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Alignment Overview

Query: NF9282_low_1 (Length: 831)

Name: NF9282_low_1
Description: NF9282
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9282_low_1
NF9282_low_1
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (428-820)||(3097096-3097488)
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chr8 (604-714)||(23018099-23018209)
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chr8 (575-613)||(26243065-26243103)
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chr8 (645-753)||(26490977-26491085)
chr8 (479-523)||(36114220-36114264)
chr8 (645-696)||(19649230-19649281)
chr8 (624-711)||(31201649-31201735)
chr8 (650-696)||(10552923-10552969)
chr8 (677-726)||(6876607-6876656)
chr8 (574-615)||(26575808-26575849)
chr8 (645-726)||(29970846-29970926)
chr8 (645-713)||(32767481-32767547)
chr8 (645-698)||(33588764-33588817)
chr8 (557-610)||(36121633-36121686)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (428-753)||(10853224-10853544)
chr3 (20-373)||(10853600-10853950)
chr3 (439-753)||(42318164-42318473)
chr3 (435-753)||(38340637-38340949)
chr3 (500-754)||(52966765-52967015)
chr3 (442-754)||(38125398-38125705)
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chr3 (557-754)||(3348191-3348388)
chr3 (557-756)||(38172261-38172460)
chr3 (439-754)||(44224596-44224907)
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chr3 (553-747)||(35930682-35930876)
chr3 (574-753)||(26519629-26519808)
chr3 (497-753)||(53074795-53075046)
chr3 (557-754)||(10334086-10334283)
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chr3 (557-754)||(35425282-35425477)
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chr3 (557-719)||(53179797-53179958)
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chr3 (558-713)||(25847982-25848136)
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chr3 (580-754)||(42475680-42475854)
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chr3 (605-729)||(40415277-40415401)
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chr3 (574-711)||(45423768-45423904)
chr3 (559-727)||(14651085-14651252)
chr3 (571-728)||(49526651-49526808)
chr3 (613-721)||(29716675-29716783)
chr3 (571-727)||(14959681-14959829)
chr3 (20-79)||(51459977-51460035)
chr3 (672-726)||(52813278-52813332)
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chr3 (700-754)||(31618368-31618422)
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chr3 (644-737)||(42644297-42644390)
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chr3 (435-486)||(38172503-38172553)
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chr3 (645-726)||(21023201-21023280)
chr3 (574-615)||(33329436-33329477)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (428-728)||(3060203-3060500)
chr5 (20-373)||(3060556-3060914)
chr5 (444-750)||(24045684-24045985)
chr5 (557-754)||(32454499-32454696)
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chr5 (557-754)||(40885172-40885370)
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chr5 (557-754)||(40495311-40495507)
chr5 (581-754)||(5710339-5710511)
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chr5 (439-680)||(28869530-28869765)
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chr5 (562-750)||(2694717-2694905)
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chr5 (672-754)||(35847843-35847925)
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chr5 (575-715)||(2861617-2861760)
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chr5 (645-697)||(2483724-2483776)
chr5 (42-120)||(2456984-2457062)
chr5 (580-754)||(3747544-3747717)
chr5 (645-698)||(22811076-22811129)
chr5 (672-736)||(33467963-33468027)
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chr5 (574-615)||(33082423-33082464)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (439-751)||(30841951-30842258)
chr4 (435-754)||(15603175-15603490)
chr4 (557-750)||(9889295-9889487)
chr4 (557-752)||(39636718-39636913)
chr4 (557-752)||(43781477-43781671)
chr4 (435-753)||(31520328-31520640)
chr4 (557-754)||(46830025-46830222)
chr4 (439-729)||(48407679-48407964)
chr4 (553-754)||(28986950-28987148)
chr4 (557-750)||(9893644-9893837)
chr4 (553-753)||(6138577-6138776)
chr4 (557-754)||(14564102-14564299)
chr4 (557-754)||(51922873-51923070)
chr4 (574-754)||(29149263-29149443)
chr4 (500-711)||(4954050-4954257)
chr4 (444-711)||(49136346-49136609)
chr4 (441-753)||(14072331-14072631)
chr4 (557-754)||(16566238-16566435)
chr4 (557-747)||(42944861-42945051)
chr4 (557-754)||(32238015-32238211)
chr4 (558-754)||(19592187-19592383)
chr4 (557-753)||(26651805-26652001)
chr4 (553-756)||(49519659-49519865)
chr4 (557-753)||(26426072-26426267)
chr4 (557-754)||(43772079-43772276)
chr4 (553-713)||(48550424-48550584)
chr4 (557-750)||(54152978-54153170)
chr4 (576-719)||(6505153-6505296)
chr4 (579-754)||(48550172-48550347)
chr4 (580-754)||(54150482-54150656)
chr4 (557-750)||(14075948-14076140)
chr4 (557-750)||(54735611-54735803)
chr4 (577-753)||(48908228-48908402)
chr4 (575-754)||(13167476-13167655)
chr4 (580-753)||(25312671-25312844)
chr4 (557-750)||(13183010-13183203)
chr4 (553-713)||(15619546-15619703)
chr4 (594-754)||(39187704-39187864)
chr4 (557-701)||(56241844-56241988)
chr4 (577-696)||(2175161-2175280)
chr4 (471-730)||(38693901-38694154)
chr4 (586-736)||(46926010-46926160)
chr4 (605-726)||(38263881-38264001)
chr4 (559-699)||(30887165-30887304)
chr4 (574-752)||(14054801-14054979)
chr4 (624-750)||(45779970-45780095)
chr4 (646-754)||(41866176-41866284)
chr4 (575-754)||(38305962-38306141)
chr4 (643-729)||(33574197-33574283)
chr4 (579-719)||(19599487-19599625)
chr4 (571-750)||(53531924-53532103)
chr4 (575-754)||(54488556-54488735)
chr4 (631-729)||(55638736-55638834)
chr4 (553-636)||(55638861-55638944)
chr4 (599-754)||(523129-523280)
chr4 (571-697)||(28752462-28752587)
chr4 (709-754)||(26459852-26459897)
chr4 (575-636)||(48257054-48257115)
chr4 (672-728)||(4649911-4649967)
chr4 (579-614)||(5025484-5025519)
chr4 (658-753)||(54655266-54655361)
chr4 (645-711)||(54487219-54487285)
chr4 (574-711)||(16492879-16493014)
chr4 (669-750)||(20232028-20232108)
chr4 (651-751)||(22694556-22694656)
chr4 (643-704)||(24512222-24512283)
chr4 (644-713)||(36150624-36150693)
chr4 (440-509)||(54152871-54152940)
chr4 (643-711)||(33843801-33843869)
chr4 (645-713)||(39993574-39993642)
chr4 (574-614)||(45106358-45106398)
chr4 (645-713)||(53914920-53914987)
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 428 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 3097488 - 3097096
Alignment:
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    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097488 ctcatacattaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggt 3097389  T
Q  528 gtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097388 gtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 3097289  T
Q  628 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097288 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 3097189  T
Q  728 tcaccaccgctataccaaacacacactcacgggtaatataaaccnnnnnnngtcaaaagacacatttcattacaaaacttcccaaacacgaaa 820  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097188 tcaccactgctataccaaacacacactcacgtgtaatataaaccaaaaaaagtcaaaagacacatttcattacaaaacttcccaaacacgaaa 3097096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 125 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3097803 - 3097611
Alignment:
Q  125 gcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctggcacaaatataactttttatctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattccccga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097803 gcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctgacacaaatataactttt-atctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattccccga 3097705  T
Q  225 aatatgttgctctctaannnnnnnataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgcatactgtacttctattatattgtaaattagtatagtgtg 318  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097704 aatatgttgctctctaatttttttataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgcatattgtacttctattatattgtaaattagtatagtgtg 3097611  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 576 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25698093 - 25697917
Alignment:
Q  576 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaact 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  25698093 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 25697995  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25697994 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgctataccaagcacacac 25697917  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 3467489 - 3467686
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |    
T  3467489 gatagtttggtcattccatatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaccaacatcaattcataagaatcacttttaaataaatatatccaaacaga 3467588  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3467589 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 3467686  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 441 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6399373 - 6399104
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttata 540  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||  ||  | | |||| ||| | |    
T  6399373 attattttaaaaggaatttatgaaccaataaaaatgtacttatgattttagaaaagtagaaataattatctgaaaagaaaatatgatatttagtttcaaa 6399274  T
Q  541 tacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 640  Q
     |||||| |    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6399273 aacaattaa----aaagataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgattaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 6399178  T
Q  641 agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcta 714  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6399177 agtgtatcgaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctatcaaactcaattcta 6399104  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 435 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 28425731 - 28425428
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||          | ||||||||||||||||||  |||| || || | |||| |    
T  28425731 attaagattattttaaaatgaatttttgaagcaataaaaattcatttat----------atgttgaaataattatctaa--tgagaataagatatttact 28425644  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||| |||||||| |    || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28425643 tttaaatacaattaa----aaggatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttg 28425548  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| || ||||    
T  28425547 taagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccac 28425448  T
Q  735 cgctataccaaacacacact 754  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  28425447 cgtcataccaaacacacact 28425428  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 577 - 752
Target Start/End: Original strand, 27649722 - 27649896
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||    
T  27649722 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatctaaacat-attcaattcatatccaaatc 27649820  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||||||||||||    
T  27649821 acttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcccaaccaaacacaca 27649896  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 558 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 4941933 - 4941739
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||||||||||    
T  4941933 ataatttggtcattttacattcaaaatcaattttaattcaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcgcttttaaataattttatccaaacataa 4941834  T
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4941833 atcaattcacctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcagaatcaattctagccaccgccataccaaacacaca 4941739  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 8124945 - 8125123
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8124945 catttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacttcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacat-aatcaattcacatcaaac 8125043  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  8125044 tcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcgattcaaccaaaatcaattatcaggactgctataccaaacacacact 8125123  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 559 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 40742444 - 40742260
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | ||| ||||||||||||||    
T  40742444 taatttggtcactacacatttaaaatcaattttgatttaaaatatccaaacatcatcaactcataagaatcacttaca--ttagtgtatccaaacataaa 40742347  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaa 745  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  40742346 tcaattcagatcaaactcacttttaacgaaaatcaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgtcgctataccaa 40742260  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 557 - 728
Target Start/End: Original strand, 44926797 - 44926967
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  44926797 gataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaataacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacat- 44926895  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44926896 aatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattct 44926967  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 22936927 - 22936749
Alignment:
Q  576 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaact 675  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  22936927 attcaaaaccaaatttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaact 22936828  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22936827 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 22936749  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 577 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 36114173 - 36113999
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||     
T  36114173 ttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataac-caatctacatcaaactt 36114075  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  36114074 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgtcataccaaacacaca 36113999  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 440342 - 440173
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  440342 gataagttggtcattatacattcaaaatcagttttgattcaatctatccaaacaacgttaactcataagaatcatttttaactgaatgtatccaaacata 440243  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  440242 aatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcagactcaattctatcaaaatcaatt 440173  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 33627170 - 33626990
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33627170 acattcaaaatcgattttgattcaaactatccaaacaacattaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcttatccaa 33627071  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  33627070 ctcagttttaaataaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattccctccaccgccgaaccaaacacacact 33626990  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 557 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 38152327 - 38152153
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  38152327 gatactttggtcattacacgttcaaaatcaattttgatttaaagtatccaaaccacatcaactcataagaatcatttttaagtaaatatttccaaacata 38152228  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcacc 732  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38152227 aatcaatttacatcaaactcac-tttaactaaaatcaattttctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcacc 38152153  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 588 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 42143486 - 42143323
Alignment:
Q  588 ttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacca 687  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  42143486 ttttgtttcaaattatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaacta 42143387  T
Q  688 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42143386 aaatcaattttctcaaactcaattatatcataatcaattctcgccaccgccataccaaacacac 42143323  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 577 - 759
Target Start/End: Original strand, 38114421 - 38114602
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||     
T  38114421 ttcaaaatcaatttttgttcgaaatattcaaacaacctcaactcataagaatcacttgaaaccgagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaactt 38114519  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacactcacgg 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  38114520 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaataaattctcaccaccgccaaaccaaacacacactaacgg 38114602  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 606 - 751
Target Start/End: Original strand, 26243129 - 26243274
Alignment:
Q  606 aaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaac 705  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26243129 aaacatcaccaactcataagaatcacttttaaacaattatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaac 26243228  T
Q  706 tcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26243229 tcaattctatcaaaatcaattctcactgccgctataccaaacacac 26243274  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 575 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 41289193 - 41289016
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||| |   |||    
T  41289193 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacctataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacaatcaac 41289094  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| | ||||||| ||||    
T  41289093 tcacttttaattaaaatcaattctctcaaactcaattctgtcaaaatcaattctcgccgccgccaaaccaaacccaca 41289016  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 587 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 24897710 - 24897547
Alignment:
Q  587 attttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacc 686  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24897710 attttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaaataaatgtatccaaacataattca-ttcatatccaactcacttttaacc 24897612  T
Q  687 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  24897611 aaaatcaattctcataaactcaattttatcaaaatcaattcttaccgccgccataccaaacacac 24897547  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 557 - 713
Target Start/End: Original strand, 40742080 - 40742236
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||    
T  40742080 gataatttgatcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaatatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacata 40742179  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40742180 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 40742236  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 15206670 - 15206849
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  15206670 cattcaaaatcaattttgggccaaactatccaaacaacatgaatttttaagaatcacttctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaac 15206769  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  15206770 tcacttttacccaaaatcaattttgtcaaactcaattctatcaaaattaattctctccaccactgaaccaaacacacact 15206849  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 574 - 713
Target Start/End: Original strand, 42148978 - 42149117
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42148978 acattcaaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacatcaactcatacgaatcacttttaaataagtctatccaaacataaatcaattcacctcaaa 42149077  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  42149078 ctcacttttaaccaaaatcaattatatcagaatcaattct 42149117  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 571 - 701
Target Start/End: Original strand, 43550861 - 43550991
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  43550861 tacacattcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacatt 43550960  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctc 701  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43550961 caactcacttttaaccaaaatcaattttctc 43550991  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 496 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 34343059 - 34342873
Alignment:
Q  496 gttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgat-aatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgat 594  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | ||||||||     ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34343059 gttgaaataattatctaa--tgagaatgaggtgtttattttaaaatacaatt-----aaaagattaatttggtcattacac-ttcaaaatcaattttgat 34342968  T
Q  595 tcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaat 691  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34342967 tcaaattatccaaacaacatccact-ataagaatcacttttaaataaatttatccaaacaaaaatcaattcatatc-tactcacttttaaccaaaat 34342873  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 557 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 30081803 - 30081635
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||  || ||  ||||||||||||    
T  30081803 gataatttggtcattacacatctaaaatcaattttgaaacaaactatccaaacaacatcagcccataagaattgcttttgtgtcagcttatccaaacata 30081704  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30081703 aatcaattca-ctttaactcacttttaactaaaatcaattttcacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 30081635  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Original strand, 29023212 - 29023376
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |||||||| ||||| |||||||| |        
T  29023212 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcaattttaaacaagtgtatccaaatataaaccaattcatct---- 29023307  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||| ||||||||||    
T  29023308 ------------caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccaccaccataccgaacacacact 29023376  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 753
Target Start/End: Original strand, 35615683 - 35615861
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||    || |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||  |||    
T  35615683 cattcaaaatcaattttgagccaaactatccaaacaacaagaatatttaggaatcaattttaagtgaatgtatctaaacataaatcaattcccattcaac 35615782  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  35615783 tcacttctttccaaaatcaatcttgtcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgctgaaccaaacagacac 35615861  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 575 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 31246450 - 31246273
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  31246450 catttaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaac 31246351  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||    
T  31246350 tcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacaca 31246273  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 669 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 30085680 - 30085596
Alignment:
Q  669 tcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30085680 tcaaattcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattatatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaacacacac 30085596  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 652 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30759363 - 30759261
Alignment:
Q  652 acataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||    
T  30759363 acataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatattaaaatcaattcttcccatcgccaaaccaaacacac 30759264  T
Q  752 act 754  Q
    |||    
T  30759263 act 30759261  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 626 - 754
Target Start/End: Original strand, 25497717 - 25497845
Alignment:
Q  626 aatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaat 725  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||    
T  25497717 aatcacttttaaataagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcctaaactcaattttatcaaaatcaat 25497815  T
Q  726 tctca-ccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||| | || | || ||||||||||||||||    
T  25497816 tcttaccctcggccataccaaacacacact 25497845  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 645 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 36121609 - 36121502
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  36121609 tatccaaacataa-tctattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgacaccgctgtacca 36121511  T
Q  745 aacacacac 753  Q
    |||||||||    
T  36121510 aacacacac 36121502  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 559 - 719
Target Start/End: Original strand, 16915019 - 16915175
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||  |||    
T  16915019 taatttagtcattacacattcaaaatcaattttgatacaaaccaaccaaacatcattaactcataagaatcacttttatgttggtgtatccaaac--aaa 16915116  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    ||||||    |||||||||| ||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  16915117 tcaatt-tcgtcaaactcacgttt-actaaaatcaattctcccagaatcaattctatcaaa 16915175  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 686 - 754
Target Start/End: Original strand, 26125842 - 26125910
Alignment:
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26125842 caaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctgtaccaaagacacact 26125910  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 557 - 636
Target Start/End: Original strand, 41981113 - 41981192
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    |||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981113 gatagtttggtcattccatatttaaaatcaattttgattcaaagtatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 41981192  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 579 - 736
Target Start/End: Original strand, 11126494 - 11126651
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcat-atcaaactca 677  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |   | ||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||      
T  11126494 caaactcaattttgattcaaactatccaaacaacacaaactcatgaaaatcacttatttataagtgtatccaaacataaatcaatctatgatc-aacttt 11126592  T
Q  678 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccg 736  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  11126593 cttttaactaaaatcaattctctcgaaataaattctaacaaaatcaattctcatcaccg 11126651  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 557 - 663
Target Start/End: Original strand, 26125528 - 26125634
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||    
T  26125528 gatattttcgtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccgtccaaacattatcaactcataagaatcatttttacattagtgtatccaaacata 26125627  T
Q  657 aatcaat 663  Q
    |||||||    
T  26125628 aatcaat 26125634  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 574 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 3619204 - 3619053
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |  | | | |||||||||| |||||||||    || ||    
T  3619204 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattgataagaatcactttcatattaatgtatccaaacacaaatcaatttcactc-aa 3619106  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||| | || |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3619105 ctcacttttgatcagaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 3619053  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 577 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 45147383 - 45147247
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||   ||||   ||  |||||    
T  45147383 ttcaaaatcaattttgattcaagttattcaaacaatatcaacttataagaatcacttttaaatgagagtgtccaaacataaccaaatttgcattcaactc 45147284  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  45147283 acttttaaccaaattcgattctatcaaaatcaattct 45147247  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37458439 - 37458344
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaaca--acatc---aactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatt 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   || | |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  37458439 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacatcacatcatgaattgataagaatcacttttatgtcaatatatccaaacataaatcaatt 37458344  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3097589 - 3097543
Alignment:
Q  327 acggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097589 acggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 3097543  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3465478 - 3465396
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  3465478 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcaccgcagaaccaaacacacact 3465396  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 638 - 704
Target Start/End: Original strand, 39219758 - 39219824
Alignment:
Q  638 gtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 704  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39219758 gtgaggatatccaaacataaatcacttcatattaaactcacttttaacgaaaatcaattctatcaaa 39219824  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Original strand, 23018099 - 23018209
Alignment:
Q  604 ccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaa 703  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||   |  || ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  23018099 ccaaacaaaatcaattaataagaatcacttttgcattcgtgtatccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgatcaaaatcaattcgatcaa 23018198  T
Q  704 actcaattcta 714  Q
    |||||||||||    
T  23018199 actcaattcta 23018209  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24297721 - 24297548
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |  | | |  ||||||| |||||| ||||    || ||||||||    
T  24297721 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatgcattactaagaatcactttcatattaatgcatccaaatataaattaatttcactc-aactcact 24297623  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||| |    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   ||||||||||||||    
T  24297622 tttgattcgaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaattaatttttatcaccgcagaaccaaacacacact 24297548  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 613
Target Start/End: Original strand, 26243065 - 26243103
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243065 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 26243103  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 638 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 37667129 - 37667057
Alignment:
Q  638 gtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  37667129 gtgagtatatccaaatataaatcaattcacattaaactta-ttttaacgaaaatcaattctatcaaaatcaatt 37667057  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 8702531 - 8702392
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||| || |  || ||| |||||||    
T  8702531 aattttgacccaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcactttaaggataatgtatccaaacataaatcaatt-atcttcaaatcatttttaac 8702433  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
     |||||||||| |   ||| |||||||||||||||| ||||    
T  8702432 taaaatcaattttgctaaagtcaattctatcaaaatcaatt 8702392  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 571 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 41891958 - 41891915
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41891958 tacacatccaaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacat 41891915  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 644 - 750
Target Start/End: Original strand, 36779434 - 36779539
Alignment:
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacc 743  Q
    |||||||||||||||| | || | ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||   |||    
T  36779434 atatccaaacataaattactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgcacaacc 36779532  T
Q  744 aaacaca 750  Q
    |||||||    
T  36779533 aaacaca 36779539  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 694
Target Start/End: Original strand, 14382178 - 14382285
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||    
T  14382178 aattttgacccaaactatccaaataacatgaattgataagaatcactttaaggataatgtatccaaacataaatcaatt-atgttcaaatcacttttaac 14382276  T
Q  686 caaaatcaa 694  Q
     ||||||||    
T  14382277 taaaatcaa 14382285  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 648 - 696
Target Start/End: Original strand, 20190186 - 20190234
Alignment:
Q  648 ccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20190186 ccaaacataaatcattttatcttaaactcacttttaaccaaaatcaatt 20190234  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 474 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25698188 - 25698144
Alignment:
Q  474 attcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  25698188 attcatttatgattttagataagttcaaataattatgtaaaatga 25698144  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 753
Target Start/End: Original strand, 26490977 - 26491085
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    |||||||||| ||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |  || ||| ||||||   |||||| | ||||    
T  26490977 tatccaaacacaaatcaatttacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaattttgacagaatcaattctagtcaccgccacacca 26491076  T
Q  745 aacacacac 753  Q
    |||||||||    
T  26491077 aacacacac 26491085  T

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Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 36114264 - 36114220
Alignment:
Q  479 tttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatg 523  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36114264 tttatgattttagataatttgaaataattatctaaaatgagaatg 36114220  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 696
Target Start/End: Original strand, 19649230 - 19649281
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19649230 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 19649281  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 711
Target Start/End: Original strand, 31201649 - 31201735
Alignment:
Q  624 agaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||| |  || || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31201649 agaatcacttttaagcaaatgaatccaaacataaatcaattcatct-taattcgcttttaattaaaatcaattctgtcaaactcaatt 31201735  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 10552969 - 10552923
Alignment:
Q  650 aaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10552969 aaacataaatcaatttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 10552923  T

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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 6876656 - 6876607
Alignment:
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  6876656 acttttaatcaaaatcaattctgttaaactcaattctataaagattaatt 6876607  T

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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 615
Target Start/End: Original strand, 26575808 - 26575849
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 615  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26575808 acattcaaaagcaattttgatcaaaactatccaaacaacatc 26575849  T

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Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 726
Target Start/End: Original strand, 29970846 - 29970926
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||||||||||| || | |   |||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29970846 tatccaaacataaatcactttaaactcaactcacttttaactaaaatcaattat-acaaattcaattctatcaaaatcaatt 29970926  T

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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 713
Target Start/End: Original strand, 32767481 - 32767547
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||| | ||||||    
T  32767481 tatccaaacataaatcaatttacatccaactcactttta--cataatcaattcactcaaaattaattct 32767547  T

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Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 698
Target Start/End: Original strand, 33588764 - 33588817
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct 698  Q
    ||||||||||||||| | || | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33588764 tatccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattct 33588817  T

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Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 557 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36121686 - 36121633
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaaca 610  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36121686 gataatttagttattagacattcaaaattaattttgattcaaactattcaaaca 36121633  T

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Target: chr3 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 428 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 10853544 - 10853224
Alignment:
Q  428 ctcatacattaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10853544 ctcatacattaatattattttaaaatgatttgatgaaccaataaatattcatttat-----tagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgagat 10853450  T
Q  528 gtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853449 gtttaattttatatacaattgattgaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 10853350  T
Q  628 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10853349 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatttatattaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 10853250  T
Q  728 tcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10853249 tcaccaccgctataccaaacacacac 10853224  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10853950 - 10853600
Alignment:
Q  20 tcaccttgattctaacatcttgcattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgccatttaagagtgattctaggtgaagctcaaatttggagctt 119  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10853950 tcaccttgattctagcattttgcattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgccatttaag--tgattctcggggaagctcaaatttagagctt 10853853  T
Q  120 ctctggcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctggcacaaatataactttttatctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattc 219  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853852 ctgcggcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctgacacaaatataactttt-atctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattc 10853754  T
Q  220 cccgaaatatgttgctctctaannnnnnnataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgcatactgtacttctattatattgtaaattagtatagtgtg- 318  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10853753 cccgaaatatgttgctctctaa-tttttgataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgaatactgtacttccattatattgtaaattagtatagtgtgt 10853655  T
Q  319 nnnnnnnnacggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 373  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853654 gtttttttacggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 10853600  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 439 - 753
Target Start/End: Original strand, 42318164 - 42318473
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||    
T  42318164 atattattttaaaataaatttttgaaccaataaaaatccatttatgattttagataagttcaaataagtatctaaaataagaatgggatgtttagtttta 42318263  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     |||||||| |    || |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||     
T  42318264 aatacaattaa----aaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 42318359  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgct 738  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  42318360 caagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccgct 42318458  T
Q  739 ataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||||    
T  42318459 ataccaaacacacac 42318473  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 753
Target Start/End: Original strand, 38340637 - 38340949
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| | |||| |    
T  38340637 attaatattattttaaaataagtttgtgaagcaataaaaatccaattatgattt-agataagttcaaataattatctaaaataagaaagagatatttagt 38340735  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||||||| |||  |    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  38340736 tttatatataataaa----aaggataatttggtcactacacatttaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacgtcaacttataaaaattacttt 38340831  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  38340832 taa-taagcatatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttcattctatcaaaatcaattctcaccaa 38340930  T
Q  735 cgctataccaaacacacac 753  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  38340931 cgccataccaaacacacac 38340949  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 500 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 52967015 - 52966765
Alignment:
Q  500 aaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaa 599  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||| |||||||| |    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  52967015 aaataattatctaaaatgggaatgagatatataattttaaatacaattaa----aaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaac 52966920  T
Q  600 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52966919 ctatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaagtcacttttaaccaaaatcaattctc 52966820  T
Q  700 tcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | | ||||||||||||||    
T  52966819 tcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccacctccaaaccaaacacacact 52966765  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 38125705 - 38125398
Alignment:
Q  442 ttattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatat 541  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||||| ||    
T  38125705 ttattttaaaataaaattttgaaccaataaaaatccatttatgattttagataagttcaaataagtatctaaaataagaatgggatgtttagttttaaat 38125606  T
Q  542 acaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtga 641  Q
    |||||| |    || |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   |    
T  38125605 acaattaa----aaggataattttgtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaa 38125510  T
Q  642 gtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctata 741  Q
    || ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  38125509 gtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaacccacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccata 38125411  T
Q  742 ccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||    
T  38125410 ccaaacacacact 38125398  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 557 - 756
Target Start/End: Original strand, 20813094 - 20813292
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  20813094 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttgaataagtatatccaaacaaa 20813193  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacactca 756  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20813194 aatcaattcaaatccaactcacttttaaccaaacacaattctctcaaactc-attctatcaaaatcaattctctccaccgatataccaaacacacactca 20813292  T

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Target: chr3; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 445 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15511636 - 15511332
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Q  445 ttttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatataca 544  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | || ||||| | |||||||||| | |||    
T  15511636 ttttaaaataaatttgtgaaccaataaaaattcatttatgattttagataaattcaaatgattatctaaattaagaatgagatatttaattttaaacaca 15511537  T
Q  545 attgattgaaatga-taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagt 643  Q
    |||     ||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  15511536 att-----aaaagagtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-taagc 15511443  T
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacc 743  Q
     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  15511442 gtatccaaacataaatcaattcacacccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccgttctatcaaaatcaattatcgccaccgccatacc 15511343  T
Q  744 aaacacacact 754  Q
    |||||||||||    
T  15511342 aaacacacact 15511332  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 3348191 - 3348388
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3348191 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatataaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacata 3348290  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3348291 aatcaatttacatccaactcacttctaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgctatgccaaacacacact 3348388  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 557 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 38172460 - 38172261
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  38172460 gatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacata 38172361  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacactca 756  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  38172360 aatcaattcacatcccactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacactca 38172261  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 754
Target Start/End: Original strand, 44224596 - 44224907
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||  | ||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||  ||  | | |||| ||| |    
T  44224596 atattattttaaaaggaatttatgaaccagcaaaaatgtacttatgattttagaaaggtagagataattatctgaaaagaaaatatgatatttagtttca 44224695  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     | |||||| |    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44224696 aaaacaattaa----aaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgactaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 44224791  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgct 738  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| || ||||     
T  44224792 tgagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccataatcaattatctcaaactcaattctaccggaatcaattctccccgccgcc 44224891  T
Q  739 ataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||| |||||    
T  44224892 aaaccaaacaaacact 44224907  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 50664707 - 50664903
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  50664707 gataatttgatcattacacattcaaaatcaattttaatttaaactatctaaacaacat-aactcttaagaatcacttctaagtgtgtgtatccaaacata 50664805  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50664806 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 50664903  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 553 - 747
Target Start/End: Original strand, 35930682 - 35930876
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||  | ||| |||||||     
T  35930682 aaatgatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattatcaactcataagaatgacttatacattagtgtatccaag 35930781  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaac 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35930782 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaataaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgatataccaaac 35930876  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Original strand, 26519629 - 26519808
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  26519629 acatttaaaatcaattttgtttcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 26519728  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26519729 ctcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacac 26519808  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 497 - 753
Target Start/End: Original strand, 53074795 - 53075046
Alignment:
Q  497 ttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattc 596  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| | |||| || || |||||||| |    || | ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  53074795 ttgaaataattatctaaaatatagatgagatatttagttataaatacaattaa----aagggtaagttggtctttacgcatttaaaatcaattttgattc 53074890  T
Q  597 aaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53074891 aaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacat-aatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 53074989  T
Q  697 ctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  53074990 ctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttcaccgccgccgtatcaaacacacac 53075046  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 10334086 - 10334283
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||    
T  10334086 gatagtttggtcattataaattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacata 10334185  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  10334186 aatcaattcatattcaactgacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccatatcaaacacacact 10334283  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 557 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 8424882 - 8424684
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  8424882 gataatttagtcattacacactcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacata 8424783  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacactca 756  Q
    | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8424782 a-tcaattcacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaattcaattatgaccaccgctatactaaacacacgctca 8424684  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 553 - 754
Target Start/End: Original strand, 23496268 - 23496462
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||        ||||||||    
T  23496268 aaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccgcaagaatcacttttag-------tatccaaa 23496360  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23496361 cataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcctcgccgccataccaaacacaca 23496460  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 558 - 752
Target Start/End: Original strand, 21224939 - 21225133
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||     
T  21224939 ataatttggtcattatacactcataatcaattttgattcaaactatcaaaacgacatcaactcgtaagaatcgcttttaagaaagtgtatccaaacatat 21225038  T
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  21225039 atcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatagagatcaattctcgccgccgctaaaccaaacacaca 21225133  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 44939567 - 44939372
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||    
T  44939567 gataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattaaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttata-gtaaatgtatccaaacata 44939469  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44939468 a-tcaattcatattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaattcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacact 44939372  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 35425282 - 35425477
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     ||| |||||||||||     
T  35425282 gataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacat- 35425380  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  || ||||||||||||    
T  35425381 aatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcccta-caaacacacact 35425477  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 496 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 16246302 - 16246054
Alignment:
Q  496 gttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatt 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||| ||||| |||||||| |    || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16246302 gttgaaataattatctaa--tgagaatgtggtatttacttttacatacaattaa----aaggatagtttgatcattacacattcaaaatcaattttgatt 16246209  T
Q  596 caaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaat 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16246208 caaactatccaaacaacatcaactcctaagaatcacttctattaaagtgtttccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaactaaaatcaat 16246109  T
Q  696 tctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
      |||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  16246108 --tctcaaactcaattctattaatatcaattctcgctaccgccaaaccaaacacaca 16246054  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 48189594 - 48189398
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      || ||||||||||||    
T  48189594 gataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacata 48189495  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  48189494 a-tcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccctaccaaacacacact 48189398  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 557 - 719
Target Start/End: Original strand, 53179797 - 53179958
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  53179797 gataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgatttaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacata 53179895  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  53179896 aatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatataaaactcaattctatcaaa 53179958  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 558 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30811683 - 30811488
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |     ||| |||||||||||||    
T  30811683 ataatttaatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaagtcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataa 30811584  T
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  30811583 -tcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgccctaccaaacacacact 30811488  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 435 - 713
Target Start/End: Original strand, 31084047 - 31084311
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||       | |||||||||||||| |||  |||| ||||| | |||| |    
T  31084047 attaatattattataaaataaatttttgaagcaataaaaattcatttataat-------aagttgaaataattatataa--tgagaatgagatatttact 31084137  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||| |||||||| |    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  31084138 tttaaatacaattaa----aatgatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaataatatcaagtcataagaatcacttt 31084233  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31084234 taag-aagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaaatcaattct 31084311  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 558 - 713
Target Start/End: Original strand, 25847982 - 25848136
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  25847982 ataatttggtcattacacatttaaaatcaatttttattcaa-ctatccaaacaacacaaactcataagaatcatttttaagtgaaggtatccaaacataa 25848080  T
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25848081 atcaattcatattaaactcactttttaccaaaattaattttctcaaactcaattct 25848136  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 754
Target Start/End: Original strand, 4984592 - 4984726
Alignment:
Q  620 cataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4984592 cataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaattcaattatatcaaa 4984691  T
Q  720 attaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4984692 atcaattctccccaccgccataccaaacacacact 4984726  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Original strand, 42475680 - 42475854
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  42475680 aaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtattcaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 42475779  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||||    
T  42475780 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctataaaaatcaattctcgtcaccgccaaaccaaacgcacact 42475854  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 562 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 23207214 - 23207039
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatca 661  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||| |||||||||||||||||    
T  23207214 tttggtcattacaagttcaaaattaattttgattcaaactatc-aaacaacatcaactcataa-aatcacttgtaaaaaagtgtatccaaacataaatca 23207117  T
Q  662 attcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgcta 739  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  23207116 attcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattataacaaaatcaattatatcaaaatcaattttcgccaccgcta 23207039  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 557 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31619040 - 31618931
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31619040 gataagttgatcattatacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctaagtgagagtatccaaacata 31618941  T
Q  657 aatcaattca 666  Q
    ||||||||||    
T  31618940 aatcaattca 31618931  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 752
Target Start/End: Original strand, 34561074 - 34561251
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  34561074 cattcaaaatcaattttgggtcaaactatccaaccaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcgcattcaac 34561173  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||  ||||||||||||    
T  34561174 tcacttttaaccaaaatcaattttatcaaacttaattctatcaaaatcaattttctccactgctgaaccaaacacaca 34561251  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 657 - 754
Target Start/End: Original strand, 55154549 - 55154646
Alignment:
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  55154549 aatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccactgccataccaaacacacact 55154646  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 572 - 696
Target Start/End: Original strand, 32357474 - 32357597
Alignment:
Q  572 acacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatca 671  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| | ||||    
T  32357474 acacgttcaaaatcaattttaattcaaagtacccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaaatgagtgttttcaaacataaatcaatttacatca 32357573  T
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    || |||| || ||||||||||||||    
T  32357574 aattcac-ttcaaccaaaatcaatt 32357597  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 586 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 30810069 - 30809942
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  30810069 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaatttataagaatcacttttaagtaagcgtaatcaatcataaatcaattcacatttaactcacttttaac 30809970  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  30809969 caaactcaattttatcaaaatcaattct 30809942  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 641 - 726
Target Start/End: Original strand, 19877449 - 19877534
Alignment:
Q  641 agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19877449 agtatatctaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaataaatt 19877534  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 605 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 40415401 - 40415277
Alignment:
Q  605 caaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 704  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||  | |||    
T  40415401 caaacaaaatcaacttataagaattatctttaagtgggtatatccaaacataaattaatttacatccaactcacttttaactaaaatcgattcctttaaa 40415302  T
Q  705 ctcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  40415301 ctcaattctatcaaaatcaattctc 40415277  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 558 - 639
Target Start/End: Original strand, 22736930 - 22737011
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagt 639  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22736930 ataatttgttcattacacattcaaaatcaattttgattcaaaccatcccaacaacattaactcataataatcacttttaagt 22737011  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 574 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 45423904 - 45423768
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||| |  || ||    
T  45423904 acatccaaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttc-aa 45423806  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  45423805 ctcacttttaggcaaaatcaattctatcagaatcaatt 45423768  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 14651252 - 14651085
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||| | || || ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| | || |  ||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  14651252 taatttggtaattatactttcaaaagctattttgattcaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatgtaagtatatcaaaacacaaa 14651153  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  14651152 tcaatt-atattcaactcacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattttattaaaatcaattc 14651085  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 49526808 - 49526651
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| || | |||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||| | |      
T  49526808 tacacattcaaaagcaattttgatttagactatttaaacaacataaattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacaat 49526709  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
     || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||    
T  49526708 caattcacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaatttcatcaaactcaattct 49526651  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 613 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 29716783 - 29716675
Alignment:
Q  613 atcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattc 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |   | || | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29716783 atcaattcataagaatcacttttaattaaacgtgtctataaataaatcaattcatatttaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattt 29716684  T
Q  713 tatcaaaat 721  Q
    |||||||||    
T  29716683 tatcaaaat 29716675  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 727
Target Start/End: Original strand, 14959681 - 14959829
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||   | | |||||||| |||||| | || |||||    
T  14959681 tacacattcaaaatcaagtttgattcaaatcatctaaacaacatcaactcataaaaatc----ttaa---aatgtatccaaaaataaatgagttaatatc 14959773  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  14959774 aaactcacttttaattaaaatcaattatttcaaattcagtt-tatcaaaatcaattc 14959829  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 51460035 - 51459977
Alignment:
Q  20 tcaccttgattctaacatcttgcattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgcc 79  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51460035 tcaccttgattctagcattttgcattatgtttggttgccttttctaaaag-aattctgcc 51459977  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 726
Target Start/End: Original strand, 52813278 - 52813332
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52813278 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 52813332  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 750
Target Start/End: Original strand, 35930876 - 35930929
Alignment:
Q  697 ctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  35930876 ctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccagtataccaaacaca 35930929  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 650 - 728
Target Start/End: Original strand, 22737055 - 22737133
Alignment:
Q  650 aaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22737055 aaacataaatcaatttacattctacttacttttaaccaaaatcaattttttcaaactcaattctatcgatattaattct 22737133  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 37698519 - 37698374
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |  | | |  |||||||||||||| ||||    || ||||||||    
T  37698519 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattactaagaatcactttcatattaatgcatccaaacataaattaatttcactc-aactcact 37698421  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||| | |  |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  37698420 tttgatccgaatcaattcattcacaatcaattctatcaaaattaatt 37698374  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 636
Target Start/End: Original strand, 41459026 - 41459099
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  41459026 tttggtaattacacattcaaaatcaatttt-attcaaattatccaaacaccatgaattgataagaatcactttta 41459099  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 754
Target Start/End: Original strand, 44225601 - 44225709
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||| || ||||| |   ||||    
T  44225601 tatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaacgaaaatcaattct-acaaaatcaattatattaaaatcaattttctccaccacacaacca 44225699  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    ||||||||||    
T  44225700 aacacacact 44225709  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 55087630 - 55087593
Alignment:
Q  582 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaact 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55087630 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaact 55087593  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 571 - 614
Target Start/End: Original strand, 53078320 - 53078363
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53078320 tacacatccaaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacat 53078363  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 751
Target Start/End: Original strand, 25181246 - 25181351
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||||||||||||||| | || | || |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||| || ||||||  |||||||   ||||    
T  25181246 tatccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattcaatcaatatcaattctagccaccgcataacca 25181344  T
Q  745 aacacac 751  Q
    |||||||    
T  25181345 aacacac 25181351  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 700 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 31618422 - 31618368
Alignment:
Q  700 tcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  31618422 tcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccaccgtcataccaaacacacact 31618368  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 698
Target Start/End: Original strand, 7012676 - 7012729
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct 698  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7012676 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct 7012729  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 644 - 737
Target Start/End: Original strand, 42644297 - 42644390
Alignment:
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  42644297 atatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatcaatttttataaaatcaattcactcaaaatcaattctcatcaccgc 42644390  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 44610351 - 44610311
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 615  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44610351 acattcaaaatcaattttgat-caaactatccaaacaacatc 44610311  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44939674 - 44939605
Alignment:
Q  440 tattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44939674 tattattttgaaataaatttctgaaccaatcaaaatccatttatgattttagataagtttaaataattat 44939605  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 559 - 636
Target Start/End: Original strand, 49790230 - 49790307
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||    
T  49790230 taatttggtcattacacattcaaaatctgttttaattcagactatccaaatatagttaactcataagaatcaatttta 49790307  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8424988 - 8424920
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8424988 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaatccatttttgattttagataagttcaaataattat 8424920  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 614
Target Start/End: Original strand, 30811289 - 30811329
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30811289 acattcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 30811329  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 38172553 - 38172503
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  38172553 attaatattattttaaaatgattttttgaagcaataaa-atccatttatgat 38172503  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 52931637 - 52931586
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  52931637 tatccaaacataaatcaatttacactaaactcacttttaactaaaatcaatt 52931586  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 21023280 - 21023201
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21023280 tatctaaacataaatcacttcaaattcaactcacatttaaccaaaatcaatt-ttacaaa-tcaattctatcaaaatcaatt 21023201  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 33329477 - 33329436
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 615  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33329477 acattcaaaagcaattttgatcgaaactatccaaacaacatc 33329436  T

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Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 428 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3060500 - 3060203
Alignment:
Q  428 ctcatacattaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3060500 ctcatacattaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaagatgagat 3060401  T
Q  528 gtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 627  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3060400 g-ttaattttatatacaattgattgaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaa 3060303  T
Q  628 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3060302 tcac-tttaagtgagtatatccaaacataaattaattcatataaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattc 3060204  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3060914 - 3060556
Alignment:
Q  20 tcaccttgattctaacatcttgcattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgccatttaagagtgattctaggtgaagctcaaatttggagctt 119  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3060914 tcaccttgattctagcattttgcattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgccatttaaaagtgattctaggttaagctcaaatttggagctt 3060815  T
Q  120 ctctggcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctggcacaaatataactttttatctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattc 219  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060814 ctgcggcaattgcaatcaattttgttttgtatagctctgacacaaatataac-ttttatctatttaccacaactgccctcatgaactccttatattattc 3060716  T
Q  220 cccgaaatatgttgctctctaannnnnnnataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgcatactgtacttctattata------ttgtaaattagtata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      | |||||||||||||    
T  3060715 cccgaaatatgttgctctctaa-ttttttataaggtacaattgaaaaatttgtttagcgcatactgtacttccattatatagtagtagtaaattagtata 3060617  T
Q  314 gtgtg-nnnnnnnnacggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 373  Q
    |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060616 gtgtgtgtttttttacggtggatgatataatcgtttgattttgaattttttacaccctttg 3060556  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 444 - 750
Target Start/End: Original strand, 24045684 - 24045985
Alignment:
Q  444 attttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatac 543  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||| ||||| ||      
T  24045684 attttaaagtgaatttatgaatcaattaaaatgcatttatgattttagataagttaaaataattatctaaaatatgaatgagatatttagttttaaatct 24045783  T
Q  544 aattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagt 643  Q
    |||| |    || |||||||| |||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  24045784 aattaa----aaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgaga 24045878  T
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacc 743  Q
      ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24045879 gcatccaaacataaatcaattcacatcagactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccatacc 24045978  T
Q  744 aaacaca 750  Q
    |||||||    
T  24045979 aaacaca 24045985  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 32454499 - 32454696
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  32454499 gataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacat- 32454597  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct-atcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32454598 aatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 32454696  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 441 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 2430552 - 2430250
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttata 540  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || | || ||||| | |||| |||||      
T  2430552 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaatccatttatgattttagataagttaaaataattattttaagtaagaatgagatatttagtttta-- 2430455  T
Q  541 tacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 640  Q
            |||  || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        
T  2430454 --------atttgaaggataatttagtcattacacactcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattga 2430363  T
Q  641 agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctat 740  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  2430362 agtgtatccaaacataa-tcaattcatgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattccatcaaaatgaattctcgccaccgccat 2430264  T
Q  741 accaaacacacact 754  Q
    |||||| |||||||    
T  2430263 accaaatacacact 2430250  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Original strand, 35760168 - 35760348
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  35760168 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcagttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 35760267  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35760268 ctcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacact 35760348  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 586 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39988088 - 39987920
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39988088 aattttgatttaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaac 39987989  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39987988 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccggtataccaaacacacact 39987920  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Original strand, 41834854 - 41835050
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  41834854 gataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacata 41834953  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41834954 aatcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactgaattctatcaaaatcaattctccccaccgccataccaaacacacac 41835050  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Original strand, 3667833 - 3668012
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  3667833 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 3667932  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3667933 ctcactttttaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactataccaaacacacac 3668012  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 577 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 13253212 - 13253038
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13253212 ttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacat-aatcaattcatattcaactc 13253114  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  13253113 acttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgcccaaccaaacacaca 13253038  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 32030678 - 32030873
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |    
T  32030678 gatagtttagtcattacaccttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaac--ataagaatcacttttgaataagtatatcaaaacaaa 32030775  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32030776 aatcaattcacatctaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactataccaaacacacact 32030873  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 7714902 - 7715095
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | || |||||||    
T  7714902 gataatttagtcattatactttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacttataagaatcaatttcaagtgagtgtgtcaaaacata 7715001  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||    
T  7715002 tatcaattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttaccaccgccatacaaaacaca 7715095  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 22482151 - 22482348
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22482151 gatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacata 22482250  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  22482251 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 22482348  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 8049178 - 8049004
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Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  8049178 aaaagcaattttgatttaaatcatccaaacaacaacaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattaacctcaaactcact 8049079  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8049078 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaagacacact 8049004  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 40885172 - 40885370
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa-tcacttttaagtgagtatatccaaacat 655  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||| | |||||||||    
T  40885172 gataatttgatcattacatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaactcacttttaaacaagtgtgtccaaacat 40885271  T
Q  656 aaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40885272 aaatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattctaacaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacacact 40885370  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 553 - 754
Target Start/End: Original strand, 10058032 - 10058233
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    ||| ||||||||    
T  10058032 aaatgataatttggtcgttgcacgttcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaa 10058131  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  10058132 cataaatcaattcatttccaactcacttttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccccaccgccatactaaacacaca 10058231  T
Q  753 ct 754  Q
    ||    
T  10058232 ct 10058233  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40791219 - 40791023
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  40791219 gataatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacata 40791120  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  40791119 a-tcaattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtgataccaaacacacact 40791023  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 42146270 - 42146466
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  42146270 gataatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacata 42146369  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  42146370 a-tcaattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtcataccaaacacacact 42146466  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 557 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 9275634 - 9275439
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||    
T  9275634 gataatttggtcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacata 9275535  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  9275534 aatcaattaacatctaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattttatcaaaatcaattttccccaccgccaaaccaaacacaca 9275439  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7386059 - 7385885
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  7386059 aaaagcaattttgatttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatttaaacataaatcaattcacctcaaacccact 7385960  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7385959 tttaaccaaaatcaattctctaaaacttaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctatactaaacacacact 7385885  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 27021090 - 27021283
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaact-atccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacat 655  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27021090 gataatttcgtcattatacattcaaaatcaattttgattcaatcttatccaaacaacatcaacttctaagaatcacttttaagtgagtata-ccaaacat 27021188  T
Q  656 aaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||    
T  27021189 aaatcaattcacatttaactcatttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattatatcaaaatcagttctaaccaccgccaaaccaaacaca 27021283  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 574 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 41740726 - 41740564
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  41740726 acattcaaaatcaattttgatttaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcacttttaaacaagtgtattcaaacataaaccaattcatctcaaa 41740627  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccg 736  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41740626 ctcacctataatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccg 41740564  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 40495507 - 40495311
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  40495507 gataatttgatcattgtacattccaaatcaattttgatttaaactattcaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacata 40495409  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  40495408 aatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccgccgccataccaaacacacact 40495311  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 581 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5710511 - 5710339
Alignment:
Q  581 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 680  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| | ||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  5710511 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa-taagcgtatccaaacataaagcaattcacaccaaactcactt 5710413  T
Q  681 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5710412 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 5710339  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 441 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 33954157 - 33953856
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttata 540  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || | || ||||| |  ||| |||||      
T  33954157 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaatccatttatgattttagatatgttcaaataattattttaagtaagaatgagatagttagtttta-- 33954060  T
Q  541 tacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 640  Q
            ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||        
T  33954059 --------attaaaaggataatttagtcattacacattcaaaattaattttgattcaaactatccgaacaacatcaactcatcagaatcacttctattaa 33953968  T
Q  641 agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctat 740  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||    
T  33953967 agtgtatccaaacat-aatcaatttacgttcaactcacttttaaataaaatcaattctctcaaactcaattctaccaaaatcaattttcaccactgccat 33953869  T
Q  741 accaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||    
T  33953868 accaaacacacac 33953856  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 439 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 28869765 - 28869530
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||  | || || || | |||| |||||    
T  28869765 atattattttaaaataaatttgtgaaccaataaaaattcatttatgattttagataaattcaaatgattatctaat-taagaataagatatttagtttta 28869667  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     |||||||| |    || ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28869666 aatacaattaa----aaggataatttggtcattacacactcgaaatctatttt-actcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 28869572  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 680  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  28869571 taagtgtattcaaacataaatcaatccacatccaactaactt 28869530  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 566 - 728
Target Start/End: Original strand, 4292120 - 4292282
Alignment:
Q  566 gtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattc 665  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  4292120 gtcattacacattcaaaattaattttgattcaaattatccaaacaatatcaaccaacaagaatcacttctaattaagtgtatccaaacataaatcaattc 4292219  T
Q  666 atatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    | ||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4292220 acattcaacttatttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattct 4292282  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 562 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 16158610 - 16158446
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatca 661  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||||| |    
T  16158610 tttgatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaatcatccaaagaacatcaattcctaagaatcacttttaaaaaagtgcatccaaatataaatta 16158511  T
Q  662 attcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16158510 attcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaaatctataaaaatcaatt 16158446  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Original strand, 7178760 - 7178936
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  7178760 ttcaaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 7178858  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||   ||||||||||||||    
T  7178859 acttttagtcaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcatcatcgccgaaccaaacacacact 7178936  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 34107068 - 34106928
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| | |||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34107068 aattttgattcaacctattcaaacaacattaattcataagaattacttttaaatgaatgtatttaaacattaatcaattcacatctaactcacttttaac 34106969  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  34106968 caaaaacaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaatt 34106928  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 620 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 23914341 - 23914235
Alignment:
Q  620 cataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23914341 cataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaacgtaaatcaattcatatccaactcaattttaagtataatcaattctctcaaaatcaattctatcaaa 23914242  T
Q  720 attaatt 726  Q
    || ||||    
T  23914241 atcaatt 23914235  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 562 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 2694905 - 2694717
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatca 661  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| || |   |||| ||| |||||| |    
T  2694905 tttggtaattacacactcaaaatcaattttgattcaaattatacaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaagttatctaaaaataaatta 2694806  T
Q  662 attcat-atcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||||||  ||||||   ||||||||||    
T  2694805 atttatgatc-aactcacttttaaccaaaatcaattcaatcaaaatcaattctgacaaaatcaattctcgtcaccgcataaccaaacaca 2694717  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 504 - 696
Target Start/End: Original strand, 41959375 - 41959561
Alignment:
Q  504 aattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactat 603  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  || ||||     ||| ||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |  ||||||||||    
T  41959375 aattatcttaaatgagaatgagatgtctaattttaactataatt-----aaaagataatttgttctttacatatccaaaatcaattctatttcaaactat 41959469  T
Q  604 ccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41959470 gaaaacaacattaactcataagaatcacttttatgtg-gtgtttccaaacataaattaattcacttttaactcacttttaactaaaattaatt 41959561  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35847925 - 35847843
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  35847925 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcaccgcagaaccaaacacacact 35847843  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 571 - 727
Target Start/End: Original strand, 16843514 - 16843661
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||    ||||||| |||||   |||   | || |||    
T  16843514 tacacattcaaaatcaattatcatttaaactatccaaacaacatcaactcgtaaaaatca--ttta----agtatatacaaac---aattggtccacatc 16843604  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
     || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16843605 caattcacttttaaccaaaatctattcgttcaaactcaattatatcaaaatcaattc 16843661  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 715
Target Start/End: Original strand, 2861617 - 2861760
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcat----aagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || | ||    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| | ||     
T  2861617 cattcaaaatcaattttgatccaaattattcaaacaacataaatttatttataagaatcacttttacat-attatatccaaacataaatcaatttacatg 2861715  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctat 715  Q
     || ||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  2861716 caagtcatttttaactcaaatcaattatatcaaaatcaattctat 2861760  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Original strand, 20068923 - 20069033
Alignment:
Q  604 ccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaa 703  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  20068923 ccaaacaaaatcaattaacaagaatcacttttgcattagtgtatccaaacataaataaatttaaactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaa 20069022  T
Q  704 actcaattcta 714  Q
    |||||||||||    
T  20069023 actcaattcta 20069033  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 2483776 - 2483724
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattc 697  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  2483776 tatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattc 2483724  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 2456984 - 2457062
Alignment:
Q  42 cattatgtttggttgccttttctaaaagcaattctgccatttaagagtgattctaggtgaagctcaaatttggagcttc 120  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  2456984 cattatgtttggctgtcttttctcaaatcaattctaccaattaaaagtgattcaagcttaaactcaaatttggagcttc 2457062  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3747717 - 3747544
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |  | | |  |||||||||||||| ||||    || ||||||||    
T  3747717 aaaatcaattttgattaaaactatccaaacaacatacattactaagaatcactttcatattaatgcatccaaacataaattaatttcactc-aactcact 3747619  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||| | |  |||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||| | | ||||||   ||||||||||||||    
T  3747618 tttgatccgaatcaattcattcacaatcaattctatcaaaatcaatttttatcaccgcataaccaaacacacact 3747544  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 698
Target Start/End: Original strand, 22811076 - 22811129
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct 698  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22811076 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct 22811129  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 33468027 - 33467963
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccg 736  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| |||||||    
T  33468027 aactcacttttaaccaaaatcagttctatcaaaatcaattttgttaaaatcaattctaaccaccg 33467963  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 614
Target Start/End: Original strand, 40979997 - 40980037
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40979997 acattcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 40980037  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13253308 - 13253266
Alignment:
Q  474 attcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaat 516  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13253308 attcatttataattttagataagttgaaatatttatctaaaat 13253266  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 33082464 - 33082423
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 615  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33082464 acattcaaaagcaattttgatcaaaactatccaaacaacatc 33082423  T

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Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 439 - 751
Target Start/End: Original strand, 30841951 - 30842258
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||    
T  30841951 atattattttaaaataaatttttgaaccaataaaaatccatttatgattttagataagttcaaataagtatctaaaataagaatgggatgtttagtttta 30842050  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     |||||||| |    || |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||     
T  30842051 aatacaattaa----aaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 30842146  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgct 738  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||     
T  30842147 caagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcc 30842245  T
Q  739 ataccaaacacac 751  Q
    |||||||||||||    
T  30842246 ataccaaacacac 30842258  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 754
Target Start/End: Original strand, 15603175 - 15603490
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||| |    
T  15603175 attaatatcattttaaaataaatttatgaaccaataaaaatgcatttatgattttagataagttgaaataatcatcaaaaatgataatgagatatttagt 15603274  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||| | |||||  |    || ||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15603275 tttaaaaacaatcaa----aaggataatttgatcattgtgcattcaaaatcaattttgacttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcatttt 15603370  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15603371 taagcaagtatatctaaacacaaatcaattcacatcaaactcactttttaccataatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccac 15603470  T
Q  735 cgctataccaaacacacact 754  Q
    ||  | ||||||||||||||    
T  15603471 cgtcaaaccaaacacacact 15603490  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 9889487 - 9889295
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9889487 gataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacata 9889388  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9889387 ta-caattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9889295  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 557 - 752
Target Start/End: Original strand, 39636718 - 39636913
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39636718 gatattttggtcgttacacatttaaaatcaattttgattcatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacata 39636817  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  39636818 aatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacaca 39636913  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 557 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 43781671 - 43781477
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43781671 gataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacata 43781572  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43781571 a-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacaca 43781477  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 435 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 31520640 - 31520328
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| | ||||||    
T  31520640 attaatattattttaaaataagtttgtgaagcaataaaaattcaattatgattttagataagttcaaataattatctaaaataagaaagagatatttaat 31520541  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    || ||||| |||  |    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31520540 tt-atatataataaa----aatgatgatttggtcattacacatttaaaatcaatttttattcaaactacccaaaaaacatcaactcataaaaatcacttt 31520446  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||| |||     
T  31520445 taa-taagcatatctaaacataaatccattcacacccaactcacttttaaccaaaattaattctttcaaacttcattctaccaaaatcaattctcgccat 31520347  T
Q  735 cgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31520346 cgctataccaaacacacac 31520328  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 46830222 - 46830025
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  46830222 gataatttggtcaatacacatttaaaatcaattttgatgtagaatatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaagaaagtgtatccaaacata 46830123  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46830122 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 46830025  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 439 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 48407964 - 48407679
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||    
T  48407964 atattattataaaataaatttttgaaccaataaaaatccacttatgattttagataagttcaaataagtatctaaaataagaatgggatgtttagtttta 48407865  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     |||||||| |    || |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||     
T  48407864 aatacaattaa----aaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaa 48407769  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48407768 caagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 48407679  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 553 - 754
Target Start/End: Original strand, 28986950 - 28987148
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  28986950 aaatggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcactt--aagtgagtgtattcaaa 28987047  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28987048 cataa-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacaca 28987146  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
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Target Start/End: Original strand, 9893644 - 9893837
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
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T  9893644 gataatttaatcattatacattcaaaatcaattttaatttaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttcaagtgggtgtatccaaacata 9893743  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9893744 tatcaattcatatctaactcacttttgacaaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9893837  T

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Target: chr4; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 6138776 - 6138577
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Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  6138776 aaatgatagtttggtcattacacattcaaa-tcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcatttttaaataagtgtatccaaa 6138678  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  6138677 cataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattatttcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacaca 6138578  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 14564299 - 14564102
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  14564299 gataagttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacata 14564200  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  14564199 aatcaattcatatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgcccaaccaaacacacact 14564102  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 51922873 - 51923070
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||    
T  51922873 gatagtttggtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacata 51922972  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  51922973 aatcaattcagattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaacaaaatcaattctcgtcgccgccataccaaacacacact 51923070  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 29149443 - 29149263
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  29149443 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 29149344  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29149343 ctcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaatacacact 29149263  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 500 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4954257 - 4954050
Alignment:
Q  500 aaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaa 599  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||| |||||||| |    || ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  4954257 aaataattatctaaaatgggaatgagatatataattttaaatacaattaa----aaggataattaggtcattacacatttaaaattaattttgattcaac 4954162  T
Q  600 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954161 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 4954062  T
Q  700 tcaaactcaatt 711  Q
    ||||| ||||||    
T  4954061 tcaaaatcaatt 4954050  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 444 - 711
Target Start/End: Original strand, 49136346 - 49136609
Alignment:
Q  444 attttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatac 543  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||  ||  | | |||| ||| | | ||    
T  49136346 attttaaaaggaatttatgaaccaataaaaatgtacttatgattttagaaaagtagaaataattatctgaaaagaaaatatgatatttagtttcaaaaac 49136445  T
Q  544 aattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagt 643  Q
    |||| |    || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49136446 aattaa----aaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattaaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagt 49136541  T
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49136542 gtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctctcaaactcaatt 49136609  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 441 - 753
Target Start/End: Original strand, 14072331 - 14072631
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttata 540  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || | || ||||| |  ||| |||||      
T  14072331 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaat-catttatgattttagatatgttcaaataattattttaagtaagaatgagatagttagtttta-- 14072427  T
Q  541 tacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 640  Q
            ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||        
T  14072428 --------attaaaaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcattagaatcacttctattaa 14072519  T
Q  641 agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctat 740  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14072520 agtgtatccaaacataa-tcaatttaccttcaactcacttttaaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccat 14072618  T
Q  741 accaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||    
T  14072619 accaaacacacac 14072631  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 16566238 - 16566435
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  16566238 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacata 16566337  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | || ||||||||||||||||    
T  16566338 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccctgctgccataccaaacacacact 16566435  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42945051 - 42944861
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42945051 gatagtttggtcattatacatttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacata 42944952  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaac 747  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||    
T  42944951 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaataaattcttgccaccgccgtaccaaac 42944861  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 32238211 - 32238015
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  32238211 gataatttagtcattagacattcaaaatcagttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttctaatatagtgtatccaaacata 32238112  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32238111 ac-caattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacact 32238015  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 558 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 19592383 - 19592187
Alignment:
Q  558 ataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    ||| |||||||||||||    
T  19592383 ataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacgtcaattcgtaagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataa 19592284  T
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19592283 atcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctaaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccatatcaaacacacact 19592187  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26652001 - 26651805
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    ||| |||| |||||||    
T  26652001 gatagtttggtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaataacatcgactcataagaattacttttagtaaagtgtatctaaacata 26651902  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  26651901 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacacac 26651805  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 553 - 756
Target Start/End: Original strand, 49519659 - 49519865
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  49519659 aaatgatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaatatcaattcataagaatcatttttaagcaagtgtatccaaa 49519758  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct---caccaccgctataccaaacac 749  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  49519759 cataaataaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaaccaattctcaccaccaccgccataccaaacac 49519858  T
Q  750 acactca 756  Q
    |||||||    
T  49519859 acactca 49519865  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26426267 - 26426072
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  26426267 gataatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacata 26426168  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  26426167 a-tcaatttatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcataccaaacacacac 26426072  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 43772276 - 43772079
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  43772276 gatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttgattcatattatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttctaaaaaagtgtatccaaacata 43772177  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | | ||||||||||||||    
T  43772176 aatcgattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccaccaaaccaaacacacact 43772079  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 553 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 48550584 - 48550424
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Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||    
T  48550584 aaatgatagtttgatcattacacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtttatccaaa 48550485  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48550484 cataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 48550424  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 54152978 - 54153170
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||| ||| ||||||||    
T  54152978 gataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcatgagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacata 54153077  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  54153078 a-tcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattatattaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 54153170  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 576 - 719
Target Start/End: Original strand, 6505153 - 6505296
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Q  576 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaact 675  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6505153 attcaaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatctaaacataaatcaattcacatcaaact 6505252  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505253 catttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 6505296  T

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Target: chr4; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 48550172 - 48550347
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Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
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T  48550172 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaatatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 48550271  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48550272 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 48550347  T

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Target: chr4; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 54150482 - 54150656
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Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
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T  54150482 aaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcatttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 54150581  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  54150582 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattcttgccaccgccataccaaacacacact 54150656  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
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Target Start/End: Original strand, 14075948 - 14076140
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T  14075948 gatactttggtcattacacattcaagattaattttgatttaaagtactcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacata 14076047  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||    
T  14076048 aatcaatttacatcaaactcac-tttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgccaaactaaacaca 14076140  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 54735803 - 54735611
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
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T  54735803 gatactttggtcattacacattcaagatcaattttgatttaaaatactcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacata 54735704  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    || ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  54735703 aaccaatttacatcaaactca-atttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgccaaaccaagcaca 54735611  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 577 - 753
Target Start/End: Original strand, 48908228 - 48908402
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Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  48908228 ttcaaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatcaacttatatgaattacttttaagcgagg-tatccaaacataac-caattcacatcaaactc 48908325  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  48908326 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaataatattaaaatcaattttcaccgccgccaaaccaaacacacac 48908402  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 13167476 - 13167655
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Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  13167476 catttaaaagcaattttgattcaatctatccaaacatcattaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaatataaatcaattcacattcaac 13167575  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  | ||||| ||||||||||||||||    
T  13167576 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatttttcctaccgccataccaaacacacact 13167655  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 580 - 753
Target Start/End: Original strand, 25312671 - 25312844
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  25312671 aaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 25312770  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||||||||||    
T  25312771 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgttaccgccaaaccaaacacacac 25312844  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 13183203 - 13183010
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  13183203 gatagtttggtcattttacattcaaaatcaattttgatttaaattatccaaaaaacatcaacttataaaaatcatttttaaataagtgtatccaaacata 13183104  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  13183103 aatcaattcaccttaaacttgcttttaaccaaaatcaattatctcagactcaattttatcaaaatcaattatcgtcaccgtcataccaaacaca 13183010  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 553 - 713
Target Start/End: Original strand, 15619546 - 15619703
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || || | | ||||||||    
T  15619546 aaatgataatttagtcattacacattcaagatca-ttttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttata-gtaa-tgtatccaaa 15619642  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619643 catacatcaattcacatccaactcactttttaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 15619703  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 594 - 754
Target Start/End: Original strand, 39187704 - 39187864
Alignment:
Q  594 ttcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatca 693  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||    ||| |||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  39187704 ttcaaattattcaaacaacatcaactaacaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaaattacttttaaccaaaatca 39187803  T
Q  694 attctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  39187804 attctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacacacact 39187864  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 557 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 56241988 - 56241844
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||    
T  56241988 gatattttggtcattatacattcaaaatcaattttgatttaaatcatctaaacattatcaactcataagaatcacttttacattaatgtatccaaacata 56241889  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctc 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56241888 aatcaattcatatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctc 56241844  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 577 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 2175280 - 2175161
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2175280 ttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactc 2175181  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  2175180 acttttaatcaaaatcaatt 2175161  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 730
Target Start/End: Original strand, 38693901 - 38694154
Alignment:
Q  471 aatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaa 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| |    ||  ||||||||||||     
T  38693901 aatatccatttatgattttagataagttgaaataatcatttaaaatgagattgagatgtttagttttatatataattaa----aagtataatttggtcat 38693996  T
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||   |      
T  38693997 taca--ttcaaaattaattttgatttaaattattcaagcaagatcaacccataagaatcacttttaagcgagtgtatccaaacataaactaatttgcact 38694094  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctca 730  Q
     |||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38694095 caacttacttttagacaaaatcaattcttttaaactcaatcatatcaaaattaattctca 38694154  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 586 - 736
Target Start/End: Original strand, 46926010 - 46926160
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46926010 aattttgattcaaaatatataaataaaattaattcataaaaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaac 46926109  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccg 736  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  46926110 caaaaacaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccg 46926160  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 605 - 726
Target Start/End: Original strand, 38263881 - 38264001
Alignment:
Q  605 caaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 704  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  38263881 caaacaacat-aactcataagtatcacttttaagtgagtatattcaaacataaattaattcacatcaaactcaattttaagcaaaattaattttctcaaa 38263979  T
Q  705 ctcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  38263980 ctcaattatatcaaaatcaatt 38264001  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 559 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 30887304 - 30887165
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||||||    
T  30887304 taatttggtcattacacattcaaaatcaattttgatacaaaccatccaaacatcattaactcataagaatcacttttatattggtgtatccaaacataaa 30887205  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    ||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  30887204 tcaatt-tcatcaaactcacgtttaactaaaataaattctc 30887165  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 574 - 752
Target Start/End: Original strand, 14054801 - 14054979
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||   || |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14054801 acatccaaaatcaattttaatttaaagtattcaaacaacatcaacttgaaataatcacttttatataagtttatccaaacataaatcaattcacatcaaa 14054900  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||||||||    
T  14054901 ctcacttttgactaaactcaattctttcaaactcaattatgtcaaaatcaattcccgtcactgccgtaccaaacacaca 14054979  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 624 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 45780095 - 45779970
Alignment:
Q  624 agaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatta 723  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  45780095 agaatcacttttaagtgaatgtatctaaacaaaaattaattcataccaaactcactttttaccaaaatcaatt-tctcaaactcaattctatcgaaatca 45779997  T
Q  724 attctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||    
T  45779996 attctcatcgccgccaaaccaaacaca 45779970  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 646 - 754
Target Start/End: Original strand, 41866176 - 41866284
Alignment:
Q  646 atccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaa 745  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | |||||    
T  41866176 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaactcaattccctcaaactcaattttatcaaaatcaattatcgccaccgccaaaccaa 41866275  T
Q  746 acacacact 754  Q
    |||||||||    
T  41866276 acacacact 41866284  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 38305962 - 38306141
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  38305962 cattcaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcgcattcaac 38306061  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||    ||||||||||||||    
T  38306062 tcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgtagaaccaaacacacact 38306141  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 643 - 729
Target Start/End: Original strand, 33574197 - 33574283
Alignment:
Q  643 tatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33574197 tatattcaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaaataattctc 33574283  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 579 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 19599625 - 19599487
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||| || | |||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||    
T  19599625 caaaagcaattttgattctaaata-ccaaacaacataaattgataagaatcaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaactcac 19599528  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19599527 ttttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 19599487  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 571 - 750
Target Start/End: Original strand, 53531924 - 53532103
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  |   |||| |||||||||||  ||  | || ||||||||||| ||  | | |||    
T  53531924 tacacattcaaaatcaattttaatcaaaactacccaaacaacatatataaataaaaatcacttttacttgcatgtagccaaacataaaccacgttacatc 53532023  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  53532024 caactcacttttaactaaaatcaattatgtcaaactcaattttatcaaaatcaattctcaccaccgccgaaccaaacaca 53532103  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 54488556 - 54488735
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| || || | |||||||||||||||   | |   ||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  54488556 catttaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaaaatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtattcaaacataaatcaattcacattcaac 54488655  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||    
T  54488656 tcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacacact 54488735  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 631 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 55638834 - 55638736
Alignment:
Q  631 cttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55638834 cttttaaataagtgtatctaaacataaatcaatttacatttaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 55638736  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 553 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 55638944 - 55638861
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  55638944 aaatgatagtttggtcattacatattcaaaatcaattttgattcatattatccaaacaatatcaactcataagaatccctttta 55638861  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 754
Target Start/End: Original strand, 523129 - 523280
Alignment:
Q  599 actatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct 698  Q
    |||||||||||||||  || |  ||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |    
T  523129 actatccaaacaacaagaatttttaagaatcaattctaagtga----atccaaacataaatcaattcatattgaactcactttttcccaaaatcaatttt 523224  T
Q  699 ctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
     |||| |||||||  |||||||| |||| || | || |||  ||||||||||||||    
T  523225 gtcaagctcaattaaatcaaaatcaattttctcaacagctgaaccaaacacacact 523280  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 697
Target Start/End: Original strand, 28752462 - 28752587
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  |||| ||| || | |||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||| | || ||    
T  28752462 tacacattcaaaaataatttttattcaaactatcagaacatcatgaattgataagaatcacttttatgttaaggcatccaaacataaatcaaattatgtc 28752561  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattc 697  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  28752562 -aactcacttttaaccaaaatcaattc 28752587  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 26459897 - 26459852
Alignment:
Q  709 attctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26459897 attctatcaaaattaattctcgccaccgccataccaaacacacact 26459852  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 575 - 636
Target Start/End: Original strand, 48257054 - 48257115
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  48257054 cattcaaaatcaattttgatccaatttatccaaacaacatgaatttataagaatcactttta 48257115  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4649967 - 4649911
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4649967 aactcgcttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattttatcaaaatcaattct 4649911  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 579 - 614
Target Start/End: Original strand, 5025484 - 5025519
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5025484 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 5025519  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 658 - 753
Target Start/End: Original strand, 54655266 - 54655361
Alignment:
Q  658 atcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| | | |||||||||| | ||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||||||    
T  54655266 atcaattcacatcaaacacacttttgactaaaatcaattattttaaactcaattatgtcaaaatcaattatcgtcaccgccgtaccaaacacacac 54655361  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 54487285 - 54487219
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  54487285 tatccaaacataaatcaatttacattcaactcacttttgatcgaaatcaattctatcaaactcaatt 54487219  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 711
Target Start/End: Original strand, 16492879 - 16493014
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||  || | | ||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  16492879 acatgcaaaatcagctttgacacaaactatccaaacgacataaattgataa-aatcacttttgtgtta-tgtatccaaacataaataaattcacattcaa 16492976  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  16492977 ctcacttttaatcaaactcaattatttcaaaatcaatt 16493014  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 669 - 750
Target Start/End: Original strand, 20232028 - 20232108
Alignment:
Q  669 tcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  20232028 tcaaactaacttttaaccaaaatcaattttat-aaaatcaattccaccaaaatcaattctcaccaccgcataaccaaacaca 20232108  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 22694656 - 22694556
Alignment:
Q  651 aacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattct-ctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacac 749  Q
    ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||   |||||||||    
T  22694656 aacataaatcactttatgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctacttaaa-tcaattctaccaaaatcaattctttccaccgcacaaccaaacac 22694558  T
Q  750 ac 751  Q
    ||    
T  22694557 ac 22694556  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 704
Target Start/End: Original strand, 24512222 - 24512283
Alignment:
Q  643 tatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 704  Q
    ||||||||||||||||| || | || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24512222 tatatccaaacataaattaagttattttaaacttacttttaatcaaaatcaattctctcaaa 24512283  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 644 - 713
Target Start/End: Original strand, 36150624 - 36150693
Alignment:
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  36150624 atatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattct 36150693  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Original strand, 54152871 - 54152940
Alignment:
Q  440 tattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54152871 tattatttttaaataaatttgtgaaccaatcaaaatccatttatgattttagataagtttaaataattat 54152940  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 643 - 711
Target Start/End: Original strand, 33843801 - 33843869
Alignment:
Q  643 tatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  33843801 tatatccaaacataaatcactttacatccaactcacttttagccagaatcaattcaatcaaaatcaatt 33843869  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 713
Target Start/End: Original strand, 39993574 - 39993642
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  39993574 tatctaaacataaatcaattcacatttaactcatttttaatcaaaatcaattctatgaaaatcaattct 39993642  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 614
Target Start/End: Original strand, 45106358 - 45106398
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45106358 acattcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaacat 45106398  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 713
Target Start/End: Original strand, 53914920 - 53914987
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53914920 tatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcgattctctgaaactcaattct 53914987  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 16202583 - 16202502
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  16202583 tatccaaacataaatcaattc-tctcaaaatcaattttatc-aaaatcaattctatcaaaatcaattcaatcagaatcaattct 16202502  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 711
Target Start/End: Original strand, 46958071 - 46958110
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46958071 aactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaatt 46958110  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 48550673 - 48550623
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  48550673 attaatattattttaaaatgattttttgaagcaataaa-atccatttatgat 48550623  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 754
Target Start/End: Original strand, 48556616 - 48556683
Alignment:
Q  687 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  48556616 aaaatcaattttatcaaactcaattctatcaaaatcaattatttccaccgctgaaccaaacgcacact 48556683  T

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Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 625 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 8683115 - 8683034
Alignment:
Q  625 gaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcata--tcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaa 704  Q
    |||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  8683115 gaatcacttttatgttaatgtatccaaacataaattaattcttacattaaactcaattttaaccaaattcaattttctcaaa 8683034  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Original strand, 22699763 - 22699829
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22699763 tatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaatt 22699829  T

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Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22980767 - 22980701
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22980767 tatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaatt 22980701  T

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Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22994354 - 22994288
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22994354 tatccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaatt 22994288  T

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Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 636
Target Start/End: Original strand, 54655200 - 54655262
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  54655200 acatccaaaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataatcactttta 54655262  T

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Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 728
Target Start/End: Original strand, 1616515 - 1616563
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Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1616515 ttttaaccaaaatcaattct-acaaaatcaattctatcaaaatcaattct 1616563  T

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Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 33721999 - 33721938
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |  | ||||||||| ||||||    
T  33721999 cattcaaaatcaattttgattcaaactattcgaataacatgactttataagaatcgctttta 33721938  T

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Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 39000612 - 39000532
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39000612 tatccaaacataaatcattttttattaagctcacttttaactaaactcaattct-acaaaatcaattcaatcaaaatcaatt 39000532  T

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Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 50523387 - 50523350
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50523387 ttcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 50523350  T

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Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 33899158 - 33898961
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  33899158 gatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattattaactcataagaatcacttttacattagtgtatccaaacata 33899059  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33899058 aatcaattcatatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacacacact 33898961  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 13739154 - 13739350
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  13739154 gataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacata 13739253  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13739254 a-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 13739350  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 13744654 - 13744850
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  13744654 gataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacata 13744753  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13744754 a-tcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 13744850  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Original strand, 10826039 - 10826235
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  10826039 gatagtttggtcattccatatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaaaatcaactcataagaatcacttttaaataagtatatccaaacaaa 10826138  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10826139 aatcaattcaaattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaattaattctcaccgccgccaaaccaaacacacac 10826235  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 559 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 29409402 - 29409207
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||||    
T  29409402 taatttggtcattatacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaaaaactgtatccaaacataaa 29409303  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||  |||||||| |||||||    
T  29409302 tcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctattaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaaaacacact 29409207  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 6208215 - 6208019
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  6208215 gataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattcaaactatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacata 6208116  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6208115 a-tcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaaatcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacact 6208019  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 566 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 17830142 - 17829957
Alignment:
Q  566 gtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattc 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||   | | || | ||||||||||||||||    
T  17830142 gtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaacgacttctaataaactgtaactaaacataaatcaattc 17830043  T
Q  666 atatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17830042 acattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagctataccaaacacac 17829957  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 557 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 16442503 - 16442347
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  16442503 gatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaatatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacata 16442404  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16442403 aatcaattcacattcaactcacttgtaactaaaatcaattctctcaaaatcaattct 16442347  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 557 - 699
Target Start/End: Original strand, 16548087 - 16548229
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  16548087 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacata 16548186  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16548187 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctc 16548229  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 1312574 - 1312395
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  ||||||||| || ||||| | | ||||| |||||||||||||||  ||  |||    
T  1312574 cattcaaaatcaattttgggtcaaactatccaaacaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccgaacataaatcaattcgcattcaac 1312475  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  1312474 tcacttttaaccaaaatcaattttatcaaactcgattctatcaaaatcaattttctccaccgctgaaccaaacacacact 1312395  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 577 - 726
Target Start/End: Original strand, 31132432 - 31132580
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||  |||| | ||| |||||    
T  31132432 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcacttttaaataagtgtatccaaaaat-aacgaattaacatccaactc 31132530  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31132531 atttttagccaaaataaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 31132580  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 737
Target Start/End: Original strand, 699525 - 699684
Alignment:
Q  576 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaact 675  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  699525 attcaaaatcgattttgattcaaactatccaa-caacattaacttataagaattacttttagtaaagtgcatccaaacataaatcaattcttatccaact 699623  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  699624 cacttt-aactaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattccctccaccgc 699684  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 21255011 - 21254835
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  21255011 ttcaaaagcaattttgattcaaactaccgaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 21254913  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    ||||||||||||||    
T  21254912 acttttaatcaaattcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcaccaccgtggaaccaaacacacact 21254835  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 557 - 727
Target Start/End: Original strand, 21455830 - 21455998
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||      
T  21455830 gataatttaatcattacacatttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaaca-c 21455927  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    |||  ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21455928 aattgattcacatccaacttacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaattatatcaaaatcaattc 21455998  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5584181 - 5584005
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | || |  ||| |||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  5584181 ttcaaaagctattttgatttaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatataaatatatccaaacataaatcaatt-acattaaactc 5584083  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||| ||||||||||    
T  5584082 acttttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcagaacctaacacacact 5584005  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 7215523 - 7215718
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||  ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||     
T  7215523 gataatttaatcattacatatttaaaattaattttgattcaatttatgcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacat- 7215620  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||  |||||  || || ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  7215621 aattgattcacgtccaattcacttttaactaaaatcaagtcttaaaaactcaattatatcaaaatcaattctgatcaccgttaaactaaacatacact 7215718  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 16122134 - 16121960
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcata-tcaaact 675  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||  | |   ||| |||||| ||||||| | | | ||||| |    
T  16122134 ttcaaaagcaattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatacataaaggtattcaaacacaaatcaacttacactcaaa-t 16122036  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  16122035 cacttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattttatcaaaatcaattataaccaccgccataccaaagacac 16121960  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15151543 - 15151461
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||   ||||||||||||||    
T  15151543 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattctactcaccgcagaaccaaacacacact 15151461  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 684 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 29399819 - 29399750
Alignment:
Q  684 accaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  29399819 accaaaatcaattctatcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacatacac 29399750  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 32599500 - 32599439
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcacca 733  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32599500 aactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctcacca 32599439  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6208322 - 6208253
Alignment:
Q  440 tattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6208322 tattatttttaaataaatttgtgaaccaatcaaaattcatttatgattttagataagtttaaataattat 6208253  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 519
Target Start/End: Original strand, 31132347 - 31132381
Alignment:
Q  485 attttagataggttgaaataattatctaaaatgag 519  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31132347 attttagataagttgaaataattatctaaaatgag 31132381  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26274665 - 26274608
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||||||||||  || |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26274665 aactcacttttagtcagaatcaattatgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattctc 26274608  T

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Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 553 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 9988656 - 9988455
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9988656 aaatgatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaa 9988557  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9988556 cataaatcaattcacatccaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacaca 9988457  T
Q  753 ct 754  Q
    ||    
T  9988456 ct 9988455  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 7472824 - 7472629
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  7472824 gataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacata 7472725  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  7472724 a-tcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacac 7472629  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 444 - 754
Target Start/End: Original strand, 36548048 - 36548353
Alignment:
Q  444 attttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatac 543  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  | || || | |||| ||||| |||     
T  36548048 attttaaagtgaatttatgaatcaattaaaatgcatttatgattttagataagttaaaataattatctgaaatatgaataagatatttagttttaaatat 36548147  T
Q  544 aattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagt 643  Q
    |||| |    || |||||||| |||| |  || ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  36548148 aattaa----aaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaatttaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgaga 36548242  T
Q  644 atatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacc 743  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  36548243 gtatccaaacataaatcaattcacatcagactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccatacc 36548342  T
Q  744 aaacacacact 754  Q
    |||||||||||    
T  36548343 aaacacacact 36548353  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Original strand, 2213480 - 2213659
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  2213480 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 2213579  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2213580 ctcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacac 2213659  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 577 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 39141600 - 39141425
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39141600 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaatgagtgtatccaaacat-aatcaattcatatccaactc 39141502  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  39141501 acttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgccaccgcccaaccaaacacacac 39141425  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 28127421 - 28127242
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  28127421 acatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaa 28127322  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28127321 ctcactttttagcaaaatcaattctctcaaactaaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacac 28127242  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 445 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 42516232 - 42515936
Alignment:
Q  445 ttttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatataca 544  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  |||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  | |||| ||| | ||| |    
T  42516232 ttttaaattgaatttatgaatcaataaaaatgaatttataatcttagataagttaaaataattatctaaaatgaaaatga--tatttagtttcaaataga 42516135  T
Q  545 attgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagta 644  Q
    ||| |    || ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||    
T  42516134 attaa----aaagataatttggttattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcattttttaatgagta 42516039  T
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  42516038 tattcaaacataa-tcaattcacatcaaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttctccaccgccatacca 42515940  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 581 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 1945166 - 1944993
Alignment:
Q  581 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcactt 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  1945166 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 1945067  T
Q  681 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  1945066 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 1944993  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5916392 - 5916196
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  5916392 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacat- 5916294  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5916293 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 5916196  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 14821120 - 14821312
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  14821120 gataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacata 14821219  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14821220 a-tcaattcacattaaactcacttttaactaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaattaattatcgtcaccgctataccaaacaca 14821312  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 36312234 - 36312430
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  36312234 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacat- 36312332  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36312333 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 36312430  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 44619195 - 44619015
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||   |||||    
T  44619195 acattcaaaatcgattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataataatcatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcccctcaaa 44619096  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  44619095 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccatcggtatatcaaacacacact 44619015  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 28261251 - 28261448
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||    
T  28261251 gataagttggtcattatacatttaaaattaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctatgtgagagtatccaaatata 28261350  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  28261351 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattgtattaaaattaattctctccaccgcccacccaaacacacact 28261448  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 563 - 752
Target Start/End: Original strand, 32501949 - 32502137
Alignment:
Q  563 ttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaa 662  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  32501949 ttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaa 32502047  T
Q  663 ttcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  32502048 ttcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcacgaccgccataccaaacacaca 32502137  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Original strand, 2215228 - 2215406
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2215228 acattcaaaatcaattctaatttaaattatccaaacaacatcaactcaaaa--attatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaa 2215325  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2215326 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaagctcaattctatcaaaatcaattctcacaaccgctataccaaacacacact 2215406  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 8170270 - 8170466
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      || ||||||||||||    
T  8170270 gataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacatctgttaacgtgtatccaaacata 8170369  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  8170370 a-tcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcgccaccgccctaccaaacacacact 8170466  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 571 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 31562821 - 31562641
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| ||||||||  ||    
T  31562821 tacacattcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatataaactcataagaatcacttttaaacgagtgt--ccaaacataa-tcaattcacctc 31562725  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  31562724 aaattcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccaccataccaaacacgcact 31562641  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Original strand, 23358232 - 23358411
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||   ||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  23358232 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacattaactcatcacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaactatttcatctcaaa 23358331  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  23358332 ctcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctat-taaatcaattctcgccaacaccataccaaacacacact 23358411  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 557 - 719
Target Start/End: Original strand, 7296112 - 7296274
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  7296112 gataattcggtcattatatattcaaaatcaattttgacttaaactatccaaataacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatccaaacata 7296211  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7296212 aatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaa 7296274  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 611 - 753
Target Start/End: Original strand, 2213658 - 2213800
Alignment:
Q  611 acatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaat 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2213658 acatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaagacaaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaat 2213757  T
Q  711 tctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | || |||||||||||||||    
T  2213758 tctatcaaaatcaattctctcatctgccataccaaacacacac 2213800  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 557 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 7295497 - 7295330
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||  |||||||||    
T  7295497 gataattcggtcattatatattcaaaatcaagtttgacttaaactatccaaacaacatcaactcatgataatcacttttatatgtgtat--ccaaacata 7295400  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7295399 aatcaatttacgtcaaactcatttttaaccagaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 7295330  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 28641599 - 28641796
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||   || ||||| |||    
T  28641599 gataatttggtcattacacatttaaaatcaattttaattcaacatatccaaacaacatcaacttataataatcacttttaaatgaagttacccaaatata 28641698  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||| |  ||| ||| | ||||||||||||||    
T  28641699 aatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcagaatcaattcaattaaaatcaattttatccatcgccaaaccaaacacacact 28641796  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 577 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25748012 - 25747837
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Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  25748012 ttcaaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 25747914  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  25747913 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcaccaccgcggaaccaaacacacac 25747837  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26208080 - 26207884
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||    
T  26208080 gatagtttggtcattgtacatttaaaatcaattttgattcatataatccaaacaacatcaacttgtaagaatcaattttaattaagtgtatcaaaacata 26207981  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||||||||||||    
T  26207980 aatcaattcacatccaactgacttttaaccaaaaccaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgtcataccaaacacacac 26207884  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 571 - 754
Target Start/End: Original strand, 3853871 - 3854054
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||| | ||     
T  3853871 tacacattcaaaagcaattttgattcaaactatccaaacaacatagattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacatt 3853970  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||| | |||||   ||||||||||||||    
T  3853971 caactcacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattccatcaaactcaattctcgctaccgcacaaccaaacacacact 3854054  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 580 - 711
Target Start/End: Original strand, 27911386 - 27911517
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911386 aaaatcaattttaatttaaagtatccaaataacatcaacttgaaataatcacttttaaatgagtatatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 27911485  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27911486 tttaaccaaactcaattctatcaaaatcaatt 27911517  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 31224690 - 31224833
Alignment:
Q  610 aacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaa 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31224690 aacatcaactcataagaatcacttttagtaaaatatatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctttcaaactcaa 31224789  T
Q  710 ttctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||| | |||||| ||||||    
T  31224790 ttctatcaaaatcaattttcgtcaccgccaaaccaaatacacac 31224833  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 588 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42089652 - 42089482
Alignment:
Q  588 ttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatc----caaacataaatcaattcatatcaaactcactttta 683  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  42089652 ttttgattcgatttatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatctatccaaacataaatcaattcacattcaactcactttta 42089553  T
Q  684 accaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| | | ||||||||||||    
T  42089552 atcaaaatcaattctcttgaacttaattctatcaaaatcaattttcatcaccgccaaatcaaacacacact 42089482  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 580 - 728
Target Start/End: Original strand, 16467066 - 16467214
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16467066 aaaattaattttgatctaaactatccaaactacatcaacccataagaatcacttttacattatcatatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 16467165  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16467166 tttaaccaaaatcaattatgccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 16467214  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 747
Target Start/End: Original strand, 18511077 - 18511249
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta-agtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| | ||  ||    
T  18511077 cattcaaaatcaattttgatttaaattatccaaacaacatcactttataagaatcatttttacattga-tgtatccaaacataaatcaattaacatttaa 18511175  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaac 747  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  18511176 atcacttttaaccaaaatcaattatatcaaaatcaattttatcaaaatcaattctctccaccgctgaaccaaac 18511249  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 557 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 25940392 - 25940264
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||   |||| ||| |||| |||    
T  25940392 gataatttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacatcatctcataataatcacttctatacgagtgtattcaaatata 25940293  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25940292 aatcaattcacatcaaactcacttttaac 25940264  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 34433413 - 34433263
Alignment:
Q  602 atccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg-agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctct 700  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34433413 atccaaacaacatgaatttataagaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctgt 34433314  T
Q  701 caaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||    
T  34433313 caaactcaattctatcaaaatcaattctcttcaccgctgaaccaaacacac 34433263  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 648 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 30007613 - 30007509
Alignment:
Q  648 ccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaac 747  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||    
T  30007613 ccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagccataccatac 30007514  T
Q  748 acaca 752  Q
    |||||    
T  30007513 acaca 30007509  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 495 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 39106877 - 39106678
Alignment:
Q  495 ggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgat 594  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||  ||||  |||||||| |    || ||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||    
T  39106877 ggttcaaataattatctaaaataagaatgagatattttgtttttaatacaattta----aaggataatttggtcattgtatatttaaaatcaattttgat 39106782  T
Q  595 tcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaa 694  Q
    ||||| |||| ||||||| | || || || ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39106781 tcaaattatctaaacaacttaaattcgta-gaatcacttttaagtgaatgtatccaaacattaaacaatttatatcaaactcactttttaccaaaatcaa 39106683  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 610 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 45714766 - 45714648
Alignment:
Q  610 aacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaa 709  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45714766 aacatcaaatcatgataatcatttttaacggagtgtatccaaacataaatcaattcacatcgaactcatttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaa 45714667  T
Q  710 ttctatcaaaattaattct 728  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  45714666 ttatatcaaaatcaattct 45714648  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 649 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 38600502 - 38600424
Alignment:
Q  649 caaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38600502 caaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattcgatcaaaattaattc 38600424  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 645 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 41580773 - 41580691
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41580773 tatccaaacataaattaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcgatcaaaatcaattc 41580691  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 580 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3602587 - 3602415
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  3602587 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatgaattaataaaaatcacttttattttaatatatccaaacataattcaattaagttc-aactcact 3602489  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||   |||||||||||||    
T  3602488 tttagacaaaatcaattctatcaaaatcaattcagtaaaaatcaattttcatcaccgcagaaccaaacacacac 3602415  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 579 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 43436410 - 43436290
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  43436410 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatcaaaacataaatcaatttacatctaattcac 43436311  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  43436310 ttttaatcaaaatcaattctc 43436290  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 577 - 719
Target Start/End: Original strand, 8041257 - 8041397
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| ||| | |||||||| | |  ||||||||||||||||||| | ||  || ||    
T  8041257 ttcaaaaacaattttgattcaaacta-ccaaacaacataaattgataaaaataaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaattc 8041354  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 719  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8041355 acttttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 8041397  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 574 - 636
Target Start/End: Original strand, 2234901 - 2234962
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2234901 acatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcactttta 2234962  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 577 - 750
Target Start/End: Original strand, 11240648 - 11240820
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  || |  ||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  11240648 ttcaaaatcaattatgagccaaactatccaaacaacaagaatttttaagaatcaattctaagtgaatgtattcaaacataaatcaattcacattcaactc 11240747  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     |||||  || ||||||||| | | |||| |||||  |||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  11240748 gcttttttcc-aaatcaattttgttaaacccaattaaatcaaaatcaattctctccacggctgaaccaaacaca 11240820  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 645 - 754
Target Start/End: Original strand, 12110919 - 12111027
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||   ||||    
T  12110919 tatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatt-tgacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgcacaacca 12111017  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    ||||||||||    
T  12111018 aacacacact 12111027  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 23267400 - 23267345
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23267400 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattc 23267345  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 34997301 - 34997194
Alignment:
Q  643 tatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatac 742  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| | || | ||    
T  34997301 tatattcaaacataaatcaattcacatccaattcatttttaacaaaaatcaattttgtcaaactaaattttatcaaaatcaattttcaccgcagccaaac 34997202  T
Q  743 caaacaca 750  Q
    ||||||||    
T  34997201 caaacaca 34997194  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 18970421 - 18970272
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||   ||||  ||| |||||||| |||||| |   ||||    
T  18970421 acatccaaaaacaattttaatccaaagtatccaaactacttcaagtcataaggatcacttttatacgagtgcatcaaaacataagtcaatttacg-caaa 18970323  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||    
T  18970322 ctcacttttaaccaaaatcaattatct--tcctcaattctatcaaaatcaatt 18970272  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 645 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30599967 - 30599858
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    |||||||||| ||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | | ||| |||||| |||||||| | ||||    
T  30599967 tatccaaacacaaatcaattgacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaattaattttgttagaatcaattctaaccaccgccaaacca 30599868  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    |||| |||||    
T  30599867 aacatacact 30599858  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 43858341 - 43858194
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcat-atcaaactca 677  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |    | |  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  43858341 caaaatcaattttagttaaaactatccaaacaatatgaattgataagaatcactttcacaataatgcatccaaacataaatcaattattcatc-aactca 43858243  T
Q  678 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||  |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  43858242 cttttgcccaaaatcaattcaattaaaatcaattctatcaaaatcaatt 43858194  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 23359993 - 23359927
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  23359993 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaatt 23359927  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 509
Target Start/End: Original strand, 14821014 - 14821082
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14821014 attatttttaaataaatttgtgaaccaatcaaaatccatttatgattttagataagtttaaataattat 14821082  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 3552992 - 3552921
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactt 633  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| ||||    
T  3552992 tttggtaattacacatttaagatcaattttgattcaaattatccaaacaatatgaaatgataagaattactt 3552921  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 751
Target Start/End: Original strand, 1763265 - 1763370
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    |||| |||||||||||| || | ||  |||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||   ||||    
T  1763265 tatctaaacataaatcactttaaattcaactcaattttaaccaaaatcaatt-ttacaaaatcaattttatcaaaatcaattctcgtcaccgcacaacca 1763363  T
Q  745 aacacac 751  Q
    |||||||    
T  1763364 aacacac 1763370  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37640274 - 37640236
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaac 612  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37640274 acattcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaac 37640236  T

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Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42850373 - 42850176
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  42850373 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaggaagtgtatccaaacata 42850274  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42850273 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 42850176  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 50977607 - 50977297
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | || ||||| | ||||||||||    
T  50977607 atattattttaaaataaatttgtgaaccaataaaaatccatttatgattttagataaattcaaatgattatctaaattaagaatgagatatttaatttta 50977508  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     | ||| || |    || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||     
T  50977507 aacacagttaa----aagggtaatttagtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa- 50977413  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgct 738  Q
    | ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  50977412 taagcgtatccaaacataaaacaattcacaccaaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgcc 50977313  T
Q  739 ataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||    
T  50977312 ataccaaacacacact 50977297  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 500 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7826561 - 7826311
Alignment:
Q  500 aaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaa 599  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | | | |||||||| |||||||| |    || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  7826561 aaataattatctaaaatgggaatgggatatctaattttaaatacaattaa----aaggataacttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaac 7826466  T
Q  600 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7826465 ctatccaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaagctcacttttaaccaaaatcaattctc 7826366  T
Q  700 tcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||    
T  7826365 tcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccaccgccaaaccaaacacacact 7826311  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 563 - 754
Target Start/End: Original strand, 6166088 - 6166278
Alignment:
Q  563 ttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaa 662  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6166088 ttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaacatcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaa 6166186  T
Q  663 ttcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6166187 ttcagatcaaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgcgataccaaacacacact 6166278  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 559 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 43729029 - 43728835
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||     
T  43729029 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa- 43728931  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43728930 tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccatcgctataccaaacacacact 43728835  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 31223346 - 31223543
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  31223346 gatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacata 31223445  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  31223446 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacact 31223543  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 553 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 35569360 - 35569159
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| ||||||||    
T  35569360 aaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaa 35569261  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  35569260 cataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacaca 35569161  T
Q  753 ct 754  Q
    ||    
T  35569160 ct 35569159  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 445 - 754
Target Start/End: Original strand, 13055862 - 13056166
Alignment:
Q  445 ttttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatataca 544  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | || ||||| | |||||||||| | |||    
T  13055862 ttttaaaataaatttgtgaaccaataaaaatccatttatgattttagataaattcaaatgattatctaaattaagaatgagatatttaattttaaacaca 13055961  T
Q  545 attgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagta 644  Q
     || |    || | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||      
T  13055962 gttaa----aagggtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcg 13056056  T
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  13056057 tattcaaacataaatcaattcacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattatcgccaccgccatacca 13056156  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    ||||||||||    
T  13056157 aacacacact 13056166  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 1199799 - 1199996
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  1199799 gatagtttagtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacata 1199898  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1199899 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 1199996  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 20800431 - 20800234
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  20800431 gataatttagtcattatacattcaaaatcaatattgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacata 20800332  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  20800331 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 20800234  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 435 - 752
Target Start/End: Original strand, 5410503 - 5410806
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||       | |||||||||||||| |||  |||| ||||| | |||| |    
T  5410503 attaatattattataaaataaatttttgaagcaataaaaattcatttataat-------aagttgaaataattatataa--tgagaatgagatatttact 5410593  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||| |||||||| |    || |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5410594 tttaaatacaattaa----aaggatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaacaacatcaagtcataagaatcacttt 5410689  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  5410690 taagt-agtgtattcaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgccgc 5410788  T
Q  735 cgctataccaaacacaca 752  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  5410789 cgccaaaccaaacacaca 5410806  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 557 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4369956 - 4369803
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4369956 gataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacata 4369857  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4369856 aatcaattcacatc-aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4369803  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 438 - 752
Target Start/End: Original strand, 25229856 - 25230173
Alignment:
Q  438 aatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataat---tatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||||  |  | ||| | |||  |    
T  25229856 aatattattttaaaatgaatttgtgaaccaataaaaacctatttatgattttacataagttgaaataataattatcaaaaacaaaaacgagatatttt-t 25229954  T
Q  535 tttatatacaattga--ttgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 632  Q
    |||| ||| |||| |  || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25229955 tttaaatataattaaaattaaaaggataatttggtcattacacactcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactaataagaatcact 25230054  T
Q  633 tttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcacc 732  Q
    | ||    ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  25230055 tctattaaagtgtatccaaacat-aatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcagttctatcaaaatcaattctcgcc 25230153  T
Q  733 accgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  25230154 accgtcataccaaacacaca 25230173  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 563 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 11023477 - 11023289
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Q  563 ttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaa 662  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  11023477 ttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaa 11023379  T
Q  663 ttcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11023378 ttcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacaca 11023289  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 48510880 - 48511077
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  48510880 gatagtttgatcattacacacttaaaatcaattttgatacatactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagcaagtgtatccaaacata 48510979  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  48510980 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattcaatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacacact 48511077  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 557 - 748
Target Start/End: Original strand, 45710021 - 45710211
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||| |||||||     
T  45710021 gataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacat- 45710119  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaaca 748  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  45710120 aatcaattcacatacaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaaca 45710211  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 12468185 - 12468380
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||| |||    
T  12468185 gataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaatata 12468283  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  12468284 aatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatc-aaatcaattcttcccgccgccataccaaacacacact 12468380  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Original strand, 35536064 - 35536240
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| || |||||||  ||||| ||    
T  35536064 ttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatctaaacat-aaccaattcacgtcaaagtc 35536162  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35536163 acttttaatcaaaattaattctctcaaactcaattctattaaaattaattttcatcaccgccataccaaacacacact 35536240  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 751
Target Start/End: Original strand, 36205165 - 36205357
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||    
T  36205165 taatttggtcattaaacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaagcaacattcactcgtaagaatcacttttaaataagtttatccaatcaaaaa 36205264  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36205265 ccaattcatatctaacccacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattccgttaaaatcaattctcaccaccgtcataccaaacacac 36205357  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 571 - 754
Target Start/End: Original strand, 13931609 - 13931790
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13931609 tacatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttgtaagaatcatgtttaagtgagtatatccaaacat-aatcaattcacatc 13931707  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13931708 aaactcatttttaaacaaaatcaatttttggaaactcaattctatcaaaatcaa-tcccaccaccgccataccaaacacacact 13931790  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 557 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 40229624 - 40229433
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||    
T  40229624 gatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcagaagaatcacctgtaagaaagtgtatccaaacata 40229525  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaaca 748  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||    
T  40229524 aatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattccaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcatcaccgtcataccaaaca 40229433  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 10470562 - 10470758
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      || ||||||||||||    
T  10470562 gataatttagtcactatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacata 10470661  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10470662 a-tcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccctaccaaacacacact 10470758  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Original strand, 12247412 - 12247588
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| | |||| | ||| |||||    
T  12247412 ttcaaaatcaattttgattcaaattctccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatt-aatttacatccaactc 12247510  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12247511 acttttaaccagaatcaattctcttaaactcaattctattaaaatcaattttcatcaccgctataccaaacacacact 12247588  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Original strand, 6464580 - 6464775
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| |||  ||||||     
T  6464580 gataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtataaaaacat- 6464678  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  6464679 aatcaattcacattaaactcacttttaaccaaaatgaactcactcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccactataccaaacaaacac 6464775  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 579 - 754
Target Start/End: Original strand, 26058235 - 26058410
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  26058235 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaattcac 26058334  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26058335 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacact 26058410  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Original strand, 47123381 - 47123555
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  47123381 aaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcacttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 47123480  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47123481 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttgccaccgccataccaaacacacact 47123555  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 574 - 754
Target Start/End: Original strand, 50406119 - 50406299
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||   |||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  50406119 acatttaaaaacaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaacttataagaatcatttttaacgaagtgcatccaaacaaaaatcaattcacatctaa 50406218  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50406219 ctcacttttaatcaaaatcaaatctttcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccgctataccaaacacacact 50406299  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 600 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 27801763 - 27801609
Alignment:
Q  600 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27801763 ctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctc 27801664  T
Q  700 tcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  27801663 ttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacact 27801609  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 575 - 729
Target Start/End: Original strand, 15884216 - 15884371
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg-agtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15884216 cattcaaaatcaattttgatccaaactatccaaacaacatgaatttataaaaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacatccaa 15884315  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15884316 ctcacttttaaccaaaatcaattctgtcaaactcaactctatcaaaatcaattctc 15884371  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 585 - 750
Target Start/End: Original strand, 9447533 - 9447696
Alignment:
Q  585 caattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaa 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9447533 caattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcacttttaaatgagtatatctaaacat-aatccattcacatcaaactcacttttaa 9447631  T
Q  685 ccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    || ||| || |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  9447632 cc-aaaccatttctctcaaattcaattttattaaaatcaattctcttcaccgccataccaaacaca 9447696  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 557 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11051464 - 11051339
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || ||| ||||||||    
T  11051464 gataatttggtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacat-aactcttaagaaccatttttaagtgtgtgtattcaaacata 11051366  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcactttta 683  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11051365 aatcaattcacatcaaactcactttta 11051339  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 586 - 754
Target Start/End: Original strand, 34718452 - 34718620
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34718452 aattttaattcaaagtatccaaacaactataattcataagaatcacttttgtacaagtgtattcaaacataaatcaatttatatcaaactcacttttaac 34718551  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||||||||    
T  34718552 caaaattaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattttttccaccgtcaaaccaaacacacact 34718620  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 649 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 49243044 - 49242956
Alignment:
Q  649 caaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49243044 caaacataaatcaattcacatccaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaattaattctcaccaccgc 49242956  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 435 - 525
Target Start/End: Original strand, 4487369 - 4487459
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgag 525  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4487369 attaatattattttaaaattattttgtgaaccagtgaatattcatttatgattttagataagttgaaataattatctaaaatgagaatgag 4487459  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 580 - 726
Target Start/End: Original strand, 25061221 - 25061367
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||| || |  ||||||||    
T  25061221 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaacataaatcaatttatgttcaactcact 25061320  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||| ||||    
T  25061321 tttaaccaaaatcaattcaaccaaaatcaattttaacaaaatcaatt 25061367  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 711
Target Start/End: Original strand, 11561826 - 11561948
Alignment:
Q  589 tttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaa 688  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11561826 tttgagtcaaactatccaaattaaatgaactcataagaatcacttttaaaatagtatattcaaatataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaa 11561925  T
Q  689 aatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
T  11561926 aattaattctttcaaactcaatt 11561948  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 557 - 630
Target Start/End: Original strand, 31933699 - 31933772
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatca 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31933699 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatca 31933772  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 638 - 754
Target Start/End: Original strand, 40352444 - 40352559
Alignment:
Q  638 gtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  40352444 gtgaggatatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaaccaaaatcaattc-cacaaaatcaattctatcaaaatcaattctcctcaccgc 40352542  T
Q  738 tataccaaacacacact 754  Q
       ||||||||||||||    
T  40352543 acaaccaaacacacact 40352559  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 577 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 23628839 - 23628706
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  23628839 ttcaaaagtaattttgattcaaaccacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 23628741  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23628740 acttttagtcaaaatcaattatctcaaactcaatt 23628706  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 291818 - 291729
Alignment:
Q  610 aacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  291818 aacaacaactcataacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaaccaattcatctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctc 291729  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 542
Target Start/End: Original strand, 11561703 - 11561810
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| | |||| |    
T  11561703 attaatattattttaaaataaatttgtgaagcaataaaaatccaattatgattttagataagtttaaataattatctaaaataagaaagagatatttagt 11561802  T
Q  535 tttatata 542  Q
    ||||||||    
T  11561803 tttatata 11561810  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 27677291 - 27677404
Alignment:
Q  102 agctcaaatttggagcttctctggcaattgtaatcaattttgttttgtatagctctggcacaaatataactttttatctatttaccacaactgccctcat 201  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  27677291 agctcaaatttgaagcttctatggcaattacaatcgattttgttctgtgtagctctcacacaaatacaccattttatctatttaccataattgcccttat 27677390  T
Q  202 gaactccttatatt 215  Q
     |||||||| ||||    
T  27677391 aaactccttgtatt 27677404  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 43134537 - 43134594
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctc 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43134537 aactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattctatccaaataaattctc 43134594  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 672 - 728
Target Start/End: Original strand, 29441271 - 29441327
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29441271 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattct 29441327  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 557 - 633
Target Start/End: Original strand, 40821797 - 40821873
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactt 633  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  40821797 gataatttagtcattgcacattcaaactcaattttgattcaaattatccaaataacatcaacaaataagaatcactt 40821873  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 585 - 711
Target Start/End: Original strand, 15576454 - 15576580
Alignment:
Q  585 caattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaa 684  Q
    |||||||||  ||||||| |||| ||| || || |  ||| |||||||||||| |  ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15576454 caattttgacacaaactaaccaatcaatataaattggtaaaaatcacttttaattttgtaaatcaaaacataaaacaattaatatctaactcacttttaa 15576553  T
Q  685 ccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
      |||||||||||||| ||||||||||    
T  15576554 ttaaaatcaattctcttaaactcaatt 15576580  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 9447424 - 9447497
Alignment:
Q  445 ttttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatga 518  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9447424 ttttaaaatgaatttatgaatcaataaaaatgaatttatgatcttagataagttaaaataattatctaaaatga 9447497  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 754
Target Start/End: Original strand, 41922 - 42094
Alignment:
Q  578 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactca 677  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||   | |    || ||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  41922 tcaaaataaattttgatccaagctatccaaacaacgtgaatttataagaatcacttttgtctta----attcaaacataaatcaattcacgttcaactca 42017  T
Q  678 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | ||| || ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||   | ||||||||||||    
T  42018 ccttttactaaaatcaattctaacaaaatcaattttatcaaaatcaattttctccaccgcagaatcaaacacacact 42094  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 751
Target Start/End: Original strand, 4347034 - 4347139
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| |  |||||||   ||||    
T  4347034 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct-acaaaatcaattctaccaaaatcaattttttccaccgcacaacca 4347132  T
Q  745 aacacac 751  Q
    |||||||    
T  4347133 aacacac 4347139  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 713
Target Start/End: Original strand, 16556295 - 16556362
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16556295 tatccaaacataaatcacttcatctcaat-tcacttttaaccaaaatcaattatgtcaaattcaattct 16556362  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 656 - 751
Target Start/End: Original strand, 6061214 - 6061308
Alignment:
Q  656 aaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| | | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||    
T  6061214 aaatcaactcatatccaattcacttt-acctataatcaattatctcaaattcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgtcaaaccaaacacac 6061308  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 688 - 735
Target Start/End: Original strand, 34661965 - 34662012
Alignment:
Q  688 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccacc 735  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  34661965 aaatcaattctctcaaactcaattttatcaaacttaattttcaccacc 34662012  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 713
Target Start/End: Original strand, 47085898 - 47085961
Alignment:
Q  650 aaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47085898 aaacataaatcaattcacattcaactcacttttaattaaaatcaattctatcaaaatcaattct 47085961  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 729
Target Start/End: Original strand, 30557577 - 30557677
Alignment:
Q  628 tcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattc 727  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||   ||| | ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||    
T  30557577 tcacttttatatgaatgtatccaaacacaaatcacttctagtcagagtcacttttaaccaaaatcaattct-acagaatcaattctatcaaaatcaattc 30557675  T
Q  728 tc 729  Q
    ||    
T  30557676 tc 30557677  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 721
Target Start/End: Original strand, 43134454 - 43134495
Alignment:
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaat 721  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43134454 tttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattctattaaaat 43134495  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 509
Target Start/End: Original strand, 6464474 - 6464542
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6464474 attatttttaaataaatttgtgaaccaatcaaaatccatttatgattttagataagtttaaataattat 6464542  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 519
Target Start/End: Original strand, 35535973 - 35536013
Alignment:
Q  479 tttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgag 519  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35535973 tttatgattttagataatttgaaataattatctaaaatgag 35536013  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 509
Target Start/End: Original strand, 40821692 - 40821759
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  40821692 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaattcatttataattttagataagtt-aaataattat 40821759  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 474 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 43729107 - 43729063
Alignment:
Q  474 attcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  43729107 attcatttatgattttagataagttcaaataattatgtaaaatga 43729063  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 46033250 - 46033210
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46033250 acattcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaacat 46033210  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 751
Target Start/End: Original strand, 13344860 - 13344938
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||   |||||||||||    
T  13344860 aactcacttttaaccaaaatcaattct-acaaaatcaattcaatcaaaatcaattatcttcaccgcccaaccaaacacac 13344938  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 598
Target Start/End: Original strand, 27677429 - 27677495
Alignment:
Q  529 tttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaa 598  Q
    |||| ||||| ||||||||||   |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27677429 tttagttttaaatacaattga---aaataatattttggtcactacacattcaaaattaattttgattcaa 27677495  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 636
Target Start/End: Original strand, 41856950 - 41856989
Alignment:
Q  597 aaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 636  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41856950 aaactatccaaacaaaatcaactaataagaatcactttta 41856989  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 6220032 - 6219966
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 711  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6220032 tatccaaacatgtatcaatttaaatccaacacacttttaatcaaaatcaattatatcaaactcaatt 6219966  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 675 - 737
Target Start/End: Original strand, 21063283 - 21063345
Alignment:
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  21063283 tcacttttgaccaaaatcaattatgtcaaattaaattctatcaaactaagttctcaccaccgc 21063345  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 547
Target Start/End: Original strand, 31933605 - 31933667
Alignment:
Q  485 attttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaatt 547  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  31933605 atttaagataagttgaaataattatctaaaataaaaatgagatatttaattttaaatacaatt 31933667  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 42850467 - 42850405
Alignment:
Q  485 attttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaatt 547  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  42850467 atttaagataagttgaaataattatctaaaataaaaatgagatatttaattttaaatacaatt 42850405  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 7765349 - 7765241
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
    |||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||  || |||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||||    
T  7765349 tatccaaacaaaaatcacttttcatccaactcacttttattcataatcaattatgtaaaa-tcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcataacca 7765251  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    ||||||||||    
T  7765250 aacacacact 7765241  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Original strand, 45709914 - 45709983
Alignment:
Q  440 tattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  45709914 tattatttttaaatcaatttgtgaaccaatcaaaatccatttatgattttagataaatttaaataattat 45709983  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 9059 - 9251
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9059 gataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacata 9158  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9159 ta-caattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9251  T

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Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Original strand, 3342759 - 3342955
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||    
T  3342759 gatagtttggtcattacatattcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacata 3342858  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  3342859 aatcaattcatatccaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 3342955  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 571 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3622586 - 3622403
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatc 670  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3622586 tacacatttaaaatcaattttgatttatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatc 3622487  T
Q  671 aaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  3622486 caactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataacaaacacacact 3622403  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 446 - 752
Target Start/End: Original strand, 9455969 - 9456268
Alignment:
Q  446 tttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaa 545  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||| ||||||    
T  9455969 tttaaaatgaattcatgaatcaataaaaatgaatttatgatattagataagttaaaataattatctaaaatgaaaatga--tatttagttttaaatacaa 9456066  T
Q  546 ttgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtat 645  Q
    || |    || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |    
T  9456067 ttaa----aaagataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaagatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgt 9456162  T
Q  646 atccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaa 745  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  9456163 atccaaacat-aatcaatttacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcgaacttaattctatcaaaatcaattctcactaccgccgtaccaa 9456261  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 37562539 - 37562736
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  37562539 gatagtttggtcattacacatacaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacata 37562638  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  37562639 aatcaattcacatccaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacact 37562736  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 750
Target Start/End: Original strand, 3375404 - 3375652
Alignment:
Q  497 ttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaattttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattc 596  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||| |||||||| |    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  3375404 ttgaaataattatctaaaat-ataatgagatatttaattttaaatacaattaa----aaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgatcc 3375498  T
Q  597 aaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3375499 aaatcatccaaacaacatcgactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacacaaatcaattcacaccaaactcacttttaaccaaaattaatt 3375598  T
Q  697 ctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |  |||||||||||    
T  3375599 ctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccatcaccgtaccaaacaca 3375652  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 34366235 - 34365925
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | || ||||| | ||||||||||    
T  34366235 atattgttttaaaataaatttgtgaaccaataaaaattcatttatgattttagataaattcaaatgattatctaaattaagaatgagatatttaatttta 34366136  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaag 638  Q
     | ||| || |    || | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  34366135 aacacagttaa----aagggtaatttggtcattacgccttcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaa- 34366041  T
Q  639 tgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgct 738  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||     
T  34366040 taagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactaacttttaactaaaatcaattctttcaaactccattatatcaaaatcaattctagccaccgcc 34365941  T
Q  739 ataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||    
T  34365940 ataccaaacacacact 34365925  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 48459679 - 48459876
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48459679 gatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaacatccattcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacata 48459778  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  48459779 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaacgtcataccaaacacacact 48459876  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 12632223 - 12632031
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  12632223 gatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaacaattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagcgagtacactcaaacata 12632124  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacac 749  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||    
T  12632123 aatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatctattctctcaaacaaaattctatcaaaatcaattctctccaccgcgaaaccaaacac 12632031  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 559 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 43738077 - 43737882
Alignment:
Q  559 taatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaa 658  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||    
T  43738077 taatttggtcatttcacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacaaaaa 43737978  T
Q  659 tcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  43737977 tcaattcatatctaactaacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattatgttaaaatcaattctcaccgtcgccatactaaacacacact 43737882  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 577 - 754
Target Start/End: Original strand, 34010329 - 34010504
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34010329 ttcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaaccacttttaaatgagtgtattcaaacat-aatcagttcatatccaactc 34010427  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  34010428 acttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgcca-accaaacacacact 34010504  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 37639399 - 37639596
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||| | ||||||||||    
T  37639399 gatagtttagtcattacacatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtttctccaaacata 37639498  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  37639499 aatcaattcacattcaattcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacact 37639596  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 574 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 43631818 - 43631642
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43631818 acattcacaatcaattttgattcaatatatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcatatccaaacataa-tcaattcatatctaa 43631720  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  43631719 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccgccataccaaacacac 43631642  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 435 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 39391383 - 39391083
Alignment:
Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaat 534  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||         ||| |||||||||||  |||| || || | |||| |    
T  39391383 attaatattattttaaaatgaatttttgaagcaataaaaattcatttat-atttt---------gaattaattatctaa--tgagaataagatatttact 39391296  T
Q  535 tttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 634  Q
    |||| |||||||| |    || |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39391295 tttaaatacaattaa----aaggatagttaggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttg 39391200  T
Q  635 taagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| || ||||    
T  39391199 taagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaaaaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccac 39391100  T
Q  735 cgctataccaaacacac 751  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39391099 cgccataccaaacacac 39391083  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 577 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 47217661 - 47217487
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 676  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47217661 ttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactc 47217562  T
Q  677 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||   |||||||||||    
T  47217561 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccgccgccgaaccaaacacac 47217487  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 565 - 751
Target Start/End: Original strand, 48134557 - 48134742
Alignment:
Q  565 ggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatt 664  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||    
T  48134557 ggtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttataaaaatcacttttaaacaagtttatccaaacat-aatcaatt 48134655  T
Q  665 catatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  48134656 ctcctcaaacccacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattttcgcaaccgccataccaaacacac 48134742  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 566 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 10372089 - 10371901
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Q  566 gtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattc 665  Q
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T  10372089 gtcattacgcattcaaaatcaattttgattcaaactatccgaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaactgtaaccaaacataaatcaattc 10371990  T
Q  666 atatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  10371989 acattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgttttaccaaacacacact 10371901  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 557 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 44967539 - 44967349
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| ||| ||||||||    
T  44967539 gataatttggtcattacaaactcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtattcaaacata 44967440  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaac 747  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||    
T  44967439 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgctaccgtcataccaaac 44967349  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 557 - 752
Target Start/End: Original strand, 38230037 - 38230232
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   | | ||||||||||||    
T  38230037 gatagtttagtcattacacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaaatgtatccaaacata 38230136  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacaca 752  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  38230137 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctctcggccgccataccaaacacaca 38230232  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 435 - 751
Target Start/End: Original strand, 47021771 - 47022082
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Q  435 attaatattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattc-atttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaa 533  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||  |||  || || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||     
T  47021771 attaatatttttttaaa-tgaatttgtgaaccaataaa-attctatatatgattttgaataaattaaactaattatctaaaataaaaattgggtatttac 47021868  T
Q  534 ttttatatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactt 633  Q
    ||||| |||||||| |    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  47021869 ttttaaatacaattaa----aatgataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacat 47021964  T
Q  634 ttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcacca 733  Q
     ||    ||| ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  47021965 ctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcactttcaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcccca 47022064  T
Q  734 ccgctataccaaacacac 751  Q
    ||   |||||||||||||    
T  47022065 ccatcataccaaacacac 47022082  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 386621 - 386428
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Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaa-tcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacat 655  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  386621 gataatttggtcattatacatttaaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacatcaa-tcataagaatcacttttcggttagtatatccaaacat 386523  T
Q  656 aaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  386522 aaatcaattcacattcagctaacttttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaacaca 386428  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 579 - 753
Target Start/End: Original strand, 41715648 - 41715822
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  41715648 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 41715747  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41715748 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 41715822  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 553 - 717
Target Start/End: Original strand, 42740357 - 42740521
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 652  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42740357 aaatgatactttggtcattacacacttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaatatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaa 42740456  T
Q  653 cataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatca 717  Q
    |||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42740457 cataaatcaattaacattcaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatca 42740521  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 580 - 754
Target Start/End: Original strand, 39977544 - 39977718
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 679  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   || ||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39977544 aaaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataataacttttatatgagtttatccaaaaataaatcaattcatatcaaactcact 39977643  T
Q  680 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  39977644 tttgactaaaatcaattctttcaaactaaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacacacact 39977718  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 557 - 750
Target Start/End: Original strand, 46541569 - 46541762
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaa-tcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacat 655  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||    
T  46541569 gataatttggtcattatacatttaaaaatcaattttgattcaatctatcaaaacaatatcaa-tcataagaatcacttttcggtgaatatactcaaacat 46541667  T
Q  656 aaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  46541668 aaaccaattcacattcaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaacaca 46541762  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 564 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 34011095 - 34010908
Alignment:
Q  564 tggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatcc-aaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaa 662  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||    
T  34011095 tggtcattacacgttcaaaatcaattttgatttaaagtaccccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgaatgtttccaaacataaattaa 34010996  T
Q  663 ttcata-tcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacaca 750  Q
    || | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || | ||||||||||    
T  34010995 tttacactcaaactcac-tttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcaccgctgccaaaccaaacaca 34010908  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 579 - 754
Target Start/End: Original strand, 32186931 - 32187106
Alignment:
Q  579 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcac 678  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  32186931 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 32187030  T
Q  679 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  32187031 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaattaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacatacact 32187106  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 457 - 707
Target Start/End: Original strand, 32205798 - 32206044
Alignment:
Q  457 tttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggat-gaggtgtttaattttatatacaattgattgaaa 555  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||  | |||| ||||| ||| |||| |    ||    
T  32205798 tttatgaaccaataaaaatgcatttataactttagataagctgaaataattatccaaaatgagaattgaaatatttagttttaaataaaattta----aa 32205893  T
Q  556 tgataatttggtcaata-cacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaaca 654  Q
     | ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32205894 ggttaatttggtcatttgcacatttaaaatcaattttgattcatactatc-aaacaacat-aactcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaaca 32205991  T
Q  655 taaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactc 707  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  32205992 taaatcaattcacatcaaacccacttttaattaaaatcaattctttcaaactc 32206044  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 557 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 36920318 - 36920143
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||| |||||| || | ||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |   ||| ||||||||    
T  36920318 gataatatggtcattatatattcgcaatcaattttgattcaatgtacccaaacaacatcaactcaaaagaatcacctttaattaaacgtattcaaacata 36920219  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcacc 732  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36920218 aatcaatttatatctaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattttatcaaaattaattctcacc 36920143  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 557 - 721
Target Start/End: Original strand, 3750656 - 3750819
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||    ||| ||||||||||||    
T  3750656 gatagtttggtcattacacatt-aaaattaattttgatttaaactatccaaacaacatcaattcataagattcaattatattaaagtgtatccaaacata 3750754  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaat 721  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3750755 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttattaaaat 3750819  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 586 - 754
Target Start/End: Original strand, 42904551 - 42904719
Alignment:
Q  586 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaac 685  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |    
T  42904551 aattttgatttaaaatatacaaacaaaattaattcataagaatcacttttaaacgagtgtatcaaaacataaatcaattcacatctaactcatttttatc 42904650  T
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||    
T  42904651 caaaaacaattctctcaaactcaattctatcaaaattcatttttcccactgccataccaaacacacact 42904719  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 582 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 24771026 - 24770854
Alignment:
Q  582 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttt 681  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  24771026 aatcaattttgacaaaaattatccaaacaacataaattgataaaaatcacttttagttttgtatatctaaatataaatcaatttacatccaactcacttt 24770927  T
Q  682 taaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||    
T  24770926 taaccaaaatcaattatctcaaacttaattctatcaaaattaattctcgtcaccgtcataccaaacgcacact 24770854  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39634287 - 39634108
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || | |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39634287 cattcaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacaagaatttataagaatcacttttgttttaagttatccaaacataaatcaattcatattcaac 39634188  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  39634187 tcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtccaaatcaattctctccaccgcagaaccaaacacacact 39634108  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 600 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 37008447 - 37008296
Alignment:
Q  600 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctc 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||      
T  37008447 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttataagaaagtgtctccaaacataaatcaa-tcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattcca 37008349  T
Q  700 tcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
     |||| |||||||||| ||||| | || || ||||||  ||||||||||||||||    
T  37008348 acaaaatcaattctataaaaatcagttttcgccaccg--ataccaaacacacact 37008296  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 439 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 47301801 - 47301622
Alignment:
Q  439 atattattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaatgaggatgaggtgtttaatttta 538  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||          ||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  47301801 atattattttaaaataaatttttgaaccaataaaaatccatttatgattttagataagt----------atctaaaataagaatgagatgtttagtttta 47301712  T
Q  539 tatacaattgattgaaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 632  Q
     ||| |||| |    || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47301711 aatataattaa----aaggataatttagtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcact 47301622  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 753
Target Start/End: Original strand, 19097483 - 19097562
Alignment:
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19097483 ctcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccgccgccataccaaacacacac 19097562  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40903290 - 40903112
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||| |  || ||    
T  40903290 acatccaaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttc-aa 40903192  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||| || |||| |  | |||||||||||||    
T  40903191 ctcacttttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacacacac 40903112  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 42752313 - 42752134
Alignment:
Q  575 cattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaac 674  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || | |||||||| | ||||   | |   |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  42752313 cattcaaaatcaattttgatctaagttatccaaacaacatgaatttataagaattatttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaac 42752214  T
Q  675 tcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||    
T  42752213 tcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacacact 42752134  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 577 - 657
Target Start/End: Original strand, 19095926 - 19096005
Alignment:
Q  577 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataa 657  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  19095926 ttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacat-aactcataagaatcatttttaaacgagtgtatccaaacataa 19096005  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 562 - 713
Target Start/End: Original strand, 1766399 - 1766550
Alignment:
Q  562 tttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatca 661  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| || |   |||||||| ||||||||    
T  1766399 tttggtaattacacactcaaaatcaattttaattcaaattattcaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaatataaatca 1766498  T
Q  662 attcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 713  Q
    ||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  1766499 atttaggttcaactcacttttaatcaaaatcaatttaatcaaaatcaattct 1766550  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 726
Target Start/End: Original strand, 12964659 - 12964736
Alignment:
Q  649 caaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 726  Q
    |||||||||||||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12964659 caaacataaatcaatctacattcaactcacttataacgaaaatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 12964736  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 696
Target Start/End: Original strand, 33746398 - 33746497
Alignment:
Q  597 aaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    ||||||||||||||| || || | |||||||||||  |||||| | | || ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  33746398 aaactatccaaacaaaatgaatttataagaatcacggttaagttaatgtaaccaaacaaaaatcaatttatattcaactcacttttaatcaaaatcaatt 33746497  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 12212490 - 12212438
Alignment:
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12212490 cacttctaaccaaaatcaattcactcaagctcaattctatcaaaatcaattct 12212438  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 635
Target Start/End: Original strand, 12964404 - 12964483
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttt 635  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  12964404 aaatgatagtttgatcattacacattcaaaat---tgttgactcaaactatccaaacaacattaactcataataattactttt 12964483  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 756
Target Start/End: Original strand, 2839277 - 2839458
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||  | || | | ||||||||||||| | | | |  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  2839277 acattcaaaaataattttgactcaaagtatccaaacaatttaaattaacaagaatcacttttgacttaatgaatccaaacataaatcaatttagttc-aa 2839375  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacactca 756  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||| ||  ||||||   |||||||||| |||||    
T  2839376 ctcacttttcataaaaatctattctatcaaaatcaattcaatcataatcaattttcgtcaccgcataaccaaacacatactca 2839458  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37886887 - 37886854
Alignment:
Q  580 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37886887 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 37886854  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 614
Target Start/End: Original strand, 4035920 - 4035960
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 614  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4035920 acattcaaaagcaattttgattaaaactatccaaacaacat 4035960  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 553 - 624
Target Start/End: Original strand, 12961738 - 12961807
Alignment:
Q  553 aaatgataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataa 624  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12961738 aaatgatagtttgatcattacacattcaaaatt--tgttgcttcaaactatccaaacaacattaactcataa 12961807  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 571 - 635
Target Start/End: Original strand, 43581618 - 43581682
Alignment:
Q  571 tacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttt 635  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  43581618 tacacatctaaaagcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaattaattataatcactttt 43581682  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 648 - 696
Target Start/End: Original strand, 44274698 - 44274746
Alignment:
Q  648 ccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaatt 696  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44274698 ccaaacataaatcattttatcttaaactcacttttaaccaaaatcaatt 44274746  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 672 - 737
Target Start/End: Original strand, 20088953 - 20089018
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattct-ctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20088953 aactcacttttaaccaaaatcaattatacttaaa-tcaattctatcaaaatcaattctttccaccgc 20089018  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 672 - 714
Target Start/End: Original strand, 20388690 - 20388732
Alignment:
Q  672 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcta 714  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20388690 aactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 20388732  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 25472192 - 25472150
Alignment:
Q  686 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattct 728  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25472192 caaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattct 25472150  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 516
Target Start/End: Original strand, 34010233 - 34010275
Alignment:
Q  474 attcatttatgattttagataggttgaaataattatctaaaat 516  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34010233 attcatttataattttagataagttgaaatatttatctaaaat 34010275  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 648 - 697
Target Start/End: Original strand, 38494276 - 38494325
Alignment:
Q  648 ccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattc 697  Q
    ||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38494276 ccaaacataaaccacttcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 38494325  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 47301620 - 47301571
Alignment:
Q  702 aaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  47301620 aaactcaattatatcaaaattaattctagccactgccataccaaacacac 47301571  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 8397 - 8594
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||||    
T  8397 gataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcatttttaaaaaagtgtatccaaacata 8496  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  8497 aatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattattcccaccgccataccaaacacacact 8594  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Original strand, 253076 - 253273
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  253076 gataagttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacata 253175  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  253176 aatcaattcatatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgcccaaccaaacacacact 253273  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 29275 - 29080
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    ||| |||||||||||     
T  29275 gataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaattcataagaataacttctattaaagtgtatccaaacat- 29177  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| | | |||||||||||||    
T  29176 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttaattctatcaaaatcaattattaccaccaccaaaccaaacacacac 29080  T

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Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29381 - 29313
Alignment:
Q  441 attattttaaaatgattttatgaaccaataaatattcatttatgattttagataggttgaaataattat 509  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29381 attatttttaaataaatttgtgaaccaataaaaatccattaatgattttagataagttcaaataattat 29313  T

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Target: scaffold0983 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 2421 - 2225
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacata 656  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || |||||||||   ||| | ||||||||||    
T  2421 gataatttggtcattacatatccaaaatcaattttgattcaaactatctaaacaacgtcaacttgtaaaaaccacttttaaacaagtgtgtccaaacata 2322  T
Q  657 aatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  2321 aatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattatgtcaaactcaattctgtcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaacagacac 2225  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 2161 - 1983
Alignment:
Q  576 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaact 675  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161 attcaaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagccatgataatcacttttatatgagtgcatccaaacataaatcaattcatatcaaact 2062  T
Q  676 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |  |||||||||||||    
T  2061 cattttgaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgacaccgccaatccaaacacacact 1983  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 557 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 5984 - 5786
Alignment:
Q  557 gataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaa-----ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaa 651  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   |   ||  |||    
T  5984 gatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaattaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaacggtaatcaa 5885  T
Q  652 acataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacac 751  Q
    ||||    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  5884 acat----caattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccctaccaccataccaaacacac 5789  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 574 - 753
Target Start/End: Original strand, 46728 - 46906
Alignment:
Q  574 acattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaa 673  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||| |  || ||    
T  46728 acatccaaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttc-aa 46826  T
Q  674 ctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctataccaaacacacac 753  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||| || |||| |  | |||||||||||||    
T  46827 ctcacttttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacacacac 46906  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 619 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 118501 - 118366
Alignment:
Q  619 tcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaa 718  Q
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T  118501 tcataagaatcacttttgtacaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaacaaaaatctattctatcaaactcaattcgatcaa 118402  T
Q  719 aattaattctcaccaccgctataccaaacacacact 754  Q
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T  118401 aatcaattcctcccaccgccaatccaaacacacact 118366  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 638 - 737
Target Start/End: Original strand, 65529 - 65627
Alignment:
Q  638 gtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgc 737  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  65529 gtgaggatatccaaacataaatcactttacattaaactcatttttaaccaaaatcaatt-tcacagaatcaattctatcaaaattaattcccatcaccgc 65627  T

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Target: scaffold0172 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 645 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15322 - 15214
Alignment:
Q  645 tatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctatacca 744  Q
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T  15322 tatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatt-tgacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgcacaacca 15224  T
Q  745 aacacacact 754  Q
    ||||||||||    
T  15223 aacacacact 15214  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 714
Target Start/End: Original strand, 301562 - 301630
Alignment:
Q  646 atccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcta 714  Q
    |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  301562 atccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 301630  T

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Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 734
Target Start/End: Original strand, 32058 - 32103
Alignment:
Q  689 aatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccac 734  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32058 aatcaattctatcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccac 32103  T

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