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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9281_low_26 (Length: 282)
Name: NF9281_low_26
Description: NF9281
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9281_low_26 |
 |  |
|
| [»] scaffold0264 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0378 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0393 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold2089 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0063 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0099 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0376 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0112 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1948 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0466 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0611 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0086 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0454 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0111 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0136 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0783 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1400 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 47667761 - 47668030
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
47667761 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
47667860 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47667861 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
47667960 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667961 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
47668030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9456131 - 9455863
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456131 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
9456032 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456031 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
9455932 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9455931 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
9455863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 42817276 - 42817544
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817276 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
42817375 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817376 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
42817475 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817476 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
42817544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 20391526 - 20391795
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391526 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
20391625 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391626 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
20391725 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391726 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttctcataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
20391795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22670544 - 22670812
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670544 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
22670643 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22670644 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatcc |
22670743 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670744 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22670812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 20779932 - 20780201
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20779932 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
20780031 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20780032 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatac |
20780131 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20780132 |
aataataaaagtcatgatacataagataaatataacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
20780201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19706726 - 19706994
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19706726 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatc |
19706825 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19706826 |
tcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattgtttaaatataataaagagtgacatatattattc |
19706925 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19706926 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
19706994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 28135010 - 28135278
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28135010 |
catacataattgtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaataatagcgttcttaaagataatgtaatc |
28135109 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135110 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
28135209 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135210 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28135278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 43802652 - 43802921
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43802652 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatacatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatc |
43802751 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43802752 |
tcatgattaagtcacacttaatatataattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattc |
43802851 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43802852 |
aatattaaaagtcatgatacataagatatgtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
43802921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22612507 - 22612234
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacg----gatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612507 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatatatatatttaagaatagcgttctataagataatgt |
22612408 |
T |
 |
| Q |
97 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612407 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactttctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
22612308 |
T |
 |
| Q |
197 |
a-ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612307 |
atttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22612234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35930596 - 35930329
Alignment:
| Q |
2 |
atacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatct |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
35930596 |
atacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagttttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatgataatgtaatct |
35930497 |
T |
 |
| Q |
102 |
catgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattca |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35930496 |
catgattaagtcgcacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattca |
35930397 |
T |
 |
| Q |
202 |
ataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35930396 |
ataataaaagtcattatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
35930329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 22234827 - 22235029
Alignment:
| Q |
67 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatt |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234827 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
22234926 |
T |
 |
| Q |
167 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234927 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
22235026 |
T |
 |
| Q |
267 |
aca |
269 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22235027 |
aca |
22235029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Original strand, 26923675 - 26923900
Alignment:
| Q |
41 |
catattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaacta |
140 |
Q |
| |
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| T |
26923675 |
catattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacattatttatgttaatgtaatctaatgattaagtcacactcaatatacaattacacgaacta |
26923773 |
T |
 |
| Q |
141 |
tctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
239 |
Q |
| |
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| T |
26923774 |
tctattctagaaactttattaacatcactacaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaag---tgatacataagataagtttaacata |
26923870 |
T |
 |
| Q |
240 |
aactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| ||| ||| || | || |||||||||||| |
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| T |
26923871 |
acctaatggactttgggacttacaccaaca |
26923900 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8727682 - 8727412
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
99 |
tctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgccatatatta |
197 |
Q |
| |
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| T |
8727583 |
tcttatgatttagtcacacttaatataaaattacacgaa-aatttattctagggactttattaacattataacaagtatgataaagagtgccatatatta |
8727485 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtt-taacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
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| T |
8727484 |
tttaatagtaaatgttatgatatgtaatataagttataacataaaccattggcctctagggcttacaccaaca |
8727412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 633949 - 633814
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaac |
138 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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tcatgattaagttacacttaatatattattacacgaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21881663 - 21881931
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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| T |
21881663 |
cataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacattaatgtaatc |
21881760 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc--atatatta |
197 |
Q |
| |
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| T |
21881761 |
tcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgccatatatatta |
21881859 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21881860 |
ttcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattgacctatagagcttacaccaaca |
21881931 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29096738 - 29096580
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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29096738 |
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29096642 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaa |
162 |
Q |
| |
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| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
29096641 |
ttacgattaagtcacacttaatattccatcacatgaactatctattctagggactttattaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14482337 - 14482299
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| Q |
231 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
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tttaacataaactattggcctctagggcttacactaaca |
14482299 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16435775 - 16435649
Alignment:
| Q |
92 |
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190 |
Q |
| |
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| T |
16435775 |
aatgtaatctcacaattaagtctcatttaatgtcgcattacttaaaatatctattctaagaactttattaatcttatataaaatataataaagaatgtct |
16435676 |
T |
 |
| Q |
191 |
tatattattcaataataaaagtcatga |
217 |
Q |
| |
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| T |
16435675 |
cattttatttaataataaaagtcatga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21969348 - 21969079
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100 |
Q |
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| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21969248 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
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T |
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| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21969148 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
21969079 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27007804 - 27008072
Alignment:
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100 |
Q |
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T |
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| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
27007904 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
27008003 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
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| T |
27008004 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27008072 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27014947 - 27015215
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
27015047 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
27015146 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
27015147 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27015215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28498508 - 28498240
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28498508 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
28498409 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28498408 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
28498309 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498308 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28498240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12562138 - 12561869
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
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| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
12562038 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattc |
12561939 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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| T |
12561938 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacgccaacag |
12561869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 22130896 - 22131165
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
|
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggataaatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
22130996 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
22131095 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22131096 |
aataataaaagtcacgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
22131165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26240499 - 26240231
Alignment:
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
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catacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
26240300 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
26240299 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 45534560 - 45534828
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
45534660 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
45534759 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
45534760 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
45534828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27880774 - 27881043
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Q |
| |
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100 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27880874 |
ctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatc |
27880973 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880974 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27881043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 28020955 - 28021224
Alignment:
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1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28020955 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataagataatgtaat |
28021054 |
T |
 |
| Q |
100 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021055 |
ctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatc |
28021154 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021155 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28021224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25611210 - 25610938
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25611210 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacattttaagaatagcgttctctaagataatgtaat |
25611111 |
T |
 |
| Q |
100 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25611110 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaggagtgccatatattatt |
25611011 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacagat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25611010 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttatcataaactatttgcccctagggcttacacaaacagat |
25610938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 8371540 - 8371808
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |
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|
| T |
8371540 |
catacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagacacatttaagaatagtgttatttaagataatgtaatc |
8371639 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8371640 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatacattattc |
8371739 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8371740 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8371808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22659781 - 22660049
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22659781 |
catacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
22659880 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22659881 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtcatatattattc |
22659980 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22659981 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggccttttggacttacaccaaca |
22660049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 2963223 - 2963489
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
2963223 |
catacataatagtctctacgctttattattatcct--aattatattaaag-tttgac-acgaatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
2963318 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttatt-aacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattat |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
2963319 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaacattactataaatataataaaaagtgtcatatattat |
2963418 |
T |
 |
| Q |
199 |
tcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2963419 |
tcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcatctagggcttacaccaaca |
2963489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36970253 - 36970022
Alignment:
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137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36970253 |
attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaacaacgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacataatatattattacatgaa |
36970155 |
T |
 |
| Q |
138 |
ctatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36970154 |
ctatctattctagggactttattaacattactataaatataataaagagtatcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaac |
36970055 |
T |
 |
| Q |
237 |
ataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36970054 |
ataaactattggcct-tagggcttacaccaacag |
36970022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21916691 - 21916524
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916691 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
21916592 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattat |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916591 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattat |
21916524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6430952 - 6430692
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| Q |
6 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6430952 |
ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaatagtgttatttatgataatgtaatctcat- |
6430856 |
T |
 |
| Q |
106 |
attaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaat- |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6430855 |
--taagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatttaata |
6430758 |
T |
 |
| Q |
204 |
aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6430757 |
aataaaagttatgatacataagataaatttaacgtaaactattggtctctagagcttacaccaaca |
6430692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18835365 - 18835119
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
18835365 |
catacataatagtctcgatgctttattattatt-tcaatccatattaaagctg-gactacagatatatttaagaataacgttttttatgttaatgtaatc |
18835268 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
18835267 |
tcatgattaagtcacacttaatatactactgc---aactatctattctaagaactttattaacattataacaaatataacaaaaattgtcatatattatt |
18835171 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcct |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18835170 |
taataacaaaagtcatgataaataaaataagtttaacataaactattcgcct |
18835119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Original strand, 20539751 - 20539953
Alignment:
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67 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatt |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20539751 |
atttaagaataacgttctttatgttaatgtaatcacatgattaagtcacacttaatattccatta-atgaactatctattctatggactttattaatctt |
20539849 |
T |
 |
| Q |
167 |
atctaaat-ataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
265 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
20539850 |
acaacaattataataaagaatgtcatatattatttaataataaaagtcatgatacataacacaagtttaacataaactattggtctcaatggcttacacc |
20539949 |
T |
 |
| Q |
266 |
aaca |
269 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20539950 |
aaca |
20539953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21914394 - 21914310
Alignment:
| Q |
185 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21914394 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21914310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21862227 - 21862147
Alignment:
| Q |
189 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21862227 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21862147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Original strand, 8782188 - 8782365
Alignment:
| Q |
91 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaat-ataataaagagtgcc |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
8782188 |
taatgtaatcccatgattaagtcacatttaatattccatcacattaactatctattttaaggactttattaatcttacaacaattataataaagaatgac |
8782287 |
T |
 |
| Q |
190 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8782288 |
atattttattaaa-aataaa-gtaatgatacataatataagtttaacataaactattgacctatagggcttacaccaaca |
8782365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12642277 - 12642210
Alignment:
| Q |
202 |
ataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12642277 |
ataataaaagtcatgatacacaacgtaagtttaacataaactataggcttctagggcttacaccaaca |
12642210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30174392 - 30174123
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174392 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
30174293 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174292 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
30174193 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174192 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
30174123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 24250319 - 24250587
Alignment:
| Q |
1 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250319 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
24250418 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24250419 |
tcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatattttattc |
24250518 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250519 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
24250587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 24229502 - 24229772
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
24229502 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggacacatttaagaataatgttctttatgataaagtaatc |
24229601 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24229602 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatttaaatataataaagagtgtcatatattattc |
24229701 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacaga |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24229702 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaaccattggcctctagggcttacaccaacaga |
24229772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 24763844 - 24764105
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| | || | |||| ||||| |
|
|
| T |
24763844 |
cataaataatagtctcgatgctttattattatc-tcaattcatattaaagctt-gagtacagatgcatttaagaatatcgttttttatgttaatataatc |
24763941 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
24763942 |
tcatgattaagtcacgcttaatatactattacatgaactatctattcttgggactttattaacattataacaaatataataaagatttccatgtattatt |
24764041 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24764042 |
taataataaaagtcattatacataacataagtttaacataaactattggcctccagggcttaca |
24764105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19616450 - 19616186
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
19616450 |
catacataatagtctcgacgctt-attattatccca-attcatattaaagctt-gactacaaatacatttaagaatagtgttctttatgttaatgtaatc |
19616354 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataat-aaagagtgccatatattat |
198 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19616353 |
ttatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatattataaaagagtgtcatatattat |
19616254 |
T |
 |
| Q |
199 |
tcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
266 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19616253 |
ttaataataaaaatcatgatacataatataagtttaacataaactattgaccgctagaacttacacca |
19616186 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 15342290 - 15342548
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| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
15342290 |
catacataatagtctccacgctttattattatccca-atttatattaaatctt-gactacatatacattaaagaatagtgttctttatggtaatgtaatc |
15342387 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaa-cattatctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
15342388 |
tcatgattaaatcacacttaatattccattacacgaaccatctattttagggactttattaatcatacaagaattataataacgaatgtcatatattatt |
15342487 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
260 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15342488 |
taacaataaaagtcatgatacataatataagtttaacataaactattggcctctaaggctt |
15342548 |
T |
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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21626647 - 21626429
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52 |
tttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaat |
151 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21626647 |
tttgacttcggatacttttaagaatattgttctttatgttaatgtaatgtcatgattaagtcttacttaatgttccatcacatgaactatctattcgagg |
21626548 |
T |
 |
| Q |
152 |
gactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21626547 |
gactttattaatcttataacaaatataataaagaatgccttattttattcaataataaatgtcatgatgcatatcataagtttaacataaactattgaca |
21626448 |
T |
 |
| Q |
251 |
tctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21626447 |
tctaggacttacaccaaca |
21626429 |
T |
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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29800317 - 29800175
Alignment:
| Q |
128 |
attacatgaactatctattctaatgactttattaacattatc-taaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataaga |
226 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
29800317 |
attacacgaactatctattctagggactttattaatcttacaataattataataaagaatgacatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagta |
29800218 |
T |
 |
| Q |
227 |
taggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29800217 |
taagtttaacataaaatattgtcctctagggcttacaccaaca |
29800175 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 223
Target Start/End: Original strand, 28719170 - 28719304
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188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| || |
|
|
| T |
28719170 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatgttccatcacatgaactatatattctaaggactttattaattttacaataagtataataaaagaatgt |
28719269 |
T |
 |
| Q |
189 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacata |
223 |
Q |
| |
|
| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28719270 |
cttattttgtttaataataaaagtcatgatacata |
28719304 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 3962 - 4230
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3962 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
4061 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4062 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
4161 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4162 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
4230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 35 - 269
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11085
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35 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10851 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
10950 |
T |
 |
| Q |
135 |
gaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10951 |
aaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
11050 |
T |
 |
| Q |
235 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11051 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
11085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 130511 - 130779
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130511 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
130610 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130611 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
130710 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130711 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
130779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 138471 - 138653
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
138471 |
gctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattcta |
138570 |
T |
 |
| Q |
150 |
atgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
232 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138571 |
aggactttattaacattatataaatataataaagagtgacatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
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Target Start/End: Original strand, 141112 - 141148
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| Q |
234 |
aacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
141112 |
aacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
141148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400119 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
18400020 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400019 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
18399920 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399919 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18399851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18407103 - 18406835
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407103 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
18407004 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407003 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
18406904 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18406903 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18406835 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 48808783 - 48809051
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808783 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
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48808883 |
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T |
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269 |
Q |
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48808983 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15729766 - 15729498
Alignment:
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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| T |
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15729567 |
T |
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| Q |
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269 |
Q |
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| T |
15729566 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
15729498 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19859137 - 19858869
Alignment:
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T |
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200 |
Q |
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19858938 |
T |
 |
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201 |
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269 |
Q |
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aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
19858869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30254153 - 30253885
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
201 |
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269 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2204567 - 2204298
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Q |
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T |
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199 |
Q |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8465014 - 8464746
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Q |
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200 |
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T |
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| Q |
201 |
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269 |
Q |
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8464814 |
aataataaaagtcatgattcataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18139625 - 18139895
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19230903 - 19230634
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 10669189 - 10669456
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T |
 |
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| |
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T |
 |
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200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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Q |
| |
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| T |
10669387 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18259411 - 18259678
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catacataatactctcgacgatttattattatccta-attcatattaaagctt-gactatggatacatttaagaataatgttctttatgataatgtaatc |
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T |
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Q |
| |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgccatatattatt |
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T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
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| T |
18259609 |
caataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 47167146 - 47167413
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T |
 |
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| |
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T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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Q |
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47167344 |
caataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41681260 - 41681502
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catacataatagtctcaaagctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaataacattctataagataaagtaatc |
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T |
 |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
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Q |
| |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacataaactatctattccaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgttatatattattc |
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T |
 |
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201 |
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243 |
Q |
| |
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| T |
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aataataaaaatcatgatacataagataagtttaatataaact |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
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Q |
| |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
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T |
 |
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200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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34128391 |
caataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28130572 - 28130309
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T |
 |
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gattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaat |
203 |
Q |
| |
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gattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggacttcattaacattattataaatataataaagagtgtcacatactattcaat |
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T |
 |
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204 |
aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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| |
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| T |
28130374 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19393711 - 19393963
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| T |
19393711 |
catacataatagtctcgacgctttataattatccca-actcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaatagcattctttatgttaatgtaatc |
19393808 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19393809 |
tcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattatagagactttattaacattactacagatataataaagagtatcatatattatt |
19393908 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19393909 |
taataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctcta |
19393963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14586181 - 14585913
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14586181 |
catacataaaagtctcgacgctttattattattcca-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttcattaagataatgtaatc |
14586084 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14586083 |
tcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttagggactttattaacattacaacaaatataataaagagtgacatatattatt |
14585984 |
T |
 |
| Q |
200 |
caa------taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacac |
264 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
14585983 |
taataatagtaataaaagtcatgatacataacataaatttaacttaaactattggcatttacggcttacac |
14585913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15999997 - 15999791
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15999997 |
catacataaaagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttctttaaggtaatgtaatc |
15999900 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
15999899 |
tcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttaggtacttaattaacattacaacaaatataataaagagtgacatatattatt |
15999800 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
15999799 |
taataataa |
15999791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22994173 - 22994055
Alignment:
| Q |
152 |
gactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22994173 |
gactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggtc |
22994074 |
T |
 |
| Q |
251 |
tctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22994073 |
tctagggcttacaccaaca |
22994055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2936046 - 2935846
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
2936046 |
cataaataacagtctcgatgctttattattatcgca-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatgttaatgtaatc |
2935949 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2935948 |
tcatgattaagt--cacttaatatataattacatgaactatttattctagggactttattaacattacaacaaatataatgaagagtgacatatattatt |
2935851 |
T |
 |
| Q |
200 |
caata |
204 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2935850 |
taata |
2935846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3587923 - 3587657
Alignment:
| Q |
2 |
atacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatct |
101 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | || | ||| ||||||| |
|
|
| T |
3587923 |
atacataatagtctctacgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactatagattcatttaagaataacgttttttatgttaaagtaatct |
3587826 |
T |
 |
| Q |
102 |
catgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
3587825 |
catgattaagtcacagttaatatttcatcacataaactacctattctatggactttattaatcttacaacaattataataaagaattgcatatgttattt |
3587726 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3587725 |
aataataaaagtcatgatacatagcataagtttcacataaactattgacatttagggcttacaccaaca |
3587657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 42150376 - 42150626
Alignment:
| Q |
10 |
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109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42150376 |
tagtctcgacgctttattattatccca-attcatattaaagctt-gactacggatacattta-gaataacgttctttatgttaatgtaatctcatgatta |
42150472 |
T |
 |
| Q |
110 |
agtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatga--ctttattaacatta-----tctaaatataataaagagtgccatatattattcaa |
202 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42150473 |
agtcacac-------------aca-gaactatctattctataggggctttattaacattactacctacaaatataacaaagagtgtcatatattattcaa |
42150558 |
T |
 |
| Q |
203 |
taataaaagtcatgatacat-aagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42150559 |
taataaaagtcacgatacataaagataagtttaacataaactattggcctctagggcttataccaaca |
42150626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48813825 - 48813749
Alignment:
| Q |
193 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48813825 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22968965 - 22968697
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22968965 |
cataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacattaatgtaatc |
22968868 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc--atatatta |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
22968867 |
tcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgccatatatatta |
22968769 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22968768 |
ttcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattgacctatagagcttacaccaaca |
22968697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 15170316 - 15170581
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcc---tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgta |
97 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| | || | ||||||| |
|
|
| T |
15170316 |
catatataatagtctctacgctttattattatcccaatttat--atattaaagctt-gactacaaatatatttaagaataacgttttttatgttaatgta |
15170412 |
T |
 |
| Q |
98 |
atctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatatt |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
15170413 |
atctcatgattaagtcccacttaatattccattacatgaac-atctattttatggactttattaattttacaacaattataataaagaatgtcgtatatt |
15170511 |
T |
 |
| Q |
197 |
attcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
266 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15170512 |
atttaatattaaaactcacgatacatagaataaatttaacataaactattagccttcaaggcttacacca |
15170581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 24443614 - 24443772
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
24443614 |
catacataatagtctttacactttgttatcatccc--atttatattaaagcttgg-ctacggatacatttaagaatatcgttctttatgttaatgtaatc |
24443710 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaa |
162 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24443711 |
tcgtgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattatagggactttattaa |
24443772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 269
Target Start/End: Original strand, 24443976 - 24444074
Alignment:
| Q |
171 |
aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
24443976 |
aaatataataaagaatgcaatatattattcaataataaaaatcatgatagataacataagtttaacataagctattgacctctaagacttacaccaaca |
24444074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 31190730 - 31191000
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||| | || | |||||||| | |
|
|
| T |
31190730 |
catacgtaatagtctcggtgctttattattatccca-atttatactaaagctt-gactaaggatatatttaataataatgttatttatgttaatgtaagc |
31190827 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31190828 |
aaacgattaagtcacacttaatataccattacatgaactatcta-tctggggactttattaacattacaacaaatataataaaaagtgccatatattatt |
31190926 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgata----cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|| | | || |||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31190927 |
taacatagtatgttatgaaaatgtcatagcataagtttaacataaattattggcctctaaggcttacaccaaca |
31191000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Original strand, 25846287 - 25846443
Alignment:
| Q |
103 |
atgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatat----ta |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| || |
|
|
| T |
25846287 |
atgattaagtcacatttaatgttccattacatgaactatctattttagagattttattaatcttacaacaaacataataaagaatgtcatatatatttta |
25846386 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
254 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
25846387 |
tttaataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaaatattgacctcta |
25846443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 5983259 - 5983324
Alignment:
| Q |
203 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaa |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
5983259 |
taataaaagtcatgatacatatcataagtttaacataaaattaatggcatccagggcttacaccaa |
5983324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16789086 - 16788818
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16789086 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
16788987 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788986 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
16788887 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788886 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
16788818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 22860175 - 22860444
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860175 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
22860274 |
T |
 |
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101 |
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200 |
Q |
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22860275 |
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22860374 |
T |
 |
| Q |
201 |
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270 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22860375 |
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22860444 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 1586395 - 1586663
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Q |
| |
|
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|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctataagataatgtaatc |
1586494 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1586495 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
1586594 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
1586595 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
1586663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 13995230 - 13995498
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100 |
Q |
| |
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|
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcattctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
13995330 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattc |
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T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13995430 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttataccaaca |
13995498 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18020128 - 18020396
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctgaatataataaagagtgccatatattattc |
18020327 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
18020328 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18020396 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27508634 - 27508903
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
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27508734 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattatta |
27508833 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
27508834 |
caataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27508903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27528220 - 27528489
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Q |
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|
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27528220 |
catacataacagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataatataatgtaatt |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatt- |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
27528320 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattatta |
27528419 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27528420 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacaccaaca |
27528489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14074495 - 14074226
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
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T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14074295 |
aataataatagtcatgatacataagatatttttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
14074226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8612930 - 8612664
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Q |
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|
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catacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8612833 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtcatatattatt |
8612734 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8612733 |
caataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8612664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13947704 - 13947501
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166 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13947704 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
13947605 |
T |
 |
| Q |
167 |
atctaaatataataaagagtgccatatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13947604 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
13947505 |
T |
 |
| Q |
266 |
aaca |
269 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13947504 |
aaca |
13947501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 5758768 - 5759034
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtatcatatattatt |
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T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5758965 |
caataataaaagtcatcatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
5759034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 17120741 - 17121002
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ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
105 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gacaatggatacatttaagaataacgttctttatgataatataatctcatg |
17120838 |
T |
 |
| Q |
106 |
attaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaata |
204 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120839 |
actaagtcacacttaatatattattatacgaactatctattctagggattttattaacattattataaatataataaagagt--catatattattcaata |
17120936 |
T |
 |
| Q |
205 |
ataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta-gggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120937 |
ataaaagtcatgatacataagatgagtttaacataaactattgacctctaggggcttacaccaaca |
17121002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 20736615 - 20736882
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| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
20736615 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcccag-ttcttattaaagctt-gactacagatacatttaagaataatgttctttatgttaatgtaatc |
20736712 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20736713 |
tcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatataataaagagtggcatatattatt |
20736812 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20736813 |
taataataaaagtcatgatacataacataagattaacataacctattggcctctagggcatacaccaaca |
20736882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19218444 - 19218176
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| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
19218444 |
catacataatagtctctacactttattattatccccttt--atattaaagctt-gactactgatgc-tttaagaatagcattctttatgataatgtaatc |
19218349 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19218348 |
acatgattaagtcacacttaatattctattacacgaactatctattctagagactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgccatatattatt |
19218249 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacagat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19218248 |
taataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaactattggactataggggttacaccaacagat |
19218176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14997007 - 14996859
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121 |
atatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatac |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
14997007 |
atatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatataaatataataaagagtgtcatatattattcaataattaaagtcataatac |
14996908 |
T |
 |
| Q |
221 |
ataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14996907 |
ataagataagtttaacataaaatattggcctctagatcttacaccaaca |
14996859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
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Target Start/End: Complemental strand, 4073588 - 4073320
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
4073588 |
acataatagtctctacgttttattattatcctg-atttatattaaag-tttgactacggatacttttaagaataatgttctttccattaatgtaatctca |
4073491 |
T |
 |
| Q |
104 |
tgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttatta-----acattatctaaatataataaagagtgccatatattat |
198 |
Q |
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4073490 |
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4073391 |
T |
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| Q |
199 |
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269 |
Q |
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| T |
4073390 |
ttaatgataaaaatcatgatacataacataagtttaacataaattattggcatctaagacttacaccaaca |
4073320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 22560475 - 22560740
Alignment:
| Q |
5 |
cataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatag--cgttctataagataatgtaatctc |
102 |
Q |
| |
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| T |
22560475 |
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22560572 |
T |
 |
| Q |
103 |
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201 |
Q |
| |
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| T |
22560573 |
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22560672 |
T |
 |
| Q |
202 |
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269 |
Q |
| |
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| T |
22560673 |
ataatagaagtcatgatacactgcataattttaacataaactatcggcttctagggcttacaccaaca |
22560740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21994603 - 21994406
Alignment:
| Q |
1 |
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Q |
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21994603 |
catatataatagtctttgcgctttattattattcca-atttatattaaagctc-gactatggatacatttaagaatagtgttctttatattaatgtaatc |
21994506 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
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| T |
21994505 |
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21994406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Original strand, 10359410 - 10359588
Alignment:
| Q |
91 |
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189 |
Q |
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| T |
10359410 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccatcacatcaactatatattatagagactttattaatcttataacaattatgataaataatgtc |
10359509 |
T |
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| Q |
190 |
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268 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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| T |
10359510 |
atattttatttaatattaaaaatcataatacatacgataagtttaacataaactattgacctctaaaacttacaccaac |
10359588 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21993786 - 21993711
Alignment:
| Q |
193 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
21993786 |
tattatttaataataaaagtcatgatacatatcataggtttaacataaattattgg-ctatagggcttacaccaaca |
21993711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11248569 - 11248530
Alignment:
| Q |
231 |
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270 |
Q |
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| T |
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tttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
11248530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 267
Target Start/End: Original strand, 23846851 - 23846923
Alignment:
| Q |
195 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
267 |
Q |
| |
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ttatttaatattaaaagtcatgatacatatgacaagtttaatataaactattgacctctatagcttataccaa |
23846923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2677028 - 2676760
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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| T |
2676928 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
2676829 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
2676828 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
2676760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15461512 - 15461244
Alignment:
| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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| T |
15461512 |
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15461413 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
15461412 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
15461313 |
T |
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| Q |
201 |
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269 |
Q |
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| T |
15461312 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
15461244 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15815036 - 15814768
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
15814937 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
15814936 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
15814837 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
15814836 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
15814768 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18111330 - 18111598
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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| T |
18111330 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
18111429 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
18111430 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
18111529 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
18111530 |
aataataaaagtcatgatacataagataggttcaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18111598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20243952 - 20243684
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| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243952 |
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20243853 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
20243852 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
20243753 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
20243752 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
20243684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26531628 - 26531360
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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| T |
26531628 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
26531529 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
26531528 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
26531429 |
T |
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| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
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| T |
26531428 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaatataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
26531360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 3369310 - 3369578
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
3369310 |
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3369409 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
3369410 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
3369509 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
3369510 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
3369578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18163177 - 18162909
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatgtaataaagagtgccatatattattc |
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T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
18162977 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 17300246 - 17300515
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100 |
Q |
| |
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 |
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101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattatttcacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
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T |
 |
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201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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|
| T |
17300446 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 4676270 - 4676538
Alignment:
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1 |
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| |
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4676270 |
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4676369 |
T |
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200 |
Q |
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T |
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269 |
Q |
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4676538 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5870433 - 5870159
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Q |
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T |
 |
| Q |
101 |
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194 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
195 |
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269 |
Q |
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| T |
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5870159 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34975566 - 34975298
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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|
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34975566 |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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34975367 |
T |
 |
| Q |
201 |
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269 |
Q |
| |
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|
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| T |
34975366 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
34975298 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38816694 - 38816458
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134 |
Q |
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|
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38816595 |
T |
 |
| Q |
135 |
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234 |
Q |
| |
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| T |
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38816495 |
T |
 |
| Q |
235 |
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271 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816494 |
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38816458 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Original strand, 11484265 - 11484472
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62 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
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11484364 |
T |
 |
| Q |
162 |
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261 |
Q |
| |
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| T |
11484365 |
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11484464 |
T |
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| Q |
262 |
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269 |
Q |
| |
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| T |
11484465 |
caccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1941738 - 1941472
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
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1941641 |
T |
 |
| Q |
102 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
1941640 |
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1941541 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
1941540 |
aataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9487566 - 9487301
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100 |
Q |
| |
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9487469 |
T |
 |
| Q |
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199 |
Q |
| |
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| T |
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9487369 |
T |
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| Q |
200 |
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267 |
Q |
| |
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|
| T |
9487368 |
caataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcccctagggcttacaccaa |
9487301 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11421031 - 11420768
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |
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| T |
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catacataatagtctcgaagctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatgttaatgtaatc |
11420934 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
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| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11420933 |
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11420834 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
265 |
Q |
| |
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| T |
11420833 |
taataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaaccattggcctctagggcttccacc |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 30040762 - 30041029
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| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |
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| T |
30040762 |
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T |
 |
| Q |
102 |
catgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
30040860 |
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30040959 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
30040960 |
gataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaacag |
30041029 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4546095 - 4545948
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
101 |
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150 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
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tcatgactaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4545950 - 4545860
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179 |
taaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4545950 |
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4545860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19365529 - 19365389
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6 |
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105 |
Q |
| |
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||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
106 |
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148 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19365431 |
attaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9537926 - 9537705
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152 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | || |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| | |
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ttgactacatatacatttaagaatagcgttctttatgttaatgtaaactctttatagagtcacacttgatattccattgcacgaactatctattctaggg |
9537827 |
T |
 |
| Q |
153 |
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250 |
Q |
| |
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|
| T |
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9537729 |
T |
 |
| Q |
251 |
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274 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9537728 |
tctggggcttacaccaacaaattg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19362397 - 19362285
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ttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatg |
135 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
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19362397 |
ttatttatattaaagctt-gactactgatacatttaagaaaagcgttccttacgttaatgtaatctcatgattaactcacacttaatattacattacatg |
19362299 |
T |
 |
| Q |
136 |
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149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
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|
| T |
19362298 |
aactatctattcta |
19362285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 5528769 - 5529013
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||| ||||| | | || |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |
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|
| T |
5528769 |
acataatagtctatacgctttattattatcatgatttaat-ttaaagctt-gactatgaacacttttaagaatatagttctttgtgttaatgtaatctcg |
5528866 |
T |
 |
| Q |
104 |
tgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaat-ataataaagagtgccatatattattcaa |
202 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||| | || ||||| |||| || |
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| T |
5528867 |
tgattaagtcgcactgaatattccatcacatgcactatctattctagggattttattaatcttacaacaattataataaaaaatgtcatattatatttaa |
5528966 |
T |
 |
| Q |
203 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
249 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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taataaatgtcatgatacataacataagtttaacataaactattggc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 39422426 - 39422694
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100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| || |||| | |||||||||| |
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|
| T |
39422426 |
cataaataatagtctatacgctttattacta-ccttaattcatattaaag-tttgtctacaaatacttttaagaataatgtcttatatgttaatgtaatc |
39422523 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |
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| T |
39422524 |
tcacgattaagtctcgtttaattttccattacatgaactatttattttagggacattattaatcttacaacaaatataataaatagtgcgtcattttatt |
39422623 |
T |
 |
| Q |
200 |
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269 |
Q |
| |
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|||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
39422624 |
taataataacaatcatgatatgtaacataagtttaacataaaactattgacctctacgacttacaccaaca |
39422694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Original strand, 23056437 - 23056615
Alignment:
| Q |
92 |
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190 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
23056437 |
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23056536 |
T |
 |
| Q |
191 |
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269 |
Q |
| |
|
||| ||| | || |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23056537 |
tattttaattaacaataaaagtcatgataca-atcatcagtttaacataaaactattcacctatagcgcttacaccaaca |
23056615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19361661 - 19361597
Alignment:
| Q |
205 |
ataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19361661 |
ataaaattcatgatacatagcataagtttaacataaacaattggcctatagggcttaaaccaaca |
19361597 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 32636499 - 32636465
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcct |
35 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
32636499 |
catacataatagtctccacgctttattattatcct |
32636465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 56516062 - 56515990
Alignment:
| Q |
194 |
attattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacacc |
265 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
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56516062 |
attatttaataataaaagtaatgatacaaaatataactttaacttaaaactattgacctctagggctgacacc |
56515990 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21034253 - 21033985
Alignment:
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Q |
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|
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|
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
21034153 |
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21034054 |
T |
 |
| Q |
201 |
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269 |
Q |
| |
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| T |
21034053 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21033985 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12299926 - 12299658
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12299926 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
12299827 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
12299826 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagcgccatatattattc |
12299727 |
T |
 |
| Q |
201 |
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269 |
Q |
| |
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| T |
12299726 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacatcaaca |
12299658 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 15846823 - 15847091
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15846823 |
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15846922 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15846923 |
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15847022 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
15847023 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagcgcttacaccaaca |
15847091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14890406 - 14890138
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890406 |
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14890307 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14890306 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtcatatattattc |
14890207 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14890206 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
14890138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21398807 - 21398539
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21398807 |
catacataatagtctcgacactttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatc |
21398708 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21398707 |
tcatgattaagtcacaattaatatataattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattc |
21398608 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21398607 |
aataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21398539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 55427036 - 55426768
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55427036 |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
55426936 |
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55426837 |
T |
 |
| Q |
201 |
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269 |
Q |
| |
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|
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| T |
55426836 |
aataataaaagtcataatacataagatagatttaacataaactattggtctctagggcttacaccaaca |
55426768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 20147841 - 20148110
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20147841 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagtgttctataagataatgtaat |
20147940 |
T |
 |
| Q |
100 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20147941 |
ctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatc |
20148040 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20148041 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
20148110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 25979015 - 25979282
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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|
| T |
25979015 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttatgataatgtaatc |
25979112 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
25979212 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
25979213 |
caataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
25979282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28088211 - 28087967
Alignment:
| Q |
23 |
ttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28088211 |
ttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatctatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
28088112 |
T |
 |
| Q |
123 |
atattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacat |
222 |
Q |
| |
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|
| T |
28088111 |
atattattacacgaactatctattctaagaactttattaatattatctaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgatacat |
28088012 |
T |
 |
| Q |
223 |
aagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
267 |
Q |
| |
|
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| T |
28088011 |
aagataagtttaacataaactattggcctttagggattacaccaa |
28087967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11787602 - 11787382
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |
|
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11787602 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaataacgttctttatgataatgtaatc |
11787505 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
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| T |
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tcatgattaagtcacatttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
11787405 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacat |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |
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| T |
11787404 |
caataagaaaagtcatgatacat |
11787382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14147036 - 14146769
Alignment:
| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || | | | ||||||| | |
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|
| T |
14147036 |
catatataatagtctctgtgctttattattatccca-atttatgttaaagctt-gactacagatacatttagaaatagctttgttaatgttaatgtagtt |
14146939 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146938 |
tcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctatggaccgtattaatcttataacaaatataataaagagtgccatatattatt |
14146839 |
T |
 |
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200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146838 |
taataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
14146769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15526765 - 15526503
Alignment:
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
15526765 |
acataatagtctctacgctttattattatc--tcatttatattaaagctt-gactacatatgcatttaagaatagtgttctttatgttaatgtaatctca |
15526669 |
T |
 |
| Q |
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tgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgccatatattattcaa |
202 |
Q |
| |
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| T |
15526668 |
tgattaagtcacccttaatattccattacacgaactatatattctaggga-tttattaatcttataacaaatataataaagaatgtcatatattatttaa |
15526570 |
T |
 |
| Q |
203 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
15526569 |
taataaaagtcatgatacgtagcttaagtttaacataaattaatggcctatagggcttacaccaaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14226029 - 14225954
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Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |
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ttatttaataataaaagtcatgatacataacataaatttaacataaaaatattggtctctagagcttacaccaaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 119743 - 119477
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
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| T |
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tacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctc |
119644 |
T |
 |
| Q |
103 |
atgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaa |
202 |
Q |
| |
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| T |
119643 |
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119544 |
T |
 |
| Q |
203 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
| T |
119543 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
119477 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 24933593 - 24933861
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Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
24933692 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
24933693 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
24933792 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
24933793 |
aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31914 - 31646
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100 |
Q |
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| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
31814 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
31715 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
31714 |
aataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcctctaaggcttacaccaaca |
31646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23545937 - 23545669
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| Q |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
23545937 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
23545838 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
23545837 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattaatc |
23545738 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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| T |
23545737 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctcacaccaaca |
23545669 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 12789950 - 12790219
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12789950 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
12790049 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
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T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctttagggcttacaccaacag |
12790219 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 25805672 - 25805941
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggatatatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25805772 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
25805871 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
270 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25805872 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
25805941 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22941265 - 22940997
Alignment:
| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
22941265 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcaaattaaagctttgactacggatacatttaagaataacattctttaagataatgtaatc |
22941166 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
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| T |
22941165 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatatattattc |
22941066 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22941065 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22940997 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31096831 - 31096563
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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Q |
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|
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|
|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatc |
31096732 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31096731 |
ccatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
31096632 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
31096631 |
aataataagagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
31096563 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20941042 - 20940774
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20941042 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatc |
20940943 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20940942 |
tcatgattaagtcacagttaatatattattacacgaactatctattctaaggacattattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattc |
20940843 |
T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20940842 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacacaaaca |
20940774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 12765281 - 12765544
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| Q |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
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catacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
12765377 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12765378 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
12765477 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
266 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12765478 |
caataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
12765544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 7865721 - 7865987
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7865721 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
7865817 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7865818 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtcatatattatt |
7865917 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7865918 |
caataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttaaaccaaca |
7865987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 12704165 - 12704428
Alignment:
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1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
12704165 |
catacatagtagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
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|
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| T |
12704262 |
tcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
12704361 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
266 |
Q |
| |
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| T |
12704362 |
caataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26245117 - 26244850
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Q |
| |
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|
|
| T |
26245117 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctt-attcatattaaagctt-gattacagatacatttaagaataacattctttatgataatgtaatc |
26245020 |
T |
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199 |
Q |
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T |
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269 |
Q |
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Target Start/End: Original strand, 9812024 - 9812287
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T |
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| Q |
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199 |
Q |
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T |
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| T |
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Target: chr5; HSP #14
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr5; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39535479 - 39535211
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T |
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Q |
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tcatgattaagtcacacttaatataccattatatgaactatctattccagggactttattaacattataacaaatataataaagagtgtcatatattatt |
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T |
 |
| Q |
200 |
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269 |
Q |
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| T |
39535281 |
taataaaaaaaattcatgatacataacgtaaatttaacataaactattgacctctagggcatacaccaaca |
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Target: chr5; HSP #16
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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20100726 |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
198 |
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269 |
Q |
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26130178 |
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T |
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Target: scaffold0378; HSP #1
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T |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
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269 |
Q |
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8120 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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Target: scaffold0393 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
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Target: scaffold0393; HSP #1
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T |
 |
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200 |
Q |
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T |
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267 |
Q |
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aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
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Target: scaffold2089; HSP #1
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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269 |
Q |
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| T |
201 |
attcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacaaaaactattggcctctagggcttacaccaaca |
273 |
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Target: scaffold0037; HSP #1
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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acataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
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Target: scaffold0019 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
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Q |
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atctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
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Q |
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| T |
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T |
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aactattggcctctagggcttacaccaacaga |
271 |
Q |
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| T |
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aactattggcctctagggcttacaccaacaga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
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Target: scaffold0006; HSP #1
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2 |
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Q |
| |
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atacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaataacgttctttatgatactgtaatct |
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T |
 |
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catgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattc |
200 |
Q |
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catgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattc |
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T |
 |
| Q |
201 |
aataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
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| T |
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aataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0063
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Target: scaffold0063; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 45235 - 45502
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
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| T |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacaagaactatctattgtaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatt |
45432 |
T |
 |
| Q |
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caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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| T |
45433 |
caataataaaagtcatgatgcataagataagtttaacagaaactattggccttttgggcttacaccaaca |
45502 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0099; HSP #1
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| T |
9125 |
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9026 |
T |
 |
| Q |
94 |
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192 |
Q |
| |
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| T |
9025 |
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8926 |
T |
 |
| Q |
193 |
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269 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8925 |
tattattctaataataaaagtacatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Target: scaffold0376; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 11817 - 12083
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Q |
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|
| T |
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catacataatagtttcgacgctttattattatcct--aattatattaaagatt-gactacagatacatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatc |
11913 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |
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| T |
11914 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatacaataaagaatgtcatatattatt |
12013 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12014 |
caataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
12083 |
T |
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Target: scaffold0112; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 198 - 1
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
198 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccattattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaacagcgttctataagataatgtaatc |
99 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattat |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
98 |
tcattattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattat |
1 |
T |
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Target: scaffold1948; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 961 - 1169
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
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961 |
ggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatcacatgattaagtcacacttaatatattattaaaaaaactatctattataaggactttatt |
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T |
 |
| Q |
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aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
260 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1061 |
aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
1160 |
T |
 |
| Q |
261 |
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269 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
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| T |
1161 |
acaccaaca |
1169 |
T |
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Name: scaffold0139
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Target: scaffold0139; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 18786 - 18969
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagag |
18885 |
T |
 |
| Q |
186 |
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269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18886 |
tgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Target: scaffold0061; HSP #1
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gttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataat |
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T |
 |
| Q |
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aaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaagagtgtcatattttattcaatattaaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
76307 |
T |
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Name: scaffold0031
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Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 40275 - 40542
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Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || |
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|
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T |
 |
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tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatgattaagtcacacttaatataccattacatgaattatctattccagagactttattaatattacaaaaaatataataaagagtgtcatatattatt |
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T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40473 |
taataataaaagtcatgctacatagcataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
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T |
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Name: scaffold0466
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Target: scaffold0466; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 13236 - 13489
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
13236 |
catacataatagtctcgacgctttattattatccca-attaatattaaagctt-gactatggatacatttaagaatactgttttttatgttaatgtaatc |
13333 |
T |
 |
| Q |
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tcatgattaagtcacacttaatatattatt-acatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattat |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
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tcatgattaaatcacacttaatatatcatttacatgaactatctattctagggactttattagcattactacaaatataattaagagagccatatattat |
13433 |
T |
 |
| Q |
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tcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13434 |
tcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaacataaactattggcctcta |
13489 |
T |
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Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9672 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgccacatattattccataataaaagt |
9573 |
T |
 |
| Q |
213 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9572 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
9516 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0086 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:
Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 53780 - 53521
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catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
53780 |
catacataatagtcttgacactttattattatccta-attcatattaaagctt-gaatacggatacatttaagaatagtgttctttatgttaatgtaatc |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53682 |
tcat--------cacacttaatatatcattacatgaactatttactctagggactttattaacattactatgaatcgaataaagagtgtcatatattatt |
53591 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53590 |
caataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
53521 |
T |
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Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
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Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
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Target Start/End: Original strand, 33927 - 34060
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aactatctattctaatgactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33927 |
aactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccacatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
34026 |
T |
 |
| Q |
236 |
cataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34027 |
cataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
34060 |
T |
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Target: scaffold0454 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
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Target: scaffold0454; HSP #1
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gactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
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Q |
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|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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gactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggtc |
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T |
 |
| Q |
251 |
tctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tctagggcttacaccaaca |
13740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0111; HSP #1
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26567 |
ctactgatacatttaagaataacgttctttattataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatacgattacacgaactatctattctagggactt |
26468 |
T |
 |
| Q |
157 |
tattaacattatcta--aatataataaagagtgccatatattattcaataataaaa |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26467 |
tattaacatta-caacgaatataataaagagtgccatatattatttaataataaaa |
26413 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0136 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
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Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
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1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
8746 |
catacatattagtctctacgctttattactatc-tcaatttatattaaaactt-gactacaaatacttttaagaatagtgttctttatgttaatgtaatc |
8649 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaatgactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||||||| | || || ||||| |
|
|
| T |
8648 |
tcatgattaagtctcacataatgt-ccattacttgaactatatattctaaggactttattaatattatatcaaatttcataaagaatacctcattttatt |
8550 |
T |
 |
| Q |
200 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8549 |
taataataaaaatcacgatacataaaataattttaacataaaactattaacctctaggatttacaccaaca |
8479 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0783 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
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Target: scaffold0783; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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6284 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggcttctagggcttacaccaacacattg |
6222 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1400 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
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Target: scaffold1400; HSP #1
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Q |
| |
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|
|
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cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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