View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9311_low_21 (Length: 395)

Name: NF9311_low_21
Description: NF9311
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9311_low_21
NF9311_low_21
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-379)||(4139046-4139426)
chr7 (1-379)||(24586336-24586714)
chr7 (1-379)||(16745321-16745700)
chr7 (1-379)||(4205347-4205725)
chr7 (1-379)||(31084423-31084802)
chr7 (1-379)||(5141135-5141514)
chr7 (1-379)||(26313650-26314027)
chr7 (1-379)||(26441211-26441590)
chr7 (1-379)||(26509496-26509876)
chr7 (1-379)||(26663713-26664092)
chr7 (1-379)||(5164342-5164720)
chr7 (1-379)||(26678905-26679284)
chr7 (1-379)||(31558195-31558573)
chr7 (1-379)||(5154042-5154419)
chr7 (1-379)||(26518751-26519127)
chr7 (5-379)||(39206940-39207314)
chr7 (1-372)||(11446846-11447217)
chr7 (5-379)||(26268886-26269264)
chr7 (1-382)||(45393176-45393558)
chr7 (1-379)||(11418580-11418958)
chr7 (1-376)||(45737261-45737636)
chr7 (1-372)||(3451276-3451648)
chr7 (1-379)||(2160528-2160908)
chr7 (1-379)||(16047273-16047648)
chr7 (1-379)||(16443804-16444183)
chr7 (1-379)||(2779210-2779582)
chr7 (1-379)||(31129863-31130235)
chr7 (125-379)||(26595750-26596006)
chr7 (1-379)||(10847541-10847923)
chr7 (1-379)||(16512241-16512613)
chr7 (5-379)||(10910727-10911095)
chr7 (12-124)||(26531926-26532038)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-379)||(31958413-31958793)
chr3 (1-379)||(5603271-5603651)
chr3 (1-379)||(24334097-24334477)
chr3 (1-379)||(28109909-28110292)
chr3 (1-379)||(47029377-47029756)
chr3 (12-379)||(5717003-5717371)
chr3 (12-379)||(5764087-5764455)
chr3 (12-379)||(5727913-5728281)
chr3 (1-379)||(28345095-28345472)
chr3 (1-379)||(32296553-32296932)
chr3 (1-379)||(29142712-29143093)
chr3 (1-379)||(4340634-4341013)
chr3 (1-379)||(4629709-4630086)
chr3 (5-379)||(10648999-10649373)
chr3 (1-379)||(4790591-4790970)
chr3 (1-379)||(4422842-4423220)
chr3 (1-379)||(21680625-21681002)
chr3 (1-379)||(29658926-29659304)
chr3 (5-379)||(10402077-10402450)
chr3 (1-379)||(8217556-8217936)
chr3 (12-379)||(5590319-5590686)
chr3 (1-379)||(5472912-5473289)
chr3 (1-379)||(18248662-18249040)
chr3 (1-379)||(22381539-22381915)
chr3 (5-379)||(51787950-51788324)
chr3 (1-379)||(16422107-16422485)
chr3 (1-379)||(17970824-17971200)
chr3 (1-379)||(28027215-28027591)
chr3 (1-372)||(18231117-18231488)
chr3 (2-379)||(22864806-22865181)
chr3 (2-379)||(22879865-22880240)
chr3 (1-379)||(17978908-17979288)
chr3 (1-379)||(48471851-48472233)
chr3 (1-379)||(20071959-20072337)
chr3 (5-379)||(11104319-11104694)
chr3 (1-379)||(18286313-18286690)
chr3 (1-379)||(18301614-18301991)
chr3 (1-379)||(6536701-6537079)
chr3 (5-379)||(5019641-5020014)
chr3 (1-379)||(20570804-20571182)
chr3 (1-379)||(16618447-16618829)
chr3 (1-379)||(7079148-7079529)
chr3 (1-379)||(31030203-31030574)
chr3 (1-379)||(18336552-18336924)
chr3 (1-379)||(18057184-18057565)
chr3 (1-379)||(6207824-6208198)
chr3 (1-379)||(19700410-19700800)
chr3 (1-379)||(32445078-32445447)
chr3 (1-379)||(4727557-4727929)
chr3 (1-379)||(15735058-15735431)
chr3 (1-379)||(5658058-5658433)
chr3 (1-374)||(4689575-4689942)
chr3 (1-379)||(8283416-8283805)
chr3 (1-379)||(35886688-35887062)
chr3 (1-148)||(15886894-15887043)
chr3 (5-124)||(8002488-8002607)
chr3 (177-379)||(15886699-15886895)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-379)||(22922048-22922428)
chr2 (1-379)||(39896027-39896405)
chr2 (1-379)||(19410389-19410769)
chr2 (1-379)||(37679796-37680176)
chr2 (1-379)||(37695061-37695441)
chr2 (1-379)||(12661498-12661875)
chr2 (1-379)||(37383636-37384014)
chr2 (5-379)||(27809664-27810040)
chr2 (1-379)||(21671075-21671456)
chr2 (12-379)||(254557-254924)
chr2 (1-379)||(11629090-11629467)
chr2 (12-379)||(37945770-37946138)
chr2 (1-379)||(3788453-3788830)
chr2 (5-379)||(12592773-12593151)
chr2 (12-379)||(13930449-13930818)
chr2 (1-379)||(40239468-40239845)
chr2 (1-379)||(27122484-27122860)
chr2 (1-379)||(37931331-37931716)
chr2 (1-379)||(34867642-34868019)
chr2 (1-372)||(12710513-12710884)
chr2 (40-379)||(16167476-16167815)
chr2 (12-379)||(9343892-9344259)
chr2 (1-379)||(34160803-34161183)
chr2 (1-372)||(16823249-16823621)
chr2 (1-372)||(16897859-16898231)
chr2 (1-379)||(27782191-27782569)
chr2 (1-379)||(32055761-32056138)
chr2 (12-379)||(39045727-39046094)
chr2 (12-379)||(31882257-31882623)
chr2 (1-379)||(21697078-21697459)
chr2 (1-379)||(34297115-34297486)
chr2 (90-379)||(31868691-31868979)
chr2 (1-379)||(27396282-27396670)
chr2 (1-379)||(34268831-34269204)
chr2 (1-379)||(28888238-28888611)
chr2 (1-379)||(19450323-19450710)
chr2 (1-379)||(23122483-23122856)
chr2 (1-379)||(27428358-27428729)
chr2 (1-379)||(20843872-20844249)
chr2 (239-379)||(23116993-23117133)
chr2 (1-95)||(31887682-31887776)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (6-379)||(28355827-28356203)
chr8 (1-379)||(29835284-29835661)
chr8 (1-379)||(31483747-31484127)
chr8 (1-379)||(19680409-19680786)
chr8 (1-379)||(33248327-33248704)
chr8 (1-379)||(9360583-9360960)
chr8 (1-379)||(18796667-18797046)
chr8 (5-379)||(31360493-31360867)
chr8 (1-379)||(19202252-19202619)
chr8 (1-379)||(44566941-44567322)
chr8 (1-379)||(12086600-12086979)
chr8 (1-377)||(18715443-18715819)
chr8 (1-379)||(21342047-21342426)
chr8 (1-372)||(33264692-33265062)
chr8 (1-379)||(15773535-15773913)
chr8 (1-379)||(19911039-19911419)
chr8 (1-298)||(16260184-16260480)
chr8 (1-379)||(22074806-22075184)
chr8 (1-379)||(19655224-19655599)
chr8 (1-379)||(27602791-27603162)
chr8 (1-379)||(22138867-22139239)
chr8 (1-379)||(2131145-2131517)
chr8 (1-379)||(19694056-19694430)
chr8 (1-379)||(14569118-14569493)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-379)||(27284224-27284602)
chr6 (1-379)||(13518056-13518434)
chr6 (1-379)||(8899561-8899939)
chr6 (1-379)||(27623569-27623949)
chr6 (1-379)||(16755778-16756157)
chr6 (1-379)||(4763721-4764099)
chr6 (1-379)||(27063440-27063817)
chr6 (1-379)||(27355973-27356351)
chr6 (1-379)||(26110273-26110650)
chr6 (1-379)||(28166452-28166831)
chr6 (1-379)||(27491091-27491469)
chr6 (1-379)||(34458370-34458746)
chr6 (1-379)||(16937887-16938265)
chr6 (1-379)||(16680097-16680476)
chr6 (1-378)||(27200144-27200522)
chr6 (1-378)||(27248711-27249089)
chr6 (1-379)||(33370293-33370671)
chr6 (1-379)||(4778838-4779217)
chr6 (1-372)||(26772498-26772868)
chr6 (1-379)||(29555516-29555894)
chr6 (1-365)||(4531246-4531609)
chr6 (1-372)||(30551869-30552241)
chr6 (1-379)||(4539620-4539999)
chr6 (1-372)||(26791774-26792145)
chr6 (1-379)||(22928743-22929123)
chr6 (1-379)||(29507374-29507754)
chr6 (12-372)||(29578984-29579343)
chr6 (1-379)||(28213412-28213791)
chr6 (1-379)||(13292813-13293185)
chr6 (2-349)||(26926729-26927073)
chr6 (1-379)||(27013691-27014062)
chr6 (1-379)||(14139262-14139634)
chr6 (1-379)||(27030981-27031356)
chr6 (1-379)||(27208862-27209236)
chr6 (1-379)||(27239992-27240366)
chr6 (1-379)||(24869668-24870040)
chr6 (124-372)||(26666527-26666774)
chr6 (1-379)||(27025103-27025477)
chr6 (1-379)||(24299622-24299995)
chr6 (1-379)||(15406395-15406769)
chr6 (1-379)||(15418182-15418556)
chr6 (83-365)||(20174589-20174881)
chr6 (83-365)||(22161110-22161402)
chr6 (1-119)||(23851450-23851568)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-379)||(3647109-3647487)
chr1 (1-379)||(10968628-10969007)
chr1 (1-379)||(51644183-51644563)
chr1 (1-379)||(10951054-10951433)
chr1 (1-379)||(28591046-28591423)
chr1 (3-379)||(41787224-41787602)
chr1 (1-379)||(28155691-28156069)
chr1 (1-379)||(20334330-20334710)
chr1 (1-379)||(16201942-16202328)
chr1 (1-379)||(20466740-20467126)
chr1 (1-379)||(21891677-21892041)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-379)||(33881094-33881472)
chr5 (1-379)||(18369347-18369725)
chr5 (1-379)||(6880271-6880650)
chr5 (5-379)||(3795510-3795885)
chr5 (1-379)||(9323445-9323822)
chr5 (5-379)||(30174437-30174812)
chr5 (1-379)||(11555322-11555699)
chr5 (1-379)||(12138144-12138521)
chr5 (1-378)||(37746144-37746521)
chr5 (1-379)||(37352459-37352837)
chr5 (1-379)||(8659287-8659664)
chr5 (1-379)||(33298501-33298883)
chr5 (1-379)||(37760950-37761329)
chr5 (1-379)||(18494583-18494960)
chr5 (1-379)||(28655210-28655589)
chr5 (1-379)||(26486364-26486731)
chr5 (1-379)||(28953595-28953973)
chr5 (5-379)||(43084230-43084604)
chr5 (5-379)||(11329609-11329985)
chr5 (1-379)||(13318643-13319020)
chr5 (12-379)||(40467368-40467735)
chr5 (1-379)||(30035394-30035771)
chr5 (1-372)||(24729938-24730309)
chr5 (1-379)||(13436489-13436874)
chr5 (1-379)||(30158001-30158380)
chr5 (1-379)||(41680672-41681051)
chr5 (3-379)||(9544522-9544899)
chr5 (1-379)||(13180608-13180982)
chr5 (1-379)||(22894384-22894761)
chr5 (1-379)||(23631937-23632317)
chr5 (1-379)||(15752673-15753045)
chr5 (1-379)||(34622486-34622865)
chr5 (1-379)||(37665301-37665679)
chr5 (1-372)||(31820232-31820601)
chr5 (1-379)||(32590091-32590468)
chr5 (1-372)||(33522349-33522722)
chr5 (1-379)||(2517033-2517412)
chr5 (40-379)||(5643807-5644144)
chr5 (1-379)||(18122231-18122609)
chr5 (1-379)||(31437432-31437803)
chr5 (3-379)||(25206247-25206630)
chr5 (3-379)||(25270403-25270786)
chr5 (1-379)||(15652575-15652951)
chr5 (1-379)||(22992939-22993309)
chr5 (1-379)||(23897842-23898214)
chr5 (1-379)||(33783455-33783828)
chr5 (1-379)||(24975817-24976189)
chr5 (1-379)||(24608213-24608587)
chr5 (1-374)||(30940604-30940971)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-379)||(39856609-39856985)
chr4 (1-379)||(40099551-40099930)
chr4 (1-379)||(5011849-5012228)
chr4 (12-379)||(20332337-20332705)
chr4 (1-379)||(24586276-24586655)
chr4 (1-379)||(14104515-14104892)
chr4 (40-379)||(27157227-27157568)
chr4 (1-379)||(30759736-30760112)
chr4 (1-379)||(33667718-33668094)
chr4 (1-379)||(54839363-54839740)
chr4 (1-379)||(5700512-5700890)
chr4 (1-379)||(18794532-18794910)
chr4 (1-379)||(14753409-14753786)
chr4 (1-379)||(34182879-34183255)
chr4 (1-372)||(21975675-21976047)
chr4 (1-372)||(31120432-31120805)
chr4 (1-379)||(36338441-36338811)
chr4 (40-365)||(24118674-24118998)
chr4 (1-379)||(6575834-6576204)
chr4 (1-379)||(1906224-1906607)
chr4 (1-379)||(15233788-15234170)
chr4 (1-379)||(15276544-15276925)
chr4 (1-379)||(15380153-15380531)
chr4 (46-379)||(1673877-1674213)
chr4 (1-379)||(14670988-14671363)
chr4 (1-379)||(17019024-17019398)
chr4 (119-379)||(36324232-36324484)
chr4 (1-57)||(18311415-18311472)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-379)||(9557-9934)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-379)||(3094-3474)
scaffold0159 (183-379)||(17949-18147)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-379)||(11999-12374)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-379)||(8844-9221)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-379)||(9875-10252)
scaffold0143 (1-379)||(33258-33633)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-379)||(4518-4899)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-379)||(18548-18926)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-379)||(1618-1996)
scaffold0322 (1-379)||(12007-12396)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-379)||(13910-14289)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-379)||(15530-15915)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-379)||(25076-25462)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-379)||(6027-6402)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-379)||(24821-25195)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (1-200)||(338-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-184)||(26243-26426)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (254-379)||(1-126)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (1-178)||(40759-40945)
scaffold0099 (319-379)||(40545-40606)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4139426 - 4139046
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4139426 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 4139327  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139326 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4139227  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139226 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 4139127  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4139126 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 4139046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24586714 - 24586336
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24586714 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 24586615  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||    
T  24586614 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aa 24586516  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586515 gactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 24586416  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24586415 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 24586336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16745700 - 16745321
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16745700 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 16745601  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16745600 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 16745501  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16745500 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 16745402  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16745401 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtc 16745321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4205347 - 4205725
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4205347 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 4205446  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  4205447 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 4205545  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4205546 aactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaac 4205644  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4205645 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 4205725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31084802 - 31084423
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084802 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 31084703  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  31084702 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-a 31084604  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  31084603 aattctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatt 31084504  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31084503 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 31084423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5141514 - 5141135
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  5141514 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 5141415  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141414 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5141315  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141314 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5141216  T
Q  300 ttttgtctatttt-taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5141215 ttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 5141135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26314027 - 26313650
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26314027 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 26313928  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  26313927 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 26313829  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26313828 aactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 26313730  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26313729 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 26313650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26441211 - 26441590
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  26441211 tgcagctgttaatgaccatcttcgtctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 26441310  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26441311 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaa 26441410  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441411 actccattttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26441510  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26441511 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtc 26441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26509876 - 26509496
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509876 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 26509777  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26509776 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaa 26509677  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-c 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26509676 aactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 26509577  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26509576 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 26509496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26664092 - 26663713
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664092 tgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 26663993  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26663992 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 26663893  T
Q  201 actctat-ttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663892 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26663793  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26663792 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26663713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5164342 - 5164720
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5164342 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 5164441  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5164442 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 5164541  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagc-taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164542 -ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 5164640  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164641 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5164720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26679284 - 26678905
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679284 tgcagctgttaatgcctatcttcacctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 26679185  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26679184 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 26679085  T
Q  201 actctat-ttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679084 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26678985  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26678984 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26678905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31558573 - 31558195
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31558573 tgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 31558474  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31558473 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 31558374  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31558373 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 31558275  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558274 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31558195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5154042 - 5154419
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5154042 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 5154141  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5154142 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 5154241  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5154242 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 5154340  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154341 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5154419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26518751 - 26519127
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26518751 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 26518850  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26518851 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 26518949  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26518950 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 26519048  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26519049 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 26519127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39207314 - 39206940
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39207314 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataa 39207215  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207214 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 39207115  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39207114 ta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttttt 39207016  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39207015 gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 39206940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 11446846 - 11447217
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11446846 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 11446945  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  11446946 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 11447044  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 298  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11447045 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaac 11447143  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11447144 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgt 11447217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26269264 - 26268886
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269264 gctgttaatgactatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 26269165  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26269164 aattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactc 26269066  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | ||||  || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  26269065 tgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaact 26268966  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268965 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 26268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 45393176 - 45393558
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45393176 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttatgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 45393275  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  45393276 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aa 45393374  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45393375 aactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 45393474  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtccat 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45393475 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccat 45393558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11418958 - 11418580
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||| || | ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11418958 tgcagctgttcatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 11418859  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  11418858 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 11418760  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11418759 actctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 11418660  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11418659 ttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 11418580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 45737261 - 45737636
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45737261 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 45737358  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  45737359 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 45737457  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  45737458 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 45737556  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737557 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 45737636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 3451276 - 3451648
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3451276 tgcagctgttaatgaccgtcctcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 3451375  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  3451376 ataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttg-aa 3451474  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaa 297  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3451475 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 3451573  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3451574 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgt 3451648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 2160528 - 2160908
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2160528 tgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaacca 2160627  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  2160628 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 2160726  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaa 297  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2160727 actctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 2160826  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2160827 gtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 2160908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16047273 - 16047648
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16047273 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaacca 16047372  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16047373 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 16047471  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  16047472 actctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtt 16047570  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16047571 tttgtcta-ttttgaaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 16047648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16444183 - 16443804
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  16444183 tgcagctgttaacgaccatcttcgtctgaagcttatgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaacca 16444084  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16444083 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 16443985  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaa 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16443984 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 16443885  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16443884 gtttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtc 16443804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 2779210 - 2779582
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2779210 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 2779309  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  2779310 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 2779408  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2779409 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 2779508  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779509 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 2779582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31129863 - 31130235
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31129863 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 31129962  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  31129963 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 31130061  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31130062 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31130161  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130162 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31130235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 125 - 379
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596006
Alignment:
Q  125 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttca 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  224 aagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaa 322  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  323 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26596006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 10847541 - 10847923
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  10847541 tgcagctgttaatgatcatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 10847640  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  10847641 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aa 10847739  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10847740 actctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 10847839  T
Q  298 ---ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
        |||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  10847840 aagttttttgtct-gttttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtc 10847923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16512613 - 16512241
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512613 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 16512514  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  16512513 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aa 16512415  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaa 296  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16512414 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaa 16512315  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16512314 agtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 16512241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10911095 - 10910727
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10911095 gctgttaacgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataa 10910996  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10910995 aattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactc 10910897  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 301  Q
    ||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||    
T  10910896 tattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt 10910797  T
Q  302 ttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
           |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10910796 -------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 10910727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26532038 - 26531926
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26532038 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 26531939  T
Q  112 attttccaagctt 124  Q
    |||||||||||||    
T  26531938 attttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31958793 - 31958413
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31958793 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 31958694  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958693 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 31958594  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958593 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 31958494  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958493 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31958413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5603651 - 5603271
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5603651 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 5603552  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603551 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5603452  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603451 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 5603352  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603351 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 24334097 - 24334477
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24334097 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 24334196  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334197 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 24334296  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334297 attctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 24334396  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334397 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 24334477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28110292 - 28109909
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28110292 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 28110193  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110192 aataaaattaccattttccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 28110093  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaa 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  28110092 aactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaa 28109993  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28109992 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 28109909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 47029377 - 47029756
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029377 tgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 47029476  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029477 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 47029576  T
Q  201 actctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029577 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 47029676  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47029677 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 47029756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 5717003 - 5717371
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5717003 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 5717102  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5717103 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 5717202  T
Q  211 tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717203 tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 5717302  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5717303 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5717371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5764455 - 5764087
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5764455 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 5764356  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764355 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 5764256  T
Q  212 -cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764255 tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 5764156  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5764155 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5764087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 5727913 - 5728281
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5727913 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 5728012  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5728013 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 5728112  T
Q  211 tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728113 tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 5728212  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5728213 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5728281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28345095 - 28345472
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28345095 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 28345194  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28345195 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaa 28345293  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28345294 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaacc 28345392  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28345393 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtc 28345472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 32296553 - 32296932
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32296553 tgcagctgttaatgaccattttcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 32296652  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296653 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 32296752  T
Q  201 actctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296753 attctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 32296852  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32296853 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 32296932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29143093 - 29142712
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  29143093 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 29142994  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142993 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 29142894  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142893 actccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 29142794  T
Q  300 ttttgtctattttt--aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  29142793 ttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 29142712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4341013 - 4340634
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4341013 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 4340914  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4340913 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaa 4340814  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4340813 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 4340715  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340714 tttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4340634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4629709 - 4630086
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  4629709 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 4629808  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629809 ataaaattaccattttccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4629908  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629909 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 4630007  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4630008 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 4630086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 10648999 - 10649373
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648999 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 10649098  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649099 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 10649198  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649199 ta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 10649297  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10649298 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 10649373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4790970 - 4790591
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4790970 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaacca 4790871  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4790870 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 4790771  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790770 a-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 4790672  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790671 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4422842 - 4423220
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4422842 tgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 4422941  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4422942 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 4423041  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4423042 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaact 4423140  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423141 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4423220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 21680625 - 21681002
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  21680625 tgcagctgttaatgaccattttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 21680724  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680725 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 21680824  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680825 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 21680923  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21680924 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 21681002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29659304 - 29658926
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  29659304 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 29659205  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29659204 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aa 29659106  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29659105 actctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 29659006  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659005 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 10402077 - 10402450
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402077 gctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 10402176  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||    
T  10402177 aattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattc 10402275  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10402276 tattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttttt 10402374  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402375 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 10402450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 8217556 - 8217936
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8217556 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 8217655  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217656 ataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 8217755  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8217756 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa 8217854  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217855 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 8217936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5590686 - 5590319
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5590686 atgactatcttcatctaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 5590587  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||     
T  5590586 attttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttc 5590488  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590487 tttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 5590388  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5590387 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5590319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5472912 - 5473289
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5472912 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 5473011  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5473012 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 5473111  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5473112 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac- 5473209  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473210 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5473289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18248662 - 18249040
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  18248662 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 18248761  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  18248762 ataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-ga 18248860  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18248861 actctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 18248960  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248961 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18249040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22381915 - 22381539
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22381915 tgcagctgttaatgaccatcttcatca-aagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 22381817  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  22381816 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 22381718  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22381717 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 22381618  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22381617 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 22381539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 51787950 - 51788324
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51787950 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataa 51788049  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788050 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 51788149  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51788150 ta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttttt 51788248  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51788249 gtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 51788324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16422107 - 16422485
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16422107 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccgg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 16422205  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16422206 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 16422304  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaa 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16422305 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 16422404  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16422405 gtttttgtgta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 16422485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17971200 - 17970824
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17971200 tgcagctgtcaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaacca 17971101  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  17971100 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 17971002  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971001 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 17970903  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970902 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 17970824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28027215 - 28027591
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28027215 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 28027314  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  28027315 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 28027413  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027414 attctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 28027512  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027513 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28027591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 18231117 - 18231488
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231117 tgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 18231216  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18231217 ataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 18231315  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18231316 actctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 18231415  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18231416 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 18231488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22865181 - 22864806
Alignment:
Q  2 gcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22865181 gcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaa 22865082  T
Q  102 taagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  22865081 taaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa- 22864983  T
Q  202 ctctatt-tttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864982 --ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 22864885  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22864884 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 22864806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22880240 - 22879865
Alignment:
Q  2 gcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22880240 gcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaa 22880141  T
Q  102 taagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  22880140 taaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa- 22880042  T
Q  202 ctctatt-tttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880041 --ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 22879944  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22879943 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 22879865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17979288 - 17978908
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979288 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 17979189  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  17979188 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 17979090  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979089 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 17978990  T
Q  299 tttttgtctatttt-taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17978989 tttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 17978908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 48471851 - 48472233
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48471851 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagttcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaacca 48471950  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48471951 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 48472050  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaa 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  48472051 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaa 48472149  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472150 aactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 48472233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 20071959 - 20072337
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20071959 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 20072056  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  20072057 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 20072155  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  20072156 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 20072254  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072255 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 20072337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11104694 - 11104319
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| || ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104694 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 11104595  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11104594 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactc 11104496  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaa--atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 302  Q
    ||||||  || |||||||||||||||  ||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104495 tattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 11104396  T
Q  303 tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104395 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11104319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18286690 - 18286313
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18286690 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 18286591  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  18286590 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 18286492  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18286491 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 18286393  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18286392 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18286313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18301991 - 18301614
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18301991 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 18301892  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  18301891 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 18301793  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18301792 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 18301694  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18301693 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18301614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6537079 - 6536701
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6537079 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 6536980  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6536979 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 6536881  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6536880 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaact 6536781  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536780 ttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 6536701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 5019641 - 5020014
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019641 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 5019740  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  5019741 aattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactc 5019839  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5019840 ta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaacttttt 5019938  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019939 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5020014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20571182 - 20570804
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  20571182 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 20571083  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20571082 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaa 20570983  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20570982 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaact 20570884  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20570883 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtc 20570804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16618829 - 16618447
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16618829 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 16618730  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16618729 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 16618631  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---a 294  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  16618630 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 16618531  T
Q  295 aaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16618530 aaagtttttgtcca-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 16618447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 7079148 - 7079529
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7079148 tgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 7079245  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  7079246 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aa 7079344  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagc----taaatacaaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-ga 294  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7079345 actctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaa 7079444  T
Q  295 aaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079445 aaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 7079529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31030574 - 31030203
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31030574 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 31030475  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31030474 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 31030376  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31030375 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31030276  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  31030275 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 31030203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18336552 - 18336924
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18336552 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 18336651  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  18336652 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-a 18336750  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  18336751 aactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 18336850  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18336851 tttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18057184 - 18057565
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057184 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 18057283  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  18057284 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-a 18057382  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18057383 aactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 18057482  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18057483 agtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 18057565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6207824 - 6208198
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6207824 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 6207923  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207924 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 6208023  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6208024 aactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 6208123  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6208124 agttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 6208198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 19700410 - 19700800
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19700410 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 19700509  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  19700510 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttg-aa 19700608  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagct-----------aaatacaaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaa 288  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||           ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19700609 actctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaa 19700708  T
Q  289 aattgaaaa--ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19700709 aattgaaaaagttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 19700800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 32445078 - 32445447
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | || | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32445078 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgctcgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 32445177  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  32445178 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 32445276  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32445277 actctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 32445376  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  32445377 t-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 32445447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4727557 - 4727929
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4727557 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 4727656  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  4727657 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 4727755  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  4727756 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 4727855  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4727856 gttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 4727929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15735431 - 15735058
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735431 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagccccaacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 15735332  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15735331 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 15735233  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15735232 actct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 15735134  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15735133 agtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 15735058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5658058 - 5658433
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5658058 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaacca 5658157  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttga 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||     
T  5658158 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg- 5658256  T
Q  199 aaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5658257 aaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaa 5658356  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||  |||      |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5658357 aaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 5658433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 4689575 - 4689942
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4689575 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaacca 4689674  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4689675 ataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 4689773  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||   |||||| ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4689774 aactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 4689872  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 374  Q
    |  ||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4689873 aagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttg 4689942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8283805 - 8283416
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8283805 tgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaacca 8283706  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  8283705 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaa 8283606  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
     |||   |||  || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8283605 -ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 8283507  T
Q  298 ---------ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
              ||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  8283506 agttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtc 8283416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 35886688 - 35887062
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35886688 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 35886787  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35886788 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 35886886  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35886887 aactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 35886986  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  |||      |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  35886987 aagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtc 35887062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15887043 - 15886894
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887043 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 15886944  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgt-gaatccgtggagtcacgcctt 148  Q
    || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15886943 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 8002488 - 8002607
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002488 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 8002587  T
Q  105 gattaccattttccaagctt 124  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8002588 aattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886699
Alignment:
Q  177 ttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttga 273  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||  |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 15886797  T
Q  274 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 373  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  ||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  15886796 agcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgtt 15886705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22922428 - 22922048
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22922428 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 22922329  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922328 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 22922229  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922228 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 22922129  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922128 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 22922048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 39896027 - 39896405
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttggg-aaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39896027 tgcagctgttaatgaccatcgtcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 39896126  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39896127 aataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 39896226  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39896227 a-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 39896325  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896326 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39896405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19410769 - 19410389
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19410769 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 19410670  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410669 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 19410570  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410569 attctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 19410470  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410469 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 19410389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37680176 - 37679796
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680176 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 37680077  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  37680076 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 37679978  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37679977 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaa 37679879  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679878 tttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37679796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37695441 - 37695061
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695441 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 37695342  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  37695341 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 37695243  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37695242 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaa 37695144  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695143 tttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37695061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 12661498 - 12661875
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12661498 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 12661597  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12661598 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 12661697  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661698 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 12661796  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661797 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 12661875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37383636 - 37384014
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383636 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 37383735  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37383736 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 37383835  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37383836 a-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 37383934  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383935 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37384014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 27809664 - 27810040
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809664 gctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 27809763  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809764 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 27809863  T
Q  205 tatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 302  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809864 tatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 27809963  T
Q  303 tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27809964 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 27810040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21671456 - 21671075
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671456 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 21671357  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  21671356 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 21671258  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21671257 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaa 21671159  T
Q  297 -actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671158 ttttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 21671075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 254924 - 254557
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  254924 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 254825  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  254824 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 254725  T
Q  211 tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  254724 tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctatt 254626  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  254625 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 254557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11629467 - 11629090
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11629467 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 11629368  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11629367 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 11629269  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11629268 actcta-ttttcttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaac 11629170  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11629169 tctttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 11629090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37946138 - 37945770
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37946138 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattacc 37946039  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946038 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 37945939  T
Q  212 -cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945938 tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 37945839  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37945838 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtc 37945770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 3788453 - 3788830
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3788453 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 3788552  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788553 ataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3788652  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788653 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 3788751  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3788752 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtc 3788830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 12592773 - 12593151
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592773 gctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 12592872  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592873 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 12592972  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  12592973 catttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactt 12593072  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593073 tttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 12593151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13930818 - 13930449
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930818 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 13930719  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930718 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt 13930619  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctat 309  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930618 cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctat 13930519  T
Q  310 ttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13930518 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 13930449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 40239468 - 40239845
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40239468 tgcagctgttaatgaccattttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 40239567  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239568 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 40239667  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239668 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 40239766  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  40239767 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 40239845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27122484 - 27122860
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27122484 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27122583  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27122584 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaa 27122682  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122683 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 27122781  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122782 tttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27122860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37931331 - 37931716
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931331 tgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 37931430  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931431 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37931530  T
Q  201 actcta------tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattg 293  Q
    ||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37931531 actctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattg 37931630  T
Q  294 aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37931631 aaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 37931716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34867642 - 34868019
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34867642 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 34867741  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  34867742 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 34867840  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34867841 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 34867939  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867940 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34868019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12710884 - 12710513
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12710884 tgcagctattaatgaccgtcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 12710785  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  12710784 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 12710686  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12710685 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 12710587  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12710586 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 12710513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 40 - 379
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167815
Alignment:
Q  40 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 139  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  140 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 238  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16167674  T
Q  239 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16167675 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 16167774  T
Q  339 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16167775 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtc 16167815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9344259 - 9343892
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9344259 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 9344160  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  9344159 attttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttc 9344061  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9344060 tttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccatt 9343961  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343960 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9343892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34160803 - 34161183
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34160803 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 34160902  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  34160903 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 34161001  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34161002 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 34161101  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161102 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34161183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16823621 - 16823249
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823621 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 16823522  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16823521 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 16823423  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823422 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 16823323  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823322 cttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 16823249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16897859 - 16898231
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897859 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 16897958  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16897959 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 16898057  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898058 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 16898157  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16898158 cttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 16898231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27782191 - 27782569
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  27782191 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 27782290  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27782291 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaa 27782390  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27782391 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 27782489  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27782490 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 27782569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 32055761 - 32056138
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || | |||| |||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32055761 tgcagctgttaataaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 32055860  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  32055861 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 32055959  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32055960 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaact 32056058  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056059 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 32056138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39046094 - 39045727
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39046094 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattacc 39045995  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  39045994 attttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttc 39045896  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045895 tttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 39045796  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045795 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39045727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 31882257 - 31882623
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31882257 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattacc 31882356  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  31882357 attttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-tttt 31882454  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31882455 cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctatt 31882554  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31882555 ttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtc 31882623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21697459 - 21697078
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21697459 tgcagctgttaatgaccaccttcatctaaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 21697360  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21697359 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 21697261  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| | |  | |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697260 actctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 21697161  T
Q  298 --ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21697160 agttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 21697078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34297115 - 34297486
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||    | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34297115 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctctcatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 34297214  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  34297215 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 34297313  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  34297314 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagt 34297413  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297414 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34297486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 90 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868691
Alignment:
Q  90 accaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  190 tttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaa 288  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaa 31868782  T
Q  289 aattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31868781 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtc 31868691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27396282 - 27396670
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  27396282 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 27396381  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27396382 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27396480  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa- 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27396481 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 27396580  T
Q  298 ---------ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
              ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27396581 aaaaaaaagttttttgtc-ctttttgaaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 27396670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34269204 - 34268831
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34269204 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcccatgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaacca 34269105  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  34269104 ataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaa 34269006  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34269005 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaa 34268906  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      ||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34268905 agtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 34268831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28888238 - 28888611
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888238 tgcagctgttaatgacaatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 28888337  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28888338 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 28888436  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888437 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 28888536  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  28888537 agttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 28888611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19450710 - 19450323
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  19450710 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 19450611  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  19450610 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aa 19450512  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagcta-----aatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-- 293  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||     || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  19450511 actctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 19450412  T
Q  294 ----aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
        |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  19450411 aaaaaaaagtttttgtct-gttttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtc 19450323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23122856 - 23122483
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23122856 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaacca 23122757  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23122756 ataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 23122658  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| ||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23122657 aactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 23122558  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  23122557 agttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 23122483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27428729 - 27428358
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || ||  | | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428729 tgcagctggtaatgaccatcttcatcaaaaactcttatgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 27428630  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27428629 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 27428531  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaa 296  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||    
T  27428530 actctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaa 27428431  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  27428430 agtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 27428358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 20843872 - 20844249
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843872 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagct-ctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 20843970  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20843971 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 20844069  T
Q  200 aactctatttttcttctactttc-aaagctaaat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattga 294  Q
    ||||||| |||  || ||| ||| |||| ||  |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  20844070 aactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattga 20844169  T
Q  295 aaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||  ||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20844170 aaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtc 20844249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 239 - 379
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117133
Alignment:
Q  239 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 338  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  339 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 23117133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31887776 - 31887682
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccacc 95  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31887776 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28356203 - 28355827
Alignment:
Q  6 ctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356203 ctgttaatgaccatcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 28356104  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28356103 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattc 28356004  T
Q  205 tattttt--cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 302  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356003 tatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 28355904  T
Q  303 tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28355903 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 28355827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 29835284 - 29835661
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835284 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 29835383  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29835384 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaa 29835483  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29835484 actcca-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 29835582  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29835583 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 29835661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31484127 - 31483747
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31484127 tgcagctgttgatgaccatcttcatctgaagcttccacatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 31484028  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484027 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 31483928  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483927 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 31483828  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483827 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31483747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 19680409 - 19680786
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19680409 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 19680508  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19680509 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 19680607  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19680608 aactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 19680706  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19680707 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 19680786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33248327 - 33248704
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248327 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 33248426  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  33248427 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 33248525  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248526 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 33248625  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33248626 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtc 33248704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 9360583 - 9360960
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9360583 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaacca 9360682  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9360683 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 9360782  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360783 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 9360881  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360882 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9360960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 18796667 - 18797046
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18796667 tgcagctattaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaacca 18796766  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18796767 ataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 18796866  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796867 a-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 18796965  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796966 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18797046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 31360493 - 31360867
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360493 gctgttaatgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 31360592  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360593 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 31360692  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360693 ta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 31360791  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31360792 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 31360867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19202619 - 19202252
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagt-ttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19202619 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 19202520  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19202519 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 19202421  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||           ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19202420 aactctat-----------tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 19202332  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19202331 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 19202252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 44566941 - 44567322
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566941 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 44567040  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44567041 aataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aa 44567139  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaa 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  44567140 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaa 44567238  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44567239 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtc 44567322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12086979 - 12086600
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  12086979 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 12086880  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  12086879 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaa 12086780  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12086779 a-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 12086681  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12086680 tttttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 12086600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 18715443 - 18715819
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18715443 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 18715540  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18715541 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 18715639  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  18715640 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaa 18715738  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 377  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715739 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 18715819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21342426 - 21342047
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342426 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 21342327  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21342326 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaa 21342227  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac 298  Q
    | ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21342226 a-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaac 21342128  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342127 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 21342047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33264692 - 33265062
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||  | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33264692 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 33264791  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  33264792 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 33264890  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  33264891 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaact 33264989  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264990 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 33265062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 15773535 - 15773913
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15773535 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 15773634  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15773635 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 15773733  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||  |||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15773734 actctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 15773833  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773834 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 15773913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19911419 - 19911039
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19911419 tgcagctgttaatgacgatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 19911320  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19911319 ataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 19911221  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaa 297  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19911220 actctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 19911121  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19911120 gtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 19911039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 16260184 - 16260480
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260184 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 16260283  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260284 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 16260383  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260384 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22075184 - 22074806
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22075184 tgcagctgttaatgaccatct-catcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaacca 22075086  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  22075085 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttg-aa 22074987  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  22074986 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaa 22074887  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     |||||||||  |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22074886 gtttttgtct-gttttgaaagcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 22074806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19655599 - 19655224
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655599 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 19655500  T
Q  101 ataaga--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttga 198  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  19655499 ataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg- 19655401  T
Q  199 aaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    |||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19655400 aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 19655301  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  19655300 aagttt-------tttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 19655224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27603162 - 27602791
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  27603162 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 27603063  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27603062 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27602964  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||  |||  || ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27602963 actctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 27602864  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||        |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  27602863 gtt--------ttttgaaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 27602791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22138867 - 22139239
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22138867 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaacca 22138966  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  22138967 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-a 22139065  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22139066 aactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaa 22139165  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22139166 a---------agtttttgaaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 22139239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2131517 - 2131145
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2131517 tgcagctgttaatgaccttcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaacca 2131418  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2131417 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 2131319  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2131318 actctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 2131219  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      ||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  2131218 agtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 2131145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 19694056 - 19694430
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694056 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 19694155  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19694156 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aa 19694254  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||   |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  19694255 aactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaa 19694354  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19694355 aagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 19694430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 14569118 - 14569493
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| || |  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14569118 tgcagctgttaacgactatcttcatcaaaagctcctatgatggcgaattcaaagtttttgggaa-tgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaacca 14569216  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14569217 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 14569315  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagcta-----aatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg 293  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||     || | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  14569316 actctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattg 14569415  T
Q  294 aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||  ||       |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14569416 aaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 14569493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27284602 - 27284224
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27284602 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27284503  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27284502 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 27284403  T
Q  201 actctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284402 -ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 27284304  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284303 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27284224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13518434 - 13518056
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13518434 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 13518335  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518334 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 13518235  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518234 actctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 13518135  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518134 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13518056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8899939 - 8899561
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  8899939 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 8899840  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899839 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 8899740  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899739 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 8899641  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8899640 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 8899561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27623949 - 27623569
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  27623949 tgcagctgttaatgaccgtctccatcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 27623850  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623849 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 27623750  T
Q  201 actctat-ttttcttctactttcaaagctaaatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623749 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaac 27623650  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27623649 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtc 27623569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16755778 - 16756157
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16755778 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 16755877  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  16755878 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 16755976  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16755977 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaac 16756076  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756077 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 16756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4763721 - 4764099
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763721 tgcagctgttaatgactatcttcatcgaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 4763820  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763821 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4763920  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4763921 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 4764019  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764020 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4764099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27063440 - 27063817
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27063440 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaagagctcttatgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacta 27063539  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27063540 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 27063638  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27063639 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 27063737  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063738 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27063817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27356351 - 27355973
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  27356351 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 27356252  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27356251 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aa 27356153  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27356152 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 27356053  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356052 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27355973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26110650 - 26110273
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26110650 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 26110551  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26110550 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 26110451  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110450 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 26110352  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26110351 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 26110273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28166452 - 28166831
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166452 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 28166551  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28166552 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 28166650  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28166651 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 28166750  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166751 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28166831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27491091 - 27491469
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  27491091 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 27491190  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27491191 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 27491289  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27491290 actctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 27491389  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491390 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27491469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34458746 - 34458370
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  34458746 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 34458647  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34458646 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 34458547  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34458546 actcta-ttttcttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-t 34458449  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34458448 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 34458370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16938265 - 16937887
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16938265 tgcagctgttaatggccatctccatctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 16938166  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  16938165 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 16938067  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16938066 aactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaac 16937968  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16937967 tttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 16937887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 16680097 - 16680476
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680097 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 16680196  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16680197 ataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 16680296  T
Q  201 actctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680297 -ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 16680395  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680396 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 16680476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 27200144 - 27200522
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27200144 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27200243  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||    
T  27200244 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aa 27200342  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200343 aactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaa 27200441  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27200442 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgt 27200522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27249089 - 27248711
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27249089 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27248990  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||    
T  27248989 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aa 27248891  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27248890 aactctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaa 27248792  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27248791 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgt 27248711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33370671 - 33370293
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  33370671 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 33370572  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33370571 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 33370472  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  33370471 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaattt 33370373  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33370372 ttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 33370293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 4778838 - 4779217
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778838 tgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 4778937  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  4778938 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-a 4779036  T
Q  200 aactctatttttcttctactttc-aaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4779037 aactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 4779136  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4779137 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 4779217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26772868 - 26772498
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26772868 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 26772769  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  26772768 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 26772670  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26772669 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaact 26772571  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26772570 ttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 26772498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 29555516 - 29555894
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555516 tgcagctattaatgaccatcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 29555615  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  29555616 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aa 29555714  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 299  Q
    ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  29555715 actctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagct 29555814  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555815 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29555894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 4531246 - 4531609
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4531246 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 4531345  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  4531346 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 4531444  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4531445 actctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 4531544  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531545 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4531609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30552241 - 30551869
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552241 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 30552142  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  30552141 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 30552043  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552042 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 30551943  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30551942 cttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 30551869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4539999 - 4539620
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  4539999 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 4539900  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  4539899 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaa 4539800  T
Q  200 aactctatttttcttct-actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539799 a-ctctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 4539701  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4539700 tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 4539620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 26791774 - 26792145
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26791774 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 26791873  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26791874 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 26791973  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26791974 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 26792072  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26792073 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 26792145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22929123 - 22928743
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22929123 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 22929024  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  22929023 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttg-aa 22928925  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaa 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22928924 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 22928825  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22928824 gtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 22928743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 29507374 - 29507754
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29507374 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 29507473  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29507474 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 29507573  T
Q  201 actctatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 297  Q
     ||||  |||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29507574 -ctctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 29507672  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507673 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29507754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 372
Target Start/End: Original strand, 29578984 - 29579343
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||  |||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29578984 atgactatcttcatctaaagctcctacacttgcaaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 29579083  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29579084 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttt 29579181  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29579182 cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctatt 29579281  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29579282 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 29579343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28213412 - 28213791
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  28213412 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 28213511  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  28213512 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaa 28213611  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28213612 a-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 28213710  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28213711 tttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 28213791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13293185 - 13292813
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13293185 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaacca 13293086  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  13293085 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 13292987  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  13292986 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 13292887  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  13292886 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtc 13292813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Original strand, 26926729 - 26927073
Alignment:
Q  2 gcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26926729 gcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaa 26926826  T
Q  102 taagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26926827 taaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaa 26926925  T
Q  202 ctctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26926926 ctcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactt 26927024  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatga 349  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927025 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27013691 - 27014062
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27013691 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27013790  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  27013791 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 27013889  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27013890 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 27013989  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013990 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27014062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14139634 - 14139262
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14139634 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 14139535  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  14139534 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 14139436  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14139435 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 14139336  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139335 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 14139262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27030981 - 27031356
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27030981 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaacca 27031080  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27031081 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27031179  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27031180 actctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 27031279  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  27031280 agttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 27031356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27208862 - 27209236
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27208862 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccc 27208961  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27208962 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aa 27209060  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27209061 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaa 27209160  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||  ||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27209161 aaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27209236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27240366 - 27239992
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27240366 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccc 27240267  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27240266 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aa 27240168  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27240167 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaa 27240068  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||  ||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27240067 aaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27239992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 24869668 - 24870040
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869668 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 24869767  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24869768 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 24869866  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24869867 actctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 24869966  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      ||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  24869967 agtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 24870040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 124 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666527
Alignment:
Q  124 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttca 26666677  T
Q  224 aagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26666676 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaa 26666577  T
Q  323 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26666576 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 26666527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 27025103 - 27025477
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27025103 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 27025202  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27025203 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27025301  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27025302 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaa 27025401  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  ||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27025402 aagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtc 27025477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24299995 - 24299622
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  24299995 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccc 24299896  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24299895 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 24299796  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
     ||||  |||  || |||| |||||| ||  ||||||| | ||| | |||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  24299795 -ctctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 24299697  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  24299696 gtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtc 24299622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15406769 - 15406395
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||   |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15406769 tgcagctgttaatggccatcttcatcaaaagcccctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaacca 15406670  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15406669 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 15406571  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||    
T  15406570 aactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaa 15406471  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |   ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15406470 aaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 15406395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15418556 - 15418182
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||   |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15418556 tgcagctgttaatggccatcttcatcaaaagcccctacgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaacca 15418457  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15418456 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 15418358  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||    
T  15418357 aactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaa 15418258  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |   ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15418257 aaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 15418182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174881
Alignment:
Q  83 tcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  183 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaa 278  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaa 20174787  T
Q  279 acattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 365  Q
    ||||| | |||      ||  | || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20174788 acattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 20174881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161110
Alignment:
Q  83 tcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  183 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaa 278  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaa 22161204  T
Q  279 acattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 365  Q
    ||||| | |||      ||  | || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22161203 acattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 22161110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23851568 - 23851450
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23851568 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 23851469  T
Q  101 ataagattaccattttcca 119  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23851468 ataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 3647109 - 3647487
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3647109 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 3647208  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647209 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3647308  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647309 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 3647408  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647409 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 10968628 - 10969007
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10968628 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 10968727  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968728 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 10968827  T
Q  201 actctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968828 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 10968927  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968928 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 10969007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 51644183 - 51644563
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51644183 tgcagctgtcaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 51644282  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644283 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 51644382  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac- 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51644383 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 51644482  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51644483 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 51644563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 10951054 - 10951433
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951054 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcggattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 10951153  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951154 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 10951253  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951254 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 10951353  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10951354 ttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 10951433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28591046 - 28591423
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || || ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591046 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaaactcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 28591145  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28591146 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 28591245  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591246 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 28591344  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28591345 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtc 28591423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41787602 - 41787224
Alignment:
Q  3 cagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787602 cagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 41787503  T
Q  103 aaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  41787502 aaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaa 41787404  T
Q  202 ctctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  41787403 ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac 41787305  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787304 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 41787224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28155691 - 28156069
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28155691 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaacca 28155788  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28155789 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 28155887  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaa 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  28155888 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 28155986  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155987 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28156069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20334710 - 20334330
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20334710 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 20334611  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||    
T  20334610 ataaaattaccattttccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttg-aa 20334512  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaa 296  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20334511 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 20334412  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20334411 agtttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 20334330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16202328 - 16201942
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||   ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16202328 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaacca 16202229  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16202228 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 16202130  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagcta-----aatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg 293  Q
    ||||||||||  || |||||||||||| |     || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16202129 actctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg 16202030  T
Q  294 aaaa---ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16202029 aaaaagttttttcgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 16201942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 20466740 - 20467126
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| | ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  20466740 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaacca 20466839  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20466840 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 20466938  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt------ 292  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||          
T  20466939 actctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaa 20467038  T
Q  293 --gaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
       |||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20467039 aaaaaaagttcctgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtc 20467126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21892041 - 21891677
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21892041 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaacca 21891942  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21891941 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 21891843  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| ||| | || ||  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21891842 actctactttcttttttatgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 21891754  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
          || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21891753 ----aagttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtc 21891677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33881094 - 33881472
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33881094 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 33881193  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881194 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 33881293  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881294 actctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 33881393  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881394 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 33881472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18369725 - 18369347
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || || ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369725 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaaactcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 18369626  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18369625 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaa 18369526  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369525 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 18369426  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369425 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18369347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6880271 - 6880650
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6880271 tgcaactgttaatgaccatcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 6880370  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  6880371 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 6880469  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6880470 gactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 6880569  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6880570 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 6880650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 3795510 - 3795885
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795510 gctgttaatgactatcttcatctaaagcctctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 3795609  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3795610 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattc 3795709  T
Q  205 tatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3795710 tattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt 3795809  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795810 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3795885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 9323445 - 9323822
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9323445 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 9323544  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  9323545 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 9323643  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9323644 aactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 9323742  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9323743 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 9323822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 30174437 - 30174812
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174437 gctgttaatgcctatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 30174536  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174537 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 30174636  T
Q  205 tatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174637 tattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 30174736  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30174737 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 30174812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 11555322 - 11555699
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11555322 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 11555421  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11555422 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 11555521  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555522 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 11555620  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555621 cttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11555699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 12138144 - 12138521
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12138144 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 12138243  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12138244 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 12138342  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12138343 aactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 12138441  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12138442 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 12138521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37746521 - 37746144
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37746521 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 37746422  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746421 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37746322  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746321 actctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 37746222  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgt 378  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37746221 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgt 37746144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37352837 - 37352459
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37352837 tgcagctgttaatgactgtcttcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 37352738  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37352737 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 37352638  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352637 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 37352539  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37352538 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 37352459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8659664 - 8659287
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659664 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttgtacttgtgaattcaaagtttc-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 8659566  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8659565 ataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaa 8659466  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8659465 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 8659367  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8659366 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 8659287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33298501 - 33298883
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33298501 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 33298600  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298601 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 33298700  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298701 actccatttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 33298800  T
Q  299 tttttgtctattttt--aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33298801 tttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33298883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 37760950 - 37761329
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37760950 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 37761049  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761050 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37761149  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37761150 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 37761248  T
Q  300 ttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761249 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37761329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18494960 - 18494583
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | || | |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494960 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgctggcgaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 18494861  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494860 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 18494761  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494760 actcca-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 18494662  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494661 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18494583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 28655210 - 28655589
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28655210 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 28655309  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28655310 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 28655408  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28655409 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 28655507  T
Q  299 -tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655508 ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 26486364 - 26486731
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26486364 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacc 26486463  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  26486464 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 26486562  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||           ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26486563 aactctat-----------tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 26486651  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26486652 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 26486731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28953973 - 28953595
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28953973 tgcagctgttaatgaccgtcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 28953874  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953873 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 28953774  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28953773 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaact 28953675  T
Q  300 ttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  28953674 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 28953595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 43084230 - 43084604
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||| || | || | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084230 gctgttaatgattatcttcatcaaaagctcctatgctggcgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 43084329  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084330 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 43084429  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt 303  Q
    || |||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43084430 ta-ttttcttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaacttttt 43084528  T
Q  304 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43084529 gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtc 43084604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 11329609 - 11329985
Alignment:
Q  5 gctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329609 gctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataa 11329708  T
Q  105 gattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactc 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11329709 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactc 11329808  T
Q  205 tatttttcttctactttcaaagctaa--atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttt 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11329809 ta-ttttcttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaacttt 11329907  T
Q  302 ttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329908 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11329985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13319020 - 13318643
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||  |   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13319020 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcatacgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 13318921  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13318920 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 13318821  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318820 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 13318722  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13318721 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 13318643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40467735 - 40467368
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40467735 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 40467636  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  40467635 attttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttc 40467537  T
Q  212 cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467536 tttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatt 40467437  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467436 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 40467368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 30035394 - 30035771
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30035394 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 30035493  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  30035494 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 30035592  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30035593 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaact 30035691  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30035692 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 30035771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 24729938 - 24730309
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24729938 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 24730037  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24730038 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttg-aa 24730136  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24730137 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 24730235  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24730236 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 24730309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13436874 - 13436489
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttca-tctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436874 tgcagctgttaatgactatcttcaatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 13436775  T
Q  100 aataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttga 198  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13436774 aataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttga 13436675  T
Q  199 aaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaatt 292  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||    
T  13436674 aa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaatt 13436576  T
Q  293 gaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436575 gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13436489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 30158001 - 30158380
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158001 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttatgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 30158100  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  30158101 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aa 30158199  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30158200 aactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 30158299  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30158300 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtc 30158380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 41680672 - 41681051
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41680672 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 41680771  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680772 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 41680871  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680872 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 41680971  T
Q  300 ttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  41680972 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 41681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9544899 - 9544522
Alignment:
Q  3 cagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544899 cagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttcagg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat 9544801  T
Q  103 aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 202  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  9544800 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaac 9544702  T
Q  203 tctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  9544701 tcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac 9544603  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544602 tttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9544522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13180982 - 13180608
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||  |   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180982 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcatacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 13180883  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180882 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 13180783  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  13180782 aactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 13180683  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180682 tttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13180608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 22894384 - 22894761
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22894384 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 22894483  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22894484 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 22894582  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ct 299  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  22894583 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggt 22894682  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22894683 ttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtc 22894761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 23631937 - 23632317
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23631937 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaacca 23632036  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  23632037 ataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 23632135  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--c 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  23632136 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagc 23632235  T
Q  299 tttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23632236 tttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 23632317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15753045 - 15752673
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15753045 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 15752946  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15752945 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 15752847  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15752846 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 15752752  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15752751 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtc 15752673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 34622486 - 34622865
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622486 tgcagctgttaatgaccatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 34622585  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34622586 ataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 34622685  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac 298  Q
    | ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34622686 a-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac 34622784  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622785 tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34622865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37665679 - 37665301
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37665679 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 37665580  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  37665579 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 37665481  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37665480 actctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 37665381  T
Q  300 ttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  37665380 ttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 37665301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31820601 - 31820232
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  31820601 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 31820502  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  31820501 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 31820403  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31820402 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 31820304  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31820303 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 31820232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32590468 - 32590091
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32590468 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 32590369  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  32590368 ataaaattaccattttccaagctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 32590270  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32590269 actcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaact 32590171  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590170 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 32590091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33522349 - 33522722
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522349 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 33522448  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  33522449 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 33522547  T
Q  200 aactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522548 aactctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 33522647  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522648 ccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 33522722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 2517033 - 2517412
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2517033 tgcagctgtcaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 2517132  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |     
T  2517133 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-ag 2517231  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaa 297  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2517232 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 2517330  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2517331 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtc 2517412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 40 - 379
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644144
Alignment:
Q  40 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 139  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  140 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaac 5644004  T
Q  240 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5644005 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5644104  T
Q  339 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5644105 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtc 5644144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18122609 - 18122231
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18122609 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 18122510  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  18122509 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 18122411  T
Q  201 actcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18122410 actctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaac 18122311  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18122310 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 18122231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 31437432 - 31437803
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31437432 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 31437531  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  31437532 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 31437630  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31437631 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31437730  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437731 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31437803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 25206247 - 25206630
Alignment:
Q  3 cagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206247 cagctgttaatgaccatcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 25206346  T
Q  103 aaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25206347 aaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaa 25206445  T
Q  202 ctctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa- 297  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25206446 ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 25206545  T
Q  298 ----ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
         |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25206546 gtttttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25206630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 25270403 - 25270786
Alignment:
Q  3 cagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270403 cagctgttaatgaccatcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 25270502  T
Q  103 aaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25270503 aaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaa 25270601  T
Q  202 ctctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa- 297  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25270602 ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 25270701  T
Q  298 ----ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
         |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25270702 gtttttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15652951 - 15652575
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15652951 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacta 15652852  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15652851 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 15652753  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15652752 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 15652653  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15652652 tttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 15652575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22993309 - 22992939
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993309 tgcagctgttaatgactatcctcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 22993210  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  22993209 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 22993111  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  22993110 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagt 22993011  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22993010 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 22992939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 23897842 - 23898214
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897842 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttccgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 23897941  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  23897942 ataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 23898040  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac----aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23898041 actctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 23898140  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||          | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23898141 aa----------agttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtc 23898214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33783455 - 33783828
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33783455 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccc 33783554  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33783555 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 33783653  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33783654 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 33783753  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  ||       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33783754 aagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33783828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 24975817 - 24976189
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24975817 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgctcgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaacca 24975916  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  24975917 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aa 24976015  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaa 296  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24976016 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaa 24976115  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  24976116 agtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 24976189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 24608213 - 24608587
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24608213 tgcagctactaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaacca 24608312  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24608313 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaa 24608412  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    | |||   |||  || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24608413 a-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 24608511  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  ||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24608512 aagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtc 24608587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 30940604 - 30940971
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940604 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 30940703  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30940704 ataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaa 30940803  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    |  |||  |||  || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30940804 at-tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 30940902  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 374  Q
    |  |        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30940903 aagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttg 30940971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 39856609 - 39856985
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  39856609 tgcagctgttaatgaccattttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaacca 39856708  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39856709 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 39856807  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856808 actct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 39856906  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856907 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39856985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40099930 - 40099551
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099930 tgcagctgttaatgcctatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 40099831  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40099830 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 40099731  T
Q  201 actctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099730 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 40099631  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40099630 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 40099551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5011849 - 5012228
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011849 tgcagctgttaatgaccattttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 5011948  T
Q  101 at-aagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  5011949 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aa 5012047  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5012048 aactctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac 5012147  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5012148 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtc 5012228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20332705 - 20332337
Alignment:
Q  12 atgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattacc 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20332705 atgactatcttcatctaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacc 20332606  T
Q  112 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332605 attttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt 20332506  T
Q  212 -cttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 310  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332505 tcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatt 20332406  T
Q  311 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20332405 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 20332337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24586655 - 24586276
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24586655 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaacca 24586556  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586555 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 24586456  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586455 aactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 24586356  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586355 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 24586276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 14104515 - 14104892
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104515 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 14104614  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  14104615 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 14104713  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104714 actctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 14104813  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14104814 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 14104892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 40 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157227
Alignment:
Q  40 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 139  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  140 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 237  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 27157369  T
Q  238 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27157368 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27157269  T
Q  338 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27157268 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 27157227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 30759736 - 30760112
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30759736 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 30759835  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  30759836 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 30759934  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30759935 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 30760033  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760034 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 30760112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33668094 - 33667718
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33668094 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 33667995  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  33667994 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 33667896  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33667895 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 33667797  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667796 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 33667718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 54839363 - 54839740
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54839363 tgcagttgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 54839462  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  54839463 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttg-aa 54839561  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54839562 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 54839660  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839661 ttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 54839740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 5700512 - 5700890
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5700512 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 5700611  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5700612 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaa 5700711  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac 298  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  5700712 at-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac 5700809  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700810 tttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5700890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18794910 - 18794532
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  18794910 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 18794811  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18794810 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaa 18794711  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794710 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaact 18794612  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18794611 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 18794532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14753786 - 14753409
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14753786 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 14753687  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  14753686 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 14753588  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14753587 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 14753489  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14753488 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 14753409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34183255 - 34182879
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34183255 tgcagctgttaatgactatctccatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 34183156  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  34183155 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 34183057  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34183056 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac- 34182958  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  34182957 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 34182879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 21975675 - 21976047
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975675 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 21975774  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  21975775 aataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttg-a 21975873  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975874 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 21975973  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21975974 cttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 21976047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31120805 - 31120432
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120805 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacc 31120706  T
Q  100 aataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  31120705 aataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-a 31120607  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120606 aactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 31120507  T
Q  299 tttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgt 372  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31120506 cttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgt 31120432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36338811 - 36338441
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36338811 tgcagctgttaatgaccattttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaacca 36338712  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  36338711 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 36338613  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36338612 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 36338513  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  36338512 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 36338441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24118998
Alignment:
Q  40 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 139  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  140 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaac 24118872  T
Q  240 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24118873 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggta 24118972  T
Q  339 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24118973 cattcaaatg-aacatgcatgagcgag 24118998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6575834 - 6576204
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6575834 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 6575933  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6575934 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 6576032  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6576033 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 6576132  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6576133 tt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 6576204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 1906224 - 1906607
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1906224 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 1906323  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  1906324 ataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aa 1906422  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    |||||| | |  ||||||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1906423 actctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 1906522  T
Q  296 aa--ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1906523 aaagttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 1906607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 15233788 - 15234170
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||    
T  15233788 tgcagctgttaatgaccatcttcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaacca 15233887  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15233888 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 15233986  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--- 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       
T  15233987 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagt 15234086  T
Q  298 ---ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
        |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15234087 tttttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 15234170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15276925 - 15276544
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  15276925 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 15276826  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15276825 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aa 15276727  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aa 295  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  15276726 actctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 15276627  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    || |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15276626 aagtttttgtct-gttttgaaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtc 15276544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15380531 - 15380153
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  15380531 tgcagctgttaatgaccatcttcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaacca 15380432  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15380431 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aa 15380333  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||     
T  15380332 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaag 15380233  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15380232 tttttgtct-gttttgaaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 15380153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674213
Alignment:
Q  46 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 145  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  146 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |  |||  |||| ||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattt 1674075  T
Q  244 tctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1674076 tctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta-ttttgaaagcaaacttgagcaacagggtaca 1674174  T
Q  341 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1674175 ttcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtc 1674213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 14670988 - 14671363
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670988 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 14671087  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  14671088 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-a 14671186  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14671187 aactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 14671286  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14671287 aagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 14671363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 17019024 - 17019398
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17019024 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 17019123  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17019124 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-a 17019222  T
Q  200 aactctatttttcttctactttc-aaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  17019223 aactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaa 17019322  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  17019323 aagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 17019398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324232
Alignment:
Q  119 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctac 36324386  T
Q  219 tttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaag 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||| |||||    
T  36324385 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaag 36324292  T
Q  319 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  36324291 caaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 36324232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18311472 - 18311415
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaattcaaagttt 57  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18311472 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaaagcttctgtacttgtggattcaaagttt 18311415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9934 - 9557
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9934 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 9835  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9834 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 9735  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 9636  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9635 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3474 - 3094
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3474 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 3375  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3374 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3275  T
Q  201 actctattt--ttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3274 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 3175  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3174 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 379
Target Start/End: Original strand, 17949 - 18147
Alignment:
Q  183 ctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949 ctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18048  T
Q  281 attttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 11999 - 12374
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11999 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagcgaatg--cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 12096  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 12196  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12197 actctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 12295  T
Q  301 tttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12296 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9221 - 8844
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9221 tgcagctgttaatgaccgtcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 9122  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  9121 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 9023  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  9022 attcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaact 8924  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8923 ttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 8844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 9875 - 10252
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9875 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaacca 9974  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  9975 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 10073  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10074 actcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 10172  T
Q  300 ttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10173 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtc 10252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 33258 - 33633
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||  || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33258 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagcccctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacca 33357  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33358 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 33456  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| ||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33457 aactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 33556  T
Q  298 ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
      |||    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33557 agttt----tttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 33633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4899 - 4518
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaa-cc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4899 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaacc 4800  T
Q  100 aataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttga 198  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  4799 aataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg- 4701  T
Q  199 aaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4700 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 4601  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4600 agtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 4518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 379
Target Start/End: Original strand, 18548 - 18926
Alignment:
Q  3 cagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18548 cagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat 18647  T
Q  103 aaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaa 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18648 aaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaa 18746  T
Q  202 ctctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18747 ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac 18845  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18846 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 1618 - 1996
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1618 tgcagttgttaatgaccatcttcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaacca 1717  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1718 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 1816  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1817 aactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 1915  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1916 tttttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 1996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 12007 - 12396
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12007 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaacca 12106  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  12107 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttg-a 12205  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagct-----------aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaa 288  Q
    ||||||| | |  ||||||||||||||||           ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12206 aactctactatctttctactttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaa 12305  T
Q  289 aattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12306 aattgaaaaagtttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 12396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 13910 - 14289
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  13910 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 14009  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  14010 ataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaa 14109  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14110 a-ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 14208  T
Q  299 tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14209 tttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtc 14289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15915
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  15530 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 15629  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15630 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 15729  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattg 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||    
T  15730 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattg 15828  T
Q  294 aaaactttttgtctatttt-taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15829 aaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 15915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 25076 - 25462
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  25076 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 25175  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  25176 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aa 25274  T
Q  201 actctatttttcttctactttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 297  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||  |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25275 actctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 25374  T
Q  298 -------ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
            |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25375 aaaaaagttttttgtct-gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtc 25462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Original strand, 6027 - 6402
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 6126  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |    
T  6127 gtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-a 6225  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 295  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||| ||  |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6226 aactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 6325  T
Q  296 aactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    ||  ||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6326 aaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 6402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25195 - 24821
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25195 tgcagctgttaatgactatcttcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaacca 25096  T
Q  101 ataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaa 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25095 ataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-a 24997  T
Q  200 aactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 296  Q
    ||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24996 aactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 24897  T
Q  297 actttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    | ||||      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  24896 attttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 24821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 338 - 537
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  338 tgcagctgttaatgcctatcttcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaacca 437  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  438 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26426 - 26243
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||| || || | ||| |||||||||||||||| |    
T  26426 tgcagctgttaatgaccatcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaa 26327  T
Q  101 ataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 184  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26326 ataaaatttccatttttcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 379
Target Start/End: Original strand, 1 - 126
Alignment:
Q  254 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  353 atgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtc 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40945 - 40759
Alignment:
Q  1 tgcagctgttaatgaccatcttcatctgaa-gcttctgtacttgtgaa-ttcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgtt-caat-gtaccacca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| || | || | ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  40945 tgcagctgttaatgaccatcttcatcaaaaagctcctatgctcgcgaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccacca 40846  T
Q  97 accaataaga-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 178  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40845 accaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40545
Alignment:
Q  319 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtc 40545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University