View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9288A_low_185 (Length: 293)

Name: NF9288A_low_185
Description: NF9288A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9288A_low_185
NF9288A_low_185
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (7-282)||(43929-44204)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (7-282)||(25956766-25957041)
chr6 (7-276)||(27850884-27851144)
chr6 (12-293)||(18708469-18708732)
chr6 (12-162)||(19399692-19399842)
chr6 (12-291)||(20734215-20734477)
chr6 (104-293)||(17318969-17319153)
chr6 (12-144)||(31630677-31630809)
chr6 (12-218)||(23151086-23151279)
chr6 (14-181)||(28708550-28708704)
chr6 (132-237)||(27323545-27323649)
chr6 (12-97)||(18927823-18927908)
chr6 (12-137)||(34297037-34297161)
chr6 (210-293)||(19444250-19444329)
chr6 (135-232)||(31733740-31733836)
chr6 (210-293)||(16133640-16133719)
chr6 (12-77)||(27322238-27322303)
chr6 (209-293)||(23017094-23017173)
chr6 (106-189)||(31733829-31733911)
chr6 (139-237)||(20136594-20136691)
chr6 (139-237)||(22196178-22196275)
chr6 (258-293)||(27326767-27326802)
chr6 (258-293)||(27387507-27387542)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (12-282)||(15099050-15099319)
chr4 (12-282)||(361956-362217)
chr4 (12-293)||(19609293-19609556)
chr4 (12-293)||(35812257-35812520)
chr4 (136-282)||(19857283-19857429)
chr4 (12-189)||(630914-631091)
chr4 (7-138)||(13844384-13844515)
chr4 (12-189)||(15868849-15869026)
chr4 (135-276)||(15869019-15869163)
chr4 (12-293)||(33185921-33186186)
chr4 (136-293)||(15042058-15042211)
chr4 (136-293)||(15112213-15112366)
chr4 (182-293)||(46642581-46642691)
chr4 (12-138)||(46642679-46642805)
chr4 (12-151)||(32851218-32851357)
chr4 (193-282)||(13844304-13844393)
chr4 (137-274)||(32851052-32851192)
chr4 (127-237)||(10357362-10357471)
chr4 (202-293)||(3484990-3485077)
chr4 (106-212)||(10357285-10357391)
chr4 (174-276)||(3514880-3514985)
chr4 (84-162)||(14185123-14185201)
chr4 (12-97)||(9923296-9923381)
chr4 (12-90)||(11479478-11479556)
chr4 (12-74)||(52873307-52873369)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (12-282)||(38550141-38550411)
chr8 (12-282)||(20982775-20983045)
chr8 (12-282)||(27472446-27472708)
chr8 (80-281)||(39833687-39833887)
chr8 (24-237)||(6102530-6102738)
chr8 (12-293)||(39936830-39937093)
chr8 (12-150)||(18760481-18760619)
chr8 (12-293)||(21579974-21580240)
chr8 (148-282)||(13428328-13428462)
chr8 (106-293)||(24713190-24713371)
chr8 (12-137)||(1327175-1327300)
chr8 (153-282)||(1323366-1323495)
chr8 (18-272)||(41680896-41681133)
chr8 (12-235)||(29763636-29763846)
chr8 (12-137)||(42560295-42560419)
chr8 (26-202)||(21415244-21415421)
chr8 (193-293)||(19127979-19128073)
chr8 (38-150)||(19128061-19128160)
chr8 (193-293)||(18760399-18760493)
chr8 (139-237)||(2418971-2419066)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (12-282)||(9389847-9390116)
chr7 (12-282)||(17232330-17232592)
chr7 (12-282)||(37727695-37727957)
chr7 (42-282)||(6170283-6170522)
chr7 (12-282)||(45847790-45848043)
chr7 (12-250)||(14270194-14270427)
chr7 (12-250)||(8468177-8468398)
chr7 (15-293)||(8851988-8852248)
chr7 (7-293)||(36686013-36686283)
chr7 (12-293)||(11066437-11066700)
chr7 (12-293)||(30821024-30821289)
chr7 (12-293)||(38480056-38480321)
chr7 (12-237)||(12371299-12371510)
chr7 (12-293)||(32434410-32434672)
chr7 (40-293)||(59239-59475)
chr7 (12-237)||(12127984-12128195)
chr7 (12-135)||(18302016-18302139)
chr7 (118-293)||(13150458-13150619)
chr7 (140-293)||(46386997-46387145)
chr7 (140-293)||(48811870-48812018)
chr7 (12-137)||(15213659-15213783)
chr7 (14-181)||(11391948-11392102)
chr7 (12-97)||(13148292-13148377)
chr7 (193-293)||(18875861-18875955)
chr7 (202-293)||(20619254-20619340)
chr7 (140-237)||(18075463-18075559)
chr7 (136-233)||(14183560-14183653)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (12-282)||(1465561-1465830)
chr3 (12-276)||(18439997-18440261)
chr3 (12-282)||(49389820-49390090)
chr3 (12-282)||(20630247-20630509)
chr3 (12-293)||(12269268-12269541)
chr3 (12-293)||(40806965-40807228)
chr3 (12-293)||(22307403-22307666)
chr3 (12-162)||(49970020-49970170)
chr3 (12-293)||(30175334-30175597)
chr3 (12-293)||(17538076-17538339)
chr3 (12-293)||(31224722-31224987)
chr3 (38-293)||(15447791-15448030)
chr3 (12-229)||(14500888-14501105)
chr3 (12-291)||(31415230-31415488)
chr3 (106-293)||(41173220-41173402)
chr3 (127-293)||(17519827-17519988)
chr3 (127-293)||(17534689-17534850)
chr3 (106-293)||(5214887-5215068)
chr3 (121-288)||(13516368-13516529)
chr3 (140-293)||(40811780-40811928)
chr3 (106-293)||(5206503-5206686)
chr3 (18-134)||(12852515-12852631)
chr3 (12-184)||(45796978-45797149)
chr3 (135-274)||(23413557-23413699)
chr3 (135-274)||(45796838-45796980)
chr3 (14-181)||(5841857-5842011)
chr3 (106-293)||(14507873-14508054)
chr3 (121-291)||(15932371-15932535)
chr3 (206-293)||(13026636-13026719)
chr3 (121-231)||(17693155-17693264)
chr3 (201-276)||(19485261-19485335)
chr3 (206-293)||(13031725-13031808)
chr3 (12-126)||(23413389-23413502)
chr3 (12-137)||(11912881-11913005)
chr3 (210-293)||(17548519-17548598)
chr3 (210-293)||(17044065-17044143)
chr3 (12-89)||(40811993-40812070)
chr3 (12-61)||(1989000-1989049)
chr3 (140-194)||(17519784-17519838)
chr3 (140-194)||(17534646-17534700)
chr3 (129-186)||(52466418-52466475)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (12-282)||(2746-3016)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (12-282)||(28194599-28194869)
chr1 (12-282)||(46382705-46382975)
chr1 (12-282)||(35981838-35982099)
chr1 (7-282)||(43697075-43697349)
chr1 (12-282)||(43542819-43543081)
chr1 (80-282)||(41305814-41306007)
chr1 (12-293)||(48300832-48301095)
chr1 (12-138)||(20636694-20636819)
chr1 (12-293)||(51274356-51274621)
chr1 (121-293)||(20587699-20587866)
chr1 (121-293)||(20592237-20592404)
chr1 (183-282)||(20636606-20636705)
chr1 (139-293)||(20634508-20634657)
chr1 (193-293)||(35088486-35088580)
chr1 (210-293)||(13528762-13528841)
chr1 (202-293)||(14238498-14238585)
chr1 (133-237)||(41227622-41227725)
chr1 (12-97)||(41227524-41227609)
chr1 (99-201)||(11809380-11809482)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (12-243)||(2442-2672)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (12-293)||(6576182-6576458)
chr2 (12-293)||(24781660-24781923)
chr2 (12-293)||(5032144-5032407)
chr2 (113-286)||(22689656-22689824)
chr2 (113-286)||(22694252-22694420)
chr2 (12-293)||(24436022-24436275)
chr2 (12-293)||(24883431-24883685)
chr2 (127-293)||(9974894-9975055)
chr2 (12-237)||(22500860-22501073)
chr2 (12-237)||(22508794-22509007)
chr2 (12-237)||(24865538-24865751)
chr2 (206-293)||(26896279-26896362)
chr2 (179-293)||(7672421-7672530)
chr2 (53-189)||(21367914-21368050)
chr2 (210-293)||(6478254-6478333)
chr2 (140-237)||(20915126-20915222)
chr2 (222-293)||(356984-357051)
chr2 (240-293)||(24865791-24865844)
chr2 (121-212)||(9975026-9975116)
chr2 (240-293)||(19202169-19202222)
chr2 (256-293)||(20913058-20913095)
chr2 (240-293)||(23969686-23969739)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (12-240)||(84991-85219)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (20-282)||(21741691-21741961)
chr5 (7-282)||(5889320-5889579)
chr5 (12-250)||(29915223-29915453)
chr5 (12-293)||(12122289-12122554)
chr5 (12-293)||(21557813-21558078)
chr5 (15-293)||(21555150-21555413)
chr5 (12-293)||(17875033-17875298)
chr5 (38-293)||(31454897-31455135)
chr5 (38-293)||(31455510-31455748)
chr5 (12-137)||(36460130-36460254)
chr5 (193-293)||(19920684-19920778)
chr5 (12-196)||(30615667-30615840)
chr5 (12-72)||(21871711-21871771)
chr5 (12-72)||(21875991-21876051)
chr5 (99-237)||(25250739-25250875)
chr5 (99-237)||(25314524-25314660)
chr5 (259-293)||(21309038-21309072)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (92-282)||(106266-106456)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (109-282)||(46923-47095)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (12-201)||(362787-362976)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (12-293)||(9122-9385)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (12-293)||(14159-14424)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (106-293)||(145756-145938)
[»] scaffold1792 (2 HSPs)
scaffold1792 (135-276)||(103-243)
scaffold1792 (12-189)||(236-412)
[»] scaffold0230 (3 HSPs)
scaffold0230 (135-276)||(23657-23797)
scaffold0230 (12-189)||(23488-23664)
scaffold0230 (179-276)||(20770-20867)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-293)||(10046-10309)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (12-293)||(59373-59636)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (12-293)||(1385-1650)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (12-293)||(9578-9841)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (12-293)||(76720-76974)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (106-293)||(57769-57951)
[»] scaffold0737 (4 HSPs)
scaffold0737 (12-293)||(6446-6710)
scaffold0737 (106-212)||(5562-5667)
scaffold0737 (128-194)||(5639-5705)
scaffold0737 (131-194)||(5751-5814)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (12-134)||(24794-24916)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (131-284)||(19320-19469)
scaffold0061 (12-113)||(15495-15595)
scaffold0061 (12-113)||(24553-24653)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (12-293)||(2894-3148)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (12-126)||(8434-8548)
scaffold0075 (135-274)||(8605-8747)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (12-184)||(8206-8365)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (135-274)||(13233-13375)
scaffold0235 (12-184)||(13373-13545)
scaffold0235 (135-222)||(24989-25076)
scaffold0235 (78-184)||(25074-25180)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (137-291)||(2768-2917)
scaffold0507 (256-291)||(2951-2986)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (145-274)||(34820-34952)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (18-134)||(7795-7911)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (14-181)||(2499-2653)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (174-276)||(4567-4672)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (12-237)||(10766-10979)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (202-293)||(33429-33516)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (202-293)||(287-374)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (26-202)||(1780-1957)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (202-293)||(10874-10961)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (202-293)||(863-950)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (12-137)||(157-281)
scaffold0599 (12-137)||(4575-4699)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (210-290)||(605-681)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (193-293)||(78299-78393)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (12-97)||(5524-5609)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (58-293)||(95300-95531)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (12-85)||(11019-11092)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (16-97)||(6831-6912)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (12-89)||(812-889)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (106-214)||(263-368)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (210-290)||(41193-41269)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (135-274)||(74522-74656)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (12-117)||(463-568)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (202-293)||(78055-78141)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (136-189)||(7585-7638)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (12-82)||(18476-18546)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (12-61)||(36198-36247)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 43929 - 44204
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43929 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctgatgtgatgtattaata 44028  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44029 tcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 44128  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44129 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 44204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 25956766 - 25957041
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25956766 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatgatgttgccttgctgatgtgatgtattaata 25956865  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25956866 tcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 25956965  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25956966 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 25957041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27851144 - 27850884
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27851144 ctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttgacttgctgcaaattatttgatggtgttgccttactgatgtgatgtattaata 27851045  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27851044 tcattaagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttggtccaaattattggagtcatacgagatgtctaagttgttaagttgttaaga 27850954  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  27850953 tgttgagtcaattgcatactcgtttacattgggtgagggcttgatgctctataatgtatatttgtacata 27850884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18708732 - 18708469
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  18708732 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgtttatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctgtcgtgat-------------t 18708646  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  18708645 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 18708547  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18708546 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtacatttatacatattatgttgagggcttga 18708469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19399842 - 19399692
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19399842 atgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggttctgccttgcttttgtgatgtattattatcatt 19399743  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19399742 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaa 19399692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 20734215 - 20734477
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20734215 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 20734314  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  20734315 aagatg----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaag-tcataagatgttg 20734401  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734402 agtccattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 20734477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 293
Target Start/End: Original strand, 17318969 - 17319153
Alignment:
Q  104 atatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgtt 202  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  17318969 atatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-t 17319067  T
Q  203 aagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17319068 aagacgttgagtcca-tgtatactcatttaagt----tgagggcttgatgcaatgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttga 17319153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 31630677 - 31630809
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  31630677 atgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgttgatgtgatgtattaatatcatt 31630776  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagtt 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31630777 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagtt 31630809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 23151086 - 23151279
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||             |    
T  23151086 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctatcgtgat-------------t 23151172  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||| |||    
T  23151173 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttatgttg-taagacgtt 23151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28708704 - 28708550
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||             ||     
T  28708704 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtgat-------------tag 28708618  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  28708617 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 28708550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Original strand, 27323545 - 27323649
Alignment:
Q  132 agttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27323545 agttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggcgtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtcca-tgcatactcatt 27323642  T
Q  231 taagttg 237  Q
    |||||||    
T  27323643 taagttg 27323649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18927908 - 18927823
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18927908 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 18927823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 34297037 - 34297161
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  34297037 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgtttccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 34297136  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34297137 aagat-ctaatgttgggataagttgt 34297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 19444250 - 19444329
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19444250 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 19444329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31733836 - 31733740
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcattta 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31733836 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcattta 31733740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 16133640 - 16133719
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16133640 tgagttcattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 16133719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 27322238 - 27322303
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatgg 77  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27322238 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgg 27322303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Original strand, 23017094 - 23017173
Alignment:
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23017094 ttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 23017173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31733911 - 31733829
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  31733911 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtttaag 31733829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20136691 - 20136594
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20136691 taagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgt-aagatgttgagtccat-gcatactcatttaagttg 20136594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22196178 - 22196275
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22196178 taagatgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgt-aagatgttgagtccat-gcatactcatttaagttg 22196275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 293
Target Start/End: Original strand, 27326767 - 27326802
Alignment:
Q  258 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27326767 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 27326802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 293
Target Start/End: Original strand, 27387507 - 27387542
Alignment:
Q  258 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27387507 taatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 27387542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15099319 - 15099050
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  15099319 atgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatactatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 15099220  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15099219 aagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattagagtcataagagctgtctaagttgttaagttgttaaaatgttg 15099121  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15099120 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 15099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 362217 - 361956
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  362217 atgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 362118  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  362117 aagatgctaatgttggt---------ttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatattg 362027  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  362026 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 361956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19609556 - 19609293
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  19609556 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgttacatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 19609470  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  19609469 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagctg-taagacgtt 19609371  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609370 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgaggacttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 19609293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 35812257 - 35812520
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||             |    
T  35812257 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatgatgttgtcttgctgttgtgat-------------t 35812343  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  35812344 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgaaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 35812442  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    || |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35812443 gactcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatatatatttatacatatcatgttgagggcttga 35812520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19857429 - 19857283
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19857429 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtagttaagatgttgaggccattgcatactcatttacgt 19857330  T
Q  236 tgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857329 tgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 19857283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 630914 - 631091
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  630914 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgacttgctgcaaattatttgattttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 631013  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | || |||| || || |||||||| ||||||| ||||    
T  631014 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatatcgacccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 631091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13844515 - 13844384
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13844515 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattattgttgatgatgacttgctataaattatttgatggtgttgccttgttgatgtgatgtattaata 13844416  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  13844415 tcattaagatgttaatattggtttaagttgtt 13844384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 15868849 - 15869026
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15868849 atgaagttgtaatgattatatctgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 15868948  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| |||  |||| || || |||||||| ||||||| ||||    
T  15868949 aagatgctaatgttggtttaagtcgcttgagttataagatgttggcccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 15869026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Original strand, 15869019 - 15869163
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-ttaa 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15869019 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatactcataatac 15869118  T
Q  234 gt--tgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15869119 gtgatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacata 15869163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33186186 - 33185921
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |  || |||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  33186186 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccatt 33186087  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |  ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  33186086 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaatcattggtatcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttg 33185999  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33185998 agtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgtcctgtaatgtatatttatacatattatattgaaggcttga 33185921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 293
Target Start/End: Original strand, 15042058 - 15042211
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt--aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15042058 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaa 15042155  T
Q  234 gttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15042156 gttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 15042211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15112366 - 15112213
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt--aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15112366 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaa 15112269  T
Q  234 gttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15112268 gttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 15112213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46642691 - 46642581
Alignment:
Q  182 tgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatg 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46642691 tgtctaagttgttaagttgttaagatgttgaatc-attgcatactcatttaagttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatg 46642593  T
Q  282 ttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||    
T  46642592 ttgagggcttga 46642581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46642805 - 46642679
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  46642805 atgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacgtgctgcatattagttaatagtgttgccttgccgtcgtggtgtattaatatcatt 46642706  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46642705 aaggtgctaatgtttgtctaagttgtt 46642679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32851357 - 32851218
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32851357 atgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctgatgtgatatattaatatcatt 32851258  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  32851257 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagat 32851218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13844393 - 13844304
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13844393 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 13844304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32851192 - 32851052
Alignment:
Q  137 tttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---atttaa 233  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||   || | |    
T  32851192 tttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaggttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatatga 32851093  T
Q  234 gttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
    | |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32851092 gatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 32851052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Original strand, 10357362 - 10357471
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10357362 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtcca-tgcatac 10357459  T
Q  226 tcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||    
T  10357460 tcatttaagttg 10357471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3485077 - 3484990
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485077 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 3484990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 10357285 - 10357391
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  10357285 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taa 10357383  T
Q  205 gatgttga 212  Q
    ||||||||    
T  10357384 gatgttga 10357391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3514985 - 3514880
Alignment:
Q  174 ataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatattta 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  3514985 ataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcataatacgagatgggagagggcttgatgatctgtaatgtatattta 3514886  T
Q  271 tacata 276  Q
    ||||||    
T  3514885 tacata 3514880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14185201 - 14185123
Alignment:
Q  84 cttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaa 162  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14185201 cttgttgttgtgacgtattaatatcattaaggtgctaatgttggtctaagttgcttaagttgtaagatgttgatccaaa 14185123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9923381 - 9923296
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9923381 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 9923296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Original strand, 11479478 - 11479556
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctg 90  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11479478 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattacttaatggcgctgccttgctg 11479556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 52873307 - 52873369
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  52873307 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttaa 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 38550141 - 38550411
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38550141 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgctgatgtgatgtattaatatcatt 38550240  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38550241 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 38550340  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38550341 agtccattgcatacttatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 38550411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 20982775 - 20983045
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982775 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 20982874  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20982875 aagatgttaatgtttgtttaaattgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 20982974  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20982975 agtccattgcatactcatttacgttgggtgaaagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 20983045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 27472446 - 27472708
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27472446 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 27472545  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  27472546 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgttg 27472637  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27472638 agtctattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatatatatttatacataatatgt 27472708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39833887 - 39833687
Alignment:
Q  80 ttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataaga 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  39833887 ttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatgaagat-ctaatgttgatctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataaga 39833789  T
Q  180 gatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatatta 279  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39833788 gatgtctaagttgttgagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgatggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataata 39833689  T
Q  280 tg 281  Q
    ||    
T  39833688 tg 39833687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 6102530 - 6102738
Alignment:
Q  24 tggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatg 123  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102530 tggttatatttgatgattgttgttgatgttgacttgctccatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatg 6102629  T
Q  124 ttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    || | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6102630 ttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatg----agttcttaagtcg-taagatgttgagtccattgcat 6102724  T
Q  224 actcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  6102725 actcatttaagttg 6102738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 39936830 - 39937093
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||             |    
T  39936830 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctatcgtgat-------------t 39936916  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  39936917 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgtt 39937015  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39937016 gagtcca-tgcatacttatttaagt----tgagggcttgatgccctctaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 39937093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18760619 - 18760481
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18760619 atgaagttataatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctattgtgatgtattaatatcatt 18760520  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaaga 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18760519 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaaga 18760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 21579974 - 21580240
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21579974 atgaagttgtaattgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 21580073  T
Q  112 -aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgtt 210  Q
     ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21580074 taagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgtt 21580161  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21580162 gagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 21580240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Original strand, 13428328 - 13428462
Alignment:
Q  148 agatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggct 247  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  13428328 agatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattacatactcatttacgttgggtgagggtt 13428427  T
Q  248 tgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13428428 tgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 13428462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24713371 - 24713190
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24713371 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtctaagctgtttaagttgt-aa 24713274  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713273 gacgttgagtccct-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 24713190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 1327175 - 1327300
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1327175 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 1327274  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1327275 aagatgctaatgttggtttaagttgt 1327300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Original strand, 1323366 - 1323495
Alignment:
Q  153 ttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacg 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |    
T  1323366 ttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttaagtacattgcatattcatttacgtcgggtgagggcttgatg 1323465  T
Q  253 ctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1323466 ctctgtaatgtatatttatacataatatgt 1323495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 41680896 - 41681133
Alignment:
Q  18 ttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatg 117  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || ||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41680896 ttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatg 41680995  T
Q  118 ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtcca 217  Q
              || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  41680996 ----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcg-taagatgttgagtcca 41681082  T
Q  218 ttgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttata 272  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41681083 ttgcatactcatttaagt----cgagggcttgatgccctgtaatgtatatttata 41681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 29763636 - 29763846
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||  || |||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29763636 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 29763734  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  29763735 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtttaagttgttaagtcgt-aagatgttg 29763822  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29763823 agtccattgcatactcatttaagt 29763846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 42560295 - 42560419
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  42560295 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttaccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 42560394  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42560395 aagat-ctaatgttggtataagttgt 42560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Original strand, 21415244 - 21415421
Alignment:
Q  26 gttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaag-atgctaatgt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||    
T  21415244 gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattatatgatgttgccttgctgttgtgaagtaataatgtcattaagaattctaa-gt 21415342  T
Q  125 tggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcat-aagagatgtctaagctgttaagttgtt 202  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  21415343 tggtcaaagtcgttcaagtcgtaagatgttgatccaagttattggagtcataaagagatgtctaagtcgttaagatgtt 21415421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19128073 - 19127979
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128073 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 19127980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19128160 - 19128061
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||             |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19128160 gattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcctg-------------attaggatgctaatgttggtctaagttgt 19128074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18760493 - 18760399
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18760493 ttaagttgt-aagacgttgagtccata-catactcatttaagttg----agggcttgatgtcctgtaatgtatatttatacatgttatgttgggggcttg 18760400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 2418971 - 2419066
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||   | ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  2418971 taagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcat---atatgtctacgttgtttaagttg-taagatgttgagtctcatgcatactcattcaagttg 2419066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 9389847 - 9390116
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  9389847 atgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 9389946  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  9389947 aagat-ctaatgtgggtctaagttgtttaagttgtaaaatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagctgttaagatattg 9390045  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9390046 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 9390116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17232592 - 17232330
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17232592 atgaagttggaatggttgtattagatgattattgttgctgttgacttgctgtatattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 17232493  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  17232492 aagatgctaatgttggtttgagttgtttaagttgtaaggtgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgttg 17232401  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17232400 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctatgtaatgtatatttatacataatatgt 17232330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 37727695 - 37727957
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37727695 atgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 37727794  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||    
T  37727795 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcatatgagatgtc--------taagttgttaagatgttg 37727886  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37727887 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 37727957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 6170283 - 6170522
Alignment:
Q  42 attgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaa 141  Q
    ||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6170283 attgttgatgatgacctactgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagttgctaatgttggt-taagttgtttaa 6170381  T
Q  142 gttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtg 241  Q
    ||| || ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6170382 gttatatgatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtg 6170481  T
Q  242 agggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  6170482 agggcttgatgctctataatgtatatttatacataatatgt 6170522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 45847790 - 45848043
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45847790 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 45847889  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||    
T  45847890 aagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgctg 45847972  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45847973 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 45848043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 14270194 - 14270427
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14270194 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 14270293  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaag----ttgttaagat 207  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||    
T  14270294 aagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtcaattgttaagat 14270384  T
Q  208 gttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14270385 gttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttga 14270427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8468398 - 8468177
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8468398 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttaatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 8468299  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  8468298 aagatgctaatgttg---------gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgttg 8468216  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttga 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8468215 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttga 8468177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 8851988 - 8852248
Alignment:
Q  15 aagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaag 114  Q
    |||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||             || |    
T  8851988 aagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttactgcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat-------------tagg 8852074  T
Q  115 atgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  |||||    
T  8852075 atgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacattgag 8852173  T
Q  214 tccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8852174 tcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattattttgagggcttga 8852248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Original strand, 36686013 - 36686283
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36686013 ctgatatgaagttttaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaata 36686112  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
     ||||||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  36686113 ccattaagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taaga 36686200  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36686201 tgttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 36686283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11066700 - 11066437
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  11066700 atgaagttgtaatagttatattggatgatcattgttgttgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 11066614  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  11066613 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 11066515  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11066514 gagtcca-tgcatactcttttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 11066437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 30821024 - 30821289
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||  || |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  30821024 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccatt 30821123  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  30821124 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 30821211  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30821212 agtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgtcatgtaatgtatatttttacatattatgttgagggcttga 30821289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38480321 - 38480056
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38480321 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 38480222  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||           ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  38480221 aagata----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgtag 38480134  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||    |||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38480133 agtctattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccatgtaatatatatttatacatattatgttgggggcttga 38480056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12371510 - 12371299
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |    
T  12371510 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat-------------t 12371424  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||    
T  12371423 aggatgctaatgttagtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacatt 12371325  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12371324 gagtcca-tgcatactcattcaagttg 12371299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 32434410 - 32434672
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  32434410 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgctgatgttgactt-ctggattttatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 32434495  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  32434496 agaatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 32434594  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    | ||| ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32434595 gagtcca-tgcatactcatttaagt----ttaggtcttgatgttctttaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 32434672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 59239 - 59475
Alignment:
Q  40 ttattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgttt 139  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||       ||  |||     |||||||||||||||||||||||    
T  59239 ttattgttgatgttgacttgctccatattatttaatgttgttgccttgctgtcgtaat-------taggatt-----gctaatgttggtctaagttgttt 59326  T
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||       
T  59327 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatgctcatttaagt--- 59421  T
Q  239 gtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
     ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  59422 -tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgtgggattga 59475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 12127984 - 12128195
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  12127984 atgaagttgtaatggatatattggacgattattgttgatgttgacttactgcatattagttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 12128070  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  12128071 aggatgctaatgttggtcgaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 12128169  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12128170 gagtcca-tgcatactcatttaagttg 12128195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18302139 - 18302016
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18302139 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttggcttgttgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 18302040  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagtt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18302039 aagatgctaatgttggtttaagtt 18302016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 293
Target Start/End: Original strand, 13150458 - 13150619
Alignment:
Q  118 ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtcca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||         |||| ||||||||||    
T  13150458 ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatctaaattatttgagtcatatgagatttctaagttgt---------aagacgttgagtcca 13150548  T
Q  218 ttgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    | ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150549 t-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 13150619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Original strand, 46386997 - 46387145
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  46386997 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg- 46387093  T
Q  239 gtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
       ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46387094 ---agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 46387145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48812018 - 48811870
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttggg 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  48812018 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagtccattgcatactcatttaagt---- 48811924  T
Q  240 tgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| | |||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48811923 tgagagtttgatgccctgtaatgtatatttataaatatcatgttgagggcttga 48811870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15213783 - 15213659
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  15213783 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 15213684  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15213683 aagat-ctaatgttggtataagttgt 15213659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 11391948 - 11392102
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||             ||     
T  11391948 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgctgttttgctgtcgtgat-------------tag 11392034  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11392035 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 11392102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 13148292 - 13148377
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13148292 atgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 13148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Original strand, 18875861 - 18875955
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875861 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 18875954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20619340 - 20619254
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20619340 taagacgttgagtccat-gcatactcattcaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 20619254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 18075463 - 18075559
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18075463 aagttgtaagatgttgattcaaattatttgagtcatataagatatctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaagttg 18075559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 14183560 - 14183653
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaa 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||  |   |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14183560 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctttg--tttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaa 14183653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 1465561 - 1465830
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||     
T  1465561 atgaagtcgtaatggttggatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgtggttgtggcgtattaatatcatg 1465660  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1465661 aagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 1465759  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1465760 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttaaacataatatgt 1465830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Original strand, 18439997 - 18440261
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  18439997 atgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacctgctgtaaattatttgatggtgttgtcttgctgaggtgatgtattaatatcatt 18440096  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagag-atgtctaagctgttaagttgttaagatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18440097 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagaatgtctaagttgttaagttgttaagatgtt 18440196  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18440197 gagtccattgcatactcatttacgttgggtgaggg-ttgatgctctgtaatgtatatttatacata 18440261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 49389820 - 49390090
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49389820 atgaagttgtaattgttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtgttaatatcatt 49389919  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49389920 aagatgttaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 49390019  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49390020 agttcattgcatactcatttacgttgggtgacagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 49390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 20630247 - 20630509
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20630247 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 20630346  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||    
T  20630347 aagatgctaatgtttgtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttggtaagatgttg 20630438  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20630439 agtccattgcatactcatttacattaggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 20630509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12269541 - 12269268
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  12269541 atgaagttgtaatgattatatttgatgattattgttgatgttgacgtgctgcatattagttaatagtgttgccttgcagtcgtggtctattaatatcatt 12269442  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||    
T  12269441 aaggtgctaatgttagtataagttgtttaagttgtaaggtgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtc--------taagttgttaagatgttg 12269350  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12269349 agtccattgcatacttatttaagttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtacatttatacatattatgttgagggcttga 12269268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40807228 - 40806965
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  40807228 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 40807142  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  40807141 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 40807043  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807042 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 40806965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 22307403 - 22307666
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||                 
T  22307403 atgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgatg------------- 22307489  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  22307490 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 22307588  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307589 gagtcca-tgcatactcattcaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 22307666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 49970020 - 49970170
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49970020 atgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtactgccttgctgttgtgatgtattattatcatt 49970119  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49970120 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaa 49970170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 30175334 - 30175597
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |    
T  30175334 atgaagttgtaatggatatatgggatgattattgttgatgttgacttgcttcatattatttaatggtgttgccttgctgtcgtgat-------------t 30175420  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||    
T  30175421 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatttt 30175519  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30175520 gagtcca-tgcttactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatccatattatgttgagggcttga 30175597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17538339 - 17538076
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||| || || |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  17538339 atgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 17538253  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  17538252 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgaaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 17538154  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    || |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538153 gactcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 17538076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 31224722 - 31224987
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31224722 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 31224821  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    |||||| |          ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31224822 aagatgtt----------taagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 31224909  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224910 agtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 31224987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 293
Target Start/End: Original strand, 15447791 - 15448030
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||          ||||||||||    
T  15447791 gattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg----------tctaagttgt 15447880  T
Q  138 ttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447881 t-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 15447978  T
Q  238 ggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
        ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447979 ----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 15448030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14501105 - 14500888
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  14501105 atgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctaatgtgatatattaatatcatt 14501006  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  14501005 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtttttaggatgttg 14500906  T
Q  212 agtccattgcatactcat 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14500905 agtccattgcatattcat 14500888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31415488 - 31415230
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31415488 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 31415389  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31415388 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 31415301  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415300 agtccattgcatactcatt---------tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 31415230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Original strand, 41173220 - 41173402
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  41173220 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taa 41173318  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41173319 gacgttgagtcca-tgcatactcatttacgt----tgagggctagatgccatgtaatgtatatttatacacattatgttgagggcttga 41173402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 17519827 - 17519988
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  17519827 gtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 17519924  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519925 tcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 17519988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 17534689 - 17534850
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  17534689 gtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 17534786  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534787 tcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 17534850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5215068 - 5214887
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5215068 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aa 5214971  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5214970 gtcgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 5214887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13516529 - 13516368
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattg 220  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13516529 atgttggtcaaagttgtc-aagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaagttgttaagtcgt-aagatgttgagtccattg 13516432  T
Q  221 catactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgaggg 288  Q
    |||||| ||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516431 catacttatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgaggg 13516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40811928 - 40811780
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgg 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40811928 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg- 40811832  T
Q  239 gtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
       ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811831 ---agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 40811780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Original strand, 5206503 - 5206686
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagtt-gtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgtta 203  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||||| |    
T  5206503 atcattaagttgcatatattggtctaagttgtttaaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttttttaagttgt-a 5206601  T
Q  204 agatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206602 agacgttaagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 5206686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 12852515 - 12852631
Alignment:
Q  18 ttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12852515 ttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg 12852614  T
Q  118 ctaatgttggtctaagt 134  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12852615 ctaatgttggtttaagt 12852631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45797149 - 45796978
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45797149 atgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgca-attatatgatgttgttgccttgctgatgtgatatattaatatcatt 45797051  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| || || |||||||| |||||||    
T  45797050 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatatgagatgt 45796978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Original strand, 23413557 - 23413699
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||   || |    
T  23413557 tgtttaagttgtatgatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgctaggatgttgagtccattgcatattcataatct 23413656  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23413657 gagatgggggagggcttgatgctctataatgtatatttataca 23413699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45796980 - 45796838
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||   || |    
T  45796980 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgtttagttgttaggatgttaagtccattgcatattcataatct 45796881  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45796880 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 45796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5842011 - 5841857
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||             ||||     
T  5842011 gaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtg-------------attag 5841925  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  5841924 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 5841857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14508054 - 14507873
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||  |||| | |||| |||| ||||||| ||    
T  14508054 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgaatcaaattattggagtcatataagatatttaagttgtttaagttgt-aa 14507957  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507956 gacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 14507873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 291
Target Start/End: Original strand, 15932371 - 15932535
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| | ||||||| || |    
T  15932371 atgttggtc-aagttgtttaaattgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtttaagttgtttaagttg-taacacgttgagt-caat 15932467  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15932468 gcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatattgagggctt 15932535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Original strand, 13026636 - 13026719
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026636 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 13026719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17693264 - 17693155
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17693264 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttaatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagttgttgagtcca-t 17693167  T
Q  220 gcatactcattt 231  Q
    ||| ||||||||    
T  17693166 gcacactcattt 17693155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 276
Target Start/End: Original strand, 19485261 - 19485335
Alignment:
Q  201 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19485261 ttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgaggg-ttgatgctctgtaatgtatatttatacata 19485335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Original strand, 13031725 - 13031808
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13031725 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatgttatgttgagggcttga 13031808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 23413389 - 23413502
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |  |||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23413389 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattactgttgacgttgacttgttgcgaattattga-tgttgttgtcttgctgatgtgatgtattaatatcatt 23413487  T
Q  112 aagatgctaatgttg 126  Q
    |||||||||||||||    
T  23413488 aagatgctaatgttg 23413502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11913005 - 11912881
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||     
T  11913005 atgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaatttcatg 11912906  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11912905 aagat-ctaatgttggtataagttgt 11912881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 17548519 - 17548598
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17548519 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatctatatttatacatattatgttgagggcttga 17548598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17044143 - 17044065
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044143 tgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 17044065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40812070 - 40811993
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgct 89  Q
    ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40812070 atgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgctttgct 40811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 1989000 - 1989049
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgct 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1989000 atgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgct 1989049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 17519784 - 17519838
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17519784 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtt 17519838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 17534646 - 17534700
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17534646 aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtt 17534700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 186
Target Start/End: Original strand, 52466418 - 52466475
Alignment:
Q  129 ctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtct 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  52466418 ctaagctgttcaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtct 52466475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2746
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3016 atgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatatgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 2917  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2916 aagatgctaatgttggtttaagttttttaagttataagatgttggtctaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagtttttaagatgttg 2817  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2816 agtgcattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 28194599 - 28194869
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28194599 atgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgataacctgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgaggtgatgtattaatatcatt 28194698  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28194699 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttataagatgttggtctaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgtttagatgttg 28194798  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28194799 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 28194869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 46382705 - 46382975
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46382705 atgaagttgtaatggttttattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccatgctgatgtaatgtattaatatcatt 46382804  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  46382805 aagatgctaatgttggtttaagttttttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatattg 46382904  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46382905 agtctattgcatactcatttacgttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 46382975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 35981838 - 35982099
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  35981838 atgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgttgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 35981937  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||    
T  35981938 aagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgcc--------taagttgttaagatgttg 35982028  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  35982029 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtttatttatacataatatgt 35982099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43697349 - 43697075
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  43697349 ctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatggtgttaccttgttgatgtgatgtattaata 43697250  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  43697249 tcattaagatgctaatgttggt-taagttgtttaagttataagatgttggtccaaattattggagtcataagtgatgtctaagtttttaagttgttaaga 43697151  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43697150 tgttgagtttattgcatactcatttacgttgggtgagggtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 43697075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43543081 - 43542819
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43543081 atgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtcatgtattaatatcatt 43542982  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  43542981 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgaaccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgttg 43542890  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43542889 agtccattgcatactcatttacgttgggtgagagcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 43542819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 41305814 - 41306007
Alignment:
Q  80 ttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataaga 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  41305814 ttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggt---------ttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataaga 41305904  T
Q  180 gatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatatta 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41305905 gatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataata 41306004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48301095 - 48300832
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||             |    
T  48301095 atgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgttgtcgtgat-------------t 48301009  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||| | || ||||||| ||||| ||    
T  48301008 aggatgttaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagttgtttaagttttttaagttgt-aagatttt 48300910  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48300909 gagtccat-gcatactcatttaagttt----agggcttgatgccttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 48300832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20636819 - 20636694
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  20636819 atgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccctgttgttgtgatgtattaatatcatg 20636720  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20636719 aagat-ctaatgttggtctaagttgtt 20636694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 51274356 - 51274621
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| | |||  ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  51274356 atgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaattaataccatt 51274455  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  51274456 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 51274543  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51274544 agtctattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgcaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 51274621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20587866 - 20587699
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  20587866 atgttggtctaagttgtttaagctgtaagatgttgatccaaattataggagtcatattaaatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat- 20587769  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587768 gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatataatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 20587699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20592404 - 20592237
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgttgagtccatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  20592404 atgttggtctaagttgtttaagctgtaagatgttgatccaaattataggagtcatattaaatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgttgagtccat- 20592307  T
Q  220 gcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592306 gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatataatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 20592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20636705 - 20636606
Alignment:
Q  183 gtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20636705 gtctaagttgttaagtcgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatccataatatgt 20636606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Original strand, 20634508 - 20634657
Alignment:
Q  139 taagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  20634508 taagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttgagtaca-tgcatactcatttaagt-- 20634603  T
Q  238 ggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
      ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20634604 --tgagggcttgatgccctataatgtatatttatacaaattatgttgagggtttga 20634657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35088580 - 35088486
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088580 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 35088487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 13528762 - 13528841
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13528762 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 13528841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Original strand, 14238498 - 14238585
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14238498 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagagcttga 14238585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 41227622 - 41227725
Alignment:
Q  133 gttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcattt 231  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||    
T  41227622 gttgtctaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-caacacgttgagtcca-tgcatactcattt 41227719  T
Q  232 aagttg 237  Q
    ||||||    
T  41227720 aagttg 41227725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 41227524 - 41227609
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    |||||||| |||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41227524 atgaagttttaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcataatatttaattgtgctgccttgctgtcgtgat 41227609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Original strand, 11809380 - 11809482
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  11809380 tattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttacg-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtgtaagttgtctaag 11809478  T
Q  198 ttgt 201  Q
    ||||    
T  11809479 ttgt 11809482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 2442 - 2672
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  2442 atgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcattttatttaatggtgttgccttgcggttgtgacgtattaatatcatg 2541  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2542 aagat-ctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 2640  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgag 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2641 agtccattgcatactcatttacgttgggtgag 2672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6576458 - 6576182
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6576458 atgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctattgtgatgtaataatatcatt 6576359  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  6576358 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 6576260  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6576259 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttataaatattatgttgggggcttga 6576182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 24781660 - 24781923
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||             |    
T  24781660 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgatgctgccttgatgtcgtgat-------------t 24781746  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  24781747 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 24781845  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781846 gagtcca-tgcatactcatttatgt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 24781923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 5032144 - 5032407
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||             |    
T  5032144 atgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgttgttgccttgctgtcgtgat-------------t 5032230  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagct-gttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||| |  |||||||| ||||| |||    
T  5032231 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgaggtgtttaagttatttaagttg-taagacgtt 5032329  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5032330 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 5032407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22689824 - 22689656
Alignment:
Q  113 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  22689824 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttg 22689726  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgag 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22689725 agtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgag 22689656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22694420 - 22694252
Alignment:
Q  113 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  22694420 agatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttg 22694322  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgag 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694321 agtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgag 22694252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24436275 - 24436022
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||             |    
T  24436275 atgaaattgtaatggttacattggatgatt-ttgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtaat-------------t 24436190  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||         ||||||||||    
T  24436189 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttg---------taagatgttg 24436099  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436098 agtcca-tgcatactcatttaagt----tgaaggcttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 24436022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24883685 - 24883431
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||             |    
T  24883685 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttggtgtcgtgat-------------t 24883599  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgtt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  24883598 aggatgctaatgttggtctaagttgt---------aagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgtt 24883509  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24883508 gagtccat-gcatactaatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttttacatattatgttgagggcttga 24883431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9975055 - 9974894
Alignment:
Q  127 gtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  9975055 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgaagtcatataagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatac 9974958  T
Q  226 tcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
     |||||||||    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9974957 ccatttaagt----tgagggcttgatgccctggaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 9974894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22501073 - 22500860
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||| | |||||| | ||||||| |||||  || |||| || || |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  22501073 atgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccatt 22500974  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  22500973 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 22500886  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22500885 agtctattgcatactcatttaagttg 22500860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22509007 - 22508794
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||| | |||||| | ||||||| |||||  || |||| || || |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  22509007 atgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccatt 22508908  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  22508907 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttg 22508820  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22508819 agtctattgcatactcatttaagttg 22508794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 24865538 - 24865751
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  24865538 atgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaattaataccatt 24865637  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  24865638 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgtcg 24865725  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  24865726 agtccgttgcatactcatgtaagttg 24865751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26896362 - 26896279
Alignment:
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896362 atgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggattgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 26896279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 7672421 - 7672530
Alignment:
Q  179 agatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatatt 278  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7672421 agatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgtcgagtccattgcatactcatggaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatatt 7672515  T
Q  279 atgttgagggcttga 293  Q
    | |||||||||||||    
T  7672516 acgttgagggcttga 7672530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21368050 - 21367914
Alignment:
Q  53 tgacttgctacatattatttaatggtgttgcct-tgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagat 151  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | | ||||||||||||    
T  21368050 tgacttgttgcatgttatttaatgttgctgcctctgcggttgtgatttattaatatcattaagatgcaaacgttggtctaagaag-taaagttgtaagat 21367952  T
Q  152 cttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
     ||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  21367951 gttgttccaaattattggagtcatatgagttgtctaag 21367914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 293
Target Start/End: Original strand, 6478254 - 6478333
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6478254 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttgatgccctgtaatgtatatttatgcatattatgttgagggcttga 6478333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20915222 - 20915126
Alignment:
Q  140 aagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    |||||||||||| ||| || ||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20915222 aagttgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgaatccattgcatgctcatttaagttg 20915126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 357051 - 356984
Alignment:
Q  222 atactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  357051 atactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 356984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 24865791 - 24865844
Alignment:
Q  240 tgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24865791 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 24865844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9975116 - 9975026
Alignment:
Q  121 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttga 212  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9975116 atgttggtcaaa-ttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgttga 9975026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 19202169 - 19202222
Alignment:
Q  240 tgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202169 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttga 19202222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Original strand, 20913058 - 20913095
Alignment:
Q  256 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913058 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 20913095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 23969686 - 23969739
Alignment:
Q  240 tgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23969686 tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacaaattatgtgtagggcttga 23969739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 85219 - 84991
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  85219 atgaagttgtaatagttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattaattgatggtgttgccttgctgatttgatgtattaatatcatt 85120  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  85119 aatatgctaatgttggtttaagttgtttaagttttaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttg 85020  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggt 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  85019 agtccattgcatactcatttacgttgggt 84991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 21741691 - 21741961
Alignment:
Q  20 gtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgct 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  21741691 gtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttacggttgtgacgtattaatatcatgaagat-ct 21741789  T
Q  120 aatgttggtctaag---------ttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgtt 210  Q
    ||||||||| ||||         ||||||||||| |||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21741790 aatgttggtttaagttgtttaagttgtttaagttataagatgttggcccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaaattgttaagatgtt 21741889  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741890 gagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 21741961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Original strand, 5889320 - 5889579
Alignment:
Q  7 ctgagatgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5889320 ctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaata 5889419  T
Q  107 tcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaaga 206  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||                | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5889420 tcattaagatgctaatgttgatttaagatgtt----------------ggtccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaaga 5889503  T
Q  207 tgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5889504 tgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 5889579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 29915223 - 29915453
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29915223 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattattgaatggcgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 29915322  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  29915323 aagatgctaatgtttatttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaagatgttg 29915414  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttga 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  29915415 agtccattgcatactcatttacgatgggcgagggcttga 29915453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 12122289 - 12122554
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||  || |||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12122289 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 12122388  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
     ||||| |          ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12122389 gagatgtt----------taagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgttaagttg-taagatgttg 12122476  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122477 agtccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 12122554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 21557813 - 21558078
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  21557813 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaattaataccatt 21557912  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||    
T  21557913 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtccaacttgttaagtcgtta-gatgttg 21558000  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21558001 agtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 21558078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 21555150 - 21555413
Alignment:
Q  15 aagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt-aa 113  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  21555150 aagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaa 21555249  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgag 213  Q
    ||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  21555250 gatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcg-taagatgttgag 21555337  T
Q  214 tccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21555338 tccattgcatactcatttaagt----tgagggcttgataccctgtaatgtatatttatatatattatgttgagggcttga 21555413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17875298 - 17875033
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| | ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  17875298 atgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattatcttgctgttgtgaagaattaataccatt 17875199  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  17875198 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatataagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgctg 17875111  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875110 agtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 17875033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31455135 - 31454897
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||          ||||||||||    
T  31455135 gattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatg----------tctaagttgt 31455046  T
Q  138 ttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31455045 t-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagttcat-gcatactcatttaagttg 31454949  T
Q  238 ggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
        ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31454948 ----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 31454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31455748 - 31455510
Alignment:
Q  38 gattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||          ||||||||||    
T  31455748 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatg----------tctaagttgt 31455659  T
Q  138 ttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31455658 t-aagttgtaagatgttgatacaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttgagttcat-gcatactcatttaagttg 31455562  T
Q  238 ggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
        ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31455561 ----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 31455510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36460254 - 36460130
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||     
T  36460254 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgcggttgtgacatattaatatcatg 36460155  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36460154 aagat-ctaatgttggtataagttgt 36460130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19920778 - 19920684
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19920778 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgtcatgtaatgtatatttatacatattattttgagggcttg 19920685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30615840 - 30615667
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||  || || | || || |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  30615840 atgaagttgtaattgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaattaataccatt 30615741  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaa 196  Q
    ||||||          | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30615740 aagatg----------tataagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcgtatgagatgtctaagttgttaa 30615667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 21871711 - 21871771
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattattt 72  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  21871711 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattattt 21871771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 21875991 - 21876051
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattattt 72  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  21875991 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcaaattattt 21876051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 25250739 - 25250875
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||  | || ||||||||  || |||  ||| ||| ||||    
T  25250739 tattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaag 25250837  T
Q  198 ttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25250838 ttg-taagttgttgagtcca-tgcatactcatataagttg 25250875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 25314524 - 25314660
Alignment:
Q  99 tattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgt-taag 197  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||  | || ||||||||  || |||  ||| ||| ||||    
T  25314524 tattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaag 25314622  T
Q  198 ttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25314623 ttg-taagttgttgagtcca-tgcatactcatataagttg 25314660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 293
Target Start/End: Original strand, 21309038 - 21309072
Alignment:
Q  259 aatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21309038 aatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 21309072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 106456 - 106266
Alignment:
Q  92 tgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagct 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  106456 tgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaagttattggagtcataagagatgtctaagtt 106357  T
Q  192 gttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  106356 gttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttaggtgagagtttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 106266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Original strand, 46923 - 47095
Alignment:
Q  109 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  46923 attaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaattgttggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttg-taaaatg 47021  T
Q  209 ttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47022 ttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctgtaatgtatatttatacataatatgt 47095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 362976 - 362787
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  362976 atgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattaattgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 362877  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  362876 aagatgctaatgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggattcataagagatgtctaagttgtaaagttgt 362787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 9122 - 9385
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||             |    
T  9122 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgatgtcgtgat-------------t 9208  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagct-gttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||| |  |||||||| ||||| |||    
T  9209 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgaggtgtttaagttatttaagttg-taagacgtt 9307  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9308 gagtcca-tgcatactcatttaagt----tgagggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 9385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14424 - 14159
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14424 atgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatt 14325  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  14324 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgttg 14237  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14236 agtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 14159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 145938 - 145756
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaag 205  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  145938 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaaattg-taag 145840  T
Q  206 atgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145839 atgttgagtccattgcatactcatttaagt----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 145756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 103
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaag 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  243 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacg 144  T
Q  235 ttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143 ttgggtga-ggcttgacgctctgtaatgtatatttatacata 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 236
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  412 atgaagttataatgattatatttgatgattattgttgatgttgacttgttgtaaattattcgatggtgttgcct-gctgatgtgatgtattaatatcatt 314  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||||    
T  313 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgttggtccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Original strand, 23657 - 23797
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaag 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23657 tgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacg 23756  T
Q  235 ttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23757 ttgggtga-ggcttgacgctctgtaatgtatatttatacata 23797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 23488 - 23664
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23488 atgaagttataatgattatatttgatgattattgttgatgttgacttgttgtaaattattcgatggtgttgcct-gctgatgtgatgtattaatatcatt 23586  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||||    
T  23587 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgttggtccaatttattggagtcatatgagatgtttaag 23664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Original strand, 20770 - 20867
Alignment:
Q  179 agatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacata 276  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  20770 agatgtcaaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttacgttgggtgagggcttgatgctctataatgtatatttatacata 20867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 10046 - 10309
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  10046 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 10132  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  10133 aggatgctaatgttggcctaagttgtttaagtcgtaagacgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgtt 10231  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    | || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10232 gagtcca-tgcatactcatttaagt----taagagcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgaaggcttga 10309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 59373 - 59636
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||             |    
T  59373 atgaagttgtaattgttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatggtgttgccttgctgtcgtgat-------------t 59459  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  59460 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgcaagatgttgatccaaattattgaagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagatgtt 59558  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |    ||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  59559 gagtcca-tgcatactcatttaatt----tgaggacttgatgccctgtaatatatatttatacatatcatgttgaggacttga 59636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1385
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1650 atgaagttgtaattgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccatt 1551  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  1550 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgagatgtctaagttgttaagtcgt-aagatgtcg 1463  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1462 agtctattgcatactcatgtaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 9578 - 9841
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||             |    
T  9578 atgaagttgtaatggttatattggatgattaccgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgcattactgtcgtgat-------------t 9664  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgtt 210  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  9665 aggatgaaaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgtt 9763  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9764 gagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatggcctataatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 9841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 76974 - 76720
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  76974 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgattttgatttgctacatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 76888  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgtt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||    
T  76887 aggatgctaatgttggtctaagttgt---------aagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtcaaagttgtttaagttgt-aagacgtt 76798  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76797 gagtgcat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgctctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 76720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 57951 - 57769
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  57951 atcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattactggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aa 57853  T
Q  205 gatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57852 gacattgagtccat-gcatactcatttaagtta----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 57769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6710
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6446 atgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaattaataccatt 6545  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt-aagttgttaagatgtt 210  Q
    ||||||          || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  6546 aagatg----------tc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgt-aagacgtt 6632  T
Q  211 gagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6633 gagttcat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatatatatttatacatattatgttgagggcttga 6710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 5562 - 5667
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaa 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||    
T  5562 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatctctaagttgtttaagttg-taa 5659  T
Q  205 gatgttga 212  Q
    ||||||||    
T  5660 gatgttga 5667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 194
Target Start/End: Original strand, 5639 - 5705
Alignment:
Q  128 tctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5639 tctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgcagtcatatgagatgtctaagttgtt 5705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 5751 - 5814
Alignment:
Q  131 aagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5751 aagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattgcagtcatatgagatgtctaagttgtt 5814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 24794 - 24916
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24794 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 24893  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagt 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  24894 aagatgctaatgttggtttaagt 24916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 284
Target Start/End: Original strand, 19320 - 19469
Alignment:
Q  131 aagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 230  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320 aagttgttcaagtcgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatt 19419  T
Q  231 taagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttg 284  Q
    |||||    |||||| |||  ||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19420 taagt----tgagggtttgttgccctataatgtatagttatacatattatgttg 19469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 15495 - 15595
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||  || ||| |||| || ||||||  |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15495 atgaagttgcgattgttatattcgatgattatcattgatgttgatttgctgcatat-atttaatgttgatgccttgttgttgtgatgcattaatatcatt 15593  T
Q  112 aa 113  Q
    ||    
T  15594 aa 15595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 24553 - 24653
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||  || ||| |||| || ||||||  |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24553 atgaagttgcgattgttatattcgatgattatcattgatgttgatttgctgcatat-atttaatgttgatgccttgttgttgtgatgcattaatatcatt 24651  T
Q  112 aa 113  Q
    ||    
T  24652 aa 24653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3148 - 2894
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |             | |||    
T  3148 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatgttgttgccttgttgtcg-------------ttatt 3062  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||        | |||||||| ||||| ||||    
T  3061 aggatgctaatgtttgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagat--------ttttaagttg-taagacgttg 2971  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    |||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2970 agtcca-tgcatactaatttaagt----tgagggcttcctgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttga 2894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 8434 - 8548
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8434 atgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcatt 8533  T
Q  112 aagatgctaatgttg 126  Q
    |||||||||||||||    
T  8534 aagatgctaatgttg 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Original strand, 8605 - 8747
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta- 232  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  8605 tgtttaagttgtaatatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaaattattaagttgttaggatgttgagtccattgcatactcataatac 8704  T
Q  233 -agttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8705 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 8747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 8206 - 8365
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             |    
T  8206 atgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat-------------t 8292  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgt 184  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  8293 aggatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13375 - 13233
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactc---attt 231  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || |    
T  13375 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatat 13276  T
Q  232 aagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13275 gagatgggggagggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13545 - 13373
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  13545 atgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatatgatgttgttgccttgctgatctgatatattaatatcatt 13446  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| || || |||||||| |||||||    
T  13445 aagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatatgagatgt 13373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25076 - 24989
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgca 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25076 tgtttaatttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgca 24989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25180 - 25074
Alignment:
Q  78 tgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataa 177  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| | |  |||| || || ||||||||     
T  25180 tgttgccttgctgatctgatatattaatatcattaagatgctaatgttggtttaagtcgtttgagttataagatgtcggcccaatttattggagtcatat 25081  T
Q  178 gagatgt 184  Q
    |||||||    
T  25080 gagatgt 25074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Original strand, 2768 - 2917
Alignment:
Q  137 tttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctg-ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2768 tttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttg-taagacgttgagtcca-tgcatactcatttaagt 2865  T
Q  236 tgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
        |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2866 ----tgagggtttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 291
Target Start/End: Original strand, 2951 - 2986
Alignment:
Q  256 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2951 tgtaatgtatatttatacatattatgttgagggctt 2986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34952 - 34820
Alignment:
Q  145 gtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtg 241  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  || |||| |    
T  34952 gtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtctaagttgttaagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatacgagatggggg 34853  T
Q  242 agggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34852 agggcttgatgctctgtaatgtatatttataca 34820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 7795 - 7911
Alignment:
Q  18 ttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7795 ttgtaatgattgtatttgatgattattgttgacgttgacttgctgtgaattatttgatgttgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg 7894  T
Q  118 ctaatgttggtctaagt 134  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7895 ctaatgttggtttaagt 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 2499 - 2653
Alignment:
Q  14 gaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||             ||     
T  2499 gaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatagtgttgttttgctgtcgtgat-------------tag 2585  T
Q  114 gatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagaga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  2586 gatgctaatgttggtctaagttgtttaaattgtaagattttgatccaaattattggagtcatatgaga 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4567
Alignment:
Q  174 ataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta--agttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatattta 270  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4672 ataagagatgtctaagttattaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcataatacgagatgggagagggcttgatgctctgtaatgtatattta 4573  T
Q  271 tacata 276  Q
    ||||||    
T  4572 tacata 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10979 - 10766
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  10979 atgaatttttaattgttatatatgatgattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaattaataccatt 10880  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttg 211  Q
    ||||||          ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||| ||| |||| | |||||| || |||||||||    
T  10879 aagatg----------tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagttatatgaggtgtataagttattaagtcgt-aagatgttg 10792  T
Q  212 agtccattgcatactcatttaagttg 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10791 agtccattgcatactcatttaggttg 10766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33516 - 33429
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggattgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 287
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  374 taagatgttaagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtataattatacatattatgttgagggcttga 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1780
Alignment:
Q  26 gttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaag-atgctaatgt 124  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| ||    
T  1957 gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattagatgatgttgccttgctgttgtgaagtaataatgtcattaagaattctaa-gt 1859  T
Q  125 tggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcat-aagagatgtctaagctgttaagttgtt 202  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  1858 tggtcaaagtcgttcaagtcgtaagatgttgatccaagttattggagtcataaagagttgtctaagttgttaagatgtt 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10961 - 10874
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 10874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Original strand, 863 - 950
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttg----agggtttaatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 281 - 157
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||     
T  281 atgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaatttcatg 182  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  181 aagat-ctaatgttggtataagttgt 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4699 - 4575
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||     
T  4699 atgaaattgtaattgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtgacatattaatttcatg 4600  T
Q  112 aagatgctaatgttggtctaagttgt 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4599 aagat-ctaatgttggtataagttgt 4575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 605 - 681
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccatgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Original strand, 78299 - 78393
Alignment:
Q  193 ttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78299 ttaagttgt-aagacgttgagtccat-gcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttg 78392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 5524 - 5609
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5524 atgaagttgtaatgtttatattggatgattattgttgatgttaacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctgtcgtgat 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 95531 - 95300
Alignment:
Q  58 tgctacatattatttaatggtgttgcct-tgctgttgtgatgtattaatat-cattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttg 155  Q
    |||| ||| |||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  95531 tgctgcatgttatttaatgttgatgtctctgctgttgtgat-tattaatattcattaagatgcaaatgttggtctaagttgca-aagtcgtaagatgttg 95434  T
Q  156 atccaaattgttagagtcataagagatgtctaagct-gt-taagttgttaagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgc 253  Q
     ||||| || || ||||||||  || |||  ||| | || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||| ||    
T  95433 ttccaagttattggagtcatataagttgttcaagtttgtctaagttgt-aagttgttgagtccat-gcatactcattaaagttg----agggcttgatgc 95340  T
Q  254 tttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    | |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  95339 tctagaatgtatattcatacatattacgttgagggcttga 95300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 11019 - 11092
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgcct 85  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  11019 atgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgctgtaaattatttgatggtgttgcct 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 6831 - 6912
Alignment:
Q  16 agttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgat 97  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6831 agttgtaatgattatatttgatgattattgttcatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttactgtcgtgat 6912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 812
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgct 89  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  889 atgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatcgtgctgccttgct 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 263
Alignment:
Q  106 atcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaag 205  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  368 atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatatctaagttgttaagtcg-taag 272  T
Q  206 atgttgagt 214  Q
    |||||||||    
T  271 atgttgagt 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 41193 - 41269
Alignment:
Q  210 tgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41193 tgagtccattgcatactcatttaagttg----agggcttgatgccctataatgtatatttatacatattatgttaagggct 41269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 74656 - 74522
Alignment:
Q  135 tgtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaagctgttaagttgttaagatgttgagtccattgcatactcat-tta- 232  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  74656 tgtttaattcgtaagatgttgatccaaattattggagtcataagagatgtc--------taagttgttaggatgttgagtccattgcatattcataatac 74565  T
Q  233 -agttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttataca 274  Q
     || |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  74564 gagatgggggagggtttgatgctctgtaatgtatatttataca 74522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 568 - 463
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcatt 111  Q
    ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  |  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  568 atgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatatcatt 469  T
Q  112 aagatg 117  Q
    ||||||    
T  468 aagatg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 78141 - 78055
Alignment:
Q  202 taagatgttgagtccattgcatactcatttaagttgggtgagggcttgacgctttgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttga 293  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78141 taagttgttgagtccat-gcatcctcatttaagttg----agggcttaatgccctgtaatctatatttatacatattatgttgagggcttga 78055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Original strand, 7585 - 7638
Alignment:
Q  136 gtttaagttgtaagatcttgatccaaattgttagagtcataagagatgtctaag 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  7585 gtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaag 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 18476 - 18546
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgctacatattatttaatggtgttg 82  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||| |||||    
T  18476 atgaagttgtaatgaatgtatttgatgattattgttgatgttgacttgttgcaaattatttgatgttgttg 18546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 36198 - 36247
Alignment:
Q  12 atgaagttgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgatgacttgct 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36198 atgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgct 36247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University