View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9293_low_11 (Length: 358)

Name: NF9293_low_11
Description: NF9293
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9293_low_11
NF9293_low_11
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (1-342)||(34822733-34823072)
chr2 (1-342)||(12726588-12726927)
chr2 (1-342)||(12643308-12643647)
chr2 (1-342)||(3800396-3800734)
chr2 (1-342)||(12637448-12637786)
chr2 (1-342)||(8942181-8942522)
chr2 (1-340)||(23773072-23773407)
chr2 (1-342)||(21275810-21276148)
chr2 (1-342)||(21140412-21140749)
chr2 (1-340)||(24686954-24687290)
chr2 (1-342)||(5889580-5889917)
chr2 (1-324)||(17397895-17398217)
chr2 (1-342)||(19888063-19888399)
chr2 (1-342)||(14907721-14908059)
chr2 (1-342)||(20013658-20013996)
chr2 (1-342)||(23818715-23819053)
chr2 (1-342)||(11232537-11232872)
chr2 (1-342)||(22514384-22514719)
chr2 (1-342)||(8886668-8887016)
chr2 (1-342)||(28776985-28777320)
chr2 (4-342)||(43644259-43644595)
chr2 (1-342)||(22282653-22282994)
chr2 (1-342)||(22273420-22273761)
chr2 (2-339)||(15631925-15632269)
chr2 (1-342)||(22862015-22862363)
chr2 (131-342)||(25600626-25600837)
chr2 (130-339)||(461402-461609)
chr2 (132-338)||(36891998-36892203)
chr2 (129-342)||(6878106-6878319)
chr2 (129-342)||(24966960-24967173)
chr2 (130-314)||(9654140-9654323)
chr2 (129-342)||(20628681-20628889)
chr2 (130-342)||(24827852-24828062)
chr2 (130-339)||(4449517-4449725)
chr2 (129-342)||(22691236-22691447)
chr2 (129-342)||(22695883-22696094)
chr2 (129-342)||(7320150-7320365)
chr2 (129-342)||(22581216-22581431)
chr2 (130-309)||(269851-270029)
chr2 (180-342)||(25877233-25877395)
chr2 (131-298)||(27260248-27260415)
chr2 (131-338)||(24572678-24572887)
chr2 (129-340)||(28972703-28972914)
chr2 (1-204)||(22692825-22693028)
chr2 (1-204)||(22697472-22697675)
chr2 (129-252)||(721133-721257)
chr2 (240-333)||(22693040-22693133)
chr2 (240-333)||(22697687-22697780)
chr2 (129-255)||(22787408-22787535)
chr2 (182-268)||(23822881-23822967)
chr2 (182-268)||(23831960-23832046)
chr2 (182-255)||(23824838-23824911)
chr2 (193-255)||(19670515-19670577)
chr2 (182-255)||(4663-4735)
chr2 (182-255)||(24295958-24296031)
chr2 (193-255)||(19658677-19658739)
chr2 (297-342)||(721313-721358)
chr2 (183-252)||(19434844-19434913)
chr2 (4-108)||(19658480-19658583)
chr2 (297-342)||(22787310-22787355)
chr2 (4-41)||(25877615-25877652)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-342)||(369424-369765)
chr7 (1-342)||(13757117-13757456)
chr7 (1-342)||(13912399-13912738)
chr7 (1-342)||(15952382-15952720)
chr7 (1-342)||(26010477-26010817)
chr7 (1-333)||(42057458-42057788)
chr7 (1-321)||(10988150-10988468)
chr7 (1-331)||(25293575-25293903)
chr7 (1-342)||(16417006-16417342)
chr7 (1-342)||(15442845-15443183)
chr7 (1-342)||(27102836-27103171)
chr7 (1-342)||(27110184-27110519)
chr7 (1-342)||(27175155-27175490)
chr7 (1-342)||(38784928-38785263)
chr7 (32-342)||(15525769-15526080)
chr7 (1-342)||(7821463-7821798)
chr7 (1-342)||(7828774-7829109)
chr7 (1-342)||(11514661-11514999)
chr7 (129-342)||(7291519-7291731)
chr7 (1-342)||(3058587-3058925)
chr7 (1-342)||(30263410-30263748)
chr7 (1-342)||(32495840-32496182)
chr7 (2-342)||(2027095-2027435)
chr7 (130-342)||(2191982-2192193)
chr7 (55-342)||(125418-125704)
chr7 (129-342)||(112583-112795)
chr7 (131-342)||(45453542-45453754)
chr7 (133-342)||(142296-142506)
chr7 (1-324)||(15761673-15761993)
chr7 (129-342)||(13867360-13867573)
chr7 (131-342)||(1938057-1938266)
chr7 (129-342)||(12544998-12545211)
chr7 (129-342)||(44863908-44864121)
chr7 (129-342)||(47288440-47288653)
chr7 (130-342)||(16210447-16210657)
chr7 (130-342)||(18981192-18981403)
chr7 (129-342)||(26071552-26071764)
chr7 (129-342)||(26095339-26095551)
chr7 (130-342)||(11582128-11582338)
chr7 (130-342)||(36051331-36051541)
chr7 (1-342)||(3893625-3893971)
chr7 (130-342)||(13038392-13038602)
chr7 (130-342)||(16480222-16480432)
chr7 (131-342)||(12249398-12249610)
chr7 (129-342)||(15823692-15823909)
chr7 (131-342)||(11285878-11286091)
chr7 (130-342)||(15926034-15926242)
chr7 (131-342)||(12753549-12753759)
chr7 (1-296)||(2436167-2436456)
chr7 (1-340)||(18255108-18255448)
chr7 (134-342)||(16571375-16571587)
chr7 (134-342)||(16594075-16594287)
chr7 (157-334)||(13571525-13571701)
chr7 (129-342)||(13273407-13273631)
chr7 (1-61)||(15518422-15518482)
chr7 (270-342)||(39047977-39048049)
chr7 (129-342)||(49049078-49049301)
chr7 (130-272)||(15629436-15629579)
chr7 (129-252)||(10862231-10862356)
chr7 (290-339)||(15761509-15761558)
chr7 (296-342)||(15629613-15629659)
chr7 (301-342)||(15851163-15851204)
chr7 (1-42)||(1938362-1938403)
chr7 (183-252)||(9058007-9058076)
chr7 (290-342)||(2191832-2191884)
chr7 (1-122)||(15913948-15914069)
chr7 (217-255)||(13376423-13376461)
chr7 (193-251)||(15913817-15913875)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (1-342)||(11341173-11341512)
chr5 (1-342)||(4201368-4201707)
chr5 (1-342)||(1221134-1221473)
chr5 (1-343)||(22884582-22884924)
chr5 (1-342)||(25425159-25425495)
chr5 (4-342)||(9732069-9732404)
chr5 (1-340)||(23327490-23327825)
chr5 (1-340)||(24595038-24595373)
chr5 (1-342)||(110385-110725)
chr5 (1-342)||(16534844-16535183)
chr5 (1-324)||(19498337-19498655)
chr5 (1-342)||(43445155-43445498)
chr5 (1-340)||(11213007-11213344)
chr5 (1-342)||(10779582-10779920)
chr5 (1-333)||(27008549-27008879)
chr5 (1-342)||(22367887-22368225)
chr5 (1-342)||(21074892-21075229)
chr5 (1-342)||(10888-11224)
chr5 (1-342)||(29192023-29192358)
chr5 (129-342)||(25192399-25192611)
chr5 (1-342)||(21234808-21235147)
chr5 (1-342)||(21933565-21933900)
chr5 (1-342)||(21939735-21940070)
chr5 (1-342)||(35580792-35581127)
chr5 (1-342)||(37010569-37010904)
chr5 (1-342)||(25901728-25902066)
chr5 (1-339)||(37051522-37051857)
chr5 (1-330)||(20615150-20615476)
chr5 (130-333)||(35792544-35792746)
chr5 (129-342)||(11582539-11582752)
chr5 (97-342)||(21649463-21649707)
chr5 (129-342)||(21392853-21393066)
chr5 (1-342)||(4863796-4864145)
chr5 (129-342)||(1169944-1170157)
chr5 (130-342)||(7424343-7424553)
chr5 (130-342)||(17473172-17473384)
chr5 (131-342)||(21652685-21652896)
chr5 (130-339)||(24184499-24184708)
chr5 (129-340)||(20710802-20711012)
chr5 (129-342)||(28258265-28258479)
chr5 (129-342)||(23513461-23513674)
chr5 (131-342)||(27185116-27185327)
chr5 (130-342)||(18779396-18779607)
chr5 (129-342)||(19404244-19404459)
chr5 (129-324)||(23510655-23510847)
chr5 (131-342)||(11338149-11338360)
chr5 (129-342)||(23453614-23453829)
chr5 (129-342)||(23465119-23465334)
chr5 (238-314)||(24474367-24474443)
chr5 (129-210)||(24470968-24471048)
chr5 (130-252)||(3672657-3672780)
chr5 (129-252)||(5452190-5452314)
chr5 (290-342)||(1169796-1169848)
chr5 (290-342)||(17473023-17473075)
chr5 (182-255)||(7727296-7727369)
chr5 (193-255)||(32967547-32967609)
chr5 (182-255)||(23492722-23492794)
chr5 (205-242)||(24473191-24473228)
chr5 (290-337)||(43445013-43445060)
chr5 (183-255)||(431149-431221)
chr5 (290-342)||(35792404-35792456)
chr5 (1-122)||(32967688-32967809)
chr5 (1-40)||(35792832-35792871)
chr5 (183-252)||(21615735-21615804)
chr5 (1-109)||(23492534-23492641)
chr5 (183-252)||(24226842-24226911)
chr5 (193-254)||(28888648-28888709)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-342)||(22355847-22356186)
chr4 (1-342)||(19999062-19999400)
chr4 (1-342)||(47355860-47356201)
chr4 (1-342)||(14950555-14950893)
chr4 (1-342)||(15274043-15274382)
chr4 (1-340)||(26338020-26338355)
chr4 (1-342)||(5684185-5684526)
chr4 (1-321)||(13049467-13049786)
chr4 (1-342)||(26678579-26678908)
chr4 (1-342)||(110017-110355)
chr4 (1-342)||(16329207-16329545)
chr4 (1-342)||(10487206-10487544)
chr4 (1-342)||(18246725-18247061)
chr4 (129-342)||(7133732-7133945)
chr4 (1-342)||(16521323-16521663)
chr4 (129-342)||(9294187-9294398)
chr4 (129-342)||(8873777-8873989)
chr4 (96-342)||(25120405-25120650)
chr4 (129-342)||(53909053-53909266)
chr4 (56-342)||(15211931-15212217)
chr4 (129-342)||(44054584-44054797)
chr4 (129-342)||(53706073-53706286)
chr4 (129-342)||(33738927-33739140)
chr4 (146-342)||(8373033-8373228)
chr4 (129-342)||(34393716-34393929)
chr4 (132-342)||(12901055-12901265)
chr4 (129-342)||(18167456-18167665)
chr4 (129-342)||(44345489-44345703)
chr4 (130-342)||(13245115-13245325)
chr4 (129-342)||(10642849-10643062)
chr4 (130-342)||(15288293-15288503)
chr4 (1-342)||(21960851-21961200)
chr4 (129-342)||(45460239-45460453)
chr4 (130-342)||(15295403-15295613)
chr4 (129-308)||(54119579-54119757)
chr4 (130-342)||(14994860-14995070)
chr4 (180-342)||(821395-821557)
chr4 (171-342)||(30233826-30233998)
chr4 (129-342)||(18495689-18495904)
chr4 (1-105)||(15138077-15138181)
chr4 (207-342)||(18294450-18294580)
chr4 (129-233)||(13751686-13751790)
chr4 (225-342)||(8044016-8044134)
chr4 (240-342)||(23271207-23271309)
chr4 (131-281)||(13810974-13811125)
chr4 (129-255)||(43282757-43282884)
chr4 (136-255)||(52266840-52266960)
chr4 (132-247)||(15043605-15043721)
chr4 (132-247)||(15110703-15110819)
chr4 (290-340)||(18294304-18294354)
chr4 (290-339)||(19019390-19019439)
chr4 (290-342)||(5684036-5684088)
chr4 (131-175)||(30235942-30235986)
chr4 (290-337)||(8373431-8373478)
chr4 (193-255)||(34197544-34197606)
chr4 (182-255)||(15852696-15852769)
chr4 (290-342)||(34394020-34394072)
chr4 (193-255)||(27959758-27959820)
chr4 (291-337)||(47356297-47356343)
chr4 (297-338)||(13810907-13810948)
chr4 (290-342)||(18109986-18110038)
chr4 (302-342)||(18110136-18110176)
chr4 (1-40)||(14994735-14994774)
chr4 (1-122)||(34197685-34197806)
chr4 (1-39)||(9293984-9294022)
chr4 (1-39)||(10642646-10642684)
chr4 (193-255)||(37958436-37958498)
chr4 (217-255)||(41167314-41167352)
chr4 (4-41)||(12837919-12837956)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-342)||(3432858-3433197)
chr8 (1-342)||(16874221-16874560)
chr8 (1-342)||(224443-224784)
chr8 (1-342)||(738066-738407)
chr8 (1-342)||(861961-862302)
chr8 (2-342)||(700856-701196)
chr8 (1-340)||(22089729-22090065)
chr8 (1-333)||(21853187-21853517)
chr8 (1-340)||(15320345-15320681)
chr8 (1-340)||(15500714-15501050)
chr8 (1-324)||(16675625-16675947)
chr8 (1-333)||(21845782-21846112)
chr8 (1-342)||(5236731-5237069)
chr8 (1-342)||(24662529-24662867)
chr8 (1-342)||(272488-272823)
chr8 (1-342)||(643026-643361)
chr8 (1-342)||(828832-829167)
chr8 (1-342)||(24386991-24387331)
chr8 (1-342)||(43684190-43684528)
chr8 (1-342)||(29758828-29759168)
chr8 (129-342)||(24718699-24718912)
chr8 (129-342)||(24107869-24108079)
chr8 (129-342)||(22908767-22908978)
chr8 (4-314)||(270279-270585)
chr8 (4-314)||(645335-645641)
chr8 (4-314)||(831070-831376)
chr8 (130-342)||(43374865-43375075)
chr8 (1-342)||(24930396-24930739)
chr8 (129-342)||(37610031-37610244)
chr8 (130-342)||(6775514-6775725)
chr8 (131-340)||(20648723-20648932)
chr8 (129-342)||(25121206-25121419)
chr8 (129-340)||(20655308-20655519)
chr8 (159-342)||(16195019-16195202)
chr8 (129-342)||(41245327-41245540)
chr8 (130-342)||(24547885-24548095)
chr8 (129-342)||(13663918-13664130)
chr8 (129-342)||(13723193-13723405)
chr8 (130-342)||(19994433-19994646)
chr8 (129-342)||(16416924-16417138)
chr8 (129-342)||(22322717-22322930)
chr8 (134-337)||(20568553-20568757)
chr8 (134-337)||(20574746-20574950)
chr8 (129-342)||(20480337-20480546)
chr8 (129-314)||(22007788-22007973)
chr8 (133-342)||(21679869-21680080)
chr8 (129-256)||(37605657-37605783)
chr8 (129-342)||(17730746-17730960)
chr8 (4-225)||(16203737-16203957)
chr8 (131-342)||(21696227-21696439)
chr8 (129-337)||(28543600-28543806)
chr8 (227-342)||(28836356-28836468)
chr8 (226-342)||(16040642-16040759)
chr8 (226-342)||(16042318-16042435)
chr8 (129-342)||(38532312-38532536)
chr8 (129-255)||(18768135-18768262)
chr8 (290-339)||(18618138-18618187)
chr8 (182-255)||(39448198-39448271)
chr8 (290-337)||(17151288-17151335)
chr8 (1-40)||(23509454-23509493)
chr8 (193-255)||(21199547-21199609)
chr8 (290-342)||(13663771-13663823)
chr8 (290-342)||(13722306-13722358)
chr8 (290-342)||(13722454-13722506)
chr8 (290-342)||(13722602-13722654)
chr8 (290-342)||(13722750-13722802)
chr8 (290-342)||(13722898-13722950)
chr8 (290-342)||(13723046-13723098)
chr8 (290-337)||(224301-224348)
chr8 (290-337)||(700714-700761)
chr8 (290-337)||(737924-737971)
chr8 (290-337)||(861819-861866)
chr8 (131-255)||(22737250-22737376)
chr8 (1-40)||(22909144-22909183)
chr8 (193-252)||(23148623-23148682)
chr8 (1-40)||(24547760-24547799)
chr8 (193-255)||(21192120-21192182)
chr8 (1-39)||(22008138-22008176)
chr8 (1-39)||(24108244-24108282)
chr8 (193-255)||(31195658-31195720)
chr8 (183-248)||(25756675-25756740)
chr8 (183-247)||(25294686-25294750)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (1-342)||(23976110-23976448)
chr6 (1-342)||(16230122-16230461)
chr6 (1-342)||(14627893-14628232)
chr6 (1-340)||(26088376-26088713)
chr6 (1-340)||(29870760-29871096)
chr6 (1-342)||(4989438-4989776)
chr6 (1-342)||(16827159-16827499)
chr6 (1-333)||(23993702-23994032)
chr6 (1-340)||(16650531-16650867)
chr6 (1-340)||(16557301-16557637)
chr6 (1-342)||(27655370-27655707)
chr6 (1-342)||(33315865-33316203)
chr6 (1-342)||(25174097-25174433)
chr6 (1-342)||(10487421-10487756)
chr6 (1-342)||(16377571-16377906)
chr6 (1-342)||(16384895-16385230)
chr6 (1-342)||(19984488-19984827)
chr6 (129-342)||(18004256-18004469)
chr6 (131-342)||(16105228-16105440)
chr6 (132-342)||(18431304-18431514)
chr6 (1-324)||(1554382-1554702)
chr6 (132-342)||(15736464-15736674)
chr6 (132-342)||(18825044-18825251)
chr6 (129-342)||(35016964-35017177)
chr6 (129-342)||(23151928-23152140)
chr6 (148-342)||(18569274-18569467)
chr6 (1-306)||(18128812-18129129)
chr6 (129-342)||(18843104-18843315)
chr6 (129-340)||(25646112-25646323)
chr6 (130-342)||(18087994-18088206)
chr6 (129-342)||(31627106-31627319)
chr6 (115-342)||(1658994-1659221)
chr6 (132-342)||(18775882-18776089)
chr6 (138-342)||(22430925-22431129)
chr6 (130-342)||(1651234-1651444)
chr6 (132-340)||(32897394-32897602)
chr6 (55-342)||(16238958-16239246)
chr6 (1-342)||(11214680-11215020)
chr6 (115-342)||(15861383-15861610)
chr6 (195-342)||(25745615-25745763)
chr6 (131-260)||(16084086-16084215)
chr6 (129-337)||(18397594-18397803)
chr6 (131-342)||(13622396-13622608)
chr6 (136-333)||(17343578-17343772)
chr6 (132-340)||(22226926-22227133)
chr6 (132-340)||(13016071-13016278)
chr6 (129-323)||(22866836-22867031)
chr6 (1-107)||(16642526-16642632)
chr6 (130-276)||(19609167-19609311)
chr6 (129-342)||(28196061-28196279)
chr6 (130-215)||(18741119-18741203)
chr6 (129-255)||(15738916-15739043)
chr6 (259-342)||(16084878-16084962)
chr6 (129-255)||(25368728-25368856)
chr6 (193-255)||(16889122-16889184)
chr6 (290-339)||(1554817-1554866)
chr6 (182-255)||(33323532-33323605)
chr6 (182-255)||(35137326-35137399)
chr6 (1-40)||(1651530-1651569)
chr6 (1-40)||(1659291-1659330)
chr6 (1-40)||(15861274-15861313)
chr6 (1-39)||(18004634-18004672)
chr6 (1-39)||(18825419-18825457)
chr6 (1-39)||(18843480-18843518)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (1-342)||(53769194-53769533)
chr3 (1-343)||(49230748-49231090)
chr3 (1-342)||(8269686-8270023)
chr3 (1-342)||(8276797-8277134)
chr3 (1-323)||(27839241-27839563)
chr3 (1-340)||(30151870-30152205)
chr3 (1-342)||(16819443-16819781)
chr3 (1-342)||(16745454-16745791)
chr3 (1-342)||(44227961-44228302)
chr3 (1-342)||(17913534-17913873)
chr3 (1-342)||(18909226-18909562)
chr3 (1-321)||(45859553-45859872)
chr3 (1-342)||(22273581-22273917)
chr3 (1-324)||(41268775-41269097)
chr3 (1-342)||(2450612-2450947)
chr3 (1-294)||(13956132-13956425)
chr3 (1-253)||(8305693-8305943)
chr3 (1-342)||(1468938-1469273)
chr3 (1-294)||(13976964-13977258)
chr3 (1-342)||(2048595-2048936)
chr3 (1-342)||(33340377-33340718)
chr3 (4-342)||(51159761-51160102)
chr3 (1-324)||(55314915-55315251)
chr3 (130-342)||(16259705-16259916)
chr3 (131-342)||(17957618-17957828)
chr3 (129-342)||(7852471-7852683)
chr3 (129-342)||(13816175-13816388)
chr3 (129-342)||(19572054-19572267)
chr3 (4-342)||(19230589-19230935)
chr3 (1-340)||(8630374-8630720)
chr3 (1-342)||(19945163-19945502)
chr3 (1-342)||(23491040-23491382)
chr3 (129-342)||(25057510-25057723)
chr3 (129-342)||(15860430-15860642)
chr3 (1-342)||(318896-319245)
chr3 (130-339)||(35122350-35122559)
chr3 (138-342)||(12351127-12351331)
chr3 (130-342)||(15574706-15574916)
chr3 (130-342)||(16183292-16183509)
chr3 (154-342)||(6148124-6148312)
chr3 (1-303)||(10737093-10737392)
chr3 (130-342)||(15613725-15613935)
chr3 (63-340)||(5227313-5227585)
chr3 (129-342)||(17099376-17099590)
chr3 (129-342)||(22145557-22145768)
chr3 (130-339)||(14297161-14297371)
chr3 (130-339)||(14302788-14302998)
chr3 (130-342)||(15469751-15469959)
chr3 (129-342)||(14522589-14522804)
chr3 (129-342)||(50113415-50113623)
chr3 (130-339)||(53899808-53900016)
chr3 (129-342)||(14294090-14294305)
chr3 (129-342)||(11198854-11199069)
chr3 (125-340)||(12265775-12265989)
chr3 (129-342)||(14299717-14299932)
chr3 (131-342)||(11062319-11062530)
chr3 (131-342)||(47786166-47786365)
chr3 (129-337)||(40938393-40938602)
chr3 (1-340)||(15939743-15940083)
chr3 (1-252)||(14846034-14846282)
chr3 (129-288)||(30205116-30205274)
chr3 (129-342)||(17523694-17523905)
chr3 (129-342)||(12562760-12562976)
chr3 (129-281)||(17138128-17138281)
chr3 (130-252)||(18905171-18905291)
chr3 (245-342)||(12031266-12031364)
chr3 (217-338)||(16935168-16935286)
chr3 (129-249)||(12951714-12951835)
chr3 (129-187)||(11813528-11813586)
chr3 (129-252)||(15516397-15516521)
chr3 (129-245)||(39654578-39654695)
chr3 (129-247)||(11883645-11883764)
chr3 (129-200)||(14287756-14287828)
chr3 (269-340)||(18897982-18898053)
chr3 (290-339)||(9303753-9303802)
chr3 (254-336)||(14843837-14843919)
chr3 (193-254)||(11330382-11330443)
chr3 (290-342)||(17937320-17937372)
chr3 (193-254)||(15874892-15874953)
chr3 (183-252)||(38812367-38812436)
chr3 (183-255)||(12490105-12490177)
chr3 (290-342)||(16260014-16260066)
chr3 (1-40)||(12266071-12266110)
chr3 (1-40)||(15574581-15574620)
chr3 (1-40)||(15613600-15613639)
chr3 (1-40)||(16259580-16259619)
chr3 (1-40)||(17957994-17958033)
chr3 (1-40)||(23081746-23081785)
chr3 (1-40)||(30141419-30141458)
chr3 (1-39)||(25057307-25057345)
chr3 (1-123)||(12490248-12490370)
chr3 (1-37)||(15470048-15470084)
chr3 (1-37)||(19262602-19262638)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-342)||(20826513-20826852)
chr1 (1-342)||(17147315-17147654)
chr1 (1-340)||(22034382-22034717)
chr1 (1-342)||(7641884-7642213)
chr1 (1-324)||(18602352-18602674)
chr1 (1-324)||(5073609-5073931)
chr1 (1-342)||(41392986-41393324)
chr1 (1-342)||(51451147-51451485)
chr1 (1-342)||(17003359-17003694)
chr1 (64-340)||(22029293-22029566)
chr1 (1-342)||(44036189-44036530)
chr1 (4-342)||(37845755-37846100)
chr1 (132-342)||(18506021-18506230)
chr1 (129-342)||(22250242-22250455)
chr1 (129-335)||(41210707-41210913)
chr1 (129-342)||(21858218-21858430)
chr1 (4-340)||(20444276-20444618)
chr1 (129-342)||(20526780-20526992)
chr1 (129-342)||(22407484-22407697)
chr1 (115-342)||(15862722-15862947)
chr1 (4-340)||(20530040-20530383)
chr1 (1-321)||(20930006-20930327)
chr1 (132-342)||(49966313-49966523)
chr1 (129-342)||(2422260-2422473)
chr1 (1-342)||(22352661-22353002)
chr1 (129-342)||(5675890-5676102)
chr1 (129-342)||(35053504-35053714)
chr1 (129-342)||(20894983-20895194)
chr1 (130-342)||(45050346-45050556)
chr1 (130-342)||(21716868-21717077)
chr1 (129-314)||(9785551-9785735)
chr1 (130-339)||(35523713-35523921)
chr1 (129-321)||(41218115-41218307)
chr1 (1-333)||(22226516-22226846)
chr1 (130-342)||(18060898-18061109)
chr1 (130-342)||(22365417-22365629)
chr1 (130-340)||(21651228-21651436)
chr1 (129-341)||(51657604-51657826)
chr1 (194-324)||(20121966-20122096)
chr1 (129-255)||(27673514-27673641)
chr1 (253-340)||(22031007-22031092)
chr1 (129-281)||(20956315-20956468)
chr1 (129-252)||(22836628-22836752)
chr1 (290-339)||(20253246-20253295)
chr1 (182-255)||(38034997-38035070)
chr1 (182-268)||(36357700-36357786)
chr1 (129-177)||(2422531-2422579)
chr1 (290-342)||(22353097-22353149)
chr1 (1-40)||(15863017-15863056)
chr1 (1-40)||(22250620-22250659)
chr1 (1-40)||(35935164-35935203)
chr1 (1-39)||(22365215-22365253)
chr1 (297-342)||(22836527-22836572)
chr1 (183-252)||(37235336-37235405)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-340)||(29887-30223)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-342)||(17375-17714)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-333)||(66733-67063)
scaffold0044 (129-342)||(94985-95198)
scaffold0044 (290-342)||(95294-95346)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-342)||(2861-3197)
scaffold0124 (131-333)||(22997-23194)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-314)||(34869-35182)
scaffold0023 (130-342)||(155640-155849)
scaffold0023 (132-340)||(732-936)
scaffold0023 (1-40)||(155935-155974)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-342)||(5718-6054)
scaffold0003 (1-342)||(217033-217374)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-342)||(25439-25777)
scaffold0141 (1-342)||(21184-21522)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-342)||(37825-38160)
[»] scaffold0383 (4 HSPs)
scaffold0383 (115-342)||(1015-1241)
scaffold0383 (129-342)||(5898-6108)
scaffold0383 (290-342)||(1336-1388)
scaffold0383 (1-40)||(906-945)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (129-342)||(38616-38828)
scaffold0078 (1-342)||(40027-40368)
scaffold0078 (1-40)||(38994-39033)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-342)||(2416-2756)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (1-342)||(32476-32817)
scaffold0184 (129-261)||(34016-34147)
scaffold0184 (1-40)||(33811-33850)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (4-342)||(145070-145407)
scaffold0025 (4-341)||(147329-147666)
scaffold0025 (290-342)||(145502-145554)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (129-342)||(28549-28761)
scaffold0116 (290-342)||(28857-28909)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (63-342)||(52559-52837)
scaffold0018 (63-342)||(56511-56789)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (129-342)||(38875-39089)
scaffold0034 (129-342)||(78216-78429)
scaffold0034 (179-342)||(44512-44676)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (4-342)||(1-338)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (131-342)||(17314-17524)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-342)||(7961-8310)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-340)||(11322-11656)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-342)||(109366-109706)
scaffold0032 (1-314)||(54176-54486)
[»] scaffold0195 (5 HSPs)
scaffold0195 (129-342)||(20056-20268)
scaffold0195 (131-342)||(17974-18184)
scaffold0195 (131-340)||(7940-8149)
scaffold0195 (131-340)||(13329-13538)
scaffold0195 (3-109)||(19920-20027)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (129-342)||(15149-15359)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (130-342)||(2124-2337)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (129-342)||(11210-11422)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-340)||(41242-41582)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (134-342)||(18862-19070)
scaffold0234 (290-342)||(18715-18767)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (129-340)||(12863-13074)
scaffold0083 (1-109)||(12727-12834)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (4-342)||(6078-6424)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (129-335)||(40263-40468)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (129-342)||(32247-32460)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (129-342)||(248824-249036)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (4-342)||(13478-13824)
scaffold0396 (1-333)||(15979-16311)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (130-342)||(27797-28007)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (130-342)||(6644-6857)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-342)||(4377-4718)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (131-342)||(14345-14557)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-342)||(270656-270999)
scaffold0009 (1-342)||(236710-237059)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (131-342)||(8745-8956)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (131-342)||(69432-69643)
scaffold0031 (129-334)||(30740-30946)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (129-342)||(27686-27899)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (129-342)||(256192-256405)
scaffold0011 (129-342)||(124576-124787)
scaffold0011 (129-342)||(193278-193489)
scaffold0011 (131-342)||(75977-76186)
scaffold0011 (165-342)||(262798-262975)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (129-342)||(1848-2059)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (131-342)||(90169-90376)
scaffold0028 (130-342)||(129051-129260)
scaffold0028 (193-255)||(78409-78471)
scaffold0028 (1-40)||(128924-128963)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (132-342)||(13025-13235)
scaffold0359 (301-342)||(161-202)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-321)||(4902-5223)
scaffold0266 (1-40)||(12786-12825)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (98-321)||(7614-7837)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (130-342)||(6434-6644)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (131-342)||(70681-70892)
scaffold0037 (129-342)||(26009-26221)
scaffold0037 (296-340)||(93527-93571)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (129-335)||(686-892)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (129-342)||(3290-3500)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (129-342)||(71736-71949)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-342)||(60103-60451)
scaffold0068 (157-342)||(46819-47003)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (131-342)||(21325-21536)
scaffold0008 (129-321)||(129504-129696)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (4-342)||(138096-138440)
scaffold0021 (129-342)||(87106-87316)
scaffold0021 (129-342)||(10328-10543)
scaffold0021 (129-205)||(77048-77124)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (131-342)||(7459-7671)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (132-324)||(14567-14757)
scaffold0138 (225-342)||(28256-28375)
scaffold0138 (225-342)||(40252-40371)
scaffold0138 (290-340)||(28472-28522)
scaffold0138 (290-340)||(40468-40518)
scaffold0138 (193-255)||(23801-23863)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (1-275)||(614-888)
scaffold0269 (134-275)||(15004-15144)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (55-342)||(145-432)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (129-342)||(5893-6104)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (130-342)||(2975-3187)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (129-305)||(4794-4970)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (131-342)||(3326-3537)
scaffold0434 (4-109)||(3191-3295)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-284)||(4092-4375)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-284)||(48932-49215)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-333)||(6441-6773)
scaffold0022 (129-281)||(108314-108467)
scaffold0022 (182-255)||(106297-106370)
scaffold0022 (297-342)||(113842-113887)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-333)||(106536-106867)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (131-336)||(1916-2121)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-248)||(197482-197726)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (55-333)||(51620-51897)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (131-333)||(6634-6831)
[»] scaffold1560 (2 HSPs)
scaffold1560 (130-296)||(1116-1287)
scaffold1560 (1-40)||(1371-1410)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (132-342)||(6549-6770)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (230-342)||(20580-20692)
scaffold0039 (129-184)||(20686-20741)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (96-268)||(9284-9455)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (225-342)||(17684-17802)
scaffold0244 (225-340)||(24105-24221)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (131-223)||(27241-27333)
scaffold0120 (220-342)||(29942-30065)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (130-281)||(4507-4658)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (129-333)||(145592-145794)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (1-240)||(14836-15073)
scaffold0225 (1-169)||(28357-28523)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (165-282)||(58899-59016)
scaffold0051 (278-320)||(59375-59417)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (129-342)||(20362-20586)
scaffold0150 (129-342)||(27191-27415)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (225-342)||(34329-34447)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (162-321)||(4469-4627)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (129-342)||(2742-2966)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (194-340)||(5723-5867)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (129-342)||(2082-2306)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (129-189)||(966-1026)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (290-342)||(164-216)
scaffold1734 (277-342)||(1-67)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (251-342)||(3077-3169)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (129-252)||(6021-6145)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (182-255)||(4728-4801)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (182-255)||(7041-7114)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (290-339)||(53279-53328)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (290-342)||(23898-23950)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (131-255)||(3667-3793)
scaffold0243 (4-122)||(3811-3929)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (182-255)||(71655-71728)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (129-254)||(7261-7387)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (297-342)||(425-470)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (183-255)||(117977-118049)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (212-255)||(12943-12986)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (297-342)||(43242-43287)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-37)||(1-37)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 34822733 - 34823072
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822733 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 34822832  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  34822833 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 34822931  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34822932 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttc 34823030  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34823031 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 34823072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 12726588 - 12726927
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726588 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 12726687  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  12726688 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 12726786  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12726787 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcttagtattcaccatcacacttc 12726885  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12726886 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 12726927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12643647 - 12643308
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643647 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcgcacctgccttacaataatctcgaag 12643548  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  12643547 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 12643449  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643448 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatggccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 12643350  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12643349 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 12643308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3800734 - 3800396
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800734 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 3800635  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  3800634 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacaactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 3800535  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3800534 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatt 3800438  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  3800437 aacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaact 3800396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12637786 - 12637448
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637786 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 12637687  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  12637686 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 12637588  T
Q  201 taggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12637587 taggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 12637491  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12637490 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 12637448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 8942181 - 8942522
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942181 taaatgcacttggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 8942280  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  8942281 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 8942380  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8942381 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 8942479  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  8942480 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 8942522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23773072 - 23773407
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23773072 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 23773171  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  23773172 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 23773270  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23773271 taggacaacacccaattatattgattatctcgacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 23773367  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23773368 aacatatttataaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 23773407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21276148 - 21275810
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276148 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatctcgaag 21276050  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||    
T  21276049 taaaagagctcaacccttttacagcaacgtcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatat 21275950  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21275949 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 21275853  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21275852 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 21275810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 21140412 - 21140749
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140412 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatctcgaag 21140510  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  21140511 taaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatgaacatgtataagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 21140610  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21140611 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaa-catgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 21140706  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21140707 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 21140749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24687290 - 24686954
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687290 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaactttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 24687191  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  24687190 taaaagagttcaactcttttacaacaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 24687092  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24687091 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcctacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 24686995  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24686994 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 24686954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5889917 - 5889580
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5889917 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 5889820  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  5889819 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 5889720  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5889719 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 5889623  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5889622 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 5889580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17398217 - 17397895
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17398217 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 17398118  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  17398117 taaaagagtcatccattttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 17398019  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca-cat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |     
T  17398018 taggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacagaaa 17397920  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  17397919 caacttgattatcaacaatcaacaa 17397895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19888399 - 19888063
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19888399 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 19888302  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  19888301 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 19888203  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19888202 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 19888106  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19888105 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 19888063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14908059 - 14907721
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14908059 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 14907962  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  14907961 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 14907863  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14907862 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 14907764  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  14907763 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 14907721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 20013658 - 20013996
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20013658 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 20013755  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  20013756 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 20013854  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20013855 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 20013953  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  20013954 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 20013996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 23818715 - 23819053
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23818715 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 23818812  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  23818813 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 23818911  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23818912 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 23819010  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23819011 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 23819053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11232872 - 11232537
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11232872 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 11232775  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  11232774 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 11232676  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11232675 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 11232579  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11232578 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 11232537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22514719 - 22514384
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22514719 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 22514622  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  22514621 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 22514523  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22514522 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 22514426  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22514425 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 22514384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 8886668 - 8887016
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  8886668 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttaca-taatctctgaa 8886765  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8886766 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatacatggacatgtaacaagactcgataatgcgataacaat-cacaattttct 8886864  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  8886865 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatc 8886964  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8886965 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 8887016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28777320 - 28776985
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28777320 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 28777223  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  28777222 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 28777124  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28777123 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagaattcatcatcacacat 28777027  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28777026 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 28776985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43644595 - 43644259
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||   |  |||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  43644595 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctt-cgttgaatcaagcacatcgtatgtaagggttcacacccgcctcaca-taatcttcgaagta 43644498  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatat 201  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43644497 aaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacttgtaacaaaactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatat 43644400  T
Q  202 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43644399 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagcattcatcatcacacatca 43644300  T
Q  302 acatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43644299 acatgattatcaataatcaacattgtcattcaacatcaact 43644259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22282653 - 22282994
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  22282653 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 22282750  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22282751 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccataa 22282848  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22282849 tatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 22282948  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22282949 tatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaact 22282994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22273420 - 22273761
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcg- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| |||||||      
T  22273420 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctctt 22273517  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||   | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22273518 aagtaaaagagctcaactcttttacaactata-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 22273615  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22273616 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaacatgcacattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 22273715  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22273716 tatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaact 22273761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 15631925 - 15632269
Alignment:
Q  2 aaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaag 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  15631925 aaatgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcaccttt-gatgcctcttgaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaag 15632022  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctc 191  Q
    |||||||| | | ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||      
T  15632023 taaaagagcttaacccttttacaactacaaatacaacacgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattctcaa 15632121  T
Q  192 cacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15632122 cacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcaattgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatca 15632221  T
Q  292 tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15632222 tcccacattaacatgattatcaataatcaacgacatcattcaacatca 15632269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22862015 - 22862363
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  22862015 taaatgcatgtggtacgagatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttaca-taatctccgaa 22862112  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        | ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22862113 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacaactataatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttct 22862211  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22862212 ccacaatatataggacaacactcaattatattgtttatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcattcacaattaaatcatagtattcatc 22862311  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  22862312 atcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaatatcaact 22862363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 25600626 - 25600837
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25600626 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 25600725  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25600726 ccgcaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat 25600825  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  25600826 tcaacatcaact 25600837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 461402 - 461609
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  461402 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 461501  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  461502 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttca 461599  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
    ||||||||||    
T  461600 ttcaacatca 461609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36892203 - 36891998
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  36892203 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctc 36892104  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36892103 cacaacattttcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatc-acatgattatcaataatcaacaatgtcatt 36892005  T
Q  332 caacatc 338  Q
    |||||||    
T  36892004 caacatc 36891998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 6878106 - 6878319
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878106 acgactatgatgcatggacaagtaacaagactcgataatgcgaccacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 6878204  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc-acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  6878205 ctccacatcctttgcattatcaagaaaacatgtccatacataattaaatcatagcattcatcatcgccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgt 6878304  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  6878305 tattcaacatcaact 6878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 24966960 - 24967173
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24966960 acgactatgattcatggacatgtatacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 24967059  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24967060 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacgaataaatcatagtattcatcaccacacgttatcatgattatcaataatcaacaacatc 24967159  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  24967160 attcaacattaact 24967173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9654323 - 9654140
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9654323 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattgttcatc 9654225  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  9654224 tccacatcatttgcattaacaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcatcacataacaacatgattatcaa 9654140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20628889 - 20628681
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||   || ||||||||||||| | |||||||||||||| | ||    
T  20628889 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgattat 20628790  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |    
T  20628789 ctccaca-ca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacat---catgattatcaataatcaacaatgac 20628695  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  20628694 attcaacatcaact 20628681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24828062 - 24827852
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24828062 cgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatc 24827963  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  24827962 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 24827866  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  24827865 attcaacatcaact 24827852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4449725 - 4449517
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  4449725 cgactatgatgcatggacatgtaacgagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgatcatt 4449626  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4449625 ttcgcaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaa-ccaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 4449527  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
    ||||||||||    
T  4449526 ttcaacatca 4449517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22691447 - 22691236
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22691447 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 22691348  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||  ||||| || ||   |||||| ||||||||||||||| ||    
T  22691347 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtctatacacaatcaaatcatactactcgtcatcatcaaat---catgatcatcaataatcaacaaagt 22691251  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||    
T  22691250 cattcaacattaact 22691236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22696094 - 22695883
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22696094 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 22695995  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||  ||||| || ||   |||||| ||||||||||||||| ||    
T  22695994 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtctatacacaatcaaatcatactactcgtcatcatcaaat---catgatcatcaataatcaacaaagt 22695898  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||    
T  22695897 cattcaacattaact 22695883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 7320150 - 7320365
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| | |    
T  7320150 acgactatgatacatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgataa 7320249  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7320250 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacaaaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 7320349  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  7320350 tcattcaacatcaact 7320365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22581431 - 22581216
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataag-gactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||| |||    
T  22581431 acgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatca 22581332  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22581331 tctccacaacgtttgcattatcaagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcattctcacaacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatg 22581232  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  22581231 tcattcaacatcaact 22581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Original strand, 269851 - 270029
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  269851 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcacc 269950  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgatt 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||| || |||   ||||||||||||||||||||    
T  269951 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaa-ccaatcagagaattattcatcacacatcaacatgatt 270029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25877395 - 25877233
Alignment:
Q  180 cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatca 279  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  25877395 cacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatggccatacacaattaattca 25877297  T
Q  280 tagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaac-aacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25877296 tagtattcattatcacacatcaacatgattatcaataatcaacgaatgtcattcaacatcaact 25877233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 298
Target Start/End: Original strand, 27260248 - 27260415
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27260248 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattgaccatct 27260347  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  27260348 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatatacaatcaattcatagtattcatcatcacaca 27260415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24572887 - 24572678
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||| |||||    
T  24572887 gactatgatgcatgaacatgtaacaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatc 24572788  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  24572787 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcacaagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaaaaatcaacaatgtc 24572688  T
Q  329 attcaacatc 338  Q
    |||| |||||    
T  24572687 attcgacatc 24572678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Original strand, 28972703 - 28972914
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||    
T  28972703 acgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatatatattgatca 28972802  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  28972803 tctccaca-catttgcattactaag-aaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgattatcaacaatcaacaatg 28972900  T
Q  327 tcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||||    
T  28972901 tcattcaacatcaa 28972914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22692825 - 22693028
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||    
T  22692825 taaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaa-aatctccga 22692922  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || ||||    
T  22692923 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaat 22693021  T
Q  198 atatagg 204  Q
    |||||||    
T  22693022 atatagg 22693028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22697472 - 22697675
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||    
T  22697472 taaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaa-aatctccga 22697569  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || ||||    
T  22697570 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaat 22697668  T
Q  198 atatagg 204  Q
    |||||||    
T  22697669 atatagg 22697675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Original strand, 721133 - 721257
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  721133 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 721232  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||||| || |||||||| ||||    
T  721233 tctccacaacaattgcattaccaag 721257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 333
Target Start/End: Original strand, 22693040 - 22693133
Alignment:
Q  240 ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22693040 ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 22693133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 333
Target Start/End: Original strand, 22697687 - 22697780
Alignment:
Q  240 ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22697687 ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 22697780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22787535 - 22787408
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||    
T  22787535 acgactatgatgcatggatatgttgcaaagactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgatca 22787436  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||    
T  22787435 tctccacaacaattgcattaccaagaaa 22787408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23822967 - 23822881
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacaca 268  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  23822967 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacaca 23822881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23832046 - 23831960
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacaca 268  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  23832046 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacaca 23831960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23824911 - 23824838
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23824911 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 23824838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19670577 - 19670515
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19670577 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 19670515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4663
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4735 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaa 4663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24296031 - 24295958
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24296031 caattttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaa 24295958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 19658677 - 19658739
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19658677 acaatataaaggacaacttccagatatgttgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 19658739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 721313 - 721358
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  721313 catcaacataatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaact 721358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19434913 - 19434844
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  19434913 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgaattatcaag 19434844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 19658480 - 19658583
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatc-tcgaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  19658480 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatcttcgaagta 19658577  T
Q  103 aaagag 108  Q
    ||||||    
T  19658578 aaagag 19658583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22787355 - 22787310
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22787355 catcaacatgatcatcaataatccacaatatcattcaacatcaact 22787310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 25877652 - 25877615
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt 41  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25877652 atgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacctt 25877615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 369424 - 369765
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  369424 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaag 369522  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  369523 taaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatat 369622  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  369623 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 369722  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  369723 caacatgattatcaataatcaacaatgtcctttaacatcaact 369765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 13757117 - 13757456
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757117 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 13757216  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||    
T  13757217 taaaagagtcatccattttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatata 13757316  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13757317 taggacgacacccaattatattgattatctccaca-ca-ttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatc 13757414  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13757415 aacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13912738 - 13912399
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13912738 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 13912639  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  13912638 taaaagagtcatcccttttacagcaacaccgactatgatgcatggacatgtataatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 13912540  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13912539 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacatttc 13912441  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13912440 aacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaact 13912399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15952720 - 15952382
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15952720 taaatgcatgtggtaccaagtctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcaaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcaaag 15952621  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    |||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||    
T  15952620 taaaagagttcaaccttttacaacaacaacgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatata 15952521  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952520 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatc 15952424  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15952423 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 15952382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26010817 - 26010477
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26010817 taaatgcatgcggtgccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 26010718  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  26010717 taaaagagttcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 26010619  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  26010618 ataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaaggaaacatgtccacacacagttacatcaaagcattcatcatcacacat 26010520  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26010519 caacatgattatcaataatccacaatgtcattcaacatcaact 26010477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42057788 - 42057458
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42057788 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 42057689  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  42057688 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 42057590  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  42057589 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaat 42057491  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  42057490 aacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 42057458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 10988150 - 10988468
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10988150 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 10988249  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  10988250 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 10988348  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca-cat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  10988349 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaaggaa-catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaccaa 10988446  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaa 321  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  10988447 caacttgattatcaacaatcaa 10988468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25293903 - 25293575
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293903 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 25293804  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  25293803 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 25293705  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25293704 taggacaacacccaattatattgattatcttcacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaac 25293606  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    ||  ||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  25293605 aatttgactatcaacaatcaataacatcatt 25293575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16417006 - 16417342
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16417006 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatgggcaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 16417103  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  16417104 gtaaaagagtcatcccttttacaacaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 16417202  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417203 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaattatagtattcaccatcacacat 16417299  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16417300 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16417342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15443183 - 15442845
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15443183 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 15443086  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  15443085 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 15442987  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15442986 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 15442888  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15442887 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 15442845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27103171 - 27102836
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27103171 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 27103074  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  27103073 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 27102975  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27102974 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 27102878  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27102877 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 27102836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27110519 - 27110184
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27110519 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 27110422  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  27110421 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 27110323  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27110322 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 27110226  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27110225 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 27110184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 27175155 - 27175490
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27175155 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 27175252  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  27175253 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 27175351  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27175352 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 27175448  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27175449 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 27175490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38785263 - 38784928
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38785263 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 38785166  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  38785165 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 38785067  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38785066 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 38784970  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38784969 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 38784928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15526080 - 15525769
Alignment:
Q  32 tcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| |||| |    
T  15526080 tcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtttaacctttttacagcaacatc 15525981  T
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15525980 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatct 15525881  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15525880 ccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcacacacacaaatagatcatagtattcatcattcacataataacttgattatcaacaatcaacaatgtca 15525782  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15525781 ttcaacatcaact 15525769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7821463 - 7821798
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7821463 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 7821560  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  7821561 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 7821659  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7821660 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 7821756  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7821757 caacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 7821798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7828774 - 7829109
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7828774 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 7828871  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  7828872 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 7828970  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7828971 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 7829067  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7829068 caacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 7829109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 11514661 - 11514999
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11514661 taaatgcatgcggtaccaaatctctacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 11514758  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||    
T  11514759 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatat 11514857  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11514858 ataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 11514956  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  11514957 caacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaact 11514999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 7291519 - 7291731
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291519 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 7291617  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291618 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 7291717  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  7291718 attcaacatcaact 7291731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 3058587 - 3058925
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||| | ||||||| |||    
T  3058587 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttata-taatctccgaa 3058683  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3058684 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 3058781  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3058782 tataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacaca 3058881  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3058882 tcaacatgattatcaataatcaacagtatcattcaacatcaact 3058925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30263748 - 30263410
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||  |  |||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30263748 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggttgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatataag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 30263651  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||    
T  30263650 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatat 30263552  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30263551 ataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 30263453  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  30263452 caacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaact 30263410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32496182 - 32495840
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||| |    
T  32496182 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcgttaca-taatctccg 32496085  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32496084 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 32495987  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-c 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  32495986 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacc 32495887  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32495886 acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 32495840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 2027095 - 2027435
Alignment:
Q  2 aaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg---ccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||   | |||  ||||||| ||||||| | |||| || | |||||| ||||||| |    
T  2027095 aaatgcatgtggtaccaaatctcgaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaact--cacatcgtatgtaagggttcacccccgacttaca-taatctccg 2027190  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-ttttctccaca 195  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2027191 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcgtggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaaattttctccaca 2027288  T
Q  196 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027289 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacacgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcac 2027388  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2027389 acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattgaacatcaact 2027435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2192193 - 2191982
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192193 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacagcaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 2192095  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2192094 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacaaaaataaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatca 2191995  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  2191994 ttcaacattaact 2191982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 55 - 342
Target Start/End: Original strand, 125418 - 125704
Alignment:
Q  55 cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgta 152  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  125418 cacatcgtatgtaagggtttacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgta 125515  T
Q  153 taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  125516 acaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaag 125614  T
Q  253 aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  125615 aaaacatgcccattcacgattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaact 125704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 112795 - 112583
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112795 acgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacatcacccaattatattgttcat 112697  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  112696 ctccacatcatttgctttatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtgtc 112597  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  112596 attcaacatcaact 112583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45453754 - 45453542
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaaca-cccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45453754 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattgttcatc 45453655  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45453654 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtca 45453555  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  45453554 ttcaacatcaact 45453542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 142296 - 142506
Alignment:
Q  133 ctatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142296 ctatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcc 142395  T
Q  233 acatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||    
T  142396 acatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacataatcatcaataatcaacaatgttatt 142495  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  142496 caacatcaact 142506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15761993 - 15761673
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15761993 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaa 15761897  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15761896 gtaaaagagttcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattt-ctccacaata 15761800  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15761799 tataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccac 15761700  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15761699 atcaacatgatcatcaataatcaacaa 15761673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13867573 - 13867360
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  13867573 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattatattgattat 13867474  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  13867473 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtt 13867374  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    || |||||||||||    
T  13867373 atccaacatcaact 13867360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1938266 - 1938057
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938266 gactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaattca--attttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 1938169  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1938168 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcattcataattaaatcataatattcatcattacacatcaacattattatcaataatcaacaatgtcat 1938069  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  1938068 tcaacatcaact 1938057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12545211 - 12544998
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12545211 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattat 12545112  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12545111 ctccacaacatttccattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 12545012  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  12545011 attcaacatcaact 12544998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 44863908 - 44864121
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44863908 acgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 44864007  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||    
T  44864008 ctccacagcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattagcatgattatcaatgatcaacaatgtc 44864107  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  44864108 attcaacatcaact 44864121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 47288440 - 47288653
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47288440 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgattat 47288539  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47288540 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 47288639  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  47288640 attcaacatcaact 47288653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 16210447 - 16210657
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||    
T  16210447 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgattatc 16210546  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16210547 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccaacacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtca 16210644  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  16210645 ttcaacatcaact 16210657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18981403 - 18981192
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  18981403 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 18981305  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18981304 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacatacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 18981206  T
Q  330 ttcaa-catcaact 342  Q
    ||||| ||||||||    
T  18981205 ttcaatcatcaact 18981192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26071764 - 26071552
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  26071764 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattat 26071665  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26071664 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatc-acatgattatcaataatcaacaatgtc 26071566  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  26071565 attcaacattaact 26071552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26095551 - 26095339
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  26095551 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattat 26095452  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26095451 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatc-acatgattatcaataatcaacaatgtc 26095353  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  26095352 attcaacattaact 26095339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11582338 - 11582128
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||    
T  11582338 cgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgattatc 11582239  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11582238 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 11582141  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  11582140 ttcaacatcaact 11582128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 36051331 - 36051541
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  36051331 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 36051430  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36051431 tccaca-catt-gcattattaagtaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattttcaataatcaacaatgtca 36051528  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  36051529 ttcaacatcaact 36051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 3893625 - 3893971
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  3893625 taaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacctgtcttaca-taatctccgaa 3893722  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3893723 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttca 3893821  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  3893822 ccacaatatatatgacaacacccatttatattgttcatctccacaacatttacattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatc 3893921  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3893922 a--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 3893971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13038602 - 13038392
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||    
T  13038602 cgactatgatgcttgaacatgtatagggactcaataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccgattatattgattatc 13038503  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13038502 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 13038405  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  13038404 ttcaacatcaact 13038392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16480432 - 16480222
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16480432 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 16480334  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16480333 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccatatacaattacatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 16480235  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  16480234 ttcaacatcaact 16480222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12249610 - 12249398
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  12249610 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatatattgatcatct 12249511  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12249510 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtca 12249411  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  12249410 ttcaacatcaact 12249398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15823909 - 15823692
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  15823909 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattatattgattat 15823810  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatag----tattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15823809 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtatatattcaccatcacatattaacatgattatcaataatcaacaa 15823710  T
Q  325 cgtcattcaacatcaact 342  Q
     || || |||||||||||    
T  15823709 tgttatccaacatcaact 15823692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 11285878 - 11286091
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||  |||| ||||||| ||||||    
T  11285878 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggagaacttccaaatatattgatcatct 11285977  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccat--cacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11285978 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 11286077  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  11286078 attcaacatcaact 11286091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 15926034 - 15926242
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15926034 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 15926133  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15926134 tccacaaca-ttgcattatcaag-aaacatgcc--cacacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatc-acatgattatcaataatcaacaatgtc 15926228  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  15926229 attcaacatcaact 15926242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 12753549 - 12753759
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||||||    
T  12753549 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattt-caccacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatct 12753647  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12753648 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaacaaattatagtactcatctccacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcat 12753747  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  12753748 tcaacatcaact 12753759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 2436167 - 2436456
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |    ||||||  ||||||| | |||| |||    |||| ||||||| |||    
T  2436167 taaatgcatgtggtaccaaatctcaaaaaggtcgtcaccttt-gatgataaaa-cacatcacatgtaaggggtcactcct----taca-taatctccgaa 2436259  T
Q  100 gtaaaagagtc-atcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| | | | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||    
T  2436260 gtaaaagagccgaactcttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaata 2436359  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2436360 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaaaatgtccacacacaattaattcatagtattcatcatcaca 2436456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18255448 - 18255108
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  18255448 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccga 18255351  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||| | | | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||    
T  18255350 agtaaaagcgcttagcccttttacaacaaca-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaat 18255252  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag-aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||| || ||||    
T  18255251 atataggacaacacccaattatattgattatccccacaaca-ttacattatcaagcaaaacatgcccacatacaaatagattatagtattcatcattcac 18255153  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  18255152 accataacttgattatcaacaatcaacaaagacattcaacttcaa 18255108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16571587 - 16571375
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca-at-tatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||   || || ||||||| ||||||    
T  16571587 tatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatct 16571488  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16571487 caacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtca 16571388  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  16571387 ttcaacattaact 16571375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Original strand, 16594075 - 16594287
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca-at-tatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||   || || ||||||| ||||||    
T  16594075 tatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatct 16594174  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16594175 caacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtca 16594274  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  16594275 ttcaacattaact 16594287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 334
Target Start/End: Original strand, 13571525 - 13571701
Alignment:
Q  157 gactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13571525 gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa 13571622  T
Q  257 catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaa 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  13571623 catgcccaaacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattcaa 13571701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 13273407 - 13273631
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  13273407 acgactatgatgcatggacatataacaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 13273506  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcac-acatcaacatgattatcaataa 317  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| |         |||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  13273507 tctccacaacaattgcattatcaagaaatcatgtccatacacaatcaattcataattcaaacaagattcattatcacaacaacaacatgatcatcaataa 13273606  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  13273607 tcaacaatgtaattcaacatcaact 13273631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15518482 - 15518422
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcg 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15518482 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcg 15518422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39048049 - 39047977
Alignment:
Q  270 aattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39048049 aattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaact 39047977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49049301 - 49049078
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||    
T  49049301 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaatatgttgatca 49049202  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcaca-catcaacatgattatcaataa 317  Q
    |||||||  || |||||||||||||||| |||| | | ||||||| || ||||| |         ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  49049201 tctccaccacaattgcattatcaagaaatcatgtctatacacaatcaagtcatatttcaaataagattcatcatcacatcatcaacatgatcatc-ataa 49049103  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    
T  49049102 ttaacaatgtcattcaacatcaact 49049078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Original strand, 15629436 - 15629579
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||    
T  15629436 cgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcat 15629535  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaat 272  Q
     |||||| || ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  15629536 ttccacaacaattgtattatcaagaaatcatgtccatacacaat 15629579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10862356 - 10862231
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-ttttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||| || |||| ||    
T  10862356 acgactatgatgcatggacatgtagcaaatactcgataatgcgacatcacctcacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatacattgatc 10862257  T
Q  227 atctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||    
T  10862256 atctccacaacaattgcattaccaag 10862231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15761558 - 15761509
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15761558 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 15761509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 342
Target Start/End: Original strand, 15629613 - 15629659
Alignment:
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15629613 acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 15629659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 15851163 - 15851204
Alignment:
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15851163 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 15851204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 1938403 - 1938362
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1938403 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttt 1938362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9058076 - 9058007
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9058076 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag 9058007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2191884 - 2191832
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  2191884 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaact 2191832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15914069 - 15913948
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  15914069 taaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaa 15913972  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttaca 122  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15913971 gtaaaagagctcaacccttttaca 15913948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 13376423 - 13376461
Alignment:
Q  217 tatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13376423 tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 13376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15913875 - 15913817
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaa 251  Q
    |||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15913875 acaatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa 15913817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 11341173 - 11341512
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341173 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 11341272  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  11341273 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 11341371  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11341372 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttc 11341470  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11341471 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 11341512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4201707 - 4201368
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201707 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgtcacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 4201608  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||    
T  4201607 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttcaaactcaatata 4201509  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4201508 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttc 4201410  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4201409 aacatgattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaact 4201368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1221473 - 1221134
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221473 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagttcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 1221374  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||    
T  1221373 taaaagagttcaacccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatat 1221274  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1221273 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 1221177  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1221176 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 1221134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22884924 - 22884582
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884924 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttttgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 22884825  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  22884824 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 22884725  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22884724 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 22884626  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaactg 343  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22884625 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactg 22884582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25425159 - 25425495
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425159 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 25425258  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||    
T  25425259 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatata 25425357  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425358 taggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaa-catgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacatc 25425453  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25425454 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 25425495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9732404 - 9732069
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaagtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9732404 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaagtaa 9732306  T
Q  104 aagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatatag 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||||||    
T  9732305 aagagttatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatatag 9732207  T
Q  204 gacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732206 gacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaac 9732108  T
Q  304 atgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9732107 atgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 9732069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23327490 - 23327825
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23327490 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 23327589  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  23327590 taaaagagtcatctcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 23327688  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23327689 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgtccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 23327785  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23327786 aacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 23327825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24595038 - 24595373
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24595038 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 24595137  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  24595138 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacaactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 24595236  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24595237 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 24595333  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24595334 aacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa 24595373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 110725 - 110385
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110725 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatctcgaag 110627  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  110626 taaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 110527  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  110526 acaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacct 110428  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  110427 caacatgattattaataatcaacaatgtcatccaacatcaact 110385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16534844 - 16535183
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16534844 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 16534941  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16534942 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtaacaagacttgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatat 16535040  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16535041 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatatacaatcaaatcatagtattcaccatcacacat 16535140  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16535141 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16535183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 19498337 - 19498655
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498337 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 19498436  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  19498437 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgtatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 19498535  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498536 taggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaagaaa-catgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacatc 19498631  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19498632 aacatgattatcaataatcaacaa 19498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43445498 - 43445155
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43445498 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 43445399  T
Q  101 taaaagagtcatccctt---ttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||    
T  43445398 taaaagagtcatcccttttattacagcaacaacgactatgatgcatggatatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaat 43445299  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-ca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  43445298 atataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaat-aatcatagtattcaccatcatca 43445201  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  43445200 catcaacatgatcatcaataatccacaatgatattcaacatcaact 43445155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11213344 - 11213007
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213344 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 11213245  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  11213244 taaaagagttcaacccttttacagccaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaatactagataatgcgaca-caat-cacaattttcaacacaatat 11213148  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11213147 ataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccgcacacaattagatcatagtattcatcatcacacat 11213048  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11213047 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 11213007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10779920 - 10779582
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10779920 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatctcaaag 10779822  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  10779821 taaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 10779722  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10779721 atatgataacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcataatattcatcatcacacat 10779625  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10779624 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 10779582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 27008549 - 27008879
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008549 taaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 27008648  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  27008649 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 27008747  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27008748 taggacaacacccaattatattgattatctccaccacatt-gcattaccaagaaaacatgcccatatacagttaaatcatagtattcatcatcacacaac 27008846  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  27008847 aatttgattatcaacaatcaataacatcattca 27008879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22368225 - 22367887
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22368225 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaag-gctcacccctgccttacaataatctcgaa 22368128  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||    
T  22368127 gtaaaagagctcaacccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaata 22368028  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22368027 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacaca 22367931  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22367930 tcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 22367887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21075229 - 21074892
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21075229 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 21075132  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  21075131 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 21075032  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21075031 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 21074935  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21074934 caacatgattatcaataatcaacaatgtcgttcaacatcaact 21074892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10888 - 11224
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10888 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 10985  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  10986 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 11084  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11085 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 11181  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11182 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 11224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29192358 - 29192023
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29192358 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 29192261  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  29192260 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgg-taagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 29192163  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29192162 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 29192066  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29192065 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 29192023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25192611 - 25192399
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25192611 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaa-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcat 25192513  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25192512 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 25192413  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  25192412 attcaacatcaact 25192399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21235147 - 21234808
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaa-tctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcga 98  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21235147 taaatgtatgcggtaccaaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcga 21235050  T
Q  99 agtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | |||||    
T  21235049 agtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaata 21234951  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21234950 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacact 21234852  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21234851 tcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 21234808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21933900 - 21933565
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21933900 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 21933803  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  21933802 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 21933704  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21933703 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 21933607  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21933606 caacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 21933565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21940070 - 21939735
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21940070 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 21939973  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  21939972 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 21939874  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21939873 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 21939777  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21939776 caacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 21939735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 35580792 - 35581127
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35580792 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 35580889  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  35580890 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 35580988  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35580989 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 35581085  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35581086 caacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 35581127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37010904 - 37010569
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37010904 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaa-agctcacctctgccttacaataatctcgaa 37010807  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  37010806 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 37010708  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  37010707 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcgtcatcacacat 37010611  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37010610 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 37010569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25902066 - 25901728
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25902066 taaatgcatgcggtaccaaatctctataaggtcgtcacctt-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 25901969  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | ||||||    
T  25901968 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatat 25901870  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25901869 ataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattactaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 25901771  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  25901770 caacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaact 25901728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 37051522 - 37051857
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  37051522 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgcctcacaataatctcgaa 37051619  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  37051620 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgcaaagactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 37051718  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37051719 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 37051817  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  37051818 caacgtaattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatca 37051857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 20615150 - 20615476
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20615150 taaatgcatgcgctaccaaatctctacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcacatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 20615247  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  20615248 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaagactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 20615346  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20615347 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 20615445  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20615446 caacataattatcaataatcaacaatgtcat 20615476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 130 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35792746 - 35792544
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792746 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 35792648  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35792647 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatca 35792548  T
Q  330 ttca 333  Q
    ||||    
T  35792547 ttca 35792544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 11582539 - 11582752
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  11582539 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattat 11582638  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11582639 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 11582738  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  11582739 attcaacatcaact 11582752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 21649463 - 21649707
Alignment:
Q  97 gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccaca 195  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21649463 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccaca 21649560  T
Q  196 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21649561 atatataggataacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattac 21649660  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21649661 acatcaacatgattatcaataatcaacgatgtcattcaacatcaact 21649707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 21392853 - 21393066
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  21392853 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgattat 21392952  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21392953 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 21393052  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  21393053 attcaacatcaact 21393066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4863796 - 4864145
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  4863796 taaatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttaca-taatctccgaa 4863893  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        ||| |||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4863894 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatgcatggacatgtaataaaactcaataatgcgacaacaat-cacaattttct 4863992  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  4863993 ccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatc 4864092  T
Q  291 atca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4864093 atcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 4864145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1170157 - 1169944
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  1170157 acgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattat 1170058  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1170057 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 1169958  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  1169957 attcaacatcaact 1169944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 7424343 - 7424553
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  7424343 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 7424441  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424442 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 7424540  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  7424541 ttcaacatcaact 7424553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17473384 - 17473172
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  17473384 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 17473285  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17473284 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcttatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatca 17473185  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  17473184 ttcaacattaact 17473172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21652896 - 21652685
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  21652896 gactataatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattattt 21652797  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21652796 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgttcatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat 21652697  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||| ||||    
T  21652696 tcaacattaact 21652685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24184708 - 24184499
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24184708 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatc 24184609  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24184608 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaccaaatcatggaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 24184509  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
    ||||||||||    
T  24184508 ttcaacatca 24184499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Original strand, 20710802 - 20711012
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  20710802 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattat 20710901  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20710902 ctccacaacattcgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatc-acatgattatcaataatcaacaatgtc 20711000  T
Q  329 attcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||    
T  20711001 attcaacatcaa 20711012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 28258265 - 28258479
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  28258265 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattac 28258364  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaa-catgattatcaataatcaac-aacg 326  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  28258365 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaatcatgattatcattaatcaacaaatg 28258463  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  28258464 tcattcaacatcaact 28258479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 23513461 - 23513674
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23513461 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 23513560  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
     |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  23513561 atccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaaatagatcatagtaatcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgt 23513659  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  23513660 cattcaacatcaact 23513674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27185327 - 27185116
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27185327 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatct 27185229  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  27185228 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtctatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtta 27185129  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  27185128 ttcaacatcaact 27185116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18779607 - 18779396
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||    
T  18779607 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatatatgacgacaaccaattatattgattatc 18779509  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaa-catgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  18779508 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaatcatgattatcgataatcaacaatgtc 18779410  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  18779409 attcaacatcaact 18779396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 19404244 - 19404459
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  19404244 acgactatgatgcacggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgttca 19404343  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19404344 tctccaccacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 19404443  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  19404444 tcattcaacatcaact 19404459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 324
Target Start/End: Original strand, 23510655 - 23510847
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23510655 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 23510754  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23510755 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacatgcaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaa 23510847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11338360 - 11338149
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||   |||  ||||||| ||||||    
T  11338360 gactatgatgcatcgacatgtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaa-ttccatatatattgatcatct 11338262  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11338261 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtca 11338162  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  11338161 ttcaacattaact 11338149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 23453614 - 23453829
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  23453614 acgactatgatgcatggacatgtaacaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 23453713  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  23453714 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatg 23453813  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||||    
T  23453814 tcattcaaaatcaact 23453829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 23465119 - 23465334
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  23465119 acgactatgatgcatggacatgtaacaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 23465218  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  23465219 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatg 23465318  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||||    
T  23465319 tcattcaaaatcaact 23465334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 238 - 314
Target Start/End: Original strand, 24474367 - 24474443
Alignment:
Q  238 atttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24474367 atttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaa 24474443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 24470968 - 24471048
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaaca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470968 acgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaaca 24471048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Original strand, 3672657 - 3672780
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  3672657 cgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcat 3672756  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  3672757 ctccacaacaattgcattatcaag 3672780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5452314 - 5452190
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||  |||||| |||    
T  5452314 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaacatattgatca 5452215  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||| | || |||||||| ||||    
T  5452214 tctccagaacaattgcattaccaag 5452190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1169848 - 1169796
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1169848 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 1169796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17473075 - 17473023
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17473075 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 17473023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Original strand, 7727296 - 7727369
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7727296 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaa 7727369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32967609 - 32967547
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32967609 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 32967547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492794
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23492722 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt-cattatcaagaaa 23492794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 242
Target Start/End: Original strand, 24473191 - 24473228
Alignment:
Q  205 acaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24473191 acaacacccaattatattgttcatctccacatcatttg 24473228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43445060 - 43445013
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43445060 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 43445013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 431149 - 431221
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  431149 aattttcacaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa 431221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35792456 - 35792404
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  35792456 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaact 35792404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32967809 - 32967688
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  32967809 taaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaa 32967712  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttaca 122  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32967711 gtaaaagagctcaacccttttaca 32967688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 35792871 - 35792832
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35792871 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 35792832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Original strand, 21615735 - 21615804
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  21615735 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag 21615804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 23492534 - 23492641
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  23492534 taaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaa 23492631  T
Q  100 gtaaaagagt 109  Q
    ||||||||||    
T  23492632 gtaaaagagt 23492641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24226911 - 24226842
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  24226911 aattttcacgacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaag 24226842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 28888648 - 28888709
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaa 254  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28888648 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaa 28888709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22356186 - 22355847
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356186 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 22356087  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  | |||||||    
T  22356086 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacagttcacaatct-caactcaatata 22355988  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22355987 taggacaacacccaattatattggttatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttc 22355889  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22355888 aacatgattatcaatattcaacaatgtcattcaacatcaact 22355847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 19999062 - 19999400
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999062 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttccgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 19999161  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  19999162 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 19999261  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999262 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagcaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatc 19999358  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19999359 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 19999400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 47355860 - 47356201
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355860 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 47355959  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  47355960 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 47356059  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47356060 taggacaacacccaattatattgattatctccacatta-ttgcattatcaagaaaacattcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 47356158  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  47356159 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 47356201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 14950555 - 14950893
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14950555 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcatacctgccttacaataatctcgaag 14950654  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  14950655 taaaagagtcatcccttttacagcaaca-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 14950752  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14950753 taggacaacacccaattatattgattatctccacaatatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaaattaaatcatagtattcatcaacacacatc 14950851  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14950852 aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 14950893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15274382 - 15274043
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15274382 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggttgtcaccttccgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctaccttacaataatctcgaag 15274283  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  15274282 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 15274184  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274183 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 15274085  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15274084 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 15274043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26338020 - 26338355
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26338020 taaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 26338119  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  26338120 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 26338218  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26338219 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 26338315  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26338316 aacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 26338355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5684526 - 5684185
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684526 taaatgcatgtgataccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaaggactcacacctgccttacaataatctcgaag 5684427  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5684426 taaaagagctcaactcttttacagccaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttgtccacaatat 5684329  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-caca 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5684328 ataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccaca 5684229  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5684228 tcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 5684185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13049786 - 13049467
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13049786 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 13049687  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  13049686 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 13049588  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-at 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  13049587 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaa 13049489  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaa 321  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  13049488 caacttgattatcaacaatcaa 13049467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 26678579 - 26678908
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678579 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcatctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 26678678  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||    
T  26678679 taaaagaatcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttcaaactcaatata 26678777  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||          ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  26678778 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat----------acatgcccatacacaatttaatcatgatattcaccatcacacttc 26678866  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26678867 aacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaact 26678908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 110017 - 110355
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  110017 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaa 110113  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  110114 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccataata 110211  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  110212 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacaca 110311  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  110312 tcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 110355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16329545 - 16329207
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16329545 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 16329448  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  16329447 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 16329349  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16329348 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 16329250  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  16329249 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 16329207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10487206 - 10487544
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10487206 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 10487303  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  10487304 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 10487402  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10487403 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 10487501  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  10487502 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 10487544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 18246725 - 18247061
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18246725 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctct-gatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 18246822  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |  | ||||||    
T  18246823 gtaaaagagtaatcccttttacagcaacaacaactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaaaaaatcacaatct-caactcaatat 18246921  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18246922 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 18247018  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18247019 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 18247061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7133945 - 7133732
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133945 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 7133846  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7133845 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcgcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 7133746  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  7133745 attcaacatcaact 7133732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16521323 - 16521663
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgc--acatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||  ||  ||  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  16521323 taaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctc-cgatgg-acaagccaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 16521419  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16521420 aagtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 16521517  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16521518 tatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcaca 16521617  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16521618 catcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16521663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 9294187 - 9294398
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9294187 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcat 9294285  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9294286 ctccacatcatt-gcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtt 9294384  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  9294385 attcaacatcaact 9294398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8873989 - 8873777
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873989 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 8873891  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8873890 ctccacaaaatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 8873791  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  8873790 attcaacatcaact 8873777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 96 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25120650 - 25120405
Alignment:
Q  96 cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccac 194  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25120650 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccac 25120553  T
Q  195 aatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25120552 aatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatca 25120453  T
Q  295 cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  25120452 catatcaacatgattatcaataatcgtcaatgtcattcaacatcaact 25120405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53909266 - 53909053
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  53909266 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattat 53909167  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53909166 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 53909067  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  53909066 attcaacatcaact 53909053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 342
Target Start/End: Original strand, 15211931 - 15212217
Alignment:
Q  56 acatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtat 153  Q
    |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||     
T  15211931 acatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaa 15212028  T
Q  154 aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga 253  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212029 caagactcgataatgcgacaacaatt-acaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaaga 15212127  T
Q  254 aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15212128 aaacatgcccacacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 15212217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 44054584 - 44054797
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44054584 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 44054683  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44054684 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 44054783  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  44054784 attcaacatcaact 44054797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53706286 - 53706073
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  53706286 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 53706187  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53706186 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 53706087  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||    
T  53706086 attcaacaccaact 53706073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 33738927 - 33739140
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33738927 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 33739026  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33739027 ctccaaaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcaccttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 33739126  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  33739127 attcaacatcaact 33739140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 8373033 - 8373228
Alignment:
Q  146 acatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcat 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8373033 acatgtatgaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcttcacatcatttgcat 8373131  T
Q  246 tatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8373132 tatcaagagaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaccgcaacatgattatcaataaccaacaatgtcattcaacatcaact 8373228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 34393716 - 34393929
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393716 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 34393814  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34393815 ctccacatcatttgctttatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt 34393914  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  34393915 tattcaacatcaact 34393929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12901265 - 12901055
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12901265 actatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctc 12901166  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12901165 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatagcattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatatcatt 12901066  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
     ||||||||||    
T  12901065 aaacatcaact 12901055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 18167456 - 18167665
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18167456 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattat 18167554  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18167555 ctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 18167651  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  18167652 attcaacatcaact 18167665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 44345489 - 44345703
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  44345489 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgattat 44345588  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44345589 ctccacatcatttgcattatcaagaaatcatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacattaacatgattattaataatcaacaatgt 44345688  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  44345689 cattcaacatcaact 44345703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 13245115 - 13245325
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||    
T  13245115 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgaaacccaattatattgattatc 13245214  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13245215 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaaatcaacatgattatcaataatcaacaatgaca 13245312  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  13245313 ttcaacatcaact 13245325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 10642849 - 10643062
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10642849 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 10642948  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10642949 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt 10643047  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  10643048 tattcaacatcaact 10643062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15288503 - 15288293
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  15288503 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 15288405  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15288404 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatgaataatcaacaatgtca 15288306  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15288305 ttcaacatcaact 15288293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21961200 - 21960851
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  21961200 taaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaa 21961103  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21961102 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaattcacaattttca 21961003  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |    
T  21961002 ccacaatatataggacaactcttgattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcatc 21960903  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21960902 accacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacatcaact 21960851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45460453 - 45460239
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45460453 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 45460354  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45460353 ctctacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccgtacacaattaaatcataagattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgt 45460254  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||    
T  45460253 cattcaacattaact 45460239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15295613 - 15295403
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  15295613 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 15295515  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15295514 tccacaacatt-gcattctcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacctatcaacatgattatgaataatcaacaatgtca 15295416  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15295415 ttcaacatcaact 15295403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54119757 - 54119579
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  54119757 acgactatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 54119658  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgat 308  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54119657 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgat 54119579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 14994860 - 14995070
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  14994860 cgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatagattatc 14994959  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  14994960 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 14995056  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  14995057 attcaacatcaact 14995070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 821557 - 821395
Alignment:
Q  180 cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatca 279  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||    
T  821557 cacaattttcacctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactca 821458  T
Q  280 tagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  821457 tagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 821395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30233998 - 30233826
Alignment:
Q  171 acaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacaca 270  Q
    |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30233998 acaacaatccacaattttcacctcgatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacaca 30233899  T
Q  271 attaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || |||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30233898 atcaaattataagattcatcatcaccacatcaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacattaact 30233826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18495904 - 18495689
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  18495904 acgacgatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 18495805  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18495804 tcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacccaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 18495705  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| |||||    
T  18495704 tcattcaacaacaact 18495689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15138181 - 15138077
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15138181 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcatcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 15138082  T
Q  101 taaaa 105  Q
    |||||    
T  15138081 taaaa 15138077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18294580 - 18294450
Alignment:
Q  207 aacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||     | |||||    
T  18294580 aacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatca-----ccacatg 18294486  T
Q  307 attatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18294485 atcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 18294450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13751790 - 13751686
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13751790 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgatcat 13751691  T
Q  229 ctcca 233  Q
    |||||    
T  13751690 ctcca 13751686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Original strand, 8044016 - 8044134
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || ||||||||    
T  8044016 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacctcaacatgatcataaacaatcaaca 8044115  T
Q  324 acgtcattcaacatcaact 342  Q
    | || ||||||||||||||    
T  8044116 atgttattcaacatcaact 8044134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23271309 - 23271207
Alignment:
Q  240 ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23271309 ttgcattaacaagaaaacatgcccacacacaaataaatcgtagtattcatcatcgcacaacaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatca 23271210  T
Q  340 act 342  Q
    |||    
T  23271209 act 23271207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13811125 - 13810974
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| | ||     
T  13811125 gactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgattatt 13811026  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcata 281  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||    
T  13811025 tccacaacaattccattatcaagaaatcatgtccatacacaaccaaatcata 13810974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43282884 - 43282757
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  43282884 acgactatgatgcattgacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatca 43282785  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43282784 cctccacaacatttgcattatcaagaaa 43282757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 52266960 - 52266840
Alignment:
Q  136 tgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccac 234  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||    
T  52266960 tgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctac 52266861  T
Q  235 atcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  52266860 aacaattgcattatcaagaaa 52266840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Original strand, 15043605 - 15043721
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  15043605 actatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatct 15043704  T
Q  231 ccacatcatttgcatta 247  Q
    ||||| || ||||||||    
T  15043705 ccacaacaattgcatta 15043721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15110819 - 15110703
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  15110819 actatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatct 15110720  T
Q  231 ccacatcatttgcatta 247  Q
    ||||| || ||||||||    
T  15110719 ccacaacaattgcatta 15110703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18294354 - 18294304
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18294354 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 18294304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 19019390 - 19019439
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19019390 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 19019439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5684088 - 5684036
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5684088 catcacacataaaaatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 5684036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30235986 - 30235942
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaac 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30235986 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaac 30235942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 8373431 - 8373478
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8373431 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 8373478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34197606 - 34197544
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34197606 acaatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 34197544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15852769 - 15852696
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15852769 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa 15852696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 34394020 - 34394072
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34394020 catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaact 34394072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 27959758 - 27959820
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  27959758 acaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaa 27959820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 337
Target Start/End: Original strand, 47356297 - 47356343
Alignment:
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47356297 atcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 47356343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13810948 - 13810907
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatc 338  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13810948 catcaacatgatcatcaacaatcaacaacgtcattcaacatc 13810907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18110038 - 18109986
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  18110038 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaact 18109986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18110176 - 18110136
Alignment:
Q  302 acatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18110176 acatgattatcaataatcaacaacatcattcaacattaact 18110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 14994735 - 14994774
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14994735 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 14994774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34197806 - 34197685
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  34197806 taaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaa 34197709  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttaca 122  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  34197708 gtaaaagagctcaacccttttaca 34197685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 9293984 - 9294022
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9293984 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 9294022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 10642646 - 10642684
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10642646 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 10642684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37958498 - 37958436
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37958498 acaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa 37958436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41167352 - 41167314
Alignment:
Q  217 tatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41167352 tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 41167314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 12837956 - 12837919
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt 41  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12837956 atgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacctt 12837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3433197 - 3432858
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433197 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 3433098  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  3433097 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 3432999  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3432998 taggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacccatc 3432900  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3432899 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 3432858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16874560 - 16874221
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874560 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16874461  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||    
T  16874460 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatata 16874361  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16874360 taggacgacacccaattatattgattatctccaca-ca-ttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatc 16874263  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16874262 aacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16874221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 224784 - 224443
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224784 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 224685  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  224684 caaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 224585  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  224584 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 224486  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  224485 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 224443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 738407 - 738066
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  738407 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 738308  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  738307 caaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 738208  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  738207 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 738109  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  738108 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 862302 - 861961
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  862302 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 862203  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  862202 caaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 862103  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  862102 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 862004  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  862003 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 861961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 701196 - 700856
Alignment:
Q  2 aaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaagt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  701196 aaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagc 701097  T
Q  102 aaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||    
T  701096 aaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatat 700997  T
Q  202 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  700996 aggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatc 700898  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  700897 aacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaact 700856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22090065 - 22089729
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090065 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 22089966  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  22089965 taaaagagttcaactcttttacagaaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 22089867  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089866 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 22089770  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22089769 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 22089729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21853517 - 21853187
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853517 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 21853418  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  | |||||||    
T  21853417 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacagcaattctcaatct-caactcaatata 21853319  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21853318 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaac 21853220  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  21853219 aaattgattatcaacaatcaataacatcattca 21853187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15320681 - 15320345
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15320681 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 15320582  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  15320581 taaaagagttcaactcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 15320483  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15320482 ataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 15320386  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15320385 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 15320345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15501050 - 15500714
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15501050 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 15500951  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  15500950 taaaagagttcaactcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 15500852  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15500851 ataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 15500755  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15500754 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 15500714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16675947 - 16675625
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16675947 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16675848  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  16675847 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 16675749  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-at 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  16675748 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaa 16675650  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  16675649 caacttgattatcaacaatcaacaa 16675625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21846112 - 21845782
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846112 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 21846013  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  21846012 taaaagaatcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 21845914  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21845913 taggacaacacccaattatattgattatcaacacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaac 21845815  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  21845814 aaattgattatcaacaatcaataacatcattca 21845782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 5236731 - 5237069
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5236731 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 5236828  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  5236829 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 5236927  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5236928 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 5237026  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  5237027 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 5237069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24662867 - 24662529
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24662867 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 24662770  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  24662769 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 24662671  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24662670 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 24662572  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24662571 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 24662529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 272823 - 272488
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  272823 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 272726  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  272725 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 272627  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  272626 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 272530  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  272529 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 272488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 643026 - 643361
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  643026 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 643123  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  643124 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 643222  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  643223 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 643319  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  643320 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 643361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 828832 - 829167
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  828832 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 828929  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  828930 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 829028  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  829029 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 829125  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  829126 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 829167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24387331 - 24386991
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||   |  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24387331 taaatgcatgtggtaccaaatctcaa-aaggtcgtcacctct-gatggaacaactcaacatcgtatgtaagggctcacccctgccttaca-taatctccg 24387235  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24387234 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 24387137  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24387136 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattaca 24387037  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24387036 catcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 24386991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 43684190 - 43684528
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43684190 taaatgcatgcagtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 43684287  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    | ||||||    
T  43684288 gtaaaagagtcatctcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatttcaaactcaatat 43684386  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43684387 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 43684485  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  43684486 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 43684528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 29758828 - 29759168
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttg-cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||    ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  29758828 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatggaacaaatcacattgtatgtaagggttcacacccgccttacaa-aatctccga 29758925  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29758926 agtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaat 29759023  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac 297  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29759024 atataggacgacacccaattatgttgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacat 29759123  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29759124 atcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaact 29759168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24718912 - 24718699
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24718912 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 24718813  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24718812 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 24718713  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  24718712 attcaacatcaact 24718699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24108079 - 24107869
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24108079 acgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacac--cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcat 24107982  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24107981 ctccacatcatt-gcattatcaagaaaacatgcccgtacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 24107883  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  24107882 attcaacatcaact 24107869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22908978 - 22908767
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908978 acgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 22908880  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22908879 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcc--catacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt 22908782  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  22908781 cattcaacatcaact 22908767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 270279 - 270585
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| || |||  | ||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  270279 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtat-taatggttcacatccgccttaca-taatctccgaagta 270374  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatat 201  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  270375 aaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatat 270472  T
Q  202 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  270473 aggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaca 270572  T
Q  302 acatgattatcaa 314  Q
    |||||||||||||    
T  270573 acatgattatcaa 270585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 645641 - 645335
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| || |||  | ||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  645641 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtat-taatggttcacatccgccttaca-taatctccgaagta 645546  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatat 201  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  645545 aaagagatcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatat 645448  T
Q  202 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  645447 aggacaacacccaattatattgttcatctcaacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaca 645348  T
Q  302 acatgattatcaa 314  Q
    |||||||||||||    
T  645347 acatgattatcaa 645335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 831376 - 831070
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| || |||  | ||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  831376 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtat-taatggttcacatccgccttaca-taatctccgaagta 831281  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatat 201  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  831280 aaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatat 831183  T
Q  202 aggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  831182 aggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaca 831083  T
Q  302 acatgattatcaa 314  Q
    |||||||||||||    
T  831082 acatgattatcaa 831070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43375075 - 43374865
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  43375075 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 43374976  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43374975 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 43374878  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  43374877 ttcaacatcaact 43374865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24930739 - 24930396
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||| |    
T  24930739 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgctttaca-taatctctg 24930642  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||    
T  24930641 aagtaaaagagctcaactcttttacaacaaca-cgagtatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaa 24930543  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-c 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24930542 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaacatgtccctacacaattaaatcatagcattcatcatcacc 24930443  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24930442 acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 24930396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 37610031 - 37610244
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610031 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 37610129  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37610130 ctccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt 37610229  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  37610230 tattcaacatcaact 37610244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6775725 - 6775514
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  6775725 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 6775626  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6775625 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 6775527  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  6775526 ttcaacatcaact 6775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20648932 - 20648723
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20648932 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattatattgatcatct 20648833  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20648832 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatacccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcat 20648733  T
Q  331 tcaacatcaa 340  Q
     |||||||||    
T  20648732 ccaacatcaa 20648723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 25121206 - 25121419
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  25121206 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgattat 25121305  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25121306 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacataattatcaataatcaacaaggtc 25121405  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  25121406 attcaacatcaact 25121419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20655519 - 20655308
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20655519 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 20655420  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20655419 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtc 20655320  T
Q  329 attcaacatcaa 340  Q
    || |||||||||    
T  20655319 atccaacatcaa 20655308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 159 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16195202 - 16195019
Alignment:
Q  159 ctcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaaca 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16195202 ctcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaaca 16195104  T
Q  259 tgcccacacacaa-ttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16195103 tgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaatatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaact 16195019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 41245327 - 41245540
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  41245327 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactcccaattatattgattat 41245426  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41245427 ctccataacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcttcttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 41245526  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  41245527 attcaacatcaact 41245540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 24547885 - 24548095
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24547885 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatc 24547983  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24547984 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 24548082  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  24548083 ttcaacatcaact 24548095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13664130 - 13663918
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13664130 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 13664031  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13664030 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatc-acatgatcatcaataatcaacaatgt 13663933  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  13663932 tattcaacatcaact 13663918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13723405 - 13723193
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13723405 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 13723306  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13723305 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatc-acatgatcatcaataatcaacaatgt 13723208  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||    
T  13723207 tattcaacatcaact 13723193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19994646 - 19994433
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  19994646 cgactataatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatc 19994547  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  19994546 tccatttcatttacattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 19994447  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  19994446 attcaacatcaact 19994433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 16416924 - 16417138
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16416924 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 16417023  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  16417024 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccacgcacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaatactcaacaatgt 16417123  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
     |||| |||||||||    
T  16417124 tattccacatcaact 16417138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22322930 - 22322717
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |     
T  22322930 acgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattac 22322831  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatc-aacaacgt 327  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  22322830 ctccacaaca-ttgcattattaagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcacatcaacatgattatcaataatcaaaaaatgt 22322732  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  22322731 cattcaacatcaact 22322717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20568757 - 20568553
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 233  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20568757 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctcca 20568658  T
Q  234 catcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattc 332  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20568657 caacatttgcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattc 20568558  T
Q  333 aacat 337  Q
    |||||    
T  20568557 aacat 20568553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20574950 - 20574746
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 233  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20574950 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctcca 20574851  T
Q  234 catcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattc 332  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20574850 caacatttgcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattc 20574751  T
Q  333 aacat 337  Q
    |||||    
T  20574750 aacat 20574746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 20480337 - 20480546
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20480337 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-caca-ttttcaccacaatatataggacaacacctaattatattgttcat 20480434  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  20480435 ctccacaacatttgcattataaagaaaacatgtctatacacaattaaatcataacattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 20480532  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  20480533 attcaacatcaact 20480546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22007973 - 22007788
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22007973 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 22007874  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaa 314  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22007873 cttcacaaca-ttgcattatcaagaaaacattcccatacacaattaaatcatagaattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaa 22007788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 342
Target Start/End: Original strand, 21679869 - 21680080
Alignment:
Q  133 ctatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  21679869 ctatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaatatattgttcatctc 21679968  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21679969 caccacatttgcattatcaagagaacatgtccatacacaatgaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgatcatcaataatcaacaatgtcat 21680068  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  21680069 tcaacatcaact 21680080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Original strand, 37605657 - 37605783
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605657 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 37605755  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605756 ctccacatcatttgcattatcaagaaaa 37605783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17730960 - 17730746
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  17730960 acgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 17730862  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17730861 tctccacaacatttgcattaacaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 17730762  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  17730761 tcattcaacatcaact 17730746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16203957 - 16203737
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc--cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || || ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  16203957 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatggatcaatt-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctctgaag 16203861  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16203860 taaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatat 16203763  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16203762 ataggacaacacccaattatattgtt 16203737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 21696227 - 21696439
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||| |||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  21696227 gactatgatgcatggacacgtaacaagactcgataatgcaacatcaatccacagtattcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatct 21696326  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21696327 ccacaacatttgcattatcaagaaaatatgcccatacacaaacaaatcataagattcattatcgcaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtca 21696426  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  21696427 ttcaacatcaact 21696439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 337
Target Start/End: Original strand, 28543600 - 28543806
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||  ||||||| ||||    
T  28543600 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatatattgatcat 28543699  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| || ||| ||||||  |  | |||||| ||||||||||||||| ||     
T  28543700 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgttcatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaacaatgtt 28543797  T
Q  329 attcaacat 337  Q
    |||||||||    
T  28543798 attcaacat 28543806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Original strand, 28836356 - 28836468
Alignment:
Q  227 atctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28836356 atctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatg 28836452  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  28836453 tcattcaacatcaact 28836468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16040759 - 16040642
Alignment:
Q  226 catctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16040759 catctccaaatcatttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaa 16040660  T
Q  325 cgtcattcaacatcaact 342  Q
     || ||||||||||||||    
T  16040659 tgttattcaacatcaact 16040642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16042435 - 16042318
Alignment:
Q  226 catctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16042435 catctccaaatcatttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaa 16042336  T
Q  325 cgtcattcaacatcaact 342  Q
     || ||||||||||||||    
T  16042335 tgttattcaacatcaact 16042318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 38532312 - 38532536
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  38532312 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatca 38532411  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcac-acatcaacatgattatcaataa 317  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||| |||  ||| ||||||| || | |||||         |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38532412 tctccacaacaattatattatcaagaaatcatatccatacacaatcaagttatagttcaaataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataa 38532511  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  38532512 tcaacaatgtcattcaacatcaact 38532536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18768262 - 18768135
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||  |||    
T  18768262 acgactatggtgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatttatca 18768163  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18768162 tctccacaacaattgcattatcaagaaa 18768135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 18618138 - 18618187
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18618138 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 18618187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39448271 - 39448198
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39448271 caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 39448198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17151335 - 17151288
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17151335 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 17151288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 23509454 - 23509493
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509454 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 23509493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21199609 - 21199547
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21199609 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 21199547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13663823 - 13663771
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13663823 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13663771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13722358 - 13722306
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13722358 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13722306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13722506 - 13722454
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13722506 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13722454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13722654 - 13722602
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13722654 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13722802 - 13722750
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13722802 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13722750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13722950 - 13722898
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13722950 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13722898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13723098 - 13723046
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13723098 catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 13723046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 224348 - 224301
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  224348 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 224301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 700761 - 700714
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  700761 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 700714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 737971 - 737924
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  737971 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 737924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 861866 - 861819
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacat 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  861866 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat 861819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22737376 - 22737250
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgta-taaggactcgataatgcgacaacaattc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| ||  || ||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  22737376 gactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgtgacatcacctcaacaattttcaccaccatatagaggacaacttccaaatatattgatcat 22737277  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||  ||  ||||||| |||||||    
T  22737276 ctccaccacaaatgcattaccaagaaa 22737250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 22909183 - 22909144
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22909183 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 22909144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 252
Target Start/End: Original strand, 23148623 - 23148682
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23148623 acaatataaaggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaag 23148682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 24547760 - 24547799
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24547760 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 24547799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21192182 - 21192120
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21192182 acaatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgtattatcaagaaa 21192120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22008176 - 22008138
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22008176 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 22008138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 24108282 - 24108244
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24108282 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 24108244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31195720 - 31195658
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  31195720 acaatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaa 31195658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 248
Target Start/End: Original strand, 25756675 - 25756740
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat 248  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  25756675 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattat 25756740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 25294686 - 25294750
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcatta 247  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25294686 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta 25294750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 23976110 - 23976448
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976110 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 23976209  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||    
T  23976210 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatata 23976309  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23976310 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagcaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcagcatcacacatc 23976406  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23976407 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 23976448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16230122 - 16230461
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230122 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16230221  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  16230222 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 16230320  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230321 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 16230419  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16230420 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16230461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14628232 - 14627893
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628232 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 14628133  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  14628132 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 14628034  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  14628033 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccatacacaattacatcataacattcatcatcacacatc 14627935  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14627934 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 14627893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26088376 - 26088713
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088376 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 26088475  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  26088476 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcaacaacaattctcaatct-caactcaatata 26088574  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26088575 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaagcatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatc 26088673  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26088674 aacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 26088713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29871096 - 29870760
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29871096 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 29870997  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  29870996 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 29870898  T
Q  201 taggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  29870897 taggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcctcacacat 29870801  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29870800 caacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 29870760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4989438 - 4989776
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989438 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatctcgaag 4989536  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   || ||||||    
T  4989537 taaaagagctcaacccttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatat 4989636  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  4989637 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagcattcaccatcacacct 4989733  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4989734 caacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaact 4989776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16827499 - 16827159
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  16827499 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgcccaacaataatctcgaa 16827402  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16827401 gtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 16827303  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16827302 tataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacact 16827203  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16827202 tcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16827159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 23993702 - 23994032
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23993702 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatttcaaag 23993801  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  23993802 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 23993900  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23993901 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaac 23993999  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  23994000 aacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 23994032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16650867 - 16650531
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16650867 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16650768  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  16650767 taaaagagttcaactcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatat 16650669  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16650668 ataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 16650572  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16650571 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 16650531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16557637 - 16557301
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16557637 taaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16557538  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  16557537 taaaagagttcaactcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatat 16557439  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16557438 ataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 16557342  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16557341 caacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 16557301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27655707 - 27655370
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27655707 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 27655610  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||    
T  27655609 gtaaaagagtcctcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatat 27655510  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27655509 ataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 27655413  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27655412 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 27655370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33316203 - 33315865
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33316203 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 33316106  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||    
T  33316105 gtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaata 33316006  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33316005 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacaca 33315909  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  33315908 tccacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaact 33315865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25174097 - 25174433
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25174097 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 25174194  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  25174195 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactataatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 25174293  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25174294 ataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 25174390  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25174391 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 25174433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10487421 - 10487756
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10487421 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 10487518  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  10487519 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 10487617  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10487618 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 10487714  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10487715 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 10487756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16377906 - 16377571
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16377906 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 16377809  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  16377808 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 16377710  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16377709 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 16377613  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16377612 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 16377571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16385230 - 16384895
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16385230 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 16385133  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  16385132 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 16385034  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16385033 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 16384937  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16384936 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 16384895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19984827 - 19984488
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttg-cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||  ||    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  19984827 taaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaggtcgtcacctt-cgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccga 19984730  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19984729 agtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactagataattcgacaacaat-cacaattt-ctccacaat 19984633  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19984632 atataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacat 19984533  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19984532 atcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaact 19984488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18004469 - 18004256
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18004469 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 18004370  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18004369 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 18004270  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  18004269 attcaacatcaact 18004256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 16105228 - 16105440
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16105228 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 16105327  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaa-catgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16105328 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtca 16105427  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  16105428 ttcaacatcaact 16105440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 18431304 - 18431514
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18431304 actatgatacatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctc 18431403  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18431404 cacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt 18431503  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  18431504 caacatcaact 18431514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 1554382 - 1554702
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  1554382 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaa 1554478  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1554479 gtaaaagagttcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattt-ctccacaata 1554575  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1554576 tataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccac 1554675  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1554676 atcaacatgatcatcaataatcaacaa 1554702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15736674 - 15736464
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15736674 actattatgcatggacatgtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 15736575  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15736574 cacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt 15736475  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  15736474 caacatcaact 15736464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18825251 - 18825044
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18825251 actatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaaa-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattattcatctc 18825153  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18825152 cacatcatt-gcattatcaagaaa-catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatttcatt 18825055  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  18825054 caacatcaact 18825044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35017177 - 35016964
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35017177 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 35017079  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  35017078 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgt 35016979  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  35016978 cattcaacatcaact 35016964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 23151928 - 23152140
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23151928 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaataat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatactgttcat 23152026  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23152027 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcattcacaattgaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtc 23152126  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  23152127 attcaacatcaact 23152140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 342
Target Start/End: Original strand, 18569274 - 18569467
Alignment:
Q  148 atgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcatta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  18569274 atgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcatta 18569372  T
Q  248 tcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18569373 tcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 18569467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18128812 - 18129129
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt----tcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct- 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||     
T  18128812 taaatgcatgtggtaccaaatcacctccagttcgtcaccttcgattcgatgccacttgaacatcgtatgtaagatttcacacctgtcttaca-taatctt 18128910  T
Q  96 cgaagtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatt 186  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18128911 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaatt 18129009  T
Q  187 ttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtatt 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18129010 ttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtatt 18129109  T
Q  287 caccatcacacatcaacatg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  18129110 caccatcacacattaacatg 18129129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18843315 - 18843104
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18843315 acgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacgacaaa-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattataatgttcat 18843217  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |     
T  18843216 ctccacatcatt-gcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaaaaatcaacaatttt 18843118  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  18843117 attcaacatcaact 18843104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25646323 - 25646112
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25646323 acgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgattat 25646224  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  25646223 ctccacaacatttgcattatcaaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaataatgtc 25646124  T
Q  329 attcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||    
T  25646123 attcaacatcaa 25646112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18088206 - 18087994
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  18088206 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 18088107  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18088106 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 18088008  T
Q  330 ttcaa-catcaact 342  Q
    ||||| ||||||||    
T  18088007 ttcaatcatcaact 18087994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 31627106 - 31627319
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  31627106 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcat 31627205  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31627206 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaacaaatcatagtattcatcaccacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 31627305  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  31627306 attcaacatcaact 31627319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1659221 - 1658994
Alignment:
Q  115 cttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  1659221 cttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacaccca 1659122  T
Q  215 attatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatca 313  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||    
T  1659121 attatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatggtcatca 1659023  T
Q  314 ataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1659022 ataatcaacaatgttattcaacatcaact 1658994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 18775882 - 18776089
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775882 actataatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 18775980  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  18775981 cacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttatt 18776078  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  18776079 caacatcaact 18776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Original strand, 22430925 - 22431129
Alignment:
Q  138 atgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatc 237  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430925 atgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatc 22431023  T
Q  238 atttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  22431024 atttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattctaca 22431123  T
Q  337 tcaact 342  Q
    ||||||    
T  22431124 tcaact 22431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1651444 - 1651234
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1651444 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatc 1651346  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1651345 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacacacaattatatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 1651247  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  1651246 ttcaacatcaact 1651234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Original strand, 32897394 - 32897602
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  32897394 actatgatgcacggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgatcatctc 32897493  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32897494 cacaacatttacattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatggtattcatcatcacacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcatt 32897593  T
Q  332 caacatcaa 340  Q
    |||||||||    
T  32897594 caacatcaa 32897602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 342
Target Start/End: Original strand, 16238958 - 16239246
Alignment:
Q  55 cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgta 152  Q
    ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16238958 cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgta 16239055  T
Q  153 taaggactcgataatgcgacaac-aattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  16239056 taaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaa 16239154  T
Q  252 gaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16239155 gaaaacatgcccacacacaaatagatcatcgtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaact 16239246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 11214680 - 11215020
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctc-aacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | |||| || || ||||| ||||||| ||    
T  11214680 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacccccgctttaca-taatctccga 11214776  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| || |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   || ||||    
T  11214777 agtaaaagagctcaaccattttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataagtactctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaat 11214875  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  11214876 atataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcaca 11214974  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11214975 caataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacaacaact 11215020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 15861383 - 15861610
Alignment:
Q  115 cttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca 214  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  15861383 cttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaa-tttcaactcaatatataggacaacaccca 15861480  T
Q  215 attatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatca 313  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15861481 attatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaacatgctcacacacaaataaatcatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatca 15861579  T
Q  314 ataatcaacaacgt--cattcaacatcaact 342  Q
    | ||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  15861580 acaatcaacaatgttatattcaacatcaact 15861610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25745763 - 25745615
Alignment:
Q  195 aatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25745763 aataaataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatca 25745664  T
Q  295 -cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25745663 ccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 25745615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Original strand, 16084086 - 16084215
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16084086 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 16084185  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16084186 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatg 16084215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 337
Target Start/End: Original strand, 18397594 - 18397803
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  18397594 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgattat 18397693  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||    
T  18397694 ccccacaacattttcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcataatactcatcatcaccacatcaatatgatcatcaatactcaacaatgt 18397793  T
Q  328 cattcaacat 337  Q
    ||||||||||    
T  18397794 cattcaacat 18397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13622608 - 13622396
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  13622608 gactatgatgcatgaacatgtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatct 13622509  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaag-aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  13622508 ccacaacatttgcattatcaagaaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattattactaatcaacaacatca 13622409  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  13622408 ttcaacattaact 13622396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17343772 - 17343578
Alignment:
Q  136 tgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17343772 tgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca 17343673  T
Q  236 tcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
     || ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  17343672 aca-ttgcattatcaagcaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 17343578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22227133 - 22226926
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  22227133 actatgatgcatggacatgtataaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctc 22227034  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| || |||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||     
T  22227033 cacaaca-ttgcattaccaaggaaacatatccacacacaaataaatcaaagtactcatcatcacacgtcaacatatttatcagtaatcaacaatgtcatc 22226935  T
Q  332 caacatcaa 340  Q
    |||||||||    
T  22226934 caacatcaa 22226926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13016278 - 13016071
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||| | | | |||||||||||| | | |||    
T  13016278 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgattacctc 13016179  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaac-aacgtcat 330  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| || ||||     
T  13016178 cacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcatgtcaacatgattctcaa-aatcaacaaatgtcac 13016081  T
Q  331 tcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||    
T  13016080 tcaacatcaa 13016071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 323
Target Start/End: Original strand, 22866836 - 22867031
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| || |||| ||||    
T  22866836 acgactatgatgcctggacatgtaacaagactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaataaattgatcat 22866935  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22866936 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatgataagattcattatcaccacatcaacatgattatcaaaaatcaaca 22867031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16642632 - 16642526
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16642632 taaatgtatgcggtaccaaatctcaaccaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16642533  T
Q  101 taaaaga 107  Q
    | |||||    
T  16642532 tcaaaga 16642526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 276
Target Start/End: Original strand, 19609167 - 19609311
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  19609167 cgactatgatgcatcgacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 19609265  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaa 276  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19609266 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaa 19609311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28196279 - 28196061
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  28196279 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 28196180  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---attcaccatcaca-catcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || | ||| |   | | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28196179 tctccacaccaattgcattatcaagaaatcatgtccatacacaatcaagttataattcaaataagaatcacatcatcaacatgattatcaataatcaaca 28196080  T
Q  324 acgtcattcaacatcaact 342  Q
    |  | ||||||| ||||||    
T  28196079 atattattcaacctcaact 28196061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 18741119 - 18741203
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18741119 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaa 18741203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 15738916 - 15739043
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  15738916 acgattatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 15739015  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||    
T  15739016 tctccacaacaattgcattaccaagaaa 15739043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Original strand, 16084878 - 16084962
Alignment:
Q  259 tgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaa-catgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16084878 tgcccatacacaattaaatcgtagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16084962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25368856 - 25368728
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-ttttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||    
T  25368856 acgactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatc 25368757  T
Q  227 atctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25368756 atctccacaacaattgcattatcaagaaa 25368728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16889184 - 16889122
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889184 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 16889122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 1554817 - 1554866
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1554817 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 1554866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Original strand, 33323532 - 33323605
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33323532 caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa 33323605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35137399 - 35137326
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| |  |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35137399 caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa 35137326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 1651569 - 1651530
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1651569 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 1651530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 1659330 - 1659291
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1659330 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 1659291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15861274 - 15861313
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15861274 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 15861313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18004672 - 18004634
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18004672 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18004634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18825457 - 18825419
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18825457 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18825419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18843518 - 18843480
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18843518 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18843480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 53769194 - 53769533
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769194 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 53769293  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  53769294 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 53769392  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769393 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 53769491  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53769492 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 53769533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 49230748 - 49231090
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49230748 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaacgtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 49230847  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | |||||||    
T  49230848 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatata 49230947  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49230948 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 49231046  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaactg 343  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  49231047 caacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaactg 49231090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8270023 - 8269686
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8270023 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaag 8269924  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  8269923 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 8269825  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8269824 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 8269728  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8269727 aacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 8269686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8277134 - 8276797
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8277134 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaag 8277035  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  8277034 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 8276936  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8276935 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 8276839  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8276838 aacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 8276797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 27839241 - 27839563
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27839241 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 27839340  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||    
T  27839341 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatata 27839440  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27839441 taggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacat 27839539  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaaca 323  Q
     |||||||| ||||| ||||||||    
T  27839540 taacatgatcatcaacaatcaaca 27839563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 30151870 - 30152205
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151870 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 30151969  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  30151970 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 30152068  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30152069 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 30152165  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30152166 aacatattaatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 30152205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 16819443 - 16819781
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16819443 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttgcaataatctcgaag 16819542  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  16819543 taaaagagttcaacccttttacagcaacaacgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 16819641  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16819642 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 16819738  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16819739 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 16819781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16745791 - 16745454
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745791 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 16745692  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    | |||||||    
T  16745691 taaaagagtcatcccttttacagcaac-acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacca-tcacaatttcaaactcaatata 16745594  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16745593 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccaaacacaattaaatcatagtattcaccaacacacttc 16745495  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16745494 aacatgattaacaataatcaacaa-gtcatgcaacatcaact 16745454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 44227961 - 44228302
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44227961 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 44228060  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  44228061 taaaagagttcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 44228159  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-caca 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44228160 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccatacacgattaaatcatagcattcatcatcatcaca 44228258  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44228259 tcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 44228302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17913873 - 17913534
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913873 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtacgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 17913774  T
Q  101 taaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||    
T  17913773 taaaagagcttaacccttttacagccaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactagataatgcgaca-caat-cacaattgtcaacacaatat 17913677  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913676 ataggacgacatccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 17913577  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17913576 caacatgcttatcaataatcaacaatgccattcaacatcaact 17913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 18909226 - 18909562
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18909226 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 18909323  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  18909324 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 18909422  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18909423 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacat--ccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacacat 18909519  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18909520 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 18909562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 45859553 - 45859872
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45859553 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 45859652  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  45859653 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 45859751  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-at 299  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  45859752 taggacaacatccaattatattgattatcttcacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaa 45859850  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaa 321  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  45859851 caacttgattatcaacaatcaa 45859872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22273581 - 22273917
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22273581 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 22273678  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  22273679 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 22273777  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22273778 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 22273874  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22273875 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 22273917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 41268775 - 41269097
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41268775 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 41268874  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |  | ||||| |    
T  41268875 taaaagagtcatcccctttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaataca 41268973  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca-t 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  41268974 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagagaacatacccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaga 41269072  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  41269073 caacttgattatcaacaatcaacaa 41269097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2450947 - 2450612
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2450947 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 2450850  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  2450849 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 2450751  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2450750 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattc-ccatcacacat 2450655  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2450654 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 2450612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13956425 - 13956132
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956425 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 13956326  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctc-cacaatat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |   | ||  ||||    
T  13956325 taaaagggtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatatat 13956226  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13956225 ataggacaacacccaattattttgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca 13956132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8305943 - 8305693
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8305943 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaag 8305844  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  8305843 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 8305745  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8305744 taggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga 8305693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1469273 - 1468938
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1469273 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 1469176  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  1469175 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 1469077  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1469076 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 1468980  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1468979 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 1468938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13977258 - 13976964
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13977258 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 13977159  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacg-actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctc-cacaata 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |   | ||  |||    
T  13977158 taaaagggtcatcccttttacagcaacaacgaactatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatata 13977059  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13977058 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca 13976964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 2048595 - 2048936
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg---ccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc- 96  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||   | |||  ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||     
T  2048595 taaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctt-cgatggaacaact--cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctcc 2048690  T
Q  97 gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccaca 195  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2048691 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccaca 2048788  T
Q  196 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca- 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  2048789 atatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcac 2048888  T
Q  295 cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2048889 cacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 2048936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 33340377 - 33340718
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  33340377 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctctg 33340474  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33340475 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatgtacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 33340572  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33340573 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 33340672  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33340673 tatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 33340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51160102 - 51159761
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg---ccacttgcacatcgaatgtaaga----gctcacacctgccttacaataatctc 96  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   | |||  ||||||| |||||||     | ||||||| |||||||| |||||||    
T  51160102 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatggaacaact--cacatcgtatgtaaggaagggttcacacccgccttaca-taatctc 51160007  T
Q  97 -gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccac 194  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51160006 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaccaat-cacaattttctccac 51159909  T
Q  195 aatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51159908 aatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagtattcatcctca 51159809  T
Q  295 cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51159808 cacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 51159761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 55314915 - 55315251
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55314915 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 55315014  T
Q  101 taaaaga--------------gtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatt 186  Q
    || | ||              || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  55315015 tacatgatatataagacatgtgtaatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatc 55315114  T
Q  187 ttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtatt 286  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55315115 t-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtatt 55315212  T
Q  287 caccatcacac-atcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    || |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  55315213 catcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaa 55315251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 16259705 - 16259916
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259705 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 16259803  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16259804 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgataatcaataatcaacaacatca 16259903  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  16259904 ttcaacattaact 16259916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17957828 - 17957618
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17957828 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgt 17957730  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17957729 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacat 17957630  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  17957629 tcaacatcaact 17957618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 7852471 - 7852683
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852471 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 7852569  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7852570 ctccacatcatttacattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagtattcctcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatgtc 7852669  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  7852670 attcaacatcaact 7852683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 13816175 - 13816388
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13816175 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 13816274  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13816275 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattgaatcatagcattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 13816374  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  13816375 attcaacatcaact 13816388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19572267 - 19572054
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19572267 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 19572168  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19572167 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatggccacacacaattgaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 19572068  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  19572067 attcaacatcaact 19572054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 19230589 - 19230935
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  19230589 atgcatatggtaccaaatctccaaaacgtcgtcacctttcgatgaatcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccaccttaca-taatctccgaagta 19230687  T
Q  103 aaagagt-catcccttttacagtaacaacg--------actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||          |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19230688 aaagagttcaacccttttacaactacaatttcaacataactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcacca 19230786  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  19230787 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccattcacaattaaatcatagtattcattatc 19230886  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230887 acacatcaacataattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 19230935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 8630374 - 8630720
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||   |||||| ||||||| |||    
T  8630374 taaatgcatgtggtaccaaatcacctccaggtcgtcacctt-cgatgccacttgaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttaca-taatctccgaa 8630471  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  8630472 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggatatgtaacaagactcgataatgcaacaacaat-cacaattttca 8630570  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| |    
T  8630571 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaagacatgcacatacacaaataaatcatagtattcatc 8630670  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8630671 atcacacattatcatgattatcaataatcaacaaagtcattcaacgtcaa 8630720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 19945163 - 19945502
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | ||| | |  ||||||| ||||||| |||    
T  19945163 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcaaaaccaccttaca-taatctccgaa 19945259  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19945260 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 19945357  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cac 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  19945358 tataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatatcattcatcatcaccac 19945457  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19945458 atcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 19945502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 23491040 - 23491382
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  23491040 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccg 23491137  T
Q  98 aagtaaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    |||||||||||  || || |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23491138 aagtaaaagagcacaacctttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaaaaaaactagataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 23491235  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23491236 tatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattaca 23491335  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaa-catcaact 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23491336 catcaacgtgattatcaataatcaacgatgtcattcaatcatcaact 23491382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 25057510 - 25057723
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25057510 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 25057608  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25057609 ctctacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtc 25057708  T
Q  329 attcaa-catcaact 342  Q
    || ||| ||||||||    
T  25057709 atccaatcatcaact 25057723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15860642 - 15860430
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15860642 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 15860543  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15860542 ctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 15860444  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    || |||||||||||    
T  15860443 atccaacatcaact 15860430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 319245 - 318896
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||| || |||    
T  319245 taaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttaca-taatttccgaa 319148  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || |||||||||    ||||        |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  319147 gtaaaagagttcaacccttttacgactacaatctcaacacgactatgatacatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttct 319049  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |    
T  319048 ccacaatatataggataacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacgattaaatcataacattcatc 318949  T
Q  291 atca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  318948 atcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 318896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 35122350 - 35122559
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35122350 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatc 35122449  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35122450 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattgtcaataatcaacaatgtca 35122549  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
    ||||||||||    
T  35122550 ttcaacatca 35122559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12351331 - 12351127
Alignment:
Q  138 atgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatc 237  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351331 atgcatggacatgtaacaagactcgataattcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatc 12351233  T
Q  238 atttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaaca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  12351232 atttgcattatcaagaaaacatgtccgcacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccaca 12351133  T
Q  337 tcaact 342  Q
    ||||||    
T  12351132 tcaact 12351127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 15574706 - 15574916
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15574706 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatc 15574804  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15574805 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 15574903  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15574904 ttcaacatcaact 15574916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16183509 - 16183292
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcc----acaatatataggacaacacccaattatattgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||     |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16183509 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaatcaatatataggacaacacccaattatattgat 16183410  T
Q  226 catctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16183409 tatctccacatcatttgcattgtcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaa 16183310  T
Q  325 cgtcattcaacatcaact 342  Q
     |||||||||||||||||    
T  16183309 tgtcattcaacatcaact 16183292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6148312 - 6148124
Alignment:
Q  154 aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6148312 aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttacattatcaaga 6148213  T
Q  254 aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6148212 aaacaagcccatacacaaataaatcatagtattcaccattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 6148124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 10737093 - 10737392
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  10737093 taaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgccacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctctgaa 10737189  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10737190 gtagaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtcacaagactcgataatgcgacaacaata-acaattttctccacaata 10737287  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  10737288 tataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatgacacg 10737387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 15613725 - 15613935
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15613725 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatc 15613823  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15613824 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 15613922  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15613923 ttcaacatcaact 15613935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 340
Target Start/End: Original strand, 5227313 - 5227585
Alignment:
Q  63 atgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactc 161  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  5227313 atgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagccaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactc 5227410  T
Q  162 gataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227411 gataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc 5227509  T
Q  262 ccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
     || | |||||| ||  || ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5227510 tcatatacaattcaa--at-gtattcatcattacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 5227585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 17099376 - 17099590
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17099376 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 17099475  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17099476 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccataaacaatcaaattataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaatgt 17099575  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||||    
T  17099576 cattcaacattaact 17099590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22145768 - 22145557
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22145768 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggaca-cacccaattatattgattat 22145670  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22145669 ctccacaac-tttgcattatcaagaaaacatgcccctacaccattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtt 22145571  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  22145570 attcaacatcaact 22145557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 14297161 - 14297371
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14297161 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatc 14297260  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14297261 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtc 14297360  T
Q  329 attcaacatca 339  Q
    |||||||||||    
T  14297361 attcaacatca 14297371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 14302788 - 14302998
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14302788 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatc 14302887  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14302888 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtc 14302987  T
Q  329 attcaacatca 339  Q
    |||||||||||    
T  14302988 attcaacatca 14302998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15469959 - 15469751
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15469959 cgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaataat-cacaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 15469862  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15469861 tccacaacatt-gcattatcaaggaa-catgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 15469764  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  15469763 ttcaacatcaact 15469751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14522804 - 14522589
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataag-gactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||| |||    
T  14522804 acgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatca 14522705  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14522704 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 14522605  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14522604 tcattcaacattaact 14522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50113623 - 50113415
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    ||||||||| | |     
T  50113623 acgactatgatgcatgggcatgtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattt-cacctcaatatataggacaaca----attatattgattac 50113529  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50113528 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcactcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 50113429  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  50113428 attcaacatcaact 50113415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 53900016 - 53899808
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53900016 cgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgatcatc 53899917  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  53899916 tccaccacatttgcattatcaagaaaacatgtccatatacaa-ccaatcatagaattcatcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatatca 53899818  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
    ||||||||||    
T  53899817 ttcaacatca 53899808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 14294090 - 14294305
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  14294090 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatca 14294189  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14294190 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 14294289  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14294290 tcattcaacattaact 14294305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11199069 - 11198854
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  11199069 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagacttgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 11198970  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11198969 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatg 11198870  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||    
T  11198869 tcattcaacattaact 11198854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12265989 - 12265775
Alignment:
Q  125 aacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgt 224  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12265989 aacatcgactatgattcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattga 12265890  T
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12265889 ttatctccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacagacaaataaatcatagtatttatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaa 12265791  T
Q  325 cgtcattcaacatcaa 340  Q
     |||||  ||||||||    
T  12265790 tgtcatctaacatcaa 12265775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 14299717 - 14299932
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  14299717 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatca 14299816  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14299817 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatg 14299916  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14299917 tcattcaacattaact 14299932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11062530 - 11062319
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  11062530 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatct 11062431  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11062430 ccacaacatttgcattatcaa-aaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtca 11062332  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  11062331 ttcaacatcaact 11062319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47786365 - 47786166
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47786365 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat------------ccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 47786278  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47786277 ccaccacattttcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcat 47786178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 337
Target Start/End: Original strand, 40938393 - 40938602
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  40938393 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcat 40938492  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||    
T  40938493 ctccataacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacttgatcatcaacaatcaacaatgt 40938592  T
Q  328 cattcaacat 337  Q
    ||||||||||    
T  40938593 cattcaacat 40938602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15940083 - 15939743
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgat-gccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| | ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  15940083 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatagacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccga 15939986  T
Q  99 agtaaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  15939985 agtaaaaaagttcagcccttttacaacaaca-cgactatgatgcatgggcatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaat 15939887  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag-aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcac 295  Q
     |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||    
T  15939886 gtatatgacaacacccaattatattgattatccccataaca-ttgaattatcaagcaaaacatgcccacatacaaatagatcatagtattcatcattcac 15939788  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15939787 accataacttgattatcaacaatcaacaaagtcattcaacttcaa 15939743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14846282 - 14846034
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||| ||||||| |||    
T  14846282 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcaccccccccttaca-taatctccgaa 14846186  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  14846185 gtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaata 14846087  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||    
T  14846086 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag 14846034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 288
Target Start/End: Original strand, 30205116 - 30205274
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  30205116 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgattat 30205215  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattca 288  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  30205216 ctccacaac-tttgctttatcaagaaaacatgcacatacacaattaattcatagtattca 30205274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17523905 - 17523694
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17523905 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgatcat 17523806  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||  |  | |||||| |||||||||||| || |||    
T  17523805 ctccgcaacatgtgcattatcaagaaatcatgtccatacacaattaattcatactactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaataatgtc 17523708  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  17523707 attcaacattaact 17523694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12562976 - 12562760
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-ttttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||   |||| ||||||| ||    
T  12562976 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagattcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatatattgatc 12562877  T
Q  227 atctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaac 325  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12562876 atctccacaacaattgcattatcaagaaaacatgtccgtacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaat 12562777  T
Q  326 gtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||    
T  12562776 gtcattcaacatcaact 12562760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 281
Target Start/End: Original strand, 17138128 - 17138281
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgta-taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17138128 acgactatgatgcatggacatgtaataaagactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgatca 17138227  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcata 281  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||    
T  17138228 tctccacaacaattgaattatcaagacatcatgtccttacacaattaaatcata 17138281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18905291 - 18905171
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18905291 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcaataatgcgaaaacaa-tcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 18905193  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  18905192 tccacaaca-ttgcattatcaag 18905171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12031364 - 12031266
Alignment:
Q  245 ttatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12031364 ttatcaagaaaacacgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaact 12031266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16935286 - 16935168
Alignment:
Q  217 tatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaata 316  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  16935286 tatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaata 16935190  T
Q  317 atcaacaacgtcattcaacatc 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  16935189 atcaacaatgtcatccaacatc 16935168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Original strand, 12951714 - 12951835
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  12951714 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 12951813  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatc 249  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  12951814 tctccacaacaattgcattatc 12951835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 11813528 - 11813586
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11813528 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt 11813586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Original strand, 15516397 - 15516521
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  15516397 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 15516496  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||||| || |||||||| ||||    
T  15516497 tctccacaacaattgcattaccaag 15516521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Original strand, 39654578 - 39654695
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  39654578 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 39654677  T
Q  228 tctccacatcatttgcat 245  Q
    |||||||| || ||||||    
T  39654678 tctccacaacaattgcat 39654695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11883764 - 11883645
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| | | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  11883764 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacactttccacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatca 11883665  T
Q  228 tctccacatcatttgcatta 247  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  11883664 tctccacaacattagcatta 11883645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 14287756 - 14287828
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14287756 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata 14287828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18898053 - 18897982
Alignment:
Q  269 caattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18898053 caattaaatcatagtattcatcatcccacatcaacgtatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 18897982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9303802 - 9303753
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9303802 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 9303753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14843919 - 14843837
Alignment:
Q  254 aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaaca 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |  ||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  14843919 aaacatgcccacacacaaataaatcatagcattcatcatcacataataacttgattatcaccaatcaacaatatcattcaaca 14843837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11330443 - 11330382
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaa 254  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11330443 acaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaa 11330382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 17937320 - 17937372
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17937320 catcacacgtcttcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 17937372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 15874892 - 15874953
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaa 254  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15874892 acaatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaa 15874953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38812436 - 38812367
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  38812436 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag 38812367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12490177 - 12490105
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12490177 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaa 12490105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 16260014 - 16260066
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  16260014 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttgttccacatcaact 16260066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 12266110 - 12266071
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12266110 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 12266071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15574581 - 15574620
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15574581 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 15574620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15613600 - 15613639
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15613600 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 15613639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 16259580 - 16259619
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16259580 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 16259619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17958033 - 17957994
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17958033 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 17957994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23081785 - 23081746
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23081785 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 23081746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 30141419 - 30141458
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30141419 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 30141458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 25057307 - 25057345
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25057307 taaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacc 25057345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12490370 - 12490248
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  12490370 taaatgcatgtggtaccgaatcatctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaa 12490273  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacag 123  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  12490272 gtaaaagagctcaacccttttacag 12490248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 15470084 - 15470048
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15470084 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 15470048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 19262638 - 19262602
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19262638 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 19262602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20826852 - 20826513
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826852 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 20826753  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  20826752 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 20826654  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826653 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 20826555  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20826554 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 20826513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 17147315 - 17147654
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147315 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 17147414  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || |||||||    
T  17147415 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatata 17147514  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17147515 taggacgacacccaattatattgattatctccaca-ca-ttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatc 17147612  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17147613 aacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 17147654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 22034382 - 22034717
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22034382 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 22034481  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  22034482 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 22034580  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22034581 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 22034677  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22034678 aacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 22034717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7642213 - 7641884
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7642213 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaaggactcacacctgccttacaataatctcgaag 7642114  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  7642113 taaaagagtcatcc--------gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 7642023  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7642022 taggacaacacccaattatattgatgatctccacaacatt-gtattatcaagaaaacatacccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatc 7641926  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7641925 aacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 7641884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18602674 - 18602352
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602674 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 18602575  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  18602574 taaaagagtcgtcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 18602476  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-at 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  18602475 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaa 18602377  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  18602376 caacttgattatcaacaatcaacaa 18602352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5073931 - 5073609
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5073931 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 5073832  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  | |||||||    
T  5073831 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggtcatgtgtaatgactcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatata 5073733  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-at 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  5073732 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaa 5073634  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  5073633 caacttgattatcaacaatcaacaa 5073609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 41392986 - 41393324
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41392986 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 41393083  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | || |||    
T  41393084 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcagtat 41393182  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41393183 ataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaacatgtctacacacagttacatcatagcattcatcatcacacat 41393281  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41393282 caacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 41393324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 51451147 - 51451485
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51451147 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 51451244  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    | ||||||    
T  51451245 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatat 51451343  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  51451344 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagagaacatgcccataaacaattaaatcatagcattcaccatcacactt 51451442  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  51451443 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 51451485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 17003359 - 17003694
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17003359 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 17003456  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  17003457 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 17003555  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||    
T  17003556 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagaattcatcatcccacat 17003652  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17003653 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 17003694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 340
Target Start/End: Original strand, 22029293 - 22029566
Alignment:
Q  64 tgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcga 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029293 tgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcga 22029392  T
Q  164 taatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22029393 taatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcc 22029490  T
Q  263 cacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22029491 cacacaaa--taaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaatagtcaacaatgtcattcaacatcaa 22029566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44036530 - 44036189
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||   |  |||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  44036530 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctct-gatggaacaactcaacatcgtatgtaagggtccacccctgccttaca-taatctccg 44036433  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44036432 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatagacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 44036335  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44036334 tgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 44036235  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44036234 tatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 44036189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37846100 - 37845755
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   |   ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  37846100 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgaatcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctctgaagta 37846003  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaac--------gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||         ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37846002 aaagagctcagcccttttacaactacaatttcaacatgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctcca 37845904  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||     
T  37845903 caatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcatt 37845804  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37845803 acacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 37845755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 18506021 - 18506230
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18506021 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctc 18506120  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18506121 cgcaacattagcattatcaagaaaa-atgcccacacacaagtaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt 18506219  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  18506220 caacatcaact 18506230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22250455 - 22250242
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22250455 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggactacacccaattatattgttcat 22250357  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  22250356 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgttcatacacaattaaatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgt 22250257  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  22250256 cattcaacatcaact 22250242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 335
Target Start/End: Original strand, 41210707 - 41210913
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  41210707 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgattat 41210806  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  41210807 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatggccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtc 41210906  T
Q  329 attcaac 335  Q
    |||||||    
T  41210907 attcaac 41210913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 21858218 - 21858430
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21858218 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttac 21858316  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21858317 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 21858416  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  21858417 attcaacatcaact 21858430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Original strand, 20444276 - 20444618
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   |   ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  20444276 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagta 20444373  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | | ||  |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20444374 aaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaag-ctttataatgcgacaacaat-cataattttctcca 20444471  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20444472 caatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatc 20444571  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20444572 acacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 20444618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 20526780 - 20526992
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20526780 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattgttcat 20526878  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20526879 ctccacatgatttacattatcaagaagacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 20526978  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  20526979 attcaacatcaact 20526992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22407697 - 22407484
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22407697 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 22407598  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22407597 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 22407498  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  22407497 attcaacatcaact 22407484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15862947 - 15862722
Alignment:
Q  115 cttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | |||||||||||||||||||||    
T  15862947 cttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaatttcaaactcaatatataggacaacaccca 15862849  T
Q  215 attatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 314  Q
    |||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862848 attatattgaatatctccacaacatt-gcattatcaaggaaacatgcccacacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 15862750  T
Q  315 taatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15862749 taatcaacaatgtcattcaacatcaact 15862722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Original strand, 20530040 - 20530383
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||   |   ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  20530040 atgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcgtcccccttcgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagta 20530138  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | | ||  |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20530139 aaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaag-ctttataatgcgacaacaat-cataattttctcca 20530236  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20530237 caatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatc 20530336  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20530337 acacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 20530383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 20930006 - 20930327
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  20930006 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgtaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctcca 20930103  T
Q  99 a-gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    | ||||||||| ||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20930104 aagtaaaagagctcaaccattttacaacaaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccataa 20930201  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || | |    
T  20930202 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaaatcatagtattcatcaccgc 20930301  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20930302 acatcaacatgattatcaacaatcaa 20930327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 49966313 - 49966523
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  49966313 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctc 49966412  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49966413 cacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccataaacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatt 49966512  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  49966513 caacatcaact 49966523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2422473 - 2422260
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2422473 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 2422374  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2422373 ctccaccacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcgacaatgtc 2422274  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  2422273 attcaacatcaact 2422260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22352661 - 22353002
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  22352661 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctctga 22352758  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || ||||    
T  22352759 agtaagagagctcaacccttttacaacaaca-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaat 22352857  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-ca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  22352858 atataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatta 22352956  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22352957 catcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 22353002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5676102 - 5675890
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5676102 acgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 5676004  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  5676003 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtctatatacaatcaattcatagtatccaccttcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 5675904  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  5675903 attcaacatcaact 5675890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 35053504 - 35053714
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35053504 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 35053602  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  35053603 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 35053700  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  35053701 attcaacatcaact 35053714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20895194 - 20894983
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20895194 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgattat 20895095  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  20895094 ctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaataatagtattcatcatcacacatcaacatgattttcaataatcaacaatatc 20894996  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    |||| |||||||||    
T  20894995 attc-acatcaact 20894983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 45050346 - 45050556
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45050346 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatc 45050444  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45050445 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtca 45050543  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  45050544 ttcaacatcaact 45050556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 21716868 - 21717077
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21716868 cgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgctcatc 21716967  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  21716968 tccacaacatttgcattatcaaaaaaacatgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacatatcaacatgattatc---aatcaacaatgtca 21717064  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  21717065 ttcaacatcaact 21717077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9785735 - 9785551
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9785735 acgactatgatgtatggacatgtgacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgttcct 9785637  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9785636 ctccacatcatttgcattatcaagaaagcatgcacatacacaattaaatcatagtattcatcatcgcacatcaacatgattatcaa 9785551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35523921 - 35523713
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35523921 cgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatc 35523822  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35523821 tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacgcaa-ccaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 35523723  T
Q  330 ttcaacatca 339  Q
      ||||||||    
T  35523722 cccaacatca 35523713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 321
Target Start/End: Original strand, 41218115 - 41218307
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41218115 acgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcat 41218213  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41218214 ctccacattatttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagaattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaa 41218307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 22226516 - 22226846
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  22226516 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaa 22226612  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||    
T  22226613 gtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaata 22226711  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca-c 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  22226712 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacata 22226810  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22226811 aataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 22226846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18061109 - 18060898
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  18061109 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggactacacccaattatattgattata 18061011  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18061010 tccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtt 18060912  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  18060911 attcaacatcaact 18060898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 22365417 - 22365629
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22365417 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 22365516  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  22365517 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgttcatacacaattaaatcatagcattcatcattatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 22365615  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  22365616 attcaacatcaact 22365629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21651436 - 21651228
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  21651436 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 21651338  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21651337 tccacaacatt-gcattatcaagacaacatgcccatgcacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtca 21651239  T
Q  330 ttcaacatcaa 340  Q
    | |||||||||    
T  21651238 tccaacatcaa 21651228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51657826 - 51657604
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  51657826 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcat 51657727  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcac-acatcaacatgattatcaataat 318  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||| |         ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51657726 ctccacaacaattgcattatcatgaaatcatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataat 51657627  T
Q  319 caacaacgtcattcaacatcaac 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  51657626 caacaatgtcattcaacatcaac 51657604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20122096 - 20121966
Alignment:
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  20122096 caatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcctcatc 20121998  T
Q  294 aca-catcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    ||| || |||| |||||||||| |||||||||    
T  20121997 acaccaacaacttgattatcaacaatcaacaa 20121966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 27673514 - 27673641
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgta-taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  27673514 acgactatgatgcatgaacatgtagtaaagactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 27673613  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||| | || ||| ||||||||||||    
T  27673614 tctccaaaacaattgtattatcaagaaa 27673641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22031092 - 22031007
Alignment:
Q  253 aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22031092 aaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcctcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 22031007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20956468 - 20956315
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||| ||||||| |||    
T  20956468 acgattatgatgcatggacatgtagcaaagacttgataatgcgccatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatca 20956369  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcata 281  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || | ||| ||||||| || |||||    
T  20956368 tctccacaacaattgcattatcaagaaatcacgtccatacacaatcaagtcata 20956315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22836752 - 22836628
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  22836752 acgactatgatgcatgaacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 22836653  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    | |||||| || |||||||| ||||    
T  22836652 tttccacaacaattgcattaccaag 22836628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 20253246 - 20253295
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20253246 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 20253295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38035070 - 38034997
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38035070 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 38034997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36357786 - 36357700
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacaca 268  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  36357786 caattttcacaacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaattatgtccacaca 36357700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2422579 - 2422531
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  2422579 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa 2422531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 22353097 - 22353149
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22353097 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatatcattcaacatcaact 22353149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15863056 - 15863017
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15863056 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 15863017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 22250659 - 22250620
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22250659 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 22250620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 35935203 - 35935164
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35935203 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 35935164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 22365215 - 22365253
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22365215 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 22365253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22836572 - 22836527
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22836572 catcaacataatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaact 22836527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37235405 - 37235336
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  37235405 aattttcacaacaatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag 37235336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 29887 - 30223
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 29986  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  29987 taaaagagttcaactcttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 30085  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30086 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacat 30182  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30183 caacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 30223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17714 - 17375
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17714 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcaaag 17615  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||    
T  17614 taaaagagtcatcccttttacaacaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatata 17516  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  17515 taggacaacacccaatgatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaaggaaacatgtctacacacagttacatcacagcattcatcatcacacatc 17417  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17416 aacacgattatcagtaatcaacaatgtcattcaacatcaact 17375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 67063 - 66733
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67063 taaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgttgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaag 66964  T
Q  101 taaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||    
T  66963 taaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtctaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatata 66865  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  66864 taggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaac 66766  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  66765 aatttgattatcaacaatcaataacatcattca 66733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 94985 - 95198
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  94985 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgattat 95084  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  95085 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacagttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 95184  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||| ||||||||||    
T  95185 atttaacatcaact 95198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 95294 - 95346
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  95294 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 95346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3197 - 2861
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3197 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 3100  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  3099 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 3001  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3000 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcaccatcacacat 2904  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2903 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23194 - 22997
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23194 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 23095  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||     ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23094 ccacatcatttgctttatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatca-----caacatgatcatcaataatcaacaatgtcat 23000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 34869 - 35182
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34869 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatatcgaag 34968  T
Q  101 taaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  34969 taaaagagttcaatccttttatagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 35067  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  35068 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagttttcatcatcacatat 35166  T
Q  300 -caacatgattatcaa 314  Q
     |||| ||||||||||    
T  35167 acaacttgattatcaa 35182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 155849 - 155640
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  155849 cgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 155750  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  155749 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 155653  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  155652 ttcaacatcaact 155640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 732
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  936 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctc 838  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||     
T  837 cacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatc 741  T
Q  332 caacatcaa 340  Q
    |||||||||    
T  740 caacatcaa 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 155974 - 155935
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  155974 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 155935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 5718 - 6054
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5718 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatgggcaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 5815  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  5816 gtaaaagagtcatcccttttacaacaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatat 5914  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915 ataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaattatagtattcaccatcacacat 6011  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6012 caacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 217374 - 217033
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  217374 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccc-gccttaca-taatctccg 217278  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  217277 aagtaaaagagctcaacccttttacaattaca-cgactatgatgtatggatatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cataattttctccataa 217180  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  217179 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcatcac 217080  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  217079 acatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaact 217033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25777
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25439 taaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 25536  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |    | ||||||    
T  25537 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaat-caccatgtcaaactcaatat 25635  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25636 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 25734  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  25735 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 25777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 21184 - 21522
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21184 taaatgcatgcggtaccatatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 21281  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |    | ||||||    
T  21282 gtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgataacaat-caccatgtcaaactcaatat 21380  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21381 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactt 21479  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21480 caacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaact 21522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 37825 - 38160
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37825 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatctcgaa 37922  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||    
T  37923 gtaaaagattcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatat 38021  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38022 ataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcatcatcacacat 38118  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38119 caacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaact 38160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 1015 - 1241
Alignment:
Q  115 cttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca 214  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1015 cttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacaccca 1113  T
Q  215 attatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114 attatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaa 1213  T
Q  315 taatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1214 taatcaacaatgtcattcaacatcaact 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 5898 - 6108
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-ctcaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 5996  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  5997 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 6094  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  6095 attcaacatcaact 6108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1388
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1336 catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 906 - 945
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  906 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38828 - 38616
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcat 38730  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38729 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 38630  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  38629 attcaacatcaact 38616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40368
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  40027 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 40124  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40125 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtagcaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 40222  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40223 tatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 40322  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40323 tatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaact 40368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 39033 - 38994
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39033 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 38994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2756 - 2416
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || | |||||| ||||||| |    
T  2756 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctct-gatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtcttaca-taatctccg 2659  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2658 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcg-taatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 2562  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2561 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacatttaaatcatagtattcaccatcaca 2462  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2461 catcaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 2416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32817 - 32476
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  32817 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 32720  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32719 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtagcaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 32622  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32621 tatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcaca 32522  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32521 tatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaact 32476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 261
Target Start/End: Original strand, 34016 - 34147
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34016 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcat 34114  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34115 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc 34147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 33811 - 33850
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33811 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 33850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 145070 - 145407
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg---ccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   | |||  ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  145070 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatggaacaact--cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaa 145165  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  145166 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 145263  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  145264 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattattaagaaaacatgcccatacataaataaatcatagtattcaccatcacaca 145363  T
Q  299 tcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  145364 ttaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaact 145407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 147329 - 147666
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg---ccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||   | |||  ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  147329 atgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctt-cgatggaacaact--cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaa 147424  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  147425 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggatatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 147522  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaa-ttaaatcatagtattcaccatcacac 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  147523 tataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattatcaagaaaacatgccaattcacaatttaaatcatagtattcatcaccacac 147622  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaac 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  147623 atcaacatgattatcaacaatcaataagatccttcaacatcaac 147666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 145502 - 145554
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  145502 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcatttaacatcaact 145554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 28549 - 28761
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28549 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 28648  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28649 ctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 28747  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  28748 attcaacatcaact 28761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 28857 - 28909
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28857 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 28909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52837 - 52559
Alignment:
Q  63 atgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggact 160  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  52837 atgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagact 52740  T
Q  161 cgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatg 260  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52739 cgataatgtgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaacatg 52641  T
Q  261 cccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52640 cccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 52559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 56789 - 56511
Alignment:
Q  63 atgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggact 160  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  56789 atgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagact 56692  T
Q  161 cgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatg 260  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56691 cgataatgtgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaacatg 56593  T
Q  261 cccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56592 cccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 56511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 38875 - 39089
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38875 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 38974  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38975 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt 39074  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  39075 cattcaacatcaact 39089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 78216 - 78429
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  78216 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 78315  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  78316 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttc 78415  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  78416 attcaacatcaact 78429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 44512 - 44676
Alignment:
Q  179 tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44512 tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatc 44611  T
Q  279 atagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44612 ataggattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaact 44676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 1 - 338
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttg-cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  ||    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  1 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagctcgtcacctt-cgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagt 98  T
Q  102 aaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatata 200  Q
    |||| || ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  99 aaaaaagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatata 196  T
Q  201 taggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatc 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  197 taggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacataattaaatcatagtatccaccatcacacatc 296  T
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  297 gacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 17314 - 17524
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17314 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcc-caattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatct 17412  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17413 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaactcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat 17512  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  17513 tcaacatcaact 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7961 - 8310
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||  ||||| | | |||||| ||||||| |||    
T  7961 taaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacaaccgtcttaca-taatctccgaa 8058  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8059 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcattgacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttca 8158  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8159 cctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcacc 8258  T
Q  291 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8259 atcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 8310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11656 - 11322
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  11656 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaa 11560  T
Q  100 gtaaaagagtcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatat 199  Q
    ||||||||  || ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11559 gtaaaagaacca-cccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaat-cacaattttctccacaatat 11463  T
Q  200 ataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacat 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11462 ataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaaggaaacatgcccacatacaattaaatcatagtattcatcatcacacct 11363  T
Q  300 caacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11362 caacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa 11322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 109706 - 109366
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || | |||||| ||||||| ||    
T  109706 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtcttaca-taatctccga 109609  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| || |||||||  |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||    
T  109608 agtaaaagagatcaaccattttacaacaact-cgactatgatgcataaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaat 109510  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109509 atataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacac 109411  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  109410 atcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 109366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 54176 - 54486
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |    ||||||| ||||||| | |||||||   |||||| ||||||| |||    
T  54176 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac-tttcgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacacccagcttaca-taatctctgaa 54272  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| || |||||||   | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54273 gtaaaagagctcaacctttttacaactata-cgactatgatgcatggacatgtagtaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 54370  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  54371 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcacattcataattaaatcatagtattcatcattacaca 54470  T
Q  299 tcaacatgattatcaa 314  Q
    | ||||||||||||||    
T  54471 ttaacatgattatcaa 54486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 20056 - 20268
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 20154  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20155 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacaagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtc 20254  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  20255 attcaacatcaact 20268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 17974 - 18184
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17974 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 18072  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18073 ccacatcatttgcattatcaagaaaacaagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcat 18172  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  18173 tcaacatcaact 18184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 7940
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  8149 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatct 8050  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8049 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcat 7950  T
Q  331 tcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||    
T  7949 tcaacatcaa 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13538 - 13329
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  13538 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatct 13439  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13438 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcat 13339  T
Q  331 tcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||    
T  13338 tcaacatcaa 13329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 19920 - 20027
Alignment:
Q  3 aatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac-ctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaag 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| ||    |||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||    
T  19920 aatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttac-ataatctccgaag 20018  T
Q  101 taaaagagt 109  Q
    |||||||||    
T  20019 taaaagagt 20027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15359 - 15149
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15359 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 15260  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15259 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcc--cacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 15163  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  15162 attcaacatcaact 15149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2337 - 2124
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  2337 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgattatc 2238  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2237 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaattatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 2138  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  2137 attcaacatcaact 2124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11422 - 11210
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11422 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaaaaat-cacaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttcat 11324  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11323 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcaacattacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtc 11224  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  11223 attcaacatcaact 11210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 41242 - 41582
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cg 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  41242 taaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacagctcaacatcgtatgtaagggttcacccctgccttaca-taatctacg 41339  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41340 aagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatagaaatgtaaaaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 41437  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-c 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| ||||| |    
T  41438 tatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaagtcatagcactcatcatcacc 41537  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41538 acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa 41582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19070 - 18862
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19070 tatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtcca 18971  T
Q  234 catcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  18970 catcatttgcattatcaagaaaacatgcacatgcacaaataaatcatagtattcacaattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatcca 18871  T
Q  334 acatcaact 342  Q
    |||||||||    
T  18870 acatcaact 18862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18715
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18767 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 18715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Original strand, 12863 - 13074
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12863 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 12961  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12962 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacctcatcaacatgattatcaataatcaacaatgt 13061  T
Q  328 cattcaacatcaa 340  Q
    |||||||||||||    
T  13062 cattcaacatcaa 13074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 12727 - 12834
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  12727 taaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgccttac-ataatctccgaa 12824  T
Q  100 gtaaaagagt 109  Q
    ||||||||||    
T  12825 gtaaaagagt 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 6078 - 6424
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    | |||| ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  6078 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagta 6175  T
Q  103 aaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  6176 aaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgattcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct 6275  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  6276 caatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatc 6375  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6376 acacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 6424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 129 - 335
Target Start/End: Original strand, 40263 - 40468
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40263 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcat 40361  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40362 ctacacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 40461  T
Q  329 attcaac 335  Q
    |||||||    
T  40462 attcaac 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 32247 - 32460
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32247 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 32346  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32347 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtacatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcgacaatgtc 32446  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  32447 attcaacatcaact 32460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 249036 - 248824
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  249036 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaaaaat-cacaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcat 248938  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  248937 tcccacatcatctgcattatcaagaaaacatgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 248838  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  248837 attcaacatcaact 248824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13824 - 13478
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  13824 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagta 13727  T
Q  103 aaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13726 aaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagattcgataatgcgacaacaat-cacaattttctcca 13628  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13627 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccacacccaattaaatcatagcattcatcatc 13528  T
Q  294 a-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  13527 accacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacatcaact 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 15979 - 16311
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  15979 taaatgcatgtggtatcaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccga 16076  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  16077 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaat 16175  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca- 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  16176 atataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacat 16274  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
     |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16275 aaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 16311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28007 - 27797
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  28007 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatc 27908  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27907 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 27810  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  27809 ttcaacatcaact 27797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6644
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6857 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 6758  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6757 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcctatacacaattaaatcatagcatccatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtc 6658  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  6657 attcaacatcaact 6644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4377 - 4718
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  4377 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccga 4474  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||    
T  4475 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaat 4573  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4574 atataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-tagcattatcaagaaaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcaca 4672  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4673 caataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaact 4718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 14345 - 14557
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14345 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatct 14444  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataa-tcaacaacgtca 329  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14445 ccacaatatttgcattatcaagaaatcatgtctatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataattcaacaatgtca 14544  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  14545 ttcaacatcaact 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 270656 - 270999
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  270656 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 270753  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  270754 aaataaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 270851  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatca- 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||     
T  270852 tatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaaaccatagtattcatcatcac 270951  T
Q  295 cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  270952 cacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 270999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 236710 - 237059
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |  | ||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  236710 taaatgcatgtggtaccttatcacctctaggtcgtcacctt-cgatgctactttaacatcgtatgtaagatttcacacctttcttaca-taatctccgaa 236807  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  236808 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaatttcca 236906  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  236907 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttgcattatcaagaaaatatgtccatacataattaaatcatagcattcatc 237006  T
Q  291 atc-acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  237007 atctccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 237059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 8745 - 8956
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8745 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 8844  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  8845 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcatcatgttcatcaataatcaacaatgtcat 8944  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  8945 tcaacatcaact 8956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 69432 - 69643
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  69432 gactatgatgcatggacatgtaacaggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatct 69531  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  69532 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcatcatgataatcaataatcaacaatgtcat 69631  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  69632 tcaacatcaact 69643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 334
Target Start/End: Original strand, 30740 - 30946
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  30740 acgactatgatgcatggacatgtagcaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcat 30839  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  30840 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataacattcattatcaccacatgaacaagatcatcaataatcaacaatgt 30939  T
Q  328 cattcaa 334  Q
    |||||||    
T  30940 cattcaa 30946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27899
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27686 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 27784  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccat-cacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |  ||||||| ||||||||| ||    
T  27785 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagtattcaccattcacaaaataacttatttatcaaaaatcaacaatgt 27884  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||    
T  27885 cattcaacatcaact 27899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 256405 - 256192
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  256405 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 256306  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaac-aacgt 327  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  256305 ctccacaacattt-cattatcaagaaaacatgctcatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgt 256207  T
Q  328 cattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||||    
T  256206 cattcaacttcaact 256192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 124787 - 124576
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  124787 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 124688  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  124687 ctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacccaattaaatcatagtattcatcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaaaatc 124590  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  124589 attcaacatcaact 124576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 193278 - 193489
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  193278 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattat 193377  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  193378 ctccaca-catt-gcattaacaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacataaacatgattatcaataatcaacaatgtc 193475  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  193476 attcaacatcaact 193489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 76186 - 75977
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||    
T  76186 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgattatct 76087  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  76086 ccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgtccacactcaattaaatcatagtattcttcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatttcat 75989  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  75988 tcaacatcaact 75977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262798
Alignment:
Q  165 aatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgccca 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  262975 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctca 262877  T
Q  265 cacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaac-aacgtcattcaacatcaact 342  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  262876 tacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaacttcaact 262798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 1848 - 2059
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  1848 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattat 1947  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1948 ctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtt 2045  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  2046 attcaacatcaact 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 90376 - 90169
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  90376 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaa---tccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatct 90280  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  90279 ccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcat 90181  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  90180 tcaacatcaact 90169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 129051 - 129260
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  129051 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatc 129150  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  129151 tccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagcattcaccatcatgcctcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 129247  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  129248 ttcaacatcaact 129260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 78409 - 78471
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  78409 acaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 78471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 128924 - 128963
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  128924 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 128963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13235 - 13025
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13235 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctc 13136  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcatt 331  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13135 aacaacatttgcattgtcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatt 13036  T
Q  332 caacatcaact 342  Q
    |||||||||||    
T  13035 caacatcaact 13025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 161 - 202
Alignment:
Q  301 aacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  161 aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5223 - 4902
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctcgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | ||||  | |||||||| ||||||| ||    
T  5223 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtaaacatcgtatgtaagggttcactgccgccttaca-taatctccaa 5126  T
Q  100 -gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
     ||||||||| ||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5125 agtaaaagagctcaacccttttaccacaaca-cgactatgatgcatggacatgtaataagactcgacaatgcgacaataat-cacaattttctccacaat 5028  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt--aaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || | |    
T  5027 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaaaatcatagtattcatcaccgc 4928  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4927 acatcaacatgattatcaacaatcaa 4902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 12825 - 12786
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12825 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Original strand, 7614 - 7837
Alignment:
Q  98 aagtaaaagagt-catcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7614 aagtaaaagagttcaacccttttacaacaaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatacgacaacaat-cacaattttctccacaa 7711  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatcac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  7712 tatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcaccac 7811  T
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7812 acaacaacatgattatcaacaatcaa 7837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6644 - 6434
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||    
T  6644 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatc 6545  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6544 tccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtca 6447  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  6446 ttcaacatcaact 6434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70681
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  70892 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttatattaatcatct 70793  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  70792 ccacaacatttgaattatcaagaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcat 70693  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  70692 tcaacatcaact 70681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26221 - 26009
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  26221 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattat 26122  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  26121 ctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgtctatacacagataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtc 26023  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  26022 attcaacattaact 26009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 340
Target Start/End: Original strand, 93527 - 93571
Alignment:
Q  296 acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  93527 acatcaacatgatcatcaataatcaacaaagttattcaacatcaa 93571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 892 - 686
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  892 acgactatgatgcatggacatgtaacaagattcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattac 793  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  792 ctccacaacatttgcattatcaagaaatcatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatttacatgattatcaataatcaacaatgtc 693  T
Q  329 attcaac 335  Q
    |||||||    
T  692 attcaac 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 3290 - 3500
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-ctcaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 3388  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  3389 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt 3486  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||    
T  3487 attcaacatcaact 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 71949 - 71736
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  71949 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattatattgatcat 71850  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  71849 ctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacacaaataattcatagtattcatcatcgcacattaatatgattatcaataatcaacaatgtc 71750  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  71749 attcaacatgaact 71736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 60103 - 60451
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  60103 taaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaa 60200  T
Q  100 gtaaaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||        ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  60201 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaatatcaacacgaatatgatgcatgaacatgtaaaaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttca 60299  T
Q  191 ccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |    
T  60300 ccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattaatc 60398  T
Q  291 atca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  60399 atcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaact 60451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Original strand, 46819 - 47003
Alignment:
Q  157 gactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46819 gactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa 46916  T
Q  257 catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46917 catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaact 47003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 21325 - 21536
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21325 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgatcatct 21424  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21425 ccacaacatttgcattatcaagaaaacatgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcat 21524  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||    
T  21525 tcaacatcaact 21536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 129696 - 129504
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129696 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 129598  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaatt-aaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  129597 ctccacatcatttgcattatcaacaaaacatgcccatacacaattaaaatcatagtattcgtcaccgcatatcaacatggttatcaacaatcaa 129504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 138440 - 138096
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||    |||||| |||||| |  ||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  138440 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt-cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagta 138343  T
Q  103 aaagagt-catcccttttacagtaacaa--------cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcca 193  Q
    ||||||| || ||||||||||   ||||        ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |      
T  138342 aaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcatggacatgtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-cactt 138244  T
Q  194 caatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatc 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  138243 caatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gtattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatc 138145  T
Q  294 acacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  138144 acacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 138096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 87106 - 87316
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  87106 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattat 87205  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  87206 ctccacaaca-ttgcat--tcaagaaaacatgtccatacacaaataaatcgtagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtc 87302  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  87303 attcaacattaact 87316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 10328 - 10543
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgt-ataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||| |||    
T  10328 acgactatgatgcatggacatgttacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatca 10427  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||  |||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10428 tctccacaacatttgcattatcaagaaaacatatccatacacaatcaaagcataagattcattatcaccatatcaacatgattatcaacaatcaacaatg 10527  T
Q  327 tcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||| |||||||    
T  10528 tcattcaatatcaact 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 77048 - 77124
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatatagga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  77048 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga 77124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 7459 - 7671
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7459 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgatcatct 7558  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7559 ccaaaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatgcacaatcaaatcataagattcatcatcaccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 7658  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||| ||||    
T  7659 ttcaacataaact 7671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 132 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14757 - 14567
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctc 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  14757 actatgatgcatggacaagtataaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgattatctc 14658  T
Q  232 cacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaa 324  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14657 cacaacatt-gcattatcaagaaa-catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaa 14567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Original strand, 28256 - 28375
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaa-acatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaac 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28256 tcatctccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaac 28355  T
Q  323 aacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || || ||||||||||||||    
T  28356 aatgttattcaacatcaact 28375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Original strand, 40252 - 40371
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaa-acatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaac 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40252 tcatctccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaac 40351  T
Q  323 aacgtcattcaacatcaact 342  Q
    || || ||||||||||||||    
T  40352 aatgttattcaacatcaact 40371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 340
Target Start/End: Original strand, 28472 - 28522
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28472 catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaacatcaa 28522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 340
Target Start/End: Original strand, 40468 - 40518
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  40468 catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23863 - 23801
Alignment:
Q  193 acaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23863 acaatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaa 23801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 614 - 888
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  614 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 711  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  712 aagtaaaagagctcaacccttttacaaccaca-cgactatgatgcatggagatggaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaa 809  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  810 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaa 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 134 - 275
Target Start/End: Original strand, 15004 - 15144
Alignment:
Q  134 tatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 233  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004 tatgatgcatggagatggaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcca 15102  T
Q  234 catcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15103 catcatttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaa 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 342
Target Start/End: Original strand, 145 - 432
Alignment:
Q  55 cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgta 152  Q
    ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  145 cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgta 242  T
Q  153 taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||    
T  243 taaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-taacattatcaag 341  T
Q  253 aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  342 aaaacatacccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaact 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6104 - 5893
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6104 acgagtatgatccatggacatgtataaggactcgc-aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattat 6006  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6005 ctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtc 5908  T
Q  329 attcaa-catcaact 342  Q
    |||||| ||||||||    
T  5907 attcaatcatcaact 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3187 - 2975
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  3187 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatc 3088  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcacca-tcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtc 328  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  3087 tccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaaatagatcatagtatttaccattcacacattaacttgattatgaacaatcaacaatgtc 2989  T
Q  329 attcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| ||||    
T  2988 attcaacataaact 2975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 4794 - 4970
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4794 acgactatgatgcatggacatgtaacaaaactcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcat 4893  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4894 ctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacgcaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacat 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 342
Target Start/End: Original strand, 3326 - 3537
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  3326 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatat 3425  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3426 ccacaacatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaatcaattcatagcattcctcatcacacatcaacatgattatcgataatcaacaatgtcat 3525  T
Q  331 tcaacatcaact 342  Q
    ||| ||||||||    
T  3526 tcagcatcaact 3537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Original strand, 3191 - 3295
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  3191 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagta 3288  T
Q  103 aaagagt 109  Q
    |||||||    
T  3289 aaagagt 3295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4375 - 4092
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  4375 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 4278  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  4277 aagtaaaagagctcaacccttttacaacaaca-cgactatgatgcatggatatgtaacaagactcgataatgcgacaagaat-cacaattttctcctcaa 4180  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagta 284  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4179 tatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaacatgcgcatacacaattaaatcatagta 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49215 - 48932
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccact--tgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-g 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||   |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |    
T  49215 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccg 49118  T
Q  98 aagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaa 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  49117 aagtaaaagagctcaacccttttacaacaaca-cgactatgatgcatggatatgtaacaagactcgataatgcgacaagaat-cacaattttctcctcaa 49020  T
Q  197 tatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagta 284  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49019 tatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaacatgcgcatacacaattaaatcatagta 48932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6773 - 6441
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  6773 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccga 6676  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || ||||    
T  6675 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggaaatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaat 6577  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca- 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  6576 atataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaacatgcccacacacaaataaatcaaagtattcatcatcacat 6478  T
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
     |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  6477 aaataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 6441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 281
Target Start/End: Original strand, 108314 - 108467
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||||||   | || ||||||| |||    
T  108314 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcacctcacaatttccaccacaatataaaggacaatttctaaatatattgatca 108413  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcata 281  Q
    |||||| | || ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  108414 tctccagaacaattgcattattaagaaatcatgtccatacacaatcaaatcata 108467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 106370 - 106297
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  106370 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 106297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 113887 - 113842
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  113887 catcaacatgattatcaattatcaacaatgtcattcaacatcaact 113842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 106536 - 106867
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-ga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||  ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||    
T  106536 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatggacaagtcaacatcatatgtaagggatcacccccgccttaca-taatctccga 106633  T
Q  99 agtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaat 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   || ||||    
T  106634 agtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaat 106732  T
Q  198 atataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  106733 atataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacat 106831  T
Q  298 atcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
    |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  106832 aataacttgattatcaacaatcaacaatatcattca 106867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2121 - 1916
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  2121 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactctataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatct 2022  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  2021 cgacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcac 1922  T
Q  331 tcaaca 336  Q
    ||||||    
T  1921 tcaaca 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 197726 - 197482
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |   | |||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  197726 taaatacatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt-cgatgataaaag-acatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctctgaa 197630  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   ||| | |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  197629 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca-caactatgatacatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaata 197532  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197531 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat 197482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 333
Target Start/End: Original strand, 51620 - 51897
Alignment:
Q  55 cacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgta 152  Q
    ||||||| ||||||| | |||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| | |||||    
T  51620 cacatcgtatgtaagggttcacccccgcctgaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgaatatgatgcatgaaaatgta 51717  T
Q  153 taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  51718 taaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaag 51816  T
Q  253 aaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattca 333  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||  |||||||    
T  51817 gaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttggttatcaacaatcaacaatatcattca 51897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6831 - 6634
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  6831 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatct 6732  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcat 330  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||     ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6731 ccacaaaatttgcattatcatgaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatca-----caacatgatcatcaataatcaacaatgtcat 6637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1287 - 1116
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattt---tctcca---caatatataggacaacacccaattatattg 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287 cgactatgatgcatgaacatatataaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattg 1188  T
Q  224 ttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcaca 296  Q
     | ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1187 attatctccacaacatt-gcattaccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcaca 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1371
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1410 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 6549 - 6770
Alignment:
Q  132 actatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatct 230  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  6549 actatgatacatggacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatct 6648  T
Q  231 ccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatca 320  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |         ||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6649 ccacaacatttgaattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattccttatcacaacatcaacatgatcatcaataatca 6748  T
Q  321 acaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6749 acaatgtcattcaacatcaact 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 230 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20692 - 20580
Alignment:
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtca 329  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20692 tccacaacacttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca 20593  T
Q  330 ttcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||||    
T  20592 ttcaacatcaact 20580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20741 - 20686
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20741 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaa 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9455 - 9284
Alignment:
Q  96 cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccac 194  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || |    
T  9455 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctc 9357  T
Q  195 aatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacaca 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9356 aatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaaggaaacatgcccacaca 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17802 - 17684
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17802 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaaca 17703  T
Q  324 acgtcattcaacatcaact 342  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17702 aagttattcaacatcaact 17684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24221 - 24105
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatca-cacatcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24221 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaaca 24122  T
Q  324 acgtcattcaacatcaa 340  Q
    | || |||||| |||||    
T  24121 aagttattcaatatcaa 24105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 27241 - 27333
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27241 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattg 27333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 342
Target Start/End: Original strand, 29942 - 30065
Alignment:
Q  220 attgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataa-t 318  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  29942 attgatcatctccacaacatttgcattatcataaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattaccaataatt 30041  T
Q  319 caacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  30042 caacaatgtcattcaacatcaact 30065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Original strand, 4507 - 4658
Alignment:
Q  130 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatc 229  Q
    |||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  4507 cgactacgatggatggacatgtaataagactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgatcatc 4606  T
Q  230 tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcata 281  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||| ||||||||    
T  4607 tccacaacatttgcatcatcaataaaatatgtccatacgcaatcaaatcata 4658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 333
Target Start/End: Original strand, 145592 - 145794
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacaccca-at-tatattgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| |    
T  145592 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatatattgat 145691  T
Q  226 catctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaac 325  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  ||||     ||||||||| |||||||||||||||     
T  145692 catctccacaacattagcattatcaagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatca-----caacatgatcatcaataatcaacaat 145786  T
Q  326 gtcattca 333  Q
    ||||||||    
T  145787 gtcattca 145794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 14836 - 15073
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||| ||||||| |||    
T  14836 taaatgcatgtggaaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacccccaccttaca-taatctccgaa 14932  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaata 198  Q
     |||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |  |||||    
T  14933 ataaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaata 15031  T
Q  199 tataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15032 tataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt 15073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 28357 - 28523
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatctc-gaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||  |    ||||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  28357 taaatgcatgtggcaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc-cgatgataaaa-cacatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaa 28453  T
Q  100 gtaaaagag-tcatcccttttacagtaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgc 169  Q
     |||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454 ttaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgc 28523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 282
Target Start/End: Original strand, 58899 - 59016
Alignment:
Q  165 aatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgccca 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58899 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgccca 58998  T
Q  265 cacacaattaaatcatag 282  Q
     |||||| ||| ||||||    
T  58999 tacacaaataattcatag 59016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 59375 - 59417
Alignment:
Q  278 catagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatca 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  59375 catagtattcaccatcacacatcatcatgatcatcaataatca 59417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 20362 - 20586
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  20362 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 20461  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcaca-catcaacatgattatcaataa 317  Q
    | |||||| || |||||||||||||||| || | ||| |||| || || ||||| |         |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20462 tatccacaacaattgcattatcaagaaatcacgtccatacacgatcaagtcataattcaaataagattcactatcacatcatcaacatgatcatcaataa 20561  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  20562 tcaacaatatcattcaacatcaact 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 27191 - 27415
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  27191 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 27290  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcaca-catcaacatgattatcaataa 317  Q
    | |||||| || |||||||||||||||| || | ||| |||| || || ||||| |         |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27291 tatccacaacaattgcattatcaagaaatcacgtccatacacgatcaagtcataattcaaataagattcactatcacatcatcaacatgatcatcaataa 27390  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  27391 tcaacaatatcattcaacatcaact 27415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Original strand, 34329 - 34447
Alignment:
Q  225 tcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaaca 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34329 tcatctccacatcatttgtattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaaca 34428  T
Q  324 acgtcattcaacatcaact 342  Q
    | || ||||||||| ||||    
T  34429 atgttattcaacattaact 34447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4627
Alignment:
Q  162 gataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  4469 gataatgcgacaacaattctcaatct-cgactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaacatgc 4566  T
Q  262 ccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacac-atcaacatgattatcaataatcaa 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  4567 ccacacacagttaaatcacagtatttatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaa 4627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2966 - 2742
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  2966 acgactatgatgcatagacatgtaacaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 2867  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcac-acatcaacatgattatcaataa 317  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||| |||  ||| ||||||| || | ||| |         |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2866 tctccacaacaattttattatcaagaaatcatttccatacacaatcaatttatatttcaaataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataa 2767  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  2766 tcaacaatgtcattcaacatcaact 2742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 5723 - 5867
Alignment:
Q  194 caatatataggacaacacc-caattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccat 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |    
T  5723 caatatataggacaacaccaccattatattgattatctcaacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacacaaa--taaatcatagtattcatcct 5819  T
Q  293 cacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa 340  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5820 cacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatacaaaatcaa 5867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 342
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2306
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    
T  2082 acgactatgatgcatggacatgtaacaaagattcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatca 2181  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgcccacacacaattaaatcatagt---------attcaccatcaca-catcaacatgattatcaataa 317  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||| |||  ||| ||||||| || | ||| |         ||||   |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  2182 tctccacaacatttttattattaagaaatcatttccatacacaatcaatttatattttaattaagattctttatcacaacatcaacatgatcatctataa 2281  T
Q  318 tcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  2282 tcaacaatgtcattcaacatcaact 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 189
Target Start/End: Original strand, 966 - 1026
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  966 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttc 1026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 164 - 216
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 1 - 67
Alignment:
Q  277 tcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1 tcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaact 67  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3169 - 3077
Alignment:
Q  251 agaaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcac-acatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3169 agaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcatcatttccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacattaact 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6145 - 6021
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| | |    
T  6145 acgactatgatgcatggacaggtagcaaagactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgataa 6046  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaag 252  Q
    |||||||| || || ||||||||||    
T  6045 tctccacaacaatttcattatcaag 6021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4728
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4801 caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7114 - 7041
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7114 caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 53279 - 53328
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatca 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53279 catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca 53328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23950
Alignment:
Q  290 catcacacatcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23898 catcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaact 23950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3793 - 3667
Alignment:
Q  131 gactatgatgcatggacatgta--taaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcat 228  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||| | | ||  ||| ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||     
T  3793 gactatgatgcatggacatacaagtaaagactcgacaatgcaagatcatctcataattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcac 3694  T
Q  229 ctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3693 ctccacaacatttgcattatcaagaaa 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3929 - 3811
Alignment:
Q  4 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagagctcacacctgccttacaataatct-cgaagta 102  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||| ||||||||  ||||||| | ||||  ||||||| |||||||    
T  3929 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc-ttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtctta-tataatctccgaagta 3832  T
Q  103 aaagag-tcatcccttttaca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  3831 aaagagctcaacccttttaca 3811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 71728 - 71655
Alignment:
Q  182 caattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  71728 caattttcacaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa 71655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Original strand, 7261 - 7387
Alignment:
Q  129 acgactatgatgcatggacatgtat-aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttca 227  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||||| ||   |||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||    
T  7261 acgacaatgatgcatggacatagagcaaagactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatca 7360  T
Q  228 tctccacatcatttgcattatcaagaa 254  Q
     ||| ||| || || ||||||||||||    
T  7361 cctctacaacaattacattatcaagaa 7387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 425 - 470
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  425 catcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaact 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 118049 - 117977
Alignment:
Q  183 aattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  118049 aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattattaagaaa 117977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 255
Target Start/End: Original strand, 12943 - 12986
Alignment:
Q  212 ccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12943 ccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa 12986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43287 - 43242
Alignment:
Q  297 catcaacatgattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaact 342  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43287 catcaacataactatcaataatcaacaatgtcattaaacatcaact 43242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  1 taaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37 taaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University