View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9262_low_14 (Length: 572)

Name: NF9262_low_14
Description: NF9262
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9262_low_14
NF9262_low_14
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (22-556)||(7032075-7032597)
chr3 (34-511)||(40930389-40930866)
chr3 (22-552)||(34332664-34333194)
chr3 (22-552)||(2364038-2364568)
chr3 (22-292)||(7312797-7313067)
chr3 (23-292)||(19920079-19920348)
chr3 (22-292)||(10323420-10323690)
chr3 (151-288)||(29523723-29523860)
chr3 (151-288)||(11203844-11203981)
chr3 (151-288)||(12342204-12342340)
chr3 (151-288)||(33496572-33496709)
chr3 (437-552)||(7312538-7312653)
chr3 (151-288)||(19890703-19890840)
chr3 (40-99)||(963030-963089)
chr3 (40-99)||(3141066-3141125)
chr3 (434-549)||(10323832-10323947)
chr3 (219-288)||(7031063-7031132)
chr3 (41-102)||(48569907-48569968)
chr3 (210-333)||(2755822-2755945)
chr3 (206-288)||(963196-963278)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (32-552)||(235296-235818)
chr7 (22-513)||(17720435-17720926)
chr7 (22-552)||(47876744-47877274)
chr7 (22-551)||(11277101-11277630)
chr7 (22-498)||(37919359-37919835)
chr7 (22-292)||(4937977-4938247)
chr7 (22-510)||(29967778-29968265)
chr7 (150-288)||(18532653-18532791)
chr7 (32-70)||(27854301-27854339)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (108-552)||(18651169-18651613)
chr6 (32-552)||(24767288-24767803)
chr6 (22-381)||(2553569-2553928)
chr6 (22-294)||(21168218-21168490)
chr6 (219-552)||(12733886-12734219)
chr6 (420-552)||(21167986-21168118)
chr6 (151-292)||(21630085-21630226)
chr6 (418-512)||(5734486-5734580)
chr6 (151-288)||(17606312-17606449)
chr6 (210-288)||(17579118-17579196)
chr6 (150-288)||(20883010-20883148)
chr6 (164-288)||(17573646-17573770)
chr6 (40-99)||(13937914-13937973)
chr6 (174-288)||(10577250-10577364)
chr6 (40-90)||(18682401-18682451)
chr6 (29-70)||(33185678-33185719)
chr6 (140-288)||(15958780-15958928)
chr6 (210-288)||(13937725-13937803)
chr6 (56-102)||(14372874-14372920)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (22-513)||(9922401-9922892)
chr8 (22-552)||(13396149-13396679)
chr8 (22-552)||(41665218-41665748)
chr8 (22-558)||(8299558-8300094)
chr8 (22-551)||(32266326-32266853)
chr8 (22-552)||(7924147-7924677)
chr8 (22-552)||(171864-172394)
chr8 (151-303)||(13200133-13200285)
chr8 (164-288)||(20824321-20824445)
chr8 (41-327)||(13879355-13879641)
chr8 (155-288)||(2170367-2170500)
chr8 (151-288)||(17699507-17699644)
chr8 (434-558)||(20496839-20496963)
chr8 (425-551)||(32567517-32567643)
chr8 (151-288)||(37434157-37434294)
chr8 (53-102)||(25090598-25090647)
chr8 (221-288)||(34137011-34137078)
chr8 (241-298)||(2529901-2529958)
chr8 (221-293)||(43270470-43270542)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (22-552)||(42927892-42928422)
chr5 (22-513)||(28535524-28536015)
chr5 (22-513)||(35983640-35984131)
chr5 (22-552)||(30732163-30732693)
chr5 (42-551)||(23238145-23238655)
chr5 (22-313)||(31641512-31641802)
chr5 (22-550)||(12824962-12825490)
chr5 (22-552)||(27117010-27117540)
chr5 (22-292)||(42513741-42514011)
chr5 (210-552)||(19255159-19255502)
chr5 (205-551)||(8227788-8228134)
chr5 (418-513)||(25824811-25824906)
chr5 (151-292)||(27767063-27767204)
chr5 (151-288)||(33385352-33385489)
chr5 (41-327)||(27795469-27795755)
chr5 (151-288)||(25857402-25857539)
chr5 (151-288)||(8300160-8300297)
chr5 (210-288)||(10776789-10776867)
chr5 (434-552)||(42513481-42513599)
chr5 (434-558)||(3418538-3418662)
chr5 (32-99)||(24408142-24408209)
chr5 (151-288)||(18359070-18359207)
chr5 (32-99)||(18089620-18089687)
chr5 (40-99)||(33169872-33169931)
chr5 (437-552)||(12820213-12820328)
chr5 (210-288)||(33169683-33169761)
chr5 (260-292)||(12820036-12820068)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (53-552)||(7403674-7404177)
chr4 (22-552)||(19755023-19755558)
chr4 (22-552)||(19784248-19784783)
chr4 (25-552)||(15739982-15740509)
chr4 (33-552)||(47685755-47686274)
chr4 (22-552)||(23642440-23642970)
chr4 (25-342)||(1828392-1828709)
chr4 (22-292)||(47418825-47419095)
chr4 (142-292)||(13270860-13271010)
chr4 (384-552)||(20788491-20788658)
chr4 (151-288)||(12697838-12697975)
chr4 (151-288)||(45472687-45472824)
chr4 (151-303)||(55725664-55725816)
chr4 (434-552)||(13271152-13271270)
chr4 (150-287)||(8361126-8361263)
chr4 (151-288)||(20002750-20002887)
chr4 (41-298)||(54483027-54483284)
chr4 (436-552)||(159954-160070)
chr4 (53-288)||(2821917-2822152)
chr4 (40-99)||(46145889-46145948)
chr4 (44-87)||(48312321-48312364)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (32-489)||(41206840-41207297)
chr2 (142-552)||(4551930-4552340)
chr2 (210-298)||(12645551-12645639)
chr2 (231-343)||(15917624-15917736)
chr2 (41-288)||(40176693-40176940)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (22-292)||(11908954-11909224)
chr1 (22-558)||(35540804-35541340)
chr1 (22-292)||(6050624-6050894)
chr1 (95-552)||(51052241-51052698)
chr1 (151-288)||(16917787-16917924)
chr1 (418-511)||(6259619-6259712)
chr1 (151-288)||(43388392-43388529)
chr1 (29-96)||(2491429-2491496)
chr1 (452-552)||(26059652-26059752)
chr1 (418-552)||(4842165-4842299)
chr1 (219-288)||(47623123-47623192)
chr1 (447-552)||(13352075-13352180)
chr1 (47-99)||(31779477-31779529)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (22-498)||(3067-3543)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (22-552)||(105692-106222)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (155-516)||(11187-11548)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7032597 - 7032075
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032597 gcgtaggcgtttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 7032498  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            |||||||||||||||||    
T  7032497 tggttattaattctggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagcc------------taatttggagttggttt 7032410  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7032409 ggcacaaacaggttcctctcaaaatttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaattgtggtcttttacc 7032310  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032309 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaggttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 7032210  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7032209 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatctt 7032110  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttctgtg 556  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032109 tttttcacttgatttggttactttgtgtttctgtg 7032075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 511
Target Start/End: Original strand, 40930389 - 40930866
Alignment:
Q  34 gtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaat 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  40930389 gtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttgcaagaatcagtgacaaatagatggctttggttaccaaat 40930488  T
Q  134 atggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacagg 233  Q
      ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | | ||  ||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  40930489 caggatggtgtgtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaacctcagttgcatcaaaacatggagttagtttgacataaacagg 40930588  T
Q  234 ttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcg 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  40930589 ttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagggattggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggccttttacctttggaggcgcg 40930688  T
Q  334 gtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctc 433  Q
    || |||||| ||  |||| |||  |||||||||||| | ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   |||||||||||||||     
T  40930689 gttgtgtgtttctggttgtgggaacgtcgaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgccttatggccaatggtgcgggcatggctt 40930788  T
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagaggg 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40930789 ggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcggatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagaggg 40930866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 34332664 - 34333194
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  34332664 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgtcagacagatggctt 34332763  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | | || |||| |||||||  |||    
T  34332764 tggttacctaatcaggatggtgggtattatgtacgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcataatatggagttaattt 34332863  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  34332864 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcaacttctgagagatcgattacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 34332963  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||| |   ||||    
T  34332964 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtg 34333063  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||      
T  34333064 cgggcatggctaggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcaaatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 34333163  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  34333164 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 34333194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2364568 - 2364038
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  2364568 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgttagacagatggctc 2364469  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  2364468 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 2364369  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  2364368 ggcataaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 2364269  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  || ||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  2364268 tgtggaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 2364169  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  2364168 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 2364069  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         ||||||||||| || |||||||||||    
T  2364068 tcttccacttgatttgattgctttgtgtttc 2364038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7313067 - 7312797
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  7313067 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctc 7312968  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  7312967 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 7312868  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7312867 ggcataaacaggtacctctcaaagtatctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaa 7312797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 19920079 - 19920348
Alignment:
Q  23 cgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggcttt 122  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  19920079 cgtaggaggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctct 19920178  T
Q  123 ggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttg 222  Q
    |||||   |||   || | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||   | |  | | || |||| ||  ||||    
T  19920179 ggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgttgacatcacaggagaagccccagttacaccatcatatggacttaatttg 19920278  T
Q  223 gcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920279 gcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 19920348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 10323420 - 10323690
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||     
T  10323420 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggattcagtgttagatagatggctc 10323519  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    | ||||   |||   |  | ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   | |  | || | |||| ||  |||    
T  10323520 tagttacctaatcaagctgatgggtattcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccatagtatggacttaattt 10323619  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10323620 ggcataaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaa 10323690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 29523723 - 29523860
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  29523723 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 29523822  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29523823 atccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 29523860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11203981 - 11203844
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||  || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11203981 tgttcgtggtgtatatgatttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 11203882  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  11203881 atacttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 11203844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 12342204 - 12342340
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||| ||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  12342204 tgttcatggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttctt-taaaagtttct 12342302  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  12342303 atccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 12342340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33496709 - 33496572
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||| ||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||   || |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  33496709 tgttcatggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaatatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 33496610  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33496609 atcattgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 33496572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 437 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7312653 - 7312538
Alignment:
Q  437 gtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgattt 536  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||       ||||||||||    
T  7312653 gtggtaggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttatttattatgcaggttgttcgagagggcgacgatctttcttgcacttgattt 7312554  T
Q  537 ggttactttgtgtttc 552  Q
    |||| |||||||||||    
T  7312553 ggttgctttgtgtttc 7312538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19890840 - 19890703
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||| | | ||| ||  ||| |||||||  | ||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  19890840 tgttcgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaataacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaacaggttcctttaaaagtttcc 19890741  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||    
T  19890740 atccttgcattgcggttgttgagggatcgattacctac 19890703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Original strand, 963030 - 963089
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  963030 ttgggaggaagaattggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcagga 963089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3141125 - 3141066
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  3141125 ttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcagga 3141066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 549
Target Start/End: Original strand, 10323832 - 10323947
Alignment:
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttga 533  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  | |||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||    
T  10323832 ggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttctgatcactttgtgcaatttatacaatatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttga 10323931  T
Q  534 tttggttactttgtgt 549  Q
    ||||||| ||||||||    
T  10323932 tttggttgctttgtgt 10323947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Original strand, 7031063 - 7031132
Alignment:
Q  219 tttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  7031063 tttggcataaacaggttcctttaaaactttctatccttgcttggcgtctgttgagggatcgcttacctac 7031132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 102
Target Start/End: Original strand, 48569907 - 48569968
Alignment:
Q  41 tgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatc 102  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  48569907 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttactactaacagtctctttgcaggaatc 48569968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2755945 - 2755822
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcg 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||| |||||  | |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| | |||    
T  2755945 tggagttgatttggcacaaacaggtacctttgaaagtgtctatatttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctactaaataaaatttggcaagtcg 2755846  T
Q  310 tggtcttttacctttggatgcgcg 333  Q
    |||  | ||| ||||||| |||||    
T  2755845 tggggtcttatctttggaggcgcg 2755822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Original strand, 963196 - 963278
Alignment:
Q  206 aatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||| |||||  | |||||||| |||||||||||    
T  963196 aatatggagttgatttggcacaaacaggtgcctttgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctac 963278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 552
Target Start/End: Original strand, 235296 - 235818
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaa 131  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  235296 ttgtgggcttgggaggaaaagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttccttacaggaatcagtgacagatagatgactttggttaccaa 235395  T
Q  132 atatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaaca 231  Q
    ||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   | | ||  ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  235396 atcaggatggtgggtattctgtacgtggagtctatgacatgttgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatatggagttaatttggcataaaca 235495  T
Q  232 ggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaaca--atctggcgaatcgtggtcttttacctttggatg 329  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| || |||||  ||||||||||||| |    
T  235496 ggttcatctcaaagtctctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaaaatcatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 235595  T
Q  330 cgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatg 429  Q
    |||||| |||||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||||||||||    
T  235596 cgcggttgtgtgtttctggttgcgagaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgccttatggccaatggtgcgggcatg 235695  T
Q  430 gctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncac 529  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||       |||    
T  235696 gctcggagtggtaggggtcgactctcaatcaaattcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacgttctttcttccac 235795  T
Q  530 ttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  235796 ttgatttggttgctttgtgtttc 235818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17720926 - 17720435
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  17720926 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttanggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatt 17720827  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  || |  ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||  || ||||||||  |||    
T  17720826 tggttaccaactcaggatgatgggtattccgttcgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacttggagttaattt 17720727  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  |||||||    
T  17720726 ggcatacacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaagataatttggcaaaccgtggcattttacc 17720627  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| ||||||  |||||| || ||||| |||   |  |||||||||| ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||    
T  17720626 tctggaggcgcggatgtgtgtttctagttgtgggaatgaagaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccattggtg 17720527  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcg 513  Q
    |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17720526 caagcatggcttggagtggtaggggttgactctcaatcaacttcagatcatttagtgcaatttattaattatgcaggatgttcgagagggcg 17720435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 47877274 - 47876744
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  47877274 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtggggttttattactaacagtttccttgcaggaatcagtgacagacagatgactt 47877175  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   | | ||  |||  ||||||  |||    
T  47877174 tggttacctaatcaggatggtgggtattatgtacgtggagtttatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatagggagttaattt 47877075  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  47877074 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagagatcagttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 47876975  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | ||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||      | ||    
T  47876974 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgcgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgcattatgacaattgatg 47876875  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||      
T  47876874 cgggcatggctaggagtggtaggggtcgactcttaatcaacttcagattattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgatggtctt 47876775  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  47876774 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 47876744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 11277101 - 11277630
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  11277101 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 11277200  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||| ||   |||   || | |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |  | |||| |||||||  |||    
T  11277201 tgggtacctaatcatgatgatgggtactctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcaaccccagttacaccataatatggagttaattt 11277300  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  11277301 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagagatcggttacctacgaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 11277400  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| | |   ||    | ||| || || |||||| |   ||||    
T  11277401 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgttttagtcttgtgtaaattttagtgcattatggccaatggtg 11277500  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||      
T  11277501 cgagcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggcgtcggtctt 11277600  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgttt 551  Q
         ||||| |||||||| ||||||||||    
T  11277601 tcttccacttaatttggttgctttgtgttt 11277630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37919835 - 37919359
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | | | |||||||    
T  37919835 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggagaagttggtagaggagtgtagagttttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacaaacatatggctt 37919736  T
Q  122 tggtta-ttaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtt 220  Q
    || |||  |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   | | || | || || ||||  ||    
T  37919735 tgattacctaaaca-ggagggtgggtattctgtgcgtggagtatatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatgaagttaatt 37919637  T
Q  221 tggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttac 320  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||| |  ||||||    
T  37919636 tggtataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagattggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgttgcattttac 37919537  T
Q  321 ctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggt 420  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||  ||| |||||||||| |||||| || |||   ||    ||||| || || |||||| |   |||    
T  37919536 ctttggaggcgcggttgtgtgtttctagttgtgggaacgttgaagatgttaatcatttatttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggt 37919437  T
Q  421 gcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagg 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37919436 gcgggcatggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgcagg 37919359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 4937977 - 4938247
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  4937977 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 4938076  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  4938077 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 4938176  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4938177 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaa 4938247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 29968265 - 29967778
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||| | || ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  29968265 gcgtaggaggttatgggcttgagaggaggaattggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 29968166  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||| ||   |||   || | ||| || | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   | |  | || | |||||||  |||    
T  29968165 tgggtacctaatcatgatgatgg-tactctgtacgtggagcctatgatatgctgacatcacaggagcaaccccagttacaccatagtatggagttaattt 29968067  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||| || | |||  |||||||    
T  29968066 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttgaggacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccatggcattttacc 29967967  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || ||||||||| |   ||||    
T  29967966 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgctttatggccaatggtg 29967867  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagg 510  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || |  ||| || | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  29967866 cgagcatggctaggagtggtgggagtagattctcattcaaccttagatcatcttttgcaatttatcaattacgcaggttgttcgagagg 29967778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18532791 - 18532653
Alignment:
Q  150 ttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttc 249  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||| || ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  | | ||| |||||||||||| | |||||||     
T  18532791 ttgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacatgaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctcgcataaacaggttcctttaaaagttta 18532692  T
Q  250 tatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18532691 tatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 18532653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 70
Target Start/End: Original strand, 27854301 - 27854339
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagg 70  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27854301 ttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagcttagg 27854339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 108 - 552
Target Start/End: Original strand, 18651169 - 18651613
Alignment:
Q  108 tagatagatggctttggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaa 207  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |   ||  ||    
T  18651169 tagatagatggttgtggttaccaaatcaggatggtgggtattctgtacatggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttagatcaaaa 18651268  T
Q  208 tttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaat 307  Q
    | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||     
T  18651269 tatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtctctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggaaaac 18651368  T
Q  308 cgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctt 407  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  18651369 cgtgggattttacctttggatgcgcggttgtgtgtctctggatgcgggaccgttgaagatgtcaatcacttgttctttgtgtgtccaacttttagcgcct 18651468  T
Q  408 tatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgag 507  Q
    ||| | |   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18651469 tattgccattggtgcgagcatggctaggagtggtcggggtcgactctcaatcaacttcagatcatttgttgcaatttattaattatgcaggttgttcgag 18651568  T
Q  508 agggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    |||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  18651569 agggcgacgatctttttttcacttgatttggttactttgtgtttc 18651613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 552
Target Start/End: Original strand, 24767288 - 24767803
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| ||      |||| | |||||||||| ||||||  ||    
T  24767288 ttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttgtattactaacagtttccttgaaga-----gtgacaaatagatggctatggttaccaa 24767382  T
Q  132 atatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaaca 231  Q
    ||  ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    | | ||  ||| |||||||  ||| ||| |||||    
T  24767383 atcaggatgataggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccctagttacatcaaaatatggagttaattttgcataaaca 24767482  T
Q  232 ggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcg 331  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  24767483 ggttcctatcaaagtctctatccttgcttgacgacttcttagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaatcgtggcattttacctttggaggcg 24767582  T
Q  332 cggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggc 431  Q
    |||| |||||| |   ||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| |||   || || ||||| || || |||||  |   ||||||||||||||    
T  24767583 cggttgtgtgtttttggttgcgggaacgttgaagatgttaataatttgtttttgtcttgtccaacttttagtgccttatgaccattggtgcgggcatggc 24767682  T
Q  432 tcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncactt 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||       |||||    
T  24767683 tcggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacattcttttttccactt 24767782  T
Q  532 gatttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24767783 gatttggttgctttgtgtttc 24767803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2553928 - 2553569
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  2553928 gcgtaggcggttgtgggcttgggagtagaagttggtaaaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 2553829  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    || |||   |||   || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||   | |  | |||| |||||||  |||    
T  2553828 tgattacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaattt 2553729  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  2553728 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 2553629  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgtt 381  Q
    |||||| |||| || |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  2553628 tttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtt 2553569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21168490 - 21168218
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  21168490 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 21168391  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||||||  |||    
T  21168390 tggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgttgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggagttaattt 21168291  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaa 294  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||||    
T  21168290 ggcataaataggttcctctcaaagtatctatcctagcttggagacttttgcaagatcgattacctacaaaaaa 21168218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 12734219 - 12733886
Alignment:
Q  219 tttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtctttt 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||  |  |||||  || |    
T  12734219 tttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggtaacccgtggcattct 12734120  T
Q  319 acctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcg 418  Q
    | || |||| | |||||  ||||| || || || |||   |||||||||||| |||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   |    
T  12734119 atctctggaggagcggttatgtgtttctagatgtgggaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggagcattatggccgatg 12734020  T
Q  419 gtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgat 518  Q
    |||| ||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |    
T  12734019 gtgcaggattggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttgtgcaatttattaattatgccggttgttcgagagggcgacggt 12733920  T
Q  519 cnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    |       |||||||||||||| |||||||||||    
T  12733919 ctttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 12733886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 420 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21168118 - 21167986
Alignment:
Q  420 tgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatc 519  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||    
T  21168118 tgcgagcatggctaggagtggtgggggtcgattctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggagacggtc 21168019  T
Q  520 nnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
           |||||||||||||| |||||||||||    
T  21168018 tttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 21167986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 292
Target Start/End: Original strand, 21630085 - 21630226
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||||    
T  21630085 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaccaggttcctttaaaagtttct 21630184  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21630185 atccttgtttggcgactattgagggatcgtttacctacaaaa 21630226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 512
Target Start/End: Original strand, 5734486 - 5734580
Alignment:
Q  418 ggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggc 512  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5734486 ggtgcgagcatggcttggagtggtaagggttgactctcaatcaacttcagatcattttgtgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggc 5734580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 17606312 - 17606449
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  17606312 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaatctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 17606411  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  17606412 atccttgcttggcgactgttgagggatcatttacctac 17606449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Original strand, 17579118 - 17579196
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  17579118 tggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctac 17579196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 288
Target Start/End: Original strand, 20883010 - 20883148
Alignment:
Q  150 ttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttc 249  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  | ||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  20883010 ttgttcgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaacaaccacatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaataggttcctttaaaagtttc 20883109  T
Q  250 tatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||    
T  20883110 tatccttgcttggcggctgttgagggattgtttacctac 20883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 288
Target Start/End: Original strand, 17573646 - 17573770
Alignment:
Q  164 tatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggc 263  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||  ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  17573646 tatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgtttatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagattctatccttgcttggc 17573745  T
Q  264 gacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  17573746 gactgttgagggatcgcttacctac 17573770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13937973 - 13937914
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13937973 ttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcagga 13937914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 288
Target Start/End: Original strand, 10577250 - 10577364
Alignment:
Q  174 tgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgag 273  Q
    ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| | |||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||    
T  10577250 tgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatagagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttatatccttgcttggcgactgttgag 10577349  T
Q  274 ggatcggttacctac 288  Q
    |||||| ||||||||    
T  10577350 ggatcgtttacctac 10577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Original strand, 18682401 - 18682451
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttac 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18682401 ttgggaggaagagttggcagaggagtgtagggctctattactcacagttac 18682451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33185719 - 33185678
Alignment:
Q  29 cgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagg 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33185719 cgtttgtggacatgggaggaagagttggtagaggagtgtagg 33185678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Original strand, 15958780 - 15958928
Alignment:
Q  140 ggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctc 239  Q
    ||||||||||  ||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||  |   | | ||| ||| || ||||  | ||||| |||||||||||||    
T  15958780 ggtgggtattcagttcgcggtgtgtctgacatgctgacatcacaggaacaacttcagttacatccaaatatgaagttaatatggcataaacaggttcctc 15958879  T
Q  240 tcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  15958880 ttaaagtctctattcttgcttggcggcttttgagggatcatttacctac 15958928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13937803 - 13937725
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||| |||||  | |||||||| |||||||||||    
T  13937803 tggagttgatttggcacaaacaggtgcctttgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctac 13937725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Original strand, 14372874 - 14372920
Alignment:
Q  56 gtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  14372874 gtagaggagtgtagggctttattactgacagtttctttgcaggaatc 14372920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9922892 - 9922401
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  9922892 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtctagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatt 9922793  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  || |  ||| | ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||  || ||||||||  |||    
T  9922792 tggttaccaactcaggatgatgggttttccgttcgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacttggagttaattt 9922693  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  |||||||    
T  9922692 ggcatacacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatgacgacttctgagggatcggttacctacaaaagataatttggcaaaccgtggcattttacc 9922593  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| ||||||  |||||| ||  |||| |||   || |||||||| | ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||    
T  9922592 tctggaggcgcggatgtgtgtttctggttgtgggaatgtagaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccattggtg 9922493  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcg 513  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9922492 cgagcatggcttggagtggtaggggttgactctcaatcaacttcagatcatttagtgcaatttattaattatgcaggatgttcgagagggcg 9922401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13396679 - 13396149
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  13396679 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacaatttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 13396580  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | | || | || |||||||  |||    
T  13396579 tggttacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatggagttaattt 13396480  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  13396479 ggcataaacaagttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 13396380  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||| |   ||||    
T  13396379 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtg 13396280  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| || ||      
T  13396279 cgggcatggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaacttcagatcattgtctgcaatttattaattacgcaggttgtttgagaaggcgacggtctt 13396180  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  13396179 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 13396149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 41665218 - 41665748
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  41665218 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttacaggaatcagtgacagacagatgactt 41665317  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | | || | || |||||||  |||    
T  41665318 tggttacctaattaggagggtgggtattctgtatgtggggtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatggagttaattt 41665417  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||| ||||||||||||||| ||| |||| || | ||   |||||||    
T  41665418 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgattcctaagagatcagttacctacaaaaaataatttggcaaaccatgacattttacc 41665517  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||| |   ||||    
T  41665518 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtg 41665617  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| |||||      
T  41665618 cgggcatggctaggagtggtaggggttgaatctcaatcaacttcagatcattgtctgcaatttattaattacgcaggttgtttgagaaggcgacgatctt 41665717  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  41665718 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 41665748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 8300094 - 8299558
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  8300094 gcgtcggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgttagacagatggctc 8299995  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   | |  | ||||||||| ||  |||    
T  8299994 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagtagccccaattacaccataatttggacttaattt 8299895  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  8299894 ggcataaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 8299795  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | ||| |  |||||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  8299794 tgtggaggagcgattatgtgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcctgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 8299695  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  8299694 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 8299595  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttctgtgct 558  Q
         |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8299594 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttcggtgct 8299558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32266853 - 32266326
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  32266853 gcgtaggaggttgtgggcctgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgtcagacagatggctt 32266754  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||| ||   |||   || | |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||| |   | |  | ||||||||||||  |||    
T  32266753 tgggtacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagcctatga--tgctgacttcacaagagcaaccacagttacaccataatttggagttaattt 32266656  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||  |||||||    
T  32266655 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccgtggcattttacc 32266556  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || || ||| |   ||||    
T  32266555 tttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattgtggccaatggtg 32266456  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||      
T  32266455 cgagcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaacctcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggcgtcggtctt 32266356  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgttt 551  Q
         ||||| |||||||| ||||||||||    
T  32266355 tcttccacttaatttggttgctttgtgttt 32266326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7924677 - 7924147
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  7924677 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 7924578  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  7924577 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 7924478  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  7924477 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 7924378  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  || ||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  7924377 tgtggaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 7924278  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  || ||      
T  7924277 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcaacggtctt 7924178  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  7924177 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 7924147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 172394 - 171864
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  172394 gcgtaggcggttgtgggcctgggaggagaagttggtagaggagtgtagggctttgttactaatagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggcta 172295  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   ||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||   | |  | |||  |||| ||  |||    
T  172294 tggttacctaataatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagaaccagttacaccataaaatggacttaattt 172195  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| |||  || ||||   || || |    
T  172194 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggaccggttacccacaaaacttaatttggtaaaccgtgacattctatc 172095  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  ||||| ||  | || ||    |||||||||||| |||||||||| |||   ||  | |||||   ||| |||||| |   ||||    
T  172094 tatggaggagcggttatgtgtttctggctgtggtaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttgacgcattatggccgatggtg 171995  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||      
T  171994 cgggattggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagataattttgtgcaatttattaattatgccggttgttcgagagggcgacggtctt 171895  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  171894 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 171864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13200285 - 13200133
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  13200285 tgttcgtggtgtgtatgatatgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttagtttggcataaacaggttcctctaaaagtttca 13200186  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggc 303  Q
    |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13200185 atccttgcttggcagctattgagggatcgtttacctacaaaatacaatttggc 13200133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20824445 - 20824321
Alignment:
Q  164 tatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggc 263  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  20824445 tatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggc 20824346  T
Q  264 gacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  20824345 gactgttgagggatcgcttacctac 20824321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Original strand, 13879355 - 13879641
Alignment:
Q  41 tgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||  |   |   |    
T  13879355 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatccgttactgatagatgggtgtggttattggacccgattg 13879454  T
Q  141 gtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctct 240  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||||| |  ||||||| || || ||||| |  |||| ||  | | ||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  13879455 gtggctattctgttcgtggggtatatgacttattgacatcgcatgaacaacctcagattcatcaaagtatggagttagtctggcacaaataggtacctct 13879554  T
Q  241 caaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttgga 327  Q
    ||||||| |  || |||| |||||  |  |||||||||| |||||||| |||  |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  13879555 caaagttacagtctttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaagccaatttggcaaatcgtggcattttaccgttgga 13879641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2170500 - 2170367
Alignment:
Q  155 cgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatcc 254  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2170500 cgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaacaggttcctttaaaagtttctatcc 2170401  T
Q  255 ttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||| |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  2170400 ttgcttggcgaccgttgagggatcgtttacctac 2170367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17699644 - 17699507
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| ||  ||||| || |||||||||| || ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  17699644 tgttcgtggtgttcatgacttgttgacatcacatgaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttct 17699545  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17699544 atccttgcttggcgactgctgagggatcgtttacctac 17699507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 20496963 - 20496839
Alignment:
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttga 533  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||    
T  20496963 ggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttga 20496864  T
Q  534 tttggttactttgtgtttctgtgct 558  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  20496863 tttggttgctttgtgtttcggtgct 20496839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 551
Target Start/End: Original strand, 32567517 - 32567643
Alignment:
Q  425 gcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnn 524  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||         
T  32567517 gcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaacctcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcaagagggcgtcggtctttct 32567616  T
Q  525 nncacttgatttggttactttgtgttt 551  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||    
T  32567617 tccacttaatttggttgctttgtgttt 32567643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37434294 - 37434157
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| ||||| |||||| | ||||| |||    
T  37434294 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacatgttcctttaaaagtctct 37434195  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  37434194 attcttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 37434157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25090647 - 25090598
Alignment:
Q  53 ttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatc 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  25090647 ttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatc 25090598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Original strand, 34137011 - 34137078
Alignment:
Q  221 tggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  34137011 tggcataaacaggtacctctcaaagtctctattcttgcttggcggcttatgatggatcgtttacctac 34137078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2529958 - 2529901
Alignment:
Q  241 caaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaat 298  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2529958 caaagtttcaatccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaat 2529901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43270542 - 43270470
Alignment:
Q  221 tggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaa 293  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||| || ||||| ||||    
T  43270542 tggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttacttggcgactgttgaaggatcgtttgcctactaaaa 43270470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 42928422 - 42927892
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||   || |||||||| |||| |||||||||| |     
T  42928422 gcgtcggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattacttaccgtttttttacaggaatcagtgacagatagatggttg 42928323  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  ||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||   | | ||| ||| |||||||  |||    
T  42928322 tggttaccaaatcaggatggtgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcgcaggaacagccccagttacatccaaatatggagttaattt 42928223  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||  ||||  |||||||    
T  42928222 ggtataaacaggttcctctcaaagtctctatccttgtttggcggcttctgagggatcggttaactacaaaaaataatttgacaaactgtggcattttacc 42928123  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
     ||||| | ||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||   || || ||||| || || |||||  |   ||||    
T  42928122 cttggaggtgcggttgtgtgtctctggatgcgggaacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcatgtccaacttttagtgccttatgaccattggtg 42928023  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  42928022 cgggcatggctcggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacgttcat 42927923  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  42927922 ttttccacttgatttggttgctttgtgtttc 42927892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Original strand, 28535524 - 28536015
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  28535524 gcgtaggtggttgtgggcttgagaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcaatgacagatagatggctt 28535623  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  || |  ||| ||| |||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||  ||  |||||||  |||    
T  28535624 tggttaccaactcaggatggtaggtactctgtacatggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcagttacatcaaaacatggagttaattt 28535723  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||    
T  28535724 ggcatacacaggttcctctcaaagtttctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacc 28535823  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| |||| |  |||||| ||  |||| |||   || ||||||||   ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||    
T  28535824 tttggaggcgcagatgtgtgtttctggttgtgggaatgtagaagatgtcgatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccaatggtg 28535923  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcg 513  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  28535924 cgggcatggcttggagtggtaggggttgactctcaatcaacttcagatcattttgtgcaatttattaattatgctggttgttcgagagggcg 28536015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Original strand, 35983640 - 35984131
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  35983640 gcgtaggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattacaggaatcagtgacagatagatagctt 35983739  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  ||||  ||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||  ||  |||||||  |||    
T  35983740 tggttaccaaatcaggatggtgggtactctgtacgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcagttacatcaaaacatggagttaattt 35983839  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||   |||||||    
T  35983840 ggcttacacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgaggaatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccatgacattttacc 35983939  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    |||||| ||||||| |||||| |   |||| |||   || |||| ||| | ||||||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||    
T  35983940 tttggaggcgcggttgtgtgtttttggttgtgggaatgtagaagttgtcaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccaatggtg 35984039  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcg 513  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35984040 cgggcatgacttggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttatgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcg 35984131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 30732163 - 30732693
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  30732163 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctc 30732262  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  30732263 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 30732362  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  30732363 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatctttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 30732462  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  ||||| ||  | || |||   |||||||||||| |||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||| | |   ||||    
T  30732463 tgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtacaacttttggtgcattatagccgatggtg 30732562  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  30732563 cgggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 30732662  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  30732663 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 30732693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23238655 - 23238145
Alignment:
Q  42 gggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacgg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||   |||   || |     
T  23238655 gggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttgggtacctaatcatgatga 23238556  T
Q  142 tgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctc 241  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |  | |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  23238555 tgggtactctgtacgtggagtctatgatatgctaacatcacaggagcaaccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaataggttcctctc 23238456  T
Q  242 aaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtg 341  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  23238455 aaagtttctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccgtggcattttagctttggaggcgcggttgtgtg 23238356  T
Q  342 tctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggt 441  Q
    | ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||| |   |||||| |||||||| ||||||||    
T  23238355 tttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcgagcatggctaggagtggt 23238256  T
Q  442 gggg-gtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggtt 540  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||       ||||| ||||||||    
T  23238255 ggggagtcgattctcattcaacgtctgatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggcgtcggtctttcttccacttaatttggtt 23238156  T
Q  541 actttgtgttt 551  Q
     ||||||||||    
T  23238155 gctttgtgttt 23238145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31641802 - 31641512
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  31641802 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatt 31641703  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||  || |  ||| | ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |   | | ||  ||  |||||||  |||    
T  31641702 tggttaccaactcaggatgatggatattccgttcgtggagcatatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacatggagttaattt 31641603  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggt 313  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  31641602 ggcatacacaggttcctct-aaagtttctatccttgcatggagactactgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggt 31641512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 12825490 - 12824962
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  12825490 gcgtaggcggttgtgggcttgggatgaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctc 12825391  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  12825390 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgcacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 12825291  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  12825290 ggcataaacaagttcctctcaaagtatgtatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 12825191  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  ||||| ||  | || |||   |||||||||||| |||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  12825190 tgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 12825091  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  12825090 cgggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 12824991  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtt 550  Q
         |||||||||||||| |||||||||    
T  12824990 tcttccacttgatttggttgctttgtgtt 12824962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 27117010 - 27117540
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  27117010 gcgtaggcggttgtgggcctgggaggaggggttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggcta 27117109  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   ||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  27117110 tggttacctaataatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagatccagttacaccataatatggacttaattt 27117209  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| |||  || |||||  || || |    
T  27117210 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggaccggttacccacaaaacttaatttggtaaaccgtggcattctatc 27117309  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  ||||| ||  | || |||   |||||||||||| |||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  27117310 tatggaggagcggttatgtgtttctggctgtgggaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggagcattatggccgatggtg 27117409  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
     |||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||  || || ||||||||||| || ||      
T  27117410 tgggattggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttgtgcaatttattaattatgtcggttgttcgagagggcgacggtctt 27117509  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  27117510 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 27117540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42514011 - 42513741
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  42514011 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 42513912  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  42513911 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 42513812  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42513811 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaa 42513741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 552
Target Start/End: Original strand, 19255159 - 19255502
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcg 309  Q
    |||||||  ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  19255159 tggagttaatttggcataaacagatttctctcaaagtatctatccttgcttggcggtttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaattg 19255258  T
Q  310 tggtcttttacctttggat-gcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgcttt 408  Q
    |||  || | || |||||  ||||||| ||||||| |  | ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||   || || |||||  | || ||    
T  19255259 tggcattattcccttggagcgcgcggttgtgtgtcactggatgcgggcacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcttgtccaacttttggtgcctt 19255358  T
Q  409 atggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgaga 508  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19255359 atggacattggtgcgggcatggctcggagtggtaggggtcgattctcaaacaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgaga 19255458  T
Q  509 gggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
      ||| |||||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  19255459 ttgcgacgatcatttttccacttgatttggttgctttgtgtttc 19255502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8228134 - 8227788
Alignment:
Q  205 taatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcg 304  Q
    |||| |||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||     
T  8228134 taatatggagttaatttgacataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggca 8228035  T
Q  305 aatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcg 404  Q
    || ||||   ||||||||||||| ||||||| |||||| ||  | || | |  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || |    
T  8228034 aaccgtgacattttacctttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgagaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtg 8227935  T
Q  405 ctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctc 504  Q
    | |||||| |   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  8227934 cattatggccaatggtgcgagcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaacctcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttc 8227835  T
Q  505 gagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgttt 551  Q
    ||||||||| || ||       ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8227834 gagagggcgtcggtctttcttccacttaatttggttgctttgtgttt 8227788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 418 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25824906 - 25824811
Alignment:
Q  418 ggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcg 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25824906 ggtgcgggcatggcttggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcg 25824811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27767204 - 27767063
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  27767204 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttat 27767105  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27767104 atccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctacaaaa 27767063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 33385352 - 33385489
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  33385352 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatattcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttct 33385451  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33385452 atccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 33385489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27795755 - 27795469
Alignment:
Q  41 tgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |  ||||||||| | ||||||||  |   |   |    
T  27795755 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttggaggaatccgttactgatagatgggtgtggttattggacccgattg 27795656  T
Q  141 gtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctct 240  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||||| |  ||||||| || || ||||| |  |||| ||| | | ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27795655 gtggctattctgttcgtggggtatatgacttattgacatcgcatgaacaacctcagattcatccaagtatggagttagtctggcacaaacaggtacctct 27795556  T
Q  241 caaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttgga 327  Q
    ||||||| |  || |||| |||||  |  |||||||||| || ||||| |||  |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  27795555 caaagttacagtctttgcttggcggttgttgagggatcgtttgcctactaaagccaatttggcaaatcgtggcattttaccgttgga 27795469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 25857402 - 25857539
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| |  |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  25857402 tgttcgtggtgcatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcttgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 25857501  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25857502 atccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctac 25857539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 8300160 - 8300297
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| |  |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  8300160 tgttcgtggtgcatatgacctgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 8300259  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8300260 atccttgtttggcgactgttgagggatcgcttacctac 8300297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10776867 - 10776789
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10776867 tggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttctatccttgcttggcgactgctgagggatcgtttacctac 10776789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 42513599 - 42513481
Alignment:
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttga 533  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||    
T  42513599 ggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttga 42513500  T
Q  534 tttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  42513499 tttggttgctttgtgtttc 42513481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3418662 - 3418538
Alignment:
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttga 533  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||       || ||||    
T  3418662 ggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccatttga 3418563  T
Q  534 tttggttactttgtgtttctgtgct 558  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  3418562 tttggttgctttgtgtttcggtgct 3418538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24408209 - 24408142
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24408209 ttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcagga 24408142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 18359070 - 18359207
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  | | ||| |||||||||||| | ||||||||     
T  18359070 tgttcgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctagcataaacaggttcctttaaaagtttca 18359169  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| |||||  |  |||||||||| ||||||||    
T  18359170 atccttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctac 18359207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 18089620 - 18089687
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||    
T  18089620 ttgtgggcttgggaggaaaagttgatagaggagtgtagggatcttttacttacagttacattgcagga 18089687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33169931 - 33169872
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33169931 ttgggaggacgagttggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcagga 33169872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 552
Target Start/End: Original strand, 12820213 - 12820328
Alignment:
Q  437 gtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgattt 536  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||       || |||||||    
T  12820213 gtggtaggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccatttgattt 12820312  T
Q  537 ggttactttgtgtttc 552  Q
    |||| |||||||||||    
T  12820313 ggttgctttgtgtttc 12820328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33169761 - 33169683
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||| |||||  | |||||||| |||||||||||    
T  33169761 tggagttgatttggcacaaacaggtgcctttgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctac 33169683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 292
Target Start/End: Original strand, 12820036 - 12820068
Alignment:
Q  260 tggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12820036 tggcgacttatgagggatcggttacctacaaaa 12820068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7404177 - 7403674
Alignment:
Q  53 ttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaat----atggacggtgggtat 148  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||| | |||||||| | ||||||  ||||    ||| | |||||||||    
T  7404177 ttggtagagaagtgtagggttttattacttacagtttccttgcaagaatcagtgacaaatagatggttatggttaccaaatcaggatgcatggtgggtat 7404078  T
Q  149 tttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagttt 248  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | | ||  ||| || ||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||| |    
T  7404077 tctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatatgaagttaatttggcataaacaagttcatttcaaagtct 7403978  T
Q  249 ctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaag 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||  |    
T  7403977 ctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaagaatttggcaaaccgtggcattttacgtttggaggcgcggttgtgtgtctctgg 7403878  T
Q  349 ttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtc 448  Q
     ||||||  ||| |||||||| | ||||||||| |||   || || ||||| || || |||||| |   |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7403877 atgcgggaacgttgaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgtccaacttttagtgccttatggccattggtgtgggcatggctcggagtggtaggggtc 7403778  T
Q  449 gactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtg 548  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||||||||| |||||||    
T  7403777 gactctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacgttcttttttccacttgatttggttgctttgtg 7403678  T
Q  549 tttc 552  Q
    ||||    
T  7403677 tttc 7403674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 19755558 - 19755023
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  19755558 gcgtaggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaatagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 19755459  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| || | || |||||||  |||    
T  19755458 tggttacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaagagcagccccaatttcatcatcatatggagttaattt 19755359  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtg---gtctttt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||    | | ||    
T  19755358 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgacattttatt 19755259  T
Q  319 acctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcg 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || ||||||||   |    
T  19755258 acctttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggagcgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggtcaatg 19755159  T
Q  419 gtgcgggcatggctcggagtgg--tgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||    
T  19755158 gtgcgggcatggctaggagtggtataggggtcgaatctcaatcaacttcagatcattgtttgcaatttattaattacgcaggttgtttgagaaggcgacg 19755059  T
Q  517 atcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
     ||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  19755058 gtctttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 19755023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 19784248 - 19784783
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  19784248 gcgtaggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaatagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctt 19784347  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||  ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| || | || |||||||  |||    
T  19784348 tggttacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaagagcagccccaatttcatcatcatatggagttaattt 19784447  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtg---gtctttt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||    | | ||    
T  19784448 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgacattttatt 19784547  T
Q  319 acctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcg 418  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || ||||||||   |    
T  19784548 acctttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggagcgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggtcaatg 19784647  T
Q  419 gtgcgggcatggctcggagtgg--tgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcg 516  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||    
T  19784648 gtgcgggcatggctaggagtggtataggggtcgaatctcaatcaacttcagatcattgtttgcaatttattaattacgcaggttgtttgagaaggcgacg 19784747  T
Q  517 atcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
     ||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  19784748 gtctttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 19784783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 15740509 - 15739982
Alignment:
Q  25 taggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttgg 124  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  15740509 taggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttgg 15740410  T
Q  125 ttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggc 224  Q
    |||   |||   || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||   | |  | |||| |||||||  ||||||    
T  15740409 ttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgttgacatcataggagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggc 15740310  T
Q  225 acaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttaccttt 324  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||| || | |  |||||  ||||||||||    
T  15740309 ataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgcgagatcggttacctacaaaaaataatttgacaagccgtggcattttaccttt 15740210  T
Q  325 ggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgg 424  Q
    ||| ||||||| |||||| ||  | || |||   ||  ||||||||| ||||||||| |||   || |  |||||  | || |||||| |   ||||||     
T  15740209 ggaggcgcggttgtgtgtttctgggtgtgggaatgttaaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtctaacttttggtgccttatggccattggtgcga 15740110  T
Q  425 gcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnn 524  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||         
T  15740109 gcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgcaggttgttcgagagggagacggtctttct 15740010  T
Q  525 nncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
      |||||||||||||| |||||||||||    
T  15740009 tccacttgatttggttgctttgtgtttc 15739982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 552
Target Start/End: Original strand, 47685755 - 47686274
Alignment:
Q  33 tgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaa 132  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||    
T  47685755 tgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcggtgatagacagatggctttggttacctaa 47685854  T
Q  133 tatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacag 232  Q
    |   || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    | |  | |||| |||| ||  |||| || ||||||    
T  47685855 tcatgatgatgggtattctgttcgtggagtctacgacatgctgacatcacaagagcagcccaagttacaccataatctggacttaatttgacataaacag 47685954  T
Q  233 gttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgc 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || |||| | ||    
T  47685955 gttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagagatcggttacctacaaaacataatttggcaaaccgtggcattttatctgtggaggagc 47686054  T
Q  333 ggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggct 432  Q
    |||  ||||| ||  | || |||   |||||||||||| ||| |||||| |||   ||  | ||||| || || |||||| |   ||||||||  ||| |    
T  47686055 ggttatgtgtttctggatgtgggaatgtcgaagatgtttctcgtttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgcattatggccgatggtgcgggattggtt 47686154  T
Q  433 cggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttg 532  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||       ||||||    
T  47686155 aggagtggtaggggtcgactctcaatcaacttcagatcatttggtgcaatttattaattatgcaggttgttcaagagggtgacggtctttctttcacttg 47686254  T
Q  533 atttggttactttgtgtttc 552  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  47686255 atttggttgctttgtgtttc 47686274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 23642440 - 23642970
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  23642440 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 23642539  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  23642540 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 23642639  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  23642640 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 23642739  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  || ||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  23642740 tgtggaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 23642839  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  23642840 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 23642939  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  23642940 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 23642970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Original strand, 1828392 - 1828709
Alignment:
Q  25 taggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttgg 124  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  || | ||||||||||    
T  1828392 taggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtggagggctttattactaacagtttctttgcaggattcagtgactgacaaatggctttgg 1828491  T
Q  125 ttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggc 224  Q
    |||   |||   || ||||||||||  || ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||   | | || |||| |||||||  ||||||    
T  1828492 ttacctaatcatgatggtgggtattccgtacgtggagcctatgatatgttgacatcacaggagcagccccagttacatcataatatggagttaatttggc 1828591  T
Q  225 acaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttaccttt 324  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  || | ||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||  ||||||||||    
T  1828592 ataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagactattgcgagataggttacctacaaaaactaatttggcaaaccgtggcattttaccttt 1828691  T
Q  325 ggatgcgcggtcgtgtgt 342  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  1828692 ggaggcgcggttgtgtgt 1828709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47419095 - 47418825
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||| || ||| |||||||||||||     
T  47419095 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggaggtggtagaggagtgtagggctttgttactaacaatttctttgcaggattcagtgttagatagatggctc 47418996  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   |  | ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   | |  | || | |||| ||  |||    
T  47418995 tggttacctaatcaagctgatgggtattcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccatagtatggacttaattt 47418896  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47418895 ggcataaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaa 47418825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 292
Target Start/End: Original strand, 13270860 - 13271010
Alignment:
Q  142 tgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctc 241  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  13270860 tgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggcataaacaggtccctctc 13270959  T
Q  242 aaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13270960 aaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaa 13271010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 552
Target Start/End: Original strand, 20788491 - 20788658
Alignment:
Q  384 tggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatt 483  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||| |   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  20788491 tggtgtgtccaacttttagcgccttatggccattggtgcgagcatggctaggagtggtcggggtcgactctcaatcaacttcagatcatttgttgcaatt 20788590  T
Q  484 tattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  20788591 tattaattatgtaggttgttcgagagggcaacgatc-ttttttcacttgatttggttactttgtgtttc 20788658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12697975 - 12697838
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| || | ||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12697975 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatgaaattaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 12697876  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  12697875 atccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 12697838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472824
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| | ||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  45472687 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaaccacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 45472786  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45472787 atccttgtttggcgactgttgagggatcgtttacctac 45472824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Original strand, 55725664 - 55725816
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| | | ||  ||  ||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  55725664 tgttcatggtgtgtatgatatgttgacatcacaggaacaacctcatgtttatcaaaatatggagttaatttggcataaacaagttcctctaaaagtttca 55725763  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggc 303  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  55725764 atccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaatttggc 55725816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 13271152 - 13271270
Alignment:
Q  434 ggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttga 533  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||    
T  13271152 ggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttga 13271251  T
Q  534 tttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  13271252 tttggttgctttgtgtttc 13271270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8361263 - 8361126
Alignment:
Q  150 ttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttc 249  Q
    |||||||||| || |||||  || || |||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  8361263 ttgttcgtggtgtatatgatttgttgccatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttc 8361164  T
Q  250 tatccttgcatggcgacttctgagggatcggttaccta 287  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8361163 tatccttgtttggcgactgctgaggaatcgtttaccta 8361126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20002887 - 20002750
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| | | ||  ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  20002887 tgttcgtggtgtttatgacatgttgacatcacacgaacaacctcatgttaatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcttttaaaagtttct 20002788  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||| |||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  20002787 atcattgcttggcggctgttgagggatcgtttacctac 20002750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 54483027 - 54483284
Alignment:
Q  41 tgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||  ||  |   |    
T  54483027 tgggaggaggatttggtagaggagtgtaggggtttattactaacagtctctttgcaggaatccgttactgatagatgggtgtggttattggatccgattg 54483126  T
Q  141 gtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctct 240  Q
    |||| |||| |||| |||| || |||||| |  ||||||| || || ||||| |  |||| ||  | | ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  54483127 gtggctattatgtttgtggggtatatgacttattgacatcgcatgaacaacctcagattcatcaaagtatggagttagtctggcacaaacaggtacctct 54483226  T
Q  241 caaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaat 298  Q
     |||||| |  || |||| |||||  |  |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  54483227 aaaagttacagtctttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaaaccaat 54483284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 552
Target Start/End: Original strand, 159954 - 160070
Alignment:
Q  436 agtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatt 535  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||       |||||||||    
T  159954 agtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttgatt 160053  T
Q  536 tggttactttgtgtttc 552  Q
    |||||  ||||||||||    
T  160054 tggttgttttgtgtttc 160070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Original strand, 2821917 - 2822152
Alignment:
Q  53 ttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacggtgggtattttg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |  || |||||| | ||||||    ||  |   ||||| |||  ||    
T  2821917 ttggtagaggagtgtagggctttaatactaacagtctctttgcaggaatctgttactgacagatgggtgtggttaccggatccgattggtggctatactg 2822016  T
Q  153 ttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctat 252  Q
    ||| ||| || |||||| || |||||||| |||| ||||| | ||||| ||  ||| |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  2822017 ttcatggggtatatgacttgttgacatcataggaacaacctcatattcatcaaaatatggagttaatctggcacaaacaggtacctctaaaagtttcagt 2822116  T
Q  253 ccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    || ||| |||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  2822117 ccatgcttggcgattgttgagggatcgcttacctac 2822152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46145948 - 46145889
Alignment:
Q  40 ttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  46145948 ttgggaggaagagttggcagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcagga 46145889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 48312364 - 48312321
Alignment:
Q  44 gaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagt 87  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48312364 gaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagt 48312321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41207297 - 41206840
Alignment:
Q  32 ttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaa 131  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |     
T  41207297 ttgtgggcatgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattatttacagtttccttgcaggaatcagtggcagatagatggttgtggttaccag 41207198  T
Q  132 atatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaaca 231  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |   | | ||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  41207197 atcaggatggtgggtattcagtatgtggagtttatgacatgctgacatcgcaggaacatcctcagttacatccaaatatggagttaatttggcataaaca 41207098  T
Q  232 ggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcg 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || | || ||||| |||    
T  41207097 ggttcctctcaaagtctctatccttgcttggcggcttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaatcgtggcattattcccttggaggcg 41206998  T
Q  332 cggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggc 431  Q
    |||| ||||||| |  | ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||   || || |||||  | || |||||| |   | ||||||||||||    
T  41206997 cggttgtgtgtcactggatgcgggcacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcttgtccaacttttggtgccttatggccattgatgcgggcatggc 41206898  T
Q  432 tcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaa 489  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  41206897 tcggagtggtaggggttgactctcagacaacttcagatcattttttgcaatttattaa 41206840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4552340 - 4551930
Alignment:
Q  142 tgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctc 241  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  ||||||| ||| ||||||||||     
T  4552340 tgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggcataaataggttcctctt 4552241  T
Q  242 aaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtg 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || || |||| | |||||  ||||    
T  4552240 aaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtg 4552141  T
Q  342 tctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggt 441  Q
    | ||  | || |||   |||||| ||||| |||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||  |   ||||||||  ||| | || |||||    
T  4552140 tttctggatgtgggattgtcgaaaatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatgaccgatggtgcgggattggttaggcgtggt 4552041  T
Q  442 gggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggtta 541  Q
     || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||       ||||||||||||||     
T  4552040 aggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttgatttggttg 4551941  T
Q  542 ctttgtgtttc 552  Q
    |||||||||||    
T  4551940 ctttgtgtttc 4551930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12645639 - 12645551
Alignment:
Q  210 tggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaat 298  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12645639 tggagttaatttggcataaacaggtttctctaaaagtttcaatccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaat 12645551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15917736 - 15917624
Alignment:
Q  231 aggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgc 330  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||||| || | |||||||| |     
T  15917736 aggttcctctgaaagtctgtatccttgcttggggactgctgagggatcgtttacctacaaaagttaatttggcaaatcgtggtattattcctttggaagt 15917637  T
Q  331 gcggtcgtgtgtc 343  Q
    ||||| |||||||    
T  15917636 gcggttgtgtgtc 15917624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40176940 - 40176693
Alignment:
Q  41 tgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |  || |||||| |  |||||    ||  |        
T  40176940 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatctgatactgacagatgggtgcggttaccggatccgattt 40176841  T
Q  141 gtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctct 240  Q
    |||| |||| ||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||| | ||||| ||  ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  40176840 gtggctattctgttcatggggtatatgacttattgacatcacaggaacaacctcatattcatcaaaatatggagttagtctggcacaaacaggtacctct 40176741  T
Q  241 caaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
     ||||||||  ||||||| |||||  |  |||||||||| ||||||||    
T  40176740 aaaagtttcagtccttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctac 40176693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 11908954 - 11909224
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  11908954 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctc 11909053  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  11909054 tggttacctaatcatgatgatgggtattctatacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 11909153  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909154 ggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcattgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 11909224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35541340 - 35540804
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  35541340 gcgtcggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttttttgcaggaatcagtgttagacagatggctc 35541241  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  35541240 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaattt 35541141  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||  || || |    
T  35541140 ggcataaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacccacaaaacataatttggcaaatcgtggcattctatc 35541041  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| |  || |  || ||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  35541040 tgtggaggaacgattatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 35540941  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  35540940 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 35540841  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttctgtgct 558  Q
         |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35540840 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttcggtgct 35540804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6050894 - 6050624
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  6050894 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 6050795  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  6050794 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 6050695  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6050694 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaa 6050624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 51052698 - 51052241
Alignment:
Q  95 caggaatcggtgatagatagatggctttggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaacccc 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51052698 caggaatcagtgatagacagatggctctggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagcccc 51052599  T
Q  195 ctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaa 294  Q
       | |  | |||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  51052598 agttacaccataatatggacttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaact 51052499  T
Q  295 caatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccg 394  Q
     ||| |||| ||||||||  || || || |||| | |||||  ||||| ||  | || |||   |||||||||||| |||||||||| |||   ||  |     
T  51052498 taatttggcaaatcgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgca 51052399  T
Q  395 actttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatg 494  Q
    |||||  | || |||||| |   ||||||||  ||| | || ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  51052398 acttttggtgcattatggccgatggtgcgggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatg 51052299  T
Q  495 cagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    |||| || ||||||||||| || ||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  51052298 caggttgttcgagagggcgacggtctttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 51052241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 16917787 - 16917924
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| |  |||||| || ||||||||||||| ||||| | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  16917787 tgttcgtggtgcatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcttgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 16917886  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16917887 atccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctac 16917924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6259712 - 6259619
Alignment:
Q  418 ggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagaggg 511  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  6259712 ggtgcgagcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattacgtaggttgttcgagaggg 6259619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43388529 - 43388392
Alignment:
Q  151 tgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttct 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||  | | ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  43388529 tgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacttcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttct 43388430  T
Q  251 atccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  43388429 atccttgcttggcgattgttgagggatcgtttacctac 43388392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2491496 - 2491429
Alignment:
Q  29 cgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgca 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||| |||||    
T  2491496 cgtttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggtactattacttacagttactttgca 2491429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 26059752 - 26059652
Alignment:
Q  452 tctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgttt 551  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||       |||||||||||||| ||||||||||    
T  26059752 tctcaatcaacttcagatcattttttgcaatttattaattatgcaggttgttcgagagggtgacggtctttcttccacttgatttggttgctttgtgttt 26059653  T
Q  552 c 552  Q
    |    
T  26059652 c 26059652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4842299 - 4842165
Alignment:
Q  418 ggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcga 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||    |||||||||| |||| ||||| || | |||| |||| ||     
T  4842299 ggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaacttcagatcattgtcagcaatttattcattacgcaggttgtttgagaaggcgacgg 4842200  T
Q  518 tcnnnnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
    ||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  4842199 tctttcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 4842165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Original strand, 47623123 - 47623192
Alignment:
Q  219 tttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctac 288  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  47623123 tttggcataaacaggtacctctcaaagtatctattcttgcttggcggcttttgagggaccgcttacctac 47623192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13352180 - 13352075
Alignment:
Q  447 tcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnnnnnnncacttgatttggttactttg 546  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||       ||||| |||||||| |||||    
T  13352180 tcgactatcaatcaacttcagatcattttttgtaatttattaattatgcaggttgttcgagagagcgacgttcattttttcactttatttggttgctttg 13352081  T
Q  547 tgtttc 552  Q
    ||||||    
T  13352080 tgtttc 13352075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31779529 - 31779477
Alignment:
Q  47 gaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcagga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  31779529 gaagagttggtagaggagtgtagggaactattactcacagttacattgcagga 31779477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3543 - 3067
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  3543 gcgtaggaggttgtgggcctgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttacaggaatcagtgacagacagatggctt 3444  T
Q  122 tggttat-taaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtt 220  Q
    ||| ||  |||  ||| | | |||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |  | |||| |||||||  ||    
T  3443 tgggtacctaaccatg-atgatgggtactcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcaaccctagttacaccataatatggagttaatt 3345  T
Q  221 tggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttac 320  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |||| || | |||  ||||||    
T  3344 tggcataaacaggttcctcttaaagtttctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagcaatttggcaaaccatggcattttac 3245  T
Q  321 ctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggt 420  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||  | || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||| |   |||    
T  3244 ctttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggt 3145  T
Q  421 gcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagg 498  Q
    ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  3144 gcgagcatggttaggagtggtgggagtcgactctcattctatctcagatcattttttgcaatttatcaattacgcagg 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 552
Target Start/End: Original strand, 105692 - 106222
Alignment:
Q  22 gcgtaggcgtttgtggacttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctt 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||     
T  105692 gcgtaggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctc 105791  T
Q  122 tggttattaaatatggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggttt 221  Q
    ||||||   |||   || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |  | |||| |||| ||  |||    
T  105792 tggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaattt 105891  T
Q  222 ggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||  || || |    
T  105892 ggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatc 105991  T
Q  322 tttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtg 421  Q
    | |||| | |||||  || ||  |  | || |||   ||||||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||    
T  105992 tgtggaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtg 106091  T
Q  422 cgggcatggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcgatcnn 521  Q
    |||   ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||      
T  106092 cggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaacttcagatcactttgtgcaatttattcattatgcaggttgttcgagagggcgacggtctt 106191  T
Q  522 nnnnncacttgatttggttactttgtgtttc 552  Q
         |||||||||||||| |||||||||||    
T  106192 tcttccacttgatttggttgctttgtgtttc 106222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 516
Target Start/End: Original strand, 11187 - 11548
Alignment:
Q  155 cgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaaccccctattcttcctaatttggagttggtttggcacaaacaggttcctctcaaagtttctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |  | |||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11187 cgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagacccagctacaccataatctggacttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcc 11286  T
Q  255 ttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaatcgtggtcttttacctttggatgcgcggtcgtgtgtctcaagttgcgg 354  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||| || |||||  || || || |||| | |||||  ||||| ||  | || ||    
T  11287 ttgcttggcgacttctcagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaaccgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgg 11386  T
Q  355 ggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcgggcatggctcggagtggtgggggtcgactct 454  Q
    |   |||||| |||||  ||||||||| |||   ||  | |||||  | || |||||| |   ||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11387 gaatgtcgaaaatgtttttcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggagcattatggccgatggtgcgggattggttaggagtggtaggggtcgactct 11486  T
Q  455 caatctacttctgatgatttgttgcaatttattaattatgcagggtgctcgagagggcggcg 516  Q
    ||||| ||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  11487 caatcaacttcagatcattttgagcaatttattaattatgccggttgttcgagagggcggcg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University