View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9264A_low_61 (Length: 401)

Name: NF9264A_low_61
Description: NF9264A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9264A_low_61
NF9264A_low_61
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (165-394)||(44241349-44241579)
chr1 (165-387)||(29001730-29001953)
chr1 (165-394)||(9869097-9869327)
chr1 (165-394)||(31072310-31072540)
chr1 (165-394)||(1174597-1174828)
chr1 (163-387)||(4599527-4599753)
chr1 (165-387)||(6238654-6238877)
chr1 (165-387)||(39053338-39053561)
chr1 (165-387)||(39059710-39059933)
chr1 (165-387)||(42091895-42092118)
chr1 (165-387)||(45015780-45016003)
chr1 (165-387)||(26621468-26621692)
chr1 (165-387)||(41305514-41305738)
chr1 (165-387)||(44916329-44916560)
chr1 (165-387)||(41297515-41297739)
chr1 (165-382)||(11913262-11913479)
chr1 (196-387)||(27240161-27240354)
chr1 (165-387)||(43686626-43686851)
chr1 (165-387)||(32797735-32797945)
chr1 (165-387)||(41299188-41299412)
chr1 (165-386)||(1115982-1116206)
chr1 (254-387)||(23764521-23764655)
chr1 (229-387)||(5445028-5445186)
chr1 (170-387)||(28413678-28413897)
chr1 (165-244)||(23762336-23762415)
chr1 (170-386)||(39806057-39806274)
chr1 (187-387)||(38672788-38672991)
chr1 (170-387)||(2824824-2825042)
chr1 (174-300)||(47646755-47646883)
chr1 (171-387)||(23251342-23251568)
chr1 (170-277)||(5357752-5357861)
chr1 (170-277)||(45620149-45620258)
chr1 (169-213)||(9316137-9316181)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (165-394)||(37026040-37026270)
chr7 (165-387)||(26601911-26602134)
chr7 (165-387)||(15914637-15914860)
chr7 (165-387)||(39432907-39433129)
chr7 (165-387)||(15949158-15949381)
chr7 (165-387)||(3924093-3924316)
chr7 (165-387)||(36875544-36875767)
chr7 (165-387)||(5049912-5050135)
chr7 (165-387)||(14287714-14287937)
chr7 (165-386)||(14298900-14299122)
chr7 (165-387)||(6795437-6795660)
chr7 (165-387)||(23612388-23612611)
chr7 (165-387)||(9642916-9643141)
chr7 (165-387)||(1948633-1948857)
chr7 (165-387)||(6020864-6021088)
chr7 (165-387)||(8185392-8185616)
chr7 (165-387)||(8192952-8193176)
chr7 (168-394)||(45433577-45433805)
chr7 (165-387)||(48353480-48353704)
chr7 (165-387)||(2446645-2446868)
chr7 (165-369)||(21642535-21642740)
chr7 (165-387)||(19089806-19090030)
chr7 (165-387)||(48347096-48347320)
chr7 (165-386)||(33850643-33850865)
chr7 (165-387)||(5056307-5056531)
chr7 (165-387)||(1378946-1379169)
chr7 (165-387)||(8142446-8142669)
chr7 (22-167)||(42422112-42422257)
chr7 (170-387)||(10831130-10831349)
chr7 (170-387)||(11024922-11025141)
chr7 (165-239)||(13774130-13774204)
chr7 (170-387)||(21901193-21901413)
chr7 (336-388)||(1942043-1942095)
chr7 (170-231)||(27954243-27954303)
chr7 (170-213)||(28442628-28442671)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (165-388)||(2643-2867)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (165-387)||(13671817-13672040)
chr6 (165-394)||(27670086-27670316)
chr6 (165-387)||(31547894-31548117)
chr6 (165-387)||(32328493-32328716)
chr6 (165-387)||(1428423-1428646)
chr6 (165-387)||(34711557-34711780)
chr6 (165-387)||(9864760-9864984)
chr6 (165-387)||(4186684-4186907)
chr6 (165-387)||(11058150-11058373)
chr6 (165-384)||(21262574-21262795)
chr6 (165-387)||(4020235-4020459)
chr6 (165-387)||(4026661-4026885)
chr6 (165-387)||(34655249-34655473)
chr6 (165-387)||(34648798-34649022)
chr6 (165-387)||(4738323-4738547)
chr6 (165-377)||(7069702-7069916)
chr6 (232-394)||(29906882-29907045)
chr6 (232-394)||(30117335-30117498)
chr6 (260-387)||(7062578-7062707)
chr6 (165-308)||(1167480-1167630)
chr6 (170-363)||(10081567-10081762)
chr6 (165-227)||(7062516-7062578)
chr6 (170-306)||(9846601-9846738)
chr6 (165-202)||(29907044-29907081)
chr6 (165-202)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (165-387)||(22359963-22360186)
chr5 (165-386)||(4973563-4973785)
chr5 (165-387)||(22313829-22314052)
chr5 (165-386)||(5876218-5876440)
chr5 (165-387)||(34357288-34357511)
chr5 (165-387)||(34359079-34359302)
chr5 (165-387)||(2957857-2958081)
chr5 (165-387)||(2966326-2966550)
chr5 (165-387)||(29980458-29980681)
chr5 (165-387)||(30041244-30041467)
chr5 (165-387)||(40958617-40958840)
chr5 (165-387)||(25894649-25894873)
chr5 (165-394)||(2438793-2439022)
chr5 (167-387)||(42150817-42151039)
chr5 (165-387)||(12505765-12505996)
chr5 (165-387)||(29414669-29414892)
chr5 (170-387)||(33794091-33794309)
chr5 (170-387)||(9843348-9843566)
chr5 (170-387)||(2156125-2156341)
chr5 (174-276)||(19853484-19853588)
chr5 (170-277)||(12918955-12919064)
chr5 (170-277)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (165-387)||(21341882-21342105)
chr2 (165-384)||(2021448-2021668)
chr2 (165-387)||(21331994-21332217)
chr2 (165-387)||(42931372-42931595)
chr2 (165-387)||(16856487-16856709)
chr2 (165-387)||(12950795-12951018)
chr2 (165-387)||(16817330-16817552)
chr2 (165-387)||(36782184-36782408)
chr2 (165-387)||(34834812-34835035)
chr2 (165-387)||(34841256-34841479)
chr2 (165-387)||(29484925-29485149)
chr2 (165-387)||(45011981-45012205)
chr2 (165-388)||(2164026-2164250)
chr2 (165-387)||(15852548-15852772)
chr2 (165-387)||(43267857-43268081)
chr2 (165-387)||(2157611-2157834)
chr2 (165-387)||(13901957-13902180)
chr2 (165-387)||(21067958-21068181)
chr2 (165-314)||(45700644-45700793)
chr2 (170-394)||(41455598-41455823)
chr2 (165-329)||(11909950-11910116)
chr2 (170-329)||(17784443-17784604)
chr2 (174-312)||(13162892-13163032)
chr2 (170-329)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (165-394)||(16405334-16405568)
chr4 (165-387)||(55462772-55462995)
chr4 (165-387)||(16838359-16838581)
chr4 (165-387)||(27590304-27590527)
chr4 (165-388)||(41372984-41373209)
chr4 (166-387)||(37368315-37368538)
chr4 (165-387)||(13594105-13594330)
chr4 (165-387)||(7780406-7780629)
chr4 (165-387)||(8103880-8104104)
chr4 (165-387)||(30238259-30238482)
chr4 (165-387)||(17456853-17457077)
chr4 (165-382)||(36754791-36755017)
chr4 (165-394)||(30211536-30211758)
chr4 (165-312)||(5660549-5660696)
chr4 (188-394)||(13003809-13004017)
chr4 (170-387)||(2947844-2948062)
chr4 (291-387)||(48914898-48914996)
chr4 (355-387)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (165-387)||(12768743-12768966)
chr8 (165-387)||(11358193-11358417)
chr8 (165-387)||(7311348-7311571)
chr8 (165-387)||(8013320-8013543)
chr8 (165-387)||(36005482-36005705)
chr8 (165-388)||(36075965-36076189)
chr8 (165-387)||(36425730-36425954)
chr8 (165-387)||(6464576-6464799)
chr8 (165-381)||(15012393-15012610)
chr8 (165-387)||(36021799-36022023)
chr8 (165-387)||(41242116-41242339)
chr8 (165-387)||(1238212-1238436)
chr8 (165-387)||(16710668-16710892)
chr8 (165-394)||(31017391-31017608)
chr8 (165-308)||(26250591-26250734)
chr8 (165-357)||(45068416-45068609)
chr8 (170-387)||(7933931-7934150)
chr8 (334-387)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (165-387)||(4311486-4311709)
chr3 (165-394)||(10941304-10941534)
chr3 (165-387)||(32746369-32746592)
chr3 (165-387)||(6036265-6036488)
chr3 (165-387)||(24179072-24179296)
chr3 (165-388)||(9570548-9570774)
chr3 (165-387)||(27501967-27502191)
chr3 (165-387)||(13014985-13015208)
chr3 (165-388)||(9577050-9577276)
chr3 (165-387)||(43995068-43995300)
chr3 (165-387)||(25893229-25893458)
chr3 (165-387)||(43931581-43931799)
chr3 (165-388)||(23068462-23068686)
chr3 (175-394)||(20651135-20651362)
chr3 (261-387)||(41353860-41353987)
chr3 (237-394)||(41354142-41354300)
chr3 (170-388)||(4590792-4591012)
chr3 (321-388)||(3577095-3577162)
chr3 (170-394)||(20952759-20952993)
chr3 (170-394)||(2785700-2785922)
chr3 (170-277)||(4644354-4644463)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (165-394)||(49683-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (165-394)||(15163-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (165-387)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (165-387)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (165-387)||(8881-9105)
scaffold0510 (165-387)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (165-306)||(12014-12155)
scaffold0513 (323-387)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (281-387)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (188-394)||(24268-24476)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241349
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44241379 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 44241349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001730
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29001753 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29001730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869097
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9869127 aatgatatttggtgtcgaacggtttatgata 9869097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072310
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31072340 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 31072310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174597
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1174628 gaatgatatttggtgtcgaacggtccatgata 1174597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599527
Alignment:
Q  163 agtattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  263 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaact 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  361 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599553 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 4599527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238654
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6238678  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238677 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6238654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053561
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39053537  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39053538 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39053561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059933
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39059909  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39059910 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091895
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 42091919  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42091918 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42091895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015780
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 45015804  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015803 aatgatatttggtgtcgaacggtc 45015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621468
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621492 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 26621468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305738
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41305714 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41305738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916329
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 355  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  356 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916360 taatttagaatgatatttggtgtcgaatggtc 44916329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297515
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  41297539 gaatgatatttggagtcgaacggtc 41297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 165 - 382
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913479
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   || |||||||| |||||  |||| ||| |||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttag---tttaaacaaacaaacaatctatcttttaaactt 11913458  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913459 agaatgatatttggtgtcgaa 11913479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 196 - 387
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240354
Alignment:
Q  196 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  296 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 27240354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686626
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 43686652  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  43686651 ggaatggtatttggtgtcgaacggtc 43686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797735
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32797758 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32797735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299412
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41299388 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116206
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggt---gttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 261  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  262 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaact 360  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  361 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116181 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 1116206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764655
Alignment:
Q  254 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  353 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 23764655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 387
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445186
Alignment:
Q  229 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 327  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  328 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgatagttggtgtcgaacggtc 5445186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413897
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28413877 gatatttggtgtcgaacggtc 28413897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806057
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  39806076 gatatttggtgtcaaacggt 39806057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 387
Target Start/End: Original strand, 38672788 - 38672991
Alignment:
Q  187 ttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaaca 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||      
T  38672788 ttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaatg 38672887  T
Q  285 agtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaatgatatttggtgtcgaa 382  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  38672888 ttttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgatatttggtgtcgaa 38672986  T
Q  383 cggtc 387  Q
    |||||    
T  38672987 cggtc 38672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 2824824 - 2825042
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||| ||| ||||  || ||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  2824824 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatgggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcataatcaag 2824923  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 367  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2824924 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaaaacaaacaacatattatcttttaacttagaatg 2825022  T
Q  368 atatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2825023 atatttggtgtcgaatggtc 2825042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  174 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 271  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  272 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 300  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251342
Alignment:
Q  171 ttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat--gatcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 268  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  269 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaac-aacaaattatcgtttaac 359  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||  |||     |||||||| ||||| |  || ||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttttattcttgcgaattagttaacttagttacaaacaaacaaacaactactcttttaac 23251370  T
Q  360 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  23251369 ttcgaatgatatttggtgtcgaacggtc 23251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  268 gaactctaat 277  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 45620149 - 45620258
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  45620149 tttggacacgaataatcttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgaagcttaatcaag 45620248  T
Q  268 gaactctaat 277  Q
    ||||||||||    
T  45620249 gaactctaat 45620258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9316181 - 9316137
Alignment:
Q  169 gtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9316181 gtttggacacgaatgatgttgttgagcaatatgtgataatatcaa 9316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026040
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37026070 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 37026040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601911
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26601934 aatgatatttggtgtcgaacggtc 26601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914637
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15914660 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432907
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttaga 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  365 atgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39432929 atgatatttgttgtcgaacggtc 39432907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949158
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15949181 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924316
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3924293 aatgatatttggtatcgaacggtc 3924316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875544
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875567 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36875544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050135
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5050112 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287714
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287737 aatgatatttggtgtcgaacggtc 14287714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298900
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  14298922 aatgatatttggtgtcaaacggt 14298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795437
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6795461  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795460 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612388
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23612411 aatgatatttcgtgtcgaacggtc 23612388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643141
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9643116 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 9643141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948857
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1948833 gaatgatatttggtgttgaacggtc 1948857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021088
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 6021063  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6021064 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 6021088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185616
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8185591  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8185592 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8185616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193176
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8193151  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8193152 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8193176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 168 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433577
Alignment:
Q  168 tgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  268 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaa 365  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  366 tgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45433605 tgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 45433577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353704
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48353679  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48353680 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48353704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446645
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2446669  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2446668 aatgatatttggtgtcgaatggtc 2446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  364 aatgat 369  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089806
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19089830 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 19089806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347320
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48347295  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48347296 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48347320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850865
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  33850843 aatgatatttggtgtcaaacggt 33850865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056531
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 5056506  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  5056507 aaatgataattggtgtcgaacggtc 5056531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378946
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1378970  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1378969 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1378946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142669
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8142645  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142646 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42422257 - 42422112
Alignment:
Q  22 gagagcatgtagctcttgtgctgctttgaaaatagtccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaacacaacgcttatcact 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  42422257 gagagcatgtagctcttgtgctgttgtgaaaatattccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaatgcagcgcttatcact 42422158  T
Q  122 ccttggtggtctacaaagtaaatgtcaatcttaaaagttatagtat 167  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42422157 tcttagtggcctacaaagcaaatggcaatcttaaaagttatagtat 42422112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831349
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10831329 gatatttggtgtcgaacggtc 10831349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025141
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11025121 gatatttggtgtcgaacggtc 11025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901413
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaa 365  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  366 tgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21901392 tgatatatggtgtcgaacggtc 21901413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942043
Alignment:
Q  336 acaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgatatttggtgtcgaacggtct 1942043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28442671 - 28442628
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28442671 tttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2643
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2667 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672040
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13672017 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13672040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670086
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27670116 aatgatatttggtgtcgaacgatccatgata 27670086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547894
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31547917 aatgatatttggtgtcgaacggtc 31547894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328716
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32328693 aatgatatctggtgtcgaacggtc 32328716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428646
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1428622  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428623 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1428646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711780
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34711756  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711757 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864984
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  9864960 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 9864984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186684
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4186707 aattatatttggtgtcgaacggtc 4186684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058373
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 11058349  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058350 aatgatatttggtgtcgaacggtc 11058373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 384
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262795
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262774 gaatgatatttggtgtcgaacg 21262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020459
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4020434  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4020435 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026885
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4026860  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4026861 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655249
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34655274  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34655273 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648798
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34648823  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34648822 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34648798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738547
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4738522  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4738523 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4738547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 165 - 377
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069916
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 7069901  T
Q  363 gaatgatatttggtg 377  Q
    ||||| |||||||||    
T  7069902 gaatggtatttggtg 7069916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 232 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906882
Alignment:
Q  232 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 330  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  331 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtctgtgata 29906882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 232 - 394
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117498
Alignment:
Q  232 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 330  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  331 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtctgtgata 30117498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 387
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062707
Alignment:
Q  260 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttta 7062677  T
Q  358 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7062678 acttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 7062707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 308
Target Start/End: Original strand, 1167480 - 1167630
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaaga-------aaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacg 257  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| |       ||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  1167480 tattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatataaaaaataaaaaaaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacg 1167579  T
Q  258 cttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 308  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167580 cttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 363
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc-aactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9846738 - 9846601
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  || | |||| || || ||| || |||||||| |||||     
T  9846738 tttgaacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatccgtatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaac 9846639  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 306  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||    
T  9846638 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattaatctc 9846601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29907081 - 29907044
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29907081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 29907044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 30117299 - 30117336
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30117299 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 30117336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359963
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  22359986 aataatatttggtgtcgaacggtc 22359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973563
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4973585 aatgatatttggtgtcgaacggt 4973563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313829
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22313852 aatgatatttggtgtcgaacggtc 22313829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 165 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876218
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggt 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5876240 aatgatatttggtgttgaacggt 5876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357511
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34357487  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357488 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359302
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34359278  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359279 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34359302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957857
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2957882  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2957881 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2957857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966326
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2966351  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2966350 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2966326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980458
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 29980482  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980481 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29980458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041467
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 30041443  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041444 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30041467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958840
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40958817 aatgatatttggtgtcgaacggtc 40958840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894873
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 25894848  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  25894849 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 25894873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438793
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  2438823 aatgatttttggtatcggacggtctgtgata 2438793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150817
Alignment:
Q  167 ttgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  267 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttaga 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  365 atgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42150839 atgatatttggagtcgaacggtc 42150817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12505996
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta--tta------aaacaaacaacaaattatcgtt 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||      ||| |||||||||| |||| ||    
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagttaacttagtttctaaataaacaacaaactatcttt 12505964  T
Q  356 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12505965 taacttaaaatggtatttggtgtcgaaaggtc 12505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414892
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  29414869 aatgatatttggtgttgaacggtc 29414892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794091
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaacattttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  33794111 gatatttggtgtcaaacggtc 33794091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843348
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 367  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  368 atatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9843367 atatttggtgtcgaacggtc 9843348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156341
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaactttcacttttacacttggttactaaaaca---aacaaattatcttttaaacttagaat 2156320  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2156321 gatatttggtgtcgaacggtc 2156341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  174 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 271  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  272 tctaa 276  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  268 gaactctaat 277  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  268 gaactctaat 277  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342105
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21342082 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 165 - 384
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021668
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacg 384  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2021648 aatgatatttggtgtcgaacg 2021668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332217
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21332194 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21332217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931595
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42931572 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42931595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856709
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16856686 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16856709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950795
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 12950819  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950818 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12950795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817552
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16817529 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16817552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782408
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36782383  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36782384 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36782408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835035
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34835011  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34835012 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34835035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841479
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34841455  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841456 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34841479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484925
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 29484950  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  29484949 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 29484925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45011981
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 45012006  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45012005 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 45011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164026
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2164051  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164050 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2164026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852548
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 15852573  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15852572 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 15852548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267857
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttg 43267882  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  43267881 aaatgataattggtgtcgaacggtc 43267857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157611
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2157635  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157634 aatgatatttggtgtcgaacggtc 2157611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902180
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 13902156  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13902157 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068181
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21068157 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 21068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 165 - 314
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455598
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 367  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  368 atatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41455624 atatttggtgtcgaacggtctgtgata 41455598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 329
Target Start/End: Original strand, 11909950 - 11910116
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttga 262  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||    
T  11909950 tattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttga 11910049  T
Q  263 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910050 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 329  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  174 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 271  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  272 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 329  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405334
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  261 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  360 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16405368 ttagaacgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 16405334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462995
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55462972 aatgatatttggtgtcgaacggtc 55462995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838581
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16838558 aatgatatttggtgtctaacggtc 16838581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590304
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  27590327 aatggtatttggtgtcgaacggtc 27590304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41372984
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  41373009 gaatgataattggtgtcgaacggtct 41372984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 387
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368538
Alignment:
Q  166 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  266 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttag 363  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttgg 37368514  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  37368515 aatggtatttggtgtcgaacggtc 37368538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594105
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594130 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 13594105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780406
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  7780430 gaatgatatttagtgtcgaacggtc 7780406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103880
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 8103905  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8103904 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8103880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238259
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30238282 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30238259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456853
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 17456878  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17456877 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 17456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 165 - 382
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755017
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 355  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  356 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 382  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 36755017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211758
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaac---- 30211731  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30211732 ----atatttggtgtcgaacggtctgtgata 30211758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 394
Target Start/End: Original strand, 13003809 - 13004017
Alignment:
Q  188 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  13003809 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 13003908  T
Q  286 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 384  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13003909 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 13004007  T
Q  385 gtctatgata 394  Q
    |||| |||||    
T  13004008 gtctgtgata 13004017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947844
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 367  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  368 atatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2947863 atatttggtgtcgaacggtc 2947844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 48914996 - 48914898
Alignment:
Q  291 acgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48914996 acgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 48914898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 387
Target Start/End: Original strand, 5660743 - 5660775
Alignment:
Q  355 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5660743 ttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 5660775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768743
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12768766 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12768743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358417
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 11358392  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  11358393 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 11358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311348
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 7311372  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311371 aatgatatttggtgtcgaacggtc 7311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013543
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8013519  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013520 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005705
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 36005681  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005682 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36005705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075965
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||      
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaacttga 36075990  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36075989 aatgatatttggtgtcgaacggtct 36075965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425954
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36425929  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36425930 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36425954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464799
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6464775  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464776 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6464799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012393
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  364 aatgatatttggtgtcga 381  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012410 aatgatatttggtgtcga 15012393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36022023
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 36021998  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  36021999 aaatgataattggtgtcgaacggtc 36022023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242339
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||      
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaacttga 41242315  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  41242316 aaagatatttggtgtcaaacggtc 41242339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238212
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1238236 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1238212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710892
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16710868 gaatgatatttggagtcgaacggtc 16710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017391
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  263 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 362  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||              ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattc--------------gcaactttgttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactta 31017423  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31017422 aaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 31017391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 165 - 308
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 308  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 165 - 357
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068609
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttta 357  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatctttta 45068609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 387
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934150
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaat 366  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| |||||||||| |  || |||||||||| ||||||||    
T  7934031 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaaccatcaactatcgtttaaccttagaat 7934129  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7934130 gatatttggtgtcgaacggtc 7934150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14393786 - 14393733
Alignment:
Q  334 aaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14393786 aaacaaacaaccaatcaacctttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 14393733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311709
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4311686 aatgatatttggtgttgaacggtc 4311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941534
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  10941504 aattatattaggtgtcaaacggtctgtgata 10941534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746369
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32746392 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32746369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036265
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  6036288 aattatatttggtgtcaaacggtc 6036265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179072
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 24179097  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24179096 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 24179072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570774
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 361  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9570748 agaatgataattggtgtcgaacggtct 9570774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502191
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 27502166  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502167 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 27502191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13014985
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13015008 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13014985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577276
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 361  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9577250 agaataataattggtgtcgaacggtct 9577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995068
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  264 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 354  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  355 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43995100 ttaacttagaatgatatttgatgtcgaatggtc 43995068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893229
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  265 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 357  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  358 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25893258 acttagaatggtatttggtgtcgaacggtc 25893229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931581
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  263 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 361  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  43931606 agaatggtatttggtgtcggacggtc 43931581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068462
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 361  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  362 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23068488 agaatgatatttggtgacgaacggtct 23068462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 394
Target Start/End: Original strand, 20651135 - 20651362
Alignment:
Q  175 acacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactct 274  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651135 acacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactct 20651234  T
Q  275 aatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt------attaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||       || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||    
T  20651235 aatcctaacgagtttcacgccttattaatctcaacttttattcttgcaaattagttcacatagtttaaacaaacaaacaaccaatcttttaacttaaaat 20651334  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20651335 gatatttggtgtcgaacagtccatgata 20651362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353860
Alignment:
Q  261 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  360 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41353887 ttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 41353860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354300
Alignment:
Q  237 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  336 acaaac-aacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattat-tttcaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtccatgata 41354300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590792
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaat 366  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaacgttttt-acgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  367 gatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4590813 gataattggtgtcgaacggtct 4590792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577162
Alignment:
Q  321 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaataatatttggtgtcgaacggtct 3577162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 394
Target Start/End: Original strand, 20952759 - 20952993
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20952759 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaagcgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 20952858  T
Q  268 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt-atcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaacaacaaatta-tcgtttaa 358  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||     ||| ||||||  ||||| || |||||    
T  20952859 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttattcttgcaaattagttaacttagttgcaaagaaacaaacaattactcttttaa 20952957  T
Q  359 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20952958 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 20952993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2785922 - 2785700
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta----tgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 265  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||    || ||||  | |||  ||||| ||||| |||    
T  2785922 tttggacacaaatgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat--atgtatatgtggtcatatggttatatgtgatgcttggtca 2785825  T
Q  266 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaatt-atcgtttaacttaga 364  Q
    || ||||||||| |||||| |||| ||||| |||   ||||||||||||| | | |  |||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||  |    
T  2785824 agaaactctaatcctaacatgttttacgccatat---tctcaactttatcttcgtattttagt--tttaaacaaacaacaaattaatgttttaacttgaa 2785730  T
Q  365 atgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  2785729 atgataatcgatgtcgaacggtccatgata 2785700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 4644354 - 4644463
Alignment:
Q  170 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 267  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| | ||||    
T  4644354 tttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaaccaag 4644453  T
Q  268 gaactctaat 277  Q
    ||||||||||    
T  4644454 gaactctaat 4644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49683
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49713 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgata 49683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15163
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtctatgata 394  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15193 aatgatattttgtgtcgaaaggtctgtgata 15163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5228
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 5204  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3486
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  364 aatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  3463 aatgatatttagtgtcgaatggtc 3486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9105
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9081 gaatgatatttggagtcgaacggtc 9105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 165 - 387
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2784
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  363 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2760 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  165 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  265 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12014 - 11949
Alignment:
Q  323 cttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 387  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12014 cttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttagaatgatatttggagtcgaacggtc 11949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99913
Alignment:
Q  281 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 99921  T
Q  380 gaacggtc 387  Q
    ||||||||    
T  99920 gaacggtc 99913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 394
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24476
Alignment:
Q  188 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  24268 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 24367  T
Q  286 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 384  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24368 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 24466  T
Q  385 gtctatgata 394  Q
    |||| |||||    
T  24467 gtctgtgata 24476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University