View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9348_low_2 (Length: 738)

Name: NF9348_low_2
Description: NF9348
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9348_low_2
NF9348_low_2
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (18-531)||(11839706-11840235)
chr3 (20-531)||(10244317-10244844)
chr3 (18-531)||(10238193-10238722)
chr3 (20-531)||(42191203-42191730)
chr3 (20-531)||(42197145-42197672)
chr3 (19-531)||(17055774-17056301)
chr3 (20-531)||(49151262-49151788)
chr3 (20-531)||(49157329-49157855)
chr3 (20-531)||(10760633-10761160)
chr3 (23-533)||(55003398-55003913)
chr3 (18-531)||(38449046-38449573)
chr3 (20-531)||(38455535-38456060)
chr3 (19-531)||(8331437-8331964)
chr3 (20-531)||(30051085-30051610)
chr3 (201-531)||(10769133-10769479)
chr3 (20-311)||(11846046-11846340)
chr3 (257-531)||(26429639-26429927)
chr3 (20-436)||(48128030-48128451)
chr3 (20-531)||(28964530-28965042)
chr3 (20-399)||(13444840-13445227)
chr3 (24-236)||(17593268-17593481)
chr3 (20-204)||(10766854-10767038)
chr3 (26-359)||(53069043-53069373)
chr3 (30-520)||(46656341-46656850)
chr3 (386-533)||(17601897-17602045)
chr3 (84-208)||(34300485-34300609)
chr3 (243-334)||(13837534-13837625)
chr3 (643-721)||(49439221-49439299)
chr3 (381-533)||(11846335-11846489)
chr3 (385-531)||(23138779-23138926)
chr3 (20-120)||(24643534-24643635)
chr3 (86-359)||(12108716-12108990)
chr3 (411-533)||(53071640-53071763)
chr3 (424-533)||(24643890-24644002)
chr3 (311-419)||(13367114-13367233)
chr3 (255-336)||(34300348-34300429)
chr3 (268-458)||(2982458-2982659)
chr3 (255-297)||(24643773-24643815)
chr3 (359-419)||(9760481-9760543)
chr3 (425-531)||(34300088-34300197)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (20-531)||(28420942-28421468)
chr7 (20-531)||(3817294-3817820)
chr7 (19-531)||(3811151-3811678)
chr7 (20-531)||(351437-351962)
chr7 (20-531)||(339031-339547)
chr7 (20-533)||(5979156-5979688)
chr7 (20-359)||(20238785-20239127)
chr7 (20-531)||(35147986-35148518)
chr7 (19-533)||(5849178-5849703)
chr7 (35-450)||(43539711-43540146)
chr7 (20-533)||(22741901-22742441)
chr7 (20-243)||(42767277-42767501)
chr7 (155-355)||(15843785-15843988)
chr7 (155-355)||(15860894-15861097)
chr7 (20-300)||(12803893-12804176)
chr7 (294-531)||(26383319-26383569)
chr7 (48-219)||(26383603-26383774)
chr7 (62-229)||(30219271-30219438)
chr7 (255-360)||(35150761-35150866)
chr7 (360-531)||(35152864-35153038)
chr7 (25-343)||(26380935-26381239)
chr7 (166-330)||(7608306-7608475)
chr7 (370-458)||(42767547-42767636)
chr7 (265-494)||(18656883-18657120)
chr7 (254-343)||(3677876-3677965)
chr7 (88-164)||(18666547-18666622)
chr7 (450-531)||(26380758-26380838)
chr7 (484-532)||(43539644-43539693)
chr7 (360-448)||(7608163-7608251)
chr7 (411-450)||(24690652-24690691)
chr7 (494-533)||(30219547-30219586)
chr7 (386-531)||(8824461-8824595)
chr7 (255-288)||(24690848-24690881)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (19-531)||(12686161-12686688)
chr5 (20-531)||(12692264-12692790)
chr5 (19-531)||(28525368-28525895)
chr5 (20-531)||(28531465-28531991)
chr5 (20-531)||(41296929-41297453)
chr5 (20-531)||(7389531-7390057)
chr5 (180-531)||(32097165-32097531)
chr5 (180-531)||(32094364-32094731)
chr5 (20-531)||(19059747-19060283)
chr5 (20-531)||(30384359-30384893)
chr5 (20-528)||(30771933-30772460)
chr5 (21-517)||(19066091-19066603)
chr5 (103-531)||(20499788-20500231)
chr5 (29-194)||(24054336-24054502)
chr5 (20-218)||(32094142-32094340)
chr5 (224-445)||(14609909-14610141)
chr5 (20-215)||(32096943-32097138)
chr5 (19-172)||(16215156-16215309)
chr5 (26-161)||(14610184-14610321)
chr5 (30-348)||(26509696-26510013)
chr5 (27-167)||(26316782-26316922)
chr5 (98-165)||(28542269-28542336)
chr5 (26-80)||(8706454-8706508)
chr5 (25-162)||(37896286-37896423)
chr5 (147-288)||(8706532-8706672)
chr5 (267-358)||(26318492-26318582)
chr5 (427-533)||(14609779-14609888)
chr5 (463-532)||(22647928-22647998)
chr5 (276-351)||(33753476-33753551)
chr5 (494-531)||(25408437-25408474)
chr5 (389-495)||(26509539-26509643)
chr5 (276-351)||(33849110-33849185)
chr5 (84-220)||(33848933-33849070)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (19-531)||(32896662-32897190)
chr8 (20-531)||(32890538-32891065)
chr8 (20-531)||(36818622-36819147)
chr8 (16-533)||(5542139-5542673)
chr8 (18-533)||(9934931-9935457)
chr8 (23-533)||(42992989-42993511)
chr8 (20-533)||(14417609-14418114)
chr8 (20-531)||(10705488-10706020)
chr8 (98-533)||(10699677-10700127)
chr8 (27-531)||(22219706-22220237)
chr8 (20-531)||(39735531-39736048)
chr8 (20-531)||(39727300-39727794)
chr8 (20-227)||(7771202-7771408)
chr8 (255-531)||(42033447-42033740)
chr8 (19-186)||(14799398-14799564)
chr8 (20-221)||(1882734-1882939)
chr8 (255-359)||(1883039-1883143)
chr8 (340-531)||(1883158-1883347)
chr8 (20-128)||(24250171-24250278)
chr8 (385-531)||(17954156-17954305)
chr8 (25-105)||(1171414-1171493)
chr8 (47-119)||(31399047-31399119)
chr8 (127-339)||(1171215-1171414)
chr8 (20-96)||(42033856-42033930)
chr8 (20-76)||(39689782-39689838)
chr8 (466-523)||(30890535-30890593)
chr8 (45-117)||(31379430-31379502)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (20-531)||(12045-12572)
scaffold0208 (20-533)||(6170-6699)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (20-531)||(13455749-13456276)
chr2 (20-531)||(13461690-13462217)
chr2 (20-531)||(36750064-36750591)
chr2 (20-533)||(28682928-28683456)
chr2 (25-531)||(35090637-35091162)
chr2 (26-531)||(35084665-35085189)
chr2 (20-531)||(44716787-44717315)
chr2 (20-531)||(30964977-30965505)
chr2 (20-531)||(31002026-31002554)
chr2 (19-531)||(31008004-31008533)
chr2 (25-531)||(13149674-13150199)
chr2 (20-458)||(11048536-11048988)
chr2 (20-531)||(23343213-23343737)
chr2 (19-344)||(35438692-35439014)
chr2 (257-531)||(19879244-19879536)
chr2 (360-533)||(35439706-35439882)
chr2 (385-531)||(35442195-35442342)
chr2 (20-219)||(29833188-29833384)
chr2 (360-531)||(7771522-7771696)
chr2 (256-318)||(29034697-29034759)
chr2 (20-108)||(1388003-1388090)
chr2 (360-447)||(23284680-23284769)
chr2 (255-317)||(29833079-29833142)
chr2 (382-458)||(31651357-31651431)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (20-531)||(50305847-50306365)
chr1 (20-531)||(25381518-25382045)
chr1 (20-532)||(25387487-25388013)
chr1 (19-531)||(34739636-34740163)
chr1 (20-531)||(31057694-31058220)
chr1 (27-531)||(31051194-31051718)
chr1 (65-533)||(8092874-8093357)
chr1 (19-531)||(44409650-44410187)
chr1 (232-531)||(1077894-1078209)
chr1 (20-458)||(24926738-24927193)
chr1 (15-533)||(27954809-27955341)
chr1 (34-532)||(38151973-38152468)
chr1 (20-192)||(1078228-1078400)
chr1 (20-531)||(24963685-24964214)
chr1 (397-531)||(25275421-25275556)
chr1 (20-194)||(12183562-12183740)
chr1 (386-480)||(12183975-12184072)
chr1 (484-533)||(33458371-33458421)
chr1 (412-494)||(23253826-23253907)
chr1 (270-343)||(33458145-33458218)
chr1 (484-531)||(4280191-4280239)
chr1 (262-313)||(12183816-12183867)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (20-531)||(4580304-4580831)
chr6 (20-531)||(8650786-8651313)
chr6 (20-531)||(25353863-25354388)
chr6 (20-533)||(21190849-21191382)
chr6 (62-531)||(25343277-25343758)
chr6 (19-531)||(31756195-31756728)
chr6 (20-533)||(21197004-21197553)
chr6 (18-239)||(32035267-32035488)
chr6 (26-531)||(21770546-21771074)
chr6 (20-225)||(21782736-21782941)
chr6 (65-531)||(21783337-21783835)
chr6 (20-177)||(8662764-8662921)
chr6 (65-458)||(21789560-21789982)
chr6 (25-436)||(17581384-17581797)
chr6 (20-215)||(18778564-18778760)
chr6 (272-533)||(30905819-30906092)
chr6 (44-164)||(34603338-34603457)
chr6 (44-164)||(34724615-34724734)
chr6 (20-177)||(6098000-6098158)
chr6 (382-531)||(12801899-12802048)
chr6 (274-419)||(28728047-28728202)
chr6 (21-111)||(6102708-6102803)
chr6 (72-181)||(17900174-17900282)
chr6 (254-357)||(20745394-20745497)
chr6 (428-532)||(6096959-6097067)
chr6 (432-531)||(17581254-17581356)
chr6 (116-177)||(1106232-1106294)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (20-531)||(24287637-24288161)
chr4 (20-531)||(10739322-10739846)
chr4 (20-531)||(10953091-10953615)
chr4 (20-531)||(6257188-6257714)
chr4 (20-531)||(48166828-48167351)
chr4 (20-531)||(48160609-48161132)
chr4 (20-418)||(33458249-33458662)
chr4 (20-296)||(10733229-10733507)
chr4 (20-296)||(10946998-10947276)
chr4 (60-418)||(33461416-33461787)
chr4 (189-531)||(10733504-10733859)
chr4 (189-531)||(10947273-10947628)
chr4 (20-531)||(50168245-50168769)
chr4 (255-531)||(26957023-26957313)
chr4 (20-531)||(49976251-49976763)
chr4 (83-458)||(44831658-44832048)
chr4 (20-216)||(26963324-26963518)
chr4 (304-531)||(26971824-26972064)
chr4 (50-339)||(19686341-19686625)
chr4 (19-137)||(26956811-26956929)
chr4 (105-359)||(4632216-4632482)
chr4 (53-177)||(3769587-3769710)
chr4 (20-111)||(4632872-4632963)
chr4 (37-458)||(50155687-50156104)
chr4 (25-119)||(34308060-34308153)
chr4 (225-455)||(35177523-35177770)
chr4 (74-208)||(50427356-50427497)
chr4 (25-120)||(55473133-55473225)
chr4 (57-157)||(9237402-9237502)
chr4 (254-354)||(33045085-33045185)
chr4 (257-330)||(17627002-17627075)
chr4 (386-480)||(28704234-28704328)
chr4 (254-332)||(32284542-32284620)
chr4 (255-330)||(3769434-3769509)
chr4 (379-482)||(9237084-9237185)
chr4 (83-220)||(31986703-31986833)
chr4 (484-533)||(50426895-50426945)
chr4 (387-531)||(17627139-17627284)
chr4 (428-533)||(4632023-4632128)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-530)||(172873-173398)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (20-531)||(1176-1697)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (20-533)||(605-1110)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (20-264)||(5465-5711)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (20-328)||(950-1261)
scaffold1114 (360-533)||(711-887)
[»] scaffold0185 (3 HSPs)
scaffold0185 (360-533)||(5615-5792)
scaffold0185 (62-175)||(5945-6057)
scaffold0185 (250-313)||(5826-5889)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (24-533)||(38076-38600)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (360-531)||(13923-14097)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 531
Target Start/End: Original strand, 11839706 - 11840235
Alignment:
Q  18 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11839706 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcatgatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 11839805  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11839806 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacg 11839905  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839906 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 11840005  T
Q  316 gatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11840006 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgg 11840105  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||    
T  11840106 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcac 11840205  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840206 taatcaattaaggctcacaattgataaata 11840235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 10244317 - 10244844
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10244317 tgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 10244416  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10244417 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgat 10244516  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10244517 aaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcaga 10244616  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10244617 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 10244716  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||    
T  10244717 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacacta 10244816  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244817 atcaattaaggctcacaattgataaata 10244844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 531
Target Start/End: Original strand, 10238193 - 10238722
Alignment:
Q  18 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10238193 tctgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 10238292  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10238293 gatcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacg 10238392  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10238393 ataaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttca 10238492  T
Q  316 gatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10238493 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgg 10238592  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||    
T  10238593 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacac 10238692  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238693 taatcaattaaggctcacaattgataaata 10238722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 42191203 - 42191730
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42191203 tgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatga 42191302  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42191303 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat 42191402  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191403 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 42191502  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42191503 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 42191602  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  42191603 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 42191702  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191703 atcaattaaggctcacaattgataaata 42191730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 42197145 - 42197672
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42197145 tgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatga 42197244  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42197245 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat 42197344  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197345 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 42197444  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42197445 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 42197544  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  42197545 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 42197644  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197645 atcaattaaggctcacaattgataaata 42197672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Original strand, 17055774 - 17056301
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17055774 ctgttcgaaatttaggtcttaataaaaaacagttttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 17055873  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  17055874 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacg 17055973  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
     |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055974 gtaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 17056073  T
Q  316 gatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  17056074 gatggggagaagagagagtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagggtttcccattattccgttaatagg 17056173  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  17056174 -catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 17056272  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056273 aatcaattaaggctcacaattgataaata 17056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49151788 - 49151262
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49151788 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 49151689  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49151688 tcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 49151589  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49151588 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcaga 49151489  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49151488 tggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 49151389  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||| ||||| |    
T  49151388 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-cagccttattacttaatttgatca 49151293  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49151292 ctaatcaactaaggcccacaattgataaata 49151262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49157855 - 49157329
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49157855 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 49157756  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49157755 tcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 49157656  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49157655 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcaga 49157556  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49157555 tggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 49157456  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||| ||||| |    
T  49157455 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-cagccttattacttaatttgatca 49157360  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49157359 ctaatcaactaaggcccacaattgataaata 49157329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 10760633 - 10761160
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10760633 tgttggaaatttaggtcttattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10760732  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10760733 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10760832  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760833 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 10760932  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||          |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10760933 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatgggc 10761032  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  10761033 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 10761128  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10761129 actaatcaactaaggctcacaattgataaata 10761160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Original strand, 55003398 - 55003913
Alignment:
Q  23 tggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcg 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  55003398 tggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcg 55003497  T
Q  123 aatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataac 222  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  55003498 gatctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgataac 55003597  T
Q  223 caaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 320  Q
    ||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003598 caaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttgg---ttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 55003694  T
Q  321 ggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccg 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| |     | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55003695 ggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatgac-----gtttcccattattccgttaatgggtcatccg 55003789  T
Q  411 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaat 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  55003790 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaataaat 55003889  T
Q  510 taaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  55003890 taaggctctaaattgataaataac 55003913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 18 - 531
Target Start/End: Original strand, 38449046 - 38449573
Alignment:
Q  18 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38449046 tctgttggaaatttcggtcttaatataaa--gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 38449143  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38449144 gatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacg 38449243  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449244 ataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 38449343  T
Q  316 gatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38449344 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgg 38449443  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttga 497  Q
    | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  38449444 gtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttga 38449539  T
Q  498 taactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38449540 tcactaatcaactaagactcacaattgataaata 38449573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 38455535 - 38456060
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38455535 tgttggaaatttcggtcttaatataaa--gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 38455632  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38455633 tcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgat 38455732  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455733 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 38455832  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  38455833 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggt 38455932  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  38455933 catccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 38456028  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  38456029 actaatcaactaacactcacaattgataaata 38456060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8331964 - 8331437
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8331964 ctgttggaaatttagctcttaatataaatagattttataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 8331865  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8331864 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacga 8331765  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatct--gacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331764 taaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 8331665  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  8331664 atggggagaagagagagtttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggt 8331565  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| || ||||||||| | ||  | |||||||||| |||||     
T  8331564 catccggacatccactca--ttaagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctta-tatccttattacttaatttgatc 8331469  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  8331468 actaatcaactaaggtccacaattgataaata 8331437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 30051085 - 30051610
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30051085 tgttgaaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataa 30051184  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| ||||| ||    
T  30051185 tcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctctaatcgacaacaat 30051284  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051285 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 30051384  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggcca 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30051385 tgggcagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggcca 30051484  T
Q  407 tccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||    |||||||||| ||||| ||    
T  30051485 tccggacatccactc--gttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tatctttattacttaatttgatcac 30051580  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30051581 taatcaactaaggctcacaattgataaata 30051610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 201 - 531
Target Start/End: Original strand, 10769133 - 10769479
Alignment:
Q  201 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaca--cacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10769133 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10769232  T
Q  299 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10769233 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10769332  T
Q  386 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagt 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||     
T  10769333 cattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 10769428  T
Q  482 cctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10769429 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 10769479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 11846046 - 11846340
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11846046 tgttggaaatttaggtcttaattaaaacagattttataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 11846145  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||    
T  11846146 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 11846245  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctga-tttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11846246 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaacctttatgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 257 - 531
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429927
Alignment:
Q  257 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattgg 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  356 ggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 443  Q
    ||||          |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26429739 ggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagcccatatcaactaa 26429838  T
Q  444 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429839 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 26429927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 48128030 - 48128451
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  48128030 tgttggaaatttaggtctcaataaaaacagatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatga 48128129  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggta-ttaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||     
T  48128130 tcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtattttggaatacct-gataaaactttcatggca--gctctca-caacaacgg 48128225  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |    ||| | | ||| |||||||  ||| |||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48128226 t----aaaaaaatgaggtgatctggaacaaacaacaatgttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcag 48128321  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||     
T  48128322 acagggagaagagaatgtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggt 48128421  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatat 436  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48128422 catccggacatccactca--ttgagtccatat 48128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 28965042 - 28964530
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28965042 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaat---gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28964946  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgga-taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |  |||||||||| ||||| | ||||||| | || |  |||||||  | ||||     
T  28964945 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatatcaatagtta-gaaattaggaatacctggattgaagctttgatgg-aagcctctcaaaagcaac- 28964849  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacacaca---atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
    || |  | ||| |||   |||||||| ||| |   | || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||        ||||||| ||||||||||    
T  28964848 atgaatagagaaagg---tgatctgaaacaaacataaagtgttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg--------atgcctcgagttctcttc 28964760  T
Q  315 agatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  28964759 agatggggagaagagagagttttccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatgg 28964660  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttga 497  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||| | |  |||||||||| ||||    
T  28964659 accatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaataact-ttattacttaatttga 28964564  T
Q  498 taactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28964563 tcactaatcaactaaggctcacaatttataaata 28964530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13445227 - 13444840
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||          ||||    
T  13445227 tgttagaaatttaggtctaaataaaaatagatttgatagaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacatt----------atga 13445138  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| | || | ||||||  |||||| ||    
T  13445137 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctcagtaacaaccat 13445038  T
Q  220 aaccaaa---gagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
    || ||||   |||| | ||||||||||  |||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13445037 aaacaaagaggagatgtgatgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttc 13444938  T
Q  315 agatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaa 399  Q
    |||||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13444937 agatggggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatttcgttaa 13444840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 17593268 - 17593481
Alignment:
Q  24 ggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17593268 ggaaatttaggtcttaattaaaaatatatttcataatagatgttcaacaatcgtaaatcaatcgcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcg 17593367  T
Q  123 aatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataac 222  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17593368 gatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataac 17593467  T
Q  223 caaagagaggagat 236  Q
    ||||||||||||||    
T  17593468 caaagagaggagat 17593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 10766854 - 10767038
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10766854 tgttggaaatttaggtcttattaaaaacaaatttcataatacatgttcaacaattataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 10766953  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccct 204  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10766954 ccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccct 10767038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 53069043 - 53069373
Alignment:
Q  26 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaat 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  53069043 aaatttaggtcttaataaaaacagattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggat 53069142  T
Q  126 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |  | ||| | ||||||| | ||  |    
T  53069143 ctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaactttcatggtagtcatcttaacaacaacaacaaaga 53069242  T
Q  225 --aagagaggagatgatctg----acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 318  Q
      |  ||  | |||||||||    ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  53069243 tgagaaggtgtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct----------agttctcttcagat 53069332  T
Q  319 ggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  53069333 ggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattgaggac 53069373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 46656850 - 46656341
Alignment:
Q  30 ttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctac 129  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  46656850 ttaggtctaaataaaaacatatttcataaaacatgttcaataaatatgaattaatagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctac 46656751  T
Q  130 gacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaa 226  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||   || |||     
T  46656750 gatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatgacaaccctctcaacaacaacgatctaaaacaag 46656651  T
Q  227 gagaggagatg-----atctgacaca---caataga-gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||     || ||| |||   ||| | | |  |||||||  |||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  46656650 gagaggagatgatataatatgaaacacatcaacatatgccagcggcgattgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcaga 46656551  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||  ||||      |||||||||||||| ||          ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  46656550 tggggagaagagaatgttt------tacggtgtattgggaaccataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtc 46656457  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |    
T  46656456 atccggacatccactca--tcgagtacatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagctttattacttaatttgatca 46656361  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcaca 520  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  46656360 ctaatcaattaaagctcaca 46656341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 533
Target Start/End: Original strand, 17601897 - 17602045
Alignment:
Q  386 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtccta 485  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17601897 cattattccgttaatgggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagcctta 17601996  T
Q  486 ttacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17601997 ttacttaatttgaccactaatcaattaaggctctaaattgataaataac 17602045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34300609 - 34300485
Alignment:
Q  84 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34300609 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34300510  T
Q  184 taaagctttcaaggcatccctctca 208  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||    
T  34300509 ttaagctttcatggcaaccctctca 34300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13837625 - 13837534
Alignment:
Q  243 acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837625 acacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 643 - 721
Target Start/End: Original strand, 49439221 - 49439299
Alignment:
Q  643 gattggtaatacaccaaatggcaaatgtgttgtgcaaaatatcaaacttaaacaccacaagtaatagcatactccacat 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49439221 gattggtaatacaccaaatggcaaatgtgttgtgcaaaatatcaaacttaaacaccacaagtaatagcatactccacat 49439299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 533
Target Start/End: Original strand, 11846335 - 11846489
Alignment:
Q  381 gttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaa 476  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11846335 gttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa 11846431  T
Q  477 ttagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  11846432 ttagccttattacttaatttgatcactaatccattaaggctctaaattgataaataac 11846489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 531
Target Start/End: Original strand, 23138779 - 23138926
Alignment:
Q  385 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattag 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  23138779 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tag 23138874  T
Q  481 tcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23138875 tcttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaata 23138926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 24643534 - 24643635
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcata--aaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24643534 tgttggaaatttaggtcttaata-aaacaaacttcatataaaacatgttcaacatttatgaatcaatagcggaagtaaataaaacattgaacatgattat 24643632  T
Q  118 gat 120  Q
    |||    
T  24643633 gat 24643635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 359
Target Start/End: Original strand, 12108716 - 12108990
Alignment:
Q  86 gcggaagcaaa-caaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggat 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  12108716 gcggaagcaaatcaaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaat 12108814  T
Q  185 aaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaataga-gttagcggcggctgatttagttct 278  Q
     ||||| | | | || || ||| | ||  |||| |   || |  ||||| ||| |||| ||  |||||||| | | |||||||||| ||||||| |||||    
T  12108815 gaagctctaatgacaaccttctgaacatgaacggtctgaaacggagagatgaggtgatatgaaacacacaacataggttagcggcgactgatttggttct 12108914  T
Q  279 tcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac 359  Q
    || | |||||||||||||||||||||||     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12108915 tctttaaccggtacctttatgcctcaag-----ttcagatcggaagaaaagatagtttgccgtgtacgatgtattgaggac 12108990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 533
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071763
Alignment:
Q  411 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaat 505  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||    
T  53071640 gacatccactcat--tgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 53071735  T
Q  506 caattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53071736 caactaaggctcacaattgataaataac 53071763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 533
Target Start/End: Original strand, 24643890 - 24644002
Alignment:
Q  424 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  24643890 gttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactca 24643987  T
Q  519 caattgataaataac 533  Q
    |||||||||||||||    
T  24643988 caattgataaataac 24644002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 419
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367233
Alignment:
Q  311 cttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaa 399  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||||||         |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcggttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctctttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaa 13367213  T
Q  400 tgggccatccggacatccac 419  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  13367214 tggaccatccagacatccac 13367233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34300429 - 34300348
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 336  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  34300429 gttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagttt 34300348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 458
Target Start/End: Original strand, 2982458 - 2982659
Alignment:
Q  268 gatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac-------- 359  Q
    ||||| ||||||| ||||   ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||            
T  2982458 gatttggttcttcttcaataagtatctttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagttcgccgtatatggtatatttgggaccatgacct 2982557  T
Q  360 --tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat 456  Q
      |||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||  |||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2982558 cttttatatttgttggtcattaggattttcattattcttttaatgggtcatcctgacatatactcgtattgagtttatatcaactaattaaatatttaat 2982657  T
Q  457 ta 458  Q
    ||    
T  2982658 ta 2982659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttta 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9760543 - 9760481
Alignment:
Q  359 ctttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  9760543 ctttatattggatgaccattagggtttcctattattcctttaatggaccatccagacatccac 9760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300088
Alignment:
Q  425 ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcac 519  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    |||||||||||||  || |||| |||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||    
T  34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaaatttaat-agtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcac 34300100  T
Q  520 aattgataaata 531  Q
    ||||||||||||    
T  34300099 aattgataaata 34300088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 28420942 - 28421468
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28420942 tgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28421041  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28421042 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 28421141  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421142 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 28421241  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28421242 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 28421341  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  28421342 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 28421441  T
Q  505 tcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28421442 tcaattaaggctcacaattgataaata 28421468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 3817294 - 3817820
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3817294 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 3817393  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3817394 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat 3817493  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817494 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 3817593  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3817594 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 3817693  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| || || |    
T  3817694 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttcatca 3817789  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3817790 ctaatcaactaaggcccacaattgataaata 3817820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Original strand, 3811151 - 3811678
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3811151 ctgttggaaatgtaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 3811250  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3811251 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacga 3811350  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811351 taacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 3811450  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3811451 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggc 3811550  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  3811551 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 3811646  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3811647 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 3811678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 351962 - 351437
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  351962 tgttggaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 351863  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  351862 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 351763  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351762 aaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 351664  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  351663 tggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccagtaatgggcc 351564  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||    
T  351563 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcac 351467  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  351466 taatcaactaaggctgacaattgataaata 351437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 339547 - 339031
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  339547 tgttggaaatttagctcttaatataaagagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 339448  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac--- 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||       
T  339447 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagct------------ctctcatcaacaacaat 339360  T
Q  217 gataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339359 gataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 339260  T
Q  315 agatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  339259 agatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccattaggtttcccattattccagtaatggg 339160  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  339159 ccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 339063  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  339062 actaatcaactaaggctgacaattgataaata 339031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 5979156 - 5979688
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  5979156 tgttgaaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatg 5979255  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| | ||||||||||||||||    
T  5979256 attggatctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacga 5979355  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5979356 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcag 5979455  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------ttta-tattggatggccattag--gttcccattattccgttaatgg 402  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||| |    
T  5979456 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttcccattattctgttaattg 5979555  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||    
T  5979556 gccatccgaacatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcac 5979655  T
Q  502 taatcaattaa-ggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  5979656 taatcaattaagggctctaaattgataaataac 5979688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20239127 - 20238785
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20239127 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 20239028  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20239027 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacaat 20238928  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238927 aaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 20238828  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20238827 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggac 20238785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 35147986 - 35148518
Alignment:
Q  20 tgttggaaattt-aggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35147986 tgttggaaattttatgtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 35148085  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||  | |||||||     
T  35148086 atcggatctacgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagctttcatggtagccctcgtaacaacaaca 35148185  T
Q  218 ataacca--aagagaggagatgatctg----acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 311  Q
    | ||  |  |  ||  | |||||||||    ||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35148186 acaaatatgagaaggtgggatgatctgaaacacacaaaatatggtcagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctc 35148285  T
Q  312 ttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggga----------ctttatattggatggccatt--aggttcccattattccgttaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  35148286 ttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggatcatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaa 35148385  T
Q  400 tgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-t 494  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||||| |    
T  35148386 tgagccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatccaa-tagccttattacttaatt 35148481  T
Q  495 tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35148482 tgatcactaatcaactaaggctcataattgataaata 35148518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5849703 - 5849178
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaat-atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5849703 ctgttgcaaatttaggtcttaataaaaacaaattttataaaattatgttcaatgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatat 5849604  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | | || | |||||| ||||||||    
T  5849603 gaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctggatgaagctttaatgacagctctctcaacaacaacg 5849504  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaataga-gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
    ||       ||||    ||||||||  | |||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5849503 at------ggagaaactatgatctgaaatacacaacatatgttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttc 5849410  T
Q  315 agatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgg 402  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||          ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  5849409 agatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattgaggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatgg 5849310  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttga 497  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  5849309 accatccgaacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttga 5849214  T
Q  498 taactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5849213 tcactaatcaactaaggctcacaattgataaataac 5849178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 43540146 - 43539711
Alignment:
Q  35 tcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacat 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43540146 tcttaataaaaacagatttcatagaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacat 43540047  T
Q  135 gtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43540046 gtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggag 43539947  T
Q  235 ---atgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg---ggag 324  Q
       ||||||||| |||||    |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  43539946 gtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggag 43539847  T
Q  325 aagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccgga 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||          |||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||||| ||||| ||    
T  43539846 aagagagagtttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtcatccaga 43539747  T
Q  413 catccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 450  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43539746 catccactca--ttgagtccatatcaattaattaaata 43539711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 22741901 - 22742441
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaat-------caatagcggaagcaaacaaaacattgaacata 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  22741901 tgttggaaatttaggtctcaataagaacaggtttcataaaacatgttcaacaattatgaatgaatcaacaatagcggaagcaaactgaacattgaacatg 22742000  T
Q  113 attatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaa 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||| ||||| |   |||| ||||||   |||    
T  22742001 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattgaggattagg-tattaggaatacctggatgaagctatggtggcagccctcttgacaa 22742098  T
Q  213 -caacgataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 300  Q
     |||||||||    |||||||||||||||||| |||           ||| |  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  22742099 acaacgataa----agagaggagatgatctgaaacaaatatcaacatcaacacggttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatgc 22742194  T
Q  301 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttccca 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||          ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22742195 ctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatattggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccca 22742294  T
Q  388 ttattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||    |||||||||| ||  |||||||||||| || |     
T  22742295 ttattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaactacttatatatttaattaattatctaat-tagaaatctaat-agcct 22742390  T
Q  484 tattacttaattg-ataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22742391 tattacttaattttatcactaatcaactaaggctcacagttgataaataac 22742441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Original strand, 42767277 - 42767501
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42767277 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 42767376  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  42767377 atcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 42767476  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctga 243  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  42767477 taatcaaagagagaagatgatctga 42767501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15843988 - 15843785
Alignment:
Q  155 taagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaata 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  15843988 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15843889  T
Q  253 gagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta-cggtgta 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15843888 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgta 15843789  T
Q  352 ttgg 355  Q
    ||||    
T  15843788 ttgg 15843785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15861097 - 15860894
Alignment:
Q  155 taagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaata 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  15861097 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15860998  T
Q  253 gagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta-cggtgta 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15860997 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgta 15860898  T
Q  352 ttgg 355  Q
    ||||    
T  15860897 ttgg 15860894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12804176 - 12803893
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  12804176 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacatga 12804077  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatct--ggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||    
T  12804076 acggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggggatgaagctttggtagcagccctctcgacaacaacg 12803977  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 300  Q
    ||    ||||||||||| |||| ||| |||     ||| |  ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12803976 at----aaagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacatggttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383319
Alignment:
Q  294 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-- 381  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||      
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggt 26383470  T
Q  382 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaat 477  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||     
T  26383469 ttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa- 26383374  T
Q  478 tagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26383373 tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 26383319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26383774 - 26383603
Alignment:
Q  48 agatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatca 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26383774 agatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaacaacagaaacaaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 26383675  T
Q  148 aggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  26383674 agcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttgatggcagccctctcaacaacaacgat 26383603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 30219271 - 30219438
Alignment:
Q  62 atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 161  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30219271 atgttcaataattatgaatcattagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaagaat 30219370  T
Q  162 tagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagag 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  30219371 tatggtattaggaatatctggataaagctttcatgacaaccatctcagcatcaacgataaacaaagag 30219438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Original strand, 35150761 - 35150866
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 354  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35150761 gttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 35150860  T
Q  355 gggact 360  Q
    ||||||    
T  35150861 gggact 35150866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Original strand, 35152864 - 35153038
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||    
T  35152864 tttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaatt 35152961  T
Q  454 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35152962 aattatccaat-tagaaatcgaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 35153038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26381239 - 26380935
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | | || |||||| || ||||||||| || ||||||  |    
T  26381239 gaaatttaggtctaaata-aaatagatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaagggggaaaacaaacacaatattgaacatgatcatgatcaga 26381141  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca 224  Q
    ||||| |         ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | || |||||||| |||||||||| |  |    
T  26381140 tctacta---------tttatcaagcatgctaagaattagggtattaggagta-ctggatgaagctttgatgacaaccctctcaacaacaacgatgaaga 26381051  T
Q  225 aagagaggagatgatctgacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag 324  Q
    ||   | || ||||  | |||||   ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  26381050 aacc-atgatatgaaat-acacaacttac-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggag 26380954  T
Q  325 aagagagagtttgccgtgt 343  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  26380953 aagagagagtttgtcgtgt 26380935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7608475 - 7608306
Alignment:
Q  166 gtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacacaca-ata---gagttagcg 261  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | | ||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||   |  ||||||    
T  7608475 gtattagaaatatctgaataaagctttgatgacagtcatctcatcaacaatgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacataagcggattagcg 7608376  T
Q  262 gcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat-ggggagaagaga 330  Q
    ||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608375 gcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 458
Target Start/End: Original strand, 42767547 - 42767636
Alignment:
Q  370 atggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42767547 atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatccactcat-tgaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 42767636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 494
Target Start/End: Original strand, 18656883 - 18657120
Alignment:
Q  265 gctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggact---- 360  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||         
T  18656883 gctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagagaaagtttgtcgtgtatggtgcattggagacaatag 18656982  T
Q  361 ----ttatattg-gatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataat 452  Q
        ||| | || |||| ||||||||  || ||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| || ||||| |||||||    
T  18656983 cctcttacagtgtgatg-ccattaggatttaccattattgtattaatgggtcatccagacatccactcata--gagtccatattaattaatttaaataat 18657079  T
Q  453 taattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaat 494  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  18657080 taattatcc-aaataaaaatctaattagccttattacttaat 18657120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3677965 - 3677876
Alignment:
Q  254 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 343  Q
    ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  3677965 agttaccggcagttgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagagaatgtttgtcgtgt 3677876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 164
Target Start/End: Original strand, 18666547 - 18666622
Alignment:
Q  88 ggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  18666547 ggaagcaaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattag 18666622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380758
Alignment:
Q  450 aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26380838 aattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 26380758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43539693 - 43539644
Alignment:
Q  484 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataa 532  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43539693 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatgataaataa 43539644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7608251 - 7608163
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa 448  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||    
T  7608251 tttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactcat--taaccccatatcaactaattaaa 7608163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24690691 - 24690652
Alignment:
Q  411 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24690691 gacatccactcatattgagtccatattaactaattaaata 24690652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 533
Target Start/End: Original strand, 30219547 - 30219586
Alignment:
Q  494 ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30219547 ttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaataac 30219586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8824595 - 8824461
Alignment:
Q  386 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtccta 485  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||        ||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||  | ||    
T  8824595 cattattccgtta-tgagtcatccagacatccactcatattgagtccat--------attaattaattaattatctaaa--agaaatctaa-tatcctta 8824508  T
Q  486 ttacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8824507 ttacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaata 8824461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Original strand, 12686161 - 12686688
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12686161 ctgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 12686260  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12686261 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 12686360  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686361 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 12686460  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12686461 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 12686560  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  12686561 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 12686660  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686661 atcaattaaggctcacaattgataaata 12686688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 12692264 - 12692790
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12692264 tgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 12692363  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12692364 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 12692463  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692464 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 12692563  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12692564 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 12692663  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  12692664 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 12692763  T
Q  505 tcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12692764 tcaattaaggctcacaattgataaata 12692790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Original strand, 28525368 - 28525895
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28525368 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28525467  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28525468 atcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 28525567  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28525568 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcag 28525667  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28525668 atggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 28525767  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||| |||||     
T  28525768 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-cagccttattacttaatttgatc 28525863  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28525864 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 28525895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 28531465 - 28531991
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28531465 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28531564  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28531565 tcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 28531664  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28531665 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccagtacctttatgcctcacgttctcttcaga 28531764  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28531765 tggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 28531864  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||| ||||| |    
T  28531865 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-cagccttattacttaatttgatca 28531960  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28531961 ctaatcaactaaggcccacaattgataaata 28531991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 41297453 - 41296929
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297453 tgttggaaatttgggtcttaatataaagagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatga 41297354  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41297353 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctg------gctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat 41297260  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctca---agttctcttc 314  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  41297259 aaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtagttctcttc 41297160  T
Q  315 agatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatg 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  41297159 agatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatg 41297060  T
Q  402 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttg 496  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||    
T  41297059 ggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttg 41296964  T
Q  497 ataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41296963 atcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 41296929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 7389531 - 7390057
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7389531 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 7389630  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||  | |||||||||||||||||    
T  7389631 tcggatccacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgat 7389729  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389730 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 7389829  T
Q  318 tggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatt--aggttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||          |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  7389830 tggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattccgttaatgggt 7389929  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  7389930 catccgaacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 7390025  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7390026 actaatcaactaagactcacaattgataaata 7390057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 180 - 531
Target Start/End: Original strand, 32097165 - 32097531
Alignment:
Q  180 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 277  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097165 tggataaagctttcatagcagccctttaatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 32097264  T
Q  278 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  32097265 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatat 32097364  T
Q  367 tggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaa 464  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097365 tggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaa 32097464  T
Q  465 atagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32097465 atagaaatctaattag-cttattatttaatttgatcactaaccaattaaggctcacaattgataaata 32097531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 180 - 531
Target Start/End: Original strand, 32094364 - 32094731
Alignment:
Q  180 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 277  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32094364 tggataaaggtttcatagcagccctttaatcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttc 32094463  T
Q  278 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||          |||||||    
T  32094464 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatat 32094563  T
Q  367 tggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaa 464  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094564 tagatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaa 32094663  T
Q  465 atagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094664 atagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 32094731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 19059747 - 19060283
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  19059747 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacatatttcataaaacgtattcaacgattataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatataa 19059846  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||   |||| |||||||  ||||||||    
T  19059847 acggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatgaagctttggtggcagccctctcgacaacaacg 19059946  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 306  Q
    ||    |||||||| || |||||||| |||           ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19059947 at----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacatccacatcaacacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaag 19060042  T
Q  307 ttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattcc 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19060043 ttctcttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc 19060142  T
Q  395 gttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat---tatccaaaatagaaatctaattagtcctattactt 491  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19060143 gttaatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattactt 19060242  T
Q  492 aa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  19060243 aatttgatcactaatcaattaagtctccaaattgacaaata 19060283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 30384359 - 30384893
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30384359 tgttggaaatttaggttttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgattat 30384458  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||  | || | |||||  || |||||    
T  30384459 gatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttcgtgacaactctctcgccatcaacg 30384557  T
Q  218 at---aaccaaagagaggagatgatct-------gacacacaatagag-ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 306  Q
    ||   || ||| |||||||||||||||        |||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  30384558 atctaaaacaaggagaggagatgatctaatctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgag 30384657  T
Q  307 ttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattag-gttcccattattccgt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |         ||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||    
T  30384658 ttctcttcagatggggagaagagaatgtttgccgtgtacggtgtattgggaccatagtctcttttatattggatgactattagattttccattattccgt 30384757  T
Q  397 taatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattactta 492  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||  |||| |||||||| | |||| |||    ||||||||||| | || |||||||| || ||| | |||||||||    
T  30384758 taatgagtcatccagacatccactca--ttgaatccatatctattaatgaaatatttaattaattat-ctaattagaaatccaa-tagccttattactta 30384853  T
Q  493 a-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30384854 atttaatcactaatcaattaaggctcacaactgataaata 30384893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30772460 - 30771933
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaa-cattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  30772460 tgttggaaatttagttcttaataaaaataaatttcataaaacatgttcaataattatgaataaacagtggaagcaaacaaaaacaatgaacatgattatg 30772361  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||| |||||   |||||||| |    
T  30772360 atcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatggcagccctc---tcaacaacaa 30772264  T
Q  219 taaccaa-ag-agaggagatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 312  Q
    ||| ||| || ||  | |||||||||| |||||    | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772263 taaacaagagaaggtgtgatgatctgaaacacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 30772164  T
Q  313 tcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||| ||||          | |||||||||||  ||| |||  ||  |||||||| ||||||    
T  30772163 tcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattgtggaccatagtctcttctatattggatgatcatcagggtttttcattattctgttaat 30772064  T
Q  401 gggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa----ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-tt 495  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||| ||   ||| | |||||||||| ||    
T  30772063 gggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaata-agaaa-ctttatagccttattacttaattt 30771966  T
Q  496 gataactaatcaattaaggctcacaattgataa 528  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30771965 gatcactaatcaattaaggctcacaactgataa 30771933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 517
Target Start/End: Original strand, 19066091 - 19066603
Alignment:
Q  21 gttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgat 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||||     
T  19066091 gttggaaatttaagtcttaataaaaacatatttcataaaccatgttcaacgattataaatcattagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaa 19066190  T
Q  121 cgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||||   |||| | |||||  |||||||||    
T  19066191 cggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaataccaggagatgaagctttggtggcagctctctcgacaacaacga 19066290  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctgacaca---------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 309  Q
    |    |||||||| |  |||||||| |||         ||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19066291 t----aaagagagaaagtgatctgaaacaaacccacatcaacacggttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 19066386  T
Q  310 tcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgtt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||    
T  19066387 tcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtattggggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgtt 19066486  T
Q  398 aatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttg 496  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |    |||||||| | |||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||| || | | |||||||| |||    
T  19066487 aatgggtcatccagacatccactcatat---atccatatccattaattaatcaattaa-tattctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttg 19066582  T
Q  497 ataactaatcaattaaggctc 517  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19066583 atcactaatcaattaaggctc 19066603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20499788
Alignment:
Q  103 attgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatcc 202  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  203 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacacacaataga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 300  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||  ||||||| ||| |  |||  |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20500131 ctctcaacatcaacgataaacagagagaa-aggcgatctgaaacaaacaagaaggttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgc 20500033  T
Q  301 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttccca 387  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||          | | ||||||||| ||||||||  || |||    
T  20500032 ctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttcca 20499933  T
Q  388 ttattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcc 483  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |  | ||||||||||| |||||     
T  20499932 ttatttcgttaatgggccatccagacatccactca--ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattat-cttactagaaatctaa-tagtct 20499837  T
Q  484 tattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20499836 tattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaata 20499788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24054502 - 24054336
Alignment:
Q  29 tttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatcta 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24054502 tttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatctatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatcta 24054403  T
Q  129 cgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggg-tattaggaatatctggataaagctttca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24054402 cgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctggataaagctttca 24054336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 32094142 - 32094340
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32094142 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagattttataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32094241  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  32094242 ataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaatacctgaataaagctttcatagcagccctctcaacaacaacga 32094340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 224 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 14610141 - 14609909
Alignment:
Q  224 aaagagaggagatgatctgacaca--caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14610141 aaagagaggagatgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggg 14610042  T
Q  322 gagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggccatccg 410  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||          |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14610041 gagaaaagaaagtttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccg 14609942  T
Q  411 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt 445  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14609941 gacatccactca--ttgagtccatatcaattaatt 14609909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 32096943 - 32097138
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32096943 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32097042  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 215  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||  |||  ||||||| ||||||    
T  32097043 ataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggattacctgaataaagctttcatagcagtcctctcaacaacaa 32097138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 16215156 - 16215309
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16215156 ctgttagaaatttaggtctttataaaaacagatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatg 16215255  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattag 172  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16215256 attggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtattag 16215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14610321 - 14610184
Alignment:
Q  26 aaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcga 123  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||     
T  14610321 aaatttaggtcttaacaaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcgg 14610222  T
Q  124 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 161  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610221 atttacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 14610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26510013 - 26509696
Alignment:
Q  30 ttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctac 129  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  26510013 ttaggcctaaataaaaacagatttcataaaacatgttcaatcattatgaa---atagtggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactac 26509917  T
Q  130 gacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagag 229  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| | | ||  ||||||| || |||||||    ||||||    
T  26509916 gacatatttgattcatcaa-gatattaagaatta-ggtattaggaatatatgaatgaagctttgatgacagtcctctcaacatcaacgat-ctgaaagag 26509820  T
Q  230 aggagat---gatctg----acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgggg 322  Q
      || ||   ||||||    |||||  |||||||  | ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||    
T  26509819 gagaaatcgcgatctgaaatacacaacatagagtcggtggcggctgatttgatacttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagat--gg 26509722  T
Q  323 agaagagagagtttgccgtgtacggt 348  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||    
T  26509721 aaaagggagagtttaccgtgtacggt 26509696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Original strand, 26316782 - 26316922
Alignment:
Q  27 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatc 126  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||    
T  26316782 aatttaggtctacataaaaacatatttcataaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatc 26316881  T
Q  127 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggt 167  Q
    || ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  26316882 taggacatgtttgatttatctacggtattaataattagggt 26316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  98 aaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 80
Target Start/End: Original strand, 8706454 - 8706508
Alignment:
Q  26 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaat 80  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706454 aaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaacaattatgaat 8706508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Original strand, 37896286 - 37896423
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    |||| |||||||||||   ||||  ||||||||||  || || || ||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| |    
T  37896286 gaaaattaggtcttaaataaaacgaatttcataaatcatatttaataatcatgaatcaacagcagaagtaaataaaatgttgaacatgattatgatcgga 37896385  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37896386 tctacgacatgattgatttatcaagaatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 288
Target Start/End: Original strand, 8706532 - 8706672
Alignment:
Q  147 aaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| | || || ||||| || ||||    || |||||||||||||||||||| ||    
T  8706532 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaacagcaac----acgaaagagaggagatgatctgaaac 8706627  T
Q  247 acaataga----gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccg 288  Q
    | ||| ||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8706628 a-aattgaaggggttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 358
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318582
Alignment:
Q  267 tgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggga 358  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagtttgtcgtttccgatatattgggga 26318582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609779
Alignment:
Q  427 gagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaa 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||    |||||||||||  |  |||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttac-tagaaatctaat-agttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 14609791  T
Q  522 ttgataaataac 533  Q
    ||||||| ||||    
T  14609790 ttgataagtaac 14609779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 532
Target Start/End: Original strand, 22647928 - 22647998
Alignment:
Q  463 aaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataa 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||    
T  22647928 aaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataa 22647998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 33753476 - 33753551
Alignment:
Q  276 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgta 351  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33753476 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacggtgta 33753551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 531
Target Start/End: Original strand, 25408437 - 25408474
Alignment:
Q  494 ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25408437 ttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 25408474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26509643 - 26509539
Alignment:
Q  389 tattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctatt 487  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||    
T  26509643 tattccgttgatggaccatccaaacatccactcata--gagttcatatcaattattttaaataattaattatcc-aaatagaaatctaatcattcttgtt 26509547  T
Q  488 acttaatt 495  Q
    ||||||||    
T  26509546 acttaatt 26509539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 33849110 - 33849185
Alignment:
Q  276 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgta 351  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  33849110 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacagtgta 33849185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 33848933 - 33849070
Alignment:
Q  84 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatg---tttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatct 180  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||    ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  33848933 tagcggaagcaaaaaaaactttgagcatggatatgatcgaatctacgacatgcatgttgatctatcaa-gatactaataatta-ggtattaggaatacct 33849030  T
Q  181 ggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgata 220  Q
     ||| ||| ||| | | ||  ||||||| |||||||||||    
T  33849031 tgatgaagttttgatgacagtcctctcaacaacaacgata 33849070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 32897190 - 32896662
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32897190 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32897091  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  32897090 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacaa 32896991  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896990 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 32896891  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32896890 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatggg 32896791  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  32896790 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 32896691  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896690 aatcaattaaggctcacaattgataaata 32896662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 32891065 - 32890538
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32891065 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 32890966  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32890965 tcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaat 32890866  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890865 aaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 32890766  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32890765 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 32890666  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  32890665 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 32890566  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32890565 atcaattaagggtcacaattgataaata 32890538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 36819147 - 36818622
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36819147 tgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatctcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatga 36819048  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||  |||||||||||||||||||    
T  36819047 tcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgccctctcatcaacaacgat 36818949  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36818948 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcaga 36818849  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36818848 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 36818749  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||    
T  36818748 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcactaa 36818649  T
Q  505 tcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36818648 tcaattaaggctcacaattgataaata 36818622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 533
Target Start/End: Original strand, 5542139 - 5542673
Alignment:
Q  16 tctctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataatt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5542139 tctctgttggaaatttaggttttaatataaatagattttataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 5542238  T
Q  116 atgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5542239 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaa 5542338  T
Q  216 cgataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542339 cgataaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 5542438  T
Q  314 cagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5542439 cagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaat 5542538  T
Q  401 gggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttg 496  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5542539 gggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttg 5542636  T
Q  497 ataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5542637 atcactaatcaattaaggctctaaattgataaataac 5542673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9935457 - 9934931
Alignment:
Q  18 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9935457 tctgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattat 9935358  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  9935357 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttcatagcagccctctaatcaacaacg 9935258  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
     |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935257 ttaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttca 9935158  T
Q  316 gatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  9935157 gatggggaga--agagagtttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattaggtttcccattattccgttaatgggt 9935061  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||    
T  9935060 catccggatatccactcatgttgagtccatatcaataaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcacta 9934961  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9934960 atcaattaagactcacaattgataaataac 9934931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Original strand, 42992989 - 42993511
Alignment:
Q  23 tggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42992989 tggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatc 42993088  T
Q  122 gaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataa 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||  |||||||||||||||||||||    
T  42993089 ggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaataccttgataaagcttttgtagccaccctctcatcaacaacgataa 42993187  T
Q  222 ccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993188 ccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 42993287  T
Q  320 gggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcca 406  Q
    |||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||||||||          ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42993288 gggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcccattattccgttaatgggcca 42993384  T
Q  407 tccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaat 505  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
T  42993385 tc-ggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaat 42993483  T
Q  506 caattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993484 caattaaggctcacaattgataaataac 42993511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 14418114 - 14417609
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14418114 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 14418018  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||    
T  14418017 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgat 14417918  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14417917 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcaga 14417818  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatcc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||        | |  ||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  14417817 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccata--------gcctctttttttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatcc 14417726  T
Q  418 actcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaa 512  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  14417725 actca--ttgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 14417630  T
Q  513 ggctcacaattgataaataac 533  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  14417629 gactcacaattgataaataac 14417609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10706020 - 10705488
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10706020 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaaatcaatagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 10705921  T
Q  119 at------cgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaa 212  Q
    ||      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  10705920 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaa 10705822  T
Q  213 caacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10705821 caacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggcttaagttct 10705722  T
Q  311 cttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgtta 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||          |||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  10705721 cttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggtttccattattccgtta 10705622  T
Q  399 atgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa- 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  10705621 atgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattc-aattagaaatctaa-tagttttattacttaat 10705526  T
Q  494 ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705525 ttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 10705488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 98 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10699677
Alignment:
Q  98 aaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaagg 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |    
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaaacttttgtag 10700029  T
Q  198 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctt 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10700028 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 10699929  T
Q  296 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--t 382  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||| ||||||||  |    
T  10699928 tatgcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtt 10699829  T
Q  383 tcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatt 478  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  10699828 tcccattactccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-t 10699733  T
Q  479 agtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    || |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699732 agcctaattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 10699677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 27 - 531
Target Start/End: Original strand, 22219706 - 22220237
Alignment:
Q  27 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacataattatgatcgaat 125  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22219706 aatttaggtcttaataaaaagagatttcataaaacatgttcaatagttatgaatcaatagcagaagaaaaagaaaactttgaacatgattatgatcggat 22219805  T
Q  126 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgga-taaagctttcaaggcatccctct----------catcaaca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||          || |||||    
T  22219806 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatggcagccctctcaacaacaaccaacaaca 22219905  T
Q  215 acgataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 312  Q
    ||||||| |||||| |  |  |||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22219906 acgataaacaaaga-aaaaattgatctgaaacaaacaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 22220004  T
Q  313 tcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22220005 tcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaa 22220104  T
Q  400 tgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-t 494  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||||||| |    
T  22220105 tgggccatccggacatccattca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tacccttattacttaatt 22220200  T
Q  495 tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22220201 tgatcactaatcaactaaggcttacgattgataaata 22220237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 39735531 - 39736048
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtctt----aatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataatt 115  Q
    |||||||||||||||| ||    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  39735531 tgttggaaatttaggtttttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaataaaatattgaacatgatt 39735630  T
Q  116 atgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 215  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  39735631 atgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctggataaa-atttcatggcaaccctctcaacaacaa 39735729  T
Q  216 cgataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaa-tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctct 312  Q
    || |    |||||||| || |||||||  ||| ||||  || ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39735730 cggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacaacaagggttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttatgcctcaagtactct 39735825  T
Q  313 tcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac---tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggccat 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||   | | |   |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||    
T  39735826 tcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacg--gtaccagagcctcttttatattagatggccattagggtttcccttattccgttaatgggtcat 39735923  T
Q  408 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||    
T  39735924 ccggacatccactga--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 39736019  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  39736020 aatcaactaatgctcacaattgataaata 39736048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 39727300 - 39727794
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatat---aaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataatta 116  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39727300 tgttggaaatttaggtcttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 39727399  T
Q  117 tgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 216  Q
    |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||  |||| |||||||| |||||||    
T  39727400 tgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttcttggcaaccctctcaacaacaac 39727490  T
Q  217 gataaccaaagagaggagatgatctgacacaca---atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    | |    |||||||| || |||||||| ||| |     || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39727491 ggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacagcaagggttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactctt 39727586  T
Q  314 cagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccgga 412  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  |||         ||  |   |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39727587 gagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatattggggaccatat---------cctct---ttcccattgttccgttaatgggctatccgga 39727674  T
Q  413 catccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatca 507  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39727675 catccactca--ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatttaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca 39727770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7771408 - 7771202
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7771408 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 7771309  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  7771308 tcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat-aagcttttgtagcaaccctctcatcaacaacgat 7771210  T
Q  220 aaccaaag 227  Q
    ||||||||    
T  7771209 aaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 255 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033447
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattg 42033641  T
Q  355 ggga----------ctttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaat----gggccatccggacatccactcatgttgagtccatatca 438  Q
    ||||          |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42033640 gggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatccggacatccactca--ttgagtccatatca 42033543  T
Q  439 actaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||    ||||||||||| | || ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033542 actaattaaatatttaattaattat-ctaattagaaatctaa-taaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 42033447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 14799398 - 14799564
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14799398 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 14799497  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14799498 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 1882734 - 1882939
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1882734 tgttggaaatttaggtcttaatataaaacagatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatg 1882833  T
Q  119 atcgaatct-acgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 215  Q
    | || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  1882834 aacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagctttcatggcagccctctcaacaacaa 1882933  T
Q  216 cgataa 221  Q
    ||||||    
T  1882934 cgataa 1882939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883143
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 354  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgccgtgtattgtgtattg 1883138  T
Q  355 gggac 359  Q
    |||||    
T  1883139 gggac 1883143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 340 - 531
Target Start/End: Original strand, 1883158 - 1883347
Alignment:
Q  340 gtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatc 437  Q
    |||||| |||||||||||||  ||   ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1883158 gtgtacagtgtattggggaccatagcctggatggccattaaggtttcccattatttcgttaatgggtcatccggacatccactcatattgagtccatatc 1883257  T
Q  438 aactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     | ||||||| |||     ||| | ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  1883258 cattaattaattaa-----tattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaagtaaggctccaaattgataaata 1883347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24250278 - 24250171
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24250278 tgttgaaaatttaggtcttaaaa-aaacatatttcataaaacatgttgaacaaatatgaatcaatagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatga 24250180  T
Q  120 tcgaatcta 128  Q
    ||| |||||    
T  24250179 tcggatcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17954305 - 17954156
Alignment:
Q  385 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcct 484  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||| | |    
T  17954305 ccattattccgttagtgggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaatta-attaaatagaaatctaa-taggctt 17954208  T
Q  485 attact----taat-tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||    |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17954207 attactttagtaatctgatcactaatcaattaagtctccaaattgataaata 17954156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1171493 - 1171414
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatt 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1171493 gaaatttaggtcttaata-aaacagatttcatgaaacatattcaacaattatgattcaaccgcggaagcaaacaaaacatt 1171414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 119
Target Start/End: Original strand, 31399047 - 31399119
Alignment:
Q  47 cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31399047 cagatttaataacatatgttcaataattatgaatcaatagtggaggcaaacaatacattgaacatgattatga 31399119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171215
Alignment:
Q  127 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||| | |||||| || ||||  ||| || |    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaag-ataacaagaattagg-tattaggaatacctggttaaagcttttatggcagctctctcaacagcaacagtaaacaga 1171317  T
Q  227 gagaggagatgatctgacacacaataga---gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgggga 323  Q
    |||| ||  |||||||| ||| |  | |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||    
T  1171316 gagatgatgtgatctgaaacaaacaacaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta--------------gttctcttcagatgggga 1171231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42033930 - 42033856
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaa 96  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42033930 tgttggaaatttaggtcttactaaaaatagatttcataaaaca--ttcaacaacaatgaatcaatagcagaagcaaa 42033856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 39689838 - 39689782
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattat 76  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39689838 tgttggagacttaggttttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattat 39689782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 523
Target Start/End: Original strand, 30890535 - 30890593
Alignment:
Q  466 tagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaatt 523  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30890535 tagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 31379430 - 31379502
Alignment:
Q  45 aacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    |||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31379430 aacaaatttcataacacatgtttaataattatgaatcaatgacggaggcaaataaaacattgaacatgattat 31379502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12572 - 12045
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaatt-atgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12572 tgttggaaatttagctcttaatataaaca-atttcataaaccatattcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataattatg 12474  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12473 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatatctggataaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacga 12374  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12373 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 12274  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12273 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatggg 12174  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  12173 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 12074  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073 aatcaattaaggctcacaattgataaata 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6699 - 6170
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaatt-atgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6699 tgttggaaatttagctcttaatataaaca-atttcataaaccatgttcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 6601  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6600 actgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 6501  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 6401  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6400 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatggg 6301  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  6300 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 6201  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6200 aatcaattaaggctttaaattgataaataac 6170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 13456276 - 13455749
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13456276 tgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatga 13456177  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13456176 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat 13456077  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456076 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 13455977  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13455976 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 13455877  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  13455876 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 13455777  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455776 atcaattaaggctcacaattgataaata 13455749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 13462217 - 13461690
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13462217 tgttggaaatataggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatga 13462118  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13462117 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat 13462018  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462017 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 13461918  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13461917 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 13461818  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  13461817 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 13461718  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461717 atcaattaaggctcacaattgataaata 13461690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 36750591 - 36750064
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36750591 tgttggaaatttaagtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 36750492  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  36750491 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgat 36750392  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36750391 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcaga 36750292  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36750291 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 36750192  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  36750191 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 36750092  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750091 atcaattaaggctcacaattgataaata 36750064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 28682928 - 28683456
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28682928 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 28683027  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28683028 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacgat 28683127  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683128 aaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 28683227  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28683228 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 28683327  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |    
T  28683328 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatca 28683423  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28683424 ctaatcaactaaggcccacaattgataaataac 28683456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 35090637 - 35091162
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35090637 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 35090736  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||  |    
T  35090737 tctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--a 35090834  T
Q  225 aagagaggagatgatctgacaca----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
     |||||||   |||||||| |||           ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090835 cagagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 35090931  T
Q  315 agatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatg 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35090932 agatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatg 35091031  T
Q  402 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |    
T  35091032 ggccatccggacatccactcatgttgagtctatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatca 35091131  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091132 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 35091162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 26 - 531
Target Start/End: Original strand, 35084665 - 35085189
Alignment:
Q  26 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  35084665 aaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggat 35084764  T
Q  126 ctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||  |     
T  35084765 ctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--ac 35084862  T
Q  226 agagaggagatgatctgacaca----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
    |||||||   |||||||| |||           ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084863 agagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 35084959  T
Q  316 gatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35084960 gatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgg 35085059  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||    
T  35085060 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcac 35085159  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085160 taatcaattaaggctcacaattgataaata 35085189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 44716787 - 44717315
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  44716787 tgttagaaatttaggtcttaataaaaacagatatcataaaacatgttcaacggttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgattatg 44716886  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| | ||||||||||||||||    
T  44716887 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacga 44716986  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44716987 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 44717086  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  44717087 atggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttccattattccgttaatggg 44717186  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgat 498  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  44717187 ccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattatatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgat 44717282  T
Q  499 aactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44717283 cactaatcaactaagactcacaattgataaata 44717315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 30965505 - 30964977
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30965505 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 30965406  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  30965405 atcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 30965306  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965305 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 30965206  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||          |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30965205 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcccattattccgttaatggg 30965106  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgat 498  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  30965105 ccatccggacatccactca--ttgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagtcttattacttaatttgat 30965010  T
Q  499 aactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30965009 cactaatcaactaaggcccacaattgataaata 30964977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31002554 - 31002026
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31002554 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 31002455  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  31002454 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 31002355  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002354 taaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 31002255  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31002254 atggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatggg 31002155  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgat 498  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  31002154 tcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgat 31002059  T
Q  499 aactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31002058 cactaatcaactaaggcccacaattgataaata 31002026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31008533 - 31008004
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31008533 ctgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattat 31008434  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  31008433 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacg 31008334  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31008333 ataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttca 31008234  T
Q  316 gatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  31008233 gatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgg 31008134  T
Q  403 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttga 497  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  31008133 gtcattcggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttga 31008038  T
Q  498 taactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31008037 tcactaatcaactaaggcccacaattgataaata 31008004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 13149674 - 13150199
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13149674 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 13149773  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13149774 tctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctg-ataaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataacca 13149871  T
Q  225 aagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg- 321  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13149872 aagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgaga 13149971  T
Q  322 ----gagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
        ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  13149972 tgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggt 13150071  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  13150072 catccgtacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 13150167  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  13150168 aataatcaactaatgcccacaattgataaata 13150199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 458
Target Start/End: Original strand, 11048536 - 11048988
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11048536 tgttggaaatttaggtcttattaaaaataaatttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 11048635  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    | | || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| | | || |||||||  ||||||| ||    
T  11048636 ttggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttttatgacagccctctcgacaacaacaat 11048735  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctgacaca-----caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttc 314  Q
         ||||||| || |||||||| |||     ||| | ||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11048736 ----caagagagaaggtgatctgaaacaaatatcaacacagtta-cggcgactaatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttc 11048830  T
Q  315 agatggggagaagagaga----gtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgtta 398  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  11048831 agatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgtta 11048930  T
Q  399 atgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11048931 atgggtcatccagacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 11048988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23343737 - 23343213
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23343737 tgtttgaaatttagatcttgataagaagagatttcataaaacatgttcaacgattacgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatga 23343638  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  ||| || ||||   |||| |||||||  |||||||     
T  23343637 acgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatacatggagatgaaactttggtggcagccctctcgacaacaaca 23343538  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 306  Q
    ||    ||| ||||||| |||||||| |||           ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23343537 at----aaatagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaag 23343442  T
Q  307 ttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  23343441 ttctcttcagatggggagaagagagagtttcccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttccattattctg 23343342  T
Q  396 ttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-t 494  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||         | ||||||||||  | ||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  23343341 ttaatgggtcatccggacatccacctatattgagtccatatc--------cattaattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatt 23343250  T
Q  495 tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23343249 tgatcactaatcaattaaggctccaaattgataaata 23343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 35438692 - 35439014
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35438692 ctgttggaaatttaggccttaata-aaacaaatttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 35438790  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||         || || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||  ||||||| |    
T  35438791 atcggatctacgacatgtttgatt---------tactaggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcatggcagccgtctcgacaacaacaa 35438881  T
Q  219 taacca----aagagaggagatgatctgacacaca-at--agagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 311  Q
     ||| |     ||||||||| |||||||| ||| | ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35438882 caacgataaggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 35438981  T
Q  312 ttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35438982 ttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 35439014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879244
Alignment:
Q  257 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattgg 355  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  356 ggac---------------tttatattggatggccatt-aggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 439  Q
     |||                |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  19879436 cgaccataacctcttttatgttatattggatggccattaagtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattcactca--ttgagtcaatatcaa 19879339  T
Q  440 ctaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     |||||||||| ||||||||    | || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19879338 ttaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattaataaata 19879244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 533
Target Start/End: Original strand, 35439706 - 35439882
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taatt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||    |||||    
T  35439706 tttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagttcatatcaactaattaaatatttaatt 35439803  T
Q  454 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35439804 aattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaataac 35439882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 531
Target Start/End: Original strand, 35442195 - 35442342
Alignment:
Q  385 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattag 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  35442195 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tag 35442290  T
Q  481 tcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35442291 ccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaata 35442342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29833384 - 29833188
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  29833384 tgttagaaatttaggtataaatataaagagatttcataatacatgtttaataattgtgaatcaataacggaaacaaataaaatattgaacataattatga 29833285  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  29833284 tcggatcgacaacatgtttgatttatcaa-gataacaataatta-ggtattaagaatacctggatgaag-tttgatgacaaccctctcaacaacaacgat 29833188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Original strand, 7771522 - 7771696
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtcca-tatcaactaattaaata----att 453  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||  |||||||||||||||||    |||    
T  7771522 tttatattggatgacgattaggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatc--gagtcccgtatcaactaattaaatatttaatt 7771619  T
Q  454 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  7771620 aattatccaat-tagaaatctaat-agctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaata 7771696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034697
Alignment:
Q  256 ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 318  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 1388003 - 1388090
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaa 108  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||| | | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1388003 tgttgtaaatttaggtcaaaataaaaatatacttcataaaacat-ttcaataattatgaatcaataacggaaacaaacaaaacattgaa 1388090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23284769 - 23284680
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 447  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  23284769 tttatatttgatggccattagagtttcacattattccgttaatgggtcatcagaacatccacccatattgagtcaatatccattaattaa 23284680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29833142 - 29833079
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctga-tttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  29833142 gttagcggcggctaaatttggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctcttcaga 29833079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31651431 - 31651357
Alignment:
Q  382 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||  |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31651431 ttcccattattcttttaatggatcatctagacatcgactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaatta 31651357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 50306365 - 50305847
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  50306365 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattataa 50306266  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50306265 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 50306167  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  50306166 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta-------gcctcaagttctcttcaga 50306074  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50306073 tggggagaagagagaatttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 50305974  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  50305973 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 50305874  T
Q  505 tcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50305873 tcaattaaggctcacaattgataaata 50305847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 25381518 - 25382045
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25381518 tgttggaaatataggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 25381617  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||    
T  25381618 tcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 25381717  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381718 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 25381817  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25381818 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggc 25381917  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  25381918 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 25382017  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382018 atcaattaaggctcacaattgataaata 25382045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 532
Target Start/End: Original strand, 25387487 - 25388013
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25387487 tgttggaaatatagatcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 25387586  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  25387587 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgat 25387686  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387687 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 25387786  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25387787 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggc 25387886  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  25387887 catccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 25387984  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaataa 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387985 atcaattaaggctcacaattgataaataa 25388013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 34740163 - 34739636
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34740163 ctgtaggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 34740064  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34740063 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 34739964  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739963 taaccaaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 34739864  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34739863 attgggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 34739764  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |    
T  34739763 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatca 34739667  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  34739666 ctaatcaactaaggccctcaatttataaata 34739636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31058220 - 31057694
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31058220 tgttagaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 31058121  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  31058120 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacgat 31058022  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatct--gacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058021 aaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 31057922  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattgggga----------ctttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||           ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  31057921 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcccattattccgttaatgggt 31057822  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  31057821 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 31057726  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31057725 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 31057694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31051718 - 31051194
Alignment:
Q  27 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaata-----tgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||     |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31051718 aatttaggtcttaatataaacagatttcatatcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatt 31051619  T
Q  122 gaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataa 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31051618 ggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctggataaaacttttgtagcaaccctttcatcaacaacgataa 31051520  T
Q  222 ccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051519 ccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatg 31051420  T
Q  320 gggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcca 406  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31051419 gggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggcca 31051320  T
Q  407 tccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataac 501  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||    
T  31051319 tccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcac 31051224  T
Q  502 taatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31051223 taatcaactaaggcccacaattgataaata 31051194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 65 - 533
Target Start/End: Original strand, 8092874 - 8093357
Alignment:
Q  65 ttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8092874 ttcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttg 8092973  T
Q  165 ggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctg--acacacaa-tagagttagcg 261  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||| |||||||    
T  8092974 ggtatgaggaatacctggataaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaactag-gttagcg 8093072  T
Q  262 gcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac-- 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  8093073 gcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattggggacca 8093172  T
Q  360 --------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa- 448  Q
            |||||||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  8093173 tagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaac 8093270  T
Q  449 ---taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
       ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8093271 atttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgattattaatcaactaagactcacaattgataaataac 8093357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 44410187 - 44409650
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44410187 ctgttggaaatttaggtcttactaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatg 44410088  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctct---catcaacaa 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||   || ||||||    
T  44410087 aacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttttatggcagccctctcaacaacaacaa 44409990  T
Q  216 cgataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----caa-------tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctc 303  Q
    ||||||    ||||||||| |||||||| |||     |||        |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44409989 cgataa--ggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctc 44409892  T
Q  304 aagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccatta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  44409891 aagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtattggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcatta 44409792  T
Q  391 ttccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctat 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| || |||||| |||| ||| | |||    
T  44409791 ttccgttaatgggccatccggacatccactca--ttgagtccatattaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaacctaa-tagccttat 44409696  T
Q  487 tacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44409695 tacctaatttaatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 44409650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 232 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1078209 - 1077894
Alignment:
Q  232 gagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 329  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1078209 gagatgatctgaaacacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagag 1078110  T
Q  330 agagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatc 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1078109 agagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc 1078010  T
Q  417 cactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggc 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1078009 cactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggc 1077910  T
Q  516 tcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||    
T  1077909 tcacaattgataaata 1077894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 458
Target Start/End: Original strand, 24926738 - 24927193
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  24926738 tgttgaaaatttaggtcttaataaaaacagatt-cataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatga 24926836  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||   |||| | |||||  ||||||||    
T  24926837 acggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctgaagatgaagctttggtggcagcactctcgacaacaacg 24926936  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 306  Q
    ||    ||||||||||| |||||||| |||           ||| |  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24926937 at----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaag 24927032  T
Q  307 ttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattcc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  24927033 ttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattcc 24927132  T
Q  395 gttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  24927133 gttaatgggccatccagacatccac-ca--ttgagtccatatccattaattaattaattaatta 24927193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 27955341 - 27954809
Alignment:
Q  15 ttctctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataat 114  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27955341 ttctatgttagaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaataatcat-aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 27955243  T
Q  115 tatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggca--tccctctcatcaa 212  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||     |||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |  |  || |||||| |||    
T  27955242 tatgatcggatctacaacatgtttgat-----aaggatataaataa-taaggtattaggaagacctggataaagctttcatgatagctctctctcaacaa 27955149  T
Q  213 caacgataaccaaagagagga---gatgatctg--acacacaataga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 305  Q
    |||||||||  ||||||||||   |||||||||  |||||||| | |  |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  27955148 caacgataaagaaagagaggatgtgatgatctgaaacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttagttattcctcaaccggtacctttatgtcttaa 27955049  T
Q  306 gttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattgggga----------ctttatattggatggccattagg--ttcccattatt 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||   ||||||||||||           ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  27955048 gttctc-tcagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtattggggatcataacatcttttatattggatgaccattatgatttcccattatt 27954953  T
Q  393 ccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctatta 488  Q
    ||  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  27954952 ccactaatgagccatccatacatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattat-caaattagaaatctaa-tagccttatta 27954855  T
Q  489 cttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27954854 cttaatttgatcactaatcaattaagcctcacaattgataaataac 27954809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 532
Target Start/End: Original strand, 38151973 - 38152468
Alignment:
Q  34 gtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgaca 133  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||||  ||||||||||    
T  38151973 gtcttaata-aaatagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaatattgaacat------gatcagatctacgaca 38152065  T
Q  134 tgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| | | ||  ||||||| |||||| |||       ||||       
T  38152066 tgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctgaatgaaactttgatgacaatcctctcaacaacaatgatg------gagaaac 38152159  T
Q  234 gatgatctgaca--cacaataga-gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 330  Q
     ||||||||| |  ||||| | | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||      
T  38152160 catgatctgaaatacacaacatacgttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaac 38152259  T
Q  331 gagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 419  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||          |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  38152260 gagtttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatggtcattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc--- 38152356  T
Q  420 tcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaagg 514  Q
         |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  38152357 ----attgagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 38152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1078400 - 1078228
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1078400 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 1078301  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttt 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1078300 tcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 1078228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 24963685 - 24964214
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24963685 tgttgaaaatttagatcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatga 24963784  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctg--gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||   || | |||||||  ||||||||    
T  24963785 acggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaagatgaagctttggtggtagccctctcgacaacaacg 24963884  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgatctgacaca-----------caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaag 306  Q
    ||    ||||||||||| |||||||| |||           ||| |  ||||| ||   ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24963885 at----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggaaactgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaag 24963980  T
Q  307 ttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggga----------ctttatattggatggccatta-ggttcccattattccg 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||           |||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||    
T  24963981 tcctcttcagatggggagaagagagagtttgccacatacggtgtcttggtgatcatagcatcttttatattagatgacaattagggtttccatttttccg 24964080  T
Q  396 ttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-t 494  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||  |||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  24964081 ttaatgggtcattcagacatccaccca--ttgagttcatatccattaattaattaattaa-tattctaaatagaaatcttataagctttattacttaatt 24964177  T
Q  495 tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24964178 tgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaata 24964214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 397 - 531
Target Start/End: Original strand, 25275421 - 25275556
Alignment:
Q  397 taatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-tt 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  25275421 taatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 25275520  T
Q  496 gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275521 gatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 25275556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 12183562 - 12183740
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaat-----tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12183562 tgttggaaatttagttcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaacaatataattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaatattgaacataat 12183661  T
Q  115 tatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttca 194  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12183662 tatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagtattaggaatacctgaataaagctttca 12183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 386 - 480
Target Start/End: Original strand, 12183975 - 12184072
Alignment:
Q  386 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattag 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12183975 cattattccgttaattggccatccggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aaatagaaatctaattag 12184072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 533
Target Start/End: Original strand, 33458371 - 33458421
Alignment:
Q  484 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458371 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 33458421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23253907 - 23253826
Alignment:
Q  412 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaat 494  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  23253907 acatctactcatatcgagtccatatcaattaattaattaattaattat-ctaaatagaaattcaattagtcttatcacttaat 23253826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 33458145 - 33458218
Alignment:
Q  270 tttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 343  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33458145 tttagttctttctcaactggtagctttatgtctatagttctattcgtatgggaagaagagagagtttgccgtgt 33458218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 4280191 - 4280239
Alignment:
Q  484 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4280191 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaata 4280239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 12183816 - 12183867
Alignment:
Q  262 gcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    ||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183816 gcgactgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 4580304 - 4580831
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4580304 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 4580403  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||||||||||||    
T  4580404 tcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacgat 4580503  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580504 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 4580603  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  4580604 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggt 4580703  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||    
T  4580704 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 4580803  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580804 atcaattaaggctcacaattgataaata 4580831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 8650786 - 8651313
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8650786 tgttgtaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 8650885  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8650886 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 8650985  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650986 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 8651085  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8651086 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggc 8651185  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  8651186 catccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagtcttattacttaatttgatc 8651281  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8651282 actaatcaactaagactcacaattgataaata 8651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25354388 - 25353863
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25354388 tgttggaaatttagatcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatg 25354289  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  25354288 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 25354190  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354189 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 25354090  T
Q  317 atggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatt--aggttcccattattccgttaatggg 403  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||          |||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  25354089 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcccattattccgttaatggg 25353990  T
Q  404 ccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  25353989 ccatccggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaat--aaatctaattagccttattacttaatttgatcact 25353892  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353891 aatcaattaaggctcacaattgataaata 25353863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 21190849 - 21191382
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21190849 tgttggaaatttaggtcttattataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 21190948  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21190949 tcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 21191048  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcc---tcaagttctcttc 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21191049 aaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcatcaagttctcttc 21191148  T
Q  315 agatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatg 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  21191149 agatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcacattattccgttaatg 21191248  T
Q  402 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattat---ccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttga 497  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    | || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  21191249 ggccatccgaacatccactca--ttgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttga 21191346  T
Q  498 taactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21191347 tcactaatcaattaaggctctaaattgataaataac 21191382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 62 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25343758 - 25343277
Alignment:
Q  62 atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 161  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25343758 atgttcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaag-atattaagaat 25343660  T
Q  162 tagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttag 259  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25343659 tagagtattaggaatacctagataaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttag 25343560  T
Q  260 cggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattgggga 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25343559 cggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattgggga 25343460  T
Q  359 c---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 447  Q
    |         ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343459 catagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccgaacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 25343360  T
Q  448 ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25343359 ataattaattatccaaaat--aaatctaattagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggttcacaattgataaata 25343277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 531
Target Start/End: Original strand, 31756195 - 31756728
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaa--cagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataatta 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31756195 ctgttggaaatttaggtcttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgatta 31756294  T
Q  117 tgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 216  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||||| || ||||    
T  31756295 taatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatgacagccctctcaacagcaac 31756394  T
Q  217 gataaccaaagagagga---gatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 309  Q
     |||  || ||||||||   |||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31756395 catacacagagagaggaggtgatgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttc 31756494  T
Q  310 tcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgtt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  31756495 tcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc-tt 31756593  T
Q  398 aatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa----ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa 493  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  31756594 aatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaa 31756689  T
Q  494 -ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31756690 tttgatcactaatcaactaagacccacaattgataaata 31756728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 21197004 - 21197553
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21197004 tgttggaaatttaggtcatagtaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatga 21197103  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa---c 216  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||   |    
T  21197104 acggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattag--tattatgaatacctggataaatcttttatggcagccctctcaacaacaacaac 21197201  T
Q  217 gataaccaaagagaggagatgatctg--acacaca--------ataga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctca 304  Q
    |||||  |  |||||||| |||| ||  ||| |||        ||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21197202 gataagga--gagaggaggtgatatggaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctca 21197299  T
Q  305 agttctcttcagatggggagaagagagagt-----------ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggtt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||    
T  21197300 agttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggtt 21197399  T
Q  384 --cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatt 478  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||||    
T  21197400 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatt 21197497  T
Q  479 agtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    || | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  21197498 agccttattacttaatttgatcactaatcagttaaggctctaaattgataaataac 21197553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 32035267 - 32035488
Alignment:
Q  18 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32035267 tctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 32035366  T
Q  118 gatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32035367 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacg 32035466  T
Q  218 ataaccaaagagaggagatgat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32035467 ataaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 531
Target Start/End: Original strand, 21770546 - 21771074
Alignment:
Q  26 aaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21770546 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgatcaacaatcgtaaattaatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacgga 21770645  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctct---catcaacaacgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||   || ||||||||||||    
T  21770646 tctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatatctgaataaagcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa 21770743  T
Q  222 ccaaagagaggagatgatctgacaca-----caa-------tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 309  Q
        ||| ||||| |||||||| |||     |||        |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770744 --ggagataggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttc 21770841  T
Q  310 tcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgt 396  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21770842 tcttcagat--ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccgtagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgt 21770939  T
Q  397 taatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattactta 492  Q
    |||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  21770940 taat-ggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattc-aattagaaatctaa-tagttttattactta 21771034  T
Q  493 a-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771035 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 21771074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 21782736 - 21782941
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21782736 tgttagaaatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 21782835  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21782836 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 21782935  T
Q  220 aaccaa 225  Q
    ||||||    
T  21782936 aaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 531
Target Start/End: Original strand, 21783337 - 21783835
Alignment:
Q  65 ttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21783337 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattag 21783436  T
Q  165 ggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctc---atcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacacaca----------at 251  Q
      ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||   | |||||| |||||  |  |||||||| |||| ||| ||| |          ||    
T  21783437 --tattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaacaaagataagga--gagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcat 21783532  T
Q  252 aga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtg 342  Q
      |  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21783533 caacggttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtg 21783632  T
Q  343 tacggtgtattggggac------------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttga 428  Q
    |||||||||||||||||            ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |    
T  21783633 tacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--taa 21783729  T
Q  429 gtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaatt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  21783730 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaat-agttttattacttaatttgatcactaatccactaagactcacaatt 21783827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 8662764 - 8662921
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8662764 tgttgtaaatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 8662863  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8662864 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaata 8662921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 458
Target Start/End: Original strand, 21789560 - 21789982
Alignment:
Q  65 ttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21789560 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattag 21789659  T
Q  165 ggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctc---atcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacacaca----------at 251  Q
      ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||   | |||||| |||||  |  |||||||| |||| ||| ||| |          ||    
T  21789660 --tattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaacaaagataagga--gagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcat 21789755  T
Q  252 aga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtg 342  Q
      |  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21789756 caacggttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtg 21789855  T
Q  343 tacggtgtattggggac------------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttga 428  Q
    |||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |    
T  21789856 tacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggat-gccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaa 21789952  T
Q  429 gtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21789953 gtccatatcaactaattaaatatttaatta 21789982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17581797 - 17581384
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaa 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  17581797 gaaatttagatctaaataaaaacataattcataaaacatgttcaactattatgaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattatagga 17581698  T
Q  125 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca 224  Q
    |||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| |  || |    
T  17581697 tctacgacatgtttgatttacc---------aagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatgacagccctctcaacaacaacaacgacaa 17581607  T
Q  225 -aagagaggagatgatctga--cacaca-atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 320  Q
      ||||||||| ||||||||  || |||   |  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17581606 ggagagaggaggtgatctgaagcaaacatcaacggttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatgg 17581507  T
Q  321 ggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatc 408  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||||||||          ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17581506 ggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---ttggggaccatagcctcttttatattggacggttattaggtttcccattattccgttaatgggtcatc 17581410  T
Q  409 cggacatccactcatgttgagtccatat 436  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17581409 cggacatccactca--ttgagtccatat 17581384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18778760 - 18778564
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaat-atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18778760 tgttggaaatttaggtcttaattaaaacaaatttcataaaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataattatg 18778661  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 215  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
T  18778660 atcggatctacgacgtatttgatttatcaa-tatattaagaattaggggttttaggaatacctggataaaactttcatggcagccctcttaacaacaa 18778564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 272 - 533
Target Start/End: Original strand, 30905819 - 30906092
Alignment:
Q  272 tagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tt 361  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||          ||    
T  30905819 tagttcttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttt 30905917  T
Q  362 tatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaa 455  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  30905918 tatattggatgaccattatggtttcccattattctgttaaaggatcatccagacatctactcata--gagtccatatcaactaattaaatatttaattaa 30906015  T
Q  456 ttatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    ||||||||  |||||||||||| || | |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30906016 ttatccaat-tagaaatctaat-agccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaattgataaataac 30906092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Original strand, 34603338 - 34603457
Alignment:
Q  44 aaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgattt 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34603338 aaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgattt 34603436  T
Q  144 atcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  34603437 atcaaggatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Original strand, 34724615 - 34724734
Alignment:
Q  44 aaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgattt 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34724615 aaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgattt 34724713  T
Q  144 atcaaggatattaagaattag 164  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  34724714 atcaaggatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6098158 - 6098000
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaatatgttcaacaa---ttatgaatcaa-tagcggaagcaaacaaaacattgaacataat 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||    
T  6098158 tgttgaaaacttaggtcttaataaaaaacaaatttcataaaacatgttcaacaacaattatgaatcaaatagcggaagtagacaaaacattgaac---at 6098062  T
Q  115 tatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 177  Q
     | || || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6098061 gaagaacggatctacgacgtgtttgatttatcaa-gatgttaagaattagggtattaggaata 6098000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 382 - 531
Target Start/End: Original strand, 12801899 - 12802048
Alignment:
Q  382 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagt 481  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||     
T  12801899 ttcccattattccattaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccaaatccattaaataattaattaa-tattctaaatagaaatctaataagc 12801997  T
Q  482 cctattactt-aattgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
      |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  12801998 tttattacttaaattgatcactaatcaattaaggctccaaattgacaaata 12802048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28728202 - 28728047
Alignment:
Q  274 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggact---------ttat 364  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||          ||||    
T  28728202 gttcttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcggttttgctgtgtacggtatattggggaccatagcctcattat 28728104  T
Q  365 attggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 419  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28728103 ataggatggccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccggacatccac 28728047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6102803 - 6102708
Alignment:
Q  21 gttggaaatttaggtcttaatataaa-cagatttcataaaatatgttcaacaa---ttatgaatcaa-tagcggaagcaaacaaaacattgaacat 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6102803 gttggaaatttaggtcttcataaaaaacatatttcataaaatatgttcaacaacaatcatgaatcaaatagcggaagcagacaaaacattgaacat 6102708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Original strand, 17900174 - 17900282
Alignment:
Q  72 attatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtatta 171  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||     
T  17900174 attatgaattattaggggaagcaaacaaaaaattgtacataaatatgttcgaatctacaacatgtttggtccatcaaggatattaataatca-ggtattt 17900272  T
Q  172 ggaatatctg 181  Q
    ||||||||||    
T  17900273 ggaatatctg 17900282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745394
Alignment:
Q  254 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtatt 353  Q
    ||||||||| | || |||| ||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatggaaataagtgagaatatgccatgtacggtgtatt 20745398  T
Q  354 gggg 357  Q
    ||||    
T  20745397 gggg 20745394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096959
Alignment:
Q  428 agtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaat 522  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||    
T  6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaa-tagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaat 6096969  T
Q  523 tgataaataa 532  Q
    ||| ||||||    
T  6096968 tgacaaataa 6096959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581254
Alignment:
Q  432 catatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgat 526  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||   |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17581356 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaccataat-agtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgat 17581259  T
Q  527 aaata 531  Q
    |||||    
T  17581258 aaata 17581254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1106294 - 1106232
Alignment:
Q  116 atgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt-agggtattaggaata 177  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  1106294 atgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaata 1106232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24288161 - 24287637
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24288161 tgttggaaatttaggtcttaata--aatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 24288064  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  24288063 tcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgat 24287964  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287963 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 24287864  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24287863 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggacatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcc 24287764  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  24287763 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 24287664  T
Q  505 tcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24287663 tcaattaaggctcacaatttataaata 24287637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 10739322 - 10739846
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10739322 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 10739421  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10739422 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10739521  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10739522 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcaga 10739621  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac--------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccat 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  10739622 tggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 10739721  T
Q  408 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||    
T  10739722 ccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatcc-aatcagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 10739817  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10739818 aatcaactaaggctcacaattgataaata 10739846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 10953091 - 10953615
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10953091 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 10953190  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10953191 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10953290  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10953291 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcaga 10953390  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac--------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccat 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  10953391 tggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcat 10953490  T
Q  408 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataact 502  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||    
T  10953491 ccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatcc-aatcagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 10953586  T
Q  503 aatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10953587 aatcaactaaggctcacaattgataaata 10953615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 6257188 - 6257714
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6257188 tgttggaaatttaggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 6257287  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  6257288 tcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacgat 6257387  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257388 aaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 6257487  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6257488 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccattattccgttaatgggcc 6257587  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |    
T  6257588 atccggatatccactca--ttgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagctttattacttaatttgatca 6257683  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6257684 ctaatcaactaaggctcacaattgataaata 6257714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48167351 - 48166828
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167351 tgttagaaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 48167255  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     || |||||||||||||||||||    
T  48167254 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 48167156  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167155 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 48167056  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48167055 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 48166956  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  48166955 catccgaacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 48166860  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48166859 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 48166828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48161132 - 48160609
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48161132 tgttagaaatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 48161036  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     || |||||||||||||||||||    
T  48161035 tcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 48160937  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160936 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 48160837  T
Q  318 tggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48160836 tggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggc 48160737  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  48160736 catccgaacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 48160641  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48160640 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 48160609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Original strand, 33458249 - 33458662
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33458249 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatatatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 33458348  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  33458349 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcttagcagccctctcatcaacaacga 33458448  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33458449 taaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcag 33458548  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  33458549 atggggagaagagaaagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccgttagggtttcgcattatttcgttaatgggc 33458648  T
Q  405 catccggacatcca 418  Q
    ||||| ||||||||    
T  33458649 catccagacatcca 33458662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Original strand, 10733229 - 10733507
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10733229 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10733328  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10733329 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10733428  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10733429 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Original strand, 10946998 - 10947276
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10946998 tgttggacatttagctcttaacataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatga 10947097  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10947098 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 10947197  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10947198 aaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 418
Target Start/End: Original strand, 33461416 - 33461787
Alignment:
Q  60 atatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaaga 159  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33461416 atatgttcaacaatcgtaaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaag-atattaaga 33461514  T
Q  160 attagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33461515 attagggtattaggaatatctggataaagcttttgcagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagtt 33461614  T
Q  258 agcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggg 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33461615 agcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtatattgggg 33461714  T
Q  358 ac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcca 418  Q
    ||          |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  33461715 accatagcctcttttatattggatgatcatcagggtttcccattatcccgttaatgagtcatccggacatcca 33461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 189 - 531
Target Start/End: Original strand, 10733504 - 10733859
Alignment:
Q  189 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaac 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10733504 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10733603  T
Q  287 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac--------tttatattggatggccatt 378  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  10733604 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccatt 10733703  T
Q  379 agg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaat 472  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| || |||||||    
T  10733704 agggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatcc-aattagaaat 10733800  T
Q  473 ctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10733801 ctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 10733859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 189 - 531
Target Start/End: Original strand, 10947273 - 10947628
Alignment:
Q  189 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaac 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10947273 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10947372  T
Q  287 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac--------tttatattggatggccatt 378  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  10947373 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccatt 10947472  T
Q  379 agg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaat 472  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| || |||||||    
T  10947473 agggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca--ttaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatcc-aattagaaat 10947569  T
Q  473 ctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10947570 ctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaata 10947628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 50168769 - 50168245
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50168769 tgttggaaatttaggtcttaataaaaccagattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 50168670  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | | ||||||| ||||  || |||| ||||||| |     
T  50168669 tcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta-ggtataaggaatacctggttgaggctttcatggca-gccactcaacaacaacaac 50168572  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaa-tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    || || ||||||||  |||||||  ||| ||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168571 aatcagagagaggatgtgatctgaaacaaacaacaaggattagcggcggttgatttagttcttcctcaa-cggtacctttatgcctcaagttctcttcag 50168473  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||          ||||||||| ||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||     
T  50168472 atggagagaaaagagagttttgcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggt 50168373  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattactt-aattgata 499  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | | |||||| | ||||      
T  50168372 cattcggtcatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttgttacttgatttgacc 50168277  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50168276 actaatcaattaagactcacaattgataaata 50168245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 255 - 531
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957313
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtatt 353  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  354 ggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 441  Q
    ||||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccactca--ttgagtccatatcaact 26957220  T
Q  442 aattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26957221 aattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagtcttattacttaatttgatcactaattaattaaggctcacaattgataaata 26957313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49976763 - 49976251
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  49976763 tgttagaaatttagattttaataaaaacaaatttcataaaacatattcaacaattatgaatcgatagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatga 49976664  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| |  ||| ||||||| |   ||  ||||||| ||||||||||    
T  49976663 tcggatctacgacatgtttgatttatcaagga---taataattagagtattaggaata-ccagatgaagctttgataacactcctctcaacaacaacgat 49976568  T
Q  220 aaccaaagagagga---gatgatct--gacacacaa---tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctc 311  Q
    || |||||||||||   ||||||||   ||||||||    || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49976567 aaacaaagagaggaggtgatgatctcaaacacacaaaataagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaa-cggta-ctttatgcctcaagttctc 49976470  T
Q  312 ttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtg-----tattggggactttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||       ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||            
T  49976469 ttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtggagaccataacctcttttatattggatggccattagggttttccattattacgt-------- 49976378  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataacta 503  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||| | ||| | ||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||    
T  49976377 catccagacatccacccatattgaatccatatccattaattaattaattaa-tattctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcacta 49976279  T
Q  504 atcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  49976278 atcaattaaggctccaaattaataaata 49976251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 458
Target Start/End: Original strand, 44831658 - 44832048
Alignment:
Q  83 atagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgg 182  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |    
T  44831658 atagcggaagcaaattaatcattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctag 44831757  T
Q  183 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagag-----aggagatgatctg----acacacaatagagttagcggcggctgattta 273  Q
    || ||||||| |   || |||||||| |||||||||||| || ||||     ||| |||||||||    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |     
T  44831758 atgaagctttgataacaaccctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtg 44831857  T
Q  274 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------ttta 363  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||          ||||    
T  44831858 gttcttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagagtt----gtgttcggtatattggggaccatagcctctttta 44831953  T
Q  364 tattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44831954 tattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 44832048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 26963324 - 26963518
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963324 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacaaatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatga 26963423  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 216  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||| |||||||    
T  26963424 acggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttttatggtagccctctcaacaacaac 26963518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 304 - 531
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26972064
Alignment:
Q  304 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccattat 26971923  T
Q  392 tccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctatt 487  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |  | |||     
T  26971924 tccgttaatggaccatccagacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-atccttatc 26972019  T
Q  488 acttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26972020 acttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaata 26972064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 339
Target Start/End: Original strand, 19686341 - 19686625
Alignment:
Q  50 atttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaag 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19686341 atttcataaaacatgttcaataactataaatcaataacggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaag 19686440  T
Q  150 gatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgacacaca 249  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| | | ||  | | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19686441 catattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaaagctttgatgacagacatttcaacagcaatgatcaccaaagagagaagatgatctgaaacaca 19686539  T
Q  250 atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 339  Q
      |    || | || |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19686540 caa----tatcagcagctgatttggttcgttctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagtttgcc 19686625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 26956811 - 26956929
Alignment:
Q  19 ctgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26956811 ctgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatg 26956910  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtt 137  Q
    | || ||||||||||||||    
T  26956911 aacggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632216
Alignment:
Q  105 tgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccct 204  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | || ||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  205 ctcatcaacaacgataaccaaa---gagaggagatgatctg---------acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtac 292  Q
     ||| ||||||| |||| ||||   |||| | |||||||||         ||||| || | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  4632383 ttcaacaacaaccataaacaaataggagatgtgatgatctgaattctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtat 4632284  T
Q  293 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||| || ||||||||||    
T  4632283 ctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatattggggac 4632216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3769710 - 3769587
Alignment:
Q  53 tcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggat 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3769710 tcataaaatatgttcaataattatgaatcaataatttaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggat 3769611  T
Q  153 attaagaattagggtattaggaata 177  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3769610 attaataatta-ggtattaggaata 3769587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4632963 - 4632872
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4632963 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacat 4632872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50156104 - 50155687
Alignment:
Q  37 ttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgt 136  Q
    |||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||||| ||||| || ||||||||||    
T  50156104 ttaataaaaccagattatataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaaca------------taattaagatcggatatacgacatgt 50156017  T
Q  137 ttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| | | ||||||| || | ||  ||||  | |||| | ||  | ||||||||  |    
T  50156016 ttgatttatcaagaatattaacaattacg-tataaggaatatttggttgaggctttcatggaagcca-ctcaatagcaacaacaattagagagaggatgt 50155919  T
Q  237 gatctgacaca--caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag-aagagagag 333  Q
    ||| ||| |||  ||| |   |||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50155918 gatttgaaacaaacaacaatattagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgccttaagttcttttcagatgaggagaaagagagag 50155819  T
Q  334 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 421  Q
    |||  |||||||||||||||||||||          |||||||||||||  |||||  | ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  50155818 ttttgcgtgtacggtgtattggggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccggacatccactc 50155719  T
Q  422 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 458  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50155718 -----gagtccatatcaactaattaaatatttaatta 50155687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 34308060 - 34308153
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  34308060 gaaatttacgtcttaata-aaacagattttataaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcatacaaaatattgaacacaaatatga 34308153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35177770 - 35177523
Alignment:
Q  225 aagagaggagatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 320  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    ||||||||||||||| |||||||  || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35177770 aagagaggtgatgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatga 35177671  T
Q  321 ggagaaga-gagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccat 407  Q
    |||||  | ||    |||  ||||||||||||||| ||||          ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||| || |||    
T  35177670 ggagaccatgatttattgttgtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcat 35177571  T
Q  408 ccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaa 455  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35177570 ccagacatacactcgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaa 35177523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50427497 - 50427356
Alignment:
Q  74 tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgttt--------gatttatcaaggatattaagaattagg 165  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||        ||||||||||| | |||||||||||||    
T  50427497 tatgaattaatagtggaagcaatcaaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagg 50427399  T
Q  166 gtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctca 208  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| || | ||||||||    
T  50427398 gtattaggaatacctggatatagcgttcatggaagccctctca 50427356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 55473133 - 55473225
Alignment:
Q  25 gaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgat 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  55473133 gaaatttaggtcttaatagaaacaaatttcataaaatatgtt---caataataaatcaatagcggaagcaaataaaatattgaatatgattatgat 55473225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9237502 - 9237402
Alignment:
Q  57 aaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatatta 156  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9237502 aaaacatgttcaatgattatgaatgaatagtcgaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatatta 9237403  T
Q  157 a 157  Q
    |    
T  9237402 a 9237402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045085
Alignment:
Q  254 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtatt 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | |||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagagaattcgtcgtgaacggtgtatt 33045086  T
Q  354 g 354  Q
    |    
T  33045085 g 33045085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 330
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627075
Alignment:
Q  257 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 330  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagaga 17627075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28704328 - 28704234
Alignment:
Q  386 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaattag 480  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28704328 cattattcagttaatgagtcatccagacatccactcatattgagttcatatcagttaattaaaataattaattatcc-aaataaaaatctaattag 28704234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32284620 - 32284542
Alignment:
Q  254 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 332  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  32284620 agttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagaga 32284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3769509 - 3769434
Alignment:
Q  255 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 330  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769509 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9237185 - 9237084
Alignment:
Q  379 aggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact-aattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat 477  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9237185 aggtttccattatcccgttaattggtcatccagacatccactca--tagagtccatatcacttcaattaaataattaattatcc-caatagaaatataat 9237089  T
Q  478 tagtc 482  Q
    |||||    
T  9237088 tagtc 9237084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 220
Target Start/End: Original strand, 31986703 - 31986833
Alignment:
Q  83 atagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgg 182  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||      |||  |||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||     
T  31986703 atagcggatgcaaacaaatcattgaacat------gatataatcaacaacatgtttgatttatcaaggataacaataatta-ggtattaggaatatctga 31986795  T
Q  183 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgata 220  Q
    || ||| ||| | |||  |||| ||| |||||||||||    
T  31986796 atgaagttttgatggcggccctttcaacaacaacgata 31986833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 50426945 - 50426895
Alignment:
Q  484 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50426945 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataac 50426895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 531
Target Start/End: Original strand, 17627139 - 17627284
Alignment:
Q  387 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtc 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |||| |||||    |||||||||| ||  | |||||||||| || |    
T  17627139 attattccgttaatgggtcatcctgacatcccctcat--tgagtccatattaattaatcaaatatttaattaattatctaat-tggaaatctaat-aggc 17627234  T
Q  483 ctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
     |||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17627235 ttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaata 17627284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 428 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4632128 - 4632023
Alignment:
Q  428 agtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgat 526  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||   |||||||    
T  4632128 agtccatatccactaattaattaattaatactctaag-tagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgat 4632030  T
Q  527 aaataac 533  Q
    |||||||    
T  4632029 aaataac 4632023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 530
Target Start/End: Original strand, 172873 - 173398
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  172873 tgttgaaaatttaggtcttaatataaacaggtttcataaaacatgttctacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatga 172972  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  172973 tcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaatacatggataaagctttcaagatagccctcttatcaacaacgat 173072  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  173073 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcaga 173172  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggcc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |  |    
T  173173 tggggagaagagagagtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatagaac 173272  T
Q  406 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataa 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |    
T  173273 atccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatca 173368  T
Q  501 ctaatcaattaaggctcacaattgataaat 530  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  173369 ctaatcaactaagacccacaattgataaat 173398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1697
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1176 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 1275  T
Q  119 atcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 218  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1276 atcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 1375  T
Q  219 taaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1376 taaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcag 1475  T
Q  317 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc 404  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||      |||     
T  1476 atggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggattttccattattcc------gggt 1569  T
Q  405 catccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||     
T  1570 catccggacatccactca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatc 1665  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1666 actaatcaactaaggcccacaattgataaata 1697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 533
Target Start/End: Original strand, 605 - 1110
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  605 tgttggaaatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaac---tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 701  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||    
T  702 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgat 801  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  802 aaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcaga 901  T
Q  318 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatcc 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||        | |  ||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  902 tggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccata--------gcctctttttttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatcc 993  T
Q  418 actcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaa 512  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  994 actca--ttgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 1089  T
Q  513 ggctcacaattgataaataac 533  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  1090 gactcacaattgataaataac 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5711 - 5465
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5711 tgttggaaatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 5612  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5611 tcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 5512  T
Q  220 aaccaaagagaggagatgatctg--acacacaatagagttagcggcg 264  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5511 aaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 950
Alignment:
Q  20 tgttggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatga 119  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    ||  | || |||||||    
T  1261 tgttggaaattcagatcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaaccattatgaatcaatatcgaaagcaaacaat---ttagatatgattatga 1165  T
Q  120 tcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 219  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| || |||| ||    
T  1164 tcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaacatcaacaat 1065  T
Q  220 aaccaaagagagga---gatgatctgacacacaat---agagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    ||   |||||| |    ||||||| || |||||     || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1064 aaaacaagagaaggtgtgatgatcggaaacacacaccaagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctctt 965  T
Q  314 cagatggggagaaga 328  Q
    |||||||||||||||    
T  964 cagatggggagaaga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 887 - 711
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taatt 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||    ||||     
T  887 tttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatctagacattcactca--ttgagtacatatcagttaattaaatatttaatc 790  T
Q  454 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||| |  | |  |||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  789 aattat-ctgattttaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataac 711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 360 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5615
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----atta 454  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  5792 tttatattgaatggccgttaggtttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 5693  T
Q  455 attatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5692 attatcgaat-tagaaatctaat-agtcatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6057 - 5945
Alignment:
Q  62 atgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 161  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  6057 atgttcaataattattaatcaatagcggcattaaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattattaat 5958  T
Q  162 tagggtattaggaa 175  Q
    || |||||||||||    
T  5957 ta-ggtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  250 atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    |||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38600 - 38076
Alignment:
Q  24 ggaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcga 123  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  38600 ggaaatttaggattaaataaaaccagatttcataagacatgttcaatcattagaaatcaacagtggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcgg 38501  T
Q  124 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---a 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||  | ||||| |||||| |||   |    
T  38500 atctacaacatgtttg-tttatcaagaatattaataatta-ggtattaggaatacctggatgaagctttgacgacaatcatctcaacaacaatgatctaa 38403  T
Q  221 accaaagagaggaga-----tgatctgacacacaat--agagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 313  Q
    | ||| |||||||||     | |||||| | |||||  || | ||||||||||     ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  38402 aacaaggagaggagattatctaatctgaaatacaataaagggctagcggcggc-----tagttcttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctctt 38308  T
Q  314 cagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac--------tttatattg-gatggccattagg--ttcccattattccgttaatg 401  Q
    |||||||| |||| |||| || ||  | ||||||||||||||| |||         ||||| || ||||  |||||||  || | ||||||||||||||     
T  38307 cagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctcttatagtgtgatgatcattagggttttctattattccgttaatc 38208  T
Q  402 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatct-aattagtcctattacttaa-ttgata 499  Q
    || ||||  ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||  | | |||||||| |||||     
T  38207 ggtcatctagacatccac-catattaagtccatatcaattaattaaataattaattattc-gaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatc 38110  T
Q  500 actaatcaattaaggctcacaattgataaataac 533  Q
    |||| |||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38109 actattcaattaaggtttcaaattgataaataac 38076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14097 - 13923
Alignment:
Q  360 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  14097 tttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaatt 14000  T
Q  454 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaata 531  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13999 aattatccaat-tacaaatctaat-agaattattacttaatttgatcactagtcaattaaggctcacgattgataaata 13923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University