View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9319_low_9 (Length: 433)

Name: NF9319_low_9
Description: NF9319
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9319_low_9
NF9319_low_9
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-229)||(18797384-18797612)
chr7 (6-215)||(38258607-38258816)
chr7 (1-229)||(7334851-7335078)
chr7 (1-229)||(30055584-30055812)
chr7 (1-229)||(10481662-10481890)
chr7 (1-229)||(27283801-27284029)
chr7 (1-229)||(37109929-37110159)
chr7 (1-229)||(9355702-9355930)
chr7 (1-229)||(32820929-32821157)
chr7 (11-229)||(31578940-31579158)
chr7 (1-221)||(21991693-21991913)
chr7 (1-229)||(17842460-17842690)
chr7 (1-229)||(11071263-11071488)
chr7 (3-229)||(24211800-24212026)
chr7 (1-229)||(23111247-23111477)
chr7 (1-226)||(41764957-41765182)
chr7 (5-229)||(15612635-15612859)
chr7 (5-229)||(32432513-32432737)
chr7 (37-229)||(15672635-15672830)
chr7 (5-226)||(37347083-37347303)
chr7 (251-433)||(33380579-33380753)
chr7 (11-227)||(10359092-10359308)
chr7 (1-226)||(43686097-43686322)
chr7 (1-229)||(5657357-5657585)
chr7 (1-226)||(4582976-4583201)
chr7 (1-229)||(6546576-6546804)
chr7 (19-229)||(44598741-44598951)
chr7 (1-229)||(8861342-8861570)
chr7 (1-229)||(48928173-48928400)
chr7 (52-229)||(37703374-37703551)
chr7 (1-229)||(29173597-29173807)
chr7 (2-229)||(25691420-25691647)
chr7 (3-229)||(33688138-33688364)
chr7 (37-174)||(37704250-37704387)
chr7 (9-229)||(43925167-43925380)
chr7 (8-229)||(46481005-46481218)
chr7 (1-229)||(12165809-12166028)
chr7 (5-226)||(31520620-31520823)
chr7 (3-224)||(38053545-38053741)
chr7 (1-229)||(22687296-22687516)
chr7 (1-172)||(27421313-27421483)
chr7 (1-196)||(48928473-48928667)
chr7 (90-229)||(35353254-35353393)
chr7 (70-229)||(26587968-26588119)
chr7 (1-229)||(26980380-26980591)
chr7 (1-229)||(12390525-12390734)
chr7 (5-133)||(44413351-44413479)
chr7 (136-229)||(44411416-44411509)
chr7 (120-229)||(32593082-32593191)
chr7 (149-225)||(37704387-37704463)
chr7 (20-100)||(32593194-32593273)
chr7 (157-229)||(34362054-34362126)
chr7 (12-58)||(34362149-34362195)
chr7 (1-49)||(34362205-34362252)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-229)||(10922805-10923033)
chr1 (11-229)||(8222216-8222434)
chr1 (1-229)||(32267112-32267340)
chr1 (1-229)||(15383011-15383239)
chr1 (6-229)||(37451369-37451591)
chr1 (2-229)||(30254502-30254729)
chr1 (1-229)||(18422729-18422957)
chr1 (1-229)||(51128937-51129165)
chr1 (2-229)||(19899639-19899866)
chr1 (1-227)||(25160710-25160936)
chr1 (1-229)||(10181877-10182106)
chr1 (1-229)||(23999425-23999653)
chr1 (2-229)||(27227355-27227582)
chr1 (6-229)||(30326822-30327045)
chr1 (1-229)||(2959826-2960054)
chr1 (2-218)||(15752108-15752324)
chr1 (1-229)||(32216133-32216361)
chr1 (3-229)||(28564653-28564877)
chr1 (1-229)||(28769730-28769959)
chr1 (1-229)||(238383-238611)
chr1 (1-229)||(27532851-27533078)
chr1 (1-229)||(38823292-38823520)
chr1 (6-229)||(27763181-27763404)
chr1 (1-227)||(47682366-47682592)
chr1 (4-229)||(9902924-9903149)
chr1 (1-229)||(46931489-46931715)
chr1 (5-229)||(4330363-4330587)
chr1 (5-229)||(16415728-16415952)
chr1 (1-229)||(27267070-27267297)
chr1 (1-229)||(47279267-47279495)
chr1 (2-229)||(7078933-7079160)
chr1 (1-229)||(42721117-42721342)
chr1 (1-229)||(37618771-37618992)
chr1 (19-229)||(15168192-15168402)
chr1 (1-229)||(27563775-27564003)
chr1 (19-227)||(33725472-33725680)
chr1 (1-229)||(40884891-40885119)
chr1 (1-229)||(3309225-3309459)
chr1 (1-227)||(34012254-34012475)
chr1 (1-229)||(41926241-41926462)
chr1 (3-229)||(14758121-14758338)
chr1 (5-229)||(39393465-39393690)
chr1 (3-229)||(3535012-3535229)
chr1 (18-229)||(22170806-22171017)
chr1 (1-201)||(48620715-48620906)
chr1 (19-229)||(31621419-31621633)
chr1 (116-226)||(1359808-1359918)
chr1 (1-229)||(1547365-1547577)
chr1 (1-229)||(11742238-11742448)
chr1 (4-229)||(38759610-38759839)
chr1 (116-229)||(48353736-48353848)
chr1 (137-229)||(21289817-21289906)
chr1 (1-65)||(21289750-21289814)
chr1 (5-49)||(1359933-1359977)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (1-229)||(1149513-1149741)
chr8 (3-229)||(43643476-43643702)
chr8 (1-229)||(10555085-10555311)
chr8 (3-229)||(23854312-23854538)
chr8 (1-229)||(37970400-37970628)
chr8 (2-229)||(1205009-1205236)
chr8 (1-229)||(7890838-7891066)
chr8 (1-229)||(36694847-36695075)
chr8 (1-229)||(9864229-9864457)
chr8 (1-229)||(16222944-16223172)
chr8 (1-229)||(27082719-27082947)
chr8 (3-229)||(12876192-12876419)
chr8 (2-229)||(35459592-35459819)
chr8 (1-229)||(6098394-6098627)
chr8 (1-229)||(16446756-16446984)
chr8 (1-227)||(30654466-30654692)
chr8 (1-229)||(31933767-31933995)
chr8 (3-229)||(5299827-5300053)
chr8 (45-229)||(4132567-4132750)
chr8 (36-229)||(33906328-33906521)
chr8 (42-225)||(8803702-8803885)
chr8 (1-229)||(39099000-39099228)
chr8 (1-229)||(40862501-40862728)
chr8 (19-229)||(1953869-1954081)
chr8 (1-229)||(11727105-11727333)
chr8 (1-229)||(38644059-38644287)
chr8 (2-225)||(13307705-13307927)
chr8 (1-227)||(34895048-34895269)
chr8 (1-229)||(44869578-44869806)
chr8 (1-229)||(465923-466141)
chr8 (1-125)||(1150090-1150214)
chr8 (37-204)||(41910895-41911061)
chr8 (1-177)||(43025783-43025959)
chr8 (116-229)||(1149801-1149910)
chr8 (1-112)||(41362596-41362707)
chr8 (1-113)||(34952028-34952140)
chr8 (146-229)||(35859160-35859243)
chr8 (150-229)||(12587812-12587891)
chr8 (70-229)||(18259233-18259388)
chr8 (102-229)||(24823275-24823394)
chr8 (120-197)||(7998478-7998555)
chr8 (37-113)||(7998411-7998488)
chr8 (155-219)||(34951948-34952012)
chr8 (185-229)||(33198067-33198111)
chr8 (150-227)||(34463704-34463778)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (3-229)||(25184197-25184423)
chr4 (5-229)||(879449-879673)
chr4 (1-229)||(37663642-37663870)
chr4 (6-229)||(50697329-50697552)
chr4 (5-229)||(55477792-55478016)
chr4 (1-229)||(19089354-19089582)
chr4 (1-229)||(19440549-19440777)
chr4 (7-229)||(42199817-42200040)
chr4 (1-229)||(17173372-17173600)
chr4 (1-229)||(35020936-35021164)
chr4 (7-229)||(32912481-32912703)
chr4 (1-229)||(17167795-17168023)
chr4 (1-229)||(28002887-28003115)
chr4 (1-229)||(33341481-33341708)
chr4 (35-229)||(1815417-1815611)
chr4 (7-229)||(6864123-6864345)
chr4 (1-229)||(55241006-55241233)
chr4 (2-229)||(5047867-5048093)
chr4 (41-229)||(3042741-3042929)
chr4 (1-229)||(34361393-34361620)
chr4 (2-229)||(23761155-23761381)
chr4 (5-226)||(36493593-36493813)
chr4 (5-198)||(4934134-4934327)
chr4 (2-229)||(29584101-29584328)
chr4 (1-229)||(34947996-34948226)
chr4 (5-229)||(47253834-47254050)
chr4 (3-223)||(25700963-25701184)
chr4 (1-229)||(38011936-38012164)
chr4 (3-229)||(27396700-27396926)
chr4 (1-229)||(7703599-7703819)
chr4 (1-229)||(46888059-46888286)
chr4 (1-229)||(9139327-9139539)
chr4 (34-229)||(32579561-32579756)
chr4 (39-229)||(17272084-17272274)
chr4 (1-227)||(49376049-49376275)
chr4 (1-229)||(37775751-37775968)
chr4 (1-229)||(50764812-50765030)
chr4 (1-227)||(32592175-32592392)
chr4 (67-229)||(46884015-46884171)
chr4 (1-229)||(37287816-37288038)
chr4 (52-196)||(35025530-35025674)
chr4 (19-229)||(33816417-33816644)
chr4 (2-229)||(30002542-30002752)
chr4 (113-229)||(7152105-7152221)
chr4 (1-174)||(54499193-54499368)
chr4 (1-229)||(4598074-4598292)
chr4 (117-229)||(26896285-26896397)
chr4 (155-229)||(4205220-4205294)
chr4 (155-229)||(39400244-39400318)
chr4 (160-223)||(56050171-56050234)
chr4 (185-229)||(35025467-35025511)
chr4 (59-125)||(39398049-39398115)
chr4 (190-229)||(23431826-23431865)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-229)||(22973947-22974175)
chr5 (1-229)||(22980875-22981103)
chr5 (6-229)||(7208729-7208951)
chr5 (6-229)||(31705477-31705699)
chr5 (1-229)||(22255264-22255492)
chr5 (1-229)||(31786511-31786739)
chr5 (1-229)||(699232-699460)
chr5 (6-229)||(5829988-5830202)
chr5 (10-229)||(12910446-12910665)
chr5 (1-196)||(27318385-27318580)
chr5 (1-226)||(23116090-23116315)
chr5 (5-229)||(38528102-38528325)
chr5 (6-229)||(35504452-35504675)
chr5 (2-191)||(14919431-14919620)
chr5 (1-229)||(24886186-24886397)
chr5 (1-229)||(30969189-30969417)
chr5 (1-229)||(43308525-43308745)
chr5 (1-229)||(15992405-15992633)
chr5 (1-229)||(17157896-17158123)
chr5 (1-229)||(19119941-19120169)
chr5 (1-229)||(33908315-33908543)
chr5 (3-229)||(27330388-27330614)
chr5 (1-229)||(5837637-5837865)
chr5 (5-229)||(8741750-8741975)
chr5 (5-229)||(35826351-35826572)
chr5 (1-226)||(36866844-36867069)
chr5 (1-226)||(40133467-40133692)
chr5 (1-229)||(21088631-21088859)
chr5 (19-174)||(23954709-23954864)
chr5 (1-227)||(36860505-36860732)
chr5 (1-227)||(35511349-35511570)
chr5 (37-228)||(35934013-35934205)
chr5 (2-229)||(25500791-25501018)
chr5 (1-229)||(39572901-39573121)
chr5 (41-229)||(13956227-13956415)
chr5 (1-229)||(7693312-7693531)
chr5 (5-229)||(8437052-8437275)
chr5 (1-177)||(26268156-26268332)
chr5 (1-229)||(1429027-1429238)
chr5 (1-229)||(6824346-6824574)
chr5 (1-229)||(32563231-32563450)
chr5 (1-229)||(9200315-9200534)
chr5 (67-229)||(2888310-2888472)
chr5 (1-229)||(15724572-15724798)
chr5 (39-229)||(42342851-42343031)
chr5 (1-161)||(5112247-5112406)
chr5 (19-227)||(14409208-14409401)
chr5 (5-229)||(22019718-22019933)
chr5 (133-229)||(25889584-25889680)
chr5 (70-229)||(25669737-25669886)
chr5 (1-131)||(28416490-28416620)
chr5 (7-229)||(8466832-8467036)
chr5 (116-164)||(11898151-11898199)
chr5 (1-74)||(25668731-25668804)
chr5 (185-226)||(28416419-28416460)
chr5 (8-56)||(11898091-11898139)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-229)||(42505950-42506178)
chr3 (5-229)||(48355018-48355242)
chr3 (2-225)||(4761527-4761751)
chr3 (1-229)||(26941135-26941363)
chr3 (11-229)||(46994536-46994754)
chr3 (1-229)||(34133008-34133236)
chr3 (1-229)||(40552134-40552362)
chr3 (1-229)||(39282725-39282953)
chr3 (1-229)||(46297637-46297865)
chr3 (1-229)||(3655077-3655305)
chr3 (1-229)||(24488837-24489065)
chr3 (5-229)||(52040797-52041021)
chr3 (1-229)||(21009677-21009905)
chr3 (1-229)||(47481595-47481823)
chr3 (1-229)||(2008006-2008233)
chr3 (5-229)||(53229027-53229251)
chr3 (1-218)||(11466897-11467114)
chr3 (40-229)||(33698265-33698454)
chr3 (1-229)||(37203140-37203369)
chr3 (12-229)||(54828576-54828793)
chr3 (2-229)||(22451042-22451269)
chr3 (42-229)||(22622593-22622780)
chr3 (9-229)||(24707990-24708212)
chr3 (7-229)||(7327357-7327579)
chr3 (1-229)||(32373543-32373771)
chr3 (7-229)||(33378660-33378882)
chr3 (8-229)||(37157787-37158009)
chr3 (19-229)||(44891588-44891798)
chr3 (1-226)||(3362326-3362553)
chr3 (14-229)||(54505894-54506108)
chr3 (3-229)||(4015535-4015760)
chr3 (2-229)||(45174579-45174807)
chr3 (1-227)||(43348331-43348556)
chr3 (1-229)||(11357256-11357467)
chr3 (7-226)||(22445943-22446162)
chr3 (1-227)||(21193679-21193906)
chr3 (11-229)||(25579822-25580040)
chr3 (1-130)||(51212955-51213084)
chr3 (8-224)||(38591778-38591994)
chr3 (1-229)||(43975767-43975991)
chr3 (1-229)||(29099428-29099647)
chr3 (22-229)||(29163912-29164110)
chr3 (132-229)||(51212646-51212743)
chr3 (54-229)||(1089819-1089994)
chr3 (2-177)||(35844400-35844575)
chr3 (35-229)||(36012244-36012440)
chr3 (1-152)||(53176127-53176278)
chr3 (85-208)||(20373140-20373263)
chr3 (5-214)||(27480252-27480478)
chr3 (1-100)||(20373300-20373399)
chr3 (39-229)||(14586555-14586735)
chr3 (4-229)||(44186392-44186601)
chr3 (37-169)||(11835562-11835695)
chr3 (120-229)||(40936165-40936274)
chr3 (116-224)||(11357030-11357138)
chr3 (5-90)||(40936068-40936153)
chr3 (138-229)||(50475021-50475112)
chr3 (133-229)||(53811609-53811701)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-229)||(7969-8197)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (5-229)||(19289216-19289440)
chr2 (2-229)||(43648138-43648365)
chr2 (3-229)||(3177023-3177249)
chr2 (1-229)||(33550880-33551107)
chr2 (1-226)||(37905790-37906017)
chr2 (7-213)||(17071646-17071852)
chr2 (1-228)||(4763713-4763940)
chr2 (2-229)||(11366274-11366501)
chr2 (18-229)||(41960939-41961150)
chr2 (16-224)||(45327817-45328025)
chr2 (5-229)||(44913748-44913974)
chr2 (5-229)||(2325271-2325487)
chr2 (38-229)||(31861971-31862162)
chr2 (5-213)||(17054005-17054213)
chr2 (1-226)||(4167004-4167229)
chr2 (1-229)||(4263969-4264198)
chr2 (2-224)||(36642069-36642293)
chr2 (1-208)||(29242052-29242259)
chr2 (16-229)||(31570627-31570840)
chr2 (1-229)||(33709125-33709353)
chr2 (2-229)||(39167262-39167483)
chr2 (17-229)||(18494174-18494385)
chr2 (1-229)||(26357659-26357887)
chr2 (5-229)||(4478455-4478675)
chr2 (2-223)||(44286032-44286253)
chr2 (2-229)||(27349841-27350058)
chr2 (20-227)||(41465602-41465809)
chr2 (19-177)||(19424573-19424731)
chr2 (45-229)||(35959023-35959202)
chr2 (1-172)||(33902148-33902319)
chr2 (2-177)||(41463795-41463970)
chr2 (1-229)||(43770741-43770960)
chr2 (3-229)||(33660270-33660487)
chr2 (1-229)||(5881621-5881839)
chr2 (1-229)||(7006831-7007042)
chr2 (1-229)||(13711546-13711769)
chr2 (11-229)||(19313944-19314157)
chr2 (60-205)||(18258204-18258349)
chr2 (116-229)||(19500808-19500921)
chr2 (19-64)||(41051263-41051308)
chr2 (38-89)||(19501773-19501823)
chr2 (185-229)||(41051193-41051237)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (6-229)||(408304-408526)
scaffold0002 (1-229)||(216-438)
scaffold0002 (1-153)||(94334-94486)
scaffold0002 (160-229)||(93975-94044)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (3-229)||(3879813-3880039)
chr6 (5-229)||(6091056-6091281)
chr6 (1-229)||(1945916-1946144)
chr6 (1-228)||(5627473-5627700)
chr6 (1-229)||(7234909-7235136)
chr6 (1-229)||(4318696-4318925)
chr6 (7-229)||(21016992-21017208)
chr6 (1-229)||(8513315-8513538)
chr6 (2-177)||(7055141-7055316)
chr6 (1-229)||(29182245-29182474)
chr6 (19-229)||(20768184-20768392)
chr6 (2-205)||(30353256-30353459)
chr6 (1-227)||(33892888-33893104)
chr6 (1-227)||(6088990-6089211)
chr6 (1-177)||(15491697-15491873)
chr6 (19-229)||(33618934-33619140)
chr6 (172-227)||(7054649-7054704)
chr6 (1-50)||(18498516-18498565)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-227)||(145893-146113)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (5-226)||(44043-44263)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-226)||(154524-154744)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (20-229)||(12010-12219)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (7-229)||(267372-267595)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (140-180)||(100948-100988)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18797384 - 18797612
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18797384 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 18797483  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18797484 ataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 18797583  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
18797584 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 18797612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 38258607 - 38258816
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
38258607 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataag 38258706  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
38258707 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtc 38258806  T
206 caaaatgttg 215  Q
    ||| ||||||    
38258807 caagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7334851 - 7335078
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7334851 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 7334950  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7334951 ataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaact-agtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 7335049  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
7335050 aaatccaagatgttgcaagcattactaga 7335078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 30055584 - 30055812
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
30055584 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgct 30055683  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
30055684 ataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 30055783  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
30055784 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 30055812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10481662 - 10481890
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
10481662 ccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgtt 10481761  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||    
10481762 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgt 10481861  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
10481862 aagtccaagatgttgcaagtattactaga 10481890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27283801 - 27284029
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
27283801 ccaccgtttgtacaatgaaatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgtt 27283900  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
27283901 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 27284000  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
27284001 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 27284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37109929 - 37110159
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatctta--ccttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||    
37109929 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttg 37110028  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |    
37110029 ttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat 37110128  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
37110129 gtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 37110159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9355930 - 9355702
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
9355930 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgtt 9355831  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
9355830 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgt 9355731  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
9355730 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 9355702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32821157 - 32820929
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
32821157 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgtt 32821058  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
32821057 ttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 32820958  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
32820957 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 32820929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31579158 - 31578940
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
31579158 tacaatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataa 31579059  T
111 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaa 210  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |    
31579058 caccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaaga 31578959  T
211 tgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||    
31578958 tgttgcaagcattactaga 31578940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21991693 - 21991913
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
21991693 ccactgtttgtacagtgtcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 21991792  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
21991793 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 21991892  T
201 aagtccaaaatgttgcaagca 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
21991893 aagtccaagatgttgcaagca 21991913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17842690 - 17842460
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatctta--ccttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||    
17842690 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttg 17842591  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |    
17842590 ttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat 17842491  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
17842490 gtaagtccaagatgttgcaagcattattaga 17842460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11071263 - 11071488
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
11071263 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgtt 11071362  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   | || |||||||| |||||||    
11071363 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgt 11071459  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
11071460 aagtccaagatgttgcaaacattactaga 11071488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24211800 - 24212026
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
24211800 actgtttatagaatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttct 24211899  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
24211900 aagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataa 24211999  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
24212000 gtccaagatgttgcaagcattactaga 24212026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23111247 - 23111477
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatct--taccttg 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||    
23111247 ccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttg 23111346  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |    
23111347 ttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacat 23111446  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || || |||||| |||||||||||||    
23111447 gtaaatcaaagatgttgaaagcattactaga 23111477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41765182 - 41764957
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||    
41765182 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgtt 41765083  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||    
41765082 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgt 41764983  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
41764982 aagtccaagattttgcaagcattact 41764957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15612859 - 15612635
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||| | || ||||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
15612859 tgtttgtagagtggcatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 15612760  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
15612759 gtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagt 15612660  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
15612659 ctaagatgttgcaagcattactaga 15612635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 32432513 - 32432737
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||    
32432513 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaa 32432612  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||    
32432613 gtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagt 32432712  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
32432713 ccaaggtgttgcaagcattactaga 32432737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672635
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaaga 136  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
137 ctatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataa---aatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 15672635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 37347083 - 37347303
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
37347083 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaa 37347182  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
37347183 gtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagt 37347281  T
205 ccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||| || ||||||||||||||    
37347282 ccaagatattgcaagcattact 37347303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Original strand, 33380579 - 33380753
Alignment:
251 atttttaaaatgtaagggaaactaatacatttgatagcgttagaggatcgttgcatcatcattctagcgttgaagagatcaggtgctcgtatggatccat 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
33380579 atttttaaaatgtaagggaaaataatgcatttgatag-gttagaggatcgttgcatcatcattctagcgttgaagagatg-------cgtatggatccat 33380670  T
351 attcccatcataatcttcctgattttaagttgttcaagctttgcgccgagatgagcacctcaaatttaatcattgttggacct 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
33380671 attcccatcataatcttcctgattttaacttgctcaagctttgtgccgagacgagcacctcaaatttaatcattgttggacct 33380753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10359308 - 10359092
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaa-tctaattttatcttaccttgttataagcgta 109  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||    
10359308 tacagtgacatcaaaagttcagt-ctgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgta 10359210  T
110 acacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaa 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||| |||||||||||     
10359209 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaag 10359110  T
210 atgttgcaagcattacta 227  Q
    || |||||||||||||||    
10359109 attttgcaagcattacta 10359092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 43686097 - 43686322
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
43686097 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 43686196  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||  |||    
43686197 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 43686296  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
43686297 aagtccaagatgttgcaagcattact 43686322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5657585 - 5657357
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||| |||||    
5657585 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgtt 5657486  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
5657485 ttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 5657386  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
5657385 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 5657357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4582976 - 4583201
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||||    
4582976 ccactatttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgtt 4583075  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  |||    
4583076 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgt 4583175  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
4583176 aagttcaagatgttgcaagcattact 4583201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6546576 - 6546804
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| | |   |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
6546576 ccactatttgtacagtaacatcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 6546675  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
6546676 ttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 6546775  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||    
6546776 aagtctaagatgaggcaagcattactaga 6546804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 44598741 - 44598951
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||    
44598741 catcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 44598840  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||| || ||||| |||    
44598841 aaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaa 44598940  T
219 gcattactaga 229  Q
    |||||||||||    
44598941 gcattactaga 44598951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 8861342 - 8861570
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | | | |||||||||||||| | ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||| ||    
8861342 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttatt 8861441  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
8861442 ttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgt 8861541  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||    
8861542 aagtctaagatgttgcatgcattactaga 8861570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48928400 - 48928173
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||    
48928400 ccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgtt 48928302  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||    
48928301 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgt 48928202  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
48928201 aagtccaagatgttgcaaacattactaga 48928173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703374
Alignment:
52 tcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 151  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatc 37703452  T
152 ataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
37703451 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactaga 37703374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29173597 - 29173807
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
29173597 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 29173696  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||    
29173697 ttaag-----------------tgttacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgt 29173778  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
29173779 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 29173807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25691647 - 25691420
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||| ||     
25691647 cactgtttgtacagtggcatcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattt 25691548  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||    || ||||||||  || ||||    
25691547 taagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgta 25691448  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
25691447 agttcaaaatgttgcaaacattactaga 25691420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33688364 - 33688138
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
33688364 actgtttgtccagtggcatcaaaagttcagt-ctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttt 33688266  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||| | |||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||||  | |  |||||||||||| ||||    
33688265 taagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgta 33688166  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
33688165 agtccaagatgttgcaagcattactaga 33688138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 37704250 - 37704387
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaaga 136  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
37704250 catagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 37704349  T
137 ctatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaa 174  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
37704350 ctatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 43925167 - 43925380
Alignment:
9 tgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
43925167 tgtacaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgc 43925265  T
109 aacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaa 208  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||      ||||||    
43925266 aacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaa 43925359  T
209 aatgttgcaagcattactaga 229  Q
     ||||||||||||||||||||    
43925360 gatgttgcaagcattactaga 43925380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46481218 - 46481005
Alignment:
8 ttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||        |||||||| ||||| |||| || |||||||||  ||| ||||| |||| |    
46481218 ttgtacaatgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatca--------gattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtg 46481127  T
108 taacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcca 207  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |    
46481126 taacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 46481027  T
208 aaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
46481026 agatgttgcaaacattactaga 46481005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12165809 - 12166028
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcata-gtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || | || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
12165809 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagtt-aagtcccttaagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgt 12165907  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||    
12165908 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctg 12165998  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    
12165999 taagtctaagatgttgcaagcattactaga 12166028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31520823 - 31520620
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
31520823 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaa 31520725  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    |                 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
31520724 g-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagt 31520642  T
205 ccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||| |||||||||||||||||    
31520641 ccaagatgttgcaagcattact 31520620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 38053545 - 38053741
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
38053545 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttat 38053636  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    |||                 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
38053637 aag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaa 38053719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22687296 - 22687516
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
22687296 ccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 22687395  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||        |||||| ||| || || |||||||||||| |||    
22687396 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaactc--------tgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgt 22687487  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
22687488 aagtccaagatgttgcaagcattaataga 22687516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27421483 - 27421313
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27421483 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttatt 27421385  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgtta 172  Q
     |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||||    
27421384 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48928667 - 48928473
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| || ||    
48928667 ccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattatt 48928569  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtac 196  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
48928568 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtac 48928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Original strand, 35353254 - 35353393
Alignment:
90 cttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaa 189  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  | || |||||    
35353254 cttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaa 35353353  T
190 atagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
35353354 atagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactaga 35353393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26588119 - 26587968
Alignment:
70 tacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||        ||    
26588119 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactc--------tg 26588028  T
170 ttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
26588027 ttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactaga 26587968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26980380 - 26980591
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
26980380 ccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgtt 26980479  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
26980480 ttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgt 26980562  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||    
26980563 aagtctaagatgttgcaagtattactaga 26980591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12390734 - 12390525
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   | | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
12390734 ccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttctt 12390635  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||    
12390634 ttaag-----------------tgtaacacttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgt 12390554  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
12390553 aagtccaagatgttgcaaccattactaga 12390525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44413479 - 44413351
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
44413479 tgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaa 44413380  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacactta 133  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
44413379 gtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411416
Alignment:
136 actatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 44411416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32593191 - 32593082
Alignment:
120 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
32593191 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaa 32593092  T
220 cattactaga 229  Q
     |||||||||    
32593091 tattactaga 32593082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704463
Alignment:
149 atcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattac 225  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattac 37704463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32593273 - 32593194
Alignment:
20 atcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
32593273 atcaaaagttcagt-ctcacagtatcatcaattcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgtt 32593194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34362126 - 34362054
Alignment:
157 ctctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
34362126 ctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactaga 34362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34362195 - 34362149
Alignment:
12 acaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcag 58  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
34362195 acaatggcatcaaaagttcagttcttatagtatcatcaattcatcag 34362149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 34362252 - 34362205
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatca 49  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
34362252 ccactgtttgtacagtggcatcaaa-gttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10922805 - 10923033
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
10922805 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgtt 10922904  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
10922905 ataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgt 10923004  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
10923005 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 10923033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 8222216 - 8222434
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
8222216 tacaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaa 8222315  T
111 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
8222316 caccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaga 8222415  T
211 tgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||    
8222416 tgttgcaagcattactaga 8222434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 32267112 - 32267340
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
32267112 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtt 32267211  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
32267212 ataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgt 32267311  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||    
32267312 aggtccaagatgttgcaagcattactaga 32267340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15383011 - 15383239
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
15383011 ccaccgtttgtacaatgtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 15383110  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
15383111 ataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 15383210  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
15383211 aaatccaagatgttgcaagcattactaga 15383239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 37451369 - 37451591
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
37451369 gtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataag 37451467  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
37451468 tgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtc 37451567  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||    
37451568 caagatgttgcaaacattactaga 37451591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 30254502 - 30254729
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
30254502 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgtta 30254601  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
30254602 taagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgta 30254701  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
30254702 agtccaagatgttgcaagcattactaga 30254729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18422729 - 18422957
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
18422729 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtt 18422828  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||    
18422829 atatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgt 18422928  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
18422929 aagtccaagatgttgcaagcattgctaga 18422957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 51128937 - 51129165
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
51128937 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 51129036  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||    
51129037 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt 51129136  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
51129137 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 51129165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19899866 - 19899639
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||     
19899866 cactgtttgtagaatggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttc 19899767  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
19899766 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 19899667  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
19899666 agtccaagatgttgcaagcattactaga 19899639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 25160710 - 25160936
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
25160710 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgtt 25160809  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
25160810 ataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 25160909  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
25160910 aagtccaagatgttgcaagcattacta 25160936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10182106 - 10181877
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
10182106 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtt 10182007  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacc-tg 199  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | |||||| ||||||||| ||    
10182006 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttg 10181907  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
10181906 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 10181877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23999425 - 23999653
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
23999425 ccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 23999524  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
23999525 ctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgt 23999624  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
23999625 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 23999653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27227582 - 27227355
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||     
27227582 cactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttt 27227483  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
27227482 taagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgta 27227383  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
27227382 agtccaagatgttgcaagcattactaga 27227355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30327045 - 30326822
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
30327045 gtttgtacaatagcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 30326946  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||    
30326945 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtc 30326846  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
30326845 caagatgttgcaagcattactaga 30326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2959826 - 2960054
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
2959826 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtt 2959925  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
2959926 tcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgt 2960025  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
2960026 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 2960054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 15752108 - 15752324
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
15752108 cactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttt 15752207  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||    
15752208 taagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgta 15752307  T
202 agtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||||| | |||||||    
15752308 agtccaagaagttgcaa 15752324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 32216133 - 32216361
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
32216133 ccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgtt 32216232  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||    
32216233 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgt 32216332  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
32216333 aagtccaagatgttgcaagcattattaga 32216361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28564877 - 28564653
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
28564877 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttat 28564778  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    |||| ||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||    
28564777 aagcataacaccccgtaaagtgtaacactta--actatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaa 28564680  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
28564679 gtccaagatgttgcaaacattactaga 28564653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28769730 - 28769959
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
28769730 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtt 28769829  T
101 ataagcgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
28769830 ataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctg 28769929  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
28769930 taagtccaagatgttgcaaacattgctaga 28769959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 238611 - 238383
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
238611 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgtt 238512  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
238511 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgt 238412  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
238411 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 238383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27533078 - 27532851
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
27533078 ccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgtt 27532980  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||    
27532979 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 27532880  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
27532879 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 27532851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 38823292 - 38823520
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||    
38823292 ccactatttgtacagtgtcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttatt 38823391  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||||    
38823392 ttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgt 38823491  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
38823492 aagtctaaaatgttgcaagcattactaga 38823520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27763404 - 27763181
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
27763404 gtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaag 27763305  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
27763304 cgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtt 27763205  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
27763204 caagatgttgcaagcattactaga 27763181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47682592 - 47682366
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  | |||||||    
47682592 ccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgtt 47682493  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
47682492 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 47682393  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
47682392 aaatccaagatgttgcaagcattacta 47682366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9903149 - 9902924
Alignment:
4 ctgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttata 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
9903149 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttca 9903050  T
104 agcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||    
9903049 agtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaag 9902950  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||    
9902949 tccaagatgctgcaagcactactaga 9902924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 46931489 - 46931715
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
46931489 ccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 46931588  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
       |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
46931589 c--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgt 46931686  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
46931687 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 46931715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 4330363 - 4330587
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
4330363 tgtttgtacagtgggatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 4330462  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||||||    
4330463 gtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagt 4330562  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
4330563 ccaatatgttgcaagcattactaga 4330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 16415728 - 16415952
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
16415728 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 16415827  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
16415828 gtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagt 16415927  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||    
16415928 ccaagatgttgcaagcattattaga 16415952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27267297 - 27267070
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
27267297 ccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatct-accttgtt 27267199  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     | || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
27267198 ttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgt 27267099  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
27267098 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 27267070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 47279267 - 47279495
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
47279267 ccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 47279366  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
47279367 ttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgt 47279466  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
47279467 aagtccaagatgttgcaaacattattaga 47279495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7079160 - 7078933
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||     
7079160 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttt 7079061  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||    
7079060 taagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgta 7078961  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || || |||||| ||||||||||    
7078960 agtctaagatattgcaaacattactaga 7078933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 42721117 - 42721342
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
42721117 ccactgtttgtacagtaacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 42721216  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||   | || |||||||| ||| |||    
42721217 ttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgt 42721313  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||    
42721314 aagtccaagatgttgcaattattactaga 42721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37618992 - 37618771
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtat--catcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
37618992 ccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttg 37618893  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||||         ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |    
37618892 ttataagcataacatcccataaagtgtaacac---------tcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacat 37618802  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
37618801 gtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 37618771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 15168192 - 15168402
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||     
15168192 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcag 15168291  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
15168292 aaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaa 15168391  T
219 gcattactaga 229  Q
    |||||| ||||    
15168392 gcattattaga 15168402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27564003 - 27563775
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
27564003 ccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 27563904  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||  ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||  |||    
27563903 ttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgt 27563804  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
27563803 aagtccaagatgttgcaagtattactaga 27563775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33725680 - 33725472
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||     
33725680 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccag 33725581  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
33725580 aaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaa 33725481  T
219 gcattacta 227  Q
     ||||||||    
33725480 acattacta 33725472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40884891 - 40885119
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| | |  |||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| || ||||||    
40884891 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgtt 40884990  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||    
40884991 ttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgt 40885090  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
40885091 aagtccaagatgttgcaaacattactaga 40885119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3309225 - 3309459
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||||    
3309225 ccactgtttgtacagtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgt 3309324  T
100 tataagcgtaacacctcacaa-----agtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagt 194  Q
    | |||  |||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
3309325 tttaaatgtaacacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagt 3309424  T
195 acctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
3309425 acccgtaagtccaagatattgcaagcattactaga 3309459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34012475 - 34012254
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
34012475 ccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtt 34012376  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||    
34012375 tcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 34012281  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
34012280 aagttcaagatgttgcaagcattacta 34012254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 41926241 - 41926462
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
41926241 ccactgtttgtacagtggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgtt 41926340  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||  ||||||||||||||||      ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
41926341 ttaagtgtaacactccacaaagtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgt 41926434  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
41926435 aagtccaagatatt-caagcattactaga 41926462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14758121 - 14758338
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
14758121 actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgtttt 14758220  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| || |||         ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
14758221 aagtgtaacaccccagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 14758311  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
14758312 gtccaagatgttgcaagcattactaga 14758338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 39393465 - 39393690
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgttata 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
39393465 tgtttgtacagtggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgtttta 39393564  T
104 agcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||     
39393565 agtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaa 39393664  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
39393665 tccaagatgttgcaaacattactaga 39393690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 3535012 - 3535229
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | | | || ||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||| |    
3535012 actgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgtttt 3535111  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||         |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
3535112 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacactt---------acatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaa 3535202  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
3535203 gtccaagatgttgcaagcattactaga 3535229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22171017
Alignment:
18 acatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctca 117  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  |||||||| ||    
22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
118 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||||| || ||||||||    
22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgca 22171005  T
218 agcattactaga 229  Q
    | ||||| ||||    
22171006 aacattattaga 22171017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 48620715 - 48620906
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
48620715 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgtt 48620814  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||    
48620815 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgt 48620905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31621633 - 31621419
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||     
31621633 catcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccag 31621534  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaa-----agattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgt 213  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||     |||| || || |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
31621533 aa-gtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgt 31621435  T
214 tgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||| ||||    
31621434 tgcaagcattagtaga 31621419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1359918 - 1359808
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
1359918 cacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttg 1359819  T
216 caagcattact 226  Q
    |||||||||||    
1359818 caagcattact 1359808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 1547365 - 1547577
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
1547365 ccactgtttgtgcagtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcat--------cagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgtt 1547456  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||        |||||||||| || || |||||||||||| |||    
1547457 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactc--------tgttaaagataccaacgataaaatagtacatgt 1547548  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
1547549 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 1547577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11742448 - 11742238
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
11742448 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgtt 11742350  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |                 |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||  | || |||||||||||| |||    
11742349 tt-----------------aagtgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 11742267  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
11742266 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 11742238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 38759610 - 38759839
Alignment:
4 ctgtttgtacaatgacatcaaaagttca---attct-catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| | || ||||||||| |||||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||||| || ||| |    
38759610 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttat 38759709  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |  | || |||||||| ||  ||    
38759710 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatg 38759809  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
38759810 taactccaagatgttgcaagcattactaga 38759839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 48353736 - 48353848
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| || |||    
48353736 cacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattg 48353834  T
216 caagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||    
48353835 caagcattactaga 48353848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21289906
Alignment:
137 ctatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactaga 21289906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 21289750 - 21289814
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaaca 65  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
21289750 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaaca 21289814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1359977 - 1359933
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatca 49  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
1359977 tgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatca 1359933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1149741 - 1149513
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149741 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 1149642  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
1149641 ataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 1149542  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
1149541 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 1149513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43643702 - 43643476
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
43643702 actgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttat 43643603  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
43643602 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaa 43643503  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
43643502 gtccaagatgttgcaagcattactaga 43643476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10555311 - 10555085
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10555311 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 10555212  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10555211 ataagcgcaacacctcacaaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 10555114  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
10555113 aagtccaagatattgcaagcattactaga 10555085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23854538 - 23854312
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
23854538 actgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttat 23854439  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23854438 aagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 23854339  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
23854338 gtccaagatgttgcaagcattactaga 23854312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37970628 - 37970400
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
37970628 ccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 37970529  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
37970528 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgt 37970429  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
37970428 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 37970400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 1205009 - 1205236
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
1205009 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttt 1205108  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
1205109 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 1205208  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
1205209 agtccaagatgttgcaagtattactaga 1205236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7891066 - 7890838
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
7891066 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgtt 7890967  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
7890966 ataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 7890867  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
7890866 aagtctaaaatgttgcaagcattactaga 7890838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36695075 - 36694847
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
36695075 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgtt 36694976  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
36694975 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 36694876  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||    
36694875 aaatccaagatgttgcaagcatcactaga 36694847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9864229 - 9864457
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
9864229 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgtt 9864328  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
9864329 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 9864428  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
9864429 aagttcaagatgttgcaagcattactaga 9864457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16222944 - 16223172
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
16222944 ccacagtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgtt 16223043  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||    
16223044 ttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgt 16223143  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
16223144 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 16223172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27082947 - 27082719
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27082947 ccactgtttgtgcagtggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgtt 27082848  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
27082847 ttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 27082748  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
27082747 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 27082719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12876192 - 12876419
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| || |    
12876192 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttatttt 12876291  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||    
12876292 aagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgta 12876391  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||    
12876392 agtccaagatgttacaggcattactaga 12876419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35459819 - 35459592
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
35459819 cactgattgtacaatgacattaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgtta 35459720  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||  |||||| | |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
35459719 taaatgtaacatcccacagattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgta 35459620  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
35459619 agtccaaaatgttgcaaacattactaga 35459592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6098627 - 6098394
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
6098627 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgtt 6098528  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattcc-----gacaataaaatagta 195  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      |||||| |||||||    
6098527 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagta 6098428  T
196 cctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
6098427 cttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 6098394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16446984 - 16446756
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| | | | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
16446984 ccactgtttgtataatggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtt 16446885  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
16446884 tcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgt 16446785  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
16446784 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 16446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30654692 - 30654466
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||    
30654692 ccactgtttgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgtt 30654593  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
30654592 ttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgt 30654493  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
30654492 aagtccaagatgttgcaagcattacta 30654466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31933995 - 31933767
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
31933995 ccactctttatacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtt 31933896  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
31933895 ataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgt 31933796  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || || |||||  ||||||||||    
31933795 aagtctaagatattgcagacattactaga 31933767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5300053 - 5299827
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| |    
5300053 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgtttt 5299954  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  || | ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||    
5299953 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaa 5299854  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
5299853 gtccaagatgttgcaagcattactaga 5299827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132567
Alignment:
45 catcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcaca 144  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgtt-taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
145 taatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 4132567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 33906328 - 33906521
Alignment:
36 tcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaag 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||||||    
33906328 tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagtgtaacacttaag 33906427  T
136 actatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
33906428 actatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 33906521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8803885 - 8803702
Alignment:
42 tatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatc 141  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
8803885 tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatc 8803786  T
142 acataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattac 225  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
8803785 acataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattac 8803702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39099228 - 39099000
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
39099228 ccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgtt 39099129  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||    
39099128 ttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgt 39099029  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
39099028 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 39099000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40862501 - 40862728
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |  ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
40862501 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagt-ctcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgtt 40862599  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||||||| |||    
40862600 ctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 40862699  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
40862700 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 40862728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1954081 - 1953869
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatc-atcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaaca-cctc 116  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |    
1954081 catcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatcccc 1953982  T
117 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||| ||||| || ||||    
1953981 acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgc 1953882  T
217 aagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||    
1953881 aagcattattaga 1953869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11727105 - 11727333
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||    
11727105 ccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttatt 11727204  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||    
11727205 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 11727304  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
11727305 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 11727333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 38644059 - 38644287
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
38644059 ccactgtttgtctagtggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 38644158  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||||  | |  |||||||||||| |||    
38644159 ttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgt 38644258  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
38644259 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 38644287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 13307705 - 13307927
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| || ||     
13307705 cactatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattt 13307804  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||| |||    
13307805 taaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgta 13307903  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattac 225  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
13307904 agttcaagatgttgcaagcattac 13307927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 34895048 - 34895269
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
34895048 ccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtt 34895147  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || | |||||||||| |||    
34895148 tcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgt 34895242  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
34895243 aagttcaagatgttgcaagcattacta 34895269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 44869578 - 44869806
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaa-ttttatcttaccttgt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
44869578 ccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgt 44869677  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||      
44869678 tttaagtgt-tgtccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccga 44869776  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
44869777 taagtccaagatattgcaagcattactaga 44869806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 465923 - 466141
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||| | | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
465923 ccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgtt 466022  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
466023 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacat-atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgt 466112  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
466113 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 466141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1150214 - 1150090
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
1150214 ccactgtttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 1150115  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgt 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
1150114 ataagcgtaacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41911061 - 41910895
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaaga 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
41911061 catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaata 41910962  T
137 ctatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||    
41910961 ctatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaaga-tgcaacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 43025783 - 43025959
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||| |||||| ||    
43025783 ccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttatt 43025882  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
     |||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
43025883 ttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagat 43025959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1149910 - 1149801
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || ||||||    
1149910 cacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttg 1149815  T
216 caagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||    
1149814 caagcattactaga 1149801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 41362596 - 41362707
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||    
41362596 ccactatttgtatagtgacatcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgtt 41362695  T
101 ataagcgtaaca 112  Q
     |||| ||||||    
41362696 ttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34952140 - 34952028
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |   |||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
34952140 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgtt 34952041  T
101 ataagcgtaacac 113  Q
     |||| |||||||    
34952040 ttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 229
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859243
Alignment:
146 aatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactaga 35859243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587891
Alignment:
150 tcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactaga 12587891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259388
Alignment:
70 tacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatg 169  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    |||||  ||||||  || |   ||||||||    
18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatg 18259328  T
170 ttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||  | || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
18259329 ttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactaga 18259388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24823394 - 24823275
Alignment:
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||        |||||| || || |||||||||||| ||||    
24823394 taagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaacgataaaatagtacatgta 24823303  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
24823302 agtccaagatgttgcaagcattactaga 24823275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Original strand, 7998478 - 7998555
Alignment:
120 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||| || || |||||||||||||    
7998478 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtacc 7998555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 7998411 - 7998488
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaa-ttttatcttaccttgttataagcgtaacac 113  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||    
7998411 cataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34952012 - 34951948
Alignment:
155 aactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
34952012 aactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 34951948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Original strand, 33198067 - 33198111
Alignment:
185 ataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
33198067 ataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactaga 33198111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463778
Alignment:
150 tcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattacta 34463778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 25184197 - 25184423
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
25184197 actgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttat 25184296  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
25184297 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaa 25184396  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
25184397 gtccaagatgttgcaagcattactaga 25184423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 879673 - 879449
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
879673 tgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataa 879574  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
879573 gcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagt 879474  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
879473 ccaagatgttgcaagcattactaga 879449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37663870 - 37663642
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
37663870 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgct 37663771  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
37663770 ataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 37663671  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
37663670 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 37663642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 50697329 - 50697552
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
50697329 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataag 50697427  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgc-atgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
50697428 cgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaatt 50697527  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
50697528 ccaagatgttgtaagcattactaga 50697552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55478016 - 55477792
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
55478016 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataa 55477917  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||    
55477916 gtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagt 55477817  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
55477816 ccaagatgttgcaagcattactaga 55477792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19089582 - 19089354
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
19089582 ccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgct 19089483  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
19089482 atatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgt 19089383  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
19089382 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 19089354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19440777 - 19440549
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19440777 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgtt 19440678  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
19440677 ataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgt 19440578  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
19440577 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 19440549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 42199817 - 42200040
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
42199817 tttgtagaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagc 42199916  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacc-tgtaagtc 205  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
42199917 ataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtc 42200016  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
42200017 caagatgttgcaagcattactaga 42200040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17173372 - 17173600
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
17173372 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgtt 17173471  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
17173472 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 17173571  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||    
17173572 aagtctaagatgttgcaagcatcactaga 17173600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35021164 - 35020936
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||   | ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35021164 ccactgtttgtacattggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 35021065  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
35021064 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgt 35020965  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||    
35020964 aagtccaagatattgcaaacattactaga 35020936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32912703 - 32912481
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
32912703 tttgtagaatgatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagc 32912604  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
32912603 gtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtcc 32912504  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||    
32912503 aagatgttgcaagcattactaga 32912481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17167795 - 17168023
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattct-catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
17167795 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttc-attctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgt 17167893  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||    
17167894 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatg 17167993  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||    
17167994 taagtctaagatgttgcaagcatcactaga 17168023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28003115 - 28002887
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
28003115 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgtt 28003016  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
28003015 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 28002916  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||    
28002915 aagtccaagatgttgctaacattactaga 28002887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33341481 - 33341708
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||    
33341481 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgtt 33341579  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
33341580 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 33341679  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||    
33341680 aagtccaagatgttgtaagcattactaga 33341708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 1815417 - 1815611
Alignment:
35 ctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaa 134  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
1815417 ctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 1815516  T
135 gactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
1815517 gactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactaga 1815611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 6864123 - 6864345
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    ||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
6864123 tttgtacaatagcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagc 6864222  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||| |    
6864223 gtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttc 6864322  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||    
6864323 aagatgttgcaagcattactaga 6864345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55241233 - 55241006
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
55241233 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgtt 55241135  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
55241134 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 55241035  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
55241034 aagtccaagatgttgcaaacattactaga 55241006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5048093 - 5047867
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||     
5048093 cactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttt 5047994  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
5047993 taagtgtaatacc-cgcaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgta 5047895  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||    
5047894 agtccaagatgttgcaagttttactaga 5047867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3042929
Alignment:
41 gtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactat 140  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 3042840  T
141 cacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
3042841 cacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactaga 3042929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34361620 - 34361393
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||    
34361620 ccactgtttgtagaatgacattaaaagttcagc-ctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgtt 34361522  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
34361521 ctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctat 34361422  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
34361421 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 34361393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 23761155 - 23761381
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||     
23761155 cactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatct-accttgttt 23761253  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||    
23761254 taagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctata 23761353  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
23761354 agtccaagatgttgcaagcattactaga 23761381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36493813 - 36493593
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
36493813 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaa 36493714  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
36493713 gtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagt 36493615  T
205 ccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    | || || ||||||||||||||    
36493614 ctaagatattgcaagcattact 36493593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4934327 - 4934134
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
4934327 tgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaa 4934228  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
4934227 gtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct 4934134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29584328 - 29584101
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  |||||||||     
29584328 cactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttt 29584229  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
29584228 taagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgta 29584129  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
29584128 agtccaagatgttgcaagcattactaga 29584101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34948226 - 34947996
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    
34948226 ccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtt 34948127  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaac--acttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
      ||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |    
34948126 taaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacat 34948027  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
34948026 gtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 34947996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 47253834 - 47254050
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
47253834 tgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat--------cagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 47253925  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||    
47253926 gtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagt 47254025  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
47254026 ctaagatgttgcaagcattactaga 47254050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25701184 - 25700963
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
25701184 actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgtttt 25701085  T
103 aagcgtaaca-cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||   | || ||||||||||| | |||    
25701084 aagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgta 25700985  T
202 agtccaaaatgttgcaagcatt 223  Q
    | || || || |||||||||||    
25700984 aatctaagattttgcaagcatt 25700963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 38011936 - 38012164
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
38011936 ccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgtt 38012035  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||    
38012036 ttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgt 38012135  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||    
38012136 aagtccaagatgttgcaaatattactaga 38012164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 27396700 - 27396926
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
27396700 actgtttgtacaatgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgtttt 27396799  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||| | || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||  | || ||||| | |||||| |||    
27396800 aagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataa 27396899  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
27396900 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 27396926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7703599 - 7703819
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||        |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
7703599 ccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcat--------cagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgtt 7703690  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
7703691 ttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 7703790  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
7703791 aagtcgaagatgttgcaagcattactaga 7703819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46888286 - 46888059
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| | | |||| |||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
46888286 ccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 46888187  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
46888186 tcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactta-gactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 46888088  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||    
46888087 aaatccaagatgttacaagcattactaga 46888059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9139327 - 9139539
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
9139327 ccaccgtttgtacagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 9139426  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||  ||||||||  |||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||| |||    
9139427 ttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaag----------------ataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgt 9139510  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
9139511 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 9139539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 32579561 - 32579756
Alignment:
34 tctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacactta 133  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
32579561 tctcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactctta 32579660  T
134 agactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
32579661 agactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaga 32579756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 229
Target Start/End: Original strand, 17272084 - 17272274
Alignment:
39 tagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagact 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
17272084 tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagact 17272183  T
139 atcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17272184 atcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 17272274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 49376049 - 49376275
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||  | ||||| |    
49376049 ccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgat 49376148  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||||||| |||    
49376149 ttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 49376248  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||    
49376249 aagtccaagaagttgaaagcattacta 49376275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37775751 - 37775968
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||    ||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
37775751 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcccccct--tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgtt 37775848  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
37775849 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgt 37775939  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
37775940 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 37775968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 50764812 - 50765030
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||          
50764812 ccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac------ 50764905  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
        | |||||||| ||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||  | || |||||||||||| |||    
50764906 ----gtgtaacaccccacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 50765001  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
50765002 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 50765030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 32592175 - 32592392
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
32592175 ccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgtt 32592274  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         ||| || || |||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
32592275 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcatatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgt 32592365  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||    
32592366 aagttcaagatgttgaaagcattacta 32592392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46884171 - 46884015
Alignment:
67 gactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
46884171 gactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattttgtttgc 46884074  T
167 atgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
46884073 atgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactaga 46884015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37287816 - 37288038
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |        |||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||||    
37287816 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataa--------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgt 37287907  T
100 tataagcgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    | |||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |    
37287908 tttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacat 37288007  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
37288008 gtaagtccaagatgttgcaagcattattaga 37288038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35025674 - 35025530
Alignment:
52 tcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 151  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35025674 tcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 35025575  T
152 ataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtac 196  Q
    || |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
35025574 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33816644 - 33816417
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctca- 117  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||     
33816644 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 33816545  T
118 ----------------caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
                    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||| | ||||    
33816544 aaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgta 33816445  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||    
33816444 agtccaagatgttgcaaacattactaga 33816417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30002752 - 30002542
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||        |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||     
30002752 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatca--------gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattt 30002661  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| | ||    
30002660 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacattta 30002570  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
30002569 agtctaagatgttgcaagcattactaga 30002542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7152221 - 7152105
Alignment:
113 cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||| ||     
7152221 cctcacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatt 7152122  T
213 ttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||| ||||    
7152121 ttgcaagcattattaga 7152105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54499368 - 54499193
Alignment:
1 ccactgtttgtac-aatgacatcaaaagttcaattctc-atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttacctt 97  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||    
54499368 ccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagt-ctctatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcatacctt 54499270  T
98 gttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaa 174  Q
    ||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||    
54499269 gttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaaa 54499193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4598074 - 4598292
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | | | |||  ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||    
4598074 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgtt 4598172  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||| | |    
4598173 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacattt 4598263  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||    
4598264 aaatccaagatgttgcaagcattattaga 4598292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896397
Alignment:
117 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc-aaaatgttg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttg 26896383  T
216 caagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||    
26896384 caaacattactaga 26896397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 4205220 - 4205294
Alignment:
155 aactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
4205220 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactaga 4205294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 39400244 - 39400318
Alignment:
155 aactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
39400244 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactaga 39400318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 56050171 - 56050234
Alignment:
160 tgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcatt 223  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
56050171 tgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35025511 - 35025467
Alignment:
185 ataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
35025511 ataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 35025467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398115
Alignment:
59 attaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgt 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||| ||||||||||    
39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431865
Alignment:
190 atagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtaga 23431865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22974175 - 22973947
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
22974175 ccactgtttgtacaataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtt 22974076  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
22974075 ataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgt 22973976  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
22973975 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 22973947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22980875 - 22981103
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22980875 ccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 22980974  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||    
22980975 ttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 22981074  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
22981075 aagtccaagatgttgcaatcattactaga 22981103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7208951 - 7208729
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
7208951 gtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaa 7208853  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||     
7208852 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtt 7208753  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
7208752 caagatgttgcaagtattactaga 7208729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31705699 - 31705477
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31705699 gtttgtacaatgacatcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataag 31705601  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||    
31705600 cgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtc 31705501  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
31705500 caagatgttgcaagcattactaga 31705477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22255264 - 22255492
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||    
22255264 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgtt 22255363  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
22255364 ataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgt 22255463  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    
22255464 aagtccaagatgttgcaagccttactaga 22255492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31786739 - 31786511
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
31786739 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgtt 31786640  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
31786639 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 31786540  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
31786539 aaatccaagatgttgcaagcattactaga 31786511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 699232 - 699460
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
699232 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttatt 699331  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
699332 ttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgt 699431  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
699432 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 699460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 5829988 - 5830202
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5829988 gtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaa---------ttaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataag 5830078  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
5830079 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 5830178  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
5830179 caagatgttgcaagcattactaga 5830202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 12910446 - 12910665
Alignment:
10 gtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgta 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
12910446 gtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta 12910545  T
110 acacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||     
12910546 acaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaag 12910645  T
210 atgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
12910646 atgttgcaagcattactaga 12910665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27318580 - 27318385
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
27318580 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatt 27318481  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtac 196  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
27318480 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac 27318385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23116315 - 23116090
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
23116315 ccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtt 23116216  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
23116215 tcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 23116116  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
23116115 aagtccaagatgttgcaagcattact 23116090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38528325 - 38528102
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
38528325 tgtttatacagtgacatcaaaagttcagt-ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaa 38528227  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||    
38528226 gtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagt 38528127  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
38528126 ccaagatgttgcaagcattactaga 38528102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 35504452 - 35504675
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
35504452 gtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataag 35504551  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
35504552 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtc 35504651  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
35504652 caagatgttgcaagtattactaga 35504675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14919620 - 14919431
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
14919620 cactgtttatataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttatta 14919521  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
14919520 taagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaat 14919431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24886186 - 24886397
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
24886186 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatt 24886285  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
24886286 ataag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgt 24886368  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
24886369 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 24886397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30969417 - 30969189
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
30969417 ccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgtt 30969318  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |    
30969317 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctat 30969218  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||||    
30969217 aagttcaagatgctgcaagtattactaga 30969189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43308745 - 43308525
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
43308745 ccactgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgtt 43308646  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43308645 ataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaagact--------atatcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 43308554  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
43308553 aagtcgaagatgttgcaagcattactaga 43308525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15992633 - 15992405
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||| |    
15992633 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgat 15992534  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     | || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
15992533 ttgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggt 15992434  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
15992433 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 15992405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17158123 - 17157896
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||    
17158123 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcg-tcattatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttatt 17158025  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| | |    
17158024 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtactttt 17157925  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
17157924 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 17157896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19119941 - 19120169
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||    
19119941 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgtt 19120040  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||      
19120041 ttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctca 19120140  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
19120141 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 19120169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33908315 - 33908543
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
33908315 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgtt 33908414  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||    
33908415 ttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 33908514  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
33908515 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 33908543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 27330388 - 27330614
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
27330388 actgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgtttt 27330487  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
27330488 aagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaa 27330587  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
27330588 gtccaagatgttgcaagcattactaga 27330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5837637 - 5837865
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
5837637 ccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgtt 5837736  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||  | || | |||||||||||||     
5837737 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgc 5837836  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
5837837 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 5837865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8741975 - 8741750
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||    
8741975 tgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaa 8741876  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacat-aatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||    
8741875 gtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaag 8741776  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
8741775 tccaaaatgttgcaagcatcactaga 8741750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35826572 - 35826351
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||    
35826572 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaa 35826474  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
35826473 gcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagt 35826376  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
35826375 ccaagatgttgcaagcattactaga 35826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 36866844 - 36867069
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
36866844 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 36866943  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||  |||    
36866944 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 36867043  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
36867044 aagtccaagatgttgcaaacattact 36867069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 40133467 - 40133692
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||| ||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
40133467 ccactatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 40133566  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||  |||    
40133567 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 40133666  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
40133667 aagtccaagatgttgcaagcattact 40133692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21088859 - 21088631
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||| | ||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
21088859 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgtt 21088760  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||||    
21088759 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgt 21088660  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||    
21088659 aaatccaagatgttgtaagcattactaga 21088631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23954864 - 23954709
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
23954864 catcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcac 23954765  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaa 174  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23954764 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 23954709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 36860505 - 36860732
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||    
36860505 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttt 36860604  T
101 at-aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||  ||    
36860605 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttg 36860704  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
36860705 taagtccaagatgttgcaagcattacta 36860732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35511570 - 35511349
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
35511570 ccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtt 35511471  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
35511470 tcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 35511376  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
35511375 aagttcaagatgttgcaagcattacta 35511349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 228
Target Start/End: Original strand, 35934013 - 35934205
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaag 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
35934013 catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaag 35934112  T
136 actatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactag 228  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
35934113 actatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactag 35934205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25501018 - 25500791
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | | |  ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||     
25501018 cactgtttgtacactgccatcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttt 25500919  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||| | |||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
25500918 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgta 25500819  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
25500818 agtctaagatgttgcaagcattactaga 25500791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39572901 - 39573121
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
39572901 ccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 39573000  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||        |||||||||| || |  |||||||||||| |||    
39573001 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactc--------tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgt 39573092  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
39573093 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 39573121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956227
Alignment:
41 gtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactat 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
141 cacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || |||||||||| || | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
13956315 catataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactaga 13956227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7693312 - 7693531
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
7693312 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgtt 7693411  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||    
7693412 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgt 7693502  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
7693503 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 7693531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 8437052 - 8437275
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||    
8437052 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaa 8437150  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    |    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
8437151 gttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagt 8437250  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
8437251 ccaagatgttgaaaacattactaga 8437275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 26268156 - 26268332
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
26268156 ccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgtt 26268255  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
26268256 ttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagat 26268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1429238 - 1429027
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
1429238 ccactgtttgtacactggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgtt 1429139  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
1429138 ttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 1429056  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
1429055 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 1429027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6824574 - 6824346
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagt--tcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
6824574 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttg 6824475  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||  | |  |||||| | ||| |    
6824474 ttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatgtc-aagataaaacaatacat 6824377  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||    
6824376 gtaagtctaagatgttgcaagcatcactaga 6824346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 32563231 - 32563450
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| | | | || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
32563231 ccactgtctgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 32563330  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | |||||||||||||||         |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| |||    
32563331 ttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgt 32563421  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||    
32563422 aagtctaagatgttgcaagaattactaga 32563450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9200315 - 9200534
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
9200315 ccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 9200414  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||   |||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |    
9200415 ttaagtgtaacattccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctat 9200505  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
9200506 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 9200534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2888472 - 2888310
Alignment:
67 gactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||    
2888472 gactacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgc 2888373  T
167 atgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
2888372 atgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactaga 2888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15724572 - 15724798
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||  |||||| ||    
15724572 ccactgtttatacaatgacatcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttatt 15724669  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||  ||||||  | ||||||||| || |||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
15724670 ttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgt 15724769  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
15724770 aagtccaaaatattgtaagcattactaga 15724798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 229
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42343031
Alignment:
39 tagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagact 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||            
42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacac-------- 42342941  T
139 atcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
42342942 -tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactaga 42343031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5112406 - 5112247
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
5112406 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgtt 5112307  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctg 161  Q
     |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
5112306 ttaagtgtaa-accccacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14409401 - 14409208
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||  |||      
14409401 catcaaaagttcagt-ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaactactc-- 14409305  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
                ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
14409304 ------------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 14409217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 22019718 - 22019933
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | | | | |||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
22019718 tgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaa 22019817  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||         |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
22019818 gtgtaacaccccacaaagtataacac---------tcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagt 22019908  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | || |||||| |||||||||||||    
22019909 ctaagatgttgtaagcattactaga 22019933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889680
Alignment:
133 aagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactaga 25889680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669886
Alignment:
70 tacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||    
25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
170 ttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
25669827 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactaga 25669886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28416620 - 28416490
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||   | || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||| ||    
28416620 ccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttatt 28416521  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacact 131  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||    
28416520 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 8466832 - 8467036
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||      
8466832 tttgtacagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaa- 8466930  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
                    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||| |||||| |    || |||||||| ||  |||||||||    
8466931 ----------------tgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgta-acgataaaatattatttgtaagtcc 8467013  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
8467014 aaaatgttgcaagcattactaga 8467036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Original strand, 11898151 - 11898199
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgttt 164  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
11898151 cacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactctgttt 11898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 25668731 - 25668804
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacac 74  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
25668731 ccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28416460 - 28416419
Alignment:
185 ataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
28416460 ataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattact 28416419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Original strand, 11898091 - 11898139
Alignment:
8 ttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatc 56  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
11898091 ttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42506178 - 42505950
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
42506178 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgct 42506079  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
42506078 ataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 42505979  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
42505978 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 42505950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 48355018 - 48355242
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
48355018 tgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataa 48355117  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
48355118 atgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagt 48355217  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
48355218 ccaagatgttgcaagtattactaga 48355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4761751 - 4761527
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
4761751 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtta 4761652  T
102 taagcgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    ||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4761651 taagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctat 4761552  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattac 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
4761551 aagtccaaaatgttgcaaacattac 4761527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26941363 - 26941135
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
26941363 ccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 26941264  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
26941263 ataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 26941164  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
26941163 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 26941135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46994754 - 46994536
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
46994754 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaa 46994655  T
111 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaa 210  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
46994654 cgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaga 46994555  T
211 tgttgcaagcattactaga 229  Q
    | |||||||||||||||||    
46994554 tattgcaagcattactaga 46994536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 34133008 - 34133236
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
34133008 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgtt 34133107  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
34133108 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 34133207  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
34133208 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 34133236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40552362 - 40552134
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
40552362 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgtt 40552263  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
40552262 ataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 40552163  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
40552162 aagtccatgatgttgcaagcattactaga 40552134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39282725 - 39282953
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
39282725 ccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 39282824  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
39282825 tcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgt 39282924  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
39282925 aaatccaaaatgttgcaagcattactaga 39282953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46297865 - 46297637
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | | | |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
46297865 ccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgtt 46297766  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
46297765 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgt 46297666  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
46297665 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 46297637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3655305 - 3655077
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
3655305 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 3655206  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    | |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  || | |    
3655205 agaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatat 3655106  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
3655105 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 3655077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24489065 - 24488837
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
24489065 ccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgtt 24488966  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||    
24488965 ttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagt 24488866  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
24488865 aagttcaagatgttgcaagcattactaga 24488837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52041021 - 52040797
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
52041021 tgtttgtatagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 52040922  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||    
52040921 gtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt 52040822  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
52040821 ccaagatgttgcaaacattactaga 52040797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21009905 - 21009677
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
21009905 ccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgtt 21009806  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
21009805 ctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 21009706  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
21009705 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 21009677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 47481595 - 47481823
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
47481595 ccactgtttgtagaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttatt 47481694  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||    
47481695 ctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgt 47481794  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
47481795 aagttcaagatgttgcaagcattactaga 47481823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2008006 - 2008233
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||    
2008006 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgtt 2008105  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
2008106 ttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgt 2008204  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
2008205 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 2008233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53229251 - 53229027
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||    
53229251 tgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaa 53229152  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
53229151 gtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagt 53229052  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
53229051 tcaagatgttgcaagcattactaga 53229027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 11466897 - 11467114
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
11466897 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 11466996  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||     
11466997 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgc 11467096  T
201 aagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||| || |||||||||    
11467097 aagtctaagatgttgcaa 11467114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698454
Alignment:
40 agtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagacta 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
140 tcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||| |||||   ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactaga 33698454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37203140 - 37203369
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
37203140 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatt 37203239  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat-aaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
     | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||||    
37203240 tttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctg 37203339  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||    
37203340 taagtccaatatatcgcaagcattactaga 37203369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54828793 - 54828576
Alignment:
12 acaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaac 111  Q
    |||| |||||||||| |||| |  |||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
54828793 acaacgacatcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaac 54828694  T
112 acctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaat 211  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||    
54828693 atcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagat 54828594  T
212 gttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||    
54828593 gttgcaagcattactaga 54828576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 22451042 - 22451269
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
22451042 cactgtttgtatggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttt 22451141  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
22451142 taagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgta 22451241  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
22451242 agtccaagatgttgcaagcattactaga 22451269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622593
Alignment:
42 tatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatc 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
142 acataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 22622593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24708212 - 24707990
Alignment:
9 tgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacactta--atctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  |||     
24708212 tgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagt 24708113  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||    
24708112 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtcc 24708013  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || | ||||||||||||| ||||    
24708012 aagaagttgcaagcattattaga 24707990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7327579 - 7327357
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||| ||   ||     
7327579 tttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagt 7327480  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||     
7327479 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtct 7327380  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||    
7327379 aagatgttgcaagcattactaga 7327357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 32373543 - 32373771
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |  |  || |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
32373543 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 32373642  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| |||    
32373643 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgt 32373742  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
32373743 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 32373771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33378882 - 33378660
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
33378882 tttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagt 33378783  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| |    
33378782 gtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttc 33378683  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
33378682 aagatgttgcaaacattactaga 33378660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 37157787 - 37158009
Alignment:
8 ttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcg 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |    
37157787 ttgtacagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtg 37157886  T
108 taacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat-aaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||    
37157887 taacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtcc 37157986  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || |||| |||||||||||||||    
37157987 aatatgtcgcaagcattactaga 37158009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 44891588 - 44891798
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||    
44891588 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccac 44891687  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
44891688 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaa 44891787  T
219 gcattactaga 229  Q
    |||||||||||    
44891788 gcattactaga 44891798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3362326 - 3362553
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacact--taatctaattttatcttaccttg 98  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
3362326 ccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaattcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctacctta 3362425  T
99 ttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||| |    
3362426 ttttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtactt 3362525  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
      |||||||| |||||||||||||||||    
3362526 agaagtccaatatgttgcaagcattact 3362553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 54505894 - 54506108
Alignment:
14 aatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacac 113  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
54505894 aatgacatcaaaaattcagc-ctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacac 54505992  T
114 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgt 213  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||    
54505993 tctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgt 54506092  T
214 tgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||    
54506093 tgcaagcattactaga 54506108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 4015535 - 4015760
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| || || | ||| |||||||||||| ||| ||||| |    
4015535 actgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgtttt 4015634  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||  |||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||    
4015635 aagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaa 4015733  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
4015734 gtccaagatgttgcaagcattactaga 4015760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 45174579 - 45174807
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
45174579 cactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgtt 45174678  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| | || ||||||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| | ||    
45174679 ttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggt 45174778  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
45174779 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 45174807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 43348331 - 43348556
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
43348331 ccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagt-cttttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 43348429  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||    
43348430 ttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgt 43348529  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||    
43348530 aagtttaagatgttgcaagcattacta 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11357467 - 11357256
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
11357467 ccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttatt 11357368  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
11357367 ttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgt 11357285  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
11357284 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 11357256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22446162 - 22445943
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattc-tcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
22446162 tttgtacagtggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaag 22446063  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
     ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
22446062 tgtaacac-tcacaatgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtc 22445964  T
206 caaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||||||||| ||||||    
22445963 caaaatgttgcaagtattact 22445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21193679 - 21193906
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
21193679 ccactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 21193778  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
     |||| |||||||  || ||||  |||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |    
21193779 ttaagtgtaacactccataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccg 21193878  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
21193879 taagttcaagatgttgcaaccattacta 21193906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 25579822 - 25580040
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||||  | || |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||    
25579822 tacagtgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaa 25579921  T
111 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||| ||| || || |    
25579922 caccccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaaga 25580021  T
211 tgttgcaagcattactaga 229  Q
    | |||||||||||||||||    
25580022 tattgcaagcattactaga 25580040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 51213084 - 51212955
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
51213084 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgtt 51212985  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacac 130  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||    
51212984 ataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 38591778 - 38591994
Alignment:
8 ttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |    
38591778 ttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtg 38591877  T
108 taacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcca 207  Q
    ||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  | || |||||| ||||  ||||| ||||    
38591878 taataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatcca 38591977  T
208 aaatgttgcaagcatta 224  Q
    | |||||||||||||||    
38591978 agatgttgcaagcatta 38591994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43975991 - 43975767
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
43975991 ccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgtt 43975892  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaact---ctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacc 197  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||       |||||| ||||||||||| ||||    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||     
43975891 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaac-------actatcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtact 43975799  T
198 tgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||    
43975798 tgtaagtccaagattttgcaagcattactaga 43975767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29099428 - 29099647
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | | | |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| | |||| ||    
29099428 ccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttatt 29099527  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| |||||||||||         ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |    
29099528 ttaagtgtaacaccccacaaagtgta---------actttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtaccttt 29099618  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
29099619 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 29099647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164110
Alignment:
22 caaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaa 121  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
122 gtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagca 221  Q
    |||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
29164012 gtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagca 29164102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212646
Alignment:
132 taagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 51212646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Original strand, 1089819 - 1089994
Alignment:
54 atcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaaca-cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatca 152  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1089819 atcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatca 1089918  T
153 taaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
      |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||    
1089919 acaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactaga 1089994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 35844400 - 35844575
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaa-ttttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
35844400 cactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagtt 35844499  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
35844500 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagat 35844575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012440
Alignment:
35 ctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacactta 133  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||    
36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
134 agactatcacataatatcataaactct-gtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactaga 36012440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 53176127 - 53176278
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||  ||    
53176127 ccactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcatt 53176226  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatca 152  Q
     |||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
53176227 ttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 53176278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373140
Alignment:
85 tttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
185 ataaaatagtacctgtaagtccaa 208  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
20373163 ataaaatagtacatataagtccaa 20373140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27480478 - 27480252
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
27480478 tgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaa 27480379  T
105 gcgtaacacc--------tcaca-----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaac----tctgtttgcatgttaaagattccgacaata 187  Q
    | ||||||||        | |||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    | |||||||||||||||||| || || |||    
27480378 gtgtaacacccagaagtgtaacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgata 27480279  T
188 aaatagtacctgtaagtccaaaatgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
27480278 aaatagtacatgtaagtccaaaatgtt 27480252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20373399 - 20373300
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
20373399 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14586735 - 14586555
Alignment:
39 tagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagact 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||            
14586735 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac-------- 14586644  T
139 atcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
     ||  || ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
14586643 -tcgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta-cggtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 14586555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44186601 - 44186392
Alignment:
4 ctgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttata 103  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
44186601 ctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttta 44186502  T
104 agcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    |  |||||||| ||||                |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||    
44186501 aatgtaacaccccaca----------------actatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaag 44186418  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
44186417 tctaagatgttgcaagcattactaga 44186392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11835695 - 11835562
Alignment:
37 catagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaat-tttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaag 135  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| |||||    
11835695 catagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaag 11835596  T
136 actatcacataatatcataaactctgtttgcatg 169  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
11835595 actatcacatgatatcatcaactctatttgcatg 11835562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 40936165 - 40936274
Alignment:
120 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
40936165 aagtgtaacacttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaag 40936264  T
220 cattactaga 229  Q
    ||||||||||    
40936265 cattactaga 40936274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11357138 - 11357030
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
11357138 cacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttg 11357039  T
216 caagcatta 224  Q
    |||||||||    
11357038 caagcatta 11357030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 40936068 - 40936153
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatc 90  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
40936068 tgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatc 40936153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475112
Alignment:
138 tatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 50475112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811609
Alignment:
133 aagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| || || |||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctaga 53811609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7969 - 8197
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |    
7969 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgct 8068  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
8069 ataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 8168  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
8169 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 8197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19289440 - 19289216
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
19289440 tgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataa 19289341  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
      |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19289340 atgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagt 19289241  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
19289240 ccaagatattgcaagcattactaga 19289216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43648365 - 43648138
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
43648365 cactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtta 43648266  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||| || ||||    
43648265 taagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgta 43648166  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||    
43648165 agtccaagatgtcgcaaacattactaga 43648138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 3177023 - 3177249
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3177023 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgtttt 3177122  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||    
3177123 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaa 3177222  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| || || ||||||||||||||    
3177223 gtccaagatattacaagcattactaga 3177249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33551107 - 33550880
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
33551107 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgtt 33551008  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||     
33551007 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttga 33550909  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
33550908 aagtccaatatgttgcaagcattactaga 33550880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 37905790 - 37906017
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
37905790 ccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 37905889  T
101 ataagcgtaaca--cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 198  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |    
37905890 ataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacat 37905989  T
199 gtaagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
37905990 gtaagtccaagatgttgcaagaattact 37906017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17071852 - 17071646
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
17071852 tttgtacaatgacatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagc 17071753  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
17071752 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatcc 17071653  T
207 aaaatgt 213  Q
    || ||||    
17071652 aagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4763713 - 4763940
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
4763713 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtt 4763812  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
4763813 tcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgt 4763912  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactag 228  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
4763913 aagtccaagatattgcaagcattactag 4763940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11366501 - 11366274
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||     
11366501 cactatttgtataatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttc 11366402  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
11366401 taaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgta 11366302  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
11366301 agtccaagatgttgcaagcattactaga 11366274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961150
Alignment:
18 acatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctca 117  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||    
41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
118 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgca 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgca 41961138  T
218 agcattactaga 229  Q
    ||||||||||||    
41961139 agcattactaga 41961150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 45327817 - 45328025
Alignment:
16 tgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacct 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
45327817 tgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 45327916  T
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
45327917 cagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 45328016  T
216 caagcatta 224  Q
    |||||||||    
45328017 caagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 44913748 - 44913974
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttata 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
44913748 tgtttgtaaaatgacataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgtttta 44913847  T
104 agcgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
44913848 agtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 44913947  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||    
44913948 gtccaagatgttgcaagcattattaga 44913974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2325487 - 2325271
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
2325487 tgtttgtacactggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaa 2325396  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |    
2325395 gcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaat 2325296  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
2325295 ccaagatgttgcaagcattactaga 2325271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 229
Target Start/End: Original strand, 31861971 - 31862162
Alignment:
38 atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagac 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
31861971 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaat 31862070  T
138 tatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||||||||    
31862071 tatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactaga 31862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17054213 - 17054005
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||    
17054213 tgtttgtacaatgacatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaa 17054114  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
17054113 gcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaat 17054014  T
205 ccaaaatgt 213  Q
    |||| ||||    
17054013 ccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 4167004 - 4167229
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
4167004 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgtt 4167103  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||  |||    
4167104 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 4167203  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
4167204 aagtccaagatgttgcaagcattact 4167229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4264198 - 4263969
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
4264198 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 4264099  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatc-acataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
     ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |     
4264098 ttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacata 4263999  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
4263998 taagttcaagatgttgcaagcattactaga 4263969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 36642069 - 36642293
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt--atcttaccttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
36642069 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgt 36642168  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |    
36642169 tttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgg 36642268  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcatta 224  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
36642269 taagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29242259 - 29242052
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
29242259 ccactgtttgtacagtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 29242160  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
29242159 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgt 29242060  T
201 aagtccaa 208  Q
    ||||||||    
29242059 aagtccaa 29242052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31570840 - 31570627
Alignment:
16 tgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacct 115  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||     
31570840 tgacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccc 31570741  T
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  || ||||||    
31570740 cacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttg 31570641  T
216 caagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||    
31570640 caagcattgctaga 31570627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33709353 - 33709125
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
33709353 ccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgtt 33709254  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||    
33709253 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgt 33709154  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
33709153 aaatccaagatgttgcaagcattactaga 33709125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39167483 - 39167262
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||     
39167483 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttt 39167384  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||| ||||    
39167383 taagtgtaacatcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgta 39167290  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||    
39167289 agtccaaattgttgctagcattactaga 39167262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18494385 - 18494174
Alignment:
17 gacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctc 116  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||    
18494385 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctc 18494287  T
117 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgc 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
18494286 acaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgt 18494187  T
217 aagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||    
18494186 aagcattactaga 18494174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26357659 - 26357887
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
26357659 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtt 26357758  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
      ||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || || |||||||||||  | |    
26357759 tcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtattttt 26357858  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
26357859 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 26357887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 4478455 - 4478675
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgttata 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
4478455 tgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgtttta 4478554  T
104 agcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    || |||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| | |||||    
4478555 agtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaag 4478649  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
4478650 tccaagatgttgcaagcattactaga 4478675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 44286032 - 44286253
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| | | | ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||     
44286032 cactgtttgtatagtggcatcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttt 44286131  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||    
44286132 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgta 44286231  T
202 agtccaaaatgttgcaagcatt 223  Q
    |||| || ||||||||||||||    
44286232 agtctaagatgttgcaagcatt 44286253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27350058 - 27349841
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||     
27350058 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttt 27349960  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
27349959 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgta 27349869  T
202 agtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
27349868 agtctaagatgttgcaagcattactaga 27349841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Original strand, 41465602 - 41465809
Alignment:
20 atcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcaca 119  Q
    |||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |    
41465602 atcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcaga 41465701  T
120 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
41465702 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaa 41465801  T
220 cattacta 227  Q
    ||||||||    
41465802 cattacta 41465809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19424731 - 19424573
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
19424731 catcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 19424632  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
19424631 aaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat 19424573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959202
Alignment:
45 catcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcaca 144  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcaca 35959121  T
145 taatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||||||||    
35959122 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac----atgtccaagatgttgcaagcattactaga 35959202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 33902148 - 33902319
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
33902148 ccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgtt 33902247  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgtta 172  Q
     |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
33902248 ttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41463970 - 41463795
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||  ||||| |||||||||| ||| |||||     
41463970 cactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttt 41463871  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
41463870 taattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagat 41463795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43770960 - 43770741
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| | | | || ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| | |||||||    
43770960 ccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgtt 43770861  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
43770860 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatcttt 43770770  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
43770769 aagttcaagatgttgcaagcattactaga 43770741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33660487 - 33660270
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
33660487 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt 33660388  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||          ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||    
33660387 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------ccacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 33660297  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||    
33660296 gtctgagatgttgcaagcattactaga 33660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5881621 - 5881839
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | | | | |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
5881621 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatcataccttgtt 5881719  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||         |||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||    
5881720 ttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgt 5881810  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
5881811 aagtctaagatgttgcaagcattactaga 5881839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7007042 - 7006831
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
7007042 ccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgtt 7006943  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||                 |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||    
7006942 ttaag-----------------tgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgt 7006860  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
7006859 aagtccaagatgttgcaagcattactaga 7006831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13711546 - 13711769
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |     |||    
13711546 ccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcat-----gtt 13711640  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
13711641 ttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgt 13711740  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||    
13711741 aagtctaagatgttgcaaacaatactaga 13711769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 19313944 - 19314157
Alignment:
11 tacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||    
19313944 tacagtgacatcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 19314042  T
111 cacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg---taagtcca 207  Q
    |||| |||||||||||||       |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  |  | |||||||||||| ||   |||||| |    
19314043 caccccacaaagtgtaac-------actatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtcta 19314135  T
208 aaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    | ||||||||||||||||||||    
19314136 agatgttgcaagcattactaga 19314157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258204
Alignment:
60 ttaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactc 159  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
160 tgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    | |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||    
18258249 tctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtc 18258204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19500921 - 19500808
Alignment:
116 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
19500921 cacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttg 19500822  T
216 caagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||    
19500821 caagcattactaga 19500808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41051308 - 41051263
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaac 64  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
41051308 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19501823 - 19501773
Alignment:
38 atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttat 89  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
19501823 atagtatcatcaattcatcagattaaca-aactacatttaatctaattttat 19501773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41051237 - 41051193
Alignment:
185 ataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
41051237 ataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctaga 41051193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 408526 - 408304
Alignment:
6 gtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
408526 gtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataag 408428  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtc 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
408427 cgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 408328  T
206 caaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
408327 caagatgttgcaagcattactaga 408304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 216 - 438
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| || ||| ||    
216 ccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttatt 315  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||        
316 ttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac---- 411  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||    
412 --gtccaagatgttgcaagcattactaga 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 94486 - 94334
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||   | | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
94486 ccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtt 94387  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 153  Q
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
94386 tcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcat 94334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 94044 - 93975
Alignment:
160 tgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
94044 tgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 93975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3880039 - 3879813
Alignment:
3 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||| |    
3880039 actgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgtttt 3879940  T
103 aagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 202  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||    
3879939 aaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaa 3879840  T
203 gtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
3879839 gtccaagatgttgcaagcattactaga 3879813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6091281 - 6091056
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
6091281 tgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaa 6091182  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaag 203  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
6091181 gcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaag 6091082  T
204 tccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
6091081 tccaagatgttgcaagcattactaga 6091056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 1945916 - 1946144
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
1945916 ccactgtttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 1946015  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
1946016 ctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 1946115  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
1946116 aagtccaagatgttacaagcattattaga 1946144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5627473 - 5627700
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
5627473 ccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 5627572  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
5627573 ctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgt 5627672  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactag 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
5627673 aagtccaagatgttgcaagcattactag 5627700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7235136 - 7234909
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
7235136 ccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagt-ctcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgtt 7235038  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||    
7235037 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 7234938  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
7234937 aagtccaagatgttgcaaacattactaga 7234909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4318925 - 4318696
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
4318925 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgt 4318826  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||  | || || |||||||||  |    
4318825 tttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacggg 4318726  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||    
4318725 aaagtccaagatgttgcaagcattactaga 4318696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21017208 - 21016992
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||| || || ||||     
21017208 tttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagt 21017109  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||      |||     
21017108 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtct 21017015  T
207 aaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||    
21017014 aagatgttgcaagcattactaga 21016992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 8513315 - 8513538
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
8513315 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgt 8513414  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||| |    
8513415 tttaa------caccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccgg 8513508  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
8513509 taagtccaaaatcttgcaagcattactaga 8513538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7055316 - 7055141
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
7055316 cactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc 7055217  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
7055216 taagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagat 7055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29182245 - 29182474
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| | ||    
29182245 ccactgtttatacagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatatt 29182344  T
101 ataagcgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
     |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||    
29182345 ttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttg 29182444  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||    
29182445 taagtctaagatgttgcaagtattactaga 29182474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 20768184 - 20768392
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||     
20768184 catcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccat 20768281  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
20768282 aaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaa 20768381  T
219 gcattactaga 229  Q
    |||||||||||    
20768382 gcattactaga 20768392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30353459 - 30353256
Alignment:
2 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtta 101  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||||| |   |||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||     
30353459 cactgtttgtacagtggcatcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttt 30353360  T
102 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 201  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||    
30353359 taagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgta 30353260  T
202 agtc 205  Q
    ||||    
30353259 agtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33893104 - 33892888
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
33893104 ccactatttgtacaatgatattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 33893006  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgt 200  Q
     || |  ||||||| |||||||||||||||         |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
33893005 ttatgtataacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgt 33892915  T
201 aagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
33892914 aagtccaagatgttgcaaacattacta 33892888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6088990 - 6089211
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaatttt-atcttaccttgt 99  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||| ||| ||||||||    
6088990 ccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgt 6089089  T
100 tataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctg 199  Q
    | |||      |||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |    
6089090 tttaa------cactctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccag 6089183  T
200 taagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
6089184 taagtccaaaatgttgcaagcattacta 6089211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 15491697 - 15491873
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgtt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
15491697 ccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttatt 15491796  T
101 ataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagat 177  Q
     |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||    
15491797 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaaagat 15491873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 33618934 - 33619140
Alignment:
19 catcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcac 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||        || |||||||| |      
33618934 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaacacc-cta 33619024  T
119 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcat-----gttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgt 213  Q
     |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||     ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
33619025 gaagtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgt 33619124  T
214 tgcaagcattactaga 229  Q
    ||||||||||||||||    
33619125 tgcaagcattactaga 33619140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054649
Alignment:
172 aaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattacta 7054649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 18498516 - 18498565
Alignment:
1 ccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaa 50  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
18498516 ccacagtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 146113 - 145893
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
146113 tttgtagaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagc 146014  T
107 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcc 206  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||    
146013 ataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtcc 145914  T
207 aaaatgttgcaagcattacta 227  Q
    || ||||||||||||||||||    
145913 aagatgttgcaagcattacta 145893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 44043 - 44263
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
44043 tgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataa 44142  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
44143 gcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagt 44241  T
205 ccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
44242 ccaagttgttgcaagcattact 44263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 154744 - 154524
Alignment:
5 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataa 104  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
154744 tgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataa 154645  T
105 gcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
154644 gcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagt 154546  T
205 ccaaaatgttgcaagcattact 226  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
154545 ccaagttgttgcaagcattact 154524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 12010 - 12219
Alignment:
20 atcaaaagttcaattctcatagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacacctcaca 119  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||    
12010 atcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccaca 12109  T
120 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaag 219  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
12110 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 12209  T
220 cattactaga 229  Q
    ||||||||||    
12210 cattactaga 12219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 267372 - 267595
Alignment:
7 tttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-atagtatcatcaactcatcagattaacacgactacacttaatctaattttatcttaccttgttataag 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
267372 tttgtacagtgtcatcaaaagttcagt-ctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaa 267470  T
106 cgtaacacctcacaaagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagt 204  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
267471 tgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagt 267570  T
205 ccaaaatgttgcaagcattactaga 229  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||    
267571 ccaagatgctgcaagaattactaga 267595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 100948 - 100988
Alignment:
140 tcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattcc 180  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattcc 100988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University