View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9286_low_21 (Length: 318)

Name: NF9286_low_21
Description: NF9286
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9286_low_21
NF9286_low_21
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (5-316)||(37261816-37262127)
chr5 (4-294)||(8428001-8428292)
chr5 (4-294)||(37373448-37373739)
chr5 (4-291)||(25542213-25542500)
chr5 (4-294)||(3690489-3690780)
chr5 (34-294)||(39883717-39883978)
chr5 (4-294)||(3876007-3876298)
chr5 (4-294)||(27881596-27881887)
chr5 (4-290)||(14192232-14192518)
chr5 (4-291)||(30346049-30346336)
chr5 (4-291)||(10025490-10025777)
chr5 (4-220)||(24629444-24629660)
chr5 (4-222)||(17871127-17871345)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (1-316)||(10039139-10039443)
chr3 (4-294)||(33283-33574)
chr3 (4-294)||(50410680-50410971)
chr3 (4-293)||(52918538-52918828)
chr3 (4-290)||(10968202-10968489)
chr3 (4-294)||(13530551-13530842)
chr3 (4-294)||(11369151-11369441)
chr3 (7-291)||(10000922-10001206)
chr3 (7-291)||(10111115-10111399)
chr3 (7-132)||(10238069-10238194)
chr3 (127-291)||(10244920-10245084)
chr3 (153-257)||(10250418-10250523)
chr3 (153-234)||(10113314-10113396)
chr3 (149-220)||(27275059-27275130)
chr3 (153-257)||(10013718-10013823)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (4-294)||(25217981-25218272)
chr8 (4-294)||(30325987-30326278)
chr8 (4-292)||(7822350-7822633)
chr8 (4-291)||(21113164-21113451)
chr8 (4-291)||(25208466-25208754)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (4-294)||(35856419-35856710)
chr4 (4-294)||(49710684-49710975)
chr4 (4-294)||(13344447-13344738)
chr4 (4-294)||(49786268-49786559)
chr4 (4-291)||(55558543-55558830)
chr4 (4-193)||(13337747-13337936)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (4-294)||(21395882-21396173)
chr2 (4-294)||(28665612-28665903)
chr2 (4-294)||(37824446-37824737)
chr2 (4-290)||(24246337-24246622)
chr2 (4-294)||(41919613-41919904)
chr2 (4-294)||(27193001-27193291)
chr2 (4-294)||(27842815-27843105)
chr2 (4-294)||(27509886-27510177)
chr2 (30-316)||(17683307-17683594)
chr2 (4-291)||(24268490-24268777)
chr2 (4-290)||(35610165-35610451)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (4-294)||(48376-48667)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (4-290)||(9000565-9000852)
chr7 (4-294)||(12785418-12785709)
chr7 (4-294)||(12780564-12780855)
chr7 (4-291)||(42232512-42232799)
chr7 (1-294)||(7037229-7037523)
chr7 (4-222)||(22844315-22844534)
chr7 (4-291)||(21069492-21069769)
chr7 (4-92)||(5828174-5828262)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (5-294)||(12517787-12518077)
chr6 (30-316)||(10188560-10188847)
chr6 (48-294)||(2200314-2200561)
chr6 (4-222)||(30881838-30882056)
chr6 (186-294)||(18857227-18857339)
chr6 (211-291)||(15334016-15334096)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (4-299)||(16042537-16042831)
chr1 (4-294)||(6310410-6310701)
chr1 (1-294)||(36207724-36208018)
chr1 (4-294)||(2329678-2329969)
chr1 (4-220)||(52501089-52501305)
chr1 (1-229)||(37389633-37389862)
chr1 (1-137)||(2452690-2452827)
chr1 (1-126)||(48774920-48775045)
chr1 (171-294)||(48774799-48774923)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (17-294)||(32457-32735)
scaffold0073 (1-294)||(260-554)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (4-291)||(28139-28426)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (4-286)||(42487-42770)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (4-294)||(183323-183614)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (4-286)||(1529-1812)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (4-291)||(4680-4967)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (4-289)||(13699-13984)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (4-291)||(19517-19804)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (4-291)||(187066-187351)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (20-273)||(5-259)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (4-206)||(17382-17584)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (4-222)||(320824-321043)
scaffold0002 (111-291)||(319135-319314)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 37261816 - 37262127
Alignment:
5 ggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
37261816 ggatcattcctagacatgatatcgcgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcaatgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttacag 37261915  T
105 cacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37261916 cacgcaccaggtctgtcctaggactatccttttccatcgtaagcaatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc 37262015  T
205 actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccatgtaattaacc 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
37262016 actggtaatagaagagccgttataccgctggatgcagcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacagccgacaatgttttccatgtaattaacc 37262115  T
305 cctttaaaaagt 316  Q
    ||||||||||||    
37262116 cctttaaaaagt 37262127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8428292 - 8428001
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
8428292 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 8428193  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
8428192 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 8428093  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
8428092 cacctggtaatagaagagccgttataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 8428001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 37373448 - 37373739
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
37373448 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagtctcatcccaaattatcaactttgca 37373547  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
37373548 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcatggagtgcgcggttcttc 37373647  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
37373648 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 37373739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25542500 - 25542213
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
25542500 gggatcattcttggacatgatatcacgcattaatcggtcaacttcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcttaaattatcaactttgca 25542401  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
25542400 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactatcagcgtcgagtatgcggttcttc 25542302  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    || ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||    
25542301 cacctggtaatagaagagtcactataccgctggatgcatcattcaatacaattaaccccttcggtctaacaacagccgacaatgttttc 25542213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 3690489 - 3690780
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
3690489 gggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggttcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 3690588  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
3690589 gcaggcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctcattaatctcaatagggactgttagcatcgagtgcgcggttcttc 3690688  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| || ||||   |||| ||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
3690689 cacctggtaatagaagagtcgttatatctctggatgcaacattcaatacaattaaccctttcgatctaacaacaactgacaatgttttccat 3690780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 39883717 - 39883978
Alignment:
34 tgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggtctgccctaggactatcc 133  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
39883717 tgatcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcagctttgcagcacgcaccaggtctgccttaggactatcc 39883816  T
134 ttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
39883817 ttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaataaggactatcagcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgc 39883916  T
233 tggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    ||| ||  | ||| |||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||    
39883917 tggatgcagtattcaatacaattaactcattcgatctaacagcagccgacaatgttttccat 39883978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3876298 - 3876007
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
3876298 gggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacatcatcggttcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 3876199  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
3876198 gcaggcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctcattaatctcaatagggactgttagcatcgagtgcgcggttcttc 3876099  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| || ||||   |||| ||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
3876098 cacctggtaatagaagagtcgttatatctctggatgcaacattcaatacaattaaccctttcgatctaacaacaactgacaatgttttccat 3876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 27881596 - 27881887
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
27881596 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 27881695  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
27881696 gcacgcatcaggtttgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 27881795  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    || |    |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
27881796 cacctggtaatagaaaagccgctataccatcggatacaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 27881887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14192518 - 14192232
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
14192518 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaattgcttcaaaacaccatcggtgca-cattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 14192420  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||     
14192419 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctaattaatctcaatagggtatgtcagtgtcgagtgcgcggttgttt 14192320  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgtttt 290  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
14192319 cacctggtaatagaagagccgttataccgctggatacaacatttaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaatgtttt 14192232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30346336 - 30346049
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
30346336 gggatcaatcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagtctcatcccaaattatcaactttgca 30346237  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30346236 gcacgcatcaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 30346138  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||    
30346137 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgactatgttttc 30346049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 10025490 - 10025777
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
10025490 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 10025589  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
10025590 gcacgcactaggtctgccccaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggaccgtcaacttcgagtgtgcggttcttc 10025688  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||    
10025689 cttctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaatagcagccgacaatgttttc 10025777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24629660 - 24629444
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
24629660 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggccaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 24629561  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24629560 gcacgcatcaggtcttccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 24629462  T
204 c-actggtaatagaagag 220  Q
    |  |||||||||||||||    
24629461 ctcctggtaatagaagag 24629444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17871345 - 17871127
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |     
17871345 gggatcattcttggacatgatat-acgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcattccatattatcaacttttct 17871247  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
     || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17871246 acatgcaccatgtcttccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 17871147  T
204 ca-ctggtaatagaagagcc 222  Q
    || | ||||| |||||||||    
17871146 caccaggtaagagaagagcc 17871127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10039139 - 10039443
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||| ||||| |||||||||| |||    
10039139 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaagaccat-----------tggagccccatcccaaattatcaatttt 10039227  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10039228 acagtacgcaccaggtctgccctatgactatccttctccagcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 10039327  T
201 ttccactggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccatgtaatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10039328 ttccactggtaatagaagagctgttataccgctggatgcagcatttaatacaattaacctttttcatctaacaacagccgacaatgttttccatgtaatt 10039427  T
301 aacccctttaaaaagt 316  Q
    ||||||||||||||||    
10039428 aacccctttaaaaagt 10039443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 33283 - 33574
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
33283 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcatcggagcctcatcccaaattatcaactatgca 33382  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
33383 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 33482  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||  | |||||||| ||||||||    
33483 cacctggtaatagaagagccgctatacggttggatgcaacattcaatacaattaacccattcgatctaacagtagccgacaatcttttccat 33574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 50410680 - 50410971
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
50410680 gggatcattcttggacatgatatcacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcatcacaaattatcaactttgca 50410779  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
50410780 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctccttaatctcaatagggattgctagtgtcgagtgcgcggttcttc 50410879  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
50410880 cacctggtaatagaagagctgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccctttcgatctaacagcagtcgacaatgttttccat 50410971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 52918538 - 52918828
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
52918538 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 52918637  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
52918638 gcacgcaccaggtctaccctaggattatccttttccatcgtaagcgatgacggctcattaatctcaataaggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 52918737  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttcca 293  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||    
52918738 cacctggtaatagaagagccgatataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaaacttttcca 52918828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10968489 - 10968202
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
10968489 gggatcattcttggacctgatatcatgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 10968390  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
10968389 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcagttcttc 10968290  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgtttt 290  Q
    || |||||||||||| || |||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||    
10968289 cacctggtaatagaatagtcgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaatatcagccgacaatctttt 10968202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 13530551 - 13530842
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||    
13530551 gggatcattcttggacatgatatgacgcattgatcggtcaactgtctcaaaacaccattggtgtatcatcggagccttatcccaaattatcaactttgca 13530650  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||     
13530651 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttctatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactatcagtgtcgagtgcacggttcttt 13530750  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||    
13530751 cacctggtaatagaagagtcactatactgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgagctaacaatagccgacaatgttttccat 13530842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 11369151 - 11369441
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
11369151 gggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgaa 11369250  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
11369251 gcatgcaccaggtctg-cctaggactatccttttccatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaacagggactgttagcgtcgagtgcacggttcttc 11369349  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||    
11369350 cacctggtaatagaagagtcgatataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaactgacaatgttttccat 11369441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Original strand, 10000922 - 10001206
Alignment:
7 atcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagca 106  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
10000922 atcattcttggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcagca 10001021  T
107 cgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc-a 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||      
10001022 cgcaccaagtctgccctaggactatccttttccatcgtaagagatgattcctca-taatctcaacagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttcctc 10001120  T
206 ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| ||| | ||   |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
10001121 ctgctaatagaagagtcactataccgctagatgcaacattcaatataattaaccccttcgatctaacaacagtcgacaatgttttc 10001206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Original strand, 10111115 - 10111399
Alignment:
7 atcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagca 106  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
10111115 atcattcttggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcagca 10111214  T
107 cgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc-a 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||      
10111215 cgcaccaagtctgccctaggactatccttttccatcgtaagagatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcaggtgtgcggttcttcctc 10111313  T
206 ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| ||| | ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||    
10111314 ctgctaatagaagagtcactataccgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagtcgacaatgttttc 10111399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 10238069 - 10238194
Alignment:
7 atcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagca 106  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
10238069 atcattcctggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcagca 10238168  T
107 cgcaccaggtctgccctaggactatc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
10238169 cgcaccaggtctgccctaggactatc 10238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 291
Target Start/End: Original strand, 10244920 - 10245084
Alignment:
127 actatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc-actggtaatagaagagccgct 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||    
10244920 actatccttttacatcgtaagagatgatgcctcat-aatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttcctcctgctaatagaagagtcact 10245018  T
226 atactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |||||||| | ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
10245019 atactgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttc 10245084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 257
Target Start/End: Original strand, 10250418 - 10250523
Alignment:
153 atgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatac 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||    
10250418 atgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagccgttataccgctggatgtagcattcaatac 10250517  T
252 aattaa 257  Q
    ||||||    
10250518 aattaa 10250523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 10113314 - 10113396
Alignment:
153 atgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
10113314 atgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagccgttataccgctg 10113396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 220
Target Start/End: Original strand, 27275059 - 27275130
Alignment:
149 gatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc-actggtaatagaagag 220  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
27275059 gatgatgcctcat-aatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttcctcctggtaatagaagag 27275130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 257
Target Start/End: Original strand, 10013718 - 10013823
Alignment:
153 atgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatac 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||  ||||| |||||    
10013718 atgcctcattaatatcaatagggactattagtgtcgaatgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagtcattataccgctggatgcagcattcaatac 10013817  T
252 aattaa 257  Q
    ||||||    
10013818 aattaa 10013823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25218272 - 25217981
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
25218272 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 25218173  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
25218172 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 25218073  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
25218072 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 25217981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 30325987 - 30326278
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
30325987 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 30326086  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
30326087 gcatgcaccaggtctgccctaggactatcattttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactatcggcgtggagtgcgcggttcttc 30326186  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
30326187 cacctggtaatagaagagccgctataccgttagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 30326278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 7822350 - 7822633
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
7822350 gggatcatttttggacatgatatcatgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 7822449  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||    
7822450 gcacgcaccaggtctgccctaggactatcctctttcatcgcaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgt------cgtggttcttc 7822543  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttcc 292  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||    
7822544 cacctggtaatagaagagccgttatactgctggatgcagcattcaatacaattaacccattcgatctaacagcaaccgacaatgttttcc 7822633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21113451 - 21113164
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
21113451 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgccgcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 21113352  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
21113351 gcacgcaccaggtctgtcctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcaacgtcgagtgtgcggttcttc 21113253  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||    
21113252 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaacgcattcgatctaacagcagccgacaatgttttc 21113164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25208754 - 25208466
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
25208754 gggatcattcttggacatgatatcacacaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagtctcatcccaaattatcaactttgga 25208655  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
25208654 gcacgcatcaggtctgccctaggactttccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagcgcgcggttcttc 25208555  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||| ||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||| |||||    
25208554 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcaacattcaatacaattaaccccatcgatctaacagtagccgacaatcttttc 25208466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 35856419 - 35856710
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
35856419 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 35856518  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
35856519 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 35856618  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
35856619 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 35856710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 49710684 - 49710975
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
49710684 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcgatgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 49710783  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49710784 gcacgcacaaggtctgccctaggactatccttttgcatcttaagcgatgatgcctcgttaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 49710883  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
49710884 cacctggtaatagaagagccgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttccat 49710975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 13344447 - 13344738
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
13344447 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaccaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 13344546  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
13344547 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactatcggcgtggagtgcacggttcttc 13344646  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
13344647 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 13344738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49786559 - 49786268
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
49786559 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 49786460  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
49786459 gcacacaccaggtctgcccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 49786360  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    
49786359 cacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatcttttccat 49786268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55558830 - 55558543
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
55558830 gggatcatttttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 55558731  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
55558730 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 55558632  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||   |||| |||| ||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||    
55558631 cttctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcatcattcaatagaattaaccccttcgatctaacagcagcggacaatgttttc 55558543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 13337747 - 13337936
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
13337747 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaccaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 13337846  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
13337847 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactatcggcgtggagtgc 13337936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 21395882 - 21396173
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
21395882 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaacagcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 21395981  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
21395982 gcacgcaccaagtctgccctaggactatcctttagcatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaacagggactgtcagcgccgagtgcgcggttcttc 21396081  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
21396082 cacctggtaatagaagagccgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttccat 21396173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28665903 - 28665612
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
28665903 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 28665804  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
28665803 gcacacaccaggtctgcccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttc 28665704  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
28665703 cacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaattttttccat 28665612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37824737 - 37824446
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
37824737 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 37824638  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
37824637 gcacacaccaggtctgcccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttc 37824538  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
37824537 cacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaattttttccat 37824446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 24246337 - 24246622
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
24246337 gggatcattcttggacatgatatcacgtattgatcggtcaactgcctcaaaataccatcagtgcatcattggagcctcatc--aaattatcaactttgca 24246434  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24246435 gcacgcaccaagtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 24246534  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgtttt 290  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||  | | |||||||||||    
24246535 cacctggtaatagaagagccgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacattagctgacaatgtttt 24246622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41919904 - 41919613
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
41919904 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 41919805  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
41919804 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgttggcgtggagtgcgcggttcttc 41919705  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
41919704 cacctgataatagaagagccgctataccattggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatcttttccat 41919613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 27193001 - 27193291
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
27193001 gggatcattcttgtacatgatataacgcattgatcggtcaactgcctcaaagcaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaattttgca 27193100  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
27193101 gcacgcaccaggtcagccctaggactatccttttccatcataagcgatgatgcctcattaatctcaata-ggaatgtaagcgttgagtgtgcggttcttc 27193199  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
27193200 cacctggtaattgaagagctgctataccgcttgatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacatccgacaatgttttccat 27193291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 27842815 - 27843105
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
27842815 gggatcattcttgtacatgatataacgcattgatcggtcaactgcctcaaagcaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaattttgca 27842914  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
27842915 gcacgcaccaggtcagccctaggactatccttttccatcataagcgatgatgcctcattaatctcaata-ggaatgtaagcgttgagtgtgcggttcttc 27843013  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
27843014 cacctggtaattgaagagctgctataccgcttgatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacatccgacaatgttttccat 27843105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 27509886 - 27510177
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
27509886 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattgaagcctcatcctaaattatcaactttgca 27509985  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
27509986 gcatgcaccagatctgccctaggtctgtccttttgcatcgtaagcaatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagtgtcgagtgcgaggttcttc 27510085  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |  | ||    ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
27510086 cacctggtaatagaagagccgctataccaccagatgcaaaattcaatacaattaacccctccgatctaacaacagtcgacaatgttttccat 27510177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17683594 - 17683307
Alignment:
30 gcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggtctgccctaggact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
17683594 gcattgatgagtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattagagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccctacgact 17683495  T
130 atccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccac-tggtaatagaagagccgctata 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
17683494 atcctttttcatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcgatagggactgtcaacatcaagtgtgcggttcttccacatgataatagaagagccgttata 17683395  T
229 ctgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccatgtaattaacccctttaaaaagt 316  Q
    | ||||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
17683394 ccgctggctgcaacattcaatacaattcaccccttcaatctaacataagccgacaatgttttccatataattaacccctttaaaaagt 17683307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24268777 - 24268490
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
24268777 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcagtggagcctcatcccaaattatcaactttgca 24268678  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24268677 gcatgcaccaggtctgtcctaggactatcattttccatcgtaagcgatgatgcctca-aaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 24268579  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||   |||| |||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||    
24268578 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcaacattcaatacaattaactcattcgatctaacagcagccgacaatgttttc 24268490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 35610165 - 35610451
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
35610165 gggatcattcttggacatgatatcacgtattgatcggtcaattgcttcaaaacaccatcggtgca-cattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 35610263  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||     
35610264 gcacgcaccaggtctgccttaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctaattaatctcaataaggtatgtcagcgtcgactgcgcggttgttt 35610363  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgtttt 290  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
35610364 cacctggtaatagaagagccgttataccgctggatacaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaatgtttt 35610451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48667 - 48376
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
48667 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 48568  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
48567 gcacgcaccaggtctgcccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 48468  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
48467 cacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaattttttccat 48376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9000852 - 9000565
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
9000852 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 9000753  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
9000752 gcacgcatcaggtctgccctaggactatccttttccatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcagttctac 9000653  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgtttt 290  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || | || ||||||||    
9000652 cacctggtaatagaagagccgatataccgctggatgcagcattcaatacaattaacccattcgatctaacagcagctgataatgtttt 9000565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12785709 - 12785418
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
12785709 gggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 12785610  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
12785609 gcacacaccaggtctgcccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttc 12785510  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
12785509 cacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaattttttccat 12785418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12780855 - 12780564
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
12780855 gggatcattcttggacatgatatcaaacaatgatcggacaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgta 12780756  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12780755 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacacctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcggttcttc 12780656  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    
12780655 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatcttttccat 12780564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 42232512 - 42232799
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
42232512 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 42232611  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
42232612 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 42232710  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
42232711 cttctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttc 42232799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7037229 - 7037523
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
7037229 taagggatcattcttgaacatgatatcacgtaatgatcggtcaactacctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcaccccaaattatcaacttt 7037328  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 200  Q
     ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
7037329 gcagcatgcattaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgtgcggttc 7037428  T
201 ttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    
7037429 ttccacctggtaatagaagagccgttataccgtttgatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatcttttccat 7037523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 22844315 - 22844534
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
22844315 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgct 22844414  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22844415 acatgcaccaggtcttccctaggactatccttttcaatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 22844514  T
204 ca-ctggtaatagaagagcc 222  Q
    || || |||| |||||||||    
22844515 cacctagtaagagaagagcc 22844534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21069769 - 21069492
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |  | || | |||||||||||||||  | ||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||    
21069769 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgaccgatgaaatgcctcaaaacaccatcaatacatcattggagcctcgttcgaaattatcaagtttgca 21069670  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||       |||||  |    
21069669 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcatcgtcg-------ggttc--c 21069580  T
204 cactggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
      ||||||||||||||  | |||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||    
21069579 acctggtaatagaagattcactataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaatcgacaatgttttc 21069492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5828262 - 5828174
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaatta 92  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
5828262 gggatcattcttggacatgatatcacacattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaatta 5828174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 12517787 - 12518077
Alignment:
5 ggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacag 104  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
12517787 ggatcattcttggacatgatatcacacaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 12517886  T
105 cacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcc 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
12517887 cacgcaccatgcctgccctaggactatcattttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtacggttcttcc 12517986  T
205 a-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
12517987 acctggtaatagaagagccgctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatgttttccat 12518077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Original strand, 10188560 - 10188847
Alignment:
30 gcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggtctgccctaggact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
10188560 gcattgatgagtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattagagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccctacgact 10188659  T
130 atccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctata 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10188660 atccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcaacatcaagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctata 10188759  T
229 ctgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccatgtaattaacccctttaaaaagt 316  Q
    | ||||| ||   |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
10188760 ccgctggctgcaacattcaatacaattcaccccttcaatctaacataagccgacaatgttttccatataattaacccctttaaaaagt 10188847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2200561 - 2200314
Alignment:
48 cctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaag 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
2200561 cctcaaaacactatcggtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctcccctaggactatctttttccatcgtaag 2200462  T
148 cgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcattt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||| | ||| ||  |||||     
2200461 cgatgatgcctcattaatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcaacctggtaatagtagagacgttataccgttggatgtagcattc 2200362  T
247 aatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
2200361 aatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttccat 2200314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 30881838 - 30882056
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |     
30881838 gggatcattcttggacatgatat-acgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcattccatattatcaacttttct 30881936  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30881937 acatgcaccaggtcttccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 30882036  T
204 ca-ctggtaatagaagagcc 222  Q
    || | ||||| |||||||||    
30882037 caccaggtaagagaagagcc 30882056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 294
Target Start/End: Original strand, 18857227 - 18857339
Alignment:
186 tcgagtgcgcggttcttccact-ggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaaccct---tttgatctaacaacacccga 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |||| ||||||||||||||    || |||||||||||| | ||    
18857227 tcgagtgcgaggttcttccacttggtaatagaagagccgttataccgctagatgcaacattcaatacaattaacccccccttcgatctaacaacagctga 18857326  T
282 caatgttttccat 294  Q
    |||||||||||||    
18857327 caatgttttccat 18857339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Original strand, 15334016 - 15334096
Alignment:
211 aatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| ||   |||| |||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
15334016 aatagaagagtcactataccgctggatgcaacattcaataaaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttc 15334096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 16042537 - 16042831
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
16042537 gggatcattcttggacatgatatcacacaatgatcagtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcatttgagcctcatcccaaattatcaactttgca 16042636  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16042637 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcatta--ctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcacggttcttc 16042734  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccatgtaat 299  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  | ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
16042735 cacctggtaatagaagagcggctataccgttggatgcagtattcaatacaattaacccattcgatctaacagcagccgacaatgttttccatataat 16042831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6310701 - 6310410
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
6310701 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 6310602  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
6310601 gcatgcatcaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgataacgcctcattaatctcaaaagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttc 6310502  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||    
6310501 cacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaatcttttccat 6310410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36207724 - 36208018
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
36207724 taagggatcattcttggacatggtatcacacattgatcagtcaactgcctcaaaacaccattagtgcatgattggagcctcatcccaaattatcaacgtt 36207823  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||    
36207824 gcagcacgcaccaggtctaccctaggactattcttttccatcgtaagcgatgatgcctcgttaatcttaatagggactgtcggcgtcgagtgcatgattc 36207923  T
201 ttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
36207924 ttccacctggtaatagaaaagccgttatactgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatgttttccat 36208018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 2329678 - 2329969
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||    
2329678 gggatcattcttggacatgatatcacacattgatcggtaaactttctcaaaacaccattggtgcatcattggagactcataaaaaattatcaactttgca 2329777  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
2329778 gcacacaccaggtctgccctaggactgtccttttccatagtaagcgatgatgcctccttaatctcaatagggactgccagtttcgagtgtgcggttcttc 2329877  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| | |||||| ||| | ||   |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||||||||    
2329878 cacctggtaatagaagagtctctataccgctagatgcaacattcaatacaattaaccctttcgatctaatagcagttgacaatgttttccat 2329969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 52501089 - 52501305
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
52501089 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggccaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 52501188  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
52501189 gcacgcatcaggtcttccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 52501287  T
204 c-actggtaatagaagag 220  Q
    |  |||||||||||||||    
52501288 ctcctggtaatagaagag 52501305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37389862 - 37389633
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
37389862 taagggatcattcttggccatgatatcacgcaatgattggtcaactgcctcaaaacaccatcattgtatcattggagtctcatcccaaattatcaacttt 37389763  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
37389762 gcagcacgcaccaggtctgccctgggactatccttttccattgtaagcgatgacacctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcgattc 37389663  T
201 ttcca-ctggtaatagaagagccgctatac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
37389662 ttccacctggtaatagaagagccgctatac 37389633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2452827 - 2452690
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
2452827 taaggggtcattcttggacatgatatcacacattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaacatt 2452728  T
101 acagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatcctttt 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
2452727 acagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcctttt 2452690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48775045 - 48774920
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
48775045 taagggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcttcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcacaaattatcaacttt 48774946  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctagg 126  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
48774945 gaagcacgcaccaggtctgccctagg 48774920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48774923 - 48774799
Alignment:
171 tagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccac-tggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatct 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||  || |||||    
48774923 tagggactgtttgcgtcgagtgcacggttcttccacctggtaatagaagagttgctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaacctcttcgatct 48774824  T
270 aacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||    
48774823 aacaacaactaacaatgttttccat 48774799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Original strand, 32457 - 32735
Alignment:
17 gacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
32457 gacatgatatcacgcaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggt 32556  T
117 ctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatag 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
32557 ctgccctaagactatccttttccattgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggtctatcagcgtcgagtacacggttcttccacctggtaatag 32656  T
216 aagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||    
32657 aagagccgttatactgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaatagcagccgacaatgttttccat 32735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 260 - 554
Alignment:
1 taagggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaacttt 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
260 taagggatcattcttgaacatgatatcacgtaatgatcggtcaactacctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcaccccaaattatcaacttt 359  T
101 acagcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttc 200  Q
     ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
360 gcagcatgcattaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgtgcggttc 459  T
201 ttcca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
460 ttccacctggtaatagaagagccgttataccgtttgatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagacgacaatattttccat 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28426 - 28139
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
28426 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgca 28327  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
28326 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 28228  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
28227 cttctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttc 28139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 42487 - 42770
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
42487 gggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 42586  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
42587 gcacgcaccaagtatgccctaagactatccttttccatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcggttcttc 42686  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatg 286  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| | |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
42687 cacctggtaatagaagagccgttataccgctggatgcagcattcattacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 42770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 183323 - 183614
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||    
183323 gggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggtacatcattggagcctaatcccaaattattaactttgca 183422  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
183423 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactggtagcgtcgagtgcgcggttcttc 183522  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttccat 294  Q
    || ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |  ||||||||||||||    
183523 cacctggtaatagaagagtcgctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaactaacaatgttttccat 183614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1812
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
1529 gggatcattattggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcatttgagcctcaaccaaaattattaactttgca 1628  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
1629 gcacgcaccaggtctgccctaggactatcctttttcattttaagcgatgatgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcccggttcttc 1728  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatg 286  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    
1729 gacctggtaatagaagagccgttataccgctggatgtagcattcaatacaattagcccattcgatctaacaacaaccgacaatg 1812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4967 - 4680
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
4967 gggatcattcttggacatgatatcatgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggatcctcatcccaaattatcaactttgca 4868  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
4867 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttctatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagggtcgagtgtgcggttcttc 4769  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| | |||||| ||  |  || | ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
4768 ctcctggtaatagaagagtcactataccgccagaagaagtattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatgttttc 4680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13984 - 13699
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
13984 gggatcattcttggacatgatatcactcattgatctgtcaactgcctcaaaacaccattagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcatctttgca 13885  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
13884 gcacgcaccaggtctgccctaagactatccttttccatcgtaagcaatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagtgtcgagtgtgcgattcttc 13786  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttt 289  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||  |||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
13785 cacctggtaatagaagagtcactataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatgttt 13699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 19517 - 19804
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
19517 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 19616  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
19617 gcacgcaccaggtctgacctaagactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggaatgtcaaagtcgagtgtgcggttcttc 19715  T
204 c-actggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    |  ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||  ||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
19716 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcagtacaattaaccccttcgatctaactacagccgacaatgttttc 19804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 187066 - 187351
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
187066 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgttcaactacctcaaaacaccatgagtgcatcattggagcctcatctcaaattatcaactttgca 187165  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
187166 gcacgcaccagg--tgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcgtca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcagttcttc 187262  T
204 ca-ctggtaatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    || ||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
187263 cacctggtaatagaagagtcattataccgctggatgcatcattcaatacaattaacctcttcgatctaacaacagccgacaatgttttc 187351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 5
Alignment:
20 atgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttacagcacgcaccaggtctg 119  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
259 atgatatcacgcaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccattagtgcatcattggagccttaacccaaattatcaactttgcagcacgcacctggtctg 160  T
120 ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcca-ctggtaatagaag 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
159 ccctaagactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcgttaatttcaatagagactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaag 60  T
219 agccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaaca 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||| || |||||||||    
59 agccgctataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17584 - 17382
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
17584 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaactattaactttgca 17485  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17484 gcacgcaccagttcttccctaggactatccttttccattgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 17385  T
204 cac 206  Q
    |||    
17384 cac 17382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 321043 - 320824
Alignment:
4 gggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatccaaaattatcaactttaca 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
321043 gggatcattcttggacatgatatcacccattgatcgatcaaatgcctcaaaacaccatcgatgtatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 320944  T
104 gcacgcaccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
320943 gcacgcaccaggtcttccctaggactatccttttctatcacaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcaacgtcgagtgtggggttcttc 320844  T
204 ca-ctggtaatagaagagcc 222  Q
    || ||||||| |||||||||    
320843 cacctggtaaaagaagagcc 320824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 319314 - 319135
Alignment:
111 ccaggtctgccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccac-tgg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||    
319314 ccaggtctgccctaagactatc-ttttccatcgtaagcaatgatgactcat-aatctcaatagggactgtcagcgtcaagtgtgcagttcttccacctgg 319217  T
210 taatagaagagccgctatactgctggttgatgcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacacccgacaatgttttc 291  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
319216 taatagaagagtcactataccgctggatgcagcattcaatacaattaacccctttgatctaacaacagccgaaaatgttttc 319135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University