View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9264A_low_464 (Length: 231)

Name: NF9264A_low_464
Description: NF9264A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9264A_low_464
NF9264A_low_464
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-216)||(15678-15893)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (1-216)||(13504881-13505096)
chr3 (1-216)||(10602472-10602687)
chr3 (1-216)||(11947407-11947622)
chr3 (1-216)||(16448760-16448975)
chr3 (1-216)||(9360971-9361186)
chr3 (1-216)||(7600355-7600570)
chr3 (1-216)||(15556942-15557157)
chr3 (1-216)||(16373565-16373780)
chr3 (1-216)||(12187076-12187291)
chr3 (1-216)||(37942378-37942593)
chr3 (2-208)||(12193491-12193697)
chr3 (5-216)||(6814868-6815079)
chr3 (1-216)||(10147011-10147226)
chr3 (1-216)||(15645001-15645216)
chr3 (1-216)||(10160173-10160388)
chr3 (2-216)||(13187418-13187632)
chr3 (2-208)||(3245589-3245795)
chr3 (1-208)||(2721305-2721511)
chr3 (1-209)||(4382751-4382961)
chr3 (1-208)||(13001425-13001634)
chr3 (1-209)||(13097711-13097919)
chr3 (1-209)||(1992803-1993011)
chr3 (1-209)||(20156515-20156722)
chr3 (1-209)||(10546936-10547148)
chr3 (1-209)||(13690608-13690816)
chr3 (1-206)||(22637702-22637908)
chr3 (1-209)||(11398215-11398424)
chr3 (1-209)||(14348588-14348797)
chr3 (1-208)||(3279191-3279399)
chr3 (1-206)||(17387839-17388045)
chr3 (1-209)||(12160207-12160416)
chr3 (9-216)||(17045697-17045902)
chr3 (9-216)||(17047857-17048062)
chr3 (118-216)||(16655798-16655897)
chr3 (1-57)||(27356728-27356784)
chr3 (1-58)||(13601220-13601277)
chr3 (1-57)||(3339226-3339282)
chr3 (1-57)||(12776534-12776590)
chr3 (1-57)||(13136210-13136266)
chr3 (1-57)||(20584262-20584318)
chr3 (1-52)||(15946773-15946824)
chr3 (1-59)||(14445768-14445826)
chr3 (1-162)||(20225754-20225915)
chr3 (1-57)||(15619283-15619339)
chr3 (1-70)||(8686387-8686457)
chr3 (1-57)||(13195458-13195514)
chr3 (1-52)||(13068306-13068357)
chr3 (1-32)||(2005499-2005530)
chr3 (1-57)||(16703307-16703363)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-216)||(123369-123584)
scaffold0029 (2-44)||(77391-77433)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-216)||(9582893-9583108)
chr7 (1-216)||(16119849-16120064)
chr7 (5-216)||(23515067-23515278)
chr7 (1-216)||(14551098-14551314)
chr7 (1-216)||(8717865-8718080)
chr7 (1-216)||(13673856-13674071)
chr7 (1-216)||(18593352-18593567)
chr7 (1-216)||(18618117-18618332)
chr7 (1-209)||(4312564-4312772)
chr7 (1-209)||(538755-538964)
chr7 (1-209)||(8780936-8781146)
chr7 (3-209)||(9003958-9004165)
chr7 (1-209)||(20108375-20108584)
chr7 (1-206)||(9264939-9265145)
chr7 (1-208)||(12548805-12549012)
chr7 (2-188)||(48801777-48801963)
chr7 (1-209)||(12567020-12567229)
chr7 (1-209)||(13657873-13658081)
chr7 (1-209)||(11921307-11921512)
chr7 (1-209)||(16532100-16532311)
chr7 (1-209)||(16633351-16633562)
chr7 (1-179)||(16465616-16465791)
chr7 (1-70)||(4461242-4461311)
chr7 (1-57)||(825783-825839)
chr7 (1-57)||(14221718-14221774)
chr7 (1-57)||(15916776-15916832)
chr7 (1-57)||(18287761-18287817)
chr7 (1-57)||(27291496-27291552)
chr7 (1-64)||(15206584-15206647)
chr7 (1-59)||(5397273-5397331)
chr7 (1-50)||(15065935-15065984)
chr7 (1-54)||(9194544-9194597)
chr7 (5-57)||(6713072-6713124)
chr7 (2-97)||(4791383-4791478)
chr7 (2-57)||(15348532-15348587)
chr7 (17-69)||(15522504-15522557)
chr7 (2-44)||(15940731-15940773)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-216)||(15699555-15699770)
chr6 (1-216)||(22165549-22165764)
chr6 (1-216)||(22243812-22244027)
chr6 (1-216)||(22061503-22061718)
chr6 (1-216)||(20170242-20170458)
chr6 (1-209)||(24855245-24855453)
chr6 (1-216)||(22767116-22767331)
chr6 (5-209)||(20107784-20107989)
chr6 (1-209)||(23023093-23023302)
chr6 (1-209)||(25625691-25625899)
chr6 (1-209)||(18448140-18448349)
chr6 (1-201)||(18854026-18854226)
chr6 (1-209)||(21560554-21560762)
chr6 (1-209)||(25631269-25631477)
chr6 (1-206)||(2181063-2181269)
chr6 (1-209)||(25963248-25963457)
chr6 (1-209)||(25967895-25968104)
chr6 (1-188)||(30671807-30671995)
chr6 (1-208)||(29595697-29595904)
chr6 (30-209)||(19585571-19585750)
chr6 (1-70)||(18184874-18184943)
chr6 (117-215)||(20016344-20016443)
chr6 (1-68)||(20218981-20219048)
chr6 (1-68)||(22113006-22113073)
chr6 (1-58)||(35270971-35271028)
chr6 (1-64)||(18731868-18731931)
chr6 (1-57)||(11204004-11204060)
chr6 (1-70)||(29686587-29686657)
chr6 (5-57)||(23517835-23517887)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-216)||(20595831-20596046)
chr5 (1-216)||(20602117-20602332)
chr5 (1-216)||(20608408-20608623)
chr5 (1-216)||(15735534-15735749)
chr5 (1-216)||(23748051-23748266)
chr5 (26-216)||(23710701-23710892)
chr5 (1-209)||(24940540-24940749)
chr5 (1-216)||(18072900-18073115)
chr5 (1-216)||(24953174-24953389)
chr5 (19-208)||(20622170-20622359)
chr5 (1-216)||(20790714-20790929)
chr5 (1-209)||(23600636-23600845)
chr5 (1-209)||(24219752-24219961)
chr5 (5-209)||(20444843-20445048)
chr5 (1-195)||(21387410-21387605)
chr5 (1-205)||(20916456-20916660)
chr5 (40-209)||(22948518-22948688)
chr5 (38-208)||(20575510-20575680)
chr5 (1-57)||(22317513-22317569)
chr5 (1-57)||(25006808-25006864)
chr5 (1-57)||(30759655-30759711)
chr5 (1-64)||(18484212-18484275)
chr5 (1-51)||(25116171-25116221)
chr5 (1-57)||(26847803-26847859)
chr5 (1-46)||(25175261-25175306)
chr5 (5-57)||(22855723-22855775)
chr5 (2-46)||(27270563-27270607)
chr5 (2-50)||(17412736-17412784)
chr5 (128-209)||(22317639-22317719)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-216)||(11496614-11496829)
chr4 (1-216)||(13822913-13823128)
chr4 (1-210)||(42709731-42709940)
chr4 (1-215)||(15254349-15254563)
chr4 (1-208)||(10630758-10630965)
chr4 (1-209)||(3354646-3354855)
chr4 (1-209)||(18081459-18081669)
chr4 (1-209)||(45234232-45234441)
chr4 (1-208)||(18291945-18292153)
chr4 (1-208)||(17484910-17485118)
chr4 (1-208)||(56580539-56580748)
chr4 (1-208)||(38426745-38426938)
chr4 (1-206)||(8092427-8092634)
chr4 (1-64)||(14653998-14654061)
chr4 (3-57)||(15865647-15865701)
chr4 (1-57)||(10650547-10650603)
chr4 (1-57)||(15260109-15260165)
chr4 (1-57)||(16682913-16682969)
chr4 (1-52)||(15409534-15409585)
chr4 (1-70)||(9488878-9488948)
chr4 (2-50)||(17296250-17296298)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (1-216)||(22665062-22665277)
chr2 (1-216)||(117543-117758)
chr2 (1-216)||(22044660-22044875)
chr2 (1-216)||(25357511-25357726)
chr2 (1-209)||(11615-11823)
chr2 (1-216)||(16775651-16775866)
chr2 (1-216)||(24795285-24795500)
chr2 (1-216)||(17590407-17590622)
chr2 (1-216)||(27627580-27627796)
chr2 (1-209)||(25144757-25144966)
chr2 (1-208)||(5500265-5500473)
chr2 (1-209)||(25804267-25804475)
chr2 (6-207)||(25370890-25371091)
chr2 (1-208)||(23798922-23799129)
chr2 (1-209)||(23643950-23644160)
chr2 (1-155)||(24178193-24178348)
chr2 (81-209)||(24502168-24502297)
chr2 (1-89)||(24506777-24506865)
chr2 (1-57)||(23159385-23159441)
chr2 (1-57)||(23570642-23570698)
chr2 (1-57)||(27631655-27631711)
chr2 (1-57)||(27768816-27768872)
chr2 (1-52)||(24171510-24171561)
chr2 (5-70)||(24321314-24321380)
chr2 (1-70)||(25337651-25337720)
chr2 (1-57)||(23257570-23257625)
chr2 (20-62)||(23648123-23648165)
chr2 (2-47)||(29955868-29955913)
chr2 (2-46)||(19805618-19805662)
chr2 (2-50)||(21512567-21512615)
chr2 (2-57)||(24019068-24019123)
chr2 (2-44)||(17334606-17334648)
chr2 (128-209)||(27631506-27631585)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-216)||(27046874-27047089)
chr1 (1-216)||(17094601-17094816)
chr1 (1-216)||(20237456-20237671)
chr1 (1-216)||(21798662-21798878)
chr1 (5-206)||(8653126-8653327)
chr1 (1-209)||(52938621-52938830)
chr1 (1-209)||(3989944-3990154)
chr1 (1-202)||(19364043-19364244)
chr1 (1-89)||(14070632-14070720)
chr1 (5-59)||(19875648-19875702)
chr1 (1-64)||(21784472-21784535)
chr1 (1-64)||(4027832-4027895)
chr1 (4-70)||(16382578-16382645)
chr1 (1-64)||(8947515-8947578)
chr1 (128-208)||(21784598-21784677)
chr1 (2-44)||(18478234-18478276)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-216)||(21382093-21382309)
chr8 (1-216)||(21098794-21099009)
chr8 (1-216)||(21104115-21104330)
chr8 (1-216)||(23911441-23911655)
chr8 (1-216)||(8314467-8314683)
chr8 (1-216)||(8322846-8323062)
chr8 (1-209)||(21843524-21843733)
chr8 (1-209)||(21939996-21940206)
chr8 (1-209)||(20038981-20039189)
chr8 (1-208)||(17620755-17620961)
chr8 (1-209)||(16418620-16418830)
chr8 (1-208)||(23454945-23455154)
chr8 (1-180)||(24034049-24034230)
chr8 (1-188)||(21538575-21538765)
chr8 (12-208)||(14352181-14352378)
chr8 (1-112)||(20712537-20712649)
chr8 (1-57)||(11346953-11347009)
chr8 (1-57)||(19767684-19767740)
chr8 (1-57)||(22370102-22370158)
chr8 (1-52)||(20002279-20002330)
chr8 (1-57)||(22033555-22033611)
chr8 (1-57)||(22099655-22099711)
chr8 (1-57)||(22102552-22102608)
chr8 (1-52)||(21831181-21831232)
chr8 (1-52)||(22817755-22817806)
chr8 (140-209)||(20712470-20712539)
chr8 (2-50)||(18572977-18573025)
chr8 (2-44)||(19902174-19902216)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-216)||(615-831)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (1-216)||(1038-1253)
scaffold0404 (1-65)||(3460-3524)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-209)||(220-428)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (1-209)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-209)||(831-1041)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-201)||(11064-11264)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (1-206)||(2852-3058)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (1-206)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (1-209)||(7941-8149)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-209)||(251870-252079)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (1-208)||(14662-14869)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (1-209)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-209)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-209)||(97726-97936)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-208)||(120954-121162)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-209)||(510-718)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (3-162)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (3-162)||(232789-232948)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-159)||(164403-164562)
scaffold0011 (2-70)||(172248-172316)
scaffold0011 (1-64)||(161995-162058)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (1-148)||(8720-8869)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-206)||(13002-13207)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-206)||(35104-35307)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-113)||(10206-10319)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (1-102)||(38508-38610)
scaffold0096 (131-181)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (1-64)||(5232-5295)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (5-207)||(37722-37922)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-64)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-64)||(50506-50569)
scaffold0035 (2-44)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (1-59)||(912-970)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (1-69)||(1834-1902)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (1-57)||(2762-2818)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-52)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (5-64)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-57)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-57)||(54849-54905)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (142-209)||(2859-2926)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-64)||(37743-37806)
scaffold0116 (128-208)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (2-57)||(1193-1248)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-64)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-64)||(45228-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-51)||(72572-72622)
scaffold0037 (1-51)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-46)||(18218-18263)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (17-57)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (4-44)||(3251-3291)


Alignment Details
Target: scaffold0230 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15893 - 15678
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 15794  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15793 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15694  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  15693 gtgtgtgtgaagtcca 15678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13504881 - 13505096
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504881 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 13504980  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13504981 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13505080  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  13505081 gtgtgtgtgaagtcca 13505096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10602472 - 10602687
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10602472 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 10602571  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10602572 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 10602671  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  10602672 gtgtgtgtgaagtcca 10602687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11947622 - 11947407
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947622 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 11947523  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11947522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaaatgagt 11947423  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  11947422 gtgtgtgtgaagtcca 11947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16448760 - 16448975
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448760 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 16448859  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16448860 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16448959  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  16448960 gtgtgtgtgaagtcca 16448975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9360971 - 9361186
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9360971 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagga 9361070  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9361071 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 9361170  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  9361171 gtgtgtgtgaagtcca 9361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7600570 - 7600355
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  7600570 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 7600471  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  7600470 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 7600371  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  7600370 gtgtgtgtgaagtcca 7600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15556942 - 15557157
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15556942 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 15557041  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15557042 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15557141  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||| ||| |||||    
T  15557142 gtgtgtatgaagtcca 15557157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16373565 - 16373780
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16373565 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 16373663  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16373664 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 16373763  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16373764 tgtgtgtgtgaagtcca 16373780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12187076 - 12187291
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  12187076 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 12187174  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  12187175 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 12187274  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12187275 tgtgtgtgtgaagtcca 12187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37942593 - 37942378
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  37942593 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 37942495  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37942494 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcctgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 37942395  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37942394 tgtgtgtgtgaagtcca 37942378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 12193491 - 12193697
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12193491 atcaaactcccccatacctgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 12193589  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  12193590 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 12193689  T
Q  201 gtgtgtgt 208  Q
    ||||||||    
T  12193690 gtgtgtgt 12193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6815079 - 6814868
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6815079 aaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcacatg 6814981  T
Q  105 tctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtg 203  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6814980 tctcctcaagggcataaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 6814881  T
Q  204 tgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||| |||||    
T  6814880 tgtgtgaagtcca 6814868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10147226 - 10147011
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  10147226 catcaaactcccccatacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 10147128  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  10147127 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10147028  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10147027 tgtgtgtgtgaagtcca 10147011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15645216 - 15645001
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15645216 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 15645118  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  15645117 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 15645018  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15645017 tgtgtgtgtgaagtcca 15645001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10160173 - 10160388
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| || ||||||||||    
T  10160173 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcgaatgacagtt-aattaaagca 10160271  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  10160272 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10160371  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10160372 tgtgtgtgtgaagtcca 10160388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13187418 - 13187632
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  13187418 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 13187516  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||    
T  13187517 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcgagtttcaagtgagt 13187616  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  13187617 gtgtgtgtgaagtcca 13187632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 3245589 - 3245795
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |      
T  3245589 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaactt 3245688  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtg 201  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||     
T  3245689 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagta 3245788  T
Q  202 tgtgtgt 208  Q
    |||||||    
T  3245789 tgtgtgt 3245795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2721511 - 2721305
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| | ||||||||||||||||| |     
T  2721511 catcaaactcccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattataatatgacaattcaattaaaact 2721413  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||||||||||||| |||  |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2721412 tatgtctcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 2721313  T
Q  201 gtgtgtgt 208  Q
    ||||||||    
T  2721312 gtgtgtgt 2721305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4382961 - 4382751
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcata-aacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  4382961 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 4382862  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  4382861 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 4382762  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  4382761 gtgtgtgtgtg 4382751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 13001425 - 13001634
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  13001425 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 13001524  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  13001525 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 13001624  T
Q  199 gtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||    
T  13001625 gtgtgtgtgt 13001634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13097919 - 13097711
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13097919 catcaaactcccccacatttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13097820  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13097819 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 13097720  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  13097719 gtgtgtgtg 13097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1993011 - 1992803
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||| |     
T  1993011 catcaaactctctcccacttgaatctttgcttatgctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattaaattaaaact 1992912  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  1992911 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaactcaacaatcaaatttcaagtgagt 1992812  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  1992811 gtgtgtgtg 1992803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20156515 - 20156722
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||||| ||||||| |     
T  20156515 catcaaactcccccacacttgaatctt-gcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagcataaacaagataatcatatgacaattaaattaaaact 20156613  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  20156614 catgtctcctcaaaggcttttatttcaattttacactaatcacaagctcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagt 20156713  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  20156714 gtgtgtgtg 20156722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10546936 - 10547148
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||| ||||||||| | |  ||||    
T  10546936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacgatattatcatatgacaattaattcgaagc 10547035  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat--ttttattcaacccaacgatcaagcttcaagt 196  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  | ||||    
T  10547036 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttttcaacccaacaatcaagtcttaagt 10547135  T
Q  197 gagtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||||    
T  10547136 gagtgtgtgtgtg 10547148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13690816 - 13690608
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||   ||||||||| ||||||| ||    
T  13690816 catcaaactcccccacacttgaatctttagttgtcatcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattatttcatgacaatttaattaaaaca 13690717  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  13690716 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtccactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13690617  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  13690616 gtgtgtgtg 13690608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22637908 - 22637702
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |    
T  22637908 catcaaactcccctacacttgaatctttacttgtgctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 22637809  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      ||| ||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22637808 ttatgcctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaacttaagcaattcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 22637709  T
Q  200 tgtgtgt 206  Q
    |||||||    
T  22637708 tgtgtgt 22637702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11398424 - 11398215
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||| || | |||||||||||| ||| |    
T  11398424 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaacaagattaacatacgacaattcaattgaaaac 11398325  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      ||||||| |||||| |||  ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11398324 ttatgtctcttcaaaggcttttatttaaagcgtacactaatcataaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 11398225  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  11398224 tgtgtgtgtg 11398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14348588 - 14348797
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||  ||| || ||||||||||||||||| |    
T  14348588 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatggtaacataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaac 14348687  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
       ||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |  |||||||    
T  14348688 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccaaacaatcaagttctaagtgag 14348787  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  14348788 tgtgtgtgtg 14348797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3279399 - 3279191
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagtt-ttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| || ||||||||| ||||||| |    
T  3279399 catcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcaacataaacaatacttaacatatgacaattaaattaaaac 3279300  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
       |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  3279299 ttgtgtctcctcaaagacttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcgaacatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 3279200  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  3279199 tgtgtgtgt 3279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17388045 - 17387839
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||| |    
T  17388045 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccttaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatgtgacaattcaattaaaac 17387946  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      || ||||||||||| |||  ||  |||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  17387945 ttatatctcctcaaaggcttttatttcaagcacacactaatcacaaactcaagcaattcttgaaatctttattcaacccaacaatcaagtttaaagtgag 17387846  T
Q  200 tgtgtgt 206  Q
    |||||||    
T  17387845 tgtgtgt 17387839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12160207 - 12160416
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |   |||||| ||||||||| ||||||||     
T  12160207 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtggcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaaga 12160306  T
Q  100 acatgtctcctcaaa-gacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    ||||||||||||||| |  || | | | ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  12160307 acatgtctcctcaaatgtttttatttcaaagagtacactaataaaaaactcaagcatttcttgtaattctt-ttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 12160405  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  12160406 gtgtgtgtgtg 12160416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17045902 - 17045697
Alignment:
Q  9 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17045902 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17045803  T
Q  108 cctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtg 207  Q
    |||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||    
T  17045802 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17045706  T
Q  208 tgatgtcca 216  Q
    ||| |||||    
T  17045705 tgaagtcca 17045697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17048062 - 17047857
Alignment:
Q  9 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17048062 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17047963  T
Q  108 cctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtg 207  Q
    |||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||    
T  17047962 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17047866  T
Q  208 tgatgtcca 216  Q
    ||| |||||    
T  17047865 tgaagtcca 17047857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16655897 - 16655798
Alignment:
Q  118 ttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16655897 ttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 16655798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 27356728 - 27356784
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356728 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 27356784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13601277 - 13601220
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacata 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13601277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacata 13601220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 3339226 - 3339282
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3339226 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 3339282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 12776534 - 12776590
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12776534 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 12776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 13136210 - 13136266
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13136210 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 13136266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20584318 - 20584262
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20584318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 20584262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15946824 - 15946773
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946824 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15946773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 14445768 - 14445826
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14445768 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcatagacatag 14445826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 20225754 - 20225915
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |   ||| || |||||||  ||||| ||| |    
T  20225754 catcaaactcccccatacttaaatctttgtttgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaataagattaacatatgacaaaacaattaaaaac 20225853  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 162  Q
      |||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  20225854 ttatgtctcctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagcattccttgt 20225915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15619283 - 15619339
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15619283 catcaaactgccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15619339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 8686387 - 8686457
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaac-atagtagcataaaca 70  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  8686387 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaagcataaacaatagcagcataaaca 8686457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 13195458 - 13195514
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13195458 catcaaactcccacacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacat 13195514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 13068357 - 13068306
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13068357 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaccaaaagacata 13068306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 2005530 - 2005499
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005530 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 2005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16703363 - 16703307
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  16703363 catcaaactcctccatgcttgaatctttgcttaacctaaagcaaaaggtataaacat 16703307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 123584 - 123369
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  123584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 123485  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  123484 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 123385  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  123384 gtgtgtgtgaagtcca 123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 77391 - 77433
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  77391 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 77433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9583108 - 9582893
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9583108 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 9583009  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9583008 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 9582909  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  9582908 gtgtgtgtgaagtcca 9582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16119849 - 16120064
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16119849 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatatacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 16119948  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16119949 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16120048  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  16120049 gtgtgtgtgaagtcca 16120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23515278 - 23515067
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515278 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 23515179  T
Q  105 tctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgt 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23515178 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 23515079  T
Q  205 gtgtgatgtcca 216  Q
    |||||| |||||    
T  23515078 gtgtgaagtcca 23515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14551314 - 14551098
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14551314 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 14551215  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat-ttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14551214 catgtcccctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaattttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 14551115  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14551114 tgtgtgtgtgaagtcca 14551098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8718080 - 8717865
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8718080 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 8717981  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8717980 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 8717881  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  8717880 gtgtgtgtgaagtcca 8717865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13674071 - 13673856
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13674071 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 13673972  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  13673971 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatcttttttctacccaacgatcaagttttaagtgagt 13673872  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  13673871 gtgtgtgtgaagtcca 13673856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18593352 - 18593567
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |    
T  18593352 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18593451  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18593452 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18593551  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  18593552 gtgtgtgtgaagtcca 18593567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18618332 - 18618117
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |    
T  18618332 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18618233  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18618232 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18618133  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  18618132 gtgtgtgtgaagtcca 18618117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4312772 - 4312564
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |     
T  4312772 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaact 4312673  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4312672 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 4312573  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  4312572 gtgtgtgtg 4312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 538755 - 538964
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  538755 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 538854  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagca-tttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||| || |  || |||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  538855 catgtctcctgaagggttttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 538954  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  538955 tgtgtgtgtg 538964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 8780936 - 8781146
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||  |    
T  8780936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaaa 8781035  T
Q  101 c--atgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |  |||||||||||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |    
T  8781036 cttatgtctcctcaaaggcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagtttcaaggta 8781135  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  8781136 gtgtgtgtgtg 8781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9004165 - 9003958
Alignment:
Q  3 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| |      
T  9004165 tcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagtttatcatatgacaattcaattaaaactt 9004066  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtg 201  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9004065 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaattacaaactcaagcatttcttgtgatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 9003966  T
Q  202 tgtgtgtg 209  Q
    | ||||||    
T  9003965 tatgtgtg 9003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20108584 - 20108375
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||||||||||| |    
T  20108584 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataaaacaaggttatcatatgagaattcaattaaaac 20108485  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      |||||||||||||| |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20108484 tgatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 20108385  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  20108384 tgtgtgtgtg 20108375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9264939 - 9265145
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaat-taaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   ||| || |||||||||||||  ||| |    
T  9264939 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataagcaagattaacatatgacaattcaataaaaaac 9265038  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      ||||||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9265039 ttatgtctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 9265138  T
Q  200 tgtgtgt 206  Q
    |||||||    
T  9265139 tgtgtgt 9265145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 12548805 - 12549012
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | | |||||| ||||||||| |||||||      
T  12548805 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaat- 12548903  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12548904 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtccactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagcttcaagtgag 12549003  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  12549004 tgtgtgtgt 12549012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 48801777 - 48801963
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||| ||| |     
T  48801777 atcaaactcccccacacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcatacacatagtagcaataaacaagattat-atatgacaattcaatcaaaact 48801875  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag 188  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48801876 catgtctcctcaaaggctttaatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaag 48801963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12567229 - 12567020
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  12567229 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagaacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 12567130  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
     ||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12567129 tcatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 12567030  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  12567029 tgtgtgtgtg 12567020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13658081 - 13657873
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13658081 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcgtaaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13657982  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  13657981 catatctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcccttttccacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13657882  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  13657881 gtgtgtgtg 13657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11921307 - 11921512
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||   || |||||||||  |||||||||    
T  11921307 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcataaacatggtagcataa-catttt---cacatgacaattacattaaagca 11921402  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    || |||||||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||    |||||||    
T  11921403 cacgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaacgcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatctagtcctaagtgag 11921502  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  11921503 tgtgtgtgtg 11921512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16532311 - 16532100
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||| |||||||||  ||||||||    
T  16532311 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16532212  T
Q  100 acatgtctcctcaaagac-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagcttcaagtg 197  Q
    |||||||||||||||| | || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||  | || ||    
T  16532211 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16532112  T
Q  198 agtgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||||    
T  16532111 agtgtgtgtgtg 16532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16633351 - 16633562
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||| |||||||||  ||||||||    
T  16633351 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16633450  T
Q  100 acatgtctcctcaaagac-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagcttcaagtg 197  Q
    |||||||||||||||| | || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||  | || ||    
T  16633451 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16633550  T
Q  198 agtgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||||    
T  16633551 agtgtgtgtgtg 16633562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 16465616 - 16465791
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||  ||||||| |  |||||| ||    
T  16465616 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcat-aaca--tttctc--atgacaaatacattaaaaca 16465710  T
Q  101 catgtctcctc-aaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaaccca 179  Q
    || |||||||| |||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  16465711 cacgtctcctcaaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaaccca 16465791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 4461242 - 4461311
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaca 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4461242 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggcagcataaaca 4461311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 825839 - 825783
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  825839 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 825783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 14221718 - 14221774
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14221718 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 14221774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15916776 - 15916832
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15916776 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15916832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18287817 - 18287761
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18287817 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 18287761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27291552 - 27291496
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27291552 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27291496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 15206584 - 15206647
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  15206584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcatagacatagcagca 15206647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5397331 - 5397273
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 59  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5397331 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 5397273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15065984 - 15065935
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065984 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 15065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 9194544 - 9194597
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 54  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9194544 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaa 9194597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 6713072 - 6713124
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713072 aaactcccctatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 6713124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Original strand, 4791383 - 4791478
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-ataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaa 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||| ||||| ||  ||| || |||||||||||||||||    
T  4791383 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcagaatgcatagacatggcagcaataaaaag-attaacatatgacaattcaattaaa 4791478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15348587 - 15348532
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15348587 atcaaacttccccaaacttgaatctttgtttgtcctcaagtaaaaggcataaacat 15348532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15522557 - 15522504
Alignment:
Q  17 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca-tagtagcataaac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15522557 acttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacattagcagcataaac 15522504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15940773 - 15940731
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15940773 atcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 15940731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15699770 - 15699555
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15699770 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15699671  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15699670 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15699571  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  15699570 gtgtgtgtgaagtcca 15699555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22165549 - 22165764
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22165549 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22165648  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22165649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22165748  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  22165749 gtgtgtgtgaagtcca 22165764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22244027 - 22243812
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22244027 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22243928  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22243927 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22243828  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  22243827 gtgtgtgtgaagtcca 22243812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22061503 - 22061718
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22061503 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22061602  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22061603 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22061702  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  22061703 gtgtgtgtgaagtcca 22061718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20170458 - 20170242
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagtttta-tcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  20170458 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagtttaaatcaaatgacaatt-aattaaagc 20170360  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  20170359 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtga 20170260  T
Q  199 gtgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20170259 gtgtgtgtgtgaagtcca 20170242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24855245 - 24855453
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24855245 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24855343  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24855344 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24855443  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  24855444 tgtgtgtgtg 24855453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22767116 - 22767331
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22767116 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtaacatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 22767214  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22767215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 22767314  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
     |||||||||| |||||    
T  22767315 agtgtgtgtgaagtcca 22767331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20107784 - 20107989
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagcacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | || |||||||||||||| ||| |  ||    
T  20107784 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagataaacatatgacaattcaattgaaaacttat 20107883  T
Q  104 gtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtg 203  Q
    |||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20107884 gtctcctcaaaggctttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtg 20107983  T
Q  204 tgtgtg 209  Q
    ||||||    
T  20107984 tgtgtg 20107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23023302 - 23023093
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataa-acagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  23023302 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcttaaacatggtagcataagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 23023203  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23023202 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23023103  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    |||| |||||    
T  23023102 tgtgcgtgtg 23023093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25625899 - 25625691
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  25625899 catcaaactcccccatacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggtgtaaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 25625800  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     ||||||||| || | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25625799 tatgtctccttaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 25625700  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  25625699 gtgtgtgtg 25625691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18448349 - 18448140
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18448349 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacttggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18448250  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||| |||||||||     
T  18448249 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcatcccaacagtcaagtttcaagtgac 18448150  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  18448149 tgtgtgtgtg 18448140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18854226 - 18854026
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  18854226 catcaaactcccccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaataca 18854127  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18854126 catgtctcctcaagggctttaatttccagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 18854027  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  18854026 g 18854026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21560554 - 21560762
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    ||| ||||| ||||||| ||    
T  21560554 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgtcaatttaattaaaaca 21560653  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  21560654 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 21560753  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  21560754 gtgtgtgtg 21560762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25631269 - 25631477
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25631269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaggaaaaatgcataaacatggtagcaataaacaagattat-atatgacaattcaattaaaac 25631367  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      || |||| |||||| ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25631368 ttatatctcttcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 25631467  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  25631468 tgtgtgtgtg 25631477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2181269 - 2181063
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2181269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2181170  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||  | |  | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  2181169 acatgtctcctcaagggcttaaatttcgagcgcacattaatcacaaacttaagcatttctcgtaatccttattcaactcaacaaccaagtttcaagtgag 2181070  T
Q  200 tgtgtgt 206  Q
    |||||||    
T  2181069 tgtgtgt 2181063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25963457 - 25963248
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| || |||||||||||||||||      
T  25963457 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25963358  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
       ||||||||||||| |||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  25963357 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25963258  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  25963257 tgtgtgtgtg 25963248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25968104 - 25967895
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| || |||||||||||||||||      
T  25968104 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25968005  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
       ||||||||||||| |||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  25968004 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25967905  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  25967904 tgtgtgtgtg 25967895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 30671807 - 30671995
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| || |||||||||||||||||      
T  30671807 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 30671906  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag 188  Q
       ||| ||| ||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30671907 ttgtgtttccccaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaag 30671995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29595904 - 29595697
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |   |||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  29595904 catcaaactccctcacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcataaataagattatcacatgacgatttaattaaaaca 29595805  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||| ||||| ||| |    
T  29595804 catgtctccccaagggctttaatttcaagtgtacactaataaaaaactcaaacatttcttgtaatcctttttcaacccaataatcaagtttcaaatgact 29595705  T
Q  201 gtgtgtgt 208  Q
    ||||||||    
T  29595704 gtgtgtgt 29595697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 19585571 - 19585750
Alignment:
Q  30 cttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcata-aacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaaagacttaaatcccaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||   ||| || |||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |||  ||  |||    
T  19585571 cttgtcctcaagcaaaaggcatatacatagcagcatagaacaagatta-catatgacaatacaattaaaactcatgtctcctaaaaggcttttatttcaa 19585669  T
Q  129 atgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||    
T  19585670 acgtacactaatcacaaacacaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttttaagtgagtgtgtatgtg 19585750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 18184874 - 18184943
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaca 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18184874 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca 18184943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 20016344 - 20016443
Alignment:
Q  117 cttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcc 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20016344 cttaaatcccaaaatgtacactaattgcaaactcaagtatttcttgaaatctttattctatccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcc 20016443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 20218981 - 20219048
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20218981 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaa 20219048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 22113006 - 22113073
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22113006 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaa 22113073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 35271028 - 35270971
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacata 58  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35271028 catcaaacacccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacata 35270971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18731931 - 18731868
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18731931 catcaaactcctccacacttgaatcttagcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18731868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11204060 - 11204004
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11204060 catcaaactcccccacacttaaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11204004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29686657 - 29686587
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca-tagtagcataaaca 70  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29686657 catcaaactctcccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaagaggcataaacattagcagcataaaca 29686587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 23517835 - 23517887
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23517835 aaactcccccatacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcatacacat 23517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20595831 - 20596046
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20595831 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20595930  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20595931 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20596030  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  20596031 gtgtgtgtgaagtcca 20596046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20602117 - 20602332
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20602117 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20602216  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20602217 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20602316  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  20602317 gtgtgtgtgaagtcca 20602332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20608408 - 20608623
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20608408 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20608507  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20608508 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20608607  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  20608608 gtgtgtgtgaagtcca 20608623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15735749 - 15735534
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15735749 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15735650  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15735649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15735550  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  15735549 gtgtgtgtgaagtcca 15735534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23748266 - 23748051
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23748266 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 23748167  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  23748166 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 23748067  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  23748066 gtgtgtgtgaagtcca 23748051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 23710701 - 23710892
Alignment:
Q  26 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaatt-caattaaagcacatgtctcctcaaagacttaaatc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23710701 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 23710800  T
Q  125 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23710801 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttatttaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 23710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24940749 - 24940540
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24940749 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24940650  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24940649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtaaactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 24940550  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    || |||||||    
T  24940549 tgagtgtgtg 24940540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18073115 - 18072900
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18073115 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 18073017  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  18073016 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 18072917  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18072916 tgtgtgtgtgaagtcca 18072900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24953174 - 24953389
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24953174 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggtataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24953272  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24953273 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24953372  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24953373 tgtgtgtgtgaagtcca 24953389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20622359 - 20622170
Alignment:
Q  19 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaaagact 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20622359 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacaattaaatcaaatgacaatttaattaaagcacatgtctcctcaagggct 20622260  T
Q  119 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20622259 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtgtgtgtgt 20622170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20790714 - 20790929
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  20790714 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 20790812  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  20790813 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacctaacaatcaagtttcaagcgag 20790912  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20790913 tgtgtgtgtgaagtcca 20790929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23600636 - 23600845
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataa-acagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||||| ||||| | |    
T  23600636 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattagaac 23600735  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23600736 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23600835  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  23600836 tgtgtgtgtg 23600845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24219961 - 24219752
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  24219961 catcaaactcccccacacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 24219862  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24219861 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 24219762  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  24219761 tgtgtgtgtg 24219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20444843 - 20445048
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagcacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  | | |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20444843 aaactcccccacacttgaatctttgattgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaaacacat 20444942  T
Q  104 gtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtg 203  Q
    |||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20444943 gtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtg 20445042  T
Q  204 tgtgtg 209  Q
    ||||||    
T  20445043 tgtgtg 20445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21387605 - 21387410
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||    || || |||||||||||||| ||| |    
T  21387605 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaatgcataaacatagcagcacacacaagactaacatatgacaattcaattgaaaac 21387506  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaag 195  Q
      ||||||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21387505 ttatgtctcctcaaagactttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaag 21387410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20916456 - 20916660
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  |   ||| || | ||||||| ||| ||| |    
T  20916456 catcaaactcccctacacatgaatttttggttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagctgcataaaataagatta-cataggacaattaaatcaaaac 20916554  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
     ||||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20916555 tcatgtctcctcaaaggcttttatttcaaccgtacactaatcacgaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 20916654  T
Q  200 tgtgtg 205  Q
    ||||||    
T  20916655 tgtgtg 20916660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22948688 - 22948518
Alignment:
Q  40 agcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacacta 138  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||  |  |||| | ||||||| ||| |||  |||  ||||||||    
T  22948688 agcaaaaggcataaacatggcagcataaacacgattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgttttctcaaaggctttaatttcaagcgtacacta 22948589  T
Q  139 atcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22948588 atcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 22948518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20575680 - 20575510
Alignment:
Q  38 caagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacac 136  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||    
T  20575680 caagcaaaaggcatagacatagcagcataaaacaagatta-catatggcaattcaatcaaaactcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacac 20575582  T
Q  137 taatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  20575581 taatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccgacaatcaagtttcaagtgagtgcgtgtgt 20575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22317513 - 22317569
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22317513 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22317569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 25006808 - 25006864
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25006808 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 25006864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30759655 - 30759711
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30759655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 30759711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 18484212 - 18484275
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18484212 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 25116171 - 25116221
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116171 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 25116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26847859 - 26847803
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26847859 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaccaaaaggcatagacat 26847803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 25175261 - 25175306
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175261 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 25175306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22855775 - 22855723
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22855775 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22855723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27270607 - 27270563
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27270607 atcaaactcccccacacttgaatcattgcttgtcctcaagcaaaa 27270563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17412784 - 17412736
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 50  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17412784 atcaaactcccccatacttgaatcattgtttgtcgtcaagcaaaaggca 17412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Original strand, 22317639 - 22317719
Alignment:
Q  128 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||    
T  22317639 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22317719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 11496614 - 11496829
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11496614 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 11496713  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11496714 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 11496813  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  11496814 gtgtgtgtgaagtcca 11496829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13823128 - 13822913
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13823128 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 13823029  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13823028 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13822929  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  13822928 gtgtgtgtgaagtcca 13822913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 42709731 - 42709940
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42709731 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 42709830  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42709831 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 42709930  T
Q  201 gtgtgtgtga 210  Q
    ||||||||||    
T  42709931 gtgtgtgtga 42709940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15254563 - 15254349
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15254563 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacgtagttgcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 15254464  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    |||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15254463 catgtctccttaagggtttaaatccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 15254364  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcc 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  15254363 gtgtgtgtgaagtcc 15254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10630965 - 10630758
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataa-acagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  10630965 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagaca-tattatcatatgacaatttaattaaagc 10630867  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10630866 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 10630767  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  10630766 tgtgtgtgt 10630758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3354855 - 3354646
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  3354855 catcaaactcccccacacttgaatagttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 3354756  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3354755 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3354656  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  3354655 tgtgtgtgtg 3354646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18081459 - 18081669
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcata-aacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18081459 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 18081558  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  18081559 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 18081658  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  18081659 gtgtgtgtgtg 18081669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 45234232 - 45234441
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  45234232 catcaaactcccccagacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtggcataaaacaagattatcatatgacaattaaattaaaac 45234331  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      |||||||||||||| |||  ||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45234332 taatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaactatcaagtttcaagtgag 45234431  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  45234432 tgtgtgtgtg 45234441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18292153 - 18291945
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18292153 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagaaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18292054  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18292053 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaagtcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 18291954  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
     ||||||||    
T  18291953 cgtgtgtgt 18291945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17484910 - 17485118
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17484910 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaaacaagattatcacatgacaatttaattaaaac 17485009  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      |||||||||||  | |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17485010 ttatgtctcctcaggggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 17485109  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  17485110 tgtgtgtgt 17485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 56580539 - 56580748
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||  |||||||| |||||||||    
T  56580539 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatctgacaattaaattaaagc 56580638  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||   ||||||  | ||||||    
T  56580639 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcatttttcaacccataaatcaagtcttaagtga 56580738  T
Q  199 gtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||    
T  56580739 gtgtgtgtgt 56580748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38426938 - 38426745
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||       |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  38426938 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaata-------ata-------ttatcatatgacaatttaattaaaaca 38426853  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  38426852 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaagccaacaatcaagtttcaagtgagt 38426753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8092427 - 8092634
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaag 98  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||   |||  | | |||||||||| | |||     
T  8092427 catcaaactttcccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaagacataaacatagtaacaataaacaagattaatatacgacaattcaactgaaaa 8092526  T
Q  99 cacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |  ||||||| | |||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  8092527 cttatgtctcattaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtga 8092626  T
Q  199 gtgtgtgt 206  Q
    ||||||||    
T  8092627 gtgtgtgt 8092634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 14653998 - 14654061
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14653998 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 14654061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15865701 - 15865647
Alignment:
Q  3 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15865701 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15865647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10650603 - 10650547
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10650603 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10650547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15260109 - 15260165
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15260109 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacat 15260165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16682969 - 16682913
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16682969 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcatcaagcaaaaggcatagacat 16682913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15409585 - 15409534
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409585 catcaaactcccccacactagaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15409534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 9488878 - 9488948
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca-tagtagcataaaca 70  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  9488878 catcaaactcccccatacttcaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatgaacattagcagcataaaca 9488948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 17296250 - 17296298
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 50  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17296250 atcaaactcccccatgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 17296298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22665277 - 22665062
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22665277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22665178  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22665177 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22665078  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  22665077 gtgtgtgtgaagtcca 22665062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 117758 - 117543
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  117758 catcaaactcccccacacttgcatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 117659  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  117658 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 117559  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  117558 gtgtgtgtgaagtcca 117543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22044660 - 22044875
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22044660 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 22044759  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22044760 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22044859  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  22044860 gtgtgtgtgaagtcca 22044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25357726 - 25357511
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25357726 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 25357627  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25357626 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 25357527  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  25357526 gtgtgtgtgaagtcca 25357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11615 - 11823
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11615 catcaaactcccccacacttgcctctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 11714  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11715 catatctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 11814  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  11815 gtgtgtgtg 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16775866 - 16775651
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16775866 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 16775767  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  16775766 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 16775667  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  16775666 gtgtgtgtgaagtcca 16775651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24795285 - 24795500
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24795285 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtaccatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24795384  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  24795385 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 24795484  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  24795485 gtgtgtgtgaagtcca 24795500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17590622 - 17590407
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17590622 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcagcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 17590523  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17590522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttctggaaatctctattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 17590423  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17590422 gtgtatgtgaagtcca 17590407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27627796 - 27627580
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  27627796 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttgaatcaaatgacaaattaattaaagca 27627697  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcc-caaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27627696 catgtctcctcaagggcttaaatcctaaaatgtacattaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 27627597  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27627596 tgtgtgtgtgaagtcca 27627580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25144757 - 25144966
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  25144757 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 25144856  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25144857 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 25144956  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  25144957 tgtgtgtgtg 25144966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 5500265 - 5500473
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5500265 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 5500364  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  5500365 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcacgtaaaccttattcaactcaacaatcaagtttcaagtgag 5500464  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  5500465 tgtgtgtgt 5500473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25804267 - 25804475
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||| || ||||||||||||||||| |     
T  25804267 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcacaaacaagattaacatatgacaattcaattaaaact 25804366  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||| ||||||||| |||  |   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25804367 tatgtatcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaaatttcaagtgagt 25804466  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    ||| |||||    
T  25804467 gtgcgtgtg 25804475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 25370890 - 25371091
Alignment:
Q  6 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||||||| ||| | ||||    
T  25370890 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtaacaataaacaggattat-atatgacaattcaatcaaaactcatg 25370988  T
Q  105 tctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgt 204  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  25370989 tctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaattacaaactcaagcatttcttataatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgtgt 25371088  T
Q  205 gtg 207  Q
    |||    
T  25371089 gtg 25371091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 23798922 - 23799129
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||| ||| |    
T  23798922 catcaaactcccccacacttgaatctttgattatcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagatta-catatgacaattcaatcaaaac 23799020  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
     ||||||||||||||| |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  23799021 tcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtatcctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 23799120  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  23799121 tgtgtgtgt 23799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23644160 - 23643950
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |   |||||| ||||||||| |||||||||    
T  23644160 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 23644061  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaa-atgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    || ||||||||||||| |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || ||||||  | |||||     
T  23644060 acgtgtctcctcaaaggcttttatttcaaggagtacactaatcacaaactcaagcatttcctgtaatcctttttcaaccctacaatcaagtcttaagtgg 23643961  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    ||| |||||||    
T  23643960 gtgcgtgtgtg 23643950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 24178193 - 24178348
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  24178193 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaatttaattaaaaac 24178292  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcat 155  Q
      |||||||||||||  |||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24178293 ttatgtctcctcaaaagcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcat 24178348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24502297 - 24502168
Alignment:
Q  81 atgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaaccca 179  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24502297 atgacaattcaattaaaaacttatgtctcctcaaatgcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccca 24502198  T
Q  180 acgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24502197 acaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24502168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24506865 - 24506777
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||    
T  24506865 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaatt 24506777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23159385 - 23159441
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23159385 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23159441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23570642 - 23570698
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23570642 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23570698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27631711 - 27631655
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27631711 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27631655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 27768816 - 27768872
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27768816 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27768872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 24171561 - 24171510
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171561 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 24171510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24321380 - 24321314
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca-tagtagcataaaca 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24321380 aaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcgtaaacattagtagcataaaca 24321314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 25337651 - 25337720
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaca 70  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25337651 catcaaattcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaatatagcagcataaaca 25337720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23257570 - 23257625
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257570 catcaaactcccc-atacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 23257625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23648165 - 23648123
Alignment:
Q  20 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23648165 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagtag 23648123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 29955913 - 29955868
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 47  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29955913 atcaaacttcccgatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 29955868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 19805618 - 19805662
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 46  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19805618 atcaaactcccccacactagaaccattgcttgtcctcaagcaaaa 19805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 21512567 - 21512615
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 50  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21512567 atcaaattcccccatgcttgaatccttgcttgtcctcaagcaaaaggca 21512615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 24019068 - 24019123
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  24019068 atcaaattcccccatacttgaatctttttttgtcctcaaacaaaagacataaacat 24019123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 17334606 - 17334648
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  17334606 atcaaactcccccacacttgaaccattgattgtcctcaagcaa 17334648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27631585 - 27631506
Alignment:
Q  128 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||    
T  27631585 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgtg 27631506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27047089 - 27046874
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27047089 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagctccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 27046990  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27046989 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 27046890  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  27046889 gtgtgtgtgaagtcca 27046874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 17094601 - 17094816
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  17094601 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 17094700  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17094701 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 17094800  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  17094801 gtgtgtgtgaagtcca 17094816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20237671 - 20237456
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20237671 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatgcagtagcacaaataattttatcaaatgacaattcgattaaagca 20237572  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20237571 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaaccacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagctttaagtgagt 20237472  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    || ||||||| |||||    
T  20237471 gtttgtgtgaagtcca 20237456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21798662 - 21798878
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  21798662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 21798761  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21798762 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatttttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 21798861  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21798862 tgtgtgtgtgaagtcca 21798878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8653327 - 8653126
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||| ||| | |||    
T  8653327 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacaagattat-atatgacaattcaatcaaaactcat 8653229  T
Q  104 gtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtg 203  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||    
T  8653228 gtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgtgtgtg 8653129  T
Q  204 tgt 206  Q
    |||    
T  8653128 tgt 8653126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 52938621 - 52938830
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  52938621 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataatcatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaatc 52938720  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  52938721 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 52938820  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  52938821 tgtgtgtgtg 52938830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3990154 - 3989944
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  3990154 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 3990055  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  3990054 acatgtctcgtcaaaggcttttatttcaaagagtgcactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 3989955  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  3989954 gtgtgtgtgtg 3989944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19364244 - 19364043
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||   ||| || ||||||||||||| ||| |    
T  19364244 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagcagcataaaacaagatta-catatgacaattcaatcaaaac 19364146  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
     ||||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || |  |||||||    
T  19364145 tcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccaacaatccagttctaagtgag 19364046  T
Q  200 tgt 202  Q
    |||    
T  19364045 tgt 19364043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14070720 - 14070632
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaatt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  14070720 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt 14070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 19875648 - 19875702
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875648 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 19875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 21784472 - 21784535
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21784472 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 21784535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4027895 - 4027832
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4027895 catcaaactcccccacccttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 4027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 16382578 - 16382645
Alignment:
Q  4 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaca-tagtagcataaaca 70  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16382578 caaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaataaacattagcagcataaaca 16382645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 8947515 - 8947578
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  8947515 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaggaaaagacatagacatagcagca 8947578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Original strand, 21784598 - 21784677
Alignment:
Q  128 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||    
T  21784598 aatgtacactaatcacaacttcaagtatttcttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 21784677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 18478234 - 18478276
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18478234 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 18478276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21382309 - 21382093
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaatt-caattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21382309 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagc 21382210  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21382209 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 21382110  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21382109 tgtgtgtgtgaagtcca 21382093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21098794 - 21099009
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21098794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21098893  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21098894 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21098993  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  21098994 gtgtgtgtgaagtcca 21099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21104115 - 21104330
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21104115 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21104214  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21104215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21104314  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  21104315 gtgtgtgtgaagtcca 21104330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23911655 - 23911441
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23911655 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcgattaaagca 23911556  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23911555 catgtctcctcaagggcttaaatcccagatgtacactaatcacaaacttaaacatttcttgtaatttttattcaacccaa-gatcaaatttcaagtgagt 23911457  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  23911456 gtgtgtgtgaagtcca 23911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8314683 - 8314467
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  8314683 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacatttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 8314584  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  8314583 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 8314484  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8314483 tgtgtgtgtgaagtcca 8314467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 8322846 - 8323062
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  8322846 catcaaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttaaatcaaatgacaaattaattaaagca 8322945  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8322946 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 8323045  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8323046 tgtgtgtgtgaagtcca 8323062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21843524 - 21843733
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataa-acagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  21843524 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 21843623  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21843624 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 21843723  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  21843724 tgtgtgtgtg 21843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21939996 - 21940206
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| ||||||||| |||||||||    
T  21939996 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 21940095  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  21940096 acatgtctcctcaaaggctttcatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtctgaagtga 21940195  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  21940196 gtgtgtgtgtg 21940206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20038981 - 20039189
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||| |||||| || || |||   |    
T  20038981 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagatcatcacatgacattttaactaagata 20039080  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    |||||||| |||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20039081 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacaataatcacaaactcaagtatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 20039180  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  20039181 gtgtgtgtg 20039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17620961 - 17620755
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    ||||||||| ||||||| ||    
T  17620961 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 17620862  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  17620861 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtaccctaatcataaactcaagcattctttgtaatcctttttcaa-ccaacaatcaagtttcaagtgagt 17620763  T
Q  201 gtgtgtgt 208  Q
    ||||||||    
T  17620762 gtgtgtgt 17620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16418620 - 16418830
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| |||||||||  |||||| |    
T  16418620 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaaac 16418719  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  16418720 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 16418819  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  16418820 gtgtgtgtgtg 16418830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23455154 - 23454945
Alignment:
Q  1 catcaaactccccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaag 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |  || |||||||||||||| |||     
T  23455154 catcaaactccccccacacttgaatctttgcttgtcctcgagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagactcacatatgacaattcaattgaaaa 23455055  T
Q  99 cacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
       |||||||||||||| |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23455054 tttatgtctcctcaaaggctttcatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaatccaacaatcaagtttcaagtga 23454955  T
Q  199 gtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||    
T  23454954 gtgtgtgtgt 23454945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24034230 - 24034049
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-ataaac-agttttatcaaatgacaattcaatt-aaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || | |||||||||||||| |||    
T  24034230 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacgagattaat-atatgacaattcaattgaaa 24034132  T
Q  98 gcacatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 180  Q
     |  |||||||||||||| ||| |||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24034131 acttatgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactgatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 24034049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21538765 - 21538575
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||| |    
T  21538765 catcaaaatcccccacacttaaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 21538666  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacac--taatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag 188  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21538665 ttatgtctcctcaaagactttaatttcaatcgtacactataatcacaaactccagggtttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaag 21538575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 14352181 - 14352378
Alignment:
Q  12 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaatt-caattaaagcacatgtctcct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | || | |||||||||  ||||||| | ||||||||||    
T  14352181 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaacaagataattatatgacaattaaaattaaaactcatgtctcct 14352280  T
Q  111 caaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgt 208  Q
    |  || |||  ||  |||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14352281 ccgaggcttttatttcaagcgtacactaattactaactcaagcattctttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgt 14352378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20712649 - 20712537
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  20712649 catcaaactcccctacacttaaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaacattatcatatgacaatttaatcaaagc 20712550  T
Q  100 acatgtctcctca 112  Q
    |||||||||||||    
T  20712549 acatgtctcctca 20712537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11346953 - 11347009
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11346953 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11347009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19767740 - 19767684
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19767740 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 19767684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22370158 - 22370102
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22370158 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20002330 - 20002279
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002330 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 20002279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22033555 - 22033611
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22033555 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22033611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22099655 - 22099711
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22099655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22099711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22102608 - 22102552
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22102608 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22102552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21831232 - 21831181
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21831232 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 21831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 22817806 - 22817755
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22817806 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaagacata 22817755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20712539 - 20712470
Alignment:
Q  140 tcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  20712539 tcacaaactcaatcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtctcaaatgagtgtgtgtgtg 20712470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 18572977 - 18573025
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 50  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18572977 atcaaactcccccatacttgaattttttcttgtccttaagcaaaaggca 18573025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 19902174 - 19902216
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19902174 atcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 19902216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 615 - 831
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  615 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaagcataaatatggtagcacaaacaattttatcaaatcacaattcgattaaagca 714  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag-cttcaagtgag 199  Q
    || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  715 caagtctcctcaagggattaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttttaagtgag 814  T
Q  200 tgtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  815 tgtgtgtgtgaagtcca 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1038
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  1253 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 1154  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  1153 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 1054  T
Q  201 gtgtgtgtgatgtcca 216  Q
    || ||||||| |||||    
T  1053 gtatgtgtgaagtcca 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 3524 - 3460
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat 65  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3524 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcat 3460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 220
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||  |    
T  428 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcgtatgacaatttaattaaaata 329  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||| |||   ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  328 catgtctcctcaagggctttaatttaaagcgtacactaatcacaaactgaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 229  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  228 gtgtgtgtg 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2496
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  2287 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 2386  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  2387 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 2486  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  2487 tgtgtgtgtg 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 831
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| ||||||||| |||||||||    
T  1041 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaattaacattatcatatgacaattaaattaaagc 942  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  941 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 842  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  841 gtgtgtgtgtg 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11264 - 11064
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11264 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 11165  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  11164 catgtctcctcaagggctttaattttaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaaaaattaagtttcaagtgagt 11065  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  11064 g 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 2852 - 3058
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2852 catcaaactcccacatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2951  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    ||||||||||| || | ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2952 acatgtctccttaagggctttaatttcatgtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3051  T
Q  200 tgtgtgt 206  Q
    |||||||    
T  3052 tgtgtgt 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 687 - 482
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||       
T  687 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgtataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaatt 588  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||||||||||||  |||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  587 aatgtctcctcaaaagcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaaccattttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 488  T
Q  201 gtgtgt 206  Q
    ||||||    
T  487 gtgtgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 7941
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | || | |||||| || || |||| ||    
T  8149 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaagcaaaaggcataaacacggtagcataaacaagatcattacatgacattttaactaaaaca 8050  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    |||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8049 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacactaatcacaaactcgagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 7950  T
Q  201 gtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||    
T  7949 gtgtgtgtg 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 251870 - 252079
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaa-cagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || | ||||||  |||||||| ||||||| |    
T  251870 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaatggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatttgacaatttaattaaaac 251969  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  251970 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactagtcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagttccaagtgag 252069  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  252070 tgtgtgtgtg 252079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14869
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  14662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgaaaatttaattaaaaca 14761  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14762 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacattattcataaactcaagcatttcttgtaaaccttatgaaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 14861  T
Q  201 gtgtgtgt 208  Q
    ||||||||    
T  14862 gtgtgtgt 14869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1108
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |   |||||| |||||||||  ||||| ||    
T  1318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaggc 1219  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  1218 acatgtcccctcaaaggcttttatttcaaagagtacattaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 1119  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  1118 gtgtgtgtgtg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 58628 - 58838
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| |||||||||  ||||||||    
T  58628 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 58727  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||  |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  58728 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaaccatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 58827  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||    
T  58828 gtgtgtgtgtg 58838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 97726 - 97936
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac-agttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |   |||||| |||||||||  ||||||||    
T  97726 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 97825  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtga 198  Q
    |||||||||||||||  |||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  97826 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 97925  T
Q  199 gtgtgtgtgtg 209  Q
    || ||||||||    
T  97926 gtatgtgtgtg 97936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 121162 - 120954
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | | || | | ||||||||| |||| || |    
T  121162 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatatttttatatgacaatttaattgaaac 121063  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||| | |||||| |    
T  121062 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaaaccttattcaacccaacaaccaagttccaagtgtg 120963  T
Q  200 tgtgtgtgt 208  Q
    |||||||||    
T  120962 tgtgtgtgt 120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 510 - 718
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||| ||| |    
T  510 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcataaaacaagatta-catatgacaattcaatcaaaac 608  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgag 199  Q
      || ||||||||||| |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  609 ttatatctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 708  T
Q  200 tgtgtgtgtg 209  Q
    ||||||||||    
T  709 tgtgtgtgtg 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12609 - 12450
Alignment:
Q  3 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-ataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||   |    
T  12609 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattat-atatgacaattcaatcaaaattc 12511  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 162  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510 atgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Original strand, 232789 - 232948
Alignment:
Q  3 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagc-ataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagcac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||   |    
T  232789 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattat-atatgacaattcaatcaaaattc 232887  T
Q  102 atgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 162  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232888 atgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 232948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 164403 - 164562
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  164403 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 164502  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttct 159  Q
    |||||||||||||| | ||| |||   ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  164503 acatgtctcctcaagggcttcaatttaaagcgcacactaatcacaaactcaagcatttct 164562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 172316 - 172248
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaca 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  172316 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaaca 172248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 162058 - 161995
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  162058 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 161995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8869 - 8720
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcat-aaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  8869 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 8770  T
Q  100 acatgtctcctcaaagacttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaact 148  Q
    |||||||||||||||| |||  ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  8769 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaact 8720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13002 - 13207
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||   |||||| || | |||||||||||| |     
T  13002 catcaaactccgccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaagaggcataaacatagtagcataaccaagattatcatataataattcaattaaaact 13101  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagt 200  Q
     |||||| ||||||| |||  ||  ||   ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  13102 tatgtcttctcaaaggcttttatttcatgcgtacactaataccatactcaagcatttcttgtaatctttattaaacccaagaatcaagtttcaagtgagt 13201  T
Q  201 gtgtgt 206  Q
    | ||||    
T  13202 gcgtgt 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 35104 - 35307
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        | |||||||||||| |||| ||    
T  35104 catcaaactcccccacacttgaatctttccttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca--------agatgacaattcaactaaaaca 35195  T
Q  101 catgtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaa------tttttattcaacccaacgatcaagcttcaa 194  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||      ||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  35196 catgtctcctttaaggctttaatttcaagtgtacagtaatcacaaactcaagcattcttggtaatcttttttttttttcaacccaacaatgaagtttcaa 35295  T
Q  195 gtgagtgtgtgt 206  Q
     |||||||||||    
T  35296 atgagtgtgtgt 35307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 10206 - 10319
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataa-acagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  10206 catcaaactcccccaaacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 10305  T
Q  100 acatgtctcctcaa 113  Q
    ||||||||||||||    
T  10306 acatgtctcctcaa 10319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 38508 - 38610
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca-taaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| | | |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  38508 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcacaaaaaaatattatcatatgacaatttaattaaaac 38607  T
Q  100 aca 102  Q
    |||    
T  38608 aca 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Original strand, 38625 - 38675
Alignment:
Q  131 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaac 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  38625 gtacattaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaac 38675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5295 - 5232
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5295 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 5232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37922 - 37722
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacagttttatcaaatgacaattcaatt-aaagcacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||   |||  | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  37922 aaactcccccacacttgaatcttttcttgccctcaagcaaaagccataaacatagcaacataaacaaaattaaaatatgacaattcaattaaaatcttat 37823  T
Q  104 gtctcctcaaagacttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtg 203  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  37822 gtctcctcaaaggctt-aatttcaagtgtacactaatcacaacatcaagtattccttgcga-acctattcaacccaac-aacaagtttcaagtgagtgtg 37726  T
Q  204 tgtg 207  Q
    ||||    
T  37725 tgtg 37722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 42300 - 42237
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42300 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 42237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 50506 - 50569
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50506 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 50569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 88361 - 88403
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  88361 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 88403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 912
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  970 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1834
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1902 catcaaactcccccacacttgaatctttgattgttctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaac 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2818 - 2762
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 12794 - 12743
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 22159 - 22218
Alignment:
Q  5 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22159 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 22218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10776 - 10720
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10776 catcaaactcccccacactttaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 54849 - 54905
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54849 catcaaactcccccacgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 54905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2859
Alignment:
Q  142 acaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgtg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2926 acaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 37743 - 37806
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37743 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaatagacatagcagca 37806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Original strand, 37869 - 37948
Alignment:
Q  128 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagcttcaagtgagtgtgtgtgt 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  37869 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-atcaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1193
Alignment:
Q  2 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1248 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacat 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22818 - 22756
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  22818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagc-aaaggcatagacatagcagca 22756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 45228 - 45291
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagca 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  45228 catcaaactcccccacacctgaatctttgcttgttctcaagcaaaagacatagacatagcagca 45291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 72572 - 72622
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  72572 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 72622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 84762 - 84812
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  84762 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 84812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18263 - 18218
Alignment:
Q  1 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18263 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 18218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 83174 - 83214
Alignment:
Q  17 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 57  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83174 acttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 83214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 3291 - 3251
Alignment:
Q  4 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 44  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3291 caaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 3251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University