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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9271_low_17 (Length: 277)

Name: NF9271_low_17
Description: NF9271
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9271_low_17
NF9271_low_17
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (17-267)||(21629690-21629940)
chr6 (17-267)||(10576833-10577083)
chr6 (17-267)||(17605917-17606167)
chr6 (17-238)||(17573268-17573489)
chr6 (62-266)||(20882617-20882821)
chr6 (24-267)||(14372574-14372817)
chr6 (69-200)||(15958463-15958594)
chr6 (155-267)||(2554051-2554163)
chr6 (161-267)||(24767012-24767118)
chr6 (119-173)||(33185844-33185898)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (17-267)||(12341838-12342088)
chr3 (17-182)||(29523389-29523554)
chr3 (24-267)||(48569622-48569865)
chr3 (24-267)||(19890991-19891234)
chr3 (32-225)||(17097502-17097695)
chr3 (119-267)||(2364686-2364834)
chr3 (119-267)||(10323154-10323302)
chr3 (119-267)||(19919812-19919960)
chr3 (69-267)||(16179306-16179504)
chr3 (24-228)||(15312895-15313100)
chr3 (84-267)||(34332398-34332581)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (17-267)||(20824606-20824856)
chr8 (17-267)||(17699788-17700037)
chr8 (24-267)||(43270766-43271009)
chr8 (24-267)||(13879070-13879313)
chr8 (30-177)||(2170656-2170803)
chr8 (84-267)||(25090761-25090944)
chr8 (24-265)||(42177137-42177375)
chr8 (119-267)||(8300212-8300360)
chr8 (102-267)||(9922993-9923158)
chr8 (134-267)||(32266986-32267119)
chr8 (119-267)||(7924795-7924943)
chr8 (187-267)||(172622-172702)
chr8 (138-267)||(41664951-41665080)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (17-267)||(25857007-25857257)
chr5 (17-267)||(8299765-8300015)
chr5 (17-253)||(10777091-10777327)
chr5 (73-267)||(27795846-27796041)
chr5 (119-267)||(30731897-30732045)
chr5 (119-267)||(42514129-42514277)
chr5 (84-259)||(12825573-12825748)
chr5 (80-267)||(31641881-31642068)
chr5 (127-267)||(35983374-35983514)
chr5 (80-267)||(28535258-28535445)
chr5 (134-267)||(23238807-23238940)
chr5 (134-267)||(27116756-27116889)
chr5 (126-267)||(42928547-42928688)
chr5 (62-166)||(18089447-18089550)
chr5 (194-267)||(27165533-27165606)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (24-267)||(14440060-14440301)
chr2 (24-267)||(12645850-12646093)
chr2 (24-267)||(28253034-28253277)
chr2 (24-181)||(40176982-40177139)
chr2 (151-267)||(33515790-33515906)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (17-248)||(43388674-43388903)
chr1 (119-267)||(6051012-6051160)
chr1 (119-267)||(35541458-35541606)
chr1 (84-250)||(11908705-11908871)
chr1 (24-266)||(47622661-47622903)
chr1 (17-59)||(16917599-16917641)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (24-266)||(2821618-2821860)
chr4 (24-267)||(48312409-48312651)
chr4 (24-267)||(54482742-54482985)
chr4 (24-267)||(55725289-55725532)
chr4 (69-267)||(5789675-5789873)
chr4 (119-267)||(23642174-23642322)
chr4 (119-267)||(47419213-47419361)
chr4 (134-267)||(19755691-19755824)
chr4 (134-267)||(19783982-19784115)
chr4 (119-267)||(11586781-11586929)
chr4 (161-267)||(23647832-23647938)
chr4 (134-267)||(1828123-1828256)
chr4 (134-267)||(15740645-15740777)
chr4 (71-267)||(19735318-19735514)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (24-267)||(31422916-31423159)
chr7 (30-267)||(37255078-37255315)
chr7 (119-267)||(4937711-4937859)
chr7 (136-267)||(11276831-11276962)
chr7 (24-181)||(25619778-25619936)
chr7 (119-267)||(17721044-17721192)
chr7 (134-265)||(29968398-29968529)
chr7 (161-267)||(235021-235127)
chr7 (202-266)||(47877475-47877539)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (119-267)||(105426-105574)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (126-267)||(3668-3809)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (167-267)||(1-101)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21629940 - 21629690
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21629940 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgaaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 21629841  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  21629840 taccacaccaacaatctcgccaaaaatcgatatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctccccaccctcacttatccc 21629741  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21629740 atctctaatcctaacaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 21629690  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10577083 - 10576833
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10577083 ccatcaccctccacccccagcaaaaacatgttccgcactgtaataactttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgaacacacaacggaacac 10576984  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10576983 taccacaccaacaatctcaccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctataaaccagccctccccaccctcacctatccc 10576884  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10576883 atctctaatcctaactatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 10576833  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17606167 - 17605917
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17606167 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgaaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 17606068  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17606067 taccacaccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgtaaaccagccctccccaccctcacctatccc 17605968  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17605967 atctctaatcctcacaatctccctccacaaagaagaacaactccggccccc 17605917  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17573489 - 17573268
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17573489 ccatctccctccacccccaacaaaaacatgttccgcattgtaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 17573390  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17573389 taccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctccccaccctcacctatccc 17573290  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctcc 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  17573289 atctctaatcctcacaatctcc 17573268  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20882821 - 20882617
Alignment:
Q  62 actttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatccc 161  Q
    |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  20882821 actttattaacaactaaatcatatagccgcctaaagcgctcacacagcggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaattggtttcggctccatccc 20882722  T
Q  162 ccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20882721 ccaccctcctcctaacacaacatgcaaaccaaccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccg 20882622  T
Q  262 gcccc 266  Q
    |||||    
T  20882621 gcccc 20882617  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14372817 - 14372574
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || || || |||||  |||| || |||||||| | ||| |||||  || |||  ||||||||| | |||||    
T  14372817 cctccacccccaataaaaacatatttctaaccgtgattactttgttgacggccaaatcatataaccgtctaaagtgctcacgaaacggaacattaccaca 14372718  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  14372717 ccaacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctgacacaacccgaaaaccaaccctccccaccctcatctatcccgtctcta 14372618  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14372617 atcctgactatctccctccaccaagaagaacaactccggccccc 14372574  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15958594 - 15958463
Alignment:
Q  69 tgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccct 168  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||  || |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  15958594 tgacagccaaatcatatagccgactaaagagctcacaaaacggaacattaccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtttcggatccatcccccaccct 15958495  T
Q  169 cctcctaacacaacctaaaaaccagccctccc 200  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  15958494 cctcctaacacaatccgaaaaccaaccctccc 15958463  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 2554051 - 2554163
Alignment:
Q  155 ccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagc 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |    
T  2554051 ccatctcccaccctcctcctaacacaagtcccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaaccctcattatctccctccaccacgaagaac 2554150  T
Q  255 aactccggccccc 267  Q
    |||||||||||||    
T  2554151 aactccggccccc 2554163  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24767118 - 24767012
Alignment:
Q  161 cccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactcc 260  Q
    ||||||||||||||||||||  |   |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24767118 cccaccctcctcctaacacacgccccaaaccagccctctccaccctcacatatcccatccctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactcc 24767019  T
Q  261 ggccccc 267  Q
    | |||||    
T  24767018 gaccccc 24767012  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Original strand, 33185844 - 33185898
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcc 173  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33185844 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtttcagccccatcccccaccctcctcc 33185898  T

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Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12342088 - 12341838
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12342088 ccatcaccctccacacccaacaaaaacatgttctgcactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagctgcctaaaacgcacacacaacggaacac 12341989  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  12341988 taccacaccaacaatctcgccaaaaattggtatcagctccatcccccaccctcctcttaacacaacctgtaaaccagccctccccaccctcacctatccc 12341889  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12341888 atctctaatcctaacaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 12341838  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29523554 - 29523389
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29523554 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggagcac 29523455  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaac 182  Q
    | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29523454 taccacaccaacaatctcgcaacaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcttaacacaac 29523389  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48569865 - 48569622
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48569865 cctcaacccccaacaagaacatgttccttaccgtgattgctttattgacggctaagtcataaagacgcataaagcgctcacacaacagaacactaccaca 48569766  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48569765 ccaacaatcttgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctccccaccctcacctatcccatctcta 48569666  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  48569665 atcctgactatctccctctaccacgaagaacagcttcggccccc 48569622  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 19890991 - 19891234
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  ||  | || |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  19890991 cctccacccccaaccagaacatgttcctcacaatgattactttattgacagctagatcgtatagccgcctaaatcgcgcacacagcggaacactaccaca 19891090  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  |||||| | |||| ||||||||    
T  19891091 ccaacaatctcacaaaaaatcgatttcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgcaaaccaaccttcctcaccctcgcttatcccatctcta 19891190  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19891191 atcctgactatctccctccaccacgaagaacaacttcggccccc 19891234  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17097695 - 17097502
Alignment:
Q  32 cccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaat 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |  |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  17097695 cccaacaagaacatgttccttaccgtgactactttgttgacagccaaatcatatagccgtctaaaacgctcacacaacggaacattaccacaccaacaat 17097596  T
Q  132 ctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaat 225  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    | |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  17097595 cacgccaaaaatcagtatcagctccgtcccccacccgtctcctaacacacgacacaaaccacccctccccaccctcgcctatcccatctctaat 17097502  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 2364686 - 2364834
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  2364686 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 2364785  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2364786 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 2364834  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10323302 - 10323154
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  10323302 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 10323203  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10323202 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaataactccggccccc 10323154  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19919960 - 19919812
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| |  |||||||||||| |||    
T  19919960 ccacaccagcaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagtctgaaaccaaccctcacctccctcacctatcccat 19919861  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19919860 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 19919812  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 267
Target Start/End: Original strand, 16179306 - 16179504
Alignment:
Q  69 tgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccct 168  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| |||||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  16179306 tgacagccaagtcatatagacgtctaaaacgcaaacacaaaggaacaattccataccaactatcgcgccaaaaatcagtattggatccatcccccaccct 16179405  T
Q  169 cctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||| ||||||||    | |||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16179406 cctactaacacacgacacaaaccatctctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctcacaatctcccgccaccaagaagaacaactccggccccc 16179504  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 15312895 - 15313100
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |  |||||  ||||||| || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  15312895 cctccacacccaacaagaacatgttccttaccgtgactactttgttgacagccaattcatatagtcgtctaaaacgctcacacaacggaacattaccaca 15312994  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccc-tcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctct 222  Q
    | ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||      |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15312995 ccaactatcacaccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctttctcctaacacacgacgcaaaccatccctccccaccctcgcctatctcatctct 15313094  T
Q  223 aatcct 228  Q
    ||||||    
T  15313095 aatcct 15313100  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34332581 - 34332398
Alignment:
Q  84 aaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacc 183  Q
    |||| |||||||| || |||||||  |||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||||||       
T  34332581 aaaggcgcctaaaccggacacacagtggaacatttccacaccaacgatcacgccaaaaatctgagtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacgt 34332482  T
Q  184 taaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
       |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34332481 cccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactcccgccccc 34332398  T

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Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 20824606 - 20824856
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824606 ccatctccctccacccccaacaaaaacatgttctgcattgtaataactttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 20824705  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20824706 taccacaccaacaatcacgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccagccctccccaccctcacctatccc 20824805  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20824806 atctctaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggccccc 20824856  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 17699788 - 17700037
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699788 ccatcaacctccacccc-aacaaaaacatgttccgcaccgaaataattttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 17699886  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17699887 taccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcacctatccc 17699986  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17699987 atctctaatcctaactatctccctccaccgcgaagagcaactccggccccc 17700037  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 43270766 - 43271009
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43270766 cctccacccccaacaagaacatgttcctcaccataattactttattgacagctaaatcatatagccgtctaaaacgcacacacaacggaacactaccaca 43270865  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  43270866 ccaacagtctggccaaaaatcggtatcggctccatcccctaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatcccatctcta 43270965  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43270966 atcctaactatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 43271009  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13879313 - 13879070
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || || ||   ||||  || |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  13879313 cctccaccccgaacaagaacatgttcctcaccgtgattgatttatcgatagctaagtcataaagacgcctaaagcgctcacacaacggaacactaccaca 13879214  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  13879213 ccaacaatctcgccaaaaatcagtatcagcttcatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctctccaccctcgcctatcccatctcta 13879114  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13879113 atcttgactatctccctccaccacgaagaacaactctggccccc 13879070  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 2170656 - 2170803
Alignment:
Q  30 cccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaaca 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2170656 cccctaacaaaaacatgttccgcaccgtaattactttattgacagttaaatcataaagccgcctaaaacgcacacataacggaacactaccacaccaaca 2170755  T
Q  130 atctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaac 177  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2170756 atctcgctaaaaatcggtatcgactctatcccccaccctcctcctaac 2170803  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Original strand, 25090761 - 25090944
Alignment:
Q  84 aaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacc 183  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25090761 aaagtcgcctaaagcgctcacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatctgctccatcccccaccctcctcctaacacaatc 25090860  T
Q  184 taaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
       |||||| ||||  | |||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25090861 cgtaaaccaaccctttccaccctcgcctatcccatctctaatcctgactatctccctccaccacgaagaacagctccggccccc 25090944  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42177375 - 42177137
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  || || || |||||| || |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||    
T  42177375 cctccaccctcaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattggcagctagatcatatagccgcctaaatcgctcacacagcgaaacactaccaca 42177276  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  42177275 ccaacaatctcgccaaaaatcgatttcggccccatcccccaccctcctcctaacacaacccgcaaacca---atccccaccctcgcctatcccatctcta 42177179  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccc 265  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42177178 atcctgactatctccctccaccacgaagaacaacttcggccc 42177137  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 8300212 - 8300360
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  8300212 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcgccaccctcacctatcccat 8300311  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8300312 ctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 8300360  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 267
Target Start/End: Original strand, 9922993 - 9923158
Alignment:
Q  102 cacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctccca 201  Q
    ||||||| ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| |     
T  9922993 cacacaatggaacatctccacaccaacaatcccgccaaaaatctgtctctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctcc 9923092  T
Q  202 accctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9923093 accctcacctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggccccc 9923158  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 32266986 - 32267119
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  32266986 cgccaaaaatcagtatccgcaccatctcccaccttcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatccttacta 32267085  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32267086 tctccctccaccacgacgaacaactccggccccc 32267119  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 7924795 - 7924943
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||  || ||||  ||||| |||||| ||||||||     |||||| ||||| | |||||||| |||| |||    
T  7924795 ccacaccaacaatcacgcccaaaatcagtatgtgccccatgtcccactctcctcgtaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacgtatcccat 7924894  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7924895 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 7924943  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 172702 - 172622
Alignment:
Q  187 aaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172702 aaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 172622  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41665080 - 41664951
Alignment:
Q  138 aaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctc 237  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||  | |||||    
T  41665080 aaaaatcagtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacgtcccaaaccaaccctctccaccctcacatatcccatctctaatcctcactatctc 41664981  T
Q  238 cctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41664980 catccaccacgaagaacaactccggccccc 41664951  T

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Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25857257 - 25857007
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25857257 ccatctccctccacccccaacaaaaatatgttccgcactgtaataacattattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 25857158  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  25857157 tgccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccatccctccccaccctcacctatccc 25857058  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25857057 atctctaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggccccc 25857007  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8300015 - 8299765
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8300015 ccatctccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgtaataacattattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaatggaacac 8299916  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  8299915 tgccacaccaacaatcgcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgaaaaccatccctccccaccctcacctatccc 8299816  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8299815 atctttaatcctcacaatctccctccaccacaaagaacaactccggccccc 8299765  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 10777091 - 10777327
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777091 ccatcaacctccacccccaacaagaacatgttccgcaccgtaataattttattgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 10777190  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  10777191 taccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacctgcaaaccagccctccccaccctcacatatccc 10777290  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagag 253  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10777291 atctctaatcctaactatctccctccaccacgaagag 10777327  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 267
Target Start/End: Original strand, 27795846 - 27796041
Alignment:
Q  73 agctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctc 172  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27795846 agctaagtcataaagacgcctaaagcgctcacacaacggaacactaccacaccaacaatctcgccaaaaatcagtatcagctccatcccccaccctcctc 27795945  T
Q  173 ctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcac-ctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||| | |||||| | ||||| ||||||||||| |  |   |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27795946 ctaacacaatccacaaaccaaccctctccaccctcgcgctatcccatctctaatcttgacttactccctccaccacgaagaacaactctggccccc 27796041  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30732045 - 30731897
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  30732045 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgtcccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccat 30731946  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30731945 ctctaatcctcacaatctccctccaccatgaagaacaactccggccccc 30731897  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 42514129 - 42514277
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  42514129 ccacaccaacaatcacgccagaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 42514228  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42514229 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 42514277  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 12825573 - 12825748
Alignment:
Q  84 aaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacc 183  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||   |||| | ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||       
T  12825573 aaaggcgcctaaaccggacacacaaaggaacatctccactccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgt 12825672  T
Q  184 taaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactc 259  Q
       |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12825673 cccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactc 12825748  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Original strand, 31641881 - 31642068
Alignment:
Q  80 tcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacac 179  Q
    |||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  31641881 tcataaaggcgactaaaccggtcacacaaaggaacatttccacaccaacaatcccgccaaaaatctgtatctgcaccgtctcccaccctcctcctaacac 31641980  T
Q  180 aacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31641981 aagacccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactatctcccgccaccatgaagaacaactccggccccc 31642068  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35983514 - 35983374
Alignment:
Q  127 acaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatc 226  Q
    |||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  35983514 acaatcacgccaaaaatccgtttctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagatccaaaccaaccctctccaccgtcacctatcccatctctaatc 35983415  T
Q  227 ctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35983414 ctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 35983374  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28535445 - 28535258
Alignment:
Q  80 tcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacac 179  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||| || ||  | || || |||||||||||||||||||    
T  28535445 tcataaaggcgactaaaacggtcacacaaaggaacatctccacaccaacaatcccgccaaaaatctgtttctacaccgtctcccaccctcctcctaacac 28535346  T
Q  180 aacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28535345 aagacccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggccccc 28535258  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 23238807 - 23238940
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  23238807 cgccaaaaatcggtatccgtaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 23238906  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23238907 tctccctccaccacgacgaacaactccggccccc 23238940  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27116889 - 27116756
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  27116889 cgccaaaaatcagtatctacaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccatccccctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacga 27116790  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27116789 tctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 27116756  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 42928547 - 42928688
Alignment:
Q  126 aacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaat 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| |||  |   |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  42928547 aacaatcacgctaaaaatctgtttcagcaccgtcacccaccctcctcctaaaacacgccccaaaccagccctctccaccctcacctatcccatctctaac 42928646  T
Q  226 cctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42928647 cctcactatctgcctccaccacgaagaacaactccggccccc 42928688  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18089550 - 18089447
Alignment:
Q  62 actttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatccc 161  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  18089550 actttattgacagacaaatcataaagccgcctaaaacgatca-acaacgaaacattaccacactaacaatcacgccaaaaatcagtataagctccatcac 18089452  T
Q  162 ccacc 166  Q
    |||||    
T  18089451 ccacc 18089447  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27165606 - 27165533
Alignment:
Q  194 ccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27165606 ccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcctcattatctccctccaccaagaagaacaacttcggccccc 27165533  T

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Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 14440060 - 14440301
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14440060 cctccacccccaacaaaaacatgttccgcaccgtaattactttattgacagctaaatcatatagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactaccaca 14440159  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  14440160 ccaacaatctcgccaaatatcggtatcggctccatccctcaccctcctcc--acacaacctgcaaaccagccctccccaccctcgcctatcccatctcta 14440257  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14440258 atcctagctatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 14440301  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 12645850 - 12646093
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  12645850 cctccacccccaacaagaacatgttccttactgtgattactttattgacagctaagtcatatagtcgcctaaagcgctcacacaaaggaacactaccaca 12645949  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12645950 ccaacaatctcgccaaaaatctgttgtggctccatctcccaccctcctcctaacacaatccgcaaaccaatcctccccaccctcgcctatcccatctcta 12646049  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12646050 atcctgactatctccctccaccaagaagaacaactccggccccc 12646093  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 28253034 - 28253277
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  || || || |||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||| |||||   |||||    
T  28253034 cctccacccccaacaaaaacatagtcctaaccgtgattactttgttgacggccaaatcatatagccgtctaaagcgctcacgaaacagaacatcaccaca 28253133  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  28253134 ccgacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctaacacaaaccgaaaaccaaccctccccaccctcgtctatcccatctcta 28253233  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28253234 atcctcactatctccctccaccaagaagaacaactccggccccc 28253277  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 40176982 - 40177139
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  || || ||   |||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  40176982 cctccacccccaacaagaacatcttcctcaccgtgattgatttattgatggctaagtcataaagtcgcctaaagcgttcacacaacggaacactaccaca 40177081  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaa 181  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40177082 ccaacaatctcaccaaaaatcggtatcaactccatcccccaccctcctcctaacacaa 40177139  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33515906 - 33515790
Alignment:
Q  151 agctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  33515906 agctccatcccccaccctcctcctaacacaatccgtaaaccaaccctccccaccctcacatatcccgtctttaatcttgactatctccctccaccacgaa 33515807  T
Q  251 gagcaactccggccccc 267  Q
    || || ||||| |||||    
T  33515806 gaacagctccgaccccc 33515790  T

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Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 43388674 - 43388903
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43388674 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttcctcactgaaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcaca--caacggaacac 43388771  T
Q  117 tgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  43388772 taccacaccaacaatctcgccaaaaatcagcatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacttgtaaaccagccctccccaccatcacctatccc 43388871  T
Q  217 atctctaatcctatcaatctccctccaccacg 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43388872 atctctaatcctcacaatctccctccaccacg 43388903  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 6051012 - 6051160
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  6051012 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 6051111  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6051112 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 6051160  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 35541458 - 35541606
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  35541458 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcgccaccctcacctatcccat 35541557  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35541558 ctctaatcctcacgatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 35541606  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11908871 - 11908705
Alignment:
Q  84 aaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacc 183  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||   |||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||       
T  11908871 aaaggcgcctaaaccggacacacaaaggaacatctccacaccaacaatcacgtcaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacatgt 11908772  T
Q  184 taaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaa 250  Q
       |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11908771 cccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaa 11908705  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47622903 - 47622661
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||   |  || || |||||  |||| || |||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||   |||||    
T  47622903 cctccacccccaacaaaaacatagtcataatcgtgattactttgttgacggccaaattatatagccgtctaaagcgctcacgaaacggaacatcaccaca 47622804  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| | ||||   |||| ||||||||    
T  47622803 ccaacaatcccgccaaaaatcagtatcggaaccatcccccaccctcctcctaacacaatccgaaaaccaaccctccccatcctcgtttatcccatctcta 47622704  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccc 266  Q
    |||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47622703 atcctcactatctctctccaccaagaagaacaactccggcccc 47622661  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16917641 - 16917599
Alignment:
Q  17 ccatcaccctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaa 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16917641 ccatctccctccacccccaacaaaaacatgttccgcactgtaa 16917599  T

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Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2821860 - 2821618
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||  ||||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  2821860 cctccacccccaacaagaacatgttccttaccgtgattgctttattgatggctaagtcataaagacgcctaaagcgctcacacaacggaacactaccaca 2821761  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  2821760 ccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatctgcaaaccaaccctccccaccctcgcctatcccatctcta 2821661  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccc 266  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  2821660 atcctgactatctccctccaccacgaagaacatatccggcccc 2821618  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 48312409 - 48312651
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || || ||   |||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||    
T  48312409 cctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattgatttattgatggctaagtcataaagtcgcctaaagcgctcacacaacggaaca-taccaca 48312507  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  48312508 ccaacaatctcgccaaaaatcgatatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaaccctctccaccctcgcctatctcatctcta 48312607  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48312608 atcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 48312651  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54482985 - 54482742
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||   |||| |||  ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  54482985 cctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtaattgatttattgatggctaagtcataaagatgcctaaagcgctcacacaagggaacactaccaca 54482886  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  54482885 ccaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaatccacaaaccaactctctccaccctcgcctatcccatctcta 54482786  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  54482785 atcctgactatctccctccaccacgaagaacaactccgaccccc 54482742  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 55725532 - 55725289
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||  |||||| |||||||| |||||    
T  55725532 cctccacccccaacaagaacatgttccttactgtgattactttattgacagctaagtcatatagtcgcctaaagcgcttacacaaaggaacactaccaca 55725433  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |   |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  55725432 ccaacaatctcgccaaaaatctgttgtggctccatctcccaccctcatcctaacacaatccgcaaaccaaccctccccaccctcgcctatcccatctctg 55725333  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||| |  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  55725332 atcatgactatctccctccaccaagaagaacaactccggccccc 55725289  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5789873 - 5789675
Alignment:
Q  69 tgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccct 168  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  5789873 tgacagccaagtcatataggcgtctaaaacgcacacacaacggaacatttccacaccaacaatcacgccaaaaatcaatattggctccatcccgcaccct 5789774  T
Q  169 cctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||| ||||||||      |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5789773 cctactaacacacgacgcaaaccatccctccccaccctcgcctatcccatctctaatcttcacaatctcccgccaccaagaagaacaactccggccccc 5789675  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23642322 - 23642174
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  23642322 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 23642223  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23642222 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 23642174  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 47419213 - 47419361
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  47419213 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 47419312  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47419313 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 47419361  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 19755691 - 19755824
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  19755691 cgccaaaaatcggtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacatcccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 19755790  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19755791 tctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 19755824  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19784115 - 19783982
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  19784115 cgccaaaaatcggtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacacatcccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 19784016  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19784015 tctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 19783982  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11586929 - 11586781
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || || | |||||||  ||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  11586929 ccacaccaacagtcacgccagaaatcagtttcggatccatccttcaccctcctcctaacacaatccgagaaccagcccaccccaccctcacctatcccat 11586830  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11586829 ctctaatcctaactatctccctccaccaagaagaacaacttcggccccc 11586781  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23647938 - 23647832
Alignment:
Q  161 cccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactcc 260  Q
    ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23647938 cccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactcc 23647839  T
Q  261 ggccccc 267  Q
    |||||||    
T  23647838 ggccccc 23647832  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1828256 - 1828123
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  1828256 cgccaaaagtcagtgtctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccatccctcaccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 1828157  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1828156 tctcccgccaccaagaagaacaactccggccccc 1828123  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 15740645 - 15740777
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||     |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  15740645 cgccaaaaatcagtatctgcaccatctcccaccctcctccta-cacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatctcatctttaatcctcacta 15740743  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15740744 tctcccgccaccatgaagaacaactccggccccc 15740777  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19735514 - 19735318
Alignment:
Q  71 acagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcc 170  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||||||  ||||||| || || ||||| || || ||||||   |    
T  19735514 acagccaaatcaaaaagctgtctaaaacacacataaaacggaacatttccacaccaacaatcatgccaaaagtcagtctcagcaccgtctcccacctgtc 19735415  T
Q  171 tcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||||||     | |||||  ||||| |  ||||| | |||| |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19735414 tcctaacacccgacacaaacctaccctctccgccctctcttatcccatctctaatcctcactatctcccgccaccaagaagaacaactccggccccc 19735318  T

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Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 31422916 - 31423159
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  31422916 cctccacccccaacaagagcatgttcctcactgtgattactttattgacagctaagtcatatagccgcctaaatcgctcacacaacggaactctaccaca 31423015  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctcta 223  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  31423016 ccaacaatctcgccaaaaatccgtttcaattccatcctccaccctcctcctaacacaacccgcaaaccatccctccccaccctcgcctatcccatctcta 31423115  T
Q  224 atcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31423116 atcctgactatctccctcaaccacgaagaacaactccggccccc 31423159  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 267
Target Start/End: Original strand, 37255078 - 37255315
Alignment:
Q  30 cccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccacactaaca 129  Q
    |||||||||| ||||||||||  || || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||    
T  37255078 cccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattgacagctaaatcatatagccgcctaaagcgctcacacagcggaacactaccgcaccaaca 37255177  T
Q  130 atctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatccta 229  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||     
T  37255178 atctcgccaaaaatcggtttcggctccatcccccaccctcctcctaacacaacccgcaaaccaactctcctcaccctcgcctatctcatctctaatcctg 37255277  T
Q  230 tcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
     | ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  37255278 actatctccctccatcacgatgaacaactccagccccc 37255315  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4937859 - 4937711
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  4937859 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 4937760  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4937759 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 4937711  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11276962 - 11276831
Alignment:
Q  136 ccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatc 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  11276962 ccaaaaatcggtatctgcaccatctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcactatc 11276863  T
Q  236 tccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  11276862 tccctccaccacgacgaacaactccgggcccc 11276831  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 25619778 - 25619936
Alignment:
Q  24 cctccacccccaacaaaaacatgttccgtactgtaataactttagtgacagctaaatcataaagccgcctaaaacgcacacacaacggaacactgccaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || || || |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||   |||    
T  25619778 cctccacccccaacaagaacatgttcctcaccgtgattactttattgacaactagatcatatagccgcctaaatcgttcacacagcggaacactataaca 25619877  T
Q  124 ctaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccat-cccccaccctcctcctaacacaa 181  Q
    | |||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25619878 ccaacaatctcgcccaaaatcgatttcggctccatccccccacccttctcctaacacaa 25619936  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 17721044 - 17721192
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  17721044 ccacaccaacaatcccaccaaaaatctgtctctgcaccgtctcccaccctcctcctaacacaagacccaaaccaaccctctccaccctcacctatcccat 17721143  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17721144 ctctaatcctcactatctccctccaccatgaagaacaactccggccccc 17721192  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 29968398 - 29968529
Alignment:
Q  134 cgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaa 233  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||     ||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  | |    
T  29968398 cgccaaaaatcggtatccgcaccatctcccaccttcctcctaacacaagacccaaatcatccctctccaccctcacctatcccatctctaatcctcacta 29968497  T
Q  234 tctccctccaccacgaagagcaactccggccc 265  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29968498 tctccctccaccacgacgaacaactccggccc 29968529  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 235127 - 235021
Alignment:
Q  161 cccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactcc 260  Q
    ||||||||||||||||||||      ||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  235127 cccaccctcctcctaacacacgtcccaaatcagccctctccaccctcgcctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactcc 235028  T
Q  261 ggccccc 267  Q
    |||||||    
T  235027 ggccccc 235021  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Original strand, 47877475 - 47877539
Alignment:
Q  202 accctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccc 266  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47877475 accctcgcctatcccatctctaatcctcactatctccctccaccacgaagaacaactccggcccc 47877539  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 105574 - 105426
Alignment:
Q  119 ccacactaacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcat 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  105574 ccacaccaacaatcacgccaaaaatcagtatctgccccatctcccactctcctcctaacacaagacccaaaccatccctctccaccctcacctatcccat 105475  T
Q  219 ctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  105474 ctctaatcctcacaatctccctccaccacgaagaacaactccggccccc 105426  T

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Target: scaffold0472 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 3668 - 3809
Alignment:
Q  126 aacaatctcgccaaaaatcggtatcagctccatcccccaccctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaat 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||      |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3668 aacaatcacgccaaaaatcggtatccgcaccatctcccaccctcctcctaacgcaggacccaaaccacccctctccaccctcacctatcccatctctaat 3767  T
Q  226 cctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggccccc 267  Q
    |||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3768 cctcactatctccctccaccacgacgaacaactccggccccc 3809  T

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Target: scaffold1350 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Original strand, 1 - 101
Alignment:
Q  167 ctcctcctaacacaacctaaaaaccagccctcccaaccctcacctatctcatctctaatcctatcaatctccctccaccacgaagagcaactccggcccc 266  Q
    ||||||||||||||| |   |||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1 ctcctcctaacacaatccgcaaaccaaccctccacaccctcgcctatcccatctctaattctgactatctccctccaccaagaagagcaacttcggcccc 100  T
Q  267 c 267  Q
    |    
T  101 c 101  T

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