View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9260_low_2 (Length: 655)

Name: NF9260_low_2
Description: NF9260
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9260_low_2
NF9260_low_2
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (1-639)||(34822387-34823028)
chr8 (1-560)||(40076630-40077179)
chr8 (2-572)||(43188181-43188750)
chr8 (1-572)||(39846370-39846930)
chr8 (1-571)||(15036098-15036668)
chr8 (1-572)||(43211638-43212208)
chr8 (1-572)||(39938588-39939157)
chr8 (1-571)||(45064374-45064933)
chr8 (1-564)||(39252149-39252705)
chr8 (3-415)||(5303612-5304010)
chr8 (1-572)||(41249478-41250014)
chr8 (159-572)||(39601835-39602256)
chr8 (122-572)||(489125-489569)
chr8 (122-572)||(42485025-42485478)
chr8 (297-578)||(25864610-25864886)
chr8 (114-426)||(2984395-2984715)
chr8 (183-423)||(24249759-24249999)
chr8 (191-423)||(37327080-37327292)
chr8 (183-313)||(20857671-20857802)
chr8 (183-313)||(35552051-35552182)
chr8 (468-568)||(5304009-5304107)
chr8 (440-572)||(35026619-35026749)
chr8 (183-286)||(34371450-34371553)
chr8 (188-313)||(45128135-45128261)
chr8 (195-286)||(25095-25186)
chr8 (195-286)||(1052938-1053029)
chr8 (183-313)||(5677456-5677587)
chr8 (195-286)||(23021889-23021980)
chr8 (195-286)||(26659860-26659951)
chr8 (356-402)||(35026740-35026786)
chr8 (334-390)||(22495216-22495272)
chr8 (198-292)||(22495325-22495419)
chr8 (112-148)||(37327264-37327300)
chr8 (183-218)||(34370133-34370168)
chr8 (366-423)||(45128025-45128082)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (1-639)||(55407158-55407805)
chr4 (1-568)||(51683337-51683904)
chr4 (1-639)||(48255942-48256580)
chr4 (1-571)||(21022259-21022828)
chr4 (1-572)||(40357651-40358221)
chr4 (1-600)||(50901586-50902181)
chr4 (1-572)||(50274866-50275418)
chr4 (1-426)||(37021448-37021883)
chr4 (191-609)||(67689-68100)
chr4 (122-572)||(30726237-30726681)
chr4 (122-572)||(1089080-1089524)
chr4 (122-572)||(1308610-1309054)
chr4 (183-567)||(21538008-21538397)
chr4 (191-538)||(46436411-46436753)
chr4 (159-423)||(14315650-14315925)
chr4 (1-150)||(68070-68222)
chr4 (183-538)||(10752983-10753343)
chr4 (183-538)||(10966752-10967112)
chr4 (177-423)||(14297401-14297658)
chr4 (141-292)||(11050037-11050188)
chr4 (439-568)||(8109529-8109656)
chr4 (183-423)||(11083562-11083813)
chr4 (183-313)||(50023099-50023230)
chr4 (183-280)||(41933179-41933276)
chr4 (183-313)||(50030217-50030348)
chr4 (195-306)||(41798563-41798674)
chr4 (198-421)||(4719949-4720163)
chr4 (195-313)||(9892836-9892955)
chr4 (191-287)||(30704436-30704532)
chr4 (195-286)||(6181358-6181449)
chr4 (195-286)||(49090834-49090925)
chr4 (194-286)||(50193893-50193985)
chr4 (183-313)||(3184342-3184473)
chr4 (183-313)||(3185440-3185571)
chr4 (183-313)||(3185648-3185779)
chr4 (195-286)||(49165447-49165538)
chr4 (183-293)||(44679631-44679741)
chr4 (195-286)||(31422111-31422203)
chr4 (502-564)||(37021933-37021995)
chr4 (504-574)||(40354703-40354775)
chr4 (112-148)||(46436725-46436761)
chr4 (366-421)||(30704301-30704356)
chr4 (439-477)||(37021898-37021936)
chr4 (366-423)||(41933363-41933420)
chr4 (191-219)||(21537947-21537975)
chr4 (446-537)||(41933439-41933527)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (1-639)||(20917386-20918023)
chr3 (1-639)||(20926348-20926985)
chr3 (1-639)||(42756220-42756853)
chr3 (1-606)||(30255373-30255975)
chr3 (1-617)||(49195836-49196433)
chr3 (1-542)||(44229877-44230415)
chr3 (1-623)||(48888817-48889436)
chr3 (1-564)||(47073577-47074142)
chr3 (1-572)||(42165295-42165865)
chr3 (1-572)||(4007693-4008264)
chr3 (1-572)||(50963086-50963660)
chr3 (1-572)||(3975838-3976409)
chr3 (1-568)||(48563078-48563629)
chr3 (1-480)||(42805632-42806107)
chr3 (147-572)||(50216398-50216821)
chr3 (192-572)||(596891-597266)
chr3 (212-571)||(3501477-3501834)
chr3 (256-572)||(51807101-51807413)
chr3 (1-141)||(49268639-49268782)
chr3 (500-609)||(42807500-42807609)
chr3 (183-313)||(16611463-16611594)
chr3 (182-293)||(17567619-17567730)
chr3 (183-313)||(22047659-22047790)
chr3 (183-313)||(41612753-41612884)
chr3 (198-421)||(31045165-31045388)
chr3 (183-293)||(20351051-20351161)
chr3 (195-286)||(52390964-52391055)
chr3 (195-287)||(2274482-2274574)
chr3 (195-286)||(29009273-29009364)
chr3 (183-313)||(36127822-36127953)
chr3 (195-286)||(42903758-42903849)
chr3 (195-286)||(46389375-46389466)
chr3 (195-286)||(50480352-50480443)
chr3 (195-286)||(54386537-54386628)
chr3 (99-161)||(54681976-54682038)
chr3 (195-286)||(49144031-49144121)
chr3 (198-292)||(4178211-4178305)
chr3 (195-272)||(46701593-46701670)
chr3 (13-96)||(50216322-50216408)
chr3 (195-286)||(34045790-34045880)
chr3 (198-291)||(4172214-4172307)
chr3 (1-60)||(597541-597603)
chr3 (510-572)||(2647829-2647891)
chr3 (538-572)||(44227246-44227280)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (1-609)||(24088153-24088762)
chr6 (1-426)||(6319934-6320363)
chr6 (1-543)||(31768861-31769408)
chr6 (198-292)||(21601012-21601106)
chr6 (183-292)||(24722336-24722445)
chr6 (472-568)||(6320371-6320465)
chr6 (183-293)||(26423404-26423514)
chr6 (183-313)||(3501555-3501686)
chr6 (195-286)||(6201562-6201653)
chr6 (195-286)||(11688529-11688620)
chr6 (195-286)||(22301594-22301685)
chr6 (195-286)||(30829220-30829311)
chr6 (159-292)||(3381192-3381313)
chr6 (195-293)||(27617122-27617220)
chr6 (335-420)||(30424143-30424228)
chr6 (325-423)||(3381049-3381147)
chr6 (335-419)||(29821737-29821821)
chr6 (439-480)||(7912647-7912688)
chr6 (385-422)||(7912702-7912739)
chr6 (439-467)||(21600826-21600854)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (1-568)||(35258249-35258809)
chr1 (1-567)||(51320851-51321415)
chr1 (1-568)||(45825023-45825579)
chr1 (1-568)||(23275493-23276045)
chr1 (1-572)||(52802264-52802834)
chr1 (1-572)||(31783098-31783657)
chr1 (1-491)||(19526914-19527405)
chr1 (1-572)||(47502447-47502987)
chr1 (122-572)||(30890194-30890638)
chr1 (122-423)||(19925018-19925319)
chr1 (142-423)||(49857461-49857740)
chr1 (307-572)||(29622105-29622365)
chr1 (332-573)||(11183309-11183548)
chr1 (183-572)||(22524259-22524650)
chr1 (1-157)||(19526727-19526886)
chr1 (1-157)||(19525405-19525564)
chr1 (1-157)||(19526540-19526699)
chr1 (1-157)||(19524557-19524716)
chr1 (1-157)||(19524744-19524903)
chr1 (335-426)||(11196153-11196244)
chr1 (183-479)||(2424924-2425224)
chr1 (183-293)||(50343525-50343635)
chr1 (1-113)||(11196268-11196383)
chr1 (183-313)||(21141413-21141544)
chr1 (459-572)||(19924889-19925000)
chr1 (198-417)||(17514267-17514497)
chr1 (1-106)||(19524931-19525039)
chr1 (1-106)||(19525592-19525700)
chr1 (1-106)||(19526066-19526174)
chr1 (183-293)||(47656277-47656386)
chr1 (190-286)||(38127045-38127141)
chr1 (183-313)||(97504-97635)
chr1 (195-313)||(2365622-2365741)
chr1 (195-313)||(19156401-19156520)
chr1 (1-84)||(49857368-49857454)
chr1 (195-286)||(3731949-3732040)
chr1 (195-286)||(13639591-13639682)
chr1 (195-286)||(26876071-26876162)
chr1 (471-572)||(2425528-2425627)
chr1 (1-60)||(2424579-2424641)
chr1 (226-286)||(8474199-8474259)
chr1 (334-421)||(25147571-25147657)
chr1 (366-421)||(38127223-38127278)
chr1 (199-273)||(25166976-25167050)
chr1 (1-60)||(22524871-22524933)
chr1 (439-475)||(23935782-23935818)
chr1 (439-475)||(38127297-38127333)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (2-567)||(36977733-36978299)
chr7 (1-572)||(27452990-27453560)
chr7 (1-572)||(47776465-47777036)
chr7 (1-608)||(9494167-9494781)
chr7 (1-568)||(37340440-37341006)
chr7 (1-550)||(47672466-47673004)
chr7 (1-572)||(17835209-17835779)
chr7 (1-572)||(34738496-34739068)
chr7 (87-572)||(39460660-39461141)
chr7 (131-557)||(10517128-10517549)
chr7 (1-390)||(14689436-14689822)
chr7 (122-572)||(15073724-15074168)
chr7 (122-572)||(42507523-42507967)
chr7 (198-573)||(17741019-17741400)
chr7 (183-279)||(5541096-5541192)
chr7 (186-313)||(556205-556333)
chr7 (183-293)||(16675193-16675303)
chr7 (183-293)||(17649561-17649671)
chr7 (195-286)||(35609984-35610075)
chr7 (195-286)||(41880904-41880995)
chr7 (195-286)||(45257401-45257492)
chr7 (195-286)||(48403771-48403862)
chr7 (183-293)||(46740103-46740213)
chr7 (195-265)||(9370958-9371028)
chr7 (41-84)||(39461126-39461169)
chr7 (1-44)||(10517554-10517597)
chr7 (235-286)||(17465329-17465380)
chr7 (235-286)||(17587834-17587885)
chr7 (366-421)||(41734441-41734496)
chr7 (510-572)||(15070607-15070669)
chr7 (446-538)||(556462-556551)
chr7 (195-232)||(17462862-17462899)
chr7 (195-232)||(17590315-17590352)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (1-640)||(42537202-42537851)
chr5 (1-568)||(38968231-38968800)
chr5 (1-572)||(7757456-7758027)
chr5 (1-571)||(8579876-8580445)
chr5 (69-568)||(512214-512709)
chr5 (1-527)||(42941858-42942383)
chr5 (1-572)||(28876775-28877345)
chr5 (99-640)||(19228144-19228685)
chr5 (1-423)||(8701595-8702021)
chr5 (1-423)||(17658598-17659024)
chr5 (122-572)||(28241295-28241739)
chr5 (198-572)||(14260-14630)
chr5 (186-423)||(40624473-40624720)
chr5 (186-423)||(20422215-20422463)
chr5 (183-313)||(5197359-5197490)
chr5 (195-306)||(19040685-19040796)
chr5 (1-91)||(14166-14259)
chr5 (198-313)||(27673224-27673340)
chr5 (195-293)||(30705543-30705641)
chr5 (1-62)||(40624406-40624470)
chr5 (504-572)||(30708778-30708846)
chr5 (510-572)||(28880202-28880264)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-572)||(28468773-28469343)
chr2 (1-557)||(39947746-39948303)
chr2 (1-564)||(45428730-45429293)
chr2 (1-538)||(32955729-32956262)
chr2 (152-571)||(21998323-21998737)
chr2 (212-578)||(25964938-25965308)
chr2 (122-514)||(17420757-17421144)
chr2 (1-291)||(45136674-45136956)
chr2 (248-572)||(7185160-7185481)
chr2 (305-572)||(45137111-45137373)
chr2 (1-216)||(22686863-22687081)
chr2 (183-280)||(25515366-25515463)
chr2 (183-313)||(29401160-29401291)
chr2 (450-572)||(42505582-42505702)
chr2 (183-293)||(36655906-36656016)
chr2 (183-293)||(10828581-10828691)
chr2 (189-313)||(45284558-45284683)
chr2 (189-313)||(45291921-45292046)
chr2 (195-313)||(20938282-20938401)
chr2 (195-286)||(3940297-3940388)
chr2 (195-286)||(5352379-5352470)
chr2 (195-286)||(30496515-30496606)
chr2 (195-286)||(43978934-43979025)
chr2 (195-286)||(15831542-15831633)
chr2 (195-286)||(43539306-43539397)
chr2 (335-420)||(35464313-35464398)
chr2 (332-420)||(31367308-31367396)
chr2 (366-423)||(25515549-25515606)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-572)||(14992-15563)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
scaffold0634 (193-571)||(7551-7925)
scaffold0634 (1-148)||(7899-8050)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (131-564)||(233-655)
[»] scaffold0155 (4 HSPs)
scaffold0155 (316-559)||(8349-8586)
scaffold0155 (191-293)||(10761-10863)
scaffold0155 (87-150)||(10833-10896)
scaffold0155 (40-79)||(10886-10925)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (337-572)||(40746-40975)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (446-572)||(18112-18236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (446-572)||(54608-54732)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (183-293)||(18489-18599)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (183-293)||(4210-4320)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (334-421)||(251183-251270)
scaffold0007 (226-274)||(246180-246228)
scaffold0007 (199-292)||(251048-251141)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Original strand, 34822387 - 34823028
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822387 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 34822486  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaa-aatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822487 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 34822586  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34822587 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcagagtataaaacatatttaaattgtgttcatttgcagt 34822686  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822687 cattcaaagccacattatgatttaaccaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 34822786  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822787 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa--tttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 34822884  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaaca 595  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34822885 tgtgataatgtgcagttaatttgcttgcaattcgtgaaaaaagttttggtgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaattaaca 34822984  T
Q  596 tgtttgtgtttctgtttatgttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  34822985 tgtttgtgtttctgtttatgttcagcacgcctcggcagttaact 34823028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 560
Target Start/End: Original strand, 40076630 - 40077179
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076630 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 40076729  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |         ||||    
T  40076730 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattatcatcatttctgt---------aacc 40076820  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  40076821 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaattataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 40076920  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40076921 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacagctacattcatttatcaattcataaactacacatataatcatcaaattgtcaattttaaaa 40077020  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40077021 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 40077115  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaa 560  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40077116 ctgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgttgaagattggaaagaa 40077179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 43188750 - 43188181
Alignment:
Q  2 ataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43188750 ataatcatcattacaataaaatttatgttcatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaatc 43188651  T
Q  99 atttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacct 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  43188650 atttgtttccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttatatcatttccataacat 43188551  T
Q  199 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtca 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  43188550 aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtatgcaaagtataaaacatattcaaatcgtgttcatttgccacca 43188451  T
Q  299 ttcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 397  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43188450 ttcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttattaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 43188351  T
Q  398 caaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttg 497  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43188350 caaccataaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tacttg 43188256  T
Q  498 taataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43188255 tgacaatatgcagttgatttgcttgcaattcttgaaaatgactttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 43188181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 39846370 - 39846930
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846370 tataatcatcattacaataaaatgtatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 39846469  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39846470 catttgtgtccatca-------------ctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 39846556  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  39846557 taaactaactaaataatcaataaaattgtcatggagacagtttatcaaacactttgtgtacaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 39846656  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846657 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 39846756  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39846757 tcaaccctaaccacatgcaaactactctattttttttttataaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 39846854  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39846855 gtgataatgtgcaattggtttgcttgcaatttgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 39846930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 15036098 - 15036668
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15036098 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 15036197  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaata-tcatttctatcatttccataa 195  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  15036198 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaaccctaatttctatcatttccataa 15036297  T
Q  196 cctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcag 295  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15036298 c-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcca 15036396  T
Q  296 tcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 394  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15036397 ccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctgaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttga 15036496  T
Q  395 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||            ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||      
T  15036497 aatcaaccctaaccacatacaaaccactctaa---tttttttaaaaaaataaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaacttat-- 15036591  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15036592 ttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgcgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaattt 15036668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 43212208 - 43211638
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  43212208 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 43212109  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  43212108 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccttaac 43212009  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  43212008 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttcccac 43211909  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43211908 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcgaattgtcaattttaaa 43211809  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||            |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  43211808 atcaaccctaagcacatacaaactactctaa----ttttttaaaaaaatcaaccaaaacaaattaacattatgattaaaatgattgacacaact--tact 43211715  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  43211714 tgtggtaatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatttt 43211638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 39938588 - 39939157
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39938588 tataatcaacattacaataaaatttatttccatcatttccataataacctaaacatcattcattaattaacacacacttaatcatttctatac-cttaat 39938686  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39938687 catttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 39938786  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  39938787 taaactaactacataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataaaacttattcaaattgtgttcatttgccacc 39938886  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39938887 attcaaagccccattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactatacatgtaatcatcaaattatcaattttaaaa 39938986  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  39938987 tcaaccctaaccacatgtaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tactt 39939081  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39939082 gtgataatgtgcaattgatttgctttcaattcgtgaaaatggacttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 39939157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 45064933 - 45064374
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45064933 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 45064834  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45064833 tcatttgtgtccatcataattctcctaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataa- 45064735  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||       
T  45064734 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaa----------aaattcaaattgtgttcatttgccac 45064645  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45064644 cattcaaagccacattaagatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaa 45064545  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  45064544 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 45064450  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45064449 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaattt 45064374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 39252705 - 39252149
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  39252705 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttgatcatttctatacaactaaa 39252606  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||||    
T  39252605 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttgaccaaactataattaacatcatttc---------cataac 39252515  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  39252514 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtattcatttgccac 39252415  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252414 cattcaaagccacattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatttattaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 39252315  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39252314 atcaa-cctaaccacatacaaactactctaattttttttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 39252218  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg 564  Q
    ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  39252217 tgtgataacgcgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgaatttggtgaagattggagagaaattg 39252149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 415
Target Start/End: Original strand, 5303612 - 5304010
Alignment:
Q  3 taatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||                  ||||||| |    
T  5303612 taatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataacctaaacatctttcaataattaacatac------------------acttaatca 5303693  T
Q  100 tttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataaccta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5303694 tttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataaccta 5303793  T
Q  200 aactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  5303794 aactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccat 5303893  T
Q  300 tcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatc 398  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5303894 tcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatgaaattgtcaattttaaaatc 5303993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 41249478 - 41250014
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||                    
T  41249478 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcactcattaattaacatacacttaatca---------------- 41249561  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41249562 --tttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 41249659  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |                |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  41249660 taaactaactacataatcaataaaattgtcattgcggcaat----------------gtgcaaagtataaagcatattcaaattgtgttcatttgccacc 41249743  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249744 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 41249843  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  41249844 tctaccctaaccacatgcaaactactctaa---tttttaaaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tactt 41249938  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41249939 gtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 41250014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 159 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 39602256 - 39601835
Alignment:
Q  159 caaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39602256 caaaatataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgc 39602157  T
Q  259 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattca 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  39602156 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcc 39602057  T
Q  358 taaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactct---------aannnnnnnnnnnnaaaaataaac 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||            |||||| |||    
T  39602056 taaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatcaac 39601957  T
Q  449 ctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaa 548  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  39601956 ctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgaatttggcgaa 39601859  T
Q  549 gattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39601858 gattggagagaaattgagaatttt 39601835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 489125 - 489569
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  489125 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 489223  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  489224 attgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaattgtgttcatttgcaaccattcaaagccacattataatttaa 489323  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||      | || |||||||||||||||||||    
T  489324 actacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttgtaaaacctaaccacatgcaaacta 489423  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  489424 ctcaa----ttttttttaaaaatttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 489517  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  489518 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagatcggagagaatttgaaaatttt 489569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 42485025 - 42485478
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaa---------tatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42485025 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaata 42485123  T
Q  213 atcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacatt 311  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  42485124 atcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacatt 42485223  T
Q  312 atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccaca 411  Q
    || |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || ||||||||||    
T  42485224 ataatttaaactacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccaca 42485323  T
Q  412 tgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagt 511  Q
    |||||||||||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  42485324 tgcaaactactcaa----tttttttaaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcact 42485417  T
Q  512 tgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42485418 tgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaatttgagaatttt 42485478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 297 - 578
Target Start/End: Original strand, 25864610 - 25864886
Alignment:
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864610 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataa-ctacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 25864708  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  25864709 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---tatttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattaatacaact--tact 25864803  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaa 578  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25864804 tgtgataatgtgtagttgatttgattgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattagagagaaattgagaatttttgagaa 25864886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2984715 - 2984395
Alignment:
Q  114 aattctcataacctaaactaactaaaaaatcaata-------tacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2984715 aattctcataacctaaactaactaaataatcaataatcaatatacactttatcaaactataattaacatcattttcatcatttccataacctaaactaac 2984616  T
Q  207 taaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattc-aaac 305  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   |||||| ||||    
T  2984615 taaataatcaatataattgtcgttgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatgaaacttattcaaattgtgtttatttggcatcattcaaaac 2984516  T
Q  306 cacattatgatttaaccaacat--aggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccc 403  Q
    |||||||| | ||||  | |||  |   | ||| ||||||||| ||| |  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984515 cacattat-acttaaaaatcattcaaagatcaattacattcatctataacatc-ttaacaacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccc 2984418  T
Q  404 taaccacatgcaaactactctaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2984417 taaccacatgcaaactactctaa 2984395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24249999 - 24249759
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24249999 atcatttccataacctaaactgactaaataatcaatataattctcattggggcattttatcaaatactttatgtgcaaagtatcaaacatattcaaaatg 24249900  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaa 381  Q
    || |||||||    |||||||| ||||||||| | |||| || ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24249899 tgctcatttgacaccattcaaaaccacattat-acttaaacatcaattacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaa 24249801  T
Q  382 ttgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24249800 ttgtcaattcctatatcaaccctaaccacatgcaaactactc 24249759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37327292 - 37327080
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327292 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 37327193  T
Q  291 tgcagtcattc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 389  Q
    |||   ||||| ||| |||||||| |||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327192 tgccaccattcaaaatcacattatcatt--------------------tacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 37327113  T
Q  390 tttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37327112 tttaaaattaaccctaa-cacatgcaaactactc 37327080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20857802 - 20857671
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  20857802 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 20857703  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  20857702 tgttcttttgcaaccattcaaaaccacattat 20857671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35552182 - 35552051
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  35552182 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 35552083  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  35552082 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 35552051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 568
Target Start/End: Original strand, 5304009 - 5304107
Alignment:
Q  468 cattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgaga 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  5304009 cattaaaatgattgatacaactta--cttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgaga 5304106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 440 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 35026749 - 35026619
Alignment:
Q  440 aaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggc 539  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||      
T  35026749 aaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgtgtagttaatttgcttgcaattcgtgaaaatgaa 35026652  T
Q  540 tttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  35026651 tttggtgaagattgtagagaaatttcgaatttt 35026619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 286
Target Start/End: Original strand, 34371450 - 34371553
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  34371450 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaaaaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 34371549  T
Q  283 tgtt 286  Q
    ||||    
T  34371550 tgtt 34371553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 188 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45128261 - 45128135
Alignment:
Q  188 ttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttc 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  45128261 ttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattcacattggggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaacgtgttc 45128162  T
Q  288 atttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
     |||||   ||||| ||||||||||||    
T  45128161 ttttgccaccattcaaaaccacattat 45128135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 25095 - 25186
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  25095 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 25186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1053029 - 1052938
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1053029 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgatacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 1052938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5677587 - 5677456
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  5677587 atcatttccataacctaaacttactcgataatcaatataattttcattggggcattttatcaaacactttctgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 5677488  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    | ||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  5677487 tattcttttgctaccattcaaaaccacattat 5677456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 23021889 - 23021980
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23021889 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 23021980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26659951 - 26659860
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  26659951 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 26659860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35026786 - 35026740
Alignment:
Q  356 cataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35026786 cataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacc 35026740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22495272 - 22495216
Alignment:
Q  334 caactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22495272 caactacattcatttatcaattcgtaaactacacatgcaaccatcaaaatgtcaatt 22495216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22495419 - 22495325
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |   | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22495419 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttatcaaaaaacatttgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttg 22495325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37327300 - 37327264
Alignment:
Q  112 ataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37327300 ataattctcataacctaaactaactaaataatcaata 37327264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 34370133 - 34370168
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34370133 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaat 34370168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 45128082 - 45128025
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||||||||||| | ||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45128082 acatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaaccataaccacatgcaaactactc 45128025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Original strand, 55407158 - 55407805
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcca---taacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407158 tataatcatcattacaataaaatttatgtcaataatttccacaataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 55407257  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55407258 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaacgaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 55407357  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  55407358 taaactaactaaataatcaatataattttcaatgaggcattcgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 55407457  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407458 attcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 55407557  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-nnnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  55407558 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaattttttttttttttaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tact 55407655  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaaca 595  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55407656 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggttttggtgaagattggagagaaattgagaattttttagagaagtttagaaactaaca 55407755  T
Q  596 tgtttgtgt------ttctgtttatgttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
    |||||||||      |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  55407756 tgtttgtgtttctgcttctgtttatgttcagcacgcctcggcagttaact 55407805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 51683904 - 51683337
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683904 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 51683805  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51683804 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 51683705  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  51683704 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 51683605  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683604 attcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaaatacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 51683505  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  51683504 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-tttttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatataact--tactt 51683408  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  51683407 gtgataatgtgtagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg-tttggtgaagattggaaagaatttgagaa 51683337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Original strand, 48255942 - 48256580
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255942 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 48256041  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  48256042 catctgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataact 48256141  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  48256142 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgttttcatttgccacc 48256241  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256242 attcaaagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 48256341  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  48256342 ttaaccctaaccacatgcaaactactctaa--ttttttttaaaaaaataaacctaagcaaactaatattatcattaaaatgattgatacaa--tttactt 48256437  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaaca- 595  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |  || |||||| |||||| | |     
T  48256438 gtgataatgtgcagttgatttgtttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgagaagtcat--gagaagttttgaaactgatat 48256535  T
Q  596 -tgtttgtgtttctgtttatgttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  48256536 gtgtttctgtttctgcttatgttcagcacgtctcggcagttaact 48256580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 21022259 - 21022828
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21022259 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 21022358  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21022359 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 21022458  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  21022459 -taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 21022557  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21022558 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaa 21022657  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |             |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  21022658 atcaaccctaaccacatacaaactactcaa---tttttttaaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 21022752  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21022753 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagcaattgagaattt 21022828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 40357651 - 40358221
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  40357651 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 40357750  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40357751 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 40357850  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  40357851 -taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtataaaacatattcaaactgtgttcatttgccac 40357949  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40357950 cattcaaatccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaa 40358049  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  40358050 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 40358144  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358145 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 40358221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 50902181 - 50901586
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902181 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 50902082  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50902081 catttgtgtctatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataact 50901982  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  50901981 taaactaactaaa-aatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatataaaacatattcaaattgtgttcatttaacacc 50901883  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50901882 attcaaagccacattatgaattaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 50901783  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  50901782 tcaaccctaaccacatgtaaactactctaa----ttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatgcaact--tactt 50901689  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacat 596  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| |||  |||||| |||| ||  |||| ||||| | |||||||||| ||    
T  50901688 gtgataatgtgcgattgatttgcttgcaattcacggaaatggatttggtgaaaatttaagagaatttgaaaacgtttt-gaaaattgtagaaactaatat 50901590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 50275418 - 50274866
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||                    
T  50275418 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaacatacacttaatca---------------- 50275335  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50275334 --tttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 50275237  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  50275236 taaactaactacataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 50275137  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275136 attcaaagccacattctgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 50275037  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  50275036 ttaaccctaaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaattaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tactt 50274942  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  50274941 gtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 50274866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 37021448 - 37021883
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatac-acttaa 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37021448 tataatcatcattataataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 37021547  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaat-----caatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttcc 191  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37021548 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatataatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcattttc 37021647  T
Q  192 ataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37021648 ataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaagatattcaaattgtgttcattt 37021747  T
Q  292 gcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 390  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021748 gccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 37021847  T
Q  391 ttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa 426  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37021848 ttaaaatcaactctaaccacatacaaactactctaa 37021883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 191 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 68100 - 67689
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68100 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 68001  T
Q  291 tgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 389  Q
    |||   |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68000 tgctaccattcaaagccacattatcatttaaacaacataggcaacaactacatttatttatcaattcataaactacacatgcaatcattaaattgtcaat 67901  T
Q  390 tttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67900 tttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacatt-tcattaaaatgattgatacaact 67805  T
Q  490 tatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaa 589  Q
      ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  67804 --tacttgtgataatgtgcggttgattttcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagatttgagagaaattgagaa--ttttagagaagttttgaaa 67709  T
Q  590 ctaacatgtttgtgtttctg 609  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  67708 ctaacatgtttgtgtttctg 67689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 30726237 - 30726681
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30726237 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaagtataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 30726335  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  30726336 attgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaa 30726435  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||     || || |||||||| ||||||||||    
T  30726436 actacataggcaacaactacattcatttatcaatacataaactacacgtgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccaaatgcaaacta 30726535  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30726536 ctcaa----ttttttttaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 30726629  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726630 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 30726681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 1089080 - 1089524
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1089080 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 1089178  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  1089179 attgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattattatttaa 1089278  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  1089279 actacatatgcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacttgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 1089378  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1089379 ctcaa----ttttttaaaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 1089472  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089473 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 1089524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 1308610 - 1309054
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1308610 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 1308708  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  1308709 attgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataatttaa 1308808  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  1308809 actacatatgcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 1308908  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1308909 ctcaa----tttttttaaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 1309002  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1309003 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaatttgagaatttt 1309054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 567
Target Start/End: Original strand, 21538008 - 21538397
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21538008 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacagattcaaattg 21538107  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||          || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21538108 tgttcatttggcatcattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacccatgc 21538207  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcatt 471  Q
    |||  ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| ||             |||| | || ||||||||||||||||||| |||    
T  21538208 aatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaactact-ta---tatttttaaaaaaacttaaactaaacaaactaacattatgatt 21538303  T
Q  472 aaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgaga 567  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||    
T  21538304 aaaatgattgatgcaact--tacttgtgataatgtgtggttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgagaatgggagagaatttgaga 21538397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 191 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 46436753 - 46436411
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436753 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgccattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 46436654  T
Q  291 tgcagtcattca-aaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 389  Q
    |||   |||||| ||||||| ||| |||||| || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436653 tgccaccattcagaaccacaatatcatttaaacagcataagcaacaactacattcgtttattaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 46436554  T
Q  390 tttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact 489  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||            |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  46436553 tttaaaattaaccctaa-cacgtgcaaactactcaaa---aaaaaattaaaaacttaacctaaacaaactaacattaacattgcaatgattaatggtact 46436458  T
Q  490 tatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
      ||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46436457 --tacttgtgataatgtggggatgattggcttgcaattcgtgaaaatgg 46436411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14315925 - 14315650
Alignment:
Q  159 caaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 258  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||    
T  14315925 caaactataattaacatcatttcaatcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgtgc 14315826  T
Q  259 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||          || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14315825 aaagtataaaacatactcaaaatgtgttcatttggcaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatt 14315726  T
Q  348 tatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || ||||||||||||||||||||||    
T  14315725 tatcaattcataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcattcataaaacctaaccacatgcaaactactc 14315650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 68222 - 68070
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccat---aacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68222 tataatcattattacaataaaatttgtgtccatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 68123  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatata 150  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68122 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaataatcaatata 68070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 538
Target Start/End: Original strand, 10752983 - 10753343
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10752983 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10753082  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    ||| |||||||   ||||| ||||||||||          || |||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10753083 tgtccatttgccaccattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacatctacattcatttatcaattcataaactacacatgc 10753182  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcatt 471  Q
    |||  ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||  |            |||| | || ||||||||||||||||||| |||    
T  10753183 aatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaactactcata----ttttttaaaaaacttaaactaaacaaactaacattatgatt 10753278  T
Q  472 aaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  | |||    ||||||||||||||||||||    
T  10753279 aaaatgattgatgcaact--tacttgtcataatgtggggatgagagacttgcaattcgtgaaaatgg 10753343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 538
Target Start/End: Original strand, 10966752 - 10967112
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10966752 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10966851  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    ||| |||||||   ||||| ||||||||||          || |||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966852 tgtccatttgccaccattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacatctacattcatttatcaattcataaactacacatgc 10966951  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcatt 471  Q
    |||  ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||  |            |||| | || ||||||||||||||||||| |||    
T  10966952 aatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaactactcata----ttttttaaaaaacttaaactaaacaaactaacattatgatt 10967047  T
Q  472 aaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  | |||    ||||||||||||||||||||    
T  10967048 aaaatgattgatgcaact--tacttgtcataatgtggggatgagagacttgcaattcgtgaaaatgg 10967112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 177 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14297658 - 14297401
Alignment:
Q  177 atttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattc 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14297658 atttcaatcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgtgcaaagtataaaacatactc 14297559  T
Q  277 aaattgtgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactac 365  Q
    ||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||          || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14297558 aaaatgtgttcatttggcaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 14297459  T
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    ||||||||| || ||||||||||||     || || ||||||||||||||||||||||    
T  14297458 acatgcaatgatgaaattgtcaattcattcataaaacctaaccacatgcaaactactc 14297401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Original strand, 11050037 - 11050188
Alignment:
Q  141 aatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttg 240  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  11050037 aatcaatatacactttatcaaactatcattaacatcctctccatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgatgcatttt 11050136  T
Q  241 atcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11050137 atcaaatactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttg 11050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 439 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8109656 - 8109529
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8109656 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactta--cttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatga 8109559  T
Q  539 ctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8109558 atttggtgaagattggagagaaattgagaa 8109529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 423
Target Start/End: Original strand, 11083562 - 11083813
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  11083562 atcattttcataacctaaactaactcaataatcagtacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagcatcaaacatactcaaaatg 11083661  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    ||||||||||    ||||| ||||||||||          || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11083662 tgttcatttgacaccattcaaaaccacatttttattatacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaatacataaactacacatgc 11083761  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    ||| |||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||    
T  11083762 aatgatcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaactactc 11083813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 50023099 - 50023230
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50023099 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50023198  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  50023199 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 50023230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 41933179 - 41933276
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41933179 atcatttccataatctaaactaactcaataatcaatataattttcattggggctttttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaat 41933276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 50030217 - 50030348
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50030217 atcatatccataacctaaactaactaaataatcagtaaaattgtcattgatgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50030316  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  50030317 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 50030348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 306
Target Start/End: Original strand, 41798563 - 41798674
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41798563 accttaactaactaaataatcaataaatttgtcgttgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgct 41798662  T
Q  295 gtcattcaaacc 306  Q
      ||||||||||    
T  41798663 accattcaaacc 41798674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 421
Target Start/End: Original strand, 4719949 - 4720163
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    |    
T  4719949 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttgacacc 4720048  T
Q  298 attcaaac-cacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||||||  |||||| | | ||||   ||||      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |      
T  4720049 attcaaaatcacattct-acttaa---acat------caattacattcatttaccaattcataaactacacacgcaatcatcaaaatgtcaattcttacg 4720138  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4720139 taaaccctaaccacatgcaaactac 4720163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 9892836 - 9892955
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  9892836 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 9892935  T
Q  295 gtcattc-aaaccacattat 313  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  9892936 accattcaaaaccacattat 9892955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30704532 - 30704436
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  30704532 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagatattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttc 30704436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 6181358 - 6181449
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  6181358 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 6181449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49090925 - 49090834
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  49090925 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 49090834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50193985 - 50193893
Alignment:
Q  194 aacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50193985 aacctaaactaagtaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttatgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 50193893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3184473 - 3184342
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3184473 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3184374  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  3184373 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3184342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 3185440 - 3185571
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185440 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185539  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  3185540 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3185571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 3185648 - 3185779
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185648 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185747  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  3185748 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3185779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49165538 - 49165447
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  49165538 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaactatcaaacatactcaaaatgtgtt 49165447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 44679631 - 44679741
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  44679631 atcatatctataacctaaactaactaaataatcaatgaaatggtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatg 44679730  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  44679731 tgttcttttgc 44679741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31422203 - 31422111
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgat-caaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31422203 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttattcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 31422111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 564
Target Start/End: Original strand, 37021933 - 37021995
Alignment:
Q  502 aatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg 564  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  37021933 aatgtgcagttgatttgcttgctattcgtgaaaatgaatttggtgaagattggagagaaattg 37021995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 40354775 - 40354703
Alignment:
Q  504 tgtgcagttgatttgcttgcaattcgt-gaaa-atggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttttt 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40354775 tgtgccgttgatttgcttgcaattcgtagaaagaagtatttggcgaagattggagagaaattgagaatttttt 40354703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46436761 - 46436725
Alignment:
Q  112 ataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46436761 ataattctcataacctaaactaactaaataatcaata 46436725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30704356 - 30704301
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30704356 acatgcaatcatcgaattttcaattccaacatcaaccctaaccacgtgcaaactac 30704301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 477
Target Start/End: Original strand, 37021898 - 37021936
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatg 477  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37021898 aaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatg 37021936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 423
Target Start/End: Original strand, 41933363 - 41933420
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41933363 acatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctatccacatgcaaactactc 41933420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 219
Target Start/End: Original strand, 21537947 - 21537975
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537947 cataacctaaactaactaaataatcaata 21537975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 537
Target Start/End: Original strand, 41933439 - 41933527
Alignment:
Q  446 aacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatg 537  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||| || | |||  ||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  41933439 aacctaaacaaactaacattaagattacattgattaattctact--tacttgtgataatgtggagatga-ttgcttgcaaatcgtgaaaatg 41933527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Original strand, 20917386 - 20918023
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20917386 tataatcatcattgcaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctgtacacttaat 20917485  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacac--ttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataa 195  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20917486 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaactataattaacatcatttcaatcatttccataa 20917585  T
Q  196 cctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcag 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20917586 cttaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcca 20917685  T
Q  296 tcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 394  Q
     |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917686 ccattcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactatacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 20917785  T
Q  395 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  20917786 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaaca-tatcattaagatgattgatacaact--tac 20917879  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaac 594  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20917880 ttgtgataatgtgcgattgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgagaa--ttttagagaagttttgaaactaac 20917977  T
Q  595 atgtttgtgtttctgtttatg-ttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||    
T  20917978 atgtttgtgtttctgcttttgtttcagcacgcctcggcagttaact 20918023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Original strand, 20926348 - 20926985
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20926348 tataatcatcattgcaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctgtacacttaat 20926447  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacac--ttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataa 195  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20926448 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaactataattaacatcatttcaatcatttccataa 20926547  T
Q  196 cctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcag 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20926548 cttaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcca 20926647  T
Q  296 tcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 394  Q
     |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926648 ccattcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactatacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 20926747  T
Q  395 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  20926748 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaaca-tatcattaagatgattgatacaact--tac 20926841  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaac 594  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20926842 ttgtgataatgtgcgattgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgagaa--ttttagagaagttttgaaactaac 20926939  T
Q  595 atgtttgtgtttctgtttatg-ttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||    
T  20926940 atgtttgtgtttctgcttttgtttcagcacgcctcggcagttaact 20926985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 42756853 - 42756220
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42756853 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacgcttaatcatttctatagacttaat 42756754  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42756753 catttgcgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 42756654  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  42756653 taaactaactaaataatca--ataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 42756556  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756555 attcaaagcgacattatgatttaaacaacatagacaacaactacatccatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 42756456  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  42756455 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattattattaaaatgattgatacaact--gactt 42756361  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacat 596  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||| || | | |||||| | ||    
T  42756360 gtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattggaaagaatttgagaa--gtttagagaattcttgaaactgaaat 42756263  T
Q  597 gtttgtgtttctgtttatgttcagcacatctcggtagttaact 639  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42756262 gtttgtgtttctggttatgttcagcacgtctcggcagttaact 42756220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Original strand, 30255373 - 30255975
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255373 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 30255472  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30255473 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccttaacc 30255572  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  30255573 tgaactaactaaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 30255672  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30255673 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttagcaattcacaaactaaacatgcaatcatcaaattgtcaactttaaaa 30255772  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30255773 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaataaacctaaacaaactaaccttatcattaaaatgattgatacaact--tactt 30255867  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacat 596  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||  || |||||| |||||| | ||    
T  30255868 gtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattggaaagaatttgagaagtttt--gagaagttttgaaactgatat 30255965  T
Q  597 gtttgtgttt 606  Q
    |||| |||||    
T  30255966 gtttctgttt 30255975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 49195836 - 49196433
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||                  |||||||    
T  49195836 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataatttacatac------------------acttaat 49195917  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49195918 catttgtgtccatcataattcttgtaagctaaactaactaaaaaatcaatatacaattaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataacc 49196017  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  49196018 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaagcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 49196117  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196118 attcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 49196217  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  49196218 tcaaccttaaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaagtgattgatacaact--tactt 49196312  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacat 596  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49196313 gtgataatgtgcagttgattttcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattagagagaaattgagaattttttagagaagtttagaaactaacat 49196412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 44230415 - 44229877
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcc---ataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230415 tataatcatcattacaataaaatttatgtccataatttccgtaataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 44230316  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44230315 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 44230216  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  44230215 taaaccaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacacattgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 44230116  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
     |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230115 gttcaaagccacattatgttttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 44230016  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44230015 tcaaccctaaccacatgcaaactactctgattttttttt-----aaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 44229923  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggcttt 542  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229922 gtgataatgtgcaattgatttgcttgcaattcgtgaaaatggcttt 44229877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 48889436 - 48888817
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889436 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaactgcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 48889337  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||    
T  48889336 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttc---------cataacc 48889246  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |    
T  48889245 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcctttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttaccacc 48889146  T
Q  298 attcaaac-cacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889145 attcaaagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 48889046  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnna----aaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48889045 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaattttttatttttatttttaaataaacttaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--t 48888948  T
Q  493 acttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaacta 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||   ||| || |||||| ||||||     
T  48888947 acttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattggaaagaatttgagaa--gtttggagaagttttgaaactg 48888850  T
Q  593 aca--tgtttgtgtttctgtttatgttcagcac 623  Q
    | |  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  48888849 atatgtgtttctgcttctgtttatgttcagcac 48888817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 564
Target Start/End: Original strand, 47073577 - 47074142
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  47073577 tataatcatcattacaatagaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 47073676  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47073677 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 47073776  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  47073777 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatattcaaattgtgttcatttgccac 47073876  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47073877 cattcaaagccacattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcattcatcaaattgtcaattttaaa 47073976  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  47073977 atcaaccctaaccacatacaaactactct-atttattttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tact 47074073  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg 564  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  47074074 tgtgataatgtgcggttgatttgcttgctattcgtgaaaatggatttggtgaagattgaagagaaattg 47074142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 42165865 - 42165295
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  42165865 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 42165766  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42165765 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataac 42165666  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  42165665 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatattcaaattgtgttcatttgccac 42165566  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165565 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 42165466  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||    
T  42165465 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa----ttttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattatgattaaaatgatggacacaact--tact 42165372  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  42165371 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaagaatatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatttt 42165295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 4007693 - 4008264
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4007693 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 4007792  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4007793 tcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcctttatatcatttccataac 4007892  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  4007893 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 4007992  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4007993 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcgaattgtcaattttaaa 4008092  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  4008093 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatgattaaaatgattgacacaact--tact 4008187  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4008188 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgctattcgtgaaagaagatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatttt 4008264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 50963660 - 50963086
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaata----attaacatacacttaatcatttctataca-c 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  50963660 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataataacctaaacatcattcaatatataattaacgtacactcaatcatttctatacaac 50963561  T
Q  93 ttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttcca 192  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  50963560 taaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata-ttaacatcatttatatcatttcca 50963462  T
Q  193 taacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963461 taacctaaactaactaaataatttataaaattgtcactgaggcattttatcaaacactttgtgtgtaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 50963362  T
Q  293 cagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattt 391  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963361 ccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattt 50963262  T
Q  392 taaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactta 491  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  50963261 taaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact-- 50963167  T
Q  492 tacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963166 tacttgtgataatgtacacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 50963086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 3976409 - 3975838
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3976409 tataatcatcattacaataaaatttatgtccaccatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 3976310  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  3976309 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcctttatatcatttccataac 3976210  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3976209 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 3976110  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3976109 cattcaaagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcaattgccaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatttttaa 3976010  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  3976009 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 3975915  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  3975914 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatttt 3975838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 48563629 - 48563078
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48563629 tataatcatcattacaataaaatttatgcccatcattttcataataacataaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatgcacttaat 48563530  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48563529 catttgtgtccatcataattcttgtaatctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 48563430  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  48563429 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 48563330  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||||||  ||||||||||||||            ||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563329 attcaaagacacattatgattta------------aacaacta----tatttatcaattcatagactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 48563246  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  48563245 tcaaccttaaccacatgcaaactactctaattttttttttt--aaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 48563150  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||    
T  48563149 atgataatgtgcagttgatttgcttgcaatttgtgaaaatgattttgatgaagattgaaaagaatttgagaa 48563078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 42805632 - 42806107
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccat---aacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805632 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 42805731  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaa-aatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42805732 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacctaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 42805831  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42805832 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 42805931  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| |||||||||||    
T  42805932 cattcaaagccacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactatacatgc--------aattatcaattttaaa 42806023  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgatt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42806024 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa-tttttcttttaaaaaataaacataaacaaactaacattatcattaaaatgatt 42806107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 147 - 572
Target Start/End: Original strand, 50216398 - 50216821
Alignment:
Q  147 tatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  50216398 tatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaaccacataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaa 50216497  T
Q  247 cactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattca 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50216498 cactttgtgtgcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaaaccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 50216597  T
Q  346 tttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaata 445  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||     
T  50216598 tttatcaattcctaaattacacatgcaatcatcaaattatcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-tttaaaaataaaaaaatc 50216696  T
Q  446 aacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgat 545  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  50216697 aacctaaacaaatttacattatcattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggt 50216794  T
Q  546 gaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50216795 gaagattggagagaaattgtgaatttt 50216821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 192 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 597266 - 596891
Alignment:
Q  192 ataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  597266 ataacctaagctaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacataatcaaaatgtgttctttt 597167  T
Q  292 gcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 390  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  597166 gccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatgggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaata 597067  T
Q  391 ttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactt 490  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  597066 tttaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa----tttaaaaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatgattaaaatgattgacacaact- 596972  T
Q  491 atacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  596971 -tacttgtgataatgtgcaattgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagaaaaattgtgaatttt 596891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 212 - 571
Target Start/End: Original strand, 3501477 - 3501834
Alignment:
Q  212 aatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaacc-acat 310  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  3501477 aatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaacccacat 3501576  T
Q  311 tatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccac 410  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3501577 tatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaaccac 3501676  T
Q  411 atgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcag 510  Q
    || |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||     
T  3501677 atacaaactactctaa-tttttttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcac 3501773  T
Q  511 ttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  3501774 ttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattgaaaagaaattgagaattt 3501834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 256 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 51807413 - 51807101
Alignment:
Q  256 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51807413 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaat 51807314  T
Q  355 tcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaac 454  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||    
T  51807313 ttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaatcataaccacatgcaaactactctaa---tttttttttaaaaataaacctaaac 51807217  T
Q  455 aaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattgg 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  51807216 aaactgacattatcattaaaatgattgatacaact--tacttgtgataatgtacagttgatttgcttgcaatttgtgaaaataactttggtgaagattgg 51807119  T
Q  555 agagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||| |||||||    
T  51807118 agagaaattgtgaatttt 51807101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 49268639 - 49268782
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49268639 tataatcatcattacaatttaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcatccaataattaacatacacataatcatttctatacacttaat 49268738  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaa 141  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49268739 catttgcgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaa 49268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 500 - 609
Target Start/End: Original strand, 42807500 - 42807609
Alignment:
Q  500 ataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacatgtt 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42807500 ataatgtgcggttgatttgcttgcaatttgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgagaattttttagagaaatttagaaactaacatgtt 42807599  T
Q  600 tgtgtttctg 609  Q
    ||||||||||    
T  42807600 tgtgtttctg 42807609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16611594 - 16611463
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16611594 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16611495  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  16611494 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 16611463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 17567619 - 17567730
Alignment:
Q  182 tatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaatt 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  17567619 tatcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaat 17567718  T
Q  282 gtgttcatttgc 293  Q
    |||||| |||||    
T  17567719 gtgttcttttgc 17567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 22047659 - 22047790
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  22047659 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 22047758  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  22047759 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 22047790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41612884 - 41612753
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  41612884 atcatatccataaactaaactaactagataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 41612785  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  41612784 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 41612753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 421
Target Start/End: Original strand, 31045165 - 31045388
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    |    
T  31045165 taaactaactaaataataaatgcaattctcattttggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcacattgtgttattttgacacc 31045264  T
Q  298 attc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||| |||||||||| | | |||| || ||     |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |    
T  31045265 attcaaaaccacatt-ttacttaaacatcaattacattaactacattcgtttatcaatttataaactacacatgcaatcatcaaaatgtcaattcattca 31045363  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  31045364 taaaccctaaccacatgcaaactac 31045388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20351161 - 20351051
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggca-tttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaatt 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  20351161 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttaatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaa-t 20351063  T
Q  282 gtgttcatttgc 293  Q
    |||||| |||||    
T  20351062 gtgttcttttgc 20351051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 52390964 - 52391055
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52390964 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgtt 52391055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 287
Target Start/End: Original strand, 2274482 - 2274574
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  2274482 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttc 2274574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29009364 - 29009273
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29009364 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 29009273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36127953 - 36127822
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36127953 atcatatccatagcctaaactaaccaaataatcaagaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36127854  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  36127853 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 36127822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 42903758 - 42903849
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  42903758 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 42903849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46389466 - 46389375
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  46389466 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 46389375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 50480352 - 50480443
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50480352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 50480443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 54386628 - 54386537
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  54386628 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 54386537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 54682038 - 54681976
Alignment:
Q  99 atttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54682038 atttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaa 54681976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 49144031 - 49144121
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  49144031 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atattcaaaatgtgtt 49144121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4178305 - 4178211
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||    
T  4178305 taaactaactaaataatcaataaaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcatttg 4178211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 46701593 - 46701670
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46701593 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacat 46701670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 50216322 - 50216408
Alignment:
Q  13 tacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaa 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216322 tacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacattattcatcatttaacatacacttaatcatttctatacacttaa 50216408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34045880 - 34045790
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  34045880 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atactcaaaatgtgtt 34045790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4172307 - 4172214
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||    
T  4172307 taaactaactaaataatcaataaaattctcatttgggcattttgtcaaacactttttgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcattt 4172214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 597603 - 597541
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcc---ataacctaaacatcattcaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  597603 tataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaa 597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 2647891 - 2647829
Alignment:
Q  510 gttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2647891 gttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggcgaagattggagagaaattgagaatttt 2647829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 44227280 - 44227246
Alignment:
Q  538 gctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44227280 gctttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 44227246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 609
Target Start/End: Original strand, 24088153 - 24088762
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccat---aacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24088153 tataatcatcattactataaaatttgtgtcaatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaacatacactgaatcatttctatacacttaat 24088252  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24088253 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacctaatcaaactatcattaacatcatttctatcatttccataacc 24088352  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  24088353 taaactaactaaataatcaatataattttcattgagacatttgatcaaacactttgtgtacaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 24088452  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24088453 attcaaagccacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaattatcaaattgtcaattttaaaa 24088552  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24088553 tcaacactaaccacatgcaaactactct-attttttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttat--tt 24088649  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacat 596  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24088650 gtgataatttgcggttgatttgcttgcaattcgtgaaaataactttaatgaaaattggagagaaattgagaatattttagagaagtttagaaactaacat 24088749  T
Q  597 gtttgtgtttctg 609  Q
    |||||||||||||    
T  24088750 gtttgtgtttctg 24088762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 6319934 - 6320363
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6319934 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaattatttctatatacttaat 6320033  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6320034 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 6320133  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6320134 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacgctttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 6320233  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320234 attcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 6320333  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320334 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa 6320363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31769408 - 31768861
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  31769408 tataatcatcattataataaaatttatttccatcatttccataataacataaatatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 31769309  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31769308 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 31769209  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  31769208 ctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcttttgccac 31769109  T
Q  297 cattc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacat----gcaatcatcaaattgtcaattt 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  31769108 cattcaaaaccacattatgatttaaacaacataagcaacaactacattcatttgtcaattcctaaaccacacatgcaagcaatcatcaaattgtcgattt 31769009  T
Q  392 taaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactta 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  31769008 taaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa--tttttaaaaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact-- 31768913  T
Q  492 tacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttg 543  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31768912 tacttgtgataatgtgcaatctatttgcttgcaatttatgaaaatggatttg 31768861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21601106 - 21601012
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21601106 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttg 21601012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24722445 - 24722336
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24722445 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 24722346  T
Q  283 tgttcatttg 292  Q
    ||||| ||||    
T  24722345 tgttcttttg 24722336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Original strand, 6320371 - 6320465
Alignment:
Q  472 aaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  6320371 aaaatgattgatacaactta--cttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgagaa 6320465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26423514 - 26423404
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  26423514 atcatatccataacataaactaactaaataaacaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 26423415  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    || || |||||    
T  26423414 tgatcttttgc 26423404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3501686 - 3501555
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3501686 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattgtccttgaggcattttctcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3501587  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  3501586 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 3501555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6201653 - 6201562
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  6201653 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 6201562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11688620 - 11688529
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  11688620 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 11688529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22301685 - 22301594
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22301685 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 22301594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 30829220 - 30829311
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  30829220 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 30829311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3381313 - 3381192
Alignment:
Q  159 caaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 258  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||            ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3381313 caaactataattaacatcattttaatcatttccataacataaactaattaaataatca------------ttgaggcattttatcaaccactttgtgtgc 3381226  T
Q  259 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3381225 aatatataaaacatattcaaattgtgttcatttg 3381192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27617220 - 27617122
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  27617220 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtattcttttgc 27617122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Original strand, 30424143 - 30424228
Alignment:
Q  335 aactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   | || ||| ||||||||||||| ||||    
T  30424143 aactacattcatttatcaattcctaaactatacatgcaatcatcaaaatgtcaattcatacataaactctaaccacatgcacacta 30424228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3381147 - 3381049
Alignment:
Q  325 cataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||| |||||    
T  3381147 cataggcaacaactatattcattcatcaatgcataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcacttataaaacctaaccacatgcaaattactc 3381049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 419
Target Start/End: Original strand, 29821737 - 29821821
Alignment:
Q  335 aactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 419  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||    
T  29821737 aactacattcatttctaaattcataaattacacatacatttatcaaaatgtcaattcctagatcaaccctaaccacatacaaact 29821821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7912688 - 7912647
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgatt 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7912688 aaaaataaatctaaacaaactaacattatgattacaatgatt 7912647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7912739 - 7912702
Alignment:
Q  385 tcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactact 422  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7912739 tcaatttcaacatcaaccctaaccacatgcaaactact 7912702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 21600854 - 21600826
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattat 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21600854 aaaaataaacctaaacaaactaacattat 21600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Original strand, 35258249 - 35258809
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35258249 tataatcatcattacaataaattttatgtccatcatttcca--acctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaatcat 35258346  T
Q  101 ttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35258347 ttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttctataacctaa 35258446  T
Q  201 actaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  35258447 actaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccatt 35258546  T
Q  301 caaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatca 399  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258547 caaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactaaattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatca 35258646  T
Q  400 accctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgta 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  35258647 accctaaccacatgcaaactactctaa----ttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattattattaaaatgattgatacaact--tacttgtg 35258740  T
Q  500 ataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  35258741 ataatgtgcagttgatatgcttgcaattcatgaaaatagctttggtgaagattggaaagaatttgagaa 35258809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 51321415 - 51320851
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51321415 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacgcttaatcatttttatacacttaat 51321316  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51321315 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaa-tcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 51321217  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51321216 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaatataaaacatattcaaattgtgttcatttgccact 51321117  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321116 attcaaagtcacattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 51321017  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgat--tgatacaacttatac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||  |||    
T  51321016 tcaaccctaaccacatgcaaactactcta-----tttttttttaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattattattcaact--tac 51320924  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgaga 567  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  51320923 ttgtgataatgtgcagttgatttgcttccaattcgtgaaaatggttttggtgaagattggaaagaatttgaga 51320851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 45825579 - 45825023
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45825579 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttttatacatttaat 45825480  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45825479 catttgtgtccatcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 45825380  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc-aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  45825379 taaattaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 45825280  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825279 cattcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 45825180  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45825179 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa----ttttttttaaaaat----------aaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tact 45825096  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    ||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45825095 tgtgataatatgcgattgatttgctggcaattcgtgaaaatgattttggtgaagattggagagaaattgagaa 45825023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Original strand, 23275493 - 23276045
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  23275493 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatca---------------- 23275576  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  23275577 --tttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata-ttaacatcatttctatcatttccataact 23275673  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg-cagt 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23275674 taaactgactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgtcacc 23275773  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23275774 cattcaaagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatttaaaa 23275873  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-nnnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23275874 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaattttttttttttttaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tac 23275971  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23275972 ttgtgataacgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattggaaagaatttgagaa 23276045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 52802834 - 52802264
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  52802834 tataatcatcattacaataaaatttatgtcaatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacacacacttaatcatttctatacaactaaa 52802735  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  52802734 tcatttgtgtctatcataattctcttaacctaaactaacaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccatagc 52802635  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||       
T  52802634 ctaaactaactaaacaatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaagatattcaaattgtgttattttgccac 52802535  T
Q  297 cattc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802534 cattcaaaatcacattatgacttaaacaacataagcaacaactacattcatttatcaattcttaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 52802435  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  52802434 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa--tttttttaaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tact 52802339  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  52802338 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaataactttggtgacgattg--gagaaattgagaatttt 52802264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 31783098 - 31783657
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  31783098 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 31783197  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  31783198 tcatttgtgtcaatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataat 31783297  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31783298 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 31783397  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31783398 cattcaaagccacattatgatttaaagaacataggcaacaactacatttatttatcaattcctaaactacacatacaatcatcaaattgtcaattttaaa 31783497  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-nnnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||             ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||                 
T  31783498 atcaaccctaaccacatacaaactactctaattttttttttataaaaaataaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattg------------- 31783584  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
         | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31783585 -----acaatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattgaagagaaattgagaatttt 31783657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 19526914 - 19527405
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526914 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattattttacatacacttaatcatttctatacacttaat 19527013  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19527014 catttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataactaacatcatttctatcattttcataacc 19527113  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  19527114 taaattaactacataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaaacataaaacatattcaaattgtgtccatttgccacc 19527213  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527214 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaaatacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 19527313  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactta 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||             ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19527314 tcaaccataaccacatgcaaactactctaatttttttttt---aaaatcaacttaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaactta 19527405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 47502987 - 47502447
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  47502987 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaacatacacttaatca---------------- 47502904  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
      ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||    
T  47502903 --tttgtctccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctat---------aacc 47502815  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  47502814 t---ctaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttaccaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 47502718  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502717 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaattacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 47502618  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47502617 tcaactctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 47502523  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47502522 gtgataatgtgcagttgatttgtttgcaattcgtaaaaatgattttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 47502447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 30890638 - 30890194
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30890638 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 30890540  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  30890539 attgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataatttaa 30890440  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  30890439 actacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 30890340  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30890339 ctcaa----tttttttaaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 30890246  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30890245 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaatttgagaatttt 30890194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19925319 - 19925018
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19925319 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 19925221  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19925220 attgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataatttaa 19925121  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  19925120 actacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 19925021  T
Q  421 ctc 423  Q
    |||    
T  19925020 ctc 19925018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 142 - 423
Target Start/End: Original strand, 49857461 - 49857740
Alignment:
Q  142 atcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttga 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  49857461 atcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattt---ttgaggcatttga 49857557  T
Q  242 tcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  49857558 tcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattctcatttaaacaacataggcaacaactac 49857657  T
Q  341 attcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||     || || ||||||||||||||||||||||    
T  49857658 attcatttatcaaaacataaactacacatgcaatgataaaattatcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaactactc 49857740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 307 - 572
Target Start/End: Original strand, 29622105 - 29622365
Alignment:
Q  307 acattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaa 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29622105 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaa 29622204  T
Q  407 ccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgt 506  Q
    |||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  29622205 ccacatacaaactactctaatttttttaa---aaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgt 29622299  T
Q  507 gcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622300 gcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 29622365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 332 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11183548 - 11183309
Alignment:
Q  332 aacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnn 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  11183548 aacaactacattaatttatcaattcataaactacacatgtaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaactctaaccacatgcaaactactctaattttt 11183449  T
Q  432 nnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtg 531  Q
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11183448 cttttttttaaataaacctaaacaaactaacataatcattaaaataattgatacaactta--cttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtg 11183351  T
Q  532 aaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttt 573  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11183350 aaaattgctttggtgaagattggaaagaatttgagaagtttt 11183309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 22524650 - 22524259
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  22524650 atcatatccatgatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacat--tcaaatta 22524553  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattatg----------atttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    |||| |||||    ||||| ||||||||||||           ||| || |||||    ||||||||||||| || ||| |  |||| | | ||||||||    
T  22524552 tgtttatttggctccattccaaaccacattatacttaaaaatcattcaaacaacaattataacaactacattaatctataacatcatta-caacacatgc 22524454  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcatt 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22524453 aatcatcaaattatcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaaccactctaattttttta----aaaaatcaacctaaacaaattaacattatcatt 22524358  T
Q  472 aaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22524357 aaaatgattgacacaactta--cttgtgataatttgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatcgatttggtgaagattggagagaatttgagaattt 22524260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19526727 - 19526886
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526727 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttctatacacttaat 19526826  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 157  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526827 catttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaa 19526886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19525405 - 19525564
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19525405 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttatatacacttaat 19525504  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 157  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525505 catttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaa 19525564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19526540 - 19526699
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19526540 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttatatacacttaat 19526639  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 157  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526640 catttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaa 19526699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19524557 - 19524716
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19524557 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttatatacacttaat 19524656  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 157  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524657 catttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaa 19524716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19524744 - 19524903
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19524744 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttatatacacttaat 19524843  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaa 157  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524844 catttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaa 19524903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 335 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11196244 - 11196153
Alignment:
Q  335 aactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa 426  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196244 aactacattaatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaaatgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa 11196153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 479
Target Start/End: Original strand, 2424924 - 2425224
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2424924 atcatatccataacctaaactaaataaataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacat--tcaaattg 2425021  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattatg----------atttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgc 371  Q
    |||| |||||    ||||| ||||||||||||           ||| || |||||     ||||||||||||||| ||| |  ||||||   ||||||||    
T  2425022 tgtttatttggctccattccaaaccacattatacttaaaaatcattcaaacaacaattacaacaactacattcatctataacatcataata-acacatgc 2425120  T
Q  372 aatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcatt 471  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  2425121 aatcatcaaattatcaattttaaaatcaactctaaccacatacaaactactctaattttttta----aaaaatcaacctaaacaaattaacattatgatt 2425216  T
Q  472 aaaatgat 479  Q
    ||||||||    
T  2425217 aaaatgat 2425224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 50343525 - 50343635
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50343525 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50343624  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  50343625 tgttcttttgc 50343635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11196383 - 11196268
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11196383 tataatcatcattacaataaaatttatgtccattagttccataataacctaaacatcattcaataattaatatacacttaaacatttctatacacttaat 11196284  T
Q  98 tatttgtgtccatcat 113  Q
     |||||||||||||||    
T  11196283 catttgtgtccatcat 11196268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21141544 - 21141413
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  21141544 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 21141445  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  21141444 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 21141413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19925000 - 19924889
Alignment:
Q  459 taacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagag 558  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19925000 taacattaacattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgcgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagag 19924903  T
Q  559 aaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||    
T  19924902 aaattgagaatttt 19924889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 417
Target Start/End: Original strand, 17514267 - 17514497
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    |    
T  17514267 taaattaactaaataatcaatataatttttatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagaatcaaacatattcaaattgtgttcatttggcacc 17514366  T
Q  298 attc-aaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtc 386  Q
    |||| ||||||||||          || |||||| || ||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  17514367 attcaaaaccacattatacttatacatcatttaaacatcaattacaacaactatattcatttatcaattcataaactacacacgtaatcttcaaaatgtc 17514466  T
Q  387 aattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaa 417  Q
    ||||     || |||||||||||||||||||    
T  17514467 aattcatttataaaccctaaccacatgcaaa 17514497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19524931 - 19525039
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524931 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttctatacacttaat 19525030  T
Q  98 tatttgtgt 106  Q
     ||| ||||    
T  19525031 cattggtgt 19525039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19525592 - 19525700
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525592 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttctatacacttaat 19525691  T
Q  98 tatttgtgt 106  Q
     ||| ||||    
T  19525692 cattggtgt 19525700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19526066 - 19526174
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526066 tataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttctatacacttaat 19526165  T
Q  98 tatttgtgt 106  Q
     ||| ||||    
T  19526166 cattggtgt 19526174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47656386 - 47656277
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  47656386 atcatatccataacc-aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 47656288  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  47656287 tgttcttttgc 47656277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Original strand, 38127045 - 38127141
Alignment:
Q  190 ccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  38127045 ccataacctaaactaactaagtaatcaataaaattttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgtt 38127141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 97504 - 97635
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  97504 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattatcattgaggcattttctcaaacactttgtgtacaaagtatcaaacatactcaaaatg 97603  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    || || |||||   ||||| ||||||||||||    
T  97604 tgatcttttgccaccattcaaaaccacattat 97635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2365741 - 2365622
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  2365741 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 2365642  T
Q  295 gtcattc-aaaccacattat 313  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  2365641 accattcaaaaccacattat 2365622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19156520 - 19156401
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  19156520 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 19156421  T
Q  295 gtcattc-aaaccacattat 313  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  19156420 accattcaaaaccacattat 19156401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 49857368 - 49857454
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccat---aacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcattt 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857368 tataatcatcattgcaataaaatttatgtccaccatttccatcataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcattt 49857454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 3731949 - 3732040
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  3731949 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 3732040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 13639591 - 13639682
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  13639591 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 13639682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26876162 - 26876071
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  26876162 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 26876071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 572
Target Start/End: Original strand, 2425528 - 2425627
Alignment:
Q  471 taaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatt 570  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  2425528 taaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgcgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatt 2425625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 2424579 - 2424641
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcc---ataacctaaacatcattcaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2424579 tataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaa 2424641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8474259 - 8474199
Alignment:
Q  226 tcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  8474259 tcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 8474199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25147657 - 25147571
Alignment:
Q  334 caactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25147657 caactacattcatctataacatcataaactacacatgcaatcatcaaagt-tcaattcctacatcaacactaaccagatgcaaactac 25147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 421
Target Start/End: Original strand, 38127223 - 38127278
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38127223 acatgcaatcatcaaattttcaattccaacatcaaccctaaccacgtgcaaactac 38127278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25167050 - 25166976
Alignment:
Q  199 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacata 273  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25167050 aaactaacaaaaaaatcaatgtaatcctcatttaggaattttatcaaacactttgagtgcaaagtatgaaacata 25166976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22524933 - 22524871
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcc---ataacctaaacatcattcaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  22524933 tataatcatcattacaataaaatttatatccaccatttccataataacctaaacattattcaa 22524871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 475
Target Start/End: Original strand, 23935782 - 23935818
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaa 475  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23935782 aaaaataaacctacaaaaactaacattatcattaaaa 23935818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 475
Target Start/End: Original strand, 38127297 - 38127333
Alignment:
Q  439 aaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaa 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38127297 aaaaaaaaacctaaacaaactaacattatgattaaaa 38127333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 36978299 - 36977733
Alignment:
Q  2 ataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  36978299 ataatcatcattacaataaaaattatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaatatacacttaatcatttctatacacttaatc 36978200  T
Q  99 atttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacct 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36978199 atctgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacct 36978100  T
Q  199 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||    
T  36978099 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttaccacca 36978000  T
Q  299 ttcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 397  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977999 ttcaaagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 36977900  T
Q  398 caaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36977899 caaccctaaccacatgcaaactactc-agattttttttaaaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tacttg 36977803  T
Q  498 taataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgaga 567  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  36977802 tgataatgtacagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgaga 36977733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 27452990 - 27453560
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27452990 tataatcatcattaaaataaaatttatgttcatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 27453089  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27453090 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 27453189  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  27453190 taaactgactaaataatcaataaaattgtcaatgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 27453289  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27453290 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaa 27453389  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27453390 tcaactctaaccacatgcaaactactctaatttttttttt---aaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tactt 27453484  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27453485 gtgataatgtgcaattgatttgcttgcaatttgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 27453560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 47777036 - 47776465
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47777036 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 47776937  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47776936 catttgtgttcatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccagactataattaacatcatttctatcatttccataacc 47776837  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  47776836 taaactaactaaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgtcacc 47776737  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776736 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 47776637  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  47776636 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa--tttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacacct--tactt 47776541  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  47776540 gtgataatgtgcagttgatttgcttgcaatttgtgaaaatgactttggtgaagattggagagaaatggtgaatttt 47776465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Original strand, 9494167 - 9494781
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494167 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 9494266  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9494267 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatca-ttccataacc 9494365  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  9494366 taaactaactaaataatcaatataattttcattgacgcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 9494465  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9494466 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaattacacatgcaaccatcaaattttcaattttaaaa 9494565  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactcta--------annnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaac 488  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||        |            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494566 tcaacccaaaccacatgcaaactactctaatttttttattttatttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaac 9494665  T
Q  489 ttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaa 588  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||   ||| || |||||| |||    
T  9494666 t--tacttgtgataatgtgcagttgatttgcttggaattcgtgaaaatggctttggtgaagattgaaaagaatttgagaa--gtttggagaagttttgaa 9494761  T
Q  589 actaacatgtttgtgtttct 608  Q
    ||| | |||||| |||||||    
T  9494762 actgatatgtttctgtttct 9494781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 37341006 - 37340440
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37341006 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctacacacttaat 37340907  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37340906 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaacaaattaatatactcttaaccaaactataattaacagcatttctatcatttccataacc 37340807  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  37340806 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 37340707  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37340706 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaagtacattcatttttcaattcataaactacacatgaaatcatcaaattgtcaattttaaaa 37340607  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||            |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  37340606 tcaatcctaaccacatccaaactactataa---tttttttaaaaaaataaacctaaacaaactaacattattgttaaaatgattgatacaact--tactt 37340512  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  37340511 gtgataatgtgctgttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgagaa 37340440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 550
Target Start/End: Original strand, 47672466 - 47673004
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47672466 tataatcatcattacaataaaatttatgttcatcatttcca-------aacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatatacttaatcat 47672558  T
Q  101 ttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47672559 ttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactagaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaa 47672658  T
Q  201 actaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  47672659 actaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccatt 47672758  T
Q  301 caaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatca 399  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672759 caaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcatagattatacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatca 47672858  T
Q  400 accctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  47672859 accctaaccacatgcaaactactataa---tttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tacttgtg 47672953  T
Q  500 ataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaaga 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47672954 ataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatagctttgatgaaga 47673004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 17835779 - 17835209
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17835779 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaatattattcaataaataacatacacttaatcatttctatacaactaaa 17835680  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17835679 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataac 17835580  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  17835579 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 17835480  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835479 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 17835380  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||            |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  17835379 atcaaccttaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattga-acaact--tact 17835286  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835285 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 17835209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34739068 - 34738496
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739068 tataatcaatattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcattatttaacatacacttaatcatttctatacacttaat 34738969  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34738968 catttgtgtccatcataattctcgtaacttacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 34738869  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  34738868 taaactaactacataatcaataaaattgtcatcgagacattttatcaaacactttgtgagcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 34738769  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738768 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 34738669  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  34738668 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa-tttttttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaact--tactt 34738572  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34738571 gtgataatgtgcagatgatttgcttgcaattcgtgaaaatagatttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 34738496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 39461141 - 39460660
Alignment:
Q  87 atacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatca 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39461141 atacacttaatcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaacatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctacca 39461042  T
Q  187 tttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461041 tatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 39460942  T
Q  287 catttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgt 385  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460941 catttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaaaataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgt 39460842  T
Q  386 caattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatac 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460841 caattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---ttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatac 39460745  T
Q  486 aacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39460744 aact--tacttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaacattagagagaaattgagaatttt 39460660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 131 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 10517549 - 10517128
Alignment:
Q  131 ctaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10517549 ctaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcatt 10517450  T
Q  231 gaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacatag 329  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10517449 gagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatag 10517350  T
Q  330 gtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannn 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  10517349 gcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaa--- 10517253  T
Q  430 nnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcg 529  Q
             |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517252 -tttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatgattaaaatgattgacacagct--tacttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcg 10517156  T
Q  530 tgaaaatggctttgatgaagattggaga 557  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||    
T  10517155 tgaaagaagatttggtgaagattggaga 10517128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 14689436 - 14689822
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14689436 tataatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 14689535  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||| |       |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  14689536 catttgtgtccatta-------cataacataaactaactaaataatcaatatacacttaaccaaacaataattaacatcatttttatcatttccataaca 14689628  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||        
T  14689629 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataaaagatattcaaattgtgtttatttgccact 14689728  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 390  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14689729 attcaaagctacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaataaataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaatt 14689822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 15073724 - 15074168
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15073724 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 15073822  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  15073823 attgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaa 15073922  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  15073923 actacataggcaacaactacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 15074022  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15074023 ctcaa----tttttttaaaaaacttaacataaacaaattaatattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 15074116  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15074117 tacaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 15074168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 42507523 - 42507967
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  42507523 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 42507621  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  42507622 attgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaa 42507721  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||     || || |||||||||||||||||||    
T  42507722 actacataggcaacaactacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgttaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 42507821  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
     || |             |||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42507822 gtcaa----tttttttaaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgtttgacacaagt--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 42507915  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507916 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 42507967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 573
Target Start/End: Original strand, 17741019 - 17741400
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |    
T  17741019 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggaattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatatggcacc 17741118  T
Q  298 attc-aaaccacattatgatttaaccaaca--taggt---------aacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgt 385  Q
    |||| |||||||||||| | |||| || ||  ||  |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17741119 attcaaaaccacattat-acttaaacatcatttaaatatcaattacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcttcaaaatgt 17741217  T
Q  386 caattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatac 485  Q
    |||||     || ||||||||||||||||||||||||| ||              |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | || |    
T  17741218 caattcattcataaaccctaaccacatgcaaactactcaaaaaaataaatt----aaatgaacctaaacaaactaacattaagattacaatgactaatgc 17741313  T
Q  486 aacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg-agaattttt 573  Q
     |||  ||||| | ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  17741314 tact--tacttttgataatgtggggatgattggcttgtaattcgtgaaaatggctttggtgagaattagagagaagttgaagaattttt 17741400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 279
Target Start/End: Original strand, 5541096 - 5541192
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaa 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5541096 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaa 5541192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 313
Target Start/End: Original strand, 556205 - 556333
Alignment:
Q  186 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 285  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||    
T  556205 attttcataacataaactaactaaataataaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtatgcaaagtatcaaacatactcaaaatatgt 556304  T
Q  286 tcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  556305 tcatttgccaccattcaaaaccacattat 556333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16675303 - 16675193
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16675303 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16675204  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    | ||| |||||    
T  16675203 tattcttttgc 16675193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17649671 - 17649561
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  17649671 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 17649572  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    | ||| |||||    
T  17649571 tattcttttgc 17649561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 35609984 - 35610075
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  35609984 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 35610075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41880995 - 41880904
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41880995 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 41880904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45257492 - 45257401
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  45257492 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 45257401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48403862 - 48403771
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  48403862 acctaaactaactaaataatcaataaaattatcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 48403771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 46740103 - 46740213
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  46740103 atcatatccatgacctaaactaattaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaatcactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 46740202  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  46740203 tgttcttttgc 46740213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 9370958 - 9371028
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9370958 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtat 9371028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 39461169 - 39461126
Alignment:
Q  41 ataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcattt 84  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461169 ataacctaaatatcattcaataattaacatacacttaatcattt 39461126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 10517597 - 10517554
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa 44  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10517597 tataatcatcatttcaataaaatttatgtccatcatttccataa 10517554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 286
Target Start/End: Original strand, 17465329 - 17465380
Alignment:
Q  235 catttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  17465329 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 17465380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17587885 - 17587834
Alignment:
Q  235 catttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  17587885 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 17587834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41734496 - 41734441
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41734496 acatgcaatcatcaaattttcaattccaacatcaaccctaaccacgtgcaaactac 41734441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15070669 - 15070607
Alignment:
Q  510 gttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15070669 gttgatttgctcgcaattcgtgaaagaagatttggcgaagatttgagagaaattgagaatttt 15070607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Original strand, 556462 - 556551
Alignment:
Q  446 aacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || | |||  ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  556462 aacctaaacaaactaacattaacattacattgattaatgctact--tacctgtgataatgtggagatga-ttgcttgcaaatcgtgaaaatgg 556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 17462862 - 17462899
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17462862 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17462899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17590352 - 17590315
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17590352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17590315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 42537851 - 42537202
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42537851 tatattcatcattacaataagatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttatatacacttaat 42537752  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42537751 catttgtgttcatcataattctcgtaaccttaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 42537652  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  42537651 taaactaactaaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccacc 42537552  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537551 attcaaagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 42537452  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa---nnnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttata 493  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  42537451 ttaaccctaacaacatgcaaactactctaatttttattttttttttaaaataaacctaaacaaaccaacattatcattaaaatgattgatacaact--tg 42537354  T
Q  494 cttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaa 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42537353 cttgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgt-agaatggctttggtgcagattggaaagaaattgagaattttttagagaagtttagaaactaa 42537255  T
Q  594 catgtttgtgtt------tctgtttatgttcagcacatctcggtagttaactg 640  Q
     |||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  42537254 tatgtttgtgtttctgcctctgtttatgttcagcacgcctcggcagttaactg 42537202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 38968800 - 38968231
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968800 tataatcttcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 38968701  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38968700 catttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccaaaaaaacaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 38968601  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  38968600 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 38968501  T
Q  298 attc--aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    ||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968500 attcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 38968401  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38968400 ataaaccctaaccacatgcaaactactctaa-tttttttttttaaaaagaaaccttaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tact 38968304  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaa 568  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  38968303 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgactttggtgaagattggaaagaatttgagaa 38968231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7758027 - 7757456
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataac---ctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7758027 tataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataatctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 7757928  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7757927 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataatttctatcatttctatcatttccataac 7757828  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  7757827 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatgttcaaattgtgttcatttgccac 7757728  T
Q  297 cattc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757727 cattcaaaaccacattataatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 7757628  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  7757627 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 7757533  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757532 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatagatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 7757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 8579876 - 8580445
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8579876 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 8579975  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8579976 tcatttgtgtccatcgtaattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 8580075  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  8580076 -taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 8580174  T
Q  297 cattcaaacc-acattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8580175 cattcaaagctacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaa 8580274  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  8580275 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 8580369  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8580370 tgtgataatgtgcacttggtttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaattt 8580445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 568
Target Start/End: Original strand, 512214 - 512709
Alignment:
Q  69 atacacttaatcatttctatacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  512214 atacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtatccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaactaaactataa 512313  T
Q  169 ttaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaa 268  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  512314 ttaacatcatttctataattttcataacctaaactaactaaataagcaatataattttcattgaggtatttgatcaaacactttgggtgcaaagtataaa 512413  T
Q  269 acatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512414 acatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactacac 512513  T
Q  368 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattat 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  512514 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactcta---ttttttttttaaaaataaacctaaacaaactaacattat 512610  T
Q  468 cattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgaga 567  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  512611 cattaaaatgattgatacaact--tacttgtgataatgtacagttgatttgcttgcaattcatgaaaatggctttggtgaagattggaaagaatttgaga 512708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 527
Target Start/End: Original strand, 42941858 - 42942383
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttcca---taacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42941858 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccacaataatctaaacatccttcaataattaacatacaattaatcatttctatacacttaat 42941957  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42941958 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccagactataattaacatcatttctatcatttccataacc 42942057  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        
T  42942058 taaactaactaaa-aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccaca 42942156  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942157 attcaaagccatattatgatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 42942256  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  42942257 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaa--tttttttttaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatgcaact--tactt 42942352  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaatt 527  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42942353 gtgataatgtgcggttgatttgcttgcaatt 42942383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28877345 - 28876775
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28877345 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 28877246  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28877245 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 28877146  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28877145 c-aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 28877047  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28877046 cattcaaacccacattatgatttaaacaatataggcaacaactacatttaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaa 28876947  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  28876946 ttcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 28876852  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28876851 tgtgataatggccacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggggaagattggagagaaattgagaatttt 28876775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 640
Target Start/End: Original strand, 19228144 - 19228685
Alignment:
Q  99 atttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19228144 atttgtgtctatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttttatcattttcataacct 19228243  T
Q  199 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  19228244 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgccacca 19228343  T
Q  299 ttcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 397  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228344 ttcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaat 19228443  T
Q  398 caaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttg 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19228444 caaccctaaccacatgcaaactactata---tttttttaaaaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaact--tacttg 19228538  T
Q  498 taataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaaaagtttagaaactaacatg 597  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||   ||| || ||||||||||||| | |||    
T  19228539 tgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgattttggtgaagattggaaagaatttgagaa--gtttggagaagtttagaaactgatatg 19228636  T
Q  598 tttgtgt------ttctgtttatgttcagcacatctcggtagttaactg 640  Q
    ||| |||      || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19228637 tttatgtttatgcttttgtttatgttcagcacggctcggcagttaactg 19228685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 8701595 - 8702021
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701595 tataatcattattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 8701694  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8701695 catttgtgtccatcataattttcataacctaaactaactaaacaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 8701794  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  8701795 taaacaaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 8701894  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  8701895 attcaaagccacattatgatttaaacaacatatgcaactactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattcattta 8701994  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    | || ||||||||||||||||||||||    
T  8701995 taaaacctaaccacatgcaaactactc 8702021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17659024 - 17658598
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataac---ctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17659024 tataatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataatctaaatatcattcaataattaacatacacttaatcatttttatacatttaat 17658925  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17658924 catttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 17658825  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  17658824 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 17658725  T
Q  298 attc-aaaccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||     |    
T  17658724 attcaaaaccacattatgatttaaacaacataggccacaactacattcatttatcaataaataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcattta 17658625  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17658624 tcaaacctaaccacatacaaactactc 17658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 572
Target Start/End: Original strand, 28241295 - 28241739
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28241295 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 28241393  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||    
T  28241394 attgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattataatttaa 28241493  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||    
T  28241494 actacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaacta 28241593  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgct 520  Q
    ||| |             |||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28241594 ctcaa----ttttttttaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattggtacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgct 28241687  T
Q  521 tgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28241688 tgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaatttgagaatttt 28241739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 198 - 572
Target Start/End: Original strand, 14260 - 14630
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14260 taaactaactaaataatcaataaaattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 14359  T
Q  298 attcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14360 attcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatttatttatcaattcctaaactacgcatgcaatcatcaaattttcaattttgaaa 14459  T
Q  397 tcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatactt 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  14460 tcaaccctaaccacatacaaactactctaa---ttttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tactt 14554  T
Q  497 gtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14555 gtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttgttgaagattggagagaaattgagaatttt 14630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 423
Target Start/End: Original strand, 40624473 - 40624720
Alignment:
Q  186 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624473 attttcataatctaaactaactaaataatcaataaaattgttattaaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 40624572  T
Q  286 tcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaac----------caacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaat 374  Q
    |||||||    |||||||| ||||||||| ||| |||          || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40624573 tcatttgtcaccattcaaaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaattcataaaatacacatgcaat 40624672  T
Q  375 catcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40624673 catcaaattgtcaattttaaaattaaccctaa-cacatgcaaactactc 40624720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 186 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20422463 - 20422215
Alignment:
Q  186 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20422463 atttccataacctaaactaactaaataatcaaaataattgtcattggggcattttatcaaacactttgtgtgaaaagtatcaaacatattcaaaatgtgt 20422364  T
Q  286 tcattt-gcagtcattcaaaccacatt----------atgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaat 374  Q
    |||||| |||    || |||| |||||          || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20422363 tcatttggcaccatttaaaactacattatactagaacatcatttaaataacatagacaacaactacattcatttatcaattcatacactacacatccaat 20422264  T
Q  375 catcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20422263 catcaaattgtcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaactactc 20422215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5197490 - 5197359
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  5197490 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 5197391  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  5197390 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 5197359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 306
Target Start/End: Original strand, 19040685 - 19040796
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19040685 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 19040784  T
Q  295 gtcattcaaacc 306  Q
      ||||||||||    
T  19040785 accattcaaacc 19040796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 14166 - 14259
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14166 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca 14259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 313
Target Start/End: Original strand, 27673224 - 27673340
Alignment:
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||   |    
T  27673224 taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgccacc 27673323  T
Q  298 attc-aaaccacattat 313  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27673324 attcaaaaccacattat 27673340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30705641 - 30705543
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  30705641 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactaaaaatgtgttcttttgc 30705543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 40624406 - 40624470
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttc---cataacctaaacatcattcaata 62  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  40624406 tataatcatcatttcaatataatttatgtgcatcatttctatcataacctaaacatcattcaata 40624470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 572
Target Start/End: Original strand, 30708778 - 30708846
Alignment:
Q  504 tgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||   | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30708778 tgtgccgttgatttgcctccaattcgtgaaagaagatttggcgaagattggagagaaattgagaatttt 30708846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 572
Target Start/End: Original strand, 28880202 - 28880264
Alignment:
Q  510 gttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28880202 gttgatttgcatgcaattcgtgaaataagatttggcgaagattggagaaaaattgagaatttt 28880264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28469343 - 28468773
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28469343 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 28469244  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28469243 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 28469144  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28469143 -taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 28469045  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469044 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaattacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 28468945  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  28468944 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattcaaatgattgacacaact--tact 28468850  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468849 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 28468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 39948303 - 39947746
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39948303 tataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 39948204  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39948203 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataac 39948104  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  39948103 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcttttgccac 39948004  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39948003 cattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcgaattgtcaattttaaa 39947904  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39947903 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa--tttttttaaaaaaaatcaacctaaacatattaacattatgattaaaatgattgacacaact--tact 39947808  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggaga 557  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||    
T  39947807 tgtgataatgtgccgttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggtgaagattggaga 39947746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 45429293 - 45428730
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45429293 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 45429194  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45429193 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataa- 45429095  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  45429094 ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 45428995  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45428994 cattcaaagccacattatgatttaaactacgtaggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcattttttaa 45428895  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  45428894 atcaaccctaaccacatacaaactactctaa--ttttttttttaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tact 45428799  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg 564  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  45428798 tgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggagaagatttgagagaaattg 45428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 538
Target Start/End: Original strand, 32955729 - 32956262
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32955729 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 32955828  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32955829 tcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacactta-ccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac 32955927  T
Q  197 ctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagt 296  Q
    |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  32955928 ctaaactaactaaataatcaa----attgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccac 32956023  T
Q  297 cattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 395  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32956024 cattcaaagccacattataatttaaacaacataggcaacaagtacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 32956123  T
Q  396 atcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatact 495  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  32956124 atcaacccaaaccacatacaaactactctaa--ttttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattggcacaact--tact 32956219  T
Q  496 tgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatgg 538  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32956220 tgtgataatgtgcagttgatttgcttgctatttgtgaaaatgg 32956262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 152 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21998737 - 21998323
Alignment:
Q  152 acttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21998737 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 21998639  T
Q  252 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  21998638 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacatagacaacaaataaattcaattat 21998539  T
Q  351 caattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacct 450  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||    
T  21998538 caattactaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacct 21998442  T
Q  451 aaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaaga 550  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21998441 aaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtacaattgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaaga 21998344  T
Q  551 ttggagagaaattgagaattt 571  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21998343 ttggagagaaattgagaattt 21998323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 212 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25965308 - 25964938
Alignment:
Q  212 aatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacat 310  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  25965308 aatcaataaaattatcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaacattcaaagccacat 25965209  T
Q  311 tatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccac 410  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25965208 tatgatttaaacaacataggaaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccac 25965109  T
Q  411 atgcaaactactcta-----annnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatg 505  Q
    |||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25965108 atgcaaactactctattttttttattttttttttaaaataaacctaaacaaactaacattatgattaaaatgattgatacaact--tacttgtgataatg 25965011  T
Q  506 tgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattttttagaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25965010 tgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgagaattttttagaa 25964938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17421144 - 17420757
Alignment:
Q  122 taacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17421144 taacctaaactaactaaaaaatcaaaataaacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaa 17421046  T
Q  222 attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaacc-acattatgatttaa 320  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  17421045 attgtcattgagacattttatcaaacacttgatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaacccacattatgatttaa 17420946  T
Q  321 ccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17420945 acaacataggcaacaactacattcaatgatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 17420846  T
Q  421 ctctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttga 514  Q
    ||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  17420845 ctctaa---tttttctaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttga 17420757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 45136674 - 45136956
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacacttaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45136674 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttatatacacttaat 45136773  T
Q  98 tatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacc 197  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45136774 catttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacc 45136873  T
Q  198 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 291  Q
    |||||||           |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45136874 taaacta-----------aataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaatatatttaaattgtgttcattt 45136956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 248 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7185481 - 7185160
Alignment:
Q  248 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7185481 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcat 7185382  T
Q  347 ttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataa 446  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||| |    
T  7185381 ttatcaattcctaaacaacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaactactcta--tttttttttttaaaaatca 7185284  T
Q  447 acctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatg 546  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7185283 acctaaacaaatcaacattaacattaaaattattgacacaact--tacttgtgataatgcgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtg 7185186  T
Q  547 aagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7185185 aagattggagagaaattgagaatttt 7185160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 305 - 572
Target Start/End: Original strand, 45137111 - 45137373
Alignment:
Q  305 ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccct 404  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45137111 ccacattatgatttaaataacataggcaagaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacctt 45137210  T
Q  405 aaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  45137211 aaccacatgcaaactactctaattttttttt---aaaaataaacctaaacaaactaacactatcattaaaatgattgatacaactta--cttgtgataat 45137305  T
Q  505 gtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45137306 gtgcagttgatttgcttgcaatttgtgaaaatggctttggtgaagattggagagaaattgtgaatttt 45137373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22687081 - 22686863
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22687081 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataatcaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 22686982  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataac 196  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  22686981 taatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctaccatttccataa- 22686883  T
Q  197 ctaaactaactaaataatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22686882 ctaaactaactaaataatca 22686863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 25515366 - 25515463
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25515366 atcatttccataacctaaactaactcaataatcaatataattctcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaat 25515463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 29401160 - 29401291
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  29401160 atcatatccataagctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 29401259  T
Q  283 tgttcatttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    ||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  29401260 tgttcttttgccaccattcaaaaccacattat 29401291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 450 - 572
Target Start/End: Original strand, 42505582 - 42505702
Alignment:
Q  450 taaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaag 549  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42505582 taaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaag 42505679  T
Q  550 attggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  42505680 attggagagaatttgaaaatttt 42505702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 36655906 - 36656016
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36655906 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaatgttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36656005  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  36656006 tgttcttttgc 36656016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 10828581 - 10828691
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10828581 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtccaaagtatcaaacatactcaaaatg 10828680  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
     |||| |||||    
T  10828681 cgttcttttgc 10828691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45284683 - 45284558
Alignment:
Q  189 tccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45284683 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45284584  T
Q  289 tttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||    
T  45284583 tttgccaccattcaaaaccacattat 45284558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45292046 - 45291921
Alignment:
Q  189 tccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45292046 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45291947  T
Q  289 tttgcagtcattc-aaaccacattat 313  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||    
T  45291946 tttgccaccattcaaaaccacattat 45291921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20938401 - 20938282
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  20938401 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 20938302  T
Q  295 gtcattc-aaaccacattat 313  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  20938301 accattcaaaaccacattat 20938282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 3940297 - 3940388
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  3940297 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 3940388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5352470 - 5352379
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  5352470 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 5352379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 30496515 - 30496606
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  30496515 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 30496606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43979025 - 43978934
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  43979025 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 43978934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15831633 - 15831542
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15831633 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaagactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 15831542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 43539306 - 43539397
Alignment:
Q  195 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  43539306 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaaaacattgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 43539397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Original strand, 35464313 - 35464398
Alignment:
Q  335 aactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   | || || |||||||||||||||||||    
T  35464313 aactacattcatttataaattcataaactacacatgcaatcatcagaatgtcaattcatacataaatcctaaccacatgcaaacta 35464398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31367396 - 31367308
Alignment:
Q  332 aacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaacta 420  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  31367396 aacaaataaattcatttataaattcataaactatatatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaacta 31367308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 423
Target Start/End: Original strand, 25515549 - 25515606
Alignment:
Q  366 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactc 423  Q
    |||||||||||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25515549 acatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaactactc 25515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 572
Target Start/End: Original strand, 14992 - 15563
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctataca-cttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14992 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 15091  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaa-aatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataa 195  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15092 tcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaaccaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataa 15191  T
Q  196 cctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15192 cctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcca 15291  T
Q  296 tcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 394  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292 ccattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaataactacattcatttatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaa 15391  T
Q  395 aatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatac 494  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||    
T  15392 aatcaaccctaaccacatacaaactactctaa----tttttttaaaaaatcaacctaaacaaattaacattatgattaaaatgattgacacaact--tac 15485  T
Q  495 ttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15486 ttatgataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaagaagatttggtgaagattggagaaaatttgtgaatttt 15563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 193 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7925 - 7551
Alignment:
Q  193 taacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7925 taacctaaactaactaaaaaatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 7826  T
Q  293 cagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattt 391  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825 ccatcattcaaagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattt 7726  T
Q  392 taaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaactta 491  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  7725 tgaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaa---tttttttaaaaaaatcaacctaaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaact-- 7631  T
Q  492 tacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattgagaattt 571  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7630 tacttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggtgaagattggagagaaattgagaattt 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8050 - 7899
Alignment:
Q  1 tataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataa---cctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatac-acttaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8050 tataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctatacaactaaa 7951  T
Q  97 ttatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaata 148  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7950 tcatttgtgtccataataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaata 7899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 564
Target Start/End: Original strand, 233 - 655
Alignment:
Q  131 ctaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcatt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  233 ctaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataac-taaactaactaaataattaataaaattgtcatt 331  T
Q  231 gaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcagtcattcaaa-ccacattatgatttaaccaacatag 329  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  332 gagacattttatcaaacacgttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcaaagccacattatgatttaaactacatag 431  T
Q  330 gtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannn 429  Q
    | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  432 gcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaactactctaa--- 528  T
Q  430 nnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcg 529  Q
             |||||| |||||||||||      |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  529 ttttttaaaaaaaatcaacctaaacaa------attaacattaaaatgattgacacaact--tacttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcg 620  T
Q  530 tgaaaatggctttgatgaagattggagagaaattg 564  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  621 tgaaaatggatttggagaagatttgagagaaattg 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 316 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 8586 - 8349
Alignment:
Q  316 tttaaccaacataggtaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgca 415  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8586 tttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactatacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgca 8487  T
Q  416 aactactctaannnnnnnnnnnnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgat 515  Q
    |||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||    
T  8486 aactactctaa----tttttttaaaaattaaacctaaacaaactaacattatcattaaaataattgatgcaact--tacttgtgataatgtgtggttgat 8393  T
Q  516 ttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgatgaagattggagaga 559  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  8392 ttgcttgcaattcgcgaaaacggctttggtgagaattggagaga 8349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10863 - 10761
Alignment:
Q  191 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10863 cataacctaaactaactaaataatcaatataattgtcattgagacattttttcaaacactttgtgtgtaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 10764  T
Q  291 tgc 293  Q
    |||    
T  10763 tgc 10761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10896 - 10833
Alignment:
Q  87 atacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10896 atacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaataatcaatata 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10886
Alignment:
Q  40 cataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaat 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925 cataatctaaacatcattcaataattaacatacacttaat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 337 - 572
Target Start/End: Original strand, 40746 - 40975
Alignment:
Q  337 ctacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactactctaannnnnnnnnn 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     || || |||||||||||||||||||||| |               
T  40746 ctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaactactcaa----ttttttt 40841  T
Q  437 nnaaaaataaacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaat 536  Q
      |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40842 aaaaaacttaacataaacaaattaacattaacattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaat 40939  T
Q  537 ggctttgatgaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40940 ggatttggtgaagattggagagaaattgagaatttt 40975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 572
Target Start/End: Original strand, 18112 - 18236
Alignment:
Q  446 aacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgat 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18112 aacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggt 18209  T
Q  546 gaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18210 gaagattggagagaaattgtgaatttt 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 54732 - 54608
Alignment:
Q  446 aacctaaacaaactaacattatcattaaaatgattgatacaacttatacttgtaataatgtgcagttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggctttgat 545  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  54732 aacctaaacaaattaacattatcattaaaatgattgacacaactta--cttgtgataatgtgcacttgatttgcttgcaattcgtgaaaatggatttggt 54635  T
Q  546 gaagattggagagaaattgagaatttt 572  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  54634 gaagattggagagaaattgtgaatttt 54608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 18489 - 18599
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  18489 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 18588  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  18589 tgttcttttgc 18599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 4210 - 4320
Alignment:
Q  183 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 282  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  4210 atcattttcataccctaaactaactcaataatcaatataattctcattggggcactttatcaaacactttgtgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 4309  T
Q  283 tgttcatttgc 293  Q
    ||||| |||||    
T  4310 tgttcttttgc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 251183 - 251270
Alignment:
Q  334 caactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaactac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||   |  | ||||||||||| |||||||||||    
T  251183 caactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaattatcaaaatgccaattcatacgtaaaccctaaccatatgcaaactac 251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 246228 - 246180
Alignment:
Q  226 tcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatat 274  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  246228 tcatttaggcattttatcaaacactttgggtgcaaagtataaaacatat 246180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 292
Target Start/End: Original strand, 251048 - 251141
Alignment:
Q  199 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 292  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||  |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  251048 aaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgagcattttgtcaatcactttatgtgtaaaatatcaaacatattcttattgtgttaatttg 251141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University