaaatataggacaccgacacctctacatacatgttaatttatttatatatggtctaacatgaaaataaaaatacatatccaa 43922091  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  43922090 acatctaacttgagcaagttatttcattagaaaaagttctaaaacaagacatcgtagtatttgatctttatttattcatctaatatcaaaaaagctaaaa 43921991  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  43921990 atgttataatcaattgtaatgtcaattaaccctgattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctactgtatgtggaagcaagagagaaa 43921891  T
Q  301 acaactgtttcagatatttgtctaagttg 329  Q
    | || || || |||||||||||| |||||    
T  43921890 a-aaatgctttagatatttgtctgagttg 43921863  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10516323 - 10516137
Alignment:
Q  91 acatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaa 190  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  10516323 acatagataagcatataacttgagcaagttatttcattagaaaaagttctaaaataagatatcgtagtatttgaccattatttattcaactcctatcaaa 10516224  T
Q  191 aaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgttta-taacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatcta 276  Q
    || ||| ||||||||||||| |  | |||||| || || |||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| | ||||||||||    
T  10516223 aaggttaaaaatgttataataagctataatgtatattaccccctaattgattaacattttttaaaacatatgtaactcttgtatcta 10516137  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 26565226 - 26565566
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||| |    
T  26565226 tcgacaccgctaatgtaaaaaatacaggacactgacaccgttacatatatgttaatttatttatatatggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatat-a 26565324  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaa-gtttaa 199  Q
     |||||||  |||  || | |         ||| |  | ||||| |||||| |||||||||||| | || |||  |||  |||  |||||||| | | ||    
T  26565325 cgatctaaaatga--aaatga---------aaatacatataaaacaagatatcgtagtatttgatctttattttctcatttaccgtcaaaaaaggctaaa 26565413  T
Q  200 aatgttataatcaattgtaatgtttataac-ccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagaga 298  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  26565414 aatgttataattaactgtaatgtctattactccctaaatgatcaacatttctaaaaacatatgtaactcttatatctaagatatgtggaagcaagagaga 26565513  T
Q  299 aaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26565514 aaa-aaatgttttagatatttgtctgagttg-tccgacacggctcgtatgagtgt 26565566  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 27063655 - 27063931
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||  ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| || | |||||||| |||||| |||    
T  27063655 tcgacatctctaatgtaaaaaatatagggcataaacaccggtacatatatattaatttatttatagacggtctaaaatgataatcaaaacacatatttaa 27063754  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||||| | || ||| ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| | |||    
T  27063755 gcatctaacttgagcagtttatttctttaaaaaacgttctaaaacaagataccataatatatgacctttatttattcatctactgtcataaaagctaaaa 27063854  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccct-aattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatcta 276  Q
    ||||| |||| || |  ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  27063855 atgttgtaattaacttaaatttctataactcctaaattgatcaacatttctcaacatatatgtaactcttatatcta 27063931  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10657595 - 10657334
Alignment:
Q  91 acatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaa 190  Q
    ||||| ||||| || |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| || |||||||| || || |||||    
T  10657595 acatagataagcatataacttaagtaagttattttattagaaaaagttctaaaacaagatatcgtataatttgacctttatttattcaactcct-tcaaa 10657497  T
Q  191 aaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgt-ttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaag 289  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||| | |   || |||    
T  10657496 aaagttaaaaatgttataatcatatgtaatgtattttagcctctaattgatcaacatttttcaaaacatatgtaaatcttgtatctacggtacatggaag 10657397  T
Q  290 caagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
     ||||||||||| || | ||| |||||||| | | |||||  | |||| |||||||||||||||    
T  10657396 taagagagaaaaaaaatattttagatatttatatgagttg-tctgacacggctcgtatgagtgt 10657334  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27111242 - 27111147
Alignment:
Q  3 gacaccgctaat-ttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatata 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  27111242 gacaccgctagtgttaaaaaatataggacaccgacaccattacatatatgttaatttatttataaacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatata 27111147  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 301
Target Start/End: Original strand, 14218511 - 14218615
Alignment:
Q  198 aaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccc-taattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagaga 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||| |||| | | |||| ||||||||||    
T  14218511 aaaatgttataatcaactgtaatgtctattaccccctaattgatcaacatttatcaaaatatatgtgactcttgtgtctacggtatgtggaagcaagaga 14218610  T
Q  297 gaaaa 301  Q
    |||||    
T  14218611 gaaaa 14218615  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17716091 - 17716029
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 63  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17716091 tcgacaccgctaatgtaaataatataggacactgacaccgctacatatatactaatttattta 17716029  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19017320 - 19017258
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 63  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19017320 tcgacaccgctaatgtaaataatataggacactgacaccgctacatatatactaatttattta 19017258  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2227383 - 2227278
Alignment:
Q  86 aaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcattt-gaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctact 184  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || || | |||||  |||||||||||| || |||||  | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  2227383 aaaatacatatataaatatctaacttgagcaa-ttgtgtcattaagaaaaagttctacaacaagatgtcatagtatttgacctttatttattcatctact 2227285  T
Q  185 atcaaaa 191  Q
    |||||||    
T  2227284 atcaaaa 2227278  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27109497 - 27109420
Alignment:
Q  31 accgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27109497 accgacaccgatacatataacttagtttatttacagacggtctaaaataaaaataaaaatacatatataagcatctaa 27109420  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 213
Target Start/End: Original strand, 49860462 - 49860544
Alignment:
Q  131 aaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||||||||  || |||||| | |||||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  49860462 aaaaagttctaaaacaagatatagtggtatttgacatttatttatttatctactatcaaaagagctaaaaatcttataatcaa 49860544  T

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Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 32676881 - 32676474
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  32676881 tcgacaccgctaatgtaaaaaaaataggacaccgaccctgctacatatatgttaatttatttttagacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatacataa 32676782  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32676781 gcatctaa-ttgagcaatttatttcattagaaaaagttataaaacaagatatcatattatttgatc-ttatttattcatctactatcaaaaaagttaaaa 32676684  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttata-acccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaa 299  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||  || |||| |||||||||||||    
T  32676683 atgttataatcaactttaatgtctatatccccctaattgaacaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatttacaatgtgtggaagcaagagagaa 32676584  T
Q  300 aacaac-tgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgtcagacaccggttttaggagtctcgaattaaaggaaaaacaacttt 398  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||  ||||||||||  || | ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  32676583 aaaaacttgtttaagatatttgtctaagttg-tttgacacagctcgtatga--gttatacaccggtcctaggagtgtcgaagtaaagaaaaaacaatttt 32676487  T
Q  399 atttaggatatcg 411  Q
    |||||||| ||||    
T  32676486 atttaggacatcg 32676474  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 40837726 - 40837886
Alignment:
Q  6 accgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatc 105  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  40837726 accgctagtgtaaaaaatataagacactgacaccgctagatatatgttaatttatttatatacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatataagcatc 40837825  T
Q  106 taacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgacc 166  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  40837826 taacttgagcaaattatttcattagaaaaagttctaaaacaagatattgtagtatttgacc 40837886  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38989491 - 38989253
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| || | ||  ||| |||      ||| ||||||||||||| |    
T  38989491 tcgacatcgctaatgtaaaaaatataggacactgacaacgttacatatattttaattttttcaaagacggtctaa------aattaaaatacatatatca 38989398  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||  || |||||||| |||||||||||| | || |||    
T  38989397 acatctaacttgagcaatttatgtcattagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgacttttatttattcatctactatcaaaagatttaaaa 38989298  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacatt 247  Q
    ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38989297 atgatataatcaa--ataatgtctataacccctaattgatcaacatt 38989253  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 329
Target Start/End: Original strand, 40837975 - 40838144
Alignment:
Q  158 tatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaata 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40837975 tatttgacctttatttattcatctactatcaaaaa-gctaaaaatgttataataaactataatgtttattacccctaattgatcaacatttctcaaaaca 40838073  T
Q  258 tatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagttg 329  Q
    |||||| | |||||||||| | | | || ||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||| |||||    
T  40838074 tatgtaactcttgtatctacggtatctggaagcaagag-gaaaaaaaatgttttagacatttgtctgagttg 40838144  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41815856 - 41815795
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41815856 gacaccgctaatgtaaaaaa-ataggacaccgacaccgctacatatatattaatttatttata 41815795  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Original strand, 10613155 - 10613201
Alignment:
Q  17 aaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 63  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10613155 aaaaaatataggacactgacaccgttacatatatgttaatttattta 10613201  T

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Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 32740775 - 32741090
Alignment:
Q  11 taatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaact 110  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  32740775 taatgtaaaaaatataggacactgacaccactacatatatgttaatttatctaaagatggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataaacatctaact 32740874  T
Q  111 tgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgta--gtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttata 208  Q
    |||| || |||||| ||| ||||||||||   || |||||| | ||  |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||  |||    
T  32740875 tgagcaatttatttaattagaaaaagttc---aacaagatatcatatagtatttgacctttatttattcatctaccatcaaaaaagctaaaaatg--ata 32740969  T
Q  209 atcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgt 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||    
T  32740970 atcaattgtaatgtctataacccccaattgatcaacatttcacaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgtgtggaagcaagagagaaaaaaattgt 32741069  T
Q  309 ttcagatatttgtctaagttg 329  Q
    || ||||||||| || |||||    
T  32741070 tttagatatttgcctgagttg 32741090  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 23431798 - 23431992
Alignment:
Q  17 aaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgagga 116  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23431798 aaaaaatataggataccgacagtgctacatatatgttaatttatttatatacggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatataagcatctaacttgagca 23431897  T
Q  117 agttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23431898 agttatttcattagaaaaagttctaaaacaaaatatcgtagtatttgacattcatttattcatctactatcaaaaaagttaaaaatgttataatc 23431992  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9149243 - 9148999
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||  |||||||||||||||   | | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  9149243 tcgacaccgcttatgtaaaaaatataggaaaatgacactgctacttat--gttaatttatttataaacgatataatatgaaaatcaaaatacatatataa 9149146  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||||||||||| || |||||||||| ||||||  | ||||| |||||| | |||||||| ||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||    
T  9149145 gaatctaacttgagaaatttatttcattagaaaaaagtttaaaacaagatatcatagtattttacctttatttatttatctactatcaaaaaagctaaaa 9149046  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacatt 247  Q
    ||||||||  ||| | |||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  9149045 atgttatagccaactttaatgtctataaccaccaattgatctacatt 9148999  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48632810 - 48632480
Alignment:
Q  16 taaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgagg 115  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||      | ||| |  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||     
T  48632810 taaaaaatataggacaccatcaccgctacacatatattaatttatttatc-----tctaaaacgaaaatcaaaattcatacataagaatttaacttgagc 48632716  T
Q  116 aagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaatt 215  Q
    |  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |    
T  48632715 agtttatttcattgaaaaaagttctaaaacaagataccatagtatttgacctttatttattcttctactatcaaaaaagctaaaaacgttgtaatcaact 48632616  T
Q  216 gtaatgtttataacccc-taattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcaga 314  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | | |||||||||| | | |||  || ||  |||||||| || |||||||||    
T  48632615 ttaatttctataaccccgtaattgatcaacatttctcaacacatatgcaactcttgtatctacggtgtgtagaacca--agagaaaaaaaatgtttcaga 48632518  T
Q  315 tatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
     |||||| | |||||  | |||||||||||| |||||||    
T  48632517 catttgtttgagttg-tctgacatggctcgtgtgagtgt 48632480  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 18476506 - 18476634
Alignment:
Q  86 aaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgacc-attgtttattcacctact 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  18476506 aaaatacatatataagcatctaacttgagcaagttatttcattagaaaaagttctaaagcaagatatcgtagtatttgaccttttatttattcatctact 18476605  T
Q  185 atcaaaaaagtttaaaatgttataatcaa 213  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||    
T  18476606 atcaaaaaagctaaaaatattgtaatcaa 18476634  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7021811 - 7021540
Alignment:
Q  9 gctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaa 108  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  7021811 gctaatgtaaaaaatataggataccaataccgcttcatatatattaatttatttataaacggtttaaaatgaaaatcaaaatatatacataaacatctaa 7021712  T
Q  109 cttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatc-aaaaaagtttaaaatgttat 207  Q
    |||| | || |||||| |||  |||||||||||||| || ||| |  |  |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||   |||||||| |    
T  7021711 cttgcgcaatttattttattgaaaaaagttctaaaacaaaataccacaagatttgacctttatttatttatctactatcaaaaaaagccaaaaatgttgt 7021612  T
Q  208 aatcaa--ttgtaatgtttataaccc-ctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatcta 276  Q
    ||||||  || |||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||    
T  7021611 aatcaactttataatttctataacccgctaatttatcaacatttctcaacacatatgtaactcttatatcta 7021540  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 252
Target Start/End: Original strand, 3387651 - 3387821
Alignment:
Q  82 aatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacct 181  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||||||  || |||||| |||  ||||||||||| || |||||||  |||||||||||| || |||||||| ||    
T  3387651 aatcaaaatacatacatatgcatttaacttgaacaatttattttattaaaaaaagttctataacaagataaaatagtatttgacctttatttattcatct 3387750  T
Q  182 actatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctca 252  Q
    || ||| ||||| || |||| ||| ||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3387751 accatcgaaaaatttaaaaacgttgtaatcaactttaatgtctataacccttgattgatcaacatttctca 3387821  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 253
Target Start/End: Original strand, 3954946 - 3955117
Alignment:
Q  82 aatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacct 181  Q
    ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||| || ||||| || ||    
T  3954946 aatcagaatacatacatgtgcatctaacttgagcaatttatttcattaaaaaaagttctaaaataagatacgatcgtatttgacctttatttatccatct 3955045  T
Q  182 actatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaa 253  Q
    |||||| |||||| | |||| ||| ||||||| | |||| | | ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  3955046 actatcgaaaaagctaaaaacgttgtaatcaactttaatctctgtaaccccttgttgatcaacatttctcaa 3955117  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 263
Target Start/End: Original strand, 126323 - 126430
Alignment:
Q  157 gtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataa--cccctaattgatcaacattcctcaaa 254  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  126323 gtatttgacctttatttattcatctactattaaaaa-gttaaaaatgttataatcaactttaatgtctataacccccctaattgatcaacatttctcaaa 126421  T
Q  255 atatatgta 263  Q
    | |||||||    
T  126422 acatatgta 126430  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10171696 - 10171639
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaattt 58  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10171696 tcgacaccgctagtgtaaaaaatataggacaccgacaccgctacatatatgttaattt 10171639  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 349
Target Start/End: Original strand, 18488357 - 18488471
Alignment:
Q  234 aattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgcccc 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||| | |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||  ||    
T  18488357 aattaatcaacatttctcaaaacacatgtaactcttggatctacgatatgtggaagcaagagagaaaaaaaatgtttcatatatttgtcagagttg-tcc 18488455  T
Q  334 gacatggctcgtatga 349  Q
    ||||||||||||||||    
T  18488456 gacatggctcgtatga 18488471  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Original strand, 16426350 - 16426487
Alignment:
Q  4 acaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagga 103  Q
    |||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   | | |||  ||| |||||||||||||| ||| | |    
T  16426350 acaccgttaatgtaaaaagcataggacactgacaccgctacctatatattaatttatttataaaagatataaattaagaatcaaaatacatacatatgca 16426449  T
Q  104 tctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttcta 141  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||  || ||||||||    
T  16426450 tctaacttgagcaatttacttcattaaaacaagttcta 16426487  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Original strand, 125172 - 125256
Alignment:
Q  81 aaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgac 165  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||| |||| | | |||||||||||    
T  125172 aaatcaaaatacatacacaagtatctaacttgagcaatttatttcattaaaaaaagttttaaaacaagaaatcatagtatttgac 125256  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30883277 - 30883217
Alignment:
Q  4 acaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttat 64  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  30883277 acaccgctaatgtaaaaaacataggacaccgacaccgctgcatatatatttattaatttat 30883217  T

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Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Original strand, 17732772 - 17733038
Alignment:
Q  85 caaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgacc-attgtttattcacctac 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  17732772 caaaatacatatataagcatctaacttgagcaagttatttcattagaaaaagttctaaagcaagatatcgtagtatttgaccttttatttattcatctac 17732871  T
Q  184 tatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacc-cctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgattt 282  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||| ||| |    
T  17732872 tatcaaaaaagctaaaaatgttataatcaactgtaatgtctattacctcctaattaatcaacatttctcaaaacacatgtaactcttgtatctacgatat 17732971  T
Q  283 gtgtaagcaagagag-aaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatga 349  Q
    ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||    
T  17732972 gtggaagcaagagagaaaaaaaaatgtttcatatatttgtcagagttg-tccgacacggctcgtatga 17733038  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40289320 - 40289050
Alignment:
Q  80 aaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcac 179  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||||   || |||||||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || ||||||||     
T  40289320 aaaattaaaatacatatataaacatttaacttggacaatttatttcattagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcat 40289221  T
Q  180 ctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatga 279  Q
    ||||||||||||||  | |||||    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||     
T  40289220 ctactatcaaaaaaactaaaaataacttaatcaattgtaatgtctacaacccctaattgattaacatttctcaaaacatatgtaaatcttgtatctatgg 40289121  T
Q  280 tttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    | |||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  40289120 tgtgtggaagcaagagagaaa--aaatgttttagatatttgtttgagttg-tccgacatgactcgtatgagtgt 40289050  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45612681 - 45612333
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||   || ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  45612681 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataga-caccgacacaattacatatatgttaattcatttaaagactgtctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 45612583  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      ||| |||||||| || |||| ||||| ||||| |||||| || ||||||      ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  45612582 acatccaacttgagcaatttatgtcattagaaaatgttctacaacaagatat-----tatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaa 45612488  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctc-aaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagag-- 297  Q
    ||| ||||||||| | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||| | || | |||||||||||      
T  45612487 atgatataatcaactataatgtctataaacccttattaatcaacatttctcaaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgtgcggaagcaagagagaa 45612388  T
Q  298 aaaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    |||| || ||||| |||||||||| | |||||  |||||| | |||||||||||||    
T  45612387 aaaaaaattgttttagatatttgtttgagttg-tccgacacgactcgtatgagtgt 45612333  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 54305571 - 54305763
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  54305571 tcgacatcgctaatgtaaaaattataggacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttaaagacggtttaaaatgaaaattaaaatacatatacaa 54305670  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaa 193  Q
      || ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||  | |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||    
T  54305671 acatttaacttgagcaatttatttaattagaaaaagttctacgacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctaatataaaaaaa 54305763  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 31734528 - 31734703
Alignment:
Q  119 ttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgta 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||    
T  31734528 ttatttcattagaaaaagttctaaaacaagatatcgtagtattt-tcctttatttattcatctactatcaaaagagctaaaaatgttataatcaactata 31734626  T
Q  219 atgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagaga 296  Q
    |||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  31734627 atgtctattacccc-atgtgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctacggtatgtggaagcaagaga 31734703  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 55680652 - 55680816
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   || |||  | ||||| |||||||||||||||    
T  55680652 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacaccgttacttatatgttaatttatttaaagaccgtctaaagtgaaaattaaaatacatatataa 55680751  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgac 165  Q
      |||||||| ||| || || | ||||  |||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  55680752 acatctaactcgagcaatttctgtcatcagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgac 55680816  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40289851 - 40289806
Alignment:
Q  18 aaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40289851 aaaaatataaaacaccgacaccgctacatatatgttaatttattta 40289806  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 3419971 - 3420042
Alignment:
Q  205 tataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatcta 276  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3419971 tataatcaactataatatctataacccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatcta 3420042  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 35529482 - 35529532
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaa-aatatagaacaccgacaccgctacatatat 50  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35529482 tcgacaccgctaatgtaaaaaaatataggacaccgacaccgctacatatat 35529532  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 253
Target Start/End: Original strand, 2641132 - 2641308
Alignment:
Q  81 aaatcaaaatacatata---taaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattc 177  Q
    ||||||||||||||| |   |||| || ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| || |||   | |||||||||| || ||||||     
T  2641132 aaatcaaaatacatacacaataagaatttaatttgagcaacttatttcattgaaaaaagttctaaaacaaaatactatggtatttgacctttatttattt 2641231  T
Q  178 acctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataac-ccctaattgatcaacattcctcaa 253  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||  || ||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  2641232 atctactataaaaaaagtcaaaaacattgtaatcaactttaatttctataactccatgattgatcaacatttctcaa 2641308  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 298
Target Start/End: Original strand, 44507760 - 44507900
Alignment:
Q  159 atttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatc-aacattcctcaaaata 257  Q
    |||||||| || ||||| || || |||| ||||||| | |||||||| ||||  | | |||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||    
T  44507760 atttgacctttatttatccatcttctataaaaaaagataaaaatgttgtaattgactttaatgtctataatccctcattgatctaacatttctcaacata 44507859  T
Q  258 tatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagaga 298  Q
    ||| || | | ||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  44507860 tatttaactcatgtgtctatggtgtgtggaagcaagagaga 44507900  T

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Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 28420958 - 28421256
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||      
T  28420958 gacaccgctaatgtagaaaatataggacaccgacaccattacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataaac 28421057  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    || ||||||||| || |||| ||||| ||||||||| || || |||||| | ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  28421058 atttaacttgagcaatttatgtcattagaaaaagttttacaacaagatatcatatgatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaaac 28421157  T
Q  203 gttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    | ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | || | |||| ||||||||||    
T  28421158 gatataatcaactataatgtctataaccactaattgatcaagatttctcaaaatatatgtaactcttgtatctatggtgtgcggaagcgagagagaaaa 28421256  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15132212 - 15131915
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||||| ||||||||||||||       
T  15132212 gacaccgctaatgtaaaatatataggacaccaacaccgctacatatatgttaatttattcaaagacagtttaaaatgaaaattaaaatacatatatagac 15132113  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    |||||||||||| || ||||| |||   ||||||||||| |  |||||| | |||||||||| | || |||||| | |||||||| |||||| | |||||    
T  15132112 atctaacttgagcaatttatt-catgataaaaagttctacagcaagatatcatagtatttgatctttatttatttatctactatcgaaaaagctaaaaat 15132014  T
Q  203 gttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| | | ||||||| || | ||   |||||||||||||||    
T  15132013 gatataatcaactataatgtctataacccctaattgatcaatatttctaaaaacatatgtaactcctgtatctctggtgtgcagaagcaagagagaaaa 15131915  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15850688 - 15850259
Alignment:
Q  16 taaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgagg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15850688 taaaaaatataggacaccgacaccattatgtatatattaatttatttatagatagtctaaaatgaaaatcaaaatacatatataagtatctaatttgagc 15850589  T
Q  116 aagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaatt 215  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||            
T  15850588 aaattatttcattagaaaaagttataaaacaagatatcacagtatttgacatttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaaatgttat-------- 15850497  T
Q  216 gtaatgtttataacc-cctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcaga 314  Q
       |||| ||||||| || | ||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||| |   |||| ||||||||||||||| || | |||||||    
T  15850496 ---atgtctataacctcccagttgatcaacatttttcaaaacatatgtaactcttgtatctacggaatgtggaagcaagagagaaaa-aaatatttcaga 15850401  T
Q  315 tatttgtctaagttg-ccccgacatggctcgtatga-----------gtgtcagacaccggttttaggagtctcgaattaaaggaaaaacaactttattt 402  Q
    |||| |||| ||||| ||   ||| ||||| ||| |           ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  15850400 tattcgtcttagttgtccgacacacggctcttataagtgttatataggtgtcagacaccggtcttaagagtgttgaattaaagaaaaaacaattttattt 15850301  T
Q  403 aggatatcgattttaattatccggcacgtatcgtacgagtgt 444  Q
    |||| | |||||||| || || |  |||| ||||||||||||    
T  15850300 aggacaccgattttagttgtctgatacgtgtcgtacgagtgt 15850259  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 44502214 - 44502468
Alignment:
Q  9 gctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaa 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||   || ||| |  ||||  | |||||||||||||  || |||    
T  44502214 gctaatgtaaaaaatataggacaccgacactgttacatatattttaatttatttaaagaaagtctaaaacgaaaaatagaatacatatataaacatttaa 44502313  T
Q  109 cttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttata 208  Q
    |||||| || |||||||||   ||||||||||| || |||||| | || ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||    
T  44502314 cttgagcaatttatttcatcataaaaagttctacaacaagatatcatactatttgacctttatttattcatctgctatcaaaaaagttaaaaataatata 44502413  T
Q  209 atcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgta 263  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  44502414 atcaactataatgtctataacccctaatcaatcaacatttctcaaaacatatgta 44502468  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18603304 - 18602989
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    || ||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  18603304 tcgacaccgttagtgtaaaaaatataggacaccggcacctctacatacatgttaatttatttatatcatgtctaaaataaaaatccaaatacatatctaa 18603205  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| | || ||||             ||||||| | |||    
T  18603204 acatctaacttaagcaagttatttcattagaaaaagttttaaaacacgatatcgtagtatttgatctttattta-------------aaaaaagctaaaa 18603118  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatc-tatgatttgtgtaagcaagagagaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||   | |||| |||||||||||||    
T  18603117 atgttataatcaattgtaatgtcaattcaccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatcataccgtatgtggaagcaagagagaa 18603018  T
Q  300 aacaactgtttcagatatttgtctaagttg 329  Q
    || || || || |||||||||||| |||||    
T  18603017 aa-aaatgctttagatatttgtctgagttg 18602989  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 1225999 - 1226323
Alignment:
Q  29 acaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatt 128  Q
    |||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||| |||  || ||| || || || ||||||||||    
T  1225999 acactgacaccaccacatatatagtaatttatttatagagggtctaaaatgaaaatcaaaatacatatgtaaacatataaattaagcaatttatttcatt 1226098  T
Q  129 tgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttat-a 227  Q
      |||||||| ||||| |||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| | |||| | ||| |    
T  1226099 gaaaaaagttataaaacaagataccagagtatttgatctttatttattcatctactatc-aaaaatttaaaaatgttgtaatcaactttaatttctataa 1226197  T
Q  228 acccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatatttgtctaagt 327  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||| | |||| || | |||||||||| ||| |||| ||  |||||||| || || | ||||| |||||||||| |||    
T  1226198 acctctaattgattaacatttctcaacacatatttaactcttgtatctacgatgtgtggaataaagagagagaaaaaatatttcaaatatttgtctgagt 1226297  T
Q  328 tgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    ||   |||||||||||||||||||||    
T  1226298 tgtttcgacatggctcgtatgagtgt 1226323  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 37855085 - 37855276
Alignment:
Q  11 taatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaact 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |||||| |    
T  37855085 taatgtaaaaaatataggacaccgacaccgctacatatatgttcatttatttaaagacggtctaaaataaaaattataatacatatataaacatctaatt 37855184  T
Q  111 tgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaat 202  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||| |  || ||||||   |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  37855185 tgagaaatttatttcatgagaaaaagttatgcaacaagatataatagtatttaacctttatttattcatctactatcaaaaaggttaaaaat 37855276  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18393717 - 18393552
Alignment:
Q  82 aatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacct 181  Q
    ||||| |||||||| ||| | || ||||||||  || |||||| |||  |||||||| || || |||||||  |||||||||||| || ||||| || ||    
T  18393717 aatcataatacatacatatgcatttaacttgaacaatttattttattaaaaaaagttttataacaagataaaatagtatttgacctttatttatccatct 18393618  T
Q  182 actatcaaaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacatt 247  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  18393617 actatcaaaaaatttaaaaacgttgtaatcaactttaatgtctataacccttgattgatcaacatt 18393552  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 44508418 - 44508478
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatt 61  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44508418 tcgacaccgttaatctaaaaaatataggacacagacaccgctacataaatgttaatttatt 44508478  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 8690012 - 8690059
Alignment:
Q  18 aaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8690012 aaaaacatagaacaccgacattgctacatatatattaatttatttata 8690059  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18602961 - 18602879
Alignment:
Q  350 gtgtcagacaccggttttaggagtctcgaattaaaggaaaaa-caactttatttaggatatcgattttaattatccggcacgt 431  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||| || |||| |||||    
T  18602961 gtgtcggacaccggtcttaggagtgtcgaatcaaagaaaaaaacaattttatttaggacaccgattttagttgtccgacacgt 18602879  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7619657 - 7619612
Alignment:
Q  19 aaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttat 64  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7619657 aaaatataggacaccaacaccactacatatatgtttatttatttat 7619612  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 3159758 - 3159818
Alignment:
Q  4 acaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttat 64  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||    
T  3159758 acaccgctaatgtaaaaaacataggacaccgacactgctacctgtatactaatttatttat 3159818  T

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Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9929546 - 9929778
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  9929546 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccaacactgctacatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 9929645  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||    
T  9929646 acatctaatttgagcaatttatttcattagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatcaaaaatgctcaaa 9929745  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccct 233  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  9929746 atgatatgatcaactgtaatgtctataacccct 9929778  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 26575982 - 26576329
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||      ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  26575982 tcgacaccgctaatgtaaaaaatatag------gacaccgttacatatattttaatttatttaaagacgatctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 26576075  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
      |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  26576076 acatctaacttgagcaatttatgtcattagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatcaaataagctaaaa 26576175  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagca--agagaga 298  Q
    | | ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| | || | |||||  |||||||    
T  26576176 acgatataatcaactataatgtctataaccactaatcgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgtgcggaagcaagagagaga 26576275  T
Q  299 aaacaactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
    ||| |  ||||| | |||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26576276 aaaaatttgttttaaatatttgtttgagttg-tccgacacggctcgtatgagtgt 26576329  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32201070 - 32200877
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  32201070 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacaccattaaatatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaattaaaatacatatataa 32200971  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaag 194  Q
      |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  32200970 acatctaacttgagcaatttatgtcattagaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactatcaaaaaag 32200877  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 27003960 - 27004253
Alignment:
Q  11 taatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaact 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  27003960 taatgtaaaaaatataggacaccgacaccgctacgtatatgttaatttatttaaagacggtctaaaatgaaaactaaaatacatatataaacatctaact 27004059  T
Q  111 tgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctact---atcaaaaaagtttaaaatgttat 207  Q
    |||| || ||||||||||  ||||||||||  || |||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||   |  ||||||  | |||||| |||    
T  27004060 tgagaaatttatttcattaaaaaaagttctccaacaagatatcatagtatttgacctttatttattcatctactgtaaaaaaaaaaactaaaaatgatat 27004159  T
Q  208 aatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  | | ||||||||||||   |||| |||||| ||||||||    
T  27004160 aatcaactataatgtacataacccctaattgatcaacatttttcaaaacatatacaactcttgtatctatggcatgtgaaagcaaaagagaaaa 27004253  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34409830 - 34409551
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaa-tatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaa-tcaaaatacatatat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||  |||  || ||||||| | |||||||||||||    
T  34409830 tcgacaccgctaatgtaaaaaaatctaggacaccgacaccattagatatatattaatttatttatagacggtccaaaataaaaaattaaaatacatatat 34409731  T
Q  99 aaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatca-aaaaagttt 197  Q
    ||  |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||| || ||||||   |||||||||||| || |||||| | ||||  ||| |||||| |     
T  34409730 aaacatctaacttgagcaatttagt-cattagaaaaagttctacaacaagatattatagtatttgacctttatttatttatctaccgtcagaaaaagcta 34409632  T
Q  198 aaaatgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatg 278  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  34409631 aaaatgatataatcaactataatgtctataacccctaattgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctatg 34409551  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 13037225 - 13037415
Alignment:
Q  3 gacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataagg 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||   |  ||| || ||||| ||||| |||||| ||      
T  13037225 gacatcgccaatgtaaaaaatataagataccgacatcgttacatatatgttaatttatttaaagacaggctaaaatgaaaattaaaatgcatatacaaac 13037324  T
Q  103 atctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  13037325 atctaacttgagcaatttatgtcatttgaaaaagttctacaacaagatatcatagtatttgatctttatttattcatctactatcaaaaaa 13037415  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44650126 - 44649967
Alignment:
Q  90 tacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaag-ttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatca 188  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||  |||||  || ||||| |||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  44650126 tacatacataagcatataaattgagcaatttatttcattgaaaaaaaattataaaacaagataccatagaatttgacctttatttattcatctactatca 44650027  T
Q  189 aaaaagtttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataa-cccctaattgatcaacatt 247  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  44650026 aaaaagttaaaaatgttgtaatcaactttaatttctataagcccctaattgatcaacatt 44649967  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Original strand, 13039011 - 13039116
Alignment:
Q  218 aatgtttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaacaactgtttcagatat 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||||||||| | || | |||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  13039011 aatgtttataaccactaattgatcaacatttctcataacatatgtaactcttgtatctatggtgtgcggaagcaagagataaaaaaattgttttagatat 13039110  T
Q  318 ttgtct 323  Q
    ||||||    
T  13039111 ttgtct 13039116  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 41848934 - 41848998
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41848934 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacaccgctatctatatattaatttatttata 41848998  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17651174 - 17651420
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| | || |||||||||   ||||| ||||||||||||||   | | |||  |||||| ||||||||||| |||     
T  17651174 tcgacatcgctaatataaaaaacataggatactgacaccgctggctatatattaatttatttatataagatctaaattaaaaaccaaaatacatacatat 17651273  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaa 200  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| || ||| ||   || |||||| || || ||||| || |||||||  ||||| || ||     
T  17651274 gcatctaacttgagcaatttatttcattacaagaagttctataacaagttacaataatatttggcctttatttatccatctactattgaaaaacttaaat 17651373  T
Q  201 atgttataatcaattgtaatgtttataacccctaattgatcaacatt 247  Q
    | ||| ||||||| | |||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  17651374 acgttgtaatcaactttaatgtctataacctctcgttgatcaacatt 17651420  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4748224 - 4747977
Alignment:
Q  104 tctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaatg 203  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| || |||||||| || ||||  || ||  | ||||||    
T  4748224 tctaacttgagcaatttatttcattggaaaaagttctaaaacaagttacgatagtatttgacctttatttattcatcttctattgaacaaactaaaaatg 4748125  T
Q  204 ttataatcaattgtaatg--tttataacccctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
     | ||||||| | |||||  | |||||||||| | |||||||||||  ||| || | ||||| | |||| ||||| | | |||| |||||| || |||||    
T  4748124 ctgtaatcaactttaatgtctctataacccctcagtgatcaacatt--tcacaacacatgtaactcttggatctacggtgtgtggaagcaatagtgaaaa 4748027  T
Q  302 caactgtttcagatatttgtctaagttgccccgacatggctcgtatgagtgt 353  Q
     ||  |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4748026 -aaaagtttcagacatttgtctcagttg-tccgagatggctcgtatgagtgt 4747977  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4748306 - 4748257
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatat 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4748306 tcgacaccgctaatgtaaaaaatataggacaccgacactgctatatatat 4748257  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 301
Target Start/End: Original strand, 9929799 - 9929864
Alignment:
Q  236 ttgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatctatgatttgtgtaagcaagagagaaaa 301  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  9929799 ttgatcaacatttctcaaaacatatgtaactcttgtatctatggtgtgtggaagcaagatagaaaa 9929864  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18724959 - 18724894
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaat-atagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18724959 tcgacaccgataatgtaaaaaaccataggacaccgacaccgctacctatatattaatttatttata 18724894  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 44650202 - 44650141
Alignment:
Q  4 acaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttata 65  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44650202 acaccgttaatataaaaaatataggacattgacactgctacatatatattaatttatttata 44650141  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 114
Target Start/End: Original strand, 40279805 - 40279874
Alignment:
Q  43 acatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  || ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  40279805 acatatatgttaatttatttagacg--gtctaaaatgaaaatcaaaagacatacataagcatctaacttgag 40279874  T

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Target: scaffold0325 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 12794 - 13046
Alignment:
Q  2 cgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataag 101  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  ||| || |||||||||||||| | |||||    
T  12794 cgacactgctaatgtaaaaaatacaggacaccgacaccgctacatatatattaatttatttacagaaggcctaaaatgaaaatcaaaatacaaacataag 12893  T
Q  102 gatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaaagtttaaaa 201  Q
     || ||||||||| || |||||||||   ||||||||| |||| |||||  | |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  12894 aatttaacttgagcaatttatttcatcgaaaaaagttcgaaaacaagatgtcctagtatttgacatttatttattcatctactatcaaaaaagctaaaaa 12993  T
Q  202 tgttataatcaattgtaatgtttataacc-cctaattgatcaacattcctcaa 253  Q
      || ||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12994 cattgtaatcaactttaatttctataacctcctaattgatcaacgtttctcaa 13046  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 70320 - 70042
Alignment:
Q  1 tcgacaccgctaatttaaaaaatatagaacaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||  |||||| |||||| ||| | |||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  70320 tcgacaccgctaatgtaaaaaacacagtacatagacaccactacatgtatatcaatttacttatagatggtctaagatgaaaattaaaatgcaaatataa 70221  T
Q  101 ggatctaacttgaggaagttatttcatttgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactat-----caaaaaagt 195  Q
    | || ||||| ||| || ||| || |||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||  || |||||||| ||| |||      |||||||     
T  70220 gaatttaactcgagcaatttactttattgaaaaaagttctaaaacaagatatcatagtatttgacatttatttattcatctaatataaagaaaaaaaagc 70121  T
Q  196 ttaaaatgttataatcaattgtaatgtttataaccc-ctaattgatcaacattcctcaaaatatatgtagcacttgtatcta 276  Q
    | ||||||   ||||||| | |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||   ||||||||||    
T  70120 taaaaatg---taatcaactttaatttctataaccctctaattgatcaacatttctcaacacatatgtaattcttgtatcta 70042  T

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Target: scaffold1723 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1723
Description:

Target: scaffold1723; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 393
Alignment:
Q  29 acaccgacaccgctacatatatgttaatttatttataggtggtttaagataaaaatcaaaatacatatataaggatctaacttgaggaagttatttcatt 128  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   | | | |  ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  555 acaccgacaccgctatctatatattaatttatttataaaagatcttaattaagaatcaaaatacata-atatgcatctaacttgagcaaattatttcatt 457  T
Q  129 tgaaaaagttctaaaataagataacgtagtatttgaccattgtttattcacctactatcaaaaa 192  Q
      ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  456 aaaaaaaattctataacaagatacaatagtatttgacctttatttatccatctgctatcgaaaa 393  T

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